3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
3CC2N 1VQ6N 3CC4N 1QVFM 4IOCL 2OTLN 5H1SQ 3CF5L 3G6EN 1VQLN 1Q86O 3CPWM 3CCSN 1S72N 3CCJN 4WF9L 5GAGP 4WFNL 3G4SN 3CCUN 1QVGM 5DM6L 1JJ2M 3CCRN 5GAHP 1YIJN 3PIOL 1VQ8N 3DLLL 3I55N 1VQON 3I56N 3CCMN 1NJIO 5HL7L 2QEXN 5DM7L 1YI2N 4WCEL 1K9MO 1M90O 1VQKN 2ZJPL 1Q81O 5JVHL 1N8RO 1KQSM 3CCLN 1KC8O 1VQNN 1ILYA 4UY8O 3G71N 1Q82O 2OTJN 1M1KO 5MLCQ 4WFAL 1Q7YO 3CD6N 2ZJQL 1VQ4N 1W2BM 1YJ9N 3PIPL 4U67L 3CC7N 1K8AO 2QA4N 1YJNN 5JVGL 1YJWN 1K73O 4IOAL 5GAEP 1OVYA 3OW2M 1VQMN 1KD1O 3CCEN 3CMAN 3CMEN 1VQPN 1VQ5N 1VQ9N 4WFBL 3J7ZO 2ZJRL 5GADP 4IO9L 3CCQN 1YHQN 1YITN 3CCVN 1VQ7N 3CXCM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZHA 4E7LA 3WUHA 1HQEA 3LP2A 1HX1A 1HLUA 1HKGA 5M1QA 1RT3A 2NRWA 2ZQBA 1TGOA 2BE2A 1VSIA 2WTUA 3WEEA 3ZX0A 3SK3A 4FJLA 4BC5A 3HPGA 3HRGA 5LJVA 1RCHA 3LAKA 1TK8A 3DXMB 4LF4K 2YNFA 4FWPA 1ASVA 3LL3A 1YIJN 4CHOA 3VQ5A 3PIOL 4R5PA 1NGAA 4CJLA 3I55N 1VQON 1S9GA 4BGAA 3CHWA 4HUFA 2O8BB 4CGIA 1X1PA 1N32K 1CZ9A 4H5RA 4B1ZA 2QI2A 4BRKA 3VQPA 2QEXN 4YDUA 4W5QA 2FSJA 2I7PA 3O9UA 1IO2A 1J6ZA 3QBXA 3TAMA 4A61A 5C24A 2G8KA 1JL2A 5KPZA 5JVHL 4KB0A 1JLFA 5HBMA 1VSKA 3M1FA 3O1BA 4B1XB 4F3TA 2D0BA 3ID8A 3OYHA 5KRTA 3CI5A 4FM1A 4DU1A 3R1XA 3E01A 4CZHA 4H0YB 1NGCA 3VEZA 4WFAL 1KAZA 2KW4A 4H5VA 3ID6A 1UWBA 4EZ6A 1OKJA 3VMFB 3AV9A 2P9NB 3ISNC 3UKRA 4LF8K 3J7YP 4H4MA 3E1YA 1C1AA 3SUPA 3R8EA 2JGUA 3OYJA 5GIOA 4CEFA 4CJ7A 2RN2A 1NLVA 1WSEA 1KVAA 4ID5A 4DV0K 3PLAA 2XY8A 1BU6O 1JCEA 4JK8A 3K0SA 3H1VX 4H0PA 4GY2B 3NF9A 3GL1A 3E66A 3TABA 5AQYA 3CMAN 3IRXA 1JXEA 2HMIA 4XH4A 3RRGA 1RDUA 4JI1K 1IG8A 4OLBA 3ZETB 2O8FB 4GW6A 2Q0UA 4AH9A 4DQRA 2RF2A 1XMQK 3AA5X 3ZSOA 4K25A 3ALYA 3NGYA 4C8MA 2YJFA 1FJGK 1LOTB 4U7BA 1C1CA 1ZC6A 3CF5L 1N34K 3VN5A 3CJ9A 3NDKA 4HTLA 2G8HA 2AJQA 1NGJA 3AAQA 1XHZA 2DPNA 3ZEUA 5J1EA 4DV2K 1ZBSA 1SAZA 3LWLA 3CQYA 4J2DA 1L3UA 1JJ2M 1HNIA 4K42A 2WBNA 4KAZA 1KVBA 2KZMA 1RT7A 2HHSA 4YOXA 4B3RK 3LM9A 1DKGD 1F21A 3LANA 4FJKA 1T3VA 4TSXA 3KLGA 3RR8A 3LDLA 4LH5A 4FZYA 4BC2A 3BZCA 4NCBA 3CFPA 4FCYA 2AA4A 2Q3SA 4AHCA 4KI4A 3WQTA 3MXJA 4BRPA 1VSMA 1RT1A 2HF3A 3B6PA 3D6RA 4CE9A 5LY3A 4MO5A 4DCHA 3BZKA 3MK6A 2BDPA 3FR0A 4FJXA 2P9IA 1EWQA 3O6WA 3HPHA 3C6TA 2QKBA 3PSFA 4BE0A 3OA9A 4H5NA 4LSLA 5KGWA 4DG1A 3AVBA 1TK5A 3VA3A 2HHWA 3ULEB 4H0VB 2Z1HA 4JKDA 2P9PB 2IS3A 2YKNA 4DR2K 1BISA 1NGGA 1XUPO 3NF7A 1D9DA 2QA4N 5BPNA 4FJGA 3DLBA 4DU3A 1JXBA 3OYGA 1VSJA 3VENA 1NGDA 1RNHA 4CJWA 2Q97A 4C8NA 1L3SA 4CZLA 3WXKA 3GBTA 1YITN 3QB0A 1JL1A 3O4WA 1TL3A 4CJFA 1FKPA 2P9LA 5KRSA 2YI1A 1KAXA 3L2WA 3ZSVA 1N5YA 4OKJA 5LMUK 3NAEA 4DFMA 4DFPA 2O8DB 4DR7K 3D7EO 3HM8A 3HK2A 1GLCG 1KCFA 3KWGA 4NXMK 1S72N 1BI4B 1DGKN 3VF2A 1X3NA 3VETA 4E19A 4H5TA 4BRNA 4WFNL 4RG8A 4C8LA 1SZ2A 3PX6A 4LC9B 3KIOA 3IDHA 2QW9A 1QE1A 2O4IA 3QLHA 1VK0A 4FXDA 4CBWA 1U6ZA 4KB1A 1LAWA 4K0KK 3ZT3A 2KLAA 4EZ9A 1EQYA 3AY9A 3MECA 2ATQA 4WQ5A 1RDCA 4FZZA 3NCIA 1JLCA 1BCOA 2F96A 4FLZA 3NVMA 4MFBA 2YNGA 4DV6K 3AAPA 2E2PA 4FYDA 1X3MA 3CJ7A 3ZYYX 1RBVA 1T7PA 3I8BA 3RMAA 3NVKA 2BGGA 5T7BA 1RFQA 2E2OA 4C1NK 3H46O 1BL3A 2FBXA 2YJEA 3F9MA 3O5BA 2E1YA 1HNXK 1TKXA 3BP8A 4CZMA 3HJFA 1CZAN 3H1QA 4KHNA 4JI6K 3SAFA 4OPKA 3TPQA 1NMNA 5FPNA 2HB5A 1WSGA 4M41A 5BREA 4BRHA 2Q1NA 5KTQA 1HNWK 1JLQA 1QZ5A 3AA2A 3WNGA 2P9UB 4Z4HA 3HVTA 4FO0A 3THYA 4Z4FA 3S3OA 4GV9A 2YX6A 1NOYA 1MU2A 3P5JA 4EIAA 3DM2A 4CIFA 4CHNA 4YHHK 1VQ5N 2BH1A 2ZJRL 2Y1JA 2E8AA 4IO9L 3U3GA 1GLLO 1U49A 3CCVN 1QSSA 3O4NA 4FWOA 4DQPA 2OPRA 3CC4N 3V4IA 1VSHA 3J80O 2HNZA 1T6DA 5JS1A 2BUPA 4M3UA 4PWDA 1RDBA 3PX0A 1HKCA 1YTAA 2D0AA 4YOUA 4JI7K 2A6AA 4WF9L 1BHLA 3U6FA 4I9LA 3SV4A 3EYZA 3OVNA 3GE1A 1QZ6A 5KQDA 1R59O 5DM6L 1ASWA 1J5OA 4C23A 2EX3A 4Y1DA 3L2QA 1GLJO 1E4FT 1I3AA 2HHVA 2NZTA 4N56A 1SQKA 2Z1GA 2UU9K 4GVMA 5AQFA 2OZSA 3CG7A 5LMNK 1NK8A 1HPZA 4FWNA 4ZTFA 2UUAK 4A5BA 2E2NA 3QO9A 2IDOA 4JI8K 5KQ8A 4JD2A 4PL8A 1C0GA 5AQNA 2Z1IA 3HO1A 1WSIA 1XNQK 4F9OA 1P90A 2P51A 3UKUA 2BANA 2Q0RA 1S1VA 1JLEA 4OX9K 2P9NA 2RHKA 4CHYA 3S3NA 5TKWA 2W42A 3AVFA 2F8TA 4JKAA 1X9WA 4CF1A 1HRHA 4W5OA 4JLHA 1HYSA 1NOZA 1HPMA 2HBLA 3CFOA 4OKEA 5AQLA 5BRDA 3QEVA 5GAEP 2QWQA 3OS0A 3LP1A 4A2AA 4J8FA 4Z0UA 3WXIA 4FK0A 4JKHA 4DTXA 4BDPA 4FLUA 1HNVA 4RW4A 4IXCA 3LDQA 3ZETA 1IKYA 4FOIA 4JRQA 3RVCA 2KTQA 4CERA 3A5LC 2HF4A 4JNEA 3NHGA 3T1YK 1ZBUA 1VAZA 3MWTA 3ZX2A 3NH1A 2HBMA 3BEXA 5AQRA 3JS6A 2VCPA 4E1NA 4CBXA 3ITHA 4B9UA 1S1WA 3L4QA 5LJWA 1S1XA 3OS1A 4DF8A 3WXLA 3QMLA 2XY7A 5F1XA 4QS8A 1YAGA 4I9QA 3OYNA 2VQFK 1VQ8N 2QWOA 3VESA 3QERA 3IUCA 4O4GA 4BRMA 2OCEA 4G1QA 2O8EB 1NJIO 3VQBA 3O9RA 2KKZA 4IFEA 4KHSA 4CEOA 3CM6A 4G9ZA 2NRVA 1W0HA 5BPLA 3PUFA 1MA9B 5KPRA 1M90O 1GOBA 2W6KA 3SAHA 3O9SA 4CJUA 4CBUA 5HROA 5DMRA 1C0MA 3AARA 5CYMA 3ZSWA 3MEGA 3SUNA 4GNIA 1HMVA 3MX2A 4CJ3A 4FJHA 4DV1K 3TI0A 3DYAA 3ZCMA 1B9FA 3ULEA 2VG7A 3AO1A 2KFZA 2P9PA 4GKKK 4EFHA 5E26A 1LAVA 5AQMA 2P5GA 5HP1A 4LD0A 4AHUA 4K43A 4B1YB 1OVYA 2V51B 4FWRA 3B6OA 5ADXH 1SS6A 2IOCA 4GMJB 4ISGA 2A42A 2RE2A 3HXMA 4QOZB 3Q7CA 4WFBL 3J7ZO 2OPQA 2UUBK 3OJSA 5HLFA 1NBWA 4MQ3A 1TYQA 3VQEA 1YHQN 3FFIA 2FF3B 3SLCA 3PO5A 4CJ5A 3MMVA 3VTIA 4CZFA 2QWMA 5FLXO 2HHUA 3VEVA 4N41A 3L2VA 4JRPA 3H45C 1QVFM 3M8QA 4PA1A 1Q86O 4FM0A 4DV7K 4I2QA 3L3UA 4E1MA 3HZ6A 3E9PA 4IDHA 5HRSA 2ETJA 1BA0A 4O8KA 3DXKA 3WNEA 2YNHA 1U2VA 1GLFO 3VEWA 3QEIA 2YKMA 1WBBA 5GAHP 3ZSQA 1UOCA 3OTOK 2E5LK 2QXLA 2Q2RA 3OYBA 1QTMA 4HWIA 3DLLL 4DUYK 1XC9A 4RW6A 1J53A 3AO5A 5HL7L 3VPZA 4BRGA 1RT5A 1REVA 1GLBG 2YHBA 1V4SA 4W5RA 1JCGA 4A5AA 3M5RA 2GWKA 1N8RO 1ASUA 3SPYA 4MLHA 2HHTA 4IJNA 3AA4A 1NJZA 3BF1A 4CJRA 3MXMA 2NRTA 3VQ8A 1Q18A 1KLNA 3THWA 1WSJA 1NGFA 5C12A 2ZF5O 1HYZA 3KHYA 4I6MB 3MAQA 1SL0A 2ZE2A 2O8CA 2I5JA 1JLAA 4DWIA 3EEQA 3OYLA 4IO8A 2VQEK 4M7XA 3DAWA 4LSNA 2OYQA 2NRHA 5JVGL 1RT6A 1QS4A 1J5EK 1GLDG 4E7HA 4JI3K 2HNDA 3C7NA 2WOMA 3D2EA 3QBWA 4BG8A 4DFKA 3LZJA 4HVJA 1IBKK 1N33K 1SKRA 3VEXA 4OPAA 3CMEN 4BROA 4C8OA 5CYQA 3KTQA 3ZSRA 3K57A 3LDPA 4DV4K 5C25A 3QEXA 1ZYQA 1A5VA 3K5OA 5FDLA 4CECA 4CJTA 1SV5A 4AHRA 1NK9A 4CGGA 4UQGA 1VQLN 3FLCO 3OYAA 2UXCK 3MCAB 4KTZA 5I42A 3AVIA 4PY5A 1RDWX 4I7FA 3PY8A 2IVPA 3EKSA 3V1RA 3RTVA 3EO3A 2P9SA 1OH6A 4JI5K 4M3XA 2HVIA 3SJJA 4OPHA 3GG4A 4A2BA 3HBTA 1T44A 3VOVA 4FW1A 5C2FA 1S9EA 1JLGA 2D0CA 5KPTA 2GTDA 1HR0K 3SAGA 1DT9A 3PV8A 1SKWA 3WT0A 2X6NA 3CERA 4B08A 4B3TK 4CESA 2EWSA 4KV8A 4B9LA 4J2BA 5CZ2A 3C65A 4CJEA 4RW7A 4JYAK 3D2FB 1C6VA 4JHDA 1K9MO 3RSEB 3WQUA 2WC9A 1QQCA 1Q81O 5AZIA 1NGHA 4GV3A 4KHYA 1WUAA 1H1VA 3PO4A 4DS4A 4ILJA 1KQSM 1BWFO 2V52B 4FJ8A 1FK9A 3BY5A 1NJYA 2PFUA 1VQNN 3RMDA 2KFNA 3CFRA 4X62K 4JKGB 2B5JA 3VERA 4XEIA 4WQ4C 5MLCQ 3AVGA 3TAFA 2GX9A 3K58A 1QQMA 1W2BM 1KSPA 2PYJA 4ILHA 4CIGA 4U67L 5AZJB 3HL8A 2GV9A 4CJ4A 4MO4A 3DLEA 3NF6A 1YJWN 3K2PA 3ZSXA 4LFAK 1NKCA 3G10A 5C0YA 3P39A 3OYCA 1EETA 1VQ9N 2W41A 2P9KB 3NGZA 2PY5A 4BR7A 4R79A 2HVHA 3L4IA 2A3ZA 5AFUA 4H03B 4ZTJA 4Q5VA 3CC2N 1YVNA 1S1TA 4H0TB 5I9EB 1OH8A 4A59A 1T8EA 3VQ6A 3DOLA 4A62A 3OY9A 2XHBA 1ATRA 1Z6RA 3NGIA 4BR4A 3O4QA 4W5TA 3SV3A 3FZFA 4IDKA 3DRPA 4DQSA 3L0QA 1C0UA 4RCHA 3C6AA 2H3GX 1IV0A 4CIEA 3F9KA 3VEOA 3KD1E 5CHIA 1EP4A 4KFBA 4RW8A 4FLVA 3IS9A 3KWIA 1QVGM 4BVPA 1SL1A 1S6QA 1IKWA 3THXB 1SKSA 2G8IA 5FROA 4DSKA 4OGCA 4CJKA 1U48A 4M63C 3CJCA 4DSIA 2VG5A 1S3XA 4PKGA 4CI6A 5B8HA 4O5FA 3T19A 3G25A 1YI2N 4KI6A 4WCEL 4NXNK 4NYNA 3H6EA 3EZ5A 3S3MA 1ITGA 4IFVA 3KLEA 3V9ZA 3M8RA 1U45A 1NKEA 3ZLJA 5AQUA 4Y0WA 5JLFA 3AGKA 5M1FA 4B1UB 3LWMA 4CGHA 4LFCK 4K8ZA 4BY9C 4H4OA 4N5SA 1RTDA 4FPBA 3TTCA 4F8RA 4JV5K 4EHUA 3EL2A 5E41A 2QXFA 4CZJA 3CETA 2ZGZA 4BRFA 4V19S 4E7JA 5EXWA 4B9NA 5LL6Z 3SCXA 1KVCA 1YTUA 2FSNA 5F2RA 4AF1A 1Y64A 3CC7N 4CHQA 5M1PA 4IG0A 4F2RA 4DF4A 3HT3A 4B9SA 3UIQA 3BDPA 4IFYA 1TUYA 3KLFA 1ZBFA 4DHYA 4JS5A 2IVNA 1ZBLA 1BQNA 1YXQA 2UXDK 2A40A 3VQ7A 4YY3K 4KHWA 3MN7A 2XO7A 1CXUA 2RPIA 3WEEB 3O3HA 4FLXA 3NH2A 3ATVA 2W40A 2G8WA 5DK5A 1S1UA 3V1QA 4YDUC 2E1ZA 2YHWA 3QETA 3C6UA 2OTLN 2WONA 3G0ZA 4M3WA 4AM7A 1BO5O 3CQXA 4K41A 4CEAA 2IVOA 3TAGA 4FJIA 4BRIA 1G99A 3CCJN 3M8SA 1UA1A 1TK0A 1NGBA 4H5WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC2 N;  1VQ6 N;  3CC4 N;  1QVF M;  4IOC L;  2OTL N;  5H1S Q;  3CF5 L;  3G6E N;  1VQL N;  1Q86 O;  3CPW M;  3CCS N;  1S72 N;  3CCJ N;  4WF9 L;  5GAG P;  4WFN L;  3G4S N;  3CCU N;  1QVG M;  5DM6 L;  1JJ2 M;  3CCR N;  5GAH P;  1YIJ N;  3PIO L;  1VQ8 N;  3DLL L;  3I55 N;  1VQO N;  3I56 N;  3CCM N;  1NJI O;  5HL7 L;  2QEX N;  5DM7 L;  1YI2 N;  4WCE L;  1K9M O;  1M90 O;  1VQK N;  2ZJP L;  1Q81 O;  5JVH L;  1N8R O;  1KQS M;  3CCL N;  1KC8 O;  1VQN N;  1ILY A;  4UY8 O;  3G71 N;  1Q82 O;  2OTJ N;  1M1K O;  5MLC Q;  4WFA L;  1Q7Y O;  3CD6 N;  2ZJQ L;  1VQ4 N;  1W2B M;  1YJ9 N;  3PIP L;  4U67 L;  3CC7 N;  1K8A O;  2QA4 N;  1YJN N;  5JVG L;  1YJW N;  1K73 O;  4IOA L;  5GAE P;  1OVY A;  3OW2 M;  1VQM N;  1KD1 O;  3CCE N;  3CMA N;  3CME N;  1VQP N;  1VQ5 N;  1VQ9 N;  4WFB L;  3J7Z O;  2ZJR L;  5GAD P;  4IO9 L;  3CCQ N;  1YHQ N;  1YIT N;  3CCV N;  1VQ7 N;  3CXC M; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FZH A;  4E7L A;  3WUH A;  1HQE A;  3LP2 A;  1HX1 A;  1HLU A;  1HKG A;  5M1Q A;  1RT3 A;  2NRW A;  2ZQB A;  1TGO A;  2BE2 A;  1VSI A;  2WTU A;  3WEE A;  3ZX0 A;  3SK3 A;  4FJL A;  4BC5 A;  3HPG A;  3HRG A;  5LJV A;  1RCH A;  3LAK A;  1TK8 A;  3DXM B;  4LF4 K;  2YNF A;  4FWP A;  1ASV A;  3LL3 A;  1YIJ N;  4CHO A;  3VQ5 A;  3PIO L;  4R5P A;  1NGA A;  4CJL A;  3I55 N;  1VQO N;  1S9G A;  4BGA A;  3CHW A;  4HUF A;  2O8B B;  4CGI A;  1X1P A;  1N32 K;  1CZ9 A;  4H5R A;  4B1Z A;  2QI2 A;  4BRK A;  3VQP A;  2QEX N;  4YDU A;  4W5Q A;  2FSJ A;  2I7P A;  3O9U A;  1IO2 A;  1J6Z A;  3QBX A;  3TAM A;  4A61 A;  5C24 A;  2G8K A;  1JL2 A;  5KPZ A;  5JVH L;  4KB0 A;  1JLF A;  5HBM A;  1VSK A;  3M1F A;  3O1B A;  4B1X B;  4F3T A;  2D0B A;  3ID8 A;  3OYH A;  5KRT A;  3CI5 A;  4FM1 A;  4DU1 A;  3R1X A;  3E01 A;  4CZH A;  4H0Y B;  1NGC A;  3VEZ A;  4WFA L;  1KAZ A;  2KW4 A;  4H5V A;  3ID6 A;  1UWB A;  4EZ6 A;  1OKJ A;  3VMF B;  3AV9 A;  2P9N B;  3ISN C;  3UKR A;  4LF8 K;  3J7Y P;  4H4M A;  3E1Y A;  1C1A A;  3SUP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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