3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
5BPMA 5BN8A 3O80A 3DJCA 3HI0A 4KBOA 2VWBA 2Q97A 3M6GA 4XH1A 1TYQA 5AFUA 1K8KA 2ASOA 2D0PA 3GBTA 5JLFA 5LY3A 5EX5A 2CH5A 5AQVA 1V4TA 4EAHD 5B8HA 5ADXA 1MDUB 4CZJA 3VEZA 4HTLA 4BC2A 1NMDA 5AQNA 1GLBG 3JS6A 3JXUA 1ZC6A 3VESA 4A2BA 3D2EB 1ATRA 2Q36A 4BRLA 3GOIA 2Q2RA 2AA4A 1GLDG 3DXMB 2ASPA 3QBXA 2E2QA 3UB5A 4CBUA 2GTDA 4BQZA 3A5OC 4B1VA 4BVOA 4H5RA 1KXPA 1X3MA 4JN4A 2HMPA 4QS8A 1OKJA 1TUYA 2CGKA 2A42A 2E8AA 4IWVA 4M63C 3WQTA 4BG9A 1ATSA 2YHXA 4IJNA 5LJVA 3CIPA 5KPTA 1XQSC 3C0BA 2IIRA 5AQYA 2NRHA 2QWOA 2Q1NA 3A5NC 3MCPA 1TYQB 3OHRA 4QS9A 2GWJA 3W0LA 5AQTA 1K8KB 1NGEA 3UKRA 3VOVA 3MN6A 2ITMA 3AAQA 5AQLA 4YDUA 1T6CA 4BQLA 3EKUA 4LC9B 3LL3A 4WQ4C 4PKHA 1BUPA 3A8YA 2P9KA 4BRCA 2QWPA 2WUSA 1HPMA 3QBWA 3VGMA 1GLCG 5F2RA 5AQJA 3O1BA 3QFUA 2A6AA 3H6EA 5AQUA 1YUWA 4FWOA 3ENOA 5LJWA 2E20A 2QM1A 2QWNA 3MN7A 5AQPA 2GWKA 3VEVA 4EHUA 3FLCO 4PKIA 1D4XA 1KAZA 5E84A 1J6ZA 3VEYA 3QICA 2YJEA 3U8XA 1U2VA 3MK6A 3UKRB 3R6MA 5FPNA 1Z05A 4CZFA 4CZMA 3D7EO 5F1XA 3ZX3A 2E1ZA 2P9UB 1G99A 2P9KB 4FPBA 4C23A 1X3NA 1NGFA 2AP1A 1C0FA 1JCFA 5AQWA 2E2NA 4MLHA 3QFPA 2I7PA 4H0PA 3WUHA 3M3ZA 4BC3A 4K43A 3H1VX 3UE5A 3S41A 4F9OA 3G25A 4BR0A 4CZGA 2E2OA 4H0YB 4PL8A 2PBDA 3MN5A 4EHTA 4BVPA 4CD3A 2YI1A 3CERA 4B1YB 3FFKB 4H5TA 2P9NA 4FWRA 2CH6A 5I9EB 1RFQA 3O8MA 2F9TA 4FWMA 2CGLA 3CQYA 1ZXOA 3GG4A 3GE1A 2Q31A 3VGKA 1SQKA 4H03B 3RSEA 2ZWHA 1U2VB 4BGBA 5BRFA 2QWLA 5TKYA 5KQ8A 4B1XB 1NLVA 4CZIA 4FWSA 4K25A 4H0OA 4NO7A 1NGJA 4HWIA 5AZIA 1T44A 3WXJA 4ISGA 3CJCA 3VF6A 1NWKA 3R8EA 4RWTA 4BC4A 4DHYA 2YCHA 4H0VB 1HKGA 4A61A 1RDWX 1BG3A 4FWLA 4J8FA 3VENA 1YAGA 2I7NA 4Z94A 4B1ZA 5EXWA 4JD2A 3BP8A 3CJBA 1XUPO 4BRQA 2Q0UA 4BRGA 1V4SA 1NGGA 2P9NB 3FE1A 4H0XB 1Y64A 3VGLA 3F9MA 1QZ5A 3HTVA 2V51B 3FZKA 1QQNA 4BRPA 4FO0A 3RSEB 4BR5A 3BF3A 4FWQA 2A40A 4B1WB 1YVNA 4MO4A 3ZX0A 3L4IA 1WOQA 5KPRA 4CD1A 2GEMA 5KPZA 2BTFA 4A62A 5AZIB 3H45C 1HX1A 4L3QA 2P9UA 3L6QA 3O1WA 3SMPA 3DXKA 2QWMA 1NGAA 4BGAA 3IDHA 3B8AX 2FSKA 4JD2B 4AM7A 5AQFA 1Z6RA 3AARA 5AR0A 1HUXA 4FWPA 2QW9A 3TU5A 5FPEA 2H3GX 3A0IX 3D2FA 4DCHA 5AZJA 3AY9A 3LDLA 2FXUA 1SAZA 4ISEA 4CZLA 3WT0A 4E1JA 1BU6O 3VEOA 4M7YA 4BRHA 3U9ZA 3VPZA 2QWQA 1IJJA 3ULEA 1JCGA 3HBTA 3CJ7A 5JICA 1BOTO 4DQ8A 1HJOA 2E2PA 1KAXA 3LDOA 5BPLA 3GL1A 2ASMA 2YHWA 3EN9A 4QS7A 4WYBA 3SLCA 3P4IA 4CJ7A 2F9WA 5AQRA 1BWFO 4FL9A 1HKCA 2V7YA 4O8KA 4I6MB 1XC3A 1S22A 3EL2A 3EO3A 3KHYA 4GNIA 1RGIA 1HKBA 3DXKB 1QQMA 1NGDA 1GLFO 2GELA 4B1UB 1GLJO 1S3XA 3U4LA 2D1KA 3H46O 3ZEUA 3D2FB 5AZJB 3J8AA 3AAPA 2J4RA 1GLAG 4IJAA 2VYPA 3WEEA 4BR2A 5AQSA 2HF3A 2E1YA 2V52B 3QB0A 2P9SA 2FSJA 2IVNA 4MO5A 2P9IA 1ZBSA 4NB4A 3CI5A 3FZHA 3HM8A 4EFHA 1MWMA 2OANA 3FZMA 3ULEB 4K42A 4WQ5A 3LM2A 3HSCA 4RCHA 5AQGA 3O5BA 1BA0A 3I33A 3A5MC 4BRAA 2HF4A 3EZWA 1KAYA 4XH5A 2KHOA 3IUCA 3LDPA 1C0GA 3ZETA 5JLHA 3KZBA 3O08A 5AQHA 1ESVA 3BF1A 4PKGA 1LOTB 4BR4A 5ELZA 1MWKA 4AM6A 3VERA 3ZEUB 4BRNA 5BREA 3ATUA 5AQQA 2EWSA 3ENHA 1QHAA 3MN9A 5F0XA 5AQIA 1U6ZA 1NGIA 3WXIA 4H5VA 3VEWA 3SK3A 2YHYA 2IVPA 3WEEB 5JMVA 3LDNA 2P9SB 2A5XA 3UKUA 2P9IB 2ZGYA 1DEJA 3CJ1A 1NGHA 2PAVA 3DAWA 2W40A 4YDUC 4BRIA 3FZFA 2P9PA 4IZ9A 4DB3A 2FF3B 3H3OB 3C7NA 4BRDA 1IG8A 5EOYA 2NZTA 1X9JA 4JHDA 2IVOA 3U9DA 4BRFA 1BO5O 4JAXA 3CJAA 2V7ZA 4FPAA 3ZETB 3VF2A 4XH4A 2D4WA 4EIAA 3KVGA 3QMLA 4I6MA 3M1FA 5BRDA 1GLEG 3H3NO 5BRHA 3QDKA 3HZ6A 2P9LA 1Q18A 4B9QA 4MLEA 1QZ6A 1E4FT 1BA1A 2W41A 3UKUB 5AQZA 3DWLA 3W3DA 5FPMA 1MA9B 2D0OA 2Q0RA 3ID8A 4K41A 3EKSA 4BC5A 2GUPA 4H0TB 1H1VA 4FOIA 2P9PB 3VF4A 4XEIA 2NLXA 2A41A 1JCEA 3VEXA 3C7NB 3ATVA 4CBXA 3ZX2A 3GDQA 4BRMA 1QQOA 3I8BA 4Y0WA 4JHDB 4WQ4A 1NM1A 1T6DA 3IMXA 4FWKA 5BN9A 5EY4A 2CGJA 4BR9A 5AQMA 2A3ZA 5AQOA 3CHWA 2FLOA 2HOEA 4BREA 1ATNA 1NBWA 3MMVA 3O4WA 4A2AA 4BR7A 3O6WA 3R9PA 2P9LB 1R59O 3MDQA 3LDQA 4CZHA 5AFUH 3VETA 1E4GT 3CQXA 3FR0A 2E88A 4BRKA 2QXLA 5ADXH 4ISFA 4IO8A 4WQ5C 4FSVA 3SJHA 4CI6A 5EVZA 5BR9A 2QWRA 5E26A 1DGKN 2ZGZA 4JNEA 4CZKA 3A5LC 3L0QA 4BG8A 1NGCA 1EQYA 3BEXA 1LCUA 2VCPA 1BDGA 3SMSA 1CZAN 2DPNA 3H1QA 4CZEA 5CE3A 4CBWA 2UYTA 4M7XA 5BPNA 3D2EA 3TPQA 3CETA 5AQXA 2FSNA 4BROA 3DXMA 1NGBA 3LM9A 3WXLA 1SZ2A 4IXCA 1P8ZA 2ZF5O 3WXKA 5KQDA 3IFRA 3WQUA 4H5WA 4O5FA 1HLUA 1YXQA 4GY2B 4RTFD 1WUAA 3FZLA 2YJFA 2FF6A 5FPDA 1DKGD 1GLLO 3BUZB 4FWNA 4PL7A 5AQKA 2BUPA 3CJ9A 4FOEA 3FGUA 1TUUA 4H5NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BPMA 5BN8A 4X64K 1TKXA 4BWJA 1UAXA 4XH1A 4Z0UA 5JENA 2O8CB 2YKNA 1K8KA 3NF6A 5HRRA 4B3TK 3CYMA 2CH5A 5B8HA 1V4TA 3ZSXA 2X6SA 1C1CA 3LALA 2RE2A 4B9NA 4HTLA 4BC2A 5AQNA 3JS6A 4IG0A 2B6AA 3VESA 3ZT0A 1F21A 4CEEA 1NK7A 3CPWM 4KHNA 2AA4A 1GLDG 4YOWA 2ASPA 2E2QA 3V9UA 2LI7A 2HMPA 1WLJA 1OKJA 2IAJA 4IDHA 3THYA 2LSNA 2NY9X 1ZYWA 4IJNA 3TARA 3TABA 2YV0X 4CHNA 1XQSC 1K9MO 2IC3A 2F8TA 4OPAA 1VQNN 4IOCL 4CVNE 3S3NA 2Q1NA 1WB9A 1T7BA 4EZ6A 3MCPA 3JYTA 2XY8A 2O8FA 4QS9A 5AQTA 3CC7N 1NGEA 2ITGA 4CJPA 4DR5K 3VOVA 2ITMA 4YDUA 3KK2A 4JRQA 4CEDA 4LC9B 3KD5E 3SQ0A 1D9DA 1HNIA 4JK9A 2P9KA 4KTWA 4JK7A 4BRCA 3QBWA 1AHOA 1KCFA 1S6QA 4ID1A 1KD1O 4QCLA 4CIFA 3RMCA 4RW9A 2X78A 3TTDA 1WAJA 1FXXA 4OJRA 4C1NK 4FWOA 3ENOA 4GW6A 3OYMA 3ZSWA 3IAYA 3PSIA 2QWNA 2IDOA 5AQPA 3PX0A 1YJNN 3G10A 1TV6A 3SUPA 4PKIA 1NKBA 2OPSA 2VGMA 3NH1A 2KJAA 5E84A 3VEYA 1EX4A 5GAHP 4BE2A 2ATQA 3WNEA 3R6MA 1DT9A 3OBWA 5FPNA 4AH9A 2W6LA 4DV7K 1TK5A 4CZFA 4CZMA 3D7EO 3V9WA 4LFAK 1C0FA 4A5BA 2KBJA 3WUHA 3S41A 3K5OA 2HSTA 5HRNA 2PBDA 4U7BA 4CD3A 2G8HA 2BGGA 3ZLJA 1SKWA 1VSJA 1VAZA 3E1YA 1BIUA 5M1OA 3KOXA 3HO1A 2QXFA 1ZXOA 4H03B 4N41A 1D8YA 1ZYVA 1IV0A 4PQUA 5KQ8A 4FM2A 2F96A 3ISNC 4FJ7A 3D6RA 4NO7A 2YEOA 2PY5A 4HWIA 1REVA 1NK5A 1QS4A 3VF6A 2W00A 3FFIA 3L3UA 1FKOA 3TAPA 4H0VB 2JGUA 3R2VA 1BG3A 1K8BA 4O0JA 4B1ZA 5HBMA 2F4VK 3QEXA 4JD2A 1BIZA 5MLCQ 1ZBHA 2Q0UA 2EHGA 1NGGA 2WBNA 4H0XB 4CQKA 3HTVA 4WFBL 2P5GA 2E0HA 5LMNK 1NOYA 3RSEB 4YORA 5D3GA 1TL3A 3L4IA 1WOQA 2GEMA 5AZIB 4I9LA 4V19S 1HX1A 4AHTA 2P9UA 3L6QA 1WSEA 2R7YA 2OZMA 3I8DA 4Z4HA 1PTXA 2YBRC 3AA3A 3B8AX 1C6VA 4CGGA 1JLBA 4DTSA 4AM7A 4CIEA 2HHVA 4FWPA 3SYZA 2H3GX 4CEBA 4Z4IA 3O9SA 1JLFA 1KFDA 3AY9A 1SAZA 4ISEA 4CZLA 4BE0A 2A1SA 4XJXA 4FLWA 1SEGA 1RBRA 3AVHA 4M7YA 1Y97A 4BRHA 5FRNA 2FBVA 4E1MA 2G8KA 4KV8A 3VPZA 4DSLA 2GL1A 1FKPA 5C10A 1IJJA 1YVUA 3ULEA 1GPTA 1JCGA 3HPGA 2KZZA 1YHQN 1L3TA 1BOTO 1EO1A 5GIOA 1HJOA 1NRAA 3MECA 2LT8A 1XHXA 3L2VA 1HKCA 3WNFA 1HNVA 4CFDA 2LY5A 1W97L 3AA2A 3EO3A 2F8SA 1GLFO 1TL1A 1X1PA 3AO3A 1GLJO 3SV3A 3D2FB 5AZJB 4FJIA 2HF3A 4UJ0A 3L3VA 2JDQD 4CJTA 2IVNA 4MO5A 2P9IA 4LF9K 1MWMA 1TKDA 2OANA 1IBMK 1MR4A 1NRBA 3E9OA 3E7UX 1WBBA 1X9SA 5CY4A 1S72N 4GV9A 2G2KA 1N4NA 3V1OA 1BA0A 3I33A 3E7RL 1KAYA 1EXQA 3LWLA 3DRPA 4JLHA 3ZETA 1IBLK 4AILC 2HB5A 2OZSA 4N56A 1LOTB 3TSPA 1JL2A 3MN9A 3L4QA 1RT7A 2XO7A 4OGCA 1HYVA 3LDNA 2YNHA 2A5XA 3OTOK 4E0DA 3ZSYA 4NLBA 2ZGYA 1KVCA 3CJ1A 2XHBA 2HMIA 3C95A 4E19A 1W2BM 4JKDA 3KLEA 3PY8A 5JS2A 4IZ9A 1ZYQA 3TAQA 1YITN 3OW2M 4HCCA 1B3CA 1N33K 3C7NA 1JLGA 4OX9K 2MZ0A 3SCXA 4KYPA 3WXMB 1X9JA 2IVOA 4GV3A 3U9DA 1BO5O 4JAXA 2V7ZA 4FJMA 3O3GA 2QEXN 4XH4A 3ZCMA 4EIAA 3KVGA 2D0CA 4GVEA 3V6DA 3SJJA 3ALYA 1L3VA 3QDKA 5HRSA 4UQGA 2NRVA 3C94A 4W5RA 2HHIA 3UKUB 2E5LK 3DWLA 4JI5K 1VK0A 1P90A 4FVMA 2ZQBA 3ID8A 1RT2A 4B9TA 4DV5K 4Z4GA 4MQ3A 1LQQA 3AV9A 4FOIA 4KO0A 3VF4A 1YJ9N 2ZJQL 1D9FA 2A41A 3BZKA 3J7ZO 2I5JA 4CBXA 1Q7YO 2LJMA 5TKWA 4JK8A 2RKIA 5I3UA 1YTAA 4H8KA 4DS5A 4M41A 3HVRA 1XWLA 2NNWA 5BN9A 5EY4A 5AQMA 5AQOA 4AHVA 1VRUA 4O5BA 5HL7L 1ZBUA 3NH0A 1NBWA 1UOCA 3O4WA 1NG9A 4BR7A 2F7TA 4CHZA 4M3WA 2P9LB 3VQ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BPM A;  5BN8 A;  4X64 K;  1TKX A;  4BWJ A;  1UAX A;  4XH1 A;  4Z0U A;  5JEN A;  2O8C B;  2YKN A;  1K8K A;  3NF6 A;  5HRR A;  4B3T K;  3CYM A;  2CH5 A;  5B8H A;  1V4T A;  3ZSX A;  2X6S A;  1C1C A;  3LAL A;  2RE2 A;  4B9N A;  4HTL A;  4BC2 A;  5AQN A;  3JS6 A;  4IG0 A;  2B6A A;  3VES A;  3ZT0 A;  1F21 A;  4CEE A;  1NK7 A;  3CPW M;  4KHN A;  2AA4 A;  1GLD G;  4YOW A;  2ASP A;  2E2Q A;  3V9U A;  2LI7 A;  2HMP A;  1WLJ A;  1OKJ A;  2IAJ A;  4IDH A;  3THY A;  2LSN A;  2NY9 X;  1ZYW A;  4IJN A;  3TAR A;  3TAB A;  2YV0 X;  4CHN A;  1XQS C;  1K9M O;  2IC3 A;  2F8T A;  4OPA A;  1VQN N;  4IOC L;  4CVN E;  3S3N A;  2Q1N A;  1WB9 A;  1T7B A;  4EZ6 A;  3MCP A;  3JYT A;  2XY8 A;  2O8F A;  4QS9 A;  5AQT A;  3CC7 N;  1NGE A;  2ITG A;  4CJP A;  4DR5 K;  3VOV A;  2ITM A;  4YDU A;  3KK2 A;  4JRQ A;  4CED A;  4LC9 B;  3KD5 E;  3SQ0 A;  1D9D A;  1HNI A;  4JK9 A;  2P9K A;  4KTW A;  4JK7 A;  4BRC A;  3QBW A;  1AHO A;  1KCF A;  1S6Q A;  4ID1 A;  1KD1 O;  4QCL A;  4CIF A;  3RMC A;  4RW9 A;  2X78 A;  3TTD A;  1WAJ A; 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