5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
4AM6A 1NGFA 3MMVA 5AQXA 2ASPA 2E1YA 3WXIA 4FL9A 1IJJA 3FGUA 3MK6A 4YDUA 2A6AA 2CGLA 4BREA 2NZTA 4IO8A 1HLUA 4FWLA 2D0PA 2VYPA 1ATNA 3A5MC 1BO5O 3ID8A 4WQ5A 4FWMA 3ZETB 2Q1NA 1XQSC 3ENOA 2Q97A 3O5BA 3O4WA 2GTDA 3DXMA 4BQZA 2YJEA 4MLEA 3O1BA 3IUCA 4EFHA 2P9KA 5BRFA 2FF3B 4GNIA 1Q18A 1QQMA 2P9PA 4CZFA 1NGCA 1KAXA 3U4LA 3A5NC 1BWFO 4BG8A 4BRPA 2FSJA 4BR5A 3KHYA 2WUSA 2D0OA 2P9IA 1K8KA 2F9TA 3SK3A 3ZX3A 3RSEB 3FZLA 4Y0WA 1QZ6A 3UKUA 5JICA 2GELA 2QWMA 1C0GA 5AQIA 4MO4A 2A3ZA 5AQNA 4XH5A 2IVPA 3LDOA 4JNEA 3ATUA 2GEMA 3UB5A 3VETA 4FWPA 3HM8A 4BRHA 5FPNA 1DGKN 1ATRA 2E2NA 4BRKA 3R6MA 3GG4A 3LDPA 5EX5A 2P9LA 3VF4A 2IVOA 1BU6O 3FFKB 4DHYA 1RDWX 3FE1A 2HF4A 2OANA 4FWQA 4H5RA 4BRQA 4EIAA 4CBWA 3U9ZA 3I33A 2QWQA 1IG8A 3WQUA 2UYTA 3GBTA 3EO3A 3LM9A 3EL2A 3QB0A 4F9OA 4BRIA 3IDHA 2FSKA 3D2EA 4O8KA 4CD3A 4IZ9A 5B8HA 2QWPA 5AZJA 2KHOA 1YAGA 3A5LC 4EAHD 4WQ4A 5AQGA 1WOQA 1V4TA 3UKUB 4CI6A 1CZAN 4CJ7A 3HI0A 4BR7A 2IIRA 2ASMA 1ATSA 1R59O 1JCEA 4Z94A 3C0BA 3DAWA 3D2FA 2ZGZA 3UKRB 4A2AA 1KAYA 2NLXA 2CGKA 1H1VA 3QFUA 1G99A 1WUAA 5AQWA 5BPLA 3MN6A 5AQMA 3W0LA 2F9WA 4CBXA 4CZLA 2E2PA 1NGEA 1ZC6A 3L0QA 3CJBA 4L3QA 3VESA 2ASOA 5E84A 2IVNA 3VPZA 4K25A 1SAZA 4BGBA 3U9DA 3QFPA 4K41A 2E8AA 4BRDA 5BRDA 2YHWA 3AARA 3ZEUA 5AZIA 5LJWA 3CIPA 5AQFA 5AQUA 4JN4A 4PKIA 2CGJA 1NBWA 3TPQA 5AR0A 1X3MA 2QM1A 3EN9A 1GLLO 2ZGYA 4C23A 2HOEA 5KPTA 3O8MA 3ULEA 3M3ZA 1BA1A 4FPBA 1NGHA 1YVNA 1TYQB 1GLAG 1OKJA 3DJCA 3W3DA 4WQ4C 4IXCA 1ZBSA 4RTFD 4BRLA 3BEXA 2P9NA 3LL3A 1MDUB 4FWNA 1HJOA 2D4WA 1T6DA 4H0XB 2Q36A 4CBUA 1NGGA 4QS8A 2ZF5O 5I9EB 3H6EA 2QWNA 3KVGA 5EY4A 3CJ7A 3VGMA 1LCUA 5AQQA 5KPZA 2GWJA 3WXJA 1U6ZA 2E2OA 2QW9A 3MDQA 4JHDB 3ZX2A 3VGKA 3H3OB 3QBWA 4J8FA 1RGIA 2AA4A 3MCPA 1U2VA 3WEEA 1YUWA 1NGIA 3GL1A 3AY9A 2I7PA 3WUHA 3CQYA 5TKYA 4AM7A 5AQKA 3IMXA 3WXLA 1V4SA 4JD2B 4XEIA 1NGJA 2V7ZA 4H0VB 1JCFA 3CJ9A 3FZFA 1BDGA 4FO0A 4BC3A 4BR2A 3CQXA 1NWKA 3GDQA 4FWOA 1S3XA 5LY3A 1KXPA 5BREA 3VEWA 4BR0A 1QHAA 3EKUA 3DXKA 3LDNA 5AQHA 2QXLA 1QQOA 4CZKA 4FPAA 3DXMB 4BC5A 3VEZA 3SJHA 3VF6A 3O6WA 1NMDA 4PKHA 5AQJA 4XH1A 2P9KB 3H45C 2YI1A 1EQYA 4EHUA 2P9PB 4H0YB 1ESVA 1GLCG 4YDUC 3VF2A 4CZEA 3O1WA 4ISEA 1Z05A 1E4FT 3EKSA 5AQVA 3A0IX 4B1XB 4CZJA 2FF6A 1X3NA 2P9IB 1BUPA 3CERA 2P9UA 4WQ5C 1K8KB 3CJ1A 5E26A 1SQKA 3GOIA 4JAXA 3S41A 1LOTB 3FLCO 3HTVA 3I8BA 2A40A 2V52B 5KPRA 2FXUA 3JXUA 1NGAA 3A8YA 2P9LB 1DKGD 1GLEG 3MN7A 4ISGA 1NGDA 1HKCA 4BRCA 3DXKB 2E88A 3VEXA 1GLJO 4BR4A 4I6MA 1TUUA 3LM2A 2Q0RA 5ADXH 5FPDA 5AQOA 4DQ8A 3H1QA 5AQPA 3M1FA 4H0TB 3FZKA 3C7NA 4BRGA 3CI5A 1YXQA 5AQZA 3OHRA 4H5NA 1MWMA 3QBXA 2HMPA 3SLCA 4CD1A 3VEYA 3D2EB 2W40A 4A61A 3CHWA 5LJVA 5AZJB 3WQTA 4BRAA 1QZ5A 4BC2A 1T6CA 5F2RA 4K43A 4GY2B 4H5WA 3H1VX 4BROA 4DCHA 3ZETA 4CZIA 1HPMA 4BC4A 5FPMA 5KQDA 1XUPO 4HTLA 1BOTO 3DWLA 1J6ZA 1RFQA 4FOIA 4ISFA 3D2FB 4B1WB 5AQSA 3ATVA 1GLFO 3CJCA 3GE1A 4EHTA 4M63C 3BUZB 3IFRA 2QWRA 4IJAA 4MLHA 3RSEA 3SMSA 4FWSA 4IJNA 3HZ6A 1KAZA 5BPNA 5BPMA 4BVPA 3M6GA 4BVOA 4NB4A 5JMVA 2I7NA 2E2QA 3R8EA 2YHYA 4QS9A 2QWLA 3ZEUB 5BN9A 4B1UB 5AZIB 1S22A 3WXKA 2E1ZA 4B1ZA 3HSCA 3ZX0A 3R9PA 5ADXA 3F9MA 3VERA 2BTFA 5EXWA 4NO7A 5EVZA 1GLBG 5FPEA 5AQYA 3TU5A 2DPNA 5AQRA 4FOEA 1D4XA 2P9SA 3BP8A 1ZXOA 3G25A 4BQLA 2H3GX 5AFUH 3ULEB 3O08A 1HKBA 4LC9B 4H5TA 1DEJA 4K42A 4PL8A 4MO5A 4QS7A 1HX1A 3EZWA 1MWKA 1P8ZA 1T44A 3UE5A 2P9NB 2GWKA 3VGLA 2CH6A 3L6QA 4HWIA 2W41A 4PL7A 1Z6RA 4H03B 2FSNA 5EOYA 3UKRA 2ITMA 4DB3A 5JLHA 4BGAA 3P4IA 2Q2RA 4BG9A 2PBDA 3VEOA 5BRHA 3VOVA 2FLOA 3HBTA 3WEEB 1U2VB 2YJFA 3MN9A 2A42A 3U8XA 4CZMA 5AQTA 1Y64A 4B1YB 4A2BA 1XC3A 5ELZA 4WYBA 3H46O 3A5OC 3AAPA 4M7YA 2D1KA 3JS6A 2ZWHA 3WT0A 3LDQA 2P9SB 4B9QA 4E1JA 3VEVA 4RWTA 2E20A 4A62A 4FWKA 1E4GT 5F1XA 3O80A 3BF3A 3MN5A 3CJAA 2EWSA 1TUYA 3D7EO 5KQ8A 2YHXA 3CETA 2VCPA 4O5FA 1SZ2A 4BR9A 3FZHA 1HUXA 4H0PA 1MA9B 1NGBA 2VWBA 4IWVA 2V7YA 5AFUA 3VENA 3FR0A 2BUPA 1BA0A 1C0FA 2J4RA 3QDKA 4RCHA 1NM1A 4BRMA 4B1VA 3FZMA 1TYQA 2PAVA 2A5XA 5BN8A 4CZGA 5JLFA 4M7XA 4H5VA 5F0XA 2P9UB 3QMLA 2V51B 5AQLA 1BG3A 1HKGA 3L4IA 4XH4A 3B8AX 2A41A 4PKGA 1NLVA 3H3NO 4H0OA 4BRNA 4BRFA 2HF3A 4FSVA 3LDLA 2YCHA 3SMPA 1QQNA 1X9JA 2Q31A 2CH5A 3J8AA 5BR9A 2GUPA 4JHDA 2Q0UA 2AP1A 3BF1A 4CZHA 2QWOA 4I6MB 5CE3A 4JD2A 3ENHA 4KBOA 1JCGA 3AAQA 3QICA 2NRHA 1GLDG 3KZBA 3C7NB 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM6A 1NGFA 2I61A 5CYQA 3G4SN 1VQ6N 4CW7B 5AQXA 4K0KK 3WXIA 4FL9A 4DMNA 3FGUA 3QI7A 3MK6A 3LDSA 4BREA 4FLVA 3VQEA 4X62K 4YOUA 5KGWA 3A5MC 5C15A 3ZETB 1X9MA 1N5YA 1XQSC 1SN1A 4J2EA 4E19A 2YJEA 2IAJA 4Y1DA 3ZSOA 2P5GA 3O1BA 3IUCA 1I39A 2IDOA 3HOSA 4GNIA 3K5MA 3SPYA 2E6LA 1NGCA 3AVCA 1LWCA 3LANA 1JLGA 1NK7A 2KQ2A 2HNYA 1K6YA 4Z0UA 4CJUA 4M41A 4AHVA 4PHTX 2D0OA 2P9IA 3KHWA 2F9TA 3VQ9A 5M1QA 4DV2K 1I3AA 4CJPA 1CLQA 1NE5A 1C0GA 3B6PA 4MO4A 2A3ZA 1L4VA 4KO0A 3LDOA 4AHUA 4JNEA 3VETA 4JEPA 1OH6A 4FWPA 3HM8A 4JK9A 4JI6K 3NDKA 3R6MA 3FFIA 3GG4A 4LFAK 5EX5A 3FFKB 1RDWX 2HF4A 3OJSA 4FWQA 2UXCK 3U3YA 1LWFA 2UU9K 5DM6L 3HK2A 2KYQA 3MWPA 4OJRA 2AJQA 1UGLA 2HHSA 1KRPA 1SEGA 3CG7A 3ZSXA 2UYTA 3ASMA 3SUNA 3P38A 3EO3A 5JVHL 3VMFB 3THYA 1VQLN 4AHTA 2QWPA 4WE1A 2KHOA 3HP9A 4LF8K 3SUPA 1J5OA 3KOYA 3C94A 2Z1IA 3HVRA 3A5LC 5JS2A 3DM2A 1S1VA 3KTQA 4CJ7A 4W5OA 4Z4EA 4GVMA 1IBLK 5HL7L 4C8OA 1JCEA 2W6LA 4Z94A 1FKOA 1HNXK 2ZGZA 4DG1A 4NXMK 4FZYA 4CF0A 3QFUA 4FJKA 3HO1A 1L5UA 3T7ZA 1SKRA 4FJMA 5BPLA 3W0LA 1NGEA 1ZC6A 3L0QA 3VESA 1VSLA 2IVNA 3SAFA 1PX9A 3P1GA 4K25A 4V1DC 3NE6A 4FJGA 3Q7BA 2OZSA 3U9DA 4K41A 3L8BA 1ZBLA 3ZSQA 3THYB 5HRPA 4E7HA 4YY3K 1OZZA 3ZEUA 3K9KA 1WNSA 5AQFA 5M1FA 1U47A 4J2BA 4FK4A 4YOXA 3BY5A 2O4GA 2D0AA 1LWEA 4JLHA 3OTOK 4DSKA 4E7KA 2WC9A 1GOBA 4DV7K 4HCCA 4IOAL 1X3MA 4JI3K 3EN9A 2E5LK 3HXMA 2HOEA 3AVBA 3ULEA 2Y1JA 3M3ZA 5FLXO 4B9UA 1EETA 5A2QO 5SZTA 4B8CA 1OKJA 1L3VA 2G8WA 4KHYA 2O8FB 4IXCA 5M1OA 4KB1A 1SL0A 1WN7A 5M1PA 3O3GA 2OPPA 3BEXA 1MDUB 3LPUA 4H0XB 4CJKA 1ZFUA 4QCLA 2QKBA 3E7RL 4GKKK 1KLMA 4C8LA 1SL1A 4JHDB 1B7DA 3QBWA 4J8FA 4CEZA 2AA4A 3WEEA 3KKRA 1YUWA 1U04A 4BECA 3AA5X 1BRZA 2I7PA 3T69A 2B5JA 4FZXC 4LF6K 5AQKA 4DFMA 2GV9A 4OVLA 4EP5A 2V7ZA 4K8ZA 1YVUA 3CJ9A 1BDGA 5C2DA 2HHIA 1IO2A 3CQXA 4E72A 1RDUA 3SQ4A 1S3XA 3QEIA 1KXPA 3VEWA 2Z1JA 4BR0A 1QHAA 4FJ7A 3DXKA 3M5RA 2NNWA 3IKMA 3LDNA 4WFNL 1QQOA 5TKWA 4CZKA 4FPAA 5C25A 1RBTA 3PSIA 4PKHA 2DFHA 3NH1A 1T05A 1GPTA 3AO4A 2P9KB 5LMUK 2P9PB 4H0YB 1Z05A 4O44A 3K57A 3CC7N 2P9UA 3QLHA 4JV5K 5E26A 3KLIA 4KAZA 2PZSA 4RG8A 3OYGA 1N4NA 2DTUA 2O8EA 3H08A 1ZVEA 4LD0A 3THWB 3V6DA 1NGAA 1DKGD 4PWDA 3AVLA 3DXKB 4Z4GA 1KVBA 2Q0RA 3VQDA 4DV0K 1U49A 4DQSA 3E1YA 3M1FA 4DLEA 3HYFA 4H0TB 2JWKA 4BRGA 4O8UA 4DTUA 5I42A 3ZT3A 5AQZA 3C6UA 3PSMA 1MWMA 2HHTA 1WAJA 4CK2A 3D2EB 2W40A 1I2VA 4A61A 1BL3A 3VQBA 3WQTA 4BRAA 1B9DA 4BC2A 1T6CA 2YKNA 4GY2B 3AVIA 2HSTA 5GIPA 3AV9A 4DCHA 3LWLA 4JKHA 4JKAA 4WFBL 3QIOA 1XUPO 3DWLA 2UUAK 3CCLN 1Q9XA 1ICAA 4OKJA 1Z26A 2E2FA 4GW6A 4B1WB 5AQSA 1HYVA 3ZCMA 3GE1A 4KH4A 1YF5L 3S3OA 4EHTA 3V9WA 4PA1A 3BUZB 5H1SQ 3ID6A 1KD1O 2ASCA 4ELUA 4IJAA 1B9FA 4MLHA 1C6VA 3RSEA 3CPEA 3SMSA 4FWSA 1N32K 2XY6A 3F73A 5BPNA 5CZ2A 3J81O 3HOTA 3VQ5A 1QSSA 3M6GA 4DR5K 4JI4K 4NB4A 5JMVA 3SCXA 2E2QA 3R8EA 4MFBA 1RDAA 1S72N 2QWLA 5BN9A 4B1UB 1S22A 4GV3A 4PQUA 4A5AA 3KK2A 4K8XA 1PE4A 3TARA 3VERA 4Y1CA 1XNQK 5AQYA 1W2BM 1JKHA 4CESA 1SKSA 4W5TA 5AQRA 4FOEA 1D4XA 4GVEA 4DQIA 1ZXOA 1RT1A 2QI2A 2RKIA 2H3GX 1Q81O 4CERA 4JI2K 2VQFK 4LC9B 4H5TA 1DEJA 3RMCA 3GKUA 1SKWA 2NRWA 4KTZA 1T44A 1B92A 3UE5A 2B68A 2GWKA 4CHQA 3VQAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4AM6 A;  1NGF A;  2I61 A;  5CYQ A;  3G4S N;  1VQ6 N;  4CW7 B;  5AQX A;  4K0K K;  3WXI A;  4FL9 A;  4DMN A;  3FGU A;  3QI7 A;  3MK6 A;  3LDS A;  4BRE A;  4FLV A;  3VQE A;  4X62 K;  4YOU A;  5KGW A;  3A5M C;  5C15 A;  3ZET B;  1X9M A;  1N5Y A;  1XQS C;  1SN1 A;  4J2E A;  4E19 A;  2YJE A;  2IAJ A;  4Y1D A;  3ZSO A;  2P5G A;  3O1B A;  3IUC A;  1I39 A;  2IDO A;  3HOS A;  4GNI A;  3K5M A;  3SPY A;  2E6L A;  1NGC A;  3AVC A;  1LWC A;  3LAN A;  1JLG A;  1NK7 A;  2KQ2 A;  2HNY A;  1K6Y A;  4Z0U A;  4CJU A;  4M41 A;  4AHV A;  4PHT X;  2D0O A;  2P9I A;  3KHW A;  2F9T A;  3VQ9 A;  5M1Q A;  4DV2 K;  1I3A A;  4CJP A;  1CLQ A;  1NE5 A;  1C0G A;  3B6P A;  4MO4 A;  2A3Z A;  1L4V A;  4KO0 A;  3LDO A;  4AHU A;  4JNE A;  3VET A;  4JEP A;  1OH6 A;  4FWP A;  3HM8 A;  4JK9 A;  4JI6 K;  3NDK A;  3R6M A;  3FFI A;  3GG4 A;  4LFA K;  5EX5 A;  3FFK B;  1RDW X;  2HF4 A;  3OJS A;  4FWQ A;  2UXC K;  3U3Y A;  1LWF A;  2UU9 K;  5DM6 L;  3HK2 A;  2KYQ A;  3MWP A;  4OJR A;  2AJQ A;  1UGL A;  2HHS A;  1KRP A;  1SEG A;  3CG7 A; 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