2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
1ATSA 1HJOA 2QXLA 1HPMA 4XEIA 3A8YA 3CHWA 4BC3A 3KZBA 3J8AA 3VOVA 4DB3A 3GE1A 3FZLA 4FWRA 3SK3A 4FOEA 3VEZA 2YI1A 2A6AA 4FPBA 1C0GA 1G99A 3A0IX 4CBWA 3DXMB 3KHYA 4PL7A 1H1VA 3DXMA 4K43A 4H0YB 1U2VB 1MWMA 1KAZA 4BQLA 5KQDA 2P9PB 3QBWA 2QWQA 1X3MA 3H6EA 1NM1A 3FLCO 3RSEA 5ELZA 2GELA 3QBXA 3WT0A 4AM6A 5JLFA 4FOIA 1NGEA 2QWLA 1K8KB 4PL8A 3R8EA 3MN7A 1U6ZA 3TPQA 1YAGA 4QS8A 4BG9A 4EFHA 2QWMA 1GLAG 1GLFO 3O6WA 3WQTA 3C7NA 3ID8A 1NGBA 3MDQA 3F9MA 4A2AA 5CE3A 3S41A 4ISGA 4H0OA 1JCGA 4O8KA 3VESA 3WXIA 3C0BA 1QQOA 1YXQA 3QDKA 4B1VA 1NGAA 3EKUA 5AQJA 3SMSA 4BRFA 5JICA 2EWSA 2Q1NA 3ULEB 1BOTO 3ULEA 4BRCA 3CJ7A 3GOIA 5BN9A 3L6QA 4A62A 1HX1A 2DPNA 1RFQA 4GNIA 2NZTA 3H3OB 1YVNA 2D4WA 5BRFA 1T6DA 5FPEA 2P9LB 4CZFA 1X9JA 2CGLA 3D2EA 3UKUB 3KVGA 4H0VB 3O8MA 4XH1A 4BVOA 3BP8A 2NRHA 1BO5O 3CQXA 3EKSA 3LDNA 3A5LC 3CJBA 4M7YA 2E2OA 3LDQA 2V51B 1DGKN 3P4IA 4E1JA 1RGIA 2HMPA 1LOTB 2BUPA 3FFKB 2P9UA 1NWKA 1SAZA 3FE1A 5JLHA 2IVOA 4H5WA 4IO8A 1WUAA 5AQFA 1S3XA 1SQKA 3H3NO 5AQXA 4I6MA 5KPTA 3D2FA 3EO3A 4XH4A 4MLHA 2QWPA 4CZHA 4XH5A 2E2NA 3LDOA 3FZFA 3M6GA 4BRQA 1BU6O 3U8XA 3H1QA 4EAHD 3CERA 3CJ9A 3U9DA 2ASPA 3W3DA 3QFPA 2E2QA 3ZEUB 3VEWA 1HLUA 4FWOA 2VCPA 4B1WB 1TYQB 2AA4A 5AQNA 1TYQA 4IJAA 3CJ1A 3BEXA 4CZJA 5BREA 2D1KA 5ADXH 4GY2B 3VF2A 3UKRB 4DQ8A 4AM7A 2AP1A 3AAQA 3A5MC 2P9KB 1NGHA 2P9KA 4B1UB 3DWLA 4FSVA 4QS9A 5BRHA 2PBDA 1GLDG 2YJEA 2W40A 4FWMA 2A40A 3GL1A 5AQPA 1NBWA 4CZMA 1ESVA 4CJ7A 4MO4A 5AQSA 3MN5A 1HUXA 3A5NC 3O1WA 3WXKA 1DEJA 1XC3A 4BR4A 3HSCA 3WXJA 1U2VA 3H46O 5JMVA 3VPZA 3EL2A 4WQ4C 2P9PA 2YHWA 5AQKA 4MO5A 3H1VX 1NGJA 2IVPA 3M1FA 4BRGA 2WUSA 3LDLA 5AQIA 3FZKA 2E1ZA 2ITMA 4F9OA 3JXUA 4BC2A 2QWRA 1K8KA 4BRNA 3QB0A 3UE5A 1HKBA 1ZXOA 1TUYA 3FZHA 1ATRA 1NGCA 2IVNA 2FXUA 3D7EO 3VENA 1NGGA 2E2PA 1BA0A 2I7PA 4BRMA 3ENHA 4M63C 3SLCA 2ZGYA 3GBTA 3VGKA 4BRIA 4BR2A 5LJWA 1GLJO 3O80A 3BF1A 4O5FA 3ZX0A 5E84A 5EOYA 5AZJB 3VEVA 2FF6A 3ATUA 5AQOA 4BRAA 2P9SB 2QWOA 2VWBA 1P8ZA 4FPAA 2P9SA 4H0TB 1MWKA 1T6CA 2PAVA 4BR7A 3EN9A 4CI6A 4M7XA 1GLEG 3FZMA 1BG3A 1XQSC 2P9LA 3HM8A 1HKCA 2V7ZA 3UKUA 3CIPA 1BWFO 4WQ4A 4BGAA 4CZLA 1ATNA 3VEOA 2A5XA 2I7NA 4BROA 2UYTA 3UB5A 3VETA 2KHOA 3A5OC 5AQLA 4CZGA 2D0PA 3O5BA 3LDPA 1V4TA 3DJCA 4Z94A 5EXWA 3SMPA 3W0LA 1EQYA 4A61A 4PKIA 1GLCG 2Q36A 1JCFA 3ENOA 5AR0A 4FWPA 2GWJA 5AQUA 4WQ5C 2GUPA 4FO0A 4L3QA 4H5RA 1X3NA 5AQYA 4H5NA 1KAYA 1C0FA 4FWSA 4CD1A 5AQQA 2FLOA 5AZIB 4BVPA 5KPRA 5AZIA 3VF4A 3ZX2A 2GEMA 3ZEUA 2ASMA 3MN6A 2IIRA 2HOEA 3WEEB 3WEEA 1Z05A 1NGIA 2ZF5O 4H03B 4LC9B 4PKGA 1XUPO 2J4RA 4B1ZA 3CQYA 2OANA 3CJAA 2P9IB 4JNEA 2Q97A 2F9TA 2YHXA 3MN9A 4JD2B 4IZ9A 4JD2A 1QZ6A 3WQUA 5B8HA 2D0OA 3UKRA 4ISEA 4EHUA 3WXLA 1NGDA 5F2RA 3SJHA 3R9PA 5AFUA 5BPLA 4NO7A 5E26A 2GTDA 5AQHA 1E4FT 4RTFD 1QZ5A 4RWTA 2QWNA 1SZ2A 1KXPA 3AAPA 3LM2A 3LM9A 1HKGA 4WQ5A 1BUPA 3OHRA 1Q18A 3QICA 5F1XA 4FWKA 2E8AA 3TU5A 3FR0A 5FPDA 1D4XA 2VYPA 4KBOA 4HTLA 2ASOA 1MDUB 4FWNA 2CH6A 3QFUA 1MA9B 5AQWA 3IMXA 4RCHA 3L0QA 3AY9A 3FGUA 3L4IA 4K41A 4IWVA 4Y0WA 5AQVA 4BC5A 3HI0A 2ZGZA 4FWQA 4DCHA 3VGMA 3MCPA 4BQZA 4CZIA 1TUUA 3CJCA 3DXKB 1GLBG 3DXKA 3LL3A 3HZ6A 4BRLA 5AQRA 3AARA 1R59O 4CZEA 3GG4A 1IG8A 3I33A 3IUCA 4CD3A 2YCHA 3O1BA 4BRDA 1GLLO 5AQZA 1LCUA 5BN8A 4YDUC 3HTVA 2A42A 3DAWA 3RSEB 5LJVA 4EHTA 4H0XB 5TKYA 1S22A 3ATVA 2CH5A 5AZJA 4QS7A 1V4SA 1WOQA 5EVZA 4BRPA 4BR0A 2A3ZA 5ADXA 3C7NB 4A2BA 2YHYA 4IXCA 1QHAA 4BRHA 4WYBA 3VEXA 4BR5A 2CGKA 2FF3B 3GDQA 4IJNA 2F9WA 4H0PA 4K25A 4CBXA 3I8BA 1Y64A 2P9NB 5AQMA 2P9NA 4DHYA 2ZWHA 3VGLA 3U4LA 3ZETB 1Z6RA 3ZETA 5LY3A 1T44A 1ZBSA 5BR9A 5AFUH 5AQTA 1BDGA 1OKJA 3D2EB 4H5VA 4JN4A 1RDWX 4C23A 5KPZA 5BPMA 2QM1A 2E88A 4B1YB 1IJJA 2V52B 4NB4A 4YDUA 5EY4A 3R6MA 5BPNA 1NLVA 2E1YA 4FWLA 5F0XA 3O4WA 4BC4A 2NLXA 3HBTA 5FPMA 2P9UB 4BG8A 1QQNA 3IDHA 3O08A 4BGBA 1ZC6A 4K42A 3MMVA 4BR9A 1JCEA 4I6MB 4MLEA 2FSNA 3D2FB 5AQGA 3G25A 2Q0UA 2V7YA 3VERA 3BUZB 5EX5A 1E4GT 4BREA 4HWIA 2Q0RA 2P9IA 3MK6A 5FPNA 2HF3A 2HF4A 2YJFA 2FSKA 3JS6A 3WUHA 3H45C 4ISFA 2H3GX 1CZAN 1BA1A 5I9EB 4JHDB 2QW9A 2FSJA 5BRDA 1DKGD 4JHDA 3CETA 4B1XB 1NMDA 2GWKA 4PKHA 4EIAA 3ZX3A 2Q2RA 2CGJA 4CZKA 3BF3A 2A41A 4H5TA 3B8AX 2W41A 3IFRA 4B9QA 3VF6A 3CI5A 2BTFA 2Q31A 4CBUA 1KAXA 4JAXA 2E20A 3EZWA 5KQ8A 1QQMA 4FL9A 3VEYA 1YUWA 4BRKA 1J6ZA 4J8FA 3M3ZA 3U9ZA 1NGFA 3QMLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W0HA 4IOCL 3KZBA 3NGZA 1Q9XA 4WFNL 3FZLA 1ASVA 1RBVA 4FWRA 5FRNA 4HVJA 2WBNA 3K2PA 1L3UA 3TI0A 1G99A 3PV8A 3DXMB 4OGEA 1QVFM 4MDBA 1XMQK 4H0YB 1WSEA 5KQDA 3QBWA 4GMJB 1NJYA 2O8FA 4FLUA 3FLCO 2GELA 3QBXA 3TSPA 4CF2A 2EHGA 1NGEA 3HYFA 3ZT0A 4WCEL 1K8KB 5T7BA 1U6ZA 4F3TA 3TPQA 1YAGA 5FLXO 4BG9A 4DLGA 4DWIA 4O44A 2ZJQL 4CK2A 4CIEA 3UIQA 3K5OA 3MCAB 5CE3A 4ISGA 1JCGA 3VESA 1WAFA 3PX4A 2QKBA 4CEFA 1VQKN 1HQEA 3SMSA 4BRFA 3GOIA 1HX1A 1B92A 1VQ9N 2KLAA 1RFQA 2D0BA 2HSTA 2OCEA 3TR8A 2VQFK 3AO3A 1HNIA 2P9LB 5DM7L 1W97L 2CGLA 3UKUB 4DR6K 3KVGA 4H0VB 4XH1A 3OS2A 1BO5O 4DUZK 3CQXA 4YOUA 3NF7A 1S9EA 1BL3A 4E7IA 4BWMA 1WSFA 2XO7A 1VQ6N 1RT5A 1LOTB 1SAZA 3FE1A 3I8DA 3H3NO 4I6MA 3D2FA 3DRPA 3JSMA 3EO3A 4XH4A 3V9UA 4MLHA 4AILC 4N56A 4MFBA 2X78A 2DFHA 2ZE2A 4EAHD 4LH4A 4ZTJA 3AO5A 3WXMB 3E9OA 3P5JA 4FWOA 3TTCA 1DT9A 2NUBA 3AA2A 1TYQA 2DTUA 4J2DA 3CJ1A 4YOYA 3OYDA 3WNFA 4N47A 4Z0UA 4JK8A 4PHTX 4X66K 2E4LA 3OTOK 5ADXH 1UA1A 1Q7YO 3UKRB 1WSHA 1RBUA 3AAQA 2OTJN 4J2EA 3G10A 5JVHL 4DR1K 4O55A 2PBDA 3EEQA 4CGJA 3GL1A 1J5EK 3AV9A 2F8TA 3KLEA 3CC7N 1EWRA 2IGIA 2Z1JA 2Y1JA 2FBTA 4CJ7A 2GX9A 1RT6A 4JI4K 3A5NC 3WXKA 4CF0A 3KIOA 4BR4A 4ID5A 2HHUA 3EL2A 4Z4HA 3HVTA 3CCUN 4JYAK 2QK9A 3ZT2A 2JGUA 1A5XA 4DV3K 5AQIA 4F9OA 1K8KA 1F21A 1HKBA 1TUYA 3T1HK 3HOSA 1NGCA 3G71N 3D7EO 4IEEA 3J7AP 1RT2A 2IAJA 3ENHA 3GBTA 3VGKA 4BRIA 3HRGA 4KTZA 1WNSA 1X9SA 1LWFA 4FLZA 2DFFA 3O80A 3A2FA 3ISNC 1NNEA 5AZJB 3VEVA 4PWDA 1JXBA 2FF6A 3ATUA 3PSFA 1EP4A 1YTUA 3OYJA 2QWOA 3V1OA 2F7TA 2VGNA 4QAGA 4KHNA 1C1BA 2HNZA 4DQPA 2IC3A 3FZMA 3CCVN 2UXDK 2P9LA 1HKCA 3UKUA 3S5TA 1U04A 1BWFO 3CMEN 4CZLA 2VGMA 3TWHA 2A5XA 2UYTA 3UB5A 1VQ5N 2A1RA 1S5JA 4H4OA 4KHWA 2O8EA 4KFBA 3OW2M 3TSQA 3LDPA 3SNNA 1V4TA 4Z94A 2HBLA 3V9SA 5C24A 4U7BA 3SMPA 3W0LA 1EQYA 4A61A 1D9FA 4KKOA 1GLCG 5HL7L 4CIGA 4LY7A 3S9HA 5AR0A 3ZSXA 4WQ5C 2GUPA 1Z26A 1EXQA 1Q82O 5CY4A 1ASUA 1YTAA 4CD1A 1EETA 4YOTA 2UXBK 3NE6A 4Z4FA 2HBKA 5AZIA 1NU0A 2DY4A 3VF4A 3SCXA 4JKEA 3MN6A 4DF4A 4IFYA 3OYKA 3MWTA 4H03B 4LC9B 3F73A 3LDSA 4ICLA 1IKXA 2J4RA 3JYTA 4E1MA 2X6SA 3OYHA 4M3RA 2HBJA 4BEBA 4IZ9A 4G1QA 4HTUA 4FJJA 4H4MA 2D0OA 3UKRA 4ISEA 3LALA 2Q3SA 5BPLA 1FXXA 4B8AB 3OS1A 5J2PA 1QZ5A 2Z1HA 3OYBA 2QI2A 5IWAK 3L2UA 3AVKA 1BUPA 2OPPA 5KI6A 3ZCMA 4AHTA 3SAFA 2HW3A 4CFCA 5M1QA 3FR0A 1C0TA 1D4XA 2VYPA 3VQ9A 4DU1A 3AA4A 2ASOA 3MXJA 2D5RA 4NLCA 4DSLA 1MA9B 1D8YA 1RBTA 3IMXA 5HRNA 3L0QA 3L4IA 3CMAN 4KTQA 4CIFA 2X6NA 4DCHA 3VGMA 3MCPA 4CZIA 3CJCA 3BDPA 4LSNA 3V81A 4FW2A 3AARA 3AVNA 3CFOA 2OPQA 3I33A 5I42A 4OVLA 4DTOA 2RN2A 1A5VA 3J80O 3DAWA 1NJIO 2D0CA 3L2VA 5AZJA 5HRRA 1V4SA 3VQCA 1T05A 1QSYA 1KTQA 5C42A 1BGXT 3C7NB 2OYQA 3MXMA 2KZMA 5FROA 4DFKA 4J2AA 2FF3B 4A59A 4H0PA 3KWGA 1YJNN 2ZWHA 3I55N 4IBNA 3OVNA 1YVUA 4B9TA 2HMIA 4W5TA 4CEZA 4CK1A 4M3UA 5BR9A 1Q9YA 2W00A 4H5VA 3ZT3A 2QM1A 3HP6A 1IJJA 1JKHA 4NB4A 4DQRA 4YOVA 1C1AA 3C65A 4DR4K 5BPNA 1BCMA 4IFVA 4YNQA 4BC4A 1I39A 3HBTA 3OJSA 4QOZB 3T1AA 3IDHA 1I94K 4MLEA 2X74A 2FSNA 4A5AA 3G25A 3E9PA 2HVIA 4ZTFA 1TK0A 3CYGA 3VERA 3G4SN 2VQEK 4IDKA 5M1FA 3AGRA 4BE0A 4CJPA 3MK6A 3VQEA 5FRMA 4ISFA 3L2QA 1CZAN 4KI6A 4FLYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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