4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
4B1VA 3FZFA 4H0PA 2PAVA 2A6AA 4H0VB 3LDOA 2E20A 3A8YA 1MA9B 3A5NC 4YDUA 4RTFD 2P9IB 4WQ5A 3SLCA 4EHTA 3WXKA 3HBTA 4K41A 3R6MA 3LDQA 2P9SB 4H0XB 1KXPA 3VOVA 1SZ2A 3LDPA 3VESA 2ASOA 5AQQA 1U2VA 2NZTA 5AQXA 5ADXA 3DAWA 4NB4A 4ISEA 3BF3A 3VGKA 3UKRB 3ATUA 2A41A 3M3ZA 3DWLA 1ZXOA 1NGCA 3QICA 3EKSA 3WXIA 4CBWA 1C0FA 2A42A 2W41A 4JHDB 4BRPA 1WUAA 5FPEA 3LDLA 1TYQA 1HJOA 3U9DA 3SMSA 3G25A 3W3DA 5EOYA 4BRKA 2A5XA 5AQYA 1YVNA 4BRCA 2E2QA 4XEIA 4B1ZA 3U4LA 3DJCA 1S22A 3QB0A 1BDGA 3H45C 3ZEUA 1OKJA 2ZGYA 4RCHA 5BN9A 4BRQA 1HX1A 2IIRA 1HLUA 3MN7A 4GNIA 3MN5A 1NGIA 5I9EB 3A5LC 1MDUB 2P9NA 1NMDA 2FF3B 2YHWA 3VEYA 4WQ4C 4BG8A 2V52B 4B1WB 1ATNA 5AQKA 4LC9B 5JICA 1XQSC 4BG9A 3ULEA 4E1JA 1YUWA 3DXMB 3QBXA 5JLFA 2Q0RA 2Q31A 4BC2A 1NWKA 4BVOA 1MWMA 2VWBA 3I33A 2ASPA 4CZHA 3WEEB 5E84A 1ZBSA 3QFUA 3CJCA 1SQKA 4Y0WA 2D0PA 5E26A 3BF1A 2ZGZA 3C7NA 3ZX2A 4Z94A 2CH5A 3HSCA 3AAPA 5AQWA 2H3GX 1KAXA 4BC5A 2Q2RA 5KPZA 1LCUA 2GUPA 3CETA 3ENHA 5LJWA 4EHUA 3CJ1A 2QW9A 2Q1NA 4FWMA 1SAZA 3O5BA 4BROA 5AQIA 4BGAA 1MWKA 3MN6A 4XH4A 3EN9A 4CI6A 3I8BA 1QZ5A 5BPLA 3LM2A 1TUUA 1U2VB 5AQJA 5ADXH 1YAGA 1E4FT 2D1KA 2D4WA 3GBTA 3W0LA 1KAZA 2EWSA 1XC3A 2FLOA 4F9OA 3EZWA 4K25A 1QQNA 5TKYA 3FZMA 1X3NA 3CIPA 1QHAA 4FL9A 3R9PA 3WXLA 4FWNA 2V7YA 1HUXA 1GLAG 5FPNA 3WXJA 5EY4A 3BUZB 4CZMA 5KPTA 3DXKA 4O5FA 3VF2A 1TYQB 2VCPA 1X9JA 4BRAA 3P4IA 4BR7A 3QMLA 4FWOA 3ID8A 4M7XA 1NGDA 3M1FA 3C0BA 4IZ9A 1JCEA 3CHWA 1GLEG 5KPRA 4CZEA 4H5NA 3ZEUB 1Z6RA 2BTFA 3O1WA 2I7PA 1DKGD 1BOTO 3GG4A 4M63C 4B1XB 3JXUA 4DB3A 3VF4A 1J6ZA 3HM8A 4FO0A 4XH1A 4A2BA 1HKGA 3CJ9A 3L0QA 3WQTA 3VEVA 5AQSA 1ATRA 2P9PA 2YI1A 2P9NB 2P9UA 5AQOA 4RWTA 3QFPA 4CZIA 3A0IX 1E4GT 3MCPA 5AQGA 4H0TB 2GTDA 3FZLA 5AR0A 4H0OA 4FWLA 1JCGA 2D0OA 3ULEB 4BRHA 1RDWX 4IWVA 2YJEA 3GDQA 4FSVA 2NLXA 2CGJA 1ATSA 4M7YA 1GLJO 3ATVA 3D2FA 3FLCO 3ZX3A 3FZHA 3C7NB 4EFHA 5FPDA 4GY2B 1V4TA 4ISFA 5BN8A 4H5WA 3ZETA 5CE3A 1D4XA 1KAYA 2GWKA 3H46O 1RGIA 1QQMA 4WQ4A 5BRHA 5AQLA 5ELZA 1Y64A 1GLCG 3UE5A 5AFUA 2E88A 3ENOA 3CJ7A 2FSKA 3L6QA 4IJAA 1H1VA 1CZAN 1S3XA 3GE1A 4CZFA 4QS7A 4L3QA 4FWRA 5EX5A 4H5VA 4C23A 5BPNA 1GLBG 4B1UB 3DXKB 3VGLA 3H1VX 2ASMA 2DPNA 5AQRA 5LY3A 1BG3A 3CJAA 1NLVA 4DQ8A 1R59O 1DEJA 2FF6A 1Z05A 2YJFA 4B1YB 2HF4A 4A2AA 3CJBA 1ESVA 2E1ZA 2AP1A 3IUCA 4BC3A 4AM7A 5BPMA 4J8FA 3EO3A 2GELA 5EXWA 5JLHA 2FXUA 5EVZA 1BO5O 2VYPA 2FSNA 4CZJA 4FWQA 2P9PB 4KBOA 5BREA 2ZF5O 3LM9A 3HZ6A 2P9UB 1NGBA 1P8ZA 1RFQA 5LJVA 4BVPA 3VERA 2QM1A 3BEXA 2ZWHA 4H5TA 5KQ8A 2YHXA 3VEZA 1JCFA 3WUHA 3VEXA 4HTLA 3KVGA 5AQHA 3GL1A 2HF3A 4JD2A 1IG8A 3HTVA 4B9QA 2BUPA 4H03B 3VETA 4CBUA 5BRDA 3A5OC 3ZETB 1QQOA 2V7ZA 3UKUA 2QWLA 2Q0UA 4BRIA 3D2EA 4A61A 3UB5A 1Q18A 3F9MA 1K8KA 2IVOA 2QWOA 1IJJA 3M6GA 3U8XA 2QXLA 4CJ7A 5AZJA 4CZLA 3GOIA 3IMXA 4DHYA 5AQPA 3VEOA 2YCHA 3AAQA 3O08A 4JN4A 3CQXA 5AFUH 3RSEA 5F2RA 3S41A 4H0YB 2IVNA 3O1BA 1HPMA 2V51B 4EIAA 1T6CA 2A3ZA 2UYTA 1NM1A 4JNEA 2P9LA 3MMVA 4FWKA 3B8AX 4BRFA 2QWPA 3FR0A 5AQTA 3D7EO 3SJHA 4IXCA 1GLFO 2NRHA 4ISGA 3WQUA 2A40A 4MLEA 3H3OB 2QWQA 1GLDG 3IFRA 1NGHA 1T44A 2GEMA 3CERA 3TPQA 4JAXA 5B8HA 3FE1A 1HKCA 2E2PA 3CQYA 5AQVA 3JS6A 1XUPO 1BUPA 5AQNA 3VF6A 5KQDA 4BREA 4MO4A 3VPZA 4I6MA 2F9TA 1BU6O 4QS8A 4YDUC 2E2OA 4WQ5C 4IJNA 3O8MA 3LL3A 4QS9A 3QDKA 4H5RA 1DGKN 1TUYA 3VEWA 2PBDA 3AARA 3IDHA 5BR9A 2E1YA 4HWIA 4BR5A 3O4WA 2E2NA 1HKBA 4K43A 4O8KA 3SK3A 2F9WA 2P9KA 5AZIA 4BRNA 3EL2A 5BRFA 3H3NO 4FPAA 1C0GA 2Q97A 3J8AA 1BA0A 4JD2B 1LOTB 3O80A 3FZKA 4BC4A 4A62A 2KHOA 4WYBA 4FPBA 3UKUB 4PKGA 4BR9A 4BRLA 2P9IA 3D2EB 3VGMA 4BR4A 1NGGA 1K8KB 2OANA 5AQUA 3A5MC 5AZJB 3OHRA 2P9SA 4MO5A 3VENA 4DCHA 1T6DA 4BQLA 3RSEB 3WT0A 4AM6A 4BRGA 5F0XA 1NGAA 3AY9A 1NGEA 2CGLA 2YHYA 3MDQA 3U9ZA 5F1XA 4FOIA 3SMPA 3QBWA 3H6EA 1BA1A 3UKRA 4PL8A 2P9LB 2J4RA 3FFKB 5AQZA 2ITMA 2Q36A 4JHDA 1V4SA 4BQZA 3FGUA 3MN9A 3CI5A 4BR0A 1QZ6A 4MLHA 4PKIA 3R8EA 1U6ZA 3TU5A 2CH6A 4FOEA 3EKUA 1GLLO 4FWSA 1G99A 2IVPA 3L4IA 5AQMA 4EAHD 4CZKA 4IO8A 1X3MA 4PKHA 3D2FB 3BP8A 4CD3A 4NO7A 3LDNA 2I7NA 3ZX0A 4BR2A 3KZBA 1NBWA 4CZGA 5FPMA 3O6WA 3KHYA 2QWMA 5AQFA 4K42A 3H1QA 2HMPA 1BWFO 1EQYA 4BRMA 4I6MB 1NGJA 2CGKA 4BRDA 4PL7A 5JMVA 4BGBA 1WOQA 2WUSA 4CBXA 1YXQA 1NGFA 4CD1A 2AA4A 4XH5A 2FSJA 3MK6A 2E8AA 2QWRA 4FWPA 2HOEA 1ZC6A 3DXMA 2P9KB 5AZIB 2GWJA 2W40A 2QWNA 3HI0A 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MXJA 1LV5A 4FM0A 4CE9A 3KLEA 1VSEA 3VMFB 1NJYA 4NYFA 4DU4A 4H0VB 3LDOA 4H4MA 4I2PA 5M1OA 4A59A 3A8YA 4FJLA 4FW1A 4RTFD 4JYAK 4FJGA 3R6MA 4O4GA 3MWPA 3LDQA 4J2EA 4LD0A 3VOVA 1SZ2A 3VESA 4CIGA 4Q0BA 5AQQA 4CGIA 1S1WA 3OBWA 2ETJA 1RDDA 3MX5A 4ISEA 3BF3A 2HHHK 2X74A 2EX3A 3ATUA 3QETA 1ZXOA 3OYCA 1DT9A 5JS2A 2VGNA 4JHDB 4BRPA 4LF7K 1ZBIA 1TYQA 3SUQA 4B3MK 4DSIA 4DSJA 4AH9A 3OJSA 1OVYA 3A2FA 3QB0A 1RT4A 4AHRA 3ZEUA 4C1NI 1QTMA 5CHIA 3V9UA 4B3SK 2G8FA 4GV6A 3AVMA 3LP1A 1NK0A 4RCHA 4BRQA 3O3FA 4DU1A 4KHWA 5KTQA 3MN7A 4GNIA 1Q81O 4DFJA 1MDUB 4OKJA 3QIOA 4CFAA 2P9NA 3VEYA 4PQUA 3C6HA 1ASVA 3M8PA 1IBKK 4LC9B 4BC2A 4BVOA 4BDPA 1MWMA 4B3OA 4JI4K 4W5RA 3WEEB 1ZBSA 3QFUA 3CJCA 3NMUA 4Y0WA 2D0PA 4CHPA 2YNGA 3CETA 2B6AA 3CJ1A 2QW9A 4CJVA 3QEXA 4FLVA 2Q1NA 4FWMA 4YOVA 3NVKA 4BROA 5AQIA 3MN6A 2LSNA 4CI6A 3I8BA 1QZ5A 2F4VK 2O8CB 2Y1IA 3PV8A 3KLIA 3LM2A 1VQ5N 3NGZA 1YAGA 5GAGP 3TSUA 5M1QA 1VQ7N 3EZWA 1IG9A 1SUQA 4K25A 4HUEA 3NH1A 3R9PA 4HCCA 2W42A 5I3UA 3SAHA 3VQAA 3VF2A 3N4PA 4B8AB 2VCPA 1X9JA 4BRAA 4BR7A 3QMLA 4O44A 1NGDA 4IDKA 4IZ9A 1VQ8N 3QESA 3OYIA 3CYMA 5DM6L 2I7PA 4B9VA 3P5JA 4O5BA 1J53A 1BHLA 1HNWK 4DB3A 4IG3A 2G8HA 4IOCL 3IAYA 3PSIA 4JKAA 3CJ9A 4DR2K 3L0QA 2XY6A 3HP9A 1VQ6N 1WAFA 5AQSA 4GKKK 1ITGA 2HHQA 5AQOA 4FJ7A 3MCPA 4LFCK 5AQGA 1U47A 5AR0A 4RW8A 2D0OA 3ULEB 1YI2N 4BY9C 5J2QA 4Z4CA 4KREA 1ATSA 4M7YA 3DLHA 4JKGA 1WSIA 4BWJA 4ELVA 4CESA 1WBDA 4FZYA 3C7NB 1S6QA 1CZ9A 4ISFA 5BN8A 4H5WA 5KGXA 1KVBA 4DS4A 1ASWA 3IS9A 1D4XA 3VQEA 2GWKA 4YHHK 4B9NA 3DLBA 3EEQA 1TKXA 3MXIA 1NNEA 2W6KA 3IG1A 5AFUA 1E3MA 4DFMA 3DMJA 3VQ4A 4H8KA 3SV4A 1DTTA 1CZAN 4CZFA 1IV0A 4FWRA 5DM7L 4GMJB 3OW2M 4OVLA 5BPNA 2GBZA 4B1UB 2OYQA 3DXKB 1FW6A 4OPKA 3QNNA 3LANA 3VTIA 4AHTA 1TK8A 1EWQA 1BG3A 3S3OA 4M45A 5HRNA 2NRZA 1R59O 2JWLA 3O9RA 1NK7A 2FF6A 1Z05A 1P90A 4J8FA 3B6OA 5A2QO 3EO3A 4CF1A 3QERA 2Y1JA 2VYPA 4JI1K 2P9PB 3G4SN 3LM9A 1CZBA 2O4IA 3QEIA 4ID1A 4CJ3A 2QM1A 3M8SA 1VQ4N 2GUIA 3F2KA 1WLJA 1LW2A 1WAJA 3NDKA 4B08A 4GVMA 4M3RA 1N32K 2HF3A 2ZM6K 1DLOA 3HTVA 5GINA 3CCVN 3CCEN 5AJ3K 4FZZA 3A5OC 4KH6A 2Q0UA 3SBTA 1TAQA 1M1KO 4A61A 3AVFA 3KD5E 1K8KA 3U8XA 3IMXA 3KLFA 3AAQA 1EXQA 3CQXA 4IDHA 1C0TA 3SQ0A 1NK5A 4DR7K 3EE8A 1K73O 4M42A 3CMAN 3DRPA 2A3ZA 3CQ8A 3OY9A 4XIUA 2P9LA 4DUYK 3MMVA 4FWKA 2G8WA 3B8AX 3FR0A 3AVKA 1XI1A 2WC9A 4IXCA 2NRHA 2A40A 3H3OB 1TVRA 1GLDG 5J2MA 1NGHA 1RDAA 2GEMA 3CCJN 4PY5A 5CYMA 4AILC 3FE1A 2HNZA 2IGIA 4A5AA 4JI0K 3V1QA 3VF6A 1K8AO 3THXB 5KQDA 3RMBA 1D5AA 2IAJA 1KFSA 2XHBA 3KK2A 1FXXA 2E2OA 1RCHA 4G1QA 3KLGA 3LL3A 4QS9A 3QDKA 1TUYA 3IDHA 4HWIA 4BR5A 3DYAA 3MCAB 4BE2A 2P9KA 5AZIA 1RT3A 1HNIA 4CEAA 4FPAA 4AHSA 4FLYA 4KI6A 3J8AA 1BA0A 1HYSA 1BCMA 4JD2B 4DTPA 3SV3A 4BC4A 4KI4A 1NKCA 3NF7A 1XMOK 2KW4A 1TV6A 5C12A 1BL3A 3UKUB 3D2EB 5AQUA 4MO5A 1T3VA 3O9TA 4WFNL 3SQ2A 1W2BM 4AM6A 2Q3SA 1JLFA 3AVBA 3K59A 5CZ1A 3MXMA 3SMPA 3QBWA 2A1RA 4OLAA 1VSDA 3PX0A 1FJGK 5CYQA 1IKXA 2J4RA 3CPEA 3FFKB 5AQZA 4BE1A 4JHDA 1V4SA 3MN9A 1YVUA 2UU9K 3ZSOA 4BR0A 1QZ6A 1RILA 4FJNA 4CJSA 4I9QA 2ITGA 4JI5K 1U6ZA 2VQFK 3RRHA 2CH6A 4FOEA 4X64K 1GLLO 1Y97A 3UIQA 2HHUA 3LWMA 1KVAA 4N5SA 3ID6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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