2YJFA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
371
structure length
352
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVKDSYVGDEAQSKRKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 111
structure length 352
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjfA03
4YDUA 3O1WA 1RDWX 1NGBA 4WYBA 2YJEA 3A5LC 1HUXA 1DGKN 2FF3B 3P4IA 3CJAA 1ATNA 1K8KA 4B1WB 3O4WA 1NGIA 4BR4A 5CE3A 5AQRA 2Q1NA 2P9SA 4BRNA 2E1ZA 3VENA 3ENHA 4JHDB 1RGIA 3O80A 2HF4A 2NRHA 3H3NO 3H1VX 1CZAN 4H5WA 3CQXA 2ITMA 3ZEUB 2UYTA 1XQSC 1NGFA 3HI0A 2QWOA 4I6MA 3F9MA 5E84A 2QWLA 3AAPA 3O1BA 1IG8A 1TYQB 4JN4A 5AQMA 4CZFA 1HKGA 1ZC6A 5FPMA 3GE1A 2V7YA 3FE1A 3LL3A 4DCHA 1U2VA 3L0QA 3VGMA 4RWTA 4FWSA 4Y0WA 4BRGA 3DJCA 1GLDG 1MA9B 1KAZA 2IVNA 4O5FA 3UKRA 4BG9A 2PAVA 4B1ZA 2ZF5O 2E8AA 2CGKA 4PKIA 4CBUA 5FPDA 4B9QA 4C23A 1QQMA 5F1XA 1OKJA 1GLCG 1YXQA 3A5OC 5BRDA 3SLCA 2P9NA 2P9LB 5JICA 2IVOA 2P9UA 3ZX3A 4BRPA 3VEYA 2DPNA 5AQUA 4EFHA 3HTVA 3M3ZA 2Q97A 4BC4A 3LM9A 1BDGA 5ADXA 4B1VA 5AFUA 5ADXH 4H0TB 5AFUH 1U6ZA 3LDQA 2QWQA 2I7NA 2ASMA 4BGAA 4BRKA 2OANA 3MN5A 3VETA 3EKUA 3GBTA 5E26A 1BU6O 3MN9A 4IXCA 2FLOA 3DXMA 4A2BA 4YDUC 2A5XA 2EWSA 2Q36A 1DEJA 1NM1A 2GELA 5AQTA 3MDQA 1V4SA 3DXKB 1P8ZA 4PKGA 4BR7A 3KVGA 1SAZA 2W40A 4CZHA 5BREA 4FL9A 4FOIA 3QFUA 4CD3A 4NB4A 4BRDA 3J8AA 5BPMA 1RFQA 5LJVA 3SJHA 2VYPA 2QW9A 1LOTB 1YUWA 2D0PA 1X9JA 2Q31A 3VEZA 2GUPA 5FPEA 3AAQA 3OHRA 5AQLA 5AQSA 2E1YA 2BTFA 3FLCO 1WOQA 1XC3A 3MK6A 1E4GT 2FF6A 3W0LA 5JLHA 2QXLA 2ASPA 1TUUA 3WT0A 2P9PB 3RSEB 4FWRA 1ESVA 5AZIA 5I9EB 3ATUA 2YJFA 2A41A 4ISFA 4PL7A 2WUSA 3LDNA 3VF6A 4BROA 2E20A 4JHDA 4FO0A 1H1VA 2A40A 3ENOA 3AARA 3WQUA 4CBXA 4BQLA 5AQQA 3AY9A 3QBWA 4IO8A 4IJAA 1BA1A 4L3QA 1Q18A 5EXWA 2E2PA 4RTFD 1TYQA 3H46O 2VWBA 4BRLA 2W41A 3R9PA 4H0YB 1HLUA 2AP1A 4M7YA 1MWKA 3EZWA 1ATRA 1X3MA 3VOVA 3UKUA 1NLVA 2QWPA 3KHYA 5BN8A 3C7NB 4ISGA 5KQDA 2F9TA 4O8KA 2HOEA 4NO7A 4JD2B 3GOIA 1EQYA 4CZGA 4EAHD 3L6QA 3GDQA 2FSJA 3B8AX 3QBXA 3MN6A 3UB5A 3WUHA 1GLEG 3DAWA 3HZ6A 4H5RA 3CETA 2GTDA 4WQ5A 5AZJA 1K8KB 4CBWA 3MN7A 2Q0UA 1BWFO 4H0PA 1J6ZA 4K25A 4MO5A 3SMPA 1JCGA 3CI5A 4WQ4C 4BR2A 3CIPA 4DHYA 4HTLA 2FXUA 2CGLA 4FPAA 3CJ9A 3A8YA 4H0XB 5LJWA 5LY3A 4I6MB 2CH6A 3QMLA 4CZLA 3H3OB 1Y64A 3WXJA 1MWMA 3CERA 4QS9A 4EHTA 3IUCA 3VERA 2IVPA 3TPQA 2HMPA 4BC3A 4BR0A 4XEIA 1GLBG 3CHWA 4F9OA 3LM2A 3BP8A 3ZX0A 2P9IB 3LDLA 4CZIA 3LDPA 4QS7A 4FWOA 5AR0A 2FSKA 2BUPA 4FWLA 5AQWA 4E1JA 4FWMA 2CGJA 2D1KA 1C0FA 1G99A 3QICA 4CI6A 2P9KA 3R6MA 3WEEB 2ASOA 2J4RA 2NLXA 2P9NB 5AQYA 3FR0A 3ZETB 1WUAA 4GNIA 5AQKA 2V7ZA 4H5NA 3CJBA 3IDHA 3JXUA 3VEXA 2YCHA 5KQ8A 2A6AA 3L4IA 4WQ4A 4EHUA 2NZTA 4JAXA 4BRAA 1GLLO 3D2FB 4FWPA 2E2OA 2YHWA 2D0OA 2V52B 3IMXA 5BPLA 3D2EB 1HJOA 4B1XB 5F2RA 4FPBA 3QFPA 4CD1A 4M63C 3CJCA 3DXMB 4JNEA 4BRHA 4DB3A 5AQXA 5AQJA 4BRFA 5BRHA 2Q2RA 2H3GX 3BUZB 2QWNA 1IJJA 4GY2B 4WQ5C 4H0OA 1LCUA 5AQHA 3FZFA 1JCEA 2AA4A 2GWKA 4H03B 3LDOA 3QB0A 2ZWHA 4XH5A 1E4FT 3ZEUA 2CH5A 5TKYA 4BREA 5KPTA 3BEXA 4K41A 5AQZA 3C7NA 1YVNA 1JCFA 4BGBA 1SZ2A 1MDUB 3G25A 3U8XA 1GLJO 5EX5A 2QM1A 4HWIA 1BA0A 4K43A 1Z05A 4IJNA 2E88A 4A62A 5ELZA 3U9DA 2GWJA 4H5TA 2ZGYA 3MMVA 1BO5O 3W3DA 1HX1A 3BF3A 5BRFA 1KAYA 4FSVA 1S3XA 2YHXA 3O08A 3R8EA 1NGGA 3WXLA 5EVZA 3M6GA 5F0XA 1NWKA 3VGKA 5AZIB 3ULEB 3HSCA 3FZMA 4LC9B 3FFKB 4H5VA 5FPNA 3VF4A 5AQFA 2YHYA 3FZHA 2P9LA 4PL8A 3ATVA 4XH1A 5KPZA 1QHAA 5BN9A 1HKCA 5AQNA 5AQIA 3HM8A 1HKBA 2E2QA 1NGCA 3WXKA 2A42A 4AM6A 3C0BA 1ATSA 1V4TA 3D7EO 2Q0RA 4Z94A 4BQZA 2P9SB 1KAXA 3A5MC 5JMVA 1NBWA 3O5BA 1D4XA 2I7PA 2IIRA 1HPMA 3CQYA 3GG4A 3UKUB 2A3ZA 5AQPA 4CJ7A 2YI1A 3EKSA 2P9IA 1QQNA 4FWNA 3VF2A 5AQGA 2KHOA 4IWVA 4BR5A 1QZ5A 4J8FA 1U2VB 3DXKA 1GLFO 3CJ7A 3WEEA 3I8BA 3SK3A 4B1UB 3I33A 2D4WA 3WXIA 3ZETA 4BRCA 4A61A 2QWMA 3UKRB 1ZXOA 1R59O 1XUPO 1GLAG 5AZJB 3U9ZA 4BR9A 4CZKA 3QDKA 2GEMA 1NGDA 1ZBSA 1SQKA 5EOYA 1QQOA 3FGUA 4BVPA 1KXPA 2F9WA 1NGJA 4H0VB 5AQVA 3EL2A 3MCPA 4BVOA 3D2FA 3JS6A 3O8MA 3HBTA 1DKGD 1T44A 3U4LA 4CZEA 3D2EA 5JLFA 3H6EA 4MLEA 2FSNA 3ZX2A 2P9UB 2VCPA 2ZGZA 3WQTA 1BOTO 4EIAA 3EO3A 1BG3A 3BF1A 4BRMA 2P9PA 4FOEA 3RSEA 4BRIA 3VEVA 5EY4A 3O6WA 4IZ9A 3VEWA 4BC2A 2QWRA 3FZLA 1TUYA 1T6DA 4FWQA 3S41A 3DWLA 1NGEA 4KBOA 4AM7A 5BR9A 3A0IX 3VGLA 1T6CA 3SMSA 3TU5A 5BPNA 4M7XA 4MO4A 3KZBA 1NMDA 5AQOA 5KPRA 3A5NC 3H1QA 4FWKA 1NGAA 3VESA 1C0GA 4A2AA 4CZMA 3IFRA 3GL1A 1QZ6A 1X3NA 3ID8A 2HF3A 2P9KB 4CZJA 4B1YB 3CJ1A 1NGHA 2PBDA 4PKHA 4DQ8A 4QS8A 4BG8A 1BUPA 4K42A 1S22A 4RCHA 2V51B 3EN9A 4BRQA 2E2NA 3UE5A 5B8HA 4XH4A 4MLHA 4JD2A 3ULEA 3H45C 1Z6RA 3FZKA 3M1FA 1YAGA 4ISEA 3VEOA 4BC5A 3VPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B9DA 3O1WA 3K57A 2HBLA 4CJLA 1WSHA 2BE2A 3OYLA 4WYBA 1TKZA 2YJEA 1BCMA 5J2QA 4GW6A 2DFFA 4JI8K 3O4WA 4GKKK 4I2PA 3MEEA 1JXBA 4BRNA 3C6AA 3ENHA 4JHDB 1S6PA 1E3MA 4X66K 3CMEN 1WSFA 1RGIA 1Z25A 4LFAK 3NGIA 2HHUA 2NRHA 4CEEA 2ITMA 3ZEUB 4YNQA 3PIPL 4I6MA 4O5BA 2VWKA 5E84A 3AAPA 3E9OA 3O1BA 1TYQB 1B9FA 3IKMA 4YOXA 3CD6N 4DCHA 2V7YA 3L2WA 3L0QA 2UXDK 4Y0WA 4CEOA 3H08A 1I94K 2P51A 4PQUA 1MA9B 1KAZA 3NF6A 2IVNA 1FK9A 4B1ZA 4DF4A 1NJZA 4B9QA 5HRPA 4BACA 4OO1J 3C94A 3V9SA 1JXEA 1BL3A 3HP6A 4CEZA 2P9NA 3U3YA 1ILYA 2P9LB 2P9UA 4ID5A 3VN5A 3ZSQA 3ZX3A 4BRPA 3HL8A 3LDSA 4FJIA 3AV9A 3VEYA 4CEDA 2OPRA 1RTIA 4EFHA 3CQ8A 1S1XA 3M3ZA 1U04A 4FLVA 4BE7B 1SKRA 3LP3A 4H0TB 4MDAA 5AFUH 4BRKA 2OANA 2HVHA 3EKUA 2NNWA 1BU6O 4IXCA 2YHBA 1J5OA 1KVCA 4A57A 4YDUC 2A5XA 4X62K 1TK5A 1SKWA 1L5UA 1V4SA 1U47A 1P8ZA 2JWKA 4BR7A 4DQIA 4K0KK 4AHUA 4JKGA 4LF4K 3DOLA 4CJTA 3QFUA 4CD3A 1NKBA 3LWMA 4YFUA 1HYZA 3U6FA 2UUCK 4CHNA 1KSPA 2GUPA 3OHRA 1VRTA 1NOYA 2C1IA 5AQSA 4TSXA 4DR3K 1X9MA 2E1YA 1NJXA 1WOQA 3T3FA 4CF8A 2ZJPL 3MK6A 2FF6A 3W0LA 2O8CB 1WSGA 3AVCA 2BGGA 4FM1A 2ASPA 3KIOA 1RCHA 1WNSA 3LWLA 3RSEB 3L2UA 4FLXA 2UUBK 3BZKA 4CK3A 5AZIA 3VQAA 5FLXO 3ATUA 2YJFA 2XY8A 2WUSA 4X64K 1RBRA 1QHTA 1YT3A 4JHDA 1H1VA 4YY3K 3C95A 3TAMA 4BQLA 2G8WA 2XO7A 5HOOA 5I3UA 1D9FA 1Q18A 3K2PA 2HHQA 4RTFD 1TYQA 3RMCA 4BRLA 1NNEA 5M1PA 1YI2N 3HJFA 3AVNA 1ATRA 3VOVA 5GADP 4W5NA 3VQBA 4JI5K 4FJ7A 2FBYA 1C1CA 4ISGA 4KTWA 5KQDA 3L3VA 1RT5A 2HOEA 1S9EA 1EQYA 1XC9A 3E01A 1RDCA 4EP4A 3L6QA 2QI2A 5J2MA 3B8AX 5IT9O 1GLEG 3CMAN 4H5RA 3CETA 3WNHA 3SI6A 4IDHA 1K8KB 5AZJA 4B3SK 3PLAA 4M3WA 3K5OA 4M3RA 1OVYA 5M1QA 3TWHA 4WQ4C 3T1YK 1NOZA 4DLEA 2O4IA 5AJ3K 4CF0A 2FXUA 2CGLA 2O8EB 4H0XB 3CJ9A 5LY3A 2OTJN 3V1RA 4W5QA 3QEXA 4F8RA 1ZBIA 1NJIO 3K9JA 4AQYK 1Y64A 1MWMA 4DTUA 3KD1E 3VERA 4FVUA 3SUPA 3KK7A 3VQ6A 1GLBG 3CHWA 4CZIA 4JRPA 3T1AA 3LAKA 4FWLA 2BUPA 1W97L 4E1JA 4CHZA 2D1KA 1SL1A 1DLOA 4Z0UA 3WEEB 5K14A 2ASOA 1BQNA 5CZ1A 3FR0A 5AQYA 1WUAA 1N33K 4H5NA 3OYNA 4FJ8A 4FXDA 2YCHA 4B9TA 2A6AA 4WQ4A 4FJGA 1C0TA 1RDDA 1XHXA 4DTXA 1S1WA 1GLLO 3D2FB 4RG8A 4NLBA 3KJVA 1BISA 1NJWA 4IG0A 3DOKA 1HNWK 2QTDA 4IKFA 4BRFA 2Q2RA 4JI1K 3CYGA 2FBXA 3TABA 4ICLA 2B6AA 3CCSN 1TK0A 3LDOA 3QB0A 3P1GA 4OKJA 1E4FT 1S9GA 4BREA 3F73A 2WC9A 3T1HK 3THWA 1TAQA 4E19A 4OGCA 1JCFA 1VSHA 4BGBA 1UWBA 2VQEK 4BY9C 1VQ6N 3U8XA 4N47A 4A62A 2X78A 3C6TA 4XIUA 2GWJA 3BF3A 5BRFA 2UUAK 1S3XA 2YHXA 2X74A 3R8EA 1NGGA 4OJRA 3A2FA 3WXLA 5EVZA 5F0XA 3OS2A 1LAVA 5EU7A 3O3FA 4KHQA 3IAYA 3HVRA 3FFIA 4NYFA 3VF4A 5AQFA 3J80O 2YHYA 3TTDA 4J2EA 1NKCA 3ZT3A 4CJPA 5JS1A 1QHAA 3RWUA 1RDAA 3HM8A 1RT4A 3NVKA 4FYDA 2O8EA 2KLAA 3SYZA 2ITGA 3C6HA 3HM9A 1Q86O 3NF7A 2Q0RA 1FKPA 2P9SB 4B9MA 1NBWA 1HMVA 1K9MO 1QSYA 1D4XA 2I7PA 4CERA 3CQYA 4E7LA 4FJNA 3DRPA 5FRMA 3RVCA 2YX6A 3M8SA 1T8EA 3UKUB 3KLHA 4DTRA 2YI1A 3CPEA 1WSEA 4CGIA 1S1VA 2D0BA 4KTZA 3V9ZA 4DR7K 3DXKA 2P1JA 3S3MA 3WEEA 2A1RA 2D4WA 3EE9A 1KTQA 4B9NA 3MEDA 4BRCA 3PO5A 3UKRB 4BE1A 3L8BA 3T7ZA 5T7BA 1GLAG 4YORA 1ZBSA 2FC0A 3FGUA 1VSDA 1KXPA 2F9WA 1SV5A 2G8IA 4B3TK 2HBMA 4BVOA 3D2FA 1DKGD 4HUEA 5HL7L 3H6EA 4MLEA 3ZX2A 2ZGZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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