2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
1Z05A 4A62A 1GLEG 2F9TA 2QXLA 5AZJB 1GLCG 3FGUA 2GUPA 1HLUA 4NO7A 3FZKA 3LM9A 3WEEB 2YCHA 4DQ8A 1BOTO 2CH5A 3I8BA 3U4LA 1S3XA 1T6DA 5KPZA 1RDWX 5E84A 1BA1A 1ZC6A 3M1FA 3MMVA 3O80A 4CZEA 3VEVA 2ASOA 4BRQA 3O6WA 2PAVA 3A5OC 3O1WA 1QHAA 3FZFA 3ID8A 3CJ7A 1U2VB 2P9UB 3MDQA 3ZEUA 2QWNA 5AQLA 3QMLA 1U6ZA 3JXUA 4MLEA 3DXMB 4H5RA 3ZX2A 3WXLA 2QWMA 3HTVA 2P9SA 4H5VA 2YJFA 4M63C 1HUXA 3VERA 4FWMA 4JN4A 4Z94A 5AQMA 5BREA 3SMSA 3H1QA 3D2FB 3AAQA 3ENHA 1BU6O 1X3NA 2HMPA 2P9IB 3CQYA 1E4GT 3M6GA 5AR0A 1EQYA 3VPZA 1OKJA 1SQKA 5KPTA 5E26A 1KXPA 4BRNA 2QW9A 4F9OA 4CZGA 3LDNA 1GLLO 3ATUA 5I9EB 3D7EO 4BRHA 4BR2A 3BUZB 2A41A 3F9MA 4BRCA 4WQ5A 5F0XA 3HI0A 1GLJO 1YUWA 2D1KA 2J4RA 1SZ2A 4H5WA 4O8KA 2BUPA 1ZXOA 1GLDG 4IJNA 3R9PA 2P9NB 3G25A 1HKCA 5AQGA 3VEOA 2E1ZA 4H0PA 3MCPA 2AP1A 3DJCA 4M7YA 4CBXA 2D0PA 5AQXA 3D2EA 4GY2B 3UKUA 4EAHD 4CBWA 1MWKA 5AFUH 3ZX3A 3J8AA 1XUPO 2HF3A 2IVOA 3GL1A 1C0GA 3VEYA 4BGBA 3ULEB 2FXUA 1HX1A 1TUUA 4CZKA 3FR0A 2A6AA 2NLXA 4WYBA 3ZETA 4BR4A 4BRLA 3LDPA 2Q31A 3IMXA 4BR0A 1J6ZA 2Q1NA 2PBDA 3HZ6A 3MN9A 2Q97A 3HSCA 1RGIA 4GNIA 3LDLA 1NM1A 5KQDA 3A8YA 3LM2A 2V51B 1BG3A 4FO0A 5FPMA 5TKYA 3W0LA 5AQRA 3FZMA 3OHRA 5AQPA 3L6QA 4B1UB 4RTFD 3KVGA 5KPRA 1KAYA 4LC9B 3WUHA 1LOTB 3C0BA 3LDOA 2NRHA 3TPQA 3VENA 2Q0UA 3IFRA 1MDUB 4BQLA 4K43A 4M7XA 2UYTA 3QDKA 2I7NA 3CHWA 4WQ5C 1DGKN 3R8EA 3A5LC 2CGKA 2V7YA 2HF4A 3C7NA 1K8KB 3DXKB 4H0XB 3I33A 3MN7A 4IO8A 1MA9B 1HKGA 1Z6RA 4CD3A 5AZIA 4L3QA 4H5TA 4BC2A 1WOQA 1T6CA 3O5BA 4PKIA 2H3GX 3D2EB 3MN6A 4CZLA 1BUPA 3AARA 4A61A 2Q36A 1E4FT 1NGEA 3CJ1A 1C0FA 4JHDB 4JD2A 4YDUA 3WQUA 5AQFA 1TUYA 4MLHA 4MO5A 1NGDA 4B9QA 3H3NO 3R6MA 2VCPA 5AQKA 2E88A 2GELA 2Q0RA 3UKRB 4DCHA 1DKGD 3SLCA 3U8XA 5AQWA 2DPNA 4IXCA 1NGGA 2QWPA 5EVZA 3H46O 5BR9A 3B8AX 3UB5A 4CZJA 2D4WA 4EHUA 1QQOA 3CJAA 1G99A 2I7PA 4HTLA 4A2AA 4ISGA 4BRFA 4FL9A 2GWKA 2QWRA 4KBOA 1X9JA 5LJVA 3BEXA 4H0VB 2E2NA 3L4IA 3RSEA 5AQOA 4K41A 4BVPA 4MO4A 3EKUA 3CERA 3GE1A 1KAZA 4BRMA 1GLAG 1T44A 2GWJA 2P9PB 2IVPA 4H5NA 5BRDA 5JMVA 3H3OB 5AQZA 3C7NB 5AFUA 4NB4A 2P9KA 3O1BA 4CJ7A 4PKHA 1QQMA 3U9ZA 5BN8A 1V4TA 4ISEA 4I6MA 2ZGZA 1TYQA 3FZLA 1V4SA 4K25A 5F2RA 5AQIA 1D4XA 3VGLA 4FSVA 4JNEA 3CETA 5ADXH 3SK3A 3CJBA 4PL7A 2KHOA 4YDUC 4FWSA 3JS6A 1LCUA 4CD1A 1NGAA 5BPNA 1GLFO 4B1VA 2YHWA 5B8HA 3ZEUB 1Y64A 3QB0A 3WT0A 1P8ZA 3FLCO 1ATNA 3CIPA 3CQXA 5AQJA 2ITMA 4BVOA 2P9SB 4AM7A 3KZBA 4PL8A 2P9LA 5AQUA 3VEWA 4BC4A 2QM1A 1NMDA 5BN9A 2A40A 2GEMA 4BRKA 4H0TB 5AZJA 5EX5A 5FPEA 4BRGA 2V52B 1HKBA 4H0YB 1JCGA 4BREA 4RCHA 1ATSA 3EO3A 3BF3A 3O08A 3WEEA 5AQVA 2NZTA 3W3DA 3VEXA 2W40A 4ISFA 1NGCA 1Q18A 4CZHA 4FWLA 3EKSA 3GDQA 4FPBA 3GOIA 3EZWA 4QS7A 1U2VA 1R59O 2P9UA 4HWIA 4EHTA 3S41A 3WXJA 3DXMA 1WUAA 3O8MA 2FSKA 4FWNA 4BRDA 2GTDA 3VGMA 1QQNA 2E2OA 3UKUB 2ZGYA 1YAGA 3MK6A 3SJHA 5CE3A 4WQ4A 1H1VA 3UE5A 2P9IA 3D2FA 5AQSA 3WXIA 1HJOA 4BR5A 2EWSA 3ZETB 4BG9A 2CH6A 1YVNA 1NGFA 5EY4A 3ENOA 1XQSC 4B1WB 1QZ6A 4PKGA 3VF6A 2WUSA 4E1JA 3O4WA 5BRFA 3HBTA 1MWMA 4A2BA 3CJ9A 1BDGA 2F9WA 4CBUA 4FOIA 3GG4A 3U9DA 3DWLA 5ADXA 5BPMA 4BR9A 4C23A 4XH5A 3HM8A 4Y0WA 4B1YB 2IVNA 1BWFO 4CZFA 3WXKA 2P9NA 5AQTA 2A3ZA 3ZX0A 3H1VX 1IG8A 1XC3A 3LDQA 3SMPA 3H45C 5AZIB 3AAPA 3ULEA 4BC5A 4XH4A 2CGJA 3LL3A 2E1YA 5FPNA 3BF1A 1X3MA 2YI1A 3TU5A 3FZHA 4JD2B 1NWKA 2A5XA 4WQ4C 5AQHA 2VYPA 4H0OA 2D0OA 5ELZA 4IWVA 4DHYA 4B1XB 1QZ5A 4RWTA 3QBWA 3QFUA 5BRHA 2ZF5O 1ESVA 4FPAA 3WQTA 1S22A 5JLFA 3FFKB 4EIAA 3EL2A 3VF2A 2Q2RA 1JCFA 2A42A 4XEIA 2QWLA 2ZWHA 3A0IX 1NGBA 4H03B 3A5NC 5BPLA 3QBXA 4IZ9A 2FSJA 1SAZA 5JLHA 4FWRA 3IUCA 3VETA 3RSEB 2E2QA 2YHXA 1K8KA 2OANA 3DXKA 5AQYA 1NGIA 5LJWA 2QWQA 1RFQA 5AQQA 3CJCA 2VWBA 2CGLA 1NLVA 4JAXA 4DB3A 4EFHA 4BRIA 2ASMA 4FWOA 1CZAN 5KQ8A 4BRAA 4BR7A 2AA4A 1KAXA 2P9KB 1YXQA 1NGJA 4BRPA 3VGKA 1ATRA 5FPDA 4BROA 3BP8A 4QS8A 1NBWA 3VOVA 5JICA 4JHDA 4FWQA 1GLBG 2E20A 3GBTA 4I6MB 3M3ZA 3VF4A 3P4IA 1TYQB 1JCEA 2FF6A 5EXWA 2E8AA 3H6EA 1BO5O 3UKRA 5LY3A 4J8FA 4IJAA 3KHYA 2E2PA 1IJJA 3MN5A 3QICA 2IIRA 4CI6A 4BG8A 3A5MC 5AQNA 4QS9A 3EN9A 3FE1A 4XH1A 2ASPA 1NGHA 2YJEA 4AM6A 4O5FA 3ATVA 3CI5A 4K42A 4BQZA 4B1ZA 2V7ZA 2QWOA 2FLOA 4FWKA 2YHYA 4CZMA 2P9PA 4FWPA 2W41A 3VESA 1BA0A 3VEZA 4BC3A 5F1XA 3IDHA 4CZIA 1DEJA 1ZBSA 4BGAA 2FF3B 2FSNA 2P9LB 3DAWA 4FOEA 1HPMA 2HOEA 5EOYA 3L0QA 3QFPA 2BTFA 3AY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UUAK 4FLWA 3P39A 2HVIA 1JLEA 2GUPA 3OYCA 1KFSA 3FZKA 3AVAA 3WEEB 3O9QA 1BOTO 2CH5A 4NLBA 4F8RA 3G10A 1RDWX 5E84A 3THWB 3MMVA 3QIOA 4CZEA 1K8AO 4DV0K 3CJ7A 4CIEA 5AQLA 3QMLA 1U6ZA 3JXUA 3DXMB 3J81O 1NK9A 2WONA 2QWMA 3OYAA 2P9SA 1JLBA 4JI6K 4M63C 1BHLA 4JN4A 5DM6L 5AQMA 2FBVA 3H1QA 3OBYA 2P9IB 2ITGA 1E4GT 3M6GA 3VPZA 1OKJA 1SQKA 5KPTA 5E26A 1TKDA 1FJGK 1U04A 2QW9A 4DR4K 4FJNA 2C1IA 4J2DA 3ATUA 5HRSA 3D7EO 4BRHA 4HHTA 4IBNA 1TAUA 2E6MA 3KK7A 3HO1A 2D0BA 3RR7A 4CJRA 2D1KA 2I5JA 2O8EA 2BUPA 1EXQA 3IG1A 3IRXA 3F5TA 5K14A 2P9NB 4OPKA 3VEOA 2O8FA 1JXEA 2AP1A 4DV6K 4KH6A 5AQXA 3K5MA 2Z1GA 3UKUA 3QETA 4M3XA 3ZX3A 4B3RK 1XUPO 2IVOA 3VEYA 2ZM6K 1XI1A 4CK2A 1VQKN 3OJUA 1LAWA 4ZHRA 4WYBA 4BR4A 2KKZA 4AF1A 2PZSA 4BR0A 2NRRA 1KVBA 1RBTA 1EETA 3VQEA 3TTCA 4CGJA 1L3SA 1BG3A 5TKYA 5CYQA 4DFJA 5AQRA 3ENBA 3FZMA 4OGEA 2QI2A 5AQPA 3V1OA 4B1UB 3WUHA 3HYFA 1W0HA 4AHVA 2NRHA 5I42A 1VSHA 3V9ZA 4JKGA 3IFRA 3NF8A 3CFPA 4M7XA 3CHWA 2G8KA 3A5LC 1RDUA 3NMUA 4DFPA 1ZBIA 3C7NA 1F21A 4HCCA 4H0XB 5J2NA 3I33A 1CLQA 2GV9A 4BE1A 4BDZA 4FLXA 1QSLA 4DU1A 5AZIA 4L8RB 1T6CA 4JKCA 3AVKA 1VQMN 1S5JA 3AVBA 3MN6A 4CZLA 1SL2A 4X62K 1HQEA 5C15A 2F7TA 4ZTFA 1S6QA 1NGEA 4B9VA 1WSIA 3TAFA 1C0FA 4HTUA 2Z1JA 1WSJA 3SBTA 3WQUA 4AH9A 4CEZA 3VQDA 4B9QA 4CF0A 5T7BA 3WXMB 1NJXA 3BZCA 4DCHA 2Q0RA 3CM6A 2XY5A 3ZSQA 4DR7K 4CEFA 3ZSXA 4DV2K 2O8DB 4MDBA 4NCBA 5EVZA 5BR9A 3B8AX 3NGIA 1YF5L 3AVMA 3QEIA 4HTLA 1IBLK 4BRFA 3EYZA 3SJJA 4FL9A 2GWKA 4IDHA 3CCRN 4JKAA 5LJVA 4LFCK 3ZT0A 4K41A 4UY8O 1GLAG 4YOYA 4EP5A 1BGXT 3SV4A 3SQ4A 3G6EN 1U4BA 3K57A 4NB4A 4BWMA 3O1BA 3TANA 4CJ7A 4CHYA 1Q82O 5GIPA 1Z25A 1FW6A 4JKHA 3E9LA 2DFFA 1TYQA 3KLFA 3DLEA 2P5OA 5F2RA 5AQIA 1D4XA 3K59A 4DF4A 2HBKA 1A5VA 3ZCMA 1RT2A 1WSHA 3TAMA 3VA3A 4ILHA 4J2BA 2KHOA 4OO1J 3M5RA 1J5EK 1LCUA 2YHWA 5B8HA 3ZT4A 2FC0A 3QB0A 3WT0A 1P8ZA 4DR2K 1YT3A 3AA5X 3DM2A 1IBMK 1XHXA 2ITMA 1JL1A 4IEEA 4CEEA 4IFEA 4MFBA 2NRTA 4DTJA 2X6SA 4CGIA 1VQ8N 3AGKA 3AO2A 4KHNA 1NMDA 3DRSA 1UA1A 4OX9K 1TKTA 4H0TB 3TAPA 5EX5A 3TWHA 4DF8A 3TTDA 4HUEA 4IEIA 1O13A 4IOCL 1ATSA 3VQ8A 2NZTA 5M1FA 4E7LA 4FXDA 1REVA 4FWLA 3S3MA 3OTOK 3NHGA 2ZE2A 3THXB 3I56N 4AHTA 2HHTA 4FPBA 1CZBA 1U45A 3P38A 4NXMK 1B9DA 4QS7A 4O5BA 2P9UA 4HWIA 4EHTA 2OPRA 4EZ9A 3F2KA 4FWNA 1JKHA 5J2QA 5DK5A 2GTDA 1JLFA 3LZIA 5E41A 2ZGYA 1YAGA 3OYDA 4FK4A 5CE3A 3UE5A 3WXIA 2RE2A 4B9LA 3KTQA 3NF7A 1YJ9N 1BISA 1HJOA 1VAZA 4OJRA 4C8OA 1HNVA 4V19S 3SQ2A 3NE6A 1RBVA 4CF1A 3LALA 4CEQA 4PKGA 2IS3A 3T1HK 2WUSA 4E1JA 1HQUA 3V9XA 1EWRA 3PX0A 3CYGA 3LP1A 4DTRA 5JVGL 1GOAA 3OS2A 3S3OA 3AO1A 3HXMA 3SPYA 3GG4A 3EZ5A 5HP1A 5ADXA 4BR9A 4KB1A 2NRXA 2O8CA 3HM8A 5C42A 1BWFO 1T8EA 4DSEA 3DMJA 3WXKA 3ZX0A 3H1VX 1BQMA 2IOCA 1XC3A 2YKNA 3LDQA 3E66A 5KGXA 4W5QA 2HHSA 2HHXA 3T1YK 4YORA 4BC5A 2RKIA 2OPPA 4M3UA 4OPAA 4DV3K 1L5UA 1OH6A 4FM0A 1EWQA 4N5SA 3BF1A 2YI1A 4B08A 2HB5A 1VSIA 4E7JA 3FZHA 4JD2B 4PQUA 4WQ4C 4J2AA 2VYPA 3AVLA 4DHYA 1QZ5A 5M1KA 4GV6A 3QFUA 4FPAA 1S22A 3FFKB 3PLAA 1QTMA 1YJWN 4DTPA 2Q2RA 1NGBA 3A5NC 3QBXA 2FSJA 3RSEB 2DTUA 3HOTA 3S3NA 3VQCA 5LJWA 4GW6A 1RFQA 4A57A 3TSQA 1KFDA 2VWBA 4H8KA 1NLVA 4JAXA 4JI7K 4BRIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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