3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
1NGEA 4BC2A 4HWIA 1BA1A 1T6CA 3M3ZA 1T44A 4EFHA 5JMVA 4CD3A 4L3QA 5AQKA 3HZ6A 2WUSA 3ULEB 2F9WA 4B1WB 5JLFA 5BREA 2EWSA 3MN7A 2Q0RA 3VEZA 4XH4A 2YHYA 4WQ5C 4NB4A 1HX1A 1HUXA 4FOEA 4PKIA 4PL7A 5AQQA 2A42A 4YDUC 4BC3A 2HF3A 3QFPA 3UE5A 5KQ8A 2ITMA 3R9PA 1BU6O 5AQOA 3SK3A 4IWVA 4WQ4C 1RFQA 4QS8A 3ID8A 4ISFA 2YCHA 4IJAA 4H0XB 1ZBSA 2QWNA 3VF2A 4DCHA 1OKJA 5AQMA 3VEWA 1RGIA 4A61A 5AQLA 2GTDA 4Y0WA 5AZJA 4AM6A 2P9PA 1QZ5A 1NGJA 3D2FB 5ELZA 4CBXA 2BTFA 3ZETA 5AZIA 4GNIA 3GL1A 3ZEUA 3CI5A 3DXMB 3KVGA 1SZ2A 3BF1A 3A5OC 2IVPA 4GY2B 2HF4A 4BGBA 2CGLA 4JAXA 5FPMA 3P4IA 1MDUB 4FWSA 3H46O 3I8BA 5BPLA 2Q0UA 3HSCA 2E8AA 1ATRA 3FR0A 3FGUA 1QQNA 3MK6A 2A3ZA 4PL8A 3O80A 1JCFA 3CETA 3JS6A 3LDPA 4I6MA 3WQTA 1ATNA 3U4LA 4BG9A 4FWPA 2GEMA 2NZTA 3A5LC 4CD1A 4IZ9A 3DAWA 3BF3A 3EKSA 3D2EA 4MO4A 3TU5A 3LM9A 2VYPA 3IUCA 3VF4A 4BREA 3SMSA 2D4WA 2P9NA 3C0BA 3RSEA 5AQYA 3LDQA 5AZJB 4H5RA 2NRHA 2P9PB 1IG8A 3O08A 2CGJA 2HMPA 4FWOA 3ZETB 5AZIB 1YAGA 1DGKN 3M6GA 3ZEUB 3CJ9A 1QQOA 3L4IA 3A0IX 4JD2A 2Q36A 3QMLA 1KAYA 3KHYA 4O8KA 3L6QA 3ULEA 2P9SA 1Q18A 2NLXA 5BRDA 3I33A 2P9KA 3WT0A 4BRCA 3WEEA 4IO8A 1QZ6A 3VEOA 2QW9A 4AM7A 5AQSA 5AQZA 3UKRB 4DB3A 3VGKA 3MMVA 2A41A 3VESA 3FFKB 4I6MB 3TPQA 5BPNA 1QQMA 3QICA 4EAHD 3D2EB 5AQPA 3W0LA 4BGAA 3R6MA 5BRHA 2ZWHA 4FSVA 5AR0A 5AQIA 3HTVA 4BC5A 3ENOA 2P9NB 3RSEB 4WQ5A 4BG8A 3R8EA 5TKYA 3VPZA 3LDLA 3DXKA 5AQVA 4YDUA 1NGFA 5FPDA 3DXMA 3U9ZA 3O1BA 4RCHA 3U8XA 2V7YA 4K43A 4WQ4A 3MCPA 4JD2B 4CZHA 2FSJA 4C23A 2P9SB 2V51B 4FWQA 1GLEG 3GDQA 4CI6A 1C0GA 2P9KB 5EX5A 1HKGA 3AAQA 1GLCG 4J8FA 3WEEB 5KQDA 1GLDG 2W41A 4FWMA 2GELA 1TUUA 3WXJA 3OHRA 3AAPA 1V4SA 5LY3A 2AA4A 3EZWA 3VOVA 4BRFA 4MLEA 1KAZA 2E2NA 4CZJA 2E2QA 4H03B 4XH5A 1X9JA 5E26A 3UKUA 2GUPA 4EHUA 3IMXA 2P9IA 4H0PA 1HPMA 2V7ZA 2IVOA 3DXKB 4RTFD 4B1YB 2W40A 4CZKA 2QWMA 4H5TA 4CZFA 3MDQA 5CE3A 3O4WA 2CH6A 2VCPA 3QBXA 4IJNA 4QS7A 4CJ7A 3MN5A 4BRHA 1X3MA 2QXLA 1X3NA 3UKRA 3FE1A 2P9UB 3D7EO 2KHOA 2E2PA 5E84A 4E1JA 2D0PA 2D0OA 4B1XB 3JXUA 1GLAG 1LOTB 2YHXA 3CERA 4XEIA 2V52B 3GOIA 5AQGA 5AQUA 1T6DA 1C0FA 3UKUB 4BRKA 2I7PA 3A5MC 3BUZB 5AFUA 2A5XA 4JHDA 3BEXA 3CJ7A 4BRQA 2CGKA 2E1YA 3QDKA 4BQLA 4BRAA 2PBDA 3H3OB 2A40A 3WQUA 2ASOA 4H0TB 2P9IB 4HTLA 5EOYA 3GBTA 2E1ZA 3CIPA 3QB0A 3MN9A 5JICA 3A5NC 3WUHA 4M7YA 4CZIA 1GLLO 5KPTA 1NGCA 4H0OA 2FF6A 3ENHA 3VETA 3WXKA 4BRMA 2YHWA 3O5BA 3ZX3A 3VGLA 1NLVA 2E20A 4DQ8A 1ESVA 2OANA 2Q1NA 1DKGD 2H3GX 3FZHA 4A2BA 3BP8A 4H5WA 5AQFA 2QWPA 1U2VA 1NBWA 1P8ZA 1LCUA 4O5FA 1KXPA 4B1VA 3O1WA 4K41A 1NGHA 1GLJO 3W3DA 3AY9A 3M1FA 3QBWA 4FPBA 5AQHA 3LL3A 3VENA 1BO5O 1ATSA 1YVNA 1NGDA 1NWKA 1TUYA 1ZXOA 4JHDB 2A6AA 1HKCA 3S41A 5JLHA 1ZC6A 5AQXA 4EIAA 5BPMA 3FLCO 3CJCA 5KPRA 4FPAA 1D4XA 2CH5A 4BR9A 1XC3A 2AP1A 5F2RA 1HJOA 2BUPA 4H5NA 1BDGA 1NGIA 4CZMA 4B1UB 4BRPA 2FF3B 2F9TA 4F9OA 1S3XA 5EY4A 2P9UA 4FO0A 1HLUA 4FWRA 1CZAN 2FSNA 2QWLA 3H1QA 3HBTA 5LJVA 3DWLA 4K42A 1U2VB 4FL9A 3VEVA 5BRFA 4WYBA 2FSKA 2PAVA 4BR4A 4RWTA 3CJAA 3MN6A 5AQWA 4BR7A 4B1ZA 4H0YB 1BOTO 2D1KA 4A2AA 3LDNA 1WOQA 5F0XA 3C7NA 3LDOA 1SAZA 1NM1A 1TYQA 2DPNA 4H0VB 3DJCA 3GG4A 2YJFA 1BWFO 1YUWA 3VGMA 1G99A 3B8AX 3SJHA 1E4FT 2FXUA 4BR0A 3EKUA 5LJWA 4CBUA 3VEXA 3SMPA 1MWKA 4BRLA 5AQNA 5FPNA 2UYTA 2GWJA 4ISEA 5BR9A 2P9LA 5AFUH 4MLHA 3EN9A 3H1VX 2QWRA 1Z6RA 2E88A 2FLOA 3FZMA 1HKBA 2QWOA 3O6WA 4QS9A 1SQKA 2J4RA 3VEYA 1KAXA 2YI1A 5AQTA 1NGAA 1IJJA 2IVNA 4BC4A 4FWNA 1JCEA 4K25A 4LC9B 2ZGYA 4FWLA 1YXQA 4BRNA 1V4TA 4JNEA 3H6EA 2E2OA 2ZF5O 3FZLA 4PKHA 4BVPA 3FZKA 2Q31A 3O8MA 4DHYA 4Z94A 3IFRA 1U6ZA 3C7NB 3ATVA 4M63C 2QM1A 1TYQB 4BR5A 2YJEA 4BRDA 3U9DA 4FWKA 2HOEA 3VERA 1EQYA 1NMDA 1Y64A 3EO3A 1NGBA 3F9MA 2QWQA 1K8KA 1RDWX 2ZGZA 4B9QA 5FPEA 4NO7A 4PKGA 3A8YA 3QFUA 4BRIA 1WUAA 3HM8A 3SLCA 2GWKA 1E4GT 3KZBA 1GLFO 4BRGA 2P9LB 2VWBA 3VF6A 4BVOA 1XQSC 3AARA 4CBWA 4KBOA 1R59O 3CQYA 1NGGA 5BN9A 5BN8A 3WXLA 4BQZA 1Z05A 3H45C 4ISGA 2Q97A 3CQXA 4M7XA 1MWMA 1DEJA 1JCGA 5EVZA 1QHAA 5KPZA 3L0QA 4IXCA 1J6ZA 2I7NA 1MA9B 3ZX2A 3J8AA 4FOIA 4XH1A 3ATUA 3UB5A 1BUPA 5EXWA 5ADXH 1GLBG 1H1VA 3LM2A 3WXIA 3G25A 4A62A 4BR2A 1BG3A 3EL2A 5B8HA 1K8KB 3HI0A 2Q2RA 4CZLA 1S22A 4CZEA 1BA0A 3H3NO 3CJBA 3IDHA 2ASMA 5AQJA 5I9EB 3ZX0A 2IIRA 5AQRA 3CJ1A 5F1XA 3GE1A 4JN4A 1XUPO 3CHWA 4H5VA 4CZGA 4MO5A 4EHTA 2ASPA 4BROA 3FZFA 3D2FA 5ADXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ9N 4FK4A 3G4SN 3O9TA 1UA1A 1T6CA 4OKKA 3RMDA 4R79A 4RW9A 5AQKA 3HZ6A 5AJ3K 4CEDA 3N4PA 1EO1A 4C8MA 4CVNE 4WQ5C 3LP2A 3J7AP 2O8CB 4YDUC 1D9DA 3P83D 2ITMA 4CE9A 5AQOA 1XNRK 3ASMA 3SK3A 2KTQA 4JKBA 4DFPA 3DRRA 2YKNA 4IJAA 3OS2A 3AVMA 4H0XB 2YC1C 1SUQA 4AHCA 4Z4IA 1EWRA 3NVKA 2KGQA 2G8UA 1RGIA 4A61A 3S3MA 2GTDA 1VQPN 4AM6A 1QZ5A 4R5PA 4CJVA 3ZETA 1N6QA 3ZEUA 3F73A 1FK9A 3CI5A 3KVGA 3T7ZA 1NOZA 3KLHA 3THXA 2HBJA 4E7IA 4CJ5A 3T1AA 1S9GA 4JAXA 2ZJRL 5FPMA 4Y1DA 1BCMA 1KVAA 2VQEK 1S1WA 3QERA 1I39A 3DM2A 2E8AA 4IFEA 3FR0A 1W97L 1WSGA 1RDCA 5HRRA 3G10A 1BK8A 3O80A 3SAHA 3JS6A 1NK8A 4LF9K 4ZHRA 1ATNA 1LQHA 2WTUA 4BG9A 3SAFA 1NK5A 4IZ9A 4ELTA 3C95A 2MZ0A 2WFBA 3IUCA 3VF4A 2KBKA 4BREA 1EX4A 4N76A 3N4QA 5FROA 3LDQA 5AZJB 4YHHK 4H5RA 2RPIA 2KBJA 2P9PB 1SV5A 1LV5A 3QEIA 2HVIA 1JZBA 1IG8A 4JI8K 4KB0A 4BECA 1HMVA 1YAGA 1TVRA 3RRGA 4C8LA 1JJ2M 3ENBA 4KI4A 4JKDA 4OO1J 1QQOA 3J81O 4B3MK 4O8KA 2P9SA 2NLXA 3S9HA 5C2FA 3BDPA 3WEEA 4IO8A 3UKRB 4DB3A 1NK6A 4BEBA 4I6MB 5BPNA 3DLBA 4YOYA 3ZLJA 1YJWN 3QICA 3QINA 3J80O 3D2EB 4BGAA 4B8CA 1XNQK 5AQIA 4GV6A 3T1YK 2P9NB 2E2FA 3RSEB 4BG8A 2FBXA 4CGFA 4WFAL 3CCRN 3KIOA 1FW6A 3DXKA 1QVGM 3OYAA 1QTMA 2QXFA 5FPDA 1QHTA 3CYMA 3U9ZA 4CF9A 4PHTX 1ZUTA 2LY5A 4M42A 5C42A 2YIOA 1BL3A 1C0MA 4K43A 4AILC 4WQ4A 1BI4A 4CZHA 1Q7YO 3P31A 1RT3A 4FWQA 4E72A 3GDQA 1I3AA 1HKGA 1GLCG 4OGEA 3BK3C 3OYGA 2P5OA 3DLGA 3WXJA 1TAQA 1XHXA 2JWLA 4CIFA 3O4QA 1C0UA 3F2KA 3VOVA 4O5BA 3OS0A 4E1NA 3NAEA 3SYZA 1KAZA 2KQ2A 1RTHA 4UAFE 2E2NA 4QAGA 4CZJA 3ZCMA 1S1XA 3IKMA 5M1QA 1M90O 3C6HA 4XH5A 1KCFA 2KW4A 1P90A 3SBTA 4M3ZA 3MCAB 4DFMA 1FKPA 2KJAA 1IKXA 3PSIA 2Z1HA 4CIEA 1U47A 4H0PA 1T03A 4RTFD 4OKEA 4E7HA 1MR4A 4CHZA 1U48A 2Z1IA 3EEQA 5CE3A 3OS1A 4QCLA 1T7BA 1JLEA 3QBXA 4QS7A 3MN5A 3QETA 4DTUA 4JKGB 4X66K 4DLEA 1X3NA 3FE1A 3DLEA 2P9UB 2NRWA 4YNQA 4C1NK 1WB9A 3OW2M 4U7BA 4GMJB 4E1JA 1OH5A 4B1XB 1ASUA 1GLAG 1LOTB 4XEIA 4YFUA 3AVLA 2DY4A 3PIOL 3LPTA 3K59A 5AQGA 4PA1A 4HUFA 1C0FA 2G2KA 4NCGA 2A5XA 4JHDA 1L3VA 4BRAA 4B9MA 2PBDA 2ASOA 2P9IB 3AVHA 1UWBA 3TAQA 5CYMA 3QB0A 2FBYA 3THYB 3CXCM 2I5JA 5KPTA 1GLLO 2HBLA 4KV8A 3ENHA 3O3GA 2RKIA 4IDHA 3HPOA 2O4IA 2YHWA 3VGLA 2NRRA 3I56N 1NLVA 4FJKA 1FH3A 3NF7A 3MX5A 4HCBA 3K5MA 3SQ1A 1WWNA 4UY8O 4A2BA 1U2VA 4DR2K 1P8ZA 1NK4A 3K57A 2M8BB 1SN4A 1W0HA 4B1VA 4OX9K 3RMCA 3SAGA 3PSMA 2IGIA 4FYDA 4Z4GA 1GLJO 4O8UA 3AY9A 3LL3A 1SKWA 3SZ2A 1ATSA 5M1NA 3TAPA 1OVYA 3VTHA 5JLHA 3KK2A 2GMOA 4F3TA 4KKOA 4FPAA 1XC3A 4CGDA 3O9SA 1BQNA 5F2RA 4MDBA 4DFJA 1WLJA 3RR7A 4KHPK 1VSIA 4CZMA 1CZ9A 2C1IA 4B1UB 1K8BA 1NMNA 2FF3B 2F9TA 4F9OA 1N32K 4CEFA 1LQIA 4OPHA 3R3LA 4V1DC 4NXNK 4FWRA 3H1QA 2ZJPL 3C6TA 5LJVA 3JSMA 2G8WA 3DWLA 4K42A 3L4QA 1VQNN 1Z26A 1IKVA 3O3FA 4FLXA 1WSFA 4FW1A 4BR7A 1JXCA 1CXQA 4CEAA 3OYLA 4A2AA 1LQQA 3LDNA 3AO5A 1XWLA 1VHXA 1I2VA 5IT9O 4H0VB 4CJQA 1ITGA 4B08A 4HCCA 2HMIA 1DTQA 5C10A 3HO1A 1FJGK 2FXUA 1N34K 5KI6A 5LJWA 3OY9A 1U49A 5AQNA 1B92A 3AA2A 1NKEA 2UYTA 5CZ1A 4ISEA 2X6SA 1RBVA 5BR9A 2QEXN 3H1VX 2QWRA 1S6QA 2FLOA 2JWKA 3VQQA 5C12A 3T1HK 1U4BA 3ZT1A 4GV9A 4DTXA 4F2SA 3U6FA 2VG5A 3QNOA 1NGAA 1L3SA 1IJJA 4NYNA 3ALYA 3NVMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VQ9 N;  4FK4 A;  3G4S N;  3O9T A;  1UA1 A;  1T6C A;  4OKK A;  3RMD A;  4R79 A;  4RW9 A;  5AQK A;  3HZ6 A;  5AJ3 K;  4CED A;  3N4P A;  1EO1 A;  4C8M A;  4CVN E;  4WQ5 C;  3LP2 A;  3J7A P;  2O8C B;  4YDU C;  1D9D A;  3P83 D;  2ITM A;  4CE9 A;  5AQO A;  1XNR K;  3ASM A;  3SK3 A;  2KTQ A;  4JKB A;  4DFP A;  3DRR A;  2YKN A;  4IJA A;  3OS2 A;  3AVM A;  4H0X B;  2YC1 C;  1SUQ A;  4AHC A;  4Z4I A;  1EWR A;  3NVK A;  2KGQ A;  2G8U A;  1RGI A;  4A61 A;  3S3M A;  2GTD A;  1VQP N;  4AM6 A;  1QZ5 A;  4R5P A;  4CJV A;  3ZET A;  1N6Q A;  3ZEU A;  3F73 A;  1FK9 A;  3CI5 A;  3KVG A;  3T7Z A;  1NOZ A;  3KLH A;  3THX A;  2HBJ A;  4E7I A;  4CJ5 A;  3T1A A;  1S9G A;  4JAX A;  2ZJR L;  5FPM A;  4Y1D A;  1BCM A;  1KVA A;  2VQE K;  1S1W A;  3QER A;  1I39 A;  3DM2 A;  2E8A A;  4IFE A;  3FR0 A;  1W97 L;  1WSG A;  1RDC A;  5HRR A;  3G10 A;  1BK8 A;  3O80 A;  3SAH A;  3JS6 A;  1NK8 A;  4LF9 K;  4ZHR A;  1ATN A;  1LQH A;  2WTU A;  4BG9 A;  3SAF A;  1NK5 A;  4IZ9 A;  4ELT A;  3C95 A;  2MZ0 A;  2WFB A;  3IUC A;  3VF4 A; 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