3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
3CC4N 3I55N 1W2BM 1M1KO 5HL7L 1VQ9N 5DM7L 3CMEN 1NJIO 3G6EN 1KC8O 1YIJN 3G71N 2OTLN 1VQLN 1K73O 3OW2M 1VQNN 3CCRN 3CMAN 1YJWN 1Q81O 3CXCM 1YHQN 3CCQN 3J7ZO 2ZJQL 3CCUN 1VQKN 4WFBL 1VQ5N 3I56N 4WFNL 4UY8O 3CF5L 5MLCQ 4WF9L 3PIPL 1YITN 1Q82O 4WFAL 1N8RO 5GADP 2OTJN 3CCLN 1K9MO 1QVGM 5DM6L 3CCMN 3CPWM 3PIOL 1VQ8N 1K8AO 3DLLL 3CC2N 2QA4N 1VQ7N 3G4SN 5GAGP 1Q86O 1KD1O 4WCEL 3CCEN 2QEXN 1YJ9N 4IOAL 4U67L 1YI2N 5GAHP 5JVGL 1QVFM 3CC7N 1YJNN 1VQPN 4IO9L 2ZJRL 1S72N 1ILYA 1Q7YO 1VQ6N 1VQ4N 5JVHL 3CCJN 5GAEP 1OVYA 3CCSN 1JJ2M 2ZJPL 3CCVN 4IOCL 1KQSM 5H1SQ 1M90O 3CD6N 1VQMN 1VQON
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OS2A 4DSEA 4FJIA 1W2BM 2IVPA 1H1VA 3THYA 3SK3A 1JKHA 4M3ZA 2VG6A 5AQNA 4OGEA 3LZIA 1OH8A 2GWJA 2GWKA 2WUSA 3VQ9A 3L2QA 4MO5A 1BOTO 4AHCA 4YFUA 1E3MA 3UKRB 2VWKA 5AQIA 3VOVA 3FFKB 3MAQA 3O4WA 5CZ2A 3CXCM 1RTIA 4JKCA 5AQFA 2UUBK 1HUXA 4H5VA 1Y64A 3DOLA 3SBTA 4LFBK 3DOKA 2PBDA 1XC9A 3SUPA 3MCPA 1YITN 1Q18A 4MDAA 3WUHA 4DG1A 1BUPA 1NJZA 4Z4IA 3C7NA 3E1YA 2Q2RA 4B9TA 4YOTA 4BACA 3CQYA 3HM9A 3PSFA 3K0SA 3QDKA 1U04A 4A5AA 4DLGA 4DKWA 3P1GA 4AHVA 1NKCA 4DFKA 1IBMK 5FLXO 3LP2A 1ATRA 1NLVA 3RVCA 2D0BA 2ZWHA 3TAFA 2DPNA 3SZ2A 3QEXA 3AV9A 2YHBA 3S3MA 3QBXA 4R79A 2I5JA 3WXLA 1YJNN 3NBPA 1DGKN 4OLAA 3QINA 3WEEA 1BGXT 3S3OA 1U6ZA 3HJFA 3LWMA 4H0VB 4MQ3A 2CH5A 3ZT4A 4AM6A 2HF4A 1NGHA 2BH1A 4DFPA 1DKGD 3D2FA 3CCVN 4OPHA 4AM7A 4FJ5A 2VWBA 4FJ9A 3KTQA 3O8MA 4BGBA 3NGIA 2ITMA 3QEIA 4KH6A 2H3GX 4H8KA 3AA5X 3SCXA 2UUAK 4CF2A 2ZM6K 2A6AA 5F2RA 3G6EN 5E41A 4R5PA 5BN8A 1RBVA 4ZTJA 4BR2A 3DXMB 3HP9A 2YHWA 3BUZB 1HYZA 3NCIA 3BP8A 1UA0A 1VRUA 1HJRA 1V4SA 2E4LA 3ISNC 2VQEK 3HZ6A 4BY9C 4GW6A 4FJXA 2R7YA 4KRFA 3SI6A 5C24A 5LL6Z 2F8SA 1VQ5N 3R6MA 3CG7A 3M8SA 1DTQA 5J2PA 4L3QA 3FFIA 1SKSA 1BQNA 3QMLA 1NOZA 4NCAA 3K5OA 3SQ1A 4FK0A 4DFMA 3ZETB 4FWKA 3PX0A 5FPDA 5AQWA 2P9PA 2O8CA 1R0AA 3ZT2A 2KQ2A 5T7BA 1RDUA 1TL1A 4CJFA 3QNOA 1BO5O 1KFSA 4HUFA 4ELTA 4DTXA 1EO1A 1QQCA 4HUGA 1MA9B 4YORA 1EX4A 2NZTA 4H5TA 1VSEA 1RBRA 4X64K 5TKWA 4CHQA 5LJWA 3FZLA 4QS9A 4E1JA 1TAQA 3L4QA 1QHTA 2EHGA 1WSJA 2GUIA 5CR4A 3VETA 3LDPA 3MEEA 3OA9A 3G10A 1HKGA 1RT1A 4J2DA 2IC3A 2KLAA 4B3SK 4E7JA 4PUOA 5E26A 5BREA 4JI1K 4DCHA 1KQSM 3T1YK 1SS6A 4CF1A 3HXMA 3VEOA 1M90O 4RW9A 3IDHA 3WNFA 5KTQA 4ID5A 1NGFA 3K2PA 3L2RA 4FW1A 1M1KO 3KKRA 2Z1GA 2VCPA 1WNSA 4EP5A 3CMEN 4NXMK 1O1WA 4HHTA 4DSFA 4CF9A 2YNIA 2OTLN 1NK4A 1QSYA 4IOXA 3VEZA 2NRRA 1RBUA 3LL3A 3M8RA 1SKRA 1LW2A 1YTAA 4M7YA 1IKWA 5ADXA 1Q9XA 3BDPA 3V9XA 3SPYA 1CXUA 4Q5VA 3H6EA 1X3NA 3KIOA 2ZJQL 2RPIA 3RMAA 4GKJK 4H0XB 3TSQA 2GELA 1GLJO 3NGYA 1XNRK 5M1OA 4WF9L 1QQOA 3A8YA 1BQMA 1VSJA 4BC2A 2GX9A 5AQGA 4AHTA 1JL2A 1VSIA 3NMUA 1D9DA 3FZFA 1JLCA 4PL7A 2ZGZA 3MEDA 1N5YA 4JK9A 5F1XA 2ASOA 4OKJA 1WAFA 2IVOA 1WN7A 2HSTA 3NF7A 2J4RA 3U6FA 1ZC6A 2Y1IA 5KGXA 4YY3K 2ZQBA 4XEIA 3HI0A 4K41A 2YNFA 1QVFM 3ZSVA 4CJVA 1GOCA 3MN7A 2NRWA 4I2PA 4DV2K 1XQSC 1EWQA 4AHRA 4PL8A 3HK2A 1REVA 3J81O 5M1PA 1JLAA 5I42A 4W5TA 3QFUA 5J2MA 3F73A 1O13A 2AP1A 2E2PA 3TAGA 4B3OA 1KXPA 5AQZA 5C10A 3ENHA 1VQON 4GNIA 4LFCK 3L2UA 1J5OA 2YNHA 2QWRA 4MFBA 5AJ3K 5CHIA 4N76A 1U2VA 3M8QA 3ZX3A 3VQ4A 2PY5A 2F4VK 5C15A 1TAUA 3VA0A 1CZ9A 3DLKA 4CHPA 3R9PA 4DTSA 5C0YA 1SL2A 1K73O 3KD5E 3VF2A 1TUUA 3HP6A 3THWA 3PX4A 3FE1A 1NGJA 3FR0A 1YJWN 1HNWK 3LP3A 4DV4K 4BR9A 4JK8A 2D1KA 3MX5A 1DLOA 2Y1JA 3EEQA 3KKSA 3DJCA 3CFPA 2P51A 3SAFA 4ISEA 1OH7A 3W3DA 2GUPA 5KPRA 3CIPA 4B9QA 1K9MO 3DYAA 4F3OA 2P5OA 3LAMA 2RN2A 3SJHA 3R8EA 1WLJA 3AY9A 1SV5A 1HNXK 2JGUA 3OYIA 4BVOA 1ATSA 1A5VA 1XHXA 4Y1CA 4CIFA 2D4WA 2E2NA 3ZT1A 3O9TA 3V1QA 2HBMA 1EP4A 3CC2N 1HQEA 2FSKA 1Q86O 1HNVA 3F9MA 4WCEL 5KQ8A 1EETA 1EXQA 4KAZA 2KZMA 2OPQA 4EAHD 3K9JA 1YTUA 3DM2A 3H3OB 3D7EO 5KPZA 4F4KA 2YV0X 2B4JA 2HNYA 2UYTA 3WNGA 4Q0BA 1TV6A 4IO9L 4Z4FA 3VEYA 3O9UA 1NKEA 4O4GA 2G8IA 2HHXA 3MK6A 3TAEA 2NRZA 1OH5A 4BWJA 3KLFA 5AZJB 4AF1A 4IG3A 2NRXA 5M1QA 5CY4A 3HOSA 2P9KB 4CBXA 1UAXA 4JKFA 3VEWA 4B9MA 4JI2K 1D5AA 5H1SQ 4JYAK 1ATNA 4ISGA 2Z1HA 2P9LB 3JS6A 3PV8A 4CZHA 3J7AP 3P39A 1QS4A 3VENA 5B8HA 4LSNA 3CFOA 2PZSA 3O5BA 4CJ4A 3DLHA 5BRFA 4OLBA 3QEPA 2XY8A 5AQMA 3SMPA 4FWOA 3J80O 4DV5K 1C1BA 3TAMA 2DFFA 3NHGA 3O9QA 3LWLA 1C0GA 3RMDA 3ID8A 3KLEA 4BROA 4CEOA 4N41A 1K8KB 3KHYA 4B8AB 3NDKA 3M3ZA 4FM2A 4UY8O 5HRPA 4FW2A 3D0PA 5LMUK 4JKGA 3KLIA 3QIOA 2ASMA 2XY6A 1WB9A 3VQ8A 1LAWA 4FOEA 1JL1A 2HBJA 3KWGA 2KFNA 4HCBA 5EY4A 3M5RA 1YXQA 1VAZA 4O5FA 4CZGA 4FLZA 3NVKA 2O8DA 3SQ0A 4JI0K 2E2QA 5FPMA 2XHBA 4BRFA 4BRNA 4H0TB 3UKUB 1XMOK 2ITGA 1HNZK 2FF6A 4X66K 1YJ9N 4XH1A 4I9QA 3TABA 4IOAL 4IFEA 4K8ZA 1TYQA 2DFEA 1YF5L 2D0OA 3VQEA 4DF8A 2Q0UA 1TKTA 1C6VA 4JD2B 1HQUA 3AVMA 4KHQA 1XI1A 4H0PA 4DLEA 2E1YA 2KTQA 2OA8A 4OPAA 5GIPA 4DQ8A 4GVMA 4CGHA 4FJKA 1FKPA 2HVHA 4IOCL 1S5JA 3LPTA 5JLHA 2YI1A 2P9UA 4NYNA 3ENOA 4KHUA 4DQIA 2IGIA 3G25A 3SBGA 1BU6O 3OTOK 1HKCA 1GLBG 2ASPA 1CLQA 4ZHRA 5HL7L 1LW0A 2V7ZA 3CETA 5AQSA 1N33K 5BPNA 1X9SA 2P9SB 2W40A 4CZLA 2UUCK 3OJSA 3DRRA 4IBNA 2P9KA 3ZSQA 4CBUA 4LD0A 3ULDA 1WSGA 3GDQA 1HR0K 3O9SA 3SV3A 4DTRA 3K5NA 4CGGA 3L2VA 2VWJA 4KB0A 4I6MB 3LALA 4C1NK 4OKEA 1YHQN 5AZIB 4DV0K 4KFBA 3GOIA 1VHXA 3LZJA 2A1SA 1W0HA 3LAKA 4CECA 2O4GA 3IAYA 3MCAB 2YHXA 3SPZA 3KZBA 4E1NA 4JNEA 2NRTA 2NNWA 1X9JA 3M8PA 1KAZA 2QXFA 1N36K 5LY3A 5AQRA 1GLDG 1SQKA 4FVUA 1LCUA 4I2QA 3D6RA 4PKGA 3RSEB 2E5LK 1IKXA 1RILA 4KB1A 2JWKA 2O8FA 1NGEA 3HYFA 3FGUA 4RCHA 2CGLA 3OHRA 2P9NB 4B1ZA 3RR7A 3WXJA 1VSDA 3ALYA 5AQQA 4EFHA 1S3XA 4GV3A 4M41A 1E4GT 4LF6K 4JHDA 4XH5A 2I7NA 1HRHA 3NGZA 2OYQA 2GBZA 3AVLA 4AILC 1VQ6N 4LC9B 5KI6A 2B6AA 1NGDA 1TK0A 4FZZA 4JKBA 4C8OA 3QBWA 4PA1A 1RBTA 3TPQA 1T05A 1YVUA 4CJSA 3UB5A 4X62K 1IG9A 3CD6N 2HMIA 3NH2A 3EE9A 3LPUA 4DTUA 2HHQA 1CZBA 3CJCA 1FW6A 3QICA 4M3RA 4X65K 2RE2A 5I3UA 4Z4CA 1C0TA 3IFRA 4GV9A 2AJQA 1KC8O 3HOTA 1RDAA 2HHTA 1X1PA 4DFJA 3HSTB 1N34K 1BIUA 3V1OA 3EKSA 4LFAK 2O8BB 2W6KA 2XRIA 3DMJA 3DRPA 2VYPA 2Q36A 1JCGA 3OW2M 3CMAN 3IUCA 3O4QA 3EN9A 1CZAN 4KHYA 3LP1A 1X9MA 4JS5A 3TI0A 3VQDA 3CCUN 3SAHA 1A5WA 2D0CA 1L3TA 4QS8A 4B1WB 1IKYA 5K14A 2YKMA 3KLHA 2QWNA 4PKHA 4QAGA 3U3YA 4CGFA 4HCCA 3OYGA 5AZIA 4O55A 5KPTA 3TTFA 4BVPA 4PQUA 5FPNA 4LF5K 4DHYA 3IKMA 3UE5A 3G0ZA 3AO2A 4KTWA 1S1VA 4DU4A 3BZCA 4BQZA 1FJGK 1HPZA 2QK9A 4KBOA 4NXNK 1RFQA 3AVJA 2OZMA 3UKRA 1W9HA 1T44A 4OPKA 3RWUA 3DLBA 4L8RB 2XY5A 2YJFA 3O4NA 1GLEG 1NJYA 3PO5A 3SUOA 2G8WA 2OZSA 2BANA 4DUYK 5EU7A 4M7XA 4IZ9A 1BG3A 1HNIA 1WBBA 1HYSA 3WXMB 4IEIA 1B92A 2ZGYA 2E2OA 1SAZA 2UXBK 4IJNA 2KKZA 2QTDA 2OPRA 3DLGA 5FPEA 3H1QA 3SLCA 5EOYA 1IO2A 1HYVA 3WXIA 4QCLA 3LDNA 4BDYA 4JI7K 2HW3A 3J8AA 3K57A 4M45A 3HO1A 3CM5A 3LM9A 1VSLA 1C0UA 1KAXA 3QERA 2X6NA 2IDOA 1BISA 2WFBA 4HUEA 3ZYYX 3N4PA 1GOAA 4CERA 1TL3A 1VQLN 4HWIA 4BQLA 1ASUA 3OYCA 3O9RA 3A2FA 1D9FA 4IFVA 4RW6A 1OVQA 3EL2A 4CHOA 4IO8A 1J9AA 2FC0A 5CYQA 3KK7A 4A57A 1NBWA 2IAJA 3KWIA 1KAYA 2QWOA 3F2KA 4HTUA 2QM1A 2UXDK 3TTCA 3RTVA 4BGAA 1JCEA 4I9LA 4WFBL 4CZMA 3EO3A 3J7YP 4IJAA 1ASVA 4CJLA 4FYDA 2QI2A 3AO4A 1RT7A 4Z4HA 4KPYA 4FLUA 4CJ3A 4JI8K 2VGMA 1K8AO 4PWDA 4BWMA 2OPSA 1NJXA 4JRQA 4IEEA 4IG0A 4A61A 1IG8A 4FJJA 3A5LC 3NAEA 3DXMA 3ITHA 5GAGP 1KD1O 4CFAA 1NWKA 1RTHA 3V9SA 4DS4A 4CEFA 3OYNA 5M1FA 3ZCMA 1R59O 4U67L 1T6DA 4FJ8A 4CZJA 1QE1A 4C8LA 1NM1A 5M1NA 4BREA 3AVCA 1QQNA 5EX5A 1LWEA 4CEEA 2V7YA 1J5EK 4CEQA 2B5JA 5C42A 2FF3B 1QZ6A 5IT9O 5GAEP 3QLHA 4CFDA 1XHZA 2E6MA 3T19A 4A62A 4KTQA 4O0JA 1S1XA 1JLBA 3CJBA 3K9KA 1SUQA 4AQYK 5AR0A 1KSPA 3DI6A 3L8BA 1WAJA 1BIZA 4KV8A 1TK5A 3ULEB 4AHSA 4CCHA 4DR6K 3ZETA 4ZTFA 3NVMA 1N32K 4IXCA 5HRNA 4DR5K 1KCFA 2P9IB 4BR5A 1NU0A 1KVBA 2F8TA 1V4TA 3VEVA 2ETJA 4M3XA 2HOEA 3VQQA 3TR8A 2D5RA 4FWQA 2NUBA 1OH6A 5JS1A 5AFUH 1NGAA 3BF1A 3O08A 2YCHA 3B6OA 4DU3A 5BR8K 3MN9A 3A5OC 3SYZA 5JS2A 4KHPK 2W42A 3C94A 3HRGA 1J53A 3ZSYA 3SV4A 3LDQA 3ZSRA 3O6WA 1S22A 3ZSXA 5AQOA 3EKUA 5HP1A 1Q81O 4KHWA 2X74A 4CZEA 2D0PA 4ELVA 3CPEA 3TU5A 4FO0A 1F21A 1KLNA 3P31A 3AA3A 1IH7A 3V6DA 4J2EA 3S41A 4K8XA 1DT9A 2CH6A 4DR7K 1WSEA 3U8XA 4J2AA 3AGRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC4 N;  3I55 N;  1W2B M;  1M1K O;  5HL7 L;  1VQ9 N;  5DM7 L;  3CME N;  1NJI O;  3G6E N;  1KC8 O;  1YIJ N;  3G71 N;  2OTL N;  1VQL N;  1K73 O;  3OW2 M;  1VQN N;  3CCR N;  3CMA N;  1YJW N;  1Q81 O;  3CXC M;  1YHQ N;  3CCQ N;  3J7Z O;  2ZJQ L;  3CCU N;  1VQK N;  4WFB L;  1VQ5 N;  3I56 N;  4WFN L;  4UY8 O;  3CF5 L;  5MLC Q;  4WF9 L;  3PIP L;  1YIT N;  1Q82 O;  4WFA L;  1N8R O;  5GAD P;  2OTJ N;  3CCL N;  1K9M O;  1QVG M;  5DM6 L;  3CCM N;  3CPW M;  3PIO L;  1VQ8 N;  1K8A O;  3DLL L;  3CC2 N;  2QA4 N;  1VQ7 N;  3G4S N;  5GAG P;  1Q86 O;  1KD1 O;  4WCE L;  3CCE N;  2QEX N;  1YJ9 N;  4IOA L;  4U67 L;  1YI2 N;  5GAH P;  5JVG L;  1QVF M;  3CC7 N;  1YJN N;  1VQP N;  4IO9 L;  2ZJR L;  1S72 N;  1ILY A;  1Q7Y O;  1VQ6 N;  1VQ4 N;  5JVH L;  3CCJ N;  5GAE P;  1OVY A;  3CCS N;  1JJ2 M;  2ZJP L;  3CCV N;  4IOC L;  1KQS M;  5H1S Q;  1M90 O;  3CD6 N;  1VQM N;  1VQO N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OS2 A;  4DSE A;  4FJI A;  1W2B M;  2IVP A;  1H1V A;  3THY A;  3SK3 A;  1JKH A;  4M3Z A;  2VG6 A;  5AQN A;  4OGE A;  3LZI A;  1OH8 A;  2GWJ A;  2GWK A;  2WUS A;  3VQ9 A;  3L2Q A;  4MO5 A;  1BOT O;  4AHC A;  4YFU A;  1E3M A;  3UKR B;  2VWK A;  5AQI A;  3VOV A;  3FFK B;  3MAQ A;  3O4W A;  5CZ2 A;  3CXC M;  1RTI A;  4JKC A;  5AQF A;  2UUB K;  1HUX A;  4H5V A;  1Y64 A;  3DOL A;  3SBT A;  4LFB K;  3DOK A;  2PBD A;  1XC9 A;  3SUP A;  3MCP A;  1YIT N;  1Q18 A;  4MDA A;  3WUH A;  4DG1 A;  1BUP A;  1NJZ A;  4Z4I A;  3C7N A;  3E1Y A;  2Q2R A;  4B9T A;  4YOT A;  4BAC A;  3CQY A;  3HM9 A;  3PSF A;  3K0S A;  3QDK A;  1U04 A;  4A5A A;  4DLG A;  4DKW A;  3P1G A;  4AHV A;  1NKC A;  4DFK A;  1IBM K;  5FLX O;  3LP2 A;  1ATR A;  1NLV A;  3RVC A;  2D0B A;  2ZWH A;  3TAF A;  2DPN A;  3SZ2 A;  3QEX A;  3AV9 A;  2YHB A;  3S3M A;  3QBX A;  4R79 A;  2I5J A;  3WXL A;  1YJN N;  3NBP A;  1DGK N;  4OLA A;  3QIN A;  3WEE A;  1BGX T;  3S3O A;  1U6Z A;  3HJF A;  3LWM A;  4H0V B;  4MQ3 A;  2CH5 A;  3ZT4 A;  4AM6 A;  2HF4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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