3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
5AQRA 3ZX2A 3QFUA 2P9IB 4FSVA 5FPNA 4HWIA 4K25A 3H1VX 4H0TB 3C7NB 5ADXH 4BGAA 3MN9A 4CD1A 3FZHA 4DCHA 1GLCG 5KQ8A 5AQYA 1MA9B 5E84A 3ZEUB 2P9KB 3F9MA 4WQ5A 5EOYA 3O8MA 1ESVA 4FWLA 5AQMA 2YCHA 3H3OB 1NGEA 4IWVA 4JN4A 2EWSA 2NZTA 1X3NA 4FWRA 4H0PA 2BTFA 5I9EB 4CZMA 4EHTA 3H45C 4BVPA 3UKUB 4FOIA 2YJEA 3CJAA 2HOEA 2F9WA 4M63C 5AZIA 3M3ZA 3QBXA 2HF4A 1ZXOA 3IFRA 1XQSC 2P9NB 2CH5A 3D2FB 3CJBA 5AZJA 1GLLO 3W3DA 1JCGA 2IVOA 3CJ1A 1NM1A 2FXUA 3EO3A 3FZFA 1JCFA 5JLFA 4IXCA 2CGKA 2QWNA 2FF3B 3FLCO 5LY3A 4K43A 2F9TA 5KPZA 3VENA 2KHOA 3AAQA 4B1YB 4B1ZA 2E88A 3WXKA 2GELA 1NGHA 2ASOA 5FPEA 5AR0A 4ISEA 3O6WA 1C0FA 1V4TA 1J6ZA 3A0IX 4FWSA 1U6ZA 3A5OC 3FE1A 3A5LC 4E1JA 2I7PA 3FZKA 4B1XB 3GG4A 2V52B 1S3XA 4GY2B 3UKRB 2CH6A 1X3MA 3LDNA 2Q97A 3ATUA 2A6AA 1NGGA 4IJAA 1EQYA 3H46O 3L6QA 4BR5A 2I7NA 1Z05A 3WEEA 3AAPA 3FZMA 3R6MA 3VESA 4JHDA 3WT0A 2ZGZA 3LDOA 1KAYA 4BRAA 4H5WA 1CZAN 1LCUA 3H3NO 4IJNA 2E8AA 4XH5A 3DWLA 3B8AX 1HKCA 2H3GX 1NMDA 2YHYA 3UE5A 3FFKB 4BC3A 5BRDA 1P8ZA 3DXMA 2D4WA 4PL8A 5KPTA 1TUYA 4BRKA 1XUPO 4FWMA 3IUCA 4FWQA 3WQUA 2P9SA 3I8BA 3HM8A 1YXQA 4FWOA 1U2VA 4I6MA 3VEWA 2A3ZA 2PBDA 2FLOA 2GUPA 4BRMA 2CGLA 3GOIA 1QHAA 5AQSA 2D0PA 3ULEB 3VETA 2V51B 4J8FA 3WXLA 5AQHA 5AQOA 3QBWA 3QDKA 4H5VA 3DXKA 1YVNA 5BRHA 3VGLA 4MLHA 3ENHA 1TUUA 3SJHA 2WUSA 3GBTA 3S41A 4RWTA 3VGMA 4CZIA 3QFPA 3D2EA 1H1VA 2Q0RA 3CIPA 1HLUA 3EN9A 4EAHD 1HKGA 3ZETB 5B8HA 4BG8A 4H0YB 3CQXA 2GEMA 5KPRA 4IZ9A 2YI1A 1JCEA 2OANA 1GLFO 1K8KA 4H0OA 5AQWA 5AQPA 3JS6A 4K41A 4LC9B 5EVZA 4FWPA 4DB3A 4FPBA 1OKJA 4BRNA 2D0OA 1MWKA 3MMVA 1G99A 3RSEB 1T6DA 4B1VA 3CJ9A 4BRQA 4H5NA 5BR9A 5TKYA 1ATSA 3H1QA 4EFHA 2UYTA 3KHYA 4BREA 1ZC6A 4BC5A 1R59O 3VPZA 3UB5A 1Y64A 2IVNA 2QM1A 4BRCA 3O08A 2P9LA 4H5TA 2QWQA 4ISGA 1NGBA 1DEJA 3VEZA 2P9PB 3MDQA 2Q31A 4CJ7A 3CJCA 4WQ4A 2P9UA 4CZKA 1QQOA 3HZ6A 3U9DA 3WXIA 4BR2A 2W40A 5FPDA 4WYBA 3WUHA 1QQNA 2Q36A 2FSJA 3C0BA 4A61A 4H0XB 4DQ8A 3QICA 2QWOA 5AQNA 2YJFA 3VEOA 3VF4A 1GLDG 4JD2B 1TYQB 3IDHA 4RCHA 4XH1A 4AM6A 2ITMA 4K42A 5AQZA 2FF6A 5AQUA 4BR4A 2A40A 3EZWA 2P9IA 5F1XA 1RFQA 4PKHA 3C7NA 1GLJO 3H6EA 4B9QA 2ZF5O 3ZX0A 4DHYA 4Y0WA 4BRIA 3ZEUA 4B1WB 4CZGA 5AQVA 2P9KA 3CI5A 3SMPA 4CZLA 3FZLA 3VERA 4C23A 4BRGA 4FOEA 2VCPA 3G25A 3GE1A 4JAXA 4BGBA 1BA0A 4BVOA 4CBUA 2E2PA 4BC2A 1WUAA 4A2BA 3M1FA 3VEYA 3D2EB 5BN9A 3DAWA 1E4GT 2ZWHA 4O8KA 4CI6A 1MWMA 1SZ2A 2DPNA 3L4IA 4WQ4C 1ZBSA 5BRFA 3MK6A 4PL7A 4FWKA 4MO4A 5JICA 3KVGA 2HF3A 4H0VB 4ISFA 3A5MC 2P9NA 3HSCA 2CGJA 2VWBA 3D2FA 4HTLA 3VEVA 2BUPA 3I33A 3TU5A 3MCPA 5CE3A 5AQJA 3LDLA 3MN5A 2V7ZA 4BRHA 1SQKA 3VF2A 3LM9A 5LJVA 1BU6O 3ID8A 3LM2A 5AZIB 2GTDA 4MLEA 3EKSA 1WOQA 3QMLA 1Q18A 4PKIA 3O1WA 4FPAA 2J4RA 5AZJB 1X9JA 1D4XA 3BP8A 2NRHA 4FL9A 1GLBG 3AARA 4O5FA 4CZEA 3CETA 5LJWA 2GWKA 2GWJA 3O1BA 3UKRA 3J8AA 4A62A 3VF6A 3BUZB 1NLVA 1DGKN 1T44A 1HX1A 3ENOA 4YDUC 1NGAA 1RDWX 5BPNA 5AQLA 2VYPA 2ASMA 4XEIA 4BR0A 1BUPA 2V7YA 1E4FT 1YUWA 5AQKA 1IJJA 1XC3A 4H03B 4BRFA 1BOTO 1NWKA 1T6CA 2IIRA 5AFUA 1BDGA 2Q2RA 4CBXA 3HBTA 4BR7A 3AY9A 3O80A 4GNIA 3SK3A 2E2OA 2E1YA 2E1ZA 1BWFO 5ELZA 1LOTB 4MO5A 2QWMA 1MDUB 1V4SA 5AQIA 4FO0A 3WEEB 3BF1A 5AQQA 5JMVA 4JHDB 2HMPA 4KBOA 1YAGA 2E2QA 3U9ZA 1GLAG 3OHRA 4CZFA 4Z94A 1BO5O 4QS9A 3BEXA 2NLXA 2ZGYA 3ZX3A 3CHWA 5BN8A 4BC4A 1QZ6A 4BQLA 1BA1A 4JNEA 4F9OA 3ULEA 3DXMB 5AFUH 2E2NA 1SAZA 3FR0A 5F0XA 3EL2A 3CJ7A 1GLEG 3O4WA 1NGFA 2W41A 2P9SB 5EX5A 5EY4A 3LL3A 1KXPA 1U2VB 3EKUA 3GDQA 3FGUA 4I6MB 1QZ5A 3ZETA 4EIAA 3LDPA 4M7YA 4BR9A 2AP1A 1NBWA 5AQFA 4BG9A 3U4LA 1IG8A 5JLHA 2IVPA 2FSNA 2YHWA 3MN6A 3R9PA 3DXKB 3VEXA 4WQ5C 3W0LA 5EXWA 5AQTA 5KQDA 3RSEA 5AQXA 4RTFD 2YHXA 1DKGD 3HI0A 4A2AA 4BRDA 1HJOA 1KAZA 1K8KB 4BRPA 1NGIA 4YDUA 3UKUA 1RGIA 2QWLA 3MN7A 3U8XA 3JXUA 2E20A 4CBWA 3O5BA 3L0QA 1NGJA 3A5NC 3WXJA 4NO7A 1C0GA 1BG3A 3QB0A 3SMSA 2FSKA 3LDQA 4AM7A 4BQZA 2P9PA 2QWPA 4IO8A 2Q0UA 1HPMA 4XH4A 2A42A 3KZBA 1ATRA 3BF3A 2QWRA 3TPQA 4FWNA 5FPMA 2QXLA 3CQYA 5BPLA 1HUXA 3D7EO 1NGDA 2D1KA 1ATNA 5E26A 1HKBA 1QQMA 4QS8A 5F2RA 4CD3A 4QS7A 3GL1A 3IMXA 3R8EA 2P9LB 1TYQA 3CERA 3M6GA 4JD2A 5ADXA 4EHUA 1KAXA 4H5RA 1Z6RA 3ATVA 4M7XA 3VGKA 4BROA 2P9UB 2PAVA 4CZHA 2Q1NA 1S22A 3HTVA 2QW9A 3WQTA 1NGCA 3SLCA 4CZJA 2ASPA 4BRLA 2A5XA 3DJCA 4B1UB 4L3QA 3A8YA 5BPMA 2AA4A 4NB4A 3VOVA 2A41A 5AQGA 5BREA 3P4IA 4PKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TAUA 1U4BA 3THYA 1YT3A 3V9WA 3ZT3A 4K25A 4CJSA 1VSJA 4M3UA 3FZHA 2HVHA 5AQYA 2B5JA 2WFBA 2DFEA 2HB5A 4YORA 3WNGA 1ESVA 4BDZA 3PUFA 2VWJA 2YCHA 1NGEA 1KLMA 4IWVA 2RPIA 4FWRA 2BTFA 3AVJA 4OPKA 4EHTA 2HHSA 4Q5VA 3BGRA 2F96A 4FJGA 4NCAA 3OW2M 3M3ZA 1D9FA 3IFRA 1XQSC 2P9NB 2CH5A 3TWHA 1XNQK 4G9ZA 4JKGA 3W3DA 2IVOA 4LF6K 2FXUA 1JCFA 2CGKA 5KI6A 2FF3B 1S9EA 2F9TA 2E0HA 3NF6A 4B1ZA 4BDPA 2E88A 3S3MA 3F73A 1NGHA 4X66K 5FPEA 3NHGA 1XNRK 4X64K 2F7TA 4ISEA 2GV9A 4KO0A 4GV3A 3RRGA 5FRNA 4B9UA 4M45A 5AJ3K 1J6ZA 2YIOA 3A5OC 2PYJA 3FE1A 1SEGA 3T1YK 1B92A 1KTQA 1NK7A 3KOWA 3UKRB 2CH6A 3G4SN 3K5NA 1Y97A 3ATUA 4FW2A 1LWFA 4C1NI 3WNHA 2I7NA 4U67L 3O3FA 2C1IA 3J7YP 1JZAA 3FZMA 4KH4A 3VESA 4JHDA 3EZ5A 3TSUA 1BGXT 3LDOA 2D0AA 2OTJN 1LCUA 3J7AP 4DTNA 1EO1A 3ZT2A 1NK8A 1C0TA 1HKCA 4GVEA 4BE1A 2Z1JA 3P38A 3G6EN 4Z4HA 5BRDA 1S1XA 1RT7A 2KKZA 4OJRA 4CJ5A 3PSIA 2D4WA 4PL8A 5CR4A 3L56A 3CCQN 1ZUTA 1XUPO 2O4IA 1VSFA 2IAJA 3E7UX 2G8FA 4B08A 3RMBA 1G15A 3I8BA 3D45A 4LH5A 1VQON 5T7BA 1U45A 3V81A 3O9RA 3OVNA 5FLXO 2A3ZA 3C6AA 2PBDA 2CGLA 4KHUA 1VSKA 5AQSA 2D0PA 4F4KA 1U04A 4HHFA 3ZLJA 1Q8IA 2IOCA 4J8FA 5AQHA 1W0HA 2KYQA 1W7AA 1YVNA 1HQEA 4YOUA 3VQAA 3ENHA 2WUSA 3DLKA 2Y1IA 1D8YA 3GBTA 3S41A 4G1QA 4RWTA 4YOXA 4B3MK 4CZIA 3QFPA 3D2EA 1I94K 3E9PA 1YIJN 3SV3A 1VAZA 1HLUA 3CIPA 3BK3C 1A5VA 2GEMA 2OANA 5A2QO 4OVLA 3NGZA 3IRXA 3KD5E 3DI6A 4DB3A 1HMVA 3RMDA 1RBTA 5HRNA 1YTUA 4CF8A 1OVQA 5JVGL 2GL1A 4LH4A 2KFZA 5BR9A 4B3SK 2UXBK 4DMNA 4N76A 2YV0X 5TKYA 4M3XA 4GV6A 1KLNA 2O4GA 3M8RA 4JLHA 2KBHA 3AVLA 3TTCA 4FCYA 4FJ8A 1NNEA 3KHYA 3TTFA 4BREA 2KBKA 3VPZA 3UB5A 2QM1A 3SQ0A 3O08A 2HW3A 3PLAA 1DEJA 4YNQA 3ISNC 4KTZA 3LP3A 4DS4A 4WQ4A 3Q7CA 3QERA 2P9UA 2DY4A 3C94A 1S1UA 3U9DA 2KGQA 3WXIA 2EX3A 2GX9A 4BR2A 5FPDA 3PSMA 1WBDA 1KFSA 2RKIA 3I8DA 4CVNE 3QICA 3J80O 2E4LA 1UA1A 2WOMA 3J7ZO 4DV6K 5CZ1A 1GLDG 5J2NA 3M8SA 1TYQB 4DV3K 4CF9A 4XH1A 1HNIA 2ITMA 4LF4K 1ASWA 2HHIA 4BR4A 3BDPA 4CJLA 3DLBA 3MCAB 4PKHA 4DHYA 1MR4A 4V1DC 4Y0WA 3OYFA 4AHRA 4OPAA 1TV6A 3NGIA 4HUEA 3SMPA 4FXDA 1D5AA 1KC8O 4FZYA 1BA0A 1C1BA 4IO9L 3DAWA 4DLEA 4O8KA 3ASMA 2YEOA 1SKSA 1J5OA 1ZBSA 2HNDA 5BRFA 4PL7A 3CCSN 4FWKA 1NU0A 4ICLA 5JICA 3KVGA 3EE8A 5FROA 4IOAL 2P9NA 3HSCA 3VEVA 2BUPA 3TU5A 4DU1A 3T3FA 1L3SA 3CCLN 2B3CA 1XMQK 3PV8A 2YBRC 3K9JA 3VF2A 4N56A 3SPZA 4J2DA 5LJVA 3AVGA 3CF5L 4OLBA 5AZIB 4CCHA 3EKSA 3QMLA 4PKIA 3O1WA 4FPAA 2J4RA 3DLRA 2LY5A 5DM6L 4KB0A 4FL9A 1GLBG 1D9DA 4LF7K 1ZFUA 1WSHA 1KV0A 2GWJA 3O1BA 2ATBA 1JLCA 3UKRA 3CFPA 2WONA 1T7PA 3KWGA 4K8XA 3TSQA 3ENOA 3QI7A 1NGAA 1RDWX 3NDKA 4W5OA 2ASMA 1BUPA 2V7YA 3QO9A 3OYHA 1YUWA 5AQKA 1XC3A 3TTDA 4BR7A 1JLAA 3CFRA 2G8UA 3SK3A 1NPIA 2E1YA 4MO5A 1W9HA 4DF8A 2X74A 4CGJA 4YOYA 3NCIA 4OKJA 3TARA 5JMVA 2HMPA 3SZ2A 3DM2A 4KBOA 4RW8A 1GLAG 3OHRA 4JK8A 4CZFA 2HHVA 4KTWA 3THVA 2QXFA 2ZGYA 2Y1JA 3CHWA 4JKBA 4JKCA 1QZ6A 4ZHRA 4JNEA 4F9OA 3DOKA 1R0AA 3SAHA 4JI4K 4BWJA 3DXMB 5AFUH 4Z4CA 4C8KA 1SAZA 3LZIA 5F0XA 4KHYA 3F5TA 1IKXA 3TI0A 4Z4IA 4HVJA 1GLEG 1ASVA 1B9FA 1WAFA 2W41A 5DM7L 2P9SB 5EX5A 3OYBA 1TKXA 4FLVA 3SAGA 3K5OA 4EIAA 1NH5A 2HNYA 1XMOK 4M7YA 1YITN 2AP1A 3Q7BA 4I2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TAU A;  1U4B A;  3THY A;  1YT3 A;  3V9W A;  3ZT3 A;  4K25 A;  4CJS A;  1VSJ A;  4M3U A;  3FZH A;  2HVH A;  5AQY A;  2B5J A;  2WFB A;  2DFE A;  2HB5 A;  4YOR A;  3WNG A;  1ESV A;  4BDZ A;  3PUF A;  2VWJ A;  2YCH A;  1NGE A;  1KLM A;  4IWV A;  2RPI A;  4FWR A;  2BTF A;  3AVJ A;  4OPK A;  4EHT A;  2HHS A;  4Q5V A;  3BGR A;  2F96 A;  4FJG A;  4NCA A;  3OW2 M;  3M3Z A;  1D9F A;  3IFR A;  1XQS C;  2P9N B;  2CH5 A;  3TWH A;  1XNQ K;  4G9Z A;  4JKG A;  3W3D A;  2IVO A;  4LF6 K;  2FXU A;  1JCF A;  2CGK A;  5KI6 A;  2FF3 B;  1S9E A;  2F9T A;  2E0H A;  3NF6 A;  4B1Z A;  4BDP A;  2E88 A;  3S3M A;  3F73 A;  1NGH A;  4X66 K;  5FPE A;  3NHG A;  1XNR K;  4X64 K;  2F7T A;  4ISE A;  2GV9 A;  4KO0 A;  4GV3 A;  3RRG A;  5FRN A;  4B9U A;  4M45 A;  5AJ3 K;  1J6Z A;  2YIO A;  3A5O C;  2PYJ A;  3FE1 A;  1SEG A;  3T1Y K;  1B92 A;  1KTQ A;  1NK7 A;  3KOW A;  3UKR B;  2CH6 A;  3G4S N;  3K5N A;  1Y97 A;  3ATU A;  4FW2 A;  1LWF A;  4C1N I;  3WNH A;  2I7N A;  4U67 L;  3O3F A;  2C1I A;  3J7Y P;  1JZA A;  3FZM A;  4KH4 A; 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