4IJNA

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium smegmatis bound to amp and sulfate
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
b'MVTVLVVNSGSSSLKYAVVRPASGEFLADGIIEEIGSGAVPDHDAALRAAFDELAAAGLHLEDLDLKAVGHRMVHGGKTFYKPSVVDDELIAKARELSPLAPLHNPPAIKGIEVARKLLPDLPHIAVFDTAFFHDLPAPASTYAIDRELAETWHIKRYGFHGTSHEYVSQQAAIFLDRPLESLNQIVLHLGNGASASAVAGGKAVDTSMGLTPMEGLVMGTRSGDIDPGVIMYLWRTAGMSVDDIESMLNRRSGVLGLGGASDFRKLRELIESGDEHAKLAYDVYIHRLRKYIGAYMAVLGRTDVISFTAGVGENVPPVRRDALAGLGGLGIEIDDALNSAKSDEPRLISTPDSRVTVLVVPTNEELAIARACVGV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium smegmatis
molecule tags Transferase
total genus 125
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA02
5AQWA 2CGJA 2P9PA 3M3ZA 4MO5A 3VGMA 1X3MA 3SLCA 4CZIA 3QB0A 5AFUH 2ZF5O 5KQDA 1JCGA 2P9UB 3WXKA 3DAWA 2VWBA 1S22A 3R6MA 3W0LA 4RWTA 4WQ5A 3QICA 4BRIA 5JICA 3CIPA 1HPMA 1GLBG 4BR2A 3D2FB 5AQFA 3AAQA 1CZAN 2GUPA 3CJAA 2QWMA 2GWKA 4A61A 2GEMA 3A5LC 3GE1A 4M63C 4IWVA 1NGDA 4DCHA 2D0OA 1U2VA 3VF2A 4CZEA 4BREA 3A8YA 4CBWA 4CJ7A 2FSNA 3AY9A 1NGBA 2YCHA 3HZ6A 3M1FA 4PKGA 5F2RA 3CJBA 5LJWA 4ISGA 1MWMA 3DXKA 3F9MA 1ZBSA 1X3NA 1ESVA 3MN5A 4FWRA 3GDQA 3ZETA 3D7EO 2P9KB 3P4IA 2W41A 2HOEA 1NGAA 4JNEA 2Q1NA 3BF1A 5JLHA 1V4SA 3ULEB 4NB4A 3TPQA 2CGKA 1KAXA 3ZEUA 3U9ZA 5FPNA 4WQ4C 3H3OB 4FO0A 5AQNA 1NGEA 3L4IA 3MN7A 1BO5O 1NBWA 5AR0A 1S3XA 3D2EA 2Q0UA 2PBDA 3GBTA 1SZ2A 1IJJA 4IZ9A 3KVGA 2FF3B 3O1WA 2ZGZA 5AQZA 3MDQA 1KAZA 3BF3A 1QQNA 2W40A 3UKRB 3WXJA 1HUXA 4BRLA 1U6ZA 5ELZA 3SJHA 2UYTA 3C7NB 3MN9A 5EVZA 3ID8A 3WUHA 2QWRA 4JD2A 4CI6A 4O8KA 1DEJA 5AQQA 3FZHA 2VYPA 3M6GA 4H0OA 1RFQA 4JHDA 1TUUA 4BROA 1QQOA 1LCUA 3FZMA 4BR5A 5AQVA 1NGCA 5AQLA 3DXKB 1XC3A 3IFRA 3ZETB 4FWOA 4BC4A 5CE3A 5AZJA 1LOTB 4CZKA 3KZBA 5ADXA 1QZ6A 4EFHA 1GLAG 3GG4A 4FOEA 4CZLA 2A40A 1XUPO 3KHYA 3UE5A 2AP1A 3SMPA 4BVPA 3JXUA 2E20A 4F9OA 2P9IA 1NMDA 5BREA 4FSVA 1Y64A 3LDPA 3D2EB 4BC2A 3QDKA 5JMVA 2P9SA 4CBXA 1Z6RA 4A2BA 2E2OA 4H5TA 3LDQA 1BG3A 3QFPA 4FWQA 3I33A 5F0XA 4GY2B 1WOQA 5AQGA 4XEIA 4JD2B 1HX1A 3O5BA 3MCPA 1HKCA 3HBTA 5AQHA 1D4XA 4ISEA 1KXPA 4CD3A 4H0PA 4BG9A 2Q0RA 2V51B 3VENA 2A3ZA 3FZLA 4JHDB 3MK6A 3EKUA 5BPMA 2E8AA 2V52B 2YHXA 5AQSA 2QWQA 2F9TA 5AQXA 3H45C 4H0YB 2HF3A 5LJVA 2ZWHA 3CETA 3AAPA 3HTVA 1E4GT 3ENHA 4M7XA 5E26A 3VEZA 3A5NC 5AZJB 1NGIA 4H0TB 1OKJA 2IVOA 2FSKA 4CZMA 2YHWA 1BWFO 1QQMA 1HKGA 3O08A 1BUPA 2P9IB 3LM2A 3VEVA 5BPNA 4IJNA 1IG8A 1H1VA 4QS9A 5BR9A 3H1VX 3FGUA 2F9WA 3DJCA 4WQ4A 1NGFA 2QWNA 3H3NO 3U4LA 4EIAA 4FWNA 4YDUA 3CHWA 3CERA 1ATSA 5F1XA 4CD1A 4BQZA 2GWJA 3UB5A 4DQ8A 3MN6A 4XH5A 2P9PB 3VEYA 3WEEA 4EHUA 4XH1A 4XH4A 4YDUC 5EX5A 3S41A 3IDHA 4K42A 3O1BA 3L6QA 5KPTA 4MO4A 3J8AA 2OANA 3B8AX 2H3GX 4BRMA 5KQ8A 2IVPA 3EZWA 5JLFA 4KBOA 1E4FT 1T44A 1ZC6A 4B9QA 1KAYA 1YAGA 4I6MA 5EY4A 4PL7A 5EXWA 4O5FA 2GELA 4BG8A 4B1YB 1U2VB 4Z94A 1T6DA 4FPAA 5LY3A 4IXCA 2QW9A 3FR0A 4BVOA 4CBUA 2J4RA 4IO8A 3EN9A 1YVNA 4BR7A 2FLOA 1QHAA 2QWLA 4CZHA 1DKGD 1NGJA 3BUZB 3HI0A 4FOIA 4H5NA 5AQRA 4L3QA 5BRHA 2E1ZA 4BR0A 4CZFA 2D4WA 3R8EA 3L0QA 1Z05A 2A6AA 4MLHA 4FWMA 3CJ7A 3O80A 1GLDG 3BEXA 2CGLA 4K43A 4BR9A 2E1YA 5I9EB 5EOYA 3LL3A 2P9UA 4B1WB 1YXQA 4QS8A 4A2AA 3UKUA 3ZEUB 4FWSA 3VEWA 2WUSA 2I7NA 4BRDA 4QS7A 3FE1A 3EL2A 3LDOA 3H46O 3IMXA 5AQTA 3WT0A 1BA0A 4BRNA 2QXLA 3LDNA 4K41A 3VEXA 4BRGA 4CZGA 1NWKA 1MA9B 2CH5A 4H03B 3C0BA 3QMLA 3O8MA 2V7YA 5AQUA 1JCFA 2E2QA 4I6MB 3EKSA 4MLEA 4PKHA 2QWPA 4HTLA 2E2PA 3CJ1A 4DHYA 3ENOA 3OHRA 1X9JA 3VERA 3QBXA 3CJ9A 1HJOA 1Q18A 3WQTA 2P9KA 2ITMA 1NGHA 1QZ5A 4CZJA 4E1JA 5AZIA 3WXIA 2GTDA 3ULEA 3DXMA 2A42A 4FPBA 3HSCA 2Q36A 3U9DA 1DGKN 1GLEG 3RSEA 4BRAA 1TYQA 5AQJA 1G99A 5KPZA 4BGBA 1GLLO 4RTFD 5BN9A 4ISFA 1R59O 4BC5A 3UKUB 4BGAA 3UKRA 5BRFA 1BDGA 5AFUA 4B1XB 2ASPA 2E2NA 2E88A 4B1VA 3HM8A 3C7NA 3TU5A 3H6EA 4JAXA 3SMSA 3AARA 4NO7A 2IIRA 2YJEA 5AQKA 4FWKA 5FPEA 4WYBA 1MDUB 2P9SB 4WQ5C 1WUAA 4HWIA 1GLFO 3R9PA 4BRQA 4H5RA 1C0FA 4A62A 4BRCA 1ZXOA 4AM7A 1SAZA 5AQPA 4BRFA 1RGIA 3W3DA 4IJAA 5E84A 4AM6A 2YJFA 4LC9B 2ASOA 4C23A 2D0PA 1J6ZA 2P9NA 3CJCA 5FPMA 2BUPA 4DB3A 4BR4A 1K8KA 5AQIA 3A5OC 3VPZA 3QBWA 3FFKB 4J8FA 2VCPA 1TUYA 2QM1A 3ZX0A 1ATNA 1BOTO 2A41A 3GL1A 4H5WA 5AZIB 3VESA 2YHYA 3VEOA 4EAHD 1NLVA 2FXUA 2Q31A 3DXMB 3G25A 1EQYA 5AQYA 3GOIA 3VETA 4RCHA 2ZGYA 2PAVA 4JN4A 3RSEB 3QFUA 2CH6A 1TYQB 3ZX3A 4Y0WA 2HF4A 2NZTA 2KHOA 3FZKA 5AQMA 4BRPA 4B1ZA 4PKIA 4H0VB 3WXLA 2P9LA 1T6CA 1NM1A 1GLJO 2FF6A 3DWLA 2AA4A 3VOVA 4H0XB 1GLCG 1JCEA 2BTFA 1V4TA 2EWSA 3JS6A 4FWPA 5ADXH 4BQLA 2Q97A 1XQSC 2NLXA 4PL8A 4FL9A 3FZFA 3A5MC 2ASMA 5BPLA 1NGGA 5BRDA 1HLUA 3VGLA 4BRHA 1YUWA 4K25A 3CI5A 3FLCO 1BA1A 1MWKA 3CQYA 3EO3A 3VF6A 3WEEB 3LM9A 3D2FA 5AQOA 2P9NB 1RDWX 3ATVA 1P8ZA 4H5VA 2HMPA 4GNIA 1K8KB 2FSJA 2QWOA 3U8XA 3O4WA 1BU6O 4M7YA 3SK3A 2D1KA 3CQXA 4B1UB 3A0IX 3ATUA 5BN8A 2IVNA 3BP8A 5KPRA 5FPDA 2V7ZA 3VF4A 2YI1A 3O6WA 3VGKA 3WQUA 1HKBA 1ATRA 3LDLA 4FWLA 4BRKA 3I8BA 2P9LB 3ZX2A 2NRHA 1C0GA 3MMVA 3H1QA 5TKYA 4BC3A 2DPNA 4EHTA 2Q2RA 1SQKA 2A5XA 2I7PA 3IUCA 5B8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BE0A 3M3ZA 1YTUA 3L2WA 1VSHA 2VWBA 4H8KA 3V9WA 1KCFA 1QQCA 4RWTA 2HHXA 4WQ5A 3QICA 5M1KA 1HPMA 3AVHA 1GLBG 4OJRA 3VQ9A 5AQFA 3DLHA 3CQ8A 1S9GA 1DTQA 4GVEA 2GWKA 3AVGA 3ZCMA 5SWMA 2GEMA 2D0AA 1NK9A 3GE1A 1IKWA 5HRPA 3TAEA 2NRRA 2UXBK 4NYFA 3VF2A 3VQ4A 4JKAA 3RRGA 1VSFA 3BZKA 4CHZA 4KI6A 3AVFA 4CCHA 1CLQA 3CJBA 2G8VA 3CYMA 4E89A 2UU9K 4DSKA 1VHXA 1X3NA 4RW7A 3ZT3A 3RRHA 3B6OA 5JVGL 3P4IA 4F2SA 2W41A 3BF1A 2HNYA 1V4SA 3O4NA 3MXIA 4KAZA 3TAQA 4C8LA 3KLFA 1KQSM 3C94A 4M3TA 1KAXA 3U9ZA 3MEDA 2RKIA 3H3OB 1OH8A 3MN7A 1ILYA 1VQ8N 1Q8IA 1S3XA 3SCXA 1SZ2A 4IOAL 4CFCA 1YT3A 5FDLA 1YIJN 1YHQN 4E7LA 5AQZA 4J2BA 1RT4A 4W5TA 3MDQA 4CF2A 3BF3A 3CCSN 2W40A 3UKRB 4CEEA 2QKBA 1Q9YA 1BQMA 1HUXA 1N6QA 4A5BA 4KHYA 1BQNA 1S1VA 4JD2A 4CI6A 3KKRA 5KI6A 4OO1J 5AQQA 1N5YA 3KLHA 3QO9A 1NJIO 2BANA 3M6GA 3RVCA 1RFQA 1QQOA 4IFVA 1Q7YO 3SV3A 4IFEA 4DV0K 3MWPA 1VQLN 3DXKB 1WSJA 3CFOA 3NFAA 3IFRA 3ZETB 3LWLA 4PUOA 3THWB 4B9VA 3KZBA 3NGZA 4CGDA 2EHGA 4LSLA 3KHYA 3UE5A 4BVPA 3SMPA 1JLEA 3AVJA 2E20A 4WE1A 1XNQK 3CCVN 1TK5A 3D2EB 3NH1A 3M8RA 3DYAA 5C12A 3LDSA 3NBPA 4CIFA 3FFIA 4H5TA 4A2BA 2NRZA 1L3UA 4B9NA 4FWQA 1J54A 1C6VA 4CEQA 4B8CA 4ICLA 3O5BA 3MCPA 1D4XA 4FJHA 2W6KA 4CD3A 3QETA 2YKNA 5CZ1A 2WBNA 3I0SA 5HBMA 3AO3A 4DV3K 2V52B 2YHXA 5AQXA 1W0HA 3OYGA 1NK0A 2O4IA 4DTMA 4H0YB 5LJVA 5CYMA 4G9ZA 3AAPA 1FK9A 1E4GT 3VEZA 5E26A 3A5NC 2VG5A 2HMIA 2O8CB 3F5TA 4M3YA 1RT3A 1NU0A 3CC2N 3SUNA 1IH7A 1N36K 1HKGA 1GOAA 1NK4A 2VQEK 3LM2A 1IG8A 4QS9A 2NNWA 2B5JA 3DJCA 1KLNA 3A2FA 3U3GA 1FJGK 1BIUA 3CERA 4M3RA 5F1XA 3UB5A 4DQ8A 2OA8A 4A5AA 4NXNK 4DU1A 3G4SN 2IDOA 1NJWA 3VEYA 4FJGA 4YDUC 3V9SA 3O1BA 3L6QA 1WSHA 3J8AA 4CK1A 3T69A 3DLEA 3M5RA 2IVPA 2X78A 2HHWA 4EP4A 3PSIA 4YOVA 5EY4A 2HHHK 1VQKN 2G8KA 2GELA 1EX4A 2HHSA 4KH6A 3TTDA 4Z94A 5LY3A 1ZYQA 4CBUA 4O55A 4LF9K 4CJWA 2J4RA 4IO8A 1YVNA 3LP3A 3Q7BA 4DV1K 3SUQA 5AQRA 3JAMO 4W5NA 3HJFA 4QAGA 4BR0A 2HB5A 1VQPN 3ULDA 4DTRA 5EU7A 3V6DA 1SS6A 1YI2N 4HUGA 4DSEA 3V9ZA 1VSEA 4CEDA 2E1YA 5I9EB 3LL3A 2P9UA 3THVA 1XHXA 3PIPL 4BRDA 3EL2A 3H46O 5AQTA 4IO9L 4BRNA 4FLWA 4JS4A 5TKWA 4CEFA 3O8MA 3WNFA 4I9QA 4CGHA 4DTUA 3KJVA 3NF9A 2OZSA 1NG9A 3CJ1A 3ZLJA 3ENOA 1U4BA 3NH2A 3NF6A 1P90A 1BI4A 1HPZA 5M1OA 1ITGA 3WQTA 2ITMA 1D9FA 1WSFA 4E1JA 3L3VA 5AZIA 4JEPA 1ZBIA 3PLAA 3CCRN 2KLAA 3QNNA 3RR8A 5FRMA 1UOCA 4GV6A 5AQJA 1WBBA 2KZMA 2PYLA 1LWCA 1NJXA 1L3VA 5M1QA 1OH7A 3UKUB 2OPSA 5FRNA 4RW6A 1BDGA 1GOBA 2E2NA 2E88A 1NOYA 3HM8A 2FBYA 5I42A 3AARA 2W6LA 5AQKA 4FWKA 1MDUB 1T7PA 1YF5L 5J2MA 1GLFO 4AM7A 1SAZA 5AQPA 3OS1A 4DLEA 4IJAA 4LF7K 4NXMK 1RDUA 3EE8A 1UA1A 1XHZA 4KHQA 4JI5K 4OGCA 4DS5A 4FK2A 2P9NA 1VQ4N 3VN5A 3V9UA 4LF4K 4DB3A 3ZT2A 1X9MA 1RCHA 3KIOA 1YJNN 4CEOA 1N32K 1K8KA 3VPZA 3FFKB 3ZX0A 3QEVA 4QCLA 1BOTO 5HLFA 2A41A 3VEOA 4KHUA 4R79A 3DXMB 2PYJA 4JRQA 1C0MA 2QXFA 2ZGYA 5J2NA 4KREA 4E7IA 4OLAA 1TYQB 4KB1A 3QESA 1J9AA 2NZTA 2QI2A 2Z1GA 3FZKA 3L2VA 1SUQA 1DLOA 4H0VB 3NDKA 2DTUA 2EX3A 1NM1A 4IEIA 4CJEA 5KTQA 3CCMN 3HO1A 2UXCK 2AA4A 3LP0A 4IG3A 4MDAA 4FM1A 3I55N 2QA4N 2BTFA 2EWSA 4E1NA 2Q97A 1L3SA 2P51A 3OA9A 4DQQA 4IBNA 4LFBK 4CHYA 1KFDA 4FJ9A 3OYHA 3TTFA 2ASMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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