3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
1YJWN 3CD6N 5GAGP 1W2BM 5H1SQ 3CCMN 1YHQN 3CC4N 1K9MO 1VQKN 2ZJRL 4WFBL 4IO9L 5GADP 3CCSN 1VQ6N 3PIOL 1M1KO 1VQ8N 3CPWM 4U67L 1VQMN 3CCVN 1VQPN 1KC8O 2ZJQL 5MLCQ 2OTJN 4IOCL 1VQ4N 3CCRN 5JVHL 5DM7L 1NJIO 1VQ5N 3CF5L 4UY8O 5DM6L 3PIPL 1KD1O 5GAEP 3G6EN 3CCLN 3CCJN 3I55N 3CMAN 4WFNL 5HL7L 1VQNN 3OW2M 1QVGM 1VQON 1Q86O 2QEXN 1VQ7N 5GAHP 1YJ9N 1OVYA 1Q82O 1ILYA 2ZJPL 3CCEN 1VQLN 3CC7N 5JVGL 1VQ9N 1YIJN 1QVFM 1Q81O 3G71N 3I56N 2OTLN 1KQSM 1K8AO 1JJ2M 3CC2N 4WCEL 4IOAL 2QA4N 4WF9L 3CMEN 1K73O 1S72N 3CXCM 1YJNN 1YI2N 3CCQN 1Q7YO 1YITN 3J7ZO 4WFAL 1N8RO 1M90O 3CCUN 3DLLL 3G4SN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YAGA 3U3YA 3PLAA 4KH4A 3E01A 1RGIA 1GLAG 2Q2RA 5GADP 3NFAA 1EP4A 3AVFA 3QEXA 4BRMA 3AVGA 3CPWM 3LPUA 3BZCA 1NKCA 2FF6A 5CYQA 3O4QA 4LSNA 4GW6A 3SNNA 2VYPA 3G10A 3OYAA 2HMIA 4FLZA 1P90A 2Z1IA 4DV3K 4KI4A 1DEJA 3PY8A 2GEMA 4GVEA 4MQ3A 5SWMA 4B9UA 5KPTA 4CF8A 4IEIA 5DM6L 3KLGA 4E7LA 2GWJA 3ZEUA 4JKGA 4I2QA 4CBWA 3NF6A 4NO7A 5GAEP 4ZTJA 4BE1A 5C0YA 3SUNA 4IG3A 3WXKA 3CMAN 1Q86O 4FWLA 1B9FA 5BREA 1JLFA 1X9WA 3CJBA 1ZBLA 1YVNA 5HOOA 2F8TA 1WN7A 2H3GX 2DY4A 3QINA 2RPIA 3O9UA 5I42A 1WSFA 1MA9B 3I56N 4E0DA 2GBZA 3U6FA 2DFEA 3BF3A 3ULEB 3T19A 3VQPA 1UWBA 5HRNA 1NGIA 3IDHA 5C2FA 3OTOK 5AZJA 1OH5A 5EX5A 3QETA 3VQCA 1Y64A 1ZBSA 1A5VA 3LDQA 1NU0A 2VWJA 5CR4A 1K73O 5KQDA 4XEIA 4BR4A 4ILGB 3MAQA 2O8BB 3C6TA 5AFUH 4FJIA 5AQMA 3CCUN 3RMAA 1BI4A 4XH1A 3FFKB 1YJWN 4NCGA 4CZLA 3PX4A 2Y1JA 5M1NA 2BH1A 1E3MA 4OKKA 3TTCA 2VWBA 3OJSA 2HHUA 4IFEA 4Y0WA 2IOCA 3CCSN 1TV6A 2QXLA 3PIOL 1RDBA 4N41A 4CJ4A 5AJ3K 4FM1A 4H5VA 1A5WA 4OPAA 3O9RA 3ZT0A 4B9SA 3ZSOA 1NK0A 3KKSA 2YCHA 4QAGA 3DAWA 3S41A 1N6QA 3NMUA 2HF3A 1JLQA 4ID1A 3AO4A 3H3OB 4C1NI 1YUWA 3FR0A 5C15A 4HHTA 3THYB 4B9NA 4OGCA 3D2EB 4J2EA 1RBVA 4LY7A 3K59A 4L8RB 2PZSA 2PY5A 1JXEA 1KLMA 3HM9A 5GAHP 1HNXK 3MX2A 1WNSA 3ULDA 3MN7A 4FWQA 4FSVA 4E1JA 4L3QA 3ZT4A 1TL3A 5J2PA 3L2RA 3VN5A 3CCEN 3LALA 2QKBA 2VQFK 3LANA 5AQIA 4AILC 2P9IB 4KTQA 1VAZA 3L4QA 4FLWA 4CJ5A 3CERA 4FK2A 1C1CA 4H0PA 3LPTA 3QIOA 2ZE2A 3I33A 4Z0UA 4AHVA 1RDCA 4NYNA 4BR9A 1U47A 3DLHA 4PQUA 3CMEN 4DSLA 1RT1A 1XQSC 2QW9A 3L6QA 4BVPA 3ZX3A 3NAEA 2FXUA 4FWKA 3ZT3A 4M3RA 3EE9A 4CZIA 3KZBA 4HTLA 4CERA 3BF1A 1QSSA 5CY4A 4CEEA 5LMNK 5BN8A 3RMBA 3IRXA 5HLFA 2HNYA 4WQ5A 4C23A 4W5RA 3GBTA 3DLBA 3VQBA 3ZX2A 4B3OA 3ZCMA 5JLHA 1HNIA 1FJGK 5AQZA 2KW4A 4BGAA 4B9MA 3P38A 2YNHA 3ZX0A 4JAXA 1ZYQA 4JD2A 2VG7A 1TYQB 2X6NA 2YV0X 3QBXA 4BREA 1EX4A 3D6RA 4RG8A 1J5OA 3FZHA 4KFBA 4KPYA 3I0RA 3TANA 4KI6A 4O4GA 2HOEA 4CGFA 5CZ1A 4O8UA 3K57A 5C42A 1SAZA 2R7YA 1J6ZA 2O8DA 3RR7A 1NMNA 3THWA 4FW2A 1WSJA 2P1JA 3VQEA 1N34K 2E20A 3OBWA 3OW2M 1VQ7N 5AZIA 1D8YA 1W0HA 3VERA 3LP3A 3UE5A 2O8CB 4BRNA 2HNZA 2IC3A 2Q31A 1TKTA 4E7IA 3A8YA 3AVBA 3B8AX 3E9PA 5JVGL 3OHRA 2YKMA 4DSIA 3OVNA 3OYCA 2YI1A 1HJOA 3S3MA 3OYEA 3MK6A 2HHHK 2Q1NA 4GVMA 1JJ2M 4WQ5C 4BC2A 1HYSA 4IOAL 2ZGZA 3WXJA 3THXA 4Z4FA 4BRHA 5C24A 4BR5A 1JLEA 2GELA 5ELZA 3V6DA 2G8FA 3O3GA 3U3GA 3LDSA 1SKWA 1K8KA 3BP8A 4RW4A 2UXBK 2JLEA 1SL0A 1JCEA 4HUFA 1ZBHA 2CGJA 4BDZA 3LZJA 4ISEA 4FWNA 1QSLA 1W7AA 5BR9A 4CEZA 3VGLA 2PAVA 1CZBA 1ZBFA 3V9ZA 3ZEUB 3RMDA 3A5OC 3TI0A 1YHQN 4JK9A 1N36K 4JKAA 1VQ6N 4CESA 1RBUA 2F7TA 3RRHA 4BC3A 4HCCA 1KVBA 1VQ8N 3ATVA 3VQDA 5JICA 2O8EB 1VSDA 4CHPA 4KHPK 4BR0A 3RR8A 5FPMA 4KTWA 1KFSA 2ZQBA 5AR0A 3WNHA 4LH4A 4BRFA 3SJHA 3ULEA 1HKGA 1J5EK 3CCRN 2E88A 5FROA 4DV7K 2EHGA 3H1QA 1T6CA 4FZZA 1YF5L 5AZJB 1IKXA 2UYTA 4YNQA 1GLLO 2P9KB 4C8MA 4GKKK 5J2QA 4FOEA 4K0KK 4JKHA 2QEXN 1C0TA 1R0AA 1VRTA 4J2BA 1UOCA 4U7BA 1NGCA 2O8BA 4BY9C 1WLJA 5BPLA 3CQ8A 4AHSA 4DR6K 2OPPA 4DV1K 4FJ8A 3CM5A 1T3VA 1NGHA 3CETA 2FLOA 3EKSA 3AVKA 3WXMB 1BI4B 1VQ9N 4WYBA 5FPNA 1Q81O 3VEXA 2A1SA 3ID8A 1WAFA 4ICLA 1TK8A 5BRHA 3MEGA 2XHBA 4KHWA 3NGZA 4H4MA 4ISFA 3QIPA 2QWMA 1UA1A 3QDKA 3QEIA 4I6MB 1XMQK 3NH0A 1FKOA 4YDUA 1NJYA 3IKMA 3QFPA 2KZZA 3O9SA 1VSJA 4B1YB 4CFBA 1HNWK 3ZSXA 3DLGA 3I8BA 3P31A 4CJTA 3GL1A 1DTQA 4O8KA 3SYZA 2P9PA 3CG7A 4BRPA 3H1VX 1OVQA 1LAVA 3THYA 4DUYK 3ZSRA 3GE1A 4W5QA 2G8WA 3KK2A 5I3UA 3D2EA 3CQYA 2Z1HA 1BIUA 4CF1A 4O55A 3BY5A 1LAWA 3DRRA 1KFDA 3C6UA 4Z4CA 2X6SA 4YHHK 1JLAA 1QHAA 5H1SQ 3OYFA 1SL1A 1VQKN 3S3OA 2XY5A 1NM1A 3QICA 2W40A 1RDUA 3O4WA 3QBWA 2J4RA 1X1PA 1V4TA 3MMVA 4PHTX 4JS5A 1NGDA 4C1NK 3RSEB 3UKUB 5BPNA 1WBDA 3QEVA 3SI6A 4B1UB 3QMLA 2P9IA 1TGOA 2A40A 4FK0A 3RVCA 3CYMA 1KVCA 4CI6A 4F9OA 2KTQA 3SAGA 3VEWA 3AO5A 4DTSA 4FLVA 4NCBA 1RDDA 2PFUA 1IBMK 3OA9A 4EHUA 5TKWA 3S9HA 1NNEA 1TAQA 5AQWA 3SBTA 1U48A 2D0AA 3VF6A 3G6EN 3JAMO 4F2SA 3BZKA 4B3SK 4Y1CA 2HBJA 3CPEA 1QVGM 4K8ZA 1Z25A 5M1OA 4C8OA 2O4GA 2GV9A 4PKIA 4JKCA 4CEDA 4G9ZA 3F73A 1S1VA 5EY4A 3ISNC 5LJVA 2YJEA 2YHBA 3PUFA 4OJRA 4GNIA 4YDUC 2IIRA 4A5BA 4CEAA 1NGGA 3PSIA 4GY2B 2VGMA 3WNGA 3DRPA 5GIOA 1IG8A 3SV3A 4JK7A 4N56A 2KHOA 1W9HA 3EL2A 4GV6A 3PO4A 4E1NA 3HT3A 1SV5A 1RT4A 4F2RA 1B92A 1IKYA 1TYQA 2E2NA 4JI3K 4EZ6A 3MECA 3SAHA 2HVIA 4CZMA 4OLBA 5F2RA 3EEQA 3EZ5A 2ETJA 4YOTA 1RT6A 2PYLA 2W42A 1YJNN 5KRSA 3AGKA 1Q7YO 1YITN 1ZXOA 4JI6K 4FZYA 4CK3A 3AA5X 3CJ9A 1D5AA 1RT2A 4KTZA 4A2AA 3AVMA 2P9UA 3EE8A 3T1YK 4LF8K 4O5FA 4H0YB 2G8UA 1XHXA 3M1FA 4FWPA 3AVCA 4DQSA 1BUPA 4H0TB 4N47A 1T05A 4YOUA 1DT9A 2D0OA 4KO0A 4EZ9A 4B1WB 5C10A 2Y1IA 3VF4A 1ZBIA 2O8CA 4QS9A 3J7AP 3A0IX 1VHXA 2IVPA 4AHRA 3KLEA 4N5SA 4E7JA 4CJ3A 1S22A 4FCYA 3LAKA 4F8RA 4CIGA 3MWTA 2OTJN 3HP6A 3AA4A 4NCAA 5FLXO 1D9FA 1LCUA 3V9XA 4JI5K 4IKFA 4BRGA 1RFQA 4KREA 3K58A 3CQXA 4IOXA 3N4PA 5AQOA 3BDPA 1NOYA 4I9QA 5HROA 4B9VA 4A2BA 2Q3SA 2E8AA 2FBTA 3CCJN 1YXQA 3THXB 1U04A 1NK7A 3L8BA 1SKSA 2NRZA 4FWSA 4CJLA 4OLAA 1QQOA 3MEDA 1K8KB 1QTMA 2OZSA 5IT9O 1OVYA 2HF4A 5GIPA 3QFUA 5HRSA 4DTUA 1GLDG 1U6ZA 4KKOA 4CK2A 4O0JA 3FGUA 4K43A 3ENOA 3TR8A 1HUXA 1OH8A 1N32K 2Q0RA 4M7YA 4JRPA 1X3NA 4H0OA 1T6DA 2B5JA 3QEWA 3H45C 4KRFA 4B9QA 2KFZA 2E4LA 2XY7A 4YOWA 3SAFA 3KLHA 1UA0A 4DHYA 3WQTA 4K42A 1U2VB 1QZ6A 2BUPA 2G8KA 2O8EA 4CGIA 1BCMA 3PX0A 4CEBA 3I8DA 4CEQA 2QWPA 3IS9A 1L3UA 4WFAL 4CJWA 5BRFA 3G0ZA 1SS6A 3C94A 4B8CA 2OYQA 2O8FB 3L2VA 4CBXA 4MLEA 4JI7K 3F2KA 4M45A 2YNGA 5BPMA 4CGGA 3VA0A 5M1FA 5D3GA 1S6QA 2P9KA 3QESA 4C8KA 5AQFA 1P8ZA 3MN9A 5JS2A 1S9EA 4Z4GA 3ENHA 2E6LA 4CZGA 3P4IA 4IO9L 1QQMA 4DFPA 2ZD1A 3ID6A 3PX6A 2LSNA 2FC0A 3TTDA 4FW1A 2YHWA 3VESA 4DR7K 3AO2A 3CJAA 4H5RA 5C25A 2XRIA 4YY3K 2KKZA 5JMVA 4PKGA 3OJUA 3AAPA 3O4NA 3SCXA 5M1PA 4H5TA 4HWIA 2E2QA 5JVHL 1VQ5N 4I6MA 4IWVA 4IFYA 5AFUA 4BDPA 3ZT2A 5BRDA 3ITHA 4F3TA 3DMJA 2YNFA 3N4QA 4CJRA 3KIOA 3D0PA 5HL7L 4DSKA 1FXXA 4CHYA 4FVMA 3T1AA 3M8RA 4FZXC 1IG9A 2P9PB 4BE0A 2QK9A 4E89A 1XNRK 3HOSA 1NK6A 2PBDA 5ADXH 4MDBA 4BR2A 2A41A 4JKDA 1VRUA 4LF5K 3HP9A 1QVFM 1YT3A 5M1QA 4M7XA 2UUBK 1XC3A 3VF2A 3MN5A 1HQUA 3E66A 1KAXA 4BQZA 3K5NA 3SMPA 1ZC6A 4MDAA 4YOXA 3EY1A 1NK8A 4HVJA 3HM8A 3AGRA 2NRHA 4DS4A 1VSKA 4FJMA 3RSEA 1CZAN 4LH5A 3P1GA 4M63C 3UKUA 4MFBA 1JCGA 4JI1K 2A6AA 4BGBA 4ZHRA 1VSHA 1CXQA 2HB5A 2P9LB 1WSHA 4H4OA 1NBWA 2V7ZA 4RCHA 3A5MC 2P9NB 3GG4A 1D4XA 1LWFA 2Q97A 1S5JA 4V19S 1Q8IA 5KRTA 1HKCA 3AAQA 3DOLA 1Q18A 5EOYA 4H0VB 4C8LA 4HUGA 4OPKA 4JHDB 2IVOA 3EKUA 1S3XA 4NB4A 3QLHA 4FJLA 4N76A 4FWMA 3P39A 2RKIA 3SUQA 4RWTA 1BU6O 1TAUA 1NJWA 4DV6K 3LDLA 4LF7K 2E6MA 3FFIA 3O3HA 4WQ4A 3OYIA 3V9SA 1WSEA 2KLAA 4DQQA 4J8FA 1LV5A 4E7KA 4CVNE 4Q5VA 1I3AA 3VTIA 4J2DA 2NRXA 3HYFA 4FJXA 5DM7L 3SV4A 2VGNA 1GLEG 3AO1A 3GOIA 4DR1K 4DFKA 5AQSA 4W5TA 4OPHA 3P5JA 3DYAA 3I55N 2O4IA 3K9KA 4CJEA 2QM1A 5AQPA 4JEPA 2HBLA 2JWKA 3KD5E 3ZLJA 1CXUA 3V1QA 3LZIA 4DU1A 3RTVA 1L3SA 4CD1A 4Y1DA 3KWGA 4KB1A 4QS8A 1ILYA 4Z4EA 3C0BA 2HW3A 4BRIA 4CFDA 4JI2K 2DFHA 2P9UB 1RBRA 2W6KA 4R79A 4W5OA 4PUOA 3KTQA 1IH7A 4R5PA 3AVJA 4FJ9A 1BISA 3G25A 2G8VA 4I7FA 4B3MK 3DXMB 3K5OA 5LL6Z 3OYLA 1CZ9A 2HHTA 3EN9A 2IDOA 3I0SA 1BGXT 4BRDA 3OYBA 1BA0A 1NGEA 1HKBA 2Q36A 4I9LA 4RW7A 3U8XA 3VOVA 2DFFA 4CJUA 3CFOA 4CECA 4FPBA 4BR7A 5GAGP 4KB0A 5FPEA 4B1VA 4DMNA 5K14A 1TKDA 3RWUA 4WQ4C 3WXIA 3M8SA 2Q0UA 4OO1J 4CJ7A 3K9JA 1EETA 3NH2A 4IBNA 4CF9A 1XC9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YJW N;  3CD6 N;  5GAG P;  1W2B M;  5H1S Q;  3CCM N;  1YHQ N;  3CC4 N;  1K9M O;  1VQK N;  2ZJR L;  4WFB L;  4IO9 L;  5GAD P;  3CCS N;  1VQ6 N;  3PIO L;  1M1K O;  1VQ8 N;  3CPW M;  4U67 L;  1VQM N;  3CCV N;  1VQP N;  1KC8 O;  2ZJQ L;  5MLC Q;  2OTJ N;  4IOC L;  1VQ4 N;  3CCR N;  5JVH L;  5DM7 L;  1NJI O;  1VQ5 N;  3CF5 L;  4UY8 O;  5DM6 L;  3PIP L;  1KD1 O;  5GAE P;  3G6E N;  3CCL N;  3CCJ N;  3I55 N;  3CMA N;  4WFN L;  5HL7 L;  1VQN N;  3OW2 M;  1QVG M;  1VQO N;  1Q86 O;  2QEX N;  1VQ7 N;  5GAH P;  1YJ9 N;  1OVY A;  1Q82 O;  1ILY A;  2ZJP L;  3CCE N;  1VQL N;  3CC7 N;  5JVG L;  1VQ9 N;  1YIJ N;  1QVF M;  1Q81 O;  3G71 N;  3I56 N;  2OTL N;  1KQS M;  1K8A O;  1JJ2 M;  3CC2 N;  4WCE L;  4IOA L;  2QA4 N;  4WF9 L;  3CME N;  1K73 O;  1S72 N;  3CXC M;  1YJN N;  1YI2 N;  3CCQ N;  1Q7Y O;  1YIT N;  3J7Z O;  4WFA L;  1N8R O;  1M90 O;  3CCU N;  3DLL L;  3G4S N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YAG A;  3U3Y A;  3PLA A;  4KH4 A;  3E01 A;  1RGI A;  1GLA G;  2Q2R A;  5GAD P;  3NFA A;  1EP4 A;  3AVF A;  3QEX A;  4BRM A;  3AVG A;  3CPW M;  3LPU A;  3BZC A;  1NKC A;  2FF6 A;  5CYQ A;  3O4Q A;  4LSN A;  4GW6 A;  3SNN A;  2VYP A;  3G10 A;  3OYA A;  2HMI A;  4FLZ A;  1P90 A;  2Z1I A;  4DV3 K;  4KI4 A;  1DEJ A;  3PY8 A;  2GEM A;  4GVE A;  4MQ3 A;  5SWM A;  4B9U A;  5KPT A;  4CF8 A;  4IEI A;  5DM6 L;  3KLG A;  4E7L A;  2GWJ A;  3ZEU A;  4JKG A;  4I2Q A;  4CBW A;  3NF6 A;  4NO7 A;  5GAE P;  4ZTJ A;  4BE1 A;  5C0Y A;  3SUN A;  4IG3 A;  3WXK A;  3CMA N;  1Q86 O;  4FWL A;  1B9F A;  5BRE A;  1JLF A;  1X9W A;  3CJB A;  1ZBL A;  1YVN A;  5HOO A;  2F8T A;  1WN7 A;  2H3G X;  2DY4 A;  3QIN A;  2RPI A;  3O9U A;  5I42 A;  1WSF A;  1MA9 B;  3I56 N;  4E0D A;  2GBZ A;  3U6F A;  2DFE A;  3BF3 A;  3ULE B;  3T19 A;  3VQP A;  1UWB A;  5HRN A;  1NGI A;  3IDH A;  5C2F A;  3OTO K;  5AZJ A;  1OH5 A;  5EX5 A;  3QET A;  3VQC A;  1Y64 A;  1ZBS A;  1A5V A;  3LDQ A;  1NU0 A;  2VWJ A;  5CR4 A;  1K73 O;  5KQD A;  4XEI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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