2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
b'DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
3LM9A 3EKSA 1TYQA 2CH6A 2YI1A 5FPMA 4CBXA 5AQJA 5EX5A 4BREA 4CZGA 1HKCA 1GLEG 2QWRA 4FWQA 3DXMA 3HTVA 2Q2RA 3C7NA 3GE1A 3WQUA 4K43A 3OHRA 1GLBG 5BRHA 3W0LA 4B1ZA 3ATVA 4FL9A 5AZIB 4IJAA 5AQFA 3BP8A 1JCGA 2HF3A 3BUZB 4ISGA 4B1YB 4GNIA 3MN9A 5EVZA 1X3NA 4BVOA 3L6QA 3FZKA 1NGJA 1HX1A 2VYPA 4IXCA 4J8FA 2IVNA 4JD2A 4PKHA 3IMXA 1RFQA 3UKUA 4BRLA 3A5MC 3QBWA 5AQGA 3L4IA 2YJFA 3LDQA 1S3XA 3GL1A 4CD1A 1OKJA 4EAHD 3U4LA 3WT0A 2HMPA 1E4FT 2ASPA 3P4IA 4MO4A 3ZEUB 1EQYA 1YAGA 3D7EO 1NWKA 2IVOA 2ZF5O 3ZX0A 1Z05A 3FZLA 1U6ZA 4FWLA 4K42A 5EOYA 3ZETA 2Q1NA 3A8YA 1IG8A 4CZJA 1GLJO 2PAVA 3LDOA 3CJ1A 2VWBA 3HBTA 3WXLA 4AM6A 3IDHA 3M1FA 5KQ8A 4BROA 5E84A 3L0QA 4QS8A 1TUYA 3ULEA 4H5WA 3AARA 3H6EA 3R6MA 5JLHA 4M7XA 5AQZA 4JHDB 4C23A 4BC4A 4WQ5A 3VEXA 4H0XB 3MN6A 5AQRA 1LCUA 4CD3A 3H3OB 3M3ZA 2QWOA 1QQMA 2E1ZA 2BUPA 1DKGD 5TKYA 4BC2A 2F9TA 2P9UA 1KAZA 3HZ6A 3HSCA 2P9NA 2YHXA 4FWOA 4YDUA 5AQIA 5AQUA 5BPLA 3MDQA 4FWSA 2FLOA 5AQQA 1GLFO 4BRGA 5AZJA 4BRNA 3VERA 4CZFA 2I7PA 3FGUA 4HTLA 4RWTA 4H0VB 3BEXA 3FR0A 1JCEA 2E2PA 5AQVA 1BUPA 1MWKA 4B1WB 3SLCA 1GLAG 4H0PA 3LM2A 3O8MA 2IIRA 3GOIA 2FF6A 5KQDA 4CBUA 2P9SA 3MN5A 2HF4A 4ISFA 4M63C 2GELA 1HUXA 4XH5A 3EO3A 3CJBA 3W3DA 5LJVA 4BRPA 2QWNA 4NO7A 1TYQB 5BRDA 1NM1A 3GG4A 1QQNA 4WQ4C 3WQTA 3U9ZA 1YVNA 3DXMB 2ZWHA 3VENA 4WQ4A 1V4SA 4LC9B 1XC3A 3C7NB 1U2VA 2FXUA 5BR9A 3VEVA 3S41A 2NLXA 1BWFO 3KHYA 3AAPA 4FPBA 4IWVA 2YCHA 3FZHA 1IJJA 3KZBA 3MK6A 3ZX2A 2QWLA 3RSEA 5KPTA 1HJOA 1BDGA 1V4TA 1D4XA 3QB0A 4CI6A 4BR0A 3WXJA 1HPMA 1ZC6A 1BU6O 3ENHA 4IJNA 3MCPA 3B8AX 3H3NO 4JD2B 5AQXA 4H0TB 3UKUB 4JNEA 1BA1A 2CGLA 3FLCO 3WXKA 4FWMA 3MN7A 2V7ZA 5KPRA 3UKRA 2YJEA 4DCHA 4FPAA 3M6GA 4FWPA 1ATRA 1T6DA 1WUAA 3C0BA 1BG3A 2QXLA 3VETA 4FOEA 5FPEA 3GBTA 3A5OC 3H45C 1T44A 4K41A 4PKGA 2J4RA 5AQSA 1NGIA 3VESA 2Q36A 4DB3A 5AFUA 2P9IA 5ADXH 2HOEA 2W41A 3FE1A 3ZETB 4BR2A 4CZHA 2Q0RA 2I7NA 4BC5A 2QWPA 4EHTA 5JICA 3VEWA 5BN9A 2GUPA 2CGJA 3CJ7A 3ULEB 4O8KA 1J6ZA 1K8KA 4IZ9A 4CZIA 3VEYA 4EHUA 5AQKA 1X3MA 4FSVA 1KXPA 3BF1A 3QMLA 3H1VX 5AR0A 1MDUB 3GDQA 5FPDA 5B8HA 4FO0A 4BRIA 1BA0A 4A2BA 3CI5A 3DJCA 2P9UB 3ENOA 4H5RA 4PKIA 2A6AA 1GLCG 3UB5A 4JAXA 3IFRA 2P9NB 1Q18A 1RGIA 2P9LA 2UYTA 5LJWA 2GEMA 2NZTA 1R59O 5AFUH 3SK3A 4AM7A 4K25A 4BR4A 4BRQA 4BVPA 5AZJB 4B9QA 3CERA 1ATNA 2D0OA 3EN9A 3O08A 4CZEA 5BPNA 4PL7A 3H46O 1NGCA 1NMDA 4CZKA 4B1XB 5JLFA 3IUCA 1NGFA 2V7YA 4KBOA 1BOTO 2KHOA 3VF6A 3FZFA 1DEJA 3WEEB 5ELZA 2P9PA 4H0YB 3VOVA 2GWKA 4F9OA 2A40A 2P9SB 3VPZA 5AQYA 4FOIA 3I8BA 2ZGYA 2FSNA 2D0PA 1H1VA 3U9DA 3D2FA 1QZ6A 4BRDA 3SMPA 3ID8A 5I9EB 1SAZA 4RCHA 3WEEA 2H3GX 3O6WA 1U2VB 3KVGA 2AA4A 2A41A 3VEZA 3A0IX 3VGKA 4MO5A 3WXIA 2CH5A 1E4GT 2D1KA 4H5VA 3D2EA 5AQOA 3RSEB 1TUUA 1SQKA 3O5BA 5EXWA 5AQWA 5LY3A 4FWNA 1GLDG 5BN8A 3LDPA 1HLUA 2FSKA 4JN4A 2V51B 3VEOA 3DWLA 3O80A 4Z94A 1WOQA 3UKRB 1XUPO 2A5XA 3AAQA 3JS6A 3O4WA 3JXUA 4BRMA 2Q31A 1RDWX 4I6MA 2P9IB 1CZAN 5AQLA 1ESVA 3QICA 1SZ2A 4BRKA 5F2RA 4CJ7A 2YHWA 2VCPA 4BR9A 1G99A 4A61A 2ASOA 5AQTA 2PBDA 3SJHA 3ZX3A 5AQNA 5BRFA 3VF2A 2F9WA 3UE5A 4HWIA 2FF3B 4BQZA 5CE3A 1NLVA 1K8KB 3EZWA 5EY4A 2E88A 4RTFD 1HKBA 2OANA 3DXKB 3ATUA 2E20A 3QFPA 2YHYA 1ZBSA 1ATSA 3CQXA 2AP1A 1C0FA 3F9MA 4DQ8A 3WUHA 3VF4A 2W40A 3LDNA 3TU5A 3MMVA 4XH1A 1BO5O 3AY9A 1NGEA 4MLEA 5AZIA 1X9JA 2A3ZA 2ZGZA 3FFKB 2A42A 3DXKA 4H03B 4MLHA 3J8AA 2P9LB 4BRCA 4BRFA 2WUSA 4EFHA 2CGKA 1MWMA 2GTDA 3QBXA 5JMVA 4QS7A 2BTFA 3A5LC 4L3QA 3H1QA 4A62A 2E1YA 4BRAA 3O1WA 2ITMA 3U8XA 4CZLA 3LDLA 1QZ5A 5AQHA 2E2QA 3QDKA 2P9PB 3BF3A 3CHWA 3HI0A 5F1XA 3ZEUA 1MA9B 1NGHA 3A5NC 2EWSA 3R8EA 4BG9A 4H5TA 4BG8A 4GY2B 4BQLA 1S22A 3D2FB 4M7YA 5FPNA 1YUWA 2FSJA 4O5FA 4Y0WA 1GLLO 4H5NA 4XH4A 4WQ5C 1DGKN 3CETA 4WYBA 4BC3A 3R9PA 3TPQA 4BGBA 2QM1A 4BGAA 1NGDA 4DHYA 4EIAA 4B1VA 1KAYA 2QWQA 4A2AA 3CJAA 2ASMA 3LL3A 4YDUC 4JHDA 3CJ9A 2QW9A 3D2EB 1QHAA 1YXQA 3HM8A 3VGLA 4ISEA 4PL8A 2E2OA 3DAWA 4IO8A 4BR7A 4FWRA 3QFUA 5BREA 2Q0UA 4QS9A 1P8ZA 3I33A 2Q97A 2P9KB 1QQOA 4H0OA 3CJCA 1HKGA 2NRHA 5AQMA 5E26A 1NBWA 1NGGA 4NB4A 2DPNA 1Y64A 1LOTB 3EKUA 1T6CA 2IVPA 3CQYA 3G25A 2D4WA 4I6MB 4BR5A 3VGMA 2P9KA 4B1UB 1NGAA 3EL2A 3FZMA 4BRHA 3O1BA 1Z6RA 1KAXA 5ADXA 1ZXOA 4E1JA 1NGBA 1JCFA 5KPZA 3SMSA 1XQSC 2E2NA 4FWKA 3CIPA 2V52B 5BPMA 2E8AA 5F0XA 4XEIA 4CBWA 1C0GA 2GWJA 4CZMA 2QWMA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LM9A 1S6PA 4M45A 3WNHA 5AQJA 3RWUA 3O9RA 4KB0A 5FRMA 3THXA 3DXMA 1RTIA 2Q2RA 1RDAA 3QINA 4H4MA 3VQAA 3WQUA 2IDOA 1VSFA 1UAXA 4FL9A 3DRRA 4IJAA 1RILA 4I7FA 4FXDA 3HT3A 2HF3A 3LAKA 5HRSA 4DTUA 4CJQA 1N8RO 1TKZA 2PYJA 3LP0A 4A5AA 4IOCL 1S9EA 1N36K 1C0MA 1VQ8N 1X9MA 2VYPA 1BIZA 4J8FA 3QEVA 3IMXA 4X62K 2P5GA 1YVUA 1OVYA 3A5MC 5C24A 3LZJA 1S3XA 3MAQA 4B9UA 4GVMA 4M42A 2P51A 1E4FT 4FVUA 2ASPA 3RMDA 4DQQA 3NGYA 5HROA 1EQYA 3D7EO 4CIEA 1NWKA 4FJ8A 2KLAA 2IVOA 4I2PA 4IEIA 2OPQA 4FWLA 1L3VA 3ZETA 2Q1NA 1S1WA 4NLBA 3CD6N 3V9ZA 2QXFA 2VWBA 3HBTA 1LAVA 3RR7A 3M1FA 4BROA 1WSIA 2HHWA 1TAQA 5HRRA 3EZ5A 4NCAA 5KI6A 2ITGA 1L3SA 1Q7YO 4CHNA 2W00A 1FKOA 4C23A 3R3LA 1NK9A 3AVCA 4CD3A 4Z4IA 1CZ9A 3MCAB 4HHTA 1VRTA 1DKGD 4NXMK 2F9TA 3HZ6A 3K57A 4YDUA 3V1OA 3VMFB 3SUNA 4JI3K 4ZTFA 1LWFA 2YKNA 4B9TA 2G8IA 3ISNC 1XHXA 1VQ6N 2G8WA 2X78A 4O5BA 4CEDA 1EO1A 4RWTA 4FM2A 3BEXA 3OJSA 3VQEA 2BANA 2Z1GA 4JLHA 2FF6A 4CBUA 2RPIA 2P9SA 4FJXA 3MN5A 4ISFA 3EO3A 4OJRA 2QWNA 1TK8A 1NM1A 4FYDA 2XRIA 1QQNA 3OYFA 1NOZA 1B92A 1V4SA 1A5WA 1NG9A 3HJFA 2FXUA 4N47A 4CJFA 4CEAA 5CR4A 1BWFO 1JLCA 3KHYA 2JWKA 2OYQA 3MK6A 2Z1HA 3V1RA 1JLQA 3CC7N 4OVLA 2KW4A 5CYMA 3C94A 1L3TA 1RT3A 4JI2K 5KGXA 3U3YA 1KSPA 3UKUB 4GV6A 4CJUA 4ELTA 3NF9A 3NH2A 1S1UA 3UKRA 4JK9A 3SPYA 1IH7A 3RMCA 1ZBHA 1BG3A 1VQON 5FPEA 3GBTA 1U48A 1T44A 5AQSA 1FXXA 1WAJA 3OS2A 2VGNA 2O8CA 4CJKA 3QNNA 3J80O 3SPZA 1W9HA 3BDPA 3KWIA 3SI6A 3ZLJA 3ZSWA 4BC5A 3TTDA 5JICA 4WCEL 3K58A 3VEWA 2VG6A 2GUPA 3NVMA 1RT1A 3CJ7A 3B6OA 2YX6A 1EETA 4O8KA 1VSJA 3HOSA 3M8SA 3ID6A 3KKRA 1KQSM 1BI4B 1CZBA 4FSVA 1KXPA 3KLFA 3ENBA 3AA4A 5FLXO 2WBNA 2G8UA 2JLEA 4FO0A 2OTJN 4CHZA 3N4PA 3CI5A 2P9UB 1XNRK 2A6AA 1GLCG 3IFRA 3LP1A 2GEMA 1KTQA 4K8XA 4OPAA 1RDCA 1IKXA 5AZJB 4DTOA 1R0AA 4CZEA 1NMDA 1C1BA 5JVGL 5JLFA 1NGFA 2V7YA 3AO3A 4C1NK 3VTHA 4A57A 1K6YA 4JKEA 3AGKA 2Y1IA 3F73A 4NCGA 5ELZA 4F9OA 1VSMA 2A40A 3VPZA 5AQYA 1S5JA 3LWLA 3CCMN 3MX2A 2ZGYA 3U9DA 4J2DA 3D2FA 1KVAA 4BE1A 3ID8A 1YJWN 4AHTA 3O4NA 4CJTA 1SAZA 5GIPA 3HRGA 3IS9A 1VQPN 2H3GX 4CEFA 2HVIA 3KVGA 1GOCA 3PUFA 1HMVA 3VEZA 3K59A 1QVGM 2IGIA 3A0IX 4MO5A 3L8BA 4WE1A 2IAJA 4DR5K 3ZYYX 2UUBK 4BEBA 3HP9A 3RSEB 4DG1A 5CZ2A 1LV5A 2Q3SA 2R7YA 2WC9A 5EXWA 4CF1A 5C12A 4M3YA 4FWNA 2UU9K 5BN8A 5H1SQ 1HLUA 4CGGA 4WFNL 4WFAL 3OY9A 4YOVA 1DTQA 4FW2A 3ZT3A 3LP3A 1QVFM 4DFJA 4JK8A 1VQ5N 4CFBA 3PV8A 4C8OA 3AA5X 1TKDA 3HOTA 3O4WA 3JXUA 3TAEA 3TTFA 3JSMA 4OPHA 3DI6A 2X6NA 1CZAN 5KGWA 2KFZA 1VRUA 1ESVA 3QICA 3THVA 3MEGA 4CJ7A 4FJHA 1C6VA 2VCPA 4BR9A 4J2AA 2ASOA 4H8KA 3OA9A 2GV9A 3HPGA 4AQYK 3M8PA 2VG5A 1N33K 1WN7A 4O44A 3ZT2A 2OTLN 3MX5A 1NLVA 1K8KB 1QS4A 5EY4A 3ASMA 4YOTA 1L5UA 3SUPA 1X9SA 2YHYA 5HL7L 1ZBSA 4LH5A 1D9DA 4CJ3A 3F9MA 3EY1A 3MWTA 4CF0A 2RKIA 4LFBK 1BO5O 4MLEA 1NGEA 5JVHL 2A3ZA 3G10A 3FFKB 4X66K 2HW3A 2NRZA 4R79A 3DXKA 2EHGA 3M8QA 2P9LB 2VWJA 4BACA 4QAGA 3U6FA 4EFHA 2GTDA 1OH8A 4QS7A 2BTFA 2HHTA 2IS3A 4NCBA 4A62A 4BRAA 4CZLA 4GVEA 4RW6A 5AQHA 2ZQBA 4C1NI 1HNWK 4DWIA 4E72A 1T3VA 2E2QA 3QDKA 5F1XA 4NXNK 1XC9A 1MA9B 4CK3A 4Y1DA 4BQLA 4G1QA 3WNEA 4DTSA 4Y0WA 4XH4A 3TPQA 1DT9A 3NE6A 3V4IA 4HVJA 4AILC 4FJ9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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