2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
4FO0A 3CJCA 2P9IB 2KHOA 3A5NC 4M7YA 3WXJA 4BRNA 3VGMA 1E4GT 3FLCO 5JLFA 4CZLA 2P9NA 3JXUA 3H45C 3ULEB 4K25A 5KPRA 3ENOA 1Z6RA 1QZ6A 1NGGA 4YDUC 1S22A 1BU6O 4BRIA 2YHXA 5LJVA 4PKIA 4BR2A 3LM9A 3ATUA 4A62A 4BRCA 1ZBSA 5AQYA 4ISGA 3L6QA 3H1QA 1DKGD 3QMLA 3HI0A 4FSVA 1YAGA 3VEXA 3VF2A 3MK6A 4EHUA 3O6WA 4NB4A 4WQ4C 4Y0WA 3S41A 4PL7A 4BROA 4CBXA 3EN9A 3GBTA 4EAHD 4B1VA 2J4RA 1KAZA 3O1WA 4KBOA 4MLEA 1BA0A 4A61A 3MN5A 3BEXA 2W40A 3QBXA 3WQTA 3J8AA 4K42A 3CETA 4FWKA 4M7XA 5ADXH 2FF3B 4E1JA 2E2OA 3L0QA 3UB5A 3DXMA 3M3ZA 5AQUA 1HKGA 2D4WA 2ASOA 3LDQA 3A5OC 1J6ZA 3ZETA 5FPDA 4JHDB 4K43A 5AZIA 3VF6A 4O5FA 3LDLA 3MN6A 1Z05A 2BTFA 3FGUA 2ZGZA 3G25A 2YHYA 3AAQA 1IJJA 2P9LA 2I7PA 4FWRA 4BR5A 5BN8A 2P9PB 3AARA 4BRMA 3DWLA 1NGFA 1X3NA 4BRHA 5AQLA 3FR0A 5AZJA 4B9QA 1YXQA 4B1ZA 2W41A 3MN9A 3H6EA 2IVOA 3IDHA 4J8FA 3U9ZA 3EL2A 3CIPA 1DEJA 2HMPA 3H3NO 4H0YB 2E2PA 1XQSC 1RDWX 2CGKA 2A3ZA 5AQQA 4CZIA 1QZ5A 1DGKN 5FPEA 2D1KA 4JN4A 4K41A 4BGAA 4FWPA 2DPNA 1HKCA 3UE5A 2QWPA 3DXKA 1RGIA 1T6DA 4H0OA 3ZX3A 3RSEB 3W0LA 2AA4A 3HBTA 4AM6A 4CD1A 2A5XA 2BUPA 1LOTB 1YUWA 4JAXA 1NBWA 2P9SB 3P4IA 4FWLA 3VETA 4BG8A 5LY3A 4B1UB 2QWLA 1QQNA 4F9OA 5FPMA 5AZJB 4BR0A 2FXUA 2P9IA 1BOTO 1BO5O 2GEMA 5AQHA 3R9PA 1U2VA 3BP8A 3UKUA 2FSJA 1HUXA 3C7NB 4LC9B 4FOEA 3WEEA 2P9NB 5AQXA 1NGHA 5EX5A 5EY4A 1RFQA 1HKBA 2CGLA 5AQZA 2GWKA 5AQIA 4DCHA 5AQVA 4I6MA 2FSNA 1T44A 3IMXA 2QWMA 3HSCA 3CQXA 3O1BA 4BRFA 5AQRA 4JHDA 4IJNA 2EWSA 1X9JA 1T6CA 4CBUA 4MLHA 1NWKA 1QQOA 4EIAA 2FF6A 1V4TA 2V7ZA 3L4IA 3D7EO 1MA9B 2UYTA 2VCPA 4WQ5C 4BR9A 3VEWA 3VF4A 2Q31A 3EKSA 5AQMA 5AQWA 3F9MA 4BQLA 1SQKA 4IXCA 5AQPA 3ID8A 3UKRA 4FPBA 4H5RA 1U2VB 2HF3A 4C23A 4CJ7A 2P9UB 3LM2A 3WEEB 5KQ8A 1WOQA 3WQUA 2V7YA 5I9EB 1NM1A 2VYPA 4M63C 2AP1A 3RSEA 2FSKA 1BDGA 3I33A 3O08A 3A8YA 3W3DA 2E2QA 1NLVA 1D4XA 3H3OB 1P8ZA 2Q0RA 1HPMA 1TUYA 2A41A 4CD3A 4CZEA 1IG8A 1GLBG 2OANA 2NZTA 5TKYA 5BPLA 1SZ2A 4L3QA 5BPMA 4JNEA 4CZFA 5KPTA 1QHAA 2VWBA 1KAYA 2QW9A 3WXIA 4ISEA 3QFPA 1E4FT 3KVGA 4XH1A 5E84A 3SMPA 3UKUB 1BUPA 1NMDA 1C0GA 3CJ1A 3CJ7A 3GDQA 2D0OA 5ELZA 4AM7A 4PKGA 3FZHA 2YJFA 3UKRB 2E1ZA 4FL9A 3WXLA 1NGBA 1JCGA 3ZETB 1BG3A 2IIRA 3A5LC 2P9PA 2WUSA 3DJCA 4JD2A 5AR0A 1TYQB 4A2BA 1GLLO 4BQZA 1MWKA 3DAWA 3VGKA 3IUCA 5JLHA 4FOIA 3KZBA 4WYBA 4DQ8A 3R8EA 4YDUA 2ZWHA 5BR9A 5AQJA 5JMVA 4BVPA 5ADXA 2PAVA 1QQMA 4BG9A 4B1WB 2P9SA 2E20A 4IO8A 4FWMA 3O8MA 3CJBA 3QDKA 4EHTA 3A0IX 3BF3A 2CH6A 4XH5A 2CH5A 1ZC6A 3BUZB 3MMVA 4CZKA 3SMSA 4BREA 5BN9A 2ASPA 4IZ9A 4BC4A 3QICA 3OHRA 5EVZA 3JS6A 5E26A 2I7NA 4CBWA 4HTLA 3VEVA 1V4SA 3LDPA 3C0BA 2F9WA 2QWRA 3FZLA 4JD2B 4BC2A 1HLUA 3EKUA 3QFUA 3VESA 2ITMA 3QB0A 2V52B 3LL3A 5AQSA 4BRAA 3CQYA 3ZEUA 2E1YA 3VENA 1ATNA 2QWOA 5AQNA 3H1VX 3O5BA 3M6GA 4IWVA 2YHWA 4BVOA 1S3XA 4O8KA 5BPNA 3VEOA 4RWTA 2ZGYA 2E8AA 3EO3A 3FFKB 4BC3A 1XC3A 4RTFD 2Q97A 3TU5A 2GUPA 5BRFA 2P9UA 2GWJA 5B8HA 3HM8A 3WXKA 1CZAN 4CZGA 3DXKB 2NLXA 3DXMB 1HJOA 1MDUB 4H5NA 3SK3A 4BRPA 4PKHA 5CE3A 2NRHA 2D0PA 3WUHA 1GLAG 1GLEG 4ISFA 4BR7A 3GOIA 2IVPA 4IJAA 4H0TB 2IVNA 2A6AA 2Q0UA 2FLOA 3ZEUB 1G99A 3U9DA 4BC5A 2HF4A 3H46O 2PBDA 3HZ6A 1NGDA 5BREA 3ULEA 4BRKA 3VPZA 3HTVA 5JICA 3VOVA 1KXPA 3O80A 4B1YB 3AAPA 4GNIA 4QS9A 4CZJA 1WUAA 2A42A 2A40A 3FZKA 4WQ5A 5AFUH 1ATSA 3ENHA 4BGBA 1OKJA 1ESVA 2HOEA 2YJEA 5FPNA 3CERA 4H0VB 3A5MC 4B1XB 2H3GX 3ATVA 1ATRA 2GELA 2ZF5O 1Q18A 4BRQA 3VEZA 2P9KA 1JCEA 2QM1A 1XUPO 3VGLA 4NO7A 3D2EB 3QBWA 5F1XA 2F9TA 5AQTA 3ZX2A 5EXWA 3LDNA 3GL1A 4H5WA 4MO4A 1GLJO 5LJWA 5AQOA 3VERA 4A2AA 1BA1A 2P9KB 1MWMA 1ZXOA 3CJ9A 3R6MA 4FWSA 1GLFO 1EQYA 3BF1A 3D2EA 3FE1A 2QWNA 4Z94A 2P9LB 4BR4A 1C0FA 1LCUA 4FWQA 1BWFO 5EOYA 3KHYA 5BRDA 3MCPA 5F2RA 1KAXA 4H0XB 3SJHA 3IFRA 2QXLA 3I8BA 1NGJA 1HX1A 4CZMA 4H03B 1K8KB 1NGCA 1GLDG 4CI6A 1NGIA 3CJAA 4RCHA 2E88A 4XH4A 3D2FA 1GLCG 2CGJA 2E2NA 3MDQA 2V51B 4I6MB 4MO5A 3CHWA 4GY2B 3U8XA 5KQDA 3D2FB 3MN7A 3O4WA 1YVNA 4FWNA 4QS8A 4FWOA 2Q2RA 2Q1NA 4HWIA 4QS7A 1JCFA 1TYQA 5AQKA 3GE1A 3VEYA 1TUUA 4XEIA 4BRGA 1R59O 3U4LA 1Y64A 5AQFA 5KPZA 3ZX0A 2QWQA 2ASMA 3CI5A 5AZIB 4WQ4A 1NGEA 4PL8A 4H5VA 5BRHA 1SAZA 2YCHA 3FZMA 2YI1A 1X3MA 1NGAA 3EZWA 3GG4A 5F0XA 5AFUA 1K8KA 3SLCA 4BRLA 4FPAA 2Q36A 3LDOA 3AY9A 3B8AX 3FZFA 4H5TA 5AQGA 4BRDA 3C7NA 4CZHA 3WT0A 2GTDA 4DB3A 4DHYA 1U6ZA 4H0PA 4EFHA 3M1FA 1H1VA 3TPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9IB 1HNVA 2O8CB 2GUIA 4I2PA 3QNOA 4F3TA 5JLFA 4CZLA 4CJWA 3JXUA 1RT3A 2NRVA 1I94K 1GOCA 4CHZA 1EXQA 1S22A 4X65K 4KH5A 3QEPA 4LY7A 3KKRA 4PKIA 2YV0X 3MXIA 4A62A 2F4VK 1U47A 2HHQA 5DM6L 3DLKA 4E7JA 3L6QA 4GKJK 4FSVA 4Y0WA 3CC4N 4BROA 3EN9A 2NRRA 3GBTA 4EAHD 2J4RA 5H1SQ 1VAZA 3O1WA 2X78A 1N32K 4KBOA 5MLCQ 3CMAN 2WONA 2JWLA 3MN5A 2OCEA 4A61A 4CIFA 4CGGA 1NG9A 3HYFA 3QBXA 2O8BB 3J8AA 1JLEA 4CERA 4IO9L 4PY5A 2PYLA 1WLJA 3SYZA 5CHIA 3UB5A 3THXB 4X66K 1HKGA 2D4WA 3L8BA 3THWB 3HPOA 3AVCA 3LDQA 3A5OC 3AA2A 2KFZA 3LP1A 1MU2A 1C6VA 4O5FA 3FGUA 1EP4A 3G25A 4CESA 4KHPK 1FJGK 3M8PA 3DRPA 2YHYA 1IJJA 4HUEA 3E1YA 1S9GA 4BR5A 2P9PB 4IDHA 3TSQA 4BRHA 3CM6A 3AO2A 4B9QA 4EP4A 4B1ZA 5FROA 3IDHA 4J8FA 3PIPL 3EL2A 3CIPA 4DV0K 1IKYA 4H0YB 2F96A 1HR0K 4MDBA 1LWCA 5AQQA 3QINA 1IKXA 1QZ5A 3K5NA 1VSIA 2A1RA 2HHTA 2D1KA 4JN4A 4K41A 4FWPA 1HYZA 2YHAA 3G10A 4JKAA 1VK0A 2FBVA 4ID5A 1QVFM 1YUWA 4Z4CA 3M5RA 4FWLA 4CJ3A 4DV6K 2ZJQL 1KVAA 2HBJA 5FPMA 2O8EB 5HLFA 4QCLA 4CJRA 5AQHA 4LF4K 1HUXA 2HBLA 4FOEA 1NNEA 2P9NB 3VQDA 5AQIA 3OYLA 3PV8A 3KTQA 3KK1A 4DV5K 2QWMA 3CQXA 4O8UA 4BRFA 4BDZA 5CYQA 4AHVA 2EWSA 1YHQN 4XIUA 2QA4N 1ITGA 3WNHA 1NWKA 1QQOA 1T05A 3F5TA 2V7ZA 5KRTA 1RBUA 1SKWA 4E7IA 3QEIA 3VF4A 2XRIA 3P5JA 3OYBA 3PIOL 2F7TA 3HJFA 5AQWA 1W97L 3F9MA 5FLXO 3VA0A 4GV6A 5AQPA 4CEDA 1VRTA 3ID8A 3V1RA 1ZYQA 3UKRA 4BE7B 4GKKK 1S1UA 3ZSYA 1Q82O 4AQYK 2P9UB 5M1NA 3WEEB 4LF7K 4IOAL 1YVUA 1FKOA 3CCVN 3F9KA 2VYPA 3KK2A 1NJIO 1JXEA 4W5TA 4CJ5A 4CFCA 2NRTA 2FSKA 4EP5A 3O08A 3A8YA 4CFBA 4IEIA 1NLVA 1D4XA 2FBTA 1TKXA 1HPMA 4C8OA 1LWFA 5BPLA 1IG9A 3TTFA 5BPMA 4JNEA 1KVBA 5KPTA 1QHAA 2QW9A 2PZSA 3WXIA 4N5SA 3U3YA 3KVGA 5E84A 1VSFA 5J2PA 4JKBA 4N76A 3UKUB 4Z4EA 1C0GA 3GDQA 4I7FA 1TKTA 3HP9A 4BECA 2YJFA 5T7BA 4DS5A 1EETA 1QTMA 3PY8A 4CGFA 3ZETB 4R79A 2IIRA 1RDUA 3DJCA 4B3MK 3SV3A 4KB1A 5AR0A 4CFAA 5JVGL 4TSXA 2Z1JA 4DFJA 3L3UA 4A2BA 4DSKA 3K9JA 1BL3A 3KZBA 2W00A 3LPTA 4GMJB 4CJTA 3HSTB 3VQAA 4DQ8A 4DSFA 2Z1IA 3T7ZA 2ZWHA 5BR9A 3TANA 5JMVA 4BVPA 4G9ZA 2W6LA 4O55A 2PAVA 4BG9A 4B1WB 5CZ1A 4E72A 3RTVA 3RRHA 4X64K 3O8MA 4KTZA 3CJBA 4OPAA 2Z1GA 3QDKA 2QKKA 1P90A 2CH6A 2CH5A 4LF5K 1ZC6A 3BUZB 3MMVA 1S9EA 1FXXA 4BREA 5BN9A 1KVCA 1VQPN 2HHVA 4FLVA 4KAZA 1I39A 1UWBA 3HL8A 4LSNA 3OA9A 3OHRA 5EVZA 4Z0UA 5HRRA 4HTLA 3LDPA 4I9QA 4RW6A 4OPKA 3KWGA 3T69A 4KHQA 3HK2A 3PX0A 3ZEUA 1FK9A 1GOAA 1J53A 3O5BA 4BVOA 4IWVA 2YHWA 3JAMO 4M41A 5KRSA 4FJGA 4YNQA 2ZGYA 1U48A 1Q9XA 1XC3A 3QEXA 1BCOA 2IGIA 3F73A 1N6QA 2GUPA 3ZSWA 2KQ2A 4DG1A 2GWJA 2HW3A 1CZAN 3NDKA 4CFDA 4CZGA 4ILJA 4NLCA 4Z4GA 4FJ7A 1VQ7N 3AVFA 1MDUB 4H5NA 4K8XA 4Q5VA 1BISA 4DR7K 3I0SA 4AHUA 2KFNA 3K59A 3KD1E 1L3TA 3ZT2A 3V1OA 4IJAA 1W2BM 2IVNA 2FLOA 3DI6A 3U9DA 3H46O 3HZ6A 5BREA 2HHXA 4BRKA 1BIZA 3VPZA 3K9KA 1LWEA 3C6AA 2KTQA 2YNHA 3AAPA 4GNIA 4QS9A 1LW2A 5C2FA 1JLFA 1WUAA 4YOXA 2F8TA 4WQ5A 1OKJA 4DF4A 2OPQA 2ZE2A 4H0VB 4OX9K 3LANA 1J5EK 1B9DA 3CYGA 3U6FA 2H3GX 3TABA 1ATRA 2GELA 4CJVA 4Q0BA 1B9FA 1S1XA 4BY9C 4M3WA 3ZSVA 4FJJA 3OVNA 4JKCA 1NK9A 5EXWA 4H5WA 1GLJO 5HROA 3VERA 1U4BA 4A2AA 1TGOA 2JGUA 3KIOA 5HRNA 1RILA 4FWSA 3LP3A 4PA1A 2F8SA 3V1QA 2E5LK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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