1RBVA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADAKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 52
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbvA00
5KRSA 2JLEA 4RW6A 4OLBA 5DMRA 1S9EA 3ZT1A 5HRPA 3K5LA 3NGIA 1HNVA 5FRNA 2G8IA 4I7FA 3QNNA 1T05A 2VG5A 2A1RA 1WSHA 1F21A 2Z1IA 2VWKA 3KJVA 3HP6A 4CJEA 4IDKA 4AILC 4FJLA 2HNZA 1X1PA 2JGUA 3TAQA 1CLQA 3CQ8A 2HNYA 2X74A 3LPUA 3U6FA 4C8LA 1VSIA 4GMJB 4B9NA 3LP0A 4FVMA 2XY7A 3SUPA 1NJXA 1TVRA 1NK8A 1NOZA 4CGHA 3SI6A 3PY8A 4FJ8A 1IKVA 3PV8A 1JXBA 1L3TA 1W0HA 1UWBA 3LP2A 3BGRA 4RW7A 1IKYA 3MEGA 3LAKA 1ITGA 2OZSA 2HW3A 3CFOA 3HJFA 1WAJA 3TABA 4KV8A 4LY7A 4KHQA 2HHVA 1DTQA 2A1SA 4OKJA 4C8KA 1BI4A 2YKMA 1RTJA 3ISNC 1U04A 1NK7A 1T8EA 1RTDA 1FKOA 3LDSA 1JLFA 3NF6A 5J2QA 1D9DA 3AA3A 3F73A 3KLGA 2HHTA 3WNFA 1HRHA 1QQCA 1LV5A 1S1TA 2FBYA 3V9WA 3KLIA 3MEDA 4CJRA 4ICLA 3OS0A 4OVLA 3WNEA 1TKDA 1TKZA 4NYFA 5K14A 2PY5A 1BQMA 4E7JA 4M3UA 2PYJA 3ZT4A 1QTMA 4Z4HA 3VQDA 4DQQA 4FJHA 2KZZA 3IS9A 2XO7A 2ZE2A 3ZSVA 4B9SA 4C8NA 4DMNA 4CEZA 4KI6A 3V9UA 3HK2A 3B6OA 4O0JA 1B9FA 1VSDA 2XY6A 4E7HA 5CYQA 3SUQA 1L3UA 4LD0A 1BCMA 4LH5A 1R0AA 3SQ2A 4N76A 1J54A 4CF1A 4KKOA 5FDLA 1BL3A 2O4GA 3LP1A 5SWMA 3PUFA 3QLHA 3NF8A 3D0PA 4NCBA 3MEEA 2HHXA 3CFPA 1S1UA 1JLBA 2I5JA 4N56A 2P51A 3KIOA 3TR8A 4HCCA 4CF2A 2OPQA 4CK1A 4CHYA 3KK2A 2ETJA 4ID5A 1ZBUA 2BANA 4CEFA 2OZMA 4CEQA 1Y97A 1XHXA 4M3XA 1HYSA 4M41A 3VQ7A 1HYVA 1VSMA 4JLHA 4RW9A 4CK3A 1ASWA 4BDPA 4CJ3A 1FK9A 2QKBA 2HVHA 3TAMA 4R5PA 3K59A 5HROA 3HVTA 4CJPA 4FM0A 4ELTA 1U45A 4F3TA 2FBXA 4CEOA 1NJWA 1Q8IA 1KFDA 2E6MA 3BDPA 1C1BA 4DSIA 4FK2A 4DQPA 1NKBA 1LWFA 4CJQA 1U4BA 3SPZA 3TWHA 5FROA 4AHSA 4OPKA 1NK9A 1RT6A 3QERA 4KHNA 4CGIA 3TAEA 1RT2A 2KW4A 4DFPA 3IAYA 3OYNA 2LSNA 4Z4GA 3VQCA 4FYDA 3VQBA 2D0BA 3QESA 1BGXT 2XRIA 3CG7A 4GVMA 1D5AA 4KHWA 3AO3A 3AVJA 4DFJA 2X6NA 2Y1IA 1TGOA 4HCBA 4AHVA 4HHTA 1BISA 1WSIA 1TL1A 2F96A 4KI4A 1NOYA 1IKXA 3HPHA 4OGEA 4AHCA 3LWMA 3TANA 2OYQA 4FW2A 4CIGA 3HL8A 4CGDA 3M8SA 1HQEA 1JXEA 3L2RA 4FLUA 3NDKA 1B9DA 3S3OA 3DLBA 4Z4IA 3NF9A 3PX4A 2D0CA 1CZBA 3OYHA 3NHGA 4CJVA 4ZTJA 4CIFA 3DI6A 4IFVA 3DRRA 4OGCA 4BE0A 1REVA 1WSGA 4FJIA 3OYLA 3L3UA 4HTUA 5CY4A 1S1WA 4B08A 2G8UA 3F9KA 5C42A 3ZSZA 1GOBA 3KLFA 1C1AA 1D9FA 2Z1HA 2WOMA 5KTQA 4FJJA 1SKWA 4DQRA 2YV0X 5HRNA 4FLVA 4EZ6A 1ZBHA 4DSJA 3RMBA 4FM1A 1LAWA 1VK0A 1RTIA 3KLHA 4UQGA 1EETA 3TAGA 4Z4FA 3NGZA 4IG3A 4H4MA 3EZ5A 4B9TA 3OYKA 2IS3A 3AVHA 4XIUA 4KTZA 4M3WA 3L2VA 4MQ3A 4BDZA 3SNNA 3QO9A 3KKRA 3SV4A 1VSLA 3ZT3A 2O4IA 3CM6A 1IKWA 1ZBLA 2FC0A 4I9QA 1BI4B 4IG0A 1NKCA 1J5OA 1KVCA 3ZT0A 4LSNA 4F2SA 4J2BA 1VSKA 4ZHRA 1Z26A 4KTQA 3T3FA 1S9GA 3O3FA 1HJRA 4TSXA 4LH4A 3SUNA 4CJUA 4O5BA 3ALYA 4QAGA 1X9MA 2G8WA 3VQ8A 4DSFA 4DSLA 4PY5A 4CJKA 4N5SA 4DS5A 3OJSA 4B9UA 1TK5A 1VRUA 2G8HA 1HQUA 2YNGA 3RWUA 3NF7A 1WN7A 3M8QA 4KFBA 2G8FA 3OYIA 4FK0A 3AO2A 3V9ZA 4DQSA 3AVBA 4I2QA 3OYGA 4CFDA 5CYMA 2VWJA 2EX3A 4NCAA 1ASVA 3TAFA 4J2DA 1WSEA 3AVFA 3ITHA 3T1AA 4CGJA 4B9MA 4DSEA 1RBVA 3G0ZA 3JYTA 4CGFA 2HHWA 3NFAA 1KCFA 3NH2A 4DLEA 3RR7A 4DU1A 1RT7A 3E01A 4DU3A 1BHLA 3PO4A 4CHNA 1CZ9A 4BE1A 3RTVA 1UOCA 1VSEA 3VQQA 4O4GA 3QIOA 2HHSA 1D8YA 2PZSA 4PWDA 4W5TA 2X6SA 2IAJA 3ZSYA 1QHTA 4KB1A 4KHYA 2KFNA 2VG6A 3HP9A 3RMCA 3V9SA 3RRHA 4CF8A 4BE2A 4DFMA 1N6QA 2XY5A 1A5VA 2YHBA 4E7KA 2DFHA 3OYAA 2G8KA 2OPSA 4KPYA 1C1CA 2D5RA 4F4KA 2KFZA 1RDDA 4WE1A 3T19A 3NCIA 4CK2A 4OPJA 1TK0A 1FXXA 3THVA 4YNQA 1HYZA 5KGXA 4E7IA 4M45A 5JS1A 3HSTB 3AVNA 1RTHA 3CYMA 2GUIA 3C6TA 3MXJA 3DRPA 4FJ7A 3M8PA 4B8CA 4CHQA 4FLWA 2P5OA 3I8DA 3KD5E 4DTUA 3L2QA 4Y1DA 5CZ1A 4FLXA 4EZ9A 3A2FA 3JSMA 4F2RA 4F8RA 4NYNA 4CF0A 3OYMA 1Q9XA 3M8RA 1XC9A 4QCLA 4G1QA 4J2AA 5C25A 4Z4EA 3DRSA 1ZYQA 3SV3A 2YNHA 4DTJA 3WNHA 1U49A 1QS4A 4CJTA 1Z25A 5JS2A 1L3VA 4DLGA 2BGGA 1JKHA 4BDYA 4CFBA 2HHUA 4CERA 1NKEA 4B8AB 2IGIA 4CEBA 3HM9A 4C8OA 2EHGA 3S3NA 4PUOA 3SPYA 3O4QA 1TL3A 1SL1A 4OKEA 1VSJA 4KO0A 1WLJA 2ZQBA 1S6PA 4DTRA 1RDBA 4HUEA 3PX0A 4E0DA 4L8RB 1MU2A 3SJJA 1RT1A 5J2NA 1TK8A 4IKFA 3WNGA 3RR8A 3V1RA 4Z0UA 5FRMA 3AA2A 1FKPA 2IDOA 4Q0BA 2GV9A 4CF9A 4DTSA 1JL2A 1IO2A 4ELUA 3NH1A 4I9LA 4NCGA 4FW1A 1SV5A 3LWLA 5HBMA 4B3OA 3S9HA 3L8BA 1XHZA 1XWLA 1IG9A 3MXIA 3TAPA 3AA4A 3I0RA 3K2PA 3KKSA 4CJWA 4CECA 3O3GA 2G8VA 1RT4A 1BIUA 4FCYA 4KHSA 4Y1CA 3K5MA 1GOAA 1GOCA 5D3GA 3HVRA 3P83D 4F3OA 5E41A 4QOZB 3V6DA 3SZ2A 1HNIA 3NBPA 2XY8A 4IBNA 3QEWA 4DSKA 3RRGA 1RCHA 4DTNA 4M3RA 4CE9A 1T03A 4O44A 4W5NA 1EXQA 1I3AA 2HB5A 3NH0A 3C94A 1JLQA 3S3MA 1K6YA 1EX4A 4O0IA 1QE1A 1BQNA 1I39A 1C0UA 3AVCA 3HPGA 3VQ5A 3OYCA 3LZIA 4BWJA 4OLAA 4RG8A 3OVNA 1L5UA 1KSPA 3QINA 1KRPA 1JLAA 4E19A 4LSLA 4FLZA 3OS2A 1SL0A 2YKNA 3V1QA 3IG1A 4FZXC 2E4LA 2HHQA 1B92A 3SQ4A 4CHOA 4Z4CA 3K5NA 3QEPA 1DTTA 4E3SA 3OYDA 3EY1A 5HP1A 3DLRA 1LAVA 2OA8A 1C6VA 3ZSWA 4CHZA 4JRPA 3LZJA 5HRRA 3OYFA 3HT3A 5KGWA 1U48A 3QIPA 1LWCA 3AVGA 2DFFA 4CJFA 4ELVA 2Q3SA 4FZYA 4IFYA 5J1EA 4DU4A 3AVIA 2E6LA 1YVUA 1VRTA 4FLTA 2KZMA 1S6QA 1ZBFA 3OYJA 1WSJA 1RT5A 1WAFA 3PX6A 4BWMA 4CEEA 4GW6A 1WSFA 1TAUA 1A5WA 4W5QA 1NK4A 4CIEA 3CFRA 4FJNA 3AVKA 3LPTA 3UIQA 2WONA 4FJ5A 2OPPA 3SUOA 4AH9A 3AVMA 4EP4A 2HVIA 1C0MA 2RPIA 4CFAA 1BCOA 3V1OA 4N41A 4CCHA 3DMJA 3AO4A 2DTUA 2Z1JA 2W42A 4FLYA 4K8XA 1RILA 4EP5A 3V9XA 5C24A 4B9LA 3ASMA 4E89A 3DLKA 3ZSXA 3SYZA 3VA3A 2F8TA 1EP4A 1KLMA 3HO1A 1ZBIA 3L2WA 1NK0A 1EKEA 3QEXA 1N5YA 1A5XA 1VSFA 3AVAA 1KLNA 3KTQA 4FJGA 3AO1A 3DLGA 1QSYA 4FZZA 4M42A 1O1WA 3CM5A 1TV6A 3LALA 4Q5VA 4W5OA 1HPZA 4KRFA 3G10A 3HXMA 1YTAA 3VQEA 1NJZA 2Y1JA 4BACA 3ZSOA 4KHUA 1TAQA 1LW0A 3C6UA 1BIZA 2B6AA 4DTPA 1TKTA 3L3VA 4CESA 3PO5A 1LWEA 1C0TA 1LW2A 3ZCMA 3OYBA 4FM2A 4KAZA 4OJRA 4DQIA 2HNDA 4W5RA 1DLOA 4M3ZA 3HYFA 3V4IA 5I42A 2P5GA 2ITGA 3ZSQA 1SKRA 2Z1GA 1YTUA 4DG1A 3KK3A 2NUBA 4CJSA 1IH7A 3AA5X 3D45A 4DFKA 4RW4A 1QSSA 3V81A 1SUQA 3QEVA 1TKXA 1CXUA 3IRXA 4H8KA 3AVLA 3O3HA 1ASUA 5HRSA 2BE2A 4AHTA 4FK4A 5HLFA 2B5JA 2P1JA 4CEAA 3SCXA 3I0SA 1JL1A 1SL2A 4E7LA 3NAEA 3K57A 2GBZA 1KVAA 1S1XA 3NGYA 4CJ4A 2XHBA 3KD1E 2OPRA 3SQ1A 1J53A 1RT3A 2QXFA 4ZTFA 1S5JA 3VQ6A 3HPOA 2ZD1A 1JLCA 2B4JA 3AO5A 3MECA 4M3TA 1CXQA 2FBTA 4AHUA 4CJ5A 4DF4A 2IOCA 1UA0A 4O55A 3QETA 3K58A 5T7BA 2KQ2A 3VA0A 4DS4A 1RNHA 4I2PA 4DTOA 4E1MA 3DOLA 1KFSA 4DTXA 4KTWA 3AV9A 1KVBA 3OS1A 4H4OA 4K8ZA 3KK1A 4J2EA 1NJYA 4B9VA 3VQPA 3VQ9A 3MAQA 4N47A 4OKKA 1YT3A 4DF8A 1S1VA 3SQ0A 4FXDA 3P1GA 3ZSRA 3B6PA 1WNSA 4CGGA 1T7PA 3L2UA 4HUGA 4FJKA 2R7YA 1QSLA 2DY4A 3ULDA 5I3UA 1X9WA 4AHRA 4CJLA 3OYEA 3FFIA 3QEIA 4HUFA 3DOKA 3C95A 1W9HA 1NK6A 4YFUA 2X78A 2YNFA 2VG7A 3K5OA 4PA1A 4C8MA 1RBTA 3EYZA 3U3GA 1RDCA 3RMAA 1U47A 4PQUA 2YNIA 3NE6A 3LP3A 3O4NA 3DLEA 3LANA 1G15A 4JS4A 2KTQA 1UA1A 3VN5A 1KTQA 3VQAA 1UAXA 1J9AA 3MXMA 1Q9YA 4HVJA 3ZT2A 1JLGA 5KRTA 2FBVA 3OY9A 3KLEA 3DLHA 4FJMA 5J2MA 5KI6A 1X9SA 3DYAA 4DTMA 1RDAA 5J2PA 4M3YA 1RBRA 2BDPA 4ID1A 3QNOA 4MFBA 3P5JA 3LAMA 4KREA 4CFCA 5SZTA 3TARA 2ATQA 2AJQA 3RMDA 2RN2A 3U3YA 1VSHA 1L3SA 3DM2A 5CZ2A 2F8SA 1RBUA 1SKSA 1NK5A 2RKIA 3OJUA 3VQ4A 2YHAA 4CEDA 4KB0A 1HMVA 4JRQA 2IC3A 2HMIA 2QK9A 5EU7A 2QKKA 4CHPA 2DFEA 2RF2A 4JS5A 1XI1A 3TI0A 3H08A 5DK5A 4FJXA 4FJ9A 2PYLA 4E1NA 2D0AA 4RW8A 1RBSA 4DWIA 1JLEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WBDA 3CQXA 3ENHA 4IWVA 4I6MA 2EWSA 1NNEA 1YJ9N 1S9EA 4PKGA 3ZX0A 4BRLA 5FRNA 1W2BM 3QNNA 1T05A 3VEWA 2E8AA 1F21A 3KJVA 4FJLA 1X1PA 2HNYA 3LP0A 2XY7A 4OX9K 2HOEA 1NJXA 1NOZA 3PV8A 3D2FB 3LP2A 3BGRA 4BC3A 1IKYA 4KH4A 3U4LA 2OZSA 3L4QA 3HJFA 1WAJA 3TABA 4LY7A 2HHVA 1DTQA 2A1SA 1BI4A 1T8EA 1RTDA 1FKOA 3LDSA 1D9DA 3AA3A 3F73A 3KLGA 2P9PA 4B1UB 4BRFA 1S1TA 4GKKK 2HF3A 3HOSA 3KLIA 3QFPA 1K8KB 3EN9A 4CD3A 4ICLA 3THXA 1TKDA 1TKZA 4NYFA 2FLOA 3CI5A 1QTMA 2P9NA 5I9EB 2PYJA 4FJHA 3IS9A 3CCJN 2XO7A 2UUCK 4C1NI 1VQ4N 4KI6A 1C0GA 4E7HA 4LD0A 2DPNA 2P9SB 3SQ2A 1KAYA 3FZFA 1BL3A 2O4GA 5SWMA 2HHXA 1W7AA 3MEEA 3CFPA 4HTLA 5JLFA 4A59A 4MDBA 2OPQA 5JVGL 5HOOA 4CHYA 3CETA 3N4PA 1NGAA 2E1ZA 4CEFA 3SLCA 2P9IA 4B3MK 4M41A 2P9LA 4CK3A 4CJ3A 3TAMA 4FPBA 3HVTA 4FM0A 5CR4A 2VQFK 3SAGA 3CHWA 1KFDA 3BDPA 4PKIA 3TSQA 3SPZA 3TWHA 1TUYA 2F7TA 3CCMN 4KHNA 1EWQA 4CGIA 4CJ7A 4IXCA 2KW4A 4CD1A 2E2NA 3L6QA 3VERA 4Z4GA 3VQCA 3QESA 4BRAA 3FZLA 1T6DA 3AO3A 3AVJA 2X6NA 4FOEA 2Y1IA 1O13A 1BISA 1WSIA 2F4VK 3MX2A 3WQUA 1NOYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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