2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
3WXKA 4AM6A 1NMDA 4XH1A 2CGJA 3KZBA 5EX5A 2P9KA 3A5MC 3VPZA 4CZJA 2P9SA 2V51B 1HUXA 2A41A 2D1KA 3FZLA 4FO0A 5AQGA 4O5FA 1BWFO 1IG8A 1MWKA 2Q36A 4ISGA 2A6AA 1T6DA 5EXWA 3D2FA 3IMXA 2FLOA 3LDPA 4BRGA 4BRIA 1HKBA 3VF4A 3VESA 3ZETB 1SAZA 1RFQA 3CIPA 1HKGA 4ISEA 2QWNA 2A5XA 3MN6A 1QQOA 1X3NA 5AQOA 2DPNA 3SK3A 2P9PA 1NGJA 4O8KA 3FR0A 3SLCA 1ATSA 3BP8A 3EZWA 3H6EA 3MMVA 4CZFA 5BREA 1Z05A 4BC5A 4PL7A 4FWSA 3D2EB 2UYTA 3ENHA 5BRDA 1DGKN 4RWTA 4RCHA 1KAZA 1KXPA 4MO4A 3RSEA 4JHDB 4DCHA 3CQYA 2I7NA 1YVNA 5AQMA 1XUPO 5CE3A 3U9DA 4WQ5C 1QHAA 2FXUA 1JCGA 2GTDA 3CETA 1NM1A 3FGUA 2NLXA 1GLJO 2IIRA 3BUZB 3ENOA 5BN8A 3DXKA 3DXMB 1CZAN 3I8BA 1WUAA 4A2BA 3LM9A 4M63C 1GLCG 3EKSA 1ESVA 5FPNA 2E1YA 3VETA 5AZJA 3A5NC 3WXLA 3I33A 5I9EB 4KBOA 5AFUA 5BPLA 5JLFA 4GNIA 3LDNA 4BRCA 2J4RA 5AQUA 4EIAA 3CERA 5F2RA 2QW9A 2AP1A 3O8MA 2V52B 5LJVA 4JD2B 4JN4A 1TUYA 3IDHA 1ATRA 4JNEA 4PKIA 2VYPA 3H3NO 1TYQA 2NRHA 1DKGD 2WUSA 3OHRA 2FSKA 2YJEA 5ADXH 4H5WA 2FF3B 3TU5A 1V4TA 1U2VB 4CD1A 3UE5A 3EKUA 5AQZA 2A42A 1BG3A 4FSVA 4B1ZA 5AQYA 4H5NA 1X3MA 4K25A 4BGBA 3UKUA 4PL8A 4K43A 4ISFA 4CZKA 4H0OA 1YXQA 2ITMA 3LL3A 1HJOA 3U8XA 2GELA 4BROA 2NZTA 4GY2B 1IJJA 5E84A 2QM1A 2QWLA 2P9LA 5BN9A 3SMPA 3VOVA 3A8YA 5B8HA 1E4GT 5TKYA 1BDGA 2A40A 3H46O 5AQNA 1J6ZA 4H0VB 1NGEA 5FPMA 3UKRA 2FSNA 4FWQA 4EAHD 5AQJA 4K42A 2P9NA 4BVPA 1ZXOA 3WXJA 3LDQA 4BRLA 5JMVA 4CJ7A 4BR9A 4L3QA 3MK6A 4CZHA 3QDKA 2YJFA 4IJAA 3ULEA 5AQIA 3M6GA 2EWSA 3D2FB 1HLUA 3B8AX 4H5RA 4M7YA 3L6QA 1RGIA 1YAGA 3O08A 5AZIA 3JS6A 1LOTB 4FWPA 3IUCA 4H0TB 1NGGA 1JCEA 3O4WA 3VF6A 3C7NA 2VCPA 2E2NA 2V7ZA 4HTLA 2IVOA 1GLBG 2GWJA 1R59O 5JICA 1Y64A 1V4SA 2ZGYA 1KAXA 4EHUA 1NGBA 4A2AA 1BOTO 5LY3A 2KHOA 2VWBA 4PKHA 3HBTA 3VGLA 2QWOA 3S41A 4H03B 5EY4A 1DEJA 3GE1A 4F9OA 3GL1A 4E1JA 1QQMA 5AQHA 3WEEB 4WQ4C 3VEVA 2E2PA 3WQUA 5AQKA 1K8KB 4BR2A 3DXKB 4H0PA 1NGDA 2E1ZA 4CI6A 1SQKA 1NGAA 2QWQA 1D4XA 2QWMA 3UB5A 4BRAA 3R8EA 1BUPA 4YDUC 2IVNA 4CZMA 1MDUB 4FL9A 4BVOA 3CJ7A 4B1XB 2YHWA 1BA1A 4BR5A 4BRKA 2P9UB 5ADXA 2V7YA 3D2EA 2CGKA 4BC2A 1XQSC 4FWRA 4B1UB 2AA4A 4BG8A 3G25A 3C0BA 1QZ6A 3VGMA 4I6MA 3R6MA 1TYQB 3W3DA 4AM7A 2BUPA 2E8AA 4PKGA 4XH5A 3QMLA 5AQRA 2ZF5O 3A5LC 4DB3A 2Q31A 4IZ9A 2QXLA 4WYBA 4CZEA 2FSJA 3HSCA 4FPBA 4FWLA 3VF2A 3DXMA 2FF6A 3MN7A 1GLLO 5KQ8A 4BRFA 2YCHA 2HMPA 2P9IB 4HWIA 4BGAA 3A5OC 3ZX3A 4FOEA 5LJWA 5AQQA 3FZMA 3ZX2A 4RTFD 4MLHA 3ZX0A 4BQZA 3VENA 3MN9A 4BC4A 1C0FA 1WOQA 2A3ZA 3GDQA 4IJNA 4XEIA 4BC3A 2P9LB 1E4FT 3ZEUA 3O6WA 4JD2A 4CZLA 2W41A 2HOEA 2ASOA 2YI1A 4FOIA 2Q0RA 4EHTA 5KQDA 3VEWA 3WUHA 2E88A 5AFUH 3U4LA 2CH5A 3O5BA 1NWKA 2I7PA 3MDQA 3IFRA 3AY9A 1BU6O 1S22A 2HF4A 4BRPA 1MA9B 1HX1A 3ID8A 4DQ8A 5BRFA 2GEMA 2P9KB 3R9PA 2D0OA 1T6CA 4H0YB 2P9SB 3HI0A 4BR7A 3FLCO 5KPZA 2Q1NA 3VEXA 3WXIA 4CZGA 5AZIB 3KHYA 4LC9B 4NO7A 4BREA 1NLVA 5F1XA 4CD3A 1S3XA 3FFKB 5F0XA 3O1BA 2Q2RA 3O1WA 2W40A 5FPEA 1SZ2A 1JCFA 5BPNA 3GG4A 2E20A 5EVZA 2P9PB 5AQXA 3M1FA 1KAYA 2F9WA 5AQTA 4IXCA 5AQSA 4BQLA 1HPMA 1EQYA 1G99A 4CBXA 1GLFO 3TPQA 3F9MA 2GWKA 3RSEB 2H3GX 1OKJA 3BF3A 4CZIA 4BR4A 1NGFA 2D4WA 1NBWA 4H0XB 5KPRA 3LM2A 3AAPA 3QICA 2QWPA 1T44A 4DHYA 3HTVA 3VERA 4B1WB 2Q0UA 2BTFA 4QS7A 3CQXA 3CJ9A 1X9JA 4H5VA 3DWLA 4BRNA 1Q18A 4CBUA 3CI5A 1XC3A 4FWNA 1LCUA 3ZETA 1ATNA 3FZKA 3O80A 4BRDA 1ZC6A 3JXUA 5ELZA 4A61A 5BPMA 5AZJB 3VGKA 4Y0WA 4EFHA 5AQFA 2GUPA 3M3ZA 3QFUA 3QFPA 2YHYA 4IO8A 2HF3A 3SMSA 3QBXA 4MLEA 3WT0A 1YUWA 3BF1A 3MN5A 4FWMA 5AQWA 4WQ4A 2QWRA 4I6MB 3SJHA 3FE1A 3CJBA 3DAWA 5AQPA 3WEEA 4B1VA 4JHDA 4QS9A 3QBWA 4WQ5A 1GLEG 1RDWX 1H1VA 2ZGZA 3D7EO 5JLHA 2ASMA 3A0IX 4FPAA 3W0LA 1K8KA 5KPTA 3FZHA 4MO5A 2ASPA 4JAXA 5EOYA 3CJAA 1TUUA 5AR0A 1U6ZA 2E2OA 3QB0A 4YDUA 4B9QA 4B1YB 3LDOA 3GBTA 3VEYA 1NGHA 3HZ6A 5AQVA 1ZBSA 3VEZA 3CJCA 4BG9A 3KVGA 1GLDG 2P9UA 3BEXA 3FZFA 3VEOA 3HM8A 4Z94A 2PAVA 4IWVA 5BR9A 2E2QA 3AARA 3UKUB 4BRMA 1QZ5A 3ZEUB 3H1QA 2CGLA 4NB4A 1MWMA 1NGIA 1GLAG 4K41A 2IVPA 3CHWA 3EO3A 3U9ZA 1C0GA 1HKCA 4BRQA 3AAQA 4CBWA 5BRHA 4FWKA 3H45C 3WQTA 2ZWHA 1NGCA 4QS8A 3EN9A 2F9TA 3UKRB 1Z6RA 3ATVA 4J8FA 4C23A 3MCPA 2P9IA 3J8AA 1BA0A 2P9NB 3L4IA 1U2VA 3L0QA 3ATUA 3LDLA 1P8ZA 2OANA 2D0PA 1BO5O 3H1VX 3H3OB 3ULEB 2PBDA 5AQLA 3P4IA 3GOIA 2Q97A 2YHXA 5E26A 3DJCA 3EL2A 4FWOA 4A62A 4BRHA 4M7XA 4XH4A 1QQNA 4BR0A 3C7NB 4H5TA 2CH6A 3CJ1A 5FPDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VG6A 3VQ9A 4XH1A 1VQ6N 2P9KA 3A5MC 3ITHA 3LZIA 4CZJA 3QLHA 5M1KA 1RDBA 1ZBLA 4LFCK 4BE0A 3ZT3A 4Z4CA 4BDYA 4FJ7A 4JK7A 2FLOA 3SUPA 4M3XA 1SAZA 5GIOA 3CIPA 4CCHA 4CJVA 1DLOA 4HCBA 4EP4A 4FJ5A 3EEQA 4BE1A 4CHZA 1QQOA 5J2PA 1X3NA 4CF1A 2DPNA 3AGKA 3QO9A 1NGJA 4O8KA 3NH2A 3OYIA 3NHGA 3SLCA 1ATSA 1K6YA 3BP8A 3EZWA 5BREA 1N5YA 3VQ5A 4FWSA 3ZSOA 1ILYA 2UYTA 4JKAA 1LW2A 1Z25A 2HW3A 4DCHA 3BZKA 3CQYA 4ID1A 1TAQA 5AQMA 1XUPO 5CE3A 3F2KA 1JCGA 2GTDA 4XJXA 1P90A 2IIRA 2PFUA 4B8AB 4MFBA 2P1JA 3ENOA 1BISA 1XMOK 3DXKA 1WUAA 3LM9A 3CCQN 2HHWA 1VQ4N 4FLVA 2QEXN 1EO1A 3O3HA 5I9EB 1Q82O 4BE7B 5BPLA 3K9KA 4BRCA 4KRFA 5CR4A 5F2RA 1QVGM 4WFNL 1KRPA 3O8MA 2GX9A 2V52B 3HXMA 4E7LA 4JD2B 1LWFA 4ELVA 4JNEA 3AV9A 1QE1A 4M3WA 2VYPA 3H3NO 1JL2A 4YOTA 3OHRA 4FYDA 2PZSA 1DTTA 4KHQA 1REVA 4NXMK 5ADXH 4CFCA 2E5LK 3TU5A 1V4TA 3MEDA 3THXA 4CJFA 1SKWA 2PYLA 4LH5A 4CK3A 4OKJA 5AQZA 1J53A 4FJHA 2Z1JA 4DSLA 4H5NA 2WBNA 1L3VA 3UKUA 1VSHA 4PL8A 4CZKA 1HJOA 3KKSA 2GELA 5DM7L 4OPHA 2F8SA 4MDAA 4ILHA 3SZ2A 1FJGK 3CCUN 1A5XA 5TKYA 3H46O 5AQNA 1J6ZA 1RTDA 4KHSA 5FPMA 3VQ4A 3OA9A 4FJ9A 4CJRA 4HTUA 4KH6A 1ASWA 4K42A 4BVPA 3THYA 1C0MA 3G71N 2O8BB 3SAHA 2YJFA 1RTIA 1HYSA 2VQFK 1O13A 1HLUA 3B8AX 3L6QA 4Z4HA 1RGIA 5M1FA 3O08A 3ZSXA 3DOLA 1JXEA 2B4JA 4YY3K 4H0TB 3O4WA 4Q0BA 1BIUA 2FBTA 2VCPA 4DS4A 3TWHA 2V7ZA 3CC2N 2IVOA 4CJQA 3MECA 5JICA 4DV0K 4A2AA 1KTQA 1U4BA 1BOTO 2FBXA 4LSLA 3HBTA 3S41A 4H03B 1TAUA 1EX4A 3THWA 3WEEB 4FK2A 1KLNA 4BR2A 3DXKB 5M1NA 1NGDA 3KWIA 3EY1A 2E1ZA 2QWQA 3OYJA 3RR7A 5HL7L 5HP1A 3TTDA 3PO4A 4FL9A 2QA4N 5CZ1A 5AJ3K 3O3GA 4BVOA 2O8CA 4LF6K 4B1XB 2YHWA 4KHNA 3ISNC 5LL6Z 3SQ1A 3SPYA 2CGKA 3G6EN 4C8NA 2RF2A 2AA4A 4BG8A 3DI6A 2D0CA 3AVBA 3C0BA 4JI8K 4O8UA 1LWEA 4I6MA 1VRTA 2BUPA 4IFYA 3MXMA 4IFEA 2ZF5O 3A5LC 4JI4K 3V1OA 4DB3A 2HHXA 1EKEA 2FSJA 4FM0A 4FWLA 2FF6A 3MN7A 1GLLO 3SV3A 1RBVA 4C8KA 4FLXA 1DT9A 2P9IB 2YCHA 4B3MK 4KO0A 1NK5A 1O1WA 5C12A 4AHVA 2B5JA 3E1YA 4RTFD 4CJ4A 4A57A 2DFEA 3VENA 4IOAL 4LF5K 3KK1A 4LFBK 5CY4A 4BC4A 4FM2A 1C0FA 2A3ZA 1RT4A 3ZEUA 3G0ZA 3NAEA 3C65A 1N36K 3LP0A 3Q7CA 2OA8A 3WUHA 1VSDA 4KREA 1VQLN 2O8EA 2I7PA 3SNNA 3IFRA 3THYB 3JSMA 4I2QA 4AHCA 4ELUA 4H0YB 2P9SB 3HI0A 1VAZA 5KPZA 1S5JA 2UXCK 3SJJA 1KVBA 4BREA 3T3FA 3QNOA 4U7BA 3CM5A 1NLVA 3DLGA 1S3XA 3FFKB 3O4QA 2IAJA 5FDLA 1YVUA 4QAGA 3DM2A 3O1WA 2W40A 1SZ2A 1JCFA 2E6MA 5BPNA 4JKBA 4BECA 2AJQA 3I0RA 1HPMA 1EQYA 1LWCA 5GADP 2OTJN 4DR6K 2E4LA 2KLAA 3KLHA 1Z26A 4DQIA 1G15A 2OPPA 4Z4EA 5M1QA 2YNHA 3J7YP 4IG3A 5FROA 3F73A 4FJNA 1JLCA 1T44A 3HTVA 2KW4A 3VERA 2Q0UA 2KKZA 1RTHA 4Z4FA 3HP6A 4H5VA 1IG9A 4Z4GA 3DWLA 4BRNA 4ZTFA 4CBUA 1RDUA 4GV6A 4DTJA 4DR4K 4BY9C 4C8MA 5BPMA 1WN7A 4Y0WA 1XI1A 1RCHA 3EYZA 4Y1DA 4J2BA 3M3ZA 3KTQA 2IS3A 3SMSA 3ZSRA 5HROA 3QBXA 4OKEA 3I55N 3MN5A 3HVTA 4FWMA 3CD6N 4I6MB 4JKEA 3CJBA 3TAEA 4B1VA 3TI0A 4DF8A 4CEZA 5JLHA 4WCEL 2KZMA 4FPAA 5KPTA 5HOOA 1TUUA 4CE9A 1W0HA 3KLEA 5HRSA 5GAHP 4JI0K 1S6QA 4J2DA 3HZ6A 5C2FA 3CJCA 4BG9A 4E89A 4DKWA 3VEOA 2PAVA 4CEDA 4IWVA 5BR9A 3AVLA 4YHHK 3ZEUB 3AA4A 1GLAG 3CHWA 1EWRA 3T19A 3EO3A 4M3ZA 4BRQA 3AAQA 4CBWA 5BRHA 5T7BA 1TV6A 3OYKA 4DTNA 2ZWHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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