4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
2VWBA 3CJ9A 4BRPA 5BR9A 4IJAA 3CERA 1NGHA 1GLFO 3ZEUB 2D0OA 3O1WA 5AFUH 4B9QA 5AQMA 3H3NO 4BGBA 3DXMB 3VEOA 3MCPA 2J4RA 3CJCA 3RSEB 1T6DA 4BRDA 5AQOA 4MO4A 4B1YB 2Q0RA 1H1VA 2YHWA 4RTFD 4BROA 4BC5A 2F9TA 1Q18A 5ELZA 3QICA 4J8FA 4FPBA 5AQPA 3C0BA 4Z94A 3QBXA 3A0IX 1BWFO 5B8HA 2HF4A 2I7PA 3MMVA 3W3DA 2Q2RA 3JS6A 4I6MA 5FPNA 3FE1A 3VESA 3H45C 2W40A 3J8AA 2A42A 4O8KA 2V52B 4H5VA 1QQOA 3CJBA 4PKGA 3SMPA 2YI1A 1RDWX 3H1VX 1KAYA 3HI0A 2E20A 3UKRA 3CQYA 4FWMA 4XEIA 2YHYA 3M1FA 1E4FT 4H0OA 3WXLA 5KQDA 1IG8A 4BVOA 2QWMA 3O5BA 1T6CA 4HWIA 1QZ5A 1TUYA 3QFPA 4XH4A 5ADXA 4QS7A 1GLJO 3WXIA 3LDOA 1K8KA 2Q0UA 2GTDA 2FSJA 2ZGYA 2ZWHA 5F0XA 2E2PA 3EKUA 2P9KB 3IDHA 5JMVA 1P8ZA 3WEEB 4DCHA 3ZEUA 1NGIA 5AQSA 5KQ8A 1GLEG 4GY2B 1NGBA 2ASOA 3BEXA 3DXMA 2OANA 2P9NB 4O5FA 1MA9B 1QHAA 3RSEA 1OKJA 3VETA 5EY4A 3A5LC 3HZ6A 4EHTA 2F9WA 3CJ1A 3S41A 1MWMA 1U6ZA 4H5RA 4BR5A 3QDKA 4BGAA 3P4IA 3B8AX 3ID8A 1J6ZA 2W41A 2A41A 3SMSA 5BREA 5AQJA 4BRAA 4BVPA 4BRHA 3KHYA 1V4SA 1U2VB 1NMDA 4FWSA 3VERA 4PL8A 2CGKA 1C0GA 1DKGD 4XH1A 1GLBG 4BQZA 3HM8A 5AQFA 2QWPA 2ITMA 1HX1A 4WQ5C 1HKCA 1GLAG 1ATSA 2NZTA 4A61A 1NM1A 3H3OB 3QB0A 2CGLA 1XUPO 3CHWA 3FFKB 4B1UB 1S3XA 3D2EB 3QMLA 4BRIA 3A5NC 4BRGA 2D4WA 3ULEB 4CBWA 5JLHA 5I9EB 1LCUA 3IUCA 1RFQA 1BU6O 3JXUA 1MDUB 3GL1A 4BQLA 1BOTO 4GNIA 2FF3B 5AZJB 3R6MA 4BR9A 2P9PB 2PBDA 3AY9A 3O4WA 2Q36A 4C23A 2DPNA 2P9KA 3G25A 3MN9A 3WEEA 2PAVA 1R59O 1X9JA 2P9LB 2GELA 3KVGA 3U9DA 5LJVA 5BRHA 1BDGA 2P9NA 3DJCA 4CI6A 3AAQA 3R8EA 1HPMA 4IXCA 3CJAA 5AQIA 2YJFA 5TKYA 1BA1A 3F9MA 4JD2B 4ISEA 4JN4A 1CZAN 3IFRA 5EX5A 3BF1A 2E2NA 3M3ZA 1T44A 2E2QA 4CBUA 3H6EA 2HF3A 1QQMA 3VGMA 1ATNA 2ASPA 2E88A 3HSCA 1U2VA 3WXKA 3AAPA 3EL2A 3O08A 3U9ZA 5JICA 1S22A 3VF6A 5BPMA 2A5XA 3D2FB 4H0VB 4H5WA 2ZF5O 3OHRA 4H03B 4BC2A 3HTVA 2BUPA 5F2RA 3SLCA 4FSVA 4CZJA 4FWPA 3UKUB 2QW9A 3MN5A 5KPTA 1ESVA 3ATUA 3D2EA 3MN6A 3GBTA 4FWLA 2GWKA 2QM1A 3UE5A 4F9OA 5AQZA 2P9IB 3ULEA 4H0PA 5AR0A 1ZC6A 2HOEA 3VGKA 2V51B 2AP1A 3U4LA 1XQSC 1KAXA 1SQKA 4MLHA 4CD1A 3CIPA 3SJHA 3H46O 2FLOA 2NLXA 4H5NA 2H3GX 4M7XA 4BRMA 5AZJA 4B1XB 2NRHA 3A5MC 4BRFA 2P9PA 2VYPA 3VF4A 5KPZA 1RGIA 3ZETB 2P9SB 1QZ6A 4K42A 1NGAA 2P9LA 3O80A 4FOIA 4IZ9A 4EIAA 3VPZA 1WOQA 3I8BA 4H5TA 4IJNA 4BR7A 3FGUA 4B1VA 3BF3A 2IIRA 3MDQA 4IWVA 3R9PA 4BC3A 4JD2A 4B1ZA 3M6GA 4A62A 2ASMA 1E4GT 4RWTA 1GLDG 3ZX2A 4JNEA 1BG3A 1V4TA 2QWQA 3EO3A 5BN9A 4BR4A 4RCHA 3WQUA 4CD3A 1BUPA 1QQNA 2A6AA 3TPQA 4CZMA 2EWSA 3MN7A 1YVNA 3WQTA 3CQXA 3D2FA 3U8XA 5BPLA 4FWRA 5JLFA 3A5OC 1SAZA 4WQ5A 1NBWA 3A8YA 5FPDA 1NGCA 5AQGA 4CZKA 2A40A 3QBWA 2KHOA 3DAWA 1KAZA 4JHDB 3UKUA 5KPRA 1NGFA 3FZFA 1Z6RA 1G99A 2P9UB 3ENHA 1YUWA 3FR0A 3GDQA 2E8AA 2IVNA 4QS8A 2D0PA 2P9IA 4BREA 3SK3A 1NGEA 4IO8A 4MO5A 5CE3A 1Z05A 5E84A 2FXUA 3DXKB 4WQ4C 3C7NB 2D1KA 2V7YA 3CETA 3GE1A 1BO5O 1TYQB 1HLUA 3AARA 4K25A 3LDQA 1KXPA 1WUAA 5EVZA 3LDPA 4H0TB 3ZETA 4CZHA 2P9SA 2IVPA 5EOYA 5EXWA 1ZXOA 2CGJA 4M63C 2AA4A 5ADXH 4A2BA 4BC4A 2GEMA 1TUUA 5BRFA 1JCEA 4BG9A 1Y64A 4H0YB 4CZEA 4EAHD 2YHXA 3QFUA 4BR0A 1YXQA 1NGJA 5AZIB 4AM7A 5LJWA 4CBXA 4BRKA 3TU5A 4BRQA 4CZIA 1SZ2A 5FPMA 3CJ7A 3EZWA 4FOEA 2QWRA 2IVOA 3VEVA 4K41A 4FWOA 4PL7A 4BRLA 2I7NA 2CH6A 3O1BA 4BG8A 4CJ7A 5E26A 3WXJA 3VF2A 2GUPA 1NWKA 4CZGA 3LM2A 4H0XB 3VEXA 3WT0A 1HUXA 1NLVA 1YAGA 4JHDA 5AQKA 4M7YA 3VGLA 2P9UA 4E1JA 4WYBA 3WUHA 4Y0WA 5AFUA 3DWLA 3VOVA 2QWNA 2Q1NA 3GG4A 4FL9A 5AQVA 4DHYA 4XH5A 4MLEA 4PKIA 3ZX3A 4L3QA 2V7ZA 3EN9A 2FF6A 2QWLA 3DXKA 3HBTA 4LC9B 2HMPA 3C7NA 2QWOA 3LDNA 4HTLA 2YCHA 5AQXA 1HJOA 1GLLO 3VEYA 4NB4A 3L0QA 3GOIA 4FWNA 1TYQA 4NO7A 4QS9A 1X3MA 3FZHA 4FO0A 4A2AA 4AM6A 2BTFA 4JAXA 1DEJA 1ZBSA 2A3ZA 1C0FA 2E1YA 3FZMA 3IMXA 4KBOA 4BRCA 4CZLA 3L6QA 3H1QA 1JCGA 3BP8A 5BPNA 1MWKA 2VCPA 1DGKN 2Q31A 3CI5A 2YJEA 3UB5A 2QXLA 3FLCO 4EHUA 4DQ8A 2WUSA 4ISGA 5AQUA 3I33A 5F1XA 2GWJA 3VEWA 3ENOA 3O8MA 4ISFA 5AQQA 5AZIA 3D7EO 5FPEA 4FWQA 4CZFA 2FSKA 2UYTA 4DB3A 3LDLA 3ATVA 4I6MB 4K43A 3FZLA 1NGGA 5AQWA 3ZX0A 3EKSA 1GLCG 3LL3A 5BN8A 1NGDA 2Q97A 1D4XA 3LM9A 3W0LA 4EFHA 4FWKA 4BR2A 4PKHA 3MK6A 1BA0A 3UKRB 4YDUC 3VENA 3BUZB 3VEZA 5AQHA 5AQYA 5AQNA 4YDUA 2E2OA 3FZKA 5LY3A 1JCFA 1EQYA 1IJJA 3L4IA 5AQRA 5AQLA 2CH5A 2ZGZA 4B1WB 1X3NA 2E1ZA 2FSNA 5AQTA 1ATRA 4WQ4A 1HKGA 1XC3A 1LOTB 4FPAA 4BRNA 1HKBA 3O6WA 3KZBA 1K8KB 5BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KIOA 4E7LA 4IJAA 4DWIA 1NGHA 3VQ7A 4KKOA 4OVLA 3HP6A 2P5OA 4B9QA 4H4MA 4BGBA 3VEOA 3K5OA 1U45A 3DRRA 4M3YA 3RSEB 3CC4N 4DR1K 2VWKA 4MO4A 4BC5A 3K58A 5C2DA 4KHWA 3DI6A 1T03A 4J8FA 3QBXA 3A0IX 1BWFO 4IG3A 5B8HA 2I7PA 4N5SA 3W3DA 2Q2RA 3JS6A 2W40A 2A42A 2JWKA 3KKSA 3MWTA 4DSEA 1J5OA 1VQ6N 3PLAA 3TAPA 4JKFA 1YVUA 1BQNA 4FJHA 2E20A 3HRGA 4JV5K 1D8YA 1DTQA 4XEIA 3ASMA 2YHYA 3O9RA 1JLAA 4RW9A 4HTUA 3D0PA 2HMIA 4HHTA 1J54A 1IKYA 2UXCK 3LZJA 1JLQA 4E7IA 3OYKA 3C65A 4K0KK 4HWIA 3SQ0A 5CYMA 4LF8K 2JWLA 1S9EA 4AHUA 5ADXA 1GLJO 1N8RO 1NJZA 5F0XA 1IBLK 4E7HA 3IDHA 2GUIA 1P8ZA 3QNNA 4DCHA 4HUFA 3EE8A 1NGIA 3K9KA 4GY2B 4CJVA 3SBGA 4G1QA 4DR6K 4DR7K 1NK9A 3RSEA 1JXEA 3VETA 1RBSA 3A5LC 3CJ1A 1KC8O 3G6EN 1HNWK 2QKKA 3QDKA 4BGAA 3PY8A 1LWFA 3B8AX 1J6ZA 2W41A 4ILJA 3LP2A 2OTLN 5AQJA 4BRAA 1REVA 4BRHA 3KHYA 1NMDA 1N33K 4Q5VA 1M90O 4JKGB 1WNSA 1N5YA 1FK9A 1GLBG 3HM8A 4Y1DA 2QWPA 4YOTA 2ITMA 5DM6L 5J2PA 1HKCA 1QVGM 1ATSA 1VQPN 3E9OA 3H3OB 1J5EK 2CGLA 1S3XA 1OVQA 4BRIA 4BRGA 3VQPA 1QE1A 2D4WA 3QEVA 2F8SA 5I9EB 3SAGA 1NNEA 5C25A 2EHGA 1RBUA 4MQ3A 4W5RA 4DLGA 3WNEA 3B6OA 3C94A 1RDCA 1BIUA 1IBMK 4GNIA 3OYEA 2FF3B 5HL7L 4BR9A 3DLHA 4LF4K 2PBDA 4JI1K 4C23A 2DPNA 4GW6A 3G25A 3ZSYA 4W5QA 2P9LB 1VRUA 3HO1A 3AVIA 4DSIA 1RDUA 3R8EA 4DTMA 4FVMA 1VSKA 4CJ5A 4PHTX 3F9MA 4UQGA 4JN4A 5EX5A 4PA1A 3DOLA 3CM5A 3H6EA 1IKWA 1TL1A 3L2QA 4IFEA 3HSCA 4DV4K 3AAPA 1VQ9N 4KHUA 1W9HA 1S22A 4JKGA 4WFNL 2G8WA 3D2FB 3DLEA 4B8AB 4C8LA 3MXJA 4BC2A 1ZYQA 2HHVA 3J81O 2NRRA 3ATUA 3QEPA 5C10A 3CYMA 3UE5A 1VAZA 2P9IB 3VQ6A 2HOEA 5J2NA 3KLIA 1RBTA 1ZBLA 4CEFA 1UA1A 4FJIA 3NMUA 2R7YA 4FLZA 2FLOA 3KK7A 4LY7A 1WSIA 4M3UA 4BRFA 2JLEA 5KPZA 4CF1A 1QZ6A 2P9LA 4FOIA 3SAHA 4M3WA 1UOCA 4B3TK 4ZTFA 4A5AA 3P31A 3TR8A 5HBMA 3RWUA 4H5TA 4ZTJA 4CCHA 1OH5A 2IIRA 4IWVA 3AV9A 4OPAA 1HMVA 1CXUA 3M6GA 1L5UA 4KH4A 1E4GT 4RWTA 1GLDG 1BISA 1BG3A 2E6MA 2O8EB 3EO3A 5JS2A 4CERA 4CVNE 4RCHA 4M3TA 3C6AA 3U3YA 4I9QA 3NF9A 2NRZA 3CC7N 3TPQA 3NE6A 3HK2A 5CHIA 4KREA 3D2FA 1ZBUA 3ITHA 3NFAA 4KAZA 4FWRA 5JLFA 3HVTA 1HYVA 3A8YA 5FPDA 4HCBA 4JYAK 3VN5A 2A40A 3QBWA 4IEIA 2E4LA 3IS9A 1ASUA 3ZCMA 1NGFA 4X64K 3DYAA 3KLFA 1TKDA 1YUWA 3FR0A 3WNGA 4YORA 4MDBA 2P9IA 4KFBA 4HVJA 1NGEA 4CJQA 5CE3A 2OPQA 4GV3A 2NRWA 4IDKA 2DTUA 4BWMA 3KWIA 2UXBK 4M3RA 5KTQA 4Z4GA 3AARA 1WUAA 4C8OA 1GOBA 1EKEA 4CW7B 3ZSRA 1TUUA 4CESA 3QETA 2HHSA 1X9SA 3CCEN 4KB0A 4EP5A 4NYNA 4EAHD 1U48A 4BR0A 3HPHA 5LJWA 4BRKA 4BE0A 3CJ7A 4O0IA 4FOEA 2O8EA 3E9LA 1HYZA 4YOWA 4CEAA 4DUZK 4PL7A 3DLGA 3TABA 2CH6A 3ZT0A 2OCEA 4LF5K 3RVCA 1HRHA 3M8QA 3ZT1A 4H0XB 4FJJA 1TKXA 1YF5L 4QOZB 2XY6A 1BGXT 4JI5K 3PX0A 5AFUA 3DWLA 3OYLA 3RR8A 3O9QA 4DV1K 3VOVA 4FL9A 1VQ5N 2RN2A 1UAXA 2BGGA 3OYDA 4PKIA 4L3QA 4CGFA 1HQUA 1FKPA 5FROA 2QWLA 4ELUA 4QCLA 2HMPA 1WBBA 4NB4A 4CIEA 1RT6A 1N6QA 1KVBA 4PUOA 2PYLA 2D5RA 4FO0A 3KK1A 3OW2M 4JS4A 1HNVA 4ILHA 3IMXA 4BRCA 3RMCA 4CZLA 4AHCA 3L6QA 1JCGA 3CI5A 4DV7K 4DTPA 4MDAA 4R5PA 1QVFM 3O9TA 3I33A 5M1QA 3WNHA 3THVA 1W0HA 2VG7A 3OYFA 3O8MA 4NLBA 3D7EO 3N4PA 5FPEA 1FJGK 2G8VA 4CZFA 4JK8A 2Q3SA 4CEDA 4I2QA 3LDLA 3FZLA 4ID5A 1NGGA 4JI0K 3WXMB 4LSLA 4L8RB 3LL3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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