4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
2HMPA 4QS9A 4AM7A 4BRQA 3CQYA 4PKHA 1XUPO 3VEXA 5AQTA 5CE3A 3DXKB 4BREA 3DXKA 3JS6A 4H0OA 5AQRA 2HF3A 1NGCA 3LM2A 5F2RA 3SJHA 3DWLA 3KHYA 1GLLO 3ID8A 5JLHA 4CBWA 3FFKB 5AFUH 2QWPA 1SAZA 4H0XB 3VF6A 5KQ8A 3FE1A 3FLCO 2QXLA 4CZGA 4BRKA 1ZXOA 1ATSA 2GEMA 3C0BA 4XH4A 5EOYA 3SK3A 3IMXA 3CQXA 5AQIA 4RWTA 3VEWA 2FSJA 3EKSA 1BG3A 2ITMA 2V7ZA 2F9TA 3B8AX 4JHDA 3U8XA 2YHYA 2Q31A 4QS7A 5FPDA 5AQYA 4CZEA 1YVNA 1NMDA 3IUCA 4IZ9A 5AQGA 5ELZA 4O5FA 4BROA 4M7XA 2P9NB 1GLAG 2P9NA 4LC9B 1JCGA 3BF1A 3MCPA 4FPAA 5AQHA 4B1VA 4WQ5A 3AY9A 2ZF5O 4BRIA 4PL7A 2GWKA 2CH6A 1QHAA 2WUSA 1NGDA 5AZJA 1R59O 2D1KA 3VGLA 3C7NB 2E1YA 1QZ5A 3D7EO 3U9ZA 2EWSA 1DEJA 2Q2RA 3U4LA 2PBDA 4CD1A 1WOQA 2ZWHA 5AQFA 4BC4A 5KQDA 3WXLA 1H1VA 3ZX3A 2A41A 1U2VB 4M7YA 5AQPA 4E1JA 3UB5A 3SMPA 1BA1A 3MN6A 4H0PA 3MDQA 2FF6A 1TUUA 4L3QA 2H3GX 1BUPA 2A3ZA 4K41A 3VEOA 1NGAA 1TYQA 2P9SB 3CJ1A 4WQ4C 5AZIB 2E2QA 5E26A 4JNEA 5BPNA 3LDNA 4H5WA 5LY3A 3C7NA 2GWJA 3JXUA 2QM1A 3VEZA 3A5LC 3AAPA 4BQLA 4EIAA 4BC3A 2J4RA 1V4SA 5BR9A 3LDQA 1NM1A 5B8HA 3BUZB 4PKIA 3VF2A 4MLHA 1C0GA 4BC2A 1JCEA 3AARA 4M63C 4IXCA 3CJ7A 1YAGA 1BO5O 1GLJO 2P9UA 3WEEA 3D2EA 4I6MB 4B1UB 2E2PA 4JAXA 2A42A 5EY4A 4C23A 4NB4A 4H03B 3H6EA 3AAQA 1G99A 4DQ8A 1IJJA 5KPRA 4BQZA 4YDUC 4CBUA 3QICA 3O80A 3VETA 2V7YA 1TUYA 1D4XA 5EX5A 5KPTA 3RSEA 1E4FT 3ZEUB 4HWIA 4BRCA 3QB0A 1BWFO 3MMVA 2HOEA 3FR0A 2UYTA 1Q18A 5EVZA 1P8ZA 2P9PB 3DXMA 2BTFA 3O4WA 4FWOA 3FGUA 4H0YB 1ATNA 2D0PA 1RDWX 3MN9A 4FWPA 3ZETA 1YXQA 4EHTA 3H1VX 2A5XA 3ULEB 4BRLA 3HSCA 4BGAA 2VWBA 3UE5A 3GG4A 4BRDA 3WXIA 4JD2B 3SMSA 1HPMA 1MWMA 4ISFA 2FLOA 3ATUA 3VGKA 1T6DA 3UKUB 2YI1A 1KAYA 1U2VA 3CETA 1ZBSA 4FOIA 3EKUA 2FXUA 4B1XB 3FZLA 1WUAA 4BR7A 2HF4A 4FWRA 4GNIA 1KXPA 3QBXA 3VF4A 3H3OB 4A2BA 5KPZA 1RFQA 1ESVA 2NRHA 4YDUA 4A61A 2CGKA 3FZFA 3HTVA 4CI6A 5BRHA 3F9MA 3W0LA 1DKGD 3WXKA 4O8KA 4ISGA 5JICA 5AQUA 2E2OA 3L6QA 3QDKA 3O6WA 2IVPA 3D2EB 5AQSA 5AZIA 2IVNA 3WQTA 5AQZA 4BRGA 2D4WA 3S41A 3A8YA 5AQWA 4BRMA 2P9KB 5TKYA 4BG9A 3BP8A 1IG8A 2E1ZA 2BUPA 4IWVA 2A6AA 3DJCA 4JN4A 4RCHA 3IDHA 4JHDB 3P4IA 3TPQA 4BRNA 5FPNA 5AQQA 4J8FA 1Y64A 4PKGA 2NZTA 2GUPA 1GLEG 4XH5A 3HZ6A 1NGEA 1K8KA 3WUHA 3H1QA 3GDQA 3QMLA 2YHWA 1EQYA 4MLEA 1NGJA 2ASMA 3HM8A 5AQJA 2I7NA 1T44A 2ASOA 5BRDA 1NGHA 1GLDG 1LCUA 3GOIA 3VEYA 4BRAA 3EN9A 3CJ9A 1HX1A 3L0QA 2AP1A 5AR0A 3CHWA 5AQXA 3CJCA 1QZ6A 4QS8A 1GLFO 2CH5A 2ZGZA 4FWNA 5F1XA 3I33A 4KBOA 1J6ZA 1SZ2A 4CZLA 5BRFA 4BR5A 3CI5A 2ZGYA 1ZC6A 5AFUA 2W41A 2E88A 4IJAA 4WQ5C 5E84A 3VOVA 4FWMA 2FF3B 3GL1A 3FZHA 1TYQB 3M3ZA 4FO0A 4K42A 4DHYA 5LJVA 4GY2B 4H0TB 1QQOA 2W40A 3GE1A 5AZJB 2QWOA 3CIPA 2YJFA 3VEVA 5FPEA 3ULEA 2QWNA 4EAHD 2OANA 4FL9A 4MO4A 4BC5A 4BVPA 2V51B 1NLVA 3CJAA 1HKGA 3QFPA 5AQNA 3MN5A 3J8AA 3UKUA 3QBWA 1S3XA 3D2FB 4H5RA 3VGMA 1X3NA 1X9JA 4XH1A 4A2AA 5AQKA 2P9IB 1NBWA 3ENHA 2QWRA 1KAZA 3MN7A 4CZMA 2QWLA 3M6GA 1HJOA 4FSVA 2V52B 2Q1NA 3R6MA 2QWMA 3H45C 3HBTA 1V4TA 3ZEUA 4FWQA 4BR2A 3O8MA 1HLUA 4BR9A 3BEXA 1OKJA 4MO5A 1U6ZA 3IFRA 4K25A 4CD3A 3A5MC 3KZBA 5BPLA 4CBXA 1HKBA 4WYBA 4CZKA 3QFUA 5AQLA 3ZX2A 3LDOA 2Q0UA 3R8EA 2E2NA 1E4GT 3ENOA 3TU5A 4F9OA 2YHXA 5BREA 1XQSC 2VCPA 4DB3A 3GBTA 4BRHA 4IO8A 1QQMA 2QWQA 4RTFD 4DCHA 5ADXH 5F0XA 2CGLA 3H46O 4ISEA 1Z6RA 1CZAN 5AQVA 4EFHA 3O08A 3O5BA 1GLCG 3VENA 4FWKA 2Q0RA 5I9EB 4H5NA 2Q36A 2E8AA 2FSKA 3LM9A 5FPMA 1NWKA 3SLCA 2QW9A 2CGJA 4BVOA 1T6CA 4CZJA 2GELA 3KVGA 3I8BA 1QQNA 4K43A 2P9UB 3LDPA 3WEEB 1NGGA 1MWKA 3U9DA 3DAWA 4WQ4A 1XC3A 4Y0WA 2FSNA 4AM6A 2DPNA 2NLXA 2P9IA 3FZMA 3EO3A 3A5NC 2YCHA 4BR0A 3BF3A 4H0VB 4HTLA 1NGFA 4H5TA 1MDUB 2GTDA 4BR4A 4BRFA 4B1ZA 4B1YB 4BGBA 4CZHA 3LDLA 1YUWA 2Q97A 3G25A 1BU6O 1GLBG 3CERA 1LOTB 4H5VA 5AQMA 3FZKA 3O1BA 3DXMB 5BN9A 3VESA 2E20A 4A62A 2IIRA 2PAVA 4BRPA 3W3DA 3WXJA 1C0FA 2F9WA 1K8KB 3H3NO 4BG8A 1BA0A 4FWSA 2IVOA 3EZWA 2P9KA 4FWLA 5EXWA 4EHUA 2AA4A 3UKRB 4FPBA 5JLFA 2I7PA 1HKCA 2ASPA 3O1WA 4IJNA 3WQUA 3ZX0A 1BOTO 5BN8A 3CJBA 3RSEB 3EL2A 5ADXA 3ZETB 1RGIA 4CJ7A 3VERA 3ATVA 2A40A 5LJWA 5AQOA 2P9PA 3R9PA 2YJEA 3LL3A 1X3MA 1MA9B 1SQKA 4B1WB 1JCFA 1BDGA 3VPZA 1HUXA 2VYPA 1NGIA 3A0IX 1NGBA 3HI0A 4JD2A 3WT0A 3L4IA 4PL8A 4CZIA 5BPMA 3OHRA 3UKRA 2P9LA 3A5OC 3MK6A 2P9LB 3D2FA 4XEIA 4CZFA 3M1FA 2P9SA 1Z05A 1DGKN 4FOEA 4B9QA 1S22A 1ATRA 4Z94A 2KHOA 4I6MA 5JMVA 1KAXA 4NO7A 2D0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM7A 3TAGA 1XUPO 3IRXA 3JS6A 1OH7A 2HBKA 4LF8K 2HF3A 1LW2A 3KHYA 3ID8A 4B3RK 1XMOK 4CBWA 1HJRA 2X78A 1VQ5N 3OYLA 2QXLA 2HW3A 4IFVA 1ZXOA 3DYAA 2R7YA 4KB0A 2A1SA 1YI2N 4XH4A 4CEFA 5EOYA 1YJNN 1HNIA 2NRWA 3VEWA 2PYLA 3VA0A 2PY5A 1VSLA 3QINA 2ITMA 1SV5A 4B3MK 2YHYA 2Q31A 4LSNA 3O4QA 1YVNA 1SL1A 4FM1A 1KCFA 1VAZA 5ELZA 3I55N 4OLAA 3CPWM 1IKWA 5C2FA 3SI6A 2A1RA 3AO3A 3OYDA 4EZ9A 3TSPA 4CK3A 3MCPA 4DLEA 5KI6A 3S9HA 2UUBK 3KD1E 3QIPA 2CH6A 1NGDA 4F3OA 3C7NB 3U9ZA 1NKEA 3NE6A 2ZWHA 4B3SK 3SQ0A 1BA1A 4PA1A 3MDQA 2FF6A 5M1OA 2QTDA 3L2RA 1Q9YA 1VQ7N 3CJ1A 4WQ4C 5AZIB 2O8FB 2O8FA 1HR0K 4ELUA 3CD6N 4J2EA 3CCEN 4E89A 4H5WA 3VMFB 5GIPA 3JXUA 2QM1A 4BQLA 3A5LC 3AAPA 4BC3A 2WC9A 2QEXN 3LDQA 4MDAA 3T7ZA 5B8HA 4FW1A 2HHVA 4CJFA 2OA8A 4BC2A 1JCEA 4A5AA 1RT2A 1RT1A 2P9UA 4I6MB 4JAXA 3L2UA 5EY4A 4M3ZA 3O3GA 4C23A 4H03B 3AAQA 4CGFA 3G71N 1RDUA 4OGCA 1T03A 5JS2A 3O80A 1A5XA 3LZJA 1W9HA 1EETA 4F8RA 1KTQA 1VRTA 2XY5A 5EX5A 4B3TK 1E4FT 3ZEUB 2HOEA 3EYZA 3V1RA 1Q18A 4DTRA 4OPHA 3O4WA 3VQCA 4AQYK 3D0PA 1WSFA 4NLBA 1C0TA 4CHPA 1D8YA 5K14A 1A5WA 3H1VX 5C42A 2WBNA 4KTQA 3CMAN 1XHZA 3HSCA 3V9WA 3WXIA 4JD2B 2QI2A 3SMSA 4G1QA 4M45A 4M3XA 3VGKA 1O13A 5HOOA 2YI1A 3SV3A 1U2VA 4AHVA 3T69A 4Z4GA 1YVUA 4BR7A 3ZSZA 2HF4A 1IBMK 4HVJA 4JK8A 4A2BA 3DRSA 1ESVA 3OS2A 2NRHA 3HPOA 1UAXA 1L3SA 3RMAA 4KO0A 4O8KA 4KHUA 5TKWA 4W5TA 2E2OA 3QDKA 3O6WA 4U7BA 3SUQA 1IO2A 4KHWA 3KK2A 3EY1A 1I3AA 4FJ8A 5AQWA 5DM7L 1DLOA 2KKZA 4KHYA 3OY9A 2A6AA 1SL2A 2RF2A 4ILGB 4OGEA 3TSUA 4JHDB 3P4IA 4E7JA 1FXXA 5AQQA 3SBTA 3ZSYA 3RMBA 4GV6A 1HNWK 4GVEA 1XI1A 3WUHA 4JKEA 2YHWA 1EQYA 2OTJN 4MLEA 4DV1K 1YF5L 1IKXA 3HM8A 1RT5A 4DV0K 2ASOA 4CERA 1NGHA 2RPIA 3L0QA 2AP1A 3S3OA 4QS8A 2CH5A 1NK8A 1B92A 4KBOA 1J6ZA 2YHBA 4IKFA 3OYJA 1ZC6A 4E7IA 1YHQN 5E41A 3SPZA 2W41A 2YNHA 3DOKA 1M90O 4IJAA 3OYEA 4E0DA 1KSPA 2X74A 3F9KA 1LWFA 4CJUA 1Q8IA 4N76A 3GL1A 1KQSM 3V81A 4FO0A 2XY8A 4K42A 1VQPN 4K0KK 5LJVA 4GY2B 1F21A 1RBVA 4JI6K 1QQOA 2W40A 1EX4A 2QWNA 4TSXA 2OANA 4BC5A 2OCEA 4B9NA 4CJTA 1NLVA 2Z1IA 1JLQA 3I0RA 2OPRA 1KVAA 4GV9A 2HVIA 1JL1A 3PX6A 3HP6A 1X3NA 3HVRA 1T05A 3DOLA 3SQ4A 1S1TA 4CZMA 4FYDA 1WBDA 3NVKA 3VQEA 3SNNA 2YHAA 4BR2A 1TVRA 1HLUA 3O9SA 3D45A 4AHUA 4FJ7A 3VQ5A 3IFRA 4FK4A 3K5NA 5M1NA 3M8QA 4AHRA 4FVMA 1NJIO 4OVLA 1NU0A 4LFAK 5CZ1A 4KI4A 4B9VA 3QEWA 4CBXA 1N32K 4CZKA 5AQLA 4PQUA 4FJLA 3OYNA 3R8EA 1N8RO 1HYSA 5CY4A 5GIOA 3TI0A 1E4GT 4O0IA 2YHXA 4BWMA 2VCPA 4CFBA 4BDYA 2P5GA 5DMRA 4ISEA 4FLUA 1KRPA 4EFHA 1NKCA 1GLCG 4FWKA 4JKDA 5I9EB 2Y1IA 4H5NA 4EP5A 2Q36A 4Z4HA 2QW9A 4KH4A 4BVOA 4CZJA 2GELA 1IKYA 4YOYA 1RDAA 1WNSA 1QQNA 1RBSA 1YT3A 1EKEA 3AVAA 3WEEB 3JSMA 1VSHA 1XC3A 4OKJA 2IOCA 3EO3A 4DTJA 4CJVA 4H0VB 4DF4A 3VQDA 5KGXA 4BRFA 4B1YB 4JRPA 4YHHK 3CFPA 1BU6O 1HQEA 4H5VA 3ZSRA 3JYTA 4F4KA 5IT9O 1RDDA 5LL6Z 2E20A 2UXCK 2PAVA 5JVGL 4ILHA 4LFCK 2VGMA 1NK0A 4Y1CA 3AA2A 1K8KB 4E7KA 1BA0A 3S3NA 4WE1A 4FWLA 3NCIA 3QNOA 3O3FA 3LPTA 5JLFA 2ASPA 2DFEA 4IJNA 1L5UA 4BE2A 5CR4A 3CJBA 3RSEB 3EL2A 3E9LA 4CJ7A 3QO9A 3VERA 3THWB 3THWA 3ATVA 2A40A 4ZTFA 1FKPA 5LJWA 5AQOA 3LL3A 3CCMN 1JCFA 3MXMA 4FLVA 1TV6A 3VPZA 3WT0A 3HI0A 3U6FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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