2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
4N56A 3P5JA 3TANA 3HP9A 1VRTA 4B8AB 2YV0X 3OYBA 4M3XA 2BE2A 1VSEA 5HBMA 1ZBLA 4H4OA 4JRPA 1CLQA 1WAJA 4W5NA 1RT2A 1KSPA 3FFIA 4ZHRA 3KLIA 3ZSVA 2HMIA 1EXQA 4F3TA 2ATQA 3QEVA 3PX0A 1QSSA 3WNGA 3ISNC 3KK3A 3SYZA 1NKEA 3LP2A 2ZQBA 4OGEA 4M3YA 2HHVA 1TAUA 1BQNA 4E1MA 4DWIA 4FJIA 4XIUA 4ELTA 1U49A 3CM5A 4FW2A 3NHGA 2IDOA 4CIEA 1RT1A 4JS4A 4DU4A 4EZ6A 3DLHA 3V9XA 4G1QA 1ASWA 2OZSA 4KB0A 1RT4A 2ETJA 2XO7A 4I2QA 3KIOA 3HSTB 1NK9A 2Z1GA 4AHCA 4R5PA 2DFEA 1TKXA 3NGIA 3ULDA 3QINA 4Y1CA 4DSFA 1X9SA 4FJGA 3O3HA 1HQEA 1J53A 3MXMA 1KTQA 4CECA 1ASUA 4EP4A 1S9GA 4KI4A 1Q9YA 1Q8IA 1KLNA 3SJJA 3AVNA 1BQMA 2EHGA 2OPRA 1WNSA 1LWEA 3LP1A 4AHSA 3DRSA 3AVHA 4N76A 5KTQA 1X9MA 3AO1A 1A5XA 4DU1A 3ZT1A 4AHTA 3HVRA 1U48A 3O4NA 2OA8A 1U4BA 2QKKA 4KFBA 1C6VA 4MQ3A 3ASMA 1KVBA 3EYZA 4FJKA 1BL3A 3OYCA 3AVBA 4F2SA 4J2AA 3V1QA 5D3GA 3OYGA 4KHWA 3NGYA 2YKNA 4B9NA 2DTUA 2QK9A 1CZBA 4J2DA 2HW3A 1J54A 3NF8A 4CJLA 4BE1A 4LSNA 3AA5X 4NYFA 4CEQA 1NJXA 4FJ8A 2JLEA 3ZSWA 1QS4A 3VN5A 4CJVA 1DTTA 3HK2A 3TARA 4CF1A 1HNVA 2A1SA 4MFBA 3RMBA 4FJ7A 2OPQA 1VSLA 3AVCA 5JS2A 4YFUA 4CESA 3OYFA 2KFNA 3SQ1A 2YKMA 3I0RA 3OYEA 3OYJA 4WE1A 1T7PA 1ZBHA 2HB5A 4B9UA 1DLOA 4Z0UA 1EP4A 4CGGA 1IO2A 2HNZA 2IS3A 3HPHA 3KK1A 5HRPA 2VWJA 1NOYA 4PY5A 4PA1A 3MEGA 1RTJA 4GVMA 4BDPA 4O44A 5FDLA 3PV8A 3KTQA 4E1NA 4BDZA 1NK8A 4DU3A 5J1EA 4FJ9A 3M8QA 3ZT3A 3DLRA 3L2QA 4CJQA 4PUOA 3SNNA 3AV9A 1BI4B 3L3VA 1C0MA 4KV8A 4BE2A 3AA3A 4DFPA 3DLBA 1D9FA 3TAEA 2GV9A 3KLEA 4CEEA 4O55A 3V9UA 1EETA 1KLMA 3QIOA 5J2QA 1RDCA 2P5GA 4ID5A 4LY7A 4W5TA 2G8FA 4FJ5A 4JS5A 2PY5A 3B6PA 4FLVA 3OYDA 1T03A 4CCHA 3AVJA 4DG1A 1S6PA 2HVHA 3K5MA 5SZTA 3LP3A 4CGJA 1RTIA 3VQ5A 1S5JA 3JSMA 3K5NA 2HHXA 4CHPA 4HUEA 1FKOA 3VQQA 3KK2A 1C1AA 4CFBA 4M3TA 4Z4FA 2G8WA 2KZMA 4DTSA 1Q9XA 5SWMA 2VG7A 3SUQA 3SQ2A 4E0DA 3P83D 4DSIA 2HNYA 3DLGA 3C94A 1KVCA 4KKOA 5CYQA 1BIUA 3NGZA 3V1OA 4AHUA 1IKWA 4FW1A 4DLEA 4NYNA 1B9DA 2JGUA 4CJFA 2FBTA 2XY6A 4C8KA 4B3OA 4PQUA 4Q0BA 3TR8A 3V6DA 1O1WA 4E89A 3VQDA 2P1JA 3OS2A 2NUBA 2HHQA 1NKBA 1VSFA 4FLXA 4AILC 3HXMA 2B6AA 4DSLA 4KAZA 5C42A 2HHSA 4FM2A 3AVAA 2DFFA 3MEDA 4C8MA 1Z25A 4FVMA 4CEBA 4I9LA 3KLHA 4DQRA 5J2NA 4M45A 1GOCA 4CGIA 3KLGA 3QESA 3LAKA 3L8BA 4LH5A 4B08A 1L3SA 1HPZA 3ZSOA 5E41A 1NK7A 3PY8A 3RWUA 3ZSQA 4DFKA 4NCBA 1VSMA 4CIGA 1VSHA 3OJUA 3O3FA 4M41A 3KLFA 4DTXA 2ZD1A 3VQ6A 1S1WA 4CJ3A 1CZ9A 1GOBA 3HT3A 3K59A 3S3OA 4DQIA 2EX3A 3EZ5A 3DRPA 1SL0A 4CIFA 3HVTA 1TK0A 3ZCMA 5HLFA 1RILA 4DTOA 1BI4A 4CJ4A 2P51A 4QCLA 4Q5VA 3CYMA 3OYIA 4CGHA 4E3SA 3C6UA 1RDAA 3ZT2A 1RDDA 1NK5A 1X1PA 4KTWA 4DLGA 2GBZA 2X6NA 4CEAA 1NK4A 1BIZA 4CJ5A 1ZBIA 2F8SA 2HHUA 1C1CA 3VA3A 3VQAA 3DLKA 5HRRA 1YT3A 4CERA 4FJHA 3LDSA 1NK6A 1B92A 2VG5A 2YNGA 1RT3A 2YNFA 3BGRA 3SV3A 1EKEA 3TAGA 3SCXA 1XHZA 2RF2A 3QERA 1HJRA 1SL2A 1TKTA 3AVMA 1RBRA 3L3UA 5HRNA 3VQBA 1ZYQA 3QNOA 2G8VA 3UIQA 4CK3A 3NAEA 3AVLA 4H4MA 4FM1A 5FRNA 1IKVA 3LPTA 4K8XA 3HPGA 3TWHA 3TAPA 3VQPA 4HUFA 3ZT4A 4BWJA 3OJSA 4BACA 4IFYA 4O5BA 5CZ1A 3SUPA 1SKSA 4ICLA 4L8RB 3OS0A 2P5OA 2GUIA 1VSKA 4LD0A 1Z26A 3G10A 3QO9A 3U3YA 1RT5A 4CEOA 3THVA 5C25A 4J2BA 4FJXA 1I3AA 4CEFA 3ALYA 3C6TA 4FK4A 3DI6A 5I3UA 3AO5A 4F3OA 1HYSA 4FM0A 1JLQA 2D0CA 3T19A 4OJRA 3DOLA 3M8SA 2PYJA 3K5OA 3KKRA 3V1RA 3DM2A 3OVNA 3MAQA 4DTRA 1T8EA 2D5RA 1HNIA 1HYVA 1FKPA 3ZSZA 3SQ4A 3PX6A 1RCHA 3SI6A 3DRRA 3ZT0A 2Z1IA 1W0HA 1TK5A 2QKBA 4J2EA 3JYTA 1TK8A 4AHVA 1RTHA 3F9KA 4CEZA 3K2PA 4OVLA 3QIPA 2IC3A 4F2RA 1K6YA 2IOCA 1JL1A 5FROA 4Z4GA 3MXIA 1WSJA 1C0UA 1FK9A 2KZZA 5J2PA 1A5VA 1RT6A 5EU7A 3K58A 1FXXA 2Z1HA 1NJYA 2X6SA 3QEXA 4CHZA 2DFHA 4Y1DA 4N47A 4CJEA 1TL1A 2YNHA 4F8RA 5HROA 2Y1IA 2OPSA 4DS5A 3TAFA 3HO1A 4E7HA 4NCGA 3OY9A 1IKXA 3LP0A 4FK0A 4IBNA 3L2UA 3PO4A 4OKKA 1VSDA 1U47A 3D45A 3MEEA 3OYKA 2A1RA 4B9LA 4OKJA 3DYAA 2XY8A 2F8TA 1NOZA 4N41A 4M42A 1WSEA 3AO4A 3QLHA 5I42A 5KGWA 4UQGA 1S1UA 5DMRA 4JRQA 3SPZA 3NF9A 1WSHA 1JLCA 1BHLA 4CK1A 3L2VA 2G8IA 4DMNA 1QQCA 4Z4EA 3HP6A 4FJMA 4N5SA 4CF0A 1JLGA 1NK0A 2XHBA 2VWKA 3U3GA 4DTMA 4FJJA 2E4LA 3NFAA 3CQ8A 2RPIA 1CXQA 3VQ4A 4C8OA 3NH0A 1QSLA 1LV5A 4HCBA 2KFZA 4CFCA 2D0AA 3WNFA 3L2WA 2BDPA 4CJSA 4PWDA 2FC0A 1D9DA 1L3UA 3HJFA 3TABA 2IAJA 1HQUA 1NKCA 4E7JA 3OYMA 1S6QA 4CJRA 1RT7A 1SUQA 4H8KA 4DFMA 3AVKA 4E7IA 4HCCA 2G8UA 1VK0A 4CK2A 3I8DA 3HPOA 1TAQA 4IG0A 3LALA 1S1TA 1B9FA 2Q3SA 1YTAA 4ZTFA 2O4IA 3V9SA 4FLZA 4B8CA 1REVA 1DTQA 1LAWA 2D0BA 3LZJA 3SPYA 1ZBUA 4O4GA 4E7LA 1KFSA 1L3TA 1RNHA 4ZTJA 1Y97A 3NCIA 3V81A 3TI0A 3V9ZA 3IRXA 3IS9A 4E7KA 4B9MA 1LWCA 4OLAA 1TKZA 2OYQA 4IDKA 4ELUA 3E01A 3OS1A 3KD1E 3NDKA 5HP1A 2HNDA 2PYLA 1TV6A 4EP5A 3VQ8A 3PO5A 1GOAA 3S9HA 3WNHA 1ITGA 2AJQA 3RTVA 1I39A 1T05A 4K8ZA 4YNQA 1D8YA 2B5JA 4FLTA 3SV4A 3S3MA 4CGDA 3EY1A 3AA4A 1JLBA 3IAYA 2OZMA 1LWFA 3NF6A 3RMDA 1LAVA 1LW0A 1X9WA 1QTMA 4KRFA 1EX4A 5FRMA 3M8PA 4W5RA 4CF8A 1HYZA 1RBSA 5KRSA 4FLUA 2WOMA 2KTQA 4M3ZA 2Z1JA 3C95A 1RBTA 2F96A 3RMAA 2HHWA 1WAFA 2W42A 5C24A 3B6OA 1UA1A 2KQ2A 3QNNA 3NF7A 4NCAA 3K5LA 3VQ7A 3MXJA 4CFDA 2BGGA 3ZSXA 3M8RA 3MECA 4DQSA 3LZIA 2PZSA 2G8HA 4KI6A 4RW7A 3NH1A 4KPYA 5HRSA 4ELVA 4B9VA 1BCOA 3PUFA 4O0IA 4KREA 4FJLA 2FBYA 1RDBA 3VQEA 4FLWA 1WSIA 4DSEA 4DTJA 3SUNA 4DQPA 4RW9A 3AO3A 4LH4A 4DTNA 1LW2A 1UA0A 1KFDA 3S3NA 4KTQA 4DTUA 3A2FA 2OPPA 1RTDA 2BANA 1IH7A 4GW6A 1BGXT 1HMVA 3NE6A 2O4GA 5J2MA 4KHYA 4B9SA 4CF2A 4W5QA 4DQQA 1JXEA 4DSJA 4DSKA 4W5OA 1UOCA 3I0SA 2E6LA 4CJWA 4RW6A 3D0PA 4OKEA 4BDYA 4I7FA 1YTUA 4FXDA 1VSIA 1D5AA 1RBVA 3OYNA 3OYAA 1W9HA 2E6MA 1VSJA 1N5YA 4KHNA 4KHUA 2XY5A 1VRUA 1BISA 1UWBA 3VA0A 4CHOA 1TL3A 5KI6A 3LWMA 1U04A 4CJUA 4FZXC 1XWLA 4CJKA 3CFRA 5DK5A 4Z4CA 3HYFA 4FCYA 4FJNA 4KO0A 4DF4A 1HRHA 3H08A 3QETA 1S9EA 1SKWA 1IKYA 4M3RA 3QEPA 1MU2A 3DOKA 4IFVA 1IG9A 3O4QA 1KRPA 1NJWA 3KKSA 4RW8A 3RR8A 4CFAA 4LSLA 4ID1A 4M3UA 1JXBA 1J9AA 3CG7A 4CEDA 2WONA 4CJPA 1NJZA 2HHTA 3TAMA 4BE0A 4Z4HA 1S1VA 2IGIA 3ZSRA 4B9TA 1SV5A 5KGXA 1BCMA 1WLJA 2HVIA 1F21A 3AVGA 4FZZA 3KJVA 3RR7A 1JL2A 3QEIA 4C8LA 3PX4A 5KRTA 4KTZA 2RN2A 3LPUA 1KVAA 4RG8A 2LSNA 2X74A 3SUOA 1L5UA 1QSYA 4KB1A 1N6QA 1C1BA 3RRHA 4O0JA 4TSXA 3DLEA 3CFOA 4HVJA 2I5JA 1XC9A 3HL8A 4DTPA 4OLBA 1G15A 3ITHA 4FLYA 3AVFA 2FBXA 1TVRA 1J5OA 4AH9A 1ASVA 1JLEA 4QAGA 5CYMA 1YVUA 4DF8A 3HM9A 3V4IA 2QXFA 4EZ9A 2G8KA 4CHNA 3SZ2A 1QHTA 3LAMA 3SQ0A 1CXUA 4CJTA 4CE9A 2YNIA 3OYHA 3CFPA 2RKIA 3AVIA 4HUGA 3TAQA 4M3WA 3WNEA 3L2RA 4CHYA 1C0TA 4HHTA 3KD5E 4I9QA 1JKHA 2FBVA 4IKFA 3U6FA 4CGFA 1A5WA 1KCFA 4OGCA 4FZYA 1TKDA 3RMCA 3VQCA 1UAXA 1WSGA 3CM6A 4Z4IA 3ZSYA 1JLAA 1JLFA 4E19A 2DY4A 4OPJA 3NBPA 2R7YA 3V9WA 4DS4A 1TGOA 2YHBA 4KHQA 3AA2A 3LANA 2X78A 4I2PA 3G0ZA 5T7BA 3T3FA 3BDPA 2ITGA 1S1XA 4CF9A 1SL1A 1QE1A 2Y1JA 5K14A 4IG3A 1U45A 3AO2A 3T1AA 1L3VA 2XY7A 4OPKA 1ZBFA 4RW4A 3DMJA 3IG1A 3RRGA 4BWMA 3OYLA 4DFJA 4HTUA 1RBUA 2XRIA 2YHAA 3O3GA 3QEWA 1R0AA 3VQ9A 1WSFA 3P1GA 3F73A 2ZE2A 1SKRA 4FK2A 3NH2A 2KW4A 5CY4A 4AHRA 1XHXA 3LWLA 4CHQA 3K57A 5CZ2A 4F4KA 1WN7A 4KHSA 4GMJB 4JLHA 4QOZB 4FYDA 2B4JA 1XI1A 2VG6A 5JS1A 4C8NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P5JA 3HP9A 1VRTA 2YV0X 5HBMA 4BRFA 4JRPA 1WAJA 1KSPA 4DR6K 4DV0K 1QSSA 3SYZA 3WT0A 2FF6A 1N8RO 2HHVA 1TAUA 1BQNA 4E1MA 4BC5A 3CHWA 4ELTA 3CM5A 3PIPL 2IDOA 4CIEA 1RT1A 4JS4A 3MN9A 4DU4A 4RTFD 3DLHA 4G1QA 2OZSA 4JI8K 4KB0A 1RT4A 2XO7A 2DPNA 4XH4A 1NK9A 2Z1GA 4AHCA 1VQ5N 3ULDA 4Y1CA 1X9SA 4HWIA 3HM8A 1J53A 4FJGA 1ASUA 4EP4A 2O8FB 1S9GA 3EKUA 4BG8A 3SJJA 5E84A 4FWRA 4AHSA 3J7YP 4OPHA 1A5XA 4EHUA 3HVRA 3O4NA 4KFBA 5EX5A 4YY3K 4MQ3A 1YHQN 1NGDA 1YAGA 1KVBA 3EYZA 2HBLA 4MLEA 2ASMA 3OYCA 4BR7A 3NGYA 1XC3A 4WQ5A 3KWIA 2HW3A 3CCMN 3H6EA 5M1FA 4JK7A 4WQ4A 4MO4A 3TARA 4B1VA 4FJ7A 3DJCA 5C0YA 1VSLA 2QI2A 4CESA 3SQ1A 3I0RA 5DM6L 3OYJA 1T7PA 3O08A 4LF8K 3BUZB 3LDNA 2W40A 1DLOA 4CGGA 2HNZA 3HPHA 4A2AA 1BA0A 1OH6A 5FDLA 4E1NA 4DU3A 4DCHA 4PUOA 3SNNA 3AA3A 3CCEN 1YF5L 2ASPA 2UUAK 4CEEA 1VHXA 4C23A 4PHTX 1RDCA 2P5GA 3HTVA 4JI7K 4GKKK 4W5TA 3U8XA 4B3TK 3OYDA 4DV7K 1MDUB 3JSMA 4HUEA 4B1XB 2PFUA 4M3TA 1MWKA 2G8WA 1Q9XA 3SUQA 4DSIA 1VQNN 3P83D 2HNYA 4KKOA 3NGZA 4LFCK 1VQKN 4FW1A 4CJFA 3VMFB 3J7AP 4LFBK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P5J A;  3HP9 A;  1VRT A;  2YV0 X;  5HBM A;  4BRF A;  4JRP A;  1WAJ A;  1KSP A;  4DR6 K;  4DV0 K;  1QSS A;  3SYZ A;  3WT0 A;  2FF6 A;  1N8R O;  2HHV A;  1TAU A;  1BQN A;  4E1M A;  4BC5 A;  3CHW A;  4ELT A;  3CM5 A;  3PIP L;  2IDO A;  4CIE A;  1RT1 A;  4JS4 A;  3MN9 A;  4DU4 A;  4RTF D;  3DLH A;  4G1Q A;  2OZS A;  4JI8 K;  4KB0 A;  1RT4 A;  2XO7 A;  2DPN A;  4XH4 A;  1NK9 A;  2Z1G A;  4AHC A;  1VQ5 N;  3ULD A;  4Y1C A;  1X9S A;  4HWI A;  3HM8 A;  1J53 A;  4FJG A;  1ASU A;  4EP4 A;  2O8F B;  1S9G A;  3EKU A;  4BG8 A;  3SJJ A;  5E84 A;  4FWR A;  4AHS A;  3J7Y P;  4OPH A;  1A5X A;  4EHU A;  3HVR A;  3O4N A;  4KFB A;  5EX5 A;  4YY3 K;  4MQ3 A;  1YHQ N;  1NGD A;  1YAG A;  1KVB A;  3EYZ A;  2HBL A;  4MLE A;  2ASM A;  3OYC A;  4BR7 A;  3NGY A;  1XC3 A;  4WQ5 A;  3KWI A;  2HW3 A;  3CCM N;  3H6E A;  5M1F A;  4JK7 A;  4WQ4 A;  4MO4 A;  3TAR A;  4B1V A;  4FJ7 A;  3DJC A;  5C0Y A;  1VSL A;  2QI2 A;  4CES A;  3SQ1 A;  3I0R A;  5DM6 L;  3OYJ A;  1T7P A;  3O08 A;  4LF8 K;  3BUZ B;  3LDN A;  2W40 A;  1DLO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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