4FWRA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 129
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwrA02
1BWFO 3VEVA 2AA4A 1KXPA 3WXLA 5BR9A 2P9KA 5JLFA 1HPMA 2F9WA 4CBWA 2NRHA 1GLBG 4BRIA 1NGJA 3WQUA 4QS8A 4PKHA 4K41A 2ASPA 1NMDA 2QWLA 4PKIA 3VEZA 4L3QA 5BRDA 5LJVA 3UKUB 2D0OA 1V4SA 4BREA 3ENOA 3L0QA 4XEIA 1XC3A 3ZX0A 4BVPA 3BF3A 3U8XA 4BRKA 2A40A 5ADXH 1X9JA 1KAZA 3QMLA 3WUHA 4RTFD 1D4XA 1BDGA 5KPRA 5BN8A 3DJCA 2ITMA 2ZGYA 4HTLA 4A2AA 2I7NA 3I8BA 2J4RA 1TYQB 2ASMA 2CH5A 4FPBA 4H0PA 1T6CA 4EFHA 4FWPA 1T6DA 4Z94A 5I9EB 5JLHA 3D2EA 4M7YA 2VCPA 3TPQA 1H1VA 3UE5A 3FLCO 5AR0A 2CGLA 4FWRA 3DXKB 3QFUA 5KPTA 4M7XA 1SAZA 4CZEA 1ATNA 4BRCA 3O1WA 3AAPA 5AQQA 3UB5A 4A61A 4PKGA 1ZBSA 2FSKA 5AQIA 1E4FT 1ZXOA 2QWNA 4H03B 5AQOA 1HKCA 2GUPA 4HWIA 3QFPA 4E1JA 1NGAA 2FXUA 3BP8A 2P9PB 2Q1NA 2FF3B 4WQ5A 2HF3A 4B1WB 4CJ7A 3CIPA 1GLLO 4PL8A 1NGHA 4EIAA 3VERA 5F1XA 4FWLA 3VESA 3GBTA 4MO5A 2V7ZA 3AAQA 4AM7A 3EKUA 4FOIA 4IZ9A 1V4TA 2P9IB 2IVOA 1NBWA 4GNIA 1DKGD 2Q31A 4O5FA 1GLDG 2IIRA 3C7NB 4FPAA 5LJWA 3A5LC 3TU5A 4ISFA 2P9UB 5CE3A 3VETA 5BPNA 1NGFA 2V52B 3UKUA 3SK3A 3FR0A 3ZX3A 3RSEB 4CBUA 3GL1A 3BEXA 3IMXA 4B1XB 3EO3A 3BUZB 1HKGA 2A6AA 4DCHA 1NLVA 4CZJA 5FPDA 4BRPA 1BA1A 5AQYA 4K25A 3U4LA 3VGLA 1YVNA 2AP1A 3LDLA 5AQUA 2QWMA 3KHYA 4FWQA 4H0TB 1ATRA 3LM2A 3MN7A 4H5TA 3SJHA 4EAHD 1XQSC 4RCHA 5FPEA 5FPMA 1QQNA 4H0YB 2NLXA 1TYQA 3H1VX 3JXUA 4I6MB 4K43A 5BRFA 3VGMA 5AFUA 1JCFA 5BRHA 2ZWHA 3GOIA 2YJFA 5EOYA 1DEJA 2QWRA 3ATUA 4BRFA 3IDHA 4C23A 5AZIB 4FO0A 1NGDA 3IUCA 4QS7A 3M6GA 3BF1A 3HI0A 1NGIA 2BUPA 2D4WA 1TUUA 3DXKA 3VEWA 4M63C 5AQHA 4EHUA 1MWKA 4WYBA 1QZ5A 4DB3A 1G99A 4YDUC 5KQDA 3FZHA 4GY2B 3ULEB 4B9QA 4BVOA 3VEYA 3WQTA 4IJNA 3ZX2A 2QWQA 5AQJA 2A42A 5BN9A 2P9PA 3VENA 5AQSA 3ID8A 2D0PA 2FSJA 3P4IA 3VEOA 3MDQA 1JCGA 3W3DA 4DQ8A 2QW9A 3WXIA 5F2RA 4BR0A 2YCHA 1T44A 2Q0UA 1LOTB 3WT0A 3LDQA 4NO7A 4DHYA 4YDUA 1GLFO 1K8KB 4CZKA 2CGKA 2KHOA 4CZGA 2P9IA 1BG3A 2UYTA 3C7NA 1Y64A 2P9UA 2V51B 4H0VB 3VOVA 3FE1A 4IO8A 3FZLA 4B1YB 3R8EA 2FSNA 3KVGA 4FL9A 3RSEA 3U9DA 3CQYA 2HF4A 2QXLA 1E4GT 1X3NA 3O1BA 3SMSA 1BOTO 2GELA 2Q97A 4KBOA 1KAXA 2P9LB 4CZMA 2OANA 4JNEA 1IJJA 3DXMB 1QZ6A 3A5NC 3ENHA 2VWBA 3H45C 3S41A 1Q18A 3H1QA 3OHRA 4IXCA 3CERA 4MLHA 4I6MA 5AQLA 5LY3A 4BRAA 1RGIA 3GG4A 3CQXA 4JAXA 3JS6A 3MN6A 5AQXA 4JN4A 2F9TA 2V7YA 4BRQA 5AZIA 4MLEA 5EY4A 3FZFA 3VEXA 2PBDA 5AQTA 3AY9A 1OKJA 2GWKA 3HZ6A 3LDNA 3O6WA 5KQ8A 2WUSA 1ZC6A 3EZWA 2GWJA 4BR2A 1SQKA 2QWOA 3GE1A 5AQNA 4EHTA 2HMPA 2YHXA 1J6ZA 3L6QA 3LL3A 1MDUB 3ULEA 2PAVA 2IVPA 2Q2RA 2NZTA 3D2FB 3MK6A 3CJ7A 1YXQA 4XH4A 2IVNA 3QBWA 1NWKA 2P9SB 5AQKA 4F9OA 4CD3A 5BREA 3ATVA 3VPZA 4FWNA 3FZMA 2EWSA 5AQMA 2YJEA 3VF2A 5EVZA 1QHAA 3QB0A 3VF4A 5E26A 2E20A 2GTDA 3MMVA 3EKSA 5AQVA 4BGBA 1K8KA 5AQWA 4BR9A 5AQFA 1U2VB 4H0OA 1WOQA 1S3XA 3CJ9A 4H5RA 4ISEA 1RDWX 2GEMA 3M3ZA 4BGAA 2E2QA 3M1FA 4ISGA 1YAGA 4CZIA 5AQGA 4BG9A 2E2NA 1GLAG 3L4IA 3O5BA 4B1ZA 4FWOA 4BRHA 1HUXA 1MWMA 4H5NA 3CJ1A 3ZETB 4BC4A 1NGCA 1NM1A 2P9LA 3HSCA 2HOEA 3H3NO 3CJBA 2CH6A 3DXMA 4Y0WA 3UKRB 4NB4A 5AQPA 1MA9B 3DAWA 4BRGA 4J8FA 1HX1A 5AQRA 1R59O 3D7EO 1NGEA 5BPMA 5KPZA 1SZ2A 3WXJA 4BG8A 2BTFA 4A2BA 1QQMA 2FF6A 2Q36A 3LDPA 4H5WA 5AZJB 4BROA 4O8KA 5ELZA 5EX5A 5TKYA 2A41A 4RWTA 2QM1A 1ESVA 2DPNA 4B1UB 3CI5A 3WEEB 1P8ZA 4JHDB 3ZEUB 3KZBA 4BQLA 3H3OB 4WQ4C 1ATSA 1GLJO 3HTVA 2YHYA 3U9ZA 4BRNA 4JD2B 4BC3A 2P9NB 1GLEG 3QICA 1YUWA 4H0XB 2E88A 3SLCA 3D2FA 3H46O 4XH5A 3W0LA 2E2OA 3O80A 5JMVA 3R6MA 2P9SA 1KAYA 4FWKA 1BA0A 4WQ4A 2I7PA 1GLCG 3O8MA 5ADXA 5EXWA 1EQYA 1Z05A 4AM6A 2A5XA 1U6ZA 3MN5A 4BC5A 2YI1A 1HLUA 4FSVA 3VF6A 3CETA 3AARA 3H6EA 4QS9A 1U2VA 5JICA 4WQ5C 2P9KB 4IWVA 3LDOA 2Q0RA 5F0XA 3CJCA 4BC2A 5AQZA 1JCEA 4XH1A 4BRDA 4FOEA 2VYPA 3ZETA 2E1YA 4CZFA 2ASOA 3EL2A 1NGGA 3UKRA 2ZGZA 4A62A 2QWPA 4BR5A 3MCPA 2ZF5O 2W41A 3G25A 1HKBA 1NGBA 3O08A 2H3GX 1QQOA 3J8AA 3EN9A 5AFUH 2E2PA 2E1ZA 3B8AX 5B8HA 4K42A 1CZAN 1BO5O 3QBXA 2FLOA 3DWLA 5E84A 4B1VA 5AZJA 4BR7A 4FWMA 2E8AA 3FGUA 3O4WA 2A3ZA 2CGJA 4MO4A 3A8YA 3WEEA 3D2EB 1BUPA 3QDKA 4IJAA 4JHDA 3ZEUA 3MN9A 4CD1A 4CI6A 4CBXA 3FZKA 2YHWA 4PL7A 3GDQA 3I33A 4BRMA 4JD2A 4BRLA 3WXKA 1IG8A 3FFKB 2W40A 5BPLA 2P9NA 1XUPO 3SMPA 1RFQA 3CHWA 3HM8A 4FWSA 1X3MA 3A5OC 3IFRA 2D1KA 3F9MA 4BQZA 4CZLA 4CZHA 4H5VA 4BR4A 1LCUA 1TUYA 4LC9B 1DGKN 1C0FA 3LM9A 1C0GA 3VGKA 1WUAA 1BU6O 3CJAA 5FPNA 1Z6RA 1HJOA 3R9PA 3A0IX 3A5MC 3HBTA 1S22A 3C0BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PIPL 1YJWN 3OS0A 2F9WA 1VQPN 1NGJA 3WQUA 1BHLA 3CCSN 5EU7A 4L3QA 4DMNA 4B8AB 3K5MA 3BF3A 3KWIA 1WSHA 1D4XA 1S1VA 3V6DA 1WBBA 2P51A 4HUFA 1DTQA 2ITMA 4KI4A 2ZGYA 3E9PA 2OPRA 2FBXA 3K5LA 1C0UA 2CH5A 4H0PA 3TI0A 1KVCA 1JL1A 5I9EB 3NAEA 3SUQA 4FW2A 3KLIA 2FBYA 4MDBA 3UE5A 3FLCO 4F3TA 3MEDA 5KPTA 5J2PA 2ZE2A 4M7XA 3OYAA 1RDUA 1NK5A 5HRRA 2FSKA 1NOZA 1E4FT 2QWNA 3CMEN 4KV8A 4KTQA 2GUPA 5TKWA 4E1JA 4BWMA 4AHVA 1BCMA 2HF3A 4B9NA 1OH8A 1HNIA 1W7AA 4W5OA 4PHTX 2V7ZA 4KO0A 4FJ9A 4ELTA 4FOIA 3L2QA 2P9IB 3AA2A 3DRSA 2F7TA 2IIRA 2YV0X 3A5LC 3QETA 5CE3A 2P9UB 1HJRA 3VETA 4OPJA 1D9DA 3LALA 1KLMA 3UKUA 3SK3A 4DR1K 3QEWA 4CBUA 1LAWA 3IMXA 4B1XB 1CLQA 2Y1JA 4DU1A 1OVQA 1T3VA 3RWUA 1Q9YA 4F8RA 1NLVA 1ASWA 3U4LA 2P1JA 1YVNA 2AP1A 3LP1A 2QWMA 3KHYA 3HOSA 4H0TB 1XMOK 4H5TA 3FFIA 1HMVA 1XQSC 2NRTA 1QQNA 4H0YB 5HROA 4IKFA 2NLXA 4J2AA 1X9SA 4K43A 3NHGA 3VGMA 4OPKA 2YJFA 2XY5A 3ATUA 1BI4B 4AHRA 2QK9A 2P5OA 5AZIB 1YJ9N 1DT9A 4RW6A 3M6GA 4DWIA 3K2PA 3SAGA 1NGIA 1VQKN 5JS2A 1J9AA 4M63C 4G1QA 1Q8IA 1QZ5A 4DB3A 3C6UA 1G99A 4YDUC 3NDKA 5KQDA 4CJQA 5GINA 2G8UA 4GY2B 3ULEB 4E89A 5GAGP 3LZJA 3DRRA 2QWQA 2P9PA 1JL2A 3VEOA 2PZSA 3JAMO 3V4IA 4BR0A 2KFZA 1JLAA 1KTQA 2OPQA 3IS9A 2BANA 5FRMA 2X78A 4BY9C 4F4KA 3C7NA 4H0VB 3VOVA 1NK8A 4ILJA 5DM7L 3FZLA 4B1YB 1K9MO 3V9WA 3DLKA 3KVGA 4FL9A 3RSEA 3U9DA 2HF4A 1E4GT 2F8TA 2W42A 4O4GA 3Q7BA 4FLVA 4IO9L 3KD5E 4PY5A 2DTUA 4CJPA 2EHGA 5A2QO 4KTZA 2OZSA 5KRSA 1XNRK 2VWBA 2OA8A 4JV5K 3S41A 3H1QA 3VA0A 3CERA 4I6MA 5AQLA 4DTNA 4WE1A 3DRPA 2YNFA 1TL1A 3HPOA 2F4VK 4C8LA 3PX0A 2Z1GA 3CYMA 2D0BA 4JN4A 2HNDA 1VSIA 3WNEA 3QLHA 3LZIA 5EY4A 3FZFA 3VEXA 3HVRA 5AQTA 3QIPA 1OKJA 2GWKA 4DSJA 4WFAL 4NXNK 4LY7A 2O8EA 2WUSA 3TABA 2YHAA 3EZWA 3PY8A 1RBTA 4B08A 1NJYA 3TAEA 3IRXA 4CIEA 4DR2K 1QSLA 3SUNA 3ZSYA 5AQNA 4X65K 4H8KA 2UU9K 2YHXA 2BE2A 3CM5A 3OS1A 3VQ5A 3ZT4A 3D2FB 2BH1A 2XO7A 3VQ6A 3CJ7A 1YXQA 1IBLK 3NMUA 4GKJK 1VRTA 4F2SA 5AQKA 1FW6A 4F9OA 3OBWA 4CD3A 5C10A 5AQMA 3OYGA 4DU3A 3CC4N 1VSLA 3VMFB 3DLGA 3EKSA 5AQWA 1WBDA 3HSTB 4OX9K 1REVA 4A5BA 3S3NA 4BDPA 3CJ9A 4H5RA 4GVEA 3LANA 1RDWX 3P39A 3M3ZA 4BGAA 1DTTA 2E2QA 3M1FA 4CZIA 1EKEA 3RTVA 4BDYA 3THYB 4B1ZA 4BRHA 1VQLN 1HUXA 4CEAA 1FJGK 1NM1A 2P9LA 3C65A 3HSCA 4KFBA 1A5VA 3HYFA 1SS6A 3MXJA 3MWPA 1U47A 3ULDA 4DV0K 1MA9B 3DMJA 4J8FA 5AQRA 1YF5L 1R0AA 1R59O 4CGGA 3D7EO 5BPMA 2RHKA 2I5JA 3LDPA 4BROA 4O8KA 2D5RA 4IOCL 4B9TA 4CEBA 2DPNA 3CI5A 3WEEB 4U7BA 4FM2A 1RTDA 3CCQN 3AO3A 1HQUA 1NG9A 3TTCA 1S72N 1UA0A 1CZBA 4BRNA 2KTQA 3MXIA 1YI2N 4JD2B 4BC3A 4PWDA 2P9NB 3QICA 4KREA 3W0LA 1RDCA 4XH5A 1WSFA 3R6MA 4JI4K 1ZBIA 4FM1A 4ELVA 2O4IA 4FWKA 1HPZA 4WQ4A 1GLCG 3KD1E 2DY4A 1JLBA 3ZCMA 4YFUA 4GVMA 3K58A 1RDBA 3NGYA 4GV3A 4M3XA 3H6EA 5JICA 3BZKA 2XY8A 4CJUA 4IWVA 4IEEA 3CJCA 5M1FA 3EE9A 5AQZA 3TARA 1VRUA 4XH1A 4O44A 4BRDA 2UXDK 1TGOA 4FK0A 1NK4A 4CK3A 4KHYA 4CJVA 2ZD1A 3TANA 4FZYA 2IAJA 2ASOA 3NGZA 3VA3A 4O8UA 1N6QA 3SQ0A 4DV4K 2DFEA 4M3UA 3LPUA 4DTPA 2O8FA 3J8AA 1RT2A 4W5NA 2E2PA 3SPYA 1RBVA 4Z0UA 1CZAN 1TV6A 1BO5O 3LWMA 4IG3A 1LWEA 4NLBA 1YHQN 1HYVA 4E1MA 3O4WA 5CHIA 5HOOA 3G71N 4CJ4A 4F2RA 2O8BA 2OTJN 4CBXA 3FZKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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