2Q0UA

Structure of pectenotoxin-2 and latrunculin b bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
351
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
total genus 122
structure length 351
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0uA03
5AQGA 5AZJB 5BPLA 5BR9A 2V7YA 2QWNA 4FWLA 1ZC6A 4ISGA 3A8YA 3O8MA 4IJNA 1J6ZA 2GUPA 3MDQA 3R6MA 5E84A 2FF3B 3KZBA 3ZEUB 4B9QA 2P9UB 5AQRA 1GLAG 4Z94A 4FOIA 4BG9A 5F2RA 1RDWX 3CJ7A 2QWPA 3CQXA 4FWOA 4RWTA 1NMDA 4B1XB 2KHOA 2E2OA 3O5BA 4H5RA 4FWRA 4O8KA 4YDUA 3TU5A 1GLCG 3FZFA 4CZLA 2E88A 3G25A 5E26A 4JD2A 4PL7A 4QS9A 3SK3A 3WXKA 3A5LC 5AQZA 4C23A 1HLUA 1YVNA 3LDLA 1XC3A 3H3NO 4H03B 3VEZA 4DHYA 4XH1A 3IFRA 3SMPA 3C0BA 4BC2A 1LOTB 3WQTA 3ULEB 5LJWA 2I7NA 4FSVA 4FWMA 2F9WA 3GBTA 3O80A 3D2EA 4CZMA 4F9OA 2ASPA 3B8AX 5AZIB 1LCUA 4DQ8A 4PKIA 3S41A 4B1VA 1NGGA 3VGMA 1T6CA 3DXKB 2FSJA 3UKRB 1T6DA 3DXKA 2P9SA 1DKGD 4XEIA 2A40A 5JLFA 1U2VB 4BC4A 1HX1A 1K8KA 4H5WA 4K25A 4FO0A 5EY4A 4EIAA 1BWFO 3FZHA 3O4WA 3IUCA 2DPNA 4FWNA 5AQFA 3LM9A 4BRPA 2HMPA 1H1VA 3AAQA 3CJBA 1JCEA 3A0IX 3CERA 3M3ZA 3LDNA 3ID8A 3VERA 5EOYA 4CBXA 1NGCA 4HTLA 5AQQA 2QXLA 1XQSC 5BREA 2AP1A 3EZWA 3H46O 2ZGZA 1NGAA 1BO5O 3QICA 1DEJA 3GDQA 2Q2RA 3BUZB 3MN5A 4CJ7A 5CE3A 3DWLA 2IIRA 4K41A 4BRHA 3SJHA 4CZEA 1JCFA 1SQKA 3AY9A 4JHDA 2QWQA 2IVNA 2VWBA 3C7NA 4WYBA 1BUPA 3FZLA 3HBTA 1NM1A 3M1FA 3VEWA 2HOEA 4CZHA 2CGKA 3CJ9A 4BR9A 2YJEA 3KVGA 2ZWHA 4H0YB 2P9NA 1Z05A 2D1KA 2P9NB 5BRHA 1KAZA 2CGJA 2D4WA 3BF1A 3HI0A 3MK6A 2NZTA 3LL3A 4IXCA 1C0FA 1KAXA 2W40A 1GLFO 1QQMA 2YCHA 3QDKA 1HKBA 4JD2B 2D0PA 4EAHD 3DXMA 3H6EA 3O1WA 4QS7A 3ATUA 4BRLA 2GELA 3BP8A 2VCPA 2V52B 1U6ZA 3JS6A 3A5NC 4EHTA 2FXUA 4H5TA 2FSKA 1ATRA 4FWPA 5AQMA 4FPBA 3CHWA 3EO3A 3DXMB 4DCHA 3VEXA 3VF6A 2FLOA 4JNEA 4MO5A 3FLCO 4BRKA 5FPNA 2D0OA 3VEYA 4B1ZA 3CQYA 5ADXH 5BN8A 1HUXA 3VENA 3CIPA 4CZFA 1KXPA 2YHXA 1XUPO 2P9KB 3JXUA 1NGJA 5BPMA 3LM2A 2P9KA 4BRFA 3I8BA 5AQSA 3M6GA 2V51B 2P9IB 3UB5A 4BVPA 4RCHA 2UYTA 5JMVA 5BRDA 4AM7A 4BR7A 1SAZA 2VYPA 5BRFA 4NB4A 5LJVA 1CZAN 5TKYA 2P9LB 4O5FA 4FOEA 2P9LA 4H0PA 2ZF5O 1D4XA 4CD1A 3ZX2A 5EXWA 2ZGYA 2YHYA 5EX5A 3HSCA 2E20A 4QS8A 3U4LA 4KBOA 3HTVA 3U9DA 2P9IA 2GTDA 2WUSA 3O1BA 3H1VX 3QBWA 4BRNA 4BRAA 3FGUA 5AQHA 2E1YA 5AQUA 4WQ4C 5AQXA 5AQIA 3QFPA 3CETA 4H0XB 5AR0A 1GLEG 1Z6RA 5I9EB 2QWLA 3AAPA 4CI6A 1HPMA 5KPZA 3QFUA 3VPZA 3VEVA 4A2AA 5FPEA 3A5OC 4K43A 1ZXOA 2P9UA 1P8ZA 4H5VA 4L3QA 3WXLA 2Q97A 4LC9B 1NWKA 3SLCA 4BRIA 1QZ6A 2QWRA 1R59O 2E2PA 3SMSA 4B1YB 2QWMA 3MN7A 3VEOA 3QMLA 4CD3A 3CJCA 3HM8A 2PAVA 3U8XA 4BQZA 4BRQA 3H45C 5B8HA 3L6QA 1RGIA 4NO7A 1IG8A 4DB3A 3F9MA 1ATNA 2E2QA 3ZX3A 4ISEA 2E2NA 4H5NA 1E4FT 1V4SA 2I7PA 3H1QA 3GG4A 3GL1A 3VGKA 4CZKA 5F1XA 1MWKA 4CBUA 3WEEB 3WEEA 1X9JA 1BA1A 3C7NB 2GWKA 1TYQB 3FZMA 1TYQA 2E1ZA 3GOIA 1ESVA 2QW9A 5FPDA 1NGEA 1NGIA 2A6AA 1ATSA 4A62A 3TPQA 3BEXA 3UKRA 5KPRA 2Q36A 4M7XA 4BRMA 3VGLA 1V4TA 4FWKA 1RFQA 3RSEA 4A61A 5AQKA 4PKGA 3ENHA 4BGAA 3VF4A 3HZ6A 3R9PA 1Q18A 2F9TA 2J4RA 2OANA 2W41A 4K42A 2BUPA 5BPNA 5LY3A 1WOQA 1S3XA 2A42A 3QBXA 5AQJA 3DAWA 4BRGA 3FZKA 5F0XA 2A5XA 1C0GA 5ELZA 2IVOA 4BRCA 4M7YA 2A3ZA 5AQVA 4WQ4A 5AFUA 3A5MC 3ENOA 3D2EB 3FE1A 3MMVA 3WT0A 2Q0RA 3ZETB 1BG3A 2FSNA 4EFHA 1T44A 2E8AA 4CZIA 2PBDA 2P9SB 2CGLA 1HJOA 1EQYA 5KQDA 1U2VA 3UKUB 4JHDB 1S22A 5KQ8A 1MWMA 3CI5A 3BF3A 4H0VB 4BREA 3WUHA 3IDHA 3CJ1A 2YI1A 1QZ5A 1MA9B 4MLHA 2ASMA 3IMXA 1NLVA 1BOTO 3FFKB 4CZGA 3AARA 1TUYA 1Y64A 4XH4A 1NBWA 1HKGA 1IJJA 2NLXA 2YJFA 3J8AA 4WQ5C 4JN4A 4JAXA 1GLBG 1WUAA 1BA0A 3EKUA 4WQ5A 4BQLA 5JICA 3VOVA 4BR0A 2A41A 3ZX0A 3W3DA 1G99A 2HF3A 4BGBA 2QWOA 3VESA 2ASOA 4BR4A 1GLJO 3L4IA 4BVOA 5AQTA 2V7ZA 3W0LA 2FF6A 4FWQA 4ISFA 3ZEUA 1ZBSA 3LDOA 4GY2B 5AQOA 4A2BA 4BR5A 4YDUC 5BN9A 5ADXA 5AZIA 2IVPA 3LDPA 4EHUA 4B1UB 5AZJA 4BROA 4J8FA 4BC3A 3L0QA 3LDQA 3R8EA 2BTFA 5KPTA 4BR2A 1K8KB 3P4IA 4GNIA 1QQNA 4IZ9A 2CH5A 3RSEB 4AM6A 3FR0A 2YHWA 2GWJA 4M63C 3U9ZA 2H3GX 4FL9A 4E1JA 3WXJA 5AQYA 2HF4A 3MN6A 3ZETA 4BRDA 1TUUA 2CH6A 1YXQA 1JCGA 2Q1NA 3EN9A 4IWVA 2ITMA 2QM1A 1DGKN 3EL2A 4PL8A 3VF2A 1E4GT 3DJCA 3ULEA 3I33A 1SZ2A 1X3NA 1OKJA 5AQNA 3O08A 4IO8A 1GLDG 1NGBA 3ATVA 4MO4A 4Y0WA 4CZJA 3WQUA 3EKSA 1HKCA 3KHYA 4XH5A 5EVZA 2EWSA 1BDGA 1GLLO 5AQWA 3UKUA 4BC5A 3D2FB 4IJAA 3H3OB 3UE5A 4BG8A 3WXIA 1KAYA 5FPMA 2AA4A 1X3MA 4FWSA 2GEMA 1YUWA 5JLHA 3OHRA 1NGFA 1MDUB 2Q31A 5AQLA 1QHAA 3VETA 3MCPA 1YAGA 2NRHA 3CJAA 1NGDA 4B1WB 4CBWA 5AQPA 3D7EO 3GE1A 3D2FA 2Q0UA 4FPAA 4PKHA 3MN9A 4H0OA 1BU6O 4H0TB 5AFUH 1QQOA 2P9PA 3O6WA 1NGHA 4I6MA 2P9PB 4I6MB 4RTFD 4MLEA 3QB0A 4HWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AZJB 3PX6A 4FJNA 3TSUA 5DMRA 3AGKA 3OBYA 4FWLA 3A8YA 4IJNA 4JI2K 4DSEA 3ZT4A 1J6ZA 5E84A 4FJLA 4JI3K 4C1NK 5AQRA 2VWJA 1GLAG 2XY5A 1Q9XA 3SUNA 2O8EB 2B5JA 3NAEA 1RDWX 3DLLL 3BDPA 4FWOA 3V1QA 1W9HA 2Z1HA 4ID1A 1I39A 5IT9O 2D0BA 3O5BA 4H5RA 4FLZA 4O8KA 5IWAK 1GLCG 1ZBFA 3V81A 1KRPA 3WXKA 3SK3A 1JXBA 5LMUK 3AV9A 3L2RA 3G4SN 1YVNA 4X65K 4H03B 1O1WA 1RDAA 4B3OA 3AVIA 3ZSVA 3ZSYA 4DR3K 3SMPA 3AO4A 4IG0A 4CJ5A 4YY3K 3SBTA 3SPZA 3GBTA 3D2EA 5CYMA 1S72N 4JKGA 1LCUA 1X9SA 5I3UA 1NGGA 3Q7CA 4IBNA 2E6LA 3DXKB 1EKEA 3TAFA 1S1TA 4GV6A 4U67L 2P9SA 4BWMA 4BC4A 1HX1A 3NFAA 4CIGA 4J2AA 4H5WA 4X64K 4EIAA 1BWFO 4JK9A 1SL0A 4FWNA 4IOXA 3LM9A 1C0MA 4KHNA 2RE2A 3CJBA 1JCEA 3VQ4A 3KLGA 2HHTA 5MLCQ 1KFSA 1YHQN 3IAYA 3HP9A 2G8WA 2QXLA 3T1HK 5BREA 2HHQA 2HBMA 5FRMA 1S9GA 5FLXO 2JWLA 5H1SQ 4JKCA 2YHAA 1L3TA 3PO5A 4CGHA 3F2KA 4JHDA 2QWQA 2IVNA 3WNHA 3NF8A 4WFNL 4WYBA 3HBTA 2HOEA 3CJ9A 2X74A 2YJEA 3AVMA 4KHWA 3THXB 1Z05A 2CGJA 4DFPA 3BF1A 1U04A 4JKEA 3P5JA 4NXNK 1P90A 4W5NA 2VG6A 3RR8A 4KH5A 3N4PA 4A5AA 4KREA 2D0PA 3H6EA 4AHVA 4W5QA 1RDUA 3CCRN 1VQ7N 3K57A 3V1RA 3J7YP 2V52B 1U6ZA 1RTHA 3JS6A 3B6OA 3K5MA 3ZSRA 3L2UA 4JK8A 4JI4K 2FXUA 3O3GA 2OPSA 2BDPA 1JLBA 1HMVA 5AQMA 4DQPA 1IG9A 3H08A 4AHUA 3KTQA 4DCHA 3KKRA 3FLCO 1VQKN 1Q82O 4PUOA 3LZIA 1VSLA 2YNGA 1SKWA 3OYLA 2R7YA 2P9KB 3LM2A 2P9KA 4BRFA 3I8BA 1XC9A 5AQSA 1Z25A 1YITN 3AVHA 5HP1A 4AM7A 5BRFA 3K5LA 5HL7L 3O9TA 2P9LB 4B8CA 4DV6K 1FJGK 1KTQA 4KTQA 3QESA 3ZX2A 2O8BB 1IO2A 2OPRA 1RTIA 2IGIA 3O1BA 2D0AA 3FGUA 2E1YA 5AQXA 4GVEA 3EY1A 3CETA 3L3UA 4M3WA 1HRHA 1WN7A 3ISNC 4H0XB 1GLEG 3SNNA 3DRPA 4JK7A 3G10A 4LFCK 3AAPA 5KPZA 4HHTA 3QFUA 4A2AA 5FPEA 2YNIA 3A5OC 4K43A 1ZXOA 3PX4A 1P8ZA 3PIOL 4L3QA 1O13A 3CCVN 4C8MA 4LC9B 3SLCA 1A5WA 4JI1K 4X62K 4W5RA 2JWKA 4B1YB 1TGOA 3VEOA 2O8FB 3U6FA 3QMLA 3U8XA 4BQZA 2VWKA 2JLEA 3H45C 1BI4B 4N76A 2AJQA 3ZX3A 1TKTA 1V4SA 3NDKA 5D3GA 2YNHA 4FK0A 4YOXA 4CGFA 4CECA 3SQ2A 1MWKA 3V9SA 3ZT1A 3WEEB 1XHZA 3CC2N 4CHYA 3JYTA 3CYMA 1BA1A 4Q5VA 2C1IA 3BZCA 4JRPA 4DWIA 4RW8A 2B4JA 1TYQA 2QW9A 5FPDA 2YNFA 4C1NI 1NGIA 1ATSA 4FVMA 3G0ZA 3CFPA 3TPQA 2NRRA 3AVNA 3K5NA 1T03A 4IO9L 4E7JA 4BRMA 4WE1A 4FJ9A 4FWKA 1RFQA 3NH0A 3ENHA 2P5GA 3DLBA 1Q18A 3ENBA 4K42A 3K58A 5FRNA 4GV9A 1WOQA 1OVQA 1S3XA 1W0HA 4DLGA 1NK9A 4FLYA 3CQ8A 4DS4A 2YKMA 4IDKA 1YT3A 3OYDA 4DTPA 2A5XA 2HNDA 1LV5A 1NJYA 1KFDA 1SV5A 4BRCA 3SV3A 2A3ZA 1J5EK 3A5MC 3TAMA 3PSIA 1NJZA 1XMQK 2Q0RA 2OCEA 4EFHA 4OX9K 3DLRA 2XRIA 2XO7A 4BECA 3ID6A 2GV9A 1EQYA 3QIPA 1S22A 3WUHA 2KLAA 2ZD1A 3CJ1A 2YI1A 3CM6A 1MA9B 2ASMA 5M1QA 4EZ9A 5DM7L 1N32K 3T7ZA 1BOTO 3LPUA 3J81O 4E7HA 4FM1A 2W42A 1TUYA 4FLUA 4BE0A 1RT5A 5KTQA 4FM0A 2A1RA 1BIZA 1NBWA 1HKGA 1QVGM 1N34K 1VSIA 4DSFA 3L4QA 4K0KK 3J8AA 1YJNN 1BA0A 4BQLA 3PX0A 1KVAA 1TK0A 4UY8O 3THYB 3O9RA 2A41A 2O4GA 1SL1A 2OPQA 4YORA 1TKZA 4CJQA 1NOYA 4BR4A 1GLJO 3N4QA 3HVRA 3SQ0A 3G6EN 5CHIA 1G15A 2FF6A 3IKMA 4B9UA 4ISFA 1ZBSA 3LDOA 3CPWM 4BR5A 4E19A 4YDUC 2KKZA 4GMJB 1IKWA 5JS2A 4EHUA 4BROA 3KLEA 3DLEA 5KPTA 1S1XA 1K8KB 1W2BM 2HVIA 1HYVA 4IZ9A 3RSEB 3SQ1A 2OA8A 3RRGA 1VSMA 5M1FA 2QI2A 4M63C 3HXMA 2O8DB 2H3GX 4FL9A 2OPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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