4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
2V52B 1T6DA 4PKIA 3M3ZA 3DXMA 4BQLA 4BRHA 4A2AA 4DCHA 1GLDG 4BC5A 1K8KA 1QQOA 2ZF5O 3UKRA 1E4FT 5E84A 5AQHA 4EAHD 1QQNA 3MK6A 3FE1A 4WYBA 5AQTA 3ULEB 2IVNA 1LCUA 1NBWA 3ATVA 3FZHA 4CZFA 3H1QA 4EHTA 3MN6A 4CZLA 3D2EA 4BR5A 3A5MC 3ZX2A 3EN9A 3VEVA 3EO3A 2A3ZA 3A5NC 4FWOA 4H0TB 1S3XA 3MN7A 2FXUA 4B1XB 5AZIA 4CD1A 2QWQA 3VF2A 3AY9A 5AQMA 1Z6RA 5AQXA 1BWFO 3DXMB 1E4GT 4H0VB 2GTDA 1NWKA 1Z05A 1K8KB 1G99A 5B8HA 4H0OA 3SMSA 1RDWX 2ASOA 3VGLA 3A5LC 1TYQA 3VEYA 1T44A 1T6CA 2BTFA 4GNIA 3UE5A 3D2EB 1NGEA 5AQVA 3TU5A 3CJ1A 5AQSA 3ENOA 1HKCA 1QZ5A 3D2FA 4B1VA 4MO5A 4H03B 4MLHA 5AZIB 2YHXA 4DQ8A 4PKGA 5EXWA 2PBDA 3R8EA 3FGUA 4EIAA 3B8AX 4DB3A 2Q36A 3VEZA 4EFHA 4H0XB 2W40A 2Q0RA 3VENA 1BDGA 3M1FA 3QMLA 1QQMA 3CQYA 4BRPA 5FPEA 1NGFA 2QWLA 5AQWA 4B9QA 2QM1A 1P8ZA 3CJAA 1TYQB 3ZEUA 2Q1NA 4CZIA 4I6MB 1GLEG 2D0PA 4B1YB 3A8YA 2ASPA 2CGJA 2CGLA 3P4IA 1YXQA 3GBTA 1NGHA 3D2FB 4JHDB 2UYTA 4PL8A 4CBUA 1SQKA 2IVOA 3ENHA 4BR7A 2QWRA 1IG8A 4H5NA 1S22A 3FZLA 3VETA 4XH4A 4CBWA 4DHYA 3MN9A 1NGGA 3I8BA 2HOEA 1ATRA 4GY2B 3MN5A 4BVOA 1HLUA 1EQYA 1XQSC 1BO5O 4CI6A 3WEEB 3EKUA 3ZEUB 2A6AA 3H6EA 2HF4A 2P9PA 1NGJA 3UKUA 2IIRA 3D7EO 2HF3A 5KPTA 4CD3A 4FPAA 1NLVA 5F2RA 4IXCA 4WQ5C 3WXKA 3F9MA 5JLFA 2QWMA 2NZTA 4XH1A 4BRFA 4E1JA 5AQZA 4WQ5A 3HTVA 4H5VA 4XEIA 3O4WA 1C0FA 5JMVA 1X3NA 4O8KA 3AAQA 2PAVA 3JXUA 3FFKB 3RSEA 4AM7A 4BG8A 1DKGD 1H1VA 4BRIA 1RGIA 5TKYA 2I7NA 5ADXA 5BRHA 4BC3A 3S41A 3BEXA 3ZX0A 2YI1A 2P9PB 1DGKN 1XUPO 3CETA 4FL9A 4ISGA 3UKUB 4IJAA 4H5WA 1BU6O 5LJWA 2FF6A 4BREA 1MWKA 3FZFA 1KAXA 3IFRA 2P9LA 2P9KA 2E8AA 3FLCO 3LDLA 4CBXA 1R59O 2QW9A 4KBOA 5AQIA 3MMVA 5F0XA 1ESVA 3ATUA 1KAZA 3FR0A 2AA4A 3QB0A 4MLEA 4BR2A 4Z94A 3U9DA 4RWTA 3RSEB 4FWNA 5AQQA 4BGBA 2E88A 3IMXA 4B1WB 2VYPA 3UKRB 3L4IA 2Q0UA 4CZMA 4JN4A 5AR0A 4NB4A 3SK3A 2FSNA 5AQPA 1TUYA 4HTLA 1ZC6A 2E2PA 3CHWA 2P9LB 2P9KB 4BRQA 3FZKA 2ITMA 5KPZA 3VF4A 5BRDA 1SZ2A 4O5FA 2FSKA 2GWJA 3O6WA 3WQUA 3L6QA 4M7XA 4QS8A 3VOVA 5AQKA 1YVNA 4FSVA 4CJ7A 2I7PA 3GDQA 1MWMA 5KQ8A 4BR4A 3EKSA 1BUPA 1ATSA 1WOQA 5AFUA 3U9ZA 3R6MA 3VEXA 4JD2A 3WXLA 2FSJA 3LDPA 1GLFO 1ZXOA 3HI0A 1ATNA 4MO4A 1GLCG 2V51B 3BUZB 1HX1A 4FWSA 2GEMA 5BPNA 3OHRA 1GLJO 2A41A 3A0IX 3SJHA 4FWRA 4K25A 4BGAA 1KAYA 3VEWA 5BRFA 3DXKA 5BREA 1QHAA 1GLAG 2VWBA 2GELA 4QS9A 3HZ6A 4BRCA 4BRDA 1NMDA 4FO0A 5FPDA 4L3QA 2Q97A 1OKJA 5BR9A 4K43A 3VF6A 4BRKA 4BRLA 4FOEA 2ZGZA 1BOTO 3EZWA 4FWLA 5KPRA 5BPMA 1YUWA 3O08A 3LM2A 4IWVA 1U2VA 5EX5A 4JD2B 2E2NA 1NGAA 1RFQA 1QZ6A 3QFPA 4CZJA 4B1UB 3IDHA 2H3GX 5AQLA 4IJNA 2WUSA 1HPMA 2YJEA 3UB5A 1X9JA 3QBXA 2ZWHA 4RTFD 3VERA 3GG4A 5EVZA 4BC2A 4ISFA 3HBTA 4BRAA 5I9EB 3L0QA 3H45C 2E1ZA 3QDKA 3VGKA 2GUPA 2E1YA 4NO7A 3ZETA 3ULEA 2CGKA 5FPMA 1U2VB 1WUAA 4J8FA 5AQOA 4A2BA 4BRMA 5JLHA 4XH5A 2QWNA 1TUUA 4H5RA 3W0LA 5AQNA 2P9SA 4H5TA 4K41A 4PL7A 1Y64A 3M6GA 3CIPA 2D1KA 1NGCA 5KQDA 2E2OA 4YDUA 1NGIA 5AQFA 5ADXH 1YAGA 1IJJA 3TPQA 4CZKA 2NRHA 3KZBA 3MCPA 3A5OC 3HSCA 3H3NO 3BF3A 3IUCA 5AQRA 1BA1A 3QICA 2Q31A 3LDQA 3H1VX 2A42A 2EWSA 2YHYA 3U8XA 5E26A 3ZETB 2FLOA 4AM6A 3VPZA 3CJ9A 4C23A 3DAWA 4FPBA 4BQZA 2QWOA 4CZHA 2DPNA 1MA9B 4BC4A 3GL1A 3CJ7A 3GE1A 4RCHA 2CH5A 5AQUA 4B1ZA 2P9SB 3CJBA 5BPLA 2BUPA 3AAPA 1X3MA 4EHUA 2W41A 1D4XA 2NLXA 4PKHA 5FPNA 3WT0A 2A40A 2HMPA 4A62A 2FF3B 4ISEA 3C7NA 3CQXA 5LY3A 3LM9A 4FOIA 3WUHA 4FWKA 4CZGA 2P9UA 1SAZA 3GOIA 4CZEA 5F1XA 3FZMA 5AQYA 5LJVA 1LOTB 1MDUB 4BR0A 2D0OA 1HKBA 4I6MA 5JICA 3O1WA 3CI5A 1DEJA 1XC3A 3KVGA 2YCHA 2F9TA 4LC9B 1BG3A 2P9IA 3O1BA 2P9NA 4JHDA 5AQJA 4BRNA 1NM1A 2QXLA 1C0GA 3QFUA 4IZ9A 3W3DA 3VEOA 4BR9A 3KHYA 3JS6A 4JAXA 5AZJA 3QBWA 3HM8A 1Q18A 4H0YB 4H0PA 3WQTA 3C0BA 1CZAN 3C7NB 2ZGYA 4FWPA 5AFUH 1U6ZA 1JCGA 2P9UB 4K42A 1GLBG 2Q2RA 3G25A 4FWQA 1BA0A 4A61A 3BF1A 4QS7A 3WEEA 1HJOA 2E2QA 3J8AA 2ASMA 4Y0WA 3WXIA 2A5XA 3AARA 3DJCA 3SLCA 1J6ZA 2AP1A 2QWPA 2V7ZA 5EY4A 2P9IB 2P9NB 2J4RA 2KHOA 3I33A 3VGMA 5AZJB 1NGDA 2CH6A 1JCFA 2YJFA 2F9WA 3EL2A 4HWIA 3CERA 3R9PA 3CJCA 2V7YA 5EOYA 3MDQA 1HKGA 4JNEA 3WXJA 3ID8A 3O8MA 5AQGA 3DXKB 3VESA 4BRGA 3ZX3A 1NGBA 5ELZA 3DWLA 1HUXA 3H46O 4M7YA 5BN9A 3H3OB 4BVPA 3LDNA 1KXPA 3O80A 2IVPA 4BG9A 2E20A 2GWKA 3LDOA 4WQ4C 4IO8A 1ZBSA 3BP8A 2D4WA 3U4LA 2YHWA 2OANA 5CE3A 4WQ4A 3O5BA 3SMPA 2VCPA 1V4SA 4YDUC 1JCEA 1GLLO 5BN8A 4FWMA 4F9OA 3LL3A 4BROA 4M63C 1V4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPQA 1C0TA 1XNRK 3M3ZA 3DXMA 5GIPA 2E6LA 3Q7CA 1GLDG 4CGDA 4BC5A 4CK1A 1QQOA 1E4FT 4WYBA 4DSIA 1QVGM 1KLMA 3FZHA 3MXJA 3H1QA 3J81O 4DV4K 1L3UA 1NKBA 1ASVA 4KFBA 2HNDA 1VQLN 1S3XA 3MN7A 3DLRA 4DQQA 4IDHA 4NYFA 3VF2A 1EWRA 3HOSA 4CEQA 4B3TK 3THVA 5C10A 5FRMA 5KGWA 1B9FA 3CC7N 4NXMK 1E4GT 1NWKA 3L3VA 4OPHA 3QEIA 4FJHA 1G99A 4H0OA 3AA2A 3VN5A 2YKMA 1T6CA 3BGRA 3KK3A 3UE5A 3D2EB 1NGEA 3LWLA 1NK0A 4L8RB 3J80O 3EEQA 1SL0A 5FROA 4MO5A 4MLHA 2YHXA 4RW7A 4DSEA 3IAYA 3ID6A 4Z4EA 2PBDA 3D0PA 4EIAA 5TKWA 2GV9A 4AF1A 1QS4A 1HQEA 2Q36A 4H0XB 5BR8K 1TKXA 3M1FA 3DOLA 4Z4FA 1NK8A 1B9DA 2QM1A 3CJAA 1QSYA 3S3OA 4CZIA 3ENBA 3Q7BA 4I6MB 1O13A 2ASPA 2CGJA 1YXQA 2RKIA 2ZJQL 3V9WA 1T8EA 3VQ5A 4HUFA 2GUIA 1QVFM 4HVJA 2W6LA 1VQON 4H5NA 1GOAA 4RW8A 2X6SA 3VETA 3H08A 4XH4A 1D9DA 4QCLA 1OH7A 4LFAK 4DTNA 1NK5A 3TAQA 4DG1A 2E5LK 2HOEA 4X66K 4DSKA 1ATRA 4GY2B 1X1PA 3MN5A 4BVOA 1N6QA 4F3OA 1EQYA 1BO5O 4CJLA 4CI6A 2F7TA 3EE9A 3CYMA 4N47A 2IIRA 2VG6A 3OYHA 4IOAL 2D0CA 2ZD1A 4LFCK 1NLVA 4IXCA 4WQ5C 4JI1K 3B6PA 5JLFA 5AQZA 4FCYA 2JWLA 3L4QA 4XEIA 3SPZA 4GV9A 4MFBA 2PFUA 4A5BA 3AVCA 4CERA 4IEIA 3NFAA 3CMEN 1N34K 1VQNN 3LANA 3JXUA 3QO9A 1HMVA 4AHRA 4M3ZA 2X6NA 4O0JA 2DFHA 4BC3A 4LFBK 1XUPO 3C6HA 3PUFA 4FL9A 3ULDA 3SCXA 3G10A 4X62K 5GINA 1NOZA 4CGGA 4B3RK 2O8FB 2OPRA 4OO1J 1KAXA 3CCQN 4FJGA 3LDLA 4FLUA 4GV6A 1VQ8N 2QW9A 1NNEA 2G8VA 1HQUA 1VRTA 5F0XA 3CCMN 3RR8A 1N32K 1KAZA 1S6QA 2AA4A 4F2SA 1RTDA 1VQ6N 4Z94A 3U9DA 4Z4HA 3RSEB 4DTOA 4BGBA 4CESA 3DRSA 5M1OA 1BHLA 2VYPA 4KRFA 4B9VA 4O8UA 3NGIA 1SKRA 5C25A 3V1RA 3SK3A 4NB4A 1YF5L 3I55N 2E2PA 4WFBL 1NKEA 3F73A 2HBMA 3FZKA 2UUBK 2ATQA 5CZ1A 3K59A 3QERA 3LDSA 5BRDA 1SZ2A 2FSKA 3WQUA 2ZJPL 4DTJA 3J7AP 5AQKA 4HCBA 1YVNA 5GAGP 3HPHA 4JKGA 3AA3A 4V19S 1VSHA 1MWMA 3JAMO 1XMOK 3K5LA 4BR4A 3CD6N 5FRNA 3KD5E 1KCFA 3U9ZA 2BGGA 1K9MO 5HRSA 4W5OA 3LDPA 1XHZA 1GLFO 1ZXOA 3I0SA 4JKHA 4FWSA 1GLJO 3MWPA 4JI5K 1VAZA 4K25A 3QINA 3I8DA 4DQRA 3K0SA 2G8FA 1KAYA 3DXKA 2P5OA 4CGJA 1QHAA 4JKCA 1Q8IA 4BRCA 5AJ3K 4BRDA 3O4QA 1JLQA 3WNFA 3VF6A 3JSMA 4H4MA 3O08A 4JD2B 4CF2A 1IKWA 5FDLA 1C1AA 1WSFA 2GBZA 3OYGA 4CZJA 1BI4A 2H3GX 5CY4A 2WUSA 3SBGA 1HPMA 3UB5A 1X9JA 2OPPA 3QBXA 4RTFD 2O8BB 1FKOA 3V6DA 4ISFA 1K8AO 3E66A 3HBTA 4JEPA 4BRAA 4KH4A 3LALA 3L0QA 2D0AA 2NRZA 2F4VK 4ILJA 1VQ4N 1U2VB 5AQOA 1HNVA 4A2BA 3NVMA 1GOCA 4PQUA 1TUUA 1JJ2M 4H5RA 1P90A 4ELVA 2P9SA 4K41A 3EE8A 3O9TA 4CHQA 1XC9A 1NJXA 1UAXA 1D5AA 4DU4A 3O4NA 3HYFA 4Y1CA 2NRHA 3MCPA 3L3UA 3CCLN 3A5OC 2XO7A 1Y97A 1FK9A 3M8PA 2HBKA 3AVBA 3CPEA 2XHBA 2YHYA 1TKZA 4AM6A 1TL3A 4C23A 4CZHA 2DPNA 1MA9B 3GE1A 1JXBA 3K5MA 2HHSA 4CHZA 3OYLA 3AAPA 1X3MA 4JI6K 4WFNL 3TAFA 1TK5A 3OYFA 2FF3B 5GAHP 3AA5X 4CEDA 3C7NA 3CQXA 4FOIA 3WUHA 3THYA 3OYMA 4IFVA 5AQYA 1MDUB 2YNIA 3SYZA 2D0OA 4I6MA 3PO4A 5JICA 1DLOA 2A1SA 3O1WA 1S6PA 1XC3A 3KVGA 1BG3A 2P9NA 2UXCK 2QKKA 3PSIA 4H8KA 3VEOA 4BR9A 1W0HA 1BCMA 3NF7A 3OTOK 2HNZA 4WFAL 3M8RA 2E6MA 1RDUA 2ZGYA 3NF9A 3O9SA 4FW1A 1JCGA 3KIOA 2P9UB 2Q2RA 3G25A 4A61A 1QQCA 2XRIA 4QS7A 4DR4K 3J8AA 2W6KA 5K14A 4FJLA 2A5XA 2OCEA 2V7ZA 5EY4A 2P9IB 4G9ZA 3CFRA 1WN7A 2KHOA 3VGMA 3KLIA 2RF2A 3QESA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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