3GOIA

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 171
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3goiA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3goiA01
1GLEG 1MWMA 1JCGA 3QDKA 3EL2A 5EXWA 3GBTA 3ZX0A 3DXMA 3O1BA 3WXJA 3CJ1A 1BU6O 5AQJA 2GUPA 3WUHA 4CD1A 4CBUA 2A3ZA 1ZC6A 2GWKA 3U9ZA 2E20A 3ZETA 1NBWA 2F9TA 3BF3A 2P9PA 5KPRA 4BR5A 4BRAA 3OHRA 2A42A 2GTDA 1X9JA 2QWRA 4RCHA 5AQMA 4BVPA 2A40A 3CERA 3FZLA 5ADXH 1U2VB 3FLCO 5JLHA 3FZMA 4K43A 5FPMA 4O5FA 2V7ZA 2QWQA 3LM2A 5EOYA 1KAYA 3ID8A 1Q18A 1GLFO 4BRNA 4H5TA 2ZWHA 4IZ9A 3U8XA 5AQLA 2E88A 2HF3A 1T44A 1NGBA 3L6QA 4PL7A 1S22A 1X3MA 1GLDG 3VEZA 3R9PA 2Q0RA 3SK3A 3G25A 2FF6A 5AQXA 3CJAA 5B8HA 4CZIA 5AQUA 5I9EB 4FWRA 1NGJA 1HUXA 2V7YA 4FWPA 1HKCA 2Q36A 5AQIA 5FPEA 4DCHA 3O08A 3VEOA 1C0FA 2YI1A 2FSJA 2QM1A 3A8YA 2P9SA 3ZEUB 4CBWA 3MN5A 3MN9A 3VF2A 5FPDA 4H5RA 2I7NA 3FZFA 4B1ZA 4XH5A 3MK6A 2A6AA 3CI5A 2P9UA 4JHDA 1D4XA 3CIPA 2PAVA 4WYBA 3IUCA 3MDQA 4H5VA 1ZBSA 1BOTO 3UKUA 4FL9A 1BG3A 2VCPA 1GLBG 5CE3A 3HI0A 1G99A 1NGIA 3QBWA 4EIAA 1LOTB 1DEJA 2QXLA 3D2FB 4B1VA 4IJNA 4BR7A 2Q1NA 3VETA 3DXKA 3FR0A 2IVNA 3KVGA 1GLAG 1QZ6A 5BPLA 2P9IA 5BRDA 3A5LC 5F1XA 4DQ8A 4H5WA 3QMLA 4MO4A 1YVNA 3BEXA 4B9QA 3HSCA 4YDUA 3C7NA 3RSEA 2P9KA 1NGHA 2QWMA 3SLCA 5LY3A 3UKRB 1RDWX 1SAZA 1BO5O 3GOIA 4EFHA 3H3OB 3O1WA 3JXUA 3SMSA 3MMVA 1DGKN 1V4SA 4BQZA 1WUAA 2W41A 4FWSA 4NO7A 4CZGA 2CGKA 4JNEA 5AQNA 5BN9A 1TYQB 3JS6A 4H0PA 4K41A 4A62A 4MO5A 3EKUA 4Y0WA 4A61A 2E1ZA 4PKIA 4EHTA 4B1XB 3O8MA 3VEXA 3VENA 1IJJA 3WXKA 1YUWA 3F9MA 2OANA 4BC3A 1DKGD 1NGDA 3WQUA 2A41A 3TPQA 3WXIA 4DB3A 1EQYA 3B8AX 3VEVA 2BTFA 4L3QA 3P4IA 3HTVA 1T6CA 1HX1A 3M1FA 3W0LA 3BP8A 5BN8A 4CZLA 1HKBA 4I6MA 3BF1A 2W40A 4BRMA 5AZIA 2CGJA 4BGBA 1MWKA 1MA9B 3VGLA 3WEEA 4BRLA 1ATRA 2V52B 4A2BA 2P9LB 4PL8A 2YHWA 4BGAA 3ZEUA 2HOEA 4FWMA 2NZTA 3D2EA 2D0PA 4BR0A 3AARA 3ATVA 3LDNA 3UE5A 4FSVA 1QQOA 1S3XA 4H0OA 3CJCA 2QWPA 2ASPA 1K8KB 4FWKA 2D4WA 4WQ4C 1LCUA 4H0TB 2E2QA 1YAGA 1RGIA 1NGFA 3GE1A 4JD2B 3DJCA 2YJFA 4FO0A 1JCEA 5F0XA 3O4WA 1E4GT 3FZKA 5BR9A 3D2FA 4GY2B 4E1JA 5EVZA 4BREA 3O6WA 3VEWA 4JAXA 3LDQA 2ITMA 4CZKA 4IWVA 4HWIA 5AQOA 2GELA 4BC5A 4CZFA 2NRHA 3ZETB 3C0BA 2Q0UA 3QB0A 3R8EA 2YHXA 5AZJA 1HPMA 3CJ7A 3EKSA 4BVOA 3H45C 5JMVA 2YHYA 3FFKB 4ISEA 1GLLO 2CH6A 4BRHA 5BPNA 3DAWA 1NLVA 4ISGA 3IFRA 4FWOA 4H0YB 2HMPA 4KBOA 1XUPO 5AQSA 1U6ZA 2BUPA 3O5BA 1NGGA 5BREA 4IO8A 4BRKA 1YXQA 2A5XA 2VYPA 3H1VX 1V4TA 3J8AA 2FXUA 3R6MA 1XQSC 3WXLA 4BRQA 3WQTA 3ULEB 4CBXA 5LJWA 3O80A 2E8AA 2FSNA 5FPNA 5JICA 4H5NA 2V51B 2P9NA 4M7YA 1IG8A 1TYQA 1SZ2A 4LC9B 3AAPA 5BRHA 1J6ZA 3QBXA 3I8BA 4CI6A 2I7PA 5TKYA 4RTFD 5AQPA 4XH1A 5AQQA 4BRFA 3QFUA 4F9OA 2Q97A 3HZ6A 4BRIA 1QZ5A 5BRFA 4WQ5A 1JCFA 3M3ZA 2AA4A 4JHDB 3WT0A 1X3NA 5AQVA 4PKHA 4QS9A 1BA0A 3UKUB 3HM8A 1NWKA 1U2VA 1NGCA 4BQLA 2ZGZA 3ZX2A 3LDOA 4XH4A 2E1YA 2P9LA 1BWFO 4Z94A 1R59O 1KAXA 5AQKA 1GLJO 2Q31A 3ENOA 5F2RA 1QQMA 3VESA 3GL1A 3VF6A 4PKGA 4H03B 3SMPA 1Z6RA 3ATUA 3MN7A 2ASOA 1BUPA 1E4FT 2FF3B 3C7NB 3SJHA 4M7XA 3TU5A 3I33A 3RSEB 5EY4A 4DHYA 1TUYA 3EN9A 4JD2A 3CQYA 3FE1A 4FPAA 1ATNA 2YCHA 3AY9A 2WUSA 1OKJA 2E2OA 1RFQA 4CJ7A 5AQTA 3QFPA 5EX5A 3L4IA 2IVPA 5AQYA 4B1WB 4CD3A 4CZHA 3U9DA 1HLUA 5AQRA 4BR2A 2Q2RA 2ZGYA 3ENHA 5KQ8A 2EWSA 2FSKA 4IXCA 3KZBA 4MLHA 4YDUC 3S41A 4FWLA 1KXPA 4BC4A 1SQKA 3IMXA 4QS8A 3A5OC 2ZF5O 2IVOA 4H0VB 3W3DA 2D0OA 3CJ9A 3LM9A 4EHUA 4B1UB 3ZX3A 5AQHA 3A5NC 4GNIA 2HF4A 3A0IX 1QQNA 3DXMB 3KHYA 2D1KA 4WQ5C 4BRGA 3IDHA 3AAQA 4FPBA 3VERA 1GLCG 2QWOA 4C23A 1P8ZA 2CH5A 4CZEA 3EZWA 2P9PB 1NGEA 2IIRA 4A2AA 3LDPA 5E84A 3ULEA 3QICA 4AM7A 4I6MB 3H3NO 2AP1A 5KQDA 2VWBA 1NMDA 3LDLA 5AZIB 5JLFA 5AQWA 1H1VA 4CZMA 1C0GA 3CHWA 4BROA 2FLOA 2QW9A 1T6DA 3WEEB 4BR9A 2KHOA 1ESVA 1WOQA 3D7EO 4MLEA 1ZXOA 3UKRA 3D2EB 3VGKA 3CQXA 1XC3A 4JN4A 2GWJA 4IJAA 2E2PA 3A5MC 5KPZA 4QS7A 2QWNA 5ELZA 4BRCA 3GDQA 3L0QA 4O8KA 4BG9A 1MDUB 1NM1A 4J8FA 3VEYA 5LJVA 2J4RA 4FOIA 4RWTA 5AFUA 3MCPA 3H6EA 3U4LA 3CETA 4BC2A 1TUUA 4BG8A 2UYTA 3VOVA 5BPMA 3HBTA 4K42A 2ASMA 4FWNA 2P9SB 1HKGA 4CZJA 3GG4A 4EAHD 1BA1A 4ISFA 5AZJB 2PBDA 4XEIA 2DPNA 3MN6A 4BR4A 3H46O 1QHAA 2P9UB 5AQFA 4NB4A 3VPZA 4FWQA 3BUZB 4FOEA 3VF4A 5E26A 3UB5A 4HTLA 2NLXA 4H0XB 4WQ4A 5KPTA 3FZHA 4K25A 5AQZA 3M6GA 3VGMA 1Y64A 3CJBA 2E2NA 5AR0A 1BDGA 5ADXA 1NGAA 3LL3A 3DXKB 3FGUA 2QWLA 3H1QA 4B1YB 1Z05A 1KAZA 3DWLA 2P9IB 5AFUH 2H3GX 2F9WA 1CZAN 1HJOA 4BRPA 1K8KA 2P9NB 4BRDA 4AM6A 2GEMA 2YJEA 4M63C 5AQGA 2P9KB 3EO3A 2CGLA 1ATSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLEG 4MDBA 4HUGA 3L2UA 4FLVA 1MWMA 3THYA 1VSJA 2P1JA 5EXWA 3GBTA 1YJNN 3O1BA 3WXJA 2D0BA 2YKNA 4CHQA 3K58A 2X78A 4CD1A 1W7AA 3HVRA 5FROA 4KV8A 2P9PA 2P51A 5KPRA 4KTZA 2OTJN 3LWMA 3AVGA 5M1QA 3MEGA 3FZLA 5JLHA 4K43A 1NKEA 1RBTA 1KAYA 3ID8A 4JKGA 4FZXC 4BRNA 1KLMA 5CR4A 3WNGA 4H5TA 2ZWHA 4IZ9A 4GV6A 4KO0A 3ULDA 1IKWA 4PL7A 1X3MA 4ELTA 1GLDG 3R9PA 2FF6A 5B8HA 4I9QA 4C1NI 5MLCQ 3VQ5A 3IS9A 4DS5A 2BDPA 4FWRA 3OYNA 1NGJA 3VN5A 2V7YA 5HRRA 4DQSA 2HHVA 4DU3A 3P38A 5AQIA 1NOYA 4FLZA 3OYHA 1K9MO 3A8YA 5GIOA 1S1WA 4H5RA 5I42A 5DK5A 2B6AA 3C94A 4B1ZA 1IBMK 4Z4IA 1ZBLA 1QHTA 1S1XA 4JHDA 1D4XA 3CIPA 2PAVA 5KRSA 4DLEA 4WF9L 3AO4A 4DU1A 5HP1A 4DG1A 3A2FA 3UKUA 4M3UA 3HI0A 1G99A 3ZT3A 3HPHA 3DLGA 4EIAA 1DEJA 5LMNK 3IRXA 4DFMA 4BDYA 2Q1NA 3VETA 3I56N 4KREA 3FR0A 4DR2K 4AHCA 3CFOA 4YY3K 5BPLA 2UXDK 4DR1K 5F1XA 4DQ8A 1S6PA 3QMLA 4DTOA 4WE1A 4FW2A 4YOUA 3RSEA 3KD1E 3L2WA 3SQ0A 1JLFA 5HBMA 2QWMA 3SLCA 1IV0A 2NUBA 1XWLA 3AVHA 1N5YA 4EP5A 3TSUA 3OA9A 4CW7B 3O1WA 1DGKN 1V4SA 3NGZA 1JJ2M 1UWBA 4FWSA 3AVKA 1TK0A 2CGKA 3KK1A 2O8EB 4M41A 4CJ5A 1TYQB 3EY1A 3JS6A 3O3HA 1EETA 4FK4A 4A62A 2OZSA 4KHSA 3E9OA 2E1ZA 4PKIA 1LAVA 4F3TA 3VENA 1IJJA 3WXKA 1NJYA 1YUWA 2OPQA 2HHHK 4O5BA 5DM6L 4NCGA 3TABA 1DKGD 1NGDA 3WQUA 2A41A 3WXIA 3V81A 4Z0UA 3V1RA 1WAFA 4KB1A 1GOAA 3KWIA 4DV1K 1W9HA 3VEVA 3Q7CA 4FJ9A 3HTVA 1T6CA 5BN8A 2YHAA 4CECA 5AZIA 4BGBA 4C8KA 1HNWK 1RTIA 4KKOA 5HRNA 4CF0A 1NJXA 3E01A 4LD0A 3VGLA 3WEEA 3L2RA 2V52B 4JV5K 3K0SA 4M3XA 4I9LA 3VTHA 4JKBA 4DV2K 2D0PA 3BY5A 3V4IA 2OPPA 3EE9A 3QESA 3T69A 3D45A 4H0OA 3CJCA 1E3MA 2QWPA 1OH8A 4FWKA 4DSIA 2D4WA 4ELUA 1LCUA 3R3LA 2E2QA 5JS1A 5E41A 5FDLA 2YJFA 1D8YA 1JCEA 5F0XA 1S1VA 4E1JA 3MECA 5EVZA 4BREA 3O6WA 3LAMA 4M3ZA 2F96A 1RT4A 1EX4A 2GELA 3I0SA 2IAJA 4CFCA 3ZETB 1WBBA 4FLXA 2NRVA 3QB0A 3R8EA 2YHXA 3H45C 3F9KA 3CCJN 3LZJA 4CGJA 2F8TA 3AGRA 3D6RA 3HVTA 4BRHA 1CXUA 4B8AB 4WFNL 3I8DA 3IFRA 4CGDA 4H0YB 2HMPA 4KBOA 1T05A 1U6ZA 4RW6A 1RCHA 3ZSOA 4BRKA 4MQ3A 3H1VX 1ZBIA 4WFBL 2JWLA 3E1YA 1NOZA 3WXLA 3O80A 2E8AA 4Z4GA 2W6KA 4JKAA 1JLAA 4H5NA 2P9NA 4AF1A 4LFAK 3PSFA 1DTQA 5BRHA 3QBXA 3K2PA 1NG9A 3MWTA 1HNXK 1XMOK 4CK2A 4XH1A 2IOCA 4BRFA 5KTQA 3HZ6A 1IKYA 4WQ5A 4PKHA 5C10A 3Q7BA 1X1PA 1B9DA 4O55A 2BE2A 1L3UA 3OYDA 3AVIA 3QERA 1OH5A 4BQLA 4JI5K 4XH4A 2YKMA 4LSLA 2QK9A 2P9LA 1BWFO 4Z94A 3HJFA 5AQKA 2Q31A 4W5OA 2OYQA 1QQMA 5M1FA 4H03B 4IBNA 2O8CB 2ASOA 1BUPA 4CJKA 5M1KA 2JGUA 1K6YA 1N34K 3EN9A 2YCHA 2E2OA 2XO7A 5AQTA 2BGGA 4B1WB 4CZHA 4A57A 2Q2RA 2ZGYA 3ENHA 4YOYA 3VQPA 2FSKA 5C2FA 3EE8A 1VK0A 3ZT2A 1N33K 2O8DB 1SQKA 3P83D 4H0VB 3W3DA 4JI6K 3CJ9A 3F5TA 4B1UB 4I2QA 3OYIA 3A5NC 1YF5L 3KK2A 3L2QA 3IDHA 3AV9A 2QTDA 1QQCA 3VERA 1NKBA 3VQEA 3DLLL 2FBXA 3D0PA 2CH5A 1VQ6N 2P9PB 4B08A 4CHPA 3L4QA 1NGEA 3QO9A 2F8SA 3ULEA 3QICA 2AP1A 5KQDA 4CESA 3LDLA 5GAHP 1C0TA 1RT1A 1H1VA 4HHTA 4JKGB 1VSHA 3P5JA 1T6DA 4IG3A 1JLCA 4BR9A 1ESVA 4MLEA 3O3GA 2Q3SA 3VGKA 3CQXA 4JN4A 1RDDA 1XC3A 1EP4A 3AVCA 2QA4N 5KPZA 3A5MC 3E66A 3SQ1A 4QS7A 2QWNA 4DFPA 1D9FA 4BRCA 3KLEA 3GDQA 1M1KO 1VQNN 4C8NA 1MDUB 4JKHA 4GMJB 2PYJA 4CIEA 4B9SA 4OO1J 5HRSA 1BQMA 4JRPA 3MCPA 4JK8A 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1TK8A 3TTCA 3M8SA 3A5LC 4X62K 4W5TA 3AVAA 4BDPA 1CLQA 2ZJPL 4HTUA 1VSDA 3L3UA 3R1XA 1ZBFA 4FJLA 4CHOA 3LAKA 3QEVA 2P9KA 5D3GA 1K73O 3E9PA 5J2PA 5LY3A 1QSLA 1RDWX 1SAZA 3NH0A 3GOIA 4GVEA 2NRTA 3DRPA 1XNQK 4IOXA 3JXUA 3SMSA 4LFBK 3V9WA 2W41A 4KB0A 3LANA 3OYFA 4CZGA 4E7KA 1EKEA 2ZJQL 1VSLA 4JNEA 2A1RA 3CYMA 1TK5A 4H0PA 4K41A 4X66K 3ZSYA 4EHTA 1O13A 3VEXA 4AH9A 2OPSA 1KVBA 4BC3A 4L8RB 3SNNA 2BH1A 2Y1IA 4DSLA 3ZT0A 3B8AX 1LW2A 4DMNA 2KZMA 3NCIA 4DUZK 3L3VA 1HX1A 1Q9YA 3BP8A 5JVGL 1HKBA 2W40A 3ISNC 4AHSA 1MA9B 4LSNA 2KFZA 4CJFA 3CMAN 3K5NA 1ATRA 5BR8K 4A2BA 2P9LB 5C12A 2HOEA 4FJMA 2NZTA 4BR0A 3AARA 3ATVA 3LDNA 4JS5A 3S3NA 4NCAA 4FSVA 3K5OA 1KTQA 1HNZK 3OVNA 4RW7A 2ASPA 1YJWN 4FJJA 1VQPN 4K8ZA 2QKBA 1EXQA 1YT3A 4N47A 3J7AP 1YAGA 3KWGA 2UUAK 4CEQA 3PSIA 4BE1A 2ZE2A 3BZKA 3O9UA 3DJCA 1YIJN 3FZKA 1LW0A 4CEZA 3SAHA 1BIUA 3OYCA 5DMRA 3O9TA 2VG7A 4M3WA 2EX3A 4R79A 3NAEA 3NE6A 2Q0UA 5AZJA 1HPMA 4Z4CA 4JK9A 3NF8A 1RDUA 3SCXA 1I39A 2YHYA 3FFKB 3VQ7A 3MAQA 4OKJA 1OVYA 4B9NA 4DTNA 5BPNA 1WSGA 3DAWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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