2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
4H0XB 2CGLA 2FSJA 4PKHA 4IWVA 4CZIA 1SQKA 3FR0A 2D4WA 1NGCA 4C23A 3KVGA 1HKGA 3QB0A 4EAHD 4JHDA 3ID8A 5FPEA 2P9PA 5AQWA 4BC4A 3VGLA 3D2EB 4H0PA 3VF6A 3R9PA 4A61A 5ADXA 5TKYA 4YDUC 3CQYA 5AQSA 1HJOA 4WQ5A 2CGJA 1V4SA 1BOTO 4K25A 4CZKA 3GG4A 5AQPA 1X3MA 4BROA 4BRIA 3FFKB 4FWLA 4BR5A 4KBOA 4BRCA 4EHTA 4JD2A 2YCHA 2GWKA 4BQZA 2I7PA 2D0OA 1U6ZA 4IO8A 4BGAA 2IVPA 3UKRB 2ASPA 5AQZA 4FWMA 4H5RA 1JCFA 3EKUA 4PL7A 1MWMA 2P9NB 3OHRA 1X9JA 4JAXA 2E2OA 2A42A 1OKJA 3IMXA 4MLHA 5AQGA 4GNIA 4AM6A 1RDWX 5EVZA 1P8ZA 5AQUA 3UKUB 5JICA 4BVPA 3QMLA 4BRKA 3WXKA 2HOEA 1GLJO 1U2VA 2Q0RA 3U8XA 4BRHA 3ZX2A 4CZLA 4QS9A 5KPZA 2YHXA 1BU6O 5B8HA 4FSVA 3IDHA 2A5XA 4HTLA 1YXQA 5AZJB 5AQVA 4RTFD 4FOEA 5AQMA 1DKGD 4WQ4A 5LJWA 1XUPO 3I33A 3H1QA 3FZFA 3DXKA 1GLBG 4CZEA 4XH1A 3ULEA 2IVOA 3SMPA 1MWKA 3EZWA 2ZWHA 1DEJA 5AQNA 4CZHA 2ASOA 4BQLA 3DXKB 1GLAG 4MO4A 3MN5A 5KQ8A 3CHWA 3FLCO 1CZAN 2J4RA 1Q18A 3FZHA 3LL3A 1ATRA 5AR0A 3CQXA 4ISGA 1R59O 1SZ2A 1YUWA 1NGAA 1XQSC 5AZIA 1S22A 1D4XA 3AARA 3EO3A 3O1BA 5BPNA 3WXJA 2A40A 3UKRA 5KPTA 3TPQA 5BPMA 1NMDA 3VOVA 2QWQA 4QS7A 3QFUA 2E1YA 3EKSA 2E20A 4A2BA 4F9OA 4CD3A 4MLEA 4H0YB 2P9LB 3P4IA 3UKUA 3ZEUB 3ZX0A 4A62A 4IJNA 3F9MA 3C7NA 2BTFA 2DPNA 4B1YB 4Y0WA 4JHDB 1MDUB 1KAYA 3H3NO 2UYTA 4FWKA 1T6DA 3MDQA 5F0XA 3MN7A 4DB3A 2Q36A 3C0BA 1RFQA 2F9WA 3LDNA 4XH5A 1KXPA 2IIRA 1X3NA 3D7EO 1Y64A 2W40A 3CJAA 3O4WA 2QWOA 4Z94A 3AAQA 2IVNA 3ENOA 3GE1A 4H5WA 3M1FA 5BN8A 5BREA 1HKBA 5ADXH 2FF6A 2P9UB 4CBUA 3CJ9A 3LDOA 2GELA 4HWIA 2E2NA 2Q1NA 4K42A 4PKIA 1NGGA 1QQOA 4EFHA 1DGKN 1MA9B 2P9SB 4PL8A 1J6ZA 3J8AA 4BRLA 2P9PB 3CERA 3U9ZA 3VETA 4M7XA 4H5NA 3JXUA 2HF3A 4BR4A 1NGJA 2OANA 3CJBA 3DWLA 1C0GA 1NBWA 2VCPA 2Q31A 3CI5A 2V7ZA 2ZF5O 3H6EA 2FXUA 4BRAA 3VEZA 3G25A 2GWJA 4A2AA 1NGIA 2GUPA 4H0TB 3M3ZA 3O6WA 4BC2A 1ZXOA 2QM1A 4FL9A 2ZGYA 1NM1A 1NWKA 5ELZA 5F1XA 3UB5A 4H5TA 3VESA 4B9QA 4FWRA 5AQXA 3FZMA 3W0LA 2QWPA 3VEOA 2A3ZA 3SJHA 3VGKA 3VEYA 5EOYA 5AZIB 5AQLA 5LJVA 2FF3B 5AQHA 3WEEA 4H0VB 3O08A 5AQOA 3RSEA 2E2PA 3LDLA 3VF4A 5AQQA 4FWOA 1TUUA 4EIAA 3ZETB 1GLFO 2QWLA 3VEWA 1TYQB 2V52B 3CIPA 3SMSA 4NO7A 1BWFO 3S41A 3BUZB 1HPMA 1QQMA 1S3XA 5BPLA 5JLFA 3MN9A 4RCHA 1BDGA 5E26A 4ISFA 4BR2A 4QS8A 1ATNA 1KAZA 2ZGZA 3O1WA 4NB4A 3H45C 2PAVA 3H46O 4CBXA 2NLXA 3O80A 4CD1A 4FWSA 1QZ5A 3D2FA 2YJEA 4BRNA 4MO5A 3HTVA 5I9EB 3VEVA 3ZX3A 1NGHA 2P9KA 4FPAA 3FZLA 4JN4A 4B1WB 2E1ZA 4CZJA 4H0OA 2BUPA 3RSEB 5BR9A 1LOTB 3SLCA 3A0IX 4J8FA 3D2EA 5AQRA 4H03B 4JNEA 3FZKA 3VF2A 2P9IA 3FE1A 4O8KA 3LM9A 5FPDA 3TU5A 2Q97A 3VPZA 5FPMA 4BG9A 2EWSA 2P9KB 3D2FB 3QFPA 4H5VA 4BG8A 5LY3A 2YHYA 4WQ4C 3VEXA 1G99A 3ULEB 1BUPA 4DHYA 2QW9A 3LDPA 4BC5A 1V4TA 2WUSA 3A5MC 3CJ7A 2GEMA 1NGFA 4CBWA 3LDQA 3WUHA 4BR9A 2ITMA 1E4FT 3H3OB 4BR0A 4L3QA 3O8MA 1BG3A 1GLDG 4IZ9A 4BRQA 4I6MA 3BP8A 2D0PA 3VGMA 3DXMA 1IJJA 1JCEA 3MK6A 5KPRA 1T6CA 3IFRA 1K8KA 4FOIA 5AQIA 3A5OC 3R8EA 1WOQA 2PBDA 1ATSA 3DXMB 1Z6RA 1Z05A 3A8YA 3M6GA 4FO0A 2FLOA 4I6MB 1ZC6A 2Q0UA 5AFUA 4BRMA 4B1UB 3JS6A 2AA4A 4PKGA 2E2QA 1GLLO 3FGUA 1NLVA 1RGIA 4FWNA 1IG8A 2P9LA 3L0QA 5BRFA 1EQYA 2CH5A 1BA1A 3BF3A 1U2VB 5AQTA 4E1JA 5AQKA 5EY4A 1H1VA 2YHWA 4JD2B 4FPBA 4DQ8A 2P9IB 4BRGA 2QWNA 2VWBA 2W41A 3U9DA 3R6MA 3L6QA 4CZFA 2V51B 1K8KB 4B1ZA 3C7NB 3ZETA 1NGBA 3I8BA 2P9SA 4CZGA 2I7NA 3QDKA 2QXLA 5AFUH 2Q2RA 3HI0A 3ATUA 5AQYA 3HZ6A 3U4LA 5AZJA 3QBWA 3GL1A 1C0FA 3UE5A 2HMPA 5JMVA 2A41A 4K41A 2CH6A 3BF1A 3GOIA 3HSCA 1WUAA 3MN6A 3LM2A 4M7YA 3QICA 4M63C 3WQTA 4RWTA 5BN9A 3WT0A 4WYBA 5JLHA 1ESVA 4FWQA 2FSKA 5AQJA 3DAWA 5EXWA 4WQ5C 4BRPA 3GDQA 1GLEG 1QZ6A 5AQFA 3AAPA 2HF4A 2YJFA 1YVNA 3DJCA 4EHUA 3VENA 4B1VA 3H1VX 4LC9B 1HUXA 1TYQA 3HM8A 1GLCG 2CGKA 5BRDA 4DCHA 1XC3A 4O5FA 1HLUA 1TUYA 2E8AA 1HX1A 1LCUA 5EX5A 3CJ1A 3CJCA 5FPNA 2H3GX 3QBXA 3A5LC 3WEEB 1E4GT 3ZEUA 2D1KA 3EL2A 3BEXA 4CI6A 3ATVA 4FWPA 1T44A 3CETA 1JCGA 2P9NA 1HKCA 2ASMA 2E88A 1BO5O 2P9UA 4XEIA 5E84A 4BRDA 4IXCA 1YAGA 3O5BA 4BC3A 3L4IA 4BRFA 2F9TA 5F2RA 4AM7A 3ENHA 4BGBA 2FSNA 3B8AX 3IUCA 3SK3A 4GY2B 3W3DA 3VERA 5KQDA 3KHYA 3AY9A 3MMVA 2VYPA 4ISEA 3WXIA 4B1XB 2YI1A 3WXLA 3GBTA 3HBTA 1NGDA 2QWMA 4YDUA 4BR7A 4CJ7A 3MCPA 2AP1A 3A5NC 4BREA 5CE3A 3EN9A 2V7YA 4XH4A 3KZBA 2NRHA 2QWRA 2A6AA 2KHOA 4CZMA 1SAZA 1QHAA 4K43A 1BA0A 3WQUA 2GTDA 4BVOA 4IJAA 5BRHA 1KAXA 1NGEA 2NZTA 1QQNA 1ZBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0XB 4CF8A 4CZIA 4KB1A 4DSIA 2HHTA 4C23A 3QERA 4DMNA 3QB0A 3LAKA 3ID8A 4NXMK 2P9PA 3KIOA 4A61A 1VQ5N 2HMIA 3NHGA 4Z4HA 1HJOA 1Q82O 3NGYA 3SYZA 4JKGA 1D8YA 1Q86O 4UY8O 3ENBA 3E1YA 5AQPA 1X3MA 3LZJA 1JKHA 1WSJA 4CGGA 1IBLK 4JD2A 2YCHA 3CC7N 3OS2A 1XHZA 1L3SA 2QEXN 4WE1A 3V1OA 4FWMA 1JCFA 1VSDA 4KH5A 4FM2A 2OTJN 4JAXA 4DSEA 5GAGP 2O8EB 3HRGA 4DTXA 3DRPA 5C2DA 3PIOL 4DTMA 3QMLA 3NH0A 3NCIA 1GLJO 1T3VA 3LPTA 4BRHA 3CCSN 2VGNA 2HHUA 3VQ8A 4DLEA 4FSVA 4R5PA 1HQEA 2VG7A 4HTLA 3VA0A 3LP0A 4C8MA 5AQVA 2KKZA 3JYTA 5AQMA 1DKGD 1W7AA 3T7ZA 4DV6K 5JVHL 4B9NA 1JLBA 4F8RA 4H4OA 4XH1A 1MWKA 2IC3A 3EZWA 3ALYA 5AQNA 1CLQA 1RT7A 2ASOA 4C1NK 4MO4A 3WNHA 4IOCL 3TAPA 4LF7K 1IH7A 3CHWA 2J4RA 3FZHA 5AR0A 4IFYA 3ZT3A 1KTQA 1SZ2A 3K5LA 1S22A 1U49A 4FW1A 1TAUA 4B3MK 4HUFA 4CIEA 1GOCA 1NKBA 1OVQA 4FLWA 2A40A 3UKRA 4IEEA 3H08A 1RDCA 3LALA 1NMDA 3SBGA 3NMUA 3THYA 4CEQA 3AA2A 3MEEA 1S6PA 4JKDA 4MLEA 4A2BA 4TSXA 4F9OA 4H0YB 3S9HA 3ZEUB 3O3FA 1BCMA 3AGKA 4IJNA 2YHBA 3F9MA 3C7NA 1C6VA 4JHDB 3ASMA 4FLZA 1VQ4N 2HHQA 1RBSA 1Q9XA 4DB3A 3LDNA 4GKJK 3O3GA 3PX0A 4B8AB 3I55N 4IO9L 1WSIA 1VQLN 5GINA 3J7AP 3QLHA 4BE1A 1X9WA 2O4IA 3GE1A 4H5WA 5BN8A 4BE7B 5BREA 5BR8K 1NK0A 1C1BA 4DFKA 1HNIA 1JL1A 4CBUA 3CJ9A 1RTIA 2GELA 3LDOA 4GV3A 4CHYA 3CF5L 2Z1JA 4PKIA 1VSLA 3U6FA 4OGEA 4PL8A 3ZT4A 1J6ZA 3AO1A 4BRLA 1NK8A 3U9ZA 5KGXA 4FXDA 4BR4A 1NGJA 4YNQA 1QSLA 4CJPA 2Q31A 3CI5A 2R7YA 4DV5K 2V7ZA 3H6EA 4I7FA 4LH4A 2X78A 3VEZA 3G25A 4M42A 5FLXO 1NGIA 3O6WA 4DTNA 4DR2K 2ZGYA 4Z4EA 1KVAA 3TSUA 1OH7A 3VESA 3CFRA 5AQXA 3FZMA 1NK9A 2QK9A 2JWKA 2JGUA 3QESA 3VGKA 5AZIB 3F73A 3WEEA 1NJWA 5J2NA 2BH1A 4FJMA 3LDLA 4JI8K 3ZETB 3VEWA 3TARA 4DFJA 4NO7A 3ZT2A 3S41A 4PY5A 4CJVA 4DTUA 5M1NA 1S3XA 5JLFA 4MDBA 4CHZA 5E26A 3ISNC 3AVFA 1RT3A 1ATNA 2HBMA 4CF2A 1RDBA 3QEIA 3TSPA 3DLLL 3H45C 2NLXA 3O80A 4L8RB 3HK2A 4CGDA 4FJJA 3RRHA 1QZ5A 2Z1IA 2YJEA 4FK0A 4MO5A 3CQ8A 3ZX3A 2P9KA 4JI6K 4CZJA 4WF9L 4DTSA 5BR9A 3OA9A 1D9FA 4DV1K 2D0BA 3LP2A 4J8FA 3D2EA 3V4IA 4H03B 4JNEA 3OVNA 4X64K 4KHUA 5HRRA 2P9IA 1IO2A 1VSMA 2WTUA 2Q97A 4M45A 3VPZA 2EWSA 4BG8A 4Z4FA 5LY3A 4ELTA 2YHYA 4B3SK 4BWJA 3ULEB 4DHYA 4E1MA 2G8FA 3LDPA 4M3RA 2GEMA 4DFPA 4CBWA 4BECA 3LDQA 3OYKA 3WUHA 4BR9A 4CEZA 2KW4A 2ITMA 3H3OB 1VSFA 1GLDG 3BP8A 3M8PA 5HOOA 2JWLA 3CM6A 2HBLA 1J5OA 4ZTFA 2IAJA 1XMQK 3AVCA 1WAJA 2F8SA 2GUIA 2BDPA 1EKEA 4DR5K 1Z05A 2XO7A 2XHBA 2OPRA 4OPAA 1YF5L 1NOYA 4BRMA 3KD1E 2G8WA 3N4QA 3RMAA 3CD6N 3PLAA 2O8CA 3THXB 1NLVA 1RGIA 4FWNA 2BGGA 3I0RA 3WNFA 3L0QA 3L2WA 4KV8A 4N47A 5EU7A 1KLNA 4AHUA 3LANA 3LAMA 5AQKA 1H1VA 3A2FA 2IS3A 4GV6A 4LF9K 2P9IB 2YNFA 3AO2A 4YOUA 4CZFA 3K5OA 3P39A 1D5AA 1K8KB 4B1ZA 4IFEA 3ZETA 5C10A 3I8BA 3FFIA 1QS4A 2Q2RA 5AFUH 4DSJA 2RF2A 5AZJA 3SV3A 1UOCA 3DLRA 5CHIA 3UE5A 3DM2A 3HSCA 3SUPA 2YX6A 4H8KA 5HLFA 3WQTA 4WYBA 4JI2K 1ESVA 1VQNN 3OS1A 2FSKA 4JKHA 3DAWA 1GLEG 2NUBA 1KC8O 3AAPA 4Z0UA 1XMOK 1SKRA 1YVNA 3DJCA 4IDHA 3OYCA 4DV2K 3E66A 4B1VA 1A5VA 4J2BA 2CGKA 1NK5A 3EEQA 1NU0A 4IG0A 1HX1A 4EZ6A 4E89A 5KRTA 4OKKA 5EX5A 4FLUA 3AA3A 3WEEB 3ZSXA 5HRSA 3ZEUA 3BEXA 3ZSWA 2P9NA 2BANA 4DR3K 1RDUA 4A59A 4GKKK 1TK8A 2ASMA 3S3MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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