4FWQA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gtp
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 135
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwqA02
1BU6O 2HOEA 5EY4A 4CZHA 3O4WA 3VGMA 3VETA 3D2EB 1T6DA 3KHYA 4JD2A 4FWLA 5AZIA 4K42A 4DB3A 1HJOA 1V4SA 3O5BA 4B1VA 2D0OA 1HUXA 2ASOA 3HZ6A 2OANA 1SZ2A 4FSVA 4BR2A 4FO0A 5BRHA 2CGLA 4BROA 3H6EA 3LDQA 3MN5A 3ZEUB 2E2OA 3B8AX 4BRCA 2QWMA 3U4LA 3MMVA 4WQ5C 4F9OA 1Z05A 3QFPA 3AAPA 3DXMA 5FPEA 3ENHA 5TKYA 3UB5A 4BREA 4Z94A 4BQLA 1WUAA 5ADXA 3BEXA 1DEJA 1XQSC 4IWVA 5I9EB 3VEXA 2FXUA 3VEZA 1V4TA 2P9SB 1U2VB 4H0XB 3EZWA 5AFUA 1TYQA 4AM7A 3LL3A 3R9PA 4CZLA 5AQTA 2GEMA 1IJJA 2Q31A 3GL1A 3HSCA 2E20A 4BR0A 4CD1A 4CZFA 3O1BA 1BA0A 1LOTB 3BUZB 1BWFO 1TUUA 5E26A 3ULEA 3ID8A 4WYBA 2E2QA 3I8BA 5KQ8A 3MCPA 2I7PA 4I6MA 1SAZA 2Q36A 4CJ7A 1QQNA 2BTFA 3L6QA 3LM9A 4K43A 4CZGA 3FR0A 3H45C 3IFRA 5B8HA 4K25A 4CBXA 4CZJA 4IO8A 3RSEB 2GWKA 1XC3A 1HKBA 2IIRA 3MN9A 2D1KA 1YXQA 4B1ZA 1XUPO 1GLCG 2V7YA 3O80A 4JHDA 4L3QA 3I33A 4CBUA 3SMSA 1MWMA 3H46O 3VGKA 5EVZA 1GLEG 5JMVA 1YVNA 5F0XA 3KZBA 3C7NA 4H5VA 3D7EO 3D2FB 1E4GT 2H3GX 4BC3A 1DGKN 1TUYA 3VESA 1S22A 5FPMA 2BUPA 3A5NC 3QBXA 4BC4A 4PL7A 1KXPA 1NGCA 3CJ1A 1HLUA 4MO5A 3UKUA 4WQ5A 4XH1A 1BUPA 3MN7A 1U6ZA 2CGJA 2V51B 4GY2B 2YHWA 2FLOA 4DHYA 2W40A 2DPNA 2ZF5O 3U9DA 1QHAA 2PBDA 4CZIA 1GLAG 2IVOA 2IVPA 5E84A 1X3MA 3U8XA 1GLBG 4XH4A 3A5LC 4M63C 3WXLA 2UYTA 2QWQA 2ZGYA 3LDNA 4EHTA 3CJ7A 3UKRA 1JCEA 2A42A 4H5TA 5F2RA 1QQOA 1NGDA 1ATNA 5AZJA 2P9UB 2ASMA 2P9SA 4A61A 1U2VA 5KQDA 3JS6A 4BVPA 5BRFA 5AQOA 1MA9B 2A5XA 3FZMA 3HTVA 1ESVA 5ELZA 5AQKA 4BRFA 4BRDA 4C23A 2E2NA 3QB0A 1R59O 2EWSA 1JCFA 2P9KB 3WXJA 4BRIA 3GG4A 4H03B 3SJHA 4BGAA 4DCHA 2FSNA 1IG8A 3DWLA 3HI0A 4FWNA 4QS7A 2YI1A 3GOIA 3AARA 3LDLA 4EFHA 5AQUA 3A5MC 4IXCA 5AQZA 2GWJA 4HTLA 3FLCO 3FZKA 2P9PB 3JXUA 1C0FA 1ZC6A 3QFUA 3DXKA 3H3OB 3VF2A 3RSEA 2AP1A 3S41A 1NGJA 1K8KB 3ATUA 3HBTA 3QMLA 1CZAN 3VF4A 2A41A 3VEWA 2YJFA 4BRLA 2F9TA 1ATSA 5AQNA 4CZKA 3FFKB 4EAHD 4WQ4C 4BRGA 4FWKA 1HKCA 1D4XA 2A6AA 4M7XA 4BG9A 5BN8A 1T44A 3GBTA 1KAXA 2ASPA 2NRHA 5BREA 4EIAA 1X9JA 3EN9A 5AQMA 5KPTA 4JN4A 4H0VB 4FWPA 3ZETA 3R6MA 2QWLA 1BDGA 1H1VA 3ZX2A 4A2BA 4FWRA 4ISEA 1NMDA 3CJCA 5AZIB 1ZXOA 4XEIA 5FPNA 3CERA 4KBOA 3WEEB 1KAZA 2VCPA 4BRAA 4IJNA 5AQQA 3R8EA 4PKIA 4J8FA 1HKGA 3TU5A 5FPDA 2GELA 4ISGA 2P9LB 4CBWA 2HF4A 4FPAA 1EQYA 3CIPA 1NGHA 2ZWHA 3SK3A 3WUHA 1J6ZA 3QICA 3U9ZA 3SLCA 5LJVA 5AQXA 2E1ZA 3VENA 3H1VX 3WXIA 3CQYA 4YDUC 5AQSA 3DXMB 3WXKA 5AQVA 3CJ9A 4BG8A 3WQUA 4JNEA 3D2EA 2ZGZA 4NO7A 3W0LA 1BOTO 5F1XA 2D0PA 1C0GA 2WUSA 3MDQA 4H5NA 1TYQB 4B1YB 4FWQA 2D4WA 3SMPA 4A62A 4K41A 2Q0RA 4IJAA 3FGUA 1DKGD 2Q1NA 2FF3B 4FPBA 1NGAA 5BRDA 3ZEUA 2E2PA 5AQYA 2IVNA 2QWOA 3LM2A 4GNIA 4RCHA 2I7NA 2A3ZA 3O08A 3ATVA 2FSJA 3VERA 3DAWA 2QWRA 4H5RA 2P9PA 3WQTA 4PKGA 3FZFA 3FZHA 1P8ZA 1HX1A 1K8KA 3CJAA 4CI6A 3P4IA 4QS8A 4WQ4A 4XH5A 5AQFA 4H0PA 3IMXA 4BR4A 1KAYA 3UE5A 4JAXA 1JCGA 5EOYA 5AQLA 5JLHA 4B9QA 1E4FT 2Q2RA 2P9NB 4O8KA 2PAVA 2HMPA 4NB4A 4B1UB 3CQXA 2VWBA 2CH6A 2F9WA 5BPLA 5AQWA 4MO4A 5AQGA 4B1XB 2GTDA 4CZMA 2YHYA 3A5OC 1Z6RA 2Q97A 3BP8A 4AM6A 3C7NB 4FWMA 1X3NA 3LDPA 4MLHA 3WEEA 1WOQA 4H5WA 3VOVA 2NLXA 2E88A 3L4IA 5KPRA 1BO5O 2P9LA 3KVGA 4E1JA 5EXWA 3UKUB 2GUPA 4B1WB 1YUWA 3VGLA 1YAGA 3QBWA 3VF6A 3C0BA 3ZX0A 1SQKA 5AQIA 4BC2A 4YDUA 3CJBA 2YCHA 4RWTA 5EX5A 3WT0A 5JLFA 4FWSA 3CETA 3UKRB 3ENOA 4DQ8A 3DJCA 3BF1A 1NGIA 2P9IB 2QXLA 1GLDG 3A8YA 5AR0A 4BRHA 3D2FA 4FOEA 4BC5A 5AZJB 5CE3A 3W3DA 4JD2B 1BA1A 1BG3A 2CGKA 1HPMA 5AQPA 3AY9A 1T6CA 2NZTA 3J8AA 2VYPA 4H0TB 4BR7A 3G25A 3FZLA 3EKUA 1S3XA 2E8AA 3GE1A 4BRKA 4A2AA 3TPQA 5BN9A 3H1QA 3OHRA 2E1YA 3IDHA 3IUCA 1MDUB 3M6GA 3A0IX 3L0QA 3O1WA 4BGBA 1NGEA 1GLFO 2FSKA 2HF3A 3ZX3A 1NBWA 1ATRA 2V52B 3GDQA 4BR9A 3CHWA 1NWKA 2KHOA 2P9UA 3DXKB 1NGGA 1GLJO 3LDOA 2QM1A 1OKJA 5LY3A 5AQJA 1NGBA 3EKSA 3M3ZA 2AA4A 3O8MA 1RDWX 4FOIA 4RTFD 1G99A 1LCUA 1ZBSA 4HWIA 4IZ9A 1NGFA 1GLLO 5KPZA 4CD3A 4BRQA 5BPMA 5BPNA 2P9NA 2YHXA 5LJWA 2P9KA 2CH5A 4Y0WA 5AQHA 4O5FA 3EL2A 3FE1A 4FL9A 4M7YA 4MLEA 3VEOA 4PKHA 3MK6A 5JICA 4FWOA 2V7ZA 3ZETB 3HM8A 4H0YB 1Y64A 4BRPA 1QZ6A 2A40A 3ULEB 4BRMA 2QWNA 3VEVA 4CZEA 2YJEA 2Q0UA 2QWPA 1QZ5A 4I6MB 4BR5A 4EHUA 3MN6A 4BVOA 1Q18A 3VPZA 1NLVA 2FF6A 4LC9B 5ADXH 1RFQA 3M1FA 4PL8A 4H0OA 2ITMA 5BR9A 4ISFA 3VEYA 1MWKA 4QS9A 4BQZA 2J4RA 3F9MA 3H3NO 2W41A 5AFUH 4JHDB 3AAQA 3EO3A 1RGIA 3BF3A 3O6WA 5AQRA 4BRNA 2P9IA 2QW9A 3QDKA 1NM1A 3CI5A 1QQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KHWA 1BU6O 2HOEA 5EY4A 1Q9XA 5M1FA 3D2EB 4JD2A 3V9XA 3K0SA 4KB0A 2HB5A 3KTQA 1RDDA 2QKBA 3NF9A 5BRHA 1XMQK 2G8IA 1Z25A 3MN5A 2E2OA 1XNRK 3B8AX 4BRCA 1UAXA 3U4LA 1NKEA 1NK9A 3MMVA 1KRPA 4NLBA 2RKIA 5FDLA 5TKYA 1W9HA 5ADXA 3J7ZO 2JGUA 4IWVA 1OH6A 4LD0A 2X74A 1TK5A 3VEZA 1V4TA 2P9SB 3NE6A 3ID6A 1YJ9N 2YNHA 3CCQN 3CPWM 4KRFA 2HHUA 4R5PA 1W7AA 4CZFA 1LOTB 4DV0K 4FJ7A 3TARA 5E26A 3ULEA 3SI6A 1T7PA 4DR6K 2E2QA 4CEEA 1HR0K 2OPPA 4NCBA 4GV3A 4I6MA 1VSLA 4CJ7A 2OPRA 2B4JA 4CZGA 2O8EB 3H08A 4CBXA 3KLIA 4XIUA 3AO5A 2EHGA 2GWKA 5KGWA 3DLEA 1XC3A 4E7HA 1ZBFA 1YXQA 4B9NA 3RMDA 1HNWK 1ILYA 4JHDA 3I33A 2IC3A 1DTTA 2Y1IA 3OYCA 3HRGA 4IO9L 5EVZA 1GLEG 3PUFA 2KLAA 1A5VA 5F0XA 3KZBA 4KTWA 5I42A 1L3UA 1JJ2M 1DGKN 3VESA 5FPMA 2BUPA 3CMAN 3QBXA 1N33K 3NGIA 1KXPA 1EXQA 3T7ZA 3UKUA 3OW2M 1TKTA 4WQ5A 3QLHA 3CCUN 3MN7A 1Z26A 2CGJA 2V51B 1T3VA 4GY2B 3TI0A 2YKNA 2W40A 2ZF5O 3ZT3A 3U9DA 1RT4A 4ZTFA 1QHAA 2IVOA 4CJWA 1X3MA 3U8XA 3AVAA 2QWQA 3CFRA 3V1QA 3CJ7A 4DR2K 1KC8O 1HNIA 1VRUA 3O9RA 4OX9K 4KH6A 3ZSYA 4YY3K 4DS4A 1YVUA 4CHZA 3AVJA 3CM6A 5AZJA 2ASMA 2P9SA 4A61A 2PZSA 5BRFA 1CXQA 3AA5X 2B6AA 1MA9B 2O8FA 1FKOA 4LF9K 1KD1O 1J53A 5DM6L 1DLOA 3OYGA 2IGIA 2P9KB 3WXJA 4X65K 3GG4A 1U4BA 2FSNA 5HRPA 4LSNA 3HI0A 4DTJA 2YI1A 1LAVA 4DR3K 4F2RA 3HOTA 4A5AA 2UXDK 1I94K 4DQPA 4C1NK 3FLCO 3T19A 1BHLA 3JXUA 2RHKA 2PY5A 3S3MA 2HNDA 1U04A 4IEEA 1CZAN 4C1NI 4DF8A 2F9TA 1ATSA 5DM7L 1SUQA 1NNEA 4JKDA 2VG7A 4FWKA 1HKCA 1D4XA 4M7XA 3SAGA 4BG9A 1IKXA 4LF7K 1KAXA 4EIAA 1X9JA 4L8RB 1C0MA 3KLFA 3EN9A 4CJTA 2Z1JA 2OZSA 4X66K 4FWPA 3R6MA 2GV9A 4HHTA 1BDGA 1H1VA 3ZLJA 4CGHA 3VQEA 4FWRA 3NHGA 1WSHA 3CJCA 5AZIB 1ZXOA 5FPNA 3VQ9A 3OYBA 1IH7A 1KAZA 2VCPA 4NYNA 5C42A 3BZCA 3R8EA 4PKIA 2Y1JA 4J8FA 4CK3A 3HO1A 3WNEA 5FPDA 4CBWA 5IT9O 4QOZB 4JI6K 3L2QA 2E6LA 3AGKA 1J6ZA 4O55A 4OPJA 1HNXK 3U9ZA 2HBKA 3SPYA 5J1EA 3VENA 4GW6A 1JLGA 3WXIA 3THYB 5AQVA 1QE1A 3ENBA 3PX6A 2B5JA 3U6FA 4CK2A 3W0LA 4CJRA 5GAEP 3E01A 3NGZA 4FJLA 3FFIA 1KFSA 4FK0A 1NK8A 1RDUA 1HQEA 3SMPA 5KTQA 2Q0RA 4IJAA 3FGUA 4KPYA 2O4IA 1DKGD 4RG8A 2FF3B 3ZCMA 1JLAA 1U47A 1NGAA 4KFBA 3AO4A 3ZEUA 5AQYA 5BRDA 1L3TA 1ZBHA 2QWOA 1ASWA 2ZQBA 2RF2A 2I7NA 2Q3SA 2A3ZA 4NCAA 1VQ8N 1A5XA 4H5RA 1QQCA 3AV9A 2OA8A 4FJNA 2HNZA 2G8KA 4ELVA 4JKGA 3RMCA 1D8YA 5AQFA 4CF8A 3KWGA 5D3GA 3IMXA 4FLYA 3ZT0A 3UE5A 4CK1A 4JRPA 4IDHA 5EOYA 1UA0A 1BQMA 1VQNN 2IS3A 3IAYA 4NB4A 3CQXA 4KTQA 4JI1K 2F9WA 5BPLA 4DV2K 2A1SA 2VQFK 4B1XB 3MXJA 3A5OC 4J2DA 2Q97A 5I3UA 3BP8A 3QERA 1X3NA 4JEPA 2KFNA 3ZSVA 2NUBA 2ZJPL 3IG1A 4W5OA 2X78A 3LAKA 1XNQK 3TR8A 3L4IA 4PHTX 4CHOA 1KQSM 1IKVA 3R3LA 4FM2A 2GUPA 3VF6A 2DFHA 1GOCA 4W5NA 4YDUA 4FLUA 1QVFM 1BI4B 2Z1HA 4B3RK 1X9MA 3DLBA 3NF6A 3HP9A 3ENOA 1B92A 3DJCA 2P9IB 5CYMA 2OTLN 3OJUA 3THXA 5CE3A 1CLQA 3QIPA 4H0TB 3G25A 3FZLA 3HP6A 2Z1GA 3NGYA 1VQ5N 1S6QA 4BRKA 4DU1A 1T05A 3IDHA 3M6GA 1FJGK 3UIQA 3TAEA 2HF3A 1GOAA 1NBWA 4LF4K 2QK9A 4YOTA 5LL6Z 4KH5A 1VQ4N 4MQ3A 3SBGA 4CFCA 1UOCA 3MEGA 3K57A 1YJWN 2HHQA 1XMOK 1BIZA 2P9UA 3DXKB 2GBZA 1TKXA 4LFCK 3VTIA 5LY3A 1NGBA 3O9SA 4BE2A 3T1AA 4DS5A 1RDWX 4FOIA 2ZJRL 3RWUA 3TAPA 5KPZA 4CD3A 3P38A 5BPNA 2YHXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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