2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
4HWIA 4Z94A 5AQUA 2Q31A 3UKRB 3CJCA 3C0BA 4FPBA 4JNEA 2E20A 3BP8A 3EKSA 4H0OA 1GLBG 1NWKA 4WQ4C 3DXMA 2HF4A 4BC2A 3MN6A 1XQSC 1GLEG 5KQDA 1Q18A 3WXIA 2P9UA 2HF3A 3IUCA 3QB0A 2V52B 5AQOA 2GEMA 4DCHA 4PKIA 4WQ5C 4ISGA 4A2AA 3WQTA 4BRQA 4BRKA 1RGIA 4FWKA 4O5FA 3A8YA 3U9DA 4FWQA 1S3XA 2GWKA 1NGBA 3ATVA 3WQUA 2DPNA 4FWMA 3S41A 3H3OB 4FWLA 2ITMA 3VEZA 4CBUA 2F9TA 3QFPA 5F2RA 2Q36A 3ZX3A 1QHAA 5AQRA 1IG8A 4I6MB 3ULEA 5AQLA 3SMPA 5BR9A 4BC5A 3M3ZA 3WEEA 3CIPA 3GE1A 2IIRA 1BO5O 1WUAA 4DQ8A 4IO8A 3KZBA 3IFRA 5LJVA 1TYQA 1MWMA 3LM2A 3ZX2A 1XUPO 1V4TA 4CZHA 2P9LB 3CJ9A 4Y0WA 3TPQA 4A61A 3LDQA 1E4GT 1IJJA 5BREA 3BF1A 4NO7A 3MMVA 4B1ZA 5AQTA 4JAXA 3FE1A 2P9PB 3O8MA 2A5XA 5AFUA 1DKGD 1R59O 4WYBA 1QQMA 3GBTA 1NM1A 2CH5A 4BRMA 2E2QA 3GG4A 3O1BA 5EOYA 3VERA 5JLFA 4BR7A 3IDHA 4BQLA 4JHDB 4H5NA 3WXKA 1GLDG 3JS6A 1U2VB 3LDOA 1ZC6A 2E8AA 2E1YA 3VEOA 2D1KA 1LOTB 1GLCG 4M7YA 4BREA 3KVGA 5EX5A 1NGJA 2P9PA 1SAZA 3AAQA 3CJ1A 4LC9B 3AARA 5E84A 3CETA 4M7XA 3W0LA 5ELZA 5I9EB 2P9SA 1BA1A 3QICA 3VENA 4CZJA 4EHUA 3R9PA 4BGAA 2QWNA 3VGKA 2CH6A 1KAYA 4BG8A 2UYTA 4J8FA 2GTDA 2QWRA 4CZMA 3U9ZA 3A5NC 1JCGA 4BRAA 3GOIA 3A5MC 1YXQA 5AFUH 3BUZB 4BG9A 1P8ZA 2FSNA 3WXLA 1G99A 4YDUC 5JMVA 1T44A 1TUYA 1KAXA 4AM6A 3L6QA 2VCPA 2P9UB 2QWMA 5AQQA 4BGBA 1NGCA 1ESVA 1SZ2A 1WOQA 2V7ZA 2YJEA 3U8XA 4BRHA 3VEVA 3MN9A 3O4WA 3B8AX 3ZEUA 4CJ7A 3TU5A 1BUPA 5AQJA 3HTVA 1C0FA 2V7YA 3D7EO 5AQSA 3VF4A 5AQIA 2PAVA 5EXWA 1BDGA 4EAHD 3HSCA 4EFHA 1QZ6A 1NGDA 1HLUA 3ULEB 4WQ4A 1YUWA 1HX1A 4BRFA 4FWPA 1T6DA 1GLLO 2NZTA 3IMXA 1X9JA 3WEEB 3EL2A 1ZBSA 1QZ5A 2E2PA 3O08A 1J6ZA 2P9NA 4QS8A 1BG3A 1E4FT 3HM8A 1TYQB 2YHXA 2Q0RA 4WQ5A 2Q1NA 1QQOA 3LL3A 1NMDA 1BU6O 3M1FA 2BUPA 3KHYA 4H5WA 3VPZA 4BR0A 2QWPA 4IWVA 1MWKA 3QBWA 3D2EA 3VEWA 3FZFA 3EZWA 5EVZA 4CD1A 1RDWX 2FLOA 1BA0A 5FPDA 4XH1A 3SLCA 1S22A 2FSKA 3A5LC 4BROA 5AR0A 3FGUA 3MN5A 4MO4A 3LDNA 4H5RA 1NGHA 3AY9A 3GL1A 4IJNA 5FPNA 1HUXA 3UB5A 2E1ZA 2CGLA 1D4XA 4A2BA 4RTFD 1YVNA 4BRGA 2P9SB 3UKUA 5FPEA 3VEXA 3H1QA 2QM1A 1NGIA 1ATRA 3SMSA 4JD2A 3R6MA 4CBWA 1KXPA 1JCFA 4H0YB 2IVNA 5BPLA 4ISFA 2ZGYA 5AZJA 3EKUA 1V4SA 2D0OA 2J4RA 3FFKB 5F0XA 3VETA 3VEYA 3ATUA 3C7NA 1H1VA 3CJBA 3VGMA 3FZKA 3BF3A 4CBXA 3FZHA 1Y64A 2YCHA 4BRCA 4FPAA 2A40A 1GLAG 3D2FA 3LM9A 4H5VA 5AQVA 3HI0A 4H0VB 2W41A 2FF3B 1NGAA 2OANA 2ASPA 1ATSA 4H0PA 5AQPA 1DEJA 3ZEUB 2E88A 3DJCA 4MLEA 3ZETA 2KHOA 5AZIA 3OHRA 4B9QA 2AP1A 4NB4A 3DAWA 3LDPA 5BPMA 3P4IA 3SJHA 3ENOA 4BVPA 2QWOA 5LJWA 3J8AA 2YHYA 4XEIA 2QWQA 3G25A 2YI1A 2Q97A 2P9KA 1T6CA 3H1VX 4BVOA 2QW9A 2P9NB 3O1WA 4PL8A 2BTFA 4BR9A 1OKJA 1TUUA 1GLFO 5BRDA 4BR2A 2Q2RA 1JCEA 2A42A 4IZ9A 2PBDA 4O8KA 4B1VA 2I7PA 1NGGA 4FWSA 4C23A 5BN9A 3DXKB 2D4WA 4L3QA 3A0IX 3QFUA 2NRHA 2GUPA 4FOEA 4B1UB 5E26A 4H03B 1X3NA 2I7NA 4BR4A 5KQ8A 3MK6A 4CZFA 4BQZA 5BRHA 3MCPA 3D2EB 3QMLA 4BC4A 2WUSA 4BRLA 1YAGA 2EWSA 4E1JA 2CGJA 1KAZA 1HPMA 5AQFA 4RWTA 1SQKA 5BN8A 4MLHA 1K8KA 4CZLA 2FF6A 2GWJA 4K43A 4PKGA 3SK3A 3WUHA 4K42A 3CJAA 5AQMA 3U4LA 5LY3A 5AQYA 3DXKA 3VESA 3QBXA 2A41A 1NGFA 1QQNA 2IVPA 1NBWA 5KPRA 4H0TB 1HKGA 3CI5A 5BRFA 4KBOA 4F9OA 3H46O 2VWBA 3UKRA 1CZAN 4CD3A 2VYPA 3HBTA 3I8BA 4FSVA 1LCUA 4BR5A 3UKUB 3H6EA 3MDQA 3FR0A 4B1YB 2Q0UA 1HKCA 3VF6A 2YJFA 4BRIA 4XH5A 3HZ6A 2ZF5O 1C0GA 2ASOA 3L0QA 4JD2B 1BWFO 4H0XB 1MA9B 4XH4A 4CI6A 4FWRA 5AZJB 4DHYA 1ZXOA 3ENHA 1XC3A 3R8EA 4BRPA 4A62A 4GY2B 3C7NB 4FL9A 5AQNA 1U6ZA 1HJOA 1X3MA 3MN7A 5KPTA 4PL7A 4BC3A 3D2FB 4M63C 2P9IB 5B8HA 5AQKA 3UE5A 3JXUA 2NLXA 2GELA 2W40A 2V51B 4MO5A 5FPMA 3FZMA 2QWLA 2A3ZA 3FLCO 3CJ7A 4FWOA 2A6AA 3L4IA 4FOIA 3CQXA 4I6MA 4RCHA 4FO0A 5AQWA 3M6GA 3H3NO 5JLHA 1ATNA 1MDUB 2ZGZA 3BEXA 3ZETB 5JICA 4K41A 1RFQA 4DB3A 5AZIB 4HTLA 3LDLA 4CZKA 3F9MA 3O80A 2HMPA 1NLVA 4H5TA 3O6WA 5ADXA 3VOVA 5TKYA 1Z05A 2E2NA 2P9IA 3FZLA 3H45C 3W3DA 2F9WA 3DWLA 2E2OA 2P9LA 5AQZA 3QDKA 2CGKA 1Z6RA 2IVOA 4ISEA 2FSJA 3O5BA 3A5OC 2QXLA 2P9KB 3EN9A 5BPNA 4EHTA 4PKHA 2D0PA 4EIAA 4FWNA 2H3GX 4AM7A 2AA4A 5CE3A 2FXUA 2ZWHA 3I33A 4JHDA 2ASMA 3CHWA 4GNIA 3VGLA 3CERA 3RSEB 1U2VA 4CZEA 5EY4A 1NGEA 5F1XA 5AQHA 4YDUA 3ZX0A 2YHWA 3EO3A 1GLJO 4CZGA 4JN4A 3CQYA 3VF2A 4B1XB 1HKBA 4QS7A 3DXMB 4K25A 3GDQA 1DGKN 1K8KB 4BRDA 4CZIA 5AQXA 3WT0A 5AQGA 1BOTO 4B1WB 3AAPA 5ADXH 5KPZA 1EQYA 4IJAA 4QS9A 4BRNA 2HOEA 3RSEA 3WXJA 3ID8A 4IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT5A 5AQUA 4ELUA 1YTAA 4FPBA 4H0OA 5J2MA 1NWKA 4WQ4C 2HF4A 4KREA 3U6FA 4A5AA 2G8IA 3T69A 4Y1DA 5KQDA 4F2SA 5T7BA 3C65A 3WXIA 2P9UA 1HNWK 1KVBA 1YT3A 3QB0A 2V52B 5AQOA 2GEMA 1TK8A 4GVMA 4WQ5C 4A2AA 4QOZB 3WQTA 1NK7A 4BRKA 3PIPL 4FJLA 4FWKA 2RKIA 3TANA 1HPZA 1U47A 3DOLA 1S1UA 3CCLN 1C1CA 3QFPA 1KTQA 3O3GA 4I9QA 3NE6A 2OPPA 5AQLA 3ULDA 3KKSA 1Q82O 1NNEA 4BC5A 4WFBL 3M3ZA 1TGOA 1F21A 5KRTA 3PIOL 1M90O 4OPAA 4KHWA 4DQ8A 2O8FB 4B3MK 1QE1A 3C6HA 3ZX2A 4JKGA 1JXEA 3PUFA 1KQSM 2YKNA 3SPYA 4M3UA 4OPKA 2IC3A 1E4GT 1IJJA 5LMNK 3DLBA 2YNGA 1VSKA 3MMVA 1NK4A 3FE1A 1QVFM 1DKGD 4DF8A 3GBTA 2E2QA 3VERA 4W5TA 4AHRA 1VRTA 3M5RA 1RTDA 4AHCA 4JRQA 1C0TA 3KLEA 4H5NA 3NMUA 3QERA 3T1AA 2ZJQL 4WFNL 4OX9K 1GLCG 3OYFA 3CCMN 3KVGA 2PYLA 3PO5A 1NGJA 5M1QA 3CJ1A 4DQSA 4LF7K 3W0LA 4NLBA 1JL2A 5JS1A 1NKEA 3G10A 4BGAA 1Q81O 3V4IA 4IKFA 1KAYA 2OA8A 2GTDA 3E9LA 2HHIA 3A5MC 5CY4A 3T19A 4CIGA 5AFUH 1S1XA 1U48A 4LF8K 1NK5A 1WN7A 3PLAA 1VQ6N 3TABA 5AQQA 3K5LA 3KK2A 4BGBA 4K8ZA 1IBMK 4DSJA 1ESVA 1SZ2A 4KI4A 1LWCA 2V7ZA 2YJEA 3U8XA 3T1YK 3OYKA 3I8DA 3ZEUA 3B8AX 3ZSRA 1CXUA 4CJ7A 4Z4CA 5AQSA 3HTVA 1YIJN 2V7YA 3MX5A 1SKSA 3AO5A 3HSCA 4CJVA 4EFHA 3CXCM 3NGIA 4ILGB 2RPIA 4HCCA 3HOSA 1HLUA 3ULEB 2O8BB 4C8MA 1WSFA 3N4PA 5M1NA 3OYAA 3UIQA 5M1PA 4E3SA 3OBWA 3MEGA 3RR8A 1ZBSA 4CEDA 2P9NA 1N32K 1SL2A 4ILJA 5HP1A 3CPWM 2Q0RA 1VQON 3S3NA 3CMEN 5HLFA 3K57A 3NF9A 4I2QA 3D2EA 4BDPA 4KH5A 3KLFA 3SUPA 3AO3A 1ILYA 1BI4A 4CD1A 1BA0A 1U45A 1WSHA 3L3VA 4CEAA 2FSKA 1T3VA 2F7TA 4FK0A 3ALYA 4XJXA 5HBMA 4MO4A 4JS5A 5HRPA 1NJZA 2ZM6K 3V81A 3GL1A 4DV7K 5FPNA 3UB5A 4N56A 2E1ZA 1C1BA 4E7HA 3THXA 2UXDK 4RTFD 3FFIA 2P9SB 4OKEA 2WBNA 4TSXA 1QSYA 3A2FA 4CHZA 2WTUA 3CCEN 4X66K 4FLUA 1ATRA 1JKHA 4JD2A 4BE2A 4X62K 4ISFA 5AZJA 3PX6A 1UWBA 5F0XA 3IG1A 3BZKA 1CZBA 1RILA 4YFUA 1XNQK 4OKKA 3CJBA 1N8RO 4E7JA 4CBXA 1Y64A 4NCAA 3AO4A 4KO0A 3T3FA 2O8DA 4DSLA 3HI0A 4H0VB 2YX6A 2XO7A 3RR7A 5C2DA 5AQPA 3DJCA 4J2DA 5CHIA 2IGIA 2QKBA 3ZETA 4LF9K 4GV6A 4JV5K 4ID1A 3V9XA 4E1MA 3V1RA 5BPMA 4DV0K 4JI5K 1T8EA 4DU4A 5DM6L 2YHYA 2Y1IA 2NRVA 2Z1JA 2QWQA 3OYEA 3TAFA 5M1KA 4M42A 3G25A 2Q97A 3LAKA 2P9KA 4J2BA 1I3AA 3O1WA 1W7AA 4WF9L 2YNHA 4BR9A 5BRDA 1GLFO 2RF2A 2Q2RA 3PSIA 4GKJK 2E6MA 4KI6A 4DTOA 5BN9A 3DXKB 3VA0A 1VSDA 1LV5A 4E89A 4Q5VA 1YJWN 4CJKA 1HR0K 1QHTA 4B1UB 3HM9A 1X3NA 1YHQN 1SL0A 3K5NA 5BRHA 3RMDA 1WBDA 4BC4A 5JVHL 3I0SA 2KQ2A 2EWSA 3VQ6A 3P31A 2CGJA 5AQFA 5BN8A 4GW6A 3SK3A 3SUNA 5AQMA 5LY3A 5AQYA 3VESA 1RDBA 4I9LA 4IG0A 4MDBA 3CCRN 2NUBA 4NCGA 4F9OA 3ENBA 3UKRA 4CD3A 3KTQA 3I8BA 3VN5A 1A5XA 3H6EA 1REVA 3MDQA 1HQEA 3RTVA 3FR0A 3TSPA 4B1YB 3CC4N 2YJFA 4XH5A 4C1NI 3CQ8A 1WAFA 3CYGA 3ENHA 4CEEA 1XC3A 4YOYA 4W5NA 5AQNA 1X9SA 3CFPA 1HJOA 3WNFA 1ASVA 4JI0K 3VQAA 3D2FB 4M63C 2A1RA 1NJXA 4CEQA 2NLXA 1NOYA 3L4QA 3FLCO 4AHSA 2HMIA 4FOIA 2A6AA 4O44A 3CQXA 4BWMA 1NG9A 3H08A 1XHXA 4BEBA 1VSJA 3H3NO 5JLHA 3ZT4A 3O3FA 3BY5A 2VGNA 4F8RA 1VK0A 5JICA 4K41A 3DLGA 4DB3A 3LDLA 4CZKA 3SCXA 4FJGA 3ZSZA 4FJ9A 5ADXA 2F8SA 3CC2N 1VAZA 4AHUA 3FZLA 2P9IA 1OH8A 3KWGA 3ZT1A 2F9WA 4CK2A 3DWLA 5AQZA 3D6RA 4WE1A 2IVOA 4DTUA 3PY8A 2DTUA 2QXLA 2F96A 2D0PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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