3HTVA

Crystal structure of d-allose kinase (np_418508.1) from escherichia coli k12 at 1.95 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
300
structure length
279
Chain Sequence
KQHNVVAGVDMGATHIRFCLRTAEGETLHCEKKRTAEVIAPGLVSGIGEMIDEQLRRFNARCHGLVMGFPALVSKDKRTIISTPNLPLTAADLYDLADKLENTLNCPVEFSRDVNLQLSWDVVENRLTQQLVLAAYLGTGMGFAVWMNGAPWTGAHGVAGEETNCSGMALRRWYEQQPRNYPLRDLFVHAENAPFVQSLLENAARAIATSINLFDPDAVILGGGVMDMPAFPRETLVAMTQKYLRRPLPHQVVRFIAASSSDFNGAQGAAILAHQRFLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords D-allose kinase
publication title Crystal structure of D-allose kinase (NP_418508.1) from ESCHERICHIA COLI K12 at 1.95 A resolution
rcsb
source organism Escherichia coli k-12
molecule tags Transferase
total genus 82
structure length 279
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.1.55: Allose kinase.
pdb deposition date 2009-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA01
2P9UA 4EIAA 4JNEA 4WQ4A 3ZETB 4A2AA 1DKGD 5AQFA 4FOEA 2HF4A 4WQ5A 1R59O 4BR5A 4K42A 3U4LA 4B1UB 3J8AA 2D4WA 4IZ9A 5AZIB 3O5BA 3U9ZA 1SZ2A 4K25A 4XH5A 1V4TA 1NGDA 2E88A 1HUXA 4FL9A 4IO8A 4JHDA 4FWQA 3HTVA 1U6ZA 1MWKA 1HLUA 3CJ7A 3ZEUB 3LDPA 1HPMA 4DB3A 4BVOA 4EAHD 4NB4A 2E2QA 5ADXA 5BN8A 4FWRA 2FF6A 3VF4A 2ITMA 4M7XA 4A61A 3ULEA 1TYQB 1QHAA 3LDOA 3W0LA 3R6MA 2A42A 2QWRA 4YDUA 3AAQA 3I8BA 3MK6A 1NGCA 5EXWA 4BC2A 4CZGA 1BDGA 4BQZA 3LM9A 1XQSC 4BC3A 3FZKA 2QW9A 4H0YB 4M7YA 1KAZA 4BVPA 2IIRA 3H1QA 3GOIA 3VGMA 3WQTA 1JCGA 3DXKB 3VPZA 4FWPA 2QWMA 3WXJA 2YHXA 4BRIA 4PL7A 3KZBA 3WEEA 3S41A 3VEWA 5F1XA 4HTLA 3FFKB 2Q36A 5AQTA 4ISGA 2E8AA 5AFUH 3AY9A 3FZLA 2V7ZA 3UE5A 1HX1A 3SMPA 1Z6RA 3ENOA 4IJNA 3SK3A 1U2VA 3JS6A 2A41A 4BROA 3A5LC 2J4RA 3VGLA 4BRQA 5BR9A 1MA9B 5AQMA 4CZHA 4PKGA 2GWJA 3MN5A 4MO5A 4JHDB 1Y64A 1S3XA 5AQJA 1NGBA 3QMLA 4XH1A 3UB5A 1MWMA 2A5XA 5KPZA 2GUPA 5AZJB 1GLCG 1IG8A 1SAZA 3AARA 2F9WA 5AQRA 3M1FA 1NWKA 1S22A 4H5VA 2P9LA 5F2RA 4B1YB 3BP8A 2CH5A 1ZXOA 3VOVA 3GBTA 4AM7A 3MCPA 1GLDG 3HZ6A 4BR4A 2P9UB 2P9NA 4BRAA 2Q0RA 4MLHA 3BF1A 5CE3A 3CQXA 2FSJA 2HMPA 5JLHA 4CZIA 4E1JA 2E2PA 4ISFA 3QB0A 3WXIA 3R9PA 4CZJA 3VEOA 2NLXA 3O4WA 2HF3A 4L3QA 5BPLA 3AAPA 1BUPA 3GDQA 1XUPO 2Q97A 3L4IA 4CJ7A 3H3OB 3O80A 3P4IA 2P9IA 4BQLA 4BRNA 1E4GT 3LL3A 3CI5A 5BRHA 5KQ8A 3L0QA 4BRHA 5JMVA 3I33A 5E84A 1G99A 3FE1A 3DXMA 4A2BA 5AQZA 2FSNA 4FPBA 3ULEB 4BG9A 4H0PA 5FPMA 4F9OA 4CD1A 4H0TB 4BRFA 3EL2A 3C7NA 5LJVA 4BRMA 4QS9A 4ISEA 5LJWA 2Q31A 1QQOA 5AQHA 5ADXH 1C0FA 4BC5A 3BF3A 3QICA 2NRHA 1NGGA 3BUZB 4FWSA 4CZEA 2QWNA 5F0XA 5EX5A 1NGFA 2I7NA 2YI1A 4H0VB 1T6CA 2VYPA 1HKBA 3WEEB 3WXKA 1V4SA 4B9QA 1XC3A 4WYBA 5FPNA 3O6WA 1RFQA 1X3MA 4I6MA 4IXCA 3VETA 1GLLO 1ESVA 3LDLA 4Y0WA 1IJJA 4H5NA 3H3NO 1U2VB 1E4FT 3LM2A 1YAGA 3QFPA 5LY3A 3ID8A 3VEZA 5ELZA 4JD2A 1GLAG 3C0BA 3IFRA 3KVGA 1MDUB 3A5OC 5TKYA 4DQ8A 4XH4A 3WXLA 1LOTB 2GWKA 1QZ6A 2QWQA 1NM1A 4BGBA 2CGKA 4B1ZA 4CZLA 4FWLA 3JXUA 3VERA 5AQGA 4BR7A 1NGIA 2P9LB 3H6EA 4FWOA 5AQSA 2P9KA 3EZWA 4JN4A 3HBTA 3CJ9A 5AQWA 1JCFA 2FSKA 4FWNA 2P9NB 2FLOA 4EFHA 4BG8A 1ZBSA 4BRLA 2NZTA 3A8YA 2E2NA 2ZWHA 4J8FA 3A5MC 2A6AA 1HJOA 3ZX0A 4FOIA 4C23A 1NMDA 4BRCA 2V7YA 5BPNA 4BR9A 2OANA 5KPRA 3MMVA 1HKCA 5I9EB 2E1YA 3FZFA 5AQPA 3WQUA 1DGKN 5B8HA 4RWTA 3IDHA 5AQOA 4B1XB 5BPMA 4FPAA 3ZX3A 2P9IB 3QFUA 3WT0A 1P8ZA 3QBXA 2ZF5O 1SQKA 3D2EA 1BU6O 3VEVA 1X3NA 3HM8A 2V51B 1BG3A 1K8KA 2F9TA 3RSEA 3DXMB 1TUYA 3VESA 3VEXA 1QQMA 4BR2A 1Q18A 3UKUA 3A0IX 3H45C 3C7NB 5BRFA 1DEJA 4CZFA 1ATSA 2UYTA 4RTFD 2YJFA 2D0OA 2PBDA 2FXUA 1TUUA 1QQNA 4CBUA 4BGAA 1ZC6A 3CJBA 4H0OA 4BC4A 1BA0A 1X9JA 5AR0A 2E20A 1KAXA 1NGHA 4BRGA 4I6MB 1BO5O 3CJCA 3BEXA 2YHYA 1NLVA 4CZMA 3IMXA 5EOYA 5AQLA 2P9SA 4IWVA 5BREA 3FZHA 3IUCA 3EKSA 3QBWA 1NGJA 3FGUA 4HWIA 3CJ1A 2CGLA 3G25A 3OHRA 4JD2B 3A5NC 3SMSA 1T44A 2AA4A 1NBWA 1RGIA 2D1KA 3D2FA 4H5RA 4M63C 4BR0A 4FWKA 3UKRA 4A62A 5AQKA 2QXLA 3DWLA 5EY4A 3TU5A 4GY2B 2ZGYA 5KQDA 1BWFO 4EHUA 4LC9B 3M6GA 5AQQA 2P9KB 1C0GA 4KBOA 4QS7A 4EHTA 5E26A 3FR0A 2QWLA 3EN9A 2ASPA 4JAXA 1T6DA 3VEYA 2AP1A 3EO3A 1GLFO 2E1ZA 1GLBG 2W40A 4FO0A 4CBWA 1HKGA 3CIPA 3ZETA 3SJHA 2IVNA 3CERA 2WUSA 3VF2A 3H46O 3DAWA 1NGEA 2ZGZA 3LDQA 3VENA 1ATRA 5AZIA 3D7EO 4PL8A 4CI6A 4DHYA 3HSCA 5FPEA 1QZ5A 2VWBA 1GLJO 1KAYA 3L6QA 3MDQA 5AQIA 4CZKA 2Q0UA 3QDKA 3WUHA 1OKJA 4BRDA 3B8AX 4H5TA 3CQYA 4MLEA 2P9PB 1BOTO 3D2EB 2Q2RA 3ZEUA 2A3ZA 2DPNA 3H1VX 2H3GX 3FZMA 1K8KB 4WQ4C 4IJAA 3M3ZA 3RSEB 2ASOA 4K41A 3SLCA 4BRPA 2BTFA 1TYQA 4NO7A 4BRKA 5JICA 3CETA 4PKIA 4WQ5C 5EVZA 3UKUB 4O8KA 5AQUA 3O1WA 3MN9A 4MO4A 4RCHA 5AQNA 3CHWA 4XEIA 5AFUA 2IVOA 2CGJA 3O08A 2QWPA 2W41A 5AQXA 3DXKA 2FF3B 2P9PA 2YCHA 3GG4A 4PKHA 3VF6A 3U9DA 2BUPA 3ATVA 4Z94A 4DCHA 3ZX2A 1H1VA 3VGKA 4GNIA 4O5FA 5BN9A 3O8MA 1RDWX 2YHWA 1BA1A 1GLEG 4K43A 1EQYA 4QS8A 3R8EA 2GEMA 3U8XA 3DJCA 1ATNA 4YDUC 4FWMA 1YUWA 1Z05A 2P9SB 1CZAN 2KHOA 1D4XA 4CBXA 4H0XB 2VCPA 3MN7A 4B1WB 1YVNA 4CD3A 2V52B 1JCEA 1NGAA 1YXQA 2QWOA 3CJAA 2A40A 5JLFA 5BRDA 5KPTA 2ASMA 3ATUA 3D2FB 4BREA 2D0PA 1WUAA 3LDNA 4AM6A 3UKRB 3GE1A 3KHYA 5AZJA 4H03B 3ENHA 2Q1NA 4FSVA 1LCUA 5AQYA 3GL1A 4H5WA 5AQVA 2QM1A 3F9MA 2I7PA 2GELA 3EKUA 2IVPA 3TPQA 2PAVA 3FLCO 3O1BA 3HI0A 5FPDA 2CH6A 2HOEA 3MN6A 1WOQA 1J6ZA 2YJEA 4B1VA 1KXPA 3W3DA 2E2OA 2EWSA 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQ8A 4OJRA 3D45A 4JNEA 3KK7A 4KI4A 2D5RA 2XY5A 4K42A 1GOAA 4IZ9A 5AZIB 3O5BA 2OPPA 4XH5A 3HOSA 1KFSA 4F2SA 1NGDA 1QTMA 1KC8O 2E88A 4FM1A 4FLVA 3DRRA 1MWKA 4I9LA 2YNFA 3ZEUB 3PY8A 4B3MK 4X64K 4KV8A 2W42A 2FF6A 3VF4A 4E7LA 2HSTA 4M7XA 4DV7K 5IT9O 3I8BA 3DLKA 3MK6A 4FJNA 2YKMA 3KLGA 2ZM6K 4YOYA 3E9PA 4OO1J 4CZGA 4MQ3A 2QI2A 5DMRA 3PV8A 3CCLN 3DRPA 4DFPA 1ASUA 3DXKB 1K9MO 3VPZA 3SPYA 3K58A 2YHXA 4PL7A 2GUIA 1FKOA 4FK2A 3VEWA 5F1XA 3AVAA 1A5XA 1YTAA 3FFKB 4ISGA 2E8AA 3AY9A 2GBZA 3THYA 2ZQBA 4OGEA 1HX1A 1RDCA 4ILJA 3I0SA 4FJJA 4BROA 1UA1A 3VGLA 2JLEA 3TWHA 2G8KA 4KTQA 1IKXA 4M42A 1YJWN 1WBDA 3LPTA 4CGIA 1LAWA 1NMNA 4CF2A 3AVBA 3G0ZA 1L3UA 4DV6K 4MO5A 4Y1CA 4DTSA 3O3FA 3ZSZA 3QEXA 3UB5A 4KAZA 4LFAK 2A5XA 4DQRA 3L3UA 5AZJB 1VQ9N 1SAZA 2F9WA 5AQRA 4LSNA 4K8ZA 5CYMA 1N6QA 3GBTA 1GLDG 3MX2A 4X65K 4JRQA 4JEPA 3NGYA 2Q0RA 3BF1A 4JI5K 3VQAA 4FZYA 4CZIA 3SAGA 1S1VA 4C1NK 4DSLA 1U47A 3VEOA 2OZSA 2WBNA 4L3QA 4KO0A 3HT3A 4E0DA 2Z1GA 4JI6K 1BUPA 3TSPA 1XUPO 1WNSA 3WNEA 3P4IA 4BQLA 3LL3A 5BRHA 3K5MA 3L0QA 5CY4A 2F7TA 5E84A 3I8DA 5DM7L 1VSHA 2KFNA 5C25A 5AQZA 3THXB 4KTWA 4IFVA 2FSNA 4FPBA 1BCOA 4BG9A 1L5UA 4BRFA 1WN7A 5LJVA 3DI6A 3VQBA 4HCBA 2Q31A 5ADXH 1C0FA 1J53A 1QHTA 4H4MA 1HNVA 4FWSA 4KH6A 4C8MA 5F0XA 4DU1A 1NGFA 1O13A 2YI1A 4H0VB 1T6CA 4JKGA 3EEQA 4U67L 4WFAL 1T05A 4B9QA 3I56N 3O6WA 3DYAA 4CJLA 4I6MA 1X3MA 4HUGA 3HK2A 3E9LA 2O8DA 3LDLA 4Y0WA 1NK8A 4RW4A 1BL3A 1U2VB 3C94A 4CF8A 1E4FT 4CK3A 2YV0X 3WXMB 3RVCA 5JS1A 3QFPA 3AVMA 3ID8A 1KQSM 3SUQA 1IH7A 4WFBL 3SI6A 1C0MA 3IFRA 1MDUB 5TKYA 5I3UA 4IDKA 1QZ6A 3VQQA 1NM1A 1UA0A 2G8UA 3HPGA 4B1ZA 3OYJA 4EZ9A 3JXUA 1X9MA 1Q9XA 3VERA 4AQYK 3HJFA 2F8SA 3CCQN 3NH2A 4FWOA 4DLEA 3ZSOA 4CJTA 4JN4A 3CCRN 5AQWA 1JCFA 2B4JA 3F9KA 2OPRA 3DLRA 5CZ1A 2XY7A 2NZTA 2E2NA 1BQMA 3ID6A 3ZX0A 1N32K 4DG1A 2PY5A 5BPNA 2HHQA 3HM9A 3CF5L 1UAXA 1VAZA 5AQPA 1VQ4N 2OCEA 3WQUA 3SQ2A 1DGKN 4CHOA 1WAFA 1IKWA 5C2DA 3OJUA 1SQKA 3D2EA 1BU6O 4C8OA 3VEVA 5HROA 4O8UA 1WSJA 1K8KA 3C6UA 3DXMB 4FJ5A 3OYKA 3KLFA 4NLBA 3VQ5A 2VG7A 3WNFA 1ATSA 2UYTA 3AO1A 2YJFA 3P83D 2D0OA 2PBDA 1CZBA 1TUUA 4I2QA 2HHUA 2KZMA 4EZ6A 2O8BB 3SV3A 1D9DA 4NCBA 1BA0A 2HHVA 4I7FA 2E20A 4A5AA 4BRGA 4LD0A 3BEXA 1NLVA 1RT1A 4IFEA 5EOYA 2UUBK 4NCGA 5AQLA 3TAMA 2XO7A 1NK4A 1NGJA 1NJXA 3FGUA 4JKAA 1VSEA 1T44A 2HNZA 4JKFA 1NBWA 3D2FA 4AHSA 3CCMN 3K5OA 4FLTA 3THWB 2KLAA 1YIJN 4GY2B 5KQDA 4LC9B 1WSHA 2YHAA 4CERA 3KD5E 1C0GA 3RMDA 4CFAA 2NRVA 3J80O 4CHNA 4JAXA 3HXMA 4M3UA 3TR8A 4FO0A 1TKDA 5SZTA 3Q7CA 1BISA 2WUSA 3V9SA 1NGEA 3LDQA 2HVHA 3U3YA 5LL6Z 5AZIA 4CI6A 4DHYA 1VQ5N 2PFUA 3J7AP 5FPEA 2VWBA 3QNNA 1KAYA 1IV0A 3S3MA 1LWCA 1OKJA 4H5TA 3CQYA 4IG3A 1Q8IA 1BOTO 4B3RK 2Q2RA 3ZEUA 3SYZA 2YNGA 2A3ZA 2OPQA 3NGZA 4B9UA 3RSEB 2ASOA 3SLCA 4BRPA 2BTFA 4NO7A 5JICA 1RT5A 4PKIA 2PZSA 1QQCA 2IAJA 4O8KA 4RW6A 3T19A 4E7IA 1U49A 2Z1JA 5A2QO 1HRHA 2QKKA 4CHPA 2CGJA 5HRSA 1K6YA 2W41A 3ZT0A 4M3WA 3DXKA 4DV1K 4G1QA 2YCHA 1M90O 4PKHA 3AO5A 1U48A 4F8RA 1KLMA 4N41A 1D8YA 4Z94A 1Q7YO 3ZX2A 4KPYA 1HMVA 1NK7A 5M1KA 3VGKA 4O5FA 1NK5A 1HNXK 4QS8A 1EQYA 3S3NA 3DJCA 1ATNA 4LH5A 3CYMA 4B9VA 4OPAA 1Z05A 2OPSA 1TL1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1HNW K;  1KAX A;  4DV3 K;  4DU4 A;  3LAN A;  4I6M B;  1YHQ N;  2O8F A;  4CZM A;  1JJ2 M;  3PLA A;  3SUP A;  2P9S A;  4IWV A;  4M3R A;  2O8E A;  3IUC A;  5KI6 A;  3NF8 A;  1L3V A;  4FLY A;  5AJ3 K;  3CJ1 A;  4B9S A;  3KKS A;  2CGL A;  3OHR A;  1C1C A;  2FC0 A;  1TGO A;  2AA4 A;  4O0J A;  4FJG A;  1RGI A;  4H5R A;  2VQE K;  4M63 C;  4A62 A;  3LPU A;  3SZ2 A;  4K0K K;  3B6P A;  2E5L K;  3ISN C;  4Y1D A;  4CF1 A;  3JAM O;  5AQQ A;  1EKE A;  4QS7 A;  3LP0 A;  4EHT A;  5E26 A;  1VQ7 N;  3PO4 A;  2QWL A;  5C10 A;  3EN9 A;  2ASP A;  2RN2 A;  1T6D A;  4N56 A;  1KLN A;  3NF6 A;  1GLF O;  2WOM A;  2DFH A;  4CBW A;  1HKG A;  3SJH A;  4Z4F A;  3NHG A;  4CK1 A;  5HRN A;  4DSE A;  2IC3 A;  1W9H A;  1VQM N;  3VEN A;  1ATR A;  1IKY A;  4FW2 A;  4WFN L;  3E1Y A;  3VQE A;  4RW7 A;  1GLJ O;  3L6Q A;  3OJS A;  3ZT1 A;  1WSF A;  3P31 A;  4OGC A;  3WUH A;  3M8S A;  3ENB A;  3L2Q A;  2HHT A;  4CFD A;  3D2E B;  1W97 L;  2HHX A;  4MFB A;  2DPN A;  1K8K B;  2BDP A;  4K41 A;  2UXB K;  4JK8 A;  1WSI A;  1TYQ A;  2UXD K;  1QSY A;  4WQ5 C;  5EVZ A;  4DKW A;  3AO4 A;  3NAE A;  3NF9 A;  2YX6 A;  4OKJ A;  3O1W A;  3ZLJ A;  4MO4 A;  3QEV A;  3DLE A;  1GOC A;  4DV5 K;  3C6H A;  3O08 A;  2QWP A;  2P9P A;  1HYZ A;  4JRP A;  5JS2 A;  3GG4 A;  3VF6 A;  4CJP A;  3R1X A;  2WC9 A;  5IWA K;  4NXM K;  4DCH A;  4KRE A;  2ZE2 A;  4DTO A;  1H1V A;  3SQ4 A;  1X9W A;  4X66 K;  3R8E A;  3U8X A;  4I9Q A;  2KHO A;  4H0X B;  4B1W B;  1YVN A;  4CD3 A;  2W6K A;  3QLH A;  3OYH A;  1RTJ A;  1SKW A;  3VTI A;  3CJA A;  3SAH A;  1VHX A;  1JXE A;  5BRD A;  3SCX A;  2BGG A;  2BH1 A;  3TAB A;  4Z0U A;  3ATU A;  3D2F B;  2YKN A;  4CF0 A;  4OPK A;  4DR6 K;  2D0P A;  3IRX A;  2DY4 A;  4MDB A;  3RMC A;  3KHY A;  4H03 B;  4FSV A;  3GL1 A;  4DS4 A;  2QM1 A;  4CIF A;  2I7P A;  1RT2 A;  3PX6 A;  3FLC O;  3G71 N;  3OW2 M;  2CH6 A;  3OYN A;  2HOE A;  3AGR A;  4B1V A;  1KXP A;  3W3D A;  1HQU A;  5GIN A;  3RWU A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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