2UYTA

Structure of l-rhamnulose kinase in complex with adp and beta-l- rhamnulose.
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords RHAMNULOKINASE
publication title Substrate Spectrum of L-Rhamnulose Kinase Related to Models Derived from Two Ternary Complex Structures.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
total genus 172
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2007-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2uytA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2uytA02
3VEVA 2V7YA 3MDQA 3J8AA 4H5RA 5I9EB 4FWNA 2DPNA 4DQ8A 4I6MA 3WXKA 3WXLA 4HWIA 1T6CA 3CIPA 5AQTA 5F0XA 2D0PA 3O1WA 1GLDG 3HI0A 2AP1A 3GDQA 1RDWX 3P4IA 3MMVA 4FSVA 1EQYA 4CBXA 1U2VA 3A5NC 4XH1A 1BA1A 3JS6A 4I6MB 4EAHD 5AQPA 1E4FT 5AZJA 3BF3A 2YCHA 3BF1A 2A41A 2I7NA 5AQKA 4JD2A 1MWMA 5AQMA 3SJHA 2J4RA 3O6WA 1XUPO 4BROA 2QWOA 4ISEA 3H3OB 1R59O 5AZJB 3VF2A 5EOYA 5JLHA 4JD2B 3H1QA 4FWPA 2FF3B 2GTDA 3VPZA 3ZX0A 4BRKA 1C0GA 4HTLA 2PAVA 4YDUC 3UKUA 2P9IA 1SZ2A 4FOIA 1NLVA 4H0VB 4A62A 1NGBA 1X3NA 3I8BA 3M6GA 4XH5A 5AZIA 1U6ZA 1GLJO 4RCHA 3R6MA 4BGAA 4BRHA 4CBUA 5BRFA 4FWOA 3IMXA 5AQWA 1KXPA 4KBOA 3M1FA 3GOIA 1LOTB 4BC5A 2P9IB 4CZLA 2D0OA 1BOTO 4Z94A 4ISGA 1C0FA 5AZIB 2CGLA 4M7YA 4M7XA 2WUSA 4WQ4C 1NMDA 1NGDA 2E20A 1NM1A 2Q97A 1V4TA 3O4WA 4FWRA 2A6AA 3ID8A 1BG3A 3EKUA 4Y0WA 3U9ZA 2V52B 2A40A 1XQSC 2CGJA 2F9TA 1KAZA 2GELA 4CBWA 2P9SA 4H5TA 4CZFA 1J6ZA 4NO7A 4FL9A 4BR0A 4H0PA 4PL7A 3FGUA 5BRHA 2HF4A 2CGKA 2FSKA 3ATVA 2P9LA 5E26A 3FZFA 1T6DA 3FZMA 2IVNA 2KHOA 4MLHA 2D4WA 5EVZA 3L0QA 5BPNA 4BC2A 3C7NA 4A61A 2A5XA 1YUWA 3VF6A 2P9SB 4WYBA 4GY2B 5AQVA 1TUYA 5FPEA 1NGAA 4BRQA 3FFKB 3MN5A 1E4GT 2P9LB 3S41A 3FZKA 3O5BA 3CJ7A 4NB4A 3HZ6A 4JNEA 3C7NB 2NLXA 2P9UA 5BN8A 5AQIA 3AY9A 5BN9A 5AR0A 4BVOA 2GEMA 1X9JA 2VYPA 3CJ9A 4K43A 4F9OA 2QWMA 5AQYA 4PL8A 2FLOA 1WOQA 3FE1A 3L6QA 4YDUA 5AQZA 4MO5A 3GE1A 1Q18A 1Z6RA 3MN6A 4FWLA 4ISFA 4BRNA 1GLCG 4A2AA 2ASMA 5AQOA 2P9UB 3O08A 4FWQA 4B1WB 4JHDA 3EZWA 2YJFA 3AAPA 3G25A 5AQFA 1G99A 4H5VA 4BG8A 1NGEA 1T44A 2NRHA 1DEJA 3KHYA 2Q0UA 4CZMA 4WQ4A 4AM6A 1HKCA 3D7EO 1BA0A 1QQOA 4JHDB 1OKJA 1NGHA 3H46O 2VCPA 2E88A 3M3ZA 1YVNA 3WEEA 5ELZA 1YAGA 1H1VA 3QFUA 1LCUA 2E2OA 4DB3A 2YHWA 3DAWA 3GG4A 3RSEA 3EL2A 1U2VB 2IIRA 4CZGA 4IJNA 1GLAG 3W3DA 1HJOA 3WEEB 5AQHA 2VWBA 4EIAA 1TUUA 3VEWA 2HMPA 3LM2A 2GWKA 1DGKN 4FPBA 3GL1A 2YHXA 2CH5A 5BPMA 3CERA 3LDOA 2D1KA 3VEOA 2BUPA 4BRGA 3HBTA 3KVGA 4BQLA 2FSNA 4BR9A 2QWRA 2F9WA 3DWLA 1BWFO 2FF6A 3WT0A 4BRLA 2PBDA 1NGFA 3VF4A 1D4XA 2A42A 5LJVA 3VETA 3O80A 3UKUB 3VOVA 1BO5O 1ATRA 1MWKA 2EWSA 3UE5A 2FSJA 3DXKA 3IDHA 3JXUA 5ADXA 1NWKA 4H5NA 4BR7A 3H1VX 4CD3A 3DXMA 4CZKA 4XH4A 1QQNA 1YXQA 3BEXA 2YJEA 2Q1NA 1Z05A 1IJJA 1X3MA 3DXKB 3VGLA 5FPDA 5AQXA 3A5OC 3U9DA 1GLFO 4CJ7A 1RGIA 3DXMB 4PKHA 5KPRA 3WXJA 1MDUB 3QMLA 5AQUA 3UB5A 1JCGA 1CZAN 3CJCA 4RWTA 1HUXA 1S22A 4WQ5C 1XC3A 3B8AX 1JCFA 3H45C 5JLFA 3IUCA 5AQLA 5AQNA 1S3XA 3ULEA 5ADXH 3QB0A 4H0XB 4EFHA 4BR5A 1QZ6A 3SLCA 2Q0RA 2Q36A 3MN7A 4GNIA 3VEZA 4CZIA 1ZBSA 3R9PA 1QHAA 3ATUA 5KQ8A 3VENA 4PKIA 3SK3A 1GLEG 5F2RA 3ULEB 2CH6A 2GWJA 1ATSA 4FOEA 3CQYA 2ZF5O 3KZBA 2ZGZA 4AM7A 2QWNA 1BU6O 2HOEA 4LC9B 3VESA 3W0LA 3QFPA 4FWSA 4J8FA 5FPNA 3BUZB 1ESVA 3L4IA 3CQXA 5BR9A 4O5FA 1HPMA 5F1XA 4E1JA 1DKGD 2QWQA 3FLCO 4B1VA 3WQTA 5E84A 4MO4A 3FZLA 2QWPA 4CZJA 3CI5A 1ZXOA 1KAXA 2ASPA 2BTFA 2E2NA 4BR4A 4DCHA 4A2BA 1V4SA 4O8KA 1QZ5A 3F9MA 2W41A 4B1UB 3WQUA 3MN9A 4BG9A 5JMVA 2I7PA 3QBWA 3AAQA 4EHTA 1JCEA 3SMSA 5EY4A 2IVOA 3A5MC 3VEYA 4CZHA 3UKRA 3QDKA 4BRIA 3CETA 4IXCA 4B1XB 2E1YA 4BC3A 4CI6A 3FZHA 1P8ZA 2E1ZA 3ZEUA 4BR2A 5AFUA 3HSCA 5EX5A 2GUPA 4H0TB 2UYTA 3H3NO 4B9QA 4FWKA 3UKRB 3EN9A 3BP8A 5KQDA 4WQ5A 4EHUA 3MK6A 4H03B 2V51B 1HX1A 4QS7A 2E8AA 3GBTA 3RSEB 5B8HA 3ZEUB 2E2PA 3WUHA 1KAYA 2ZWHA 3VGKA 3FR0A 2H3GX 4FPAA 4BRAA 3MCPA 3LDNA 3D2FA 3O8MA 3ENOA 4K41A 2P9NA 2QW9A 2Q2RA 1TYQA 2QM1A 4FWMA 4B1YB 3CHWA 3SMPA 3QBXA 4H5WA 4B1ZA 3VERA 1HLUA 5LY3A 4JN4A 3DJCA 5AFUH 3D2EA 3LDPA 3R8EA 3D2FB 5BRDA 3CJ1A 4H0OA 5BREA 2P9NB 3VEXA 1TYQB 3CJAA 3I33A 1ATNA 4BGBA 1MA9B 4BREA 5KPZA 1WUAA 1NGGA 3LDLA 3U8XA 4XEIA 1SQKA 1GLLO 1K8KA 3D2EB 2P9PA 1IG8A 3A5LC 2NZTA 4M63C 3TPQA 3ZETA 3HTVA 4BRFA 1SAZA 3WXIA 3CJBA 3IFRA 1ZC6A 4IO8A 1BUPA 2FXUA 3EKSA 5TKYA 1BDGA 5AQGA 1Y64A 3HM8A 3ZX3A 3C0BA 3OHRA 1K8KB 2QWLA 2P9PB 5AQJA 3ZETB 4QS8A 1NGJA 2HF3A 5CE3A 3LL3A 4K25A 2ITMA 1GLBG 3AARA 5AQQA 2QXLA 1NGIA 4FO0A 3A0IX 4BVPA 4BRCA 4BRDA 5BPLA 3A8YA 2IVPA 1HKGA 3TU5A 2W40A 4BQZA 3O1BA 2P9KA 4C23A 3ENHA 4MLEA 4JAXA 5KPTA 2E2QA 1NGCA 4K42A 3LDQA 2ASOA 4PKGA 5FPMA 2YI1A 1NBWA 4DHYA 4CZEA 5AQRA 4CD1A 5JICA 2YHYA 5AQSA 3U4LA 3VGMA 4IZ9A 4L3QA 4QS9A 1RFQA 2P9KB 4H0YB 4BRPA 4BC4A 2V7ZA 2ZGYA 3H6EA 3QICA 5EXWA 5LJWA 2A3ZA 3EO3A 1QQMA 3ZX2A 3LM9A 4RTFD 4BRMA 2OANA 4IJAA 4IWVA 2Q31A 1HKBA 2AA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJ9A 4I2PA 2F4VK 3TSPA 5I9EB 3PV8A 4R79A 1YF5L 1HNIA 2Q3SA 3WXLA 1T6CA 3SBTA 3CIPA 3AVCA 4FJKA 5AQTA 3P39A 4KHYA 3GDQA 1RDWX 1S9EA 1QSLA 3CPWM 3LP2A 3MAQA 4DV6K 4DF8A 4CBXA 3A5NC 4XH1A 1BA1A 4I6MB 3LP1A 4E7LA 2YCHA 4JD2A 2O8DB 5AQMA 4EZ6A 4E1NA 2W42A 2UXDK 4BROA 1Q81O 4ISEA 1XC9A 2RN2A 1R59O 2IC3A 3F73A 1S1XA 5AZJB 4Z4HA 1YJ9N 5M1FA 3RMBA 1KTQA 3V1OA 4HTLA 2PAVA 3LAMA 1EO1A 3VQEA 4LF5K 3UKUA 4FOIA 4AHCA 4A62A 3THVA 4DFMA 3VQ8A 1VRUA 4BGAA 4KRFA 4KV8A 3TSQA 3M8RA 4FWOA 4DUYK 4FJIA 4RG8A 1KXPA 3GOIA 2P9IB 4E0DA 4CZLA 1BOTO 4ISGA 1EP4A 1KLMA 1RTHA 1C0FA 3DOLA 2CGLA 4DR3K 4WQ4C 1NMDA 2HHXA 1NGDA 3TR8A 3HO1A 1V4TA 4FK0A 1KCFA 2A6AA 4YOVA 3RMDA 4FJLA 2FBTA 1XQSC 4KB1A 2F9TA 1QSYA 1YJWN 2VWKA 1J6ZA 3VQ5A 4FL9A 4AHVA 3AVJA 4KHNA 3FGUA 1FK9A 4DLEA 4KREA 3FZMA 4C1NI 4MLHA 1IBMK 1TKZA 4A61A 2G8UA 1YT3A 4DFPA 3KKRA 3HXMA 1YUWA 3VF6A 3V9SA 1TUYA 5FPEA 4BRQA 2RKIA 3MN5A 1JKHA 3SV3A 1E4GT 2VQFK 4M3RA 4A57A 1TKDA 3ZLJA 4CFDA 2P9UA 3SV4A 2NRXA 4F9OA 3PO4A 2QWMA 2FLOA 4CJPA 1WOQA 4WE1A 2O8BA 4YDUA 3O9QA 3D45A 5C2FA 4FWLA 1Z6RA 4ISFA 4A2AA 4LF6K 2ASMA 3AGRA 4E7HA 4FWQA 4B1WB 5AQFA 4B8AB 5BR8K 4FZZA 4CEQA 1WSEA 1DEJA 4C8NA 4HVJA 3KHYA 5GIPA 3B6OA 4CZMA 2HSTA 3THYA 2VGNA 2YNGA 1S72N 4Z4CA 2VCPA 1JLGA 4PY5A 5C0YA 1FXXA 1KVAA 1IKYA 1WSGA 3CCJN 1C0UA 4KI6A 1ZBUA 3AVHA 3HPOA 2HBMA 1N6QA 2QK9A 1XNQK 1NG9A 1SKSA 4B9VA 2HHHK 3VQBA 2HMPA 3LM2A 2GWKA 1DGKN 3GL1A 3ZT4A 4RW7A 2CH5A 3SCXA 4LH5A 3O3FA 3CERA 3LDOA 3U3YA 3TARA 1RDAA 3K5MA 3ZSOA 3HBTA 4FLYA 1NK8A 4LD0A 3QNOA 4FJ8A 2F9WA 3DWLA 1BWFO 4JI7K 4IOXA 1HR0K 3WT0A 4BRLA 4CK1A 4KI4A 2FC0A 1NGFA 1CZBA 4BE0A 3VA0A 2Z1JA 3L2WA 5DM6L 3RWUA 3UKUB 2HVIA 3F9KA 2X6SA 1MWKA 3UE5A 1OH7A 4IFEA 4O55A 1TV6A 3ZSVA 4IO9L 4DKWA 3H1VX 1RBRA 1RT1A 1D9FA 1VSKA 3TSUA 4DV4K 3AA2A 1YXQA 3BEXA 1RDDA 1BCMA 2W6KA 3DXKB 3VGLA 1TK0A 1JL2A 3EE9A 3SUNA 3DXMB 4FM0A 3SPYA 1M90O 3WNFA 5KPRA 3WXJA 1IO2A 2YNIA 3CJCA 3NDKA 4RW6A 3HP6A 4RWTA 1S22A 2GV9A 5JVHL 1P90A 3TAEA 3KJVA 1Z26A 4ILGB 3SJJA 3SUOA 1HNWK 2YHAA 1VAZA 3T69A 2HHWA 3HK2A 1QZ6A 4W5RA 4GNIA 4CZIA 4HHTA 3R9PA 3CMAN 3B6PA 1NKEA 1EX4A 4CE9A 1EWQA 4FM1A 3VENA 5GAHP 1VSEA 4PKIA 3SK3A 4E7IA 2YX6A 4KTWA 2QXFA 3OYIA 3CQYA 2ZF5O 4H4MA 4CGHA 3OW2M 3BUZB 1J5EK 3PIOL 3LZIA 3DLBA 4O5FA 4ILHA 4CEDA 3ULDA 4M3YA 1DKGD 4DTJA 3QIPA 3FLCO 1XNRK 1RILA 1JLQA 2ZJRL 1ZXOA 1J54A 2BTFA 4BR4A 5J2NA 3R3LA 4O8KA 2Z1HA 4L8RB 4Q0BA 4EZ9A 4HUFA 1EKEA 1L3TA 3SQ4A 1D8YA 4O5BA 4BG9A 4DR5K 4CHZA 3QBWA 2PZSA 3SMSA 4DTRA 3SNNA 3UKRA 1IKXA 4FJ5A 2NRRA 3FZHA 2E1ZA 3ZEUA 3PSFA 5AFUA 3CCVN 3HSCA 2GUPA 5JS2A 1Q8IA 4DTMA 2KTQA 4WQ5A 1J5OA 2V51B 1HX1A 4CESA 5FRMA 3S3MA 2E4LA 5HRPA 4PQUA 4NCAA 1OVQA 2BGGA 5HRRA 3VGKA 2H3GX 4CJQA 3HVTA 4NYFA 3MCPA 4NCBA 3D2FA 4O0JA 4OKKA 1RDUA 2QW9A 4IDKA 1W0HA 2RF2A 5D3GA 2QM1A 3SMPA 3OYGA 4H5WA 4R5PA 3DJCA 3HPHA 5AFUH 4O0IA 1VQPN 3R8EA 4H0OA 2P9NB 2O8CB 1TYQB 2HHUA 2F96A 3AVGA 1ATNA 3VTHA 2PY5A 3LDLA 3U8XA 4DSIA 4CHPA 2HNDA 4DMNA 3KK3A 3D2EB 3C6HA 1LV5A 4CJLA 4QAGA 3PIPL 1RDBA 2NZTA 1JLCA 1VSFA 3CJBA 3IFRA 2O8EA 1TVRA 4DWIA 3EKSA 5FDLA 5GAGP 3QESA 3G4SN 1Y64A 3O3HA 4B8CA 3OHRA 1K8KB 4E19A 3KLFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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