3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
2Q36A 4FOIA 2P9LA 3RSEB 3AAQA 1TUUA 1ZBSA 2FLOA 3VERA 3O08A 1BOTO 3C7NA 3CJBA 3W0LA 5KQDA 4FWPA 1BO5O 4BRPA 3CI5A 4ISEA 3EO3A 1NGCA 3ZEUB 5F0XA 5AQUA 3H1QA 2E1ZA 1NWKA 1HKCA 1Y64A 3EKUA 4M7YA 5FPDA 3BP8A 4PKIA 2CGJA 4JHDA 1BU6O 2F9TA 4QS8A 3ATUA 4CI6A 2CGLA 1NGDA 3DAWA 3FE1A 3GBTA 1NGBA 1D4XA 1RGIA 1SZ2A 1P8ZA 2ASMA 3ZX2A 4Z94A 4H0VB 3L4IA 3SMPA 2YHXA 1OKJA 3ZETB 4CZJA 1RDWX 1GLLO 4B1VA 1JCEA 4MLEA 1QQNA 2D0OA 2NRHA 4ISFA 2E8AA 5F1XA 1TUYA 1MWKA 5AQXA 4EFHA 4AM7A 4LC9B 2A41A 3FLCO 4H03B 4IJAA 3MN7A 4I6MA 4H5NA 2D1KA 4AM6A 3C7NB 4BRLA 1KAXA 4DB3A 1QQOA 4JNEA 1GLBG 3GDQA 1GLJO 3CJCA 4BRFA 1H1VA 1CZAN 2PBDA 3WEEB 2E2PA 3LDQA 1E4GT 5AQFA 5EY4A 3B8AX 3UKRB 5AQRA 4FWKA 3I33A 3EL2A 3VEWA 3F9MA 3FZFA 3BF1A 4XH5A 2Q0RA 3J8AA 2E20A 4KBOA 3H6EA 1T6CA 4M63C 2DPNA 1NBWA 3FZMA 3QFUA 2BTFA 2HF4A 4H0PA 1BWFO 1HJOA 4B1XB 3BUZB 3DWLA 3HBTA 2CH5A 3WQTA 3VGKA 3R8EA 5ADXA 3M1FA 3VEZA 1DKGD 4BC5A 4BG9A 4BVPA 4CZGA 4EIAA 4MLHA 2UYTA 2CGKA 3VEVA 1QZ6A 2IIRA 2ZGYA 4CZHA 3VETA 2YI1A 4CD1A 3G25A 4FWMA 4I6MB 3ATVA 2YCHA 3HI0A 4JN4A 1NGJA 3LDPA 3U8XA 2QM1A 5EX5A 3SK3A 2W40A 2FSNA 1QHAA 5AQZA 3VEYA 2QWOA 2W41A 4F9OA 2ITMA 2AA4A 3WXKA 3P4IA 5AQKA 2YHWA 2FXUA 4PL8A 1MDUB 3A5LC 4BQZA 4CZLA 4BC2A 4RWTA 3FZHA 1MA9B 4EHTA 4GY2B 4CD3A 3VEOA 4XH1A 4BR5A 1V4TA 2HMPA 1KAYA 4H5RA 5AFUA 3IUCA 2F9WA 2A3ZA 4CZMA 2HOEA 3IMXA 1NGGA 3A5MC 4BVOA 5BRDA 1T44A 2GTDA 5JICA 2P9PA 2E1YA 4C23A 4H0TB 4FWNA 4PKGA 1BA0A 1LCUA 3MN5A 3MK6A 5AQHA 4BRIA 3H45C 3BF3A 4BRQA 5BN8A 4K25A 5I9EB 2V52B 3QBXA 2HF3A 1HKGA 4FL9A 3GOIA 3WXIA 3D2EA 2WUSA 3SMSA 2Q31A 4B1WB 3CJ9A 5EVZA 3HZ6A 4H0YB 4QS9A 3WT0A 1X3NA 3MN9A 1GLDG 1Z05A 3O4WA 3U9DA 4PL7A 5BPLA 1K8KA 4WYBA 3GG4A 1DEJA 3ENHA 4MO4A 2VWBA 4BREA 1EQYA 2BUPA 2QWMA 3DXMA 3VGLA 3ZX0A 1XQSC 3OHRA 4BR7A 3C0BA 3VEXA 5KPRA 1XUPO 1ATRA 2I7NA 1NGFA 2P9LB 4CZFA 2J4RA 4JD2A 3VF4A 5FPNA 1TYQA 4YDUC 3QB0A 3O1WA 4BR4A 2A42A 1T6DA 3CHWA 3QFPA 4IZ9A 1J6ZA 1MWMA 3EKSA 1YVNA 2E2NA 2GWKA 1X3MA 1E4FT 3O80A 4BR0A 3A8YA 4JHDB 1Z6RA 1ZXOA 4A61A 3QDKA 4FWLA 3VGMA 4B1YB 4DQ8A 4YDUA 4WQ4C 3D2EB 4H5VA 1NGHA 4PKHA 4BRNA 5ADXH 2FSJA 5BPNA 2YHYA 4O5FA 3UE5A 1HKBA 1BA1A 4GNIA 2FF3B 2Q0UA 2QWLA 4CJ7A 5KPTA 3HTVA 3DJCA 3LL3A 3WXLA 3CERA 3KVGA 2P9IA 2QWRA 5FPEA 3CJAA 4CZKA 2A40A 3O8MA 2FF6A 5E84A 1C0GA 4QS7A 3FZKA 2GEMA 2NZTA 4J8FA 4MO5A 2A5XA 2Q97A 3SJHA 3FGUA 4FOEA 4BRAA 4WQ4A 4FWRA 5AQNA 3H1VX 2H3GX 4JD2B 2ZWHA 3O6WA 2VYPA 3D7EO 5AQOA 3JXUA 4BC3A 2D4WA 5AR0A 3KHYA 2IVPA 3LDNA 3CIPA 1U6ZA 3MCPA 4RTFD 3RSEA 3CQXA 3AAPA 3H46O 1HUXA 5EXWA 4XEIA 3JS6A 1U2VA 1ESVA 4L3QA 4H5WA 4HWIA 3TU5A 5AQYA 4IWVA 3ZEUA 3H3NO 3O5BA 1SQKA 3M6GA 3GE1A 1BG3A 4K42A 3UB5A 2QWQA 1IG8A 4FPAA 4FO0A 4O8KA 4EAHD 2IVOA 2YJEA 4EHUA 3L6QA 5AQQA 4B1UB 2Q2RA 3VPZA 1G99A 4JAXA 4A2AA 3ID8A 3CJ1A 4CZEA 5BRHA 3WXJA 3ZETA 3MDQA 1LOTB 1NGIA 1GLFO 2ZGZA 2QWPA 2YJFA 5JMVA 4CBUA 2CH6A 3S41A 5AQWA 4BRHA 4A62A 3UKUA 3FZLA 2D0PA 4FWOA 4IJNA 5E26A 3DXKA 3QBWA 4M7XA 1X9JA 4H5TA 5BR9A 2GWJA 1U2VB 3O1BA 5BREA 4NB4A 5JLHA 1XC3A 3H3OB 2EWSA 1GLAG 5KPZA 2NLXA 1JCFA 3VF6A 2I7PA 1NMDA 3TPQA 3WEEA 4HTLA 5AQGA 2ASOA 1YXQA 5CE3A 2ZF5O 3LDOA 3UKRA 5AQPA 4BC4A 4IXCA 5AQLA 1KAZA 1RFQA 3CQYA 3VF2A 2E2OA 5AQJA 5AZIA 3VESA 2PAVA 3LDLA 1NGEA 3A0IX 2P9NA 3D2FA 4BR2A 3IFRA 1ZC6A 4XH4A 4B1ZA 4Y0WA 3WQUA 4H0XB 2P9PB 5AZJA 4FWQA 3EZWA 4BGBA 1BDGA 4ISGA 1C0FA 1ATNA 1BUPA 5AQIA 4NO7A 4E1JA 3CETA 3UKUB 4DCHA 2V7ZA 1DGKN 5AQVA 3FR0A 3DXKB 3LM9A 1R59O 1WUAA 2P9UA 4BRCA 5AQMA 2QW9A 1V4SA 2GELA 3W3DA 2GUPA 3MN6A 4FPBA 4BQLA 1YUWA 2P9SA 2P9KA 4H0OA 2V51B 1K8KB 1HPMA 3AARA 5AQSA 3LM2A 4FSVA 1HLUA 3DXMB 3U4LA 3A5OC 4K43A 3ENOA 3FFKB 4K41A 3WUHA 4BR9A 4CZIA 5KQ8A 3A5NC 2ASPA 3ULEA 3SLCA 3R6MA 4A2BA 2V7YA 3CJ7A 4FWSA 5AZIB 1HX1A 1TYQB 4RCHA 2OANA 5EOYA 1YAGA 3KZBA 1S22A 4WQ5C 2P9NB 3D2FB 1ATSA 3HSCA 2QWNA 1NLVA 5AQTA 5AZJB 1GLEG 4BRKA 2A6AA 5BRFA 1QZ5A 4CBXA 2E88A 2FSKA 4DHYA 1NM1A 5AFUH 4B9QA 1S3XA 5BPMA 4BRDA 2KHOA 3ZX3A 3HM8A 1QQMA 4BRMA 1NGAA 2P9UB 4WQ5A 3VENA 5FPMA 3U9ZA 3IDHA 4BRGA 5LJWA 4BG8A 3R9PA 5JLFA 2P9SB 5TKYA 1Q18A 2P9KB 1GLCG 1JCGA 1SAZA 4CBWA 3MMVA 2IVNA 1WOQA 3M3ZA 3QMLA 3BEXA 2QXLA 2P9IB 2Q1NA 2VCPA 4IO8A 2AP1A 5F2RA 5LY3A 1KXPA 3QICA 3ULEB 4BGAA 3VOVA 3L0QA 5B8HA 2E2QA 3I8BA 3AY9A 4BROA 3EN9A 5ELZA 5LJVA 5BN9A 3GL1A 1IJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CM5A 3CCSN 1S1TA 4E72A 4CJVA 3QERA 3MWPA 2GUIA 3O3HA 1N34K 4FOIA 2N69A 1SV5A 1JXBA 2YIOA 3VERA 1J5OA 3HPHA 3L8BA 2QA4N 1N4NA 5C25A 5KQDA 2YIPA 1S6QA 2D5RA 2LKBA 2E1ZA 1NWKA 3EKUA 5FPDA 3L2UA 3BP8A 4JHDA 3NGIA 1S1UA 2F9TA 1BGXT 3K5MA 3ZLJA 1D9DA 4IFYA 4YOWA 1KLNA 3O4NA 5GIPA 3IKMA 1D5AA 4Z94A 4H0VB 4DLEA 3J7ZO 4W5RA 4CJ4A 4OLBA 4B1VA 1C0MA 4JKAA 4C1NK 2YNHA 3N4PA 1U47A 2NRHA 3F73A 1YJNN 4ISFA 1HR0K 3R2VA 2ASCA 3SCXA 1MWKA 4FJKA 3AO5A 3SAHA 4M3XA 4IFVA 1K8AO 1AHOA 4AM7A 1IBKK 1OH8A 4I6MA 4BRLA 4DR5K 3P38A 4DB3A 3EEQA 3RRHA 3QEPA 4JNEA 3VQ9A 1GLBG 4FLZA 3THXA 3RMAA 3BDPA 3CJCA 4BRFA 2O4GA 2G8WA 4FJHA 3LDQA 4KTWA 3CF5L 1OZZA 5EY4A 3DM2A 4FW2A 3TSUA 3F9MA 3JAMO 1VQLN 4CFAA 4HUFA 4KHUA 1B7DA 2Q0RA 2NRWA 3J8AA 1DJTA 4KBOA 3H6EA 4M63C 5GAEP 1XMOK 3FZMA 3QFUA 2HF4A 4H0PA 1BWFO 3DWLA 1IBLK 1OH5A 2CH5A 4CF0A 1C1AA 3MX5A 3R8EA 5C12A 1FXXA 2I61A 3VEZA 4CZGA 2KPYA 2UYTA 5A2QO 1QZ6A 2IIRA 5CHIA 2ZGYA 4IOCL 1DT9A 2IDOA 3LWMA 1VSEA 5CR4A 4DTOA 2JLEA 4W5NA 4I6MB 3V9XA 1EWQA 3HI0A 4EP5A 1T7BA 1HRHA 3ZSRA 1NGJA 3Q7CA 2VWKA 5CZ1A 3THXB 4RW4A 3HPOA 1BCGA 1WNSA 2VGMA 3KLIA 2QWOA 3OS0A 3M8RA 2RKIA 4CFDA 3U6FA 1RDBA 4OKKA 4X62K 4CJ5A 4LFCK 3HOTA 3HM9A 5D3GA 4OPJA 3MAQA 4DFPA 1N6QA 1MA9B 1ZFUA 2WC9A 3F5TA 3QEIA 5M1OA 4B3MK 4H5RA 4E7HA 4F3TA 4OPAA 2F9WA 4RW6A 4OO1J 1POIA 4E1NA 3HP9A 4CJ3A 5BRDA 4DUZK 2GTDA 3V1QA 2E1YA 3RMDA 4H0TB 4FLYA 3MXIA 4PKGA 3J7AP 4Z4EA 1BA0A 1LCUA 3NCIA 1QQCA 3BF3A 1X9SA 3MXMA 4K25A 1UA0A 4CJKA 5I9EB 1VQMN 3OYJA 2HF3A 1GOBA 1YVUA 4DSIA 1GPSA 2JDQD 2WUSA 4JI8K 3SMSA 4B1WB 4FK2A 1LW0A 4QS9A 1TKZA 1S5JA 1J5EK 1Z05A 3KP0A 3O4WA 3U9DA 4DR3K 1UGLA 2X6SA 1K8KA 3VQ7A 1NK8A 2F8SA 3VTIA 3U3GA 4AHSA 3MX2A 2G8FA 2M8BB 1EQYA 3VGLA 4AEIA 1SEGA 4BR7A 2GL1A 5FLXO 4E3SA 3KK1A 4PQUA 2J4RA 4JD2A 3VF4A 3I8DA 4CFCA 5FPNA 3CCEN 1ASUA 2A42A 4DSFA 1T6DA 3RMBA 4FLXA 3KKRA 3CCMN 4IZ9A 1U49A 2E2NA 2GWKA 3ITHA 4DWIA 3T1HK 3VQCA 4ELTA 2QK9A 1WLJA 3I56N 5C2DA 4FJXA 4DQ8A 3SUQA 3PX4A 5ADXH 3EE9A 2FSJA 2YHYA 1SKSA 4FJJA 1HKBA 1T03A 4M3TA 2QWLA 1PX9A 4KHPK 3ZSYA 2P9IA 3CJAA 1YI2N 2A40A 5E84A 2FF6A 4QS7A 2NZTA 4YORA 2HHVA 2Q97A 4DMNA 5AQNA 5H1SQ 1IH7A 4ILJA 4JD2B 4FJGA 1VNAA 1RTDA 1VK0A 4DKWA 4BC3A 4CERA 4FJ9A 3Q7BA 3LDNA 1U6ZA 3MCPA 4DQSA 3H46O 4XEIA 3VQ6A 1L3TA 4LFBK 4HWIA 2HHSA 2W00A 1BCMA 3ZSVA 4CK1A 3ZT2A 4AHUA 3M6GA 4HUGA 1NU0A 1XNQK 2QWQA 4RW7A 2DFHA 4KHWA 4FPAA 5TKWA 4IG3A 4FO0A 4O8KA 3SQ0A 4BDPA 3N4QA 2OYQA 2YJEA 3L6QA 5AQQA 5C42A 2IC3A 4KI4A 1WN7A 5CZ2A 1VQ6N 2KBKA 4A2AA 1JLGA 2PFUA 5J2MA 5BRHA 3VTHA 3SUOA 1NGIA 3KWGA 3OYHA 4Q0BA 1K73O 3OBWA 4BEBA 1NKCA 4LFAK 1CXUA 1WB9A 3KKSA 3OYAA 4BRHA 1N32K 3BK3C 1OMYA 3UKUA 3FZLA 4FWOA 4DTMA 3QBWA 1X9JA 4W5OA 4JV5K 1UA1A 3J81O 3O1BA 5BREA 1NJXA 4FLUA 4DTPA 3CCJN 4DQIA 1XC3A 1WSJA 1WSHA 4MDBA 2EWSA 5KPZA 2O8DA 1K8BA 3IAYA 1VQ5N 3TPQA 1YXQA 1T0ZA 3UKRA 4WFNL 1XRSB 4JKCA 1FH3A 5AQLA 3CXCM 4PY5A 4CHYA 5CYMA 3CFOA 3AVNA 3VF2A 1NJIO 5AZIA 3PV8A 4CCHA 2WOMA 1KFSA 3LDLA 2P9NA 3D2FA 1EKEA 4N41A 2E6MA 5KRSA 1SS6A 4FWQA 3BY5A 3HVRA 3KTQA 3UKUB 2LY5A 1DGKN 1YJWN 4TSXA 2R7YA 2QW9A 1V4SA 1ZBLA 4E0DA 3W3DA 3O9TA 4IDKA 4KYPA 4GV6A 5HBMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CM5 A;  3CCS N;  1S1T A;  4E72 A;  4CJV A;  3QER A;  3MWP A;  2GUI A;  3O3H A;  1N34 K;  4FOI A;  2N69 A;  1SV5 A;  1JXB A;  2YIO A;  3VER A;  1J5O A;  3HPH A;  3L8B A;  2QA4 N;  1N4N A;  5C25 A;  5KQD A;  2YIP A;  1S6Q A;  2D5R A;  2LKB A;  2E1Z A;  1NWK A;  3EKU A;  5FPD A;  3L2U A;  3BP8 A;  4JHD A;  3NGI A;  1S1U A;  2F9T A;  1BGX T;  3K5M A;  3ZLJ A;  1D9D A;  4IFY A;  4YOW A;  1KLN A;  3O4N A;  5GIP A;  3IKM A;  1D5A A;  4Z94 A;  4H0V B;  4DLE A;  3J7Z O;  4W5R A;  4CJ4 A;  4OLB A;  4B1V A;  1C0M A;  4JKA A;  4C1N K;  2YNH A;  3N4P A;  1U47 A;  2NRH A;  3F73 A;  1YJN N;  4ISF A;  1HR0 K;  3R2V A;  2ASC A;  3SCX A;  1MWK A;  4FJK A;  3AO5 A;  3SAH A;  4M3X A;  4IFV A;  1K8A O;  1AHO A;  4AM7 A;  1IBK K;  1OH8 A;  4I6M A;  4BRL A;  4DR5 K;  3P38 A;  4DB3 A;  3EEQ A;  3RRH A;  3QEP A;  4JNE A;  3VQ9 A;  1GLB G;  4FLZ A;  3THX A;  3RMA A;  3BDP A;  3CJC A;  4BRF A;  2O4G A;  2G8W A;  4FJH A;  3LDQ A;  4KTW A;  3CF5 L;  1OZZ A;  5EY4 A;  3DM2 A;  4FW2 A;  3TSU A;  3F9M A;  3JAM O;  1VQL N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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