2Q0UA

Structure of pectenotoxin-2 and latrunculin b bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
351
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
total genus 122
structure length 351
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0uA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0uA03
4O8KA 3F9MA 1KXPA 4A61A 3O5BA 4CZGA 2ZF5O 3FFKB 3CJCA 4AM6A 1BA0A 1QQMA 5BRDA 3B8AX 1SAZA 3C7NB 3SMSA 2IIRA 4BREA 1RFQA 2Q2RA 4CZMA 4EIAA 3ZETB 4EFHA 3DXMB 3QMLA 4BROA 3ATUA 1NGEA 2EWSA 1YUWA 5KPZA 3A5MC 2IVNA 3MK6A 4FWMA 5FPMA 5AQGA 1BO5O 3D7EO 1NBWA 5F2RA 3KHYA 3L4IA 3VEOA 5BPNA 5LJVA 4BRDA 5AQTA 5EY4A 5AZIB 1CZAN 1MWKA 2E1ZA 4FPAA 3HBTA 1DEJA 1YAGA 2QWPA 2V7ZA 4GY2B 4BR0A 1ZXOA 2W41A 2CH5A 1MA9B 3AY9A 1NGDA 1ATRA 2P9NB 4RCHA 4BRAA 4CBXA 1D4XA 2NZTA 4NB4A 3P4IA 1GLFO 2QWMA 4B1VA 1X3NA 2W40A 4HWIA 5E84A 2ZGZA 3ZEUA 3U9DA 3C0BA 2E2OA 4BR5A 4BVOA 3ENHA 1E4GT 2Q31A 2P9IB 4XH1A 3DXKA 3H3OB 3CHWA 5AQQA 4K42A 4FWKA 3O08A 2GWKA 3VESA 2A3ZA 3QB0A 3W3DA 1K8KB 3H6EA 1NGCA 3FZFA 3QFUA 1U2VB 4BRQA 5AQSA 2FF6A 4BQLA 3O1WA 3VEZA 4BRIA 3A5OC 2YHWA 4YDUA 3DAWA 5BPLA 4BRCA 4B1ZA 4WQ4A 3L6QA 3RSEA 3VPZA 2BUPA 3C7NA 4FPBA 4XH4A 4BRNA 1BUPA 3R8EA 3L0QA 3ULEB 4BR2A 4E1JA 4BVPA 3DXMA 5AQLA 5JLHA 4QS7A 1R59O 4FSVA 1QQNA 1E4FT 3UB5A 4CZKA 4FWSA 4FWNA 3H45C 3AAQA 3WXKA 5ADXH 4IJAA 1HX1A 2YI1A 2HOEA 2I7NA 4HTLA 2FSNA 2P9UB 3QFPA 4MO5A 2ZGYA 3HSCA 4WQ5A 2GTDA 3DXKB 4H0TB 3O1BA 2GEMA 2A40A 2NLXA 2ASOA 4I6MA 4PKIA 1MWMA 3TU5A 4NO7A 4M7XA 2QWNA 4WYBA 3VOVA 2PAVA 5BR9A 2Q0RA 2OANA 5AFUA 2A42A 4ISFA 4DCHA 3HTVA 1T6CA 5AQJA 5LJWA 1TYQB 4BG9A 5CE3A 2IVPA 4JD2A 3M1FA 2P9IA 2Q0UA 2GELA 3RSEB 3BUZB 1NGAA 2P9LA 3HZ6A 3VF6A 4CZHA 4H5WA 4C23A 1YXQA 2FLOA 4JAXA 3VENA 2A41A 3U9ZA 4BC3A 3VERA 2YJFA 1K8KA 1HKGA 1U2VA 4FL9A 1KAZA 3VGLA 3MN5A 3CJ1A 5ELZA 2QWOA 4H0OA 3GOIA 1H1VA 4PKHA 2NRHA 2QWQA 1HLUA 3LDQA 1QZ5A 3IUCA 2YJEA 4IJNA 3O80A 5AQIA 1Y64A 3ULEA 1V4SA 4K25A 3DWLA 4H0VB 4I6MB 3MN6A 3O6WA 5EVZA 4BRFA 3HI0A 2P9SB 3UKUA 2YHXA 1X9JA 3CQYA 2GWJA 2CGLA 3G25A 3EL2A 5BPMA 1Q18A 2FXUA 4XEIA 3WEEB 2CGJA 1BU6O 2P9UA 2AA4A 3FZMA 3FGUA 4BG8A 3M6GA 4B1WB 2D0OA 4JD2B 4JNEA 4LC9B 1ZBSA 3ATVA 1DKGD 4BRHA 5E26A 4A62A 1IG8A 2P9LB 3DJCA 3ZX3A 1T44A 3LM2A 4ISEA 5AQZA 3I8BA 3VF4A 2QWRA 4DB3A 2FF3B 3A8YA 5AQYA 4BRGA 5BN9A 1RDWX 2F9WA 3VEVA 2P9KB 2P9PA 3LDPA 3H1QA 1GLJO 1QHAA 3JXUA 1JCEA 5AQHA 3FR0A 2AP1A 5FPEA 1TYQA 1Z05A 3EO3A 1DGKN 3ID8A 2E88A 2QM1A 2YCHA 3FLCO 4IO8A 5AQXA 4H5TA 4BRKA 4CD3A 3EKSA 1OKJA 3R6MA 4XH5A 5JICA 4RWTA 4YDUC 4H0YB 4K41A 3WT0A 3SLCA 3A0IX 1YVNA 4WQ4C 5BRFA 3CJ9A 4BGAA 1G99A 3CJBA 4FWOA 1NWKA 1XQSC 2UYTA 1KAYA 5AQPA 5TKYA 2Q97A 3UKUB 3CJAA 4RTFD 2HMPA 4FOIA 2PBDA 1NLVA 3FZLA 2WUSA 1JCGA 2CH6A 3MDQA 3VETA 3WXLA 3A5NC 5EX5A 5JLFA 5AQMA 4J8FA 3LM9A 1QZ6A 5KPTA 2Q1NA 3FZHA 1T6DA 2CGKA 3QDKA 2E2QA 3SMPA 3ZX0A 1NGFA 1JCFA 1ESVA 4H5RA 2E1YA 2E20A 3O8MA 4EAHD 3D2FB 3MCPA 5F0XA 2P9SA 3CERA 4FO0A 5AQFA 5AFUH 1P8ZA 2P9PB 5B8HA 1GLAG 5ADXA 3EN9A 1GLCG 3WEEA 5KPRA 4A2AA 3IFRA 4B1YB 3H3NO 2VWBA 4IZ9A 3QBWA 4K43A 3BF1A 4CBWA 4CBUA 4H0PA 2Q36A 4CZJA 4B1UB 1ZC6A 1GLDG 1Z6RA 1NGHA 1WOQA 5LY3A 3D2EA 3SK3A 5KQDA 3WUHA 2E2NA 3I33A 3VEXA 4H03B 2P9KA 4AM7A 1TUUA 3CIPA 4BRLA 5AR0A 1IJJA 3ZX2A 3CJ7A 3KZBA 3GE1A 1BDGA 2D0PA 3GBTA 3R9PA 4M63C 4PL8A 3MN7A 2YHYA 4MLHA 2J4RA 4EHUA 5AZJA 2BTFA 4H5VA 4A2BA 3GG4A 3IMXA 3AARA 4EHTA 4BGBA 1XC3A 5FPDA 3IDHA 4FWPA 3VEWA 3A5LC 2A6AA 1NMDA 4KBOA 4BC5A 2E2PA 3CI5A 1SZ2A 3UE5A 2ASMA 1HJOA 4CZFA 4L3QA 3U4LA 2E8AA 5F1XA 1LOTB 5AQWA 4B1XB 3O4WA 3BEXA 4PKGA 4BC2A 5I9EB 2QWLA 4BQZA 2VYPA 4FWQA 4BR4A 4GNIA 4CJ7A 4Z94A 1S3XA 3EKUA 4CZEA 1NM1A 4H0XB 4BRPA 4MLEA 4M7YA 1GLEG 3HM8A 1RGIA 1BOTO 2V51B 3D2EB 4H5NA 3D2FA 5AQNA 3KVGA 4MO4A 5AQUA 4FWRA 3VEYA 5AQRA 1BG3A 1TUYA 2HF3A 2GUPA 4BC4A 1HKCA 1HKBA 2VCPA 3UKRA 3BP8A 1GLBG 1NGGA 4ISGA 5EOYA 3ENOA 3H1VX 1SQKA 1C0FA 3FE1A 5AZJB 3VGKA 4CI6A 4JHDA 1NGIA 2D4WA 3AAPA 5BN8A 4PL7A 3W0LA 3LDOA 1V4TA 2QW9A 2ITMA 1X3MA 4F9OA 2KHOA 2HF4A 3JS6A 3BF3A 3J8AA 1HUXA 3QBXA 4BR7A 1C0GA 3LDLA 5EXWA 3TPQA 1S22A 2I7PA 1U6ZA 2QXLA 3H46O 3S41A 3WQTA 3GDQA 3OHRA 4CZIA 5FPNA 4CD1A 4O5FA 2D1KA 3MN9A 2V7YA 3WXJA 2V52B 4DQ8A 5AQKA 2A5XA 4IWVA 1XUPO 1BWFO 1MDUB 3CQXA 2DPNA 3ZETA 4JN4A 3LL3A 1NGBA 2FSKA 2IVOA 5AQOA 1QQOA 4WQ5C 2ZWHA 3LDNA 4QS8A 1KAXA 2FSJA 4DHYA 2F9TA 3VF2A 5KQ8A 3SJHA 3MMVA 4Y0WA 1J6ZA 3U8XA 3QICA 3UKRB 4BRMA 3ZEUB 5JMVA 3FZKA 3WXIA 3CETA 3EZWA 5BREA 4BR9A 5AZIA 3VGMA 4JHDB 4IXCA 5BRHA 3M3ZA 1ATNA 3GL1A 4CZLA 4FWLA 1LCUA 2ASPA 5AQVA 1WUAA 2H3GX 3WQUA 4B9QA 1HPMA 1ATSA 2P9NA 4FOEA 4QS9A 1GLLO 1NGJA 1EQYA 1BA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THYA 5M1FA 3O5BA 4JI0K 5C25A 4C8LA 2WC9A 3B8AX 3VQ9A 1QSYA 1VQ6N 1RFQA 4CZMA 4EIAA 3NMUA 4DTXA 1NGEA 1RBSA 4E7HA 5KPZA 4LF5K 2HBMA 1J9AA 4DF8A 1U49A 2YX6A 4FLXA 1BCOA 3KTQA 3L4IA 1R0AA 5EY4A 2NRXA 4Z0UA 4AILC 3CCRN 2KZMA 1EWQA 4BR0A 1YAGA 1CXQA 1T05A 3O4NA 1NGDA 1ATRA 3NHGA 3CCQN 5I3UA 4RCHA 4GW6A 3NF7A 1GLFO 4LD0A 3KLIA 4CFAA 3NGZA 5E84A 3KD5E 4LF9K 3ZEUA 4ICLA 3RMAA 2E2OA 3ENHA 1XNQK 1E4GT 3OYGA 2P9IB 5DM7L 3NF8A 1S72N 4B8AB 3CHWA 4DF4A 4FWKA 4KTWA 2B6AA 1HNIA 2WOMA 3VESA 2G8WA 1CZBA 1WSJA 1BIZA 1QVGM 5KGXA 4DR2K 3QFUA 1U2VB 5AQSA 1HPZA 1RT5A 4BQLA 4KAZA 1NKCA 1U4BA 3O1WA 2YHWA 4MDAA 5CYMA 4DU3A 1UA0A 3ZT3A 5BPLA 5C42A 5IWAK 3EEQA 4CK1A 3RSEA 3VPZA 3K9JA 1BUPA 4FZYA 4DTOA 4E1JA 5JLHA 2VG5A 3THVA 2ZM6K 4CIGA 1XMQK 1QQCA 4QS7A 4FSVA 1WBBA 4N5SA 4YY3K 4CZKA 3V81A 1YIJN 3ZYYX 4TSXA 2RHKA 2QA4N 4FVUA 1ASUA 4K8XA 2HOEA 4HTLA 4YOXA 1M90O 1TL1A 3PLAA 3CQ8A 4WQ5A 2XY6A 2HBJA 3ZT4A 4H0TB 2BH1A 3O1BA 1J5OA 2A40A 4FK4A 1DLOA 2NLXA 2ASOA 4I6MA 4DSIA 1MWMA 4B9TA 4JI2K 3NH2A 1HYZA 1LW0A 5K14A 4DR4K 3NCIA 2A42A 3CMAN 2P9IA 2GELA 3LWMA 3L3UA 4JI7K 4CZHA 4ZTFA 3L4QA 2A41A 4JKDA 1RCHA 2YJFA 1QTMA 4RW6A 1U2VA 2B4JA 1NMNA 4YORA 4FL9A 2IAJA 1LWEA 1BGXT 4NXMK 2QWOA 4JI3K 5J2MA 1RTDA 3PX0A 4FVMA 4M3YA 1LWCA 3KJVA 5CZ2A 1TVRA 1YJWN 3O80A 1Y64A 4N76A 2RF2A 2HW3A 4K25A 5TKWA 1S5JA 3I0SA 1OVYA 1RTIA 2YHXA 1X9JA 3L2RA 1W97L 2YKMA 1L3SA 3LP0A 3E9LA 3FGUA 2YNGA 3AVAA 5KI6A 4LC9B 4FM2A 2OA8A 1OH7A 2P9LB 4NCBA 4LSLA 3I8BA 2QWRA 2JGUA 5C0YA 2X6NA 1EKEA 4X64K 5C24A 5M1KA 4LSNA 5HBMA 3BY5A 3JXUA 1QHTA 5AQHA 3FR0A 2AP1A 3V4IA 1DGKN 4CW7B 2YCHA 3FLCO 5CY4A 4A5BA 4DFKA 1OKJA 3ZLJA 3DOLA 3TAGA 4YDUC 4K41A 4FM1A 3A0IX 4RG8A 4FYDA 3KKRA 2UYTA 3ZT0A 4KKOA 4HUEA 3CJAA 2DY4A 4BE2A 1RT4A 2PBDA 4CGJA 3FZLA 1JCGA 3TAMA 3A5NC 5EX5A 1JLAA 3MEEA 1W7AA 4J8FA 5KPTA 4DTMA 4EP5A 2CGKA 4CF0A 2E2QA 3SMPA 1NK5A 1SS6A 2WTUA 2YNIA 3KWIA 2JWKA 3LWLA 3QO9A 2XO7A 5F0XA 3CERA 4ILJA 4CJTA 3CCMN 4CJQA 1W9HA 4LF6K 3EN9A 4FZXC 1D5AA 4KFBA 4A2AA 3IFRA 3H3NO 1LV5A 3OYAA 4KREA 3QBWA 2E4LA 3BF1A 5GINA 3S3OA 2X6SA 4N47A 1GLDG 5LY3A 3D2EA 3I33A 1RBRA 2PZSA 1TUUA 3TAQA 5M1QA 2HSTA 4DUZK 1CZ9A 3RMCA 3M8RA 4PY5A 3AO3A 4YOWA 4ELUA 1A5WA 3PX6A 1BI4B 3GG4A 3IMXA 4EHTA 4WE1A 5FPDA 3IDHA 4FWPA 4MDBA 4KBOA 3G6EN 3CFRA 4BC5A 4M3XA 3LPUA 3CCVN 4FJMA 3CFOA 1O13A 4KRFA 3I56N 3THXB 1O1WA 4CGDA 3KLEA 3S3NA 3SAGA 2PYJA 5AQWA 3F5TA 2Z1IA 3D0PA 4BC2A 5I9EB 3IKMA 4BQZA 4F3OA 4Z94A 3KLFA 4CEQA 2WFBA 4MLEA 4M7YA 3KKSA 1XI1A 4WCEL 5AQNA 1BOTO 4WFBL 1Z25A 3KVGA 2LSNA 1HKBA 1HKCA 2VCPA 4CHQA 2OTJN 3UKRA 3WXMB 1NGGA 1VQ4N 2RPIA 3FE1A 5AZJB 1WSGA 3NH0A 4JHDA 2D4WA 3W0LA 1VSHA 4CFBA 4DFMA 5J2NA 4DSEA 3RR7A 3CCEN 1NJYA 1C1CA 4CJWA 3M8SA 1X3MA 2VG6A 4PA1A 3AVJA 3BF3A 4DU1A 3JSMA 4BR7A 3OS0A 1BIUA 2EX3A 3S41A 3WQTA 3GDQA 3MCAB 3OHRA 5FPNA 3M8PA 4OGCA 4NCGA 4QOZB 5AQKA 3PUFA 3RMDA 5HRPA 1T7PA 3L2WA 3ZETA 1XMOK 2FBYA 3LL3A 1TKTA 3SQ1A 2IVOA 5AQOA 3C95A 4LF4K 3T69A 4WQ5C 4QS8A 2DFHA 4DHYA 5M1PA 3THWB 3DLHA 3THXA 4LFBK 3MMVA 4Y0WA 4B9MA 3U6FA 3OBWA 5GAHP 3QICA 3G71N 4BRMA 5JMVA 4DSJA 1J53A 3VGMA 4IXCA 4I9LA 5JENA 2XY8A 1WN7A 4G9ZA 3AO2A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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