3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
5AQSA 3CIPA 4WQ4A 1BA1A 3AAPA 1Y64A 2P9KB 4DHYA 4K41A 4BVOA 1U2VB 3QFUA 1EQYA 2VWBA 3ENHA 3HTVA 4AM7A 1NGJA 3VF4A 1LCUA 4BRMA 3H45C 1T6DA 3CJAA 2QWOA 2GTDA 2P9KA 1BOTO 5BPNA 3ULEB 4J8FA 4I6MB 3M3ZA 3HI0A 5AQJA 2D1KA 5KPZA 3AY9A 1U2VA 4BRCA 1XQSC 3ENOA 3R9PA 1KAXA 5AQIA 4PKIA 3ULEA 4I6MA 1Z6RA 4BGBA 1NGFA 4JNEA 3A5NC 4CBUA 3DWLA 4MLHA 3BP8A 4BRDA 4K25A 2I7NA 1NGEA 3G25A 4CZJA 4B1VA 3B8AX 1Z05A 2YHXA 4JHDB 1K8KB 5AQOA 4BRIA 3KVGA 4XEIA 4BRLA 3QFPA 3R8EA 1GLBG 1KAYA 3ZEUB 4IJAA 2KHOA 2FXUA 2IVPA 4FWNA 2E2OA 4JN4A 2D4WA 3LDLA 4CD1A 4JHDA 2D0PA 4M7XA 1K8KA 3VGKA 4HWIA 3MMVA 1DEJA 1NGBA 3QBWA 1X3MA 5AQVA 3EKSA 3ZEUA 2V52B 3CHWA 4FO0A 3SK3A 3MK6A 2A41A 4BR0A 2ZGZA 2PBDA 4YDUC 4IXCA 3U8XA 4EFHA 3R6MA 5FPDA 3A8YA 3CETA 1Q18A 2WUSA 2V51B 2CH5A 3VEWA 2EWSA 2P9LB 2VYPA 1KAZA 5AQHA 2GWKA 5KQ8A 5JMVA 3FLCO 3VF6A 1QQOA 1T44A 4K42A 3HZ6A 3D2FB 4FWMA 3QDKA 1IJJA 2P9LA 4BC3A 4CI6A 2HMPA 4QS8A 1E4GT 3WQUA 1SQKA 5F2RA 3H1VX 4EHTA 4H5VA 3D2FA 3FZHA 4EIAA 4BQLA 3FFKB 4QS7A 2I7PA 5AQXA 2Q0RA 3C0BA 4FWOA 4B1WB 2QWMA 1YVNA 1QZ5A 4O5FA 3U9DA 2IVOA 2V7ZA 1NBWA 4HTLA 1HKGA 2E8AA 3EKUA 1NGAA 1MWKA 3FE1A 3LDOA 1R59O 3KHYA 3WUHA 3IFRA 3FZLA 4H0TB 4BC5A 3CERA 2ZF5O 2A3ZA 3GL1A 5EY4A 3EO3A 2DPNA 5I9EB 5BRHA 2AA4A 3AAQA 2YJFA 2YHYA 3DAWA 3CI5A 4NB4A 1IG8A 3L6QA 3CQXA 5AR0A 1NM1A 2H3GX 4BREA 2NRHA 3QICA 2E1ZA 3VETA 4AM6A 3L4IA 5ADXA 5JLHA 3VF2A 1BO5O 5FPMA 3BF3A 5AQLA 3I8BA 2VCPA 1QQMA 3MCPA 1ESVA 3H3OB 4BRPA 3A5LC 2CH6A 1QQNA 2P9UB 5CE3A 2W41A 2E88A 3O08A 4H5TA 1RDWX 3LM9A 1KXPA 4H0XB 1S22A 4JAXA 4O8KA 4XH1A 5ELZA 2ASMA 1BA0A 3BEXA 3CJCA 2P9UA 2QWPA 4FPAA 1NGCA 3QMLA 1ZC6A 4H0YB 4H0VB 1NLVA 1CZAN 4EHUA 1S3XA 5BREA 4FSVA 5FPEA 3O8MA 1X9JA 2YHWA 4M63C 5JICA 2NLXA 3H6EA 1JCGA 5BN9A 4EAHD 1BWFO 4MLEA 3ZX2A 4KBOA 5B8HA 2FF6A 1H1VA 2UYTA 1HKCA 4BVPA 1ATSA 5AQUA 4XH4A 3HM8A 2QWRA 4CZLA 1XC3A 1BG3A 4FL9A 1WOQA 3HSCA 4A61A 3VEVA 3GOIA 3LL3A 3LM2A 2PAVA 5AZJB 3WXJA 5TKYA 3HBTA 5ADXH 4M7YA 2CGKA 4IJNA 3UKRB 4IZ9A 2A6AA 4BR7A 5JLFA 5LY3A 4FPBA 4Y0WA 3BUZB 4C23A 2YCHA 4BRQA 2QWLA 1E4FT 3WXLA 5AZJA 5AQFA 3EL2A 1GLDG 3LDPA 1NGHA 3A5OC 2GUPA 4CZHA 1BDGA 3UKRA 2A5XA 5AQMA 4WYBA 4BR4A 4GNIA 2QM1A 3U4LA 3FR0A 1P8ZA 4B9QA 4CZMA 4BRNA 5BRFA 1NGGA 3I33A 4ISFA 1DGKN 3JXUA 3QB0A 3P4IA 3O80A 4FWRA 3QBXA 2W40A 2P9IB 5LJWA 3TU5A 5BN8A 3GE1A 4BRHA 3WT0A 3OHRA 4BR2A 2FF3B 4BG9A 5BRDA 3D2EB 5E26A 2GEMA 3O4WA 2P9IA 4H03B 4WQ5A 2ASOA 2IIRA 3W0LA 3BF1A 3D2EA 3VGLA 3IDHA 1ZBSA 1D4XA 1QZ6A 3ZX0A 5KPRA 5AQTA 4FOIA 1MDUB 5FPNA 3O1WA 5KQDA 2Q1NA 5BPLA 2HOEA 4PL8A 2F9WA 1X3NA 5E84A 3VENA 4BC4A 4FWSA 3A0IX 3O1BA 4CZEA 5EVZA 2NZTA 3TPQA 4PL7A 4K43A 4RWTA 3VGMA 5AQNA 1C0GA 4BQZA 4ISEA 4WQ4C 1RGIA 3CJBA 4H0PA 2ITMA 3LDQA 4IO8A 2FLOA 2QWQA 1GLLO 3VESA 4A62A 4BR5A 5KPTA 3VOVA 2D0OA 1ATNA 2Q2RA 4CD3A 4A2AA 3M6GA 1NGDA 4L3QA 3UKUB 2QXLA 3ZETB 4FWQA 5AQPA 3IUCA 4BGAA 3RSEB 2E2NA 4CBXA 1WUAA 3WQTA 3C7NB 1C0FA 4FWPA 3UB5A 4BRAA 2E2PA 4A2BA 2CGJA 1HJOA 2V7YA 5EX5A 3UKUA 1NMDA 3ZETA 2CGLA 3EZWA 4BR9A 3MN5A 4JD2B 4PKGA 1HX1A 3RSEA 3H3NO 3S41A 2YI1A 4CBWA 2FSJA 2P9SB 2IVNA 3C7NA 2E2QA 3ATVA 5EXWA 5AFUH 4BRGA 1YAGA 2FSKA 5AQQA 3FZFA 2AP1A 1BUPA 2YJEA 4JD2A 2J4RA 2A42A 2P9SA 3U9ZA 3H46O 2ASPA 4H0OA 1V4TA 1TYQB 4Z94A 1JCFA 3CQYA 4H5WA 5BPMA 3L0QA 1GLEG 4BROA 3MN7A 3CJ7A 4ISGA 2GELA 2QW9A 1NWKA 5AQGA 3WXIA 3D7EO 1GLAG 5AQYA 2Q36A 4E1JA 2BTFA 3SMPA 3M1FA 3VEZA 1TYQA 4MO4A 3W3DA 1SZ2A 4B1XB 5BR9A 2HF4A 2ZWHA 4FOEA 5AQZA 2Q0UA 1GLJO 1YUWA 2BUPA 1LOTB 2F9TA 4QS9A 1J6ZA 3ZX3A 1T6CA 2GWJA 4B1YB 4DB3A 3DXKB 3ATUA 3CJ9A 5LJVA 3SLCA 1HUXA 4LC9B 1G99A 2ZGYA 1JCEA 4RTFD 1MA9B 4BC2A 1DKGD 3J8AA 3LDNA 4YDUA 4CJ7A 3DXMB 1ZXOA 1BU6O 3SMSA 3O6WA 3WEEB 5F1XA 4BRFA 3DXKA 2P9NB 4FWLA 2QWNA 4NO7A 3VERA 4BRKA 4CZKA 2E20A 3DXMA 3FGUA 4CZFA 3WEEA 3DJCA 4WQ5C 1GLFO 4MO5A 5F0XA 1TUUA 1XUPO 1YXQA 2P9NA 2Q31A 4H5RA 4XH5A 3VEXA 3H1QA 3FZKA 3A5MC 4B1ZA 1HPMA 4CZGA 3KZBA 3GG4A 2FSNA 1U6ZA 3CJ1A 3MN6A 5AQKA 2A40A 3ID8A 3O5BA 3SJHA 3VPZA 4F9OA 3GDQA 2HF3A 4PKHA 4RCHA 3JS6A 5AFUA 2E1YA 2P9PB 3VEOA 3EN9A 1SAZA 3MN9A 3IMXA 1OKJA 1NGIA 3WXKA 4H5NA 1QHAA 1GLCG 1HLUA 4BG8A 1ATRA 1RFQA 2Q97A 3VEYA 5AZIB 2P9PA 5EOYA 2OANA 4DQ8A 3F9MA 4B1UB 4DCHA 3GBTA 3MDQA 5AQRA 3UE5A 3FZMA 1TUYA 3AARA 4IWVA 4GY2B 4CZIA 5AQWA 1V4SA 5AZIA 1MWMA 4FWKA 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQSA 4CF8A 3THWB 4LH5A 4WQ4A 1QS4A 4Z0UA 1ZYQA 1VSHA 4K41A 4BVOA 1WT7A 2G8KA 3DOKA 2VWBA 3QFUA 3ENHA 3VF4A 1D5AA 4BE1A 4Z4EA 1X9MA 3M3ZA 2PFUA 1UA0A 1BL3A 5D3GA 3HSTB 1T7EA 5T7BA 3P31A 4B08A 1D8YA 5JS2A 3Q7CA 4BGBA 1NGFA 4JNEA 4MLHA 4BRDA 5GINA 4W5OA 3G25A 4WCEL 4AB0A 4CZJA 4B1VA 4CJTA 3AO5A 1TK8A 2YHXA 1VK0A 3S3OA 2IS3A 4CHQA 2UUAK 2O8DA 3KLIA 5AQOA 3CYGA 2DFFA 1LWFA 4XEIA 4BRLA 4CECA 1BCMA 1GLBG 4FW1A 1KAYA 4FLVA 4FJ7A 1NH5A 4PUOA 2FXUA 2IVPA 3MX5A 4JN4A 2A1SA 2D0PA 3DLKA 1K8KA 4M7XA 3ITHA 4KHWA 4KB0A 1TV6A 2JWKA 1DEJA 1NGBA 1TVRA 1X3MA 3ZEUA 4CHPA 3CHWA 3SYZA 5JVGL 3F73A 2ZGZA 4FJKA 3U8XA 4EFHA 3R6MA 5FPDA 4IFEA 3OYLA 3PX0A 1Q18A 2DTUA 4QOZB 4QCLA 2NRTA 2EWSA 2RHKA 3KLEA 4QAGA 5KGWA 3FLCO 3VF6A 3AVMA 3SBTA 2F4VK 1T44A 1C1BA 1SV5A 1IJJA 4CI6A 3ALYA 2HHIA 5C25A 1NU0A 1CZ9A 3ZT0A 1PE4A 4IEEA 4DMNA 2RN2A 3D2FA 4W5NA 2X6NA 4FWOA 3L2QA 4B1WB 1X9SA 4GV6A 1YVNA 1QSYA 3U9DA 3V1OA 4B9UA 1BIUA 4HTLA 3DRRA 3MX2A 3HK2A 3V9ZA 3ZSXA 4E89A 1NGAA 1MWKA 3EZ5A 3FFIA 1VQON 3MXJA 1R59O 3KHYA 3IFRA 3KJVA 3OVNA 3FZLA 1IKVA 2W6LA 4DLEA 3S3MA 1I6FA 1Q8IA 2UXCK 5BRHA 1LW2A 4NB4A 1OVYA 1IG8A 3THYB 3CQXA 2H3GX 1UOCA 1NG9A 1YIJN 5ADXA 4U7BA 5AQLA 1FKPA 2VG7A 3DLGA 4GMJB 4CJ4A 3V4IA 2G8HA 4H4OA 1QQMA 1OH6A 1SL0A 2K35A 2CH6A 1M1KO 5CE3A 3TSUA 3O08A 2N66A 4Z4CA 3SQ0A 4YOYA 4JK7A 3E9LA 4H0XB 4PA1A 1S22A 1W0HA 3L3VA 4LF7K 3LPUA 1BA0A 2WONA 4JKDA 4IOXA 1NGCA 1JKHA 1ZC6A 3NF9A 1UAXA 5BREA 4FSVA 4R79A 5FPEA 3O8MA 1X9JA 2YHWA 2NLXA 3ISNC 2D0AA 1JCGA 1PX9A 3ZX2A 4JI8K 2FF6A 3OJUA 1A5WA 4RG8A 5AJ3K 2XO7A 1SN1A 5AQUA 3HM8A 1XC3A 1WOQA 3AA2A 4A61A 3VEVA 3GOIA 1NJZA 2PAVA 2X74A 2HW3A 4CEOA 2UUBK 2P5GA 5ADXH 1KFDA 3CM6A 1J9AA 2HHVA 4JS4A 4CFDA 5LY3A 2HBLA 4C23A 4BRQA 2KFZA 1E4FT 2WC9A 3SQ2A 5AZJA 3SUQA 4OKKA 3BDPA 2EHGA 1K8BA 4KHSA 2KBJA 2YNGA 4M42A 3PX6A 3UKRA 5SWMA 5AQMA 4CGHA 4BR4A 3TWHA 4GNIA 4LF8K 3OYKA 4BRNA 5HOOA 1RBRA 3NMUA 1HJRA 3QB0A 4E7LA 4DQRA 3O80A 2NY8X 4FWRA 3V9WA 2W40A 2P9IB 5LJWA 2LY5A 3QLHA 3GE1A 3NDKA 1SKRA 3CQ8A 3THXB 1KRPA 1WWNA 5E26A 2GEMA 3RR7A 4H03B 1ICAA 1B3CA 4NCGA 4Q0BA 5GAGP 4K0KK 3OS2A 2OTJN 3HO1A 3P39A 3D2EA 3B6OA 1ZBSA 4BACA 4FJHA 1QZ6A 4NXNK 1EP4A 1MDUB 5FPNA 4GV9A 1HNXK 4O5BA 4FZXC 3NF8A 4IG0A 4YFUA 3HRGA 1RT4A 4B9SA 2F9WA 3OY9A 2HVHA 3A0IX 3O1BA 4J2BA 1T0ZA 4PL7A 4K43A 1ZBIA 4BQZA 5LL6Z 1KLNA 1VQ8N 2O8EB 2NRZA 4JI2K 4CFAA 1DTTA 4DQQA 1ITGA 2BH1A 3HP6A 4CQKA 1TKXA 1GLLO 5EU7A 4W5TA 4DR6K 1NKCA 2QKBA 5M1QA 1ATNA 2O8CB 4BY9C 1C0UA 2R7YA 1HQEA 2Q2RA 3SCXA 4ILHA 4AHSA 5A2QO 3I55N 3PX4A 3M6GA 3UKUB 1YJNN 1QSSA 3IS9A 3RTVA 2WOMA 4FWQA 5C0YA 3IUCA 2NUBA 3RMAA 3V9UA 2YBRC 5KI6A 2E2NA 1WUAA 3C7NB 2QTDA 3HPGA 4HVJA 3UB5A 4BRAA 1UA1A 1NK6A 4F2RA 3ZT4A 2KTQA 1HJOA 5EX5A 2FBXA 1NK7A 1NMDA 3ZETA 3SJJA 1VQNN 3RSEA 4FLUA 2YI1A 3RWUA 4CBWA 1I94K 1RDBA 4DV1K 4BRGA 3QIPA 2FSKA 4YOXA 1FXXA 2LKBA 2Q3SA 1HQUA 3HOSA 3L4QA 4NLCA 2J4RA 2P9SA 3LP3A 2HNZA 4JEPA 1V4TA 4Z94A 4W5RA 4DR1K 4FLYA 4DF8A 3O4QA 4H5WA 1GLEG 2GELA 3OYBA 3MECA 1CXQA 4JKGA 5DM7L 1K9MO 4DV5K 3AO3A 2QA4N 3OYCA 4C8KA 1RDAA 3ZCMA 1CZBA 3W3DA 1SZ2A 4B1XB 1NJWA 3RVCA 3WXMB 4NYFA 4Y1CA 4FOEA 4MDAA 4DTNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AQS A;  4CF8 A;  3THW B;  4LH5 A;  4WQ4 A;  1QS4 A;  4Z0U A;  1ZYQ A;  1VSH A;  4K41 A;  4BVO A;  1WT7 A;  2G8K A;  3DOK A;  2VWB A;  3QFU A;  3ENH A;  3VF4 A;  1D5A A;  4BE1 A;  4Z4E A;  1X9M A;  3M3Z A;  2PFU A;  1UA0 A;  1BL3 A;  5D3G A;  3HST B;  1T7E A;  5T7B A;  3P31 A;  4B08 A;  1D8Y A;  5JS2 A;  3Q7C A;  4BGB A;  1NGF A;  4JNE A;  4MLH A;  4BRD A;  5GIN A;  4W5O A;  3G25 A;  4WCE L;  4AB0 A;  4CZJ A;  4B1V A;  4CJT A;  3AO5 A;  1TK8 A;  2YHX A;  1VK0 A;  3S3O A;  2IS3 A;  4CHQ A;  2UUA K;  2O8D A;  3KLI A;  5AQO A;  3CYG A;  2DFF A;  1LWF A;  4XEI A;  4BRL A;  4CEC A;  1BCM A;  1GLB G;  4FW1 A;  1KAY A;  4FLV A;  4FJ7 A;  1NH5 A;  4PUO A;  2FXU A;  2IVP A;  3MX5 A;  4JN4 A;  2A1S A;  2D0P A;  3DLK A;  1K8K A;  4M7X A;  3ITH A;  4KHW A;  4KB0 A;  1TV6 A;  2JWK A;  1DEJ A;  1NGB A;  1TVR A;  1X3M A;  3ZEU A;  4CHP A;  3CHW A;  3SYZ A;  5JVG L;  3F73 A;  2ZGZ A;  4FJK A;  3U8X A;  4EFH A;  3R6M A;  5FPD A;  4IFE A;  3OYL A;  3PX0 A;  1Q18 A;  2DTU A;  4QOZ B;  4QCL A;  2NRT A;  2EWS A; 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