3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
3KHYA 1DGKN 3QBXA 3C7NA 3GL1A 5AQMA 3C7NB 3VEWA 3H1VX 1JCGA 1KAXA 3ZEUA 4KBOA 3ZEUB 3HSCA 4BR2A 5KQ8A 5FPEA 3LM9A 3A8YA 4J8FA 4EFHA 5JICA 3LDNA 3ZETA 4H0VB 4RWTA 3ZETB 4CZGA 5JLHA 3A5MC 1HKGA 3BP8A 3ZX3A 2QWOA 4B1XB 2YJEA 3O80A 2D4WA 2QM1A 3EZWA 1GLJO 4DQ8A 1GLAG 3A5OC 1Z6RA 3LL3A 3WQUA 1BOTO 5F2RA 4CJ7A 5FPMA 3DWLA 2NLXA 4BRCA 3LDOA 1ESVA 4B1WB 1DEJA 3WQTA 5AQVA 4FOEA 5ELZA 5KPRA 4EAHD 2NRHA 1D4XA 5F1XA 3O4WA 4B1UB 5AQUA 3CJ1A 2P9SA 1YUWA 2FSJA 5AQQA 4B1VA 1XC3A 4BG8A 3MN9A 3EN9A 3FZLA 1TYQB 1K8KA 5E26A 2CGKA 1GLLO 2YI1A 3CJ7A 3W0LA 4BC2A 2WUSA 3KZBA 3VEXA 1SZ2A 2FSNA 3DJCA 4BRIA 1MWKA 4K42A 3JXUA 1ZXOA 3ID8A 2P9NA 4ISFA 3VESA 4BR9A 2P9NB 2W40A 1ATNA 5AQYA 3CQYA 1MA9B 2Q2RA 1G99A 4CBXA 3HI0A 1IG8A 3IMXA 3IUCA 1J6ZA 3U8XA 4BRAA 3VGLA 2H3GX 3I33A 4HTLA 4M7YA 2CGJA 3CI5A 3CJBA 1QQNA 3L0QA 1BUPA 3AY9A 3KVGA 3UKUA 4XEIA 3UKUB 2FXUA 3MCPA 5AQOA 3VPZA 2Q0UA 4M7XA 1C0FA 1RGIA 4WQ5C 4BVPA 1QQMA 1DKGD 3TPQA 4O5FA 3SLCA 1NBWA 1KAYA 1H1VA 2VYPA 4E1JA 4BQZA 1QHAA 5EY4A 1KXPA 3D2FB 3HM8A 3GG4A 1SAZA 3SMPA 5AQTA 4BRPA 4BVOA 3MN5A 4B1ZA 4RCHA 4QS7A 1BA0A 2F9WA 4PKGA 3R8EA 3QDKA 3G25A 2A40A 4DB3A 1NGEA 1E4FT 1ZC6A 1P8ZA 4H5VA 3LDPA 3EKUA 3VGKA 3OHRA 3ENOA 5AQIA 4FPBA 1Y64A 4F9OA 1HX1A 2NZTA 4B1YB 3JS6A 5TKYA 2HF4A 2V7ZA 3VF4A 5LY3A 3FGUA 1BU6O 4BGBA 2CH6A 2D1KA 1BWFO 4FWPA 5AQFA 3EL2A 2VWBA 4LC9B 2F9TA 5FPNA 2ZWHA 2E2PA 5BRHA 3CQXA 4FWKA 4A2BA 4EHTA 4CZKA 3QBWA 2I7PA 3O5BA 3DAWA 1R59O 2E8AA 3VEYA 3L4IA 5BN9A 1HPMA 1GLCG 3UB5A 4H5WA 4EHUA 1YXQA 4Z94A 4H0PA 3O08A 5AQNA 2E1YA 1S22A 3FLCO 5CE3A 4IJNA 3WT0A 3VETA 4CZHA 1QZ5A 3AARA 3FZMA 4I6MA 4MLHA 4BRFA 4DHYA 4I6MB 2ASOA 4YDUC 4BC5A 1TYQA 3UE5A 2GEMA 5F0XA 2YHWA 3MDQA 4MO5A 3VEOA 4FL9A 1U6ZA 3WXLA 2FLOA 3GOIA 4M63C 2J4RA 1CZAN 5EOYA 1Z05A 1IJJA 2GTDA 2V52B 3DXKB 3M1FA 4IWVA 2CGLA 4BREA 4FWRA 4YDUA 3CJ9A 1TUYA 4BGAA 4FWLA 3HTVA 2GUPA 5AQXA 1NGDA 3M6GA 3WXJA 3H3OB 5AQKA 1TUUA 4A62A 1NGIA 2ASPA 3QB0A 3RSEA 1MWMA 2I7NA 3RSEB 1MDUB 5B8HA 2P9PA 4BRQA 3CHWA 4CZMA 1T6CA 2P9PB 3AAQA 1U2VA 1GLDG 1V4SA 4JHDA 2QWMA 1U2VB 2Q1NA 4H0XB 2E2OA 4JHDB 3VGMA 3W3DA 5BN8A 4FWQA 3VENA 4B9QA 3M3ZA 4WQ4C 4NB4A 2E88A 2IIRA 1RDWX 3H3NO 1C0GA 3ULEA 1ATSA 1SQKA 4A2AA 3DXMB 2A41A 3ULEB 3QFPA 1EQYA 4K43A 3MN7A 2YHXA 3VEVA 3MN6A 4XH5A 4CZJA 3S41A 4C23A 2QWNA 4EIAA 4A61A 1NWKA 4BR7A 5AQRA 4WQ4A 3P4IA 3SJHA 5AQJA 3A5LC 3U9DA 3D2FA 4CZFA 5KQDA 4BRHA 4WQ5A 2GELA 1JCFA 4H5TA 3WXKA 1GLEG 4FO0A 4IO8A 4FWMA 2EWSA 2HOEA 4BC4A 5AQHA 2FSKA 2E2QA 4ISGA 4JAXA 4K25A 2AP1A 2ZGYA 1NMDA 3EKSA 1HLUA 3C0BA 2YJFA 3CJAA 4FWNA 4BRMA 1NM1A 4PL8A 2A3ZA 4CZLA 3A0IX 5AQPA 3O6WA 2QXLA 5AFUA 2YCHA 2E2NA 4K41A 4FOIA 4CD3A 4BRNA 3B8AX 2ASMA 1HJOA 2A6AA 1YAGA 3LDQA 2FF6A 4DCHA 2OANA 2Q97A 3CETA 2GWJA 4BRGA 4H0TB 5AQWA 2ZF5O 2GWKA 3BF1A 1QQOA 3ATVA 1BDGA 3VEZA 4CBWA 3SK3A 5AZJA 5AFUH 4BR4A 5AZJB 4MO4A 2P9IA 5BRFA 4MLEA 2P9IB 3D2EA 1BA1A 2HMPA 3D2EB 3H46O 1YVNA 2QWPA 3U9ZA 2YHYA 2V51B 5LJVA 4BRKA 3O1BA 3A5NC 5BPLA 4CZEA 3VOVA 1HKBA 4FSVA 4XH4A 2AA4A 1NGJA 1NGHA 2W41A 2A5XA 4FWOA 2IVOA 3FZHA 3CIPA 3LM2A 3D7EO 3R6MA 1QZ6A 4ISEA 3TU5A 3ENHA 4BR5A 4Y0WA 2D0OA 1X3NA 5BREA 3FE1A 3IFRA 3F9MA 3QFUA 3VERA 2Q36A 3WUHA 1T6DA 3CJCA 2QW9A 1V4TA 4PKHA 1GLBG 1ZBSA 3BF3A 3J8AA 4BC3A 3L6QA 1S3XA 5AQGA 3DXKA 5EXWA 2KHOA 3H6EA 1GLFO 3H45C 3VF2A 1LOTB 5AQLA 3QICA 2P9SB 2Q31A 4JN4A 1XQSC 3MK6A 4H0OA 1E4GT 3WXIA 4RTFD 5FPDA 1WUAA 3VF6A 3QMLA 1BO5O 2PAVA 1HUXA 2QWRA 1K8KB 4H03B 4PKIA 2FF3B 3HZ6A 2Q0RA 5JLFA 2D0PA 5ADXA 1T44A 5AZIA 2ITMA 5AZIB 2HF3A 3CERA 5EX5A 3ZX0A 1NGAA 2P9LA 5E84A 5AQSA 2P9LB 4IJAA 3ATUA 1KAZA 4JD2A 3GDQA 4BG9A 4H5RA 4JD2B 3DXMA 2PBDA 1NGBA 1Q18A 2BTFA 2E20A 3U4LA 5KPZA 1X9JA 3GE1A 5AR0A 1XUPO 5ADXH 4IXCA 3BEXA 4L3QA 1BG3A 4CZIA 3O1WA 3WEEA 1JCEA 4JNEA 3AAPA 4WYBA 3WEEB 4QS9A 4PL7A 3BUZB 5BPNA 2P9KA 5AQZA 4IZ9A 4QS8A 5KPTA 2P9KB 1ATRA 5I9EB 2P9UA 4XH1A 3SMSA 5JMVA 3GBTA 4FPAA 3FZFA 2P9UB 4BRDA 1NGCA 2QWQA 3UKRA 3LDLA 2BUPA 3UKRB 4AM7A 1NGFA 4BRLA 1NGGA 2IVNA 4BROA 4CBUA 4HWIA 4CD1A 5LJWA 2VCPA 4CI6A 2ZGZA 2DPNA 5EVZA 1RFQA 4GNIA 1HKCA 5BRDA 2CH5A 3EO3A 1X3MA 2UYTA 3FR0A 2IVPA 1WOQA 4BR0A 1OKJA 4FWSA 2V7YA 4H5NA 4H0YB 4NO7A 2E1ZA 3FZKA 3I8BA 5BPMA 3ZX2A 4BQLA 3O8MA 3MMVA 3FFKB 3HBTA 4O8KA 3R9PA 5BR9A 4GY2B 2A42A 3H1QA 1LCUA 1NLVA 4AM6A 3IDHA 2QWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KHYA 2F4VK 4KB1A 3GL1A 4N5SA 2YC1C 3H1VX 3LP3A 3CCVN 3ZEUB 1QSLA 5JICA 4EFHA 3LDNA 4O0JA 2KLAA 1B7DA 3ZETB 1TKTA 1HKGA 4NCBA 4B1XB 2LT8A 4DTMA 2NRVA 3DOKA 4Y1DA 5M1QA 1Z6RA 5HRNA 2O8FA 4DU1A 3P31A 3RMAA 4GKJK 3DWLA 3HXMA 4XJXA 2LI7A 4UAEF 4DU3A 3NGYA 3WQTA 1QS4A 2UXBK 2XY7A 1NK7A 3BZCA 4C8NA 3OYJA 3L2RA 3CYMA 1NK9A 4J2DA 5AQUA 4B9LA 3CJ1A 3V9SA 2P9SA 4DSJA 2NY9X 5AQQA 4O44A 5H1SQ 1SUQA 3EN9A 3CCQN 3C6HA 4DV3K 3RWUA 4DR7K 4O55A 4YY3K 4W5RA 2ZQBA 1SZ2A 1QTMA 4KREA 3AVNA 1VSIA 3DJCA 2UXCK 1I39A 1FKPA 4FJMA 1L3TA 4FM2A 4FLZA 2ZD1A 4FJIA 1ZBFA 1ZYWA 2P9NA 4B9SA 1X1PA 5I42A 1REVA 2Q2RA 1G99A 1IG8A 3IMXA 1KV0A 3CFOA 3U6FA 3KK1A 3IUCA 3U8XA 3VGLA 1O13A 5K14A 3CI5A 4E7IA 1CZ9A 2EX3A 1Y97A 3L0QA 3AVGA 3NDKA 3AY9A 3KVGA 1IKYA 4BDZA 4OGCA 3UKUB 2LN8A 2QA4N 3KWGA 4JKAA 2Q0UA 1C0FA 1RGIA 5M1NA 2W6KA 2KFZA 4DV4K 3TAMA 1L3SA 1NBWA 4X65K 1BQMA 4BQZA 2KJAA 4ELVA 1LWCA 1VNAA 5EY4A 1VSHA 2OA8A 4MQ3A 3LWLA 5AQTA 4BRPA 1WN7A 4DTOA 4RCHA 4QS7A 2HB5A 4PKGA 1P00A 2XY8A 2OPSA 4DB3A 3CQ8A 4H5VA 3OHRA 4RW6A 4M3XA 3C65A 4IFVA 1WAJA 4B1YB 1JLEA 4JV5K 2FBXA 1HJRA 4AB0A 3MXJA 4BDPA 3CC4N 3DLRA 4I9LA 3VF4A 3O3FA 3FGUA 4DR2K 3CM5A 1KCFA 4FWPA 1BWFO 5AQFA 3TSQA 4IFYA 1JXCA 4B3OA 3M5RA 2VWBA 4MDBA 4QCLA 3SUPA 3E9OA 4AQYK 3T1HK 1X9WA 2PY5A 3CQXA 4HVJA 1NE5A 4A2BA 5C15A 1VQNN 3OJUA 1RILA 4LSNA 1VQ9N 4JI8K 3SUQA 1DTTA 3O5BA 3PY8A 3NBPA 3L4IA 1HPMA 3IS9A 4GKKK 4EHUA 4H0PA 3O08A 5CE3A 3AVAA 3I56N 4IJNA 4CZHA 3FZMA 3OA9A 4LFBK 3SCXA 1YT3A 1D9FA 4DHYA 4FJKA 2ASOA 1G15A 3O4QA 1UWBA 4LFAK 3MDQA 2VG6A 4HCCA 5CYQA 4BE0A 4F8RA 3GOIA 4M63C 3CCUN 3MXIA 4KH6A 3NE6A 5CZ2A 3OBWA 5EU7A 1Z05A 3M8QA 4GV3A 2V52B 2WTUA 1RTJA 4CGJA 5FDLA 4FWRA 1TUYA 2IDOA 4CF0A 4ZTJA 3G4SN 1P90A 5AQKA 4A62A 2ASPA 1MDUB 3CHWA 4OVLA 2K35A 1T6CA 2M8BB 2P5GA 3WNFA 1BRZA 3O9QA 4H0XB 4JHDB 3SBTA 5BN8A 4NXMK 4FWQA 4CJEA 3T3FA 4BEBA 2E3GA 2E88A 4EP5A 2R7YA 4M3RA 1RDAA 3ULEA 1ATSA 3LP2A 3KOYA 3DXMB 1JZAA 3T69A 4XH5A 3S41A 1NK0A 2QWNA 1SKRA 3DLEA 2F7TA 4A61A 1NWKA 2EHGA 2ETJA 3SJHA 3L56A 1NKEA 3U9DA 4X64K 2O8CB 2B3CA 1X9SA 3QIPA 2VQFK 3TAPA 3OS0A 4DQIA 4CJRA 2YNGA 3OTOK 3K2PA 1KLMA 4WFBL 4DR1K 2EWSA 2HOEA 3MEGA 1VQ4N 1Q9XA 2B68A 1X9MA 1Z25A 4JK7A 1HLUA 1RTDA 4JKHA 4BACA 2A3ZA 3OYCA 3ISNC 4FJHA 3AV9A 3QO9A 4CEBA 1S1UA 5KGXA 4DR3K 2YCHA 3RTVA 1KLNA 4K41A 1S1XA 3V81A 4CD3A 3F5TA 3B8AX 3HOTA 2W00A 2HBJA 4DCHA 1J5OA 2KFNA 5C2DA 5C10A 4OLBA 4NXNK 4IO9L 3DLHA 4H0TB 2ZF5O 4CEEA 3SQ1A 1KRPA 3VEZA 2FC0A 3QIOA 4CBWA 5AZJA 4JI5K 4JYAK 3M8PA 3V1RA 3SBGA 1NNEA 4AHVA 1DLOA 4DSIA 2FBTA 4DV1K 4MLEA 3LWMA 3HT3A 2QWPA 4JKFA 3U9ZA 2V51B 4BRKA 4DQSA 3QETA 5BPLA 1S5JA 3L3VA 1NGHA 3THXB 4FWOA 2X78A 3R6MA 4OPJA 3R2VA 3SUOA 3K5OA 3VQ5A 4Y0WA 1X3NA 1ICAA 5BREA 4BDYA 2GMOA 3K57A 1WSGA 4V19S 5FRMA 2ZJPL 1T6DA 3EE9A 1IKVA 2ITGA 4OKKA 1V4TA 4KTZA 3RVCA 1ZBLA 1ZBSA 4K8XA 1C0MA 3LPUA 4XIUA 4DV2K 2KHOA 1POIA 1GLFO 4LSLA 3SPYA 4FW1A 4BECA 5AQLA 1VQ7N 1TK5A 3LANA 4V1DC 4ILJA 3VF6A 1EWQA 1D8YA 1PX9A 5IT9O 2OPQA 2D0PA 5ADXA 2O4IA 4CIEA 1N33K 1KFDA 1NGAA 2P9LA 5JS2A 4IG3A 1FJGK 1HRHA 3MEDA 2UUBK 4H5RA 4JD2B 2FBVA 2BTFA 5KPZA 4LF7K 1A5WA 4O8UA 3QINA 4CECA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KHY A;  2F4V K;  4KB1 A;  3GL1 A;  4N5S A;  2YC1 C;  3H1V X;  3LP3 A;  3CCV N;  3ZEU B;  1QSL A;  5JIC A;  4EFH A;  3LDN A;  4O0J A;  2KLA A;  1B7D A;  3ZET B;  1TKT A;  1HKG A;  4NCB A;  4B1X B;  2LT8 A;  4DTM A;  2NRV A;  3DOK A;  4Y1D A;  5M1Q A;  1Z6R A;  5HRN A;  2O8F A;  4DU1 A;  3P31 A;  3RMA A;  4GKJ K;  3DWL A;  3HXM A;  4XJX A;  2LI7 A;  4UAE F;  4DU3 A;  3NGY A;  3WQT A;  1QS4 A;  2UXB K;  2XY7 A;  1NK7 A;  3BZC A;  4C8N A;  3OYJ A;  3L2R A;  3CYM A;  1NK9 A;  4J2D A;  5AQU A;  4B9L A;  3CJ1 A;  3V9S A;  2P9S A;  4DSJ A;  2NY9 X;  5AQQ A;  4O44 A;  5H1S Q;  1SUQ A;  3EN9 A;  3CCQ N;  3C6H A;  4DV3 K;  3RWU A;  4DR7 K;  4O55 A;  4YY3 K;  4W5R A;  2ZQB A;  1SZ2 A;  1QTM A;  4KRE A;  3AVN A;  1VSI A;  3DJC A;  2UXC K;  1I39 A;  1FKP A;  4FJM A;  1L3T A;  4FM2 A;  4FLZ A;  2ZD1 A;  4FJI A;  1ZBF A;  1ZYW A;  2P9N A;  4B9S A;  1X1P A;  5I42 A;  1REV A;  2Q2R A;  1G99 A;  1IG8 A;  3IMX A;  1KV0 A;  3CFO A;  3U6F A;  3KK1 A;  3IUC A;  3U8X A;  3VGL A;  1O13 A;  5K14 A;  3CI5 A;  4E7I A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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