2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
1BA1A 4BRKA 4DB3A 5BRDA 3UKRA 2PAVA 4EHUA 1CZAN 3M1FA 3VOVA 4B1UB 3CHWA 2P9IA 4RWTA 3D2EB 2YHXA 1EQYA 5JLHA 1HPMA 3GOIA 1XUPO 5AQRA 4BC3A 2CGKA 4PKIA 4AM6A 2HF3A 4NO7A 1YVNA 5E26A 3H1QA 2YCHA 1BWFO 1IJJA 3LDQA 2A41A 4H0YB 4B1XB 3CJBA 3FZLA 3I33A 2P9KA 3A5OC 3U9ZA 2NZTA 4XH5A 3DXMB 5LJVA 1U2VA 4FO0A 4ISGA 4CZLA 2NLXA 3RSEA 1D4XA 3CQYA 4EHTA 2IVNA 3EN9A 2ZF5O 3DXKB 2Q97A 2QWLA 4H0XB 1NGEA 5EX5A 2E1ZA 5EVZA 4H03B 2E1YA 3HZ6A 3HBTA 5AZJB 4JN4A 3BF3A 5EOYA 1HLUA 2BTFA 2OANA 2E2OA 3S41A 1GLFO 1T6DA 1DKGD 4MLEA 4BQZA 2QWRA 4FWPA 5AR0A 2GUPA 3CQXA 4HTLA 2AP1A 1GLJO 4K43A 1JCGA 1TYQA 3VEZA 2FLOA 3TU5A 1YUWA 5ADXA 3GE1A 1BA0A 1GLBG 4QS7A 3ZEUB 3KHYA 3AAQA 4BGAA 3DJCA 1SZ2A 4CD3A 5KPTA 3F9MA 3A5MC 4PKGA 2QWMA 5AZIB 4CJ7A 4H5VA 3FZKA 2QM1A 5BPNA 3B8AX 2VYPA 2E2NA 3CJ9A 4A2BA 4MO4A 3CJCA 3VETA 1QQMA 5LJWA 4FWLA 3HSCA 1ZBSA 1NWKA 2ASOA 3J8AA 4CI6A 3D2EA 4LC9B 1QZ6A 2IVPA 5BPLA 3C7NB 3MN9A 3O1BA 3VEXA 1LOTB 3HI0A 3HTVA 1S22A 3FGUA 1BUPA 2AA4A 5AQMA 4H0VB 3R6MA 4BC2A 3DXMA 2P9LA 3W0LA 4CZJA 4DQ8A 2FSJA 1GLLO 4BRMA 1T44A 4CZMA 1X9JA 4B1VA 2GELA 4BR2A 1Y64A 3H3OB 1XC3A 3VGLA 3BUZB 1ATNA 2CH6A 1QHAA 3DXKA 3A5LC 3LDNA 3WQTA 3JXUA 4FWQA 4FPAA 4FL9A 4PL7A 1S3XA 1MWKA 4Y0WA 5AZJA 4O5FA 2Q0RA 4FSVA 4IWVA 1Z6RA 1NGGA 2ITMA 4ISEA 3L4IA 3CJAA 2IIRA 1HKBA 1U6ZA 4BVPA 4QS9A 3MN7A 3W3DA 3U9DA 3L0QA 3ZEUA 4XH4A 3HM8A 1HX1A 4CZEA 1KAXA 2WUSA 4JD2B 3VESA 1BOTO 3MN5A 3VEOA 3ZX0A 3UKUA 3EL2A 1NMDA 3ENOA 3ZETB 3EKSA 4BR4A 4F9OA 2YJFA 1E4GT 3CETA 2P9UA 4XH1A 4BGBA 4BR7A 1G99A 2E20A 3MDQA 5AFUA 4JNEA 4BG8A 4WQ4A 3CIPA 3O80A 5AQYA 2A5XA 4I6MB 4B1YB 1NGIA 1P8ZA 4FOIA 1GLAG 4AM7A 4IXCA 5AQXA 5JMVA 3MMVA 4WQ4C 5F2RA 3CI5A 2P9SB 3L6QA 4BR0A 2VWBA 1NGJA 1BG3A 1NLVA 3A8YA 3CERA 2DPNA 4K42A 3MN6A 3WEEB 4H5RA 2A42A 1NGDA 1TUYA 3H45C 5FPNA 4BRLA 1NGAA 5KQDA 5AQTA 4E1JA 3AAPA 2J4RA 3GDQA 3VPZA 4A2AA 4J8FA 2UYTA 3P4IA 4BRCA 2D0PA 5BREA 4PKHA 4FWMA 2V52B 2VCPA 3U8XA 3UE5A 5F1XA 4A62A 1Z05A 2V7ZA 4KBOA 1KAZA 1C0GA 3R8EA 3D2FB 4H5NA 1MA9B 1NM1A 4CZGA 1E4FT 2FF3B 4BRGA 1QQOA 2QWQA 4BRDA 2GWJA 3VF2A 2FF6A 3O6WA 2P9IB 3FZMA 4DCHA 2W40A 1GLEG 4BQLA 1GLCG 3O8MA 3WUHA 2EWSA 2ZWHA 3M6GA 1BU6O 5TKYA 5JLFA 3QICA 4HWIA 1DEJA 2ASPA 4H0OA 4B1ZA 2P9NB 4JD2A 1BDGA 3GL1A 3WXLA 3IDHA 4H0PA 2ASMA 4BG9A 4CZFA 3FZFA 3FZHA 3VF6A 2GWKA 1K8KB 3ID8A 1GLDG 5BN8A 1ZC6A 2PBDA 4BRQA 3QBWA 1V4TA 4BVOA 5AQQA 3VGMA 1NGHA 2FSKA 4FWRA 4MLHA 2YHWA 3VENA 4IJAA 4I6MA 3I8BA 1DGKN 1MDUB 4MO5A 3UB5A 3GG4A 3CJ1A 1R59O 3LM9A 1ZXOA 2H3GX 1J6ZA 4NB4A 2P9SA 2E88A 3ULEB 3JS6A 1JCFA 2V51B 4RTFD 4BRFA 1KAYA 2QWPA 3QFPA 5AQKA 4BRPA 3WQUA 5KQ8A 3A0IX 4K25A 3WEEA 3IUCA 4CZIA 3WXJA 3GBTA 5F0XA 1WOQA 5AQFA 2QWNA 1TYQB 3FFKB 4CBUA 1HUXA 3MK6A 3QB0A 1JCEA 4M63C 1NGCA 5EY4A 5AQWA 4BR5A 3CJ7A 3AARA 2CGJA 4B1WB 1NBWA 2ZGYA 3VF4A 5AZIA 5AQGA 4FWOA 1H1VA 1SQKA 2GTDA 3BP8A 3A5NC 3QBXA 1LCUA 3ATVA 3D2FA 3H46O 4FWKA 4IJNA 3O4WA 3ZX3A 2HOEA 4M7XA 4QS8A 4DHYA 2I7NA 4B9QA 2HMPA 4K41A 4Z94A 3VEWA 1BO5O 2ZGZA 3O1WA 3SMSA 2CH5A 3VEYA 4JHDB 5AFUH 4O8KA 5KPRA 4FOEA 1QQNA 3QDKA 2FXUA 3C7NA 1OKJA 2P9NA 2Q2RA 5E84A 5BRFA 3ZX2A 2D4WA 2BUPA 1X3NA 2E2PA 4L3QA 4WQ5A 5AQSA 5KPZA 2P9LB 1XQSC 5ELZA 2A6AA 4JAXA 2IVOA 4WQ5C 5BPMA 2A3ZA 1NGFA 5AQJA 2I7PA 3QFUA 1KXPA 1K8KA 4CBXA 3M3ZA 1MWMA 2P9PB 4GNIA 3MCPA 3IMXA 3QMLA 1X3MA 2KHOA 3OHRA 4CD1A 2FSNA 5I9EB 3H3NO 3KVGA 5ADXH 4YDUA 1HKCA 3ULEA 1RFQA 3D7EO 4FWNA 3SK3A 5AQZA 2NRHA 4YDUC 2W41A 3SJHA 2Q1NA 4H5WA 5AQNA 3U4LA 4BREA 2YJEA 2QXLA 3UKRB 4XEIA 3FR0A 3SMPA 2YI1A 1ATRA 4IO8A 3WXKA 4BRHA 4H0TB 1ESVA 5BN9A 2F9TA 3H1VX 2Q31A 1RGIA 3LM2A 1HKGA 3VEVA 2A40A 5EXWA 4BR9A 5FPDA 5FPEA 3IFRA 5BR9A 2Q0UA 2YHYA 3UKUB 5AQLA 1SAZA 1V4SA 3DAWA 3H6EA 3G25A 4EIAA 3R9PA 3TPQA 2P9KB 5B8HA 1NGBA 1C0FA 3VERA 5AQUA 1WUAA 1YAGA 2E2QA 3ZETA 3EKUA 2P9UB 4A61A 1U2VB 4M7YA 1YXQA 3C0BA 3EZWA 3RSEB 1Q18A 4ISFA 1RDWX 2F9WA 3BF1A 4CZKA 4C23A 2HF4A 5AQHA 5CE3A 4BRIA 3FLCO 2QW9A 3FE1A 4JHDA 4WYBA 4CZHA 3LL3A 3LDPA 3SLCA 5FPMA 3WT0A 1ATSA 2CGLA 5AQIA 3O08A 3KZBA 5BRHA 4FWSA 4BRNA 4EAHD 2Q36A 4FPBA 4RCHA 5LY3A 4BROA 3WXIA 3BEXA 4BC5A 5AQPA 5AQOA 2V7YA 3AY9A 2P9PA 1QZ5A 2D1KA 5AQVA 3LDOA 4BC4A 3O5BA 5JICA 3ENHA 2D0OA 4H5TA 4IZ9A 3DWLA 2QWOA 1IG8A 1HJOA 4CBWA 2GEMA 4GY2B 4EFHA 1T6CA 3ATUA 3VGKA 1TUUA 3LDLA 3EO3A 2E8AA 4PL8A 4BRAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E89A 4CGGA 3QIOA 3QEVA 2OPQA 4CF9A 4LFBK 4FJIA 4EHUA 5JVGL 1O13A 3AVMA 3G6EN 1CZBA 4CIFA 4FLTA 1BCOA 5JLHA 2P51A 4DUYK 4KH6A 1XUPO 4BC3A 2HF3A 3O9UA 2HB5A 3HXMA 3LPTA 1BWFO 1Q8IA 2HNYA 4FYDA 2A41A 4IBNA 1RBTA 3CJBA 3FZLA 2P9KA 3U9ZA 4DF8A 3QETA 2OA8A 2W6LA 2NLXA 3RSEA 2EX3A 4EHTA 2R7YA 1EWQA 2ZF5O 3DXKB 2Q97A 3QIPA 3WNHA 4FJXA 4DR6K 4FLUA 3K2PA 2O4IA 5EVZA 4H03B 4DTRA 3HZ6A 1WSEA 1XNQK 3T1AA 5CZ2A 4CE9A 1T6DA 4JI2K 5CHIA 1XWLA 4MLEA 4BQZA 2ZJRL 4BE0A 5AR0A 2GUPA 1N5YA 3CQXA 2QEXN 4HTLA 1TKTA 1TYQA 5ADXA 3ID6A 3GE1A 1BA0A 2O4GA 3AAQA 3KHYA 4BGAA 3ZYYX 4YORA 3CMEN 1FJGK 3OYLA 2QM1A 5BPNA 3NMUA 3B8AX 3NVKA 1RDUA 3N4PA 4OKEA 4KH4A 3E1YA 4WF9L 4NCBA 5LMUK 3K5LA 5LJWA 3HSCA 1KVBA 4DU3A 3P39A 4WCEL 1TKXA 4NLCA 3T3FA 1QZ6A 3ULDA 4FK4A 1FK9A 3O1BA 3RMDA 3BZCA 4AQYK 3HT3A 1KLNA 3DOKA 3SV3A 2HVHA 3MEEA 1YIJN 4DS5A 1S22A 2AA4A 5C15A 4FLWA 4H0VB 4LD0A 3SAFA 4DQ8A 4BACA 2UUCK 3TAMA 1Y64A 1ASVA 3OTOK 3H3OB 4FVUA 4X66K 3OJSA 3BUZB 3PO4A 3DXKA 1QHAA 1RT6A 2VG6A 3WQTA 3Q7BA 1RTIA 2PYLA 2C1IA 1W0HA 3O9QA 5FLXO 4HCCA 3B6OA 4O5FA 1WSJA 4BE1A 3FFIA 3KK3A 1IH7A 1NGGA 3RTVA 5CZ1A 1FKOA 3O9TA 3W3DA 4UQGA 2QK9A 1NKCA 4DSJA 3V9UA 3AA5X 3L2WA 4XH4A 4KHQA 5C10A 4FJGA 4CZEA 4B9SA 3VA0A 1C1AA 2Q3SA 3WNEA 1YJNN 3PX0A 1BCMA 2W6KA 3UKUA 1WAFA 5D3GA 1EO1A 1KVCA 1XC9A 2P5GA 1X9WA 4BR4A 3SBTA 1ITGA 3MXMA 4JI1K 2YJFA 5HROA 4XH1A 4BR7A 2NUBA 1TAQA 4IEEA 3G71N 2G8VA 2UUAK 3O80A 3O9RA 3CCJN 4IXCA 5JMVA 4YOUA 2OPSA 4FK2A 1QVGM 4H8KA 4BR0A 4CHPA 2F7TA 3AVBA 1W7AA 3PLAA 4OLAA 3MN6A 4LF5K 4EP4A 4DWIA 2BGGA 1S1VA 4Q0BA 1HPZA 3EZ5A 4BRLA 5KQDA 4JK9A 3GDQA 4J8FA 1KVAA 4ELTA 4OKJA 3LWLA 2VWKA 2X6NA 1CZ9A 4ILJA 3CCMN 5F1XA 1XHZA 1IKXA 4DFJA 1TL1A 2XO7A 4I9QA 4G1QA 4KHUA 1J5EK 2DFFA 1L3UA 1S9GA 4KHYA 3SBGA 3VF2A 2FF6A 3O3HA 2W40A 1GLEG 4Z4EA 4LF9K 3I0SA 3M6GA 2X74A 4KI4A 5H1SQ 5JLFA 2C1GA 4FW1A 5K14A 4KHWA 2UXDK 3NGYA 3ZT1A 3S5TA 2ASMA 4CFDA 2HHQA 1UA0A 1NJIO 4E3SA 4J2BA 4V19S 3VF6A 5HL7L 2GWKA 3OYNA 1K8KB 4NCAA 1JXEA 3SNNA 2OTLN 4B3TK 4BRQA 1YHQN 1X9MA 3O4NA 4K8ZA 3LP3A 5HRSA 1VSFA 2PY5A 4U7BA 1MDUB 4PY5A 4JI5K 1R59O 1K73O 3JS6A 4BRFA 4NXMK 5C0YA 4CJVA 3F2KA 4HTUA 1S1TA 4PWDA 3A2FA 3G10A 5KQ8A 3IUCA 4CZIA 3WXJA 1S1XA 1WOQA 1EP4A 1HUXA 1RT5A 3MK6A 3QB0A 4M63C 1LAVA 5IWAK 5EY4A 3EE8A 2X6SA 4ZTJA 1IG9A 4B9UA 3CF5L 4PQUA 2KQ2A 2YKNA 3VF4A 3VQCA 4OPJA 3RRHA 3CCVN 2NRXA 2HBKA 4YOTA 1NJZA 4IJNA 2FBYA 1SUQA 4QAGA 3I55N 3LANA 2HOEA 1GOCA 4Z94A 2DFHA 1QE1A 4K41A 4CHZA 1DLOA 1JLCA 3MEDA 3O1WA 1I94K 3VEYA 4O8KA 2O8FB 1Z25A 5J2NA 5E41A 2FXUA 3C7NA 4IDKA 1C0UA 5E84A 2HW3A 2D4WA 1VSHA 2BUPA 4WQ5A 3QEWA 2OCEA 3OYBA 2P9LB 1XQSC 4RW4A 4DLGA 4KHSA 2Z1GA 4JEPA 2BANA 1NJYA 1K8KA 4FJMA 3HYFA 2YHBA 3M3ZA 2P9PB 1D5AA 4E0DA 1S6PA 2IC3A 4GNIA 3QEPA 1NK8A 4KHNA 4Z4FA 2HHUA 2IOCA 3KVGA 3F9KA 5ADXH 2DY4A 3LAKA 3VQ6A 3IRXA 3D7EO 3SK3A 4C8KA 3I0RA 4YDUC 4DV4K 3SJHA 4BWJA 3ALYA 4H5WA 5AQNA 3QLHA 4IOXA 4OJRA 2YI1A 1ATRA 4KV8A 1C0MA 4IO9L 1JLQA 1RGIA 3I56N 3LM2A 3VEVA 2VG5A 3TTCA 4BR9A 3JYTA 3HPGA 3MXJA 4JS4A 2Q0UA 4JI3K 3DAWA 3D6RA 3R9PA 2YNGA 2B6AA 1VK0A 4KTZA 1C0FA 3AGKA 3EKUA 2P9UB 2NRWA 3KWIA 1U2VB 4CJTA 5JS1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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