2Q0UA

Structure of pectenotoxin-2 and latrunculin b bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
351
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
total genus 122
structure length 351
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0uA03
1ZC6A 3S41A 3BF3A 4WQ5A 4CBXA 3SK3A 5BRHA 3ZX0A 3MN5A 4FPBA 5TKYA 4BREA 2ASPA 2ZF5O 1XUPO 2HF3A 2P9IA 4F9OA 3P4IA 4CJ7A 1RGIA 2FSNA 5AQSA 3LDPA 4CZJA 5BPLA 4IO8A 5BR9A 2E2QA 3BUZB 5AQVA 3VERA 4IWVA 1GLJO 1NBWA 1HX1A 2VYPA 3ATVA 2A5XA 4BGAA 1ZXOA 4B1XB 2DPNA 5AZIA 2VWBA 4FO0A 4PL7A 4A2AA 1Q18A 1MWKA 3F9MA 1YXQA 4AM7A 4RTFD 3DXMB 5ELZA 4FSVA 4HWIA 5BN9A 3WEEB 3O1BA 3IUCA 4K41A 1BO5O 2D0OA 4NO7A 1X9JA 4H03B 5JLFA 5AQIA 4CZGA 2PBDA 3CERA 5FPMA 1NGFA 3WXKA 4CZMA 2P9SB 4FWKA 2BUPA 4CBWA 3FZKA 2VCPA 3O6WA 3UKRB 3ZETA 4A2BA 4BC4A 4BRDA 3WT0A 1CZAN 3MN9A 3CETA 3FZFA 4FOEA 3H1VX 3VESA 2YI1A 5ADXH 3M6GA 1U2VA 1TUYA 1RDWX 3O08A 4FOIA 4BR4A 2FXUA 3WQTA 4FWLA 2P9NA 1GLDG 3EL2A 4BC3A 1HKGA 1NGCA 4JN4A 4CI6A 4C23A 3MCPA 3VOVA 3DXKA 3CJCA 1K8KB 4WQ4A 5EVZA 4CD3A 3VEYA 4CZFA 1BA1A 4O8KA 4FWNA 3VPZA 3MN7A 2HOEA 2GTDA 3WXIA 4BRCA 1YUWA 5KPZA 5AQTA 3RSEB 5KPTA 2V7YA 1NGAA 2V7ZA 1SAZA 5AQGA 5F2RA 1HKBA 3ENOA 1YAGA 1R59O 1NMDA 3EN9A 3R6MA 1LCUA 1P8ZA 3VEOA 3SMSA 5AQKA 3FGUA 3EKUA 2QM1A 5FPDA 1Z6RA 1BWFO 2ASMA 4CZIA 1HPMA 2PAVA 4KBOA 1E4FT 1MWMA 4BC2A 2P9PA 3SMPA 5B8HA 2I7PA 2GWKA 2IVNA 4JHDA 1BDGA 4I6MA 4K25A 4FL9A 3VEXA 1ATRA 4IJAA 4BQLA 3A5NC 3EKSA 5AQWA 3LM2A 2ASOA 3GDQA 4FWQA 5BRFA 3CQXA 3H3NO 3H1QA 1WOQA 4FWPA 3R9PA 2D1KA 1NM1A 5AFUH 3SJHA 5KPRA 5AQFA 2GWJA 3HBTA 5AQPA 2HMPA 1DGKN 3QB0A 4A61A 1XQSC 1NGBA 3HI0A 3O4WA 2FSJA 3A5MC 2Q97A 2J4RA 1BA0A 2P9KB 3LM9A 3WXJA 2AP1A 3CHWA 3JXUA 4B1VA 3FE1A 4BG8A 3KZBA 4MLEA 1G99A 1DEJA 3D2EB 3ULEB 5EX5A 4FPAA 2P9UA 3C7NB 2FF3B 4H5VA 2I7NA 4ISEA 3CJ9A 4CD1A 3BP8A 3U9ZA 3L4IA 3TPQA 3FZMA 3UKUA 4FWSA 1NGGA 1NGEA 1WUAA 3U8XA 3UB5A 3U9DA 3H6EA 4AM6A 1HLUA 5AQYA 1SZ2A 2P9IB 2ZWHA 3H3OB 2Q1NA 3FZLA 2HF4A 1U6ZA 3WEEA 3CI5A 2D4WA 4BRGA 3G25A 4EHTA 3L6QA 1DKGD 3CJ7A 4JAXA 3QICA 3A5LC 3LDQA 1V4TA 1ZBSA 2E20A 4QS8A 3QBXA 1S3XA 2YHXA 2CH5A 5AZIB 2FF6A 4QS7A 2CGJA 3LL3A 4ISFA 4BRPA 1Z05A 5AQNA 5BN8A 3HSCA 3R8EA 3D7EO 1KAZA 2GELA 4BR5A 5AFUA 3MMVA 2Q2RA 4BR9A 3GE1A 1NLVA 2GEMA 3QMLA 4BR7A 3GBTA 4BRQA 3ZETB 5EXWA 5JICA 1OKJA 4BRLA 5FPEA 1QZ6A 1ATNA 3VGLA 2FLOA 3IFRA 1K8KA 3U4LA 3VENA 1EQYA 5BRDA 1GLCG 3VF4A 4BG9A 1U2VB 3AARA 3I33A 4BRAA 5LJVA 4EIAA 2IVOA 1BUPA 2E1ZA 3QBWA 4B1ZA 3HM8A 2W41A 2P9NB 4H5NA 2IIRA 2V51B 3RSEA 3WUHA 4BROA 3HTVA 3DXKB 1C0FA 2OANA 4HTLA 1JCGA 4GY2B 3O5BA 4CBUA 4CZHA 4QS9A 3FFKB 1GLLO 4DB3A 4BVOA 3WXLA 2YCHA 1HKCA 3GG4A 4EAHD 4WYBA 3D2FA 5E26A 3ZEUA 5BREA 4H5TA 3JS6A 3ZX2A 3LDLA 1D4XA 1QQNA 5AQOA 2ITMA 4EFHA 2A42A 2BTFA 4DHYA 5E84A 5ADXA 2P9LA 1QQOA 1H1VA 4JNEA 1ESVA 4PKIA 3QFPA 4WQ5C 3QDKA 4RCHA 5AQQA 1C0GA 3CJAA 4JD2A 3OHRA 2KHOA 2P9PB 3CJ1A 4K42A 3TU5A 2QWLA 3AAQA 4JHDB 3LDOA 5EOYA 1V4SA 4H0PA 4ISGA 2NLXA 4CZLA 3O1WA 1T6CA 3M3ZA 2ZGZA 5F0XA 4K43A 5BPMA 3EO3A 2P9KA 5AQZA 2CGLA 3IMXA 3GL1A 2IVPA 3DAWA 4FWOA 2GUPA 2WUSA 5I9EB 3O80A 1SQKA 1HJOA 4MO4A 1X3NA 2QW9A 1J6ZA 1TYQB 1GLBG 3CJBA 3KHYA 4GNIA 3MK6A 3C7NA 4BC5A 3B8AX 5AZJB 4BVPA 2E1YA 5KQ8A 4XH5A 1KXPA 3VGMA 4B1WB 4H0VB 3H45C 1Y64A 3VETA 3M1FA 2CH6A 4PKGA 2V52B 5CE3A 4YDUA 1KAXA 4H5RA 3DXMA 4FWMA 5KQDA 1XC3A 2P9UB 4E1JA 2QWPA 2A6AA 3GOIA 3A5OC 3HZ6A 3I8BA 4Z94A 3UKUB 2P9SA 5AQUA 3A8YA 3O8MA 3UKRA 4PL8A 3VEWA 4O5FA 3DJCA 4IZ9A 4BGBA 1NGIA 2QWNA 3KVGA 1JCEA 5AR0A 1NGDA 4FWRA 4WQ4C 4MO5A 4BR2A 4Y0WA 4DCHA 5AQRA 3MDQA 4A62A 2ZGYA 3IDHA 4IXCA 5AQJA 3L0QA 2F9TA 2E2OA 1BU6O 4H0TB 2QWRA 5JMVA 2YHWA 2YJFA 5LJWA 1T44A 1LOTB 4BRFA 2E8AA 4BRMA 1YVNA 2E2NA 3ATUA 2Q31A 3BF1A 4PKHA 3ZX3A 1E4GT 2QWOA 2A40A 3EZWA 4RWTA 5AQMA 2QXLA 3VEVA 2QWMA 2YJEA 2AA4A 4H0XB 2Q0RA 4B1YB 2QWQA 3C0BA 4XH1A 4IJNA 1IJJA 4H5WA 1NWKA 1HUXA 2F9WA 3FLCO 3AAPA 1GLEG 5AQXA 1ATSA 1GLFO 2FSKA 1QQMA 3W3DA 4BRKA 3CIPA 4M7XA 1MDUB 5JLHA 4DQ8A 2CGKA 2YHYA 4M63C 4CZEA 4L3QA 3VF2A 1RFQA 3DWLA 3SLCA 2H3GX 1TUUA 2D0PA 1BG3A 3WQUA 3A0IX 3LDNA 4XH4A 4BRNA 3MN6A 2Q36A 5LY3A 1X3MA 2Q0UA 1NGHA 4MLHA 1KAYA 1BOTO 1QZ5A 2W40A 1GLAG 4H0YB 3D2FB 3J8AA 5AQHA 2NZTA 5AQLA 2E88A 4BQZA 5EY4A 3ZEUB 3ID8A 1MA9B 3ENHA 4LC9B 4XEIA 5F1XA 4NB4A 2NRHA 4I6MB 3QFUA 4BRIA 4BRHA 3H46O 1T6DA 4CZKA 2P9LB 4M7YA 4J8FA 3UE5A 3AY9A 4BR0A 3VGKA 2A41A 1IG8A 3VF6A 5FPNA 2E2PA 4JD2B 4B9QA 3BEXA 4H0OA 4YDUC 1S22A 3VEZA 3D2EA 2A3ZA 3CQYA 1QHAA 3ULEA 4B1UB 2UYTA 2EWSA 3W0LA 4EHUA 1TYQA 1NGJA 5BPNA 3FR0A 5AZJA 3FZHA 1JCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CK1A 1WB9A 1CZ9A 4KB1A 1XUPO 3ZYYX 1WSEA 1LWEA 2YNIA 4Q0BA 5BR9A 2E2QA 4K0KK 2G8IA 3K58A 4B1XB 1YJWN 4KHWA 5AZIA 1XHZA 4YNQA 4AM7A 3IRXA 5ELZA 4DQIA 3ZSVA 2W6LA 1REVA 4FCYA 2KTQA 1WSJA 3IUCA 4W5OA 3O4NA 3KLGA 4Y1CA 3K0SA 1W7AA 4NO7A 4H03B 5TKWA 1SL1A 3WXKA 2HSTA 2BUPA 4CBWA 4CFBA 1W0HA 3BY5A 1ASVA 4W5RA 4RW8A 4A2BA 4BC4A 3WT0A 2DY4A 3G71N 3SQ4A 3MN9A 3THWB 1I94K 2IDOA 3FZFA 1L3UA 3I0SA 3VESA 2YI1A 3KLEA 3QEPA 4J2AA 1RBRA 4E72A 2VWKA 1R0AA 4Y1DA 1RDWX 2FXUA 3T19A 4ELVA 3OS1A 3I55N 4BC3A 1P90A 4UQGA 3K59A 1TK0A 4FLTA 2O8DA 3AVJA 1UA0A 2EX3A 1Z25A 2PFUA 2JLEA 2UUBK 4GMJB 3DLLL 4FWNA 4JEPA 5MLCQ 2EHGA 2GTDA 3WXIA 4IFYA 4OVLA 3CXCM 1HNWK 1KQSM 4OGEA 2V7YA 3NFAA 1RDAA 3OA9A 1SAZA 1R59O 4IKFA 1B9FA 1NMDA 3G0ZA 3SMSA 4DUYK 2ZE2A 3L2QA 3P38A 4ELUA 4CZIA 4DTXA 5C24A 4KBOA 3SMPA 4F3TA 2I7PA 4EZ9A 2OPSA 4B8CA 4I6MA 1ZBHA 4O0IA 4FL9A 4BQLA 3OVNA 3QEIA 3CMAN 2ASOA 4B3OA 1XWLA 1RDUA 5GADP 3CQXA 3AVNA 3CFOA 3E1YA 1WOQA 4FWPA 4M3TA 2NNWA 1SL2A 3HBTA 2DFEA 5AQPA 4CVNE 3OYAA 3ZSXA 3KD5E 4DR3K 2UXBK 3HI0A 2Z1GA 3HT3A 2P9KB 3WXJA 2AP1A 3CHWA 4B1VA 4JKBA 5HRSA 3VQ5A 1L3VA 4KH4A 2VG7A 3TSQA 2Y1IA 3K9JA 3R1XA 4CGHA 3OYJA 4CHPA 1NMNA 2FF3B 4H5VA 4ISEA 3ZT1A 2C1GA 3U9ZA 3FZMA 4KTQA 1NGGA 1NGEA 1Z26A 1N5YA 4EZ6A 3U9DA 1NKEA 3CF5L 2WC9A 4FJGA 4C8NA 2C1IA 3CCEN 3RMAA 3G25A 4ILHA 1Q82O 3L6QA 3NGYA 4JAXA 3QICA 3A5LC 3SAFA 3LDQA 4CJWA 1ZBSA 4X62K 1NG9A 2CH5A 1VQPN 2G8UA 2RN2A 4QS7A 1X9WA 2CGJA 4B3MK 1RDDA 5BN8A 4MDBA 3HSCA 2GELA 3DOLA 4BR5A 3THWA 1K9MO 3OJUA 4DWIA 5C42A 4CJPA 2Q2RA 3ZSQA 4FLUA 1NK8A 4FJ8A 4CF0A 1Q9YA 1LWCA 1NJWA 4BR7A 3GBTA 3VQCA 4BRQA 1J5EK 3ZETB 5EXWA 3RR7A 3CYGA 4JLHA 1T03A 4F4KA 4QOZB 2D0BA 1QZ6A 1KSPA 3KLFA 4IFVA 4BG9A 1C0TA 4BRAA 3VTIA 4KH6A 3HSTB 3EZ5A 1RTIA 3AA2A 1VQ4N 1NJIO 4B1ZA 2P9NB 4H5NA 3A2FA 4F8RA 1HQEA 2YKMA 4V19S 3HP6A 4CJLA 4FW1A 3WUHA 3DXKB 3HOTA 3NAEA 1ZBLA 4E19A 2G8HA 1JCGA 2F96A 3O5BA 3ZT2A 3CCRN 4CIFA 3M5RA 3CCVN 3MX5A 1S1WA 3CM5A 2NRVA 4AF1A 3MCAB 4IFEA 3PX4A 4JV5K 5E26A 1N33K 4KV8A 5GAEP 3HPHA 1NK9A 4GV6A 3JS6A 4KHSA 2BDPA 3L8BA 1VSHA 2JWKA 2BTFA 4JNEA 3ZCMA 4DSJA 4RCHA 5AQQA 3P31A 3ZT3A 3BDPA 1OH6A 3CJAA 3LPUA 4FJIA 3TU5A 4OKJA 3KK7A 4YOUA 2XY8A 3OW2M 3J7YP 1V4SA 3C95A 3PX0A 1QSYA 4ISGA 4N76A 2NLXA 4CZLA 3NBPA 3NHGA 2ZJQL 3M3ZA 1VSJA 1UAXA 2P9KA 2OTJN 3DAWA 3HVTA 3OYHA 1N8RO 4B9UA 3CCLN 2WBNA 4FJHA 3AVLA 5HBMA 2QW9A 1HPZA 1QVGM 4B9VA 3KHYA 4IDKA 4GNIA 4BC5A 3VQ4A 4XIUA 3HPOA 4B1WB 4JI7K 2O8BA 1ZBIA 4OLAA 4ICLA 1KAXA 5KQDA 4FWMA 2X6SA 1J53A 2P9UB 3F5TA 3V1RA 3SBGA 3N4PA 1K6YA 5FRMA 1KFDA 2A6AA 3GOIA 3A5OC 1KC8O 4CEQA 3V9UA 2B4JA 4JKAA 3IKMA 3VEWA 4O5FA 4BGBA 4QAGA 1NGIA 2QWNA 4A57A 2YKNA 3B6OA 3G10A 5FROA 1NGDA 4FWRA 4AHCA 3AVFA 3OBWA 4BE2A 3ID6A 4BR2A 2AJQA 4FK2A 5D3GA 3BGRA 5AQRA 2F8TA 3MDQA 3L2VA 4IXCA 5AQJA 3TAFA 4CERA 3Q7CA 2F9TA 3M8SA 1BU6O 2RHKA 1NKCA 3AO5A 2LSNA 2HNZA 3PIOL 1VSMA 3T3FA 1YVNA 4FK4A 3TWHA 3KWGA 2Q31A 3J7AP 3NF8A 1VAZA 3EZWA 1OVQA 2AA4A 1O1WA 2Q0RA 4CEOA 3C0BA 1JLCA 4IJNA 1VQNN 3FLCO 1ATSA 1YI2N 2FSKA 4BRKA 1MDUB 3THXA 4JI5K 4M63C 3HP9A 4FK0A 1RFQA 3PLAA 1S1VA 3DWLA 1BL3A 1EXQA 2D0PA 5JS2A 3SI6A 4FVUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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