1G15A

Co-crystal of e. coli rnase hi with two mn2+ ions bound in the the active site
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
150
structure length
141
Chain Sequence
KQVEIFTDGSALGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHAEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVGHPENERADELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Co-crystal of Escherichia coli RNase HI with Mn2+ ions reveals two divalent metals bound in the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 47
structure length 141
sequence length 150
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2000-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1g15A00
1NJYA 1JXBA 2PYJA 1WSJA 3LP1A 4CHYA 3HP6A 2IDOA 1NK0A 4Z4EA 4CEEA 4B08A 4KTQA 3ZSWA 4CF2A 1GOCA 2XO7A 3V9XA 3ZSXA 4FLUA 4KTZA 3HK2A 4DG1A 3KD5E 4ID1A 4NYFA 3MXMA 1D9FA 4Q5VA 3JYTA 4CEDA 3VQ9A 4KHYA 3AVFA 2OPRA 4EZ9A 3TAGA 3AA2A 1HYVA 1ZBLA 3AA5X 1BQNA 1N5YA 3VQAA 1X1PA 4Z4CA 1LV5A 1J53A 1VSHA 4B9UA 2OZMA 4H8KA 3V1OA 2HHTA 1U47A 3BGRA 3S9HA 3CFRA 4KO0A 1NK7A 4FJIA 4I9LA 3DOLA 4FJJA 2QK9A 4DS5A 3OYJA 4ELVA 5HRSA 1QSSA 3A2FA 3TI0A 4CJWA 4CK3A 1TV6A 3DLGA 3SPYA 3KLIA 2I5JA 1BL3A 3RMBA 1SL1A 3DRPA 4FLVA 4KI6A 4W5OA 3DRSA 3O4NA 4TSXA 3VQEA 3KKSA 1T05A 4CJFA 3LWLA 2G8VA 4J2AA 4FZXC 4CE9A 3SQ2A 1RBSA 1NK5A 4CEOA 4FK4A 4E7JA 4DTUA 3D45A 3P1GA 1DTTA 1XHXA 4M42A 3SUNA 1KCFA 1TK5A 4PQUA 2DTUA 3B6OA 2X6NA 3CM6A 4O4GA 4HVJA 4E7HA 3SQ1A 4RW4A 3CM5A 1I39A 1RDCA 2VWJA 3TAFA 4QCLA 3L8BA 4W5TA 4FJLA 3VQBA 1GOBA 4FJXA 1J5OA 3M8PA 5C25A 4FYDA 1RNHA 4JS5A 1LAVA 3RRGA 3HPOA 4DQIA 1S1UA 3QEVA 3NGIA 4E7KA 3SV4A 1HMVA 4AHTA 3HT3A 3KLFA 4NCAA 2VWKA 3PV8A 1U04A 4FJHA 4OGCA 2Z1JA 5HBMA 3IG1A 4CFBA 2KFNA 4O44A 4DTMA 3C95A 3DLKA 5KI6A 3DLHA 2DFEA 2IC3A 5J2QA 3PX6A 3HL8A 4E1NA 4N5SA 2Y1IA 2DFFA 1C0TA 1HNIA 2JGUA 1J9AA 1L3VA 2PY5A 2KZZA 3SQ4A 4IFVA 3RMDA 2E6MA 5D3GA 1NJXA 2O4GA 1G15A 4OVLA 3MEEA 1RDBA 2A1SA 1A5XA 5JS2A 2XY6A 2BGGA 2GBZA 1NK6A 4C8OA 4ICLA 4CGDA 3AA4A 3HSTB 3LPUA 3DLEA 4M3RA 4DU4A 4CJVA 4Z4HA 1WAFA 1EP4A 3P83D 1S1WA 5KGXA 2XY5A 5J2MA 3LP2A 4O0JA 3LDSA 1WSGA 3LANA 4HUFA 1KVBA 2ITGA 3AO5A 3K5LA 1HQUA 4IDKA 3M8RA 5DK5A 4CHQA 2O4IA 4M3UA 1VRUA 1RTIA 2HNZA 4OPJA 3HPGA 1HRHA 1S9EA 4KV8A 4B3OA 4EZ6A 4E0DA 5KRTA 5CYMA 4MQ3A 4DFJA 3BDPA 1BIUA 2B6AA 3LPTA 3V1QA 1RTJA 1XHZA 3KD1E 4DQSA 1HYZA 1RTHA 2RPIA 3LWMA 3TWHA 2QKKA 4I9QA 1NOZA 1S6QA 4KKOA 4J2EA 1RTDA 2B5JA 4JRQA 3I0SA 3OYCA 3OYKA 4FJKA 4FK2A 1UAXA 1CZBA 4IG0A 4E3SA 2HVIA 5FROA 1C1BA 2G8FA 4DSJA 1RT4A 1SUQA 3L2RA 3VQ5A 3E01A 3ZSQA 4LSNA 1D5AA 4FM1A 3PX0A 4ELUA 4FVMA 3RWUA 3WNGA 3K59A 3F9KA 4DSLA 1JLGA 1NJZA 1KSPA 3NGYA 2EX3A 4LY7A 2R7YA 3HVRA 3AVBA 3MEGA 3SUPA 1T7PA 4J2BA 1RBTA 3OYGA 1SKWA 1N6QA 3SYZA 1LWEA 3ZSYA 3ASMA 4DTNA 2HHWA 4OKJA 3C94A 4YNQA 4H4OA 4CEZA 1VSJA 4CERA 1KTQA 5HRNA 3TAQA 4BDZA 4DU1A 1TAUA 3ZSRA 1LW0A 2XY8A 3I8DA 3AVIA 4DTXA 1C6VA 4DTPA 2G8WA 3L3VA 4BWMA 4DMNA 4LD0A 4KB1A 2DFHA 3AVNA 3C6TA 3QINA 4CK2A 3O4QA 1RT5A 3KKRA 5E41A 3NGZA 3AVGA 3V9UA 4CF1A 3V4IA 4KREA 1WAJA 4CESA 4OJRA 1U45A 3P5JA 1U49A 3AVCA 1VK0A 1QE1A 3LAKA 1L3SA 3WNHA 4AHRA 3VQ4A 4N76A 4PWDA 3NH0A 4AHCA 4Y1DA 2KZMA 1IKYA 2QKBA 3AVHA 2AJQA 4B9MA 4IG3A 4CFCA 1JL2A 1XWLA 2NUBA 1ASUA 5EU7A 4N47A 3OYIA 4FLZA 2A1RA 1IG9A 3PO5A 1VRTA 2EHGA 5I3UA 2D5RA 4O55A 4O5BA 1MU2A 3PO4A 2IOCA 5FRMA 3L3UA 1SKSA 1UWBA 1W0HA 1ZBFA 4G1QA 4JLHA 4W5RA 1L3TA 4H4MA 1BQMA 3AVLA 2XY7A 1LWFA 4XIUA 3G10A 1NK8A 4F8RA 1BISA 3VQ7A 4W5NA 5T7BA 2F8TA 3NF8A 2FC0A 2VG6A 2OPSA 4GVMA 3NH1A 3LP3A 3SJJA 4DTJA 3AO2A 3TR8A 4E89A 4M3XA 1C0UA 3IS9A 4FCYA 2B4JA 4DFPA 1R0AA 4JS4A 4FJ8A 4HCCA 3K2PA 5HP1A 1HYSA 1BHLA 1B92A 4CHNA 3OYEA 5FDLA 1BI4A 3HYFA 3DI6A 4NYNA 1WN7A 1D8YA 1BCMA 4B9TA 4CF9A 3ZT3A 3OYLA 4FJNA 2QXFA 1S5JA 1LAWA 4KB0A 1VSDA 4DFKA 4GW6A 2ZE2A 3KK3A 3T1AA 4C8KA 1Q9YA 4HUEA 2P5GA 4BE1A 2G8UA 4BE0A 3VA3A 3KIOA 4RW7A 4FLXA 3B6PA 2Y1JA 1L3UA 4E19A 3TABA 1CLQA 3QNNA 1J54A 5J2NA 4CJ4A 3OS0A 1JLAA 3VQDA 4CJTA 4DQPA 1TAQA 3DRRA 4YFUA 1RBUA 4B9LA 4PUOA 1BCOA 2RN2A 4CHPA 3HM9A 4M3YA 4F2RA 1FKPA 2WONA 1A5VA 4AH9A 1RT2A 3QNOA 5CZ2A 1WSHA 2LSNA 4LH5A 4PA1A 1GOAA 4LH4A 4CF0A 1QTMA 5HROA 4CCHA 4FJ5A 3QEWA 4Q0BA 3UIQA 4CJKA 4FW2A 2XRIA 3OYHA 3O3GA 4I2PA 3OYFA 1ITGA 1YVUA 4DQQA 1RT7A 2GV9A 4E7LA 2OYQA 3AVAA 4NCBA 2DY4A 1KLNA 1RBRA 4KHQA 3L2WA 2ATQA 3H08A 1T03A 2IAJA 4KTWA 2VG5A 5KRSA 3OJSA 1DTQA 2HVHA 3SV3A 4K8ZA 4CIGA 1CXUA 1HQEA 2YV0X 4OLBA 4IFYA 3KLGA 3CYMA 1C1CA 1WNSA 2D0CA 4CEFA 1JKHA 1X9SA 3VN5A 4CJ5A 1EXQA 2HB5A 3DM2A 3K5OA 2Z1IA 3ZT1A 4E1MA 4DTRA 3QEPA 1T8EA 1TKZA 3KLHA 3SPZA 3EZ5A 1KLMA 3TANA 3KK2A 1UA0A 4M3TA 2HNYA 2ETJA 4LSLA 4CJLA 2OPPA 4B8CA 1BI4B 1TGOA 3AO1A 3CQ8A 2FBXA 5CYQA 4CJQA 4BE2A 4DF8A 3SUQA 1I3AA 2D0BA 4CHOA 4FJMA 4J2DA 1Z25A 4CHZA 3LZJA 4O0IA 1NKEA 4B9NA 3QLHA 4DLEA 1JXEA 2FBYA 1TK8A 4MFBA 3ITHA 4AHSA 3ULDA 3TAEA 3VQQA 1HPZA 1HNVA 3ZT4A 2HNDA 1JLQA 3ISNC 3NH2A 4HHTA 1VSLA 4CJPA 1NKCA 1EKEA 2JLEA 3G0ZA 2YNHA 3PX4A 3SUOA 1S6PA 1ZBHA 3L2UA 3NBPA 4BDYA 2P1JA 4QOZB 1BIZA 1FXXA 1SL0A 3VQCA 3HJFA 3M8SA 2RKIA 2Z1HA 2OZSA 3HVTA 5J1EA 3V9SA 3NF7A 3MAQA 4FLTA 1TK0A 1RBVA 1RDAA 4KHUA 3WNEA 4Z4GA 2HHUA 1WSIA 4C8LA 2HHQA 3EYZA 5FRNA 4N56A 1S1XA 4M45A 3T19A 1JLCA 3SCXA 3IAYA 1S1TA 3LZIA 4K8XA 4CEAA 4CIFA 1KFSA 3SI6A 3OYDA 2W42A 4BDPA 4DSIA 4F3TA 4FLYA 4KPYA 4CJSA 1ZBUA 1TL1A 2Z1GA 4FJ7A 4FZYA 1CXQA 3ZSOA 2BDPA 3CG7A 4HUGA 4E7IA 1IKXA 3T3FA 1C0MA 4M41A 1QSLA 2XHBA 1KRPA 1NK9A 1EETA 3DOKA 1TKXA 3SZ2A 3PY8A 4CIEA 1U48A 4F4KA 1FK9A 1RDDA 2BANA 4DFMA 1KVAA 1WLJA 3C6UA 3ZT0A 3ZCMA 3JSMA 4F2SA 2HW3A 3MXJA 2ZD1A 1ASWA 2GUIA 4ELTA 4M3WA 2YNFA 2E4LA 4FW1A 1XC9A 4L8RB 3PUFA 2IS3A 5C42A 1Q9XA 2YNIA 3HP9A 3OY9A 4DS4A 4HCBA 5I42A 1D9DA 1Y97A 1RILA 3O3HA 2E6LA 1REVA 1TL3A 3S3MA 1IKWA 1JLBA 3MXIA 2G8IA 4I7FA 1RT1A 2P51A 2Q3SA 3ALYA 3RR7A 1VSEA 1X9WA 1YTUA 4FLWA 3QEIA 1QHTA 3QEXA 4F3OA 1SV5A 4KAZA 1FKOA 4CJEA 4OPKA 5C24A 3AO3A 3VA0A 3FFIA 4KHNA 1YTAA 4CEQA 1JLFA 4DF4A 3NAEA 4CF8A 4ZTFA 1NK4A 3HO1A 4EP5A 1DLOA 3IRXA 3U6FA 3RR8A 3KLEA 5JS1A 3AVJA 3V1RA 4FJGA 3AVKA 4CJRA 4C8MA 2KTQA 3VQ6A 4RW6A 4B9VA 4FK0A 2KFZA 4WE1A 2HHSA 4AILC 2WOMA 3V9WA 4ZHRA 3LALA 3S3OA 2P5OA 2RF2A 5HRPA 4Z4FA 2FBVA 4IBNA 3V81A 1ZYQA 3U3GA 1TVRA 2YNGA 2G8HA 1S9GA 3OYNA 5SWMA 4CJUA 4Z0UA 3NE6A 3M8QA 4DTSA 3OYMA 2HMIA 4DSKA 4NCGA 1WSFA 1A5WA 1SL2A 4QAGA 1NOYA 3HPHA 3HXMA 2D0AA 3AO4A 3LAMA 2FBTA 3DMJA 1ZBIA 1YT3A 1C1AA 3K57A 5KTQA 1IH7A 4ID5A 2KW4A 2YKMA 2YHBA 2X78A 4GMJB 5HLFA 4ZTJA 1TKTA 3VQ8A 2HHVA 2HHXA 1KVCA 3OS2A 4B8AB 3SNNA 1JL1A 3I0RA 3KK1A 4CGFA 4UQGA 2OPQA 3F73A 3D0PA 5J2PA 4FJ9A 3DLRA 4OGEA 1QS4A 4CGIA 3V6DA 3EY1A 4FM2A 3S3NA 2PZSA 1LW2A 3AVMA 4BACA 4DSFA 3TAMA 3OS1A 3K58A 1B9DA 3RRHA 3QIPA 4DU3A 4FXDA 3L2QA 3CFPA 3NDKA 3K5MA 1NKBA 4KHWA 2YKNA 4OKKA 3AV9A 3O3FA 3OYBA 1HJRA 3NFAA 3TARA 3RMCA 3ZT2A 2OA8A 4OKEA 4KI4A 4HTUA 3VQPA 2IGIA 4N41A 5CZ1A 3QETA 3CFOA 3DYAA 4RW8A 4JRPA 3RTVA 4B9SA 4Y1CA 4W5QA 3AA3A 3TAPA 3KTQA 4C8NA 1EX4A 1VSMA 3NF6A 3OJUA 3RMAA 1KFDA 3K5NA 3THVA 1RCHA 1NJWA 1WSEA 2BE2A 2ZQBA 4AHVA 4RW9A 4AHUA 1B9FA 5K14A 4CEBA 3OYAA 3ZSZA 4FM0A 3LP0A 3MECA 3L2VA 3OVNA 4CFDA 1U4BA 4EP4A 1X9MA 4Z4IA 5DMRA 4M3ZA 1W9HA 4BWJA 4CECA 2F8SA 1CZ9A 1RT3A 3QIOA 3SQ0A 4RG8A 4FZZA 1O1WA 4R5PA 4DSEA 1S1VA 1VSKA 3U3YA 4IKFA 1LWCA 3KJVA 3DLBA 1VSFA 1JLEA 2F96A 1L5UA 2PYLA 4DWIA 1BGXT 2X74A 4CFAA 2YHAA 1XI1A 4CGJA 3V9ZA 4OLAA 1IKVA 1Q8IA 4DTOA 1IO2A 3MEDA 4KFBA 1TKDA 4DLGA 2VG7A 2G8KA 3QO9A 4I2QA 5CY4A 1RT6A 4KHSA 4KRFA 4CJ3A 5KGWA 1UOCA 2KQ2A 3WNFA 4CGGA 5HRRA 1ASVA 3QERA 1QQCA 1SKRA 5SZTA 1UA1A 3NF9A 1VSIA 4CGHA 4DQRA 3NHGA 3NCIA 3ZSVA 4PY5A 1F21A 3QESA 2X6SA 4CK1A 1QSYA 1K6YA 1Z26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NJYA 1JXBA 3ZX0A 4CEEA 4B08A 4Z94A 4KTQA 5AR0A 3V9XA 3ZSXA 3HK2A 3VF6A 5ADXH 1VHXA 3MXMA 1XC3A 5GAEP 3H46O 4CZLA 3DWLA 3ZETA 3THXB 2Q36A 3KWIA 4H8KA 2KLAA 3A0IX 1U47A 4IEEA 3JS6A 1NK7A 4I9LA 2GWJA 1JJ2M 2HMPA 4I6MB 4CK3A 3DLGA 2I5JA 4DB3A 1SL1A 4W5OA 4DV1K 1HR0K 4CZIA 1NMDA 1U2VB 4FZXC 1NK5A 3P1GA 1XHXA 3SUNA 2DTUA 3B6OA 4E7HA 1NG9A 1NJZA 4RW4A 3TAFA 4K0KK 3DXKB 3L8BA 4FJXA 1VQ7N 2OTJN 5BRHA 3VF4A 3QEVA 2D0OA 3NGIA 1YIJN 1YI2N 1HMVA 3L0QA 2JWKA 5FPNA 3HT3A 2F9WA 4NCAA 1ATNA 3CJ1A 3G6EN 4CFBA 1DEJA 2HBMA 3DLKA 2IC3A 2VWBA 5J2QA 3ENBA 2O8BA 3HL8A 1U6ZA 2DFFA 3J8AA 2PY5A 3H45C 1L3VA 5JVHL 4FWMA 3O5BA 4JI8K 1NJXA 3A5NC 3MEEA 1RDBA 3E1YA 4C8OA 1HNXK 3AA4A 3LPUA 4DU4A 4JI0K 2FSJA 2XY5A 1S1WA 4MDAA 4O0JA 3LDSA 5LJVA 2ITGA 3D2EB 1VRUA 1WOQA 1GLEG 4NXNK 4H03B 4CD3A 1OH8A 2B6AA 3KD1E 4B1XB 3VENA 2QWNA 2QKKA 1OVYA 4I9QA 1NOZA 1S6QA 3TSUA 1VQ6N 4E3SA 2F7TA 3VQ5A 3EEQA 3R9PA 3MN6A 3RWUA 3K59A 4XH5A 3NGYA 3HVRA 3SUPA 2D0PA 1SKWA 1QHAA 2BH1A 3SYZA 1LWEA 3ASMA 4DTNA 5CHIA 1ATSA 4OKJA 4CEZA 1VSJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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