2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
3KZBA 4QS8A 3WXIA 4BR4A 1U6ZA 1J6ZA 3MN5A 3QBXA 3SK3A 1DKGD 2Q0RA 4Y0WA 1U2VB 2E2OA 3ID8A 2GWJA 2IIRA 2YI1A 2I7PA 4XH5A 4L3QA 3CJ7A 3R8EA 4M7XA 3VGMA 4B1YB 4BRQA 2OANA 4C23A 4MO4A 3D7EO 3HM8A 1HPMA 2P9KA 3L0QA 2BUPA 5AQOA 3ZX2A 2CH6A 1YUWA 1NGJA 3HZ6A 4I6MA 3M1FA 2AP1A 3O08A 3CJCA 1LOTB 4FWQA 3CJAA 2QWMA 3GE1A 3W3DA 3DXMB 3VEYA 3DAWA 2VCPA 1HKCA 1P8ZA 3W0LA 3U9ZA 1QZ6A 1HKGA 3LL3A 2HF4A 3C0BA 4H5WA 4K42A 5FPNA 1SAZA 3O4WA 5E84A 3FZFA 1X3NA 4PKIA 4QS9A 5AQMA 5AQIA 1DEJA 1HJOA 3IFRA 4HWIA 1NGIA 3LDOA 4IJNA 4BRGA 4A2BA 5AQKA 2E1ZA 1X9JA 5EY4A 1QZ5A 3F9MA 3SJHA 4AM7A 3BP8A 4B9QA 5I9EB 5AFUH 1Q18A 3CJBA 2V52B 4FOIA 4BR5A 4FSVA 2P9UB 4JD2B 3JS6A 3MMVA 3VGLA 2V7ZA 1ATRA 4M7YA 4B1XB 3VESA 2A6AA 1BUPA 5AZJB 3A5NC 1BWFO 5JMVA 4IWVA 2QWQA 2A5XA 5ELZA 3WEEB 4BR7A 1KAXA 3LDNA 5AQZA 4BQZA 2DPNA 3BEXA 2P9SA 3A5OC 5AQJA 3RSEB 3O1BA 2P9NA 4FO0A 5AQVA 1YXQA 5JLHA 3EN9A 1T6CA 1XC3A 2FF6A 2W41A 2F9TA 2QWNA 4DCHA 4CD3A 2P9IA 2QW9A 3HTVA 5LJWA 4NO7A 4H0PA 3O6WA 5AZJA 4DQ8A 3DXKB 3QMLA 3QICA 1JCEA 2IVOA 4GNIA 3WXKA 4CZHA 2FSJA 3S41A 4CZFA 5AR0A 3MN6A 3FZHA 4BR9A 2QWPA 5AQTA 4BREA 4FWPA 4BROA 4DHYA 5AQLA 4H5NA 1HLUA 3QFUA 5KPTA 4ISGA 1NGDA 5ADXH 4BC4A 1ZXOA 3EL2A 3EZWA 3H3OB 4QS7A 2NLXA 2A41A 3VETA 3LDPA 2ASOA 3M3ZA 3L6QA 1R59O 3HSCA 2CGKA 5AQFA 3I33A 4BRKA 4F9OA 3O1WA 3C7NA 4H03B 4B1VA 2E2QA 3H6EA 4H5VA 4PKGA 5KPRA 4CBWA 3IUCA 4FWNA 3ENOA 1BA1A 4IZ9A 3VF6A 2J4RA 3ZX0A 5FPEA 3UKRA 3B8AX 5AQGA 1XUPO 3WUHA 1GLCG 3ULEB 3KVGA 2D4WA 4JHDA 5F1XA 4RWTA 5KPZA 5F2RA 5BRDA 4HTLA 3LM2A 4FOEA 3VEZA 2D0OA 4JN4A 4BVOA 5BN8A 1QQMA 1KAYA 4WQ4C 1NGFA 1JCFA 2ZWHA 4BGAA 1U2VA 3VPZA 2A42A 3CJ1A 5AZIA 3ZETB 1QHAA 1GLBG 5LY3A 2PAVA 5AQUA 4CZJA 1RDWX 4CZMA 4FPBA 3FZLA 5KQDA 4IXCA 5AQWA 3CHWA 4BQLA 1QQOA 5BPMA 1EQYA 2E2PA 3IMXA 4H0YB 3L4IA 3VEXA 4E1JA 5BREA 4Z94A 2Q2RA 3DXMA 3FGUA 4FPAA 4M63C 1XQSC 4BR0A 1RGIA 2FLOA 4BRPA 2CH5A 2YHWA 1NMDA 1GLAG 1TUUA 4FWLA 2E8AA 4WQ4A 3I8BA 2FSKA 2QWOA 3D2FB 1HX1A 5AQPA 2P9PA 4BGBA 4BRDA 1G99A 4FWRA 4BC3A 2GEMA 4BRIA 4DB3A 3UE5A 3IDHA 4CZKA 1TYQA 4FWOA 5AQYA 4BR2A 2VWBA 3FR0A 2VYPA 4BC5A 3VGKA 3FZKA 1V4SA 2YJFA 2A3ZA 3BUZB 4BRAA 5AQSA 2Q1NA 4CZEA 2ZGYA 4GY2B 1MA9B 4JAXA 4RCHA 5F0XA 4WYBA 4LC9B 3CERA 4FL9A 4RTFD 3ZEUA 3A5MC 4B1UB 4CI6A 1IG8A 2P9SB 3LDLA 3VERA 1K8KB 3CI5A 5EOYA 3C7NB 4K25A 3U4LA 1GLJO 3QFPA 2V7YA 1HUXA 1C0GA 3WQUA 5AQRA 2BTFA 5AQNA 4A61A 4BRFA 5LJVA 3LDQA 3LM9A 1BOTO 3ATUA 3VF2A 3BF1A 5BN9A 2GWKA 4BRLA 4IO8A 5AQXA 2GTDA 3HI0A 2WUSA 4ISEA 1ZBSA 1HKBA 3R6MA 4PKHA 3ZEUB 3VEWA 3JXUA 5EXWA 3AAPA 3VEOA 3QDKA 5BPNA 1E4GT 1WOQA 2P9PB 1NGGA 3H1QA 3AAQA 4CZLA 1BG3A 1JCGA 1K8KA 5EX5A 4BRHA 3UKUB 2E1YA 2ASMA 2NZTA 4MLEA 1SQKA 4JHDB 2QM1A 3ATVA 2FXUA 3WXLA 2ITMA 4CD1A 1ESVA 2E20A 3GDQA 3EO3A 2Q31A 5BRFA 3WEEA 1SZ2A 2FF3B 3OHRA 5AQQA 3HBTA 3J8AA 3H3NO 2ASPA 5AFUA 2QXLA 4EHTA 4O8KA 1Z05A 2YJEA 1KAZA 1D4XA 1MDUB 3VEVA 3VOVA 4O5FA 1NGHA 3GG4A 3CQXA 2CGLA 4EHUA 3FZMA 3WXJA 1BU6O 4FWKA 3GL1A 2P9LB 4IJAA 4J8FA 3U9DA 4XEIA 3SMSA 1C0FA 5E26A 3QB0A 4JNEA 3P4IA 5BPLA 2HMPA 3WT0A 2YHXA 1S3XA 3DJCA 4BC2A 4BRMA 2F9WA 1NM1A 3WQTA 5B8HA 2AA4A 3A8YA 2E2NA 4A2AA 4CBUA 3CIPA 1NLVA 1V4TA 4YDUA 1NGEA 3FE1A 4CZIA 2CGJA 4EAHD 4MO5A 4EIAA 4B1WB 4A62A 2P9IB 2HF3A 3CETA 5ADXA 3SLCA 4BVPA 2P9LA 3SMPA 1S22A 1WUAA 5JLFA 2EWSA 1T6DA 4EFHA 3MN7A 1YVNA 2QWRA 3EKSA 4CZGA 1NGBA 2V51B 4K43A 4XH4A 4B1ZA 1NGAA 3ENHA 2YCHA 3GOIA 1GLDG 4PL8A 3H46O 2IVPA 1ZC6A 2Q97A 3O8MA 2QWLA 2IVNA 4H5TA 4H0OA 1RFQA 3U8XA 4K41A 3UB5A 1NBWA 1GLFO 4PL7A 3H1VX 2HOEA 4JD2A 3A5LC 5BRHA 5BR9A 1NWKA 4BG9A 4H0VB 2PBDA 3UKRB 1OKJA 1LCUA 2NRHA 3VF4A 3FFKB 1MWKA 3KHYA 3DWLA 1X3MA 2FSNA 4WQ5C 3CQYA 2A40A 3ULEA 3H45C 3G25A 5AZIB 3RSEA 4AM6A 2KHOA 1ATNA 4MLHA 3TPQA 1H1VA 1ATSA 2YHYA 1KXPA 1E4FT 2D1KA 5FPMA 3MDQA 3QBWA 3ZX3A 4H0XB 2GUPA 3VENA 3EKUA 3ZETA 3M6GA 3MK6A 5JICA 3TU5A 4BRNA 3D2FA 1BDGA 4BG8A 5CE3A 2H3GX 4H0TB 3D2EA 1TUYA 2ZGZA 4KBOA 4NB4A 2E88A 3AY9A 4FWMA 2UYTA 4YDUC 3AARA 3MN9A 1T44A 3UKUA 2W40A 1TYQB 1CZAN 2ZF5O 1YAGA 3CJ9A 3O5BA 2I7NA 3DXKA 5TKYA 1IJJA 1GLLO 3FLCO 5FPDA 3GBTA 1GLEG 1BO5O 5KQ8A 4ISFA 3R9PA 4CJ7A 5AQHA 4FWSA 2P9NB 3MCPA 1QQNA 1BA0A 1Y64A 4BRCA 1NGCA 3A0IX 2D0PA 4H5RA 2P9KB 1MWMA 3D2EB 2Q0UA 2GELA 1Z6RA 3BF3A 4WQ5A 4I6MB 2P9UA 2Q36A 1DGKN 4XH1A 5EVZA 4CBXA 3O80A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI5K 1BHLA 4OGCA 1IBMK 2GX9A 2Q0RA 4ELVA 1XI1A 3T1YK 2JGUA 1XWLA 4M7XA 4C23A 3HM8A 3L0QA 2CH6A 4FM1A 3NF9A 2AP1A 3GE1A 3ZLJA 4E89A 1BIUA 4LY7A 2VCPA 4JI7K 4CK1A 1QZ6A 3MXMA 3ZT3A 4I9QA 2HF4A 3C0BA 4K42A 1SAZA 1SL2A 2PY5A 3RTVA 4BE2A 4CJRA 3FZFA 4PKIA 1LWEA 4CJWA 3MWTA 3RRGA 3IFRA 1NGIA 1UWBA 2ATQA 4IJNA 1ITGA 5AQKA 3JAMO 3THXA 5EY4A 4HVJA 1X9WA 1LAWA 3SJHA 1VSDA 2VWKA 3CCVN 3AO5A 2AJQA 1Q18A 2P9UB 1WSGA 1TKDA 4B1XB 1IKWA 3HPOA 2G8IA 3A5NC 4IWVA 4AQYK 3I0SA 1B9FA 4B9VA 3BEXA 3VTIA 4CFBA 4W5OA 2WC9A 4IO9L 5AQJA 4O0JA 5DK5A 3OYKA 4OO1J 3OYCA 4LH5A 1XC3A 2W41A 1VSLA 4ZHRA 4CESA 1VQLN 3DLHA 2QW9A 2XY8A 1VSIA 4DR3K 5LJWA 4NO7A 5LMNK 2O8EA 2D0CA 2UUCK 4B9LA 3O4QA 4BDYA 4LF7K 1JCEA 2HBMA 3PLAA 2IVOA 4GNIA 3WXKA 3QERA 4B8AB 5M1PA 1HQEA 4AHRA 4FJGA 2KQ2A 3MEGA 4BROA 4H5NA 4CEBA 4JK8A 1S5JA 3CPWM 2NLXA 3KTQA 3HSCA 1WBBA 3O1WA 4OKKA 1B92A 3WNFA 4W5QA 3HOSA 3G6EN 3H6EA 3VQCA 1I3AA 2NRXA 5FPEA 4U7BA 3WUHA 4DU4A 4NYFA 4CJQA 1GLCG 2RN2A 5F1XA 3CCLN 4JHDA 4E7KA 1U49A 3VQBA 5F2RA 2XY7A 2F8SA 1FKOA 3LM2A 4CERA 2DFFA 3SPYA 3CCRN 2ZWHA 1U2VA 4WFAL 3CJ1A 4RW8A 5AZIA 1QHAA 1GLBG 1LW0A 1IBLK 1YVUA 3VQ6A 3G4SN 3KLHA 5FRNA 4FXDA 4CZJA 4CZMA 4C8KA 3M5RA 4BQLA 2E2PA 3R1XA 3EE9A 5C0YA 3F2KA 1UOCA 4Z94A 1XQSC 3OJSA 4FJIA 2Z1IA 3BZCA 1NK0A 1VQNN 2WFBA 4BRPA 1Z25A 4HUGA 3V9XA 4DMNA 1YTUA 3TTFA 5HBMA 4J2DA 3VQ4A 4DUZK 2HNDA 1TL3A 4E3SA 3ZCMA 2E8AA 4A5AA 3D2FB 2EHGA 1J5OA 2Q3SA 4BRDA 1JJ2M 3THXB 3QLHA 4BC3A 4DB3A 5KRSA 1NK5A 2E6LA 3J81O 3IDHA 4CZKA 1NU0A 4CIGA 5AQYA 4KI4A 3F73A 3VTHA 2VWBA 3ZT1A 3FR0A 2VYPA 3VGKA 2B5JA 5LMUK 5EU7A 4CEQA 3L2UA 3LZIA 2G8VA 4CJPA 2P1JA 3RMBA 5AQSA 3IKMA 3DOLA 1N8RO 4G9ZA 1RDDA 3O9QA 3J80O 3TAMA 3CERA 1UA0A 3VN5A 4RTFD 4YOXA 1NJXA 4DS4A 4X64K 4BACA 1CLQA 2KTQA 4C8OA 3LDLA 3VERA 4FM2A 4OPHA 1Q7YO 4CHZA 1SKRA 2G8UA 3LP0A 3ZT0A 4RW7A 2ZJQL 4BY9C 3OYFA 2W6KA 4DQPA 4DTSA 3ZSVA 4OLBA 3CMEN 2RKIA 1YJNN 1ZBSA 3VA3A 1QQCA 1HKBA 3E9LA 4GW6A 4B9NA 3QESA 3JXUA 4Z4IA 1HYSA 1RBVA 1E4GT 2YNHA 2P5OA 4OPAA 2UUBK 4KH4A 1OH7A 4F4KA 1K8KA 4KTWA 3DM2A 5GIPA 2NZTA 4MLEA 1SQKA 1TKTA 4JHDB 4FK2A 4CGGA 4BE1A 3WXLA 1ESVA 2E20A 4OLAA 3ZYYX 2WOMA 3M8QA 1LWCA 1OH8A 1RTHA 1FKPA 4Y1CA 3HBTA 3J8AA 4DLEA 3I8DA 2QXLA 3SQ4A 3BGRA 5A2QO 2W6LA 1F21A 3VOVA 3VEVA 4RG8A 1BL3A 1VRUA 2CGLA 4QOZB 3FZMA 3WXJA 1HNWK 2P9LB 3F9KA 3U9DA 4XEIA 3SMSA 1VSMA 2OPQA 2HMPA 2VQFK 3WT0A 1KTQA 3DJCA 3A2FA 4KTQA 3D45A 2E2NA 4CBUA 4XIUA 3TTDA 3RMDA 3KLFA 3NCIA 4F3OA 2CGJA 2X6SA 4CF8A 1T8EA 4TSXA 1U45A 4GKKK 2NRTA 2P9IB 3SCXA 4FJJA 1WUAA 4CK3A 2ZJPL 3B6OA 1T6DA 3MN7A 4EP4A 4IEEA 1L3TA 3ISNC 1UAXA 5HRPA 4GV9A 3EKSA 1NG9A 3BDPA 1NGBA 2V51B 1ZBIA 1JLCA 4B9SA 1QSYA 3HJFA 1CZ9A 1ZC6A 2Q97A 2IVNA 2KLAA 4H5TA 4JI6K 4JKGA 3UB5A 4CJ3A 3M8PA 4CE9A 4H0VB 3EYZA 3CCEN 3D6RA 4DV1K 1OKJA 3VF4A 3FFKB 1MWKA 3KHYA 2UXBK 3DWLA 2FSNA 1SUQA 1ATNA 4MLHA 3TPQA 4M45A 1ATSA 3SZ2A 2YHYA 1RT2A 3ZX3A 4H0XB 4FZZA 4KPYA 4OKEA 3M6GA 4IG3A 1EO1A 5JICA 3D2FA 1BDGA 4BG8A 2O4GA 3TAQA 3QEIA 2H3GX 3D2EA 4NXNK 4FWMA 4GVMA 1WBDA 3AARA 4A59A 1TYQB 1CZAN 2UUAK 4JK7A 4LF4K 3CM6A 2ZF5O 4IBNA 2ZM6K 4N41A 3FLCO 1RDUA 5FPDA 2YNFA 3ZSYA 4IOAL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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