2UYTA

Structure of l-rhamnulose kinase in complex with adp and beta-l- rhamnulose.
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RHAMNULOKINASE
publication title Substrate Spectrum of L-Rhamnulose Kinase Related to Models Derived from Two Ternary Complex Structures.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
molecule tags Transferase
total genus 172
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2007-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2uytA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2uytA02
4NO7A 3IFRA 3QMLA 1LCUA 4IWVA 1BUPA 1IG8A 2Q36A 4K42A 5AQTA 4CZHA 4M7XA 2Q97A 4A62A 4O8KA 2A41A 4H5NA 2IVNA 3CQYA 3ATUA 4JHDB 2YHXA 3IMXA 1TUUA 4IO8A 2FSKA 3ATVA 5CE3A 4YDUA 3WQUA 1JCGA 4BRLA 4MLEA 4CBWA 3LDOA 4BC2A 4CI6A 4FWNA 1J6ZA 4BRQA 1OKJA 4FWSA 3UKUA 3A5OC 4ISEA 2P9NB 5AQQA 3MDQA 4H0YB 1BA0A 4DHYA 1DGKN 2E1ZA 4GY2B 3EZWA 5KPZA 1C0FA 4BR7A 2QWRA 2W40A 2QWLA 3ZETB 2P9UB 1NGFA 3JS6A 5BN9A 3LDPA 4XEIA 5BPNA 3I8BA 2V52B 3SMSA 2WUSA 3VF6A 3O5BA 3RSEB 3LL3A 4CD3A 3FZLA 3VF2A 2D1KA 4B1ZA 4ISFA 5KPTA 1V4TA 3GDQA 3EO3A 3HBTA 3EL2A 3A0IX 5AQGA 3ZEUA 3DXMA 1GLFO 1RFQA 3L4IA 4MO4A 3G25A 5AZJB 5AQSA 4BQLA 3VOVA 5I9EB 4WYBA 4BR0A 3FZMA 3BP8A 2FSNA 5TKYA 2F9TA 1GLAG 1NBWA 3AARA 4BRFA 4RWTA 4H0PA 5AQHA 1JCEA 4JHDA 4YDUC 4BR4A 3EN9A 3J8AA 3BUZB 3CETA 4EFHA 4L3QA 5BR9A 3R6MA 1NMDA 3A5NC 2QWNA 4CZJA 1C0GA 1ATNA 4BR2A 2P9NA 3H6EA 3BF3A 3AAQA 3CJAA 3HI0A 3LDNA 2GEMA 5AQYA 1NGCA 3CJ1A 1S22A 3WT0A 3P4IA 2F9WA 5AQKA 4BREA 4H0XB 3VF4A 2KHOA 3EKSA 2GUPA 5JMVA 3VEZA 3RSEA 5AQXA 3U8XA 4QS8A 3KZBA 3LDQA 1YVNA 1IJJA 4KBOA 3H1VX 5EY4A 4BGAA 4WQ5C 5LJWA 5AQMA 4BR9A 3VETA 2CH6A 3MN5A 3I33A 4CD1A 2P9KB 3KVGA 3SJHA 1E4GT 2P9PB 2Q0RA 1QQMA 4HWIA 4O5FA 5AZJA 4BG9A 1ZBSA 3CJ7A 2A5XA 3VGLA 3ZEUB 3UKRB 3DXMB 3MMVA 3O08A 5AQLA 1NGAA 2BUPA 5BN8A 3H45C 1BOTO 2QM1A 3DJCA 3HTVA 4H0OA 3QB0A 2E2PA 4FWOA 1BDGA 3VENA 1D4XA 5ADXA 4PKIA 4A61A 3D7EO 2CH5A 3QDKA 1ATSA 5BRDA 3ULEB 1U6ZA 4CZMA 2W41A 4FOIA 3JXUA 4A2AA 4CZEA 4CBXA 2E2NA 5E84A 3FFKB 4BRKA 4E1JA 1NGDA 4FWRA 4LC9B 4XH5A 2HF3A 1S3XA 3CJCA 4BRIA 4JAXA 4B1YB 1X3NA 3CJBA 3AY9A 1XUPO 3HM8A 2V7ZA 3SLCA 2VYPA 3S41A 5AFUA 2E2QA 2D4WA 2GTDA 4J8FA 2FLOA 1WOQA 1NWKA 2FF3B 5E26A 5AQRA 5KPRA 3CIPA 3LM9A 4XH4A 5EOYA 3U4LA 1HLUA 2P9KA 2PAVA 2PBDA 3GBTA 4BC4A 4CZLA 5FPDA 1G99A 3A5LC 5AR0A 1EQYA 3VEWA 2P9PA 4IJNA 4EIAA 1TUYA 4GNIA 2ASOA 4PKHA 3ENHA 1KAXA 4BROA 1HJOA 4AM7A 2NZTA 4EHUA 2V51B 3UKRA 1MA9B 2Q2RA 4BVOA 3A8YA 4H5WA 2P9LB 3ZX0A 3BF1A 3B8AX 1HPMA 2E8AA 3DXKB 3FLCO 1QQNA 4FWPA 4H0TB 4PL8A 5EXWA 4BR5A 3WEEB 4RCHA 4RTFD 1MDUB 2DPNA 3ULEA 5BREA 2HF4A 1GLBG 4JD2A 5EVZA 2FXUA 4BQZA 1P8ZA 4BRNA 1BA1A 5F0XA 4I6MB 3R8EA 2ZWHA 4A2BA 2E2OA 4M7YA 1HUXA 2VWBA 3H1QA 3W0LA 3O1BA 4BRPA 3BEXA 4CZGA 2GELA 2YHWA 3O4WA 2YHYA 3OHRA 4B1XB 1GLDG 5AZIB 1H1VA 4BRMA 5BRHA 4FWMA 2Q0UA 1Z6RA 3H46O 4B1VA 5LJVA 2P9IB 4CJ7A 2VCPA 1GLLO 1QQOA 3FZKA 5EX5A 5KQDA 4CBUA 3WXJA 3GE1A 1X3MA 3W3DA 5BPMA 3M3ZA 3SMPA 2D0OA 2E88A 3QICA 2QWQA 3C0BA 5F1XA 4BC3A 1T6CA 3QBXA 2E20A 4FOEA 1MWKA 4HTLA 4BVPA 4H5RA 2I7PA 1ZXOA 3LM2A 2I7NA 3ID8A 3ZX3A 4F9OA 4CZIA 5ADXH 3QBWA 4DCHA 2BTFA 3U9ZA 3A5MC 4ISGA 4EHTA 1QHAA 2IVOA 5AQUA 4PKGA 2P9LA 3VEVA 4XH1A 4BGBA 5AQWA 3DXKA 4H5VA 2ZGZA 1YAGA 3FGUA 2Q1NA 3C7NB 3MK6A 3WEEA 1SQKA 4BRDA 4NB4A 4AM6A 3O80A 4BRCA 2H3GX 4DQ8A 1ZC6A 3SK3A 2GWJA 4FSVA 1TYQB 1XC3A 1YUWA 2ZF5O 1R59O 1K8KA 4K41A 5AFUH 4I6MA 5BRFA 3O8MA 3CERA 3VEXA 4JD2B 3F9MA 3UE5A 4FWQA 4H5TA 3CQXA 3R9PA 3ENOA 1X9JA 3VEYA 5JICA 2ZGYA 1DEJA 2ASPA 3HSCA 3MN9A 1Z05A 5AZIA 3KHYA 4Y0WA 3EKUA 2FF6A 3TPQA 4FWKA 1HKCA 1SZ2A 2P9IA 5BPLA 5AQJA 4DB3A 3D2FB 3O6WA 5FPMA 1NGHA 2QWPA 4QS9A 2QXLA 3ZX2A 1BU6O 1CZAN 2GWKA 2YJFA 1GLEG 3UB5A 2P9SA 2HOEA 2NLXA 5FPEA 3MCPA 1V4SA 3GL1A 3VGMA 4BC5A 1RGIA 3H3NO 2YI1A 3O1WA 3CHWA 2UYTA 4IXCA 5JLFA 1RDWX 3CI5A 1ESVA 1HKBA 3VPZA 2A6AA 3M6GA 1LOTB 3H3OB 5AQIA 3WQTA 5ELZA 1T44A 2A40A 4QS7A 1U2VB 3M1FA 3C7NA 2QWMA 1GLJO 3D2EB 4JN4A 1NGEA 4WQ4A 2IVPA 3DWLA 1ATRA 1BO5O 5B8HA 2D0PA 2CGJA 5AQZA 1TYQA 2QW9A 2CGKA 1E4FT 2OANA 1BG3A 1KAZA 4WQ5A 4B9QA 3LDLA 3MN6A 3U9DA 4FO0A 2IIRA 2EWSA 3WUHA 5FPNA 1K8KB 3IUCA 5AQVA 3WXKA 4M63C 1NGGA 3FZFA 4B1UB 1Q18A 2FSJA 2HMPA 3TU5A 3VGKA 2AP1A 3VERA 2QWOA 4FWLA 1T6DA 4BRHA 4MO5A 2Q31A 2YCHA 3D2FA 3DAWA 5AQOA 1HKGA 4CZKA 3GOIA 4K43A 3IDHA 1QZ6A 4K25A 1NGJA 4BRGA 4PL7A 1GLCG 2ASMA 5AQPA 3MN7A 3FR0A 1MWMA 4FL9A 3HZ6A 3FE1A 1NGBA 2YJEA 1QZ5A 2P9SB 5KQ8A 3CJ9A 1DKGD 5AQFA 3VESA 5LY3A 1WUAA 3L0QA 1NLVA 3UKUB 4C23A 1BWFO 1JCFA 3L6QA 3QFUA 1U2VA 2A3ZA 3WXIA 4FPBA 5AQNA 3ZETA 4EAHD 3D2EA 2P9UA 5F2RA 4WQ4C 4BRAA 3VEOA 4MLHA 5JLHA 4H0VB 4CZFA 4Z94A 2ITMA 1NM1A 1YXQA 1XQSC 4BG8A 2A42A 1HX1A 4FPAA 2CGLA 2V7YA 4IZ9A 3QFPA 1SAZA 3AAPA 1NGIA 4B1WB 3GG4A 4JNEA 1Y64A 2J4RA 2NRHA 2AA4A 4IJAA 1KAYA 1KXPA 2E1YA 4H03B 3WXLA 3FZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NO7A 4HUGA 3QMLA 1L3VA 3DLBA 5AQTA 4FJGA 2NRTA 4YOYA 3KTQA 2HNYA 4Z4HA 1S1WA 1YITN 3SQ4A 2YHAA 4JKBA 3B6PA 2YHXA 3IMXA 1TUUA 4DUZK 3ATVA 3WQUA 1OVQA 4CW7B 3O9TA 4BRLA 1XHZA 4FWNA 1D5AA 3DMJA 1T03A 1J6ZA 4DS4A 4FWSA 3UKUA 1OH8A 3A5OC 4ISEA 2P9NB 3CCEN 4GV6A 1RDBA 1BA0A 3MWPA 3DM2A 4DTJA 2KKZA 3EZWA 1QE1A 1NJXA 4BR7A 2ZE2A 5BN9A 3SV3A 1B92A 4E19A 3LDPA 4W5NA 4XEIA 5BPNA 4DSKA 2G8WA 2V52B 2WUSA 4CEFA 1TKXA 3ZSQA 3LL3A 1WSIA 1VSEA 4FZYA 4B1ZA 3NF8A 2G8VA 1SV5A 1NKBA 5C2DA 3A0IX 1KFDA 2WOMA 4E7LA 3L4IA 3G25A 1Q8IA 4HVJA 5I9EB 3OW2M 1FW6A 1VQMN 4GVEA 4DV7K 4BR0A 5M1QA 2FSNA 5TKYA 3L3UA 1NBWA 2QI2A 3EY1A 2Z1JA 2F96A 4BRFA 4BWJA 4RWTA 4H0PA 4U67L 1JCEA 4YDUC 1W0HA 3EN9A 4DSJA 5K14A 4W5QA 4L3QA 4RW6A 4M45A 3R6MA 1NMDA 1QQCA 2QWNA 3T69A 1C0GA 4CK1A 3OYGA 1ATNA 4Y1DA 4IEIA 3BF3A 3TTCA 4AHTA 1I3AA 4AHRA 3OYAA 5AQYA 3J7YP 2OTJN 2BGGA 1TKZA 3O9UA 4ZTFA 3P4IA 1EO1A 2F9WA 1LV5A 3CD6N 2KHOA 5HRSA 2HBJA 3U3GA 5C15A 1VQ5N 4QS8A 1YVNA 1U4BA 4KBOA 4KHUA 4IOXA 4BR9A 2CH6A 1Q82O 3I33A 3E9LA 4O4GA 1HJRA 4CJTA 1E4GT 4HWIA 4O5FA 4H4OA 3ITHA 2G8HA 4BG9A 1ZBSA 4NCAA 3SYZA 3UKRB 1VSMA 1W9HA 4FJHA 4B08A 3H45C 1BOTO 1D8YA 3MAQA 3HTVA 3MWTA 5HOOA 2E2PA 1D4XA 5ADXA 4A61A 3D7EO 2CH5A 3E66A 5BRDA 2KTQA 1U6ZA 1C0TA 1K6YA 3SUQA 3O9RA 4LH5A 1WSFA 3HPOA 1HQEA 1JXEA 2OYQA 4KTZA 1NGDA 5M1FA 3CJCA 1RTIA 4KHWA 1S6PA 3HM8A 2QXFA 2V7ZA 5HLFA 4DR6K 2GTDA 4TSXA 3P39A 3E9PA 3IG1A 2FF3B 2O8FB 3JAMO 3CFOA 1VRUA 4J2BA 1J53A 1ZBUA 4J2AA 2B4JA 5EOYA 1HLUA 2NNWA 3GBTA 3U4LA 3A5LC 5AR0A 1Z25A 3M8PA 5CYQA 1SUQA 1BQNA 3AO4A 4HHTA 4EIAA 4GNIA 4PKHA 2OZSA 3PV8A 2IGIA 3HXMA 1HPZA 4DTOA 4IEEA 4DS5A 3SUNA 3ZT4A 4FW2A 4JEPA 2Q2RA 1IKVA 2D5RA 3A8YA 1YJNN 1C1AA 2P9LB 1NK6A 3O9QA 3ZX0A 4FLVA 4FLUA 4H0TB 3HP6A 1VQLN 3KLEA 3DLGA 4CF1A 4FJLA 1KSPA 2JGUA 4JD2A 3L2RA 2X74A 1YTAA 4FJIA 4I6MB 4FJMA 2VGMA 3K5LA 2E2OA 4OX9K 3SJJA 4CZGA 2KZMA 1HNVA 4CHZA 2YHWA 1KRPA 3ZSZA 4NLCA 2YHYA 4CHYA 4BRMA 3RTVA 2OPPA 2XY7A 2HW3A 4CF0A 4B3RK 2YHBA 4WE1A 2QTDA 3ASMA 1X3MA 3W3DA 3D45A 4CGDA 3M3ZA 3G10A 1W2BM 2D0OA 2E88A 3C0BA 1SL2A 1W7AA 1HYVA 3AO1A 3MECA 3U6FA 4BVPA 2I7PA 1ZXOA 4DFPA 3LM2A 4DV6K 5ADXH 3SPZA 2F4VK 2W6KA 1W97L 4KHSA 3AVFA 4WFBL 4XH1A 4ID1A 1CXUA 3V4IA 4FVMA 4BGBA 3KLFA 1O13A 2Q1NA 3WEEA 1RBTA 3O3HA 3LZIA 3I0SA 4M3TA 2H3GX 4DQ8A 3AVKA 3HVTA 1N8RO 1YVUA 3LDSA 4FSVA 3MX2A 5IT9O 5LMNK 3P38A 5BRFA 3O8MA 3G0ZA 4JD2B 3UE5A 4FWQA 5M1NA 2QKKA 2YNFA 3JYTA 4X62K 2NRZA 2ZGYA 3AVCA 4N5SA 4DTSA 2ASPA 1RNHA 4HUFA 4ELTA 4FZXC 5AZIA 1ILYA 3KHYA 4Y0WA 4FJNA 3U3YA 5HP1A 3TPQA 5M1PA 2P9IA 3MCAB 3A2FA 4JRQA 4KV8A 3O6WA 1S6QA 4QS9A 1S1UA 4JK7A 1CZAN 1GLEG 3NBPA 3UB5A 3DLKA 2P9SA 3HYFA 1NK7A 3ZT1A 5FPEA 3MCPA 1WLJA 3TABA 2O8BA 3R1XA 4AH9A 3LPUA 1JLAA 1TL1A 3SNNA 5JLFA 4NCGA 3S3MA 1SL0A 1S1TA 3VPZA 2X6NA 1EXQA 2A6AA 3M6GA 3PSFA 2B6AA 4PUOA 3KK2A 3KLIA 1CXQA 1U2VB 3TSUA 4Z0UA 4JN4A 3G6EN 1U48A 1T05A 5AQZA 4OGEA 5DM6L 5KRTA 2QW9A 2UXDK 5FROA 1KAZA 2QKBA 4PY5A 4WQ5A 4EP5A 4CJKA 3SAHA 4RW8A 2Z1GA 1JXBA 5HBMA 3H08A 4LH4A 1IKXA 3THYA 4YOXA 3S9HA 5FPNA 3L2UA 3VQ6A 1BIUA 3WXKA 4DR4K 1WBBA 1YTUA 1NGGA 1Q18A 1TK5A 4N41A 4IG3A 3ZSYA 1RTJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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