3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
3CCRN 4IOCL 1VQ4N 1KD1O 4WFBL 5DM6L 5GAHP 1KQSM 1S72N 4UY8O 5DM7L 3G71N 3DLLL 3G4SN 4U67L 3CCQN 1Q82O 5MLCQ 2QA4N 3CCJN 1N8RO 3CCMN 1YJ9N 4WCEL 1M90O 1YJNN 3I56N 1VQ6N 3PIPL 4WFAL 2ZJPL 3CCEN 3CC7N 3CMEN 1Q81O 1QVFM 3CCVN 3CCUN 1VQ8N 3G6EN 1Q86O 3CC2N 1YIJN 4IO9L 5HL7L 5GAEP 3CF5L 3CD6N 1W2BM 1VQON 1VQNN 3I55N 1VQ5N 4WF9L 5GAGP 3CXCM 1OVYA 1QVGM 2OTJN 1VQKN 4WFNL 1VQLN 2ZJRL 1KC8O 1VQPN 3CC4N 1ILYA 5JVHL 1Q7YO 1VQ9N 5H1SQ 2QEXN 1VQ7N 1K73O 3CCLN 1YITN 1YHQN 1K9MO 3J7ZO 4IOAL 2ZJQL 1JJ2M 1K8AO 1VQMN 3OW2M 3PIOL 1M1KO 5GADP 3CMAN 2OTLN 1NJIO 3CPWM 1YJWN 3CCSN 1YI2N 5JVGL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CEDA 3PLAA 4BR2A 3CM5A 3KLGA 4N56A 2Q0UA 1KQSM 4FLTA 2NRZA 2OPQA 3VQ7A 4FWLA 4LF8K 3FZLA 3I0RA 2IVNA 3QEVA 4CERA 4NYNA 2YCHA 3LP3A 3M8RA 1WBBA 5ADXH 4CJPA 1CXUA 4BVOA 1HNZK 2HMIA 3OBYA 1NOZA 4E7IA 4KH5A 3OS0A 4FVUA 4EP4A 3RWUA 4B1UB 2PBDA 3V81A 3PIPL 2IDOA 3WXKA 3M5RA 3O9RA 2E4LA 5JLFA 3PX4A 1B9DA 1HPZA 1TV6A 4BRFA 3MX2A 4QS7A 4NB4A 3SNNA 1VQ8N 4DV0K 4HHTA 1G99A 2G8IA 2UU9K 3T3FA 2NRHA 3M1FA 1OH6A 4BGAA 1RT6A 2EX3A 1J5EK 2UUBK 1IV0A 2YNGA 4X62K 4GVEA 3PUFA 2IAJA 4YOVA 3NGZA 5ADXA 3O9TA 5SWMA 4JD2B 3EL2A 4ILGB 3BUZB 3CM6A 4HUEA 4KI4A 3V1OA 1OVYA 3HI0A 3W0LA 3SJJA 3LAMA 2GTDA 2OPRA 1IJJA 4Q5VA 1HLUA 4CGGA 3DJCA 1JLFA 1T3VA 3KVGA 3QDKA 3OTOK 4BRCA 3DXMB 4KHYA 3SQ0A 4FWSA 4B9VA 3O80A 3FFIA 3M8PA 4WQ5C 2HHUA 4Z4HA 3GL1A 3PSFA 4HTLA 4CHZA 4B9UA 1VSJA 3A0IX 1HYVA 2NNWA 3ZX2A 3RRHA 4YOWA 3P4IA 4AF1A 4CJVA 3AO1A 4FM1A 2A5XA 3LANA 3ENHA 1LWFA 2P9KB 4JEPA 3ITHA 4JLHA 2VGNA 4HTUA 4JI8K 3MDQA 1RDWX 2YHXA 4KH4A 1X9MA 3BZCA 4CZHA 3LDOA 3D45A 4BROA 3LDSA 2FSKA 1BA0A 3H3NO 3VQAA 4ISEA 2I5JA 1HYSA 5C2DA 4W5TA 3DLBA 1NKEA 2O8FB 1WSEA 3PV8A 2DY4A 4M3UA 2HBLA 4ID1A 4ILJA 4CJLA 1RGIA 1R0AA 4R79A 4BG9A 4JI7K 3PY8A 5CYMA 4JKDA 5C12A 4PA1A 4GNIA 2AJQA 5FPEA 1ATNA 4WQ5A 5BR8K 4FWQA 2FF3B 3CJCA 3THXA 4RW4A 1N32K 3EO3A 1XNRK 2HHSA 2Q97A 3TANA 4JV5K 1HX1A 1LW2A 3DOKA 4FLUA 1Q86O 3P31A 3DXKA 1RBVA 4MLEA 3BF1A 3LM9A 3MXMA 4Z4EA 3O9SA 4LF9K 3H1VX 4H0PA 1DTTA 4KTWA 4B9NA 1N34K 4KTQA 4AHTA 3CXCM 3O9QA 5AQLA 5C42A 1BA1A 1RTJA 4CHPA 1HJRA 4BACA 4DR4K 4IDHA 4F2SA 1EWRA 3AVFA 1J9AA 4ISGA 4O44A 3VQQA 2XY7A 3CCLN 1VSKA 1FW6A 3O5BA 4AM6A 1BCMA 2DFEA 4KTZA 4N76A 1ZC6A 3FZFA 1QE1A 4JRPA 2NRVA 4JKBA 4J2BA 3LAKA 4NCGA 1HJOA 3J7YP 5BRDA 3K57A 2YI1A 1NNEA 4DTOA 3P83D 1XHZA 1EXQA 1S9EA 4LH5A 3L2VA 1FXXA 1XUPO 4CHOA 4MQ3A 2UXCK 3ZT0A 2Q36A 1BU6O 1EWQA 3MXJA 3KLEA 2FBXA 1U47A 3HL8A 1NK6A 2KFNA 1QZ6A 4WQ4C 4DHYA 1IG9A 3ZX0A 2YX6A 3ZSQA 1IBLK 1RDDA 3E1YA 4DSEA 1FKPA 4CZLA 3SUPA 3TARA 3CG7A 1GLDG 4F3TA 2D0AA 3EKSA 4DV2K 2HBMA 5FPMA 4FW1A 4BDYA 4J2EA 1XWLA 3P5JA 2BDPA 3L0QA 1NJWA 3WQUA 3BDPA 4F2RA 3QMLA 4JI3K 3LWMA 4FJKA 3CI5A 5J2PA 3CCEN 3F2KA 3HK2A 2E2QA 3MWTA 1RT1A 3UKRA 2HHXA 3I8BA 2VYPA 1GLJO 2B5JA 4J8FA 1XI1A 4NCBA 1BQMA 5ELZA 3LALA 4KB1A 5GAEP 4DSLA 5AR0A 3DAWA 2XHBA 2KQ2A 2RHKA 1I3AA 3U8XA 2CGJA 5AQIA 4CZFA 4E7KA 4CF9A 1NLVA 2B6AA 4Y1CA 1T8EA 1IKVA 3AVGA 3KWIA 3QFUA 4WQ4A 2OA8A 1YTAA 3RTVA 3H6EA 1S6PA 3C6HA 3TAQA 3SQ4A 1MU2A 1NK9A 3WEEA 4EHUA 1ILYA 1CZAN 1WOQA 3KIOA 2X6NA 4JKHA 1WSIA 1C0TA 1L3UA 4CBWA 4BE0A 3D2FB 4B1VA 1BIUA 1IBMK 3HTVA 3AAPA 2E1YA 3OJSA 4CK1A 1UA1A 2DFHA 4BWMA 3CJAA 4X65K 5K14A 3LM2A 1NGFA 1BI4A 1YXQA 3SAFA 1FJGK 4BRLA 4DQRA 2QW9A 3VF6A 4CJ5A 1HNWK 1HNXK 4IJNA 1SL1A 1KLNA 4H5TA 3EEQA 1RTHA 2Z1JA 2XY5A 4FWKA 4NXMK 4FM2A 1KD1O 3ALYA 3SQ2A 4DSIA 2E2NA 4H0OA 3KD1E 3MN7A 3K9JA 2QK9A 2HBJA 3L4QA 1QSYA 4B3SK 1X9SA 2P9NA 2IOCA 4A2AA 3QERA 3CYMA 4DV3K 2O4IA 1S1XA 2PYJA 3HRGA 3ZSXA 3ZSWA 2F96A 1L3VA 5HP1A 1JL2A 2PZSA 4E7LA 3RRGA 4I6MA 1VSDA 3GDQA 3V9SA 3VN5A 3K5MA 2WUSA 4B9QA 2WONA 5C25A 3AVMA 2A6AA 4B3OA 3F5TA 5C2FA 4X64K 2CGKA 1KRPA 2E88A 2VG7A 4AH9A 1UA0A 4U7BA 4E89A 4CK2A 4JHDB 3V9WA 4PWDA 3SMSA 1NG9A 2ZF5O 1YIJN 2HF4A 2GELA 2JWKA 2QWRA 2VG6A 3AGRA 4K41A 4PKHA 3AVIA 4A59A 1GOCA 4F9OA 3IAYA 3K9KA 2J4RA 3VEXA 1VK0A 3LP0A 5GAGP 5HOOA 4BRDA 1XMQK 2UXBK 3LZJA 3SQ1A 2V7ZA 2P9IA 4FJNA 2CGLA 5T7BA 4Q0BA 1NJZA 3VTHA 4DSFA 4IXCA 1T7PA 5EOYA 4AILC 4RW6A 1U6ZA 1TKZA 2DPNA 3HOSA 1YITN 1K9MO 5JICA 2P9SB 3WXJA 1NM1A 2QWPA 4BVPA 4DFKA 4H5NA 3O8MA 3MN5A 4H5WA 5IT9O 1Q18A 1M1KO 4H5VA 3VQ5A 4CEZA 1VSLA 4CGIA 4DLGA 4E7JA 3ISNC 1FKOA 1REVA 2P9PB 4FVMA 4LY7A 5E26A 3VQBA 2P5OA 3OVNA 4M3TA 4JKFA 4BRHA 4IWVA 3C6TA 2EWSA 3DRSA 4UQGA 3TTFA 4HUFA 3U6FA 1NMNA 4CF8A 1U2VB 3ASMA 4O5BA 2ZD1A 3G4SN 3NH2A 1S1UA 3SV3A 4N5SA 3KLFA 4DU1A 3HVTA 1N8RO 1ASUA 3KLHA 3C6UA 4DLEA 4EZ6A 1M90O 1ESVA 3QEXA 5AQPA 3OYEA 1C1BA 3H08A 4IJAA 4PHTX 4OLAA 2P9LB 3EKUA 2QWOA 4LH4A 2HVHA 3GOIA 4QOZB 4PQUA 4XH5A 4OJRA 3VGMA 4MO4A 4NYFA 4PL8A 2P9NB 4RG8A 1D5AA 4CGDA 1EX4A 2W6KA 2KW4A 4A61A 3OYMA 2RE2A 4OGCA 4PY5A 4EP5A 4DTXA 5AQYA 2YNFA 2D0OA 4M3RA 3TAEA 3WNFA 3AVKA 2A1RA 3HBTA 4G1QA 4BDZA 4CFDA 3RVCA 4HCCA 4CJ4A 2HNDA 3ZSOA 3HZ6A 3NGIA 3QLHA 2FF6A 4DSKA 2WTUA 1BHLA 2YHYA 2YNHA 2O8EA 2FSJA 4FK2A 5DK5A 1K73O 4JYAK 3KKRA 2D1KA 3QB0A 4FZXC 3OY9A 1SV5A 4CIEA 2D4WA 3VEVA 3CJBA 3AA2A 4MDAA 4KHQA 1BDGA 3OJUA 3VEYA 4BRAA 1QHTA 1TKTA 5AQXA 1BQNA 5KQ8A 2QXFA 3FGUA 5BRHA 3WXMB 4FCYA 3M8SA 2Q3SA 4CJTA 2EHGA 1NU0A 4UY8O 1GOBA 3ZT1A 4BR7A 3O3FA 1WSHA 1J53A 5J2QA 3RMDA 3HP9A 4JN4A 1VRTA 1B92A 3VQCA 1RTDA 4M63C 4K42A 1NJYA 1Q82O 2UXDK 3L2RA 4H0YB 1S6QA 3DI6A 5KPZA 2G8KA 3K5NA 4B9MA 1RBUA 4CFBA 4BQZA 3KJVA 4CF1A 3D2EB 4E0DA 3ZSZA 4AHCA 3J81O 1HPMA 5TKYA 2RKIA 2ETJA 2E1ZA 3V4IA 2HHWA 1F21A 3HYFA 4CESA 4C1NK 1WB9A 3CCVN 1KTQA 3M3ZA 3CQYA 3ZT2A 1QZ5A 2P51A 1NK7A 1WNSA 3O6WA 2F8TA 4L8RB 4AHVA 4C8LA 1YT3A 3V9ZA 2HNZA 3U4LA 3C7NA 3K0SA 4IO9L 1S1VA 4IFVA 5EVZA 1BUPA 1CZBA 4JRQA 4CJEA 1HMVA 5CZ1A 2HW3A 2F8SA 4M7XA 1TKDA 4W5OA 1CLQA 3DLHA 4QCLA 5E84A 3A5NC 3RR7A 3E66A 3CERA 3A5MC 4RTFD 3KTQA 3TAGA 4GV9A 3CC4N 3MEEA 1DEJA 3VQ9A 4B9TA 3TPQA 4OX9K 3UKUB 4DS5A 1BGXT 3H45C 3AA5X 3MEGA 1KVAA 2O8DB 3HPHA 3AO3A 3R6MA 1NMDA 3RR8A 1SQKA 2CH6A 1HKGA 4DV6K 4DR1K 3NMUA 2ATQA 4FLXA 4IFEA 4BC2A 4H8KA 4B8AB 1X3NA 3K2PA 3AVNA 3BZKA 4B1YB 4KREA 4Z0UA 3S3NA 4FWPA 4MO5A 2NZTA 3IS9A 4OKKA 2IC3A 1C1AA 3O4WA 2O8EB 3DRPA 4M3WA 3NH0A 5BN9A 3DLGA 5I3UA 1LW0A 5LL6Z 3CQ8A 1HQUA 1Z26A 3OYFA 3OYLA 4KHSA 1NGEA 1NWKA 4LD0A 1NK8A 2QKBA 2ZM6K 1DT9A 3CCMN 4FJLA 3TAFA 2KLAA 3E9LA 5EXWA 4C8NA 2Z1HA 4M3XA 3D0PA 1ZBUA 2OPPA 1T05A 1RT4A 4CK3A 1VQ6N 1WUAA 4FJ7A 5HRPA 3DM2A 1IBKK 3TAMA 1Y64A 2WC9A 1RT2A 1TAQA 4KFBA 5FRMA 4BRPA 4BR0A 3H1QA 3VF4A 4YDUC 3HO1A 3ATVA 4B3TK 5JLHA 1WSJA 1LAWA 4KO0A 1P90A 1N36K 3MN9A 5I9EB 4BG8A 4WYBA 3MK6A 5EU7A 4O0IA 2G8WA 5AQSA 4MLHA 1VQNN 4IKFA 3T1HK 3VEZA 2G8VA 5DMRA 1C1CA 2BH1A 3AVAA 1J54A 2E6MA 4CZKA 4FZZA 3T1AA 3T7ZA 4BC5A 1UWBA 4W5RA 4E1NA 2D5RA 3FLCO 1LOTB 1KC8O 2BE2A 4B8CA 5JVHL 1VQ9N 2QEXN 2X6SA 4FXDA 3L2WA 4RW7A 4K8ZA 2YHBA 3D2FA 3PX0A 1RT7A 1NGAA 1KXPA 2ITGA 4RW9A 3C7NB 2OPSA 3Q7CA 2AP1A 1ITGA 3BF3A 5AZJA 4NLBA 1KFSA 2UYTA 3SLCA 3KK2A 4DB3A 3BEXA 2YJEA 4IEEA 3HSTB 2JLEA 3OYBA 1BOTO 3OS2A 3G10A 1EQYA 1TKXA 1YVNA 5GAHP 3AVCA 1Q8IA 1Q9YA 4GMJB 3VQ8A 1S5JA 3H3OB 5AQVA 2IVOA 4EAHD 4FLVA 3DLLL 5AQJA 1C6VA 4ZTJA 3NHGA 1JKHA 4CI6A 1VSFA 1A5WA 3VEOA 4KHWA 4ZTFA 4E1MA 5KI6A 4JAXA 2OCEA 3CFPA 3LDQA 3M8QA 4GW6A 4DCHA 4FWMA 1U4BA 4M3YA 3MXIA 1KVCA 1T03A 3ULDA 1LAVA 4JI4K 2VWBA 1I94K 4KV8A 5AQRA 2KZZA 3IFRA 4CJFA 5BN8A 3MEDA 1KAZA 2F7TA 3TR8A 4Z4GA 1UAXA 2ZJPL 3N4PA 4CE9A 4JHDA 3CQXA 2ASOA 1NGBA 3VETA 4AHSA 4GV6A 3KKSA 4H0XB 4KRFA 4HVJA 1DKGD 3THWB 1MWMA 2V7YA 4BE2A 1NGJA 3EN9A 4A57A 2O8BB 3QNOA 3SAGA 4O4GA 1HQEA 3QIOA 3OYAA 2GX9A 4B1WB 4DQ8A 2Q1NA 3KK3A 4JKGA 1VQ5N 4CVNE 5AQWA 3K5OA 4BY9C 4KB0A 3SUOA 3EZWA 4LFCK 1U48A 4BE1A 2HHQA 5D3GA 1JCEA 4JKEA 1VQPN 3VGKA 4BRIA 2ZGYA 4KAZA 2P9SA 4BDPA 3VMFB 1DGKN 1U45A 3W3DA 3VTIA 2VCPA 3OBWA 4PKIA 3T19A 4BR5A 3QEWA 4DTMA 3JSMA 5HRRA 3AGKA 3KK7A 4QS8A 3SV4A 1L3TA 4IO8A 2HOEA 1OH8A 3Q7BA 4PL7A 3WUHA 4EZ9A 4FJGA 4LF4K 2VWKA 2P9PA 1TYQA 4QAGA 3CMAN 2IIRA 5LMNK 4CZJA 3ZYYX 1NKBA 1QQOA 1ZBIA 3L4IA 3HXMA 4YOYA 3P1GA 2Z1IA 2RPIA 1IKXA 5EY4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCR N;  4IOC L;  1VQ4 N;  1KD1 O;  4WFB L;  5DM6 L;  5GAH P;  1KQS M;  1S72 N;  4UY8 O;  5DM7 L;  3G71 N;  3DLL L;  3G4S N;  4U67 L;  3CCQ N;  1Q82 O;  5MLC Q;  2QA4 N;  3CCJ N;  1N8R O;  3CCM N;  1YJ9 N;  4WCE L;  1M90 O;  1YJN N;  3I56 N;  1VQ6 N;  3PIP L;  4WFA L;  2ZJP L;  3CCE N;  3CC7 N;  3CME N;  1Q81 O;  1QVF M;  3CCV N;  3CCU N;  1VQ8 N;  3G6E N;  1Q86 O;  3CC2 N;  1YIJ N;  4IO9 L;  5HL7 L;  5GAE P;  3CF5 L;  3CD6 N;  1W2B M;  1VQO N;  1VQN N;  3I55 N;  1VQ5 N;  4WF9 L;  5GAG P;  3CXC M;  1OVY A;  1QVG M;  2OTJ N;  1VQK N;  4WFN L;  1VQL N;  2ZJR L;  1KC8 O;  1VQP N;  3CC4 N;  1ILY A;  5JVH L;  1Q7Y O;  1VQ9 N;  5H1S Q;  2QEX N;  1VQ7 N;  1K73 O;  3CCL N;  1YIT N;  1YHQ N;  1K9M O;  3J7Z O;  4IOA L;  2ZJQ L;  1JJ2 M;  1K8A O;  1VQM N;  3OW2 M;  3PIO L;  1M1K O;  5GAD P;  3CMA N;  2OTL N;  1NJI O;  3CPW M;  1YJW N;  3CCS N;  1YI2 N;  5JVG L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CED A;  3PLA A;  4BR2 A;  3CM5 A;  3KLG A;  4N56 A;  2Q0U A;  1KQS M;  4FLT A;  2NRZ A;  2OPQ A;  3VQ7 A;  4FWL A;  4LF8 K;  3FZL A;  3I0R A;  2IVN A;  3QEV A;  4CER A;  4NYN A;  2YCH A;  3LP3 A;  3M8R A;  1WBB A;  5ADX H;  4CJP A;  1CXU A;  4BVO A;  1HNZ K;  2HMI A;  3OBY A;  1NOZ A;  4E7I A;  4KH5 A;  3OS0 A;  4FVU A;  4EP4 A;  3RWU A;  4B1U B;  2PBD A;  3V81 A;  3PIP L;  2IDO A;  3WXK A;  3M5R A;  3O9R A;  2E4L A;  5JLF A;  3PX4 A;  1B9D A;  1HPZ A;  1TV6 A;  4BRF A;  3MX2 A;  4QS7 A;  4NB4 A;  3SNN A;  1VQ8 N;  4DV0 K;  4HHT A;  1G99 A;  2G8I A;  2UU9 K;  3T3F A;  2NRH A;  3M1F A;  1OH6 A;  4BGA A;  1RT6 A;  2EX3 A;  1J5E K;  2UUB K;  1IV0 A;  2YNG A;  4X62 K;  4GVE A;  3PUF A;  2IAJ A;  4YOV A;  3NGZ A;  5ADX A;  3O9T A;  5SWM A;  4JD2 B;  3EL2 A;  4ILG B;  3BUZ B;  3CM6 A;  4HUE A;  4KI4 A;  3V1O A;  1OVY A;  3HI0 A;  3W0L A;  3SJJ A;  3LAM A;  2GTD A;  2OPR A;  1IJJ A;  4Q5V A;  1HLU A;  4CGG A;  3DJC A;  1JLF A;  1T3V A;  3KVG A;  3QDK A;  3OTO K;  4BRC A;  3DXM B;  4KHY A;  3SQ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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