2Q0UA

Structure of pectenotoxin-2 and latrunculin b bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
351
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 122
structure length 351
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0uA03
5AZIA 3A5OC 3FZLA 4CZJA 2P9PB 3H1VX 3L6QA 2A42A 3FZFA 1QHAA 5F2RA 3JXUA 3TU5A 4BGAA 3CJCA 4BG9A 3ENHA 2H3GX 2IIRA 2GEMA 2A41A 3P4IA 4IXCA 3A8YA 1D4XA 1H1VA 5E84A 3CIPA 5FPMA 4RWTA 3DXKB 3VEYA 2P9PA 1QQNA 3LM9A 3HSCA 4FWSA 3UB5A 5BPLA 3CJ1A 2A40A 4DHYA 4FOEA 3VETA 4BR9A 3CJ7A 3QBWA 4DQ8A 4IZ9A 1K8KA 5LJVA 2YCHA 5AQQA 1TYQB 5AQMA 3VGLA 1NGFA 2ASMA 3O6WA 4IWVA 3DXKA 3CJ9A 1T6CA 2CGLA 5AQOA 1BG3A 2CGJA 2BUPA 1J6ZA 4BRHA 3KVGA 1TYQA 3FFKB 4CBUA 3LDQA 2CGKA 2E2NA 4BGBA 3CJAA 2Q1NA 4RTFD 2D0PA 2P9SB 3C0BA 1SQKA 4H0TB 1WOQA 1Z6RA 3EL2A 2GWKA 1RDWX 4BG8A 2QWNA 4E1JA 3LL3A 2YHXA 4BR0A 3O80A 4FWLA 4FOIA 3FZHA 4FWQA 4A2AA 4BRKA 4WYBA 3QICA 2P9NB 3IUCA 4A2BA 2D4WA 5AQJA 1DEJA 3VEVA 4H5NA 3U4LA 3ENOA 3O8MA 4K41A 3M1FA 4FWMA 4FPBA 4H5WA 1BA0A 3CQXA 2CH5A 3MN7A 2YJEA 4ISEA 5I9EB 2P9NA 2EWSA 3VGMA 4BC2A 5AQHA 5ADXA 1TUYA 3I33A 4BREA 5AFUH 4CZGA 2QWLA 3WQTA 2FF3B 4A62A 1C0FA 3VEZA 3QB0A 1GLBG 4CZKA 4NO7A 4CI6A 4BR4A 4FWNA 4CZHA 3ZX2A 1X9JA 5JICA 3GBTA 3GOIA 4AM7A 5BR9A 3MMVA 4JNEA 4I6MB 4PL7A 2F9TA 3ATVA 4FWKA 1IG8A 1KAZA 1LCUA 2D1KA 5FPNA 1NGDA 4MLEA 2V52B 5BRDA 2AA4A 3WT0A 1ATNA 2Q31A 3IFRA 5AQIA 4H0YB 3D7EO 2HOEA 4FPAA 3JS6A 2D0OA 3VOVA 5AZIB 3VF6A 3FZMA 1GLDG 3ULEB 2ZGZA 2DPNA 4H5VA 2GUPA 2PBDA 2NLXA 3G25A 5BRFA 1MWKA 1BO5O 1U2VB 3AARA 2FLOA 4GY2B 1Q18A 3ZX3A 4EHTA 3OHRA 4MLHA 4RCHA 3HI0A 3ULEA 4Y0WA 5AQKA 5CE3A 4BR5A 4BVOA 2FSJA 3H3NO 1BOTO 4QS8A 4PKGA 1GLJO 3R6MA 1K8KB 3R8EA 3DJCA 1U2VA 4ISFA 4B1VA 1NLVA 2W41A 1NGIA 4FWPA 2Q0UA 3EKUA 3O5BA 5BN9A 4GNIA 2IVNA 4CD3A 1CZAN 3LDPA 3VEXA 1NGGA 2V7ZA 4CBWA 1Y64A 1QZ6A 5TKYA 1R59O 3AAPA 5AQTA 4XH4A 1DKGD 4QS7A 3L4IA 3D2FA 4AM6A 3VGKA 5KPTA 2Q2RA 3UKRB 4IJNA 2HMPA 4Z94A 1SAZA 1NBWA 2P9LB 2WUSA 4BRIA 3H3OB 3ZX0A 3CI5A 2YI1A 4H03B 3SMPA 2Q97A 5AQNA 2NRHA 5AFUA 4EAHD 3H1QA 5ELZA 3VF4A 1HKBA 1V4SA 3TPQA 1OKJA 3BUZB 1XUPO 3UKRA 1YAGA 4PKIA 2P9LA 1NGHA 4BC3A 4BRDA 5FPEA 3VPZA 1GLCG 3HZ6A 2YJFA 2V51B 3VEWA 2ZWHA 4IJAA 1LOTB 4BVPA 1MWMA 4BQZA 4BRGA 2QWOA 2QWRA 2QW9A 4B1WB 2OANA 2Q36A 3EKSA 3QMLA 2P9UB 1GLAG 4LC9B 5KPRA 3EN9A 5BPMA 4BRAA 4JAXA 3HBTA 1WUAA 4FO0A 2J4RA 1HLUA 4F9OA 3IDHA 3U9ZA 1ZXOA 4XEIA 1YXQA 3UE5A 4M63C 1U6ZA 1E4FT 1G99A 1BWFO 3GL1A 4O8KA 2P9UA 4K43A 3MN9A 3KZBA 1ESVA 4BROA 2ITMA 1BUPA 3WXJA 5KPZA 5AQUA 1MDUB 3CJBA 3SJHA 2UYTA 3LDLA 1HPMA 3WXIA 3SK3A 4NB4A 4CZLA 5JLHA 3LM2A 3GE1A 2FSKA 5E26A 4PKHA 5JLFA 2QWQA 2VCPA 2ASOA 3GDQA 4M7YA 3GG4A 4CJ7A 5BREA 1MA9B 3R9PA 1NGEA 3BP8A 3VESA 3HM8A 2GWJA 5AQXA 3VF2A 4B9QA 3LDOA 4K25A 2CH6A 5AQPA 3MCPA 1SZ2A 4O5FA 4BRQA 2IVPA 5B8HA 3L0QA 2AP1A 3LDNA 3O08A 3A0IX 3C7NB 1S22A 2PAVA 2E2PA 3S41A 5AQSA 1X3NA 3AAQA 3MK6A 2P9IB 2QWMA 4B1YB 2A5XA 4H0VB 5AQYA 4BRFA 4CBXA 5LY3A 2P9KA 4CZMA 5F0XA 1P8ZA 1TUUA 3O4WA 1ATSA 2FSNA 3C7NA 3W0LA 3FLCO 5AQLA 3KHYA 1BDGA 3SLCA 2W40A 2GELA 5AR0A 1BA1A 3FR0A 2P9IA 2E2OA 4IO8A 4KBOA 3D2FB 1T44A 5KQDA 4H0PA 3U9DA 1ATRA 3B8AX 3BF3A 2GTDA 3QBXA 4FSVA 4CZIA 4BC4A 3WEEB 4JD2B 3U8XA 1KXPA 1QZ5A 3CERA 4H5RA 1JCEA 1HUXA 2I7PA 4CZEA 1RFQA 4BRPA 1GLFO 5AQWA 1GLEG 2VYPA 4H0OA 4M7XA 3A5NC 3WEEA 4JD2A 4QS9A 1YUWA 4BRMA 4B1XB 5EXWA 4HWIA 4BRCA 3FGUA 1S3XA 1QQMA 3WXKA 4L3QA 1XC3A 1NGCA 3FE1A 2YHWA 4WQ5C 4XH1A 1X3MA 1KAYA 1ZBSA 1T6DA 5BRHA 3EO3A 3CETA 5LJWA 5JMVA 2HF3A 2I7NA 4BQLA 1XQSC 1NGBA 1NMDA 5AQFA 3WQUA 3M3ZA 2FXUA 3VERA 3I8BA 4EIAA 4CZFA 5EY4A 5EVZA 3D2EB 4PL8A 5KQ8A 1NGJA 4DB3A 5FPDA 3DWLA 3F9MA 3H6EA 4B1ZA 1C0GA 3HTVA 5AQGA 5BPNA 3CHWA 5AQZA 3D2EA 3A5MC 2HF4A 2P9SA 4BR7A 3UKUB 1NGAA 3AY9A 4MO5A 3VEOA 1HX1A 3EZWA 4EHUA 2KHOA 4WQ4C 3SMSA 3A5LC 3ZEUB 3H45C 3FZKA 2VWBA 2QM1A 4MO4A 3QFPA 3H46O 1HKGA 4YDUC 5F1XA 1Z05A 2QWPA 4BC5A 1HJOA 4H0XB 4JHDB 1RGIA 3WXLA 2ZF5O 3UKUA 2E1YA 4BRNA 1KAXA 1QQOA 3O1WA 4WQ5A 4JN4A 2ZGYA 3ZEUA 1DGKN 2E88A 1EQYA 2QXLA 4J8FA 3BEXA 1IJJA 1BU6O 1JCGA 3ATUA 4JHDA 4K42A 4H5TA 4BRLA 4FL9A 1JCFA 3BF1A 4ISGA 3W3DA 3DAWA 3MN6A 3ID8A 2E8AA 2P9KB 2E2QA 2YHYA 1HKCA 2E20A 1GLLO 1NM1A 4A61A 1E4GT 4DCHA 2E1ZA 3VENA 2F9WA 4I6MA 3DXMB 5EOYA 3ZETB 5AQRA 3CQYA 5AQVA 5AZJB 3RSEB 4B1UB 4C23A 2Q0RA 4FWOA 4EFHA 3M6GA 5ADXH 1V4TA 2NZTA 4XH5A 3MN5A 3IMXA 2BTFA 5EX5A 4CD1A 4BR2A 2IVOA 2V7YA 3J8AA 3O1BA 3MDQA 2A6AA 4FWRA 4WQ4A 3ZETA 3DXMA 5AZJA 3RSEA 4HTLA 3WUHA 2ASPA 2A3ZA 2FF6A 1ZC6A 4YDUA 1YVNA 3QDKA 1NWKA 5BN8A 3QFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AZIA 4E89A 4CZJA 4ELVA 3QIOA 1T8EA 2G8WA 3L6QA 5M1PA 2HBKA 3FZFA 5F2RA 2QTDA 3CC2N 3S9HA 1TK0A 1XHZA 3ENHA 2DTUA 5GIPA 2A41A 3IAYA 3P4IA 2D0AA 3A8YA 4CK2A 4FLUA 3G10A 5E84A 5FPMA 3OJUA 3DXKB 3OYFA 2DFHA 3UB5A 3HSCA 4JS4A 2P51A 5M1QA 4RW8A 3ZSYA 2VQFK 4FOEA 5T7BA 4LSLA 4XIUA 4B9MA 4DU4A 1TYQB 1S9GA 3PIPL 4CGJA 2DY4A 3DI6A 1NGFA 1TL3A 4IWVA 4FJ9A 3DXKA 4QAGA 4LFCK 4M3WA 4JYAK 2CGJA 4LF8K 2F96A 1NKCA 5M1KA 4GV6A 4BRHA 2HHVA 3DLGA 3HVTA 1TYQA 1W9HA 3KVGA 2CGKA 4B9TA 2E2NA 3CJAA 1XI1A 4H0TB 1JLBA 2GWKA 1RDWX 4BG8A 3IS9A 4DV3K 3PX6A 3KWIA 4BR0A 4GMJB 3HOSA 1HRHA 3O80A 3CD6N 1CLQA 4BRKA 3L2QA 4MQ3A 4C1NK 1EKEA 3CM5A 3ENOA 4K41A 4DLEA 3M1FA 4BDYA 1TVRA 2FBTA 1BA0A 1A5WA 1HYVA 4DMNA 4ISEA 3TTDA 4BDZA 4N56A 1HR0K 5JS2A 3O3FA 3UIQA 1JL1A 3WNFA 5ADXA 1NJYA 2HNDA 3ENBA 3SAHA 3SV3A 4M45A 4KPYA 3SUQA 1C0FA 1GLBG 4NYNA 4BR4A 3AO4A 4FWNA 3CQ8A 2EHGA 3ZX2A 5M1NA 3I0SA 4AM7A 4PL7A 4LD0A 4CEQA 4LH4A 4PHTX 1LCUA 4CERA 5FPNA 1NGDA 3HP6A 3TABA 2PYLA 3RMAA 5EU7A 2AA4A 1VSKA 4AILC 3IFRA 5IWAK 4H0YB 3K9KA 3O4QA 1YJNN 3JS6A 2IGIA 5C25A 3ZSWA 2E6LA 3DLRA 1SKRA 2FBVA 4W5QA 1ZBLA 2GUPA 1TKTA 3F2KA 4GY2B 1Q18A 2HBMA 3ZX3A 4RCHA 3HI0A 2GV9A 4Y0WA 4CF1A 2FSJA 4JI2K 3LWLA 3HT3A 4FJ5A 3NBPA 1EXQA 4J2BA 5C12A 3DJCA 5CZ2A 1WSFA 4FLYA 4ISFA 4CK1A 3TWHA 1J5OA 1NGIA 3E66A 2JGUA 4JI5K 4CJRA 4CD3A 3AVGA 2NNWA 4RG8A 3TSPA 5TKYA 4U7BA 1LAVA 3T7ZA 1RTJA 5AQTA 4WCEL 1BIZA 4QS7A 1RTIA 5HROA 4FLWA 3UKRB 4IEEA 1OH7A 4LF7K 1JLCA 4JKFA 3CXCM 3T3FA 2NRHA 1C0TA 5AFUA 3DLEA 1DTTA 2KQ2A 4WFBL 1RNHA 4DFKA 3IKMA 1XUPO 3UKRA 1T7PA 3ZT1A 5KRSA 4FJHA 4UY8O 4KV8A 3VPZA 2YNHA 2XHBA 1GLCG 4DTSA 3J80O 2V51B 1QVGM 2ZWHA 4IJAA 1LOTB 1VSHA 4W5NA 4BVPA 1YITN 1HYSA 4BRGA 2QWOA 4DQPA 3P1GA 4MDBA 1CZBA 3KKRA 4FJLA 3EKSA 1GLAG 3EN9A 3CPEA 4BRAA 3P39A 1TKZA 4HTUA 1HLUA 3G71N 4M3TA 2BDPA 4XEIA 3SQ2A 4M63C 1VQMN 1U6ZA 5MLCQ 3GL1A 4O4GA 4LF9K 3SJJA 2OPSA 4KHWA 4J2EA 4CJQA 5KPZA 3M8QA 3L8BA 5AQUA 3I55N 1MDUB 4Z4GA 4E7JA 4F3OA 3LDLA 1Q8IA 2FSKA 3JYTA 4PKHA 2D5RA 5JLFA 2QWQA 4C8KA 2HB5A 3A2FA 1QE1A 2GWJA 3VF2A 4IEIA 3KKSA 4E0DA 2F4VK 5AQPA 5KI6A 1SZ2A 4CJ3A 1NJXA 3DRRA 4B3MK 5B8HA 3HO1A 3O08A 1S6PA 3NH0A 1VQ8N 3C7NB 3SUNA 1S22A 1VQ4N 1U04A 4E7HA 1NKBA 5AQSA 3LZJA 1X3NA 3SQ1A 5LY3A 3HM9A 1TUUA 1ATSA 1JLQA 3C7NA 4BE1A 3RTVA 3FLCO 3QEIA 2HBLA 2W40A 2GELA 1WSHA 3PX4A 3FR0A 2DFFA 5KQDA 1T44A 4H0PA 3U9DA 4CF2A 4GVEA 1OH5A 4GKJK 3HOTA 3K5LA 3LZIA 3J7AP 1NMNA 4DQRA 2KFZA 3CERA 1W7AA 3M8RA 3KWGA 1JCEA 4B9SA 1G15A 1RFQA 4BRPA 4JKDA 3TAGA 1GLEG 2HHXA 1HNWK 2WC9A 3DMJA 3G4SN 1RTDA 4R79A 4JEPA 4CEBA 3FGUA 1QQMA 3EZ5A 4FLTA 3WXKA 3VMFB 4XH1A 3FE1A 1X3MA 3E9LA 4FZZA 1S1UA 1SL2A 1N34K 3TSQA 4KTQA 5FROA 4YOTA 2I7NA 4BQLA 5GIOA 4FJJA 1U48A 3VERA 2R7YA 4CIEA 4DSFA 4HVJA 4CZFA 1IG9A 3CYGA 3D2EB 4CFDA 1VQ9N 5KQ8A 3KIOA 2WTUA 1NGJA 5FPDA 4WE1A 4E1MA 3F9MA 3ZSZA 2Q3SA 5AQGA 3CHWA 4C8MA 3D2EA 1ZBFA 3OTOK 1NGAA 2OYQA 3WNEA 3VEOA 1HX1A 3EZWA 4C1NI 4DUZK 4JKGB 3M5RA 4WQ4C 3RR7A 1S1TA 2VWBA 1IO2A 2B4JA 4DF8A 4YDUC 2QWPA 1HJOA 4H0XB 4DKWA 1IKWA 4A57A 1W97L 4JKCA 2ZGYA 3ZT2A 2UUBK 3SAGA 4J2AA 1GOCA 3BEXA 4DFJA 3ATUA 4CGIA 4RW9A 4M3XA 3T69A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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