3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
2OTJN 4IOAL 3CF5L 1VQ9N 3CCMN 1M1KO 3DLLL 1QVGM 3CMEN 1K8AO 2ZJQL 1QVFM 5DM7L 5JVHL 1YI2N 1KD1O 1S72N 3PIOL 1VQLN 3CMAN 2ZJRL 5DM6L 1YJWN 1NJIO 1YHQN 1K9MO 2QA4N 4UY8O 1JJ2M 3CCVN 5GADP 5GAEP 3G4SN 1W2BM 1VQ8N 1VQON 3CC7N 4WFBL 2QEXN 3CC2N 1M90O 3CPWM 1VQ4N 1VQ7N 1VQMN 1Q82O 3CXCM 1YITN 4WFAL 5GAGP 3J7ZO 1YIJN 4U67L 1VQ5N 1VQKN 3CC4N 3CCLN 4IOCL 5HL7L 1YJNN 1N8RO 3G71N 4WF9L 3CD6N 5GAHP 3CCQN 1Q86O 2OTLN 1OVYA 5H1SQ 1ILYA 1KQSM 1VQ6N 4IO9L 1K73O 3CCUN 3PIPL 3CCRN 4WCEL 3G6EN 1VQNN 4WFNL 1YJ9N 1VQPN 5MLCQ 1Q7YO 3OW2M 3I56N 1Q81O 3CCEN 3I55N 1KC8O 2ZJPL 3CCJN 3CCSN 5JVGL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSEA 3MN5A 2ZF5O 2XHBA 1XNQK 5KGXA 4LSLA 1TAQA 1A5WA 3A5NC 3OYEA 1WUAA 1W97L 3ZSVA 5CZ2A 4E7HA 3ATUA 1BO5O 5JS2A 1VSFA 3KWIA 4DU1A 4OPJA 1FJGK 2EHGA 1YJWN 5C24A 1QQCA 2QWOA 2VCPA 2B6AA 4NB4A 3H1QA 3OA9A 5AQKA 5KPZA 1FK9A 1LWCA 5AQQA 5BREA 3WQTA 3SQ1A 4B9SA 3THYA 3BGRA 3FR0A 3W3DA 4EFHA 5CE3A 1UAXA 3QDKA 1T6CA 1XMQK 1RILA 2YKNA 1S3XA 3AVHA 3O9TA 5CYQA 4B08A 5J2NA 2Z1HA 5B8HA 2E6LA 1NK6A 5AR0A 1IBLK 4N76A 3NF8A 4B8CA 1HUXA 3FZKA 3ZSZA 2OTLN 3L2UA 3PX0A 1RTDA 3VTIA 4HUEA 3HOTA 1ILYA 4A2BA 2EX3A 5E84A 1HR0K 4NLCA 2FLOA 4MDAA 4F9OA 2E2NA 3IUCA 1QQNA 3DXMA 3JYTA 4DV0K 2QKBA 2UUCK 4BRLA 4K25A 1NK5A 3BY5A 4QCLA 4F3OA 1TV6A 4YOTA 4CIEA 2X74A 3J8AA 3AVBA 3VEVA 3S41A 1JL1A 2Z1JA 2RPIA 4DB3A 4BC4A 2VG7A 5IT9O 4JYAK 1C1BA 2JGUA 3HP9A 3TU5A 5BN8A 2QWQA 5GIPA 1BIZA 3TTCA 3CFPA 4I9QA 5FPEA 3DLLL 3FGUA 3AVJA 4H5WA 4DSFA 4JV5K 4PWDA 3ZX2A 3KK7A 2Q31A 4A5AA 2ZE2A 3BF3A 2Z1IA 1TKDA 4NCAA 5CHIA 4CI6A 4JEPA 3V9SA 3I8DA 3TPQA 1TL1A 5M1QA 2E2QA 4AHCA 4JKEA 3ZLJA 4Z4IA 1NJIO 1WN7A 2Q1NA 1K9MO 1NKEA 3OYCA 3EL2A 5JS1A 5TKWA 3WNHA 5GADP 1XHZA 3VQ7A 4BRHA 4YOUA 1NNEA 1FW6A 1N33K 1TUUA 3JS6A 2OCEA 3AA4A 2Q0UA 1NOZA 3SYZA 4CGHA 3C6HA 4OVLA 3DLHA 2F9TA 4M3ZA 5AQGA 3OYJA 4OPHA 1RDDA 3K5NA 5M1FA 1X3NA 4FJKA 2X78A 2HHVA 1EO1A 3TAMA 3ID8A 5EY4A 2DTUA 1N8RO 4B1YB 2YX6A 4DV1K 3A5MC 1VRUA 4LC9B 5JMVA 3M8PA 4CZEA 5C15A 1N34K 3JXUA 4JKFA 5AQTA 4BE1A 3ISNC 2O8DA 3F9MA 3SAHA 3GE1A 3G6EN 4X66K 1A5VA 1WNSA 3V9UA 3AO3A 3RSEB 4KI6A 2IVNA 1NGGA 3KHYA 4CFDA 2PZSA 3WXIA 4YY3K 3O1WA 1NJXA 1JXEA 4CHPA 3VMFB 4J2AA 3LANA 1RT6A 4FJ8A 4O8KA 2P9LB 5KTQA 2PYLA 3MMVA 5ELZA 4KHWA 4DU3A 1T3VA 4W5QA 2QM1A 2YHBA 3A2FA 4H5NA 4CHOA 3IS9A 1LOTB 3VEXA 2KLAA 1RBTA 1S9GA 4IDKA 2P9SB 1NLVA 2Y1IA 1TKZA 2CGLA 4FWPA 4IZ9A 2HHXA 1GLDG 2YKMA 1S1WA 1JL2A 1JJ2M 1ZBHA 3S3NA 3G25A 1QE1A 3ZT3A 4A62A 2RKIA 3NE6A 5TKYA 3SQ2A 1A5XA 5FRNA 4HHTA 4H8KA 2P9UB 2ITMA 4LFBK 2IVPA 4FCYA 2P5OA 2P9PA 4W5OA 3U9ZA 2HHTA 4CBXA 1IKWA 3GBTA 3OYBA 1VSJA 1TKXA 4B9VA 4FJJA 2UXDK 2WFBA 5HBMA 4CZHA 2E5LK 3HPHA 2YHWA 3DOKA 5FPMA 3HM9A 1W0HA 2DFHA 5FROA 4DSKA 3CCQN 1BOTO 5H1SQ 1TK8A 1SKRA 4BWJA 3SUQA 1BU6O 2QWRA 3LDSA 2QXLA 1JLAA 5ADXH 2G8KA 2GX9A 4BG8A 4FYDA 3KVGA 2D4WA 3HYFA 1VQNN 4FSVA 5LJVA 1HYVA 4DF4A 1UA1A 3B6OA 4DQSA 3M8SA 2FF3B 4G9ZA 3PUFA 4GMJB 4CGGA 1CZBA 1BI4A 2YHAA 1GOAA 2F8SA 3CCSN 3OS1A 2OA8A 2V52B 3MEEA 3K9JA 4TSXA 1WAFA 4CJUA 1VQ9N 1TKTA 2E1YA 3BEXA 4XIUA 4FLVA 4KV8A 3O3GA 3ZCMA 4F3TA 5KQ8A 1BA1A 4BRGA 3NHGA 1ATNA 5DM7L 4RG8A 3HL8A 1YI2N 2NRHA 4BWMA 3TI0A 3EZ5A 1KD1O 5AQSA 3VTHA 3VETA 1ASUA 5HRRA 2A42A 5J2MA 3WT0A 1IG9A 3DXKB 3K5LA 5T7BA 3S3MA 3NAEA 3VQ9A 2QA4N 1F21A 3AA3A 1RNHA 4QOZB 5C10A 3C7NA 1C0FA 4JKGB 5AQJA 5GAEP 3IDHA 2IC3A 4J2DA 3MEDA 1S1XA 1SL1A 4YORA 1RDAA 4JKCA 4JI3K 2GUPA 1N5YA 4DTNA 4GVEA 2V7YA 1VQMN 2QWPA 4WFAL 5GAGP 4BQLA 1ZC6A 4CHZA 4RW9A 1RT5A 4FWMA 3CC4N 4FOEA 1C0MA 1OH6A 1HJRA 4K0KK 3P31A 4BC5A 4KREA 2B4JA 4ILHA 4FZXC 3L2VA 3OYNA 3NH2A 1WBBA 2BDPA 1OVYA 1RFQA 2HBJA 2VWBA 1K8KA 1WSHA 3CJBA 3VQQA 3IG1A 1DTQA 4CJTA 1TYQA 4CZKA 1JCGA 4N5SA 4DSIA 1ASVA 1HKCA 2OZSA 5AQUA 5FRMA 2D0BA 3MWTA 5BRHA 1TYQB 3CM5A 2OPSA 3KKRA 3M6GA 4QS8A 3AA2A 3RWUA 4LD0A 1QSYA 3CCEN 1HYSA 3I55N 2W40A 4KPYA 1XI1A 1BI4B 4DLEA 1KAYA 3TSUA 2GWJA 2FSJA 3LDQA 1S1TA 1JLGA 1I3AA 3VEYA 4FK4A 1JLBA 4LF8K 4FM0A 4H0PA 4FJMA 3A5OC 1QZ5A 2RE2A 5KRTA 2OPPA 4DTPA 4ELVA 4HVJA 3SBGA 3P83D 1WAJA 2QWLA 2G8FA 4CJSA 5AQIA 3OVNA 2F4VK 3PIOL 1S22A 3LAKA 4LFCK 3WXJA 2QWMA 3ZSQA 4CD1A 1EKEA 3KK3A 3THWB 2HW3A 1NKBA 3VQAA 1WBDA 4CFBA 3J7YP 1JXBA 3H3NO 3MEGA 1C0GA 2HHSA 4CZLA 4KO0A 4OLBA 3AO1A 3RVCA 3NF7A 4BVPA 4OX9K 4H0VB 2GV9A 3LP1A 3OYIA 2CH5A 1KAZA 2XY6A 4KHSA 4DFKA 3HBTA 4ELUA 3RRGA 4E19A 1M90O 3QEPA 4LF4K 3O4NA 2HNZA 4H5VA 3LL3A 4ISFA 1HPZA 4KH4A 3WNEA 2FC0A 3CYMA 4GVMA 1VHXA 4YFUA 4JI7K 2E1ZA 4X65K 2EWSA 4FLYA 2AA4A 3EZWA 3WNFA 4CK3A 4YHHK 1QZ6A 4YOVA 4IO8A 4CBUA 3PIPL 1D4XA 4L3QA 1VRTA 2WTUA 3C6TA 4DR2K 1T8EA 2O8CA 1XC3A 1TL3A 3MN6A 4JNEA 5JLFA 1LW0A 1SUQA 3HVTA 3CJAA 3OW2M 1RBSA 3WXKA 4JI0K 4B1WB 1RTHA 1IKVA 4CF0A 4BDYA 5AJ3K 4ZTJA 1IJJA 2VGMA 1NGCA 2KKZA 3AVGA 3NBPA 4OGEA 1KC8O 3FFIA 1CLQA 1GLEG 1BL3A 1HKGA 4HUGA 4H0OA 3MDQA 4YDUC 2QK9A 2G8IA 1M1KO 3L0QA 2ZGYA 3VESA 2HF3A 1RBVA 1SV5A 3P1GA 3VQBA 1OVQA 4F8RA 1MWKA 2YCHA 3N4QA 1QVFM 4JD2A 4DR3K 1GLAG 2FSKA 3SV3A 1KVAA 3FFKB 3AVMA 4CZGA 1L3TA 4W5TA 1RDCA 2V7ZA 5M1PA 4YOXA 3TANA 1W7AA 1RT3A 4A2AA 2KHOA 2DFEA 1I94K 4KI4A 3ZETB 2NNWA 4CJ4A 4LH5A 3ZX3A 3LP2A 4CJRA 1XQSC 3PO4A 4NLBA 1BCMA 4W5RA 2JLEA 4GV6A 3EEQA 3H08A 4F2RA 3HT3A 1ZBLA 4DR1K 3AVNA 1J5OA 4B9TA 5HROA 1VSMA 3R3LA 3K0SA 1IKXA 4O5BA 4OKJA 3CFRA 4HWIA 3CJ9A 3ALYA 5LL6Z 1NG9A 3CC2N 3EY1A 4AQYK 5C0YA 3H45C 2BTFA 4XH4A 4DUZK 4MO4A 1XWLA 2P9NB 1D8YA 2P9IA 1YTAA 4DQ8A 4DQQA 1NK4A 4DWIA 5GIOA 3THXB 1N36K 1WSFA 1BHLA 4DR5K 4FLUA 3QIOA 3QFUA 4Y0WA 2HVIA 4BG9A 1KFSA 1T03A 3DRRA 3LZJA 4I7FA 1MU2A 2B5JA 3D2EB 3CJ7A 2A6AA 3L2RA 4KHYA 3VF6A 5BRDA 4JK7A 2GEMA 1IH7A 4FW2A 5EOYA 1HQUA 3SK3A 4CEOA 1YAGA 2A1SA 2HVHA 2YJEA 1TK5A 3NH0A 3AARA 3ZSYA 3QO9A 3KLGA 2VWJA 2HHHK 5JICA 2OPRA 4O44A 2NRRA 4FM1A 1KTQA 3NVKA 1T44A 1GLFO 3GL1A 2E2PA 3OYFA 4FJGA 4B3OA 1NM1A 4I2PA 2I7NA 2ATQA 4JHDA 4C1NK 3QMLA 1B9FA 1BISA 1S9EA 3H46O 5EVZA 2FBXA 4CIFA 4JHDB 5SWMA 1QSLA 1FXXA 1Q8IA 3NGIA 1OKJA 3LP3A 2J4RA 4BRMA 3RRHA 4H0TB 4CZMA 3CMAN 1HMVA 3ATVA 2Q97A 3C65A 4BDPA 5C2DA 5DM6L 3UB5A 3I8BA 5KQDA 3V1QA 3OY9A 3W0LA 4DV5K 3G0ZA 4DV6K 2A41A 4X62K 2CGJA 4KTZA 1NGFA 4M3UA 2I5JA 1KSPA 3HVRA 1RT2A 4C23A 1W2BM 3RMAA 4CERA 2UUAK 4FK2A 2D0PA 1NGEA 4IG3A 3VGMA 2ZGZA 4DHYA 3OBYA 4NYFA 4GV9A 1JKHA 5AQXA 2HHUA 5LY3A 2HMPA 4M3RA 2GUIA 4AILC 1RDBA 4CJPA 1NU0A 1YITN 1DEJA 3L2WA 1NGAA 3DM2A 3V4IA 1VQKN 4YDUA 4CEBA 3A5LC 1WSEA 2YNHA 3CD6N 3R1XA 3SAGA 2E6MA 3AAPA 4Z0UA 4DTSA 1NBWA 5I3UA 5KGWA 3OYAA 1HPMA 4LF9K 4KAZA 3LPTA 3T3FA 3VF4A 4K8ZA 2O8FB 1NK8A 1Q9YA 1IBMK 1U04A 3R8EA 1EQYA 1L5UA 4Z4FA 3QESA 3VQ5A 3E9OA 4WQ4A 4M41A 2GWKA 3NGZA 3WUHA 3I0SA 3OYDA 4PUOA 3AGKA 4BRIA 3V1OA 1O1WA 1NGIA 4M3YA 3U9DA 3K5MA 3SJHA 1B9DA 1GLLO 2YNIA 4WQ4C 3T1YK 3OS0A 4LF7K 3ITHA 1B92A 3WXLA 2QW9A 4H5RA 4OO1J 2P51A 5AQLA 5D3GA 4MQ3A 1NK9A 1BDGA 1LWFA 1OH7A 2JWKA 5AQVA 4QS7A 3CETA 3EE8A 1KXPA 4CK1A 1WSGA 1IBKK 1QHAA 3IRXA 5A2QO 1BCOA 5LJWA 2PFUA 4DSJA 3A0IX 4CW7B 4E0DA 2JWLA 4EHUA 1CXUA 3M3ZA 4BR4A 3SQ4A 2A5XA 4CCHA 4DFPA 3UIQA 4IKFA 2VG6A 3AAQA 2FXUA 3VEZA 4M42A 2PBDA 1HJOA 4JKAA 4QAGA 2HSTA 2VWKA 4JKGA 4FLTA 1ITGA 1U4BA 4FZYA 1WSJA 1IO2A 4KHQA 5AZJA 4JK9A 2D0AA 5E26A 1X9JA 3QIPA 5C42A 3F73A 3T1HK 4IXCA 2BH1A 4LSNA 4HCBA 4B9NA 2G8WA 3OHRA 2VQFK 3H1VX 3TTDA 3TABA 4W5NA 4BVOA 2LSNA 4AM6A 1U45A 4CJLA 1YIJN 4U67L 3BP8A 4J8FA 3KD1E 2HBLA 4Z94A 5AZIA 2HBMA 3QBXA 3L3UA 4WF9L 3ZSOA 2E8AA 4FLXA 4H5TA 3O9RA 4CJWA 4JS5A 3NVMA 4FJLA 4IOXA 2BUPA 5BPMA 3ULEA 5BN9A 5EX5A 3QEWA 1CXQA 1J5EK 1O13A 4MDBA 3FZHA 1JCFA 3V9XA 4FLZA 2O8EA 3DLRA 2O8FA 2KW4A 1EP4A 4EIAA 4FO0A 4Z4EA 4IDHA 4FJXA 4DUYK 4ISGA 2DFFA 1ZYQA 4PHTX 2WUSA 4E3SA 3QINA 3SCXA 4DCHA 3VGLA 3SI6A 2OTJN 3D2EA 4BR9A 5M1KA 1R59O 4DQPA 5I9EB 1HLUA 3VA0A 2D1KA 1OH8A 4NCGA 3QEVA 4Z4GA 1NGHA 5JVHL 4I6MA 4FWSA 2Q0RA 5AQWA 1S72N 4CJFA 3C7NB 1MDUB 4MLHA 3CJ1A 1LAVA 1TVRA 4KRFA 3CI5A 3LP0A 4A57A 4CJKA 1NOYA 2P9PB 3R6MA 1V4SA 1DTTA 4CEDA 5HP1A 4CF9A 3AO2A 1YHQN 4BRAA 5HRNA 3PY8A 4M45A 1J9AA 1U2VA 5EU7A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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