2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
3VERA 3FGUA 2E8AA 5AQQA 3FZMA 2FSNA 1ZBSA 2BUPA 2FF6A 1GLCG 3ZX3A 5LJWA 2V52B 3U9DA 3BEXA 3CERA 4K25A 4IJAA 1Z6RA 4YDUC 1MWKA 4XH4A 3VEOA 3DXKB 3AY9A 3C7NA 5AQNA 4BRFA 2FXUA 3ZETB 4K41A 2A5XA 1JCGA 4EIAA 3O4WA 4BR2A 1ESVA 3VESA 4KBOA 1GLDG 3GG4A 4JNEA 4BC3A 2CH5A 3ENHA 5FPNA 1S3XA 4B1VA 4AM7A 5F1XA 1K8KB 2P9UB 3WEEB 4BRHA 3WXKA 3VETA 1C0FA 3IUCA 4GY2B 1GLEG 3ULEA 3C0BA 2FSJA 4DHYA 1X9JA 3AAPA 2P9KB 3BUZB 4WYBA 2I7PA 1G99A 2F9WA 4BRDA 4CJ7A 3P4IA 3ID8A 1SAZA 3IDHA 1HKBA 3VPZA 1QZ6A 3EL2A 1HJOA 3FZKA 4CZIA 4PKIA 4I6MA 5AQFA 1DEJA 2Q31A 3O1WA 3ENOA 3KZBA 2P9LA 1NGHA 3WQTA 1NGFA 1R59O 1WOQA 1HLUA 5AQHA 4BR0A 4FSVA 1OKJA 2QWNA 3QBXA 2E88A 1D4XA 1T6CA 4L3QA 5AQIA 3R6MA 3IMXA 5BPLA 2GEMA 2J4RA 3KHYA 5AZJB 3ZEUA 2GWJA 5AQUA 4WQ5A 3WXJA 5ADXA 1Z05A 5KQDA 2FSKA 4NO7A 4RCHA 5BRFA 3EZWA 3VGLA 3DJCA 1NGEA 1IG8A 2P9SB 4B1WB 1NGBA 5AFUA 4H5NA 2ZF5O 1P8ZA 4MLEA 2ASMA 4H0PA 1MWMA 1NGCA 3L4IA 3M3ZA 2YHYA 4BC4A 2IVPA 4H5TA 3VF4A 5JICA 1X3NA 1U2VA 3L6QA 3FZHA 4A62A 1NBWA 1XQSC 1EQYA 3BF1A 3VF6A 4NB4A 4FPBA 3D2FA 4CBUA 3CJCA 5AQVA 1TYQA 4H0TB 4BC2A 2NZTA 4DB3A 4IXCA 1KAXA 4JHDB 2E20A 2HMPA 3QICA 4H0VB 4CZLA 4H5RA 3EKUA 1NGDA 5AQZA 1NGJA 4WQ4C 3GDQA 5AQSA 4BR4A 1XUPO 1NLVA 3EKSA 1NM1A 2W41A 2P9PB 5AQRA 1TUYA 4ISGA 2Q0RA 3OHRA 3LM9A 3MN6A 3TPQA 5I9EB 3H6EA 4BG9A 2F9TA 4MO5A 1BU6O 2EWSA 1BG3A 2QWOA 3FFKB 4BQZA 5JLFA 5E26A 5EVZA 3SMSA 5AZIB 5FPEA 2ZGZA 1HX1A 3H45C 3FLCO 3O6WA 3VEYA 3UKRB 2HF3A 3CQXA 3EN9A 1CZAN 3A8YA 2QW9A 3CJ9A 2YI1A 3L0QA 3RSEA 1U6ZA 2ASOA 1T44A 2W40A 2GELA 3R8EA 3QMLA 5CE3A 3W0LA 1RGIA 2Q0UA 4FPAA 4CZEA 3VF2A 3O08A 4BROA 1KAYA 2P9NA 3WT0A 3O8MA 3MN7A 4H0YB 4BVOA 3VEVA 3FE1A 3GOIA 3C7NB 3WXLA 5BN9A 1RFQA 3QB0A 4FL9A 4XH1A 3DXMA 2CH6A 4QS7A 1YUWA 2KHOA 4B1XB 4JD2A 3QFPA 2P9IA 1DKGD 3MN9A 2D0OA 3LDLA 4B1YB 1NGGA 3M1FA 4IZ9A 3HBTA 4C23A 1YVNA 4FWKA 3A0IX 1GLAG 2QWMA 3D2EA 1C0GA 2YJEA 3ULEB 3ZX0A 3JS6A 1V4SA 4FWMA 4CI6A 1TUUA 5AR0A 2D0PA 4J8FA 3A5OC 2VYPA 4E1JA 2V7ZA 3GBTA 2ZGYA 4O8KA 5AQJA 3JXUA 3A5LC 2V7YA 2ASPA 4BRGA 4IJNA 3ATVA 1KAZA 3BP8A 3FZLA 4K42A 4DQ8A 3VEZA 2YHXA 3HTVA 4MO4A 4B1ZA 5AQLA 4CZHA 4BRLA 5AQXA 5LY3A 4B9QA 3H3OB 2CGKA 3AAQA 2P9LB 3VENA 2QWRA 4HTLA 1GLBG 4YDUA 1BA1A 3VGKA 4BREA 2QWQA 2Q2RA 4IO8A 3IFRA 3UKUA 5BPNA 1LCUA 3CI5A 4CZJA 5BRHA 1SZ2A 2OANA 3ZEUB 4BQLA 1GLFO 2GTDA 4CZKA 1SQKA 2A40A 4M63C 3GE1A 3ZX2A 5E84A 4PL7A 5JMVA 2A6AA 3I33A 4PL8A 5B8HA 1QQOA 4FWRA 3AARA 4CD1A 5AQPA 2NRHA 1MDUB 4GNIA 1ATRA 1NGAA 3M6GA 3QBWA 3R9PA 2E2PA 5KPZA 3WUHA 3DWLA 1S22A 2E2NA 1DGKN 3HM8A 4K43A 1BA0A 3LDQA 4CBWA 3H1QA 2HF4A 4DCHA 2E1YA 3VEXA 3LDPA 3O80A 3U9ZA 4F9OA 4M7XA 4BR7A 2A42A 2YJFA 3DXKA 1BDGA 4BRNA 3ZETA 3UB5A 5F2RA 3UE5A 3H1VX 3D2FB 3LDOA 4EHUA 3H3NO 1Q18A 5EOYA 3SLCA 1ATNA 2I7NA 4CZGA 1QQNA 4B1UB 4BRPA 2NLXA 4WQ5C 1GLLO 3G25A 5BRDA 4BRKA 1K8KA 2P9UA 5AQGA 3WEEA 3WQUA 1NWKA 4FO0A 1BWFO 1BUPA 1H1VA 1NMDA 5AQKA 5KQ8A 4A2AA 4M7YA 1HKCA 1NGIA 2P9KA 4FOIA 2CGJA 2D1KA 4EHTA 5FPMA 3FZFA 1Y64A 3HSCA 3O5BA 4FWSA 5TKYA 4MLHA 3SK3A 3LM2A 4BC5A 4FWLA 4H03B 4XEIA 2Q36A 2PAVA 3LL3A 4BRIA 2ITMA 3B8AX 1T6DA 3U8XA 3MDQA 3CETA 3MMVA 4BR5A 5ADXH 1LOTB 5KPRA 4BRMA 3SMPA 2FF3B 4BVPA 4FWPA 3MCPA 4RWTA 3VGMA 1BO5O 3RSEB 3I8BA 4FOEA 5AFUH 3HI0A 3QFUA 3WXIA 1RDWX 4BG8A 4CD3A 5FPDA 5AZJA 3MN5A 2BTFA 5AQTA 3CJ1A 2P9NB 4H0XB 2AP1A 2GUPA 2QWPA 4FWQA 1XC3A 1MA9B 2UYTA 1QHAA 2QXLA 3J8AA 5EXWA 3CJ7A 4LC9B 5KPTA 1V4TA 5EX5A 4WQ4A 4BGAA 2P9SA 4RTFD 5JLHA 5LJVA 2GWKA 3CIPA 3DXMB 1ZC6A 3A5NC 4ISFA 4JD2B 4I6MB 2V51B 2P9IB 3SJHA 1J6ZA 5AQWA 4QS8A 2HOEA 2VWBA 2WUSA 4XH5A 2E1ZA 1QQMA 2AA4A 3TU5A 4CZMA 1JCEA 4PKHA 5AQYA 4Z94A 5BREA 3D2EB 2QWLA 4IWVA 1YAGA 2Q97A 5EY4A 5BR9A 3U4LA 3BF3A 4EAHD 1KXPA 5ELZA 1WUAA 1QZ5A 3CJBA 3ATUA 2VCPA 3QDKA 3CQYA 1E4GT 1HKGA 3HZ6A 1E4FT 4BGBA 2YHWA 4PKGA 4JHDA 2H3GX 3W3DA 1ZXOA 4BR9A 3D7EO 2IVNA 2E2OA 4QS9A 3H46O 3CJAA 1BOTO 4CZFA 3EO3A 4FWOA 4H0OA 4BRAA 2DPNA 4A2BA 4JN4A 2A3ZA 2A41A 4BRCA 5BPMA 2D4WA 2PBDA 4FWNA 4O5FA 5AQMA 4EFHA 3CHWA 2P9PA 4BRQA 3FR0A 2E2QA 4ISEA 3O1BA 5F0XA 1JCFA 2CGLA 3A5MC 3UKUB 4A61A 2QM1A 1IJJA 3MK6A 1U2VB 1HUXA 1GLJO 2ZWHA 4H5WA 3GL1A 1HPMA 4H5VA 2IVOA 3LDNA 3S41A 3VEWA 3F9MA 5AZIA 3DAWA 4JAXA 1X3MA 5BN8A 2IIRA 2Q1NA 4CBXA 1ATSA 4HWIA 3UKRA 3KVGA 5AQOA 1YXQA 2FLOA 4Y0WA 1TYQB 4AM6A 2YCHA 3VOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQEA 4Z4IA 5AQQA 4C8OA 4U67L 3AVIA 2VQEK 1J54A 2V52B 2HHVA 3MXIA 3BEXA 4K25A 1KVBA 1RNHA 4XH4A 4CF1A 3DXKB 3C7NA 1C1AA 4BRFA 2HVHA 1XHXA 2G8KA 3DLGA 1RBUA 1JCGA 3OVNA 4EIAA 3ULDA 3FFIA 1IKYA 1JLEA 4JKFA 3J7AP 4BR2A 1VRTA 2CH5A 4E19A 4FZZA 4UQGA 3TTCA 3RR7A 1K8KB 1YF5L 1TAQA 1C0FA 3J7ZO 1GLEG 4DV6K 3ZT3A 4CEAA 3T19A 4CHQA 2F9WA 4JKAA 3CM5A 1HRHA 3IDHA 1HKBA 4JI3K 1HJOA 3FZKA 3AO5A 3O9TA 1IBMK 1HYVA 2UUCK 4I6MA 5AQFA 2Q31A 2IGIA 4CJKA 1S1UA 3CYGA 4CFAA 1U4BA 3PLAA 3WQTA 3NGYA 1NGFA 1WOQA 3DYAA 4OGEA 4YOTA 3CCJN 4FSVA 4CGDA 5AQIA 2E88A 4DFKA 3R6MA 3OYGA 3M5RA 5BPLA 4FJ9A 2YHBA 3TAMA 1ASVA 3BDPA 5AZJB 3T7ZA 1RDAA 4KHQA 2O8EB 3THWA 4EP4A 5AQUA 3HPHA 4RCHA 4JKBA 3PO4A 1LW2A 1B9FA 4DTUA 1A5WA 1NGEA 1IG8A 4B1WB 1TKZA 4H5NA 4MLEA 1P8ZA 4F2SA 4CF0A 3EZ5A 1X9WA 4IDKA 2GX9A 1NKCA 1MWMA 3QIOA 4H5TA 5JICA 3LPUA 4AHUA 3FZHA 1VQPN 1YITN 3OJUA 3BF1A 3E66A 2O8CA 2ZD1A 3PUFA 3CJCA 5CR4A 3VTHA 2QXFA 3AVNA 3DRSA 1TYQA 2E5LK 3CFPA 4X65K 3VQCA 4M3RA 4KHUA 3T1YK 3PO5A 2HSTA 2HNZA 4B08A 1NK9A 1WB9A 1YJNN 3EKUA 5AQZA 3RMCA 2X74A 2ZJQL 1U47A 3TABA 1XUPO 2EHGA 3TTFA 5CHIA 1D9DA 3O9SA 4DSIA 1QVGM 4Z0UA 3MX2A 2P9PB 3MN6A 2F9TA 1JXBA 2QWOA 4J2EA 3MAQA 3MWTA 4B9UA 2BGGA 3NVMA 4CJFA 5AZIB 5FPEA 2IC3A 3DRPA 2UUAK 3OYFA 2HBMA 1VQKN 3LZIA 2YI1A 3RSEA 3I56N 1T44A 2QEXN 3W0LA 4CHZA 3KK7A 4G9ZA 1TK5A 1HNXK 3O8MA 4BE2A 3SCXA 4BVOA 1EETA 4ILJA 3FE1A 4OKJA 3L8BA 3HRGA 3WXLA 4FJMA 3OYLA 2X78A 4A5AA 4FL9A 3OYCA 3DXMA 4B9VA 1YUWA 2KHOA 1OH5A 3QFPA 1TKTA 4ELVA 3MN9A 1RBTA 4C8KA 3HM9A 4AHRA 5KGWA 4DR4K 5DM7L 3ZLJA 4FJHA 1V4SA 3THXB 1TUUA 2Y1IA 2Z1GA 3A5OC 1BQMA 2ZGYA 4DTOA 4E7KA 3A5LC 1JL2A 2ASPA 4X66K 3FZLA 3BP8A 2YHXA 1IO2A 4B1ZA 4CFDA 3CPWM 3VA0A 4CZHA 4BRLA 3C6TA 3AA4A 5AQXA 3ZSQA 3H3OB 2WC9A 4OPAA 3K5LA 4HTLA 1GLBG 1BA1A 3DLKA 3ITHA 2QWQA 2Q2RA 4GKKK 3IFRA 1RDBA 4CW7B 4LF7K 3UKUA 3RR8A 1BHLA 5M1NA 5BPNA 2RN2A 4RW4A 3RMDA 2UXDK 1ASUA 3KLFA 4OLAA 3CI5A 4M3TA 3KK2A 2OANA 2GTDA 4YORA 3U3GA 3ISNC 4CZKA 3SBGA 5J2QA 5JS2A 4CF2A 1S72N 4O5BA 3SPYA 1X1PA 3OYNA 4LF8K 3PIPL 4W5RA 4DR3K 5AQPA 2NRHA 1MDUB 4GNIA 2ZJPL 4DTMA 3QBWA 3R9PA 3VQAA 4B8AB 5KPZA 1VQLN 3VQ6A 3T1HK 4FYDA 1NK4A 1BA0A 4B9MA 4KH6A 1QS4A 4O8UA 3L2WA 3EYZA 3P31A 3VEXA 3O80A 3U9ZA 4M7XA 3VQ4A 1K6YA 1VSDA 4FM2A 3HOTA 5J2PA 2A42A 3DXKA 4FLTA 2E6MA 4PQUA 3LDOA 1XHZA 3H3NO 3HYFA 4FJ7A 3SLCA 1QHTA 1W97L 4CGJA 4HUEA 3G25A 5BRDA 4BRKA 1TL3A 1K8KA 2C1IA 2DFFA 5AQKA 1SL1A 1NJWA 5KQ8A 3SQ0A 3CCSN 3DLRA 4AHSA 4GKJK 4F3TA 2CGJA 1T8EA 4DTJA 2HW3A 1J5EK 1Y64A 3PX6A 4MLHA 2XY5A 3LM2A 4BC5A 3PX0A 4FWLA 4H03B 4XEIA 4BWMA 2Q36A 3VA3A 3AA3A 1Z26A 3QLHA 3LP3A 3AVGA 3MMVA 3CETA 5KPRA 1D9FA 1S1TA 2QA4N 2FF3B 1C6VA 2P5GA 1VSKA 1SKWA 3VGMA 3G6EN 3AVCA 2QI2A 3HI0A 4YOUA 3VMFB 3CFRA 4DR6K 1RT2A 4Y1DA 1UAXA 5FPDA 2OYQA 5AZJA 4DS5A 2WFBA 5AQTA 2HBKA 3CJ1A 4LH4A 2OA8A 2O8EA 1IKVA 1S6QA 4I9QA 4G1QA 4LSLA 2QWPA 4FWQA 1XC3A 4W5NA 2VG5A 2UYTA 2NRTA 1U45A 4DLGA 1S1VA 3CJ7A 5KPTA 5EX5A 4WQ4A 3F73A 5GAGP 3S9HA 1Q9YA 3PV8A 1IG9A 1QSSA 4LD0A 4CEDA 3OYKA 4I6MB 1J6ZA 2HOEA 1OVYA 1DLOA 3RTVA 3KLIA 4KO0A 4DSKA 4CJ4A 3SQ2A 4JKDA 4LF4K 4CZMA 1JCEA 1KTQA 4Z94A 2KW4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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