2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
b'HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
3KK3A 3TAPA 3KD5E 3QIPA 3OS1A 3KLEA 1I39A 1VSKA 1HMVA 2OPRA 3KD1E 1JKHA 2RF2A 1BIZA 3HSTB 4E1NA 3NE6A 3S3NA 1EETA 1W9HA 1NJXA 3SV3A 4FJGA 4CCHA 4OPJA 3DLKA 3RTVA 2G8KA 3DRRA 3P5JA 2AJQA 4CGFA 4CEQA 4Z4CA 4JLHA 4F8RA 2HHVA 1TK0A 3QLHA 3DRSA 3AVAA 3AO5A 2Z1GA 3V1OA 3I8DA 1IKVA 1VSFA 4EP4A 1JLEA 4MFBA 3EZ5A 3PO5A 3NF8A 4CEFA 4IG0A 5HRNA 4J2DA 3QEXA 4F4KA 1WSGA 2G8HA 1NK0A 3SQ2A 1BQMA 2VG6A 4CERA 4CF0A 3V1RA 3M8RA 3CQ8A 1RDDA 3I0SA 4H8KA 3PX4A 3V81A 3QNOA 1QQCA 5J2MA 4B9SA 4KHWA 5SZTA 3SJJA 5KGXA 3K5MA 1X9WA 4N47A 5HP1A 1HYSA 4FM2A 2VWJA 3DLBA 3IG1A 1VSIA 4RW4A 4KHUA 3T1AA 2Z1JA 3K2PA 4KB0A 3ZT1A 2QK9A 4DFMA 4BE1A 1B92A 3RR8A 1TK5A 1FK9A 3TAQA 4PY5A 3LP0A 4BDZA 3SCXA 3VN5A 2F8SA 3MEEA 1X9MA 4ELUA 3LZIA 3AA5X 2O4GA 4B9MA 1NOZA 2EHGA 4E3SA 1W0HA 3AVCA 4LSNA 3ZSQA 1GOAA 1VSJA 4H4OA 4CIFA 5SWMA 3M8PA 4DFKA 2GUIA 5C42A 3HVTA 1U49A 1GOCA 1VSMA 3OYMA 3ULDA 1TAUA 3DLHA 4AH9A 3QEVA 1RBSA 4FVMA 3U3GA 3HPGA 2Y1JA 4DQIA 2ETJA 4FZZA 5CYQA 1QSYA 3C6UA 4DQPA 2B6AA 4RW7A 4QCLA 5HLFA 4DF4A 1B9FA 4Q5VA 4C8KA 3OS0A 4YFUA 2PZSA 3HO1A 4W5QA 2HVHA 4LH5A 1X1PA 3TAEA 1UWBA 2HNDA 1HYVA 1WSEA 4H4MA 4KV8A 4F3TA 2HVIA 1JLGA 1XHXA 4F2SA 1WSIA 3NH1A 5C24A 4DSJA 4CIEA 4CEZA 5HBMA 4DFJA 1BCOA 3UIQA 1KCFA 3TAMA 5JS1A 1S1VA 3JYTA 1CXQA 3OYNA 3ZT2A 1TL3A 3RRHA 3D45A 3MXMA 4FK4A 3MXIA 2XY8A 3WNEA 1LAVA 1RT1A 1WAJA 1TKZA 4HVJA 3DYAA 3KLFA 4W5RA 3SNNA 1RNHA 2RKIA 2PYJA 4DSIA 1C1AA 1RILA 2DFEA 4CESA 5T7BA 2G8WA 4M42A 4AHSA 3CM6A 4C8MA 1ASUA 1JLFA 3V9ZA 4FK2A 2E6LA 1TKXA 1DTQA 4CK1A 2BGGA 1JLAA 3NGYA 3OYBA 3LP3A 4B9LA 2OPSA 2BE2A 3KTQA 3QESA 4Y1CA 3O3FA 3KLGA 3HM9A 1A5XA 1C1BA 4E19A 3OYJA 3NBPA 1FKOA 2ZD1A 1SKRA 2D0BA 3MEDA 2KQ2A 5HRSA 2Z1IA 1RBUA 4E7HA 4BE0A 3OYDA 3QINA 3V9WA 4IBNA 3NHGA 4KHYA 3VQ6A 1S6QA 4FJXA 5FRMA 4HUEA 4FM1A 3L2QA 3ZSWA 4E89A 1U47A 4ZHRA 4NCGA 4OJRA 3AVHA 2IGIA 4CF2A 1RTHA 2YNIA 2W42A 4XIUA 3BDPA 4AHTA 3E01A 4E7JA 1WLJA 1NK5A 1YTAA 4E1MA 4DU3A 3RWUA 4CJRA 1TGOA 4BWJA 2HHWA 4RW8A 3NGZA 5HROA 2DFHA 1RDAA 3LPTA 4C8LA 3DRPA 1RT5A 3K57A 4FJMA 4Q0BA 1C6VA 1D9FA 3AV9A 1WNSA 1ZBFA 5I3UA 1SUQA 2G8IA 4HUFA 1HNIA 3M8QA 1JL2A 3S3MA 4FJIA 2IOCA 2RPIA 1KLMA 3RMBA 4FXDA 4DTMA 3OJUA 4OVLA 5I42A 3AVFA 1Q8IA 2OA8A 3NCIA 2DTUA 5HRRA 1VSDA 4LSLA 1KVCA 4Z4FA 4K8XA 4IFVA 2KW4A 1L3SA 4BWMA 2YHAA 4O0JA 3L8BA 3THVA 1KLNA 4KB1A 1UA1A 5FDLA 4HTUA 1S9EA 2D0CA 4CF8A 4G1QA 3B6PA 4CFAA 4DTSA 5HRPA 1BQNA 1NK4A 1BGXT 3NH0A 1S1UA 2YHBA 4DS5A 2XY5A 2QKKA 2X78A 3QIOA 4I9QA 1ZYQA 3P83D 3QO9A 3TAFA 4FK0A 1Y97A 1IKXA 3TR8A 2VG5A 3ISNC 4ZTFA 1LV5A 3C95A 5KTQA 4CJ3A 3G10A 2P5GA 4DSLA 2XRIA 1VRUA 1NKBA 3VA0A 4C8OA 5FRNA 2G8UA 2R7YA 4FCYA 1U48A 2HMIA 3SUNA 3AVBA 1TL1A 4IFYA 4B8CA 4FLWA 3QETA 3V6DA 5D3GA 2GV9A 3HP6A 4E7LA 3K58A 1A5WA 1TVRA 4KI4A 4BDPA 2OPPA 3F9KA 4CEAA 3KLHA 3ZT4A 4KAZA 4CEDA 4M3TA 1DLOA 3OYIA 4JS4A 1IKWA 2D5RA 1S1TA 3CFRA 4NCAA 1XWLA 5CZ1A 4EP5A 3TWHA 3SPZA 3B6OA 4CEEA 1Z26A 4DSFA 4FLVA 3LZJA 5J2PA 4KHNA 1RDBA 3S9HA 1QS4A 1VRTA 3AA4A 3IAYA 4CJLA 4CHQA 3HT3A 2YNFA 1HNVA 3OYAA 4CF1A 1Q9XA 4CK2A 2HHUA 4CFDA 1MU2A 3K5LA 4Z4GA 3ZSVA 2DFFA 3AVLA 3LAKA 3G0ZA 3O4QA 2HHQA 3O4NA 2XHBA 2KZMA 1D5AA 3CFPA 4B08A 3FFIA 3SV4A 3AVIA 1SL0A 4CHZA 4CJ5A 3RMCA 4F3OA 2KFZA 3L3UA 4DFPA 1G15A 4PA1A 4TSXA 1ZBIA 3VQBA 3PX6A 3OYHA 1TKDA 4FJ7A 3ZT3A 4KRFA 3P1GA 3DM2A 1BI4A 4KFBA 5KI6A 4CK3A 4E7IA 1LWFA 1KVAA 4CGDA 4DQRA 3OYGA 4KTWA 4DF8A 2P5OA 1S1XA 1XHZA 3WNFA 1XC9A 2G8VA 4J2EA 1JLQA 2IDOA 1J9AA 2EX3A 1T05A 4NYFA 1RBTA 4FLYA 1TAQA 1U45A 1NK9A 1EP4A 3DLEA 4BDYA 3ASMA 3DI6A 3IRXA 1LAWA 1NK7A 1KVBA 4ID5A 4WE1A 3O3GA 5KRSA 1QSSA 4E0DA 4B9NA 3SYZA 1SL2A 1KFSA 4E7KA 1YVUA 1NKEA 1IO2A 1T03A 4OGCA 3NAEA 3TANA 4DTRA 4CF9A 3AA3A 4CJSA 4CFBA 2Y1IA 4N76A 3OYCA 3T3FA 4OKKA 3WNGA 4IG3A 3KIOA 2YNGA 3SZ2A 3PV8A 4FW2A 3DLRA 1NJYA 4CIGA 5KGWA 4W5TA 1LWCA 4NYNA 1DTTA 4C8NA 4HHTA 3WNHA 1RT6A 4DTOA 4KI6A 2HHXA 2HHSA 3TARA 2KZZA 1QSLA 3NGIA 1ASVA 4GW6A 1NJWA 2GBZA 3AO1A 3HVRA 4HCBA 3NF7A 5FROA 4CJPA 1J54A 2JGUA 1JXBA 1RTIA 1C0UA 4CECA 5J1EA 4JS5A 1N5YA 4QOZB 4O55A 4OKEA 1C0MA 4CGGA 1RBVA 3SQ0A 3CFOA 1KTQA 1U4BA 3DLGA 4I9LA 4DQQA 1BHLA 1SV5A 3AVKA 3MXJA 1S6PA 1RT7A 4FJNA 3OS2A 4FJLA 4PWDA 4DTJA 1XI1A 3PY8A 2I5JA 2X6SA 1JLCA 4OPKA 1NJZA 4OGEA 1SKWA 1ZBHA 4CJ4A 3DMJA 3CM5A 4KHQA 3RRGA 1WAFA 4LH4A 1NK8A 3K59A 4PQUA 2OZSA 1T8EA 3AA2A 4DTXA 1EXQA 4OKJA 2D0AA 3ZSRA 1RCHA 2FBXA 3RR7A 1IH7A 1VSEA 3ALYA 1X9SA 4CJWA 4M3RA 1D9DA 3OYEA 3NF6A 3DOKA 2OYQA 4ID1A 4DLGA 4EZ9A 1RTJA 2HNYA 4ZTJA 1S5JA 1HQUA 2ATQA 4DTNA 4OLAA 4DLEA 4CEBA 3NFAA 3AVGA 3KK1A 2PY5A 4LD0A 1LW0A 3A2FA 1ZBUA 4CJFA 3LAMA 4DMNA 4R5PA 3SQ4A 4M45A 4DG1A 2LSNA 4NCBA 1VK0A 1D8YA 4F2RA 4O4GA 2HHTA 2ZE2A 4I2PA 2B4JA 1O1WA 3AVNA 3C6TA 3LANA 3NF9A 1IG9A 1RBRA 1NOYA 3T19A 3L2WA 4Z4EA 3HPOA 3V9XA 3HP9A 4CGIA 3OVNA 4O44A 1RTDA 1L3UA 2XY6A 1I3AA 4AHUA 4CJQA 3PO4A 2YKNA 5EU7A 4FJ8A 3EYZA 4FM0A 3C94A 4LY7A 4CE9A 4FLXA 1ITGA 2ZQBA 5K14A 1WSJA 4DU1A 1YTUA 4JRQA 4M3UA 3HPHA 3VQCA 1TV6A 4ICLA 2VWKA 1QHTA 5E41A 3V9UA 1UA0A 4K8ZA 4KREA 3VQEA 4GVMA 1HYZA 2NUBA 3KLIA 3MEGA 3HL8A 1WSFA 1J5OA 2QXFA 4B9VA 5DMRA 4M41A 4HCCA 3QERA 4AILC 4BE2A 1KRPA 3AO2A 2X6NA 3L2RA 2BANA 3S3OA 4M3WA 4DWIA 1S1WA 3PUFA 2XO7A 1C1CA 1R0AA 4DQSA 1QE1A 3VQPA 4M3YA 2FC0A 3K5NA 5CY4A 1BISA 3LP2A 4O5BA 1CZBA 2E4LA 4FJJA 3QEWA 2KFNA 3AO4A 4FZYA 3U3YA 4N5SA 4ELTA 3VQ4A 5DK5A 2IAJA 3OY9A 1UOCA 3CYMA 3TI0A 3KKRA 1ZBLA 1REVA 4FLUA 4CEOA 3RMAA 3VQDA 1BIUA 2WOMA 1ASWA 2HW3A 4L8RB 1HQEA 3TABA 4KTQA 1JXEA 4W5OA 3KJVA 2G8FA 4FJHA 4IKFA 3OYLA 2Z1HA 1A5VA 2ITGA 2RN2A 1NKCA 2QKBA 1SKSA 4FJKA 4KKOA 5J2QA 1HJRA 2IS3A 1HPZA 1K6YA 2FBVA 2IC3A 4KO0A 4RG8A 4UQGA 1L5UA 1RT3A 4CJKA 1FXXA 4CGJA 3JSMA 4Y1DA 4PUOA 4N56A 1C0TA 2JLEA 3L3VA 4B9TA 2E6MA 3VQ5A 2P51A 3SUPA 1HRHA 3QEPA 4B9UA 4CJTA 4CHPA 4DS4A 3H08A 4ELVA 1EX4A 2YV0X 3VA3A 1QTMA 1RDCA 1J53A 1LWEA 3K5OA 1B9DA 3V4IA 4DTUA 4CFCA 1YT3A 4I7FA 3QNNA 1JL1A 3U6FA 1TK8A 2F96A 4RW9A 3RMDA 3SPYA 3ZSOA 4BACA 2PYLA 1N6QA 4FLZA 4M3ZA 4B8AB 5JS2A 1VSHA 1RT2A 2FBTA 5KRTA 4GMJB 3ZT0A 3O3HA 4DSKA 4DU4A 3LWMA 3ITHA 2HB5A 1L3TA 3V1QA 4FJ9A 4FJ5A 4OLBA 1KFDA 4CJUA 4DSEA 3TAGA 1WSHA 2KTQA 3V9SA 4CHYA 1T7PA 3KKSA 1JLBA 3D0PA 3AVMA 3AO3A 4MQ3A 1F21A 2X74A 3M8SA 3PX0A 5C25A 4KHSA 3L2VA 4FZXC 4JRPA 3LDSA 1BI4B 2VG7A 4QAGA 3HXMA 3SQ1A 1KSPA 2O4IA 3IS9A 4M3XA 2B5JA 2DY4A 4EZ6A 2YNHA 1RT4A 3OYKA 3DOLA 4FYDA 4I2QA 4HUGA 4Z4IA 5CZ2A 3NDKA 1BL3A 4N41A 3NH2A 2XY7A 1U04A 4J2AA 3ZSXA 3LPUA 2A1RA 4Z0UA 3MAQA 4AHCA 1EKEA 3AVJA 4CHNA 1FKPA 3F73A 3HYFA 3VQAA 3LWLA 4KPYA 3L2UA 5CYMA 3VQ9A 2Q3SA 2P1JA 4AHVA 3EY1A 3QEIA 3OYFA 3MECA 2A1SA 1BCMA 3OJSA 1S9GA 4FLTA 3CG7A 4RW6A 4Z4HA 3SUQA 3HK2A 1NK6A 1L3VA 4CJVA 3BGRA 4CHOA 1GOBA 3VQ7A 3LALA 4FW1A 2WONA 2F8TA 1UAXA 3I0RA 2HNZA 2OPQA 4IDKA 3ZCMA 1CZ9A 1TKTA 1Q9YA 5J2NA 1SL1A 4DTPA 3ZSZA 2FBYA 3SUOA 4AHRA 3VQ8A 1IKYA 4J2BA 1CXUA 3HJFA 4CJEA 4YNQA 4W5NA 2YKMA 4KTZA 3VQQA 1WN7A 3KK2A 3SI6A 2BDPA 2OZMA 1CLQA 4CGHA 1LW2A 3LP1A 1Z25A 4B3OA 4O0IA 1VSLA 3ZSYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WOQA 3TAPA 3R9PA 5BRFA 1I39A 1HMVA 3HSTB 3E9LA 1BIZA 4DUZK 1W9HA 5AQNA 2A41A 3DRRA 4CGFA 1KAZA 3V1OA 1IJJA 1IKVA 4OPAA 3H6EA 2HSTA 3FLCO 5TKYA 1U2VB 4YY3K 5M1FA 2NRWA 5HL7L 1WSGA 2G8HA 2UYTA 1NK0A 3SQ2A 4CERA 2W40A 4H8KA 2QWNA 2A42A 4KH5A 5KQ8A 3VERA 4M7XA 4B9SA 4YORA 4KHWA 3SJJA 4N47A 1VQ8N 3O08A 4QS9A 3L4QA 4DFMA 5AR0A 1S22A 3RR8A 3DJCA 1W7AA 1FK9A 4PY5A 2ASOA 3SCXA 3VN5A 1X9MA 4ELUA 3P39A 3A5OC 3AA5X 4GV6A 1NOZA 1W0HA 3AVCA 4EHUA 3CCEN 4CIFA 4DR2K 1U49A 3M8PA 3HVTA 1TAUA 3DLHA 3U3GA 4HTLA 1DGKN 2ETJA 2B6AA 4RW7A 4QCLA 3C6HA 2GWKA 2WC9A 4Q5VA 4FWNA 3TAEA 2HNDA 1HYVA 1WSEA 4H4MA 4F2SA 1WSIA 3NH1A 4DSJA 4LF7K 3CJ9A 5KPTA 5JS1A 1S1VA 3ID8A 4DV2K 2NLXA 1CXQA 1TL3A 3D2FA 5EX5A 4FK4A 4CVNE 1WAJA 1TKZA 4DSIA 2O8DB 4H0XB 3KWIA 3SAHA 3THYA 1OH7A 4JKGA 1JLFA 4FK2A 2E6LA 1JLAA 4JK7A 4CZGA 3CC4N 1ZC6A 3LP3A 4B9LA 1S3XA 2BE2A 5GAEP 3O3FA 3KLGA 4XH5A 2ZD1A 1NG9A 2D0BA 4FOEA 3QINA 3V9WA 2D1KA 3NHGA 4FJXA 4FM1A 4NCGA 2IGIA 4BRQA 4IJNA 2W42A 5A2QO 1WLJA 1NK5A 3RWUA 1TGOA 4BWJA 2HHWA 1CZAN 4FJMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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