5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
5ELZA 4NB4A 3FZKA 3MN5A 5F1XA 4A61A 2E2QA 4JHDB 4MLHA 2BUPA 4E1JA 3CJ1A 2VWBA 3KVGA 3WXKA 3UKRA 4MO4A 1MWKA 4PKHA 1G99A 2D4WA 2P9SA 5BPNA 4BR0A 4BRNA 3R6MA 5AQOA 4CBUA 4FWSA 1U6ZA 5AFUH 1GLBG 4MO5A 3B8AX 4HWIA 3RSEB 3H1VX 1JCFA 1Y64A 2FSKA 3EN9A 1NGIA 5BRHA 4BRPA 1RDWX 1BOTO 3UKRB 2QWNA 3GL1A 3O6WA 3HI0A 2ZGZA 2P9SB 4B9QA 4BRGA 2ZF5O 4BC2A 1ESVA 4FWPA 1NMDA 5FPNA 1C0FA 4JN4A 3DXMA 4FWNA 4IJNA 4EIAA 3KZBA 2A5XA 3BEXA 3O1WA 2ASPA 1QHAA 3WQUA 5EVZA 3VEVA 3DAWA 3CETA 3DXKA 2IVNA 3VEYA 3QBXA 3IUCA 2QWMA 3BF3A 5AQKA 3I8BA 3CQXA 4IO8A 4CZKA 3CJ9A 4BR5A 2FF3B 3G25A 3HTVA 3QFUA 5BRDA 1ATNA 1NLVA 3A5OC 3DXMB 4CJ7A 2CGLA 3VEOA 4JD2A 1C0GA 3H46O 3J8AA 4QS7A 2E88A 1BU6O 4EFHA 3WQTA 2CGKA 2YJEA 1NGDA 3DXKB 3A8YA 3MMVA 3ZEUA 1NWKA 2Q0UA 3AY9A 3FZLA 3R8EA 1NGFA 2GELA 3FZHA 4CZJA 3IMXA 4EAHD 2IIRA 5AR0A 2NRHA 2P9KA 1ZXOA 5BPLA 2P9PA 4A62A 3CQYA 3BP8A 3EL2A 1V4TA 4JD2B 3W3DA 3BF1A 3VGKA 5AQRA 4Y0WA 1P8ZA 3ZX0A 1DEJA 4B1WB 1RGIA 5ADXA 3SMSA 2GTDA 4H5VA 3CI5A 3WXIA 1DGKN 2A42A 3ZEUB 1LOTB 1R59O 4BRHA 2E2NA 4CZMA 3FZFA 4I6MA 4H0XB 1T6DA 2P9NA 5CE3A 4H0YB 3L0QA 2Q36A 1X9JA 3UE5A 3GOIA 5I9EB 2P9KB 3LM9A 3JS6A 4BC5A 3D7EO 4BR4A 2Q31A 3WXLA 1IG8A 1HLUA 2YCHA 1IJJA 1U2VB 3UKUA 4H0PA 1YUWA 3DJCA 2NZTA 1XQSC 1BA1A 4B1ZA 2CH5A 4I6MB 3QBWA 4QS9A 2P9NB 3VESA 5E26A 4BRFA 4BRAA 1KXPA 3CERA 3VPZA 4A2BA 5BN8A 1E4GT 1GLLO 3CJBA 4CI6A 1KAYA 4BRIA 3O08A 4WQ5A 1KAZA 3F9MA 2QWLA 2ITMA 2ASOA 4K42A 3QMLA 2Q1NA 1DKGD 4B1VA 1NGAA 2AP1A 3UKUB 2GWKA 2FLOA 3VENA 5EX5A 1GLCG 3H3NO 3LM2A 2E20A 2W41A 5LJWA 2QWQA 5AQQA 1YXQA 4M63C 4AM7A 1CZAN 4F9OA 4CD3A 5ADXH 4BG8A 4BRCA 5AQPA 5B8HA 4RTFD 1QQNA 2E1ZA 3VEWA 3S41A 3IFRA 3CJ7A 4K25A 3ZX2A 4Z94A 4ISFA 2F9TA 3ATUA 3JXUA 2H3GX 4DB3A 1SZ2A 5BPMA 4DQ8A 2QM1A 3VOVA 4BR9A 5BR9A 3U9DA 2GWJA 5AQHA 3O8MA 4BG9A 4FO0A 4BRKA 2ZGYA 3M6GA 2A3ZA 3AAQA 1OKJA 3KHYA 4PL7A 2A6AA 1HKGA 4XEIA 4BC4A 2VCPA 2HF4A 2HOEA 2Q2RA 3ENHA 5AQLA 1BG3A 2IVOA 1YVNA 5AQXA 4B1YB 5BREA 3ATVA 5E84A 3ID8A 1YAGA 3HM8A 4AM6A 4BROA 4DHYA 5AQJA 3O80A 2UYTA 5LY3A 4CD1A 3H45C 4BR7A 1HKBA 4A2AA 4CZLA 2IVPA 4XH4A 1K8KA 3GE1A 2W40A 3GBTA 2FF6A 3CJCA 1JCEA 2P9UA 1NGEA 3VF2A 5KPTA 3SK3A 5JLHA 1Z6RA 3VGLA 2PBDA 3EKSA 3U4LA 3ULEA 2J4RA 4CZGA 3P4IA 4L3QA 1KAXA 3MDQA 4K43A 3O4WA 1E4FT 4BGAA 5AQYA 3CHWA 3VGMA 5AZIA 3W0LA 5FPDA 1XUPO 3QDKA 1TYQA 5AQNA 3U9ZA 1K8KB 4QS8A 1U2VA 3O1BA 1MA9B 1WOQA 3LDPA 2P9UB 4GY2B 2ZWHA 4KBOA 5BRFA 3WXJA 3GDQA 2E8AA 2I7PA 3ULEB 1BA0A 4H03B 3LDNA 3FR0A 1NBWA 1BO5O 4K41A 4JNEA 1NGGA 5TKYA 2QXLA 3O5BA 4H5TA 1ZC6A 2HMPA 5AZIB 3A5LC 2YHXA 5AQFA 1TYQB 4HTLA 4WQ5C 2F9WA 4FWOA 2YHWA 4CZFA 4RWTA 1H1VA 4O8KA 3EO3A 2P9LA 1ATSA 5LJVA 2ASMA 3M1FA 1HKCA 2A41A 1BDGA 4FPBA 3FLCO 2VYPA 4H0VB 3IDHA 3VEXA 5FPMA 4BVOA 3U8XA 4EHTA 4BRQA 4FPAA 3QFPA 4FL9A 1QZ6A 1QZ5A 4J8FA 4M7XA 1LCUA 2D1KA 5KQ8A 1D4XA 3MN9A 3FE1A 1J6ZA 3FZMA 2E1YA 4O5FA 4BR2A 2P9LB 5AQUA 1EQYA 2QWRA 4H5WA 2P9IA 4CBXA 3ZETA 5JLFA 4FOEA 3QICA 5FPEA 2AA4A 3MN6A 1SQKA 1NM1A 4BC3A 5EY4A 2BTFA 4YDUA 1HPMA 4FWQA 2HF3A 4CZHA 4IZ9A 3OHRA 3EKUA 2Q0RA 3H1QA 3H3OB 4FOIA 4BRDA 2P9IB 4JAXA 4EHUA 1NGCA 3LDLA 3ZX3A 2FSNA 5AQTA 3MK6A 3ZETB 1MDUB 4FWLA 4B1XB 3WEEA 3WUHA 5EXWA 2I7NA 3I33A 2V7YA 1ATRA 1X3MA 4WQ4C 3A5NC 1JCGA 3UB5A 5JMVA 5AQWA 4IWVA 3C7NA 4FSVA 1NGHA 1GLJO 2V7ZA 3ENOA 5BN9A 4ISEA 3MN7A 3WT0A 4C23A 1GLAG 2EWSA 4RCHA 3WEEB 4WQ4A 4BRMA 1S22A 5AQVA 4BQZA 1T44A 1GLFO 5EOYA 5AZJA 4PL8A 1MWMA 1HJOA 3LDOA 3C7NB 2YJFA 3CJAA 3SJHA 4WYBA 1NGJA 5AQSA 2E2PA 3H6EA 2QWPA 4BREA 1BWFO 3C0BA 1GLDG 3A5MC 2FSJA 3LL3A 1V4SA 1SAZA 4H0TB 1X3NA 3EZWA 3L6QA 3DWLA 3R9PA 3VF6A 4H5RA 3AARA 3VETA 2QW9A 1TUYA 1WUAA 5AZJB 2DPNA 3HSCA 3CIPA 4CZEA 3A0IX 3HBTA 4M7YA 5KPZA 1T6CA 1Z05A 3FGUA 2V52B 4FWKA 2GEMA 4FWRA 5AQMA 1TUUA 4IXCA 3VF4A 4BGBA 3D2FA 3BUZB 4BQLA 2YHYA 5AQGA 5AQZA 5AFUA 5KPRA 3D2EA 4ISGA 4MLEA 1S3XA 4XH5A 4GNIA 4BRLA 2FXUA 3M3ZA 2QWOA 2OANA 4NO7A 3QB0A 1NGBA 4CZIA 2D0OA 3AAPA 3SMPA 4FWMA 1HUXA 5F2RA 1XC3A 4PKIA 2Q97A 1QQMA 5AQIA 4LC9B 1QQOA 1GLEG 3MCPA 4H0OA 2P9PB 5JICA 3VEZA 4CBWA 2PAVA 4H5NA 3LDQA 2CH6A 1Q18A 3GG4A 4DCHA 3D2FB 3VERA 2V51B 4JHDA 3SLCA 2KHOA 3D2EB 2CGJA 3TPQA 3HZ6A 3L4IA 5KQDA 1BUPA 4IJAA 1ZBSA 4PKGA 5F0XA 4YDUC 1RFQA 2E2OA 3TU5A 4BVPA 2YI1A 2GUPA 3FFKB 2D0PA 2WUSA 4XH1A 3RSEA 2A40A 1HX1A 2NLXA 4B1UB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A61A 4X62K 2IAJA 2Y1JA 2BUPA 1YJWN 3UKRA 3OYIA 1LQQA 3ZCMA 5BPNA 1RBRA 4KB0A 4MDBA 4LH5A 4BR0A 5AQOA 4A59A 1T8EA 4JV5K 4FWSA 4KRFA 4EP4A 1S1UA 4FXDA 4FLVA 3AVNA 3B8AX 4HWIA 2YNGA 5IT9O 4FJNA 5J2MA 1OMYA 4UQGA 2OZSA 4CFDA 4B3SK 1BOTO 3VN5A 2MZ0A 2NUBA 4UY8O 4BC2A 2I61A 4KHWA 4JN4A 5FPNA 1C0FA 1KFDA 2IS3A 4DSEA 1YHQN 3MX5A 3HPGA 4EIAA 4IOXA 3NBPA 3U3YA 2A5XA 1S1WA 1VQ7N 2QI2A 4CEDA 3VQ7A 3VEVA 3IS9A 2IVNA 3A2FA 1NJZA 4OGEA 4KB1A 2G2KA 5AQKA 1N4NA 3CQXA 4FJGA 1YITN 4BR5A 4X64K 3HTVA 4CE9A 5CR4A 3OS1A 4I2PA 4CJ7A 2CGLA 5KGXA 4C8LA 4JI8K 2JWKA 1BU6O 2HHVA 2YNHA 3SAGA 3MMVA 4M3TA 3BK3C 2Q0UA 4E3SA 3AY9A 1NGFA 2GELA 3HPHA 4J2DA 4JKHA 4GW6A 1OH5A 5HL7L 4BECA 3CQYA 3CW4A 3OYCA 5HLFA 4CHQA 3VGKA 4Y0WA 1D8YA 1RGIA 2YEOA 1LW0A 4DF4A 3WXIA 3CI5A 1B92A 1JL1A 3K9JA 4O5BA 1DGKN 4XIUA 2A42A 4CERA 1NNEA 3K2PA 4CZMA 2KYQA 3VQAA 4F8RA 1KQSM 3CCRN 1VSEA 5T7BA 4E7HA 3UE5A 5I9EB 3P1GA 1NK8A 2QEXN 2P9KB 3BGRA 4B3RK 3LM9A 3PX6A 1B9DA 4HTUA 4BR4A 4CHOA 1RTDA 2Q31A 4NXMK 3R2VA 4AHSA 4KH6A 1IG8A 4K8XA 3UKUA 4H0PA 1YUWA 4LF6K 4FLWA 4JKAA 1RBTA 1N5YA 1BA1A 4B1ZA 2P9NB 3V9ZA 4BRFA 4CGGA 3LP3A 3O3FA 4FK2A 3VPZA 4DR5K 3ENBA 1SL1A 2VY6A 1XNRK 2Q3SA 1N33K 5C10A 4WQ5A 3VTHA 3KKRA 2NY8X 2ITMA 4LF7K 3QMLA 5HRRA 1UOCA 3C6TA 2Z1GA 2GWKA 2A7TA 5EX5A 1IKXA 1GLCG 4WF9L 3OTOK 2Z1IA 4H4MA 3HVTA 1CN2A 4DU3A 1DTTA 4M63C 4AM7A 4F9OA 1VQ6N 3N4PA 4M3WA 4XJXA 4DR4K 1NMNA 1JLGA 1O1WA 3V1OA 3VEWA 3JSMA 3EE9A 1KLMA 2OA8A 1TL3A 4ISFA 3ATUA 3AA2A 1SZ2A 4DQ8A 3KIOA 5BR9A 1IBLK 1HNIA 4DQQA 5AQHA 3O8MA 4FW2A 4LFAK 1VQON 2O8CA 1DTQA 4AHVA 1S1TA 4CJQA 3M8PA 4CCHA 1WB9A 4KH5A 3KHYA 4PL7A 2VCPA 3V9SA 2HOEA 4DTJA 5AQLA 1BG3A 3QI7A 5GINA 1NE5A 1FW6A 4WCEL 5KGWA 3J80O 2HMIA 5BREA 3KK2A 5E84A 3KOYA 3THWB 1YAGA 3HM8A 3ULDA 3TAEA 5KK4A 3LZJA 3PX4A 1YTUA 5AQJA 3AV9A 1B7DA 3O80A 3NDKA 4CD1A 3FFIA 4BR7A 3U3GA 4JS5A 4XH4A 4CK1A 3OYNA 4YOWA 2OYQA 4CJEA 2FF6A 1WN7A 2ITGA 5CY0A 2IOCA 1JCEA 2HBLA 1WSGA 1Q9XA 3U4LA 3ULEA 3LWMA 4FJKA 3OBWA 3L2QA 3KTQA 4IBNA 4CZGA 4FJIA 4UAFE 5C12A 5AQYA 3DM2A 3HSTB 3ZYYX 5FLXO 3VGMA 5AZIA 1K8AO 3HRGA 1T05A 1TYQA 2G8FA 5AQNA 4YFUA 4CJWA 3LALA 3KK7A 3AA3A 3TTCA 1WOQA 2P9UB 4IDKA 3HVRA 1EXQA 4JK8A 3WXJA 3GDQA 4IFVA 1BA0A 4H03B 3LDNA 4OKJA 3C6UA 3FR0A 1NGGA 5TKYA 4NCAA 4H5TA 4FLTA 4EZ6A 1XRSB 1KVBA 1BL3A 4FZYA 2BE2A 4DS5A 1C1BA 2WC9A 1U45A 4WQ5C 2LJMA 2F9WA 2YNFA 4LF8K 3O3HA 4CZFA 2RHKA 5I3UA 1DLOA 3V6DA 2P9LA 4PA1A 1U04A 3K5LA 1LQIA 4W5QA 4CIGA 1J9AA 1CLQA 4H0VB 4I2QA 1IO2A 1QSYA 1HQUA 1VSLA 2UXBK 4LH4A 1RDAA 3UIQA 3MAQA 2PYLA 4E7KA 4ICLA 1BCGA 4FJHA 4F2RA 2D0CA 2RE2A 3J81O 3FZMA 3CCJN 3ASMA 4O5FA 3SJJA 5AQUA 2RN2A 4MDAA 3OS0A 1EQYA 4CJTA 3MXMA 2IGIA 5CZ1A 1I3AA 4CBXA 4B08A 3MXIA 3T69A 4BACA 4CF2A 4N41A 2ASCA 2AA4A 3MN6A 1HRHA 2VG7A 4Z4FA 1NM1A 5M1FA 5EY4A 4YDUA 1HPMA 4JRPA 4V19S 1B9FA 1HNVA 4FJMA 1IKWA 3SQ2A 1VHXA 4DTNA 3H3OB 2P9IB 4JAXA 4CK3A 4B3TK 3ZETB 5AQTA 4OKEA 1EKEA 3WUHA 4BY9C 2HW3A 3K57A 5EXWA 1FKPA 4LY7A 1D5AA 5FDLA 1YJ9N 2R7YA 2V7YA 1X3MA 3EY1A 1TKXA 1D9FA 5C42A 3TWHA 1A5XA 5JMVA 3V9XA 2HVIA 1UA1A 1NGHA 4R79A 3THYA 4LSNA 1GLJO 1L3VA 4BEBA 5BN9A 1KVCA 4ISEA 3WT0A 4C23A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2FSJ A;  3LL3 A;  1V4S A;  1SAZ A;  4H0T B;  1X3N A;  3EZW A;  3L6Q A;  3DWL A;  3R9P A;  3VF6 A;  4H5R A;  3AAR A;  3VET A;  2QW9 A;  1TUY A;  1WUA A;  5AZJ B;  2DPN A;  3HSC A;  3CIP A;  4CZE A;  3A0I X;  3HBT A;  4M7Y A;  5KPZ A;  1T6C A;  1Z05 A;  3FGU A;  2V52 B;  4FWK A;  2GEM A;  4FWR A;  5AQM A;  1TUU A;  4IXC A;  3VF4 A;  4BGB A;  3D2F A;  3BUZ B;  4BQL A;  2YHY A;  5AQG A;  5AQZ A;  5AFU A;  5KPR A;  3D2E A;  4ISG A;  4MLE A;  1S3X A;  4XH5 A;  4GNI A;  4BRL A;  2FXU A;  3M3Z A;  2QWO A;  2OAN A;  4NO7 A;  3QB0 A;  1NGB A;  4CZI A;  2D0O A;  3AAP A;  3SMP A;  4FWM A;  1HUX A;  5F2R A;  1XC3 A;  4PKI A;  2Q97 A;  1QQM A;  5AQI A;  4LC9 B;  1QQO A;  1GLE G;  3MCP A;  4H0O A;  2P9P B;  5JIC A;  3VEZ A;  4CBW A;  2PAV A;  4H5N A;  3LDQ A;  2CH6 A;  1Q18 A;  3GG4 A;  4DCH A;  3D2F B;  3VER A;  2V51 B;  4JHD A;  3SLC A;  2KHO A;  3D2E B;  2CGJ A;  3TPQ A;  3HZ6 A;  3L4I A;  5KQD A;  1BUP A;  4IJA A;  1ZBS A;  4PKG A;  5F0X A;  4YDU C;  1RFQ A;  2E2O A;  3TU5 A;  4BVP A;  2YI1 A;  2GUP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4A61 A;  4X62 K;  2IAJ A;  2Y1J A;  2BUP A;  1YJW N;  3UKR A;  3OYI A;  1LQQ A;  3ZCM A;  5BPN A;  1RBR A;  4KB0 A;  4MDB A;  4LH5 A;  4BR0 A;  5AQO A;  4A59 A;  1T8E A;  4JV5 K;  4FWS A;  4KRF A;  4EP4 A;  1S1U A;  4FXD A;  4FLV A;  3AVN A;  3B8A X;  4HWI A;  2YNG A;  5IT9 O;  4FJN A;  5J2M A;  1OMY A;  4UQG A;  2OZS A;  4CFD A;  4B3S K;  1BOT O;  3VN5 A;  2MZ0 A;  2NUB A;  4UY8 O;  4BC2 A;  2I61 A;  4KHW A;  4JN4 A;  5FPN A;  1C0F A;  1KFD A;  2IS3 A;  4DSE A;  1YHQ N;  3MX5 A;  3HPG A;  4EIA A;  4IOX A;  3NBP A;  3U3Y A;  2A5X A;  1S1W A;  1VQ7 N;  2QI2 A;  4CED A;  3VQ7 A;  3VEV A;  3IS9 A;  2IVN A;  3A2F A;  1NJZ A;  4OGE A;  4KB1 A;  2G2K A;  5AQK A;  1N4N A;  3CQX A;  4FJG A;  1YIT N;  4BR5 A;  4X64 K;  3HTV A;  4CE9 A;  5CR4 A;  3OS1 A;  4I2P A;  4CJ7 A;  2CGL A;  5KGX A;  4C8L A;  4JI8 K;  2JWK A;  1BU6 O;  2HHV A;  2YNH A;  3SAG A;  3MMV A;  4M3T A;  3BK3 C;  2Q0U A;  4E3S A;  3AY9 A;  1NGF A;  2GEL A;  3HPH A;  4J2D A;  4JKH A;  4GW6 A;  1OH5 A;  5HL7 L;  4BEC A;  3CQY A;  3CW4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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