2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
3L3UA 2X78A 3IG1A 1U49A 3RR8A 4OKJA 4DQQA 3OYMA 4CGJA 4Z4CA 2OYQA 1EKEA 3AVIA 1J9AA 3SUQA 2DFEA 1U4BA 1JLFA 2WONA 3KLIA 3LP1A 3NAEA 3RMBA 1XI1A 1D9FA 3HPOA 5CZ1A 4J2BA 3AVAA 3OYLA 1CZBA 3KK3A 1L3SA 4AHVA 3V6DA 5HRSA 1LAWA 1IH7A 4DG1A 2VWKA 3AO3A 2IS3A 3OYDA 4OPKA 4DTMA 5EU7A 3LP3A 1YT3A 4JLHA 1HQEA 1BIUA 1B92A 5CYQA 3WNHA 4M3XA 4I9LA 4BWMA 3ZSXA 4B8CA 3VA3A 1SL0A 5J2NA 1TAQA 3ZSOA 3IRXA 1X9WA 3BGRA 2GUIA 4DTNA 4N41A 1WSFA 4AILC 4ELUA 1W9HA 4DSFA 1X9SA 2HMIA 3HYFA 4W5TA 1RTHA 5C25A 3MAQA 4OJRA 3IS9A 4E7IA 4FVMA 4BE2A 5HBMA 4B9NA 2Z1GA 4DQPA 3V9SA 3LAMA 2A1RA 3DLEA 3AVNA 4FW2A 4OKEA 3ZSQA 1LWCA 1LW0A 3L8BA 4CK3A 4EZ6A 2HHXA 5SZTA 3ZT3A 1HNVA 4FLVA 2PYLA 1D9DA 3O4NA 3NGIA 2QXFA 3EZ5A 2ZD1A 4EP4A 3KLGA 4H4MA 3KLEA 3AVKA 3DRSA 4FM0A 3SCXA 1ZYQA 4C8OA 4EP5A 3G0ZA 3P5JA 1CZ9A 3SPZA 1SKWA 4KTWA 1DTTA 3TI0A 4FZYA 4KHNA 3QINA 4HCCA 3HJFA 4AHSA 2FBVA 3SPYA 1NK5A 2YKNA 4W5QA 3M8PA 1UA1A 3MECA 4IG0A 1A5VA 3P83D 3NGYA 3RMAA 4DU4A 4FK0A 4CEFA 2W42A 4FJLA 2BANA 3ZSWA 5HROA 4AHRA 4CHOA 4E19A 3NH0A 3T3FA 2XY8A 3AVGA 1NK9A 4GW6A 4Z4FA 3OJSA 3VQBA 4RG8A 4CGDA 4N5SA 4TSXA 3O3FA 3QIPA 2G8IA 2YHBA 4DFMA 4O5BA 1D8YA 2YNIA 3WNEA 3V1OA 4DQIA 4KPYA 3RR7A 2XY6A 3OYCA 4KRFA 4CJ4A 4MFBA 4FLTA 3PX0A 4CFDA 4CEZA 2ETJA 3LANA 2QKKA 3E01A 3KD1E 1NKEA 4KFBA 4FJXA 4PWDA 1REVA 4YFUA 4OKKA 4CEOA 1KFDA 1RT6A 1RT3A 1JLEA 5D3GA 4DLGA 3B6OA 1BCMA 1RBTA 3DLKA 4GVMA 1JLBA 4AHTA 4F2RA 1TKZA 1Q9YA 3PUFA 4C8LA 2O4GA 4CFAA 3S3NA 3SYZA 3C6TA 4KTZA 4LY7A 1L5UA 4N56A 3FFIA 4KHWA 4FJ9A 3RRHA 1QSLA 5C24A 4RW7A 2DY4A 4DSEA 3I8DA 4L8RB 4DTOA 4W5NA 1VRTA 2OA8A 3ZSZA 1T03A 1BQNA 3C95A 1NJWA 4K8XA 2KZZA 4M3WA 4M3UA 5CZ2A 4DS5A 3QNNA 4FZZA 1NJXA 1KFSA 3AVHA 3LDSA 3KK2A 4FJJA 1UAXA 4FYDA 1RBUA 4F3TA 4DLEA 1TK8A 2HHWA 4CF2A 5KGXA 1VSMA 1D5AA 3H08A 4CJ3A 2G8UA 1QE1A 3AV9A 1HRHA 2A1SA 4F3OA 3QEWA 1QS4A 3CQ8A 3SJJA 3CFOA 1VSJA 3TWHA 4B3OA 1S1VA 3WNFA 3OYNA 4QAGA 5FDLA 4LSLA 2NUBA 5CYMA 1R0AA 1T8EA 4KB0A 4KI6A 4OLBA 4KREA 3TAFA 4HHTA 4FK4A 4DTSA 4CJFA 4CF9A 3QESA 1U45A 2OPRA 3L3VA 5HRPA 3OYGA 3S3OA 1NK0A 1RILA 3DLGA 5E41A 4F8RA 2RPIA 3C6UA 3MEDA 4M42A 4M45A 4LD0A 1RBVA 3LWMA 4Y1DA 2F8TA 2VG6A 3LPTA 2XRIA 2G8WA 3RMDA 2YNHA 1Y97A 3UIQA 3HPGA 1CXUA 3MEGA 1C1CA 1ITGA 4E7KA 2Z1JA 2YHAA 1S6PA 2F96A 5HRRA 4BWJA 4NYNA 4FM1A 1TGOA 1J54A 4QOZB 2IGIA 2PYJA 1TAUA 4OGCA 3KTQA 3ZSYA 2B5JA 1BI4B 2KQ2A 3AO2A 5KI6A 3KLFA 4AHUA 3I0SA 4E7LA 2Q3SA 4AHCA 3QNOA 3RWUA 4XIUA 4K8ZA 3DLHA 4CGIA 4HUEA 1QSYA 4ELVA 5J1EA 4DSKA 1Q9XA 4CJUA 4OGEA 3OY9A 1DTQA 4DQSA 2D5RA 5HRNA 3LWLA 4FLXA 1LWFA 1SL2A 4JS5A 1N6QA 5J2QA 3VQEA 4KHUA 5KTQA 3VA0A 3SQ0A 2Z1HA 3HPHA 5I3UA 4ICLA 3K57A 4CIGA 3TARA 3T1AA 2F8SA 1X1PA 1K6YA 1RDDA 3AVCA 4CERA 3V9XA 4I2PA 3PX6A 4ZTFA 4FJGA 4FJIA 3SQ4A 4ZHRA 4CGFA 4BDPA 3CM6A 4KAZA 4KV8A 3SV4A 4FLUA 3OYIA 1B9DA 2VWJA 5SWMA 2RN2A 3AVMA 4CFBA 3QEXA 3V4IA 2DTUA 1G15A 4B08A 3PY8A 3NH2A 1C1BA 3CFRA 3HVRA 1BIZA 3ZSVA 4HTUA 3QEIA 3PO4A 1S1TA 4BACA 3JYTA 4I9QA 4CK2A 1HYSA 4LSNA 4BE1A 2OPQA 1VSIA 1RNHA 3MXJA 3O4QA 5HP1A 4DSJA 4RW9A 4Z4IA 3A2FA 1BL3A 3QLHA 3KK1A 3V9WA 3KKSA 4KO0A 3VQ4A 4IG3A 4F4KA 2BGGA 1MU2A 4OLAA 4CJWA 3OS1A 1VSLA 3AVFA 3TANA 5FRNA 1J5OA 3BDPA 2IAJA 1YVUA 4JRQA 1RTDA 3TABA 5J2PA 3AVJA 3KKRA 4CJQA 4ELTA 1IKXA 1KSPA 1WNSA 1Z25A 3AA3A 3AVLA 3HP9A 4I7FA 4H8KA 5FROA 1JXEA 4DFJA 1TK0A 5JS2A 3PO5A 1RBSA 3HO1A 1KCFA 3NF8A 4B8AB 1WSIA 4Q0BA 2HVHA 1RT4A 3K58A 4B9VA 2GBZA 3DOKA 4DF8A 2O4IA 2WOMA 2YV0X 4YNQA 3OYAA 3SUPA 2HHSA 2IOCA 4PA1A 4F2SA 3F9KA 1C0TA 1YTAA 4CK1A 1VSKA 1QQCA 1O1WA 3DRRA 4LH4A 3ZT1A 5I42A 2HNYA 1XC9A 4JRPA 2XY7A 3QEPA 1NOYA 1S1XA 1ZBLA 4M3RA 4IBNA 2HHUA 3NCIA 1L3UA 3VQAA 3LPUA 2ZQBA 4J2EA 1BI4A 1KVCA 1JLGA 1TKXA 3SNNA 4CGGA 4FLWA 5T7BA 1S6QA 2PZSA 1LWEA 4CE9A 3HT3A 3AA4A 4EZ9A 1VSHA 1EP4A 3OVNA 3CYMA 4N47A 3NF9A 3CFPA 3DI6A 1RDBA 3L2WA 1XHZA 1KTQA 3K5OA 4Q5VA 4RW8A 2HHQA 3NF7A 4CIEA 3ZT2A 3VQCA 3QERA 1L3TA 1L3VA 1SV5A 2E4LA 4CCHA 1UOCA 3K5MA 5DK5A 3F73A 4MQ3A 1TKDA 1TL1A 4KHYA 1S1WA 4CJKA 4I2QA 3SUOA 2X74A 3SQ1A 1KVBA 4C8MA 3AVBA 1ASWA 3TAPA 1X9MA 4O4GA 4Y1CA 4OVLA 3HXMA 2P1JA 1IKWA 4UQGA 3RRGA 2HB5A 2EX3A 3VN5A 3MXMA 3K5LA 3VQ6A 2FBXA 1ZBIA 1VSFA 3THVA 1J53A 3WNGA 1FKOA 1CXQA 3VQ7A 3OYEA 4DF4A 4FK2A 2QKBA 1RT7A 3SV3A 4DFPA 4E89A 4J2DA 2KTQA 1LW2A 4CJSA 3O3HA 3V9ZA 3SI6A 1IG9A 1JLCA 4CEAA 2B6AA 3TAEA 1KLNA 4KB1A 4DMNA 1FK9A 4Z4GA 3G10A 3LZJA 3PX4A 4IFVA 3DM2A 3S3MA 1YTUA 3NBPA 1VRUA 2RF2A 2HHVA 4FJ8A 2P5OA 1HPZA 3TR8A 1I39A 4CEEA 1NK8A 3LZIA 3QIOA 3D45A 4AH9A 4FJ7A 3OYHA 3OYBA 3S9HA 4KHQA 2XHBA 4WE1A 3LP2A 1UWBA 2ITGA 3O3GA 1RT5A 4CJ5A 4M3ZA 1ZBUA 2E6MA 4R5PA 4DTXA 1B9FA 1WSEA 2D0CA 3OS2A 1A5XA 4ZTJA 3NE6A 4DSIA 2VG7A 1VSDA 3SZ2A 5DMRA 4CJVA 1BHLA 3AO4A 3OYFA 4NCGA 1EXQA 3NHGA 1TL3A 1WSHA 1SUQA 3JSMA 5KRTA 4CEBA 4E7JA 3SUNA 3TAMA 1ZBFA 3ZCMA 4CF0A 3TAQA 2P51A 1GOCA 3CG7A 1I3AA 4CJRA 1VSEA 1BGXT 1C1AA 1KLMA 4H4OA 4HUGA 4M41A 2Y1IA 1JKHA 4KTQA 4CGHA 1WLJA 1NOZA 3LALA 4KKOA 4E3SA 3PV8A 3OS0A 1LAVA 3AA5X 1NK4A 4CEDA 1NKCA 1TV6A 1XHXA 3DYAA 1Z26A 2X6NA 3DLBA 3DMJA 2KFNA 1IO2A 4DSLA 1KVAA 3C94A 1RDCA 3NDKA 4B9LA 5KGWA 2D0AA 3K5NA 3ZSRA 1LV5A 2OZSA 3CM5A 4CF8A 3NH1A 1JL2A 1WAFA 4LH5A 4E1MA 2P5GA 4N76A 1KRPA 3DOLA 2ZE2A 2OPSA 2FBTA 1HYVA 2VG5A 1WSJA 1GOBA 3OJUA 3HM9A 3MEEA 3QETA 3HK2A 4NCAA 3L2RA 4KI4A 5J2MA 3D0PA 2JLEA 1HMVA 2IC3A 4PQUA 3VQ5A 1SKSA 2HW3A 1T05A 4NYFA 3RTVA 4O0JA 2Z1IA 4B9SA 2G8VA 4FW1A 4E7HA 3HVTA 4C8NA 1RTJA 1JLQA 3HL8A 5CY4A 4CESA 3OYKA 2XO7A 4BE0A 4B9MA 4Z4EA 2ATQA 2LSNA 3V81A 3VQQA 4DU1A 4FLZA 1XWLA 3QO9A 2YKMA 3T19A 1ASUA 2FBYA 4IKFA 2I5JA 4IFYA 3EY1A 1HNIA 1U04A 1T7PA 2G8KA 4CJEA 2HNZA 3VQPA 4FM2A 1BISA 2XY5A 2HNDA 3QEVA 2AJQA 1ZBHA 2FC0A 4E0DA 1RT1A 4E1NA 1RBRA 4BDZA 1FKPA 3ZT0A 1WSGA 3I0RA 2KZMA 2OPPA 4CJPA 4KHSA 3P1GA 3HSTB 4DS4A 4M3YA 2EHGA 2YNFA 1F21A 3EYZA 4OPJA 4W5OA 4ID1A 3SQ2A 4DTPA 4CECA 1U47A 4ID5A 5K14A 4HVJA 3NFAA 4RW4A 1BQMA 4G1QA 3DRPA 3ASMA 3U6FA 2PY5A 3L2QA 3ITHA 2Y1JA 3LAKA 2HVIA 4Z0UA 2YNGA 4FJNA 5HLFA 4DFKA 5FRMA 1W0HA 4PY5A 4O44A 3B6PA 4QCLA 1JXBA 1HJRA 1S1UA 1RDAA 2G8HA 3NF6A 3L2UA 1S5JA 1IKVA 2DFFA 4NCBA 4DTRA 4B9TA 3AO1A 3U3YA 3VQ8A 4FCYA 1TKTA 4CF1A 1CLQA 3V1RA 1QTMA 4HCBA 1VK0A 4CHQA 2BDPA 4B9UA 1FXXA 3M8RA 4JS4A 1A5WA 1Q8IA 4DTUA 1QHTA 4CJLA 1IKYA 1EX4A 4PUOA 3V1QA 3U3GA 2BE2A 2KFZA 2E6LA 3KD5E 2HHTA 4IDKA 3L2VA 1ASVA 1N5YA 2QK9A 1WN7A 2D0BA 1NJYA 1RT2A 4CJTA 1NJZA 3NGZA 3KLHA 3V9UA 1RCHA 1EETA 4CHYA 1U48A 4M3TA 4Z4HA 5KRSA 1TK5A 2OZMA 4DU3A 1JL1A 2RKIA 4DWIA 4CIFA 3OYJA 1SKRA 1NKBA 1S9GA 4W5RA 4DTJA 3HP6A 4CFCA 1SL1A 2R7YA 1NK6A 2JGUA 4CHZA 3DLRA 3K2PA 1DLOA 2G8FA 3VQ9A 2DFHA 1C0UA 1JLAA 4RW6A 3KJVA 3ZT4A 3KIOA 3M8SA 4HUFA 4BDYA 4J2AA 4FJKA 4DQRA 3AA2A 3RMCA 1HQUA 4FJMA 1C0MA 2B4JA 5JS1A 4FJHA 3TAGA 1QSSA 4CHPA 1UA0A 2GV9A 3ISNC 4FLYA 3MXIA 1RTIA 1BCOA 4CHNA 3IAYA 3ULDA 1NK7A 1TVRA 2X6SA 4O55A 2KW4A 1S9EA 3ALYA 3VQDA 2IDOA 4O0IA 4C8KA 1GOAA 3K59A 4FXDA 4CEQA 4FJ5A 1HYZA 5C42A 1C6VA 4FZXC 4GMJB 3LP0A 1WAJA 3M8QA 3AO5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L3UA 1EKEA 1J9AA 4CZHA 2DFEA 3LP1A 3NAEA 2P9NB 3AVAA 3OYLA 2EWSA 3DXKB 1VQKN 1CZAN 3UKRB 4AHVA 4JV5K 5HRSA 1YJWN 1HKGA 2W40A 3AO3A 3O9RA 2JWKA 1SL0A 4LFAK 4BRLA 5J2NA 3MWTA 3PLAA 5GAGP 2NLXA 3QICA 1WSFA 4DV1K 4AILC 1W9HA 4O8KA 3IS9A 4ILHA 5TKWA 5HBMA 4BE2A 1WUAA 3LAMA 2A1RA 3J80O 4EZ6A 2HHXA 5SZTA 4FLVA 2PYLA 2UXDK 1FJGK 4CW7B 3IKMA 4H4MA 2E1ZA 3AVKA 1E3MA 3JXUA 3P31A 1XUPO 4KH6A 4AHSA 1HUXA 3M8PA 1NGGA 3NGYA 4M7XA 4CEFA 5AJ3K 3NH0A 5M1QA 4BR0A 2QA4N 1NG9A 3VQBA 4N5SA 4Y0WA 1NGHA 2QW9A 2YNIA 4DQIA 4KPYA 2O8CB 4KRFA 3AY9A 2O8DB 4MFBA 4FLTA 4WYBA 4PWDA 4CEOA 1RT6A 3P4IA 5EVZA 3B6OA 5C12A 3DLKA 1JLBA 3CETA 1EWQA 1R59O 1VQNN 2HBJA 3DXKA 4FPAA 2O4GA 3E9PA 4LY7A 4N56A 3W0LA 4DSEA 2FXUA 4W5NA 2V7ZA 1VRTA 1NJWA 3A8YA 2KZZA 3CMAN 5AQKA 4FZZA 2JWLA 4DR7K 3A5OC 4EIAA 1D5AA 4WQ4C 1KAZA 1QS4A 3CQ8A 3PIPL 3WNFA 5CYMA 1R0AA 1T8EA 4KI6A 4HHTA 3VEVA 5HRPA 2E2OA 3OYGA 1VQ5N 3BUZB 5LMUK 4M45A 1NGDA 2UXCK 4BRIA 2Q0RA 4DR2K 4B3MK 4AM7A 1N8RO 3MDQA 1W7AA 3HPGA 3M1FA 2YHAA 1S6PA 2F96A 5HRRA 4NYNA 4BRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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