2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
3QMLA 3QICA 5LY3A 3BF3A 1QZ5A 5AR0A 2GEMA 2W40A 3HTVA 4FWNA 5ELZA 4WQ4C 2KHOA 4K25A 3AY9A 3L0QA 5AFUH 4AM6A 3GDQA 3WXJA 5LJVA 3MCPA 4BGBA 3DAWA 4MO5A 2CGLA 5AQSA 1HLUA 4A61A 1IG8A 4EFHA 3QB0A 3GL1A 4PKGA 3D2FB 4BC3A 3VEXA 4BC5A 3ID8A 1QHAA 2GTDA 3GBTA 2D0PA 2Q0UA 3D7EO 2P9SA 3VGLA 4BQLA 1TUUA 3FZLA 2FSNA 4BRGA 1R59O 3ATUA 2FLOA 2Q2RA 2FSKA 5AQUA 3VPZA 4BRKA 1GLAG 2YHYA 3BUZB 4B9QA 1ZC6A 3D2EB 3QBWA 1SAZA 5BPNA 4WYBA 1MWKA 4BRHA 3KHYA 3I8BA 3O1WA 5ADXH 2QWQA 4CBWA 4EHUA 1NGDA 2V7ZA 3O5BA 1H1VA 5BREA 1Q18A 3WQTA 3LDQA 3ZETB 3LDLA 3WXIA 3FFKB 3CJ7A 1T6DA 1NGHA 4H5RA 4JAXA 3P4IA 4B1UB 1YVNA 4FWKA 3WEEA 2P9KB 4XEIA 3C0BA 3IUCA 5BRHA 1U6ZA 4H0OA 5KPRA 4RTFD 3AARA 3M3ZA 1T6CA 1BA1A 1BO5O 4BG8A 1X3MA 2D4WA 5AQTA 4JN4A 3EL2A 3TU5A 4CI6A 4CZLA 1SZ2A 3VEWA 3FZHA 1NGBA 3BEXA 3VENA 3A5NC 5AQYA 3EN9A 4JHDA 1NMDA 1GLJO 1NGFA 3QFUA 1NGAA 3FE1A 3LL3A 4BVOA 4PL7A 2EWSA 3MN7A 3DXMB 1U2VA 3H6EA 3IDHA 4MLHA 1X3NA 5AQZA 4BC2A 4H0YB 5BPMA 1CZAN 1E4GT 2NRHA 1BU6O 1NLVA 2CH5A 4BRIA 2QWRA 4DCHA 3LM9A 3CJBA 1ZXOA 3U8XA 1Y64A 2FSJA 2Q97A 2A41A 3GE1A 5FPDA 4B1YB 5AQXA 3WXLA 1BG3A 2Q1NA 3MN9A 5LJWA 3HBTA 1BOTO 3HI0A 3RSEB 3CJ1A 4BRDA 1KAXA 4A2BA 4BGAA 3DXMA 1Z6RA 5AZIA 2BUPA 1YUWA 3VOVA 1HJOA 2AP1A 1T44A 2F9TA 5AZJA 2GUPA 1GLFO 2V52B 3TPQA 3CI5A 2QM1A 2YJFA 3MN5A 2AA4A 4PKIA 3ULEB 4EHTA 4Z94A 3VERA 3WQUA 1E4FT 2Q36A 3VEVA 3C7NB 4LC9B 3CQXA 3EO3A 4IJNA 4XH1A 2DPNA 3ZEUB 4H0TB 1KXPA 2E8AA 2J4RA 3KVGA 5JICA 3IMXA 3UB5A 3M1FA 1XQSC 3EKSA 4B1VA 4M7XA 2I7NA 3DJCA 4Y0WA 4FOEA 4H5NA 4BR4A 1QQNA 4NB4A 3M6GA 5AQNA 3U9DA 4F9OA 4DHYA 3FLCO 3UE5A 3CJAA 4MLEA 3H45C 3VESA 2HMPA 3LDNA 3ULEA 1HPMA 3A5OC 1KAZA 4KBOA 3SLCA 5BN8A 4FL9A 5F1XA 5ADXA 4CZEA 1C0GA 2WUSA 3O1BA 3C7NA 1C0FA 2NZTA 5CE3A 3FR0A 3MN6A 2E20A 2ASPA 2Q31A 3SMSA 3H3OB 3ZEUA 1QQOA 1Z05A 4H0VB 3VGKA 3SK3A 3R8EA 2HF3A 4FWLA 5AQIA 4M7YA 4FOIA 3QDKA 3EKUA 5AQLA 5FPMA 2QW9A 3CETA 3HZ6A 3EZWA 3MK6A 3HSCA 2YCHA 1HUXA 2VCPA 3D2FA 4BREA 4ISEA 2E2PA 2HF4A 3ENHA 3QFPA 1NM1A 5KQDA 1ZBSA 5EX5A 2ITMA 1ATRA 4BR5A 3F9MA 4GNIA 3L6QA 5AQJA 5F0XA 4NO7A 5KPZA 4O8KA 2A3ZA 2A40A 1GLCG 2P9NB 5AQQA 4H0XB 4C23A 5E84A 4EAHD 1NGEA 5BN9A 3G25A 3D2EA 2D1KA 1OKJA 3LDOA 4L3QA 3CERA 4BQZA 2IVNA 4BR2A 2ZGYA 4I6MB 2Q0RA 1K8KB 4FWSA 4O5FA 4FWMA 3DWLA 3WXKA 2BTFA 3DXKB 4FPBA 2W41A 5AQFA 4BG9A 4B1ZA 1NBWA 2E88A 3UKUB 3BP8A 3CJ9A 4BROA 4CZFA 3CHWA 3ZETA 5JLFA 1HX1A 3A0IX 4JNEA 3SJHA 2P9UB 2A42A 2P9KA 4CZKA 2A6AA 5B8HA 4JD2B 4FWRA 1TYQB 4FSVA 4YDUA 4AM7A 5BR9A 2H3GX 1GLEG 1K8KA 3J8AA 1S3XA 1YXQA 3DXKA 3FZFA 1SQKA 1RDWX 5FPEA 3UKUA 1QQMA 4ISGA 4B1WB 4CZIA 2VWBA 1RFQA 2PBDA 2ZGZA 1MDUB 3H1VX 5AQGA 4BR7A 2YJEA 5AFUA 3ATVA 2P9LB 2P9UA 2ASOA 1G99A 4PKHA 2E2OA 5TKYA 4WQ5A 5AQWA 2YI1A 4IXCA 1DKGD 2FF3B 2V51B 2FF6A 4JD2A 3W3DA 3VETA 1BDGA 1NGGA 2CGKA 3JXUA 2A5XA 3VEYA 1LOTB 3WT0A 5AQPA 1DEJA 3ZX2A 1D4XA 3MMVA 1NGJA 5JLHA 3FZKA 3RSEA 4FO0A 2QWNA 5AQMA 4QS8A 4BC4A 4QS9A 2OANA 4H5TA 3IFRA 4BRCA 3O80A 5BRFA 1JCFA 1GLDG 1QZ6A 2P9SB 1BWFO 2ZF5O 3U4LA 3A5LC 4XH5A 4FWPA 4BRNA 3GG4A 4M63C 1ESVA 4H03B 1V4TA 4J8FA 2QWLA 4BRLA 4FPAA 4H5VA 3VEOA 2NLXA 2ASMA 1GLBG 3KZBA 3L4IA 4RCHA 1BUPA 2E1ZA 2GWKA 3CJCA 1X9JA 2CGJA 1J6ZA 1XUPO 3VGMA 4QS7A 1XC3A 3I33A 3ZX3A 3B8AX 4ISFA 4IO8A 2YHXA 4IZ9A 5KQ8A 1BA0A 3WUHA 1WOQA 5EXWA 4E1JA 2D0OA 2YHWA 4GY2B 1LCUA 1HKBA 3S41A 3AAPA 4MO4A 4CZGA 4WQ4A 4EIAA 3R6MA 5I9EB 1MWMA 3JS6A 2V7YA 1HKCA 4FWOA 3ENOA 3WEEB 4HTLA 4BR0A 1GLLO 1P8ZA 2E2NA 1TUYA 4BR9A 5KPTA 1YAGA 5AQKA 3VF2A 2QWPA 4K43A 3AAQA 4K41A 2I7PA 3QBXA 3O8MA 3O6WA 5AQRA 4CZHA 3O08A 3HM8A 1RGIA 2CH6A 4B1XB 4BRFA 4YDUC 2E1YA 3LM2A 2QWMA 4CZJA 2E2QA 3W0LA 4CBUA 1EQYA 3R9PA 4JHDB 2ZWHA 2IVPA 1DGKN 1U2VB 1ATNA 3UKRB 2IIRA 5AQHA 1NGIA 5EOYA 2QXLA 3CIPA 1JCGA 4FWQA 2P9NA 3VF4A 4PL8A 1IJJA 1KAYA 5AQVA 3BF1A 4WQ5C 3ZX0A 4DQ8A 2P9PB 4XH4A 4I6MA 5AQOA 3VF6A 4BRQA 4H5WA 4CD1A 4A62A 3U9ZA 4H0PA 3SMPA 2QWOA 3FZMA 2HOEA 3UKRA 5AZIB 5E26A 2F9WA 5EY4A 3VEZA 2IVOA 2P9IB 4CZMA 2GELA 3GOIA 5AZJB 1NWKA 4RWTA 1ATSA 1V4SA 4IJAA 5EVZA 5FPNA 4CBXA 3CQYA 4BVPA 4DB3A 1WUAA 4BRPA 2VYPA 4K42A 2UYTA 3H1QA 3A8YA 4IWVA 3H3NO 3A5MC 4BRAA 1S22A 3O4WA 1TYQA 2P9PA 5BRDA 2GWJA 4CJ7A 1MA9B 2FXUA 2PAVA 5F2RA 3OHRA 5BPLA 3FGUA 1JCEA 3H46O 5JMVA 2P9IA 3LDPA 3MDQA 1HKGA 4BRMA 1NGCA 4CD3A 4A2AA 4HWIA 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BF3A 4DUYK 3AO2A 5J2MA 5D3GA 1B9DA 5ELZA 4LF6K 1Z25A 3AY9A 4E3SA 3L0QA 5AFUH 5C24A 3P39A 4CFDA 2BDPA 2IOCA 3MCPA 4OPAA 1HLUA 1OH6A 3L3UA 3O9QA 3QB0A 3C95A 4F2SA 4CGGA 1U48A 4PKGA 3HRGA 4RW9A 5CZ1A 5HRNA 1WSIA 3OYFA 4JV5K 3WNFA 4BC5A 4CJWA 2Q0UA 3D7EO 4NCGA 3VGLA 1HQUA 3SBTA 3QEPA 3LPUA 2GUIA 2ZD1A 2RF2A 2NRTA 4BQLA 1IV0A 4DV7K 1TUUA 3I8DA 3AO5A 2OZMA 2Q2RA 3NHGA 3ZLJA 4BRKA 3VQPA 4HUFA 4B9QA 1GOAA 3D2EB 3I0RA 5BPNA 1YITN 4WYBA 2HBKA 4BRHA 3I8BA 5ADXH 2HNYA 2YV0X 1ASVA 3O3GA 4KO0A 3HP9A 4CBWA 4EHUA 2V7ZA 2KKZA 5BREA 1Q18A 3LDQA 4I2QA 3OYCA 1FJGK 3CJ7A 1T6DA 1UWBA 3CMAN 1YVNA 1VRTA 4FWKA 1T8EA 2W6LA 3NGYA 1D9FA 3E9LA 2KLAA 2RHKA 1U6ZA 5KPRA 4RTFD 1JKHA 4LFAK 3NGZA 1D9DA 4KTZA 3G4SN 1WBBA 3O9UA 3NH0A 1SL1A 2VQEK 1O13A 2VG5A 4CI6A 1SZ2A 3VEWA 4IDHA 4DFKA 4CGDA 3PO5A 3G6EN 1U49A 4CF2A 1ZBFA 4FJIA 1NGFA 1YTAA 1MU2A 4PL7A 3O3FA 3RMAA 1HNZK 2YKNA 4E1MA 3MN7A 2RN2A 5J2PA 1U2VA 3EE8A 3H6EA 1WAFA 4DS4A 4LSNA 4K8XA 2NRHA 3RVCA 1NLVA 4DCHA 4CECA 3U8XA 3J81O 4CEBA 2HHVA 2PY5A 2FSJA 4KHSA 1S1XA 2A41A 2OA8A 2XY5A 4B1YB 4F4KA 1VQ7N 1QHTA 4M3XA 1SUQA 4DR3K 2DY4A 2W00A 4DSEA 2VWKA 1VSKA 4A2BA 4DSIA 2E6MA 1NK5A 3SAFA 4NLCA 1N5YA 4N5SA 2GUPA 4CHYA 4LD0A 3TPQA 3CI5A 2W6KA 4N41A 3O9TA 2YJFA 4EHTA 1S5JA 4ZHRA 2GX9A 3VQCA 3VEVA 3CQXA 1HNIA 1VSDA 4GW6A 3NVKA 4IFYA 1VQMN 4XH1A 3M8QA 1KXPA 1NJXA 4G1QA 4B8AB 3M1FA 2Z1HA 3EKSA 1D5AA 4GKKK 5HL7L 3KIOA 1NJWA 1QQNA 2D0CA 5DM7L 1NOYA 1VHXA 3O9RA 4DHYA 3CJAA 4H4OA 4JI5K 4FLZA 1S1VA 2HMPA 2VGMA 3ULEA 1HPMA 1KAZA 4FL9A 3O1BA 3C7NA 1C0FA 2OPQA 4DR2K 4GMJB 4K0KK 4CHZA 3SMSA 3H3OB 1YT3A 5CZ2A 3VGKA 2HF3A 5AQIA 3AO3A 4J2AA 5FPMA 1VSIA 3EYZA 4CJ5A 1RTHA 1HUXA 3VQDA 1NK9A 4JS4A 3NF6A 2X74A 4H8KA 4CF1A 1NM1A 4HCCA 4N76A 1C1AA 3MEEA 3OYEA 1HNXK 5AQJA 5GAHP 3SV4A 3ZSZA 5KPZA 1Q9XA 2HBMA 1X9MA 2A40A 1GLCG 1XWLA 2O8CB 5AQQA 4C8MA 5E84A 2OPPA 5BN9A 3G25A 3D2EA 3P31A 4L3QA 4YOWA 4DMNA 2IVNA 4BR2A 2ZGYA 1RDUA 3PV8A 4O5FA 4FWMA 3DWLA 4BG9A 4X66K 3AVGA 3QNNA 4FM2A 3IS9A 1NBWA 4O55A 2E88A 3UKUB 3BP8A 3J7AP 4AHVA 3I55N 3SJHA 3SJJA 2WC9A 4X65K 4YNQA 1WBDA 5C0YA 4E19A 3AVLA 3TSPA 3SUQA 2HW3A 3THXB 1A5XA 4FSVA 4YDUA 5J2QA 5BR9A 4DFPA 1GLEG 1C0UA 3VQ4A 4AHUA 3TAPA 1S3XA 4ZTJA 4ILHA 3HL8A 4TSXA 1RDWX 1C1BA 1QQMA 1VQPN 3NH1A 4ILGB 2XY6A 3WXMB 3AVCA 3V9WA 4BR7A 3D45A 4PKHA 3LZIA 1TL3A 1HR0K 3VQ5A 4NCAA 2PZSA 4XIUA 4DV5K 5AQWA 1DKGD 3WNGA 3LP3A 1NGGA 4PA1A 2CGKA 3JXUA 2HVHA 2IAJA 1LOTB 1DEJA 4KHNA 1NGJA 2QWNA 4CJUA 1ZBUA 5HRSA 1M90O 5C2FA 3OVNA 3TAGA 1K6YA 4BRCA 1VQON 2Y1JA 1N34K 1GLDG 2ZF5O 1Q81O 2UUAK 4XH5A 4N56A 3V6DA 4OGCA 4J8FA 4AILC 2QWLA 4Q0BA 4FPAA 4FM0A 3KZBA 1GLBG 4N47A 4RCHA 5CHIA 3V1RA 4FZZA 2BE2A 5AJ3K 1X9JA 2CGJA 4CERA 1VQ5N 4YOVA 2ZQBA 3VGMA 3HPOA 3O9SA 4I9LA 2QK9A 1BA0A 3M5RA 1N32K 5C42A 1WOQA 4E1JA 3HOSA 3DOKA 2WTUA 4EP5A 4IG0A 4EIAA 3AVIA 5I9EB 3LAKA 4HCBA 4NYFA 4FWOA 4ZTFA 1GLLO 1P8ZA 3D0PA 2YHAA 3VF2A 1RT5A 5DM6L 3A2FA 1VQ8N 4DV3K 3RRGA 3O8MA 3VA0A 4CZHA 3LWLA 5LMUK 2CH6A 3TTCA 4B1XB 3CM5A 4BRFA 5GAGP 1EQYA 3R9PA 4JHDB 2ZJRL 1DGKN 3UKRB 1ATNA 4JKGA 1L5UA 4JI6K 1O1WA 4R5PA 1JCGA 1T03A 3AO1A 4L8RB 1IJJA 3HK2A 1KAYA 5AQVA 3FFIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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