2P9UB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
248
structure length
222
Chain Sequence
TEPPMIQAVLTLYQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 59
structure length 222
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uB02
4JD2B 1NGEA 4JHDB 4FWLA 4PKHA 1U6ZA 5EVZA 5JMVA 1LOTB 2W40A 3GL1A 3IUCA 4DQ8A 4I6MA 3SK3A 5AZIA 3U4LA 3A5MC 3CERA 3DXMA 1X3NA 1HJOA 3GBTA 2Q1NA 4H0OA 3WEEA 4BC2A 1WOQA 4RWTA 1RDWX 3VF4A 2I7PA 3BUZB 2VYPA 4KBOA 1ZBSA 1V4SA 2Q36A 2IIRA 2QW9A 5EX5A 4IWVA 2A40A 4JN4A 4M7XA 1GLEG 2UYTA 2FSNA 2Q97A 1NGJA 2P9UB 4CBWA 5BPNA 3ATUA 4HTLA 3W3DA 4MO5A 4BR2A 1RFQA 4O5FA 4B1UB 1HKCA 1YXQA 2FSJA 4BR5A 5I9EB 2ZGYA 3ULEB 3D2EB 3EZWA 2GUPA 1JCEA 1SQKA 5JICA 3QICA 2IVPA 4MLEA 5F0XA 2E88A 3VGKA 4H0PA 3F9MA 3R9PA 3EKSA 1J6ZA 3UKUB 3LM2A 5AQRA 4A62A 3ZEUB 2V7ZA 4EAHD 3IDHA 5AQFA 1BUPA 2F9WA 2QXLA 3EN9A 2J4RA 1Z05A 1NLVA 3ZETB 1BG3A 4FOIA 5AQIA 5F2RA 4NO7A 4EHTA 5AQQA 3KVGA 4BROA 2YHXA 5EY4A 3MK6A 3CJ7A 1NGFA 5AQHA 1HKBA 4M7YA 4FO0A 5AFUA 5AQKA 5AR0A 4CZEA 2FF6A 2P9SB 4BC5A 5LJWA 1D4XA 2PAVA 4FL9A 5B8HA 1C0GA 3VEXA 1QQOA 4JNEA 4EFHA 1QZ6A 2CH6A 2A6AA 4WQ5C 4DB3A 3R6MA 2NLXA 4I6MB 4F9OA 5ELZA 4BGAA 1NGHA 5KQDA 1ATNA 3KHYA 1OKJA 3QFPA 3MN7A 3H1QA 1KAZA 2HF4A 3VEWA 1C0FA 4HWIA 3DAWA 3CIPA 3VOVA 1X9JA 5AQGA 4H5TA 4IXCA 3O5BA 2GEMA 3ID8A 4H0VB 1YVNA 2P9KB 1XUPO 1E4GT 1IJJA 1GLJO 3WUHA 1MA9B 4RCHA 3QBXA 5AQTA 5JLFA 2Q2RA 2D0PA 4WQ4C 2P9NA 4QS9A 4CI6A 4BR7A 3CQYA 2FSKA 3BP8A 1NGAA 5LJVA 2DPNA 3CETA 1U2VA 1LCUA 1HPMA 5AQSA 1EQYA 3H1VX 2P9PA 4DCHA 1QZ5A 2ASPA 2GTDA 4MLHA 5BR9A 3H3NO 1DEJA 3CHWA 3BF1A 4E1JA 3FGUA 1QQNA 3BF3A 3FZKA 2AA4A 5AFUH 3VEVA 2CGJA 2QWMA 4IJNA 3W0LA 3VF2A 1BA0A 2D1KA 4B1XB 4MO4A 4BRMA 2VCPA 5KPRA 3S41A 4NB4A 3UE5A 4B1WB 3UKRA 1GLDG 3SJHA 3DXKB 4EHUA 2D0OA 1GLFO 3O08A 5AQYA 4B1ZA 4FWOA 5LY3A 4FWQA 3O4WA 3H45C 1GLAG 3CJ1A 1HKGA 1DGKN 3LDLA 4BRKA 2BUPA 2E2OA 3VESA 5KPZA 3H46O 3M1FA 1ATSA 4FPAA 1NGIA 3TPQA 3QDKA 5AQVA 2IVNA 2YCHA 2E1ZA 2E2NA 5E26A 4BVPA 2P9IA 1T6DA 1ESVA 3LDNA 3MDQA 5AQPA 5AQWA 4BRCA 3WQUA 4PKIA 4QS7A 3RSEA 4H0TB 5BPLA 2P9LA 3I33A 5CE3A 4BR9A 4CZGA 3AAQA 4PL8A 2QWLA 4PKGA 2E2PA 2QWOA 3CJAA 3P4IA 1BU6O 1BO5O 1TYQA 4BRLA 2YI1A 1XC3A 4CZIA 1X3MA 2CGKA 1YUWA 5AQLA 4BRNA 4CZJA 4BRAA 1IG8A 2QWPA 4K25A 1JCFA 1GLBG 1WUAA 3CJBA 3QFUA 4FOEA 4ISFA 3WQTA 3UB5A 1T6CA 3FE1A 4AM7A 4JHDA 4BRIA 1BDGA 4YDUA 2E8AA 3C7NA 2PBDA 1U2VB 3GE1A 3QMLA 2HMPA 1NGCA 2P9PB 5KPTA 3O1BA 1BA1A 4CZKA 1YAGA 4BR4A 1Q18A 1DKGD 1S22A 3AARA 4BQZA 4IO8A 3FR0A 5F1XA 3WXKA 3ATVA 3FZHA 3O80A 5AZIB 3OHRA 2YJEA 2QWRA 3U9ZA 2GELA 3CQXA 3DXMB 4L3QA 3WEEB 2EWSA 2QWNA 3FLCO 1NBWA 3FZFA 4EIAA 3WXLA 3FZMA 4Z94A 3VEZA 5EOYA 3ULEA 2Q31A 3JS6A 3D2EA 1Y64A 2V51B 3VERA 4BR0A 1KAXA 4O8KA 1CZAN 3IFRA 3A5NC 3HM8A 2H3GX 2Q0RA 3MN9A 4K41A 5BRFA 1HLUA 3EKUA 4FWMA 3A8YA 4FSVA 3U9DA 2ZF5O 2A5XA 2F9TA 2NRHA 3IMXA 2A42A 1K8KA 3M3ZA 3B8AX 3RSEB 2P9LB 4A2AA 1P8ZA 3O1WA 1NWKA 4BREA 3ZETA 5AQXA 3SMSA 3WXJA 2YHYA 2ZGZA 1T44A 2E2QA 2E20A 4CBUA 1MWMA 5AQMA 3ENOA 3G25A 4QS8A 3VGLA 4BGBA 3D2FA 1E4FT 5FPDA 2P9SA 1QHAA 4CD1A 5ADXA 4WQ5A 3FFKB 4BC4A 3ZX0A 3HZ6A 4BQLA 4BRDA 3GOIA 3BEXA 3HSCA 3HTVA 5EXWA 4B1VA 4M63C 3ZX2A 4CZFA 3C7NB 3M6GA 3I8BA 4B9QA 4H5WA 1SZ2A 5BN8A 1NGGA 3AAPA 4YDUC 3GDQA 1MWKA 3CI5A 3VEYA 1NM1A 2A41A 4LC9B 4C23A 3A5OC 1S3XA 2OANA 2WUSA 4BRPA 4BC3A 2HOEA 4GY2B 1GLLO 4FWRA 4H0YB 1NMDA 3D7EO 1QQMA 3ENHA 4WYBA 1NGBA 4WQ4A 2P9KA 3VENA 3FZLA 4J8FA 5JLHA 2BTFA 5AZJA 1MDUB 1RGIA 4A2BA 5AQJA 3CJ9A 3DWLA 3MCPA 2YHWA 3ZX3A 3TU5A 5BRHA 2CH5A 2Q0UA 4IZ9A 1Z6RA 2QM1A 4BRHA 4CZLA 4BRGA 1V4TA 2IVOA 3A0IX 3O8MA 3LDQA 4DHYA 3GG4A 2QWQA 4CD3A 5BPMA 3WXIA 2P9NB 4RTFD 5E84A 5BREA 2FF3B 4JD2A 2HF3A 4K43A 5AQUA 4B1YB 4ISGA 1K8KB 5FPMA 3L0QA 2VWBA 1KXPA 3VGMA 3H3OB 3LDOA 2ZWHA 5ADXH 1XQSC 5BRDA 3A5LC 3HI0A 1G99A 3QBWA 3DXKA 4GNIA 3CJCA 3LL3A 3MN6A 5AQOA 4IJAA 2ITMA 1SAZA 2ASOA 3D2FB 4Y0WA 3HBTA 4FWKA 2AP1A 1ATRA 2CGLA 3O6WA 1H1VA 3J8AA 1ZXOA 3SLCA 2A3ZA 2YJFA 3UKRB 1JCGA 4H03B 4CZMA 2P9UA 3R8EA 3WT0A 4BG9A 4K42A 3KZBA 2V7YA 4XEIA 1NGDA 5BN9A 1KAYA 3AY9A 3SMPA 4XH1A 4CZHA 4XH5A 2FLOA 4FWPA 4BG8A 3VETA 4A61A 2NZTA 3L4IA 2I7NA 4PL7A 3JXUA 2D4WA 3MMVA 4BRQA 4FPBA 4FWNA 3VEOA 1BWFO 3C0BA 2P9IB 1R59O 3UKUA 4H5VA 4CBXA 4JAXA 5AQZA 4BVOA 1TUUA 3ZEUA 4FWSA 5TKYA 3LDPA 2KHOA 1TUYA 3VF6A 3MN5A 2E1YA 4H5NA 4H0XB 4XH4A 2FXUA 1HUXA 3QB0A 1BOTO 2GWKA 5AZJB 3U8XA 1ZC6A 1GLCG 5KQ8A 3EO3A 2V52B 1TYQB 5FPEA 2GWJA 2ASMA 1HX1A 3H6EA 5FPNA 4ISEA 2W41A 3VPZA 3EL2A 3L6QA 3DJCA 5AQNA 4AM6A 4H5RA 4BRFA 3LM9A 4CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O8UA 1NGEA 1KVAA 1U6ZA 5EVZA 3GL1A 4YHHK 2E4LA 4I6MA 4DR1K 3NVMA 4J2AA 5LL6Z 4CEDA 3A5MC 4FJ5A 2IDOA 4E89A 4DSLA 1WOQA 4A57A 3VF4A 3BUZB 2Q36A 4BDPA 2QKKA 5EX5A 1NK0A 4JN4A 4M3XA 1OVYA 4M7XA 2IGIA 3NDKA 3DLLL 5BPNA 2HHSA 4B3MK 1YXQA 4BR5A 1HJRA 4CESA 1KFSA 4CE9A 3EZWA 3CFPA 3PO5A 1VRUA 5F0XA 1X9WA 3L2RA 4JI5K 2E88A 3N4PA 3VGKA 4H0PA 4E1NA 2Q3SA 3R9PA 3HPOA 1J6ZA 1L3SA 4KB0A 2V7ZA 3DYAA 2F9WA 1Z05A 1BG3A 5AQIA 1XMQK 1D5AA 4FLUA 4OPKA 3SYZA 3KVGA 1CZBA 4BROA 2QTDA 4FZXC 2QI2A 5EY4A 4F8RA 4E3SA 4M7YA 3KWIA 3EE8A 3TTFA 4CZEA 3OYGA 3VQ7A 4E7HA 2B6AA 1ASVA 5B8HA 3OYIA 3MWTA 3SJJA 4HUGA 1WBDA 5C2FA 4OPAA 4DB3A 4EZ9A 3E9OA 2NLXA 4I6MB 3OYCA 1W9HA 4CCHA 4LF4K 1XNQK 2HHQA 1E3MA 3H1QA 2HF4A 3PV8A 3DRPA 3VEWA 3HPGA 4CHPA 1YTAA 5CYMA 4CGIA 4IXCA 2GEMA 3ID8A 3O9RA 4CJ4A 4ELVA 4H0VB 1YVNA 2ATQA 4CFBA 4DWIA 3V6DA 4GV6A 1Z25A 5J2QA 4OKKA 2D0PA 1K73O 4FJ9A 4NYNA 3QNNA 5H1SQ 1XHZA 1P90A 3BP8A 5LJVA 2W00A 1JLEA 1G15A 1EQYA 2P9PA 4YOUA 1S6QA 4JI3K 4MLHA 3H3NO 3HYFA 4Z0UA 3OYNA 3BF1A 4E1JA 3FGUA 3FZKA 4DFJA 4ZTJA 1JLAA 4LD0A 2E5LK 4CEZA 4MO4A 3AVFA 4BRMA 3ZYYX 1EWQA 4NB4A 5EU7A 1IKWA 2PYLA 5GAGP 1N34K 2HNYA 4H8KA 1KQSM 1GLDG 1VHXA 3LWMA 4NYFA 3ID6A 1VSMA 4FWOA 4DTNA 3O4WA 4CHOA 4KH5A 3LDLA 4LFCK 1TK5A 2W6KA 3H46O 2JWKA 2WC9A 5C15A 3QDKA 1C0UA 5E26A 4BVPA 4E1MA 4CGGA 1ESVA 3ZT2A 2DFFA 4IBNA 4CJFA 1FKOA 4CGDA 5JVHL 1S1TA 2Z1HA 4OX9K 5E41A 4CJPA 3RSEA 3WNEA 1UWBA 3NE6A 3CCVN 3VQ9A 3CJAA 3N4QA 4JKCA 3VQPA 4U7BA 4KO0A 1VQ5N 3HOSA 2YI1A 1D9FA 1X3MA 4B3OA 4CEOA 3RVCA 3TAQA 1GOAA 1VQLN 3LZIA 4YOTA 1ILYA 1VQON 2BGGA 2IOCA 3ZSYA 1JCFA 2XO7A 4KFBA 1WUAA 3TR8A 3UB5A 1SL1A 5HRRA 4J2BA 1EX4A 3FE1A 4AM7A 4JHDA 1MU2A 1VQ6N 4JI4K 2HMPA 5T7BA 2P9PB 3O9SA 1VK0A 4FW2A 4A59A 3TARA 3O1BA 4JS4A 1S22A 3T19A 1RDAA 1BIUA 4JK9A 3HM9A 4BQZA 3DLRA 1HNVA 4CK1A 3MXIA 4TSXA 2OPQA 2KFZA 3WXKA 2G8UA 3TTDA 3SAHA 1NJZA 2YJEA 2QWRA 2EWSA 3NH0A 4FLTA 4JYAK 5C0YA 2WONA 1NBWA 3FZFA 4QAGA 3OYDA 3L2QA 3CFRA 4X62K 4JEPA 5EOYA 3DI6A 3ULEA 4DTXA 3SAGA 3R1XA 3CFOA 3EEQA 4O8KA 1CZAN 3KJVA 1VQ8N 4B9LA 3A5NC 3BY5A 3SAFA 4CFDA 5J2NA 2Q0RA 2G8VA 3AVGA 1VSKA 1JKHA 4CIEA 1ZBIA 3IMXA 2F9TA 2NRHA 2A42A 1K8KA 4NXNK 5CHIA 4ELUA 3O9UA 1B9DA 3B8AX 3RSEB 3AVIA 5AJ3K 3O1WA 4BREA 4AHSA 5M1FA 2D0CA 3WXJA 3OY9A 3ZSXA 2ZGZA 1T44A 4DSEA 3NAEA 4YORA 3WNHA 3ZSOA 4DU1A 3THYA 1MWMA 4QS8A 2KZMA 4LH4A 3VGLA 3D2FA 2YNGA 3ZLJA 4LF8K 3K9KA 1SV5A 4Y1CA 3CF5L 2OPSA 3HZ6A 3VQ8A 4BQLA 3O3FA 1J9AA 4BRDA 3HSCA 3HTVA 2D0AA 5C42A 5BR8K 3K59A 3F9KA 1IBMK 1RDCA 4CF8A 4B9QA 2QK9A 3V1QA 3T1HK 2O8FA 1C1CA 4LY7A 5J2MA 1GOBA 5BN8A 4PA1A 3AAPA 3DMJA 3GDQA 1MWKA 5JS2A 3CI5A 1TKDA 3A5OC 2WUSA 4BRPA 5GAHP 2HOEA 1VQ7N 4FK0A 4ID1A 1RT7A 3D7EO 4W5NA 4X64K 4JI0K 2HNDA 1YJNN 2YNIA 4KHNA 1VQ9N 1W97L 4A2BA 4W5OA 3K5LA 4CHYA 3TABA 3PX0A 2CH5A 2A1RA 3HJFA 4W5TA 3LDQA 2HBMA 2QWQA 2HHXA 3WXIA 3RMAA 4CK3A 2OCEA 3C65A 2FBYA 1JLBA 3LP3A 4JD2A 2BANA 3KLEA 4O0JA 4ISGA 3SBGA 1K8KB 5FPMA 1VAZA 3EYZA 1S1VA 1RT6A 4U67L 4CHZA 1KXPA 4M3RA 3VGMA 2NRWA 2ZWHA 1YIJN 3G0ZA 3AVJA 3L3UA 3IKMA 5HL7L 3DXKA 4GNIA 1SAZA 2Z1JA 3D2FB 3HBTA 4FWKA 1ATRA 3MEGA 1R0AA 3BZCA 3RRHA 1JJ2M 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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