2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
4BC5A 3ZX3A 2W41A 2D1KA 4EIAA 3L0QA 1HLUA 4BRMA 3U8XA 3VOVA 3FFKB 3P4IA 3S41A 4RTFD 1P8ZA 5F2RA 1BO5O 1DGKN 3VEYA 2AP1A 2Q2RA 5AQIA 3MN6A 4JD2A 1BOTO 3CJ9A 3DWLA 5BRFA 4BRLA 1E4FT 4CZMA 2F9TA 3O80A 1TUUA 1C0FA 1MWMA 4BQLA 2Q0UA 2E88A 2P9NA 3B8AX 4HTLA 5AR0A 1HJOA 1SZ2A 3I8BA 2A6AA 3DAWA 3ATUA 3ID8A 3WXJA 4BR9A 3O6WA 1T6DA 3FR0A 4BRIA 1MDUB 2V7YA 5AQTA 1NMDA 1ESVA 3CHWA 2W40A 3AARA 2IIRA 4BRHA 3FLCO 3TU5A 4L3QA 4K42A 2H3GX 5AFUH 5AQMA 3H46O 5AQFA 5AQNA 2YHXA 3C7NB 3ZETB 1BU6O 1YAGA 5AZIB 1QHAA 3F9MA 3EZWA 3DXKB 1NGBA 3FZFA 3J8AA 3HZ6A 2OANA 3WUHA 5AQSA 2CGKA 3MN7A 5KQDA 4FWOA 3HSCA 4BRPA 3CJ1A 4GY2B 1WOQA 1S3XA 4CZGA 4CZEA 2GWJA 3CERA 3WXKA 4BG8A 4BVOA 4DCHA 2CGJA 3IMXA 3ZETA 3CJAA 5BN9A 3EL2A 4GNIA 2NLXA 3DXKA 2A41A 1X3NA 4KBOA 4H5NA 3MN5A 3CETA 3LM9A 3W3DA 3BP8A 1MA9B 5F0XA 3U4LA 4QS8A 4BR5A 1RDWX 3KHYA 4NB4A 4FOIA 3U9ZA 4DB3A 1K8KB 4BC2A 2FF3B 2A40A 3UKRB 3W0LA 4CBUA 3EKUA 3VEOA 2VCPA 5AQPA 2E8AA 1NM1A 1JCGA 2A5XA 3FE1A 4BRNA 2AA4A 4WYBA 5AFUA 2P9UB 4FWPA 1E4GT 4J8FA 2VYPA 4IWVA 1BWFO 2ZWHA 3R9PA 1YUWA 3GE1A 1K8KA 1NGDA 3VPZA 1QQOA 3CJ7A 3MDQA 3UKRA 1IJJA 3OHRA 4CZJA 4MLHA 1EQYA 3M3ZA 4CD1A 3GG4A 3LDQA 5BRHA 4MO5A 1GLCG 3QBWA 2PAVA 5FPNA 1KAXA 2IVNA 3FGUA 1U2VA 1JCFA 4HWIA 5FPDA 1NWKA 3ZX0A 2P9KB 5AQRA 3A5MC 4FWSA 5JMVA 4BRDA 2QWQA 2E2QA 4FPAA 2HF3A 2F9WA 3SJHA 4PL8A 4EAHD 5KPRA 1QQNA 1BG3A 3AAQA 3GBTA 2Q36A 3LM2A 2ASPA 3QBXA 4NO7A 1HKCA 1ATNA 5AZJB 3VESA 2Q0RA 1RGIA 3CI5A 4BGBA 1GLLO 4O5FA 4WQ4C 1SQKA 2FSNA 2P9KA 1BA0A 2E1ZA 3VENA 2GUPA 5ADXH 2E2PA 3FZHA 2Q31A 3ENOA 2PBDA 3CJCA 3A5LC 1V4SA 3HBTA 1QZ5A 3DJCA 4A2AA 1T44A 4K43A 2CH5A 3WT0A 3O1WA 5AZJA 4EHUA 2V52B 4H03B 4CBXA 3O4WA 3ENHA 3IFRA 4BRAA 3HI0A 3VEZA 3VF2A 3VF6A 2ASOA 5AQYA 4BC4A 3WXIA 4YDUC 4I6MA 1GLFO 5AQKA 2CH6A 5AQHA 3WQTA 4FOEA 4PKGA 2FXUA 3QB0A 3SMSA 5JLFA 3UB5A 2IVOA 5TKYA 1LOTB 4XH5A 3O08A 2GEMA 4M7YA 5BR9A 2ITMA 1NGIA 1NGCA 4A61A 3D2FB 3VEWA 2EWSA 1ATRA 2WUSA 2YHWA 1NGGA 2ZGZA 4BGAA 4FWKA 4Z94A 4BRKA 3M6GA 1HKGA 4H0TB 4H5WA 5ADXA 4MLEA 1XUPO 3IUCA 4IJAA 3IDHA 4CZFA 1Y64A 5BPLA 3VETA 2FSKA 4XH1A 1ZC6A 2QM1A 4FWRA 3LDOA 4WQ4A 3QDKA 2FF6A 3VGMA 1TYQB 3D2FA 3TPQA 1NGAA 4IO8A 2I7PA 2UYTA 3H3NO 1ZBSA 2GTDA 3LL3A 4C23A 3G25A 5AQXA 3EO3A 1J6ZA 4CZKA 2Q1NA 5AQWA 2NRHA 3H3OB 1HPMA 5LY3A 1U2VB 4H5TA 1NLVA 3KZBA 2P9IB 3O5BA 1TYQA 4BVPA 1QZ6A 2BTFA 3SLCA 3ZEUB 3UKUB 1TUYA 4BREA 4YDUA 5KPZA 4O8KA 3MCPA 4Y0WA 1KXPA 2VWBA 4EFHA 2QW9A 4BR0A 2YJEA 4DHYA 3EN9A 3C0BA 2GELA 3LDLA 4XEIA 3A0IX 3QFUA 4BR2A 3BEXA 3GOIA 2P9IA 4A2BA 4B1ZA 1CZAN 3QFPA 4BR7A 4F9OA 1H1VA 2KHOA 3HTVA 2E2OA 2E1YA 4FSVA 3ZEUA 3UKUA 3WEEB 1YVNA 4BQZA 1HKBA 1NGEA 1D4XA 5EXWA 5JLHA 1GLJO 3CIPA 3LDPA 5E26A 1RFQA 3R6MA 5EX5A 4AM7A 2D4WA 3VERA 1GLEG 4FL9A 1Q18A 3H1QA 3QMLA 4IXCA 1BDGA 1XQSC 1ATSA 1OKJA 3ZX2A 2I7NA 4B1WB 1LCUA 4PKHA 1X9JA 3WEEA 5JICA 3R8EA 4AM6A 5ELZA 2QXLA 2ZF5O 3AY9A 3A5OC 2YJFA 1DEJA 4I6MB 1JCEA 5B8HA 2D0PA 5AQGA 4H5VA 4CBWA 5CE3A 3WQUA 1MWKA 3H6EA 1KAYA 3VEXA 1DKGD 1X3MA 4RCHA 3L4IA 5AQZA 1GLBG 2GWKA 3DXMB 5F1XA 3H45C 4B1UB 4B9QA 1KAZA 5AQVA 1ZXOA 4RWTA 3D7EO 4BROA 2A42A 3CQYA 4CZHA 4IZ9A 4JN4A 5KPTA 4FWLA 3RSEA 3FZLA 4ISFA 3O8MA 4H5RA 1HX1A 3SMPA 2YHYA 2P9SA 4JHDB 4MO4A 4BRCA 1V4TA 3MK6A 3MMVA 3GL1A 3VGLA 2HOEA 2V51B 3D2EB 3DXMA 1HUXA 2CGLA 1BUPA 5BPNA 2Q97A 4H0XB 3HM8A 4FPBA 2P9PB 3AAPA 4IJNA 4JNEA 5BRDA 4LC9B 3FZKA 5BPMA 4QS9A 2ZGYA 3ATVA 3I33A 2QWOA 4FWNA 4JHDA 5FPEA 3BUZB 4PKIA 2FLOA 4B1YB 5LJWA 2NZTA 1NGHA 3D2EA 1Z6RA 1BA1A 4BR4A 4CZLA 2E20A 4H0VB 3A5NC 3BF3A 1U6ZA 4FWMA 4JAXA 1GLDG 3WXLA 3SK3A 1NGJA 5KQ8A 4M7XA 4WQ5C 4BG9A 3O1BA 2P9PA 3ULEB 2P9LB 4K41A 5FPMA 2ASMA 3C7NA 2YI1A 4H0YB 4CD3A 4QS7A 3CJBA 5AZIA 2E2NA 5EVZA 2QWLA 3VF4A 4EHTA 2QWPA 4PL7A 5AQQA 4ISEA 4FWQA 3M1FA 4FO0A 3L6QA 1G99A 2QWNA 2IVPA 3H1VX 5I9EB 4A62A 1Z05A 4DQ8A 1NGFA 4B1VA 1R59O 3ULEA 5E84A 2J4RA 2DPNA 3FZMA 3A8YA 5AQLA 2FSJA 2P9LA 3CQXA 5EY4A 2QWMA 3EKSA 4CJ7A 1S22A 4BC3A 3VGKA 1IG8A 2HMPA 3BF1A 2YCHA 5AQJA 4B1XB 3JS6A 5AQUA 4M63C 3UE5A 4BRGA 1GLAG 3JXUA 5AQOA 3GDQA 4H0OA 5EOYA 4XH4A 4BRFA 3LDNA 5BREA 4H0PA 2P9UA 1C0GA 1WUAA 4BRQA 1SAZA 2D0OA 3QICA 2V7ZA 4ISGA 2HF4A 5BN8A 3MN9A 4E1JA 2A3ZA 2BUPA 4CI6A 4WQ5A 1XC3A 3VEVA 4JD2B 4CZIA 3U9DA 1NBWA 3RSEB 1QQMA 4K25A 2P9NB 2P9SB 1T6CA 5LJVA 1YXQA 3KVGA 2QWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BC5A 2VG5A 2W41A 1J53A 4EIAA 1LWEA 3D6RA 1KRPA 3P4IA 1DGKN 2Q2RA 1D9FA 5AQIA 1B9FA 3CJ9A 2KZMA 5BRFA 1E4FT 2E88A 3B8AX 4O44A 1Q82O 1SUQA 4FLYA 1SZ2A 1X9WA 2A6AA 4DQQA 3ID8A 4M41A 5DK5A 4YOUA 3IRXA 3OYDA 1M90O 3DLLL 4BRIA 2LSNA 1IO2A 4JS5A 2ZJRL 4FCYA 1ESVA 4CHYA 3L3UA 4BRHA 2UXCK 3FLCO 3TU5A 3AA4A 1DLOA 4YOWA 3C6TA 1SL0A 3ZETB 3KK3A 3M5RA 2OANA 3WUHA 2G8UA 1U47A 4B3OA 3PSFA 2CGKA 3CPWM 2W6KA 1IV0A 5GAEP 4WFBL 4FWOA 2FBYA 1WNSA 1QSLA 3K9JA 4CEOA 4JKDA 1LWFA 4CZEA 4DV7K 4FJGA 1RT6A 4KAZA 4BVOA 5FROA 1IBKK 3CJAA 5BN9A 4IO9L 3MN5A 4OPKA 4Y1CA 1EP4A 3S3OA 1OH8A 1MA9B 3U4LA 2YHAA 3KHYA 3SPYA 4CHQA 4BC2A 3PX0A 4B3SK 4CBUA 4RG8A 3W0LA 2W6LA 2VCPA 1S5JA 3H08A 1YVUA 4FJIA 1VQON 3CCUN 1RBSA 2XY7A 3OYAA 3FE1A 4JI1K 2P9UB 4J8FA 3C95A 3DMJA 3NBPA 2VYPA 3KLEA 4MDBA 3AV9A 4CK1A 2P5GA 3K5LA 1VQ8N 4CJFA 3IAYA 1NGDA 1QQOA 3CJ7A 1JXBA 2YNFA 3HOSA 1TKXA 1ZBIA 5BRHA 4MO5A 3QBWA 2PAVA 2PYJA 3KTQA 3E9OA 4HWIA 1U45A 3A5MC 4E89A 3P5JA 1SL1A 4BRDA 3CC7N 4FPAA 2HF3A 2F9WA 3SBTA 3SJHA 4BE2A 3ZSVA 4EAHD 4LY7A 1QQNA 1BG3A 2GBZA 4CGIA 1LV5A 4NO7A 1ATNA 3NH0A 5AZJB 3VESA 3LANA 2Q0RA 1RGIA 1X9SA 4HVJA 4EP5A 2NUBA 4JK7A 3E9PA 1SQKA 2FSNA 1BA0A 3EZ5A 5ADXH 1TK0A 1RBVA 1Y97A 3CJCA 3S3MA 1WSEA 3U3GA 3NH1A 1QZ5A 3SJJA 4CIFA 2X74A 3O1WA 3AO1A 4YOYA 4JRQA 4NYNA 1R0AA 4WFNL 1RBUA 5KRTA 4IFVA 3VF2A 1WB9A 5AQYA 3KK2A 4Z4CA 1JLEA 4LD0A 5CYMA 5AQHA 1JXEA 4PKGA 2FXUA 3QB0A 5JLFA 2HSTA 3LP2A 5TKYA 4I9QA 2WC9A 3O08A 4DFJA 3O3HA 2ZJPL 2GEMA 4M7YA 5GADP 3JAMO 4A61A 4FZZA 1W0HA 1A5WA 4DR5K 4Z94A 4CJ4A 4H5WA 4RW4A 4CF0A 1XUPO 2EX3A 3CCSN 1ZBFA 5BPLA 3NHGA 2F8TA 4XH1A 3ZT3A 3I0SA 3L2RA 3OBWA 3MEDA 4KKOA 4E72A 1ASUA 1TYQB 3TPQA 1YJWN 1EETA 3MWTA 4IO8A 1NK6A 1C0MA 4E7IA 4AHSA 2NNWA 4JKGA 3ZSRA 2IAJA 1DT9A 4CZKA 3H3OB 5T7BA 4NCGA 3THWB 1ILYA 4H5TA 1NLVA 2P9IB 4DSFA 1W2BM 3E9LA 3EEQA 4BVPA 1QZ6A 2BTFA 3F5TA 4W5RA 4CJKA 3ZEUB 2QKBA 3O3FA 1VRUA 3TTDA 4H8KA 4YDUA 5KPZA 3TAFA 3K59A 1VQ7N 4DHYA 4ZTJA 3V81A 3EN9A 3C0BA 2HHIA 3LDLA 4XEIA 4IG3A 1LAVA 2Q3SA 1H1VA 4NLCA 3VA0A 1OH5A 3DRPA 4BQZA 3J81O 4BDZA 1QVGM 3PLAA 2PFUA 5C10A 3OYNA 1S6PA 1VQNN 2O8EA 5EX5A 5J2MA 3ZT0A 4C8LA 5GIPA 4LSLA 4LFCK 1XQSC 3ZX2A 1HJRA 4B1WB 1ZBHA 4BY9C 5KTQA 5JICA 1FJGK 3R8EA 3SPZA 4Y1DA 2ZF5O 2BE2A 2YJFA 1DEJA 5B8HA 2D0PA 5AQGA 3T1AA 4IDKA 1MWKA 1IKXA 4Q5VA 1N8RO 4DTUA 1UA1A 1X3MA 1YTAA 4RCHA 3KKRA 5AQZA 1FXXA 5F1XA 4C8MA 3QO9A 3S3NA 4ID5A 2IGIA 1ZBUA 2W42A 4JN4A 1ZYQA 3RSEA 1YJNN 3FZLA 4ISFA 4PQUA 2E6MA 1JL1A 1L3UA 1WSJA 1YF5L 4GVEA 3MMVA 3AVLA 4F3OA 3HPGA 4GV9A 3NGYA 2ZE2A 4AHRA 3DXMA 1HUXA 2CGLA 1EWQA 4CGGA 1VSMA 2Q97A 1TKZA 4FPBA 5EU7A 1N36K 5BPMA 3R3LA 3ATVA 3L2VA 4OLAA 2QWOA 1OVQA 3BUZB 3MXJA 3Q7CA 1XHZA 2NZTA 3ZT1A 1KCFA 1Z6RA 4CZLA 3MWPA 1GLDG 1OH6A 2ITGA 1TVRA 5KQ8A 4M7XA 2WFBA 2G8FA 1EKEA 1HRHA 3U3YA 3T1YK 4K8XA 1A5VA 4K41A 3SAHA 3CXCM 5FPMA 4H0YB 4KTWA 4QS7A 4M3ZA 2VG7A 1RT3A 2HBMA 1NG9A 4FWQA 1MU2A 1TL3A 1G99A 3HP6A 3OJUA 5I9EB 1RDAA 4A62A 1IKVA 1R59O 3P31A 2J4RA 2DPNA 4CJPA 4C8OA 3SUOA 4L8RB 3EKSA 1S22A 1UOCA 3VGKA 2OPQA 4KHYA 3BF1A 5AQJA 2Z1JA 3JS6A 2HVIA 1YJ9N 4M63C 1TKTA 3HXMA 2KKZA 3UE5A 4CF2A 1RDCA 4BRGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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