2YJFA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
371
structure length
352
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVKDSYVGDEAQSKRKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 111
structure length 352
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjfA03
1EQYA 4CI6A 3ZETA 5BPLA 4BC3A 3HSCA 4EFHA 3EO3A 4EAHD 4A62A 3TPQA 4CZMA 2FF6A 3CJAA 3ATUA 3MN9A 4M63C 1QHAA 2ASPA 2IVNA 1MWMA 3CI5A 3CJ1A 5E84A 3VESA 3D2EA 1GLEG 5KPRA 3M6GA 1YXQA 5AQQA 4K42A 3EN9A 3VEWA 1GLJO 4EIAA 3H45C 1D4XA 3DXMB 3A5MC 1KAXA 3R8EA 2A41A 3LL3A 4B1WB 1DKGD 2QM1A 4BQLA 5KPTA 1NGDA 1KAZA 4JNEA 4CZIA 3CQYA 4MO4A 2Q1NA 5B8HA 1HKCA 2P9NB 2QXLA 3O6WA 3WEEA 3DWLA 3F9MA 3FLCO 3CJ7A 5FPNA 4BRDA 5KQDA 2ZF5O 3ATVA 3WQTA 3CJBA 2CH5A 1NGGA 4FWMA 4H0VB 4IJAA 4WQ4C 3DAWA 2QWQA 3GBTA 4IWVA 2YI1A 2A42A 2P9KA 3I33A 5ADXH 1E4GT 1XUPO 1BG3A 3A5NC 3GE1A 3ZX0A 4FL9A 2QW9A 1NGEA 2FSJA 4CD1A 4BR5A 2HF3A 5AQSA 2CGLA 3FE1A 1X3MA 5TKYA 4BRNA 1CZAN 4M7YA 4MO5A 4FWLA 3R6MA 3U4LA 3DXMA 3P4IA 3MN6A 1WOQA 4YDUC 1E4FT 4BR7A 5AR0A 1X3NA 5BRHA 5F1XA 3A5LC 2CGKA 3J8AA 1LCUA 1Y64A 4A2BA 1SZ2A 3TU5A 1T6CA 1H1VA 1NMDA 1QZ6A 1HUXA 1GLDG 3FGUA 4NO7A 1ZBSA 3VEXA 1TYQB 3LM2A 1YUWA 5EXWA 4DHYA 3IMXA 1BOTO 1U2VB 4FWSA 4BRPA 4DB3A 1NLVA 2FSNA 5EX5A 4H03B 3A5OC 4MLHA 2V51B 3DXKB 1T6DA 3ZX3A 5AQOA 4J8FA 4EHUA 1SAZA 2HF4A 5AQHA 3FZHA 1QQMA 2DPNA 4F9OA 3ENOA 3FFKB 2ZGYA 3WXKA 4FSVA 1RGIA 4B9QA 4JD2B 2D4WA 3VENA 4C23A 4H5NA 3HZ6A 4CD3A 3BEXA 5AQWA 3QBXA 4PKHA 3MN7A 1C0FA 3H6EA 3L6QA 4BRAA 4GNIA 4O5FA 2VWBA 3BF1A 3KVGA 2BTFA 3UE5A 3MCPA 1TUYA 1J6ZA 1ATRA 2VYPA 3QFUA 1XQSC 2FLOA 3MN5A 3WXIA 4AM6A 3WUHA 4H0TB 2E8AA 3LDLA 4H0YB 3RSEA 2E88A 2QWOA 3VGMA 4BQZA 4Y0WA 5AZIB 3VEYA 3VETA 4M7XA 1TYQA 3CHWA 4QS8A 4GY2B 3MMVA 3SK3A 3CJCA 1U2VA 3JS6A 4FWNA 2Q0RA 4NB4A 3FZLA 3ULEA 3VEZA 4BROA 4BRHA 3C7NB 1X9JA 2YJEA 2AA4A 3DXKA 1BUPA 4IXCA 4O8KA 3LDQA 5FPEA 5FPDA 2D0PA 5AQRA 4H5VA 4BGBA 1HLUA 3UKRB 3WXJA 3FZMA 4JHDB 1NGAA 2E2OA 4IZ9A 4JD2A 3AAQA 3ID8A 4K25A 1DEJA 1IG8A 2HMPA 3VF2A 2P9SB 3H1QA 3D2FB 3M1FA 3O1BA 4CZKA 1BA1A 1MDUB 2YCHA 3AARA 4K43A 1DGKN 5KPZA 1Z6RA 1XC3A 3ZEUB 2V52B 2VCPA 3FZFA 4IO8A 2HOEA 1Q18A 4AM7A 3O8MA 3EL2A 2OANA 5AQYA 4CZJA 1QQNA 1HKBA 4MLEA 2A3ZA 2PAVA 4CZLA 2QWNA 3SMPA 4XEIA 5AZIA 4BRMA 3QMLA 3WXLA 1NGCA 2GUPA 4BRGA 3LDPA 4PKIA 4B1YB 3JXUA 1GLAG 4JN4A 3CETA 3WT0A 2D0OA 2H3GX 3C7NA 2UYTA 2W40A 4FOIA 4BRFA 5AZJB 1QQOA 1NGBA 4BC2A 1OKJA 3CQXA 2A40A 4BRCA 3KHYA 2E2NA 1HJOA 2GWKA 3UKRA 1NM1A 2ASOA 4RTFD 4BVOA 4WQ5C 3H1VX 4H0XB 4JHDA 5AQZA 2NRHA 2Q97A 1NBWA 5E26A 4BGAA 1NWKA 2P9NA 4L3QA 1IJJA 4FWRA 2F9WA 2P9SA 4BG9A 3H46O 1T44A 3CERA 3D2FA 3H3NO 3U8XA 5AQPA 4H5RA 5AQJA 2AP1A 2CGJA 3D7EO 1MA9B 5F2RA 4PL7A 2FXUA 3ZEUA 1V4TA 3O08A 3L4IA 4ISEA 4FWOA 4XH5A 5JMVA 5BPMA 2D1KA 5AQKA 3VEVA 4I6MB 2QWPA 4H0PA 2A6AA 3DJCA 4ISFA 4ISGA 3WQUA 3LM9A 2P9UB 4B1ZA 4BR2A 3G25A 2ASMA 2Q0UA 5BRDA 1HX1A 1NGIA 3BUZB 1SQKA 5AQVA 4DCHA 3VF4A 4KBOA 3HI0A 3CIPA 4BRKA 4QS9A 2Q36A 4WQ4A 4RCHA 3SMSA 2FF3B 4BC5A 3QFPA 1C0GA 4CBWA 4WYBA 2ITMA 3GDQA 1BDGA 2ZWHA 3A0IX 1V4SA 2E1YA 5AQNA 5BN8A 3QICA 4CBUA 2PBDA 3KZBA 4FWKA 1R59O 2V7YA 4IJNA 2Q2RA 3IFRA 3WEEB 1NGHA 3O1WA 1GLLO 2NZTA 3HTVA 3W3DA 4BRQA 2GTDA 4BR0A 3S41A 3A8YA 3QDKA 5EOYA 1HPMA 4YDUA 3VPZA 4A61A 1GLFO 3R9PA 3OHRA 1TUUA 3UB5A 5AQIA 3MK6A 3O4WA 2YHWA 2BUPA 3BF3A 1KXPA 2P9KB 2P9PB 2J4RA 2P9UA 4PKGA 4FPAA 1JCGA 4LC9B 3H3OB 3C0BA 1ZC6A 5AQFA 3VOVA 2W41A 3VGLA 4PL8A 4XH4A 4B1XB 1BU6O 5AQMA 3W0LA 1YAGA 4BREA 5BREA 2FSKA 2GEMA 3GL1A 4CJ7A 2KHOA 2P9LB 1G99A 4EHTA 5KQ8A 1NGJA 3LDOA 4B1VA 4BC4A 5FPMA 2WUSA 1ATSA 1GLBG 4A2AA 4BR4A 3EZWA 3UKUB 3FZKA 1MWKA 2F9TA 1JCEA 3SJHA 2Q31A 1S22A 5LJVA 4FWPA 5AQGA 3L0QA 5JLHA 1K8KB 3VGKA 3U9DA 5LY3A 4FWQA 2P9PA 1HKGA 2NLXA 3VEOA 1RFQA 3LDNA 4HTLA 3M3ZA 3EKUA 5F0XA 1S3XA 4K41A 4XH1A 3IUCA 3SLCA 3ZX2A 5AFUH 5EVZA 3O5BA 5I9EB 2E1ZA 5ELZA 1BA0A 2P9IB 2YJFA 1ATNA 2P9LA 1Z05A 2GWJA 2QWLA 3I8BA 4QS7A 1NGFA 4BG8A 2ZGZA 2QWRA 4H5TA 1GLCG 5JLFA 4BR9A 4H0OA 4RWTA 4BVPA 4BRIA 5AQTA 3ZETB 3ENHA 3MDQA 1BO5O 3UKUA 3RSEB 3EKSA 5LJWA 4FOEA 1P8ZA 4BRLA 2QWMA 1RDWX 4Z94A 5JICA 1LOTB 3HM8A 3BP8A 2IVPA 3ULEB 1K8KA 3D2EB 3GG4A 5AZJA 3U9ZA 3B8AX 4CZFA 1U6ZA 2I7PA 2YHXA 4CZEA 5EY4A 1KAYA 1YVNA 4FO0A 4H5WA 4DQ8A 3HBTA 4CZGA 5ADXA 3AY9A 3GOIA 2I7NA 5AQUA 2E20A 1QZ5A 3IDHA 5BPNA 4FPBA 5AQXA 3FR0A 2IVOA 5AFUA 2A5XA 1JCFA 1WUAA 3CJ9A 4CZHA 1ZXOA 5BN9A 1BWFO 3AAPA 3QBWA 5BRFA 3QB0A 4CBXA 5CE3A 2P9IA 4B1UB 5BR9A 5AQLA 2E2PA 4HWIA 2YHYA 2IIRA 4WQ5A 3VF6A 2EWSA 3VERA 2E2QA 3O80A 4I6MA 2CH6A 4JAXA 2V7ZA 4E1JA 1ESVA 2GELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LAMA 4CI6A 2G8KA 2HVHA 4EFHA 3QINA 3TPQA 4CZMA 2FF6A 1Q7YO 2WC9A 2ASPA 2D5RA 4AHSA 2YV0X 1KC8O 3LPTA 1GLEG 5KPRA 1TK5A 4EIAA 2ATQA 2KFZA 1HJRA 3A5MC 2HHHK 4FLVA 1KAXA 2YKMA 2A41A 3OS2A 3LL3A 4WFAL 3TSQA 1HQEA 4LD0A 1BL3A 2QM1A 3ZT0A 4BQLA 2HHTA 1NGDA 1RT7A 5KRTA 4JI4K 3MECA 4M3UA 3V1OA 1ZBUA 4G9ZA 4FVUA 3DLKA 3KIOA 1BI4B 4GW6A 2CH5A 2D0AA 4FWMA 4WQ4C 3DAWA 1J9AA 3AVHA 4OPAA 3L8BA 3OJUA 4E19A 2HW3A 3I33A 1ASVA 3DLEA 1KD1O 1NJYA 1BG3A 1Z25A 3ZX0A 4DU4A 3S5TA 4FL9A 2FSJA 4DQQA 2HF3A 3J7AP 4CJSA 2OPQA 2W6KA 3EEQA 4MO5A 3R6MA 4CJUA 4B3RK 4CE9A 3MN6A 4A59A 3ZCMA 2NUBA 3Q7BA 4NCGA 1S9EA 1Y64A 3BZCA 4JKFA 1HNVA 3K5LA 1GLDG 3K58A 1TYQB 1BI4A 1YUWA 2IS3A 1U2VB 4BRPA 4FJGA 3DXKB 5FROA 4I9QA 5AQOA 4O8UA 4EHUA 1SAZA 5AQHA 3D6RA 3CFPA 1RBVA 2A1SA 1NJZA 4IFEA 3IRXA 4J2DA 3QERA 4C23A 3BEXA 3MX2A 3QBXA 3MN7A 4LF6K 3L6QA 2HBLA 2YHAA 2XY5A 3ZSRA 3TARA 3VQ8A 2VWBA 4NCBA 1NU0A 3OW2M 3ZYYX 4O5BA 2RPIA 1JL1A 1WAFA 2OA8A 3E01A 5EU7A 4CGGA 4DTUA 2FLOA 1VQ8N 2B4JA 1OVYA 4ICLA 5I42A 4W5QA 2E88A 2QWOA 4BDZA 2E6LA 5AZIB 2NRZA 3VETA 1RNHA 1QVGM 1QQCA 4YOVA 1TYQA 5CHIA 3V9XA 3LALA 4FLWA 4FWNA 1U2VA 4NB4A 3NH1A 2Q0RA 4FJ8A 4BROA 2C1GA 1X9JA 1LWCA 1I3AA 3DXKA 1BUPA 2EX3A 4YHHK 1M1KO 3VA3A 4O8KA 1RT5A 3HP9A 5AQRA 1ITGA 4H5VA 4DR4K 1SL1A 3FZMA 4DTMA 1WSGA 3AAQA 2FBXA 2HNYA 5GIPA 2O8DB 1DEJA 1NJIO 4QCLA 4E7HA 3MX5A 3HO1A 1CZ9A 2YCHA 4K43A 3ZEUB 4DTSA 3AVMA 3NVMA 4AM7A 3O8MA 5CY4A 1HKBA 2KW4A 4MLEA 4CECA 2KZMA 4XEIA 5AZIA 3PIPL 2ZJQL 3AVGA 4KAZA 4K0KK 3TTFA 3LDPA 3HVRA 4KHUA 2YHBA 1YJ9N 4CF9A 4BRFA 4BWJA 4BC2A 5HRPA 3NFAA 1S9GA 4AH9A 4CHPA 3AVBA 1L3UA 1SL2A 1RT2A 2F8SA 4H0XB 1VQ7N 2NRHA 4CF0A 1SUQA 2FBTA 3VTIA 3SNNA 2P9NA 4AHUA 4DU1A 4DTXA 1WBDA 4BDPA 4L3QA 2KLAA 4FZZA 2PYJA 3ID6A 1MA9B 3ZEUA 4E1MA 4XH5A 1Q81O 3CMAN 2RHKA 3CD6N 3ZSVA 4ISGA 3WQUA 4B9SA 4C8NA 2Q0UA 5BRDA 1HX1A 1NGIA 3OY9A 2D0CA 4CJTA 3KWIA 3OVNA 4OVLA 4WQ4A 4RCHA 1A5WA 3CG7A 4FZYA 3SZ2A 4CHZA 3THVA 2E5LK 4YNQA 4GKKK 5BN8A 3RR8A 3KZBA 4FWKA 4U67L 1RT6A 2RF2A 4UY8O 1R59O 5C25A 3QEXA 2V7YA 4IJNA 3IFRA 2JWLA 3TTDA 3WEEB 2R7YA 1NGHA 3O1WA 3NE6A 1GLLO 3KD1E 4PA1A 4Q0BA 3S41A 4DR2K 3A8YA 3QDKA 5GAEP 1FJGK 3VPZA 1UA0A 1TAQA 4H4MA 1WSIA 5C24A 1VSIA 3NMUA 4DTRA 3UB5A 4CJFA 2UXBK 1HNWK 4WCEL 1NK0A 2P9KB 3MWPA 1RDAA 2J4RA 3C6AA 3L2QA 4F3TA 1JCGA 1LAVA 1T05A 3H3OB 1O1WA 4C8OA 1ZC6A 2OTLN 2JLEA 3R1XA 3WNFA 2DFEA 3SQ2A 5J2MA 4C8LA 1WSEA 1RTDA 4E7KA 4LF4K 2Y1JA 4CJ3A 4BREA 5M1PA 5CR4A 2WOMA 2KHOA 4DFJA 4FK2A 3RWUA 4B1VA 5FPMA 4DS5A 3MXIA 1QE1A 2F96A 5JS1A 4BR4A 3PUFA 1SKSA 1JCEA 3KK7A 1RCHA 4CIFA 4CK2A 4DQRA 3L0QA 3TSUA 1K8KB 4FVMA 3QEWA 4MQ3A 4CEFA 1HKGA 4E0DA 4CW7B 3OYBA 1FW6A 1ZBIA 3LDNA 4HTLA 4GMJB 1Q86O 1KVBA 4CEQA 1O13A 1S3XA 4K41A 4XH1A 4B9LA 2XHBA 3IUCA 2XO7A 5AFUH 2YNHA 5EVZA 5I9EB 4B9UA 5HROA 2YJFA 2GWJA 5I3UA 4CJRA 5FLXO 2QWRA 4DTPA 1N33K 1FK9A 1GOBA 2B6AA 4RWTA 4BVPA 3PSIA 4JI2K 3O9TA 5IT9O 3ENHA 3CC7N 4Z4EA 3HRGA 4DWIA 3EKSA 2Y1IA 3S3NA 4AHCA 3ISNC 2VGNA 1EWRA 4C1NI 4YOTA 1EO1A 1RT1A 4RW6A 1K8KA 3ZSZA 4FJNA 4CZFA 2B5JA 4K8ZA 4CZEA 5D3GA 1YVNA 3HBTA 5ADXA 2IGIA 3AY9A 3GOIA 5AQUA 4AHTA 4X66K 1QZ5A 3L2WA 2ZM6K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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