2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
1ZBSA 3RSEB 2P9PA 4BROA 4AM6A 3H3NO 3QICA 1QQNA 4A2BA 1T6CA 3HTVA 4PL8A 1YAGA 1HKGA 2QWLA 3U9ZA 1NGDA 2E20A 3VGLA 3VEYA 2A42A 4BR5A 2E8AA 2A5XA 2NLXA 3FR0A 3U8XA 2QWPA 2CGLA 3EKUA 1ATNA 5AQYA 2FF3B 4BRHA 3IUCA 1JCFA 4CJ7A 2FLOA 2FSKA 3W3DA 4BC4A 1P8ZA 3AAPA 3O4WA 3D7EO 3QDKA 4IWVA 5AQKA 3P4IA 1NWKA 2ZGYA 4H0XB 3ZETA 4BRLA 2CH5A 3GDQA 3KHYA 4XH1A 3AAQA 4ISFA 4BGAA 4IO8A 3DXKB 4KBOA 4B1YB 4BRGA 5ADXA 5JICA 3G25A 4JNEA 5EX5A 3CERA 1HJOA 4H0VB 3CJ7A 4B1ZA 1T6DA 3VERA 1QZ5A 2QWOA 2QWNA 2E88A 2F9WA 3VGMA 1DEJA 4YDUA 4BC3A 4JD2A 4CZIA 1S3XA 1ATSA 1U6ZA 3LM2A 4BQLA 1KAXA 4FWPA 1E4FT 1YUWA 3SMSA 4Y0WA 4Z94A 1TUUA 4CZFA 2AA4A 1NBWA 4BG9A 3CJ1A 2PBDA 4FWSA 4H03B 3CQXA 3FE1A 3ZEUA 3VENA 4DQ8A 1NGGA 4MO4A 3GE1A 2FF6A 2IVOA 3EN9A 2Q31A 1NGIA 3VOVA 4BRIA 3H45C 5AR0A 3R9PA 5KPTA 3MMVA 3UKUA 1LCUA 4FWMA 5AZJB 3AARA 3HZ6A 1JCEA 2Q97A 4WQ5C 4K41A 3UB5A 2EWSA 4BRCA 2Q2RA 3A5LC 3FZHA 3VETA 4H5RA 1RFQA 2P9SA 4GNIA 2IVPA 4BR4A 1RGIA 2VCPA 4ISEA 3CJBA 3ZX0A 4A62A 1KAYA 3M6GA 4I6MA 3UE5A 4BGBA 1QZ6A 1SAZA 4BVOA 3WT0A 1EQYA 1R59O 3CQYA 1GLEG 5BREA 2E2QA 1QQOA 2J4RA 4J8FA 2YHWA 3IMXA 4FOIA 1D4XA 1OKJA 1IJJA 1C0FA 3O6WA 4EAHD 4FSVA 3A5MC 2Q0UA 4BRMA 3LDOA 3WXKA 1CZAN 1NM1A 5I9EB 2A40A 5ELZA 4FWOA 2P9UB 3VGKA 3WEEB 4BR9A 3ZETB 2E1YA 3O1WA 5BN8A 2P9NA 2HF3A 3CETA 4H0OA 4K43A 5AQMA 4RTFD 1Z05A 2QWQA 3HM8A 4YDUC 4K25A 2QM1A 4DB3A 5KQDA 1DKGD 1NMDA 3BUZB 3ID8A 4L3QA 1XQSC 3VESA 4E1JA 4M7XA 4FWKA 3LL3A 3CHWA 2PAVA 3KZBA 1YXQA 3WUHA 2YHYA 3WXIA 4EFHA 3D2EA 3UKRA 2P9LA 3A5OC 2P9KA 4FOEA 2E2OA 3HSCA 4H5TA 2YJFA 2WUSA 5BPLA 4B9QA 2A3ZA 1HX1A 2GWJA 3WQTA 4XH5A 5FPEA 2CGJA 1V4TA 4CZHA 3DWLA 4BRPA 5CE3A 3M3ZA 3MN6A 2QW9A 2NZTA 4PL7A 2CGKA 2A41A 5F2RA 1NGHA 5BRDA 3ATVA 2ZWHA 4PKGA 3O1BA 4BC2A 1IG8A 2H3GX 4NB4A 1BU6O 1NGCA 3S41A 3UKUB 1BWFO 3RSEA 3SJHA 2ASPA 3FLCO 2ITMA 1GLLO 2A6AA 3D2FA 1BA1A 1H1VA 2UYTA 2W40A 5AFUH 1GLAG 1S22A 2CH6A 2ASMA 1HKCA 1NGEA 4QS9A 5JLHA 1HKBA 2E2PA 3IFRA 1NGFA 4I6MB 1HLUA 2YI1A 4BRAA 2V51B 4FL9A 1WOQA 3WQUA 4CZGA 1T44A 4MLHA 3CJ9A 1Y64A 3FGUA 4O8KA 5AQVA 5JMVA 2V7ZA 3CI5A 3O5BA 2P9IA 1BA0A 1NGBA 1K8KB 5F1XA 5LJVA 3LDPA 3U4LA 4M7YA 3C7NB 4H5NA 3EKSA 4RCHA 3L4IA 5BRFA 3A8YA 4F9OA 4BR0A 3MDQA 4CZEA 3EO3A 5FPMA 3DAWA 2GELA 4CZLA 5BPNA 2V7YA 3DXKA 3MN7A 5LJWA 1TYQB 4MLEA 2IIRA 5AZIB 3EZWA 2D0OA 3KVGA 1ESVA 1SQKA 3QB0A 2I7NA 3VPZA 3U9DA 2GWKA 2YHXA 3A0IX 2AP1A 2QWMA 5ADXH 2P9PB 1LOTB 1NGJA 1U2VA 4QS7A 1C0GA 1J6ZA 3VF4A 3QBWA 1WUAA 4CBXA 2ASOA 5BN9A 3SK3A 4JHDA 3BEXA 2VWBA 4LC9B 2VYPA 2HF4A 5KPZA 1Q18A 4CBUA 3QFPA 1YVNA 1X3NA 1NLVA 2NRHA 2ZGZA 1MWMA 3O80A 2HMPA 3R6MA 5AQNA 3J8AA 1GLFO 1ZC6A 2IVNA 3I33A 2HOEA 1GLCG 4EIAA 3CJAA 3H1VX 3L6QA 2BUPA 4DHYA 3SMPA 5KPRA 3BP8A 5E84A 4QS8A 5AQZA 3WXLA 4XH4A 2Q36A 5AZJA 4ISGA 3DXMA 4WYBA 4EHTA 4DCHA 2D0PA 2QWRA 4H5VA 2V52B 4HTLA 3W0LA 4CBWA 1MDUB 3QFUA 4JD2B 3HI0A 3IDHA 2F9TA 3TU5A 3BF1A 4BVPA 4FWLA 4GY2B 2I7PA 4WQ4A 5EXWA 4BG8A 3MCPA 3D2FB 2BTFA 4FPAA 3VF6A 5EOYA 3H3OB 3H46O 3VEXA 1E4GT 4A61A 4BR7A 4BREA 3ZX3A 1MWKA 5AQRA 3GL1A 1X9JA 4FO0A 2OANA 3ULEA 4B1XB 5AQOA 1GLJO 3MN9A 3ZEUB 2KHOA 3FZLA 3TPQA 3VEVA 4IJAA 2D1KA 5LY3A 1SZ2A 5F0XA 2P9IB 5BPMA 4B1VA 5AFUA 2E2NA 3VF2A 5AQJA 4H5WA 3CIPA 2P9UA 1BG3A 3WEEA 3ATUA 3LM9A 1MA9B 3C0BA 5E26A 2W41A 3DJCA 4FWQA 5JLFA 4O5FA 3OHRA 3AY9A 1G99A 3QBXA 4PKIA 3LDNA 4CD3A 4BRKA 2P9SB 3L0QA 5EY4A 1XC3A 5EVZA 2FSJA 5AQXA 3BF3A 1KAZA 3ENOA 2GEMA 4A2AA 2YCHA 3EL2A 4C23A 3LDLA 2D4WA 3CJCA 2DPNA 1U2VB 1TUYA 4XEIA 4B1WB 1BOTO 1V4SA 1RDWX 4MO5A 3ENHA 5FPDA 3I8BA 4M63C 3H1QA 5TKYA 5AQQA 2FXUA 3MN5A 4FWNA 4JHDB 2ZF5O 4CZMA 5AQPA 2Q1NA 4CD1A 2GUPA 4CZKA 2QXLA 1GLBG 1ATRA 1BUPA 5AQIA 5BRHA 3JS6A 1ZXOA 5B8HA 1NGAA 4BRDA 5KQ8A 1BO5O 3FFKB 4FPBA 3O08A 3LDQA 3A5NC 4BRQA 3SLCA 2P9NB 4B1UB 4BR2A 1BDGA 4BRNA 4CI6A 5FPNA 1KXPA 3F9MA 4HWIA 5AQTA 4K42A 3DXMB 1QHAA 3MK6A 5AQWA 5AQGA 1HPMA 5AQHA 3M1FA 4H0PA 1JCGA 4IJNA 5AQLA 3ZX2A 4BRFA 4WQ4C 1X3MA 3VEZA 2FSNA 4CZJA 3D2EB 3GBTA 3UKRB 2P9LB 2P9KB 4H0TB 1QQMA 2E1ZA 1DGKN 4RWTA 3FZFA 3VEOA 3VEWA 2YJEA 4JN4A 1K8KA 4BQZA 1HUXA 4PKHA 4AM7A 3FZKA 1XUPO 3QMLA 3ULEB 2Q0RA 4JAXA 3C7NA 4H0YB 5AQSA 3R8EA 3FZMA 5BR9A 3GG4A 1Z6RA 4NO7A 3H6EA 3O8MA 3JXUA 4EHUA 2GTDA 4FWRA 5AQFA 1TYQA 5AZIA 3WXJA 3HBTA 3B8AX 5AQUA 1GLDG 4IXCA 3GOIA 4WQ5A 4IZ9A 4BC5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSQA 3H3NO 1QQNA 3QESA 3KWIA 4GW6A 4DV1K 1I3AA 1JLQA 4KHPK 2A42A 3THWB 2NLXA 5KRSA 3U8XA 4A59A 1KSPA 4BE7B 2VGNA 2QWPA 2CGLA 1N5YA 2VGMA 3EKUA 1ATNA 4BRHA 1ASUA 4W5OA 3IUCA 1JCFA 3TARA 4N41A 1XHZA 2UXDK 4Z0UA 1HPZA 2ZGYA 5D3GA 4AHCA 5H1SQ 3O3HA 4CGGA 1GOAA 3EEQA 3T7ZA 1C1AA 4O4GA 4JRPA 5I42A 3CERA 1HJOA 1EP4A 2QWNA 2O8BA 4BDZA 2F9WA 1WSEA 4C8NA 1DEJA 1T8EA 3IG1A 1EWQA 3KKRA 3ZSVA 2ZQBA 4BQLA 3MEEA 4FWPA 4YOWA 1YUWA 3HVTA 2F4VK 3E9OA 1TUUA 2JGUA 4FJ5A 2XY5A 4CZFA 2AA4A 1YTAA 3CJ1A 4DSEA 1HQEA 5SZTA 3DLGA 3CYGA 4B8CA 2NRZA 1VQPN 4MO4A 2ZD1A 1Q81O 1TKTA 3VOVA 3F2KA 3U3YA 3QEPA 3AA3A 4Q5VA 3MMVA 2QKBA 3HZ6A 4LH5A 4FLXA 5AJ3K 4YORA 4CJWA 4BRCA 3VETA 3DLEA 1RFQA 4HCBA 4DFPA 4GKKK 2IVPA 4BR4A 1RGIA 1KVBA 4B9NA 4A62A 3THYA 1KAYA 3L3VA 4NYFA 4CJRA 3LP2A 4JI5K 3I0SA 3MXIA 2W00A 4Z4IA 1EKEA 3HXMA 2J4RA 4G9ZA 5CZ2A 1ZBFA 2YHWA 3IMXA 3ZSWA 3LP0A 3T69A 5LMNK 1WNSA 4KREA 4CJ5A 2Z1JA 2RF2A 3DLLL 1W9HA 1NKCA 1C0UA 3ZETB 1J9AA 3O1WA 1KFDA 4YNQA 2HF3A 3QEIA 4H0OA 3AVBA 1Z05A 1S6QA 4KB1A 5DM7L 4M3RA 4M7XA 4O55A 4WFAL 2PAVA 3WUHA 1RT2A 1YXQA 3M5RA 3VMFB 3NGYA 3UKRA 2P9LA 3A5OC 1QVFM 4E1NA 2E2OA 5HOOA 3WNGA 4K8ZA 2WUSA 1W97L 5BPLA 3HL8A 4XH5A 5BR8K 3AVCA 4CGJA 1IV0A 3V1RA 4CZHA 1ZBLA 1TAUA 2CGKA 2GBZA 1NGHA 3CCSN 4Y1CA 1S5JA 3PX0A 3RMCA 1NJXA 3I8DA 2ZWHA 3LALA 3N4PA 4CJ4A 1YJWN 2PYLA 2A1RA 4LH4A 2H3GX 1KVCA 4NB4A 3HO1A 1NGCA 2UXCK 1BWFO 3FLCO 2ITMA 1OH6A 4CFBA 3D2FA 1BA1A 3CCRN 2UYTA 3UIQA 1Q7YO 1NGEA 4CFCA 4C8MA 3THWA 2G8UA 4OPJA 2E2PA 2KZMA 1NGFA 1BGXT 4I6MB 4CF9A 4FVUA 4MLHA 4O8KA 1Y64A 5KGWA 5C15A 1MU2A 3CI5A 3QEXA 4LF6K 5MLCQ 2D5RA 1NGBA 3MAQA 2YHAA 5JENA 3ZT0A 4NCGA 5CHIA 3OYDA 4DMNA 4JS4A 1HNXK 4M7YA 3TANA 4OKJA 4NCAA 3CCJN 3DRRA 3MDQA 4BR0A 4CZEA 5J2QA 4IOXA 3EO3A 4FZXC 3PIOL 5AZIB 3EZWA 3KVGA 1SQKA 3CCEN 2I7NA 4JK8A 3K9KA 4GKJK 5EU7A 1RBRA 1RDCA 2VWKA 4FVMA 3QO9A 1NGJA 1U2VA 4QS7A 3ZSOA 1XI1A 3CFPA 3VF4A 4B3TK 4F2SA 3VQAA 4O8UA 1VSFA 4IO9L 3QEVA 4JI2K 4DTUA 1YVNA 3C95A 1SKWA 1VRTA 1X3NA 1RDDA 4YFUA 1NLVA 4B9MA 3R6MA 1MWMA 4MFBA 5JS2A 1VQ7N 4LSNA 2IVNA 2HHQA 1GLCG 3TABA 1C0TA 3CC7N 3HP9A 3BP8A 3EE8A 4A57A 4QS8A 1REVA 2Y1JA 3NMUA 4WYBA 4EHTA 4KH6A 3NH1A 4BACA 3AVJA 4CBWA 3QFUA 4NYNA 3HI0A 3IDHA 3I0RA 2HHXA 2BE2A 4CIEA 5JVHL 4BVPA 4FLZA 4FWLA 3QLHA 4GY2B 2I7PA 3VF6A 4ILGB 4BR7A 5IT9O 4CE9A 1A5VA 1MWKA 1X9JA 4FO0A 1JLBA 4B3RK 3SQ4A 1BIZA 4B1XB 3V9ZA 4E7IA 5AQOA 5SWMA 3AO5A 4CF8A 3SPZA 2OYQA 3TSPA 2P5OA 2KHOA 3TPQA 2Z1IA 4IJAA 1M90O 1RT7A 2G8VA 4GVMA 2D1KA 2FBXA 1LW0A 3BZKA 4H5WA 4JKFA 2NRRA 2KKZA 3C0BA 1VQLN 1WAFA 2UUAK 3DJCA 4OKKA 5GIPA 4FWQA 1M1KO 5JLFA 1NKEA 4OLAA 2W6LA 4F3OA 3IRXA 3LDNA 1KD1O 4CD3A 3OYIA 4Z4EA 4M3TA 5AQXA 3K5OA 1KAZA 3ENOA 3PSIA 5IWAK 1C1CA 4UY8O 3PO5A 4C23A 3NF6A 5JS1A 2D4WA 3S3NA 3ULDA 3C6TA 2BGGA 4XEIA 1NOYA 4FZYA 1CLQA 4CF1A 3J7YP 3ENHA 2P1JA 4KKOA 3HVRA 4RW4A 3MX5A 4FWNA 1ILYA 4DS4A 3AGRA 4CD1A 1W2BM 1NJWA 3LP1A 3OYBA 4W5QA 4ZTJA 5AQIA 4CEBA 3TTFA 4DTRA 3E9LA 5DMRA 1JXBA 1NGAA 4H4OA 4JKEA 1BO5O 2HHTA 2GV9A 5M1QA 3SLCA 4BR2A 1BDGA 1S9EA 4BRNA 1KXPA 3DXMB 1QHAA 4KH4A 3CFOA 5AQWA 3PSFA 4G1QA 3ZX2A 2DFHA 2RHKA 1X3MA 3VEZA 3D2EB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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