5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
5AQJA 5BPLA 2P9UA 5ADXA 5LJVA 3L6QA 2FSJA 4FWLA 2BUPA 3VGKA 2ZWHA 3ID8A 4L3QA 1HKBA 2CGLA 5ELZA 5JMVA 3S41A 5AQLA 5E84A 1RGIA 3SMSA 4WQ5A 4AM7A 1NBWA 5AQKA 2FLOA 4FWKA 2H3GX 2P9SA 2P9KA 3EN9A 3WXKA 1EQYA 2FF6A 4FWSA 2ASMA 2QWQA 1SAZA 2CH6A 2OANA 2Q0RA 2ZF5O 4CZIA 4MO5A 3D2FA 2E2PA 3BF1A 3UKRA 3EL2A 3EZWA 1ATNA 3VESA 4BROA 5AQSA 4BQLA 1Q18A 1LOTB 3KHYA 3FR0A 4FWQA 3W3DA 3EO3A 3QMLA 3CQYA 4PKGA 1X3NA 5EVZA 3WXIA 3C7NB 4BGBA 4BR2A 4CZLA 3ULEA 1ATRA 3GOIA 4FOIA 4PKHA 4HTLA 3WT0A 4K43A 2V7ZA 3SMPA 1ESVA 2GWKA 2P9LA 3CJ7A 4K41A 4H5TA 5TKYA 1GLJO 4CBWA 2QWOA 3FLCO 3O4WA 3MK6A 5B8HA 1KAZA 5AFUA 3ZETA 4FWRA 3WEEA 1S3XA 4MLEA 1K8KB 3VEVA 3FZFA 4K42A 2EWSA 4BVPA 3MN7A 4NB4A 2QWRA 4O8KA 4BRLA 3FGUA 1WUAA 1ZXOA 4Z94A 1QQMA 3CERA 4BR7A 4B1WB 3CETA 2Q97A 1KAXA 1QHAA 1IJJA 3CJ9A 3WXJA 3A5NC 2QWPA 5AQQA 4DCHA 3LM9A 1T44A 4BRKA 3L4IA 3LL3A 1T6DA 3R8EA 5LJWA 3QICA 2QWNA 3SK3A 3P4IA 1Z6RA 2CGJA 4FWPA 3B8AX 3F9MA 1GLFO 2E8AA 4BGAA 4RWTA 1NGGA 2HOEA 3QFUA 1H1VA 3U9DA 2GWJA 3WUHA 5LY3A 4B1UB 2V51B 1HX1A 5BR9A 3O5BA 3QBXA 3C0BA 5KQ8A 1V4TA 4FOEA 3HTVA 1NLVA 4BRPA 3UKUB 3IDHA 3DXMA 3AAQA 3RSEB 4ISEA 3WEEB 4I6MA 1NGHA 4BRIA 1NWKA 1DGKN 5BRHA 4QS9A 4JHDA 2HF4A 1XQSC 3VF6A 4C23A 2W41A 1KAYA 5BN8A 3C7NA 3BEXA 2GELA 2IVOA 3H45C 4H0OA 4M7YA 3UE5A 3I8BA 1DEJA 1BA1A 4B1VA 3KVGA 2F9WA 2PAVA 1ZC6A 4IXCA 2DPNA 2D1KA 1TYQB 4WQ4A 5AQZA 5AQIA 1K8KA 5FPNA 4B1YB 3QBWA 4M63C 1BWFO 3H3NO 3GBTA 3U9ZA 2QWMA 4CBUA 1GLDG 4FO0A 5JLFA 5BPNA 5AQHA 3HSCA 5EOYA 4CD3A 1GLCG 3DWLA 3ATVA 3BUZB 3BP8A 4BRDA 1TUYA 4BRAA 3ATUA 3LM2A 5AZJB 2IIRA 3VF4A 4BC3A 4BRGA 2P9PB 4BR0A 3ZX2A 3DXMB 3H3OB 3HZ6A 4I6MB 5AQUA 1C0GA 3QFPA 2A5XA 1C0FA 1RFQA 3J8AA 4BC5A 5AQWA 4JHDB 3VEXA 2HF3A 3VERA 2YI1A 1LCUA 1NGIA 3AAPA 2FF3B 4KBOA 4FSVA 5F1XA 2BTFA 3VEZA 5KQDA 1XC3A 1YUWA 1HKCA 1E4FT 2D4WA 2E2QA 1NGEA 3CJCA 1NGAA 2Q2RA 3O6WA 3FFKB 3VEYA 5AZIB 4CZHA 4H0TB 3UKUA 2D0OA 2QWLA 3RSEA 1GLAG 3VEOA 3SJHA 2IVPA 3GL1A 2YJEA 5F2RA 5JICA 2NRHA 4BG9A 3CJ1A 4H0YB 5F0XA 4EIAA 2FSNA 1U6ZA 2IVNA 2P9NB 4PKIA 4A62A 4GNIA 2V7YA 4BRNA 1BO5O 2E1YA 3UB5A 1DKGD 3KZBA 4JD2B 3VPZA 4H5NA 5FPDA 1NGFA 4BR9A 5BREA 1R59O 3R9PA 1NMDA 3H1VX 1HPMA 4JAXA 5E26A 2GEMA 1TYQA 5ADXH 1BA0A 2E1ZA 1Y64A 1NGJA 1IG8A 2YJFA 4QS7A 4RCHA 5CE3A 4CZEA 1QZ6A 3GG4A 2PBDA 3H46O 3QB0A 3VF2A 1ATSA 4B1XB 3FZMA 4BC2A 4H03B 1J6ZA 2E20A 1WOQA 3WQUA 3ZEUB 3ZX3A 5AQPA 3DAWA 4J8FA 4O5FA 3LDPA 4IJNA 5AZJA 3VEWA 3VGLA 2W40A 4Y0WA 2YHXA 4A61A 2P9PA 3A5OC 4BRCA 2WUSA 5BPMA 4CJ7A 4XH4A 5BN9A 3TU5A 4QS8A 4H0PA 1MA9B 2A40A 2E2NA 1X3MA 4BRMA 4PL7A 1E4GT 5EXWA 3TPQA 3AARA 2F9TA 5AQGA 2E2OA 4MO4A 4DB3A 2Q1NA 1YXQA 3A5MC 5AQOA 5AQTA 1HUXA 3I33A 1GLLO 4JNEA 5AZIA 3EKSA 4A2BA 4WQ5C 3VGMA 2E88A 2QW9A 3A8YA 4CZMA 2YHWA 2A41A 3FZHA 4BQZA 3OHRA 3WXLA 4BRQA 4FWNA 2V52B 5AQNA 1BOTO 5AFUH 4IWVA 2QXLA 4PL8A 2A42A 3VENA 5BRFA 2P9NA 2AP1A 4GY2B 3MDQA 2ASPA 5AQMA 1T6CA 2AA4A 1QQNA 4CZJA 1BG3A 1QZ5A 5FPEA 2P9IB 4DHYA 4K25A 2I7PA 4EHUA 2NLXA 5KPRA 4WYBA 1GLEG 4JD2A 1G99A 1JCEA 4BRHA 2Q31A 4AM6A 1NGCA 1HKGA 3HI0A 3A5LC 1ZBSA 3R6MA 2ITMA 3GDQA 4H5VA 3CQXA 3O80A 3H6EA 2KHOA 4FL9A 4EAHD 4EHTA 4BG8A 1BUPA 1Z05A 1QQOA 3WQTA 1SZ2A 1YAGA 4RTFD 2D0PA 2ZGYA 5KPTA 4XEIA 1CZAN 5AQYA 2UYTA 3D2EB 1S22A 3DJCA 3U4LA 4BREA 1NGBA 5AQFA 3ZEUA 1D4XA 2FSKA 4CZFA 4B1ZA 4IZ9A 4CD1A 1U2VB 1V4SA 1JCGA 1TUUA 1JCFA 3U8XA 4DQ8A 3AY9A 3CJBA 3LDLA 5AQVA 3HBTA 2J4RA 1OKJA 3FZKA 3CIPA 3DXKB 2Q0UA 3CI5A 4ISGA 3MMVA 5JLHA 3O08A 2CGKA 1BDGA 2P9UB 3M1FA 3MN5A 4JN4A 1YVNA 3O1WA 3IUCA 4BC4A 3VETA 2QM1A 2NZTA 4BRFA 3ZX0A 1MDUB 1X9JA 4FWMA 2ZGZA 4IJAA 3GE1A 3MN9A 3JXUA 3G25A 3JS6A 2ASOA 4EFHA 3FZLA 4XH5A 4H5RA 3CHWA 1BU6O 5AR0A 4ISFA 3LDQA 2P9SB 4HWIA 2P9KB 3QDKA 2YHYA 4E1JA 4CBXA 2P9IA 5KPZA 1NM1A 1NGDA 4FPAA 5I9EB 4BR5A 3D2FB 3UKRB 4H0VB 4H0XB 2VYPA 4CZGA 1MWMA 3CJAA 4YDUC 3M3ZA 2YCHA 2A6AA 1KXPA 4FPBA 2VCPA 4F9OA 4XH1A 4LC9B 4FWOA 3L0QA 4BR4A 1P8ZA 5FPMA 3IMXA 3SLCA 1HJOA 3ULEB 5EX5A 3D7EO 3W0LA 4NO7A 5EY4A 4WQ4C 3LDNA 3D2EA 2P9LB 3O1BA 4MLHA 2I7NA 4H5WA 2HMPA 4CI6A 4M7XA 3MN6A 3MCPA 4B9QA 1XUPO 3FE1A 5AQRA 1U2VA 2GTDA 3ENOA 3H1QA 5AQXA 3ZETB 4CZKA 4A2AA 5BRDA 3HM8A 3VOVA 3M6GA 2CH5A 3IFRA 1MWKA 2A3ZA 1RDWX 3LDOA 2GUPA 4IO8A 3O8MA 3DXKA 4YDUA 2Q36A 3EKUA 4BVOA 2FXUA 3BF3A 1HLUA 3ENHA 1GLBG 3A0IX 1SQKA 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NI 5BPLA 3OA9A 1JXEA 4FJLA 4QCLA 3SUQA 2YX6A 3F9KA 3OYIA 1RT2A 1NK4A 4ID1A 1X9SA 4JI3K 3DRSA 1U4BA 4E1MA 1GOAA 1BCMA 3J81O 4FJMA 1HYSA 1LWFA 5J2PA 4KHPK 2BGGA 1NBWA 2FLOA 4HHTA 1VQ9N 1IBMK 4R5PA 3KK2A 3TTDA 4I2QA 4FWSA 1GOCA 1YJ9N 2OANA 1KC8O 4LSLA 4GKKK 2VY6A 2E2PA 3BF1A 4FLVA 3UKRA 2G8UA 2HNZA 1ATNA 4BROA 3S5TA 1TKXA 3NBPA 1VQMN 3KHYA 4FVMA 3FR0A 3CQYA 3WXIA 1LV5A 2HSTA 3C7NB 4CZLA 1C0TA 3ULEA 4PKHA 3WT0A 3LALA 2P9LA 4B9MA 3E7RL 4K41A 3QEPA 3LAMA 1VRTA 3O4WA 3OYLA 4UAEF 1O1WA 1OMYA 1BGXT 2KBHA 4HUEA 4A59A 3OVNA 3VEVA 4KHNA 5T7BA 4BVPA 4NB4A 4BRLA 1OH8A 3NFAA 3LANA 2HHUA 3FGUA 1JXBA 4IFYA 2HHWA 1VSDA 1ZXOA 1K9MO 1U45A 4B1WB 2GX9A 1ITGA 2HBMA 3CJ9A 3WXJA 4BEBA 5AJ3K 5C0YA 2QWPA 2W6LA 2KBJA 3SQ4A 2D5RA 2E3FA 3MXJA 4B8CA 1T6DA 3R8EA 5FDLA 2LI7A 4DV1K 5LJWA 4Y1CA 2QWNA 3SK3A 3CC2N 2F4VK 1KQSM 3B8AX 3THWB 1GLFO 2E8AA 3C6TA 4BWJA 1NGGA 1T7AA 4BGAA 1H1VA 5CYQA 1OH7A 1HX1A 1I2VA 1ASVA 2UXDK 3O5BA 1Q86O 2WOMA 3RMBA 2E6MA 3QNNA 5KQ8A 4DSJA 4WFAL 4FOEA 4X66K 3HTVA 3QINA 1NLVA 4B9SA 1FKPA 1TK8A 1VQ5N 1S1VA 4LF6K 3DXMA 4M3RA 1NWKA 1W2BM 3PO5A 3HOSA 4M3ZA 4JHDA 4E1NA 5KRTA 4C23A 4ILGB 1YT3A 5LL6Z 3BEXA 2IVOA 3C95A 4YORA 4M7YA 1QVFM 3UE5A 4OPHA 3QEXA 4PA1A 4FZYA 4KTZA 1HR0K 4FJXA 4LF7K 5GAEP 4EP4A 1MR4A 3DRRA 4IXCA 2DPNA 1TYQB 1NKBA 5AQZA 1K8KA 2P51A 4B1YB 3VQ4A 3B6PA 4M63C 4JI1K 3WXMB 2HHSA 2PYLA 4DQIA 3K57A 3DLEA 2QWMA 5JLFA 5BPNA 4X62K 1X1PA 1PE4A 3HSCA 4JI5K 4H4MA 3TAQA 4NXMK 2WTUA 4BRDA 3P1GA 3LM2A 3UIQA 1NRAA 4GW6A 5C12A 2LSNA 3G10A 4CJVA 3I0SA 3ZX2A 3SQ1A 2DTUA 2NUBA 1TK5A 1C0GA 1WMTA 1WB9A 1K6YA 4I9QA 2GMOA 2O8FB 3VERA 2WC9A 3AAPA 2FF3B 3LWLA 2I5JA 3HOTA 4CVNE 2SN3A 3WNEA 5M1PA 1S1XA 3I8DA 3ZLJA 3IG1A 1AYJA 2YNHA 4B3RK 3AV9A 1NGEA 4CJFA 1NGAA 2Q2RA 1Q9XA 3UKUA 3RSEA 3G4SN 2G8WA 3E9PA 3GL1A 4DSLA 2YJEA 1SNBA 1C0MA 5F2RA 3ITHA 3L3VA 5J2NA 4FW1A 4H0YB 4A62A 3KOWA 4IEIA 4CEQA 3HJFA 3QETA 3PV8A 2KLAA 1DKGD 4DV0K 5JVHL 4H5NA 1NGFA 4BR9A 3T1AA 3R9PA 4N56A 1WBDA 4E89A 1HPMA 2RN2A 4CK1A 4L8RB 2X78A 3ZT4A 2DY4A 3ASMA 2W6KA 2IC3A 4CEEA 1GOBA 4CZEA 3GG4A 3QB0A 4B1XB 3C6AA 3PSIA 1A5VA 2RHKA 2ATBA 4NLBA 4E0DA 4NCBA 4DR4K 3RR8A 2E20A 2G8VA 3ZX3A 2G2KA 2VGMA 3ZT1A 1NNEA 1VSHA 2YHXA 3NCIA 4BRCA 1PX9A 2WUSA 4C8NA 4K8XA 4DS5A 2XO7A 4XH4A 1K8BA 1VSLA 5GIOA 4LF5K 3TPQA 1WSFA 2HBLA 3OYMA 4NYNA 1T03A 4JKBA 2E2OA 4KPYA 1BL3A 3CFRA 1J53A 4CJEA 4DB3A 1YXQA 3K0SA 1VQKN 1L3UA 4JI7K 3PX4A 3A5MC 4FK4A 3AVNA 2D0CA 1IG9A 5CY4A 3CQ8A 1W97L 4WQ5C 3VGMA 2E88A 4JI2K 2VG5A 3KK7A 2A41A 5J1EA 1UA1A 1ZBHA 1HMVA 2QK9A 2V52B 5AQNA 2YEOA 5AFUH 3CYMA 2QXLA 2HMIA 1BCOA 3P31A 4CJWA 4DQSA 1HNVA 1KV0A 2ASPA 5AQMA 3KOYA 4AHUA 2AA4A 1QZ5A 3BZCA 5FPEA 4DHYA 2LJMA 1NJZA 1NE5A 1B9FA 4NCGA 1LAVA 4DTSA 2PYJA 4FM1A 4AM6A 3TTCA 1HKGA 3ZT0A 1JKHA 1CN2A 2RKIA 3HI0A 3LPTA 3A5LC 4J2EA 1LQHA 3AVMA 4H5VA 2ITMA 5CZ2A 3H6EA 3VQ8A 3KTQA 3MX5A 2D0BA 1YAGA 2YILA 2D0PA 5KPTA 3I56N 3CCRN 2OPQA 1CZAN 4BREA 2HW3A 1EWQA 5AQFA 5M1QA 3ZEUA 3TI0A 2FSKA 4M45A 4HUFA 4FJ8A 4B1ZA 2F8TA 1U2VB 1V4SA 4DV5K 3HYFA 4YOTA 3M8PA 4JI0K 1ICAA 4M3YA 2W00A 4DQ8A 3AY9A 1NK0A 3M8RA 3HBTA 1VAZA 2N2RA 2UUCK 3FZKA 3MEEA 4FJKA 4KHSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4C1N I;  5BPL A;  3OA9 A;  1JXE A;  4FJL A;  4QCL A;  3SUQ A;  2YX6 A;  3F9K A;  3OYI A;  1RT2 A;  1NK4 A;  4ID1 A;  1X9S A;  4JI3 K;  3DRS A;  1U4B A;  4E1M A;  1GOA A;  1BCM A;  3J81 O;  4FJM A;  1HYS A;  1LWF A;  5J2P A;  4KHP K;  2BGG A;  1NBW A;  2FLO A;  4HHT A;  1VQ9 N;  1IBM K;  4R5P A;  3KK2 A;  3TTD A;  4I2Q A;  4FWS A;  1GOC A;  1YJ9 N;  2OAN A;  1KC8 O;  4LSL A;  4GKK K;  2VY6 A;  2E2P A;  3BF1 A;  4FLV A;  3UKR A;  2G8U A;  2HNZ A;  1ATN A;  4BRO A;  3S5T A;  1TKX A;  3NBP A;  1VQM N;  3KHY A;  4FVM A;  3FR0 A;  3CQY A;  3WXI A;  1LV5 A;  2HST A;  3C7N B;  4CZL A;  1C0T A;  3ULE A;  4PKH A;  3WT0 A;  3LAL A;  2P9L A;  4B9M A;  3E7R L;  4K41 A;  3QEP A;  3LAM A;  1VRT A;  3O4W A;  3OYL A;  4UAE F;  1O1W A;  1OMY A;  1BGX T;  2KBH A;  4HUE A;  4A59 A;  3OVN A;  3VEV A;  4KHN A;  5T7B A;  4BVP A;  4NB4 A;  4BRL A;  1OH8 A;  3NFA A;  3LAN A;  2HHU A;  3FGU A;  1JXB A;  4IFY A;  2HHW A;  1VSD A;  1ZXO A;  1K9M O;  1U45 A;  4B1W B;  2GX9 A;  1ITG A;  2HBM A;  3CJ9 A;  3WXJ A;  4BEB A; 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