3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
3EKUA 4FWNA 1GLCG 2YHXA 5TKYA 4H5NA 2HF3A 1SZ2A 3KHYA 3WT0A 4BR0A 5BPLA 4ISGA 2W41A 3MCPA 5BR9A 3CIPA 5AQYA 2F9TA 4FWRA 4CZFA 1V4SA 2GTDA 3AAQA 3A5NC 3LDNA 4EAHD 5ADXA 5E84A 2P9SA 5AFUA 4BRKA 4CBXA 3L4IA 1XQSC 4M7XA 3U9ZA 3UB5A 4CZHA 3EL2A 3VEVA 2P9SB 1GLLO 2QW9A 1YAGA 3QDKA 1BG3A 1QQOA 2YHYA 4BRNA 1JCFA 3DXKA 2V52B 5F0XA 4BQLA 1ZXOA 4CZJA 4PKIA 5BN9A 3DXKB 3H3NO 2P9UA 2ZGYA 3U8XA 4EHUA 3WXLA 1OKJA 2Q97A 3FLCO 2P9UB 2CGKA 4K43A 1QHAA 1NWKA 3VESA 3VEXA 2Q2RA 1LOTB 5AQZA 1KAZA 3SMSA 2FLOA 3LDOA 2VCPA 4BRFA 2E2NA 2Q1NA 4K41A 4BRHA 4BROA 1SQKA 4H03B 1TYQA 5JICA 4AM6A 4CZIA 3DWLA 4BREA 1HKGA 2QXLA 4BRLA 3ZX3A 1XC3A 3EZWA 3IFRA 4CZEA 5AQKA 1D4XA 4FPAA 2IVNA 4WQ5C 4RWTA 5AQMA 2E1ZA 3VGMA 3CERA 4B1ZA 3WQUA 1ESVA 2A3ZA 4RTFD 1QZ6A 3AY9A 2Q0UA 4BR5A 4FWPA 2D0OA 1Q18A 4B1YB 4GY2B 3DXMA 1BUPA 4M7YA 1GLDG 2FXUA 3UKUA 3F9MA 3ZX2A 4H0TB 4JHDA 4BC4A 1DEJA 3W3DA 3UE5A 1IJJA 4WQ5A 4BGBA 4BRCA 3CJAA 4H0XB 4IJNA 3UKUB 4KBOA 5AQGA 4JHDB 1QZ5A 4B1XB 5BRDA 5BN8A 3BP8A 2V7YA 4I6MA 1KXPA 2QWQA 5FPNA 2AA4A 2DPNA 3ATVA 3WXKA 2A5XA 3CETA 3ZX0A 4BQZA 4I6MB 3FZKA 3HTVA 1TUUA 3ID8A 3O8MA 2AP1A 3U9DA 2CGLA 2HF4A 2P9PA 4BVPA 4CZKA 1NM1A 2ZWHA 4QS7A 3CHWA 5KQDA 4CBUA 2A40A 5LJVA 2P9PB 3MMVA 1MDUB 5EOYA 3ENHA 2GUPA 4XH5A 4A62A 3LDLA 5FPMA 3KVGA 3H1QA 3MN7A 5FPDA 3D2FB 3GDQA 4XH4A 3LM9A 2QWMA 1GLFO 4EHTA 1X9JA 3SJHA 3CQXA 4BC3A 4BRMA 4BR9A 3C0BA 4YDUC 3CJBA 1NGBA 3TU5A 1BU6O 4H0VB 3CJ9A 5BRHA 1MWKA 3VEYA 4K42A 4CD1A 4K25A 3R6MA 1X3MA 1HX1A 4H0YB 4BRIA 1ZBSA 3EKSA 3QFPA 1K8KA 4YDUA 4BR2A 1K8KB 3W0LA 1C0FA 1QQNA 4JD2A 3HSCA 4CJ7A 4PL7A 3L6QA 3FE1A 3L0QA 3QBWA 5CE3A 2FF3B 4FPBA 4JD2B 2ZGZA 3VEZA 4XH1A 4A2AA 2OANA 3VENA 1ZC6A 1C0GA 3QICA 2E2OA 3M6GA 5AQFA 4BC2A 4ISEA 3UKRA 4B9QA 3MN5A 5BPNA 2YCHA 3D2EA 4FWQA 5AQRA 3UKRB 1NGIA 4BR4A 1NGJA 5AQUA 4BR7A 5AQPA 2YI1A 2GWKA 3D7EO 2IVOA 4BG9A 3JXUA 3D2EB 5AZJB 5AQWA 4MO5A 3O6WA 3O08A 2BTFA 1EQYA 5AQOA 1HJOA 5KPZA 1NLVA 1J6ZA 1S3XA 3GOIA 2FSNA 4QS8A 3O4WA 3FR0A 3VF2A 2ZF5O 4EIAA 3MK6A 4DQ8A 1JCGA 4A2BA 3WXJA 1Y64A 3U4LA 1RFQA 4MLHA 2P9NA 3HBTA 4NO7A 3RSEB 4Z94A 1JCEA 4MLEA 1ATSA 3QB0A 3O80A 2GEMA 3WUHA 5JLHA 2P9NB 3M1FA 4BRGA 1T6CA 2ITMA 1NMDA 3FZHA 3M3ZA 3CQYA 3HZ6A 5BRFA 1GLAG 2H3GX 1NGCA 2E8AA 4DB3A 1DKGD 2PBDA 1Z6RA 1U2VA 3VEOA 3H3OB 3VGLA 1U2VB 2P9IA 5JLFA 1RDWX 4FWLA 5ADXH 3C7NA 2E2PA 5AFUH 1E4FT 1Z05A 5LY3A 3ULEA 1NGHA 2P9IB 2Q0RA 4B1VA 3CJ7A 4BRDA 2CGJA 1KAXA 3C7NB 1NBWA 4CBWA 3ULEB 2P9KB 2HOEA 1DGKN 1BWFO 4F9OA 1IG8A 5EX5A 2A6AA 2GELA 3WEEA 2A42A 4L3QA 4BC5A 4CD3A 2A41A 2IIRA 3WEEB 4PL8A 3D2FA 1LCUA 3A5MC 2Q31A 2FSKA 5LJWA 4HTLA 1WOQA 4IJAA 4QS9A 5AQJA 4CI6A 2KHOA 1NGEA 3ZEUA 2D1KA 3QMLA 1R59O 5FPEA 1RGIA 5F1XA 3ZEUB 2D0PA 3MN9A 1MWMA 5EVZA 5B8HA 5AQQA 4BRQA 1BO5O 2QM1A 2NZTA 3O5BA 4FSVA 2ASOA 4EFHA 1T6DA 2PAVA 2NLXA 1BDGA 1H1VA 4FWSA 4FL9A 3FZLA 3LM2A 4CZGA 2E1YA 4FWKA 3GE1A 4H0PA 4ISFA 3GG4A 3H46O 4O8KA 3FZFA 2E2QA 3H6EA 3JS6A 1V4TA 1NGDA 3SK3A 1HPMA 1TUYA 4JAXA 5I9EB 3O1WA 4J8FA 2NRHA 3MDQA 3DAWA 3BEXA 3A5LC 3P4IA 5EY4A 2D4WA 4C23A 3FFKB 2YJEA 4HWIA 3LDPA 5AQXA 3J8AA 5AQIA 3IDHA 3WXIA 5AQSA 4DHYA 3GL1A 3H1VX 5KPRA 4MO4A 4RCHA 3TPQA 4BGAA 5AZJA 2HMPA 4BG8A 4IXCA 2YJFA 1KAYA 1G99A 3O1BA 3DJCA 4A61A 3BF1A 3A0IX 5AQVA 5JMVA 4FWMA 4PKGA 5AQTA 3ZETA 3LDQA 1YXQA 1BA0A 1MA9B 1BA1A 3HI0A 3MN6A 1U6ZA 4CZMA 2FF6A 1HLUA 3ZETB 3VERA 1QQMA 3KZBA 2J4RA 2IVPA 1E4GT 3VGKA 4DCHA 2VYPA 3RSEA 1ATNA 1YVNA 2W40A 3OHRA 2QWPA 1NGAA 3A8YA 5AZIA 5KPTA 2CH6A 1T44A 2ASPA 4LC9B 3ENOA 4Y0WA 5AZIB 3A5OC 5KQ8A 4H5WA 4FO0A 4O5FA 1CZAN 2QWLA 1HUXA 2WUSA 1TYQB 3B8AX 5ELZA 2CH5A 4WYBA 1BOTO 4BRPA 4BVOA 4WQ4C 1P8ZA 2E88A 3R8EA 2YHWA 3LL3A 3VPZA 3VEWA 3BUZB 3G25A 3GBTA 3H45C 4IO8A 2I7NA 3VF6A 2V7ZA 2UYTA 3FGUA 2QWOA 2P9KA 2V51B 3EN9A 4JN4A 4AM7A 4NB4A 1S22A 3DXMB 4H0OA 5AQLA 3CJ1A 4WQ4A 1X3NA 3VOVA 2BUPA 3CJCA 3I8BA 4XEIA 4B1UB 3R9PA 5BPMA 2GWJA 4BRAA 1GLJO 3I33A 4JNEA 3EO3A 3IMXA 2P9LA 3AAPA 4FOIA 3VF4A 5EXWA 3ATUA 1YUWA 3FZMA 5E26A 2QWRA 4H5TA 1GLEG 1GLBG 2EWSA 2F9WA 2P9LB 2QWNA 4PKHA 3SLCA 4H5RA 3WQTA 3QBXA 2I7PA 4FOEA 5BREA 2ASMA 4IWVA 2FSJA 1NGFA 3S41A 1ATRA 1SAZA 4FWOA 3IUCA 4M63C 2VWBA 3CI5A 1NGGA 4E1JA 3QFUA 2Q36A 5AQHA 3BF3A 5F2RA 1WUAA 1HKCA 4B1WB 5AR0A 4IZ9A 3VETA 4H5VA 1HKBA 3HM8A 1XUPO 2E20A 3AARA 5AQNA 4CZLA 4GNIA 3SMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NHGA 3RTVA 4AF1A 3KC6A 4FWNA 4FVMA 3CCUN 4CGJA 4N47A 2QA4N 3KHYA 1I6FA 5BPLA 3OYIA 4ISGA 3NDKA 4DKWA 4LF5K 4C1NI 1WN7A 3LDNA 5T7BA 3WNEA 2P9SA 5AFUA 4BRKA 1MU2A 3N4PA 3QO9A 3L4IA 4CEQA 4CZHA 5C2FA 3EL2A 1SEGA 3LP3A 3VEVA 1GLLO 1VSEA 1BG3A 2YHYA 1VSLA 1QE1A 3HYFA 4J2EA 1C0TA 2HBMA 3MAQA 1UOCA 2DTUA 3U8XA 1VQON 3E1YA 4CJKA 4JI5K 4ID1A 2HVHA 2Q97A 4KTWA 2P9UB 2KTQA 4AHUA 1SNBA 1QHAA 4K43A 3VESA 4JEPA 3VEXA 1ZBFA 2Y1JA 1IBLK 2GBZA 1FXXA 1KAZA 3SMSA 2FLOA 4OPKA 2VCPA 1IKVA 4K41A 4BRHA 4BROA 1TYQA 4OO1J 2YEOA 2N69A 4BWJA 1FK9A 3K9JA 3Q7CA 4DR2K 3CG7A 3K59A 2QXLA 2E2FA 3EZWA 4CZEA 5KGXA 3PUFA 1J54A 4FLYA 2D56A 4RWTA 2K35A 5AQMA 3VGMA 3QEIA 1NK0A 4RTFD 1SL1A 1IKWA 1KFSA 2D0OA 1KVCA 1Q18A 2PFUA 4GY2B 3MXIA 3DXMA 3WXMB 3PO5A 3AO1A 1NPIA 1GLDG 3UKUA 4OKJA 3ZX2A 1J9AA 4BC4A 2RE2A 3UE5A 3O9QA 2W6LA 3C6TA 3TAFA 5AQGA 1RT1A 4JHDB 1QZ5A 4B1XB 5BN8A 4I6MA 1KXPA 3OBWA 3DOLA 4Z4EA 2DPNA 2A5XA 4CHZA 3G10A 2F96A 1B9FA 1IO2A 1UAXA 2X74A 3D0PA 1RTJA 4KTZA 3CCSN 3ID8A 3O8MA 1N8RO 5JVGL 4E89A 4CEBA 4CCHA 2CGLA 2P9PA 5LMNK 2ZWHA 2HB5A 3SUPA 5KQDA 4IG3A 2A40A 2ZQBA 4CGFA 3C6UA 3IG1A 1MDUB 2HBLA 4EZ6A 4ID5A 1VQ7N 5J2QA 2O8DA 2GUPA 3VQ4A 1EP4A 3PX4A 3NH1A 3BY5A 4A62A 3S3OA 3Q7BA 2FBYA 4HUGA 3MN7A 3GDQA 3M8RA 1GLFO 3SJHA 3KP1A 3MWPA 4B8CA 3JYTA 1QHTA 4BC3A 4PWDA 1ZBLA 4FLWA 4YDUC 4RG8A 4GV6A 4LD0A 3CJ9A 3KK7A 4CGGA 4JK9A 3R6MA 3KD5E 3L2QA 3EKSA 2O8EB 4LF8K 4JKEA 3G4SN 3SCXA 3TAMA 1TL1A 4FLZA 4DSKA 4FJJA 2UXDK 3L6QA 1MR4A 3FE1A 4WFNL 5CE3A 2ZGZA 2OANA 1ASUA 3JAMO 5A2QO 4ICLA 2G8VA 2E2OA 2E5LK 4KRFA 4GKJK 5AQFA 1WSJA 1DQ7A 4CK1A 2A1SA 4BWMA 4N76A 3T1HK 2HHXA 1EETA 1NKBA 3UKRB 5AQRA 2KW4A 4DTSA 2QI2A 2KLAA 1WB9A 3OYNA 4GVMA 3ULDA 3O6WA 4DR4K 5J2PA 1EQYA 4E7HA 2ZJPL 3THWA 5KPZA 2OCEA 3GOIA 3DLRA 3OYBA 4K8ZA 3O4WA 4CFBA 3HK2A 3QNNA 2YIOA 1JCGA 2IS3A 4A2BA 2P5GA 4IEEA 1S1VA 3SBTA 5M1FA 4AHSA 4YOWA 3OYJA 4NO7A 4Z94A 2YNFA 4MLEA 3QB0A 4BE2A 3WUHA 4FJ9A 2P9NB 3M1FA 2XO7A 4AHRA 1T6CA 1NMDA 4IDKA 4JRQA 3CQYA 1VNBA 1C1BA 3HZ6A 2D5RA 1LWFA 3AO3A 1XNQK 2H3GX 3O9TA 3EZ5A 2PBDA 1Z6RA 4LSNA 3KD1E 5K14A 3NVMA 1WLJA 4DFPA 4JI6K 2P9IA 4JLHA 4FJHA 1N32K 5JLFA 4LH5A 5LY3A 5LMUK 1NGHA 4B1VA 4BRDA 1RT4A 2CGJA 2WTUA 1KAXA 1NBWA 3LP1A 4CIFA 1BWFO 4BECA 4KREA 5EX5A 2YNIA 4DQIA 4X62K 3ZT1A 3E01A 4CF0A 3TSPA 1NJWA 2Q31A 1S1UA 3SQ4A 2VWJA 5LJWA 3OYDA 3OYMA 1RDUA 1X9SA 2KHOA 2O8BB 3NMUA 3VQ7A 2UUCK 2D1KA 3OYEA 1R59O 1UGLA 5F1XA 1N33K 4JK7A 5EVZA 4BRQA 2Z1GA 1X1PA 2QM1A 3VA0A 2NZTA 4KH4A 1HNZK 5CYMA 2PAVA 4NLBA 4AQYK 1SUQA 1HNVA 1KC8O 3ZCMA 3P38A 3FZLA 3LM2A 4BDPA 4CZGA 3O9SA 1NJIO 1QS4A 1VQ5N 4DFKA 4HCCA 2B6AA 1VQ6N 2A1RA 3H6EA 3CFPA 3O1WA 3ALYA 3WNHA 3BEXA 2P51A 3SNNA 1LQIA 4HWIA 5AQXA 3DLGA 1TI5A 4CHOA 3WXIA 5KTQA 5J2NA 5AQSA 4DHYA 4IG0A 5KPRA 3KWGA 2KKZA 3I0SA 2ZD1A 2HHWA 1M1KO 2YJFA 1T7AA 1UWBA 1FW6A 4YOXA 1HMVA 4CHPA 4B9VA 3DLBA 4PKGA 2YHBA 3RWUA 2N2QA 4KHWA 4L8RB 3HI0A 3MN6A 3KLHA 4CZMA 3KKSA 2G8WA 1L3UA 3O4NA 3VERA 2N66A 3KZBA 5FROA 4AAZA 3V1QA 5FRNA 4JKFA 4PY5A 2VG5A 3CCMN 4DCHA 2VYPA 3RSEA 3O3GA 4M3XA 1ATNA 1YVNA 2W40A 2QWPA 3I0RA 4KPYA 2PYLA 5C15A 3IAYA 1UA0A 2LN8A 1T44A 4O0JA 1E3MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3NHG A;  3RTV A;  4AF1 A;  3KC6 A;  4FWN A;  4FVM A;  3CCU N;  4CGJ A;  4N47 A;  2QA4 N;  3KHY A;  1I6F A;  5BPL A;  3OYI A;  4ISG A;  3NDK A;  4DKW A;  4LF5 K;  4C1N I;  1WN7 A;  3LDN A;  5T7B A;  3WNE A;  2P9S A;  5AFU A;  4BRK A;  1MU2 A;  3N4P A;  3QO9 A;  3L4I A;  4CEQ A;  4CZH A;  5C2F A;  3EL2 A;  1SEG A;  3LP3 A;  3VEV A;  1GLL O;  1VSE A;  1BG3 A;  2YHY A;  1VSL A;  1QE1 A;  3HYF A;  4J2E A;  1C0T A;  2HBM A;  3MAQ A;  1UOC A;  2DTU A;  3U8X A;  1VQO N;  3E1Y A;  4CJK A;  4JI5 K;  4ID1 A;  2HVH A;  2Q97 A;  4KTW A;  2P9U B;  2KTQ A;  4AHU A;  1SNB A;  1QHA A;  4K43 A;  3VES A;  4JEP A;  3VEX A;  1ZBF A;  2Y1J A;  1IBL K;  2GBZ A;  1FXX A;  1KAZ A;  3SMS A;  2FLO A;  4OPK A;  2VCP A;  1IKV A;  4K41 A;  4BRH A;  4BRO A;  1TYQ A;  4OO1 J;  2YEO A;  2N69 A;  4BWJ A;  1FK9 A;  3K9J A;  3Q7C A;  4DR2 K;  3CG7 A;  3K59 A;  2QXL A;  2E2F A;  3EZW A;  4CZE A;  5KGX A;  3PUF A;  1J54 A;  4FLY A;  2D56 A;  4RWT A;  2K35 A;  5AQM A;  3VGM A;  3QEI A;  1NK0 A;  4RTF D;  1SL1 A;  1IKW A;  1KFS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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