2P9UB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
248
structure length
222
Chain Sequence
b'TEPPMIQAVLTLYQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
total genus 59
structure length 222
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uB02
5BREA 1CZAN 3UB5A 4BGAA 3H1VX 3QMLA 2OANA 4XH1A 2QWNA 2Q97A 2QM1A 3WQUA 5EVZA 2Q31A 3D2FB 4CZFA 1NGCA 2IVPA 3KHYA 2P9SB 2IVNA 1JCGA 3EZWA 2AP1A 3BUZB 5AQUA 4IO8A 3L0QA 1NGIA 3U8XA 4IXCA 1Z6RA 4PKGA 1MDUB 2FF3B 3F9MA 4FWNA 4B1ZA 4F9OA 4EFHA 2W40A 5AR0A 3W0LA 3LM9A 4H0XB 3GG4A 2E1YA 3FZFA 4MO4A 4A62A 4BRFA 3HTVA 4BRCA 2E2OA 3LM2A 1G99A 4FWMA 5ELZA 3D2FA 4K25A 4J8FA 2GTDA 4EHTA 3ZX3A 4NO7A 1D4XA 3KZBA 2A5XA 4A2AA 3MN7A 4BC4A 3IDHA 1MA9B 4HTLA 1KAZA 4K43A 3WT0A 4BC5A 4H03B 3A5MC 5AQZA 3O4WA 5AQJA 3R6MA 3DJCA 3O8MA 5AQNA 4EAHD 4RWTA 3EN9A 2QXLA 2ZGZA 1NGBA 3O08A 4BRQA 4E1JA 3RSEB 1TYQB 2ITMA 1T44A 3FZMA 2E88A 3ZETB 5B8HA 1XQSC 4FWPA 3QB0A 1R59O 3ZETA 4H5VA 4BRDA 3QICA 4Y0WA 2HF3A 1HLUA 1DGKN 1TYQA 4FWOA 4YDUC 5BN8A 3BF1A 3CHWA 3S41A 4EIAA 3VGLA 1EQYA 2P9UA 1H1VA 3LDPA 2ASOA 3ATVA 4CI6A 2J4RA 3EL2A 3P4IA 2FSJA 4IJAA 3LDLA 3LL3A 3VGKA 5AQSA 3HSCA 5AQGA 3H45C 2CGLA 3A5NC 3CJ7A 3WEEA 5F1XA 2P9PA 3O5BA 4BR2A 2YCHA 1BUPA 3W3DA 3O1BA 3H3OB 3ENHA 1GLBG 2Q2RA 2BUPA 5AQWA 2QWOA 2D0OA 4FPAA 1C0FA 2E8AA 5AFUH 3MN6A 2I7NA 3WXKA 5I9EB 1T6CA 1NGAA 3QBXA 4FWRA 4H5TA 4PKIA 1WOQA 4CZGA 5F2RA 3VEWA 5AZJB 4BR9A 2QW9A 4H5RA 4CD1A 2ASPA 2P9UB 4QS9A 4DB3A 4WQ4A 5JICA 1X3MA 4ISGA 4CZIA 5KPZA 2QWRA 4GNIA 1ATNA 3EKUA 1NBWA 1V4TA 4BRPA 3O1WA 3LDOA 5EY4A 4Z94A 3VOVA 3FFKB 3H1QA 5ADXA 4PL7A 1E4GT 2A41A 1U2VB 3M6GA 4CD3A 4XH4A 2HMPA 3CJ1A 4BRGA 3CQXA 1ATRA 3M3ZA 2E2QA 3GE1A 3ZX0A 1HKBA 4CJ7A 2ZWHA 3VEZA 4HWIA 2P9NB 1IG8A 3RSEA 2H3GX 5EOYA 3MCPA 3A0IX 2NLXA 1HKCA 2VWBA 4FO0A 3VEYA 1DEJA 3VERA 4BVPA 4FWLA 1NGJA 2FXUA 3M1FA 4O8KA 1V4SA 3MMVA 3MN5A 5BRDA 1HJOA 2P9LB 4YDUA 5AQIA 2HOEA 4CBUA 4CZEA 3H6EA 4BRNA 3LDNA 1ZXOA 3WQTA 4B1WB 3FE1A 3L6QA 4KBOA 4B1YB 3C7NA 4FWKA 2GELA 3KVGA 3VEVA 3HZ6A 4O5FA 2A42A 3VF4A 3ZX2A 3U9DA 5F0XA 3ID8A 3CJ9A 4QS7A 3VGMA 4CZLA 1GLEG 1LCUA 3TPQA 4BR5A 2FF6A 1QQNA 3SK3A 3CJCA 2IIRA 4RTFD 4BRAA 3ULEB 4I6MA 4FPBA 3DXMA 2P9KA 1BWFO 4BG8A 3A5LC 3UKUA 3U9ZA 4B1UB 2Q36A 4PKHA 3H3NO 2CGKA 3CJBA 5BPLA 4L3QA 1BA0A 5TKYA 1YXQA 1HKGA 4B9QA 2F9WA 5JMVA 3IFRA 4M7XA 3HM8A 1LOTB 1BA1A 4JHDB 1BU6O 5AQTA 4JD2A 1GLDG 4BVOA 5E26A 1SZ2A 4H5NA 3QFPA 3SMPA 3UKRB 1BG3A 4H0TB 1BO5O 4K41A 3IUCA 1K8KA 2W41A 3TU5A 4FWSA 3O80A 3VETA 4AM7A 3FLCO 4M7YA 5KQDA 1ATSA 2D1KA 3MDQA 3AAPA 2Q0UA 3UKUB 2EWSA 1NGDA 4CZHA 5AZIA 3HBTA 4ISEA 2PBDA 3WXIA 1RDWX 5BRHA 1Z05A 3VEOA 4FSVA 2ZGYA 4ISFA 3FGUA 2YHWA 4PL8A 3WXLA 2VYPA 3DXKA 3O6WA 3ZEUA 4JD2B 5AQRA 1HUXA 5KPTA 3H46O 4BR0A 3CJAA 3SJHA 4BGBA 1SQKA 1KXPA 2AA4A 3AY9A 4IJNA 2HF4A 3GOIA 3U4LA 5LJVA 2D0PA 3AAQA 2P9IB 5EXWA 2KHOA 3WUHA 1Y64A 3QDKA 1MWKA 2WUSA 1XUPO 3QFUA 3A8YA 1QZ6A 2FLOA 4NB4A 5BPNA 1RGIA 3BEXA 5LY3A 2QWQA 4H0PA 4BRKA 2YI1A 2DPNA 1KAXA 3CETA 5AQMA 3SLCA 4H0VB 1NWKA 5AQYA 2YHYA 3J8AA 1JCFA 3CERA 3B8AX 5AQKA 2GWJA 3GDQA 4B1XB 5AQLA 4MLHA 3FZLA 1C0GA 4XH5A 3R9PA 4BRMA 4GY2B 4BR4A 4CBXA 3CIPA 3JS6A 1S3XA 1E4FT 2I7PA 4A2BA 1NM1A 3VF6A 5AQHA 5AQPA 3DXMB 4IZ9A 3ULEA 1ZBSA 2YJEA 4A61A 3UE5A 3D2EB 5FPDA 1YUWA 4EHUA 1ESVA 4BG9A 5JLHA 1HX1A 3BF3A 2E1ZA 1ZC6A 3DXKB 2YHXA 2YJFA 3GBTA 4MLEA 4IWVA 4BR7A 1J6ZA 5AQOA 3AARA 5EX5A 1NGHA 1QQOA 1U6ZA 2P9PB 1TUUA 3D2EA 3G25A 1X3NA 3VEXA 3WXJA 1P8ZA 2NRHA 5KQ8A 1S22A 2GEMA 2Q0RA 3DWLA 4CZMA 3I33A 3GL1A 4BC3A 1IJJA 3ENOA 1HPMA 3ZEUB 3A5OC 4H0OA 3ATUA 1DKGD 3CI5A 2E20A 1NMDA 2A3ZA 5BR9A 4BQLA 5CE3A 2A6AA 3C0BA 4RCHA 4M63C 3MN9A 1GLCG 1Q18A 3FR0A 4WQ5C 2IVOA 4H0YB 5AZIB 4BC2A 4BRHA 3EKSA 4H5WA 2F9TA 3C7NB 2QWMA 3EO3A 1SAZA 3IMXA 4BQZA 4FWQA 2P9IA 2FSNA 3L4IA 5AQVA 2GUPA 1BOTO 1K8KB 5E84A 4C23A 4DHYA 4CZJA 2D4WA 3CQYA 4FOEA 2QWLA 4JN4A 1GLJO 5AQFA 4MO5A 4B1VA 5LJWA 5AFUA 2P9KB 2BTFA 2V51B 4QS8A 4BREA 4BROA 1T6DA 1WUAA 1NGEA 4JHDA 1OKJA 5FPMA 5FPEA 4FL9A 1U2VA 3HI0A 5AQQA 2PAVA 1NGFA 2E2PA 4BRIA 5KPRA 5BPMA 2P9SA 3VENA 4JNEA 2GWKA 5BN9A 1GLFO 1TUYA 2ZF5O 1JCEA 3DAWA 1BDGA 1NGGA 2FSKA 3FZKA 4K42A 4WQ5A 2Q1NA 3R8EA 3I8BA 2P9LA 4JAXA 1YVNA 4I6MB 5AZJA 1QQMA 2V7YA 3VPZA 3D7EO 5AQXA 1GLLO 1X9JA 5FPNA 1QZ5A 1GLAG 1RFQA 4WQ4C 3SMSA 4FOIA 4BRLA 2ASMA 3VF2A 3UKRA 1NLVA 1YAGA 3VESA 2E2NA 4DCHA 3JXUA 4DQ8A 2CGJA 2VCPA 3QBWA 2P9NA 3FZHA 4WYBA 1XC3A 4CZKA 2NZTA 2CH6A 1QHAA 5BRFA 3WEEB 5ADXH 2CH5A 2QWPA 5JLFA 3OHRA 1MWMA 1KAYA 2UYTA 3LDQA 4AM6A 2A40A 3BP8A 4XEIA 2V52B 2V7ZA 4LC9B 4CBWA 3MK6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BREA 5FROA 4DTUA 2QWNA 2Q97A 4Z4CA 4ILJA 3CCRN 3DM2A 1NGCA 3KHYA 3ALYA 1JCGA 3ZSRA 1BI4A 3BUZB 1K6YA 1NGIA 4IXCA 1IO2A 3LP2A 4B9LA 3WNFA 2ZE2A 3F9MA 4B1ZA 2W40A 5AR0A 4Z0UA 3W0LA 1OH7A 4JKAA 3LM9A 3GG4A 3HTVA 3LAKA 4FWMA 4DTSA 3D2FA 4CCHA 4J8FA 2QI2A 5H1SQ 3NGIA 4GMJB 4EHTA 1EP4A 4MDAA 4E7LA 4E0DA 4NO7A 4H4OA 3KZBA 3SUQA 1KAZA 4K43A 3SAFA 2HHWA 1VQLN 4FJMA 1JXEA 1ZBLA 3K57A 4RG8A 5AQNA 4E3SA 1JL2A 2QXLA 3RSEB 1TYQB 2YKNA 1T44A 3CF5L 4CW7B 4JI1K 1RT6A 3QINA 3QB0A 3ZETA 1N34K 3P5JA 5C2FA 3QICA 4FZXC 1DGKN 3HOTA 4FM1A 4JKFA 5HRRA 4CGHA 4OPKA 4B3MK 1BCMA 1X9MA 3LDPA 3ATVA 3P4IA 2KFNA 1CXQA 4FZZA 1HQUA 4CECA 1SL0A 4FLUA 3A5NC 3O5BA 3HP9A 1ZBUA 3CMEN 1JLQA 1RDCA 1W0HA 4WFBL 4PUOA 1SKWA 1QSSA 1M1KO 4C8KA 3I8DA 5AFUH 2E8AA 3IKMA 1NK4A 1T6CA 1NGAA 4FWRA 2HBKA 4H5TA 4PKIA 4I2PA 5AZJB 1TK8A 1DTQA 3BDPA 4CD1A 4QS9A 4WQ4A 4NCBA 4NYFA 3L8BA 2WOMA 2OCEA 2GV9A 4GNIA 1V4TA 2ITGA 3LDOA 5EY4A 3HOSA 3VOVA 4CJ4A 4KH6A 1E4GT 3L2VA 1YJNN 4RW9A 1JLBA 5C2DA 3VMFB 1X9SA 2E2QA 3MEGA 2P9NB 3RSEA 1ZBIA 4FK2A 3Q7CA 1TVRA 3DOLA 2H3GX 1Q9XA 2RE2A 2A1RA 4M3UA 3MCPA 3KIOA 4U7BA 1LW2A 2NLXA 1N5YA 2ZJRL 3VERA 3AVJA 1FW6A 3M1FA 1XWLA 1V4SA 3MN5A 4OO1J 3NF8A 1UA0A 2P9LB 1S6PA 1ZXOA 3VQPA 4LF7K 3FE1A 3VTHA 3C7NA 3VQQA 4A57A 4CIGA 2FBVA 3KVGA 3HZ6A 4DUZK 2A42A 3KLHA 4CVNE 4FJ8A 1EX4A 3VGMA 4QS7A 1LCUA 1D8YA 3QO9A 4AHSA 5IWAK 4RTFD 4GV9A 3ULEB 3KLGA 4FPBA 4DS5A 3K59A 3VQEA 1BWFO 2HBMA 4HHTA 3UKUA 4FLYA 3U9ZA 4G9ZA 1Q9YA 1RT7A 3QEPA 3H3NO 2NRVA 2D0AA 5TKYA 1YI2N 5JMVA 4M7XA 5KGXA 4KHWA 4CERA 4JHDB 1BU6O 4DU1A 4JD2A 1GLDG 2JLEA 3P1GA 4BVOA 5CHIA 4DV4K 3IS9A 4JEPA 5JVGL 1HPZA 5KRSA 1GOAA 1WSGA 2RF2A 3CCUN 3PX6A 1DT9A 2VQEK 3IUCA 3M5RA 3OYAA 1KFSA 4DR5K 4WFAL 2E4LA 3ENBA 1ATSA 2D1KA 2X74A 3UKUB 1ASVA 4CJ5A 4DV2K 4FLWA 2EWSA 3WNHA 5AZIA 4IFYA 2OA8A 5FRNA 2PBDA 3WXIA 3THXB 4PA1A 4YOXA 4JI7K 1LWFA 2Z1HA 2HHIA 3QIPA 3CCLN 3M8QA 4G1QA 3WXLA 5HP1A 2VYPA 3O6WA 3THWA 5C42A 4O4GA 3CJAA 3VTIA 4GV6A 1KXPA 3AY9A 4DMNA 3GOIA 3OYJA 1VQPN 2F4VK 2D0PA 3CCEN 3VQBA 1KLNA 2FBYA 1XUPO 5HROA 3A8YA 3MWTA 3ZSOA 1ZYQA 1C6VA 5BPNA 2X6NA 5SWMA 4KH4A 1LAWA 3DLEA 1IKXA 2UUAK 3SYZA 4AHUA 4JYAK 4DTNA 3HK2A 4E1MA 5AQMA 1TKDA 4H0VB 1B9DA 3HSTB 5AQKA 2GWJA 5HRPA 5AQLA 2HHXA 1C0GA 1RTHA 4GY2B 2GBZA 4CIFA 4LH5A 3JS6A 2HVIA 4IG0A 2I7PA 1NM1A 1T8EA 2UXCK 2R7YA 3VQ9A 4IZ9A 3CG7A 1VRTA 4W5NA 4YOWA 3SUNA 4BE2A 2I5JA 1K9MO 4EHUA 4HUEA 1BGXT 3AVCA 4BG9A 5JLHA 1HX1A 3T7ZA 5J2QA 2OTLN 4HCCA 1RBSA 4JRQA 3CC7N 4BR7A 1J6ZA 5AQOA 1NGHA 1QQOA 1U6ZA 4O5BA 3D2EA 3VEXA 3WXJA 4OX9K 2G8IA 4CF0A 2HBJA 4CZMA 2VG5A 4KFBA 2VWJA 4NLCA 4B8CA 2JGUA 1VRUA 3ATUA 3OJUA 3N4PA 3U3GA 1NG9A 4IOCL 1YITN 4DF4A 5BR9A 1NJIO 4BQLA 1LAVA 3AVFA 2A6AA 5CE3A 3VQDA 4RCHA 1Q18A 2VG7A 5AZIB 1WBDA 3OTOK 3EKSA 4M41A 3V9ZA 3OBWA 3G4SN 4CIEA 5JS1A 3C7NB 3L2UA 2QWMA 3EO3A 3NHGA 3IMXA 3TANA 4FWQA 1JLGA 4PQUA 3L4IA 4J2BA 4IEIA 4CHZA 3CFRA 3OA9A 3OYEA 2P51A 2YNHA 3CQYA 1D9DA 4JN4A 1U4BA 3TTCA 4Z4EA 4OKKA 3AO2A 3K0SA 3PO4A 2P9KB 2BTFA 4QS8A 2Z1IA 2IDOA 4BROA 1VK0A 4JHDA 3HO1A 1YTUA 2PYLA 1N6QA 1OKJA 3AVGA 5FPMA 3V9UA 3HI0A 3OYNA 2Z1GA 3DMJA 2PAVA 3QNOA 4IBNA 4DTOA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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