3HTVA

Crystal structure of d-allose kinase (np_418508.1) from escherichia coli k12 at 1.95 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
300
structure length
279
Chain Sequence
KQHNVVAGVDMGATHIRFCLRTAEGETLHCEKKRTAEVIAPGLVSGIGEMIDEQLRRFNARCHGLVMGFPALVSKDKRTIISTPNLPLTAADLYDLADKLENTLNCPVEFSRDVNLQLSWDVVENRLTQQLVLAAYLGTGMGFAVWMNGAPWTGAHGVAGEETNCSGMALRRWYEQQPRNYPLRDLFVHAENAPFVQSLLENAARAIATSINLFDPDAVILGGGVMDMPAFPRETLVAMTQKYLRRPLPHQVVRFIAASSSDFNGAQGAAILAHQRFLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords D-allose kinase
publication title Crystal structure of D-allose kinase (NP_418508.1) from ESCHERICHIA COLI K12 at 1.95 A resolution
rcsb
source organism Escherichia coli k-12
molecule tags Transferase
total genus 82
structure length 279
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.1.55: Allose kinase.
pdb deposition date 2009-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA01
5JLHA 3ZETA 5AQKA 1R59O 1WUAA 1LCUA 2QXLA 3ULEA 3WQUA 3U4LA 4HTLA 4PL7A 4PKGA 2E8AA 2HF3A 5AQZA 1Q18A 3D2EA 3H46O 4LC9B 5F2RA 4F9OA 3AAPA 3U9ZA 3FGUA 3ZEUB 1NGIA 4JNEA 1BDGA 3CQYA 4FWKA 3R9PA 1NLVA 2D4WA 5AQSA 1BOTO 2GWKA 3DWLA 3AY9A 3C7NB 1NGFA 3VEXA 2F9TA 4CZIA 2AA4A 3JXUA 5JLFA 2P9PA 2Q31A 3LL3A 4K25A 4FWNA 4FWOA 3R8EA 3UKRB 2D0PA 2Q1NA 4BRPA 3VOVA 4BVOA 2PAVA 5JMVA 2PBDA 2CGKA 3FR0A 3FZMA 1NGEA 4BC4A 5BPMA 5ELZA 3HM8A 3R6MA 3SMSA 3VERA 3WEEB 3I8BA 5AQYA 1GLLO 1X3NA 3CJ9A 1YVNA 3MN6A 2NRHA 3CJAA 4WQ5A 2FSKA 2A6AA 3KHYA 4M7XA 2NZTA 2HMPA 1J6ZA 1E4GT 2YHYA 2IVNA 1ZC6A 4FL9A 2P9NA 4RTFD 5FPMA 4IWVA 1ATSA 2IVOA 1K8KB 5BPNA 3AARA 4L3QA 5AFUH 3IUCA 1RGIA 1KAZA 4CZJA 2GTDA 4H0PA 2CGLA 3W3DA 4WQ4C 2CH6A 3MMVA 2NLXA 3MDQA 2Q2RA 1BG3A 4WQ5C 4B1ZA 4H0TB 2D0OA 3QFUA 4JD2B 4MO4A 1JCEA 1HUXA 3IDHA 4BRHA 2P9UB 3H45C 5AZJB 2ASOA 2GUPA 4PKIA 3W0LA 5FPEA 2Q0RA 2E1ZA 1NGBA 1NGDA 2VCPA 3KZBA 2W40A 4CBUA 2ZF5O 5BR9A 2Q97A 3GG4A 3BUZB 1T6CA 1YAGA 2P9IB 4HWIA 1OKJA 4CD3A 1BA0A 2V7ZA 3O4WA 3LDOA 4BC2A 2Q36A 3LDLA 4EFHA 4AM6A 2I7PA 2P9SA 3C7NA 2FF3B 3QBWA 4DHYA 5KQDA 4BRIA 4JHDA 3A5NC 3S41A 5BREA 4K43A 4DQ8A 1QZ6A 3RSEB 4H5RA 2A3ZA 5EXWA 1EQYA 3AAQA 3MK6A 5AQHA 2QWMA 4QS8A 1GLDG 3O8MA 1ZBSA 3L4IA 5TKYA 4B1UB 4CZLA 2YHXA 3D7EO 4EHUA 5FPDA 1SAZA 4EIAA 3FZKA 4BQZA 4BR0A 4H5TA 1ESVA 3EO3A 3OHRA 3SK3A 4MO5A 4FOEA 3HBTA 4BG9A 2YJEA 2UYTA 4A62A 4MLHA 4ISGA 4AM7A 5AQLA 2YCHA 3P4IA 4JD2A 1XUPO 2FSNA 2GEMA 3U8XA 2P9UA 3M3ZA 3VF4A 4DCHA 1BA1A 3VGLA 4B1WB 2GELA 3QICA 3BP8A 2P9LB 5AZIB 3HSCA 3VEVA 5LY3A 3WQTA 5F1XA 3VF2A 4GY2B 4QS9A 2QWPA 1S3XA 4H0YB 4ISFA 5BRDA 1D4XA 1GLBG 3LDQA 5CE3A 4CZGA 2QWOA 1DEJA 3CHWA 4M7YA 1RDWX 5AQFA 2QW9A 3DXMB 1YUWA 4IZ9A 3DAWA 1E4FT 2ZGYA 5EOYA 5KPRA 3CIPA 3QMLA 1G99A 3TPQA 3CERA 3QB0A 1QZ5A 2ZGZA 4A2BA 3FZFA 3VPZA 5LJVA 3ENHA 1NBWA 4IXCA 3VEZA 3ENOA 2DPNA 3D2FB 5AQNA 4BVPA 3A5MC 3O5BA 3DXKA 1GLFO 5AQGA 1BWFO 5BRFA 5KPTA 4WQ4A 1S22A 5AQVA 3ZX3A 1GLEG 5AQWA 1NMDA 3UE5A 4C23A 4CJ7A 1C0FA 1NGJA 3UKUA 3H3NO 1SZ2A 5AQXA 5JICA 2WUSA 1HKGA 4H0XB 3EKSA 3LM9A 4A61A 2AP1A 4BGAA 2QWRA 3BF1A 2E88A 1BUPA 5BN8A 4RCHA 1HJOA 2KHOA 1Z05A 4FWRA 2QWNA 2V51B 4WYBA 1DKGD 4EAHD 4NO7A 4BRGA 4IJAA 3M1FA 2F9WA 4CZHA 5EVZA 2V52B 4XH4A 5AR0A 4JAXA 4MLEA 4KBOA 3ZEUA 3A5LC 1U6ZA 2A40A 4XH1A 4CBWA 2P9KB 5ADXA 3QBXA 5AQPA 3IMXA 3HI0A 1KAXA 4BRAA 1ATNA 4BGBA 4E1JA 2VYPA 4FWLA 5B8HA 3GE1A 4B1XB 4BRCA 4H03B 1H1VA 3WXIA 4I6MB 5LJWA 3LDPA 1HLUA 3D2EB 3UKRA 2I7NA 2E20A 4O8KA 1HKBA 4H5VA 4CZFA 3D2FA 3LM2A 5AQRA 5AQMA 2VWBA 3LDNA 3VGMA 3WEEA 3HZ6A 1LOTB 3JS6A 2E2NA 3MN7A 3VEYA 3KVGA 3BF3A 3U9DA 2QWLA 1DGKN 4A2AA 1QQMA 2YHWA 3EL2A 3G25A 3L6QA 4J8FA 4O5FA 4BG8A 1K8KA 3GOIA 4CZEA 5BPLA 3A5OC 4FWMA 2A41A 1BO5O 4BC5A 3VETA 3ZX0A 4BRNA 1CZAN 5AQJA 3F9MA 1TUYA 4Z94A 5AZJA 1RFQA 3SLCA 3MN9A 3EN9A 3J8AA 3CJCA 4B1YB 1T6DA 1QHAA 4FPAA 4BC3A 1NGHA 2YJFA 3UB5A 3O6WA 2V7YA 3VGKA 2BUPA 4BR9A 2P9KA 2P9IA 5BRHA 5KPZA 1Z6RA 5EX5A 2ASPA 1U2VB 2A42A 1MWKA 1TUUA 3M6GA 4CD1A 4CBXA 3MCPA 1HX1A 2OANA 3CETA 4ISEA 4YDUC 3CI5A 1X3MA 1NGAA 4BRQA 1KAYA 4FSVA 4H5NA 4I6MA 4BRFA 4H0OA 3RSEA 4BQLA 3H1VX 3FZLA 1SQKA 3A0IX 1QQOA 1XC3A 3TU5A 1NWKA 2E2OA 2YI1A 1MDUB 4BREA 2E2QA 1JCGA 1TYQB 2IIRA 3QFPA 3CJ1A 5AQTA 3IFRA 3FFKB 2FLOA 1NGCA 2W41A 2P9SB 3O1BA 4BRLA 3GBTA 4JHDB 3VEWA 4CZMA 3FZHA 4BRDA 4Y0WA 5AQQA 3H1QA 5KQ8A 3GL1A 4FOIA 2Q0UA 4K41A 2A5XA 1GLJO 1HPMA 2BTFA 2IVPA 4FPBA 3VEOA 4EHTA 1P8ZA 4NB4A 1NM1A 4CZKA 4H0VB 2CH5A 1MA9B 3WT0A 2E2PA 1X9JA 1Y64A 3A8YA 4DB3A 1JCFA 5AZIA 1MWMA 2P9LA 3B8AX 2ZWHA 4RWTA 1NGGA 5FPNA 5ADXH 2FXUA 3VENA 4PL8A 5I9EB 3O08A 3WXLA 4BR2A 1YXQA 3DXMA 3WXKA 3ATVA 4GNIA 4JN4A 1U2VA 5AFUA 4BRMA 3ZETB 2HF4A 4FWQA 3ULEB 3FLCO 5AQUA 1WOQA 2H3GX 1ZXOA 4H5WA 2GWJA 4QS7A 2EWSA 3WUHA 2HOEA 2ASMA 5E84A 5EY4A 4XH5A 1T44A 1QQNA 3BEXA 4FWPA 3VESA 1BU6O 3VF6A 3CJBA 2CGJA 5AQIA 3L0QA 3H6EA 3CJ7A 5AQOA 1TYQA 4BROA 3SJHA 2J4RA 1V4TA 3EKUA 1ATRA 3C0BA 4XEIA 2P9PB 1GLAG 4CI6A 5E26A 3FE1A 3EZWA 4K42A 3HTVA 4M63C 3MN5A 4IO8A 3DJCA 4B1VA 3H3OB 3I33A 3ID8A 3O80A 4BR4A 4IJNA 2QM1A 2D1KA 3ZX2A 2E1YA 2ITMA 3DXKB 1C0GA 3SMPA 1HKCA 3ATUA 3GDQA 4BRKA 4PKHA 4FO0A 1KXPA 4B9QA 1IJJA 1XQSC 4YDUA 1GLCG 2FF6A 5BN9A 2P9NB 3UKUB 3CQXA 3WXJA 3O1WA 5F0XA 1IG8A 2FSJA 3QDKA 1V4SA 4BR7A 4FWSA 2QWQA 4BR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FROA 1JLGA 1BISA 3O4NA 5JLHA 3AO4A 4A5AA 1KVAA 4B9LA 3PY8A 2E8AA 5AQZA 2ZQBA 5M1KA 4JI1K 3FGUA 4ELTA 1NGIA 3BZCA 1RBSA 3E66A 4EZ9A 3R9PA 2XRIA 3BZKA 2GWKA 4DFMA 1J5OA 3WXMB 4YOVA 3RTVA 2ITGA 3SV4A 1C0TA 3JXUA 4I9QA 2Q31A 4LF5K 3PO4A 4N47A 4F3OA 4FWNA 1EX4A 4BVOA 2Q1NA 3R1XA 3VOVA 4BRPA 3HK2A 3FR0A 3TSUA 3CFRA 1NGEA 5BPMA 1A5WA 1TK0A 1GLLO 1YVNA 3OS2A 2NRHA 1ILYA 4DR1K 4CIGA 2FSKA 5CR4A 1WB9A 4M7XA 2JWLA 2GBZA 2G8VA 1WNSA 3OA9A 2P9NA 3M5RA 4AILC 5JS1A 1K8KB 3AARA 3IUCA 4DV3K 2GTDA 1JL2A 3PIOL 1K8AO 1D5AA 3MDQA 2Q2RA 3I55N 4MO4A 2E6MA 4FLUA 3LZIA 3H45C 5AZJB 4O5BA 1VSIA 2E1ZA 3OYGA 3CFOA 4YOWA 4CF0A 2KQ2A 2OA8A 3ID6A 2LSNA 1N34K 3GG4A 1T6CA 1W2BM 4HWIA 4LF9K 4Z4HA 1HR0K 3NF7A 1LWEA 1NKBA 3LDLA 2HW3A 4AM6A 2P9SA 4BRIA 4JHDA 3AVIA 5TKWA 3S41A 1QZ6A 3RSEB 4H5RA 1EQYA 3J7YP 1WAFA 5AQHA 3HXMA 4M3RA 2UU9K 2QWMA 1WBDA 1JXBA 3O8MA 1X9SA 4DV5K 3CPEA 1ZBSA 3DMJA 5TKYA 4CZLA 1Q7YO 3V9ZA 4MDBA 1WSGA 5FPDA 1XHXA 4KHPK 5M1NA 1HJRA 4H5TA 1YT3A 1KVCA 4CF2A 2WBNA 1NOYA 1NU0A 4MO5A 4DFPA 1NK0A 2XO7A 2P1JA 1RBRA 4MLHA 1EP4A 4FJ7A 1SS6A 1XUPO 1JXEA 2FSNA 3G71N 1U48A 1IG9A 4FW2A 3BP8A 5AZIB 1EWQA 1Q86O 2D0CA 1RTHA 2KLAA 3EYZA 4H0YB 2NRXA 1RDCA 5BRDA 4DS5A 3EY1A 4FJKA 5CE3A 4FJ8A 2BDPA 1DEJA 3T69A 4K8ZA 4KHYA 4IZ9A 2HNZA 4FJ9A 4CHOA 1E4FT 1HRHA 1TKZA 2IC3A 3AO3A 4DR7K 3CIPA 3QMLA 3LP0A 3TPQA 4DUZK 4C8KA 1EO1A 3QB0A 1QZ5A 1T3VA 1YIJN 4M3WA 1Q9XA 1NG9A 2HBMA 3G0ZA 3KTQA 3ENOA 2B4JA 2DPNA 1HNXK 1S1TA 4BVPA 3KK1A 3S3MA 4KHWA 5FDLA 1I3AA 4CIEA 1RBTA 5BRFA 1VSKA 1S22A 1ZBUA 3VQ4A 1GLEG 4IFEA 4CJ7A 4J2EA 4HHTA 4BWMA 3ZYYX 3TABA 2WUSA 4A61A 4FM2A 3EKSA 1VQPN 2AP1A 1RT6A 5GIPA 1TAQA 4FVMA 3THXA 3TAPA 2W42A 1HMVA 3C6TA 1Z05A 4FWRA 4DTSA 3LZJA 4NO7A 2HHHK 1E3MA 2GX9A 3Q7BA 1IV0A 3ZEUA 1FXXA 5I3UA 3E9OA 2P51A 4XH1A 1VSMA 3QBXA 3AA5X 4BRAA 1C1AA 2OPQA 3JYTA 3TAFA 2VYPA 5B8HA 1NKEA 2NUBA 3LALA 2HNDA 3CCQN 3AO5A 3CM5A 3ENBA 4E1NA 4OVLA 1OVYA 4KPYA 3OYMA 4R79A 1HLUA 3D2EB 4DQIA 4Y1DA 4Q0BA 1QVGM 2X74A 4OGCA 4FLVA 4H5VA 4CZFA 3SUNA 2VWBA 4JRPA 4IFVA 3LDNA 3MXJA 4CFBA 1UA0A 4RW9A 2YX6A 1LOTB 4QOZB 2E2NA 4KAZA 2X6SA 2ZJQL 5KRTA 3OJUA 1C1BA 1JKHA 4KTZA 3U9DA 4A2AA 3LAMA 3G25A 4JEPA 3OYIA 1Q82O 2VGNA 1ITGA 3O9TA 1SUQA 3HJFA 3PV8A 3DRRA 5GAGP 2WTUA 2G8UA 1CZAN 5AQJA 3KJVA 3DLHA 1RFQA 2ZE2A 4DLEA 3ZSRA 1VQLN 4B1YB 4JKHA 1NGHA 1P90A 4AHVA 4BE0A 4AQYK 2YJFA 4LF6K 2V7YA 4ELVA 2P9KA 3MWPA 1EKEA 4KI4A 2B5JA 2ASPA 3O9UA 3HOTA 4M3TA 4IFYA 3VQQA 2OANA 1T03A 3CCLN 3CI5A 4YHHK 1X3MA 4C8NA 1NGAA 4FSVA 4I6MA 4BRFA 5KI6A 3PIPL 2ATQA 3HM9A 4GKKK 1SQKA 3PSFA 1QQOA 4JI3K 1XC3A 4B9TA 3CMEN 4BE1A 2YI1A 2IIRA 1N8RO 2NRTA 3QFPA 3IFRA 4ILHA 2FLOA 2W41A 5CZ2A 5KGWA 3O1BA 1I39A 3TAQA 1ASWA 3CQ8A 4DWIA 3O3GA 5KQ8A 3I8DA 1DLOA 2Q0UA 4K41A 4OLAA 4H8KA 4DMNA 3T1HK 1BGXT 3IG1A 1N33K 2UUBK 4FPBA 4V19S 1P8ZA 4Z4GA 1MA9B 1VQ5N 3WT0A 2O4GA 2E2PA 2OPPA 1X9JA 2P9LA 1HQEA 1YI2N 1IKXA 5EU7A 2DFEA 2ZD1A 5FPNA 3IAYA 5ADXH 3K5OA 3N4PA 2KW4A 5DK5A 3WXLA 4J2AA 3DXMA 4TSXA 2YNHA 4HUGA 4DR6K 4CEQA 1NMNA 1VSDA 1WOQA 2DFFA 2GWJA 3AA4A 1ZYQA 1VRTA 2O8FB 2O8EB 5CYMA 4IDHA 4YOYA 4FK0A 4OPAA 1T44A 1QQNA 3OYKA 3BEXA 1CZ9A 3SAFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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