5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
5AQJA 3D2FB 3FZHA 2J4RA 4B9QA 1MDUB 5AQTA 3H3NO 2CGLA 4PKHA 4BR9A 1LOTB 3B8AX 4WQ5C 4M7XA 4F9OA 4BRDA 3KHYA 4JHDB 2Q36A 4H03B 2A42A 4EHTA 4H0XB 5BN8A 1ZC6A 4HTLA 2E1YA 4BREA 1RGIA 5AFUH 3SMSA 3QDKA 1JCEA 4IJAA 4B1XB 3C7NB 4A2AA 5AQXA 1TUYA 3MCPA 1BUPA 3F9MA 2YCHA 2V7ZA 5EX5A 3L6QA 3GE1A 5AFUA 3VGKA 1J6ZA 2YHXA 3LDPA 4GNIA 2ZGYA 4B1UB 1CZAN 4XH5A 1HX1A 5KPTA 4WQ5A 4KBOA 2VYPA 3W0LA 3ATVA 1HJOA 2KHOA 4CJ7A 3CHWA 3L0QA 4XH4A 3GG4A 4JAXA 3SK3A 5AQHA 2HF3A 3KZBA 4CZJA 5ADXH 2QW9A 5KPRA 3QFPA 3ULEB 1BA0A 4H0VB 4B1ZA 4E1JA 4FOIA 3P4IA 5AQSA 2A5XA 1T6DA 3ZETA 1ESVA 1T6CA 4I6MB 3FLCO 3M1FA 1GLFO 1QHAA 4IXCA 4CD1A 4YDUC 5JLHA 3EL2A 1QZ6A 4H0TB 3CJCA 1ZBSA 2E2QA 3VF2A 3IMXA 3GDQA 2FSKA 2CGKA 2AP1A 2D1KA 5FPDA 4EFHA 2VCPA 4CI6A 5BPNA 5EXWA 2P9IA 2YI1A 3U4LA 2A3ZA 3OHRA 2P9KA 1Z05A 4FWOA 1QQNA 3DXKA 4FPAA 3MK6A 1HKCA 1X3NA 3QICA 3S41A 3KVGA 2D4WA 1YAGA 1XUPO 2HF4A 2P9PA 2GEMA 4QS9A 4PKGA 4ISFA 2QWLA 1NGEA 2E1ZA 3R9PA 5FPMA 5E84A 1TUUA 4RWTA 2NZTA 3A0IX 5AQQA 2P9SB 3LDLA 1OKJA 4BR2A 2E8AA 3WXLA 4YDUA 4MO4A 2ASPA 3VERA 2P9UB 2DPNA 3LL3A 2OANA 4H0PA 4DCHA 2V52B 5TKYA 1ATSA 2CH6A 1DKGD 3CETA 1GLBG 2GWJA 3DXMB 3O1BA 3JS6A 4Y0WA 5AQNA 5F1XA 3WQUA 3MN9A 3H6EA 3AAQA 5AQOA 3CJ9A 2ZF5O 3IUCA 5F0XA 1SZ2A 4BRMA 1DGKN 5AQYA 2NLXA 3I33A 2HMPA 4CZMA 3D7EO 1RFQA 5B8HA 2E88A 3VEYA 3EKSA 4H5WA 3O08A 3RSEB 5LJVA 3GOIA 1D4XA 3D2EA 3WXKA 4J8FA 4A62A 2Q31A 5EOYA 3LDOA 4CZLA 2QWQA 3ZEUB 4BC5A 1TYQA 5BREA 2EWSA 1IJJA 3R8EA 4FWLA 1YUWA 1MWKA 3U8XA 3VGLA 4BROA 2D0OA 5EY4A 2W40A 1HUXA 3LM2A 3CI5A 4IJNA 3FGUA 2ZWHA 5E26A 2FF3B 3AARA 4BC4A 2ASOA 3MDQA 3VGMA 1WUAA 4BRLA 5AQWA 2WUSA 3MN6A 3UKUA 4A2BA 4H0YB 3HTVA 1NBWA 1K8KA 2Q2RA 2F9WA 3EN9A 4BC3A 3LDNA 3ENOA 3TU5A 3VEWA 4WQ4C 4FWMA 2V7YA 3WXIA 4L3QA 4K41A 4DB3A 4Z94A 2YHWA 2P9NA 3SJHA 4BGAA 3IFRA 5JMVA 5BPLA 2FSJA 2I7NA 3GL1A 2FF6A 3BF3A 3MN5A 4BRFA 4H5NA 3C0BA 3WQTA 3DJCA 4BVOA 3ZX0A 2YJEA 4HWIA 4PKIA 2FLOA 3O4WA 3SMPA 4JD2B 1G99A 5LJWA 3UKRB 3HSCA 1GLCG 3CQXA 3R6MA 1NGBA 5KQ8A 1QQOA 3FR0A 3QMLA 5BPMA 3VF6A 4CZGA 1IG8A 2PAVA 1GLEG 4O8KA 3FZLA 4FWNA 4CBUA 4CZFA 2ZGZA 2QM1A 3VETA 2Q0RA 3FE1A 1ATNA 3A5LC 1Y64A 3H1QA 3L4IA 4EIAA 4WQ4A 5AZIA 4EAHD 3JXUA 3ZX2A 4BRGA 1X9JA 2NRHA 3BUZB 4PL7A 2ASMA 4FWPA 4GY2B 5BRHA 1S3XA 3UKRA 4BR5A 5AR0A 1SAZA 2GELA 4FWSA 4H5VA 3J8AA 4WYBA 1NGCA 3CJAA 2QWOA 2V51B 3HBTA 4CZKA 1X3MA 4BVPA 3WEEA 2D0PA 1U2VA 4IWVA 2P9LA 5CE3A 5AZJA 3D2FA 4BGBA 5BR9A 4JN4A 1S22A 1JCGA 2ITMA 2FXUA 5AQMA 3LDQA 4H5RA 4B1YB 4C23A 2Q0UA 4JHDA 5I9EB 1KAXA 5FPNA 4BRCA 5AQUA 5AQPA 3VEVA 4AM6A 4FO0A 1NM1A 1HPMA 4NO7A 3O80A 5BN9A 2QXLA 2QWRA 3O8MA 3UE5A 1YXQA 3C7NA 3ZETB 3QBWA 2BUPA 1BO5O 2QWMA 5AQVA 3FZFA 1EQYA 4MLEA 3HI0A 1T44A 2AA4A 4DQ8A 2A40A 2CH5A 1E4FT 4FWQA 3CJ1A 1V4TA 4BR4A 1ATRA 3DAWA 3O1WA 4K25A 1R59O 4CZIA 5JICA 5AQRA 1SQKA 4LC9B 4FWRA 3VEZA 2P9IB 3G25A 5ELZA 4FL9A 3TPQA 1NWKA 5AQFA 1WOQA 5EVZA 2P9KB 3M6GA 1QZ5A 3DXKB 5JLFA 2E2OA 1KXPA 4ISEA 1DEJA 1Q18A 4BRKA 3ULEA 2P9PB 4BQLA 1BOTO 4CBXA 1BDGA 3WXJA 4EHUA 2IVPA 2VWBA 4JNEA 4H0OA 3CJ7A 3SLCA 4QS7A 2E2NA 3VPZA 1ZXOA 5AQIA 4I6MA 3UB5A 4BRQA 4K43A 1RDWX 3GBTA 4CBWA 1BU6O 1NGFA 4NB4A 2W41A 1XQSC 1C0GA 5AQKA 3AY9A 3LM9A 4FWKA 1BG3A 1XC3A 4XEIA 3IDHA 1P8ZA 3H3OB 3H46O 4O5FA 2GUPA 4PL8A 3CQYA 3ATUA 5FPEA 4BRAA 4DHYA 1NGIA 4BRPA 4B1WB 5AQGA 3A5MC 1KAZA 1GLLO 2E20A 2IVNA 2E2PA 2Q1NA 4BQZA 3WUHA 1GLJO 2I7PA 4RTFD 2YJFA 3ENHA 1JCFA 4RCHA 3BP8A 3D2EB 5F2RA 1LCUA 3VENA 3W3DA 1Z6RA 1BA1A 2P9SA 3QB0A 3FFKB 4BG9A 2Q97A 3A5NC 1MWMA 3CERA 1TYQB 2P9UA 3HZ6A 4K42A 2CGJA 2UYTA 3VOVA 4CZHA 5AQLA 4BRIA 3DXMA 1HKGA 2GTDA 1BWFO 5KQDA 3H1VX 4BR7A 4BG8A 3ID8A 4M63C 3UKUB 4BR0A 5ADXA 1K8KB 4FOEA 1GLAG 2IIRA 3VEXA 3VF4A 1KAYA 3VESA 5BRFA 2A41A 2FSNA 3A8YA 4BC2A 3H45C 4CD3A 3FZKA 4FPBA 4CZEA 4QS8A 5AZJB 1NGDA 2P9NB 3WT0A 5KPZA 3DWLA 1NGHA 3O6WA 2QWNA 1YVNA 4BRHA 3RSEA 3FZMA 2H3GX 3MN7A 2F9TA 4H5TA 3EKUA 4MLHA 3EZWA 3ZEUA 1NMDA 3CJBA 3EO3A 5BRDA 4MO5A 2BTFA 1HKBA 1V4SA 3O5BA 4AM7A 4M7YA 3MMVA 1NLVA 1C0FA 3BF1A 4BRNA 5AQZA 3BEXA 4IO8A 3I8BA 4XH1A 3HM8A 1GLDG 2IVOA 3U9DA 1E4GT 3U9ZA 1HLUA 3CIPA 1MA9B 2PBDA 5AZIB 2GWKA 4FSVA 3A5OC 4IZ9A 3QFUA 1NGGA 4ISGA 3ZX3A 4A61A 5LY3A 2QWPA 2A6AA 1U6ZA 3VEOA 1H1VA 2HOEA 3AAPA 1NGAA 3QBXA 1QQMA 3WEEB 1U2VB 3M3ZA 4JD2A 1NGJA 2P9LB 4B1VA 2YHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2FB 1MDUB 2MZ0A 3VQQA 4PKHA 4BR9A 5IT9O 1QSLA 1LOTB 1CHZA 5D3GA 1K8AO 3KHYA 4FLUA 4UQGA 3DRRA 1RT5A 1R0AA 3QNOA 2QK9A 4CJVA 4B9NA 4KHPK 1TL3A 3V9UA 4M3ZA 3SMSA 1TAQA 5C25A 1WWNA 2X6NA 4B1XB 3CW4A 2F7TA 1NH5A 4JKFA 3SQ0A 3E9LA 2W42A 4CGFA 4R5PA 3GE1A 4FJ5A 1HYSA 1EWQA 2ZJRL 1XC9A 5C2FA 2YHXA 3VQ9A 2ZGYA 3LAMA 4LF5K 1C55A 4CFCA 1C0UA 5KK4A 1KFSA 4BECA 2ITGA 4DFMA 5IWAK 4WQ5A 3RTVA 3ATVA 2KHOA 1U47A 4DV6K 5GAGP 4EP5A 4CZJA 4E72A 1I6GA 3MXIA 4Y1DA 4M3UA 2QW9A 3QFPA 1VAZA 4H0VB 5C24A 5BR8K 5DMRA 4V19S 5HL7L 4B1ZA 1RTJA 4FOIA 1TKZA 4PA1A 5LMUK 5AQSA 3ZETA 4CJUA 1GLFO 3T69A 2NNWA 2ASCA 4DFKA 2E2QA 3SF4D 4IFEA 2CGKA 1LV5A 2D1KA 4EFHA 3SUPA 1W9HA 5BPNA 4ILHA 2YI1A 5M1NA 2GL1A 1QQNA 3DXKA 2D4WA 5DK5A 1YAGA 1N4NA 1KVBA 5KRTA 3CCJN 2JGUA 4AQYK 4YOVA 4CEOA 2GEMA 4RW4A 2UXDK 4ISFA 2E1ZA 1DTTA 2O8DB 3OYMA 2I61A 5I42A 1S9GA 5FLXO 5AQQA 3R3LA 1OKJA 3WXLA 2OCEA 5M1PA 2P9UB 3AVNA 2V52B 5TKYA 3AA4A 1DKGD 3THXB 2GWJA 3DXMB 4G9ZA 4Y0WA 3TARA 5AQNA 1NPIA 2ZJPL 5F1XA 1YJ9N 4KV8A 3MN9A 3WQUA 3H6EA 3LANA 3CJ9A 5F0XA 3QNNA 1DGKN 4AHSA 3P83D 4KH6A 1TK5A 4FJMA 3NGZA 3CFRA 4CHYA 3EKSA 5LJVA 3U3GA 3WXKA 4J8FA 2Q31A 3DOLA 5EOYA 1VRTA 3HPGA 3L2RA 3OS0A 3MWPA 3EEQA 1N5YA 2DFFA 4BC5A 5BREA 1Y97A 4O55A 3SQ4A 1RTDA 3VGLA 3OS1A 4BROA 1SKRA 2OPRA 3LM2A 1RT4A 4IJNA 2LJMA 5E26A 4YOXA 3AARA 1NK0A 3MDQA 2RF2A 3OTOK 5AQWA 3EY1A 4O0IA 3LWLA 3HTVA 4CFBA 1UA0A 1FW6A 3P39A 2Q2RA 4CEDA 4CK2A 4KB0A 2F9WA 1ZBUA 3CYMA 3LDNA 3D6RA 4RW9A 3ENOA 3THYB 3TR8A 4Q0BA 3WXIA 1T7AA 2YHWA 5BPLA 2FSJA 2QKKA 3RR7A 2QKBA 3O3GA 3QETA 1VHXA 3NE6A 4AILC 3IKMA 2O8FA 4KREA 3DJCA 3G0ZA 1ZBFA 2YJEA 4CIFA 1AYJA 1HPZA 3SMPA 4YORA 1JLBA 1Q8IA 1QVGM 1GLCG 3T1HK 5C2DA 2HW3A 1QQOA 4FW2A 3ZT4A 1WN7A 3CCEN 3VF6A 1RDDA 1KCFA 4DTNA 4O8KA 3FZLA 4CZFA 1DLOA 4FK2A 1ICAA 1HNZK 1C1BA 3FE1A 4BE2A 2LN8A 4CHPA 4EIAA 3JXUA 1RTHA 3T3FA 3BUZB 2D0BA 2LT8A 3VQ4A 2YIPA 3J8AA 4FJKA 4WYBA 2HMIA 3CJAA 4IG3A 3I0RA 4F4KA 4O5BA 4JK9A 2Q3SA 1X3MA 3AO3A 2VWJA 4FLVA 3AO5A 4J2BA 3PV8A 2PY5A 5BR9A 3TTFA 1ASWA 3LZIA 4CJWA 3NGYA 1ZVEA 2ATQA 4CFDA 3G71N 1VSJA 2Q0UA 3HT3A 2BH1A 1QQCA 1KAXA 5FPNA 3AVMA 2UUBK 3EZ5A 5AQUA 5AQPA 4CK3A 4MDAA 4G1QA 1XI1A 1NM1A 3QINA 1HYZA 3OBWA 2XRIA 3C7NA 3ZETB 1FK9A 3QBWA 3FZFA 3NGIA 1T44A 4FJJA 4DQ8A 1I39A 1XNQK 4B9VA 3MXMA 3DRPA 1ATRA 3DAWA 4CZIA 3VMFB 4DMNA 5AQRA 1RT3A 5JVHL 3J7YP 2E0HA 2KZZA 4DV0K 4FWRA 4FZYA 2NRRA 1WOQA 5J1EA 2HHSA 2HVHA 3VA0A 3M6GA 4CJLA 1KLMA 3DXKB 3T1AA 1NK5A 4ISEA 3P1GA 4JI5K 2KBKA 3DLGA 2VWBA 1YIJN 4H0OA 3A2FA 1NJWA 5C0YA 1JLCA 2E2NA 5AQIA 4BRQA 1VQON 3NFAA 4V1DC 1RT6A 1T8EA 3GBTA 4CBWA 4EZ6A 3V9ZA 4NB4A 2W41A 1N32K 3AGKA 3LM9A 4FWKA 1KQSM 3SV4A 1VSMA 1XC3A 3KWGA 1ZU3A 3PO4A 3UIQA 4LSNA 2EX3A 2GUPA 3PO5A 3ATUA 4GKKK 1NK7A 2RPIA 4B9LA 4FLTA 3KKRA 1E3MA 4C1NK 4B1WB 1BQMA 3L2QA 4FJHA 2E20A 2IVNA 2Q1NA 1NNEA 4RTFD 4Y1CA 4LF9K 4AB0A 4CF0A 4FM0A 2QXFA 3W3DA 1Z6RA 3TAGA 3E7RL 1D9DA 1BA1A 2YNHA 4BG9A 2YHBA 3RMCA 2JLEA 3F2KA 2W00A 5M1QA 1GOCA 1JKHA 3L3UA 3MECA 4K42A 4YHHK 4DFPA 1LWEA 1KVAA 1IBLK 5AQLA 4E89A 3ALYA 1ITGA 1JL2A 3KC6A 2GTDA 1EWRA 2Y1JA 1SN4A 4OVLA 1VSLA 3H1VX 4ID1A 1PTXA 4BR0A 2E3GA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3D2F B;  1MDU B;  2MZ0 A;  3VQQ A;  4PKH A;  4BR9 A;  5IT9 O;  1QSL A;  1LOT B;  1CHZ A;  5D3G A;  1K8A O;  3KHY A;  4FLU A;  4UQG A;  3DRR A;  1RT5 A;  1R0A A;  3QNO A;  2QK9 A;  4CJV A;  4B9N A;  4KHP K;  1TL3 A;  3V9U A;  4M3Z A;  3SMS A;  1TAQ A;  5C25 A;  1WWN A;  2X6N A;  4B1X B;  3CW4 A;  2F7T A;  1NH5 A;  4JKF A;  3SQ0 A;  3E9L A;  2W42 A;  4CGF A;  4R5P A;  3GE1 A;  4FJ5 A;  1HYS A;  1EWQ A;  2ZJR L;  1XC9 A;  5C2F A;  2YHX A;  3VQ9 A;  2ZGY A;  3LAM A;  4LF5 K;  1C55 A;  4CFC A;  1C0U A;  5KK4 A;  1KFS A;  4BEC A;  2ITG A;  4DFM A;  5IWA K;  4WQ5 A;  3RTV A;  3ATV A;  2KHO A;  1U47 A;  4DV6 K;  5GAG P;  4EP5 A;  4CZJ A;  4E72 A;  1I6G A;  3MXI A;  4Y1D A;  4M3U A;  2QW9 A;  3QFP A;  1VAZ A;  4H0V B;  5C24 A;  5BR8 K;  5DMR A;  4V19 S;  5HL7 L;  4B1Z A;  1RTJ A;  4FOI A;  1TKZ A;  4PA1 A;  5LMU K;  5AQS A;  3ZET A;  4CJU A;  1GLF O;  3T69 A;  2NNW A;  2ASC A;  4DFK A;  2E2Q A;  3SF4 D;  4IFE A;  2CGK A;  1LV5 A;  2D1K A;  4EFH A;  3SUP A;  1W9H A;  5BPN A;  4ILH A;  2YI1 A;  5M1N A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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