3HTVA

Crystal structure of d-allose kinase (np_418508.1) from escherichia coli k12 at 1.95 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
300
structure length
279
Chain Sequence
KQHNVVAGVDMGATHIRFCLRTAEGETLHCEKKRTAEVIAPGLVSGIGEMIDEQLRRFNARCHGLVMGFPALVSKDKRTIISTPNLPLTAADLYDLADKLENTLNCPVEFSRDVNLQLSWDVVENRLTQQLVLAAYLGTGMGFAVWMNGAPWTGAHGVAGEETNCSGMALRRWYEQQPRNYPLRDLFVHAENAPFVQSLLENAARAIATSINLFDPDAVILGGGVMDMPAFPRETLVAMTQKYLRRPLPHQVVRFIAASSSDFNGAQGAAILAHQRFLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords D-allose kinase
publication title Crystal structure of D-allose kinase (NP_418508.1) from ESCHERICHIA COLI K12 at 1.95 A resolution
rcsb
source organism Escherichia coli k-12
total genus 82
structure length 279
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.1.55: Allose kinase.
pdb deposition date 2009-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA01
4A2AA 3ZEUA 4BVPA 3SJHA 2E1YA 3A5NC 2I7NA 3GDQA 3UKUA 3WEEA 3RSEB 2IVNA 1ATSA 5EOYA 3O08A 5F0XA 4CI6A 5AQVA 3CJAA 4FPAA 4EFHA 1YXQA 2QWRA 4CZIA 3VERA 1C0FA 3F9MA 3VETA 2YHWA 3WXJA 1XQSC 1NMDA 2QWQA 2GWKA 1SQKA 1TYQB 4FWPA 3VGKA 4BG8A 4DQ8A 4KBOA 4RCHA 3M1FA 3EN9A 2QWPA 1MWKA 3EKSA 4BR9A 4IJAA 3WXLA 1NLVA 3O4WA 2P9IB 2IVPA 3G25A 4WQ5A 3EL2A 2BTFA 3UKRA 1G99A 5AQMA 3ULEA 4EHUA 3VGMA 1HKGA 1XC3A 4NO7A 5AQIA 4RWTA 3GBTA 3SMPA 2FF6A 1NWKA 3CJ1A 5AZIA 3HM8A 4BR2A 3QB0A 4MO5A 1U6ZA 5BRDA 1Y64A 3DXMB 3H45C 5AQGA 3ZX3A 3EKUA 2E2PA 3B8AX 3MN6A 4O5FA 5AQXA 3M3ZA 2Q0RA 5AQSA 3EO3A 4GY2B 4O8KA 4BR4A 2NLXA 2YHXA 3LDNA 3LDQA 1BWFO 3QFUA 3A5MC 3VEYA 3VF6A 5AZJB 3WT0A 3RSEA 3O8MA 4BQLA 3MN5A 3H6EA 3VEWA 4FSVA 4MLEA 1X9JA 1GLLO 2V52B 3WUHA 5FPMA 5BPMA 3A8YA 3ZX2A 3KHYA 1YVNA 4XH1A 4BVOA 2E8AA 3WQTA 3FE1A 1TYQA 4IO8A 3MCPA 1NGBA 3FZFA 2CH6A 3FZMA 1GLAG 1S3XA 2J4RA 3ZETB 5AQFA 1NGHA 2AP1A 3QDKA 1NGIA 2QWOA 2P9IA 3HSCA 3IFRA 2GELA 3MMVA 1QQOA 2ITMA 3SK3A 1NGFA 1GLCG 4BRAA 5F2RA 3JS6A 1BA0A 1YAGA 5AQUA 3MN9A 1SZ2A 3AARA 3DXMA 3A0IX 4CZMA 5BPNA 1KAXA 4CZLA 4C23A 3LDLA 1MDUB 2OANA 1ATRA 4BRNA 4K42A 1NGJA 2E2OA 2ZWHA 4FOIA 5AZJA 1HKBA 3U9ZA 4CZEA 3DWLA 2NRHA 5E84A 1WOQA 2HF3A 2Q97A 3L6QA 3VEXA 4E1JA 1IJJA 1J6ZA 3GL1A 4BRDA 2IVOA 2P9KB 3R8EA 2QWLA 2PAVA 4WQ4A 2HOEA 3CJBA 3ENOA 3HI0A 3ZETA 3ZX0A 2ASPA 3QFPA 1BOTO 1OKJA 1KAZA 2H3GX 4BREA 4QS7A 4BR0A 2P9LB 4BC5A 5TKYA 5FPNA 4HTLA 4PKGA 2YCHA 3CQYA 1R59O 4YDUA 1DKGD 2W41A 2A42A 3VESA 1RGIA 5KPRA 5B8HA 5AQHA 3FZHA 3CETA 5AQZA 2E88A 4H0OA 5BR9A 2CH5A 4IZ9A 3R9PA 4CBXA 4H5VA 1IG8A 3IMXA 4BRQA 2AA4A 4CZFA 4JAXA 3EZWA 3AAPA 1KAYA 3O5BA 5AQLA 2GWJA 4BRKA 4BRGA 4PKHA 3UB5A 3W3DA 2VYPA 4K41A 2IIRA 1JCGA 4H5WA 4BGBA 3A5OC 3AY9A 4DB3A 3H1QA 4B1ZA 4BR7A 1GLFO 5EX5A 5JLFA 1SAZA 2A41A 4DHYA 2YHYA 2P9KA 2VWBA 2V7ZA 3O6WA 3VF4A 4CBUA 1BDGA 1WUAA 4WQ5C 2FXUA 5AQOA 4H0YB 1QZ5A 2FF3B 2P9LA 5F1XA 2HF4A 4ISGA 4J8FA 1DGKN 4FWQA 3O1WA 4FWOA 1Z6RA 1NGGA 4FOEA 3VPZA 4L3QA 3VEVA 4PL7A 2QXLA 4FWSA 2QM1A 4FWMA 5LY3A 1HX1A 5AFUA 3O80A 2Q2RA 3DJCA 1NM1A 1S22A 2Q1NA 4IWVA 3HTVA 5BN9A 1GLJO 1T6DA 3CQXA 4FWKA 4A62A 1T6CA 1K8KB 5AFUH 2VCPA 2D4WA 1QQMA 3BP8A 1Z05A 4JHDB 2CGKA 3GG4A 5BPLA 3JXUA 4AM7A 2P9SB 3CHWA 5AQYA 4FPBA 3SLCA 3VF2A 4H0PA 3BF3A 2EWSA 1D4XA 1XUPO 5AQWA 1NGAA 1Q18A 3CERA 1DEJA 3QBXA 3QICA 2A6AA 3CIPA 4BC2A 4BR5A 3OHRA 5AR0A 2D0PA 4ISFA 2I7PA 5FPDA 4B1UB 4H03B 4BRMA 4BRCA 1TUUA 4IXCA 3U9DA 4M7YA 1NGEA 4B1XB 1V4TA 5BN8A 4B9QA 3BEXA 1HLUA 4CZGA 1HJOA 3I8BA 2ZGZA 3IDHA 3MK6A 5KQ8A 2Q31A 2NZTA 3SMSA 3WQUA 2QWNA 2HMPA 5AQKA 1E4FT 2F9WA 4CZJA 5AQPA 2QWMA 4CZHA 4PKIA 2YI1A 2UYTA 3D7EO 3U4LA 3S41A 3WXIA 5JLHA 1HUXA 4BC3A 5BRHA 5KPZA 1K8KA 5EY4A 4FL9A 3HBTA 4JNEA 5LJWA 4JHDA 3GE1A 1BA1A 2E2QA 5BREA 3LL3A 3U8XA 3H46O 3FZLA 4BROA 1MA9B 3LM2A 4QS8A 2FLOA 2P9SA 2Q0UA 4I6MB 4CBWA 1TUYA 2P9PB 1U2VB 2E2NA 3FFKB 2P9NB 3O1BA 4BC4A 3VENA 4WQ4C 4JD2B 3CJ9A 1QHAA 2YJFA 3KVGA 5AQRA 3IUCA 5E26A 4BRLA 2A5XA 1P8ZA 2CGJA 3VOVA 2FSJA 4DCHA 5CE3A 4BGAA 1H1VA 3D2FB 1BU6O 4XH5A 4YDUC 1LOTB 1C0GA 1ESVA 3FZKA 1ATNA 4JN4A 2V7YA 1GLBG 1E4GT 1GLEG 5ADXA 3FLCO 3D2EB 5AQTA 3CI5A 2PBDA 1CZAN 1MWMA 4Z94A 4B1VA 1NGCA 3I33A 1HPMA 4M7XA 1JCEA 4H0VB 3ATVA 4BRPA 4NB4A 3L0QA 3ATUA 5ADXH 3AAQA 3MDQA 4XEIA 3R6MA 2WUSA 4BRHA 3ENHA 2YJEA 3TU5A 2W40A 5KQDA 4FWNA 1HKCA 3DXKB 4MO4A 3ID8A 5EVZA 5BRFA 4MLHA 4Y0WA 3UE5A 3H3NO 5AQQA 1QQNA 3A5LC 4QS9A 3C0BA 3C7NB 2V51B 2GTDA 3GOIA 4B1YB 2GUPA 4H5TA 4CZKA 4LC9B 2FSKA 4M63C 4EIAA 2P9UB 3HZ6A 2E1ZA 2D0OA 4I6MA 1YUWA 2P9PA 4PL8A 4BRIA 1U2VA 2P9NA 1BG3A 3VEZA 3QMLA 4JD2A 5ELZA 3ZEUB 3TPQA 4EHTA 4F9OA 2F9TA 2QW9A 5EXWA 4BRFA 3UKUB 3WEEB 3CJCA 1QZ6A 4K25A 1BUPA 3LM9A 3M6GA 1T44A 3WXKA 4BG9A 3H1VX 1ZXOA 3D2FA 5AQNA 3CJ7A 4RTFD 4IJNA 5JICA 3W0LA 2ZGYA 3BF1A 3FGUA 4CJ7A 4B1WB 2ASOA 2ASMA 4FWLA 3MN7A 4FO0A 4K43A 3LDOA 1GLDG 4H0TB 4H5NA 5AQJA 3VEOA 2GEMA 3D2EA 4EAHD 2BUPA 2ZF5O 2FSNA 1RDWX 2DPNA 2KHOA 4CD1A 3J8AA 3DAWA 4BQZA 4ISEA 4A2BA 3QBWA 3UKRB 3ULEB 4WYBA 1NBWA 1BO5O 3FR0A 2D1KA 1KXPA 4H0XB 1EQYA 3DXKA 2CGLA 5FPEA 4HWIA 4XH4A 3P4IA 1NGDA 3KZBA 4CD3A 5JMVA 1JCFA 2E20A 3C7NA 5KPTA 4GNIA 5AZIB 3LDPA 1ZC6A 1V4SA 2A3ZA 4A61A 1LCUA 2Q36A 3BUZB 2A40A 4H5RA 5LJVA 1ZBSA 3VGLA 2P9UA 3H3OB 1RFQA 1X3NA 4FWRA 4AM6A 3L4IA 5I9EB 1X3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKEA 4BY9C 3F9KA 2E1YA 3A5NC 2I7NA 4KTQA 5DM7L 5GADP 1LAWA 4CI6A 4E7HA 1Q9XA 4EFHA 4DR3K 4JI3K 1C0FA 1L3VA 3RMCA 4DSLA 4DV7K 3VETA 1I39A 5M1QA 1SQKA 1HR0K 1GOBA 4X66K 4IFYA 3PSFA 4CEZA 2QWPA 3LDSA 3AVAA 4QCLA 3EKSA 4BR9A 3WXLA 4DV3K 2P9IB 4UY8O 3CFOA 2XO7A 3KLEA 4LF4K 4KTZA 4KHPK 4RWTA 3TSUA 5SWMA 2E6MA 4KI4A 2FF6A 4CERA 4BR2A 4MO5A 1ITGA 1TAQA 4CJVA 3T1HK 5AQGA 3ZX3A 3NHGA 3CC2N 3B8AX 4CECA 4O5FA 1QTMA 1K9MO 3VQ4A 5AJ3K 2UXDK 4N47A 3P1GA 3QFUA 4HCBA 3QEXA 1NK8A 3VEYA 1OH6A 4Z4CA 1W9HA 1TK8A 1JL1A 4BQLA 3THWA 1NJZA 2P1JA 2V52B 4CFAA 4E7JA 3DM2A 5CYMA 1YVNA 2O8DA 4B08A 4XH1A 4CEAA 1WB9A 4BVOA 3WQTA 2NNWA 2WOMA 3ZSXA 3FE1A 1TYQA 4AHTA 3FZFA 3I55N 1JL2A 3OBWA 2DFFA 1NGHA 2HHUA 5KGXA 4UQGA 3OA9A 3IAYA 4DTJA 3CD6N 1Y97A 3SK3A 1RBVA 2OPRA 3ZSYA 3VA3A 3T19A 1C0MA 3QEWA 4G1QA 3MN9A 1SZ2A 3AVMA 1D9DA 4PWDA 1KAXA 3KWGA 4W5OA 4OPAA 3OS0A 5SZTA 3LP3A 1SL2A 1OVYA 2ZJPL 5HP1A 3ISNC 5M1KA 1KLMA 4W5NA 2OZSA 1WOQA 4CGIA 2D0BA 3VEXA 1YI2N 1IJJA 1J6ZA 3I0RA 1VQ8N 4BRDA 4FM1A 3KIOA 1XNQK 2XY8A 1DTTA 3CJBA 4L8RB 2WBNA 4CIFA 1KAZA 2D5RA 1VQKN 4BR0A 3O9QA 3S3MA 5FPNA 4IOXA 3BGRA 3CQYA 1DKGD 1WSEA 3DLRA 4CGFA 2IC3A 4IDHA 5JVGL 1QSYA 3ZYYX 5B8HA 3FZHA 4LD0A 4CJFA 3CETA 5AQZA 4ELVA 3NFAA 2KFNA 3PUFA 4B3TK 3VTIA 1DLOA 5BR9A 4ELTA 4GW6A 3R9PA 4WF9L 3ID6A 4H5VA 1HYSA 2HNZA 2OZMA 3DRPA 3VQEA 4C8KA 4FJLA 1KAYA 3AVIA 3O5BA 3L2QA 3MWPA 2O8FB 5GIPA 4FZZA 1VHXA 3TTFA 3K5MA 4DB3A 3LAMA 1ZBUA 2BGGA 2ZE2A 4B1ZA 3KK7A 4BR7A 3FFIA 5JLFA 1WSIA 4IFEA 3G71N 4OJRA 1S1TA 4YOVA 5C2DA 2P9KA 4KHUA 1XWLA 1LW0A 3VF4A 4CBUA 1BDGA 3V1OA 2YNFA 1K6YA 3SYZA 1TL3A 4CEOA 2HF4A 4J8FA 2JLEA 4FWQA 4FWOA 4FLYA 4ZHRA 4L3QA 3VEVA 1EX4A 4GV6A 3AVCA 2NRXA 2XY7A 4PL7A 1NNEA 4C1NK 3AGRA 1C6VA 2G8FA 5LY3A 4FYDA 2OTJN 3RR8A 4O0IA 4G9ZA 5J2QA 5A2QO 1GLJO 3CQXA 3HRGA 4YY3K 2HBKA 3J80O 1A5WA 2VCPA 2HHXA 4JHDB 1Z05A 4B8CA 3MECA 1RT6A 3VQ9A 3S3OA 4DTMA 3CHWA 1SL0A 4IG0A 4CGJA 3BF3A 2EWSA 1XUPO 1T3VA 5I3UA 4FLVA 1HQUA 4I7FA 1VQLN 4Q5VA 2O8BB 3SPYA 3CERA 1RDBA 1NKCA 3AA5X 5CYQA 3QICA 2A6AA 3PY8A 3LP0A 4DF4A 4O5BA 4B1UB 4ID5A 2F8TA 4H03B 4BRCA 4YOXA 3OYGA 1NKEA 3HK2A 4E7IA 1IKVA 4FJNA 1HLUA 4CZGA 1HJOA 1S6QA 3IDHA 5M1NA 3CMEN 4LF8K 5KQ8A 1DTQA 5FRNA 1S1XA 2HHHK 1KRPA 1VK0A 2QA4N 4CZHA 1L3UA 3D7EO 3V9ZA 5M1FA 4BC3A 5KPZA 2X78A 2YX6A 4HCCA 2YHAA 4FL9A 4DWIA 1S1UA 4Z4FA 5LJWA 4CE9A 1OVQA 1U45A 3H46O 4BROA 2BH1A 2P9SA 3SZ2A 2P9PB 2QKBA 2EHGA 1L3TA 3V1RA 2P9NB 4DV0K 3BZKA 3O3GA 2YNIA 3MXJA 3T3FA 4AILC 4C8NA 4M3RA 2FC0A 3CJ9A 3KVGA 4LSLA 3IUCA 2QTDA 4CJUA 3LZIA 3EYZA 1N34K 4DCHA 3TSQA 1K8AO 4XH5A 1LOTB 4KHQA 4FZXC 1NJWA 1ATNA 1TKTA 1GLEG 1YHQN 2G8HA 1CZBA 4FVMA 1MWMA 4B1VA 3I33A 1HPMA 4NLBA 2ATQA 4H0VB 4K8ZA 3EZ5A 4XEIA 4BRHA 1TGOA 3RWUA 5HL7L 2Q3SA 3DXKB 1VRUA 5EVZA 5BRFA 2YHBA 2G8IA 3AA3A 3MWTA 3H3NO 1LWCA 3GOIA 3VQQA 1TKXA 4J2BA 3LANA 4H5TA 5DK5A 4R5PA 1QHTA 2FSKA 2KKZA 2P9UB 3HZ6A 3J7YP 1WBDA 1UAXA 1XHZA 3QMLA 4JD2A 3ZEUB 3TPQA 2QW9A 2IAJA 1CXUA 4CK2A 4DFMA 1WBBA 3RTVA 4JRQA 1RBUA 4K25A 3CFRA 1KLNA 4X65K 4BG9A 4NXMK 1UA1A 3H1VX 1HNZK 2JGUA 1ZXOA 3LPUA 5JICA 4IJNA 4JK7A 4PQUA 3W0LA 1TK5A 4DU4A 3FGUA 5CHIA 4FWLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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