2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
3WT0A 4A61A 4PKIA 3DXKA 4BQLA 2QWNA 1HKCA 5EY4A 2FLOA 4I6MA 1P8ZA 1NGJA 2BUPA 3GG4A 1XUPO 3ENHA 4A2AA 4O8KA 1YVNA 4M63C 4CD1A 4PL8A 3RSEA 4K25A 3C0BA 3MDQA 4BRNA 1LOTB 2E2QA 5AQOA 3VEOA 2W40A 3WXJA 5KPRA 1QQMA 3FLCO 5ADXH 5BRHA 2IVNA 4CBXA 2E2PA 3EZWA 4BR4A 4B1YB 4A2BA 3VF6A 1MDUB 1HUXA 1SZ2A 3P4IA 4CZHA 1IG8A 3M1FA 1NGGA 4JD2A 4BC5A 2BTFA 3CI5A 2VWBA 3W0LA 2PBDA 1MWMA 4WQ5A 3VESA 1KXPA 3L0QA 4RWTA 3D2FB 3VOVA 1V4SA 4BC3A 3UKRB 2QWRA 3IMXA 2P9NB 4MO4A 1ATNA 2ZF5O 3GBTA 3L6QA 4YDUA 1Y64A 1NM1A 2YHYA 4BGBA 3D2EA 2E2OA 1DGKN 1BDGA 3LDQA 3MN5A 4ISGA 3U9ZA 4BG8A 3ZETB 1QQOA 3FZMA 1S22A 4NO7A 2P9SA 3C7NB 3VEXA 3HM8A 3QFUA 3ATVA 5JLHA 4FWRA 1GLAG 2OANA 3LDNA 3LM9A 3O4WA 4CBUA 1NLVA 5F0XA 4BRMA 4FWOA 3IDHA 1JCEA 1RGIA 3BF1A 4BQZA 4CZKA 5AZIB 3KHYA 3ID8A 2D1KA 2I7PA 3VGMA 4BRQA 1V4TA 3SMSA 4CBWA 4E1JA 2ASOA 3S41A 2CH5A 3FFKB 5AFUH 3EO3A 4J8FA 4FOIA 1SQKA 3QDKA 1HX1A 3ATUA 2QWLA 5BRDA 4IWVA 4WQ5C 3TPQA 2QW9A 4H0PA 2DPNA 5KQDA 4ISEA 1NMDA 3JS6A 4BRFA 1K8KB 4WQ4A 3ZX0A 3DWLA 3L4IA 5AQGA 3ZEUA 4FWQA 4YDUC 5BN8A 2KHOA 1GLLO 4B1WB 3QICA 1ESVA 3LDOA 1NWKA 4O5FA 4EIAA 1HLUA 4IXCA 4BRHA 1ZBSA 3SMPA 4BRKA 3DXKB 5BPNA 2A6AA 1BU6O 2QM1A 3R6MA 4C23A 4H0TB 1OKJA 2IVOA 1C0FA 4I6MB 3VF2A 1E4FT 5AQNA 1TYQA 3UE5A 2E2NA 3SJHA 3O6WA 5KPTA 1KAYA 4FWLA 1BUPA 2A5XA 2Q1NA 4WYBA 4PL7A 4FPAA 1D4XA 1U2VA 3FGUA 2P9UA 3MN6A 4H0OA 2FF6A 4CZFA 2P9PA 3A5NC 1ATRA 2ITMA 4XEIA 1ZC6A 4HTLA 1RDWX 5FPNA 5KQ8A 2NLXA 4JHDA 4CZGA 3DXMA 2EWSA 1QZ6A 3VF4A 4EFHA 2HF4A 5LY3A 4B1UB 2D4WA 4WQ4C 2AP1A 1T6CA 2I7NA 2VCPA 5EX5A 5FPDA 2P9IA 3CJCA 5AZJA 3EKUA 3CJ7A 3BF3A 1XQSC 3IFRA 4QS7A 5TKYA 2P9KA 3R8EA 5E84A 3JXUA 3D2EB 3DAWA 4H0YB 4BREA 4JN4A 2ASMA 1BWFO 5AQZA 2Q0RA 3CJ9A 3MN7A 2V7YA 3FE1A 3GL1A 3ZX3A 4F9OA 1KAXA 2P9SB 4BR5A 3QBWA 1T6DA 3AY9A 5AQMA 3CJBA 3ULEB 4CD3A 5AQRA 5AQPA 5AQUA 2NZTA 3CIPA 4IJAA 4XH1A 2ZGZA 2VYPA 3FR0A 1NGIA 4JAXA 5ADXA 1U6ZA 1JCFA 3CQXA 4BRAA 4BG9A 1X3MA 4BRLA 2Q97A 5AQTA 2YI1A 3O8MA 4FOEA 3BP8A 4Y0WA 5BN9A 1GLCG 5AQVA 1LCUA 5BR9A 3H3NO 2P9LB 3AAQA 2YHWA 2A3ZA 4KBOA 5AQYA 3H1QA 3AAPA 1T44A 2YJEA 4M7XA 2UYTA 3QBXA 2F9WA 3BUZB 3WQTA 1NGFA 4DHYA 3SLCA 1EQYA 1CZAN 1XC3A 2CGJA 3ZEUB 2E88A 1KAZA 2P9NA 3O08A 1RFQA 4FWKA 2Q36A 1QQNA 3CJ1A 3EL2A 2YJFA 3DJCA 3VEVA 2AA4A 1NGCA 2D0OA 4FWMA 2Q2RA 3LDLA 2A40A 2NRHA 3ZETA 3CQYA 5KPZA 2QWMA 5E26A 5BPMA 2D0PA 3LM2A 3WXKA 3A5LC 3WEEA 1YAGA 4B1VA 3EN9A 4CZMA 2HOEA 3GE1A 1SAZA 1TYQB 3BEXA 5EVZA 2ZWHA 4BRCA 1Q18A 4LC9B 4GY2B 4L3QA 4H0VB 1GLBG 2CGKA 3QMLA 5BRFA 3VPZA 3J8AA 5AFUA 5BREA 1TUUA 3H3OB 3QFPA 4QS9A 2P9UB 3A5MC 3HI0A 2HMPA 3LDPA 4BR0A 2P9PB 3UKUA 5AQHA 5B8HA 1BA0A 4K43A 4JHDB 3DXMB 3RSEB 4B1XB 3M3ZA 4BC4A 3H6EA 2V52B 3HZ6A 1H1VA 4Z94A 1E4GT 3CERA 5AQKA 4QS8A 5F2RA 3U9DA 2GWJA 3I33A 4BR7A 2V51B 1HJOA 2ZGYA 3VENA 2QWQA 1K8KA 2P9IB 4IJNA 1G99A 5AZJB 4H0XB 1WOQA 4JD2B 3KVGA 2YHXA 3CJAA 3LL3A 4DCHA 2H3GX 3F9MA 4BRIA 2ASPA 1JCGA 5JLFA 1WUAA 3FZFA 3U8XA 3WQUA 1GLEG 4FWSA 3H45C 3D7EO 4FWNA 2V7ZA 5FPMA 1NGBA 3W3DA 4ISFA 3FZLA 5F1XA 4B9QA 4AM6A 5FPEA 4AM7A 2GTDA 3MCPA 4BR9A 5BPLA 4XH4A 4H5RA 4M7YA 4IO8A 4MO5A 5LJWA 4CZJA 4K41A 3EKSA 3KZBA 5EOYA 4B1ZA 1S3XA 4MLEA 4EAHD 3O80A 4FO0A 5AQLA 4CZIA 5LJVA 1QHAA 4EHTA 1MA9B 2J4RA 3ENOA 3HBTA 1QZ5A 1BA1A 3WXIA 4DB3A 5AQJA 1J6ZA 4BROA 2IIRA 3MK6A 3CETA 3AARA 4MLHA 5AQFA 2QWOA 4BVOA 1DEJA 3GDQA 4BRPA 2FSJA 4RCHA 2E1YA 3FZKA 1Z05A 1R59O 3UB5A 3VEZA 4CJ7A 4PKGA 2GEMA 3OHRA 1GLFO 1NGDA 4CZLA 3WXLA 5ELZA 3G25A 3WUHA 2CGLA 4JNEA 4RTFD 1DKGD 4IZ9A 3CHWA 3TU5A 2A42A 2Q0UA 1NGHA 3O1BA 4H5VA 3VGLA 1GLDG 1IJJA 4BGAA 1X9JA 4FSVA 4CZEA 4H5TA 4FL9A 3D2FA 2FF3B 3MMVA 4XH5A 3UKRA 4H5NA 3A8YA 3ULEA 1NGEA 3WEEB 3VGKA 2QWPA 2GUPA 4H03B 4GNIA 4K42A 3HSCA 4CI6A 3MN9A 4BRGA 4FWPA 1MWKA 2CH6A 1HKGA 3H46O 5AQSA 2PAVA 5AQIA 3M6GA 3C7NA 1HKBA 3FZHA 3A5OC 1BOTO 5I9EB 4A62A 2HF3A 3B8AX 1C0GA 1GLJO 1NBWA 3UKUB 3O1WA 5JMVA 1ZXOA 3VEYA 5AZIA 4DQ8A 5EXWA 3H1VX 1YXQA 2E1ZA 2P9LA 2QXLA 5AR0A 3SK3A 4NB4A 2FSKA 1ATSA 3VERA 1U2VB 4FPBA 1X3NA 2GWKA 4H5WA 1BO5O 3U4LA 3HTVA 3IUCA 5AQQA 2E20A 2W41A 2FSNA 1YUWA 4BR2A 4PKHA 4BRDA 1BG3A 3VETA 3R9PA 2YCHA 1HPMA 3QB0A 3O5BA 2A41A 5CE3A 4BVPA 5JICA 5AQWA 4BC2A 2E8AA 2WUSA 1Z6RA 2IVPA 2FXUA 3ZX2A 3I8BA 1TUYA 5AQXA 3VEWA 1NGAA 4HWIA 3GOIA 2Q31A 2F9TA 2GELA 2P9KB 4EHUA 3A0IX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DF4A 3THXA 4A5AA 1S1WA 3ZSVA 1B9FA 2ZJPL 3OYAA 3GG4A 4E19A 4YFUA 3AO5A 4TSXA 3BGRA 3G10A 3F73A 4IOAL 4PL8A 4OPHA 4K25A 3C6AA 4M3UA 3CCMN 2W40A 1QQMA 3AVFA 3FLCO 5ADXH 3HVRA 2YNHA 4BECA 1ZYQA 1RT1A 3NFAA 4IG3A 4A2BA 1MDUB 2O8BB 4CZHA 4BC5A 2NRRA 4CJWA 2BTFA 4BWJA 1NK0A 3K9JA 4M3YA 2PBDA 1MU2A 3MXIA 3VESA 2D0BA 2WC9A 4MFBA 4H8KA 2KZMA 1B92A 3NF8A 4BC3A 4CEQA 2QWRA 1UA1A 2YHYA 2A1SA 1NK8A 1NMNA 1C0TA 4JKDA 4KHWA 3E1YA 1L5UA 3KD5E 3U9ZA 1ZBIA 4CJ3A 4BG8A 1CZ9A 1QQOA 2R7YA 3FZMA 2DFEA 1S22A 1OH6A 1M1KO 3HM8A 4LFAK 1FKOA 1HYZA 1S9GA 1IV0A 2OANA 2I5JA 5F0XA 1NLVA 4ILJA 4C8KA 3TR8A 3IDHA 2ZM6K 1Q8IA 4B9UA 3BF1A 4H4OA 1VSLA 1ITGA 1BI4B 5BR8K 4FCYA 4E1JA 3LAKA 3RWUA 2ZJQL 3DLGA 3HP6A 3RVCA 4B3TK 3CQ8A 1XWLA 4HHTA 3CM6A 2IC3A 3O4QA 1JLCA 3CPWM 3G71N 4O44A 2QWLA 4KAZA 1QSLA 4OPAA 1NOZA 4WQ5C 3NGIA 4ISEA 4FLVA 1K9MO 2QKBA 3CC7N 4R79A 1K8KB 1U48A 4MDAA 3DWLA 5AQGA 3ZEUA 4FWQA 4IKFA 4DQRA 4U7BA 4LFCK 1RDCA 3LDSA 4EIAA 5FRNA 2B4JA 3OBYA 1N32K 3O3GA 4BRKA 4Y1CA 3DXKB 5BPNA 3ALYA 4I6MB 3VF2A 4ID5A 4KKOA 4EP5A 5C0YA 3TI0A 4FJMA 3PUFA 4JV5K 2YNGA 3O6WA 2Y1JA 5KPTA 1KAYA 3DLLL 4OO1J 1UWBA 3DI6A 4NXMK 4WYBA 2QK9A 1RNHA 1WNSA 3CC2N 1BIZA 3C65A 3PX4A 1D4XA 4JRPA 4X65K 3G4SN 1IO2A 3AVLA 1FXXA 4ELVA 1ZC6A 3DYAA 4JHDA 4E0DA 2OTLN 3TTCA 3KLFA 1KLMA 4M3RA 4B1UB 2WOMA 3VQ9A 3OS2A 3CM5A 2I7NA 3OYHA 5AZJA 3U3GA 4E1NA 3JYTA 2Z1HA 2VG5A 3CJ7A 3IFRA 2UUBK 1F21A 3KD1E 2HNDA 2QTDA 3DAWA 4JN4A 1T3VA 4YHHK 4PHTX 2ASMA 5C2DA 2HHSA 2OPRA 1Q82O 1T6DA 2X74A 3AY9A 3NCIA 3OYCA 3D45A 3T69A 2NRXA 3ULEB 2IOCA 3R1XA 5HL7L 1WBBA 2NRVA 2G8FA 1SL1A 4IJAA 4IO9L 1T03A 2Z1GA 1NK6A 4EP4A 4RG8A 3RMAA 1RTHA 4IFEA 1X3MA 4BRLA 2Q97A 1N6QA 3O8MA 3KWGA 4A57A 3OJSA 5AQVA 4DTNA 3WNEA 5BR9A 3SQ0A 4KI4A 4MQ3A 2P9LB 4E1MA 2HHHK 4FW1A 4KBOA 2EHGA 4FYDA 3H1QA 1HPZA 4M7XA 2JLEA 1D5AA 2UYTA 3IAYA 3BUZB 3I0RA 4DHYA 4KHUA 3L2QA 2P9NA 3AO2A 1QQNA 4U67L 1S5JA 3EL2A 1LAWA 3VQ7A 3LWLA 2D0OA 2Q2RA 1I3AA 2C1GA 2D0PA 1YAGA 1NKBA 4CJFA 1EP4A 2UXCK 1SKRA 4FJ5A 3TSPA 2HOEA 1TYQB 3BEXA 2P51A 1ASWA 5EVZA 4CGGA 1Q18A 5AJ3K 3QMLA 2CGKA 4DTOA 2G8KA 3DRSA 3HRGA 1S1XA 5BREA 3SZ2A 5I3UA 3O9UA 4QS9A 1WBDA 2IDOA 4F4KA 4LF9K 4BR0A 3DLHA 4JS4A 5AQHA 3T1YK 1U47A 3M8QA 1LV5A 4K43A 3HPGA 3M5RA 2UU9K 3DXMB 4B1XB 4F3TA 4BC4A 3P5JA 5C42A 3H6EA 2V52B 1H1VA 4CEZA 5AQKA 3U9DA 1Z25A 2BDPA 1SV5A 3VENA 1REVA 4DMNA 3DRRA 5H1SQ 1G99A 4H0XB 1HRHA 1WOQA 1VSKA 4CEAA 1DT9A 3KVGA 3CJAA 3LL3A 3LWMA 3SUPA 1JCGA 3NVKA 2ITGA 4J2AA 1WUAA 3WQUA 1JLAA 3W3DA 3CCJN 4AM6A 2HHVA 4LF5K 1NK7A 4BE1A 4M7YA 2ZQBA 4CZJA 3KZBA 5EOYA 3E9OA 2G8UA 4DS5A 4B9TA 1QHAA 1NJXA 4GVMA 3O9SA 3HBTA 1QZ5A 3WXIA 1VSMA 4OKJA 1W9HA 4E7JA 1CXQA 3AARA 5IT9O 4KO0A 2QWOA 4BVOA 4FJ8A 1DEJA 4CHOA 4BRPA 2FSJA 4OPJA 4ZHRA 1HNZK 4CJ7A 4KPYA 1GLFO 1NGDA 4CZLA 3WXLA 2NRWA 3DLRA 3DM2A 4HUFA 4DU1A 1WAJA 1DKGD 1IH7A 3O9TA 3V1OA 4B8CA 1IKWA 1GLDG 3ENBA 4DG1A 4J2EA 4H5TA 3S5TA 3D2FA 4FJJA 2P5OA 3AVBA 4RW9A 3UKRA 3A8YA 1YHQN 3SUNA 1ASUA 3EZ5A 3WEEB 4JI5K 4CIGA 3VGKA 5C12A 2VGNA 1YJ9N 2GUPA 4GNIA 4AHCA 3S9HA 4CF8A 2CH6A 1O1WA 1S72N 2B6AA 3VQPA 5AQIA 3FZHA 2ZE2A 4IOCL 4O0JA 4OKKA 3PV8A 3LANA 4XJXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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