3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
3C7NA 4BGAA 1X9JA 5AQVA 4NO7A 1CZAN 5AQTA 3RSEB 5E84A 1ATNA 3IFRA 3MMVA 4CBWA 1ATSA 3M6GA 4FWKA 2QW9A 5EY4A 1NWKA 2A3ZA 2YHWA 3O6WA 3WQUA 3ULEA 3VF2A 2AP1A 4PKGA 4BR4A 3A5NC 4GY2B 1KAYA 3FZMA 3L4IA 1SZ2A 3IUCA 3L6QA 2E88A 5AQIA 1J6ZA 3GE1A 3LDPA 1HLUA 3ZETB 1H1VA 1T6DA 2YCHA 4BGBA 4AM7A 1ESVA 1Z05A 3EO3A 2Q2RA 4XEIA 1R59O 1U6ZA 4BR2A 3SK3A 4H0YB 1QZ6A 2VYPA 4MO5A 3O4WA 4BR9A 2QXLA 2IVPA 5B8HA 5BPLA 3BF1A 5CE3A 5AQPA 4H0XB 4CZFA 3OHRA 4BRFA 4EHTA 2V51B 3C7NB 1YVNA 3HBTA 2I7PA 2P9KA 4BRQA 4IJNA 1BWFO 4HWIA 4BC3A 3WEEA 4H5NA 2A42A 3IDHA 2FSKA 4CZIA 1C0FA 4BC4A 3C0BA 2I7NA 3LM9A 4WQ4A 5BR9A 4RCHA 5AQWA 2W41A 3TPQA 3KVGA 2FLOA 1C0GA 2CGLA 3HZ6A 3LDLA 3LDNA 3RSEA 3UB5A 2GUPA 2P9UA 4H0TB 4A2AA 5AZJB 3VGMA 4HTLA 3VEXA 1GLBG 4CJ7A 3A5OC 3CJ1A 2Q1NA 3D2FA 5AQZA 1QQOA 2FXUA 3O08A 3SMPA 2UYTA 2H3GX 4H0VB 2Q97A 4EFHA 2FSNA 2E2QA 2QWLA 3GG4A 5JLHA 4FOIA 5JMVA 3VPZA 5BREA 5JLFA 4JAXA 4IWVA 3ATUA 3AARA 2HOEA 4JD2B 3CIPA 4BRDA 4DHYA 5FPNA 3CQYA 3LM2A 3A5MC 5AFUH 2E20A 3ZEUB 4ISGA 5AQRA 4XH4A 4BRGA 4B1XB 3HSCA 1BA1A 1BG3A 4XH1A 3DXMB 1TUYA 3VEZA 1K8KA 3MN7A 2A40A 2QWPA 4BQZA 2P9IA 3ZX2A 1KAXA 3AY9A 2HF4A 3EL2A 5AQNA 1BU6O 1DGKN 2P9SB 2E2NA 5BN8A 1NGAA 1T44A 1GLAG 4CI6A 1RGIA 4BREA 4FWOA 1E4FT 1GLEG 5KPRA 2Q0UA 1V4SA 2HMPA 4LC9B 4YDUC 2QWRA 1JCGA 3CJCA 4F9OA 3BP8A 5BRHA 5AQUA 3MDQA 1NGBA 3KHYA 3MN6A 1E4GT 2GEMA 3QDKA 3M3ZA 4PKHA 3WXLA 4CBXA 2ITMA 3A5LC 3W0LA 5AZIA 4FL9A 1NBWA 3HTVA 5LJVA 1JCFA 2E2OA 4Z94A 3FLCO 4C23A 4IJAA 3O8MA 3I33A 2VCPA 4ISFA 2CGKA 2BTFA 1IJJA 5AQOA 4B1UB 5I9EB 3ZX0A 3H3NO 4FWNA 3UKRA 5KQ8A 4BRHA 3D2EB 1GLJO 1XC3A 4DB3A 4M63C 4BRMA 5AQSA 1GLLO 3FZKA 4Y0WA 1KAZA 3SJHA 1GLDG 1MA9B 3CERA 4BROA 2CH6A 5F2RA 3D7EO 4BRLA 2QWOA 1K8KB 4BR7A 2CGJA 1U2VA 3JXUA 3KZBA 3ENOA 2YJFA 2YHYA 2NZTA 3SMSA 2A41A 2GWKA 4H5WA 4I6MB 4H0PA 3LDQA 1TYQA 3B8AX 3QFPA 4CZKA 4FWPA 4CZLA 1SQKA 1NGJA 1NLVA 4M7XA 3ID8A 2Q0RA 5KPZA 4BR0A 1LCUA 3G25A 3UKUB 1XQSC 3R9PA 2OANA 2A6AA 3H1VX 3EN9A 4L3QA 1S3XA 1BO5O 3WUHA 5AQJA 5EXWA 4BG8A 3FZFA 3MCPA 2ASPA 1RDWX 3EKSA 4FOEA 4MLHA 1HKGA 2E8AA 5FPDA 3CJ9A 5BRDA 4BRKA 1X3NA 5JICA 3CQXA 4FO0A 2F9TA 2P9LB 3U8XA 4QS8A 3GOIA 2BUPA 2HF3A 3ULEB 1MWMA 4K25A 3VEYA 2P9NB 3CI5A 4PKIA 4CD1A 1T6CA 4BC2A 4B1YB 4A2BA 5EVZA 1ZBSA 2P9UB 4H5RA 5LY3A 1YXQA 3VGKA 3D2EA 3VETA 3P4IA 3FZHA 5AQYA 1WOQA 3VERA 4CZEA 4O8KA 3ATVA 3S41A 4RTFD 1YAGA 1QQMA 4YDUA 1NGGA 3DXMA 1BA0A 3ZETA 3HM8A 3DJCA 3ZX3A 4EIAA 4QS7A 1NGDA 5ELZA 3QFUA 5TKYA 2P9KB 2D0PA 1HJOA 3WT0A 4BQLA 4BRCA 2V7ZA 2ZWHA 2Q31A 4M7YA 4BR5A 3FGUA 2P9SA 3O5BA 4BC5A 1OKJA 3VF6A 3WXJA 3EKUA 5AZIB 5BN9A 2QM1A 1QZ5A 3DWLA 2GWJA 3QMLA 2F9WA 4WYBA 3SLCA 4EHUA 4BVOA 4FWMA 3QBWA 3R6MA 3ENHA 1SAZA 3VGLA 5AZJA 4FWRA 2ZGZA 3DXKA 4E1JA 3BEXA 2EWSA 2QWQA 2IVOA 4BG9A 2A5XA 5EX5A 4BRIA 4XH5A 2CH5A 4K41A 2ASMA 2YHXA 3QICA 2W40A 1HX1A 3BF3A 3UKRB 1NGFA 2AA4A 2E2PA 1X3MA 2GTDA 1Z6RA 3M1FA 4WQ5A 4H5TA 4PL8A 2E1ZA 5LJWA 3QB0A 1MDUB 1RFQA 3O1BA 3FE1A 3UE5A 4CZHA 4CBUA 2QWNA 3H1QA 1IG8A 4BRPA 5AFUA 4H03B 1HKBA 3AAQA 5AQGA 3VOVA 2NLXA 4B9QA 1NGCA 4FWQA 2P9LA 1YUWA 3J8AA 4WQ4C 3DXKB 3QBXA 1JCEA 5BRFA 3U4LA 4MLEA 4DCHA 1NGIA 2DPNA 2FF6A 2V52B 1QHAA 2IVNA 3CJ7A 2KHOA 1ZXOA 3TU5A 4ISEA 2P9IB 4FPAA 4B1WB 2D1KA 4FPBA 5ADXH 1KXPA 3H3OB 2PBDA 1EQYA 4IO8A 5F1XA 3VF4A 3VENA 3IMXA 2FF3B 1G99A 3D2FB 1DEJA 3BUZB 4RWTA 3LL3A 1BUPA 3CHWA 4J8FA 2P9PA 3A8YA 3ZEUA 4JN4A 2YI1A 4B1ZA 1TUUA 1LOTB 4H0OA 5KQDA 1ATRA 1BDGA 5AQHA 5AQKA 1ZC6A 4BRAA 4JNEA 3JS6A 3FR0A 1QQNA 3GDQA 1HUXA 1Y64A 4IXCA 3MK6A 2ASOA 4FWSA 5BPNA 3CETA 5FPEA 2PAVA 1V4TA 3AAPA 3UKUA 3WXKA 4WQ5C 4A62A 1BOTO 1S22A 3W3DA 4AM6A 4B1VA 2V7YA 3GBTA 5AQQA 4JHDA 5AQFA 4MO4A 1NGHA 4NB4A 3U9ZA 5KPTA 5ADXA 4FSVA 1DKGD 2ZF5O 1MWKA 5BPMA 1HKCA 2P9PB 3VEWA 1NM1A 4CD3A 3MN5A 1GLFO 4CZJA 5AQMA 2GELA 1P8ZA 4DQ8A 4KBOA 5AQLA 3L0QA 3CJAA 1HPMA 4A61A 1NGEA 3EZWA 3F9MA 3WXIA 1WUAA 1U2VB 3CJBA 3LDOA 1XUPO 4CZMA 4GNIA 1D4XA 2NRHA 3O80A 3VESA 3H6EA 3A0IX 3FFKB 1Q18A 2ZGYA 2D4WA 3I8BA 3H46O 2Q36A 3U9DA 5EOYA 2WUSA 2E1YA 1NMDA 4CZGA 2P9NA 4K43A 4QS9A 3WQTA 3MN9A 4PL7A 4K42A 4BRNA 4BVPA 5AQXA 4FWLA 3H45C 4I6MA 4IZ9A 2D0OA 5E26A 3O1WA 2IIRA 1TYQB 3HI0A 4O5FA 2FSJA 4JHDB 3DAWA 2QWMA 3GL1A 5F0XA 2J4RA 4H5VA 3WEEB 2VWBA 3FZLA 5AR0A 5FPMA 4EAHD 3R8EA 3VEVA 3VEOA 4JD2A 1GLCG 2YJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJRA 1HNZK 5LL6Z 4BACA 1P0AA 4NO7A 1RT3A 5C0YA 4DV3K 1B7DA 3VQPA 4CBWA 4FWKA 1RT6A 1IBLK 4W5QA 4JKDA 4KAZA 1XNRK 1CLQA 1TK8A 3O6WA 3WQUA 3ULEA 5CY0A 3WNGA 2N2RA 4GY2B 1RT2A 1SZ2A 1JLQA 5J2PA 2E88A 1J6ZA 4BE2A 1HLUA 3ZETB 4FW2A 2WFBA 3PIOL 3BK3C 1H1VA 3NVKA 1T6DA 2YCHA 2IC3A 1DLOA 2HVIA 3NDKA 2Q2RA 4XEIA 4KHPK 3NMUA 3OBWA 2VYPA 2OTLN 4MO5A 4BR9A 4FLXA 1VQ7N 3BF1A 4H0XB 2Q3SA 2V51B 4DV5K 3C7NB 1NPIA 4N76A 4IJNA 1BWFO 2A42A 2FSKA 4E3SA 1ZFUA 3S3OA 4WQ4A 1OH8A 4RCHA 3V1OA 1TK0A 1D9FA 4DSIA 4L8RB 3PO5A 3MXMA 3LDLA 3LDNA 4JI8K 1ITGA 5C12A 3VGMA 2D5RA 4CJEA 3RVCA 2Q1NA 3P38A 5AQZA 3O08A 3SMPA 4CIFA 3O9QA 2W6LA 1K73O 3HVTA 4H0VB 1VHXA 4BY9C 5BR8K 4EFHA 3GG4A 4OJRA 1PTXA 5BREA 3M8QA 3TSQA 4DSEA 1RBTA 1WSEA 3OYGA 2YX6A 4G1QA 4Z4IA 2OPRA 3OJSA 4BRDA 2E3GA 4IBNA 3QIPA 4GKKK 5FPNA 3CQYA 3A5MC 3C94A 4AB0A 4XH4A 4BRGA 3HSCA 1BA1A 1BG3A 2YHAA 1TUYA 4MDAA 1OH6A 4KV8A 2A40A 3QINA 4H8KA 2QWPA 4O8UA 2I5JA 3HP9A 1X9MA 2OPPA 4CJUA 3SAFA 2KLAA 4DR4K 3R3LA 3F73A 1Q86O 4M45A 5BN8A 3WNHA 3THWA 5GAEP 1GLAG 2PZSA 1UGLA 4JK7A 4IOCL 4FWOA 3VQCA 4GV6A 4YFUA 1ILYA 3OYJA 3HRGA 3TTCA 2PY5A 2QWRA 1JCGA 1W97L 1NJXA 3SAHA 1RBUA 4DTXA 1RT1A 2QTDA 3TR8A 1Q9XA 5C25A 2G8HA 3THXA 3QDKA 3TAFA 1N36K 4PKHA 4CBXA 1I3AA 4C8MA 3KK3A 1U04A 3ZT3A 3W0LA 2O8CA 3HTVA 1JCFA 2ZE2A 4IJAA 1S1XA 3SBGA 3DOLA 1LAWA 4DQSA 3I33A 4JI4K 1ASWA 1NJYA 1T7EA 3KLIA 2CGKA 3QEXA 3LPUA 4FWNA 3UKRA 4CGHA 4C8LA 4BRHA 4B3MK 3C6UA 4B8AB 2OZSA 4M63C 4BRMA 1N33K 1OMYA 1KQSM 2UU9K 3SJHA 2CH6A 4NYFA 3C6TA 5F2RA 1O1WA 2YC1C 1K8KB 4BE1A 3LZJA 5DM7L 3KZBA 3SMSA 3QESA 3KLHA 5JENA 3DLEA 2A41A 3E1YA 3THYA 5HLFA 4DTUA 4BEBA 2GWKA 3ZSZA 2YNIA 2HHTA 2F96A 4FW1A 1TYQA 1JKZA 1SEGA 2HHUA 1RDDA 1TL1A 3P31A 2Q0RA 3T1YK 3O9SA 4F8RA 4FZXC 4DS5A 2OANA 1EO1A 1ZYQA 3NVMA 1KLMA 4BWJA 1S3XA 2XY5A 3AVHA 2DTUA 1SKWA 1VQ9N 4BG8A 2NUBA 3KWGA 1HKGA 2E8AA 4B3OA 3CJ9A 4BRKA 3THXB 1X3NA 1HYSA 4X64K 1T0ZA 4BE7B 1S1VA 2YIOA 1IO2A 4XIUA 1TVRA 1TV6A 1WT7A 4DUZK 1BI4B 1MWMA 3OA9A 2B4JA 3QI7A 3VEYA 3KOYA 3SQ1A 3LP0A 1ZU3A 2E5LK 3CI5A 2UXDK 3ZT0A 4CD1A 5CZ2A 4A2BA 4DQIA 3MWPA 3M8SA 3VGKA 5C15A 3VETA 2XHBA 4PWDA 3P4IA 4EP5A 3FZHA 5AQYA 3T7ZA 2GX9A 3ATVA 3S41A 4ZTJA 1RBVA 2HBKA 4MDBA 4O0JA 1NGGA 1YIJN 1BA0A 3Q7CA 3ZX3A 5FRNA 4CVNE 3QFUA 4FJJA 3ZSWA 2QI2A 1HJOA 2E2FA 2I61A 4JKCA 3K0SA 2V7ZA 4M7YA 3PX4A 3KP0A 3T19A 3VF6A 2YNGA 3WXJA 1KC8O 4JI3K 1SN1A 1W2BM 3AVIA 3DWLA 3MEEA 3QMLA 5CR4A 2QEXN 4WYBA 4KPYA 3NBPA 4RW7A 1VSMA 3DYAA 4FWMA 3R6MA 3ENHA 1SAZA 3VGLA 1SS6A 5AZJA 4N47A 3SCXA 1A5XA 2EWSA 3OYCA 5EX5A 4BRIA 4N41A 4ELTA 2YHXA 2W40A 1HX1A 3BF3A 5KGXA 1NGFA 1PE4A 4CEAA 1X3MA 2GTDA 3K5LA 1Z6RA 3AO4A 4H5TA 4CGGA 1T1TA 3HXMA 1AYJA 4DSJA 3RTVA 2HHQA 4CEZA 1WSIA 1RFQA 2W6KA 4E7JA 5GIOA 1JL1A 3SQ2A 3KHWA 3U3GA 1C0UA 2G8VA 1WSJA 1RTDA 4FK4A 2LSNA 3T1AA 4H03B 3I55N 1YJWN 4NXNK 2C1IA 3AAQA 3VOVA 2NLXA 4FWQA 4YOYA 4WQ4C 3DXKB 3OYHA 1B3CA 5BRFA 3U4LA 4MLEA 4DCHA 1P00A 3V1RA 1RTIA 3DRPA 4IG3A 3B6OA 3SQ0A 3TU5A 4YNQA 1SL2A 1LV5A 3K58A 4B9LA 4CHZA 5LMNK 4JYAK 3H3OB 4CF9A 4J2AA 4IO8A 4KH6A 1G99A 3M5RA 3VQ5A 2YBRC 1HYVA 4IDKA 4J8FA 3NGIA 2UUBK 3A8YA 1WBDA 4NCBA 2G8WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CJR A;  1HNZ K;  5LL6 Z;  4BAC A;  1P0A A;  4NO7 A;  1RT3 A;  5C0Y A;  4DV3 K;  1B7D A;  3VQP A;  4CBW A;  4FWK A;  1RT6 A;  1IBL K;  4W5Q A;  4JKD A;  4KAZ A;  1XNR K;  1CLQ A;  1TK8 A;  3O6W A;  3WQU A;  3ULE A;  5CY0 A;  3WNG A;  2N2R A;  4GY2 B;  1RT2 A;  1SZ2 A;  1JLQ A;  5J2P A;  2E88 A;  1J6Z A;  4BE2 A;  1HLU A;  3ZET B;  4FW2 A;  2WFB A;  3PIO L;  3BK3 C;  1H1V A;  3NVK A;  1T6D A;  2YCH A;  2IC3 A;  1DLO A;  2HVI A;  3NDK A;  2Q2R A;  4XEI A;  4KHP K;  3NMU A;  3OBW A;  2VYP A;  2OTL N;  4MO5 A;  4BR9 A;  4FLX A;  1VQ7 N;  3BF1 A;  4H0X B;  2Q3S A;  2V51 B;  4DV5 K;  3C7N B;  1NPI A;  4N76 A;  4IJN A;  1BWF O;  2A42 A;  2FSK A;  4E3S A;  1ZFU A;  3S3O A;  4WQ4 A;  1OH8 A;  4RCH A;  3V1O A;  1TK0 A;  1D9F A;  4DSI A;  4L8R B;  3PO5 A;  3MXM A;  3LDL A;  3LDN A;  4JI8 K;  1ITG A;  5C12 A;  3VGM A;  2D5R A;  4CJE A;  3RVC A;  2Q1N A;  3P38 A;  5AQZ A;  3O08 A;  3SMP A;  4CIF A;  3O9Q A;  2W6L A;  1K73 O;  3HVT A;  4H0V B;  1VHX A;  4BY9 C;  5BR8 K;  4EFH A;  3GG4 A;  4OJR A;  1PTX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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