3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
3ZETB 1RFQA 3R6MA 3D2FB 3SLCA 5AQUA 5FPEA 4B1XB 5AQHA 4FWMA 5F1XA 4DQ8A 3W3DA 5AQMA 5F2RA 1H1VA 2YI1A 4M7XA 2ASMA 2QWLA 5BRDA 3R8EA 3EN9A 5CE3A 1R59O 4BC5A 2AP1A 3SK3A 3LM2A 2E2NA 3SMPA 3H45C 3O8MA 4K43A 4CZHA 2FSNA 4CD1A 1U2VA 3CJBA 4WQ4C 3FGUA 5AZJA 5EVZA 4CZLA 5KQDA 2GWKA 2P9UB 4B1UB 5BPLA 2V7YA 5E84A 2E88A 4BC4A 2KHOA 5AQQA 3VPZA 3MDQA 2E2QA 1BWFO 3TU5A 4BG8A 4CBUA 2H3GX 2YCHA 1RDWX 4JNEA 1G99A 2FLOA 4CZGA 1Q18A 2NRHA 1BO5O 3D7EO 2GEMA 3EO3A 5EY4A 1HLUA 2VWBA 5AQGA 5ELZA 3FE1A 2P9IB 4H0XB 2IVPA 4BRFA 5JLFA 4PKGA 5AZJB 3ULEB 4B1YB 1NGFA 4WYBA 2J4RA 3QMLA 2QXLA 3A5LC 4BR4A 3WEEB 3ZEUA 4A2AA 3DXKA 3U9ZA 3H3NO 1HKGA 4BROA 3B8AX 3WXKA 1X3NA 3KVGA 1QHAA 1MWMA 3CJ9A 3WQTA 4FWNA 4BR5A 1MA9B 4ISGA 3LDQA 3ZX0A 3FZLA 4M7YA 2Q97A 1TUYA 3MN9A 5AQWA 2V7ZA 3HM8A 1YAGA 4QS7A 4XH4A 1HPMA 3CI5A 3ZX3A 2GWJA 4BREA 2ITMA 4CJ7A 3LM9A 4CZIA 3ZEUB 4AM6A 3ZX2A 5AQJA 3DXMB 5KPZA 3DXKB 3J8AA 4Y0WA 5LJVA 3IUCA 3SJHA 4M63C 3TPQA 4EHTA 4IZ9A 2HF3A 2YHYA 1X3MA 2ASOA 3I8BA 3UKRA 1T6DA 2YHWA 2QW9A 3EL2A 1ATRA 5AQFA 2UYTA 3MN5A 2Q1NA 2YHXA 1NGAA 4H0VB 4B9QA 3P4IA 3UKUA 2QWQA 1NMDA 3M1FA 1HUXA 2E8AA 5B8HA 5KPTA 3FLCO 3EKSA 4BRMA 3IMXA 4EFHA 2CH5A 2VCPA 1V4SA 5KQ8A 4JD2B 1NWKA 4ISFA 1NGJA 2P9NA 4CZFA 4EAHD 3M3ZA 1X9JA 1GLFO 1NBWA 3SMSA 4FWRA 3A0IX 5E26A 4BR0A 2PBDA 4RWTA 3U4LA 4EHUA 5BRFA 3WXIA 3CJ1A 3WT0A 2FSJA 1HX1A 3GBTA 4BVPA 5JICA 3UKUB 3KZBA 3OHRA 3VF4A 2D4WA 3DAWA 3ATVA 4CZEA 1T44A 3VGKA 3A5MC 2CH6A 1IJJA 1SZ2A 4FWLA 4CZMA 1LCUA 1WUAA 1GLEG 1E4GT 2GTDA 4A2BA 2A6AA 1CZAN 4I6MA 1BDGA 2W41A 4CBXA 4FL9A 1QQNA 3D2EB 1P8ZA 1HJOA 3L4IA 4PKIA 5LJWA 2Q36A 3M6GA 1MWKA 3FZHA 4MO4A 3CQXA 2HOEA 3U9DA 5F0XA 4BVOA 1IG8A 2A40A 4CBWA 1BG3A 2FXUA 3CIPA 5AQZA 1C0FA 4E1JA 3QFPA 2CGLA 3HSCA 1BA1A 5AQXA 1RGIA 2GUPA 1BA0A 2VYPA 4XH1A 4BRLA 4FWQA 5BN9A 4DB3A 1YVNA 3VEVA 1TUUA 3H46O 2P9LA 1U2VB 1Z05A 1TYQA 3FFKB 2D0OA 5AZIA 4MO5A 5ADXA 4ISEA 1QZ5A 4YDUA 3G25A 5BPMA 1BU6O 1YXQA 2Q0RA 4YDUC 4DCHA 1KXPA 1DKGD 3VGLA 2ZWHA 1NGDA 2D0PA 3BF1A 4BRKA 5AQVA 1ESVA 4BRAA 4Z94A 5FPNA 3VESA 3UE5A 1U6ZA 3BF3A 3HZ6A 3R9PA 2YJFA 4BR2A 4BRGA 4K42A 4MLEA 3MN6A 2IVNA 1D4XA 1XC3A 3LDPA 3L6QA 4CI6A 2E2OA 4FO0A 4O5FA 1NGHA 2P9SA 4JAXA 4K25A 1S3XA 3C7NA 1Y64A 2FF3B 5EOYA 3FZMA 3KHYA 3L0QA 4A61A 1K8KA 2GELA 4H5WA 4NB4A 4DHYA 3LDOA 1C0GA 3ID8A 4JHDA 5JLHA 3O4WA 5I9EB 3O5BA 4CZKA 4B1VA 3RSEA 1T6CA 3LDLA 2P9KA 3QICA 5EX5A 2P9PA 4H0YB 2PAVA 3CJ7A 4FWKA 4CD3A 3GDQA 3CHWA 3VENA 5FPDA 4RTFD 1WOQA 3VETA 1NGCA 1ZXOA 2CGKA 4BC3A 1JCEA 3UKRB 3GG4A 1Z6RA 3ZETA 4H5RA 3QFUA 3CERA 4F9OA 4PKHA 4H5TA 3FZKA 2V52B 5AFUA 3O1BA 3RSEB 1GLJO 3H1VX 4BGBA 4AM7A 1S22A 3ENHA 2EWSA 4H5NA 2NLXA 3CJAA 2QWNA 3BP8A 2BUPA 2YJEA 2Q2RA 2QWRA 2P9NB 3WUHA 2IIRA 2IVOA 5AQRA 1NLVA 2D1KA 1XQSC 2I7NA 5AQYA 2ZGZA 2QWOA 3O08A 3A8YA 4BRPA 4BRIA 4WQ5A 2AA4A 4FPAA 1JCFA 4H0OA 3QBXA 4IXCA 2E1YA 1BUPA 4IO8A 1E4FT 2P9UA 4BG9A 4BRHA 4IJAA 3JXUA 3U8XA 1MDUB 1BOTO 4WQ5C 3O80A 4FWSA 3AAPA 4FSVA 2CGJA 2F9TA 1NGBA 5AQLA 3WQUA 5BR9A 3AAQA 5ADXH 4JN4A 1V4TA 3O6WA 1HKCA 1GLLO 4IJNA 3AY9A 4NO7A 2FF6A 3H6EA 3HBTA 3VF2A 4B1WB 3QBWA 4WQ4A 3WXJA 1OKJA 3WXLA 4BQLA 4I6MB 1XUPO 2P9IA 4B1ZA 5AR0A 4HWIA 2Q31A 3ULEA 4QS8A 1GLDG 4IWVA 5AQTA 2ZF5O 4GNIA 3DWLA 3EZWA 3WEEA 4A62A 1SAZA 1DEJA 4BR7A 4FWOA 3BEXA 3VEYA 1J6ZA 1NGGA 3CETA 3MCPA 3GE1A 4FOIA 1NM1A 1YUWA 2E2PA 3C0BA 4BR9A 4EIAA 3W0LA 5BREA 4KBOA 2HMPA 3GL1A 3CJCA 4BRNA 1QQMA 2QM1A 5AQKA 4LC9B 3HTVA 2A41A 4CZJA 5BRHA 2P9LB 3I33A 5AQNA 1TYQB 1QZ6A 4H5VA 3IDHA 3S41A 5AZIB 1NGIA 3VERA 4H03B 4PL7A 4H0PA 3VOVA 1GLBG 1JCGA 5BN8A 3IFRA 3DXMA 4BRCA 1LOTB 3ENOA 3JS6A 3VEZA 1NGEA 3QDKA 1QQOA 3UB5A 3VEOA 2ZGYA 4XH5A 2A42A 5LY3A 4BQZA 3CQYA 2A5XA 2QWMA 1DGKN 3O1WA 2WUSA 3DJCA 1KAYA 4FOEA 1ZC6A 4FWPA 5AQIA 3MN7A 2F9WA 4HTLA 1ATSA 4MLHA 3MK6A 3H1QA 3QB0A 4O8KA 4RCHA 4JD2A 3VEXA 4H0TB 5AFUH 4FPBA 2P9SB 3C7NB 3H3OB 2HF4A 3LL3A 1KAXA 5AQPA 3VEWA 4C23A 4L3QA 5TKYA 5EXWA 5BPNA 1K8KB 5KPRA 4PL8A 1GLAG 2I7PA 4K41A 1GLCG 2QWPA 5AQOA 4GY2B 3LDNA 1SQKA 2A3ZA 4JHDB 4BC2A 3ATUA 3FR0A 3D2FA 3F9MA 3EKUA 1KAZA 3AARA 4BGAA 3FZFA 3VF6A 2Q0UA 2ASPA 2W40A 5FPMA 5JMVA 1HKBA 2P9KB 2P9PB 3MMVA 4QS9A 5AQSA 4BRQA 2NZTA 3BUZB 2FSKA 2V51B 3HI0A 4XEIA 4BRDA 2DPNA 3A5OC 3A5NC 1ZBSA 2BTFA 3GOIA 4J8FA 3D2EA 2E1ZA 3VGMA 1ATNA 1EQYA 2E20A 2OANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZETB 1RFQA 1QSSA 3LPTA 3RMBA 3D2FB 3SLCA 3U3GA 5AQHA 5F1XA 4KHWA 1VQ8N 3W3DA 5F2RA 2G2KA 4W5QA 2YI1A 1RCHA 5BRDA 1L5UA 2FBYA 2OTLN 5CE3A 4BC5A 4CHNA 4HTUA 2XY8A 1D5AA 3H45C 3O8MA 1SS6A 4CHOA 4DV5K 4CD1A 4YNQA 3KJVA 4UADE 3O3FA 1TK0A 4ZTJA 1U2VA 1ZVGA 3CC4N 4V1DC 4WQ4C 4JKCA 3V1OA 1VQ5N 2V7YA 5E84A 2KQ2A 3OS0A 1EKEA 2G8VA 1CLQA 3S5TA 3CCMN 5AQQA 2P5GA 2E2QA 4X64K 1IV0A 3AVCA 3DLEA 2IC3A 4FM0A 1MR4A 4JNEA 2YNFA 1Q18A 2NRHA 3IKMA 4CJEA 1NE5A 2HBMA 2SN3A 1KLMA 4CHZA 3TR8A 1T8EA 2P9IB 4YOUA 4CJPA 1KD1O 2XRIA 4DSIA 4LFBK 3NFAA 3CCJN 4B1YB 3V9UA 1TK8A 1HR0K 3SV3A 2OPQA 4RW9A 1U04A 1S6PA 4FM2A 4BROA 1F21A 1L3SA 1X3NA 3AVAA 5CY4A 3KVGA 4X65K 1QHAA 1UOCA 1N4NA 3CJ9A 4FWNA 3HPGA 4BR5A 2F8SA 5AQWA 2NRRA 3HM8A 1HQUA 3DRRA 5J1EA 4BWJA 2ITMA 1LAVA 4FJNA 3CFPA 1SKWA 3LM9A 2G8HA 2OPPA 4CFAA 5AQJA 3DXMB 4E7JA 2XY6A 3DXKB 3J8AA 4Y1CA 4Y0WA 3SBTA 1DJTA 3CQ8A 1Q9XA 3LALA 1N34K 3IUCA 3SJHA 4EHTA 1X9SA 1X3MA 1JZBA 2HBKA 5AQFA 3G0ZA 3MN5A 4H0VB 3SPZA 4KAZA 2KZZA 1YIJN 4Z4IA 3TABA 5KPTA 3FLCO 4BRMA 2CH5A 3OYCA 4JK7A 4DR2K 3KLIA 3ZSZA 2YIPA 4EAHD 3QETA 3KD5E 4W5NA 3M3ZA 4CGIA 3SMSA 1BI4A 1LW2A 4MFBA 4OKEA 2PBDA 4RWTA 2LY5A 1D9DA 2IAJA 1NMNA 5BRFA 3WXIA 1N6QA 2AJQA 3GBTA 5JICA 2NY9X 1S1WA 3KZBA 5C2DA 4FLXA 3ATVA 5GAEP 4CZEA 1SL2A 4Q0BA 2LSNA 3A5MC 1IJJA 1SZ2A 4JI6K 4ILJA 4LSLA 1E4GT 1VSDA 3VN5A 2KYQA 4I6MA 3VQ6A 3SPYA 5I3UA 3UIQA 3D2EB 1DTTA 4CJRA 4I2QA 3AO3A 4O55A 1IBMK 5LJWA 3M6GA 3MECA 3CCRN 4B9SA 5F0XA 4YORA 3CYMA 1IG8A 3MEEA 5CYQA 4Z4FA 4E1JA 3JAMO 5DMRA 1NG9A 1BA1A 2GUPA 2VYPA 1YF5L 2VGMA 1TUUA 4F2RA 1TKZA 1U2VB 4QOZB 1EX4A 1TYQA 3FFKB 3SV4A 3ZT3A 3TAGA 1K8BA 1CXQA 1RDAA 1QQCA 4IFEA 3WNGA 3F5TA 1KCFA 2D0BA 4X66K 1DKGD 2D0PA 2KFNA 3BF1A 3BZKA 5AQVA 3AVNA 1ESVA 3SUQA 4ID5A 3M5RA 4BRAA 1U47A 2JLEA 3IS9A 4RW6A 2ZM6K 4IFVA 1HNZK 5DK5A 1SN1A 1U6ZA 2YJFA 3SZ2A 5HOOA 2E3GA 4K42A 4CHYA 3IRXA 3OJSA 3MN6A 1VSFA 1VSMA 2UUBK 5J2PA 1JL1A 3BZCA 3QNOA 3L6QA 3E7RL 3MXJA 4CI6A 4FJXA 4DV4K 2NRWA 1L3VA 4JAXA 1S3XA 3PO4A 1JLQA 2E5LK 4BDPA 4CVNE 3PLAA 4KTZA 5EOYA 4EP5A 3FZMA 3L0QA 1K8KA 2KGQA 3R3LA 5LMNK 1C0GA 3TAQA 4CQKA 4DQQA 3L2WA 3ID8A 1NRBA 1TAUA 1S6QA 3RSEA 3NGZA 3V6DA 4GV9A 3LDLA 3SUNA 3O9TA 1C1BA 1BGXT 4NLBA 3DLRA 5EU7A 2HSTA 2UXDK 2P9PA 4DQSA 2NY8X 4W5TA 1T03A 5TKWA 3THVA 4RTFD 1NGCA 1IKVA 2D0CA 2A1RA 4DR4K 3K5LA 4YOVA 4U67L 1Z6RA 2VG6A 4OGCA 1CXUA 4KB0A 3OA9A 4F9OA 3DYAA 1ICAA 4EZ6A 4H5TA 2KPYA 4IFYA 1IO2A 3VA3A 4BGBA 1GLJO 1BIZA 1S22A 3G71N 1LWCA 2E6LA 2X78A 3CJAA 3DLGA 3TI0A 4DR3K 2Y1IA 2YNGA 3WUHA 5AQRA 1NLVA 1VQKN 1VNBA 2D1KA 1XQSC 4DR7K 5J2QA 5C42A 4M3WA 1BI4B 1JXEA 4BRPA 4JS4A 1TL1A 2AA4A 3VQBA 4A5BA 4JEPA 3QBXA 4IXCA 3AA3A 1BUPA 1E4FT 2NRXA 2P9UA 4DFKA 1PE4A 3THYB 3DRSA 1JL2A 3RWUA 3FFIA 4AHSA 1NGBA 3WQUA 1E3MA 1WBDA 3NHGA 4CERA 3AY9A 3KTQA 3KLHA 3H6EA 3CCVN 3RRGA 4WQ4A 3WXLA 4I6MB 1XUPO 2IGIA 1NK6A 1JLCA 1GPTA 1EWRA 2W00A 3ULEA 4B3RK 1ZU3A 4DS4A 1EWQA 4IWVA 5AQTA 3DWLA 3EZWA 3WEEA 2Z1GA 1IKYA 1OVQA 3BEXA 1NK8A 3E7UX 1FKOA 4OKKA 1NGGA 4CEOA 1NM1A 1YUWA 3K5MA 2IOCA 3CM5A 3DM2A 5BREA 2DY4A 4WFAL 4CJVA 2HMPA 3CJCA 3U3YA 1QQMA 3VMFB 2QM1A 4F3TA 4TSXA 5BR8K 4LC9B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZET B;  1RFQ A;  1QSS A;  3LPT A;  3RMB A;  3D2F B;  3SLC A;  3U3G A;  5AQH A;  5F1X A;  4KHW A;  1VQ8 N;  3W3D A;  5F2R A;  2G2K A;  4W5Q A;  2YI1 A;  1RCH A;  5BRD A;  1L5U A;  2FBY A;  2OTL N;  5CE3 A;  4BC5 A;  4CHN A;  4HTU A;  2XY8 A;  1D5A A;  3H45 C;  3O8M A;  1SS6 A;  4CHO A;  4DV5 K;  4CD1 A;  4YNQ A;  3KJV A;  4UAD E;  3O3F A;  1TK0 A;  4ZTJ A;  1U2V A;  1ZVG A;  3CC4 N;  4V1D C;  4WQ4 C;  4JKC A;  3V1O A;  1VQ5 N;  2V7Y A;  5E84 A;  2KQ2 A;  3OS0 A;  1EKE A;  2G8V A;  1CLQ A;  3S5T A;  3CCM N;  5AQQ A;  2P5G A;  2E2Q A;  4X64 K;  1IV0 A;  3AVC A;  3DLE A;  2IC3 A;  4FM0 A;  1MR4 A;  4JNE A;  2YNF A;  1Q18 A;  2NRH A;  3IKM A;  4CJE A;  1NE5 A;  2HBM A;  2SN3 A;  1KLM A;  4CHZ A;  3TR8 A;  1T8E A;  2P9I B;  4YOU A;  4CJP A;  1KD1 O;  2XRI A;  4DSI A;  4LFB K;  3NFA A;  3CCJ N;  4B1Y B;  3V9U A;  1TK8 A;  1HR0 K;  3SV3 A;  2OPQ A;  4RW9 A;  1U04 A;  1S6P A;  4FM2 A;  4BRO A;  1F21 A;  1L3S A;  1X3N A;  3AVA A;  5CY4 A;  3KVG A;  4X65 K;  1QHA A;  1UOC A;  1N4N A;  3CJ9 A;  4FWN A; 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