2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
5AQTA 3MCPA 4RCHA 3VF4A 1HKBA 5AQFA 5BREA 4WYBA 5AQKA 4B1ZA 3UKUA 3FZFA 5TKYA 4BROA 3WT0A 3ENOA 3P4IA 5AQYA 3U4LA 4A62A 4O5FA 3TPQA 2F9WA 3MN7A 2HF4A 3UKRA 4H0XB 4A61A 4BRHA 3R6MA 3BF1A 2BTFA 4BG9A 3A5MC 1T44A 3AAPA 3WEEA 1NM1A 3CJ7A 4BQZA 2ZF5O 3H1VX 4CZGA 3BEXA 2V7YA 3BF3A 3JXUA 1S3XA 1NWKA 3CQYA 3HI0A 3IMXA 4FOIA 5AR0A 4DQ8A 2I7PA 3VEZA 1DEJA 3VETA 2CH5A 3UE5A 3C7NA 3O1BA 3VF6A 3VPZA 4BVPA 3UKUB 3O6WA 3EZWA 1V4SA 5E84A 3RSEA 3C7NB 4E1JA 1BA1A 4FSVA 1GLAG 4Z94A 3M6GA 2P9IA 1TUYA 3VESA 3VF2A 5AQNA 5BPNA 5AQHA 3FR0A 5AQVA 2VYPA 3AY9A 3DXKB 3QB0A 5AQQA 1X9JA 3FFKB 3MMVA 4K42A 1WUAA 4QS7A 5JLHA 1NGFA 3SLCA 4BVOA 4WQ4A 1BOTO 1QZ6A 4BRNA 1KXPA 1CZAN 2YJFA 3HM8A 3UKRB 3A0IX 5FPEA 3EO3A 3AAQA 4MLHA 4AM7A 2IVNA 5KQ8A 3IFRA 4NO7A 4CZJA 4BR2A 2W40A 3HBTA 3ID8A 2AA4A 1XQSC 2OANA 5EVZA 3KHYA 1ESVA 3BUZB 2HMPA 4CJ7A 3SJHA 1NGDA 1HUXA 1HJOA 1HKGA 4M7YA 1NGBA 2P9LA 4WQ4C 4BRPA 3L0QA 4BRQA 4EHTA 2D0OA 4EHUA 3A5OC 2D1KA 1BA0A 2FXUA 2ASOA 1H1VA 4BQLA 5ADXH 5EY4A 4FWKA 1YAGA 3WXIA 4H0TB 2QW9A 3OHRA 4WQ5A 3QICA 4CZFA 1GLEG 2IIRA 5BN9A 4BGAA 2CGLA 5AQZA 3LDPA 5I9EB 1BU6O 5BRFA 2Q0RA 2P9UB 1SAZA 2E8AA 5ELZA 5AQIA 1ZC6A 2P9PA 4B1WB 3LDLA 3QFPA 3LM2A 4L3QA 5AFUH 3D2FB 3BP8A 1JCFA 3CJ9A 4FPAA 3DXKA 3VEYA 3H3NO 1HLUA 4H0PA 1NGEA 2YI1A 3HZ6A 4EIAA 2QWLA 2P9UA 3IDHA 3U9ZA 3VEWA 4B1VA 1C0FA 2GWKA 3F9MA 3LL3A 4B9QA 1BUPA 4FWRA 3GOIA 3RSEB 3VEXA 4Y0WA 3H1QA 1KAZA 3LDOA 4FPBA 2QWOA 3M1FA 4BGBA 2GUPA 4M7XA 1NLVA 5LJWA 4BR7A 5BRHA 3VEVA 4GNIA 4O8KA 2FLOA 1QHAA 2PBDA 3WXKA 4BRGA 2QWNA 3D2EA 3CJBA 5AZIA 4CD3A 3IUCA 4F9OA 2P9NB 3GL1A 1NGHA 4HWIA 3SK3A 1YUWA 5KPRA 4BRLA 3O5BA 4CZMA 3FE1A 5EXWA 3MN6A 3AARA 2CGKA 3A5LC 3A5NC 4PKIA 4BRIA 4IJNA 4BC2A 4A2BA 2IVOA 4FWPA 3DAWA 4GY2B 4XH1A 5EOYA 4IO8A 4BRKA 3GBTA 2A5XA 2FSNA 5F2RA 1JCGA 5BN8A 3FZKA 1NGAA 3EKUA 4FWMA 2CH6A 2FF3B 3WUHA 4JHDB 2ZGZA 3U8XA 4RWTA 2GELA 2ZGYA 2GWJA 3LM9A 3FZHA 3R9PA 4FWLA 1T6CA 4H0OA 1MWKA 1G99A 4QS8A 1EQYA 4CZIA 1NGJA 2E1ZA 1J6ZA 5AQMA 4CD1A 2YHYA 1LOTB 3ATVA 3HSCA 4B1UB 3CI5A 4H5NA 3ZETB 3MDQA 3ZX3A 3QBWA 4BC4A 5CE3A 5AQJA 5BPMA 1ZBSA 5AFUA 4ISEA 1MWMA 3FZMA 3ULEB 4H03B 1BO5O 1V4TA 1NGGA 2YCHA 4PKGA 3MN9A 4BR4A 1Z6RA 1HX1A 2E88A 2A6AA 1R59O 1P8ZA 1XUPO 4AM6A 2A40A 2Q36A 3M3ZA 3CETA 4ISFA 3TU5A 4BRCA 4MLEA 2FF6A 5EX5A 4CZHA 2P9NA 1HPMA 5KQDA 1GLJO 3HTVA 5AZIB 1NBWA 3H3OB 4FOEA 4FWNA 2YJEA 3ULEA 3CHWA 3WQUA 4ISGA 4FWSA 1ATSA 3H45C 3O80A 4H0YB 3UB5A 3QBXA 2D0PA 1ZXOA 4QS9A 1GLLO 1MA9B 2P9SB 5FPDA 3GDQA 4EFHA 1BWFO 1MDUB 4C23A 5BRDA 2H3GX 4BG8A 4XH5A 3KVGA 3VOVA 4JD2B 4CBUA 2HOEA 1KAXA 2QWQA 4CI6A 4PKHA 3VEOA 2P9LB 2QWPA 4H5TA 4MO5A 1NGCA 3QFUA 1JCEA 4XEIA 3DXMA 4HTLA 1KAYA 3VGLA 5AQXA 1U6ZA 4CBXA 1U2VB 4B1XB 2Q0UA 3JS6A 1K8KA 5AQRA 1GLFO 1WOQA 5B8HA 1QQOA 3ZEUB 2A3ZA 4RTFD 1C0GA 5LJVA 3LDQA 2E1YA 2GTDA 2E20A 4H5RA 3W0LA 4XH4A 4LC9B 2PAVA 2QXLA 1D4XA 1SQKA 1S22A 3CJCA 1X3NA 2CGJA 3VERA 4BC3A 1K8KB 1IJJA 2A41A 2ZWHA 4CZEA 1ATNA 4BRDA 3G25A 3DJCA 3O4WA 4IZ9A 3R8EA 3S41A 1GLBG 3VENA 4BRFA 3A8YA 3U9DA 4PL7A 2E2OA 2QM1A 4B1YB 1ATRA 5FPMA 1GLDG 3FZLA 4BR9A 1BG3A 2QWRA 3ATUA 4IJAA 1XC3A 4IXCA 3WXLA 5LY3A 1BDGA 4MO4A 2P9IB 4DCHA 4KBOA 5JICA 3B8AX 2IVPA 3J8AA 4JD2A 3H6EA 5JMVA 2V52B 5AQLA 1YVNA 1X3MA 2P9SA 4K41A 4FO0A 2WUSA 3SMPA 4DB3A 2FSJA 4I6MB 1HKCA 1LCUA 1Z05A 2NLXA 2Q2RA 3CQXA 4PL8A 3FGUA 5AQSA 3H46O 2E2PA 4BR0A 2KHOA 5F1XA 5FPNA 4NB4A 2VWBA 3W3DA 1U2VA 2YHXA 3I33A 5AQUA 5E26A 3QDKA 3MK6A 3DXMB 2P9PB 2ASMA 3FLCO 4DHYA 1IG8A 4FL9A 4CZLA 4K25A 2BUPA 2Q1NA 5AQWA 2AP1A 4BREA 4YDUA 2J4RA 3ZETA 5ADXA 5KPZA 1QZ5A 3WQTA 1QQMA 3VGKA 4JN4A 5BPLA 3EN9A 2E2NA 3LDNA 1RFQA 4YDUC 1DGKN 5AQPA 1NMDA 1YXQA 3VGMA 5JLFA 4H5VA 2V51B 4IWVA 5AQGA 1TYQA 4J8FA 2UYTA 4WQ5C 4BC5A 2NRHA 4JNEA 4JHDA 3QMLA 4FWOA 4JAXA 2A42A 1RGIA 2W41A 3CJAA 3CIPA 3D7EO 3O1WA 1NGIA 3D2FA 3WEEB 1Q18A 2QWMA 4BR5A 3MN5A 4BRAA 3DWLA 4M63C 2FSKA 2I7NA 1DKGD 2E2QA 2VCPA 1OKJA 3C0BA 2ITMA 4EAHD 1RDWX 2V7ZA 1SZ2A 4CBWA 3L4IA 2NZTA 5AZJA 3CJ1A 1E4FT 3CERA 3I8BA 3ZX2A 1GLCG 2F9TA 5AZJB 3ZEUA 2Q31A 3EL2A 4I6MA 3ENHA 3GE1A 2EWSA 2HF3A 1QQNA 1T6DA 4CZKA 3O8MA 2GEMA 3WXJA 4H0VB 3KZBA 4H5WA 5AQOA 1E4GT 4FWQA 2YHWA 2ASPA 2Q97A 3EKSA 2P9KA 3ZX0A 1TYQB 3L6QA 3O08A 1TUUA 5BR9A 3D2EB 5KPTA 1Y64A 2DPNA 2D4WA 5F0XA 4A2AA 4K43A 2P9KB 3GG4A 4BRMA 3SMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQTA 4JRPA 3QIOA 1VQ4N 1HKBA 1S6QA 5AQKA 4B1ZA 3UKUA 4RW9A 1QS4A 5TKYA 2AJQA 3TAFA 5M1OA 3CG7A 5FDLA 2EHGA 5AQYA 3U4LA 3ZT0A 3CMAN 4O5FA 2F9WA 4BE1A 3BF1A 4BG9A 3A5MC 1OH5A 4CFDA 3CFPA 1I39A 3SJJA 1RT5A 4BQZA 1SV5A 1WAJA 3EZ5A 2HW3A 2XY8A 4AHTA 1HNXK 3LDSA 3PX0A 1QSSA 4Z4CA 4DUYK 2YNGA 4MDBA 4CCHA 4HVJA 5D3GA 2I7PA 4KI4A 3VEZA 4OKKA 3ZSYA 3VETA 2KTQA 2IAJA 3UE5A 3K0SA 3O1BA 4Y1DA 3UKUB 4BDPA 1TV6A 1V4SA 4KB0A 3RSEA 3OYJA 4YFUA 4FSVA 4Z94A 1FKOA 3WNEA 3J7YP 3VF2A 4LF6K 5AQNA 1LW2A 3P39A 3P83D 1A5XA 4LH4A 3FR0A 4M41A 3AY9A 4DTUA 4JRQA 4FJXA 2O4GA 1SKWA 3MEGA 3QB0A 3MMVA 2VQEK 1NGFA 3SLCA 3C6AA 4WQ4A 1BOTO 4BRNA 4DR3K 2F96A 4KTQA 3UKRB 4YORA 3OYAA 4DV7K 3HM9A 4AM7A 2IVNA 4KHQA 2ITGA 2F7TA 3PUFA 3TARA 1BIUA 4CZJA 2EX3A 2W40A 4ELUA 4DTJA 1REVA 1BI4B 3PX6A 3O3FA 3OW2M 1N6QA 3SNNA 2HBKA 1HUXA 1KQSM 4M7YA 4AILC 2WFBA 2Y1JA 3HT3A 2YHBA 4RW8A 4BRQA 4EHTA 4DF4A 3VQ6A 1RCHA 4DSIA 1BA0A 5C0YA 5EY4A 4KFBA 2YNHA 4H0TB 3SZ2A 3QICA 3I56N 1GLEG 3BDPA 3MXIA 5BN9A 4UY8O 2CGLA 4CGIA 3SAFA 3LDPA 5I9EB 5BRFA 3O3GA 4DTMA 4OJRA 1DTQA 4ILJA 5EU7A 2E8AA 1R0AA 5AQIA 4GV9A 2UU9K 4FJ7A 1FJGK 1HMVA 4L3QA 2ETJA 1D9DA 5AFUH 3RR7A 4OVLA 5GINA 4CGGA 4FPAA 3QNOA 3VEYA 3CC2N 2YI1A 3ULDA 4EIAA 2IOCA 2QWLA 3IDHA 1NK9A 3OYKA 1C0FA 4O5BA 3JAMO 4O55A 3KLHA 1YIJN 4JI1K 3LL3A 1XHZA 4CJSA 4M42A 1CXUA 3GOIA 3RSEB 4FLWA 4Y0WA 3BGRA 4B8AB 3ZSQA 1U04A 2QWOA 3M1FA 4CFAA 3MEEA 4BE0A 1NLVA 4BR7A 2GX9A 4GNIA 1Q82O 4CJRA 2FLOA 4JK9A 3WXKA 4H8KA 1JLFA 3CJBA 4CD3A 3FFIA 3CPWM 4DV2K 3PO5A 2P9NB 3GL1A 4KH5A 2P1JA 4CHPA 4H4OA 1EX4A 4HUFA 4LFAK 3AARA 4LF5K 2NRWA 1X9WA 3M8PA 2O8BB 3C95A 1TKTA 4DLGA 2HNDA 1K6YA 4GY2B 4NXMK 1HYSA 4IO8A 5F2RA 3WNFA 3KTQA 5BN8A 4JKAA 3FZKA 2VQFK 2C1GA 1IH7A 2O8EA 3S9HA 2FF3B 3AA3A 3OYLA 4CGJA 4BWJA 2ZGYA 2KFNA 3OS2A 3HO1A 4CGFA 3R9PA 4FWLA 1T6CA 2BE2A 3CCUN 1MWKA 2X78A 3LALA 4YNQA 1Q9XA 2E1ZA 4CHZA 3VQ9A 4C8LA 4CD1A 1LOTB 1KFDA 4NLBA 3V1RA 1QHTA 3C6HA 3MDQA 4JI6K 5CE3A 1IV0A 4M45A 5AFUA 3PX4A 4BY9C 4ZHRA 2YCHA 4DU4A 3PV8A 4BR4A 5CZ1A 1VQKN 3H08A 4DU3A 2QTDA 4AM6A 1YITN 1XNRK 1NJZA 4JS5A 1T05A 4CJ3A 5EX5A 3CYGA 1HPMA 3ZT3A 3HTVA 5HOOA 3OYMA 1NBWA 3AVFA 4FWNA 2OYQA 1VQ6N 3CHWA 4ISGA 4FWSA 3RMBA 4H0YB 3CFRA 1ZXOA 1MA9B 1CZ9A 1X1PA 3PIOL 5HRNA 1MDUB 2HVIA 1EXQA 4XH5A 1C0UA 3O4QA 3VOVA 4FCYA 3DLHA 5CY4A 4B3MK 1NK8A 4HUGA 4KHYA 4OPAA 3VEOA 4O0JA 3TI0A 5I42A 1JKHA 4HTLA 3OYIA 3ITHA 3SV3A 4LFCK 1JJ2M 4RW7A 2Q0UA 4WFNL 4FJMA 2YKNA 5B8HA 1IO2A 4L8RB 1RT1A 1IKXA 3PSFA 4B9MA 1TVRA 4DTSA 3QESA 2ATQA 4BACA 4H5RA 3W0LA 3BZKA 3CJCA 3O9QA 4JI5K 2ZWHA 4CZEA 1ATNA 4A59A 1WAFA 2NUBA 5HRRA 3DJCA 2UUCK 1HQUA 3HSTB 4QAGA 3A8YA 4LF8K 4E72A 2E2OA 2QM1A 3OS0A 3NDKA 4BR9A 4X65K 1BG3A 4IJAA 3E9OA 3G0ZA 2RE2A 4KBOA 5H1SQ 4KHNA 2NRZA 2YNFA 3KD1E 1T7PA 1QSYA 4FJGA 3OYNA 1TKDA 1YTUA 3AVGA 3SMPA 1HKCA 4GW6A 1KFSA 5JENA 2NLXA 4C8OA 4NYFA 5IWAK 4PL8A 3THWA 2HVHA 3HK2A 5AQSA 3H46O 2KHOA 5F1XA 4DV3K 3TWHA 3ZYYX 2RN2A 1W2BM 4NB4A 4CHYA 1JLBA 3VQEA 2YHXA 3I33A 4JKFA 4CHNA 3F73A 3QDKA 2P9PB 4IFEA 4DHYA 3JSMA 1EP4A 4K25A 1C0MA 3HVTA 1WSIA 4KH6A 3S3NA 5KPZA 4ELTA 3WQTA 1QQMA 1UAXA 2HB5A 3VN5A 1QVGM 1UOCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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