5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
2A41A 5AQIA 4BR7A 4IWVA 3QICA 4H0VB 1NGAA 2Q97A 1WOQA 5ELZA 3GDQA 1MWMA 1MDUB 4ISFA 4BRKA 3MCPA 2QWPA 2QWNA 3ZEUA 2YHXA 4BR2A 2QWQA 5AQNA 3QFUA 3H3OB 3VF4A 4YDUA 1NGBA 3UB5A 5AQPA 4WYBA 4FWKA 1GLLO 4I6MA 4RCHA 5LY3A 3WQTA 2P9SB 2P9UB 2IVOA 3H6EA 2P9UA 4QS7A 3O08A 3WQUA 3DAWA 2HF4A 4A2BA 1HKGA 3A5NC 2P9LA 3QBXA 5FPEA 4WQ4A 3TPQA 3FGUA 4BRNA 2KHOA 3H3NO 4HTLA 1IJJA 4BRIA 4FL9A 3HTVA 4FWQA 4CD1A 4F9OA 1YXQA 1YAGA 4DB3A 3VPZA 4A61A 4ISEA 3B8AX 4BRCA 5BPNA 4MO4A 3ULEA 1BA1A 3WUHA 3HBTA 4KBOA 3SK3A 1J6ZA 3VEYA 2E8AA 3A5OC 1EQYA 1ESVA 4CZGA 3ATVA 2YJFA 3FE1A 1Q18A 3GG4A 1RDWX 2GTDA 3I33A 5E84A 3C7NB 4BRHA 2E88A 3VESA 5AQJA 4BR4A 5EX5A 4QS9A 1RGIA 5BREA 3LDPA 4H0PA 3ENOA 2P9PB 3HZ6A 4EHUA 1U2VA 5EXWA 2CGKA 4XH4A 3A5MC 4WQ5A 3M3ZA 3UKRA 2E2QA 3U9DA 3CJAA 4BRGA 3SMSA 1GLJO 3H46O 3WXJA 1NGJA 3M1FA 4Z94A 3IMXA 3R6MA 3VF6A 1LCUA 1SQKA 3AAQA 4FWOA 1SZ2A 4MO5A 3VERA 5KPTA 1IG8A 2D0OA 4L3QA 5AQQA 1TYQB 4A2AA 5KPRA 1HJOA 3S41A 2W41A 2FF3B 3QB0A 3CJ1A 1D4XA 4IO8A 2EWSA 3TU5A 1X3NA 3MN7A 2H3GX 3LM9A 1JCEA 4K42A 3W0LA 5BN8A 3O4WA 2Q31A 2Q0RA 3FZKA 2YCHA 4JAXA 3O1BA 2ZF5O 2FXUA 2E1YA 1BUPA 2Q1NA 1MA9B 2GWKA 4EIAA 4RWTA 2ZWHA 2P9IB 5LJWA 4GNIA 4BR0A 1KXPA 4JHDB 4JHDA 3D2EB 2GELA 4BRLA 3LM2A 4YDUC 1JCGA 1GLBG 3ZX3A 2PAVA 2E20A 2E2OA 4M7YA 4BGAA 5EY4A 2IVPA 4IJNA 4K43A 3G25A 1ZBSA 5FPMA 2ASOA 3O80A 3CJ9A 1GLEG 1BA0A 4IXCA 4E1JA 1T6CA 4NO7A 1DGKN 3QDKA 3O5BA 5AQSA 2QWOA 4BC5A 3VEXA 4C23A 2J4RA 3SJHA 4K41A 3ID8A 4BRAA 4EHTA 3LDLA 1HKBA 2A3ZA 1Z05A 3VETA 2FSNA 1NGIA 4CZIA 4BRMA 3ENHA 3MN9A 2VCPA 2QM1A 5BRHA 1QQOA 3DXKB 4AM7A 5JLFA 2A42A 1NBWA 2QXLA 1HPMA 1T44A 1HLUA 4FWPA 2P9SA 1NGCA 4FPBA 1QQNA 4H0TB 4MLEA 2QWMA 1GLCG 5KQDA 1K8KB 2VYPA 3VGKA 5AQWA 1QHAA 2ASMA 3VEZA 4BC3A 5AFUA 3UE5A 1RFQA 2HOEA 4BQLA 3L0QA 2NRHA 4JNEA 5AZJB 3BUZB 4CZFA 4XH5A 3H45C 2YHYA 5BPLA 1X3MA 3FFKB 4H5WA 1R59O 4H0OA 3RSEB 4BG8A 3RSEA 1XQSC 2F9TA 2FLOA 3AAPA 4QS8A 3VEWA 3KHYA 3EZWA 3GBTA 3VGMA 5AQVA 4FWMA 3D2FB 3D2FA 1TUYA 2A40A 2P9KB 4CZMA 1HUXA 4BVOA 3L6QA 3O1WA 4BQZA 5AFUH 3QFPA 4FOEA 3L4IA 4PL8A 3C7NA 2GWJA 4BROA 4CI6A 1BO5O 2V7ZA 1BWFO 1E4GT 3ZX2A 1U6ZA 1T6DA 3IDHA 2I7NA 2P9PA 2FSKA 5EVZA 4O5FA 4XEIA 4CZLA 2VWBA 2OANA 1NMDA 3QBWA 1XUPO 2GEMA 3C0BA 4FO0A 3BF1A 3OHRA 3O8MA 4RTFD 3BP8A 4B1WB 5AQZA 1BOTO 4CZEA 5AQLA 3R8EA 4FPAA 2E2NA 3KVGA 3CJ7A 1TYQA 1LOTB 1KAXA 4H5TA 2QW9A 4PL7A 3GL1A 5JLHA 3M6GA 1OKJA 3GE1A 4PKGA 5CE3A 2AA4A 1KAYA 4DQ8A 1NM1A 5BPMA 4B1YB 4IZ9A 4BRFA 2ITMA 4FWNA 4MLHA 1NGGA 4ISGA 3IFRA 1HX1A 3VEVA 1ATNA 3MMVA 4IJAA 5FPDA 2D0PA 3EKSA 4H0YB 4CZHA 3UKUB 5F1XA 2F9WA 1V4TA 5AQOA 3MN6A 2P9IA 4H03B 1Y64A 5AZIB 5AZIA 2FSJA 5TKYA 3P4IA 3QMLA 4EAHD 5LJVA 3D2EA 1WUAA 3MN5A 4CZJA 4CBUA 3IUCA 5JMVA 2P9NB 5AQMA 5ADXH 2D1KA 1QZ6A 1S3XA 4H5VA 4DCHA 5AQYA 1SAZA 1GLAG 1G99A 2Q36A 3JS6A 1YVNA 3DJCA 4WQ4C 2WUSA 3WT0A 3ZX0A 3CI5A 5BR9A 4FWSA 3CHWA 2ZGZA 1ATRA 3U9ZA 3A8YA 2DPNA 2I7PA 3WEEB 4CBWA 3FZMA 4BC4A 5F2RA 1QZ5A 2V52B 3FZLA 2ASPA 1NGFA 3SLCA 5AQTA 3FR0A 4BC2A 2PBDA 2UYTA 1JCFA 4B1ZA 2YHWA 4JN4A 3DXKA 3FLCO 5KQ8A 1X9JA 3EKUA 4B1UB 1P8ZA 5BN9A 2A5XA 4B1VA 3CQYA 4BRPA 1DEJA 4M63C 5AQRA 3HM8A 3MK6A 3LDNA 2HF3A 1K8KA 2FF6A 3HI0A 2NZTA 3ZEUB 3VEOA 3A5LC 1GLDG 3LL3A 3VOVA 5EOYA 3DXMB 5AR0A 3DXMA 3CJBA 4WQ5C 4B1XB 3AY9A 4I6MB 5AZJA 4CJ7A 3WXIA 1Z6RA 4CD3A 2CGLA 4BRDA 4PKIA 4LC9B 1ZC6A 4K25A 4B9QA 3A0IX 4A62A 2YI1A 3JXUA 5AQFA 3LDQA 2P9LB 4FOIA 4DHYA 1DKGD 3FZHA 3O6WA 2P9KA 1BU6O 3VGLA 4NB4A 4J8FA 5I9EB 5F0XA 3H1VX 4FSVA 4Y0WA 3ULEB 1TUUA 4H5RA 3D7EO 3CJCA 5FPNA 4EFHA 1ZXOA 2A6AA 3BEXA 4BG9A 2D4WA 4H0XB 2NLXA 1BDGA 3U4LA 1XC3A 3U8XA 4FWLA 3AARA 1QQMA 3H1QA 4BGBA 2V7YA 4BR9A 5BRFA 3KZBA 2IVNA 2CGJA 1NGHA 3I8BA 3VF2A 5AQGA 4M7XA 1U2VB 5ADXA 5B8HA 1HKCA 2YJEA 3EN9A 3UKRB 1KAZA 5AQKA 3ATUA 3SMPA 4CBXA 5KPZA 3LDOA 3EL2A 3DWLA 3W3DA 4BRQA 5AQHA 5AQUA 1ATSA 1GLFO 2GUPA 3F9MA 1NLVA 2W40A 3WXLA 1H1VA 2Q2RA 2ZGYA 4FWRA 3R9PA 3CIPA 4AM6A 1C0GA 3UKUA 2Q0UA 4CZKA 3HSCA 3ZETB 3ZETA 1NGDA 2IIRA 1YUWA 3CETA 4PKHA 4XH1A 2P9NA 4JD2B 5BRDA 4JD2A 3CERA 4BVPA 5AQXA 2E2PA 1C0FA 1BG3A 1V4SA 3MDQA 3WXKA 4BREA 3CQXA 3BF3A 4BR5A 4H5NA 2HMPA 5JICA 3EO3A 1S22A 4GY2B 3WEEA 2CH5A 2QWLA 2QWRA 2E1ZA 2BTFA 3J8AA 1NWKA 1MWKA 2AP1A 4O8KA 1NGEA 1CZAN 4HWIA 3FZFA 3GOIA 2BUPA 2V51B 2CH6A 1E4FT 3VENA 5E26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OJRA 1WT7A 2N66A 3EE8A 4IWVA 1NGAA 1ZBIA 1MWMA 4DSJA 1NJIO 3KLEA 4M3YA 2QWQA 5GADP 4C8MA 3VF4A 2G8UA 1FW6A 1NK7A 4YDUA 5AQPA 2X6NA 4FWKA 1GLLO 3WQTA 1RBTA 4O5BA 4QS7A 3DLHA 3U3YA 2VGNA 3LAMA 3A5NC 1PTXA 3ZCMA 2G8VA 3V6DA 1YITN 3AVGA 3LP1A 3PIPL 4BRNA 4A5AA 4HTLA 3DOKA 4Z4GA 2GL1A 4FL9A 3HTVA 4FWQA 3HJFA 4M3RA 3T1AA 1L4VA 4UADE 3HL8A 3VPZA 1KSPA 1CXUA 1S6PA 3KLHA 3ULEA 5FROA 3WUHA 1KV0A 2ATQA 3SK3A 2KW4A 4E72A 2HBLA 4CJUA 2HHIA 1C1AA 3TTDA 1ESVA 4PQUA 3MEEA 3SUNA 4DV3K 4O55A 1HQUA 1KQSM 1QE1A 3AO5A 3OS1A 4Y1DA 1RGIA 1NPIA 4OVLA 4IOXA 2A1SA 3J80O 3K5OA 2G8HA 2HHVA 5C12A 4M3ZA 2CGKA 3A5MC 3M3ZA 3CJAA 4BRGA 4KB0A 3TAEA 4UAEF 3M1FA 3AO1A 1YIJN 4Z94A 5IWAK 3R6MA 1LCUA 2ETJA 3AA5X 1SQKA 5DK5A 3NGYA 3NGIA 3ZT2A 1P00A 5AQQA 4R5PA 5KPRA 1HJOA 3VQBA 3J7YP 3CCQN 1D4XA 1BHLA 2VG5A 4B08A 2XY8A 3V1QA 3QI7A 3MN7A 3AVMA 1W2BM 4K42A 3G71N 5BN8A 1AYJA 2NY9X 1VSLA 3SUPA 1VQMN 1J54A 4IKFA 1O1WA 3KD5E 4AHUA 3O1BA 4CGFA 1BUPA 3QNOA 4U7BA 1HYVA 3M5RA 1RNHA 2DFEA 1IBLK 3KD1E 4RWTA 1VSIA 2JWLA 1HJRA 4Y1CA 4N47A 4FJLA 4CFBA 2LY5A 3R3LA 4M7YA 1AHOA 4TSXA 1N34K 3VA3A 3G25A 1ZBSA 1E3MA 4KPYA 2WBNA 4BECA 1I39A 5M1NA 3CFOA 5KTQA 3N4PA 4E1JA 3HPOA 1BMRA 4DSKA 2Z1IA 1VQLN 2OCEA 4U67L 1VQKN 5CZ1A 1SEGA 4W5OA 1RDCA 4KV8A 2HSTA 4CEQA 3VQQA 3TSQA 4DFJA 4KHUA 4CGHA 2FSNA 4CEFA 4DTUA 1ZBHA 1Q86O 1XHXA 1JLCA 2VCPA 1R0AA 3L8BA 4IOCL 4FM0A 4DLEA 1HYZA 3TAMA 1NKBA 3CC7N 4AM7A 3CFRA 2HBMA 5JLFA 4DTNA 1NBWA 5HP1A 5HRRA 1HLUA 3CCMN 2QTDA 3ITHA 2VWKA 2LR3A 3R2VA 1DT9A 3I0RA 3OYHA 1WSFA 1N6QA 3ZSRA 2VG7A 4BC3A 4FLUA 5AFUA 4FJXA 3IKMA 3D0PA 3OS0A 3AVBA 2I5JA 2NRHA 5AZJB 4CZFA 5C2FA 3ZSVA 3TR8A 2O8BB 4CERA 3OYIA 2X6SA 4H5WA 1R59O 3RVCA 1HPZA 1XQSC 4FZZA 3V9UA 1FK9A 1XNRK 3EZWA 4EZ6A 1JKHA 1X1PA 3VGMA 5AQVA 4FWMA 3B6OA 2RF2A 3RR8A 4B9SA 1HUXA 4BVOA 5KRTA 2IGIA 3O1WA 1SN1A 1HYSA 4BQZA 3RMBA 3KWGA 4GVMA 4B8CA 1LV5A 3L4IA 2VY6A 3TABA 5C0YA 3CF5L 1E4GT 3LP2A 5EU7A 4DTRA 1MR4A 5EVZA 4DS5A 4ELUA 1WSIA 4ILGB 1NMDA 1JLGA 4FJ8A 1XUPO 3OYJA 2E6MA 3BF1A 3OHRA 1ZVEA 3O8MA 4RTFD 5AQZA 4CZEA 3ZT0A 2MN5A 3E7RL 4GV3A 2IC3A 1OH7A 3QETA 1KAXA 4H5TA 1VSHA 2IAJA 3GE1A 4HE7A 3O4NA 4PKGA 4O4GA 5CE3A 4Z4FA 1KAYA 3G6EN 5BPMA 3SUQA 4IZ9A 2HHTA 3OYMA 2ITMA 5SWMA 3SF4D 1NGGA 3IFRA 3VEVA 2QA4N 1ATNA 1RT1A 4BEBA 1O13A 4DU4A 1KD1O 4QCLA 3EKSA 1WSHA 3UKUB 5F1XA 3LAKA 1XC9A 4WFNL 1RDUA 4G1QA 5JVHL 1ZBFA 2FSJA 2E3FA 3VQEA 4BWJA 1WUAA 1QQCA 1QSLA 1BGXT 2OTLN 4Z4CA 3O3FA 4UQGA 2P9NB 4DTSA 3PUFA 1KVAA 1QZ6A 5DM6L 1YJWN 1TGOA 4DQSA 1P0AA 5AQYA 3I8DA 1SAZA 4DU3A 4WE1A 3CXCM 1CXQA 1W0HA 4Z4EA 3WT0A 4CHOA 3CI5A 3CHWA 4FM2A 4E1NA 2LT8A 2JLEA 4E7JA 4K0KK 3E66A 4OGEA 1QZ5A 1N5YA 2ZQBA 4YY3K 1B9DA 5AQTA 4PHTX 1QVGM 4J2EA 1HNXK 2YHWA 3K2PA 4JKDA 4X65K 4WF9L 1FJGK 3H08A 2ASCA 4Z4IA 3HYFA 1P8ZA 2LN8A 4AF1A 4LF6K 1QTMA 3HM8A 4I2PA 2HF3A 1K8KA 4C1NK 1J53A 2HHSA 1C56A 3KKSA 2O8FA 3AGRA 4KH5A 1TI5A 4V1DC 4LC9B 4MFBA 1ZC6A 1L3SA 1RDDA 4CEZA 3E9PA 4E19A 4M3TA 2KPYA 2HNZA 1VSFA 2P9KA 5I9EB 4NYNA 3S3MA 5HROA 5F0XA 1UOCA 2NRZA 2KYQA 4IFVA 4FSVA 2LY6A 4IG0A 3AVJA 2GMOA 1JLBA 3D7EO 2O8DB 3AA4A 3SUOA 4CJLA 4EFHA 1ZXOA 4E7IA 2KLAA 2BDPA 3RMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4OJR A;  1WT7 A;  2N66 A;  3EE8 A;  4IWV A;  1NGA A;  1ZBI A;  1MWM A;  4DSJ A;  1NJI O;  3KLE A;  4M3Y A;  2QWQ A;  5GAD P;  4C8M A;  3VF4 A;  2G8U A;  1FW6 A;  1NK7 A;  4YDU A;  5AQP A;  2X6N A;  4FWK A;  1GLL O;  3WQT A;  1RBT A;  4O5B A;  4QS7 A;  3DLH A;  3U3Y A;  2VGN A;  3LAM A;  3A5N C;  1PTX A;  3ZCM A;  2G8V A;  3V6D A;  1YIT N;  3AVG A;  3LP1 A;  3PIP L;  4BRN A;  4A5A A;  4HTL A;  3DOK A;  4Z4G A;  2GL1 A;  4FL9 A;  3HTV A;  4FWQ A;  3HJF A;  4M3R A;  3T1A A;  1L4V A;  4UAD E;  3HL8 A;  3VPZ A;  1KSP A;  1CXU A;  1S6P A;  3KLH A;  3ULE A;  5FRO A;  3WUH A;  1KV0 A;  2ATQ A;  3SK3 A;  2KW4 A;  4E72 A;  2HBL A;  4CJU A;  2HHI A;  1C1A A;  3TTD A;  1ESV A;  4PQU A;  3MEE A;  3SUN A;  4DV3 K;  4O55 A;  1HQU A;  1KQS M;  1QE1 A;  3AO5 A;  3OS1 A;  4Y1D A;  1RGI A;  1NPI A;  4OVL A;  4IOX A;  2A1S A;  3J80 O;  3K5O A;  2G8H A;  2HHV A;  5C12 A;  4M3Z A;  2CGK A;  3A5M C;  3M3Z A;  3CJA A;  4BRG A;  4KB0 A;  3TAE A;  4UAE F;  3M1F A;  3AO1 A;  1YIJ N;  4Z94 A;  5IWA K;  3R6M A;  1LCU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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