3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
4WCEL 4UY8O 2OTJN 3I56N 5MLCQ 1W2BM 1YJ9N 3CF5L 3G4SN 1M1KO 2ZJRL 3CCJN 5GAHP 3CCRN 3G71N 1VQ9N 5H1SQ 2ZJQL 4IO9L 2OTLN 3CCUN 1QVFM 5JVHL 1VQNN 1Q81O 1KD1O 1VQKN 3CCMN 3CC7N 1N8RO 3CCQN 1YIJN 5GAEP 1NJIO 3CCSN 3CMAN 1ILYA 3CPWM 4WF9L 3CD6N 3CXCM 1VQ5N 3CCEN 3CC4N 1YI2N 1VQ6N 3CMEN 1Q82O 3G6EN 5HL7L 3CCLN 2QA4N 2ZJPL 1K9MO 1VQ4N 4U67L 1VQ7N 1K73O 5GADP 4WFAL 1KQSM 1YJWN 5DM6L 5GAGP 3J7ZO 4WFBL 3PIOL 2QEXN 3PIPL 1S72N 4WFNL 1K8AO 1M90O 1YHQN 3DLLL 1JJ2M 4IOAL 3CC2N 3OW2M 4IOCL 1YITN 1OVYA 5DM7L 1VQ8N 3I55N 1VQLN 1VQON 1Q86O 1KC8O 1VQMN 3CCVN 1VQPN 5JVGL 1YJNN 1Q7YO 1QVGM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GKKK 4B8AB 4FSVA 1CLQA 3OVNA 2UYTA 3L3VA 4OKJA 4M3WA 1BQMA 3NF6A 3B8AX 5CYQA 3VTHA 5LL6Z 4OPKA 3EY1A 3QEXA 4ELVA 1YTUA 3F73A 3NH2A 1MA9B 1DTTA 1FKOA 2A41A 4FOEA 1CZAN 3DLGA 1ASUA 4LH4A 3VERA 2PY5A 1QQOA 4O44A 4IO9L 4IEEA 1KVBA 4BRGA 1QVFM 4JD2B 1GLEG 4NO7A 3IDHA 4JI2K 3JAMO 3LDLA 4BRAA 3CJ7A 4FLZA 2W40A 1VSEA 1VSKA 3MWTA 3M1FA 1QQCA 4Z94A 1C0TA 2QKKA 3J7YP 3RR8A 4I7FA 4Z4CA 5KQ8A 5EY4A 1ILYA 4IBNA 3VGLA 3SV4A 4FW2A 3QEIA 2E5LK 3CPWM 3OYBA 2I5JA 4C8MA 4AHTA 3VQAA 2X6SA 4DLGA 3RSEA 4JKGB 1NKCA 1RDCA 2XY6A 3DLKA 2D5RA 3I0SA 5AR0A 3V4IA 2B4JA 2E88A 4LF4K 1YVUA 3CCLN 3T1YK 5KGWA 1RFQA 3KLIA 3DJCA 3AVFA 3L2VA 3C94A 3PSIA 1LWEA 4BQLA 3ALYA 3KK7A 5BPMA 4CFAA 3C6TA 3U9DA 1NK5A 3NF8A 3HL8A 2O8BB 3AV9A 1TV6A 2OZSA 2YCHA 4BRMA 1SV5A 3K5LA 1S9GA 1KVCA 2ZE2A 3AVMA 5AFUH 3VQEA 4E7JA 2YHYA 2NRZA 4DS5A 2IOCA 4JD2A 4DR3K 4CJPA 2WOMA 2G8KA 4PKIA 1NK4A 3CQYA 3SQ0A 2W6KA 2XY8A 4RW8A 4CEQA 1NJWA 1QZ5A 4DR5K 1VSDA 4CEAA 2P9NB 3GG4A 3VEZA 3HBTA 1R0AA 3BUZB 3WQTA 1Z26A 4JKGA 2D4WA 2HF3A 4AHRA 3OYNA 3L3UA 3AVHA 2F4VK 2A5XA 3TAPA 3QICA 4CZHA 3QEVA 4JV5K 3CJ1A 2BE2A 5EOYA 1SKRA 4BR7A 3H08A 1O13A 3T69A 5LMNK 2HHHK 4OX9K 3HP6A 3GL1A 3SUNA 1IBKK 1D8YA 3IFRA 3NH0A 3CC7N 3VF4A 2HHVA 2D0AA 5GAEP 3RMCA 1X3MA 2P9UB 3A5NC 3H1VX 2O8BA 1BO5O 4WQ4C 1YVNA 1CZBA 3L0QA 2GV9A 2I7PA 4R5PA 3ZX0A 4ILHA 1RBSA 5M1NA 4BE0A 2NRHA 4BQZA 3KWIA 4BWJA 3G10A 3IUCA 3ENOA 1Q82O 1S6QA 1I94K 2QA4N 3QIPA 3PO5A 3DMJA 1YUWA 1YTAA 1C0MA 1WUAA 4MQ3A 3ENBA 2V7ZA 2QXLA 4FK4A 1K73O 1X9MA 4FWSA 4B1ZA 1MU2A 2O4GA 3R1XA 3FZLA 4CJ5A 2P9NA 1WNSA 1TAUA 3VQDA 1NM1A 3NGIA 3S3MA 4WQ4A 3C65A 4FL9A 1J53A 5J2MA 5JLHA 2F9WA 3HYFA 4N56A 1JXBA 5BRHA 1HNVA 2R7YA 4FM0A 3KLFA 1BHLA 2YV0X 1QQMA 1BCMA 3ITHA 3EZ5A 4OO1J 5FPEA 2F9TA 3OYMA 2F7TA 1HNIA 4C1NI 1NKEA 2WTUA 4BC4A 1EX4A 2P9UA 1NGBA 3AA5X 5M1PA 2IIRA 4RTFD 4H5WA 4CGIA 4ZHRA 4KHQA 3HSCA 4NLBA 3LM9A 1W2BM 1ZXOA 5EVZA 2X6NA 4CFDA 3KLHA 1NK0A 3ID6A 3SLCA 3G4SN 4LF6K 4H0PA 4DV2K 5GAHP 4YNQA 5EU7A 3CCRN 4WQ5C 4DFPA 2BUPA 3TAMA 3OYFA 4DTPA 4RW4A 2NUBA 4IEIA 1IG8A 2IGIA 3ATVA 4BRKA 2NLXA 3IKMA 3NHGA 1EWRA 4F3OA 3WNHA 3MN9A 4DTNA 1TL1A 4BR4A 3CMAN 4BR5A 4EIAA 1IO2A 4BDYA 4BY9C 5DMRA 3RMAA 4JI8K 3N4QA 1LWCA 4FO0A 4G9ZA 1VRUA 3UE5A 2HMPA 1C6VA 2ZD1A 3WNFA 2BTFA 3M8SA 4Z0UA 1RILA 4AM7A 1TL3A 3HI0A 4X64K 3TSUA 4CHZA 1K8KB 4WQ5A 4CERA 3ZT1A 4CGDA 1NOZA 2ZQBA 3ZT2A 4FJIA 4M7XA 1SQKA 2XRIA 1ZC6A 3AGKA 4XH5A 3SZ2A 2QI2A 4PQUA 4BRFA 4AHSA 1NG9A 5FDLA 4EAHD 1EP4A 3HVTA 4JKFA 5C42A 3L2WA 4DR6K 3MN7A 2KTQA 1EETA 4I2QA 3K9JA 4FJ5A 4YORA 2IVPA 1ZBFA 1U6ZA 3V1QA 1UA0A 2CH6A 4DUYK 2UU9K 1XNRK 1RT4A 4CZFA 4E0DA 1BI4B 3BEXA 1NWKA 1Z05A 4BROA 3S3NA 3DLBA 4O5FA 4KTWA 4PKGA 3NH1A 1VQPN 3KTQA 1BL3A 2YJEA 3DI6A 2VWBA 4FWKA 4Z4FA 5E84A 2FF6A 2GTDA 2UXDK 1GLDG 5SWMA 4CF2A 3CPEA 2EX3A 1RDAA 3QBWA 2ETJA 3R3LA 4XH4A 2VQEK 1VSJA 2Z1GA 1VSFA 3MX5A 1QTMA 2E4LA 4KI4A 2E1YA 1VQ9N 4LF8K 1K8KA 4CJQA 1ASWA 2P9LB 1J6ZA 3DLEA 3HO1A 3SQ2A 1VQNN 1QHAA 1VQKN 3FZFA 1VHXA 1V4SA 4B9VA 4C8NA 4JKCA 5AQOA 4FPBA 1NGGA 3CYMA 4IZ9A 1YXQA 3K59A 4ELUA 3AVCA 4I9LA 4CF0A 5B8HA 1NGIA 2FSNA 3V9XA 1VSHA 2E6LA 4BDPA 2OZMA 1BI4A 3JXUA 3DM2A 2KHOA 3V1RA 2A3ZA 2QWLA 4CEOA 4CJUA 1UA1A 4KB0A 4M3UA 3NF9A 4DFJA 5AQWA 2IAJA 4KHNA 3VOVA 4I2PA 2QXFA 3ZT3A 2Q0RA 3WXMB 3OTOK 5GIPA 4FM2A 5ADXA 3HXMA 3AAQA 5AQLA 4DTUA 4FWQA 3AA4A 2IVNA 3VPZA 3HK2A 4Z4GA 3V9WA 2P5GA 1RNHA 2Q31A 4E7HA 1Q9XA 2HB5A 1NNEA 5KGXA 1RTHA 3HPGA 1C0UA 3TAEA 3CC2N 3B6PA 1NMNA 3ZEUA 1T3VA 3O08A 3NAEA 4CZMA 2P9LA 1ITGA 1YITN 3R9PA 4YY3K 4O8UA 1FJGK 3LANA 1GLFO 3AAPA 3DRRA 4CD3A 4DR2K 3VF6A 3NMUA 3K5MA 4DTJA 4WCEL 3M8QA 1RDWX 4E19A 1SZ2A 4H0TB 3BZKA 4J2AA 4CVNE 4DTMA 4KPYA 3OYAA 1JLEA 1WOQA 4ILGB 4X62K 2P51A 2I7NA 5LJWA 1M1KO 4JK7A 2PFUA 2RHKA 4E89A 4BG8A 3SMPA 4QCLA 1RBTA 3NVMA 1X3NA 4B9TA 4CESA 1J5OA 1NJZA 4JYAK 2OYQA 3LDPA 3LDOA 3CCUN 3NGYA 3EE8A 2PYJA 4JEPA 3J7AP 2EHGA 5TKWA 4JS5A 1RCHA 5FROA 1S1TA 4KFBA 2HHUA 3WXLA 1W0HA 5KRSA 4WF9L 4FJ9A 4DWIA 3CXCM 4BRNA 4ILJA 3WXIA 4PWDA 4FZZA 4LSNA 3OYIA 5TKYA 3CC4N 3DRPA 4QS9A 1RBRA 1SUQA 3QNNA 3F5TA 3FZMA 4FM1A 1TK8A 2JWKA 3IS9A 1LWFA 4H5VA 1VK0A 3D6RA 4NYFA 3SJJA 5F0XA 2EWSA 3RRHA 4H5RA 4JKDA 4O0JA 4KI6A 3SBGA 1HKBA 3PIOL 4ID1A 1BQNA 4CEDA 1XHXA 1LV5A 2YI1A 2IS3A 5AQYA 5EX5A 4RCHA 5CYMA 4JKEA 3ULEB 3RR7A 4ZTJA 1Q8IA 5IWAK 3I55N 3VGKA 1WSJA 1EO1A 3TAFA 2X78A 2GEMA 1YJNN 2NRVA 2BGGA 3SQ4A 1H1VA 4JAXA 4FJHA 1NGEA 1L3VA 2VQFK 1DT9A 5AQNA 3UKRB 3NE6A 3K5OA 1N6QA 4HCBA 4W5TA 2QWMA 3PY8A 2E2PA 4RW6A 4CZJA 4A2BA 1CXUA 1IBMK 3AVBA 1KXPA 3WUHA 1U4BA 3AO4A 1ZBIA 4DQRA 1FKPA 1OH6A 3CCMN 1GOCA 1G15A 3KJVA 3MEEA 1TK5A 4CBUA 4B1YB 2KKZA 4GV6A 4M45A 1LW2A 1WBDA 1S3XA 1U47A 2HBMA 3OS1A 1NGAA 3CFRA 5KRTA 4OJRA 3O3GA 1HJOA 1U45A 3QB0A 1XMQK 4DG1A 1MWMA 4YDUC 3LP1A 4FJGA 3ULEA 3TTDA 3TTFA 3SCXA 2NNWA 2A1SA 4B9NA 1JCFA 4FJMA 2FBVA 3M5RA 3CHWA 2GWJA 5GADP 4CIFA 4CZKA 3E01A 3FGUA 4JI7K 4BRPA 4FLYA 4HVJA 1YJWN 4JI1K 4PUOA 2DFEA 4RW7A 3UKRA 4BRCA 3H45C 3ZX3A 4F8RA 2ITGA 4KH6A 3PIPL 4DCHA 3O8MA 2ASOA 3H1QA 1YHQN 3ZSYA 4YDUA 4DU3A 1TUYA 2BDPA 3AVAA 1RTIA 1RDUA 3CG7A 4H4MA 3MCAB 4CZIA 5AQSA 2F8SA 3CJCA 3KKRA 4B8CA 4B9SA 4YFUA 4JRPA 1VQLN 1Q9YA 4DV5K 4ICLA 3ZETB 3D2EB 2YHXA 2CH5A 4QAGA 3N4PA 3EYZA 4AHCA 3QO9A 5KTQA 1CZ9A 3D45A 4CZGA 5AQZA 3SPYA 2O8CB 2FSJA 3AVIA 4B1VA 3VEWA 3TTCA 5HRSA 3DAWA 3KK3A 4FW1A 2B6AA 3H46O 3V1OA 3MN5A 2P1JA 2ZJRL 3V9ZA 5KPRA 4F4KA 1HYVA 5FLXO 5HROA 1BCOA 4R79A 1NK6A 4DMNA 2HHQA 5KPZA 1YAGA 3LPTA 4A5BA 1VSMA 3AVGA 1TAQA 3A5OC 4DF4A 1N32K 3VQCA 1RT1A 3CIPA 2OPSA 4KH4A 2AJQA 3UB5A 1C1AA 3LL3A 2WUSA 3K5NA 4JS4A 4DR7K 4CHYA 3QLHA 4FJXA 1D9DA 4DKWA 1W7AA 1ZBHA 3DXKB 3HM9A 3K58A 3EKUA 4CK2A 4B3MK 1C0GA 1TYQB 3AVNA 3K2PA 4H0YB 4IDKA 2HHTA 3VQ9A 3ZETA 3D2EA 4DTRA 2Y1JA 4CZEA 3RWUA 3P83D 3OY9A 1BISA 2A40A 2BH1A 4M3TA 1SKWA 4YOVA 4MDAA 2O8CA 5HLFA 3DXMB 2ITMA 2VCPA 2QKBA 3AVKA 2Q97A 1S6PA 3O9QA 2UXBK 3NBPA 5KI6A 5AQXA 2IDOA 2YX6A 1I39A 1ASVA 4NYNA 3BF1A 3MN6A 1IKVA 3U6FA 4IOCL 3CI5A 4FK0A 3HPOA 4OVLA 1EWQA 4FK2A 1VQ8N 1B9DA 4X66K 3WNEA 2GX9A 3VQ6A 4DF8A 1KC8O 1XUPO 3RMDA 4CD1A 1JKHA 3A2FA 1HNWK 3L4QA 3CM6A 4BC5A 3P38A 1KSPA 3M8RA 2VG5A 3MMVA 4N5SA 1S1UA 2WONA 2WBNA 3DXKA 4AH9A 4LFCK 4FJNA 3PLAA 3SYZA 3OYDA 1TYQA 5HBMA 3VQ5A 1IKYA 2IC3A 1KRPA 3FR0A 1VSLA 3FLCO 1IJJA 2XY5A 3K0SA 4CK3A 2XHBA 5C25A 3OS2A 3P5JA 4QOZB 4MO4A 4M3ZA 3AO2A 3U9ZA 4DSIA 4FJKA 3VQ8A 1L5UA 2Z1IA 4H0VB 2G8HA 1MWKA 1NJIO 3DXMA 5AJ3K 5J2QA 1XC3A 4BC2A 1WAJA 4H4OA 2VGNA 4HWIA 2YNFA 1BU6O 4NCGA 2G8UA 1JLGA 2ZWHA 1GLCG 1A5XA 3ISNC 1DEJA 1N33K 3BY5A 1ZBLA 1K9MO 4L3QA 1S1VA 4MLEA 3QDKA 4JN4A 4E1MA 5E41A 1Q18A 3VQ4A 3KKSA 3VENA 3HVRA 4H5NA 3BP8A 5HRPA 5T7BA 1RBUA 4DFMA 1K6YA 3VQ7A 2QW9A 1Y97A 1SL1A 3LPUA 2OPRA 1RDDA 3O9SA 3SAGA 2CGJA 4KHPK 2UXCK 3UKUA 5M1QA 4YOXA 1NJYA 4DFKA 5C0YA 4KTQA 4BGAA 4OPJA 1HJRA 2PYLA 4FPAA 1T05A 3VQQA 2D0BA 3VQBA 3WNGA 3ZSRA 1NK7A 4BR0A 1HKGA 4KO0A 3THXB 4FJLA 4K0KK 5I3UA 4LF9K 1NOYA 1OVYA 1Q86O 1IG9A 2IVOA 2HVIA 1WSEA 3C6UA 4YHHK 1J54A 3LAMA 2NRWA 5AQRA 5BR9A 4CZLA 4O0IA 1JXEA 4CE9A 3ZSQA 3HP9A 3LP0A 2D0CA 2LSNA 1FW6A 3QETA 5BPNA 1YJ9N 1ATNA 2HBLA 2H3GX 4EZ9A 3LP2A 2HNDA 3E9LA 4X65K 4DQIA 4DS4A 5DK5A 3RRGA 1LAWA 1NLVA 3KLGA 4BRLA 2P9KB 4YOUA 3FZKA 1TKDA 2O4IA 3DLHA 3VEOA 1G99A 4FLXA 2G8WA 3DOLA 3F9MA 4HHTA 4HTLA 1SL2A 5JS1A 4CEZA 4CJRA 4CGJA 4I9QA 2ZF5O 3NCIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WCE L;  4UY8 O;  2OTJ N;  3I56 N;  5MLC Q;  1W2B M;  1YJ9 N;  3CF5 L;  3G4S N;  1M1K O;  2ZJR L;  3CCJ N;  5GAH P;  3CCR N;  3G71 N;  1VQ9 N;  5H1S Q;  2ZJQ L;  4IO9 L;  2OTL N;  3CCU N;  1QVF M;  5JVH L;  1VQN N;  1Q81 O;  1KD1 O;  1VQK N;  3CCM N;  3CC7 N;  1N8R O;  3CCQ N;  1YIJ N;  5GAE P;  1NJI O;  3CCS N;  3CMA N;  1ILY A;  3CPW M;  4WF9 L;  3CD6 N;  3CXC M;  1VQ5 N;  3CCE N;  3CC4 N;  1YI2 N;  1VQ6 N;  3CME N;  1Q82 O;  3G6E N;  5HL7 L;  3CCL N;  2QA4 N;  2ZJP L;  1K9M O;  1VQ4 N;  4U67 L;  1VQ7 N;  1K73 O;  5GAD P;  4WFA L;  1KQS M;  1YJW N;  5DM6 L;  5GAG P;  3J7Z O;  4WFB L;  3PIO L;  2QEX N;  3PIP L;  1S72 N;  4WFN L;  1K8A O;  1M90 O;  1YHQ N;  3DLL L;  1JJ2 M;  4IOA L;  3CC2 N;  3OW2 M;  4IOC L;  1YIT N;  1OVY A;  5DM7 L;  1VQ8 N;  3I55 N;  1VQL N;  1VQO N;  1Q86 O;  1KC8 O;  1VQM N;  3CCV N;  1VQP N;  5JVG L;  1YJN N;  1Q7Y O;  1QVG M; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GKK K;  4B8A B;  4FSV A;  1CLQ A;  3OVN A;  2UYT A;  3L3V A;  4OKJ A;  4M3W A;  1BQM A;  3NF6 A;  3B8A X;  5CYQ A;  3VTH A;  5LL6 Z;  4OPK A;  3EY1 A;  3QEX A;  4ELV A;  1YTU A;  3F73 A;  3NH2 A;  1MA9 B;  1DTT A;  1FKO A;  2A41 A;  4FOE A;  1CZA N;  3DLG A;  1ASU A;  4LH4 A;  3VER A;  2PY5 A;  1QQO A;  4O44 A;  4IO9 L;  4IEE A;  1KVB A;  4BRG A;  1QVF M;  4JD2 B;  1GLE G;  4NO7 A;  3IDH A;  4JI2 K;  3JAM O;  3LDL A;  4BRA A;  3CJ7 A;  4FLZ A;  2W40 A;  1VSE A;  1VSK A;  3MWT A;  3M1F A;  1QQC A;  4Z94 A;  1C0T A;  2QKK A;  3J7Y P;  3RR8 A;  4I7F A;  4Z4C A;  5KQ8 A;  5EY4 A;  1ILY A;  4IBN A;  3VGL A;  3SV4 A;  4FW2 A;  3QEI A;  2E5L K;  3CPW M;  3OYB A;  2I5J A;  4C8M A;  4AHT A;  3VQA A;  2X6S A;  4DLG A;  3RSE A;  4JKG B;  1NKC A;  1RDC A;  2XY6 A;  3DLK A;  2D5R A;  3I0S A;  5AR0 A;  3V4I A;  2B4J A;  2E88 A;  4LF4 K;  1YVU A;  3CCL N;  3T1Y K;  5KGW A;  1RFQ A;  3KLI A;  3DJC A;  3AVF A;  3L2V A;  3C94 A;  3PSI A;  1LWE A;  4BQL A;  3ALY A;  3KK7 A;  5BPM A;  4CFA A;  3C6T A;  3U9D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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