4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
2A42A 2GWKA 3MK6A 4EHUA 3A5OC 3GBTA 2Q0UA 3R8EA 4WQ4A 4BR0A 3MN6A 3FE1A 3CIPA 2P9PB 4BC4A 2FF6A 4YDUA 5AZIB 1HKCA 3ULEB 3SMPA 5AQLA 3W0LA 2W41A 1NMDA 3FZLA 1U2VB 3MN5A 4EHTA 3C7NA 1Z05A 3LDPA 4BRCA 3QDKA 2YJFA 1HKGA 2QWLA 4H03B 1V4SA 2GELA 1BUPA 3BEXA 3OHRA 5TKYA 1NLVA 3VEZA 3SJHA 3ID8A 2PAVA 4RCHA 3D7EO 3W3DA 4FWSA 1T6CA 2IVNA 2Q0RA 2ITMA 1MWKA 4IWVA 3VEYA 2D1KA 3VOVA 1GLAG 4BRPA 4GNIA 4WQ4C 1YUWA 3WEEA 1X3MA 3R9PA 2I7PA 1SAZA 4YDUC 3DJCA 1BA0A 4FWQA 2FLOA 1JCGA 3JXUA 3WXJA 2NZTA 4K42A 2IVOA 3VPZA 1HX1A 5F2RA 1GLJO 4BG8A 4BR7A 1IG8A 3J8AA 3KHYA 4CZJA 2AA4A 2QM1A 3BF1A 4FPBA 3VGMA 4BG9A 2GEMA 3I33A 4O8KA 3CJBA 3DXKA 3DWLA 3UB5A 2YJEA 3H46O 3DAWA 5AFUA 3A5LC 1C0GA 1QHAA 1T44A 2P9NB 3AARA 4BRNA 4CBXA 4GY2B 5AQRA 1KAXA 5AQKA 3VEXA 1TUUA 2HF3A 2P9UA 2Q1NA 2ASOA 1K8KB 4M63C 3FZFA 4PL8A 1JCEA 4K43A 1RDWX 1JCFA 3FZHA 1NGJA 5FPDA 3VEWA 3O1WA 1T6DA 4M7YA 3UKUB 1KXPA 2FXUA 3WQTA 3LDLA 5AR0A 1ATSA 3KZBA 3VEOA 4FL9A 3C0BA 2P9SB 2Q97A 5EOYA 2E8AA 4BRKA 5BPNA 3CJCA 4NO7A 3MN9A 2YHXA 3FR0A 2QWRA 2QWNA 4I6MB 2HMPA 2QWPA 4JN4A 3IUCA 1GLCG 1ZBSA 4EAHD 3QBWA 4PL7A 2E1ZA 3MDQA 3GG4A 4QS7A 3MCPA 2P9PA 4BRMA 3VESA 3ULEA 1ESVA 1D4XA 2EWSA 5EY4A 3EKUA 2F9TA 4FOIA 4C23A 1U2VA 4BRIA 5KPRA 4JHDA 3WXLA 1Q18A 3U4LA 4CZKA 4HWIA 3TPQA 3IMXA 1NGAA 1RFQA 5AQOA 4XEIA 2A5XA 2GTDA 2QWMA 2CGJA 4BGBA 4H5WA 1V4TA 3VF6A 4RTFD 3B8AX 1G99A 1YAGA 5FPNA 3GDQA 1NGHA 1IJJA 3M1FA 3SK3A 4DHYA 3QICA 1NM1A 2IIRA 1NGDA 3EKSA 3LDQA 1GLFO 4B1XB 1BG3A 3EL2A 5AQYA 4CBWA 4BC5A 2VYPA 5BR9A 1YXQA 4BQLA 2YHWA 5BRHA 5KQDA 1GLBG 2BTFA 4FOEA 4QS8A 4H5NA 4A62A 4B1WB 1NGGA 1TUYA 3H1VX 3JS6A 4FWNA 4XH5A 4FWRA 5ELZA 1NGFA 3TU5A 5AZJB 2FSKA 2YHYA 4AM7A 5JLFA 2J4RA 3CJAA 2ZGZA 1NGEA 3FZKA 1BOTO 2P9NA 4CZGA 1OKJA 3P4IA 1S22A 1X9JA 2GUPA 5F1XA 2PBDA 3CERA 5KQ8A 3QB0A 1Z6RA 1K8KA 1MA9B 2P9IB 3RSEA 1KAYA 2ZF5O 2I7NA 5I9EB 3ZEUB 2P9LB 5BN9A 3UKUA 4CZMA 2VCPA 3ZX3A 4DQ8A 3LDNA 1TYQB 3CETA 3O1BA 2P9SA 2V51B 3A8YA 3LDOA 5AQMA 3LL3A 5ADXH 1HUXA 4FWPA 4I6MA 3CQXA 4H0TB 4J8FA 3R6MA 3H1QA 5AQVA 1BU6O 1DKGD 5AQNA 4BRDA 4CZIA 2P9KB 2A41A 3WXIA 4M7XA 3WQUA 4PKGA 4E1JA 5AQTA 4F9OA 3C7NB 5FPMA 3U9DA 1NWKA 1J6ZA 2QW9A 3CQYA 2V7YA 2V7ZA 2E1YA 5E26A 2E2PA 3VGLA 4BRQA 5AQXA 1BWFO 4K41A 3BP8A 3ZETB 4Y0WA 3DXMB 3UKRB 1HKBA 4BROA 4FWKA 2YCHA 3L0QA 2F9WA 3FFKB 3WEEB 1U6ZA 2QXLA 4H0YB 3BUZB 4HTLA 4B1UB 4BVPA 4CZEA 1ZXOA 3F9MA 4A2BA 1GLDG 3A5NC 4H5VA 4BVOA 5AZIA 3U9ZA 3UE5A 1X3NA 3FGUA 2FF3B 3HZ6A 3QFUA 3H3NO 2A6AA 1P8ZA 1EQYA 2Q36A 2WUSA 3DXKB 2KHOA 3CJ1A 1ATNA 1LCUA 1SZ2A 2QWOA 1SQKA 4JD2B 1HPMA 3FZMA 3QFPA 1ZC6A 4BR2A 3SLCA 1CZAN 4CJ7A 4DB3A 3VEVA 1GLEG 2NLXA 5AQSA 5KPTA 2P9UB 4PKHA 4AM6A 5AQJA 3ZX2A 3D2FB 3H6EA 5JLHA 1QQMA 3G25A 1RGIA 4BRGA 4CD3A 1BDGA 1HJOA 4PKIA 2P9LA 3VETA 5FPEA 4RWTA 2E2QA 3H45C 3VGKA 1LOTB 1TYQA 2ZGYA 4JNEA 4K25A 4EFHA 4A2AA 2A40A 4IJNA 3EN9A 1NBWA 5BN8A 1MDUB 1BA1A 1XQSC 2E2NA 4QS9A 5EX5A 1WUAA 4JAXA 4IJAA 4LC9B 3MN7A 2ASMA 4EIAA 4ISEA 3ZX0A 4FO0A 5AFUH 4BQZA 5F0XA 5AQHA 2P9KA 4XH4A 3L6QA 1DGKN 4H5TA 4CBUA 5LY3A 2CH6A 1WOQA 4H0OA 3AAQA 4JHDB 4BR9A 3GE1A 3O08A 1XC3A 4B1ZA 3U8XA 5AQZA 4KBOA 1QZ6A 3D2EB 3LM2A 2ZWHA 3WUHA 3A0IX 5KPZA 3L4IA 5BRFA 3HTVA 2HF4A 4BGAA 4FPAA 4B9QA 2OANA 3KVGA 3ZETA 3M6GA 3O80A 4H0XB 2E20A 3QBXA 3DXMA 5EXWA 1NGIA 2FSJA 5AQIA 3O6WA 1ATRA 3UKRA 4BRFA 5E84A 4BC3A 3AAPA 3MMVA 3ENOA 3CI5A 4FSVA 1C0FA 3ENHA 2NRHA 3I8BA 2FSNA 3AY9A 3CJ7A 5JICA 2VWBA 2IVPA 5AQPA 2ASPA 1H1VA 3LM9A 1Y64A 5CE3A 4CZLA 3M3ZA 4NB4A 3HBTA 4IO8A 2Q31A 3S41A 3VENA 5BRDA 4B1VA 4BRAA 4DCHA 5AQGA 3IDHA 2CGKA 4IZ9A 3FLCO 3BF3A 3HM8A 1QQNA 4L3QA 1GLLO 4WQ5A 4JD2A 4MLEA 3WXKA 5AQFA 2Q2RA 5AQWA 5LJWA 2BUPA 3CHWA 1DEJA 2CGLA 2H3GX 3GL1A 1QQOA 3IFRA 5EVZA 3CJ9A 3O4WA 3RSEB 4CD1A 3A5MC 3D2FA 3WT0A 4CI6A 4BC2A 3H3OB 4H0PA 3HI0A 4ISFA 4MO4A 4BRLA 1MWMA 5AQQA 3ATVA 4ISGA 4IXCA 5B8HA 1E4GT 2YI1A 1BO5O 4FWMA 1E4FT 3SMSA 5ADXA 1R59O 4CZHA 2E88A 1NGCA 2D4WA 3HSCA 2GWJA 4WYBA 2D0OA 2CH5A 4XH1A 5AQUA 1HLUA 2AP1A 4WQ5C 4BRHA 5JMVA 2DPNA 4FWOA 5AZJA 4MO5A 3ATUA 3EZWA 3VF2A 1YVNA 4H5RA 5BPLA 2QWQA 4CZFA 2D0PA 4A61A 4BR5A 3O5BA 1KAZA 2UYTA 4BR4A 1NGBA 3O8MA 2E2OA 2P9IA 3QMLA 3D2EA 5BPMA 4MLHA 3ZEUA 5BREA 4Z94A 3VF4A 4BREA 1S3XA 1XUPO 4B1YB 2HOEA 3VERA 1QZ5A 2V52B 4O5FA 2W40A 4FWLA 5LJVA 2A3ZA 4H0VB 3GOIA 3EO3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ID6A 3DI6A 3R3LA 4OX9K 4NXNK 2Q0UA 2PYLA 4IG0A 5JVHL 3M8QA 3CIPA 3EEQA 4CEFA 4BC4A 2D0AA 1HYVA 4CJWA 4KI4A 4CHPA 5AZIB 2FBTA 4FJXA 1RT2A 3SMPA 5J2QA 3FZLA 2B4JA 4OGCA 1XNQK 1ASVA 3C7NA 5EU7A 4R79A 1SS6A 5CY4A 3ZSZA 1HKGA 4DQPA 1V4SA 2VWJA 2QKKA 4Y1DA 3VQDA 3QEWA 1JLEA 2JGUA 3V9XA 2P5GA 3P38A 3E9PA 4FWSA 2HHWA 2DTUA 2OPRA 4PHTX 2ZE2A 5HRPA 3SBTA 2WTUA 4N47A 4BRPA 3WEEA 3K57A 5KGXA 3S9HA 1TV6A 3DRSA 1VQKN 1SKWA 4YDUC 3DJCA 1BA0A 1JCGA 3WXJA 3OYMA 5A2QO 3VQBA 1IKWA 2IVOA 3NH2A 4BG8A 3OYCA 1YI2N 2AA4A 2QM1A 4CK1A 3CFRA 4LF7K 1TAUA 4O5BA 1FKPA 4PWDA 3LDSA 3UB5A 1L3UA 3DAWA 3A5LC 2P9NB 4LH4A 4CBXA 1M1KO 2HVHA 3PLAA 3VEXA 4NCAA 3FZFA 3ZSXA 1JCEA 5KGWA 1JCFA 1TKDA 3VEWA 3SV3A 3O1WA 4CFAA 3VQ9A 4W5RA 1W0HA 2PZSA 2P1JA 3N4PA 3WQTA 3LDLA 5AR0A 4B9VA 5J1EA 1I3AA 4BACA 5EOYA 3R1XA 1FKOA 4NO7A 4DSJA 2QWRA 5C2FA 4CF9A 2HMPA 2QWPA 4JN4A 1RDBA 1OVQA 1KFDA 3NE6A 4EAHD 1S1UA 3RR8A 2E1ZA 3MDQA 2BH1A 1J5EK 3GG4A 4QS7A 2P9PA 4B3SK 4JI3K 2EWSA 3QETA 1VRTA 5EY4A 4RW8A 4DMNA 4YOVA 4YFUA 5KPRA 2WOMA 1TL3A 4BWMA 2Q3SA 1UA0A 3AGKA 2E6MA 1VAZA 4XEIA 5J2MA 4RW6A 2OYQA 3QEVA 2KZZA 1W7AA 3TWHA 2Z1GA 5FPNA 3KK3A 3TAPA 3L3VA 4HCBA 4YHHK 3ULDA 4HUGA 3N4QA 3CMAN 1J54A 4M3WA 3QICA 3CCLN 2NNWA 4DV1K 4RW7A 3LDQA 1YTAA 1GLFO 1BG3A 1NMNA 3ASMA 1SKRA 4JS4A 1ZYQA 2F8SA 1YXQA 5BRHA 5LMNK 1U47A 4FOEA 4QS8A 3NFAA 3FFIA 4B1WB 3ZT2A 3H1VX 3ITHA 4XH5A 5ELZA 1NGFA 5FDLA 2FSKA 4AM7A 2GBZA 1IV0A 3MAQA 3CD6N 2BGGA 3P4IA 4V19S 4HCCA 1BGXT 3HM9A 4CFDA 2HBKA 4BE1A 3NBPA 2YKNA 3I55N 1K9MO 3HK2A 1K8KA 3AA3A 1MA9B 1HNVA 5LL6Z 1KAYA 2I7NA 4DR3K 4CE9A 3UKUA 4JKHA 2VCPA 3ZX3A 4DQ8A 3SQ1A 3MXIA 5HRSA 4BWJA 3LDOA 3NHGA 4J2EA 4U67L 4FWPA 4I6MA 3R6MA 2Z1JA 3H1QA 1DKGD 1HPZA 3O3FA 4X66K 4B3MK 4M7XA 5HP1A 2OPPA 3C7NB 1C1BA 4Z4GA 3AO5A 4CJKA 3KWGA 3K2PA 3KJVA 1JL2A 2UUBK 3HT3A 5E26A 3VGLA 3JYTA 1VQLN 1EP4A 4JK8A 4JRQA 3SAFA 3ZETB 4M3YA 2B6AA 4Y0WA 4DTXA 2X6NA 3DXMB 1NKEA 1HNIA 3HJFA 4BROA 2YCHA 3DOKA 1ZBLA 3DLHA 3B6PA 4CJSA 3U3YA 1YTUA 3WEEB 1KSPA 2QXLA 3BUZB 1ASUA 2HHSA 4JI8K 4WF9L 3K58A 4CZEA 3F9MA 1LW2A 1KLNA 4BVOA 1FJGK 3FGUA 2FF3B 4GV6A 2KKZA 4HHTA 1TKTA 1D9FA 3QFUA 1NK6A 2YKMA 1X1PA 4AH9A 1RBUA 1WSFA 3NMUA 1VQON 5C2DA 3J7AP 4O0JA 1ATNA 1LCUA 3V1OA 1RTDA 1ZC6A 1T05A 4UY8O 4X65K 1CZAN 3P39A 4DB3A 1CXQA 1GLEG 3T1YK 1WSEA 3ZX2A 4LFBK 3D2FB 4E19A 4DR1K 4KHWA 4BRGA 3LANA 4OPKA 4FLYA 3K5OA 3H45C 2BE2A 5C25A 3J81O 3L4QA 1REVA 4EFHA 3CM5A 3TAFA 2WC9A 1W97L 4CVNE 1BA1A 3NH0A 4ILGB 3MN7A 3DOLA 4E7KA 4CJQA 4DV5K 4FXDA 4CJUA 3E66A 5AFUH 1BI4A 1C1AA 1U45A 4DFPA 1D8YA 3L6QA 1DGKN 5LY3A 4CFCA 1WOQA 3MXMA 1SL0A 2D5RA 3GE1A 3THYB 5E41A 3U8XA 3G10A 5AQZA 2PYJA 1TAQA 4A59A 3LM2A 2O8FA 3SUPA 2WFBA 5KPZA 4ID1A 5M1QA 3HTVA 4FJJA 4BGAA 4FPAA 1IKYA 4AQYK 2OANA 4EP5A 3KK2A 3SYZA 5AQIA 1ATRA 4BC3A 3QEXA 5DM6L 3AAPA 4NYNA 5KRTA 3QO9A 4WFAL 3ZCMA 4FSVA 4KB1A 2VG6A 3ENHA 2NRHA 2FSNA 2RE2A 3KIOA 3OW2M 4FLWA 1QSYA 3S3NA 3BGRA 5AQPA 4M3XA 3LM9A 4CZLA 2O8DA 4YY3K 4NB4A 2OZMA 4IO8A 2O8BA 2E4LA 3OYHA 4BRAA 5AQGA 4DR2K 4C1NI 1XMOK 1RILA 1NNEA 4L3QA 1GLLO 4AHRA 1O13A 3WXKA 5AQFA 2OA8A 4KPYA 3TANA 4F8RA 4KB0A 1WSIA 1DEJA 5TKWA 4WCEL 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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