2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
4F9OA 4I6MA 1BOTO 1G99A 1QZ5A 2GWJA 3L4IA 4CJ7A 2CH5A 4H0XB 3MMVA 1BA0A 4FL9A 3JS6A 2V7ZA 4BRQA 4B1XB 2P9LA 5TKYA 2E2PA 3GE1A 3A0IX 2FSJA 4BG9A 4J8FA 5EOYA 2FSKA 4IZ9A 4FPAA 4H5TA 3VEYA 2D0OA 3SLCA 2FLOA 2P9IB 3UE5A 3LDLA 3C7NA 5I9EB 3ATVA 2YHXA 3GOIA 2A5XA 3LM9A 2A42A 2E20A 3VF4A 2NLXA 4B1UB 3MN6A 2KHOA 4M7YA 3VETA 3D2EA 2VYPA 2I7PA 1QQOA 4EFHA 3BEXA 5AQHA 4K41A 2ZGYA 3BF3A 1X3MA 3ENOA 1T6DA 1YXQA 5AQXA 3VEWA 1GLBG 4MO5A 3ENHA 3IUCA 1CZAN 3ID8A 1GLCG 1NWKA 1RDWX 3VGKA 1ZXOA 4BR5A 1JCEA 4H5RA 3O6WA 5AQZA 1KAZA 5AQOA 3L6QA 1IJJA 3QBXA 3CQYA 4QS8A 3MDQA 4CZMA 3CERA 3R6MA 5CE3A 1QQMA 5JMVA 3MK6A 2P9SA 4JHDA 2E2NA 3H1VX 1NGDA 2UYTA 4BRKA 4BREA 2ZF5O 3I33A 4ISEA 2J4RA 4CZLA 3A8YA 2HF4A 3JXUA 3UKRB 3IDHA 4K42A 3J8AA 1T6CA 5AQGA 3VEVA 4BRLA 3AAPA 1Z6RA 3ZX2A 1K8KB 2Q0RA 4FWQA 4BRCA 4MO4A 4LC9B 1NGJA 1Z05A 2ASMA 4CZFA 1XQSC 3DAWA 2D1KA 4MLEA 2FXUA 5ADXA 2IVPA 4NO7A 2AA4A 4BC2A 4CZHA 4MLHA 4BGBA 4WQ5C 1BUPA 4L3QA 3DWLA 4YDUC 3A5MC 4CBUA 5AZJB 4NB4A 3MCPA 2CGLA 4RTFD 4BRMA 2HMPA 2E88A 1ATSA 1NLVA 3HI0A 2IVNA 1HKCA 3HSCA 3QDKA 4H5VA 1JCFA 4B9QA 4BRFA 1ATNA 1QHAA 5BN8A 2P9UA 2D0PA 1Y64A 1GLEG 3CJBA 3WQTA 3VGMA 3FFKB 1Q18A 2P9KA 5AQUA 1QZ6A 2H3GX 1ZBSA 3WXJA 1E4GT 3BUZB 4XH4A 4JD2B 4BC4A 5AFUA 4H0VB 5AQVA 3P4IA 3VOVA 3O08A 1S3XA 4XEIA 5KPTA 3S41A 4JAXA 5E84A 3D2FB 5KQDA 3EKSA 4H0OA 3C0BA 4BROA 1U6ZA 1RFQA 2F9TA 4IO8A 3HZ6A 2PBDA 1T44A 2W40A 3WEEA 3H3OB 3B8AX 1DGKN 2VCPA 3D7EO 2QWOA 4CBWA 2A40A 2ZGZA 4FWRA 3KZBA 4XH5A 5KQ8A 1NGFA 1MDUB 3FE1A 1DEJA 4DQ8A 1U2VA 4E1JA 1NBWA 1GLFO 4K25A 1J6ZA 4O5FA 1ATRA 5AZIB 1NGAA 4WQ4A 4A62A 2OANA 3LL3A 4H0PA 2FF3B 4BRDA 1H1VA 1ZC6A 3EZWA 4FWKA 4GNIA 2QW9A 2YJEA 3A5NC 4CD1A 4M7XA 3AARA 1NM1A 4H5NA 2V7YA 2V52B 3ZETB 1V4SA 3MN7A 4QS7A 4A61A 4M63C 1OKJA 3R9PA 3RSEA 3KVGA 2Q1NA 3A5LC 1WUAA 1LOTB 3ZEUA 4I6MB 3A5OC 3UKUA 1BU6O 2VWBA 2FF6A 4O8KA 3IFRA 2FSNA 3LDQA 4PKGA 1TYQB 4IJNA 4XH1A 3LDNA 4PL7A 2A3ZA 5AQLA 2E2QA 2IVOA 2P9LB 1HJOA 3FGUA 3H45C 5EVZA 1GLDG 2QWLA 3DXKA 5ELZA 1TUUA 5BREA 1C0GA 3MN5A 2ITMA 1C0FA 3LM2A 2BUPA 4IJAA 2CGKA 1BO5O 3HBTA 1GLAG 3DXMA 3QFPA 4HTLA 1NGBA 2P9PB 2YCHA 4EIAA 3HTVA 4BQZA 4WYBA 4CI6A 1MWKA 2ZWHA 5AQPA 1E4FT 5AQQA 2QWNA 4FWMA 3M3ZA 5FPEA 4BR2A 4DB3A 2PAVA 3U9DA 3VEOA 3GBTA 4FWOA 1GLLO 1NGHA 3O1WA 1BA1A 4Y0WA 1SZ2A 3CIPA 1S22A 4FWPA 3R8EA 5EXWA 3CQXA 3VENA 2QM1A 3IMXA 3WT0A 1XUPO 1BDGA 4B1ZA 5ADXH 4PKHA 4JD2A 1V4TA 3FZMA 5FPDA 4BR9A 4JNEA 1HPMA 3QB0A 3D2FA 4DCHA 2GWKA 3ZX3A 2P9SB 2YHWA 4JHDB 3U8XA 3H46O 5F2RA 3EO3A 3ZX0A 4A2BA 3ULEB 4BVOA 2QXLA 3O1BA 4FOEA 5EY4A 3FZKA 3CJ9A 2CGJA 3VESA 1X9JA 4BQLA 3HM8A 2YJFA 5JICA 4FWLA 4CZEA 3SMPA 1BG3A 4K43A 1SQKA 1RGIA 4H03B 5AZIA 4IXCA 3FZLA 5BPMA 4FWSA 5AFUH 3BF1A 2P9IA 1NGEA 3U4LA 3DJCA 5B8HA 2QWPA 4BR7A 4EHTA 4H5WA 3EKUA 3TPQA 5FPMA 5AQYA 2GUPA 3QMLA 4AM7A 2CH6A 2Q31A 3CJCA 4BRPA 1IG8A 3CJAA 3GL1A 4CZJA 3ATUA 4BR4A 1NGCA 2WUSA 4EHUA 2Q36A 3M6GA 1JCGA 3FZHA 5BRDA 3WXLA 4IWVA 1BWFO 2EWSA 2GELA 5BRHA 2GEMA 2E2OA 2A6AA 2P9NB 2IIRA 1LCUA 3I8BA 2W41A 2P9UB 3O80A 1TYQA 3GDQA 5F1XA 4JN4A 1DKGD 2P9KB 3TU5A 4BRAA 2BTFA 3H6EA 4EAHD 2E8AA 4BVPA 5AQNA 4CZIA 3WUHA 5KPZA 4CZGA 3L0QA 1X3NA 3CI5A 3FR0A 5BRFA 3OHRA 2ASOA 1EQYA 4H0YB 3UKRA 2QWQA 2GTDA 3CETA 5AQFA 5AQMA 4A2AA 2P9PA 2QWMA 3WEEB 4DHYA 4BRHA 3AAQA 4BR0A 5JLHA 4CBXA 1K8KA 1MA9B 4WQ5A 3VGLA 1YAGA 4Z94A 4AM6A 2DPNA 3CJ7A 1NMDA 1U2VB 4ISGA 4YDUA 3SJHA 4B1WB 2E1ZA 5AQWA 3SK3A 3WXKA 3MN9A 5LJWA 4QS9A 5BPLA 5FPNA 1HKBA 3VF6A 3WQUA 3C7NB 3CJ1A 4RCHA 3F9MA 3M1FA 5AR0A 5AQSA 5AZJA 5AQRA 3LDPA 4H0TB 4WQ4C 2Q97A 4RWTA 3U9ZA 3BP8A 3CHWA 3FLCO 4PKIA 4FSVA 3D2EB 5KPRA 2NRHA 3W0LA 3EL2A 4BRNA 3ULEA 5E26A 3GG4A 2NZTA 3KHYA 4B1YB 3RSEB 3QFUA 1R59O 3O8MA 2HOEA 3ZEUB 2YI1A 3H3NO 3VF2A 4KBOA 4BC5A 3UKUB 1KAYA 2F9WA 1ESVA 5AQKA 1WOQA 1HLUA 4B1VA 1KXPA 3G25A 5AQIA 1NGGA 3W3DA 1SAZA 2YHYA 2Q0UA 5AQTA 4BRIA 5AQJA 4BRGA 4C23A 3DXKB 5JLFA 3WXIA 1YVNA 1HX1A 2QWRA 3VEXA 2AP1A 4FWNA 3VERA 4GY2B 5BN9A 1YUWA 1GLJO 4BC3A 3DXMB 4HWIA 2D4WA 4FPBA 4CD3A 5F0XA 5BR9A 2E1YA 2A41A 1D4XA 3QICA 1KAXA 3QBWA 4ISFA 3VEZA 2HF3A 2ASPA 4FOIA 2P9NA 1HKGA 3EN9A 1XC3A 5LY3A 1HUXA 3LDOA 2Q2RA 3UB5A 1MWMA 5BPNA 3O4WA 3SMSA 4BGAA 1P8ZA 5EX5A 3AY9A 4PL8A 1TUYA 3FZFA 4FO0A 3ZETA 5LJVA 4BG8A 2I7NA 3O5BA 3H1QA 1NGIA 4CZKA 2V51B 3VPZA 1QQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I6MA 2HW3A 1G99A 1NU0A 3TANA 1HMVA 4ZTJA 2GWJA 4CFBA 4HCBA 3BZKA 4H0XB 4KI4A 4CJFA 3SPZA 3WNGA 4CK1A 3RMCA 5J2MA 4BWMA 4AQYK 3NGZA 3GE1A 1UWBA 4E19A 2FSKA 4IKFA 3NAEA 4H5TA 3VEYA 1VSEA 3K9KA 4DR5K 3C7NA 1RBTA 3LM9A 1YTUA 1S72N 3BY5A 3FFIA 4F2SA 4EFHA 3NBPA 4E0DA 4DTXA 4WFBL 4DF4A 4BE0A 3ID8A 3OYJA 4EP5A 3VGKA 4LF4K 4BR5A 2QK9A 4BY9C 3AVNA 3O6WA 5AQZA 2OCEA 4G9ZA 3QBXA 4JI8K 4CZMA 3CERA 2PYJA 5GADP 4FYDA 3TTFA 4BACA 4YFUA 1TKDA 3H1VX 1RTDA 5C2FA 4BRKA 3I33A 4E7IA 3LDSA 1VRUA 4F3OA 4M3YA 5JVGL 3ZCMA 3OBYA 4MFBA 5C15A 1EP4A 5JS2A 1KLNA 4FVMA 3QIPA 4LC9B 3MWTA 4FM1A 4IDKA 4B9TA 2VQFK 4MLHA 3S3MA 5T7BA 1ZBUA 1S1TA 4L3QA 3DWLA 4CBUA 4Z4CA 4RW9A 1NJIO 3NDKA 3THWB 3LAKA 3LPTA 4CGGA 4W5OA 3KIOA 3JYTA 1NLVA 1HPZA 2IVNA 2QXFA 3QDKA 5M1NA 4F8RA 1GOBA 3U6FA 1C0TA 4BRFA 1ATNA 3SJJA 4FZZA 3CJBA 3WQTA 4ZTFA 3H08A 3SAFA 2P9KA 5M1PA 1QZ6A 2UXDK 1ZBSA 5I42A 1REVA 1L3UA 5AFUA 4JK8A 4H0VB 3VOVA 3O08A 2YX6A 1S3XA 4XEIA 4CEOA 5KPTA 2OPSA 3CCVN 5E84A 4OKJA 1VQON 4Z4IA 3D2FB 4JV5K 5KQDA 2NRTA 4M41A 2F9TA 3HZ6A 2JLEA 4JI4K 3B8AX 3NF8A 4KAZA 3L3VA 3SCXA 2A40A 3P5JA 1I3AA 4N5SA 1NGFA 3FE1A 3R1XA 1OVQA 4DTSA 3LAMA 4O5FA 1ASUA 4WQ4A 3OS2A 3LL3A 2FF3B 3CYGA 1H1VA 2HBLA 4DS5A 2YNHA 4CEDA 4GNIA 4JKGB 3A5NC 1C0UA 2KTQA 1RTIA 3LANA 3VA0A 1VQNN 3TSQA 2V7YA 4G1QA 4Y1DA 2ZJQL 3THYA 2HHHK 2Y1IA 4CEBA 3RSEA 2Q1NA 4AHSA 4NCGA 2KFNA 3A5OC 4OGCA 1BU6O 3ZT2A 2VWBA 2FF6A 4HVJA 4FJIA 2FSNA 4J2DA 4F2RA 2ZQBA 4JS4A 4IOXA 1HJOA 1WSJA 4KKOA 4B3SK 2QWLA 3O9SA 3AVBA 5I3UA 2ITMA 5KRSA 2BUPA 1BO5O 3C95A 4WCEL 1N8RO 4KHNA 3QFPA 4O44A 2HSTA 4YOYA 3PIPL 3KLGA 3L2UA 2P9PB 3I0RA 2YCHA 4KB0A 4EIAA 4K8XA 4BQZA 4WYBA 1W0HA 3AVKA 1ASWA 1XWLA 2IGIA 4DB3A 4IFVA 1T3VA 3G10A 3VEOA 3V1QA 4E89A 4CK3A 1NGHA 3O1WA 3CQXA 1BI4B 1NKCA 4Z4EA 2VQEK 3FZMA 4KI6A 2VG7A 5FPDA 4JI7K 4F4KA 3QB0A 4DCHA 2GWKA 3ZX3A 2P9SB 3L2RA 1WSFA 1F21A 5F2RA 3EO3A 3ULEB 4FOEA 3FZKA 4ELVA 3ZT0A 4KHQA 2CGJA 4KO0A 4YOUA 4CECA 3CFPA 4FLWA 2G8KA 2B4JA 3TABA 3SI6A 2ZE2A 3SMPA 4F3TA 1IH7A 4CJKA 3AVMA 1VQ8N 1VSIA 4IBNA 5KGXA 2GUPA 2NRVA 4JEPA 3V1OA 4GVMA 4BE2A 3AVGA 4YORA 3ATUA 3V9SA 4L8RB 4FLTA 1BCOA 3M6GA 1VK0A 3FZHA 4FM0A 2GELA 3L8BA 2GEMA 4DG1A 4Z4FA 2P9UB 4YOVA 2HVIA 1TYQA 1VQ5N 3GDQA 5F1XA 1RBRA 3ZSRA 4BVPA 1IG9A 3PSIA 4NYFA 1TKXA 1NK9A 4FJ5A 1J53A 4JKEA 1BQMA 1JLAA 5BRFA 3AVLA 4H0YB 1VQ9N 4V19S 4DSEA 4X65K 3THXA 4CJRA 5KRTA 3WEEB 1OH6A 4FJHA 3HXMA 4BRHA 4MDBA 4BR0A 4CBXA 1HRHA 4WQ5A 5J1EA 1RBUA 4DQSA 4AM6A 1NMDA 1U2VB 4YDUA 4LF7K 1J5OA 3P39A 5BPLA 1HNIA 5AR0A 3C7NB 3CJ1A 4RCHA 3M1FA 4CHOA 3THWA 1SL0A 3NFAA 3MX5A 4WQ4C 4PKIA 2JWLA 5A2QO 1LAVA 2HNDA 3HPGA 1NJYA 1RT4A 3EL2A 5SWMA 3QNNA 4CE9A 3AA4A 3QFUA 2W6LA 1R59O 3KD5E 1RT2A 3VQDA 4C1NI 4CGHA 1TAUA 3AA3A 1ESVA 3RR7A 5AQKA 1NK8A 4AHVA 1ZBHA 4JI3K 4B1VA 1KXPA 2RHKA 4I7FA 3PIOL 1WBBA 1SAZA 2Q0UA 1VQPN 1N36K 4BRIA 4BRGA 3G4SN 3DXKB 3EEQA 3WXIA 3HM9A 1RBVA 3VERA 1SUQA 4ILGB 2O8EA 1K6YA 3D45A 2E1YA 3CCEN 1WLJA 1D4XA 1YTAA 3OY9A 4AHCA 5SZTA 4A57A 1EWQA 1KAXA 3HSTB 5M1FA 3VEZA 2HF3A 3CFOA 5AJ3K 1HUXA 1NMNA 2Q2RA 5BPNA 2O8FB 2P51A 5DM7L 4CEQA 1P8ZA 5EX5A 3SNNA 4CERA 2O8CA 3H1QA 4X62K 3M5RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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