3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
1QVGM 3CMEN 3CXCM 2ZJQL 1KC8O 1VQ8N 3DLLL 2OTJN 1YJWN 4U67L 3CC7N 3CCUN 4WCEL 1YITN 1Q81O 2QA4N 5GAGP 4WFAL 1ILYA 3I55N 3CPWM 5JVHL 5DM7L 1N8RO 5GADP 1YIJN 3CCMN 5GAHP 1VQ4N 5JVGL 1YI2N 5H1SQ 1OVYA 3CC4N 1VQ9N 1Q82O 3CC2N 1K73O 3CCRN 3CCEN 3CCLN 3G71N 5HL7L 3PIOL 1W2BM 3CCSN 3I56N 1YHQN 1M90O 5DM6L 1KD1O 3G4SN 1Q7YO 1Q86O 1YJNN 1KQSM 4WFNL 5MLCQ 1QVFM 1VQ5N 1YJ9N 4IOCL 3CCJN 1K9MO 3PIPL 4IO9L 1M1KO 3G6EN 1NJIO 3OW2M 3CF5L 4WFBL 1VQLN 1VQPN 1VQON 3J7ZO 4UY8O 1JJ2M 2ZJPL 3CCQN 1VQ7N 4WF9L 3CCVN 1VQMN 1S72N 4IOAL 2QEXN 2OTLN 1K8AO 3CMAN 1VQKN 3CD6N 1VQ6N 1VQNN 2ZJRL 5GAEP
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AO2A 1QQCA 1NGAA 2ATQA 4BC5A 4DR3K 4A2AA 1N36K 3AA2A 4JS4A 2BANA 4CERA 2EWSA 4DTNA 2O8BA 4M45A 2G8VA 3LM2A 2F9WA 3K9KA 3A2FA 1R0AA 4EZ9A 3M3ZA 4WFAL 3FGUA 3LAMA 1HYSA 2UUBK 1E4FT 5JVHL 2QM1A 3CYMA 1C0GA 4BE1A 3CI5A 2QWNA 4PL7A 1ZBLA 4DFKA 5KRSA 1Y97A 4BRIA 3OA9A 3T19A 3LWLA 3WEEB 4CFDA 4ELUA 4KHYA 3DYAA 4JHDA 4O5BA 3MN9A 4C8MA 1BQNA 2KKZA 1ATSA 4OPHA 4KO0A 1NK4A 1OVYA 2E6LA 3PUFA 3E9LA 4K25A 4NXMK 3OTOK 1SQKA 2IVOA 1N32K 1U2VB 3BGRA 4KPYA 4CEQA 4FWRA 3MECA 3CJBA 3P31A 3CFPA 1G15A 2HVIA 4B3RK 1GOBA 4WQ4A 2DPNA 3QFPA 3DXMB 4K43A 4FM2A 4DV1K 4HUEA 2R7YA 3ZYYX 2F9TA 1HX1A 3RMAA 3O4QA 3MX5A 4JI8K 4DSLA 2WONA 4IOCL 2X74A 3HSTB 2HSTA 5IWAK 3P1GA 4B9MA 5AQNA 4GVMA 4BDPA 3HRGA 3V9XA 2B5JA 1HPMA 2FC0A 4C8LA 4FO0A 3V1QA 4YORA 4PKHA 3L2RA 4CBXA 4DR4K 4CGIA 5BR8K 5F0XA 4GMJB 3J7ZO 4CK2A 4YOVA 3M8RA 3BEXA 4CJFA 4FJ9A 1SV5A 4CHZA 4FJMA 3S9HA 3PSFA 1R59O 3NFAA 3OYBA 2UXDK 1B92A 1RDUA 4I9QA 1VQNN 3L3VA 4Z4IA 4JI7K 3VEWA 4FM0A 4LF9K 3R3LA 4DSFA 2P9IA 5FDLA 5EVZA 1WAJA 2O8DA 4IDKA 4CJWA 5AQSA 1A5VA 5AZIA 3C95A 2NRWA 2QA4N 2WOMA 1Y64A 4KB0A 3CPWM 4FWSA 3V9ZA 1TK8A 3L8BA 3NGZA 2QWQA 3KLIA 1HKBA 4CEAA 2D1KA 1JLFA 3E9OA 3VERA 4CJKA 2W40A 4AHVA 2A5XA 3ZETB 4HUGA 3OYKA 5FPEA 4IBNA 2ZD1A 4LY7A 1BQMA 3KD5E 1H1VA 3DOLA 1QSYA 4O8UA 2HMIA 3PO4A 1U2VA 3PSIA 1FJGK 4YHHK 2YNFA 1GLCG 3R9PA 1LWCA 3I56N 3LL3A 4C8KA 5LJWA 2QWMA 1S1WA 3LZIA 4R79A 5AZJB 1BL3A 1NKEA 2UXBK 2HHUA 3O3FA 3OY9A 2PFUA 3HM8A 2CGJA 3V9UA 3AVFA 4IXCA 3OYGA 4EHTA 1SKSA 1IKWA 1T6DA 4AM6A 4FYDA 3RRGA 1Q9XA 4MQ3A 3L2VA 4JV5K 3WQUA 2A6AA 4CJ4A 3CPEA 2XO7A 1KFDA 3AO5A 4WFBL 2A3ZA 4B08A 5AR0A 3HZ6A 4NXNK 2HW3A 4NCGA 1VRTA 4IFVA 3RRHA 1ZXOA 4KI4A 5ADXA 4J2BA 3AVJA 3OHRA 3ZSRA 3ISNC 3PX4A 2ZF5O 5C0YA 3ZLJA 5AQLA 4CHOA 4DLEA 1U45A 4AHUA 3I0SA 3VQAA 3HPOA 3AO1A 3NAEA 1X3NA 3KWIA 3BY5A 3TTCA 1RBSA 4B8CA 1OH7A 3M8QA 1KVCA 1ZBFA 4CHYA 5AQJA 1L3SA 4BY9C 2YKNA 3V4IA 4BR4A 3OYMA 4LH5A 1HJOA 3NHGA 4AHTA 2HHVA 5AQPA 2HOEA 2E2QA 1JLGA 1GLFO 4NB4A 3SUQA 1S1TA 3KLGA 3CJ7A 4NCAA 3A5MC 5FPNA 1U6ZA 5ADXH 2ZWHA 3PX0A 2W6LA 4OLBA 3EO3A 4CJVA 5SWMA 3OYNA 4B3TK 4GVEA 4OLAA 3L6QA 2QWOA 1YI2N 1LAWA 1RBUA 3L2QA 3T1YK 2Q36A 1Z6RA 4H0XB 5FROA 3RMDA 1KLNA 4PQUA 5J1EA 3UKUA 1UOCA 1J54A 4XIUA 1WAFA 4JI6K 3F9KA 4CZMA 4B3MK 3G71N 4FWLA 1HR0K 1TKTA 1YHQN 3DLBA 1C0MA 3DRSA 3QFUA 4MO4A 1MU2A 1NLVA 3D2FA 4KTZA 1IBLK 2QKBA 4KTWA 1IV0A 5LL6Z 3U3GA 3THXB 3FLCO 2A1RA 1QQOA 3KKSA 3SQ1A 1RCHA 3N4PA 3LALA 2P9LA 5AQRA 4CHQA 1K8KA 3V9SA 1YT3A 3D45A 2FSJA 2NRXA 3TWHA 1XUPO 3SUPA 1NM1A 4K41A 4NCBA 1JXBA 3RMCA 5M1NA 3JAMO 1V4TA 3WNGA 4IZ9A 4UY8O 3QEIA 4Y1DA 4BR7A 5J2NA 2I7PA 2PBDA 4DB3A 1TV6A 5C24A 3MCPA 4LC9B 4BC4A 4IOAL 4BRPA 4CF9A 3AAPA 2OTLN 3NH2A 1VSLA 4V19S 1NGHA 2O8FB 3SQ0A 2XRIA 3D2EB 4JS5A 2P9UA 2ITGA 3VTIA 4DFMA 4IG0A 3VF4A 3O4NA 1VQ8N 2XY5A 4E1NA 1I39A 5KPZA 4KREA 3JYTA 3L2UA 3TAGA 3VMFB 3QETA 2HHSA 2YHBA 2HNZA 1HNXK 4DQRA 1WN7A 1NOYA 2O8EB 3VQPA 5AQKA 3AA4A 4JI5K 4DTMA 3S41A 1KFSA 4J2AA 2FBTA 4FWOA 5BN9A 1ZBHA 3T1AA 3AO4A 4J2EA 4BDYA 2I5JA 5BREA 2BE2A 1UA0A 3UKRA 4C23A 5EXWA 4KHPK 4BR5A 1S9GA 4B1YB 4QS7A 2P5OA 3P38A 4MLEA 4JHDB 5M1FA 2E2PA 4B1ZA 3NCIA 1FXXA 2FSNA 3WNFA 2UYTA 3NF9A 5AQWA 3MMVA 3O9SA 4ISEA 4CCHA 1ATRA 2IC3A 4CJRA 1K73O 3NF8A 4RCHA 1CXQA 3ZSWA 2OPPA 1FK9A 2HNYA 4IOXA 4IEIA 3PIOL 1YUWA 1I3AA 2PAVA 1WSHA 3H45C 2OPQA 2F96A 4H0OA 5I3UA 1W7AA 3OVNA 4B9NA 3DRRA 4IFYA 2P5GA 4W5NA 2P9NB 3MWPA 4H0PA 5MLCQ 5LMNK 4DQQA 1K8KB 1T03A 4RW9A 3O08A 3HBTA 5JLHA 1LW0A 2VQFK 2VG6A 4CGFA 1VSMA 2Q0UA 4M3WA 4N41A 1JXEA 1Z25A 1QQMA 1VQLN 1VRUA 3VEXA 4BROA 1RT3A 4DTOA 4ID1A 3QNNA 3CCVN 5HRSA 4DLGA 1U49A 2ETJA 4H0YB 2NRTA 4I2PA 3D6RA 4E7IA 3DXKB 4E0DA 4KBOA 3D2EA 5JLFA 4CZFA 2GV9A 4KH6A 4C1NI 5SZTA 2NRHA 1HNWK 5LMUK 1BISA 4FW1A 4DTXA 1RDWX 3CC7N 3HPGA 1A5XA 1BIUA 3CQ8A 2GELA 4F3TA 1WBDA 3ZCMA 2O8EA 1QHTA 1P90A 3THWA 4WQ5A 4QS9A 3LWMA 3ZEUB 3MXMA 2IOCA 4UQGA 2FF3B 4B3SK 2OYQA 1N8RO 4BRGA 3SMSA 4YOXA 5AFUH 1JLQA 4NLCA 4JK7A 4JKCA 3ZETA 4YOUA 4CFAA 1BHLA 4DQIA 4DU4A 2Z1HA 5H1SQ 4DSKA 3HP9A 3ZSZA 3CC4N 3H1VX 4OPKA 3SAHA 3QNOA 1RT2A 2F8SA 4CEEA 1XNQK 5ELZA 4GV9A 2OPRA 2YX6A 1N34K 4QS8A 4CJUA 1DKGD 1E4GT 3C6TA 4JKGB 3N4QA 5CY4A 5AQHA 5DM6L 1RBRA 3A5NC 3RMBA 3AGKA 4H8KA 1XMOK 2P9NA 1HKGA 4JD2A 4I6MB 4ISFA 2HHWA 1EXQA 4E1MA 3U6FA 1BU6O 1N5YA 2JWKA 2QI2A 3AVGA 4ILGB 3U9ZA 4ZTFA 2ZQBA 3CJCA 1NGBA 3HK2A 3M5RA 3L3UA 3O80A 1ZBSA 1KAZA 1BOTO 3J8AA 2V52B 4Q5VA 1RT7A 1E3MA 4Y0WA 1D4XA 1EWRA 1ZYQA 4A5BA 3OBWA 5BPMA 4JI1K 5E26A 3CMAN 3TANA 4H4OA 4W5OA 1HKCA 1DLOA 4BVPA 3KLHA 2ZJQL 2X78A 1YJWN 4U67L 1JCEA 4CHNA 4GV3A 4CGDA 3PLAA 1YITN 5KGWA 4DUZK 3KVGA 3CQXA 1EQYA 1WUAA 5HRNA 5EY4A 2ASOA 4B9QA 5BRHA 3I55N 4F9OA 4H03B 1CZBA 4RWTA 1J6ZA 3J7AP 3DLGA 3VQCA 1D8YA 5TKYA 1BDGA 4DV7K 4JI0K 1YVUA 3WXJA 5JMVA 3OYFA 4L8RB 3SYZA 1RTHA 1TGOA 3EE8A 2KHOA 3V81A 1WSGA 1SS6A 2YHYA 5GIOA 4A61A 3O3GA 4BE2A 5EX5A 3K5LA 1XHZA 1GLLO 2G8IA 3MXJA 1TAUA 1XC9A 2WTUA 4GV6A 4AM7A 1S1VA 1HJRA 1EKEA 4AQYK 1X9WA 4K8XA 1TK0A 3FFIA 3G0ZA 1KVBA 4E7HA 3TAMA 3NH1A 4CGJA 1DGKN 4R5PA 3D2FB 4FJHA 1QTMA 1RILA 1NU0A 1Q7YO 2IVPA 5IT9O 5K14A 4DTJA 2VWJA 1TUYA 1KQSM 3OJUA 1RBVA 3V1OA 4DTUA 1IKXA 4JD2B 5M1QA 4QCLA 2OZMA 4IO9L 2HHTA 3QEXA 5KGXA 2KLAA 3IG1A 3O5BA 2DTUA 4NO7A 1JLEA 3AVMA 3ULEB 3E01A 4EIAA 4RTFD 4DQSA 2BGGA 3RR8A 2W6KA 4JYAK 4DMNA 4OO1J 1TK5A 3AA3A 2FSKA 3VESA 3KLEA 5TKWA 2PY5A 2PYJA 2P9IB 4O0IA 3O1WA 3KIOA 2Q2RA 3SV4A 1SL1A 4CFBA 3JSMA 3NF7A 1L3VA 3NF6A 2UXCK 3D0PA 4CEDA 5AQYA 2EX3A 4FWPA 4EP5A 1SZ2A 4CE9A 4DF8A 3I0RA 1IBKK 3DLRA 1OVQA 3MCAB 4WYBA 3SK3A 1L3UA 2YKMA 2HVHA 1WOQA 2VG7A 2IAJA 4CEFA 3P5JA 2VG5A 4FPAA 2KW4A 5AJ3K 1NBWA 3PV8A 5AQIA 4C8NA 1YVNA 3NGIA 3OBYA 4YOTA 3HTVA 4JKAA 1LW2A 4BG9A 2W42A 4Z0UA 1JKHA 3GDQA 3MN7A 3MK6A 4X64K 3M1FA 3ZX0A 3CCEN 3CCLN 1QZ5A 2BDPA 4M7XA 3SPYA 1NGGA 4KRFA 2D5RA 4EFHA 4ELVA 4CBWA 3KWGA 5AZJA 4BDZA 3NGYA 2RHKA 5AQMA 4FCYA 2O4GA 3PY8A 1YJNN 4YNQA 3DM2A 1CZ9A 3O4WA 4W5TA 3HPHA 1KCFA 1HRHA 1L5UA 3AA5X 2GWKA 3TSUA 1IG8A 2CGKA 3AY9A 1TYQB 3AVBA 2X6SA 3SUNA 1TKZA 3ULEA 2OZSA 3OS2A 4OKJA 3LM9A 3OYJA 4DFJA 1RTDA 1RT4A 2ASPA 3QO9A 3VEVA 1LV5A 3TSQA 4IFEA 3CD6N 5D3GA 1CXUA 3V1RA 2E4LA 4DTPA 3TABA 3CERA 4W5RA 1CLQA 2HBMA 2IGIA 2OTJN 4CIFA 1SKRA 4AILC 1XI1A 2G8HA 1RT1A 3AVKA 1IJJA 3T7ZA 4E7LA 1Q9YA 4GKKK 3SZ2A 2Z1GA 2P51A 4KH4A 5GAGP 4F2RA 4B1XB 3PO5A 2NNWA 4LD0A 3ZEUA 3VPZA 5AQOA 2O4IA 1OH8A 2NRZA 4CJ7A 2P9KA 3J80O 4NYFA 2P9SB 4PL8A 1HNVA 3ZT4A 3VF6A 4B3OA 3OYAA 4C8OA 4N56A 2HNDA 3ZT0A 4K42A 4CZLA 4E7KA 1KLMA 1Q18A 3WQTA 3C6HA 1WBBA 3OYEA 4LH4A 1OH6A 4DCHA 4BGBA 3LP3A 4YOYA 3VEOA 5HL7L 1ATNA 2VWBA 3LP2A 5HBMA 2HBKA 5KRTA 3FZKA 1HNZK 4YDUC 3KD1E 5CE3A 1KAYA 3WNEA 5AQQA 3CG7A 1HYZA 4DG1A 4O55A 4FJGA 4OJRA 2YV0X 3B6OA 2P9LB 3UE5A 3OYCA 1BI4A 4N76A 3TAFA 3SUOA 1NGFA 3V9WA 4JK8A 2D0BA 1NKBA 3EEQA 5J2MA 1M1KO 3G6EN 3EZWA 3SJHA 1JLAA 3MDQA 3VN5A 1J9AA 5CZ1A 3HM9A 2W41A 2YJFA 4FJ5A 4Z4CA 2YHXA 4IEEA 4OVLA 4XEIA 4A59A 2Y1JA 1IKVA 3KK7A 2O8FA 3C7NA 4FW2A 3TAQA 4LF7K 2VGMA 1NJWA 2NUBA 2P9UB 4LSLA 3PX6A 4BRAA 3QLHA 4HUFA 2O8DB 5KI6A 4NYNA 3LDSA 4HVJA 4CJLA 3VQEA 4B9SA 4JEPA 3AVCA 2JWLA 4HCCA 1RBTA 1BA0A 3CJAA 3MEDA 2ITMA 4CIEA 2YNHA 5F1XA 2FLOA 4ILJA 1HLUA 3ITHA 3QICA 4BE0A 3AAQA 4MFBA 4WE1A 3UKRB 5FPDA 1NGCA 3FZLA 2YCHA 3BUZB 2VCPA 2P9SA 4WQ5C 4FJNA 1VHXA 4CECA 4H5TA 2QW9A 3NBPA 4YOWA 5JVGL 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QVG M;  3CME N;  3CXC M;  2ZJQ L;  1KC8 O;  1VQ8 N;  3DLL L;  2OTJ N;  1YJW N;  4U67 L;  3CC7 N;  3CCU N;  4WCE L;  1YIT N;  1Q81 O;  2QA4 N;  5GAG P;  4WFA L;  1ILY A;  3I55 N;  3CPW M;  5JVH L;  5DM7 L;  1N8R O;  5GAD P;  1YIJ N;  3CCM N;  5GAH P;  1VQ4 N;  5JVG L;  1YI2 N;  5H1S Q;  1OVY A;  3CC4 N;  1VQ9 N;  1Q82 O;  3CC2 N;  1K73 O;  3CCR N;  3CCE N;  3CCL N;  3G71 N;  5HL7 L;  3PIO L;  1W2B M;  3CCS N;  3I56 N;  1YHQ N;  1M90 O;  5DM6 L;  1KD1 O;  3G4S N;  1Q7Y O;  1Q86 O;  1YJN N;  1KQS M;  4WFN L;  5MLC Q;  1QVF M;  1VQ5 N;  1YJ9 N;  4IOC L;  3CCJ N;  1K9M O;  3PIP L;  4IO9 L;  1M1K O;  3G6E N;  1NJI O;  3OW2 M;  3CF5 L;  4WFB L;  1VQL N;  1VQP N;  1VQO N;  3J7Z O;  4UY8 O;  1JJ2 M;  2ZJP L;  3CCQ N;  1VQ7 N;  4WF9 L;  3CCV N;  1VQM N;  1S72 N;  4IOA L;  2QEX N;  2OTL N;  1K8A O;  3CMA N;  1VQK N;  3CD6 N;  1VQ6 N;  1VQN N;  2ZJR L;  5GAE P; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AO2 A;  1QQC A;  1NGA A;  2ATQ A;  4BC5 A;  4DR3 K;  4A2A A;  1N36 K;  3AA2 A;  4JS4 A;  2BAN A;  4CER A;  2EWS A;  4DTN A;  2O8B A;  4M45 A;  2G8V A;  3LM2 A;  2F9W A;  3K9K A;  3A2F A;  1R0A A;  4EZ9 A;  3M3Z A;  4WFA L;  3FGU A;  3LAM A;  1HYS A;  2UUB K;  1E4F T;  5JVH L;  2QM1 A;  3CYM A;  1C0G A;  4BE1 A;  3CI5 A;  2QWN A;  4PL7 A;  1ZBL A;  4DFK A;  5KRS A;  1Y97 A;  4BRI A;  3OA9 A;  3T19 A;  3LWL A;  3WEE B;  4CFD A;  4ELU A;  4KHY A;  3DYA A;  4JHD A;  4O5B A;  3MN9 A;  4C8M A;  1BQN A;  2KKZ A;  1ATS A;  4OPH A;  4KO0 A;  1NK4 A;  1OVY A;  2E6L A;  3PUF A;  3E9L A;  4K25 A;  4NXM K;  3OTO K;  1SQK A;  2IVO A;  1N32 K;  1U2V B;  3BGR A;  4KPY A;  4CEQ A;  4FWR A;  3MEC A;  3CJB A;  3P31 A;  3CFP A;  1G15 A;  2HVI A;  4B3R K;  1GOB A;  4WQ4 A;  2DPN A;  3QFP A;  3DXM B;  4K43 A;  4FM2 A;  4DV1 K;  4HUE A;  2R7Y A;  3ZYY X;  2F9T A;  1HX1 A;  3RMA A;  3O4Q A;  3MX5 A;  4JI8 K;  4DSL A;  2WON A;  4IOC L;  2X74 A;  3HST B;  2HST A;  5IWA K;  3P1G A;  4B9M A;  5AQN A;  4GVM A;  4BDP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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