4IJNA

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium smegmatis bound to amp and sulfate
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
MVTVLVVNSGSSSLKYAVVRPASGEFLADGIIEEIGSGAVPDHDAALRAAFDELAAAGLHLEDLDLKAVGHRMVHGGKTFYKPSVVDDELIAKARELSPLAPLHNPPAIKGIEVARKLLPDLPHIAVFDTAFFHDLPAPASTYAIDRELAETWHIKRYGFHGTSHEYVSQQAAIFLDRPLESLNQIVLHLGNGASASAVAGGKAVDTSMGLTPMEGLVMGTRSGDIDPGVIMYLWRTAGMSVDDIESMLNRRSGVLGLGGASDFRKLRELIESGDEHAKLAYDVYIHRLRKYIGAYMAVLGRTDVISFTAGVGENVPPVRRDALAGLGGLGIEIDDALNSAKSDEPRLISTPDSRVTVLVVPTNEELAIARACVGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium smegmatis
molecule tags Transferase
total genus 125
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA02
4B1ZA 4BRNA 4PL8A 3QFUA 4BRIA 3U8XA 1BO5O 4A62A 2ITMA 2NZTA 1NGAA 1NGGA 4BRGA 5FPMA 1BU6O 5BN9A 5JLHA 3VESA 2D0PA 5AQHA 4JNEA 1RDWX 4FWKA 3UKRB 3LM9A 5AQRA 1K8KB 4AM7A 2F9WA 2D4WA 5F1XA 2IVPA 1GLBG 2ZWHA 1YVNA 4BGBA 1SZ2A 1QQNA 4EFHA 4WQ5C 2V7YA 3CI5A 3SMPA 4CZFA 2A3ZA 3GE1A 3I8BA 4H5NA 3KZBA 4FWRA 1NM1A 4IZ9A 3KVGA 4HTLA 2ASOA 3QICA 4DQ8A 2HOEA 1ZXOA 2AP1A 5BRFA 3R9PA 3WEEB 4RTFD 3ZETB 2Q0UA 5CE3A 4WQ4C 3MDQA 1V4TA 3DJCA 4CD3A 1S22A 2CH6A 2P9UA 3EO3A 5AQOA 1S3XA 5KQDA 2A40A 3HTVA 1U2VA 5AQSA 4BROA 5KPZA 1KXPA 2V52B 3VGLA 1TYQB 4MLHA 3U9DA 3CIPA 2Q0RA 3VEZA 3WQUA 2P9KB 3D2EB 3W3DA 3A8YA 4BREA 1HUXA 1HKGA 2HMPA 1NGFA 2P9IB 4BR0A 3JS6A 4CJ7A 4FWNA 3RSEB 5AQWA 3BEXA 3L6QA 3UKUA 2FXUA 2BTFA 2H3GX 1E4GT 3HM8A 1JCGA 3DWLA 4JHDB 2BUPA 4CZJA 4Z94A 4DB3A 3FZHA 2IVOA 5AQJA 1Y64A 4FPAA 3VF6A 5BPLA 1YXQA 1IJJA 3FGUA 3ZEUA 3DXKB 1C0FA 3MK6A 1NWKA 2V51B 1CZAN 3A5NC 1HJOA 4BR2A 1GLJO 4BC2A 2A5XA 4BRFA 2V7ZA 4C23A 3MMVA 2Q31A 2J4RA 4EHUA 1SQKA 5AFUH 1BWFO 3O5BA 3LDLA 3W0LA 4EAHD 4RWTA 1ATSA 3HSCA 4CZHA 4O5FA 2P9NB 2IVNA 4K25A 5EY4A 2QW9A 3LDQA 3H3OB 4H5WA 3H3NO 4FL9A 3EN9A 4HWIA 2E1ZA 3ATUA 3H1QA 1NGHA 5BN8A 3O1WA 5AQGA 4IJNA 3CHWA 1NBWA 3ID8A 1XUPO 2ZGZA 5EOYA 3VF4A 3WUHA 5AQVA 4JD2B 3BF1A 1IG8A 4H0XB 4H0YB 3FR0A 3UB5A 2WUSA 4A2BA 1XQSC 3BF3A 5AQZA 3TPQA 1DKGD 4M63C 1G99A 2W41A 4FOIA 2E2NA 3CETA 4BVPA 4F9OA 3QBWA 4FO0A 1SAZA 3D2FB 3D7EO 4JN4A 4ISEA 1ESVA 4H03B 5AQQA 3C0BA 2NLXA 3MN6A 3AARA 3CJ9A 1GLLO 3A0IX 5AQYA 2YI1A 3DXMB 2P9LB 3KHYA 3C7NB 4FWMA 4FWSA 1LOTB 4H0VB 1HKCA 2GTDA 5FPEA 4MLEA 2UYTA 3O4WA 3A5LC 5JMVA 2QWMA 3GBTA 4K42A 4BRKA 4WQ5A 1ZBSA 3LDOA 4CI6A 4K43A 2GELA 3M3ZA 5AZIA 4NO7A 3UKRA 2FSNA 5AQFA 2IIRA 3UE5A 3ULEB 2QWLA 4GY2B 1EQYA 5F0XA 4BR9A 3A5MC 1TUYA 2E20A 1T6CA 2CGKA 3CJAA 1KAZA 1GLAG 1X9JA 2QWPA 3CJBA 3ZX3A 3MCPA 3U4LA 4FWQA 2D1KA 4H5VA 1NGJA 2YJFA 3LDPA 3EKUA 4WQ4A 3J8AA 5ADXH 1YAGA 4B1XB 2F9TA 3FZFA 2GUPA 4E1JA 5I9EB 4PKIA 3S41A 3IMXA 1MWKA 1GLFO 1Q18A 1HX1A 4M7XA 1DGKN 4BRCA 3CJ1A 4LC9B 1JCEA 4RCHA 5LJVA 4YDUC 3IUCA 3MN7A 3EKSA 2P9UB 2W40A 5AFUA 1U2VB 1JCFA 4A2AA 4BG8A 4BRAA 4FSVA 4BVOA 4CBWA 1TYQA 4DCHA 2HF4A 2E1YA 4IO8A 2HF3A 4BGAA 1Z6RA 4BQLA 3GG4A 4BG9A 3VGKA 2A41A 4BRLA 1RGIA 2NRHA 2FF6A 3P4IA 2P9PB 2YCHA 4QS8A 2D0OA 4FOEA 3WQTA 4FPBA 4CZGA 3ENHA 3WXKA 2ASMA 1HPMA 3WT0A 4MO4A 1HLUA 2AA4A 3ZX0A 1QZ6A 4GNIA 5AQXA 3ZEUB 3DXKA 3GL1A 4I6MB 2GWKA 4H5TA 4BRDA 5FPNA 5BRDA 5AQKA 4XEIA 2ZF5O 5AQIA 1GLDG 3U9ZA 2Q97A 3DAWA 4H0TB 4NB4A 4AM6A 3SLCA 3WXIA 3L0QA 1J6ZA 1NMDA 2E2OA 1C0GA 5AZJB 4ISGA 3SJHA 4FWOA 3QB0A 4H5RA 3LM2A 3O8MA 3B8AX 2PBDA 1MDUB 2YJEA 3FE1A 1YUWA 4QS7A 3L4IA 4CD1A 2YHYA 3HBTA 3MN5A 4BRQA 4IXCA 4B1VA 1NLVA 2ASPA 2P9SA 3BP8A 2VCPA 3BUZB 1XC3A 1DEJA 3O08A 3VF2A 4XH1A 1RFQA 3VEYA 3H45C 1GLCG 1U6ZA 5BR9A 2YHWA 5AQPA 2Q36A 1BOTO 5TKYA 3ATVA 5KPRA 2CGJA 4CZIA 3VEXA 4ISFA 4FWLA 4IJAA 1ZC6A 5ADXA 5LY3A 1NGDA 4XH5A 3FZLA 1OKJA 4CZKA 3H46O 4BR4A 3DXMA 3VGMA 3VEWA 2GWJA 1NGEA 1K8KA 1BA0A 4EHTA 1X3MA 4XH4A 4BR5A 3O6WA 5AZIB 5FPDA 3EL2A 2CH5A 1QHAA 3ULEA 4IWVA 2FSJA 4CZLA 3ZX2A 3HZ6A 5JICA 3FFKB 3TU5A 3O80A 3AY9A 3IFRA 2KHOA 4YDUA 5BRHA 3LL3A 3QDKA 2E88A 3CJCA 5AQMA 5JLFA 3WEEA 4BR7A 2FF3B 3ZETA 1NGBA 1T6DA 3FZMA 3VETA 3VERA 4B1YB 1MA9B 3FZKA 1NGIA 3HI0A 3R8EA 2YHXA 5EX5A 2QWOA 3EZWA 5E26A 2Q1NA 4BRPA 4BRHA 3H6EA 3LDNA 3VEVA 2EWSA 5BREA 4MO5A 1TUUA 4Y0WA 5AQTA 5AQUA 3VOVA 1QQOA 2P9KA 1Z05A 3D2EA 3I33A 4B1WB 3M1FA 1R59O 2PAVA 3GDQA 3VEOA 2CGLA 1T44A 2P9IA 4BC3A 5B8HA 4BC4A 3RSEA 5EVZA 2A42A 3MN9A 1KAYA 4H0OA 3UKUB 5AQNA 1V4SA 4CBXA 4JHDA 3A5OC 2E2QA 4WYBA 2Q2RA 3WXLA 3CQYA 1WUAA 3H1VX 2E2PA 2I7PA 4BC5A 4M7YA 1BDGA 3VPZA 4A61A 2P9PA 3IDHA 3JXUA 4K41A 2QWNA 3ENOA 5KPTA 4B1UB 1MWMA 4CBUA 3AAQA 1BUPA 2QWQA 3R6MA 4JAXA 1LCUA 5F2RA 4I6MA 5ELZA 1D4XA 1X3NA 4J8FA 5KQ8A 2A6AA 2P9NA 3QMLA 4O8KA 3AAPA 3F9MA 4CZEA 3QFPA 5E84A 4BQZA 1E4FT 5AZJA 3VENA 4PKHA 2QWRA 3GOIA 2FSKA 5EXWA 5BPMA 1KAXA 3O1BA 3SK3A 4JD2A 1NGCA 1H1VA 4FWPA 1QZ5A 2ZGYA 5AR0A 4CZMA 3OHRA 1ATNA 1GLEG 2QM1A 2I7NA 2VYPA 4KBOA 2P9SB 1ATRA 3M6GA 2E8AA 2VWBA 1HKBA 1QQMA 3CJ7A 3FLCO 3D2FA 3SMSA 1BA1A 3CERA 3QBXA 4DHYA 4PL7A 4L3QA 4PKGA 2OANA 2QXLA 2GEMA 3CQXA 1P8ZA 2FLOA 5AQLA 1BG3A 3G25A 4H0PA 5LJWA 1WOQA 4QS9A 4B9QA 2P9LA 3C7NA 2DPNA 5BPNA 4EIAA 3WXJA 4BRMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B1ZA 4B3SK 1VSKA 5KRSA 2HHTA 4Q0BA 2NZTA 5HLFA 1JKHA 5FPMA 1BU6O 3NGIA 1NK6A 3VESA 4JNEA 4FWKA 1OH8A 3QEVA 3G4SN 4F3OA 3CCJN 4Z4FA 2O8FB 1CXQA 4CJLA 1RCHA 2IVPA 4CF2A 2YX6A 5JS2A 3LZJA 3M8PA 1QQNA 4EFHA 2EX3A 2V7YA 3GE1A 4H5NA 4FWRA 4CE9A 1NM1A 3P31A 3KVGA 3U3YA 4KKOA 1VSMA 1HYVA 3QICA 4CJSA 1MU2A 1ZXOA 2AP1A 2ZQBA 1RILA 4DFPA 1EO1A 3K9JA 4IOXA 3WEEB 4CJUA 4RTFD 5DMRA 4FLTA 4CIEA 4CEAA 4CJ3A 1LW0A 4YOVA 3VQ6A 4FJKA 3O9QA 4WQ4C 3MDQA 4CD3A 4CJRA 2CH6A 4Z4HA 1N6QA 4DLGA 2XO7A 3G0ZA 3TANA 1SL0A 1KXPA 1NJYA 3CPWM 2V52B 1KFSA 1KQSM 4LH4A 4DTMA 2VQFK 2P9KB 4YOYA 3THVA 1FKPA 1HUXA 1HKGA 4KH6A 5HRNA 1NGFA 2P9IB 4BR0A 4FWNA 4KRFA 2NRRA 3EYZA 1S9GA 3UKUA 2FXUA 4Z4GA 3HM8A 4NYFA 3ZT4A 2BUPA 4N5SA 2FBTA 4DB3A 3SQ4A 3OBWA 4UQGA 3QNOA 4DV3K 5BPLA 3FGUA 1NKCA 1IBMK 4FJLA 3A5NC 4DU3A 1GLJO 2A5XA 4C23A 3PIPL 3QLHA 2QXFA 3ULDA 3KWIA 3QESA 4GV3A 1NK4A 5T7BA 1I3AA 1M90O 3K57A 4DWIA 3MEEA 2QW9A 3LDQA 5HROA 4CJEA 1WSEA 3E01A 4JKGA 2E1ZA 1VQ5N 3H1QA 5BN8A 4N76A 3O1WA 3AA5X 1NBWA 5EOYA 3AVKA 3VF4A 1NK0A 3O9SA 4JD2B 1Q9XA 3PV8A 4IKFA 2WUSA 5FRNA 4A2BA 1WAFA 1XQSC 3BF3A 1GOCA 3TPQA 3EY1A 4FVMA 4M63C 2W41A 3RMAA 2IAJA 5C0YA 3D2FB 3D7EO 1NNEA 1ESVA 5AQQA 3BGRA 3DMJA 2YHAA 4PY5A 1LW2A 1LWEA 1N32K 2UXDK 3SI6A 3DYAA 2XY6A 1FXXA 3KHYA 1EP4A 1JLGA 1HKCA 4OGEA 3IKMA 3N4PA 4MLEA 4DQPA 2HB5A 5JMVA 4LFBK 3SQ1A 1KCFA 4DR1K 3S3NA 3SUQA 3WNHA 2FSNA 1OH5A 3SBTA 1DT9A 2QWLA 3PUFA 5F0XA 1IO2A 2HBKA 4H4OA 1WSHA 2UUCK 3K59A 1T6CA 4C8LA 1FKOA 2CGKA 4E7KA 4BWJA 1GOBA 3U4LA 4E0DA 4AHRA 4EP5A 4FXDA 4AHTA 4CHQA 2QA4N 4DTPA 1NJWA 4J2BA 3KLEA 3OS0A 4M7XA 4IBNA 4B9VA 4BRCA 4YY3K 4LSLA 4IFYA 3T1AA 4B3MK 3CM5A 4IFVA 3MN7A 3EE9A 1S6PA 1N36K 2PZSA 5AFUA 3HXMA 2G8KA 1U2VB 1JCFA 4JKBA 4A2AA 2OCEA 3SUOA 4J2DA 1T03A 3Q7CA 3VQ8A 4IO8A 3ZSZA 2JGUA 4RG8A 3CCUN 3NVMA 4M3UA 3DRRA 4BRLA 2RE2A 4RW4A 1IG9A 3P4IA 2P9PB 4JK8A 1IKWA 2YCHA 3V1OA 5I3UA 4CZGA 3ENHA 4WE1A 1LV5A 1HPMA 4MO4A 3KK2A 3NE6A 3ZX0A 2G8VA 4NYNA 5AQXA 4DU1A 1D9FA 5AQKA 4FK0A 4NB4A 3ID6A 4H0TB 3WXIA 2UUBK 4HVJA 1C0GA 2F96A 1DTQA 1QQCA 3OYIA 2O8EB 3HVRA 3B8AX 4BDPA 1YUWA 3TSPA 4CD1A 2YHYA 4CEOA 4DV0K 3MN5A 5AJ3K 3RMBA 3CCRN 1WN7A 2UU9K 3WXMB 3BP8A 1BIZA 1TK0A 2YKNA 3TAPA 4B9NA 2VCPA 3KLHA 1S1WA 3BZCA 2W6LA 1N5YA 3OYCA 4JI5K 3P1GA 3CC2N 5BR9A 3DLKA 3F73A 2YHWA 3ENBA 1RDCA 5KPRA 4OX9K 2CGJA 4YOTA 3VEXA 3DRPA 4I2PA 4IJAA 5LY3A 3LDSA 1NGDA 3PO5A 3SQ2A 3PY8A 1OH6A 3G6EN 2O8BB 1TL3A 3SPYA 1IH7A 4CHNA 3NH1A 4TSXA 4W5TA 2GWJA 4E7JA 4C1NI 4B8AB 1WSFA 4EHTA 1UA1A 1M1KO 2DFHA 4MQ3A 5FPDA 3AVLA 2CH5A 4LF4K 1QHAA 1BISA 1G15A 4IWVA 4KTWA 3TTCA 3DLEA 1TK8A 4RW7A 3CCVN 4DQIA 4CGJA 3TU5A 3O80A 5GINA 1YF5L 1VSLA 3SZ2A 3OYBA 2KHOA 4YDUA 4M45A 1QVFM 4M3YA 4DR4K 1SUQA 3VN5A 3K0SA 4BE0A 4BR7A 4KV8A 4R79A 1IKYA 1NGBA 2GUIA 1RBSA 3AVNA 3E1YA 1NGIA 3VQQA 4CGIA 4HTUA 3NF9A 2YHXA 3H6EA 5BREA 1QSLA 5M1OA 4JKHA 3SYZA 3VEOA 4BC3A 4BC4A 3RSEA 4WFAL 2A42A 3MN9A 4H0OA 1K9MO 5GIOA 4OKJA 3LP1A 3A5OC 4JHDA 4WYBA 3CQYA 3V9ZA 1ASUA 4CEBA 4M7YA 1BDGA 3O4NA 2P9PA 3IDHA 2QWNA 2XRIA 3NAEA 4CJPA 4CBUA 1NJIO 1BUPA 2HHXA 3KWGA 4M3RA 2ZJQL 2HHHK 4J8FA 4DTSA 3CM6A 3OJSA 1Y97A 1B9FA 3VENA 1FK9A 2VGNA 2QWRA 4ELTA 1N8RO 2FSKA 5EXWA 4X62K 4JKEA 3CMAN 1VQLN 3C6AA 1NGCA 1H1VA 4Z4EA 3MEGA 2ZGYA 4DV2K 4CGHA 2I7NA 4KBOA 3M6GA 3DLBA 2NUBA 5GAHP 4A57A 2VWBA 1JL2A 1HKBA 1YITN 3HPGA 2QXLA 4DR3K 2FLOA 4IEEA 4JI3K 4QS9A 4ID1A 3K9KA 3WXJA 4BRNA 1UAXA 1BO5O 2ITGA 1JXBA 1NGAA 1NGGA 3OA9A 3QINA 4BRGA 4CFAA 3D45A 4OJRA 1YJNN 4JI2K 3ZSVA 5AQHA 1WSIA 3UKRB 2XY8A 3LM9A 1XHZA 3HP6A 2KFZA 5FDLA 4AQYK 3LP3A 4ZTFA 4JK7A 1VSIA 3CI5A 2F4VK 2A3ZA 3P38A 3I8BA 1RTDA 1CZ9A 4AILC 1C0MA 4H8KA 4AH9A 4CEQA 3L3UA 1SKRA 2NRXA 3OS1A 2ASOA 3R9PA 4CJTA 5CE3A 3DJCA 1S22A 2NNWA 4E7IA 2RF2A 3EO3A 5AQOA 1S3XA 4FLUA 4F4KA 3HTVA 5KPZA 3NBPA 4E89A 1TKDA 4MLHA 4CJ4A 4J2AA 3OJUA 3WQUA 3SUNA 3D2EB 4CK2A 3W3DA 1ZYQA 2NRWA 2OPRA 4B9LA 4JYAK 4CK3A 1WSGA 1RDUA 4NLBA 4G9ZA 3JS6A 4DSJA 4CCHA 3BEXA 3L6QA 2BTFA 3NH0A 2I5JA 4EZ9A 3DWLA 5TKWA 1CZBA 1ILYA 3NF8A 3THYB 1ITGA 3RR8A 3FZHA 3PIOL 3VF6A 3O9TA 4CEFA 2KKZA 4GVEA 3ZEUA 1C0FA 2V51B 4Z4IA 4AHSA 4BC2A 4BRFA 3MMVA 3K5OA 1SQKA 1W9HA 5HRSA 1BWFO 2P1JA 1ZBUA 4CF9A 3MEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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