3GOIA

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 171
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3goiA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3goiA01
2P9SA 1QZ6A 3WUHA 1ZBSA 4GY2B 4CJ7A 5AZIA 1ESVA 2V51B 3H1VX 1HKGA 3EZWA 4AM6A 2GEMA 5BN8A 2IVPA 2QM1A 3ZETB 3GOIA 4BC2A 4MO5A 3AY9A 5FPEA 4RTFD 3HI0A 1TYQA 4QS7A 2V52B 3CJAA 4J8FA 3IMXA 3U9DA 2ZGZA 1GLAG 1GLLO 4WQ5A 3TU5A 1HKBA 3LL3A 3VEWA 1S3XA 3O5BA 5EOYA 4B1YB 2IVOA 2CH6A 1SAZA 2UYTA 5AZJA 5BR9A 2ASOA 3GL1A 3P4IA 4BC5A 2Q1NA 2QW9A 4M7YA 1MA9B 4IXCA 3DXKA 4H0YB 4BRPA 1HUXA 1BU6O 1E4GT 1P8ZA 4FPAA 2E2PA 1KAYA 2H3GX 1BO5O 1ATNA 2P9NA 3C7NA 4A2AA 3SLCA 2Q36A 3CQYA 2GWJA 4JN4A 1YVNA 3VEXA 1DEJA 2GUPA 2YCHA 4JD2B 4QS9A 1HKCA 2HF3A 3DXMA 4FOEA 2FF3B 3D2FA 3G25A 5BRFA 3I8BA 3CQXA 3RSEA 1NLVA 3O1WA 2QWPA 3H45C 5AQKA 4CZEA 1NGIA 1ZXOA 3VERA 4BRKA 3SK3A 2E1YA 1NGAA 5AQNA 5AQUA 1LOTB 3FLCO 4JHDA 4K41A 4BVOA 3MN6A 3MCPA 4PKHA 3L4IA 3VPZA 3MDQA 4XH4A 5BPNA 3WEEB 2ASMA 4K42A 3FR0A 2A3ZA 3KVGA 3D7EO 1BG3A 2P9PA 4FPBA 1TYQB 4NB4A 4FWLA 5AQWA 3UKRB 2YJEA 5KPRA 4MO4A 1HPMA 3GG4A 3HSCA 4IJAA 3CERA 4L3QA 4EIAA 4BR5A 5AR0A 1BUPA 4O8KA 3ZX0A 4CZHA 5AQXA 4BRGA 3GE1A 1Q18A 3WXKA 4PL7A 2QWRA 3DXKB 3GDQA 1T6CA 2FLOA 4K43A 1YXQA 1CZAN 3O4WA 3BP8A 3BEXA 2KHOA 1X3NA 4BVPA 3M6GA 2AA4A 1QQOA 2FSJA 2AP1A 3U9ZA 3AAQA 5KPZA 2YI1A 1NGHA 5FPDA 1XQSC 4FOIA 4BRAA 3VEVA 3DXMB 2IVNA 4FWMA 1G99A 2P9IA 3D2FB 4CD1A 4CZJA 2E2NA 3CIPA 1SQKA 3IDHA 5LJWA 5BRDA 4FO0A 5AQFA 4FWPA 3ZX3A 3D2EA 4BRQA 1NWKA 1MWKA 1JCGA 3JXUA 3UE5A 2QWMA 4B1XB 4B1UB 3CETA 5AQVA 4B1VA 4BROA 5LY3A 4CZMA 2Q0RA 1YAGA 1KAXA 4MLHA 5AQSA 5FPNA 5AQRA 4FWNA 3H3NO 5FPMA 4BRIA 2QWLA 2EWSA 2P9LA 3QFUA 1D4XA 2HOEA 2P9PB 1U2VA 2P9KB 1NGEA 2F9WA 1X3MA 1RDWX 3HM8A 3HZ6A 5AQPA 3FZMA 1NGGA 2OANA 4AM7A 4F9OA 3EKSA 1T6DA 2E1ZA 4H5VA 3WT0A 1XUPO 4I6MA 3WXLA 5AFUH 1NGJA 5B8HA 5F2RA 3FE1A 1HJOA 4FWKA 3SMPA 3R9PA 1Y64A 2NRHA 3R6MA 1TUYA 3EO3A 4H0XB 4BC4A 5ADXA 2D0PA 2HF4A 5AQJA 1U6ZA 3WQUA 4CBUA 2V7YA 3S41A 4BR4A 5AQOA 1V4TA 1IG8A 5JMVA 2A42A 3VEZA 1J6ZA 3W3DA 4DCHA 5BRHA 1R59O 1RFQA 2D4WA 1H1VA 5KPTA 2E2QA 3VF6A 3KHYA 3VETA 3ZEUB 2ASPA 3VGLA 1GLBG 3WXJA 4WYBA 5JICA 4YDUC 3ULEB 3H46O 4BRDA 3GBTA 3W0LA 4CZIA 1C0FA 4BGBA 4BR0A 1TUUA 3MK6A 3QBXA 3CJCA 1NGCA 3I33A 4ISGA 4RWTA 4H5NA 1E4FT 5BPMA 5E26A 3VF4A 1GLEG 2F9TA 3ZX2A 3MN9A 2P9SB 2IIRA 4IO8A 1EQYA 3CHWA 5AZIB 3DAWA 1XC3A 4BGAA 3QICA 3UB5A 2I7NA 3LDNA 2ZWHA 3LDOA 5AQTA 5ELZA 3DJCA 3LM9A 5JLFA 4WQ4C 2P9LB 4XH5A 4EHTA 3H6EA 3FZLA 2CH5A 4HWIA 4H5TA 2P9UA 1IJJA 4BR7A 2YJFA 2Q97A 3ATUA 3A5NC 3L0QA 3QB0A 2GTDA 2VCPA 4JAXA 4C23A 2NZTA 1KAZA 1X9JA 2VWBA 2FXUA 5TKYA 4FL9A 5AQIA 5AZJB 4E1JA 4DQ8A 5AQZA 4BRLA 1BA0A 3R8EA 3UKUA 2PBDA 2E88A 5F0XA 2GELA 2FSNA 4BRNA 2P9NB 3C7NB 3EKUA 2V7ZA 4ISFA 2A6AA 2E8AA 4YDUA 3LDPA 3H3OB 4B9QA 1BDGA 3WQTA 1GLDG 1BA1A 3ID8A 3FGUA 3M1FA 5EXWA 3RSEB 3C0BA 4H03B 3VEYA 1SZ2A 2NLXA 1DGKN 1WUAA 2Q31A 4GNIA 1GLJO 1MDUB 2DPNA 4BG9A 2A5XA 5EX5A 4JHDB 1QZ5A 3MN5A 4M63C 3QMLA 2FF6A 4H5RA 1NMDA 3H1QA 4EHUA 3EN9A 2HMPA 3A0IX 4JD2A 4WQ4A 1OKJA 5BN9A 3U4LA 1K8KA 1LCUA 1V4SA 4PKGA 4PL8A 4XEIA 4CZGA 4A2BA 2W40A 4H5WA 1S22A 2CGLA 5EVZA 5BPLA 3DWLA 4ISEA 1Z6RA 1QHAA 3MN7A 3FZFA 3M3ZA 4IWVA 1JCEA 1NM1A 3BF3A 3WEEA 3VOVA 4LC9B 4DHYA 2QWQA 1NGBA 2W41A 1YUWA 3BF1A 4B1ZA 3O08A 4KBOA 3OHRA 2ZGYA 3JS6A 5AQQA 3UKUB 4DB3A 1HLUA 3A5OC 4A61A 3LDLA 2I7PA 3UKRA 5F1XA 1ATRA 4IZ9A 2A40A 3CJ7A 5JLHA 1GLFO 2D0OA 3A5LC 4BRHA 3J8AA 4CBXA 4H0OA 3F9MA 3FFKB 1NBWA 2VYPA 2P9IB 5LJVA 3CJBA 4BRMA 3L6QA 4EAHD 1C0GA 3KZBA 3HBTA 1NGFA 3D2EB 3VGKA 4FWSA 4A62A 4MLEA 4IJNA 4BRFA 4CZKA 4PKIA 4BRCA 4BR2A 3ENHA 3VF2A 1MWMA 5AFUA 3A5MC 4HTLA 4BQZA 4BREA 4BR9A 3FZHA 3VGMA 4NO7A 5E84A 4H0PA 1K8KB 3ATVA 4CZLA 2CGKA 1QQMA 4Z94A 1BWFO 3QDKA 1U2VB 4RCHA 4M7XA 4FWOA 4CBWA 4CI6A 1ZC6A 2PAVA 3IFRA 4H0VB 1JCFA 2Q2RA 4JNEA 4BG8A 3VESA 4I6MB 5AQMA 5EY4A 2CGJA 1RGIA 4CD3A 3QFPA 3O8MA 3MMVA 3A8YA 3ZETA 1T44A 3WXIA 1QQNA 1Z05A 2P9KA 2D1KA 4FWQA 5AQLA 2YHYA 2YHXA 3SJHA 4O5FA 2FSKA 3BUZB 3QBWA 4FSVA 2J4RA 3SMSA 1WOQA 2ITMA 4BC3A 4CZFA 1GLCG 2QXLA 3IUCA 4WQ5C 5KQ8A 3EL2A 4EFHA 2QWOA 4Y0WA 2BTFA 1HX1A 3VEOA 1KXPA 5BREA 4QS8A 3O1BA 2QWNA 3LM2A 3B8AX 2BUPA 2YHWA 2A41A 5AQYA 1NGDA 3CJ1A 5I9EB 3AARA 3ZEUA 5KQDA 1DKGD 3VENA 3LDQA 5AQHA 2E2OA 2E20A 3ULEA 2GWKA 4B1WB 5CE3A 3CJ9A 3TPQA 4BQLA 2ZF5O 3O6WA 3AAPA 5ADXH 3HTVA 5AQGA 3O80A 3FZKA 1BOTO 3U8XA 2P9UB 3ENOA 4XH1A 4H0TB 3CI5A 2WUSA 4FWRA 1ATSA 4K25A 2Q0UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QZ6A 2RF2A 4GY2B 5CY4A 1J53A 1L3SA 4AM6A 2VQFK 4O5BA 4FJNA 1WSJA 5BN8A 2F8TA 4MO5A 3AY9A 4DUYK 4M42A 4RTFD 1L3VA 2HHSA 4J8FA 4LSNA 2I5JA 1VQPN 2PYJA 2FBXA 2BGGA 1HKBA 5HRNA 4GKKK 1IBLK 2CH6A 1NOYA 1TKDA 2UXCK 5I3UA 1DTQA 1Q86O 2UYTA 2ASOA 2BH1A 4OGEA 4Z0UA 2AJQA 1YIJN 2QW9A 2A1SA 4M7YA 1SKSA 5CZ2A 1HUXA 3VQAA 2JLEA 3NF9A 1BO5O 1ATNA 1C0MA 4RG8A 4PA1A 1DEJA 3B6OA 4JD2B 2E4LA 4CEDA 4CERA 1F21A 4E19A 3EEQA 3CQXA 4DFJA 4CZEA 3LDSA 1NGAA 4AF1A 5I42A 1S1XA 4JHDA 4QAGA 3EZ5A 1HPZA 5E41A 4PKHA 3L4IA 3VPZA 3MDQA 5LL6Z 4XH4A 3WEEB 2ASMA 3O9UA 4B3SK 3KVGA 4CJVA 3KLFA 4DG1A 3SAFA 2HHQA 3WNFA 2IDOA 3NBPA 3UKRB 3P31A 4MO4A 3OYMA 3HSCA 4RW9A 2YNHA 4B3RK 4DSJA 5AR0A 2F4VK 4CF1A 3PIOL 2XHBA 4X65K 3NAEA 2JWLA 4RW7A 4CVNE 4H4OA 1LWCA 4CZHA 5AQXA 4BRGA 4U7BA 1NK5A 2YX6A 1Q18A 3ASMA 2QWRA 2HHVA 4OX9K 1ASUA 1WN7A 1ZBFA 1EP4A 3AVLA 2KHOA 2G8UA 4BVPA 2FSJA 2AP1A 4CJTA 4CJUA 2BANA 4FOIA 4DSEA 1IKYA 1QE1A 3DXMB 1TGOA 4IFEA 4CFAA 2P9IA 3D2FB 3K58A 3KK3A 4CZJA 2E2NA 3OYDA 3OYIA 3ZX3A 4OKKA 5J2QA 4DMNA 1ILYA 2BDPA 1MWKA 1JCGA 4BACA 2QWMA 4JKEA 4B1UB 3CETA 3P1GA 4IOCL 3OYBA 4B1VA 4CIEA 2Q0RA 1KAXA 4MLHA 5FPNA 2O8FB 4FWNA 3H3NO 2YNGA 2P9LA 3QFUA 3V9XA 1X3MA 1RDWX 5T7BA 3HYFA 1X9WA 4FJMA 3SAGA 1NGGA 4AM7A 3LALA 4ELVA 3WT0A 2O4GA 3WXLA 2IC3A 4WFBL 5FDLA 3VMFB 4C1NK 4JKHA 4LY7A 3R9PA 2XY7A 2NRHA 3ITHA 5HROA 3NCIA 3T19A 4MQ3A 4GV3A 3E9PA 4CBUA 3WQUA 2VWJA 3S41A 3N4QA 5AQOA 1V4TA 1IG8A 4ZTFA 3QLHA 4DR3K 4JK9A 3W3DA 3C6UA 1RFQA 3MWTA 3KHYA 3ZEUB 2ASPA 5C12A 4DU3A 2X6SA 1SL2A 2QKKA 4DTPA 1GLBG 3WXJA 4E7LA 4BE1A 4ILGB 3U6FA 3LZIA 2OPPA 3H46O 3GBTA 1SKWA 4CZIA 3MK6A 4H4MA 3CJCA 4DTXA 3K5LA 4JI3K 4ISGA 4RWTA 1Q81O 1E4FT 2DY4A 3VF4A 4E7KA 2RKIA 1BGXT 3EY1A 3MN9A 2PZSA 1REVA 3CHWA 1VQON 3HOSA 3DAWA 3O4QA 2ZE2A 2I7NA 2O8CB 3CCUN 2PYLA 3UIQA 3DOKA 3FZLA 2CH5A 4H5TA 3D6RA 5GINA 4BR7A 2ZJRL 2VGMA 2GTDA 3SYZA 2NZTA 2WONA 5GAEP 3CCRN 1X9JA 3RMCA 4I2PA 1LAWA 2BE2A 2NUBA 4DR1K 2P5OA 4BRLA 4JRPA 1TV6A 2D0AA 3DRRA 3R8EA 2E88A 4O0JA 5F0XA 2HVIA 3SV3A 2FSNA 1HMVA 3SQ2A 1NU0A 1D9FA 5JVGL 2LSNA 4CJFA 3LDPA 3H3OB 4AHUA 1VQLN 3S3MA 4YHHK 4B9QA 2OA8A 4LH4A 4C8OA 1J5OA 1FXXA 2E5LK 3C0BA 3ALYA 4OVLA 1SZ2A 3I8DA 1ITGA 1SKRA 1DGKN 1WUAA 3L2QA 3MEGA 1GLJO 2DPNA 4BY9C 2A5XA 4JHDB 1QZ5A 4LFBK 3OYAA 2FF6A 5FROA 1NMDA 4K0KK 2ZD1A 4EHUA 1WBBA 3IRXA 3A0IX 4HCBA 3NH2A 2OPRA 1KVCA 2Q3SA 2FBYA 4CJLA 4BDYA 1RTIA 1SS6A 1BL3A 1TAUA 1VQ9N 4B9VA 3U4LA 4XEIA 1LCUA 4KV8A 1NNEA 4A2BA 2ZJPL 1UAXA 3MEEA 4DV1K 4KHPK 2QA4N 4BWJA 4JI0K 4IWVA 4LC9B 4DHYA 4NXNK 2QWQA 1NGBA 2W41A 3BF1A 4CEFA 1NMNA 3HVRA 3JS6A 3UKUB 3TTFA 1FK9A 3HPHA 4M3WA 1DLOA 1KQSM 4B9MA 1TL1A 2FBVA 4K8XA 2I7PA 2D0BA 1ATRA 3CJ7A 5JLHA 3VQDA 3J8AA 3O4NA 4CBXA 3F9MA 4NLBA 3RVCA 4ELUA 2P9IB 1KLMA 4BRMA 4GW6A 2YNFA 4QOZB 3KZBA 1OH6A 2X78A 3VQ5A 2PY5A 1NK4A 4IBNA 3E01A 5AFUA 3VQEA 3U3YA 1QHTA 1KCFA 3FZHA 4CFBA 1QSYA 5FLXO 3QETA 2UU9K 4FJ5A 1IBKK 3K9JA 1K8KB 3ATVA 2CGKA 4Z94A 3C65A 4RCHA 4MDAA 3OW2M 4WCEL 1ZC6A 4F4KA 1ASVA 1C1CA 3OS2A 1VSEA 4JLHA 4DWIA 1WB9A 4I9QA 4DTJA 3NE6A 2D1KA 4JKCA 4KI6A 2FSKA 4FJJA 3QBWA 4CHOA 1C6VA 5HOOA 1W97L 3PX4A 5KRSA 3CF5L 3EL2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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