3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
2A3ZA 2I7NA 2P9IA 3TU5A 2HMPA 2CH6A 4CBUA 4B1VA 3DXKB 1MA9B 1X9JA 3CI5A 3O1BA 1LOTB 2D0OA 5FPNA 1GLDG 1T6DA 1U2VB 2QWMA 1NGJA 1E4FT 1HKCA 1RGIA 4BC4A 4BR2A 3ZX2A 3UKRB 3HI0A 1NGAA 1GLAG 1NGDA 2CH5A 3U4LA 2QW9A 4CD1A 5JLHA 4FPBA 1KAYA 1Q18A 1GLFO 3VGKA 4BR9A 4KBOA 3MN6A 4PL8A 1IJJA 2F9WA 1HKBA 5EXWA 3QB0A 3EKSA 3M6GA 3QICA 4ISFA 1QZ6A 1YUWA 1J6ZA 2Q2RA 3KZBA 4PKIA 4L3QA 2AA4A 3CETA 3FFKB 4A2AA 3AARA 1DEJA 1WOQA 4BQZA 3D2EB 5JMVA 4B1ZA 4JD2A 4A62A 3CHWA 3BF3A 3S41A 4FWLA 1K8KA 3IUCA 4XH4A 4BC3A 3ENOA 5AQTA 1JCEA 2W40A 2QXLA 4FOEA 5BPLA 2E20A 3WT0A 4Z94A 3WXIA 3HZ6A 3ATVA 2QWPA 4JD2B 2GEMA 4BVPA 2FSJA 3I33A 1OKJA 2VCPA 2P9NB 2I7PA 4I6MB 5KPRA 1K8KB 3WXLA 4H5VA 4GY2B 4BR4A 3H1QA 3FZMA 4CZFA 2E2QA 5B8HA 3BP8A 3DAWA 3WUHA 3FZFA 4J8FA 4B1YB 4FWMA 3DXMA 1GLJO 1GLCG 2Q0UA 3FR0A 3ULEA 3MK6A 1Y64A 3D2FA 2A41A 4FPAA 3SMPA 1XQSC 3W0LA 2E1ZA 4B1XB 2PBDA 5BPNA 3VETA 1X3NA 4QS9A 3U9ZA 4M7YA 5FPMA 3DXMB 2YJEA 5AQNA 2P9PA 1NGEA 2E88A 1G99A 3D2FB 3W3DA 4DQ8A 4H0VB 2YHWA 2QWOA 1GLEG 4PKGA 4BRIA 4H0XB 1C0GA 2H3GX 4PL7A 4QS8A 2P9PB 3VENA 2BTFA 3VEXA 2GUPA 4BRCA 5FPDA 3O4WA 4YDUC 4CZGA 3R8EA 1JCGA 2A6AA 2Q0RA 2ASPA 5JLFA 4DB3A 3UB5A 5AQGA 4FWQA 3UKUB 3GBTA 3FZKA 3LDQA 1E4GT 1HKGA 3ATUA 1BWFO 4FWKA 2Q97A 3MN7A 2GWKA 4DCHA 3VPZA 4WQ4A 1BDGA 3DWLA 4EFHA 3EZWA 2A42A 2UYTA 2NZTA 3G25A 5EVZA 3LDOA 2QWQA 5CE3A 3RSEA 4M63C 4RCHA 5AZIA 2P9LA 4WQ5C 3CQYA 4FOIA 4K41A 3LDNA 4QS7A 5AZJA 4BVOA 4A61A 4B1UB 4BRKA 2D0PA 5AR0A 1QZ5A 3IFRA 3HSCA 5AQQA 5F0XA 4JNEA 1V4SA 1NLVA 1RDWX 2P9LB 2ZGZA 2ZGYA 1BUPA 1T6CA 1YXQA 5ADXH 3A8YA 2P9IB 5BR9A 5AQYA 3SJHA 3AAQA 2ASOA 3M3ZA 2HOEA 4IO8A 1DKGD 1NBWA 5BN9A 2Q1NA 5AQVA 3MMVA 3EKUA 3H3OB 1S22A 2YCHA 3H45C 1NGCA 1HJOA 4CJ7A 1ZXOA 2P9UA 1XUPO 2GTDA 1Z6RA 5EOYA 3SLCA 1ZBSA 4ISGA 3ZEUA 1TUUA 4XEIA 1IG8A 3LM9A 3GL1A 2V52B 5AQSA 2VYPA 3TPQA 2VWBA 2QM1A 2DPNA 3J8AA 4JN4A 2IVNA 3BEXA 3ZEUB 4H0YB 3ZETA 3VGMA 3LDLA 2YI1A 4FL9A 1BA1A 3I8BA 4B1WB 5E26A 5LJWA 2EWSA 5AQPA 2E2OA 3LM2A 4AM6A 3VGLA 4CBXA 3GG4A 1XC3A 5AQXA 4GNIA 3L4IA 3WEEA 3CJBA 3ID8A 5ADXA 4BGAA 5BRDA 4Y0WA 4BRHA 2BUPA 5EY4A 2FSKA 1ATNA 3C7NA 4MO4A 1HPMA 5KQ8A 3LL3A 4K43A 3BUZB 3WEEB 4EHTA 5BREA 4FWSA 1KAXA 1NGFA 3O80A 3VESA 5KPZA 3A5MC 3C7NB 2FXUA 2CGJA 3R6MA 5KQDA 4AM7A 1BG3A 1TUYA 3ULEB 3MN5A 4CBWA 5EX5A 4BRNA 5AQZA 2GELA 3L0QA 2PAVA 3QMLA 2P9KA 4M7XA 2W41A 3C0BA 2A5XA 4BRDA 3QFUA 3MDQA 1NMDA 2D1KA 3AY9A 4BRQA 1HX1A 1BOTO 2OANA 1WUAA 5I9EB 4DHYA 4IWVA 4CZMA 4K25A 1C0FA 4BRMA 4H5WA 5BN8A 2P9KB 5AQKA 5AQUA 5TKYA 4JHDA 5KPTA 2YHXA 1CZAN 4BROA 3KVGA 1X3MA 2FF6A 3WQTA 1BU6O 4BREA 4MLHA 4JHDB 4BGBA 5AQFA 2HF3A 3FGUA 3H1VX 1ESVA 4FWOA 1SQKA 2QWNA 4H0OA 3FZLA 2QWLA 2D4WA 5AQMA 4H5NA 1QHAA 4FSVA 3F9MA 4XH1A 4RTFD 4CD3A 3JS6A 1D4XA 3QFPA 3EL2A 3VEZA 2YJFA 3RSEB 3WQUA 3VEWA 3O08A 2V7ZA 5BPMA 3O6WA 3OHRA 5AZIB 3VEOA 3VEVA 5AQJA 2NRHA 4BRAA 4B9QA 3FZHA 4IXCA 4MO5A 5AZJB 2E8AA 2E1YA 1U2VA 4H5TA 3ZX0A 3L6QA 2YHYA 3UKRA 4FWRA 3SMSA 1LCUA 4FWPA 5E84A 4XH5A 4BR7A 4FWNA 4BRLA 2CGKA 2WUSA 4HTLA 3QDKA 1ATRA 5AQLA 4CZLA 1QQOA 4CZIA 4BC2A 2Q36A 1T44A 1MWMA 3WXKA 3A5LC 2IIRA 2P9UB 3EN9A 4H03B 3DJCA 1SAZA 4BR5A 3FE1A 3GE1A 4H0PA 2E2NA 3D2EA 2HF4A 3CJ1A 3EO3A 4H0TB 1QQMA 5AQOA 3A5OC 4CZJA 1MWKA 1MDUB 1NWKA 1S3XA 4YDUA 3D7EO 1NGBA 5AQIA 4BRFA 1GLLO 4BG9A 3CJAA 5AFUH 4K42A 3ZETB 3GDQA 5AQHA 4C23A 2P9NA 3MN9A 4O5FA 4WQ4C 1GLBG 3R9PA 4I6MA 1R59O 3U9DA 2ZWHA 4CZHA 3H3NO 4FO0A 3CJ9A 2J4RA 5F2RA 3KHYA 1DGKN 4CZEA 4EIAA 3SK3A 5BRFA 3GOIA 3B8AX 1YVNA 4IJAA 2AP1A 3CIPA 4WQ5A 5AQRA 3QBWA 3QBXA 3WXJA 3LDPA 1SZ2A 3HBTA 3AAPA 4BR0A 1KAZA 5FPEA 1BO5O 4MLEA 4F9OA 2QWRA 3FLCO 2Q31A 3HTVA 4NO7A 3O8MA 1NGHA 3VF6A 3O5BA 4RWTA 2FF3B 4IZ9A 5LJVA 3U8XA 1V4TA 3CQXA 4BRGA 2NLXA 3H6EA 4BQLA 3CJCA 1TYQA 3P4IA 3BF1A 2P9SA 3A0IX 5AFUA 4CZKA 1YAGA 3ZX3A 5AQWA 2F9TA 2CGLA 4BC5A 3H46O 5F1XA 1ATSA 4BRPA 4PKHA 3VEYA 1TYQB 3VF2A 1HLUA 4LC9B 4NB4A 1U6ZA 2P9SB 3CJ7A 3JXUA 3IDHA 5LY3A 1NGIA 4H5RA 3UKUA 2IVOA 3VF4A 4EHUA 3A5NC 1P8ZA 1Z05A 4A2BA 2GWJA 4O8KA 1NM1A 4JAXA 2V51B 1QQNA 5ELZA 3IMXA 4IJNA 2ZF5O 5JICA 1EQYA 2FSNA 3M1FA 1JCFA 2A40A 1RFQA 2ASMA 4E1JA 3ENHA 1KXPA 4HWIA 4EAHD 3HM8A 1ZC6A 1NGGA 1BA0A 3CERA 3O1WA 4BG8A 1HUXA 1H1VA 3VOVA 3UE5A 3DXKA 2FLOA 2KHOA 2V7YA 2E2PA 3VERA 4ISEA 5BRHA 4WYBA 2ITMA 2IVPA 3MCPA 4CI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DM6L 2A3ZA 3BY5A 4CBUA 5CYMA 2IC3A 3O1BA 5DMRA 5GINA 1LOTB 2E2FA 4IFVA 2QWMA 2KW4A 2YIOA 4BR2A 3UKRB 3HI0A 4DTRA 1NGAA 2QW9A 3DOKA 4CERA 4KAZA 1NNEA 1WBDA 3E9OA 4KBOA 1BIUA 3ZSRA 3QB0A 2ZQBA 1X1PA 3QICA 4ISFA 1YUWA 1FKPA 3ITHA 2Q2RA 3RRHA 1YTUA 3BZCA 1KLNA 3MCAB 4BQZA 3CC2N 4I7FA 2O8EB 4DWIA 1JKZA 3D2EB 3OVNA 1T7BA 3CHWA 3HPOA 4FZXC 4KH4A 1EX4A 4BC3A 3E9PA 4IG0A 1OMYA 4FK2A 3IS9A 3WXIA 1C1CA 4JKEA 1KQSM 4GV3A 1Y97A 2FSJA 3I33A 4KHWA 1LW0A 5KPRA 1B3CA 3DRRA 1K8KB 1JLAA 4H5VA 1YVUA 4GVEA 4LF9K 2UUBK 4GY2B 5KI6A 4BR4A 4Z4GA 1IBMK 3S9HA 4B9MA 3FZMA 4AEIA 1Z25A 4DQQA 4IDKA 3OJUA 1W9HA 3VQPA 1WB9A 1X9MA 4C8KA 4FJMA 2Q0UA 4NXMK 3MK6A 1Y64A 3D2FA 4AHVA 1S1TA 1XQSC 4CEZA 3F5TA 3DMJA 3U9ZA 5FPMA 1NU0A 3DXMB 5AQNA 1IBKK 2KYQA 4CFBA 3W3DA 4CK1A 1TVRA 3AVBA 4B9UA 4OO1J 2YX6A 3AVHA 2NRZA 1LQIA 4PKGA 2QWOA 3OYIA 1OH8A 4HUFA 1XRSB 1W7AA 4FJGA 3DLRA 4BDZA 4QS8A 1T3VA 4EP5A 3OYAA 3O4WA 3D0PA 1JKHA 2KPYA 4FW1A 4DV4K 2HW3A 1DQ7A 3UKUB 3NDKA 4M42A 5D3GA 2FBVA 3FZKA 3LWMA 2Q97A 3MN7A 4AQYK 3VPZA 4WQ4A 1D5AA 4J2BA 3RMAA 4DR6K 1DLOA 3OTOK 1HR0K 4M63C 4RCHA 3JYTA 2YEOA 2P9LA 2PFUA 4PY5A 2Z1HA 3V9UA 3ID6A 2OPSA 4FW2A 4BVOA 4CE9A 3CYGA 4B1UB 3TSUA 2D0PA 4PWDA 3O9RA 3J7ZO 4DV7K 1NPIA 4JK9A 1XNQK 3QEXA 1NLVA 2P5OA 2ZGZA 1GOAA 4DTOA 1KRPA 3K5OA 1S1UA 3VQ7A 3SQ4A 1IG9A 1S1VA 1DKGD 2FC0A 1QSSA 4JI0K 1EP4A 3NMUA 1REVA 3EKUA 3H3OB 2D0CA 1S22A 1WN7A 3RMBA 3CG7A 2D5RA 3HPHA 2XY6A 2P51A 1XUPO 2GTDA 3SLCA 3LZIA 3LM9A 4PQUA 2RPIA 5AQSA 2HNZA 3SUQA 2PZSA 3AO2A 3DLHA 2HB5A 5EU7A 4JN4A 2O4GA 3O4NA 3AVMA 4KREA 2VY6A 2QKKA 5HRPA 3T1YK 3I8BA 2VWKA 1XI1A 4CBXA 3SAHA 1J5OA 4FJXA 5AQXA 4LF8K 3WEEA 4BGAA 3VTIA 2BUPA 2FSKA 3C94A 2O8BB 1ATNA 2YNIA 4M3XA 3D45A 3TSQA 4K0KK 3TI0A 3QEIA 4EHTA 3THXA 5BREA 4FWSA 3T3FA 5FRMA 1KAXA 3P38A 3C7NB 1YI2N 1WT7A 4H4OA 1JLFA 1NOYA 3R6MA 3AVGA 4AM7A 3OBWA 3MN5A 3IG1A 1DJTA 5I3UA 2DTUA 1UA1A 5AQZA 3L0QA 3QMLA 4JI6K 3V4IA 4F2SA 2MN5A 3VQQA 5JVHL 1HYSA 3E1YA 2A5XA 4M3YA 3QFUA 1NMDA 2LT8A 3AY9A 4OLBA 3QEVA 3R2VA 1VSLA 4CZMA 1ZBIA 4H5WA 3TAGA 5AQKA 1YJ9N 3TWHA 1HNWK 4CGFA 4WF9L 2G8WA 1KVCA 3AVCA 4LFAK 1Q9XA 3HSTB 4BEBA 3CD6N 1S5JA 2B3CA 4YOTA 3KHWA 1BU6O 1TK8A 4BGBA 4WCEL 5J1EA 3FGUA 1KC8O 3H1VX 1ESVA 4H4MA 4CW7B 1XHXA 1TK0A 4CGHA 2QWNA 3L3UA 3SAFA 4H0OA 2QWLA 5AQMA 1A5XA 4KTWA 4CJLA 3QFPA 2ITGA 5C0YA 3VEWA 1Q7YO 4CEBA 4A5BA 1DTQA 3VEOA 3CM6A 2HBJA 2YNGA 3I55N 2NRHA 3E9LA 2PYJA 4NLBA 3FZHA 4KO0A 3MWTA 3LWLA 4H5TA 3AGKA 3L6QA 1UOCA 1LCUA 4XH5A 2G8IA 4QOZB 3SUOA 2MBKA 1XMQK 4HTLA 3LALA 1P0AA 2M8BB 4A5AA 1QQOA 1VHXA 3SV4A 1VSJA 3TTFA 3DYAA 3A5LC 1LWCA 5IWAK 3I8DA 4JS4A 5GAGP 2NRRA 3FE1A 3GE1A 4B3TK 4KB0A 2HHQA 2YNHA 1K9MO 1KV0A 3DRPA 1MR4A 3DOLA 4BACA 3QESA 1MWKA 3K5NA 1NWKA 1J5EK 1FK9A 3D7EO 5AQIA 1OVQA 2X6SA 3NVMA 4BG9A 1ASVA 2KBKA 3C95A 5AQHA 4I9QA 1LWFA 3R9PA 1GLBG 1R59O 4OVLA 2RHKA 3J7AP 1XHZA 4LFBK 2WBNA 1VSHA 4JK7A 1DGKN 2ETJA 4BE2A 3SK3A 5BRFA 3GOIA 1VSIA 5J2PA 2Z1GA 1L5UA 4C1NI 5AQRA 2YV0X 3O3HA 3HBTA 3LPUA 1KAZA 3ZT4A 4C8MA 1BO5O 4FJKA 4CJPA 2QWRA 1U49A 2OPPA 4CEFA 3HTVA 4FCYA 3VQBA 3THXB 1NGHA 3KD1E 3T1AA 3THVA 3O9TA 3O4QA 5DM7L 4K8XA 4BRGA 1SL0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DM6 L;  2A3Z A;  3BY5 A;  4CBU A;  5CYM A;  2IC3 A;  3O1B A;  5DMR A;  5GIN A;  1LOT B;  2E2F A;  4IFV A;  2QWM A;  2KW4 A;  2YIO A;  4BR2 A;  3UKR B;  3HI0 A;  4DTR A;  1NGA A;  2QW9 A;  3DOK A;  4CER A;  4KAZ A;  1NNE A;  1WBD A;  3E9O A;  4KBO A;  1BIU A;  3ZSR A;  3QB0 A;  2ZQB A;  1X1P A;  3QIC A;  4ISF A;  1YUW A;  1FKP A;  3ITH A;  2Q2R A;  3RRH A;  1YTU A;  3BZC A;  1KLN A;  3MCA B;  4BQZ A;  3CC2 N;  4I7F A;  2O8E B;  4DWI A;  1JKZ A;  3D2E B;  3OVN A;  1T7B A;  3CHW A;  3HPO A;  4FZX C;  4KH4 A;  1EX4 A;  4BC3 A;  3E9P A;  4IG0 A;  1OMY A;  4FK2 A;  3IS9 A;  3WXI A;  1C1C A;  4JKE A;  1KQS M;  4GV3 A;  1Y97 A;  2FSJ A;  3I33 A;  4KHW A;  1LW0 A;  5KPR A;  1B3C A;  3DRR A;  1K8K B;  1JLA A;  4H5V A;  1YVU A;  4GVE A;  4LF9 K;  2UUB K;  4GY2 B;  5KI6 A;  4BR4 A;  4Z4G A;  1IBM K;  3S9H A;  4B9M A;  3FZM A;  4AEI A;  1Z25 A;  4DQQ A;  4IDK A;  3OJU A;  1W9H A;  3VQP A;  1WB9 A;  1X9M A;  4C8K A;  4FJM A;  2Q0U A;  4NXM K;  3MK6 A;  1Y64 A;  3D2F A;  4AHV A;  1S1T A;  1XQS C;  4CEZ A; 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