4IJNA

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium smegmatis bound to amp and sulfate
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
MVTVLVVNSGSSSLKYAVVRPASGEFLADGIIEEIGSGAVPDHDAALRAAFDELAAAGLHLEDLDLKAVGHRMVHGGKTFYKPSVVDDELIAKARELSPLAPLHNPPAIKGIEVARKLLPDLPHIAVFDTAFFHDLPAPASTYAIDRELAETWHIKRYGFHGTSHEYVSQQAAIFLDRPLESLNQIVLHLGNGASASAVAGGKAVDTSMGLTPMEGLVMGTRSGDIDPGVIMYLWRTAGMSVDDIESMLNRRSGVLGLGGASDFRKLRELIESGDEHAKLAYDVYIHRLRKYIGAYMAVLGRTDVISFTAGVGENVPPVRRDALAGLGGLGIEIDDALNSAKSDEPRLISTPDSRVTVLVVPTNEELAIARACVGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium smegmatis
total genus 125
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijnA02
4DHYA 2ASMA 3O1WA 4CZKA 4ISFA 3MN7A 4QS7A 3S41A 3H46O 1BO5O 2J4RA 4FOIA 4PL7A 4CZEA 4EHUA 2IVPA 4B1VA 4BRIA 4BR2A 5ADXH 3WEEA 1QHAA 2D1KA 3D2EB 4H0XB 3FZLA 4IXCA 1ATSA 4H0YB 1YXQA 1MWKA 3G25A 1OKJA 4CZLA 5TKYA 4BRNA 4FO0A 4EFHA 1NBWA 2YI1A 4CI6A 5KQDA 4Z94A 3ENOA 2YHYA 3FE1A 4B1ZA 2FSKA 3VESA 1E4FT 1BDGA 2VYPA 4QS8A 1ZC6A 1KXPA 4WQ4A 3UKUA 1GLLO 3CI5A 4CZFA 1NM1A 3UB5A 3A5LC 2PAVA 4FWKA 1TYQB 2HMPA 1LCUA 2QWOA 4FWOA 4B1UB 4J8FA 3UE5A 5BN9A 2Q0RA 1MA9B 4CD1A 1NGIA 1KAZA 3CHWA 2V7ZA 3IMXA 5BR9A 2FXUA 3CQYA 2P9UB 4PL8A 5AQSA 3O80A 3LL3A 5B8HA 2QWNA 1K8KA 5ELZA 4H5WA 1QQOA 4BC5A 3JS6A 1U2VB 4BRLA 4BRAA 2QM1A 5FPDA 4K43A 4H0OA 3ULEB 3R9PA 3W0LA 5AQFA 3OHRA 4BGBA 1SQKA 2FF3B 4IO8A 3GOIA 4NB4A 3H1VX 3CETA 3CIPA 1GLDG 4H5TA 3ID8A 2HOEA 4CZIA 2Q36A 4BQZA 5EVZA 2PBDA 1NLVA 1YUWA 1JCGA 2NZTA 2ZWHA 4FWRA 3WT0A 5BRHA 1HKGA 2A40A 1HKBA 3O08A 1IG8A 2WUSA 4M7XA 5AQHA 2GUPA 3TPQA 3WEEB 1ZBSA 3ENHA 1LOTB 4K41A 5CE3A 3LM9A 2ITMA 2E20A 2Q31A 3HTVA 3ZETA 5AQMA 5BPNA 3FZFA 3DAWA 3AAQA 3WXJA 4B1XB 4CZJA 2YJFA 3AY9A 3QB0A 5AQGA 3M1FA 1HX1A 1WUAA 1XC3A 3GL1A 5ADXA 1CZAN 3SJHA 3EKSA 3SMPA 4CZHA 1NGJA 3H6EA 2ZGYA 3HSCA 2H3GX 2E2NA 4JHDA 3WUHA 2YJEA 2Q1NA 1GLBG 3UKUB 3GG4A 3VEWA 1X3MA 3CJBA 1NWKA 3QICA 1DGKN 2E1YA 2BTFA 1X3NA 5BN8A 2DPNA 3DJCA 5AZJA 5LY3A 2P9NA 4JAXA 4RTFD 1BWFO 1HPMA 2GELA 1MWMA 4F9OA 1QQNA 4JD2B 4WQ5C 3A5OC 3IFRA 4H03B 2A41A 3FFKB 4DCHA 4FWPA 3ZX3A 1K8KB 3KVGA 3U9ZA 5AQUA 3P4IA 2W40A 3H3OB 3D2FB 3I33A 4H0PA 3GE1A 4HTLA 1KAYA 2ASOA 3VETA 3AAPA 2P9PA 3A0IX 1KAXA 4BRCA 5BPLA 3MDQA 3CQXA 1GLEG 1SZ2A 3I8BA 1NGBA 3LDLA 4BRDA 4E1JA 2P9IA 5AQJA 2CH6A 1IJJA 2E2QA 3VEZA 5FPMA 2KHOA 4MO5A 4BVOA 1BG3A 3FGUA 3BUZB 3W3DA 1T44A 1R59O 2NLXA 1NMDA 4FWNA 3BF1A 3CJCA 4CZMA 1QZ5A 4BREA 3QBWA 2A42A 4IJAA 1BA0A 3AARA 1NGEA 3ZETB 5EX5A 5F0XA 1JCEA 5F1XA 3CJAA 5KPRA 4H0TB 4MO4A 1RFQA 4FPAA 3RSEA 4KBOA 2VCPA 3C7NA 3O4WA 3BP8A 3WXLA 3VOVA 4CZGA 3FZKA 3LDQA 2GTDA 3SLCA 4M7YA 5FPNA 2Q97A 5AQIA 3L6QA 4JHDB 4H5VA 4A2BA 5AZIB 4BC3A 3WQUA 3O8MA 1EQYA 3ATVA 2A6AA 2ASPA 1WOQA 1NGDA 5FPEA 3VGMA 3SK3A 1BU6O 5AQQA 1XQSC 1YVNA 3HM8A 4BRHA 4A2AA 1ESVA 4M63C 3UKRA 2FSNA 3LM2A 1ATRA 3CERA 3QDKA 4PKGA 5AZJB 4GY2B 4BRGA 3HI0A 3EO3A 3M6GA 4JNEA 1D4XA 3EKUA 4FWSA 3CJ9A 1T6CA 3BEXA 2Q0UA 3H45C 3M3ZA 3J8AA 3EL2A 5AQKA 5F2RA 3VEYA 4L3QA 5AQTA 4NO7A 2QXLA 1S22A 2P9LA 2ZF5O 3DXKA 4I6MA 5JMVA 2NRHA 3VEXA 4JN4A 3QMLA 4WYBA 2CGKA 2QWMA 1J6ZA 4FL9A 2W41A 2A5XA 4B1YB 4XH1A 4AM7A 4DB3A 3A5MC 4BG8A 3A5NC 3ZX2A 2QWRA 2YHXA 5AQVA 3MN9A 3ZX0A 5AR0A 2BUPA 2P9IB 4BRMA 4BQLA 5EXWA 4CD3A 4HWIA 3GDQA 3SMSA 5E26A 4BRQA 5BRDA 4BR0A 2IVOA 3HZ6A 1RDWX 1GLCG 3QFPA 3WQTA 1S3XA 4AM6A 2D0PA 1NGAA 1GLJO 1HUXA 1SAZA 4PKHA 1DEJA 4C23A 2V52B 2E88A 3GBTA 4CBWA 2V51B 4FWLA 3MN6A 4BVPA 3BF3A 3IUCA 3ULEA 4CBUA 4ISGA 5AQZA 3ATUA 1NGGA 3C7NB 1V4TA 5EY4A 2V7YA 5AFUH 5JLHA 4FWMA 4MLHA 2E1ZA 2QWPA 3EZWA 4QS9A 3VPZA 3JXUA 4BG9A 4BR9A 2E2OA 4WQ5A 4RCHA 4XH4A 2I7PA 3DXMA 2FF6A 1U6ZA 4H0VB 5AQNA 4XEIA 4Y0WA 2GWJA 1RGIA 2P9SA 4BRPA 3UKRB 3VF2A 5BPMA 4ISEA 3ZEUA 1C0GA 2P9KA 3VENA 1Z6RA 2F9WA 4A61A 4BR4A 3A8YA 2A3ZA 3LDOA 3CJ7A 1GLFO 3U4LA 3EN9A 4WQ4C 2AP1A 3C0BA 2GWKA 1JCFA 4BC2A 2HF4A 3H1QA 2E2PA 2P9LB 4CJ7A 4I6MB 3DXKB 1V4SA 3MCPA 5JLFA 1HKCA 4IZ9A 3WXIA 1X9JA 4FWQA 2CGLA 3DWLA 5AQPA 1Z05A 4BGAA 3FZHA 3O1BA 3FZMA 3B8AX 3U9DA 4FOEA 1TUUA 4EIAA 1NGFA 2QW9A 1BUPA 1MDUB 1GLAG 2UYTA 3MN5A 3QFUA 5EOYA 1BOTO 1QQMA 2GEMA 4EHTA 4FPBA 3QBXA 3IDHA 3D7EO 5BREA 4O8KA 2AA4A 4GNIA 1DKGD 2HF3A 3LDPA 4O5FA 4LC9B 3CJ1A 4XH5A 4JD2A 1T6DA 5KQ8A 3L0QA 5AQRA 2YHWA 1NGHA 3VEOA 3D2EA 1TUYA 2P9NB 5AQOA 1P8ZA 2FLOA 4BROA 5KPZA 3U8XA 3D2FA 4B1WB 2QWLA 4H5NA 2CGJA 4A62A 2F9TA 2ZGZA 4RWTA 3VERA 3KZBA 3FR0A 4YDUC 4BR7A 2VWBA 4BR5A 3TU5A 1ATNA 3VEVA 3WXKA 2IIRA 4BRKA 3VF6A 4IWVA 2IVNA 1YAGA 3DXMB 5AQXA 3R8EA 2P9PB 1XUPO 4IJNA 1TYQA 2P9SB 3R6MA 4FSVA 1Y64A 2YCHA 4YDUA 5AFUA 3VF4A 5JICA 4BRFA 4PKIA 3O5BA 3ZEUB 3VGLA 2P9KB 4DQ8A 1E4GT 4H5RA 2Q2RA 1HLUA 4MLEA 1C0FA 2D4WA 2P9UA 2I7NA 3KHYA 5E84A 2D0OA 5AQYA 1HJOA 3F9MA 3MMVA 5LJVA 5KPTA 1U2VA 4BC4A 1H1VA 5BRFA 3L4IA 3FLCO 2EWSA 3MK6A 1Q18A 5AZIA 1QZ6A 2E8AA 3O6WA 2CH5A 4CBXA 4EAHD 3VGKA 4K25A 3RSEB 4B9QA 3H3NO 5I9EB 2FSJA 1G99A 2OANA 1NGCA 5AQLA 3HBTA 3LDNA 1ZXOA 1BA1A 5LJWA 4K42A 2QWQA 5AQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Y1DA 4FM2A 2OA8A 5KTQA 2ASMA 4Z4IA 3O1WA 4Z0UA 4ISFA 3MN7A 3OYCA 4QS7A 3H46O 1UWBA 1BO5O 1CXQA 2J4RA 2P5OA 4BRIA 1YT3A 3D2EB 4IXCA 1ATSA 1TVRA 4H0YB 3H08A 4FZXC 4A59A 5A2QO 1S1WA 4CZLA 3CCLN 4BRNA 4FO0A 5KQDA 4JKGA 3HRGA 2YHYA 4HCBA 3VA0A 3K9JA 2NRWA 2QK9A 1BDGA 3MAQA 2IGIA 1LW2A 4WQ4A 3NVMA 5C0YA 3NF9A 3A5LC 4JKEA 3TAPA 4NCAA 3KWIA 4KI6A 4DV0K 4M3TA 4B1UB 3MX2A 3VQ5A 1MU2A 4JV5K 3MWPA 4CD1A 5JS1A 4B8CA 1SV5A 1JL2A 4YNQA 2FXUA 3CQYA 2P9UB 4PL8A 1BL3A 1Y97A 3DOKA 3O80A 1YIJN 3LL3A 1S6PA 1NJXA 1B9FA 3JS6A 1RT4A 4H0OA 3HPOA 2E6MA 3ZSZA 1SQKA 2ITGA 3GOIA 1TGOA 3CIPA 4DF4A 1GLDG 2KFZA 3ID8A 1GOAA 4DSLA 3TSUA 5EVZA 3LWMA 1D8YA 1YUWA 3WT0A 4DLGA 5BRHA 1YTUA 1JLQA 3O08A 4IOCL 4M7XA 4CHZA 3R3LA 3TPQA 3WEEB 3CMAN 3T1HK 4CJ4A 3TWHA 2Q31A 4E7HA 3I0RA 4F3TA 4OO1J 4CZJA 3ZT3A 3M1FA 1WUAA 1L3UA 2Y1IA 4CEQA 3NF8A 5HLFA 2NRXA 4OX9K 4HUFA 3F73A 3ZLJA 2HVHA 4RW8A 4FK2A 3MXMA 3H6EA 2FBVA 1W97L 3WUHA 2YJEA 4LH4A 2Q1NA 3GG4A 3CJBA 1NWKA 1HNIA 2BTFA 2VG5A 3F9KA 4CGFA 4YOUA 1VQ6N 2O8DB 4W5QA 3O9QA 4DR6K 3OTOK 4JAXA 1BWFO 1BI4B 2YNFA 4WQ5C 4E7IA 1HQUA 5M1PA 1WLJA 4ELTA 1K8KB 2QA4N 3OYGA 3E9OA 1R0AA 4B9VA 1XC9A 5FROA 3K58A 3I33A 4HTLA 4CW7B 2HVIA 4PUOA 3AAPA 1NJWA 3T19A 2P9PA 1BISA 3I8BA 4BRDA 4E1JA 3DOLA 4CJPA 2JGUA 3JAMO 2DFHA 1FK9A 3VEZA 5FPMA 3T1YK 4F8RA 4BVOA 3C6HA 3TAEA 1SL2A 4M3XA 4BDZA 4FJ8A 2OTJN 3HVRA 1QZ5A 2UXCK 1D9DA 3ZETB 1JCEA 4IO9L 3KK1A 2O8EB 2RPIA 4QAGA 2VCPA 3SQ1A 4CZGA 4CEAA 3LDQA 2GTDA 3SLCA 3V9UA 4KFBA 2HHSA 2GUIA 1VRTA 2YHBA 4JHDB 4BC3A 3ATVA 2A6AA 1D5AA 4CERA 1HYSA 1HYZA 1KD1O 2XO7A 3U3GA 4FLVA 4CEDA 1ESVA 2FSNA 1ATRA 3QDKA 3AVGA 4PKGA 3TTDA 2OTLN 4BRGA 2OCEA 2VGNA 4AQYK 4BWJA 2UU9K 4TSXA 1T03A 2I5JA 3J8AA 3L4QA 4ICLA 1U4BA 3VMFB 3DRSA 4YY3K 2O8CA 3DXKA 3OYBA 3CXCM 4DQSA 4DV6K 4WYBA 1O1WA 4O4GA 3OYAA 4FXDA 1J6ZA 1KVBA 4FL9A 5T7BA 4BE2A 3CPEA 2F8SA 4KHPK 3A5MC 1NG9A 3ZX2A 2YHXA 4C8KA 4UQGA 1TL3A 4CFDA 4AHCA 3I56N 4BQLA 1CXUA 1JLEA 5EXWA 5IWAK 4CD3A 3GDQA 3SMSA 1K73O 2JWLA 3KKRA 3MECA 1GLJO 4YORA 1SAZA 4M3ZA 1DEJA 1LAVA 4GVMA 4C23A 3SNNA 5J2NA 4YOYA 1L3VA 1KLMA 4BVPA 1TAQA 3S3NA 3BGRA 3PV8A 4FJMA 4YOXA 5AQZA 3ATUA 1OH5A 4GW6A 3OBWA 3B6OA 4U67L 1RBVA 3CYMA 4X65K 4F2RA 2E1ZA 4FJGA 1RDBA 2HMIA 4QS9A 4BG9A 3HXMA 4F3OA 4XH4A 2I7PA 1JLCA 3VQPA 5IT9O 4H0VB 4XEIA 1UA0A 4JKFA 4JK7A 4AF1A 4CIEA 1W0HA 2GWJA 3AO3A 1RGIA 1RILA 1WSJA 1OVQA 1NJIO 2F96A 4KO0A 4FJKA 5JVGL 4ISEA 5EU7A 1FW6A 1C0GA 3OYFA 3TAFA 2A3ZA 3CJ7A 4O8UA 2QKBA 2AP1A 1JKHA 3V1OA 2E2PA 3PSIA 1JLBA 3PX4A 3MCPA 5JLFA 3SJJA 5C42A 2DY4A 1HKCA 3OYKA 3TAMA 3FZHA 1NKBA 3V9XA 3O1BA 3FZMA 3U9DA 3DI6A 1TUUA 3VQCA 1SL1A 5J2PA 3E9LA 3MN5A 1W9HA 1KFSA 4EHTA 5GINA 1VQ4N 3NBPA 4FYDA 3QBXA 2YNHA 3QNNA 1GOBA 1VQ9N 4DSFA 3SUQA 3QETA 2RF2A 1DKGD 2HF3A 2OPSA 3MX5A 3OYIA 4O5BA 1HR0K 4JEPA 1S5JA 3D2EA 3O9SA 3NCIA 3LP1A 1OVYA 3U8XA 4DR5K 1RCHA 4M41A 1Q9YA 3T1AA 4QOZB 2ZGZA 1BQNA 5H1SQ 2DFFA 4BR5A 2IDOA 4O0IA 4KKOA 3AA3A 1VQKN 3TU5A 3WXKA 4HHTA 2IIRA 4BRKA 1S9EA 2IVNA 2OYQA 3R8EA 2P9PB 3CCRN 2P9SB 1Y64A 2YCHA 1IG9A 5AFUA 1BIUA 1BCMA 3ZEUB 3VGLA 2Q2RA 3O3HA 1C0FA 1WN7A 2P9UA 3M8SA 4FVUA 2D0OA 5GAEP 2O4GA 3N4QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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