3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
3FLCO 1NGAA 3LDOA 4BC3A 3CJ1A 3O4WA 4BRNA 1GLDG 3M3ZA 3VEOA 1RGIA 2YHWA 4YDUC 2QWLA 3M1FA 3O1BA 1XQSC 4JD2A 1RDWX 1K8KB 1TUYA 3MDQA 2YHXA 4DQ8A 2UYTA 2Q31A 1HKCA 3BUZB 4BR4A 2P9LB 3EN9A 3HTVA 5AQGA 2CGKA 3BP8A 3IFRA 5EY4A 4FWPA 1X3NA 5JLHA 5F1XA 4PL8A 2P9NB 3VEWA 2HOEA 3UKRB 4CZFA 2P9SB 4WQ4A 3I33A 3BF3A 3VEVA 2WUSA 4LC9B 1QQMA 2NRHA 3ZX3A 4H0VB 5AQOA 3VF6A 5EXWA 1RFQA 4PL7A 4B1XB 1S3XA 5AQYA 3AAQA 3EKSA 3QBWA 4EIAA 5BRFA 5AQRA 1H1VA 2BTFA 4MO5A 5AFUA 2P9UA 2E20A 1YXQA 4BRGA 3VGMA 4BRFA 1YAGA 4CBUA 4J8FA 5AQXA 2E1YA 5B8HA 5AQSA 5AZJA 2E2NA 2V52B 4XH1A 4BRAA 3WEEB 3DXKB 4BROA 3A5LC 4YDUA 4CBXA 4IJNA 5AQIA 3SMSA 1MWKA 3TU5A 2FSJA 2P9KA 1GLAG 4FOEA 4FO0A 1DEJA 4A2AA 4BVOA 3DXMA 1Z6RA 2Q1NA 4DCHA 5FPEA 2CH6A 2D4WA 3H1VX 5AQQA 4FWKA 4EAHD 4EHTA 2CH5A 2AA4A 1X9JA 2A3ZA 4BRPA 2J4RA 1T6CA 3DJCA 4PKHA 5KPTA 5KPRA 3ULEB 1JCGA 1GLLO 5TKYA 5ADXH 3SK3A 4H5TA 1K8KA 3FGUA 3MN6A 4CD3A 4FWNA 1Y64A 3D7EO 2P9LA 4ISGA 3H1QA 2HMPA 3VOVA 4FWRA 5AQZA 1QZ5A 5AQKA 4BRKA 4CI6A 2HF3A 2QXLA 1KAYA 3O80A 1DKGD 1T6DA 4FWQA 3GG4A 4M7XA 1JCFA 5AQWA 2P9NA 5AQPA 2P9SA 3AAPA 4MLEA 1ATSA 5AQMA 4QS9A 2QWOA 2ITMA 4JHDB 4PKGA 4H5VA 3IMXA 3MMVA 1ZC6A 3ZEUA 1HJOA 3DAWA 1QQOA 4EFHA 4MLHA 3ZETB 3LM9A 3BEXA 3VPZA 1LCUA 3F9MA 1WUAA 4B1YB 3H46O 4O8KA 4CZKA 4A2BA 2Q97A 2VCPA 2YI1A 1GLJO 1TYQA 5ELZA 3DXKA 3WEEA 1NM1A 4BR2A 1NGCA 4JN4A 2D0PA 3IDHA 3R9PA 4DB3A 5KQDA 1NMDA 1NGEA 2GTDA 4BRCA 3CJCA 4GNIA 3C7NB 1HLUA 3JS6A 2A6AA 3L0QA 3GOIA 4BC4A 4H03B 5F2RA 4BR7A 4JAXA 4CZLA 2E2PA 3L6QA 2IVOA 1OKJA 1BUPA 2ZGZA 5EVZA 1NLVA 4C23A 5LJWA 2ZGYA 3EZWA 3QMLA 3ENHA 2F9WA 1NGGA 5BPNA 4H0YB 4M7YA 1BG3A 5FPDA 4BGBA 4K43A 2ASOA 2IVNA 3GDQA 5JLFA 2V7ZA 1NGFA 3QFPA 3B8AX 1ATNA 1SAZA 3FR0A 3EL2A 3WXLA 5AZIB 4CZMA 2A5XA 2IVPA 4H0PA 3DWLA 4K42A 3TPQA 3MK6A 4B1UB 3WQTA 5BRHA 1NGJA 3JXUA 4IJAA 4JNEA 3VF2A 1BDGA 5BR9A 4H5WA 2IIRA 3GE1A 3ZX2A 3KHYA 3UB5A 4BC5A 4FPAA 3WXJA 2GELA 3QBXA 5BRDA 3FZFA 2YJEA 1HX1A 1U2VB 2HF4A 4WQ5A 2FF3B 2V51B 3FFKB 3S41A 2FSNA 4JHDA 4BRQA 2QWQA 2E2QA 3M6GA 3GL1A 3LDNA 3VERA 4BR5A 3ZX0A 3CQXA 4CZGA 2GWJA 3WQUA 4FL9A 2ZF5O 1J6ZA 3D2EB 1EQYA 3U8XA 5E26A 3U9DA 3ID8A 2NLXA 4QS7A 4AM6A 3VETA 2KHOA 3CI5A 2A41A 5BPMA 4BRDA 5ADXA 4BRIA 2I7PA 5KPZA 1X3MA 1C0FA 5AQUA 3C7NA 3QFUA 4XH5A 3R8EA 4XEIA 3FE1A 2E1ZA 2YJFA 3D2FB 1GLFO 3AY9A 3VEYA 5KQ8A 3OHRA 4CD1A 4QS8A 5EOYA 4H5NA 3H45C 3RSEB 2NZTA 2GUPA 1XUPO 3FZKA 3WXKA 1HPMA 3UKRA 3VEXA 3A5NC 5AZIA 4K25A 4B1ZA 2H3GX 4CZHA 1V4TA 1LOTB 5BN9A 2EWSA 4DHYA 3QDKA 3CJ9A 3FZHA 3C0BA 4E1JA 1BWFO 2GWKA 4IXCA 4BQLA 1YUWA 1KXPA 1MWMA 1WOQA 1R59O 4O5FA 3LM2A 4BG9A 1NBWA 4FWSA 4BRMA 1Q18A 3HBTA 1CZAN 4BVPA 5F0XA 1BOTO 3UE5A 5AQLA 1ZBSA 3UKUB 4WQ5C 2D0OA 2QWNA 5AQTA 4K41A 5JMVA 2BUPA 3KZBA 4BREA 1GLBG 2P9IB 2OANA 4RCHA 4CJ7A 3VEZA 3U4LA 3VENA 3I8BA 3MN7A 3D2EA 4PKIA 2D1KA 5AQVA 3CERA 1NGIA 3VF4A 4CZEA 2QM1A 1SZ2A 3MN9A 2A42A 3EKUA 4H5RA 3O8MA 5FPNA 5FPMA 3G25A 3CIPA 1MDUB 2CGJA 3O5BA 3O6WA 3VESA 4BRHA 3A8YA 2FF6A 5E84A 3SJHA 4B1WB 3SLCA 3ULEA 4Z94A 4MO4A 1XC3A 3HZ6A 5BREA 4ISEA 4KBOA 4ISFA 3FZMA 4NB4A 4CZJA 3D2FA 3SMPA 4AM7A 2FSKA 3IUCA 4FSVA 1BA1A 2W40A 2F9TA 4RTFD 2P9PB 5EX5A 3J8AA 5I9EB 1NGDA 1BA0A 1ESVA 2QWRA 4IZ9A 3LDQA 1V4SA 2YCHA 3RSEA 5JICA 2A40A 4H0XB 1DGKN 4BQZA 3P4IA 2FLOA 4RWTA 3CJ7A 3KVGA 3O08A 1D4XA 4CZIA 3VGLA 1QHAA 4FWLA 1HKGA 3LDPA 1IG8A 1BO5O 3H3OB 3ZETA 3ZEUB 3EO3A 4I6MB 1SQKA 3BF1A 2PAVA 3ATUA 4BR9A 4M63C 2Q0RA 5AQHA 1E4FT 3UKUA 4GY2B 3WT0A 4EHUA 2P9IA 1HUXA 1TYQB 4BC2A 5AQJA 5AFUH 4H0TB 2Q0UA 1NGBA 3WUHA 3FZLA 1YVNA 1KAZA 3O1WA 4F9OA 4L3QA 1HKBA 4IWVA 4BGAA 2QWPA 1GLCG 3QICA 1S22A 3H6EA 2QW9A 1BU6O 5AQNA 2V7YA 4JD2B 2ASPA 1QZ6A 3W3DA 2FXUA 1NWKA 3AARA 3LL3A 2PBDA 3MCPA 2W41A 2QWMA 5CE3A 5BPLA 5AQFA 3VGKA 2CGLA 3HSCA 4FOIA 2VWBA 3H3NO 4NO7A 2P9PA 4FPBA 4H0OA 2Q2RA 3L4IA 3A5MC 2YHYA 4BR0A 2I7NA 3CQYA 3QB0A 2ZWHA 5LY3A 1U2VA 2E8AA 4XH4A 3WXIA 1U6ZA 2AP1A 4IO8A 3MN5A 3HM8A 2P9UB 4FWMA 3U9ZA 4A62A 1NGHA 3LDLA 4HTLA 2ASMA 4WQ4C 1QQNA 2E88A 3A5OC 4CBWA 5AZJB 3ATVA 3CJAA 4BRLA 1ZXOA 1P8ZA 3GBTA 2E2OA 4Y0WA 5LJVA 1TUUA 4I6MA 3ENOA 1JCEA 3CETA 4A61A 4BG8A 3HI0A 4HWIA 4WYBA 1GLEG 3W0LA 4B1VA 2VYPA 1IJJA 1C0GA 1E4GT 5AR0A 3CHWA 4B9QA 5BN8A 1MA9B 3R6MA 1ATRA 1KAXA 4FWOA 3CJBA 2P9KB 1G99A 3A0IX 3DXMB 1T44A 1Z05A 2DPNA 2Q36A 2GEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FLCO 3LDOA 2JDQD 1WBDA 4F4KA 1VSKA 3QEVA 1W2BM 1JL2A 1I94K 5SZTA 2VQFK 4YY3K 3VEOA 4NCBA 1XNQK 3LANA 2KBJA 4YDUC 1VQ8N 3O9TA 4FJMA 3M1FA 2DY4A 3ULDA 4JD2A 5KGWA 4J2DA 4XIUA 4DQ8A 2Q31A 4FJIA 1T7AA 3BUZB 3EN9A 4X65K 3D0PA 2CGKA 2X74A 5EY4A 3TWHA 3O9RA 5JLHA 2OTLN 1JL1A 3UKRB 4Z4EA 1U4BA 2P9SB 4WQ4A 3V9XA 3AVIA 3NF8A 3T7ZA 2KZZA 3VTHA 5K14A 3ZX3A 2HVIA 4W5OA 1YHQN 3L56A 4IEIA 4CJPA 4W5NA 4ILHA 4B1XB 4ILJA 3QBWA 3LAMA 5BRFA 3V4IA 2BTFA 4PY5A 3OS2A 2EX3A 4LF7K 1YXQA 4FJ9A 1KVAA 3PV8A 1YAGA 1U48A 3CMAN 1RT5A 1Q8IA 5AZJA 4JV5K 3S5TA 3E7RL 3P1GA 4BROA 1IBLK 1B9DA 3V9ZA 4IJNA 2RE2A 1YJNN 5AQIA 2ITGA 2ZE2A 3SMSA 5M1PA 3TU5A 2FSJA 1RBSA 1RNHA 1QHTA 3ZT0A 4BY9C 3L2WA 3E9LA 2N66A 2Q1NA 2IDOA 4JKDA 2D4WA 5AQQA 4CEBA 4YOWA 4EAHD 3CXCM 2XY5A 2X6NA 1IKXA 2AA4A 1W7AA 4M3TA 2X6SA 4PKHA 4CF8A 4E89A 3ULEB 1JCGA 3EEQA 1TAUA 4DV6K 4JKGA 1A5VA 3MN6A 1BI4A 1T8EA 3SCXA 4ISGA 2NNWA 3VOVA 2O8EA 4YOUA 5AQZA 3HVRA 3PSIA 2HF3A 2QXLA 3O80A 1I3AA 4IO9L 2OPRA 5AQWA 2P9NA 5AQPA 4MLEA 1W97L 3BY5A 1S1UA 1VSHA 1S1TA 2QWOA 1N6QA 2ITMA 4LF8K 3CCUN 1WSGA 4DV0K 4PKGA 4CECA 3WXMB 2HHSA 3ZEUA 3E66A 4B8AB 3DAWA 2OZSA 3QLHA 4O5BA 4CFBA 1LCUA 3AVCA 3H46O 4O8KA 3KHWA 4WF9L 3CF5L 4CZKA 5J2QA 2HHHK 2VCPA 1E3MA 4M3RA 5ELZA 4BR2A 3KC6A 3VQEA 3NE6A 4JN4A 3R9PA 5KQDA 3V1QA 3E01A 2VY6A 2GTDA 1BRZA 3GOIA 3SQ4A 4BR7A 4N56A 4QOZB 1VSEA 3ENHA 3AVBA 1JJ2M 2WBNA 4H0YB 1IO2A 3SV3A 4UY8O 4DSJA 4M3XA 3P31A 3J7ZO 4L8RB 1RT1A 3K5OA 1JLEA 3QFPA 1ATNA 2I5JA 5AZIB 3K9JA 3MCAB 4H8KA 2IVPA 2HHVA 3THWA 3MK6A 1K6YA 1NGJA 3JXUA 4JS4A 3KJVA 4LF9K 3GE1A 3F5TA 1EKEA 1YJ9N 4CFDA 1B7DA 4FPAA 1NK9A 3QBXA 3G0ZA 2G8IA 3FZFA 2Q3SA 2HF4A 3SNNA 1HYSA 5HOOA 1I2UA 1RILA 1YITN 3CC4N 2E2QA 3GL1A 4LH4A 4Z4CA 3N4QA 1P00A 2YKNA 3VQPA 4CZGA 4B8CA 4DTUA 2GWJA 1UA0A 3Q7CA 3DLKA 2ZF5O 1WB9A 3NGZA 2RN2A 2BE2A 2DFHA 3KLHA 5E26A 4CF0A 4QS7A 2IGIA 4AM6A 1ZBHA 3VETA 2KHOA 1QQCA 1JXCA 4CESA 4BDPA 4YOTA 3MEDA 4BRIA 4YOVA 4B9TA 1N8RO 3SZ2A 3SAFA 3C7NA 5HP1A 2Z1JA 4G1QA 1NK0A 1KFDA 4XEIA 3AO4A 4DR2K 4EZ6A 4JS5A 1S1XA 3T1AA 1XHXA 3D2FB 3M8RA 2D56A 4C8MA 4B9VA 4CJEA 3SQ0A 4GVMA 4FLYA 1N36K 3ZSYA 1VRTA 1YF5L 3F73A 3SUOA 3HJFA 1QSYA 2NZTA 1UAXA 3A5NC 4O0IA 4R79A 4B1ZA 5HRSA 3DLHA 4FJLA 4YFUA 4Z4HA 2ASCA 1B3CA 1VSLA 4RW6A 1HMVA 5C2FA 1YUWA 3VTIA 3QESA 1WOQA 3MEGA 2NRVA 2HBMA 5TKWA 1LQIA 3RRGA 2O8CB 1EX4A 4BRMA 4DTJA 1SKSA 3HBTA 2ZJQL 5H1SQ 3G6EN 1ZBSA 4WQ5C 5AQTA 3KZBA 4RCHA 1IH7A 1LWFA 3CCEN 4JKEA 2WFBA 5C10A 5J2PA 2YIPA 3PX6A 3MN7A 2G8FA 4LH5A 3CERA 3NH2A 1ASWA 1OZZA 3VF4A 4OLBA 2QM1A 1SZ2A 2XHBA 2DFEA 1SL0A 2ATQA 4N47A 3NAEA 3O5BA 3O6WA 2ZJRL 4BRHA 3HPGA 3SJHA 4B1WB 3SLCA 4Z94A 1IG9A 1OMYA 4BWMA 4ZTJA 5SWMA 4YOXA 4CZJA 1T1TA 4FJJA 3THYB 3IUCA 3AVLA 2W40A 1BI4B 3KWIA 3O4NA 4RTFD 4OPJA 4E0DA 1TK0A 4JI2K 1ESVA 4DS4A 2QWRA 4IZ9A 1V4SA 3RSEA 5JICA 5GIPA 4CFCA 2Y1JA 3QEIA 3RRHA 4BQZA 3U3GA 4J2BA 3VQDA 3CJ7A 3QEPA 3KVGA 4KHPK 4KHNA 3SAHA 3RTVA 3BGRA 2P5GA 4FWLA 3T1YK 3A2FA 1HKGA 3F2KA 3KP0A 4B9LA 3CFRA 3ZEUB 4ELVA 4DV7K 1Q82O 1K8AO 1VQ5N 3TTFA 2MZ0A 2LSNA 3PX4A 2P9IA 3SJJA 4W5TA 4C8LA 1RT4A 1HUXA 3RR8A 5AFUH 2Q0UA 3C6TA 4CHQA 2GL1A 4I9QA 4C1NK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FLC O;  3LDO A;  2JDQ D;  1WBD A;  4F4K A;  1VSK A;  3QEV A;  1W2B M;  1JL2 A;  1I94 K;  5SZT A;  2VQF K;  4YY3 K;  3VEO A;  4NCB A;  1XNQ K;  3LAN A;  2KBJ A;  4YDU C;  1VQ8 N;  3O9T A;  4FJM A;  3M1F A;  2DY4 A;  3ULD A;  4JD2 A;  5KGW A;  4J2D A;  4XIU A;  4DQ8 A;  2Q31 A;  4FJI A;  1T7A A;  3BUZ B;  3EN9 A;  4X65 K;  3D0P A;  2CGK A;  2X74 A;  5EY4 A;  3TWH A;  3O9R A;  5JLH A;  2OTL N;  1JL1 A;  3UKR B;  4Z4E A;  1U4B A;  2P9S B;  4WQ4 A;  3V9X A;  3AVI A;  3NF8 A;  3T7Z A;  2KZZ A;  3VTH A;  5K14 A;  3ZX3 A;  2HVI A;  4W5O A;  1YHQ N;  3L56 A;  4IEI A;  4CJP A;  4W5N A;  4ILH A;  4B1X B;  4ILJ A;  3QBW A;  3LAM A;  5BRF A;  3V4I A;  2BTF A;  4PY5 A;  3OS2 A;  2EX3 A;  4LF7 K;  1YXQ A;  4FJ9 A;  1KVA A;  3PV8 A;  1YAG A;  1U48 A;  3CMA N;  1RT5 A;  1Q8I A;  5AZJ A;  4JV5 K;  3S5T A;  3E7R L;  3P1G A;  4BRO A;  1IBL K;  1B9D A;  3V9Z A;  4IJN A;  2RE2 A;  1YJN N;  5AQI A;  2ITG A;  2ZE2 A;  3SMS A;  5M1P A;  3TU5 A;  2FSJ A;  1RBS A;  1RNH A;  1QHT A;  3ZT0 A;  4BY9 C;  3L2W A;  3E9L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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