5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
5AQWA 4BRHA 1ATNA 1ESVA 1QQNA 4BRIA 3AAPA 2YJFA 4QS7A 3L4IA 4CD3A 3I8BA 5AQOA 4WQ4A 1R59O 3BP8A 2YJEA 4FWMA 2GTDA 3U9DA 4K42A 3JS6A 4QS9A 5TKYA 2GUPA 5AQYA 2QWLA 4FO0A 4L3QA 1ZC6A 2F9TA 1V4TA 4RTFD 3WEEA 1NGAA 5JLHA 4K43A 5AQLA 2QW9A 3JXUA 1HKCA 1MA9B 3H3OB 3KHYA 1GLJO 3EL2A 2P9SA 1NGCA 3B8AX 3H6EA 1NBWA 5BRHA 5AQQA 1EQYA 5BR9A 2HF4A 1XQSC 1GLFO 4A2AA 2P9KB 1QQOA 2E1ZA 3A5NC 5EVZA 3U4LA 2ITMA 3O8MA 3SLCA 5KPRA 3IFRA 4BRMA 3FGUA 2Q36A 2ZGYA 5AQNA 4O8KA 4ISGA 1CZAN 4FWNA 4BR7A 2P9LA 1NGHA 1X9JA 5AQRA 1KXPA 3R8EA 1KAYA 3TPQA 2FXUA 3ENOA 3UKUB 4YDUC 2QM1A 3SMPA 4K41A 3VF2A 1QHAA 3FZLA 3ULEA 3LM2A 3MN5A 3VF4A 4MO5A 4BVPA 5EY4A 3EZWA 2ASOA 4CBUA 2D0PA 1WUAA 4FPAA 4I6MB 4QS8A 4PKGA 3LDQA 3CQYA 3VEOA 2QWQA 2FF3B 3QB0A 1NGJA 1K8KB 4H5VA 5BN9A 5AQTA 4H5RA 3QBXA 1C0FA 4JAXA 5AZJB 3D2FB 5I9EB 2A41A 4BRPA 3WXLA 3VPZA 4F9OA 4H03B 4BG9A 5AR0A 1YUWA 4H5NA 2P9UA 3EKSA 4BRFA 4CJ7A 4FL9A 1YAGA 3UKRA 4AM7A 3CQXA 3QFUA 2DPNA 2FSNA 2ASMA 2D1KA 3LM9A 1BDGA 2P9IA 2QXLA 4CI6A 4FWPA 4FOEA 2E1YA 3C0BA 4BROA 2P9NA 3ATVA 4H0VB 1LCUA 2A40A 3LDLA 3BF1A 3WT0A 4H0TB 1NGEA 1OKJA 3WXIA 1GLAG 1BG3A 2WUSA 3GE1A 1NGIA 1H1VA 3GDQA 3GBTA 5AQVA 2E2NA 2W40A 5BRDA 3EN9A 1IJJA 3A5OC 2OANA 3QBWA 3ZETB 2I7NA 5E26A 1GLLO 2ZF5O 3LDOA 3M3ZA 1IG8A 3MK6A 2VYPA 3D2EA 2FSKA 4PL8A 3BF3A 3RSEB 1P8ZA 5LJWA 4B1UB 5F1XA 1V4SA 4XH1A 1Y64A 2E20A 3CJCA 3H3NO 4B1VA 4BC4A 2A5XA 4FPBA 4H5WA 3CJBA 3ZX3A 4BQLA 5AQSA 2YI1A 4XH4A 5FPEA 3GL1A 3O4WA 2GEMA 4IJAA 3VOVA 2PAVA 4GY2B 3MMVA 1ZXOA 1SQKA 1TYQB 4M7XA 4FSVA 4BRKA 1BO5O 4K25A 4FWSA 3FE1A 2VCPA 2KHOA 3LL3A 5JICA 5AQJA 3A5MC 3H45C 4B1XB 2CGKA 2HF3A 4BC5A 2QWOA 5AQPA 4FWKA 1MWKA 4A2BA 1NGFA 2QWPA 2CH6A 3FR0A 3VEXA 5KQDA 3SK3A 4H0PA 3VESA 1NGBA 5JMVA 1LOTB 3FFKB 4H0OA 1HKBA 3DXKA 4J8FA 3GOIA 4BRAA 1J6ZA 3VGMA 2IVOA 4JD2B 4CZLA 1BUPA 4BG8A 3IMXA 1U2VB 3ENHA 4O5FA 3W0LA 3O1WA 2EWSA 3CJ9A 2CH5A 3C7NB 3R6MA 4PKHA 4BR4A 1QQMA 4BC2A 1JCGA 5FPMA 4BR5A 1MDUB 3KZBA 4MLHA 1HKGA 2YHWA 2A3ZA 3FZMA 5AQXA 1SZ2A 2P9PB 4BC3A 3DXMB 2NZTA 2YHXA 3CERA 1WOQA 1ATSA 2Q0RA 1MWMA 1HJOA 2HMPA 3FZKA 3CI5A 3CIPA 4FWOA 3RSEA 1TUYA 5AFUH 5AZIA 1HUXA 2FSJA 2YCHA 4H0XB 4BVOA 4KBOA 3FLCO 1KAZA 3ATUA 3D7EO 2PBDA 3WEEB 3L6QA 2VWBA 2FLOA 4JHDA 5KPTA 1JCFA 3DWLA 3VERA 5F2RA 4CZJA 4WQ4C 2P9SB 4B1WB 3VETA 1GLDG 3WXJA 1KAXA 2E88A 3AY9A 5AQGA 5ADXA 4NB4A 3H1QA 2GELA 1BOTO 1HX1A 1G99A 4GNIA 5EX5A 5BPMA 3VF6A 1RFQA 1E4GT 2E2QA 3OHRA 1BU6O 1T6DA 4FWQA 3FZHA 3QICA 2F9WA 1HPMA 2ZGZA 4B1ZA 2P9LB 2IIRA 3IDHA 3TU5A 5AQUA 3J8AA 4M63C 4EHUA 3DJCA 1RDWX 1S3XA 1X3NA 3MN9A 3O5BA 1ATRA 4CZGA 5ELZA 2NLXA 2Q97A 1NLVA 1XC3A 2A42A 4DB3A 4DQ8A 4JN4A 2P9KA 2Q2RA 4YDUA 3ULEB 4B1YB 3MCPA 2D0OA 1NMDA 3HSCA 2V7YA 5E84A 5KQ8A 3O80A 3LDNA 4JD2A 2BTFA 3O6WA 2QWRA 4CBXA 5LY3A 4H5TA 3U9ZA 4LC9B 1Q18A 3ZX2A 4BGAA 2GWKA 3H46O 3UKUA 2QWMA 1BWFO 4XH5A 5BN8A 4NO7A 4EAHD 5LJVA 3U8XA 4E1JA 2GWJA 3BUZB 4AM6A 4PL7A 3UKRB 3O08A 3EKUA 4I6MA 4BREA 2P9PA 3DAWA 3UB5A 2BUPA 2P9IB 4CD1A 3GG4A 4EIAA 3HBTA 3AARA 1K8KA 3ZEUB 5EXWA 4B9QA 1Z6RA 2P9NB 4FOIA 4IWVA 5AQZA 4ISEA 4IO8A 2Q31A 3M1FA 3D2FA 5AZJA 1GLBG 4BR2A 2V51B 5BPLA 1GLCG 3HM8A 2J4RA 1BA0A 3QDKA 3MDQA 2V7ZA 3VEYA 3HZ6A 2V52B 4CBWA 4BRNA 2Q1NA 1D4XA 2H3GX 3EO3A 2CGJA 3R9PA 4XEIA 4H0YB 3UE5A 2IVPA 1ZBSA 3HI0A 1Z05A 3D2EB 1TUUA 1YXQA 2ZWHA 3G25A 4CZEA 2E8AA 3WQUA 3L0QA 2FF6A 3W3DA 3WQTA 3S41A 4C23A 1T6CA 5CE3A 3VENA 3VEVA 4WYBA 3CJ7A 4IJNA 4M7YA 4ISFA 3ZETA 1DKGD 3M6GA 3IUCA 4HWIA 4HTLA 5AQFA 4CZFA 4BR9A 1RGIA 2HOEA 4DHYA 4WQ5C 5BPNA 2I7PA 1HLUA 1GLEG 1DEJA 1E4FT 1NWKA 3WUHA 5BRFA 5AFUA 3CHWA 4PKIA 4IZ9A 4EFHA 1X3MA 1NGDA 2AA4A 2D4WA 3P4IA 5AQKA 3MN7A 2CGLA 2E2PA 3VGKA 4CZIA 3CETA 2ASPA 1TYQA 4FWRA 4Z94A 3F9MA 4EHTA 3SJHA 3CJ1A 3I33A 2AP1A 3QFPA 1DGKN 3DXKB 4A61A 1T44A 3FZFA 4JNEA 3VGLA 3CJAA 1XUPO 4BRLA 1S22A 4BGBA 1C0GA 5ADXH 5KPZA 2QWNA 2UYTA 3SMSA 3VEWA 4BRCA 4CZHA 3HTVA 2E2OA 3ZEUA 5EOYA 4RCHA 3A5LC 2YHYA 3BEXA 3ID8A 3MN6A 3AAQA 5FPNA 1U6ZA 5AQIA 4BR0A 3WXKA 5AQMA 4FWLA 3VEZA 3KVGA 5BREA 2IVNA 4MLEA 3LDPA 4CZKA 2Q0UA 2W41A 4CZMA 1JCEA 3H1VX 3ZX0A 3A8YA 5JLFA 1BA1A 4Y0WA 4RWTA 1U2VA 1QZ6A 2NRHA 5AQHA 1NM1A 1NGGA 1SAZA 3A0IX 3C7NA 3O1BA 4MO4A 1QZ5A 5AZIB 1YVNA 4BRQA 5B8HA 5F0XA 4IXCA 3QMLA 4A62A 4BRDA 2P9UB 4BQZA 2A6AA 5FPDA 4WQ5A 4JHDB 4BRGA 4DCHA 3DXMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WFNL 1JZAA 2D0AA 4KHSA 1ESVA 1QQNA 4FJ8A 3AAPA 4DG1A 4O8UA 4B9UA 3BP8A 3ZT3A 3OS2A 1T7BA 2P51A 4B9TA 3OTOK 2RE2A 4HVJA 1EWQA 4E7IA 1REVA 4ID5A 4L3QA 1ZC6A 3P31A 2F9TA 3MEGA 2O8EB 1HKCA 4U67L 5DM7L 2PYJA 3LWMA 1BMRA 1NBWA 1HYVA 1FKPA 4OKKA 3TAMA 4ELTA 2Q3SA 3O9SA 4FJHA 2ZE2A 3HRGA 5CR4A 1GLFO 3F5TA 4A2AA 3CCUN 4FJIA 3A5NC 2WTUA 1UA1A 4X66K 3U4LA 2ITMA 4OKEA 4M3TA 2JDQD 1EWRA 1VNAA 3O8MA 1BHLA 5KI6A 4JI7K 3IFRA 1W9HA 3L56A 1SNBA 4ISGA 4EP4A 4YOUA 4FWNA 4FK2A 2P9LA 4ELUA 1KXPA 2XHBA 3DLHA 5E41A 3P39A 3UKUB 1KD1O 2GL1A 2YNGA 3OYMA 3CFPA 3SMPA 4F4KA 1SKRA 4CJFA 1NJXA 3FZLA 2WOMA 3LP2A 3MN5A 3KLFA 4CBUA 4DR7K 4FPAA 2W00A 4XJXA 4LY7A 2QWQA 3QB0A 4GW6A 1NGJA 2HW3A 2QEXN 1B92A 2YKMA 1EP4A 1IKWA 1C0FA 3D45A 1KFSA 4JAXA 5AZJB 5I9EB 2VGNA 3MXMA 4BRPA 4BG9A 2O8BB 2PYLA 3VQ8A 4CHYA 4CE9A 4FL9A 4AM7A 3CQXA 4CGGA 3L2VA 4CFDA 3HOSA 2ASMA 4DTUA 2P9IA 3VMFB 2DFEA 1LQIA 4BWJA 4I7FA 4JK8A 1K8BA 2WONA 2B3CA 3B6OA 4H0VB 4JI0K 3CC2N 1LCUA 2HNDA 3L3UA 3LWLA 4CVNE 3WT0A 1EETA 1CXQA 1OKJA 3DRPA 3HPOA 2KYQA 5CZ2A 1NGIA 4W5TA 1NRBA 3GDQA 1F21A 4NLCA 3THYA 2YX6A 2IGIA 5E26A 3MK6A 1WSGA 2ATQA 4DV1K 1FKOA 4DR3K 4NCBA 1L3TA 5F1XA 2PFUA 2QA4N 3H3NO 4E19A 4UY8O 3KWGA 3ZSZA 4DSEA 4FPBA 3O3HA 3CJBA 1WT7A 4BQLA 4I2PA 3TSPA 5FPEA 4IJAA 4Y1DA 3MMVA 2VWKA 1TYQB 1N36K 2NRTA 2F96A 3MEEA 3CC4N 4AQYK 2DY4A 3VQ9A 2VCPA 2ITGA 1N34K 4HUFA 4AB0A 3THVA 3E9OA 4ILHA 3KKSA 4CFAA 2HF3A 2IAJA 3SQ4A 3KLHA 2CH6A 3CCMN 3SK3A 4W5QA 1WSIA 4IOAL 1NGBA 1YTAA 3HM9A 4RW8A 2B68A 1W2BM 1RBVA 4K8ZA 2A1SA 1ZYVA 2O8BA 3VGMA 1ZFUA 1RBRA 2IVOA 3OYKA 1VQ6N 1BUPA 3SUPA 4BG8A 3IMXA 2E3GA 1U2VB 3O1WA 4NYFA 2MN5A 3C7NB 4PKHA 4A5BA 3AA3A 3FFIA 4IBNA 4KH5A 4BR5A 3KZBA 4GVEA 2OPSA 4HUEA 1YF5L 3KLEA 4AHSA 1NJYA 2WC9A 3BZCA 4BC3A 3DXMB 2NZTA 1KLNA 2BRZA 5FROA 3OW2M 1YI2N 3S3MA 1ATSA 1A5XA 1MWMA 4A5AA 1KC8O 2HHSA 4QOZB 3CI5A 3CIPA 4FWOA 1RNHA 3NVMA 3MWPA 3ZLJA 1S1TA 2O8DB 3D7EO 1JLCA 3WEEB 2VWBA 4CFBA 3S3OA 4JHDA 3DRSA 3S5TA 4V1DC 1P0AA 4CZJA 1RT3A 1KAXA 4BDPA 5AQGA 3H1QA 2GELA 5DK5A 3O3GA 5BPMA 3CCSN 1T7PA 1DTTA 1CHZA 1BU6O 4LF8K 1J53A 2F9WA 4IEEA 2IIRA 5FDLA 4R79A 4HUGA 2OPPA 3AVGA 4KV8A 3DJCA 2XRIA 1X3NA 2LR3A 2W6KA 4CZGA 4FVUA 5CYMA 1W0HA 1KRPA 4DB3A 3AVJA 4YDUA 4O0JA 4YHHK 1IBKK 3CW4A 4CF8A 3E9LA 2V7YA 5KQ8A 4M3WA 3O80A 3ZSWA 3CC7N 1JL1A 1A5WA 4ICLA 4CW7B 2QWRA 1GOBA 3OYGA 4DV6K 3ZX2A 4DFPA 4E72A 2GWKA 3G10A 1JKHA 3VN5A 3VQQA 2QWMA 4EAHD 5CY4A 4JKDA 3BUZB 4OPKA 2ASCA 4IFEA 3PY8A 1DT9A 2E6LA 3O08A 3EKUA 3E9PA 2G8FA 1QVFM 3UB5A 5AJ3K 3AO5A 3ZEUB 1JLGA 4B8AB 1Z6RA 4IWVA 2WBNA 5AQZA 1XWLA 3JYTA 4IO8A 3AO4A 4OX9K 3HM8A 1X1PA 4HE7A 3QDKA 1SKSA 2V7ZA 1BISA 2O8DA 3KD5E 1XMQK 1BQMA 3ZT2A 2Y1IA 4YNQA 3NDKA 5EU7A 2CGJA 4LFAK 4MQ3A 4A59A 4DR5K 4AHRA 2YC1C 4LFBK 3I8DA 1WNSA 3HI0A 1Z05A 3QIOA 2ZWHA 4DF8A 2F8SA 3NH1A 1NJWA 2HMIA 4JKGA 3ZT4A 3IKMA 3OYJA 3ID6A 4YOYA 2DFFA 3VENA 1HPZA 3CJ7A 3HXMA 1NK6A 1OH6A 5KTQA 4UAFE 4IDHA 3ZETA 4B3SK 3EYZA 4DUYK 1Q81O 3KLIA 1VRTA 4CJ5A 2F4VK 3THWA 1HLUA 4FJKA 4FJ5A 4CF2A 1E4FT 4KHYA 4PKIA 4FJ9A 1FH3A 3QEXA 4JYAK 4BEBA 2Z1HA 3MN7A 3VA3A 3CETA 3ISNC 3L2RA 1IO2A 3LALA 3NMUA 4Z94A 1TL3A 1HQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4WFN L;  1JZA A;  2D0A A;  4KHS A;  1ESV A;  1QQN A;  4FJ8 A;  3AAP A;  4DG1 A;  4O8U A;  4B9U A;  3BP8 A;  3ZT3 A;  3OS2 A;  1T7B A;  2P51 A;  4B9T A;  3OTO K;  2RE2 A;  4HVJ A;  1EWQ A;  4E7I A;  1REV A;  4ID5 A;  4L3Q A;  1ZC6 A;  3P31 A;  2F9T A;  3MEG A;  2O8E B;  1HKC A;  4U67 L;  5DM7 L;  2PYJ A;  3LWM A;  1BMR A;  1NBW A;  1HYV A;  1FKP A;  4OKK A;  3TAM A;  4ELT A;  2Q3S A;  3O9S A;  4FJH A;  2ZE2 A;  3HRG A;  5CR4 A;  1GLF O;  3F5T A;  4A2A A;  3CCU N;  4FJI A;  3A5N C;  2WTU A;  1UA1 A;  4X66 K;  3U4L A;  2ITM A;  4OKE A;  4M3T A;  2JDQ D;  1EWR A;  1VNA A;  3O8M A;  1BHL A;  5KI6 A;  4JI7 K;  3IFR A;  1W9H A;  3L56 A;  1SNB A;  4ISG A;  4EP4 A;  4YOU A;  4FWN A;  4FK2 A;  2P9L A;  4ELU A;  1KXP A;  2XHB A;  3DLH A;  5E41 A;  3P39 A;  3UKU B;  1KD1 O;  2GL1 A;  2YNG A;  3OYM A;  3CFP A;  3SMP A;  4F4K A;  1SKR A;  4CJF A;  1NJX A;  3FZL A;  2WOM A;  3LP2 A;  3MN5 A;  3KLF A;  4CBU A;  4DR7 K;  4FPA A;  2W00 A;  4XJX A;  4LY7 A;  2QWQ A;  3QB0 A;  4GW6 A;  1NGJ A;  2HW3 A;  2QEX N; 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