3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
2V7ZA 1HLUA 3O1WA 4B1UB 3UB5A 4K25A 3A5MC 4WQ4C 2E2OA 5KPRA 4B1XB 4AM7A 5AQOA 4H5RA 3L0QA 2FSKA 2ZGZA 4E1JA 2AA4A 4CI6A 1YAGA 3HBTA 4BRIA 2NLXA 4CBUA 4EHTA 5AQHA 2E8AA 1X9JA 2A40A 1E4FT 4HTLA 3MN6A 1HKBA 3ZETB 3EKSA 2FXUA 3C7NB 2HMPA 4JN4A 1YUWA 5F0XA 2ASMA 4ISGA 3D2EA 2AP1A 3WQUA 3CETA 3A5LC 4JHDB 2KHOA 5AQPA 4QS8A 2Q0UA 3ULEA 5LJWA 1K8KB 1BUPA 2D4WA 4O8KA 3HM8A 4FWNA 1HJOA 4H0XB 1D4XA 1BDGA 4AM6A 2YI1A 2F9WA 4BR4A 3VESA 4B1VA 2ASPA 2FF6A 4B1ZA 2VWBA 3I8BA 2A5XA 1GLJO 4BQLA 2UYTA 3O08A 2P9SA 1DGKN 5BRFA 5BRHA 5AQNA 3QFUA 1SZ2A 3VEOA 3VEVA 2A42A 1NGEA 3L6QA 3WXJA 1X3MA 3D2FB 5TKYA 2NRHA 2ZGYA 4MLEA 3GBTA 5JMVA 1V4TA 3MCPA 3R8EA 1DEJA 4FWOA 1HKGA 3LDQA 1XUPO 5AZIA 3TU5A 1GLEG 5AQGA 4CZFA 3U9DA 1RGIA 3U8XA 3SMSA 4MO4A 2YCHA 1OKJA 3DWLA 1BA1A 1ZC6A 3JS6A 4YDUC 3W3DA 5BPMA 3WT0A 4A62A 3FZKA 4BVOA 4BVPA 2D1KA 3CQXA 4BC4A 2P9PB 3OHRA 1ATSA 4BRMA 3CI5A 3CIPA 3R6MA 2CGKA 2DPNA 2BUPA 2YJFA 4BREA 3O8MA 4FOEA 4CBXA 3ENHA 2EWSA 1T44A 3R9PA 2HOEA 3VOVA 1WUAA 1P8ZA 1BA0A 4ISEA 1HUXA 3U9ZA 1GLFO 4Y0WA 4EFHA 3M6GA 4GY2B 3SK3A 2GWKA 4NO7A 1E4GT 4I6MB 3QMLA 2J4RA 3CERA 2ZF5O 1NWKA 2YHWA 2Q97A 5FPDA 4NB4A 2E1YA 2P9IA 3VGKA 2ITMA 3L4IA 5AQVA 2IIRA 1C0FA 3ATVA 4CD1A 1HKCA 3LM9A 4JNEA 3ATUA 1HPMA 3KZBA 2GELA 4BRDA 1XQSC 3CJ9A 4XH1A 1MDUB 1SAZA 4FPAA 3HZ6A 2VYPA 4H5VA 4FO0A 1NGIA 4A2AA 4ISFA 5AQQA 3KVGA 1HX1A 3U4LA 3A5NC 3IDHA 2E88A 3D7EO 3FZHA 2W41A 3QBWA 2P9LA 3DXKA 3BEXA 4LC9B 4FSVA 3LDLA 3GG4A 2P9KA 1GLLO 3HSCA 1GLCG 1GLAG 4M7YA 1JCFA 1V4SA 3DXKB 2H3GX 1JCEA 1U6ZA 1SQKA 1TYQA 2D0PA 4B1YB 1G99A 2P9KB 5F2RA 4GNIA 2QWMA 2ASOA 2E2QA 4PKIA 3H3NO 4WQ4A 4BROA 1QHAA 4H0OA 3VENA 1C0GA 3VGMA 3H46O 3D2EB 2Q0RA 1RFQA 4CZIA 2BTFA 2P9UA 3BF1A 3CJ7A 2GTDA 5I9EB 3ULEB 5AQYA 2YHXA 2A3ZA 1GLBG 4H5TA 4FWSA 3H3OB 4XH5A 2V52B 4BC3A 1QQNA 4DB3A 4L3QA 2F9TA 1Y64A 3EO3A 5AQKA 4CZGA 4M63C 3MMVA 1ZBSA 5AQXA 2QWRA 3GE1A 3H1VX 3O4WA 3A8YA 3P4IA 5FPMA 1BU6O 4CBWA 3FZFA 4WYBA 2P9SB 5BPNA 4RCHA 1S22A 2QXLA 3VF2A 4BRHA 5AZJA 1T6CA 3CJBA 1GLDG 3M3ZA 4H5NA 1TUYA 3CJAA 5KPTA 1ESVA 2FSNA 4MO5A 3BP8A 3VF4A 4DHYA 4BRGA 3QBXA 5BRDA 5LJVA 1KAZA 5AZIB 3LM2A 4Z94A 1CZAN 4B1WB 2CGJA 2IVOA 3VEZA 4CZKA 1ZXOA 1MWKA 4BRFA 5F1XA 5KQ8A 2V7YA 5E26A 2FSJA 5AQTA 1NBWA 3AY9A 1NGGA 2A41A 4CZMA 2E1ZA 3O5BA 1KXPA 5AQJA 5EVZA 1QZ6A 2Q1NA 1ATRA 3O6WA 3VF6A 3MN9A 2ZWHA 4BRAA 2QM1A 3IUCA 3JXUA 5JLFA 4BRQA 4C23A 5AR0A 4YDUA 1Z6RA 3TPQA 4WQ5A 4IO8A 1NGHA 5KPZA 1KAXA 5AQSA 3VEYA 3ZEUA 3FZMA 4CZEA 3IFRA 3M1FA 1NMDA 2P9NA 4IJNA 5JLHA 5KQDA 1BG3A 2CH5A 5EXWA 5AQZA 3QDKA 3CQYA 3C0BA 4RWTA 4H0VB 1U2VA 3GOIA 3RSEA 4FWMA 1BO5O 3MDQA 4BRPA 2P9NB 1QQMA 5AQIA 4BRNA 4JD2A 2P9IB 4K43A 4H03B 3LL3A 3VERA 5CE3A 4IWVA 5BPLA 3HI0A 4FOIA 3UKRA 3VGLA 2YHYA 4M7XA 3VETA 1U2VB 4DQ8A 1RDWX 4CZLA 1YVNA 2I7PA 1S3XA 3FLCO 4B9QA 2YJEA 4JAXA 1NGCA 3EL2A 4BG9A 3VPZA 3ZX3A 1LOTB 4BG8A 4BGAA 2VCPA 3F9MA 4PL8A 3QICA 3S41A 3FE1A 5BN9A 5LY3A 1NLVA 3WXIA 3CJCA 4XEIA 2E20A 3H45C 2P9LB 3I33A 3QB0A 3LDNA 1TUUA 2WUSA 3ZX0A 1Q18A 3CJ1A 3ZETA 4HWIA 4EHUA 3C7NA 3BF3A 3VEXA 3O80A 2E2NA 3SLCA 2OANA 3DJCA 4BR7A 4JHDA 1NM1A 4BGBA 4BC5A 5AFUA 2D0OA 4BQZA 1R59O 3MK6A 1K8KA 4FWKA 5FPNA 3EKUA 1TYQB 2GWJA 4BC2A 3AARA 3WXLA 2Q36A 2Q2RA 4BRKA 1QZ5A 5EX5A 1IG8A 4IJAA 3DXMA 3MN7A 4H0TB 3H1QA 2P9UB 3EN9A 5B8HA 5ELZA 4FPBA 2W40A 4XH4A 3GDQA 4QS7A 1YXQA 2GEMA 3UE5A 3A5OC 5AQMA 4EIAA 2QW9A 3UKUA 2GUPA 4CZJA 4J8FA 1IJJA 2CH6A 3DXMB 1NGDA 1WOQA 2PAVA 3H6EA 4K42A 3D2FA 2I7NA 4FWPA 3SJHA 3WQTA 5BR9A 2FLOA 3ID8A 4H5WA 3ENOA 5AFUH 5AQRA 3LDOA 3LDPA 1Z05A 1BOTO 5AQWA 4FWRA 3MN5A 3UKUB 3SMPA 4A61A 3FR0A 3WXKA 2IVNA 4CZHA 5AZJB 5ADXA 1J6ZA 4BR5A 3ZX2A 3AAPA 2QWQA 3J8AA 3B8AX 1X3NA 3CHWA 2Q31A 1T6DA 1MWMA 2V51B 5EY4A 4EAHD 3AAQA 2P9PA 4DCHA 5JICA 2HF4A 1DKGD 4FL9A 3KHYA 3VEWA 5AQUA 4WQ5C 1ATNA 1MA9B 1EQYA 4CJ7A 4H0YB 2HF3A 3DAWA 1XC3A 2E2PA 5FPEA 4BRLA 3IMXA 5AQLA 5BREA 4MLHA 5BN8A 3G25A 1NGJA 5AQFA 5E84A 4PKHA 5EOYA 5ADXH 4F9OA 2IVPA 4BR9A 4I6MA 1H1VA 1KAYA 2FF3B 2QWNA 1JCGA 3ZEUB 2CGLA 2A6AA 3FGUA 1NGFA 3BUZB 3FFKB 2NZTA 3WEEA 4IZ9A 4FWQA 1BWFO 4CD3A 2QWLA 3WUHA 4IXCA 2QWPA 3A0IX 3FZLA 4RTFD 4BR2A 3O1BA 1LCUA 4BR0A 3QFPA 4PKGA 3RSEB 2PBDA 1NGBA 4H0PA 4QS9A 4BRCA 2QWOA 3WEEB 4JD2B 1NGAA 4PL7A 3GL1A 4O5FA 4KBOA 3EZWA 3W0LA 3HTVA 3UKRB 1QQOA 4K41A 4FWLA 4A2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O1WA 3UB5A 1X9WA 4JKDA 1KQSM 5AQOA 2HBMA 1VQ5N 2UUCK 1IKWA 5HROA 3HP6A 1YVUA 3V9WA 4M45A 1EXQA 1RBVA 1AHOA 5CYQA 4CBUA 2E8AA 3HJFA 2ASCA 1HKBA 1WSGA 4A57A 2FXUA 3SAFA 1QQCA 1TK8A 2HMPA 4N41A 3DLHA 1EETA 1YUWA 1YTAA 1UA0A 4KB0A 3CETA 2HVIA 1J54A 1NJYA 1RBTA 4ZTJA 3TABA 4ELUA 4AM6A 1BDGA 2YI1A 4CK1A 4CGIA 4KTWA 4YFUA 4B1VA 2FF6A 3SUOA 2VWBA 3TI0A 5E41A 2G8UA 3HO1A 1A5VA 1CHZA 2P9SA 2G8WA 3ZT0A 1TKDA 4CJWA 4OO1J 1ZBHA 3P39A 3OYCA 3QFUA 1SZ2A 1NGEA 3DLBA 3D2FB 4JKGA 5TKYA 4N47A 1J5OA 1HRHA 4MLEA 4F3TA 3DLGA 4LH5A 3KOYA 1SN1A 4R5PA 1HKGA 1XUPO 4X65K 5DM6L 2OZSA 3K57A 4DQSA 3U8XA 2E6LA 2UUBK 2YCHA 3TSUA 3ENBA 3G4SN 1JZAA 3JS6A 1TK5A 4MDBA 4KYPA 4B9MA 4A62A 4BVOA 3QESA 1U47A 4FLYA 2HVHA 2P9PB 3OHRA 1TL1A 1NK4A 1TKTA 4O8UA 1SKWA 2DPNA 2YJFA 2EX3A 2Y1IA 3O8MA 3PY8A 2LI7A 3ENHA 4I2QA 3I8DA 2MN5A 4CJPA 2HOEA 1HUXA 3OBYA 1GLFO 1IO2A 4IFVA 3V1RA 2O8EA 2NY8X 2QKKA 3TTCA 4B3RK 1RDAA 4DV0K 1N5YA 4NO7A 3MAQA 3KWGA 4J2BA 4FXDA 2O8EB 4CFDA 3VGKA 4CF0A 2A1SA 1C0FA 3AO2A 4L8RB 1RDDA 3TR8A 3ATUA 3CCLN 4XH1A 1MDUB 1SAZA 3HZ6A 4HCBA 2O8CA 3AO1A 1BL3A 4H4MA 3U4LA 2E2FA 3NH1A 1TK0A 4DTRA 3D7EO 4CJTA 1YF5L 4DSKA 1VSDA 4I7FA 4DKWA 1JLFA 1BQMA 3R1XA 2O8CB 1REVA 3NVKA 1VQ8N 3LDLA 5T7BA 1VQ7N 2GMOA 3PX6A 3HSCA 1RBUA 1NK8A 3SUPA 2HBKA 2KW4A 1QS4A 2IGIA 2KFNA 4IOXA 3ZT3A 4B1YB 4E7HA 1WBDA 3PLAA 4GNIA 3TWHA 2E2QA 4NLBA 3V4IA 1Y97A 2D0BA 4J2AA 1WB9A 1QHAA 3VENA 3CCUN 4B8AB 1JXEA 1N4NA 2YNHA 3L2UA 4WFBL 2UUAK 3BF1A 3NF6A 4FZYA 5I9EB 3S9HA 4LF5K 2D5RA 3TTDA 3VQEA 2A3ZA 3SF4D 3KTQA 2W42A 4BC3A 4IG0A 1N33K 3CCRN 1T8EA 3TANA 3IKMA 3QINA 2KZZA 3P5JA 4HVJA 3A8YA 1X9SA 3P4IA 5FPMA 3T3FA 2E6MA 3LP2A 2IS3A 1TKZA 3THYA 3P1GA 1KLNA 4IBNA 3CJBA 1IKYA 4XJXA 4YOUA 2FSNA 4MO5A 3G0ZA 5JVGL 2KZMA 5BRDA 3QBXA 1KAZA 1IH7A 1Q8IA 1LQQA 2NRWA 2Z1GA 1N8RO 3VTIA 2IVOA 2LY5A 3EY1A 1G15A 1RT1A 2XY8A 4FCYA 2HMIA 5KQ8A 2WFBA 3FFIA 3AVKA 5AQTA 1I39A 4BWJA 2MBKA 3TTFA 5HRPA 2XY7A 1J5EK 2ITGA 2A41A 4CZMA 4LF4K 3O5BA 1XI1A 2Q1NA 4JEPA 3J7YP 4I9QA 4YHHK 1VSJA 3CQ8A 3KHWA 5HRNA 1KAXA 2NY9X 3NF7A 4CZEA 4PY5A 1U49A 3NMUA 2Y1JA 3O9UA 3BGRA 3U3YA 4FM0A 5KQDA 2CH5A 3MX5A 5EXWA 4BACA 1ITGA 1KFSA 5K14A 4HUFA 4BE0A 1SKRA 4DFJA 4IDHA 4CJ4A 2W6KA 1RCHA 4BRNA 2ATQA 4H03B 3MEGA 4IWVA 5BPLA 1VSFA 2HW3A 4X64K 3VGLA 4M7XA 4FJ5A 1TV6A 4DFMA 1YI2N 4DSEA 4CZLA 4DTSA 5GIOA 1S3XA 4B9QA 4CCHA 4BG9A 1RTIA 3F5TA 3KLFA 2DFEA 3VPZA 1WMTA 3VQBA 3K5NA 1ASWA 2IOCA 4NCAA 2ETJA 1RT6A 3SNNA 4JK9A 1L3TA 3FE1A 3Q7CA 3EE9A 2N66A 3H45C 4JS4A 2C1IA 4QCLA 3QB0A 3LDNA 1EO1A 3ZETA 5M1OA 4CK3A 3QNNA 2HSTA 4RW4A 3C7NA 3HVTA 3K5OA 1KVCA 3BF3A 4CJLA 3O3FA 1JXCA 3E9LA 4Z0UA 1Q9YA 2OANA 1S1XA 3C94A 4JHDA 3HT3A 3E66A 4DUYK 1MYNA 4KI4A 3Q7BA 4I2PA 1K9MO 2Q36A 4CJKA 1K8BA 4BRKA 5EX5A 4IJAA 4FJ7A 3OYHA 4V19S 1S5JA 4CJEA 3AV9A 5GAEP 1VQ4N 4UJ0A 3EN9A 4NXNK 3TAPA 4W5QA 4CEQA 4OPHA 3KKSA 2W40A 4XH4A 3V6DA 3ISNC 3A5OC 3QEWA 1RT2A 3UKUA 3QERA 4JKEA 1SKSA 4K42A 3CW4A 1Q86O 4FWPA 3WQTA 3NE6A 5BR9A 3E01A 2FLOA 2BANA 4H5WA 3K2PA 5AFUH 1NJIO 2C1GA 2JLEA 2Z1JA 4FJ8A 1BOTO 3PIPL 3UKUB 3SBGA 4A61A 4JK8A 4FJKA 2IVNA 4FVUA 4M3TA 1ZBUA 5AZJB 1CZBA 3ID6A 4OX9K 3AAPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O1W A;  3UB5 A;  1X9W A;  4JKD A;  1KQS M;  5AQO A;  2HBM A;  1VQ5 N;  2UUC K;  1IKW A;  5HRO A;  3HP6 A;  1YVU A;  3V9W A;  4M45 A;  1EXQ A;  1RBV A;  1AHO A;  5CYQ A;  4CBU A;  2E8A A;  3HJF A;  2ASC A;  1HKB A;  1WSG A;  4A57 A;  2FXU A;  3SAF A;  1QQC A;  1TK8 A;  2HMP A;  4N41 A;  3DLH A;  1EET A;  1YUW A;  1YTA A;  1UA0 A;  4KB0 A;  3CET A;  2HVI A;  1J54 A;  1NJY A;  1RBT A;  4ZTJ A;  3TAB A;  4ELU A;  4AM6 A;  1BDG A;  2YI1 A;  4CK1 A;  4CGI A;  4KTW A;  4YFU A;  4B1V A;  2FF6 A;  3SUO A;  2VWB A;  3TI0 A;  5E41 A;  2G8U A;  3HO1 A;  1A5V A;  1CHZ A;  2P9S A;  2G8W A;  3ZT0 A;  1TKD A;  4CJW A;  4OO1 J;  1ZBH A;  3P39 A;  3OYC A;  3QFU A;  1SZ2 A;  1NGE A;  3DLB A;  3D2F B;  4JKG A;  5TKY A;  4N47 A;  1J5O A;  1HRH A;  4MLE A;  4F3T A;  3DLG A;  4LH5 A;  3KOY A;  1SN1 A;  4R5P A;  1HKG A;  1XUP O;  4X65 K;  5DM6 L;  2OZS A;  3K57 A;  4DQS A;  3U8X A;  2E6L A;  2UUB K;  2YCH A;  3TSU A;  3ENB A;  3G4S N;  1JZA A;  3JS6 A;  1TK5 A;  4MDB A;  4KYP A;  4B9M A;  4A62 A;  4BVO A;  3QES A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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