4FWRA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 129
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwrA02
4QS8A 4NO7A 1Z05A 4CI6A 2GELA 3U4LA 2I7NA 2PAVA 1YUWA 3VEXA 3C7NA 4I6MA 3UE5A 4CZHA 4BRMA 1NGBA 3MCPA 2P9SB 2AP1A 5BPMA 3IMXA 1NGJA 4O8KA 2V7ZA 3IUCA 3DXKA 4XH4A 2FF3B 5AQUA 3I33A 2P9PB 2ZF5O 3WXLA 1HKGA 3L0QA 5BN9A 4BR4A 2A40A 1JCGA 2QWNA 3O5BA 1OKJA 4BRDA 5FPMA 1QZ5A 4M7XA 1J6ZA 4BR9A 4FO0A 1HKCA 2E2QA 3WT0A 4BG8A 2WUSA 4B1XB 4BR5A 1JCFA 3CI5A 3FZKA 3VENA 3U8XA 3FLCO 4DB3A 3LDQA 3LDOA 2ASOA 1XUPO 5EOYA 1QQOA 2P9LB 3MN7A 5FPEA 5EXWA 2IVNA 3ZEUA 2AA4A 3UKRB 2CH5A 4FPAA 1Q18A 2QWLA 3QFPA 1TYQB 1HJOA 3A5MC 1U6ZA 4DHYA 3CERA 2E1ZA 2H3GX 3MMVA 2BTFA 3QBWA 1MWKA 2VYPA 1SZ2A 4CBUA 3L4IA 4BG9A 3EO3A 3O6WA 4A62A 5KPTA 5LJVA 5EX5A 4IO8A 4H0TB 3M3ZA 4AM6A 3VETA 3DWLA 4I6MB 2GWKA 2Q0UA 3AAPA 3FFKB 3D2EB 3O80A 3ZX0A 3VPZA 5E26A 3DJCA 3TPQA 3RSEB 1LCUA 4WQ5C 4EFHA 5KQ8A 5LY3A 3VGKA 4F9OA 3O08A 5E84A 1K8KB 3A5NC 3FE1A 2Q1NA 2GTDA 4BROA 4WQ5A 4BR7A 1E4FT 1QQNA 4QS9A 2IVOA 3LM9A 2D0OA 3A8YA 3F9MA 3VEZA 3VEOA 4L3QA 4BRAA 5TKYA 3H3OB 4BGBA 5AQFA 1HX1A 3BUZB 5F1XA 4MO4A 3ZEUB 4BVOA 1NGAA 2F9TA 1GLAG 5F0XA 2YHWA 3KHYA 1LOTB 3VGMA 1SAZA 5BREA 1ZC6A 3WXJA 3M1FA 1ZBSA 2D0PA 4BRGA 4NB4A 2IIRA 3UB5A 2QWPA 1YAGA 3D7EO 1G99A 3U9DA 1ATSA 4H5WA 4BR0A 2E2PA 2FSJA 4AM7A 5AZIA 2V52B 4RTFD 3WXKA 2W41A 5AQVA 1MA9B 3FZLA 2GUPA 3HBTA 4PKIA 3VGLA 4K25A 4YDUA 5AQTA 3ZETB 5AZJA 1U2VB 2QM1A 4MO5A 3CQYA 1NGCA 4PL8A 2YCHA 3EL2A 4BQLA 4ISEA 3QICA 2CGKA 3H6EA 1GLEG 4A2BA 1NGIA 3SMPA 2Q36A 1R59O 3SLCA 3W0LA 5B8HA 3VEYA 2Q97A 3CJBA 4FL9A 1NGFA 3R9PA 1BUPA 1RGIA 3LL3A 5FPNA 4BQZA 2UYTA 3LDNA 1C0FA 2QWOA 5BRHA 4WYBA 3U9ZA 3H1VX 4JNEA 4H5NA 1ZXOA 3TU5A 2P9NB 3H1QA 4H5RA 1HKBA 5JICA 3IFRA 4K42A 3WUHA 5AQYA 4ISFA 3KVGA 3QBXA 4PKGA 1Y64A 1V4TA 3GG4A 4PKHA 4FOIA 1BU6O 4XH1A 4HWIA 4CZMA 3VESA 2Q2RA 2YJEA 4E1JA 2E2NA 4IXCA 2P9IB 3BF3A 3J8AA 1KXPA 3HZ6A 3SJHA 2FSKA 4BC2A 1BWFO 3D2FB 4JHDA 5JLFA 3MN5A 4B1YB 1GLFO 4FWRA 3FZMA 5ADXH 3WXIA 4JD2A 3UKUA 1MDUB 2ZWHA 3C7NB 4H03B 2A5XA 3LM2A 2ASMA 4FWSA 5AQJA 4BC3A 3DXMA 1BO5O 2IVPA 3CQXA 3DXKB 4CZKA 1BG3A 3A5OC 3CETA 1IJJA 4XH5A 3A0IX 2ASPA 3FZHA 3HI0A 1KAXA 3GDQA 3MN6A 2P9UA 4GNIA 4EHTA 5JMVA 2A42A 4BR2A 2FSNA 3LDLA 3CJ9A 2VWBA 3R6MA 2A6AA 2CGJA 3IDHA 3MN9A 5KPRA 2P9KA 2CH6A 4JN4A 5CE3A 2E8AA 4CD1A 3G25A 1HLUA 2CGLA 4H0YB 1CZAN 4C23A 4O5FA 1ATRA 3AAQA 3H46O 4IJNA 2E1YA 1NMDA 5FPDA 4JD2B 3JXUA 4A61A 5AQNA 3UKUB 1NBWA 4IZ9A 3C0BA 2V7YA 3QMLA 2P9PA 4H0XB 1NGGA 5AQGA 2E2OA 4MLHA 5JLHA 1EQYA 1DEJA 4ISGA 1QZ6A 3CJ1A 3R8EA 4CZGA 1QQMA 3FZFA 4FWQA 2J4RA 3QB0A 4CZLA 3ULEA 1GLJO 2W40A 4RWTA 4CZFA 1C0GA 2P9LA 3JS6A 3ENHA 4BRKA 2BUPA 1MWMA 1X3MA 5BPNA 3UKRA 2DPNA 2QXLA 4GY2B 4DCHA 4JAXA 2KHOA 3GBTA 1Z6RA 3CHWA 3VF2A 4CZEA 2FXUA 4XEIA 1S3XA 2P9KB 3B8AX 4B1UB 4BVPA 5KQDA 4KBOA 3EZWA 1HUXA 4CJ7A 5AQKA 2PBDA 1BDGA 4IWVA 2FF6A 1NGDA 4FPBA 4A2AA 2NRHA 4BREA 4RCHA 3ZX3A 3MDQA 3OHRA 1X9JA 3CJAA 3ID8A 2Q0RA 3DAWA 2HF3A 5AQWA 3BF1A 3I8BA 1RFQA 3D2EA 1KAZA 1NLVA 5AZIB 3BEXA 1V4SA 3RSEA 3VF4A 5I9EB 4FSVA 2F9WA 4IJAA 3GL1A 4QS7A 3M6GA 3O1BA 1TUYA 5BRDA 3VEVA 4PL7A 2GWJA 4K41A 1K8KA 3BP8A 5AQMA 3ATVA 4FWLA 5AZJB 5AFUA 1S22A 3H45C 3L6QA 4FWMA 4CZJA 5AR0A 2QWQA 4B1WB 4H5TA 1BOTO 5AQIA 4Y0WA 1NM1A 4FWNA 3ULEB 1KAYA 2YHYA 3WEEA 1RDWX 2YJFA 2HF4A 2E88A 4FWPA 3VEWA 1GLBG 2QWRA 3EKSA 3ATUA 3O4WA 4LC9B 1X3NA 3CIPA 3S41A 2YHXA 3VERA 3W3DA 2QWMA 2D4WA 1YXQA 4FOEA 4M7YA 4J8FA 3FR0A 4BC5A 4BRHA 3CJ7A 4CZIA 3VOVA 1NGHA 4H0VB 5LJWA 4CBXA 3QDKA 4BRLA 4BGAA 1DGKN 5ELZA 1GLCG 4BRNA 2I7PA 4M63C 3H3NO 5AQLA 3AARA 1BA1A 2HOEA 2A41A 4FWKA 1T44A 5AQZA 5AQHA 3GOIA 5AQQA 3FGUA 3HSCA 3P4IA 3ZETA 5BR9A 1TUUA 1U2VA 4EIAA 2A3ZA 1ATNA 3EN9A 3QFUA 3CJCA 4H5VA 2NZTA 3SK3A 3O8MA 1E4GT 1WUAA 3HTVA 3O1WA 4JHDB 5AQRA 1GLDG 2E20A 3WEEB 5AFUH 3VF6A 4EAHD 4BC4A 2OANA 3ZX2A 1JCEA 4HTLA 4CD3A 1NGEA 4H0OA 5AQXA 1QHAA 2VCPA 4FWOA 2P9SA 3A5LC 5EY4A 4BRIA 4Z94A 3ENOA 3AY9A 1WOQA 3EKUA 1NWKA 5KPZA 3DXMB 4MLEA 5BN8A 1XC3A 5BRFA 5F2RA 3MK6A 2P9NA 2FLOA 5AQOA 4EHUA 3SMSA 3WQUA 2ITMA 4WQ4C 3GE1A 1IG8A 4H0PA 4CBWA 1YVNA 4BRCA 2GEMA 2ZGYA 1D4XA 1P8ZA 2P9UB 4WQ4A 2QW9A 2HMPA 1HPMA 1H1VA 2V51B 4BRQA 4DQ8A 4BRPA 4BRFA 4YDUC 4B1VA 5AQPA 4B9QA 1BA0A 2NLXA 3LDPA 2Q31A 1DKGD 3WQTA 1GLLO 5BPLA 2P9IA 4K43A 1T6DA 5ADXA 5EVZA 1TYQA 2ZGZA 3KZBA 1T6CA 1ESVA 2D1KA 4B1ZA 2YI1A 1XQSC 3D2FA 1SQKA 3HM8A 5AQSA 2EWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B4JA 4KTWA 4CJQA 2GELA 4ILHA 3U4LA 4DFKA 4FZXC 3CFRA 1YF5L 1J5OA 4IOXA 3O4QA 3VEXA 5KTQA 3KTQA 1RT6A 4IEIA 3MCPA 4LF7K 1F21A 2AP1A 4CGFA 4CHPA 3IUCA 3HPGA 2PZSA 3ZT3A 4DTUA 1CLQA 3L0QA 4DLEA 4BR4A 3PSIA 4E7IA 5FPMA 2ZE2A 1J6ZA 1CZ9A 4CHQA 3LZIA 3NE6A 4FO0A 1HKCA 4PA1A 3M8QA 3WT0A 4B1XB 4BR5A 1U47A 1QQOA 2IAJA 3V9ZA 1TKZA 4JKDA 1WAFA 4BDZA 3QESA 4LF5K 3LWMA 3RRHA 2CH5A 4AHUA 4HUEA 3OYEA 3B6OA 4E7KA 2OYQA 4FLYA 3KIOA 3VQ5A 4CGJA 2F4VK 3CC4N 4JI8K 3D6RA 1SZ2A 2IC3A 4CBUA 3ZSZA 2NNWA 3EO3A 3O6WA 5KPTA 4GV3A 5LJVA 1HYSA 3JAMO 5CY4A 3MEEA 2GWKA 3AAPA 3O80A 3FFKB 4DR1K 1HNWK 3KWIA 1OH8A 3VPZA 4C1NK 4V19S 3RSEB 4FLVA 4GVEA 4JK9A 5C2FA 1KFSA 4EFHA 5KQ8A 3NF6A 4CJ4A 3A5NC 4W5NA 2Q1NA 4F2RA 3O3HA 4KRFA 3NGIA 4QS9A 4W5RA 1S72N 4JKCA 2HVHA 2D0OA 3VEOA 4B3OA 2DFFA 1KCFA 3B6PA 5AQFA 4MO4A 3E01A 4CGIA 3HL8A 3EEQA 1NNEA 4IDHA 5F0XA 4B9NA 4CGDA 1RBVA 4X62K 4OVLA 4BRGA 4LF6K 2IIRA 4IBNA 1VQ7N 3NGYA 3D7EO 1ATSA 4LH4A 1IO2A 4O0JA 1WLJA 1HNIA 3ZSQA 3VA3A 3UIQA 3VQ9A 1SL2A 4JKEA 1KSPA 4JS5A 5AQVA 4JI6K 2GUPA 3QERA 3HBTA 5M1KA 4KH5A 5AQTA 2ZD1A 3TAMA 2QM1A 3CQYA 2BH1A 3QICA 2CGKA 2YNGA 2Y1IA 3WNGA 4OKKA 2Q36A 4I2PA 3NVMA 5HRSA 3T7ZA 4K8XA 4FL9A 1FKOA 4LFAK 2JWKA 1TVRA 1LAVA 1ZXOA 1KC8O 3H1QA 4H5RA 5JICA 2XHBA 3IFRA 4MFBA 3OYNA 4CEQA 1KFDA 3QBXA 2G8IA 3QEWA 4CIGA 1Q8IA 4PKHA 3AVIA 2HBMA 4CZMA 4CF0A 2VWKA 1N32K 4BWJA 4CHYA 1MU2A 2NRXA 1JLBA 2E2NA 5C12A 4E7HA 4DSIA 4RG8A 1B9DA 3J8AA 3HZ6A 4NLCA 2HHQA 4JKGA 3D2FB 3Q7BA 4CFCA 1OH6A 3LP3A 4CEFA 3CCQN 1OH7A 5ADXH 3WXIA 5BR8K 3OBWA 2NRWA 3C7NB 2X6NA 3K9KA 2NUBA 4H03B 3WNHA 4M3ZA 3O3GA 3DYAA 2KKZA 4KTQA 3C94A 1BG3A 3A5OC 4Z4EA 3HP9A 3K0SA 1TK5A 1KLNA 3CF5L 3HI0A 3TSPA 4JYAK 3SJJA 1P90A 1ILYA 4I9QA 3LDLA 3ZT4A 3CJ9A 4FJIA 4DS4A 3NHGA 2GX9A 3IDHA 3CCUN 4E19A 3MN9A 3M8RA 4JN4A 3DRRA 1SL0A 1HLUA 1UWBA 4U7BA 3SBTA 4O5FA 3PO4A 2XY8A 3NAEA 3HP6A 1YHQN 5IWAK 4JD2B 3NDKA 4E0DA 5I3UA 2HHXA 3K2PA 3C6TA 1NBWA 3THXB 1EETA 1LW0A 1W0HA 4IZ9A 4DR3K 4WF9L 5MLCQ 4BACA 1ZBUA 3M8PA 4IFYA 1NGGA 1NKBA 1KLMA 4MLHA 1DEJA 3R8EA 4W5TA 3SYZA 5M1NA 1TKDA 1YIJN 4RW4A 1BISA 4CZFA 2WC9A 5LMUK 4FK2A 5KGXA 4IO9L 4B3RK 1X3MA 3R1XA 1D8YA 2ZM6K 2DPNA 2QXLA 4NLBA 4ZHRA 3KLFA 1IBMK 1Z6RA 1HMVA 3G0ZA 5DMRA 2P9KB 4BVPA 5KQDA 3AO2A 1A5WA 1A5XA 4IG3A 4A2AA 2ZQBA 1IKYA 4RCHA 2OTLN 3ZCMA 1NJYA 4CFBA 2QA4N 4NYFA 3OYLA 2PFUA 3V9XA 2OZMA 2O8DB 3I8BA 2ETJA 1NLVA 3BEXA 2PYJA 4JEPA 4DTRA 3VEVA 1BHLA 1K8KA 3BP8A 4FM0A 1VQ8N 3L6QA 4CZJA 5AR0A 3CC2N 1BOTO 5AQIA 4KFBA 1NM1A 4FWNA 1KAYA 1QVFM 2HW3A 1RDWX 4FLTA 2QEXN 4FJ9A 2HF4A 2HBJA 1S9EA 4FWPA 4YFUA 3DMJA 5J1EA 3ATUA 1Q9YA 4LC9B 3T69A 3M8SA 3F5TA 2QKKA 3S41A 4CJSA 4HUGA 3HRGA 3THYB 2QWMA 2D4WA 5CZ1A 4GMJB 4FOEA 1W9HA 3BZKA 4OLBA 2D0AA 4BC5A 3CJ7A 4NCAA 3CPEA 3ISNC 4CZIA 3P31A 1NGHA 4DUZK 1HNVA 1S1WA 3VQAA 4BGAA 4JV5K 1YI2N 1GLCG 1C1BA 2I7PA 4M63C 5M1QA 3AVLA 4JK8A 3OYFA 4FJXA 1X9MA 1SKWA 3P4IA 4CJVA 1ATNA 3QFUA 4WCEL 3CJCA 1E4GT 1CZBA 4GKJK 3HTVA 2ZJPL 5AQRA 3NF9A 3K5NA 3V9WA 3SUNA 4QCLA 2R7YA 4N5SA 4YY3K 3ZX2A 4CD3A 3KD1E 4Z4FA 2F8TA 3J7AP 5M1OA 3PIOL 4DSJA 2JGUA 3CQ8A 1WOQA 3EKUA 1BQMA 4ELTA 3VN5A 3AA5X 5F2RA 2KTQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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