2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
3NAEA 3CM5A 4CJEA 1WSGA 4W5TA 3OYCA 3WNHA 4FJMA 2KQ2A 4FK4A 4FK2A 4OPKA 4CEFA 3M8QA 3PO5A 4F2RA 1NK4A 4JLHA 4DTJA 1CXUA 1ASWA 3DM2A 3DLGA 3CG7A 4CGGA 2KTQA 4FJHA 1DLOA 4FLZA 1RCHA 1HRHA 3VQQA 1NK5A 3ZSXA 3SUNA 4DSEA 3HSTB 1QE1A 3MEEA 3SV3A 4OGCA 4DLGA 2Z1HA 4FJ9A 1REVA 2JGUA 3NGYA 3RMBA 4I2QA 1NKBA 3VQ4A 3PX0A 4CIGA 4Z0UA 3S3MA 3LANA 3NH0A 3PX6A 1RDDA 4F4KA 4IG3A 4N76A 3K5LA 1U4BA 4W5OA 4DTRA 3NH2A 1NJYA 1ASUA 1VRUA 4J2DA 1NOZA 1HNIA 1RDAA 4IG0A 2YHAA 2OPQA 3FFIA 3VQPA 3T1AA 5CYQA 4CESA 4R5PA 4FW2A 1QQCA 4AHVA 1TVRA 1SL1A 1D9DA 2XY7A 4KTQA 3NF9A 2HNDA 1RBUA 4K8XA 4H8KA 3VQ8A 3SUQA 3TANA 3VN5A 3LWLA 3HJFA 3HPOA 4O5BA 1HQEA 4KHSA 4I9LA 1NOYA 4J2EA 4BDPA 1VSKA 3NF6A 4IFYA 3OYIA 4ELVA 3C95A 1D9FA 1WNSA 1B92A 2B6AA 4YNQA 4Q5VA 4C8LA 4L8RB 3VQ9A 4FM0A 2G8HA 1GOAA 4DTMA 4O55A 2E4LA 4RW8A 5KI6A 2YKNA 5JS1A 4FLYA 4DFMA 1RNHA 4PUOA 2QK9A 2YHBA 2BE2A 1BGXT 3RMCA 4CEBA 3QLHA 2OPPA 4MFBA 2HNYA 3B6PA 3G0ZA 3AA4A 4CJSA 3OYJA 1U47A 2F8SA 4JRQA 1KLNA 1WSEA 5E41A 3LAMA 1TKDA 3AVHA 4DQQA 3QESA 3KK1A 3NGZA 4ZHRA 3V4IA 3MEGA 4LSNA 3RMDA 3QEPA 2IS3A 2YKMA 1XHZA 4FCYA 4FM2A 3KJVA 1NK9A 1LWCA 4M3TA 1U04A 1FXXA 1ITGA 1HMVA 4CHYA 4DU4A 1BCMA 5FRNA 5DK5A 2KW4A 4Z4HA 1C6VA 3L8BA 1QSSA 4BE1A 1HJRA 3AVGA 3M8PA 3VQBA 4HVJA 3QEVA 4DS5A 3ZSZA 1W0HA 4KKOA 2D0BA 3V1QA 2FBVA 1JKHA 3NF8A 4E7KA 4DQSA 1CLQA 3VA0A 2IAJA 3AA2A 4H4OA 3O4QA 4OVLA 1BI4B 3T19A 4KHQA 4FZZA 1JLFA 3DLEA 4F3TA 1LWFA 4EP5A 4FLUA 1L3TA 1A5WA 2NUBA 4B08A 3OYMA 2ETJA 3HL8A 5CY4A 4DSKA 4RG8A 3V9XA 2KFZA 3EY1A 3TAMA 4CFAA 1ZBLA 1U48A 3QO9A 4PY5A 4HUEA 2KFNA 4C8OA 3TAEA 1JL1A 1I3AA 1L3VA 1X1PA 1ZBIA 4PA1A 4GVMA 1WAFA 4KFBA 2YV0X 4EP4A 2ZQBA 3O3FA 4M3ZA 1B9FA 4NYNA 4LY7A 3K57A 3TI0A 1YTUA 1T05A 2E6MA 4CEAA 1RDCA 4Z4IA 4ZTFA 1EP4A 1T03A 4FW1A 3OYEA 1NJWA 1SKWA 1JLCA 4CF0A 2ZD1A 3KTQA 3S9HA 4XIUA 3H08A 1WN7A 2HHXA 3L2UA 3P5JA 1Z25A 3K2PA 1S6PA 4DTNA 1IH7A 4M41A 2PY5A 4DF4A 3QIPA 4DLEA 1S5JA 4KV8A 4F8RA 3MECA 4FJJA 2X78A 4LH5A 2D5RA 3QEWA 3TAQA 4KI4A 5J2NA 2RF2A 4FJ8A 4Y1DA 1S1TA 3OYGA 2F96A 2HB5A 2R7YA 3D45A 4AILC 4BDYA 5CYMA 4DSIA 1RBTA 2DFFA 2VG6A 5HP1A 1TAUA 4M45A 3NGIA 3PY8A 4FM1A 4KI6A 4DFJA 1JL2A 1BQNA 3VQ5A 1ZYQA 3U3YA 2G8UA 4CEOA 3VQ6A 2QKKA 4I2PA 2A1RA 3RWUA 4AHCA 4CF8A 1UOCA 1C1BA 3KLHA 1U49A 3KD5E 3AO2A 1SKRA 3BDPA 2DFHA 3ZSYA 4KHWA 1HYVA 5FDLA 4CEDA 3I8DA 1X9SA 2E6LA 5C42A 4Y1CA 2Z1GA 4DTUA 4KHNA 4B9TA 1TKTA 2QXFA 3LPUA 5K14A 4I9QA 1JLQA 1VSDA 2GV9A 4AH9A 4E7LA 4N56A 3DOKA 3SNNA 5DMRA 3VQAA 3S3OA 3VA3A 4BE0A 4B9NA 4DFPA 3LALA 3D0PA 1WSFA 3A2FA 1VSEA 4CFDA 4CF2A 4FLWA 1JLBA 1BHLA 4FJKA 4N47A 2X74A 1J53A 3IRXA 4CJFA 3K5NA 4BE2A 2P1JA 1SKSA 1C0MA 4QAGA 3HVTA 1T8EA 2KZMA 3K5MA 1J54A 5KRSA 4FJXA 3QNOA 3OS0A 3SI6A 4W5QA 2HVIA 2WONA 2B4JA 4CEQA 5HRRA 1N5YA 2I5JA 1GOBA 4ID5A 3V1OA 3DLKA 4KTWA 3VQDA 4CHZA 2Z1IA 4DG1A 3O3GA 1WSHA 3MXMA 3RR7A 4ICLA 2P51A 3AO4A 1WLJA 3G10A 1BL3A 1IG9A 1I39A 3LP2A 4E7HA 3LWMA 1LWEA 3SPZA 4CF9A 2IGIA 2GBZA 1KTQA 3NFAA 4H4MA 3KKRA 1S1UA 5J2MA 3L3VA 4W5NA 4LH4A 3U6FA 1NKEA 1Q9XA 3SQ1A 4BACA 4ID1A 1VRTA 4HCBA 3HK2A 3I0SA 3KLFA 1NK8A 4Z4GA 4DU1A 2XY6A 4CJTA 3SPYA 2A1SA 2Y1IA 1KCFA 4IBNA 3V1RA 4NYFA 1FK9A 3ZT1A 2G8VA 3ALYA 3TAPA 2OA8A 4OLAA 3HPHA 4CHNA 3AA5X 3MEDA 1RT2A 3DRSA 3O4NA 1C0UA 4B9LA 3CFOA 1SL0A 4RW7A 3WNEA 3K5OA 1FKOA 1WSIA 4ELUA 3RTVA 4CJLA 3VQCA 3I0RA 1IO2A 4HUFA 4B3OA 3ZT0A 3RMAA 2HMIA 1KFDA 3NBPA 2OPRA 1TAQA 3DRRA 1S1WA 1DTQA 4CJVA 1KSPA 1RT7A 3THVA 2D0CA 3AVAA 3V6DA 5C24A 1TGOA 3HO1A 4NCGA 4ZTJA 3SV4A 2HVHA 1JLAA 2GUIA 2BANA 4FJGA 5SZTA 2G8FA 4C8NA 1Z26A 4DMNA 3BGRA 3SCXA 3IG1A 1QS4A 4E7JA 5J2QA 3V9WA 1Q9YA 2HHQA 2PZSA 2OZMA 4KB0A 2VG5A 4TSXA 2XRIA 4CECA 3NHGA 3TWHA 4E7IA 1NKCA 4M3WA 4PQUA 1LW2A 2KZZA 4I7FA 3RRHA 4K8ZA 3SQ4A 4M3XA 4OLBA 4OPJA 3KLIA 3V9SA 1TK8A 1G15A 3C94A 3DI6A 1MU2A 4IDKA 2W42A 1RT5A 1DTTA 5CZ2A 4DTSA 1WAJA 3ISNC 3AVKA 4G1QA 3QNNA 3WNGA 1RT4A 1ZBFA 1RTJA 3OJUA 3OS2A 4F3OA 4FLXA 5KGWA 4CHPA 1HNVA 3OYDA 4CGJA 4EZ6A 4B9MA 4DSLA 2XY5A 4UQGA 4YFUA 4OGEA 1L5UA 1XWLA 3SQ0A 4FK0A 1ZBHA 3LPTA 3ZSVA 4KAZA 2YNIA 3OVNA 4JS4A 3QIOA 4E3SA 4NCAA 2HHVA 4DSJA 1Y97A 4CHOA 3CYMA 4O4GA 2X6NA 3HP6A 2OZSA 1LAWA 4OKKA 4CK1A 3CFPA 4HUGA 3L2QA 2HHUA 1KVCA 2BGGA 3ITHA 5KRTA 3SUPA 4CIEA 1UA1A 2HNZA 3HM9A 4E0DA 2RN2A 2WOMA 3NDKA 2VWKA 1HPZA 1HQUA 4KTZA 3AO5A 3C6TA 4DTPA 4E89A 1UWBA 1LAVA 4RW4A 5CZ1A 3SZ2A 4CJQA 1J5OA 2XO7A 3P83D 3AO3A 3AVCA 4HTUA 1ZBUA 2XY8A 3P1GA 3CQ8A 1K6YA 4HCCA 1TKZA 4C8MA 3SQ2A 1NK6A 1FKPA 3KLGA 3HVRA 1VK0A 1RBVA 3ZT4A 4J2BA 1X9MA 1JXEA 1KVBA 3HXMA 4FJ7A 3K58A 4W5RA 3HP9A 2AJQA 4AHRA 5KGXA 3QEIA 3KKSA 3HT3A 3AO1A 1SUQA 2PYLA 1L3SA 1W9HA 3QETA 4CJKA 3NF7A 1RTDA 3DRPA 3KD1E 4KB1A 4FYDA 3B6OA 1RTIA 3V81A 2YNGA 4FJIA 3M8RA 1EKEA 4FZYA 5I3UA 4B9UA 3RRGA 3KK2A 1U45A 2P5GA 2HW3A 4Z4EA 1QSLA 4DQRA 4KRFA 2HHWA 3VQ7A 2ZE2A 1S6QA 2OPSA 3AVNA 1BISA 4JS5A 5HRPA 1X9WA 4KPYA 3MAQA 2G8IA 4M3YA 1UAXA 1C1AA 1VSFA 1S9GA 3PV8A 3JSMA 3AV9A 4IKFA 3SJJA 4CJPA 2ITGA 2FBTA 1YT3A 4BDZA 1WSJA 3NE6A 4M42A 4CEZA 3HPGA 4O0JA 4LD0A 3KIOA 4DS4A 1S1XA 1TKXA 3M8SA 1CXQA 3ASMA 3ZT3A 3NCIA 3LDSA 3TAGA 4DQIA 4M3RA 3ZSOA 1L3UA 3EYZA 3PO4A 2EHGA 3OYNA 1N6QA 3S3NA 2D0AA 4FJNA 2Q3SA 1KRPA 3C6UA 3IS9A 1TL3A 4OKEA 4CEEA 4Z4FA 4N5SA 4WE1A 4CFBA 3DMJA 3DLHA 4CE9A 1HYZA 3DLRA 1Q8IA 2LSNA 1EETA 1ASVA 1JLEA 4E1NA 3OYLA 5HROA 5EU7A 4FLTA 2BDPA 4M3UA 3OS1A 4QOZB 1IKWA 2JLEA 3RR8A 4F2SA 3LP3A 3PX4A 2FC0A 4CJWA 3MXJA 1IKVA 1A5XA 3OY9A 4HHTA 1RT1A 1TK0A 1QTMA 2DY4A 2B5JA 1RILA 3U3GA 5I42A 1JLGA 3OJSA 1BIZA 3DYAA 4CGDA 1BI4A 4Z4CA 3VQEA 4O44A 3AVFA 4RW6A 3ZCMA 4CGIA 4C8KA 1NJXA 4CGFA 1KFSA 1A5VA 2FBXA 2RPIA 1YVUA 2HHSA 3F9KA 1J9AA 3QEXA 1XHXA 5D3GA 4FZXC 1VSIA 1YTAA 1KLMA 3AA3A 3JYTA 1NK7A 4KHYA 2DFEA 4BWJA 3E01A 3CM6A 2OYQA 3L2WA 1VSMA 2YNHA 1IKYA 3LP1A 5HRNA 1R0AA 3ZT2A 2P5OA 3K59A 1JXBA 1QSYA 1EXQA 2ATQA 4QCLA 2XHBA 1C0TA 3V9ZA 3IAYA 1RDBA 5FROA 4DU3A 5JS2A 3SUOA 4CHQA 1BIUA 3UIQA 4KHUA 3SYZA 3KLEA 1S1VA 1VSLA 4IFVA 4KO0A 4E19A 3V9UA 4J2AA 3OYFA 4B9SA 2F8TA 4PWDA 2O4IA 5SWMA 4DWIA 1BQMA 1VSJA 2IDOA 4B9VA 4DQPA 1CZ9A 1TK5A 1UA0A 1RBSA 3ZSRA 3O3HA 1QHTA 2Z1JA 4E1MA 2FBYA 2VG7A 1EX4A 4DF8A 1SL2A 1RTHA 3OYHA 1XI1A 3AVLA 3WNFA 4FJ5A 2QKBA 3LZIA 3AVMA 3L2VA 4GW6A 3QINA 4CJ4A 3TABA 3MXIA 3ULDA 1NJZA 4EZ9A 1KVAA 1RT3A 2G8KA 3AVJA 1S9EA 3LAKA 3ZSQA 5HBMA 5HRSA 4CIFA 3OYBA 1D5AA 3L2RA 1VSHA 3PUFA 4GMJB 3ZSWA 4CERA 3CFRA 4AHTA 5C25A 3EZ5A 2G8WA 3DOLA 2DTUA 1B9DA 4KREA 4CJUA 4DTOA 3NH1A 3OYKA 4JRPA 3DLBA 4MQ3A 4B8CA 5J1EA 1CZBA 4N41A 3HYFA 1NK0A 2YNFA 3TAFA 4FJLA 1D8YA 5J2PA 5FRMA 4CFCA 3TR8A 4DTXA 3TARA 5KTQA 1O1WA 4CJRA 4DFKA 1SV5A 1C1CA 5HLFA 1HYSA 4O0IA 3LZJA 1IKXA 5T7BA 1RBRA 1T7PA 1TL1A 2Y1JA 4CK2A 3KK3A 4RW9A 4CK3A 4FVMA 4B8AB 2VWJA 4CF1A 1LV5A 4CJ5A 4CCHA 1BCOA 1GOCA 3LP0A 4CJ3A 4OKJA 3QERA 4AHUA 4OJRA 4Q0BA 3AVIA 4BWMA 3T3FA 4FLVA 3AVBA 2EX3A 4DSFA 4FXDA 3F73A 1TV6A 3OYAA 2IOCA 4AHSA 1XC9A 3L3UA 4NCBA 4CGHA 2IC3A 4ELTA 2HHTA 1F21A 2RKIA 2X6SA 2PYJA 2O4GA 1LW0A 1RT6A 4LSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NAEA 4CJEA 3OYCA 1X3NA 4CZEA 4FJMA 3WNHA 4BVOA 2KQ2A 3KWIA 2HBJA 1E4GT 4CEFA 3M8QA 1K8AO 3PO5A 1GLDG 4DTJA 4ISGA 2UXBK 1NGFA 4FLZA 3BZCA 1NGIA 3MEEA 4BVPA 3HSCA 4I2QA 3EO3A 3VGKA 4N76A 4B1VA 3VERA 4DTRA 4RCHA 3NH2A 4FWMA 4DCHA 1VRUA 1IBKK 3O6WA 5AR0A 4CESA 3VQPA 5AZJA 4FW2A 3TSUA 4AHVA 1WB9A 3DXKB 3E9LA 1RBUA 1MA9B 3SUQA 4PKGA 2YJEA 4KHSA 4KH5A 4YOUA 4KBOA 1NOYA 4A5BA 4BGBA 4GV9A 4NO7A 1D9FA 1WNSA 2RE2A 4Q5VA 4BY9C 1GOAA 4O55A 2E4LA 4RW8A 5KI6A 3MWPA 5H1SQ 3LDLA 4PUOA 3EKUA 3H46O 3B6PA 3TSPA 1Q81O 1KLNA 1WSEA 5E41A 4PHTX 1NGDA 3LAMA 2QWMA 4DQQA 4H0YB 4ZHRA 3V4IA 4AQYK 3QB0A 4LSNA 1XHZA 4FCYA 1DKGD 3H3NO 4M3TA 1U04A 5FRNA 2E8AA 1BCMA 1HKBA 5DK5A 3J81O 5F2RA 1C6VA 3ULEB 3M8PA 3VQBA 4CZMA 1W0HA 2YHXA 3V1QA 4E7KA 3O4QA 2QA4N 5FLXO 1JLFA 1LWFA 2NRHA 3PIPL 1A5WA 4JI2K 4B08A 3OYMA 4FLUA 1E4FT 2ETJA 5CY4A 3CPWM 1U48A 3TAEA 1JL1A 1I3AA 3AAQA 3H1VX 1L3VA 3NMUA 2YV0X 4JI7K 2QWRA 3O3FA 1B9FA 3TI0A 3ENHA 2YHWA 4JKBA 4Z4IA 3ZX3A 1T03A 4FW1A 2ZD1A 3S9HA 4FVUA 3L2UA 4IJAA 3K2PA 1QQNA 4IEEA 5AFUH 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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