2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
4Z94A 4CZJA 4A62A 3QFUA 1QQMA 2CGJA 4EIAA 5KPRA 4K25A 3DXMB 4WQ4A 1TYQA 3CHWA 1NM1A 4H0OA 1MWMA 3UB5A 3WEEA 3D2FA 4BQZA 5AQQA 5FPEA 2FF3B 3TU5A 1MDUB 3L6QA 1Z05A 2BTFA 3EO3A 5AFUH 2H3GX 2QW9A 4H03B 2P9NA 3BP8A 3JXUA 5FPNA 1Z6RA 1SQKA 1LOTB 1ATSA 4FWRA 4XH5A 1NGCA 3O1BA 1NGIA 4XH4A 1E4GT 2V7ZA 3QICA 3F9MA 3IFRA 1GLCG 2IVOA 2QM1A 3B8AX 2YHWA 3ZX2A 2A6AA 4EFHA 2FSKA 4HWIA 2P9KB 3LDLA 1BUPA 2ASMA 5TKYA 4BRDA 1E4FT 4CZGA 3RSEA 3LDPA 5AQOA 4BROA 4B1YB 3CJCA 1DGKN 2YHYA 3HSCA 1BA1A 5AQXA 3H46O 5JMVA 2E88A 1LCUA 2CGLA 1NWKA 3QBXA 3FZHA 4K41A 2P9SB 2A41A 1SAZA 2HF4A 3H6EA 4ISFA 2VWBA 3DXMA 3U4LA 4EHTA 4BRGA 5BRDA 2QWNA 4EHUA 3FLCO 2YJEA 3DXKB 4CZMA 2E2QA 1KAXA 4BRHA 2WUSA 4B1UB 4DCHA 3CQXA 4FWQA 5F0XA 1T6DA 5E84A 4MLHA 1HX1A 5AQGA 3VGKA 1NGJA 3VGLA 4BRMA 4BGAA 3BEXA 2GUPA 2HOEA 3GL1A 1JCFA 4MO5A 1WOQA 2D1KA 1IJJA 4K42A 4CI6A 3CJ1A 4IWVA 2FSNA 4M7XA 1QZ6A 3KHYA 1C0FA 3DWLA 2NZTA 1NGHA 2AA4A 5AQHA 1NLVA 5EOYA 2PBDA 3ATVA 3GOIA 4BR5A 2KHOA 5AQZA 4FSVA 1RDWX 4MO4A 5EY4A 1IG8A 3WUHA 3UKRB 4BRLA 1NGGA 5ADXA 3WXIA 3WXKA 4CBXA 1GLLO 3KZBA 1OKJA 4BC3A 3AAQA 4FWNA 4FWPA 3CJBA 3MN5A 2J4RA 2P9SA 4H0XB 4H5RA 4JAXA 5EXWA 4I6MB 3LDOA 1V4TA 2P9NB 3HM8A 3DXKA 1CZAN 3WQTA 2CH5A 3VEOA 4CD3A 4PKHA 4BR0A 2FLOA 4AM7A 3LL3A 1BO5O 4CBWA 5KPZA 3CI5A 4FO0A 3P4IA 2E1YA 3O1WA 4FWMA 4C23A 3FFKB 4BG9A 1HUXA 5AQLA 5F1XA 1RGIA 3MDQA 4E1JA 4A61A 3ZX3A 4O5FA 2GELA 3ZEUB 4JN4A 5BN8A 1GLFO 2IVNA 1HKBA 3RSEB 2E8AA 2Q0UA 5AQMA 2V52B 1Y64A 3A5MC 2ASOA 3EL2A 2PAVA 4DB3A 5BR9A 4IZ9A 3A5NC 2A3ZA 5AQIA 3MK6A 3UKRA 3VEVA 2W41A 5BPMA 3OHRA 1P8ZA 4FOIA 3VPZA 2AP1A 4I6MA 1QQOA 2QWLA 4BRPA 3QMLA 1NBWA 3LM9A 2P9LA 1DEJA 3FGUA 2ZWHA 4K43A 3D2EB 4EAHD 3VEWA 3UKUB 1X3MA 4FWKA 4JHDB 4L3QA 4BRCA 4CZIA 4IO8A 2CH6A 5LJWA 4JD2B 4ISEA 3WXJA 1ATNA 3H3OB 3AY9A 3VESA 4GY2B 1MA9B 1U2VB 4FOEA 2E1ZA 4H5NA 4JNEA 3ZEUA 4BRKA 3R6MA 3LM2A 2F9WA 4B1WB 3L0QA 3JS6A 2E2PA 4PL7A 3O08A 3CIPA 2ITMA 3FZLA 3G25A 3I8BA 3LDQA 4BRFA 3ULEB 3SLCA 1BU6O 1HKCA 3MCPA 1T44A 3MN6A 4DQ8A 2Q0RA 1NMDA 2FXUA 4H0PA 2NLXA 4FL9A 1EQYA 5BPNA 1KXPA 2D0OA 4Y0WA 3M1FA 4BVPA 3H1VX 1GLJO 2HMPA 1V4SA 3CJ9A 2P9UB 3D2EA 1HPMA 5F2RA 4BR7A 3UKUA 1C0GA 4CJ7A 4JHDA 5AFUA 1BWFO 3FR0A 4FWOA 3GG4A 2ZGYA 4CZFA 2A5XA 4JD2A 4BR9A 5AZJB 4IXCA 4PKIA 1ZC6A 1U2VA 2IIRA 4BG8A 1XQSC 4BREA 1QHAA 4WQ5C 1MWKA 2BUPA 1G99A 5FPDA 5CE3A 5EVZA 3O80A 3VETA 5AQVA 4O8KA 4J8FA 3BF1A 2DPNA 3MN9A 3FZMA 4FWLA 2Q1NA 3FZKA 3W0LA 2ZF5O 2P9PB 4BR4A 3ULEA 3IDHA 3IUCA 5ELZA 2A42A 2P9LB 3I33A 3QDKA 1KAYA 4PKGA 3ATUA 4BGBA 4BVOA 2EWSA 1D4XA 2IVPA 2V7YA 2UYTA 2E2NA 3U9DA 1BA0A 3VEZA 4HTLA 4QS8A 1JCEA 2GTDA 3A8YA 5AZIB 1ESVA 2P9UA 1YAGA 5AQTA 3VOVA 3A5OC 3J8AA 1NGBA 3TPQA 5AQJA 3SMSA 4NO7A 5AQUA 4F9OA 2GWKA 4A2AA 5AQKA 3HTVA 3M6GA 5AZJA 2HF3A 2V51B 1BDGA 3GBTA 3D7EO 3U8XA 3CETA 1YVNA 5AQSA 5BRHA 1K8KB 3C7NB 5KPTA 5LY3A 2QWPA 1ATRA 3H3NO 2A40A 1NGDA 4B1VA 2ASPA 5LJVA 4FPBA 2E20A 2FSJA 2P9PA 5JLHA 1ZBSA 3HBTA 1JCGA 1Q18A 3SK3A 4CZEA 3EKUA 4H0YB 3DAWA 3EN9A 5KQ8A 1J6ZA 5I9EB 5BN9A 4ISGA 4YDUC 3VGMA 1YXQA 3R9PA 4BRNA 4H0TB 3MMVA 5AZIA 3R8EA 4NB4A 2OANA 3QB0A 1TUUA 2QWOA 3ZETB 4M7YA 4BQLA 2ZGZA 4RTFD 4B9QA 3C0BA 3BUZB 4XH1A 4BRIA 3CQYA 1HJOA 4H5TA 4FWSA 2GWJA 5AQNA 3VENA 3FZFA 3KVGA 4H5VA 2Q31A 1X3NA 5AQWA 5FPMA 3H1QA 5AQFA 2E2OA 5AQYA 1K8KA 3C7NA 4WQ4C 4CBUA 2CGKA 3U9ZA 1QZ5A 1RFQA 1S3XA 2Q97A 2Q36A 3GDQA 4MLEA 1YUWA 4A2BA 4WQ5A 2FF6A 4KBOA 5ADXH 3A5LC 3IMXA 2D0PA 1ZXOA 5BPLA 2VCPA 2YHXA 4B1XB 4BC2A 3L4IA 5AR0A 2QWRA 3M3ZA 3FE1A 5JICA 5KQDA 2VYPA 3A0IX 2W40A 3VEYA 3VEXA 3O5BA 4BRAA 1T6CA 3AARA 1HLUA 1NGAA 4PL8A 2P9IB 3ID8A 1U6ZA 3DJCA 3H45C 3O4WA 3S41A 3ZETA 1S22A 3HI0A 1HKGA 2Q2RA 4CZHA 1GLEG 4RWTA 4QS7A 1GLBG 4BR2A 2F9TA 3SMPA 5AQRA 3WXLA 4DHYA 5E26A 2QWQA 1BG3A 3VF6A 5EX5A 3SJHA 3QBWA 3VF2A 3VF4A 4CZLA 3LDNA 1XC3A 1NGEA 4IJNA 3W3DA 5AQPA 4H0VB 3O6WA 3VERA 2P9KA 1X9JA 4WYBA 4FPAA 4BC5A 2YI1A 1GLDG 1BOTO 2I7PA 2QWMA 2YCHA 3O8MA 3WT0A 2GEMA 1TYQB 4IJAA 3MN7A 3WEEB 2I7NA 3D2FB 4H5WA 4M63C 1GLAG 4GNIA 3GE1A 5B8HA 4CD1A 3CERA 3CJAA 3QFPA 2D4WA 1H1VA 1WUAA 3CJ7A 4BC4A 2P9IA 5BREA 4QS9A 4XEIA 3BF3A 1NGFA 2YJFA 5BRFA 3UE5A 4YDUA 3EKSA 3ZX0A 4B1ZA 3AAPA 3ENOA 4CZKA 1R59O 4LC9B 1DKGD 3EZWA 1XUPO 2NRHA 3WQUA 5JLFA 1TUYA 2QXLA 4RCHA 3HZ6A 1SZ2A 4AM6A 4BRQA 3ENHA 1QQNA 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OA9A 4I9LA 4CZJA 4DTOA 5KPRA 4CJFA 4DTSA 3U6FA 1TYQA 3CHWA 1TAQA 2JLEA 2G8UA 3L6QA 4F8RA 4LD0A 1Z05A 2BTFA 4X66K 1VQ4N 4FLZA 4KREA 2YX6A 1NJWA 1XI1A 1Z6RA 1JKHA 3M5RA 3V1RA 4W5QA 1NGCA 4DV2K 1EKEA 4I2QA 2V7ZA 3F9MA 2QM1A 5GIOA 4DSJA 1NK6A 2FSKA 2P9KB 3ULDA 3LDLA 2XY7A 1ZBLA 1BUPA 3AVJA 4DV0K 1OH5A 3SAGA 4CZGA 1TK8A 1VQLN 4QOZB 4BROA 4B1YB 4HTUA 1BA1A 3H46O 1LCUA 4DQIA 1SV5A 5K14A 2CGLA 3LANA 1NWKA 2A41A 1SAZA 1D9FA 2HF4A 4JEPA 1QSSA 1EX4A 3EY1A 4FM0A 3CCQN 3HOTA 2QWNA 1WNSA 3MXJA 3P5JA 4CZMA 3OYJA 3S3OA 4DCHA 3E66A 2X78A 1U48A 3CQXA 4FWQA 3P38A 4ZTFA 1RT1A 4JKAA 5E84A 1NGJA 2ATQA 2HNZA 3ZT3A 3BEXA 4DQRA 2GUPA 4CEEA 5HL7L 4MO5A 1VQNN 1QZ6A 3C6AA 1EWQA 4B8AB 1L3UA 2NZTA 4Z4HA 2AA4A 1RILA 3CYGA 5AQHA 3OY9A 2PBDA 3GOIA 1U4BA 3TTCA 3C65A 2KHOA 1RT2A 4KHNA 4FSVA 1RDWX 3WUHA 3CMEN 3UKRB 2IS3A 4BRLA 3KD5E 3DLBA 3KZBA 3ZSVA 5CZ1A 4FM2A 2J4RA 4H5RA 4OKKA 4I6MB 4CHPA 3I0SA 2QKBA 2NRVA 1XMOK 4CFCA 3DXKA 1EP4A 3CCSN 1WSIA 4ELUA 4FZXC 2CH5A 4PKHA 2B6AA 1KLNA 2FLOA 4CCHA 3VN5A 4YOWA 3THWB 4M3RA 4AHRA 1NJXA 4C23A 3FFKB 1GOAA 4KV8A 4F2RA 1HUXA 1NK9A 5F1XA 1QTMA 3AA2A 4JN4A 3QEWA 3K59A 3QESA 4JRPA 4DTNA 3KKSA 2KW4A 3IRXA 1IKVA 4CK3A 1HKBA 3D45A 2HHVA 2Q0UA 3LP3A 3QEIA 2ASOA 4CEOA 4HCBA 4YOTA 2PAVA 5BR9A 3A5NC 4AILC 5J2PA 5AQIA 1O1WA 3DLRA 3MK6A 2HBKA 4IBNA 2XHBA 4DSIA 3OHRA 1P8ZA 3SAHA 2AP1A 3OJSA 2F4VK 2DFEA 1FKPA 2WBNA 4H4OA 3FGUA 3KWGA 2G8WA 2ZWHA 2HHWA 2HHXA 3UKUB 4FWKA 4JHDB 5CYQA 4CGJA 4JD2B 5HRSA 3WXJA 1ATNA 3T69A 4DLEA 1EWRA 1MA9B 3ZSRA 1TKDA 3ZT1A 4FLYA 2E1ZA 4RW7A 3CYMA 1VQON 2GUIA 3L0QA 4IOXA 3T1AA 3HPHA 1BQNA 4GVEA 4I2PA 3U3YA 3CC2N 1QVFM 3I8BA 2XY8A 1BISA 4BE7B 3DRSA 3K0SA 3LWLA 4I9QA 1K9MO 4H8KA 4CJTA 4GW6A 2I5JA 4FL9A 3SUNA 1EQYA 5HRRA 2W00A 5JS1A 4FJLA 2HMPA 3DM2A 2O8CA 3D2EA 3V9WA 3ZSWA 2YKNA 4FWOA 2UXDK 3K2PA 3BZCA 2ZGYA 4KTQA 4CZFA 4CEDA 1U2VA 1N36K 1QHAA 4WQ5C 3QETA 1MWKA 3HT3A 4DS4A 3AVMA 3I8DA 1ASVA 1QS4A 1WAFA 4O8KA 4J8FA 3ZLJA 4FLTA 3BF1A 1HYZA 4FWLA 3FZKA 1YTUA 3ULEA 1RDBA 3TABA 3R1XA 3LPUA 2HBJA 4GV9A 3QDKA 4OKEA 4PKGA 4BGBA 1YVUA 2E2NA 1BA0A 3OJUA 1N32K 1JCEA 1NJYA 5AZIB 2P9UA 1IKYA 5AQTA 4CJUA 3A5OC 1SL2A 5EU7A 3J8AA 3EZ5A 4CF1A 3PIPL 2VG6A 2GWKA 5AQKA 4FLXA 4QAGA 5AZJA 4B9SA 1TK5A 3K5NA 1SKRA 4B3TK 4LY7A 3THVA 1RBSA 2OZSA 3D7EO 1VQKN 4DSKA 4NXNK 1YVNA 5AQSA 1I94K 2QWPA 1T03A 1NGDA 1N8RO 4C8OA 4DF4A 2E20A 4JYAK 4FJXA 4CEZA 4JK7A 2P9PA 4OPKA 1Q86O 2O8FB 1S6PA 2WFBA 4E7JA 4DTUA 2C1GA 1C1AA 3IS9A 4CZEA 3EKUA 2O8EB 4H0YB 5I9EB 4M3XA 1YXQA 3CCVN 4B9UA 3O9TA 4KKOA 2BGGA 4KTWA 3LDSA 3ZETB 3ALYA 5CYMA 2G8HA 2VWKA 3HP6A 1Z25A 3SQ0A 3NH2A 3CQYA 4H5TA 4FWSA 4YOUA 5HP1A 3AO3A 3KVGA 1UA0A 4W5NA 4H5VA 4G9ZA 2Q31A 3TSQA 3H1QA 3KD1E 2Z1IA 1K8KA 3C7NA 4CBUA 3DLKA 1CXQA 1RFQA 1S3XA 2Q97A 3K5OA 3S9HA 4HHTA 3EE9A 4FM1A 2FF6A 2YHAA 3A5LC 4CGFA 4CEAA 4BWJA 3L2RA 4B3OA 1KRPA 1RDCA 3FE1A 5HRNA 4KHUA 4JLHA 3CCEN 1W7AA 5M1FA 3SUOA 5KQDA 1Q7YO 1VQ7N 2W40A 1VQ9N 1WB9A 4Z4IA 3OBWA 3NGIA 4FK2A 4O8UA 4PHTX 1S1WA 3ID8A 4MQ3A 3L3UA 3H45C 4ZHRA 1HKGA 3N4PA 2Q2RA 4HCCA 3AO2A 4B9VA 4DHYA 4IOCL 3MWTA 1TAUA 3OYHA 3VF6A 5EX5A 4DTRA 3SBTA 4E7LA 4PUOA 3PUFA 4DSLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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