2P9UB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
248
structure length
222
Chain Sequence
TEPPMIQAVLTLYQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 59
structure length 222
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uB02
4A62A 2E2QA 2IVPA 3O1BA 3VPZA 1NLVA 3LDLA 5AQVA 3UB5A 1DEJA 5EXWA 4JN4A 1NGJA 1NGHA 1TUUA 2I7NA 4H0XB 2FSJA 3EL2A 4FOIA 2P9SB 1GLJO 5FPNA 5LJWA 4FWKA 3OHRA 4CI6A 3B8AX 2V51B 1HUXA 1H1VA 1U2VB 1WOQA 4HWIA 2CGKA 4I6MB 3HI0A 3LL3A 4BRLA 1SAZA 4FO0A 3M6GA 3JXUA 2V52B 5EVZA 3WT0A 3R9PA 1BO5O 3IMXA 4NO7A 5BREA 1HX1A 1G99A 1V4TA 3QBXA 4CZEA 1BOTO 1NWKA 2GWJA 3QICA 4BRKA 5EY4A 1MWMA 3H6EA 3LDPA 1GLCG 2YCHA 1EQYA 1K8KA 4BR5A 1C0GA 3O4WA 4H0VB 4BRHA 2CGLA 3O5BA 3ZETB 2QW9A 5AQUA 2ZGYA 3CERA 1NMDA 1MWKA 3CJ7A 3KVGA 3RSEA 5KPZA 1SQKA 2A5XA 3IDHA 3QFPA 4B1YB 3C7NB 4BRCA 1HLUA 3GG4A 4YDUC 5AQHA 4WYBA 1KAZA 1BDGA 2P9KB 1Z6RA 1ATNA 2FLOA 2A41A 3VENA 3D2FB 3H3OB 3A5OC 4MO5A 3EN9A 5EOYA 5AQPA 4BC4A 2NZTA 2E8AA 1CZAN 4AM6A 3AAQA 2YJEA 1NM1A 2ZGZA 2D0PA 4PL8A 3CI5A 4FWRA 4FWSA 4B1XB 4BC2A 1Q18A 1YAGA 4BVPA 4PL7A 3QDKA 3VF2A 5BPMA 4C23A 4B9QA 3BF1A 2P9NA 4GNIA 5F1XA 1BWFO 3ENHA 4WQ5A 3VETA 4QS9A 3H1VX 5CE3A 2W40A 4H5NA 3QMLA 4A2BA 2E1ZA 1BA0A 3BP8A 4XH4A 3FR0A 4CZMA 3DAWA 3VGKA 4GY2B 2QM1A 3HSCA 4Y0WA 4H5VA 3ATUA 3MN9A 3D7EO 4J8FA 3EKUA 1MA9B 1S22A 4FWQA 3MCPA 3H3NO 3I33A 1IG8A 4FWMA 3SMSA 3SJHA 4B1WB 2NRHA 4BRQA 4BVOA 4IXCA 1HKBA 4ISFA 3VEXA 2YI1A 4H5WA 2P9IA 1T6CA 2P9PA 4A61A 5AR0A 3L4IA 3O80A 5TKYA 3AY9A 4JD2A 3M1FA 5FPMA 2EWSA 3R6MA 4YDUA 2HMPA 4BRPA 4FWPA 3EO3A 3FZHA 1XUPO 2YJFA 4O8KA 2F9WA 3FLCO 2Q1NA 3DXKA 4CBUA 3L0QA 3UKRB 4K25A 2IIRA 1YVNA 1KAXA 2ASMA 4B1UB 1ATRA 4A2AA 1D4XA 4BRFA 2VYPA 4MLEA 2ZF5O 1SZ2A 1NGDA 4M7YA 4FOEA 2P9UB 1DKGD 4PKHA 4BROA 2AP1A 3WUHA 1HKCA 1QQMA 1U2VA 2Q2RA 5B8HA 1TYQA 4I6MA 2BTFA 2E20A 4BR0A 4CBXA 4FWNA 3SK3A 3EZWA 1OKJA 2CH6A 5E26A 1J6ZA 3IUCA 3I8BA 2E88A 4Z94A 5BN8A 2FSNA 3A5NC 1Z05A 3VOVA 3EKSA 4BC5A 3M3ZA 1XQSC 2D0OA 2FF3B 3O8MA 1X3NA 4WQ5C 4H0TB 4JNEA 3VF6A 4HTLA 3VGLA 1E4FT 4KBOA 5FPEA 3ZETA 3VEOA 2PAVA 4BR2A 4BGAA 4CZKA 3S41A 4EHUA 5AQOA 2UYTA 2HOEA 1NBWA 1QZ6A 3C7NA 3CIPA 1KXPA 4BGBA 2BUPA 3R8EA 3GDQA 3H1QA 4ISGA 3VEWA 2E2NA 2P9KA 2V7ZA 3ID8A 4JHDA 4MO4A 2D1KA 2QWOA 4PKIA 3U8XA 3D2FA 5BN9A 5AQRA 4XH5A 3JS6A 4IO8A 1BG3A 5BR9A 5AQJA 4DHYA 4BG9A 2Q0UA 3CQYA 4H5RA 5AFUH 5AQXA 5BRHA 1WUAA 3A0IX 1P8ZA 5AZJB 4FL9A 3WQUA 1QZ5A 3CETA 3MN5A 1DGKN 3GBTA 1KAYA 4FPAA 3O08A 3LM2A 3MDQA 3G25A 1K8KB 5AQKA 2FF6A 2WUSA 5KPTA 3WEEB 3MMVA 2F9TA 4EIAA 1E4GT 1NGAA 2YHWA 2P9LB 4H03B 1Y64A 5ELZA 4M63C 1C0FA 2A40A 4BR4A 3RSEB 3TU5A 3AAPA 3J8AA 3VGMA 4WQ4A 4IJNA 5EX5A 1YXQA 1JCGA 4F9OA 3AARA 4EFHA 4FWLA 2ITMA 1ATSA 2YHYA 3DXMB 4CZGA 3FZMA 3O6WA 5BRDA 4JAXA 3LDQA 3TPQA 5ADXH 1GLEG 3BEXA 3CJBA 1GLBG 1T6DA 5AZIA 1NGIA 4EHTA 4PKGA 3CJ1A 2H3GX 3UKRA 4XEIA 3MK6A 3VEVA 4BC3A 1JCFA 1QQOA 3ZEUB 4BRGA 2ZWHA 3A5LC 4CBWA 2FSKA 3ENOA 3LDOA 2A42A 3U9ZA 1XC3A 4BRDA 3WQTA 2P9UA 1TUYA 5I9EB 2QWRA 3ATVA 4RWTA 2D4WA 2CH5A 3D2EB 2AA4A 2QWQA 5AQFA 5KQDA 4BRMA 2ASOA 3ZX3A 2P9SA 2P9IB 3VEZA 3FZLA 5KPRA 3O1WA 4CJ7A 4BR9A 4QS8A 2KHOA 2VWBA 3ZX0A 3UKUB 4B1VA 4FWOA 2A3ZA 5AQYA 3FGUA 5AQGA 3ULEB 4XH1A 4MLHA 1ZBSA 4H5TA 4IZ9A 3A8YA 1ESVA 4ISEA 1NGEA 4CD3A 4BQZA 4M7XA 5LY3A 4IWVA 2PBDA 2ASPA 3F9MA 2NLXA 5JICA 5AQZA 1LCUA 3MN7A 3QFUA 2J4RA 4FSVA 3QB0A 1JCEA 3H45C 5BRFA 5JMVA 5BPLA 1LOTB 3FFKB 4H0OA 2E2OA 3DJCA 4BG8A 3BF3A 1HPMA 4BQLA 1TYQB 4BR7A 2OANA 4WQ4C 3FZFA 1HJOA 3LDNA 3CHWA 2IVNA 3MN6A 4B1ZA 2Q31A 5AQQA 1RGIA 1IJJA 5AZJA 3GE1A 4BRIA 4K43A 2CGJA 3QBWA 5AQWA 5AQSA 3UE5A 2YHXA 4RCHA 4O5FA 2E1YA 1S3XA 4L3QA 1NGFA 5F0XA 5E84A 5JLFA 3WEEA 4CZHA 5AFUA 3FE1A 4NB4A 2P9LA 4H0PA 1BA1A 3VESA 2QXLA 3CJ9A 3WXJA 3WXKA 2QWLA 3W0LA 3HM8A 1RDWX 1BUPA 3CJCA 4JHDB 3HZ6A 3GOIA 3ZX2A 3BUZB 3DXMA 1GLDG 2HF3A 3HBTA 4BRNA 2GWKA 2IVOA 4LC9B 3VF4A 3DWLA 2DPNA 2VCPA 2GEMA 4H0YB 4DCHA 5KQ8A 2Q36A 3WXLA 4AM7A 1X9JA 4K41A 3LM9A 3HTVA 1V4SA 3ZEUA 3KZBA 2FXUA 4K42A 5F2RA 4BRAA 3VERA 2HF4A 4DB3A 1T44A 2Q97A 5FPDA 3FZKA 3U9DA 1QHAA 1U6ZA 1BU6O 2P9NB 2QWPA 5AQTA 4CZJA 5AQLA 2A6AA 5ADXA 1NGBA 3C0BA 1GLAG 1NGGA 1HKGA 4IJAA 1ZC6A 2V7YA 3D2EA 3VEYA 3H46O 4BREA 1NGCA 4RTFD 1RFQA 1QQNA 1ZXOA 3P4IA 4DQ8A 1GLFO 4CZLA 4EAHD 3UKUA 3GL1A 4CZIA 1MDUB 1YUWA 3ULEA 5BPNA 2GTDA 2GELA 2P9PB 1R59O 3IFRA 3CJAA 4JD2B 2W41A 3SLCA 4CD1A 3A5MC 3CQXA 5AZIB 2QWMA 2E2PA 2QWNA 3L6QA 3WXIA 3U4LA 5JLHA 5AQMA 1X3MA 5AQNA 3W3DA 1GLLO 5AQIA 4CZFA 3DXKB 4QS7A 5LJVA 3KHYA 4E1JA 2I7PA 2GUPA 3SMPA 4FPBA 2Q0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LSNA 2KFNA 3VPZA 5KRTA 1S72N 1NLVA 3UB5A 3V9WA 1T3VA 3P39A 4RW7A 4AQYK 1QSLA 2E5LK 4M3XA 4FJGA 4BE2A 1REVA 4I2QA 4H0XB 3EL2A 4FOIA 1RT4A 4CI6A 3B8AX 1WOQA 3HO1A 2O8EA 2CGKA 2ATQA 1YTUA 4FO0A 3C95A 5HBMA 2V52B 3WT0A 3R9PA 1FKPA 4KHWA 1VSJA 3OY9A 3FFIA 1M1KO 1SS6A 3QBXA 4CZEA 1V4TA 1BOTO 3HXMA 2G8VA 2PY5A 4CJ3A 1RDAA 3TTFA 4LF6K 2HHQA 1YHQN 2BGGA 4BR5A 3TAMA 2FBTA 1B9FA 2HHWA 4X66K 3O4WA 3V1OA 3V9ZA 1KTQA 3ZETB 4FJMA 4C8OA 4EP5A 3HJFA 5AQUA 2ZGYA 3OS2A 3J7AP 1MWKA 4K8XA 1C1CA 3KLEA 3CJ7A 3NGIA 3VQCA 5KPZA 3SUNA 3CCEN 2A5XA 3IDHA 1SV5A 2ZQBA 5HRRA 3VQ5A 3GG4A 4YDUC 5AQHA 2HHHK 1S1VA 1KAZA 1BDGA 2P9KB 2FLOA 3O9QA 4DV5K 3H3OB 1BCOA 5EOYA 4M3YA 4TSXA 4E0DA 4PL8A 1IG9A 4FWRA 4BC2A 4BVPA 4FZZA 3QDKA 3MWPA 2P9NA 4GNIA 5F1XA 1BWFO 3ENHA 4AH9A 4CIGA 5CE3A 3OBYA 4E7KA 4KTZA 1E3MA 4XH4A 1S6PA 5H1SQ 4C8MA 4GY2B 4Y0WA 3ZSZA 3F5TA 5J2NA 2XY5A 1ZBIA 2JGUA 4JI3K 2RKIA 3AVGA 4FWMA 2DFFA 4B1WB 4O8UA 1K9MO 4BVOA 1HKBA 1JLGA 4CFBA 5C25A 4H5WA 2P9IA 3V1RA 3L4IA 4H8KA 4HUEA 1KD1O 3VQEA 3ASMA 1OH8A 4BRPA 4FWPA 4CVNE 3CPEA 2YNFA 1YI2N 3SCXA 4O8KA 3FLCO 3DXKA 3SV3A 4JK7A 1XC9A 3KJVA 3M8SA 1ATRA 1OVYA 4JEPA 3KIOA 4JI4K 2W6LA 1NGDA 4JV5K 1C0TA 3WXMB 4IDHA 1J5OA 4FOEA 2QKKA 3V9XA 4PKHA 1BQMA 2XY8A 2Q2RA 4HCBA 3SQ1A 4JKEA 4KHNA 2BTFA 4JK9A 4FCYA 1SKSA 4CEEA 4KH5A 2BH1A 3SK3A 3EZWA 2UUBK 3RWUA 4KHPK 5BR8K 3J80O 3RMBA 2FSNA 3A5NC 1O1WA 3V81A 4IO9L 2O8FA 4FJXA 4K0KK 4FW2A 4IFEA 4ZTFA 2FF3B 4KI4A 2UXCK 4H0TB 3I0SA 2XY6A 2OPPA 4FLVA 2B6AA 5FPEA 4FJNA 1EKEA 2PAVA 3S41A 4NYFA 1N8RO 5JVGL 1KXPA 4BGBA 4BDYA 2OA8A 1U48A 3MECA 4CHPA 2V7ZA 4DR4K 2HNYA 4PKIA 4G9ZA 3D2FA 4B9TA 4XH5A 4DV7K 1BG3A 1YVUA 4OVLA 5SZTA 5AQJA 4FM0A 2Q0UA 3NF8A 2ZD1A 3KWGA 3K58A 5AFUH 4GKJK 3A0IX 5CR4A 1QZ5A 3P1GA 3MN5A 3MXIA 3E9OA 4FPAA 4OJRA 3OYEA 3G25A 4KH6A 3AVKA 1L5UA 3L2UA 5M1FA 1S1UA 3DLBA 3MMVA 4F4KA 1DTTA 3DRPA 1I94K 3T3FA 2D5RA 2RHKA 4JKGB 3RSEB 1N5YA 3SPYA 1BGXT 1S5JA 3AA3A 3VGMA 1XHXA 4JKFA 4CIFA 1RDCA 3THXA 1VHXA 5C12A 3RMDA 4KB1A 2NRXA 4DSFA 2ITMA 1HNZK 3FZMA 3OYJA 4JAXA 3LDQA 5IWAK 5GIPA 4XJXA 3ZSRA 3CJBA 3S9HA 4A5BA 4XEIA 2NRVA 3MK6A 3QETA 4YHHK 4DTNA 1KVCA 3LZIA 4BRGA 4CJSA 3VN5A 4YOXA 2D0AA 3CCQN 4DTMA 3A5LC 1IBLK 4CGFA 3CCVN 3R1XA 3B6OA 4WCEL 2R7YA 5C2DA 3U9ZA 3KK3A 2HBLA 4RWTA 1YIJN 3NH1A 1L3TA 1NKBA 4O0IA 2CH5A 3DRRA 2HB5A 2QWQA 3TSQA 4IEIA 4CHQA 4O55A 4J2AA 2VWJA 3ZSOA 1T05A 2GV9A 4CJ7A 1RDUA 1QQCA 2OZSA 1ASVA 1YJWN 3L4QA 2QTDA 1B92A 2P1JA 3CMEN 1ZBSA 1JKHA 3G10A 3D45A 3M8PA 4HTUA 1Y97A 4JI5K 4IKFA 2XHBA 2PBDA 2ASPA 2JLEA 4DV1K 5A2QO 3QB0A 3H45C 5JMVA 1OH7A 1EX4A 4H0OA 4CEZA 5D3GA 4BG8A 1HPMA 1I39A 3VTIA 1Q9XA 3AVBA 3CD6N 4BR7A 4WQ4C 1HJOA 4FJJA 4DSEA 1M90O 1ILYA 1YF5L 2IVNA 4E72A 2Q31A 1IJJA 5J2PA 2O8EB 1NOYA 3QBWA 1RT6A 3RRHA 2YHXA 1ITGA 4UY8O 2E1YA 2X78A 2VWKA 4CHYA 3SAGA 3SBTA 3NHGA 1XMOK 5M1KA 3AVAA 2P9LA 1BA1A 2G8FA 2G8HA 3QERA 3T7ZA 3SNNA 3W0LA 1RDWX 2RPIA 4U67L 3AVHA 4UQGA 3HZ6A 3ZX2A 2W6KA 3BUZB 1LV5A 3AO1A 4CFAA 3AVFA 4CFDA 4M3TA 2HF3A 3LWMA 3HBTA 4HVJA 5JENA 2GWKA 3SAHA 3L8BA 4DTPA 3VF4A 2YV0X 2VCPA 1JXBA 4CEBA 4N41A 4K41A 2LSNA 1UAXA 2IC3A 3LM9A 3NMUA 2Z1GA 4Z4CA 2FXUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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