5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
4BC4A 5E84A 3MN6A 3ZX3A 4BQZA 4M7XA 3FGUA 1OKJA 3AY9A 4IO8A 3TU5A 3M3ZA 3A5MC 3U8XA 2FXUA 3OHRA 5BREA 2E2OA 4A61A 3MN5A 1QQNA 1BA0A 2D0PA 4B1ZA 1U6ZA 5F1XA 4MO5A 3WEEB 3SJHA 3GL1A 4EAHD 2W41A 3DXKA 3WQUA 1GLDG 3EO3A 5AQXA 4AM7A 5EY4A 3U9ZA 3FE1A 1ZBSA 3LL3A 1QQMA 2YHWA 3QB0A 4E1JA 1HX1A 1T6CA 2Q31A 4H5VA 4JD2A 3UKRB 1C0GA 1ESVA 2QWQA 5EX5A 3WXJA 3C0BA 4WQ5C 3VGLA 5KPRA 5AQTA 2W40A 2HF4A 3VGKA 5AQUA 1BWFO 2FSNA 4NO7A 4I6MA 3QBWA 4CZIA 5AQRA 3O5BA 4FO0A 2A5XA 2ITMA 3S41A 5JLHA 1BDGA 3EL2A 4B1XB 4JN4A 4YDUA 2GUPA 3DWLA 2YHYA 3ULEA 4BR4A 2Q0UA 3LDPA 3H45C 3IMXA 3FZMA 3VF2A 5AQFA 3P4IA 4CZMA 1HLUA 5BPMA 2P9KA 4AM6A 4BC5A 4XEIA 3SMPA 1H1VA 3BP8A 5BRFA 5AZIA 2P9PA 4FWQA 4CBUA 4BQLA 3A8YA 3H3NO 4BRGA 3H6EA 3VOVA 4CD1A 4BRHA 2ZF5O 5B8HA 2YJFA 4LC9B 4BRDA 5KPZA 4WQ5A 4EFHA 4FPAA 2QWNA 3DXKB 3GG4A 1NGBA 1TYQA 3CJ7A 5FPMA 3UKUB 1Y64A 3SK3A 4JHDA 4FWOA 4BGAA 1HJOA 3QICA 3AAPA 1BA1A 4WQ4C 4CBWA 4DB3A 3HBTA 3A0IX 4H0OA 1TUUA 3H46O 4JD2B 5E26A 3C7NA 5JMVA 4A2AA 1NGCA 1GLLO 1NLVA 3CQXA 2QW9A 5AQMA 5AQSA 1T44A 3DXMA 2QWOA 1IG8A 1QZ5A 1D4XA 5BRHA 3KHYA 4QS8A 2E2QA 2V52B 2CH5A 4I6MB 3L4IA 2AP1A 5AR0A 4CZKA 1RDWX 4FWKA 1BO5O 3LDNA 4IJNA 2D0OA 1WOQA 2QWMA 1RGIA 1SAZA 3O4WA 2NRHA 1CZAN 4C23A 2P9NA 3ULEB 4RWTA 5KQ8A 1S3XA 4GNIA 2Q0RA 3QDKA 3O80A 3FZKA 1S22A 2I7NA 3MK6A 2CGLA 4CZGA 4BC3A 2P9KB 4BR0A 3FR0A 3ATUA 4H0VB 4DHYA 4ISFA 1BG3A 3DJCA 3CIPA 3H1VX 5AZIB 2P9PB 5ADXA 4K25A 1X3NA 2E2PA 4BR9A 3D2FB 3LDOA 4WQ4A 1QHAA 1V4TA 4ISEA 4BROA 2IVPA 2J4RA 1MWKA 3ATVA 3U9DA 1JCFA 2VWBA 4BRMA 4CZJA 1NGEA 2E1YA 4CBXA 3GDQA 4DCHA 1TYQB 4BR2A 5LY3A 3AAQA 4FOIA 5AQPA 4JHDB 2BTFA 1X3MA 4KBOA 3QMLA 3CJ1A 3SMSA 5AQKA 4MLEA 2IVNA 1DKGD 2A6AA 5KQDA 3GBTA 2F9WA 2V7YA 4FWRA 1G99A 3C7NB 4IXCA 1C0FA 3KVGA 4A62A 1J6ZA 4PKGA 4BRFA 1EQYA 3ZEUB 4K43A 3W3DA 4O8KA 4FWLA 5FPNA 3BEXA 1NMDA 1SQKA 3MN9A 2FSKA 5AQWA 1SZ2A 4BVOA 5AQZA 3I33A 5KPTA 5AQQA 2HMPA 3R9PA 3CJAA 1NWKA 3O08A 3QFUA 2E8AA 1LCUA 4EIAA 2CGJA 3FZFA 1BOTO 3A5OC 2Q36A 5I9EB 3W0LA 4H5WA 2FF3B 3MMVA 4BRPA 4RCHA 4FPBA 5AFUA 5TKYA 4A2BA 3G25A 4PKHA 4FWPA 1WUAA 4BRKA 3MN7A 3MDQA 4B9QA 3TPQA 4B1YB 2CH6A 3D7EO 3UE5A 2A3ZA 2GTDA 3ENOA 4BG8A 4EHTA 2P9SA 3ZX0A 5AZJA 2CGKA 2Q2RA 4QS7A 4IWVA 4BRAA 2YI1A 4HWIA 4J8FA 3EKUA 3J8AA 2VCPA 1IJJA 1NGHA 1XUPO 3WXIA 4Y0WA 3CQYA 2QWPA 3VEVA 3LM2A 1NGDA 4BVPA 4BRLA 4H5TA 3LM9A 1NM1A 4GY2B 2GELA 4K41A 4PKIA 5CE3A 2QWRA 4FL9A 3JXUA 3VEZA 1HKCA 1YAGA 2H3GX 3LDLA 4HTLA 3WXLA 5FPEA 3SLCA 1YUWA 3LDQA 2DPNA 3O1WA 4FWMA 1TUYA 3EKSA 2FF6A 3I8BA 3ID8A 4CZHA 4PL7A 3L0QA 4Z94A 1Z6RA 5BPLA 4H03B 5LJWA 2QXLA 5AQLA 2KHOA 4F9OA 1QQOA 5AQJA 1KXPA 4FOEA 4ISGA 3UB5A 3CI5A 4BR7A 3ENHA 3VETA 3EN9A 3A5NC 1LOTB 4B1VA 5JICA 3HI0A 4XH1A 4M63C 4JAXA 1Q18A 2D4WA 3CJBA 4H0TB 1GLBG 3B8AX 1HUXA 2Q1NA 1P8ZA 2YCHA 4FWSA 5ADXH 3FLCO 2E88A 5JLFA 4YDUC 4BR5A 3KZBA 1JCGA 4B1WB 4MLHA 1NGIA 4BRQA 3HSCA 4M7YA 5AQYA 4EHUA 3EZWA 3DAWA 1NGJA 2HF3A 4FWNA 5BN9A 4H0PA 2E2NA 5AQOA 1U2VA 4BREA 4L3QA 3BF1A 3MCPA 2P9SB 5AZJB 2ZGZA 1RFQA 3UKUA 2NZTA 1KAYA 2Q97A 3VEWA 3ZETA 3VEYA 5BRDA 3ZX2A 3M6GA 4NB4A 1HKGA 2P9LA 3IUCA 1ATNA 1BU6O 2ZWHA 3M1FA 3VESA 1E4FT 2YJEA 4FSVA 1MA9B 2BUPA 4H0XB 2PAVA 1ATSA 4BC2A 3H1QA 2ZGYA 2IIRA 2A40A 2IVOA 3DXMB 3FZHA 3F9MA 2P9IA 3D2EA 3BUZB 3O6WA 1X9JA 3HTVA 5AQIA 5AQHA 3IFRA 4K42A 3RSEA 4WYBA 4H5RA 1GLFO 2FSJA 1Z05A 3HZ6A 2P9UA 3WT0A 3QBXA 1YVNA 1K8KA 2E20A 2V7ZA 4BG9A 3CERA 2NLXA 1MWMA 2ASMA 5FPDA 2P9NB 1T6DA 2FLOA 2GWKA 2HOEA 5F0XA 3R6MA 1KAXA 4CZFA 3FFKB 1NGAA 1DEJA 1MDUB 2QM1A 5AFUH 4BGBA 3AARA 5EVZA 2A42A 3VENA 3L6QA 3VERA 3O1BA 1QZ6A 2D1KA 4RTFD 1GLEG 1NGGA 5LJVA 3R8EA 1NGFA 3U4LA 1V4SA 3CETA 3VF6A 3WEEA 1HKBA 2VYPA 5EOYA 2YHXA 3VF4A 4MO4A 1GLCG 2ASPA 2A41A 4O5FA 3VEXA 2UYTA 3D2FA 3BF3A 3O8MA 4BRCA 5BN8A 1E4GT 1HPMA 4CZEA 4H5NA 4BRNA 4H0YB 4CI6A 1XQSC 3UKRA 3WXKA 2OANA 4CZLA 1NBWA 1U2VB 4IJAA 4QS9A 3FZLA 2GEMA 5EXWA 2AA4A 3IDHA 1DGKN 3A5LC 1YXQA 1XC3A 2V51B 3ZETB 4CD3A 1ZXOA 3H3OB 2I7PA 3VGMA 5F2RA 4IZ9A 2P9LB 3HM8A 5BPNA 3GOIA 4DQ8A 2E1ZA 3CHWA 3VEOA 3QFPA 5AQGA 2WUSA 5AQNA 4BRIA 3GE1A 4B1UB 1R59O 3CJ9A 4PL8A 5AQVA 1ATRA 1JCEA 3ZEUA 2EWSA 1ZC6A 2QWLA 2P9IB 1KAZA 3D2EB 3JS6A 1GLJO 2PBDA 4CJ7A 5ELZA 2ASOA 3RSEB 5BR9A 4XH4A 3WQTA 4XH5A 1BUPA 1GLAG 2GWJA 4JNEA 3WUHA 2F9TA 2P9UB 3VPZA 3CJCA 1K8KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WT7A 5E84A 1IG9A 3P31A 5C42A 4BQZA 4ILHA 1VHXA 2JGUA 4F2SA 3FGUA 4KO0A 4YY3K 4FJXA 3QNOA 1X9WA 1Q82O 3SF4D 3NDKA 4FZYA 3QI7A 4J2EA 1QQNA 2LJMA 4DTJA 3CCUN 1RBTA 3C65A 4YOUA 5C0YA 4MO5A 3WEEB 3OYIA 1W9HA 3GL1A 3U3GA 2O4IA 3MEEA 2W41A 3DXKA 1VQ6N 3TR8A 3LZJA 2XY5A 1GLDG 3EO3A 4YOTA 1VRUA 4PUOA 4JEPA 3CCQN 3OBWA 3LL3A 3THXB 3QB0A 2YHWA 4IG3A 4KTZA 5J2PA 2Q31A 3MWPA 4RG8A 3NH2A 3L56A 1ESVA 2JWLA 1A5WA 1KFDA 4QCLA 2W40A 1IBLK 3VGKA 4PHTX 4L8RB 1RDCA 1D5AA 2QI2A 1TV6A 1P0AA 1OVQA 1IV0A 2GMOA 1JL2A 5JLHA 2VY6A 4AILC 2KW4A 4JN4A 2HHVA 2P5GA 2OPQA 3J7AP 3LDPA 4DR3K 1L4VA 4DFJA 1HLUA 1RT7A 4K0KK 4CHPA 3E7UX 4CGFA 2QXFA 5JS2A 4UADE 1RT4A 1VQ4N 3AVNA 2QA4N 5JVHL 5AZIA 4E7JA 4CBUA 1YHQN 4BQLA 4CEOA 4JKGB 1JKHA 2Y1IA 2B4JA 2JWKA 3THWA 3H6EA 3VOVA 1SEGA 1OH6A 4M3YA 3V9XA 3SQ2A 2MZ0A 1U49A 1OMYA 4WQ5A 4IOAL 3DXKB 4CJKA 1NGBA 5FROA 3C6UA 3QEVA 4JHDA 4BGAA 4CJUA 1QQCA 3QEWA 3QICA 3AAPA 3DRRA 4WQ4C 3VQPA 4CBWA 4HUEA 2O8DA 4H0OA 1EXQA 5E26A 4KHSA 4BDYA 1NGCA 4JKHA 5SZTA 3G6EN 3CQXA 4CJ5A 3DXMA 3R1XA 5FRMA 3EEQA 2O4GA 3SQ1A 3FFIA 3KIOA 1RDWX 4FWKA 1D9DA 3SBTA 4R5PA 4IJNA 4FJNA 4RW8A 3ZT2A 3K57A 1NE5A 1LW0A 1NK8A 1KC8O 2ATBA 5KQ8A 2ZM6K 1E3MA 1LWFA 3JYTA 4CFDA 2HW3A 3M8QA 1ZBLA 2I7NA 3MK6A 4E0DA 4DSIA 3FR0A 2DY4A 2LI7A 4EZ6A 2YNIA 3VQCA 2KFNA 4FLUA 1WSGA 3H1VX 3CIPA 3N4QA 3UIQA 5AZIB 3TAPA 1L3UA 2E2PA 4DTPA 2PZSA 3CFOA 1J5OA 4FK4A 1FKPA 1QHAA 1NK6A 4ISEA 1V4TA 3THWB 1RT1A 3C6AA 4DR1K 3ZT3A 2O8BA 2XY6A 1GPSA 3HPGA 3TTCA 3BY5A 2E1YA 4CEEA 5C10A 4BR2A 2F8SA 4AF1A 5C2FA 5MLCQ 4BE0A 4JHDB 2BTFA 4M3XA 1VSIA 4KH6A 3QMLA 4YOYA 1NH5A 1TVRA 4FLXA 4FJMA 4Z4FA 2O8DB 2A6AA 3GBTA 2F9WA 4C1NK 1JXBA 5GAEP 1BMRA 1S9GA 1C0FA 3KVGA 4LSNA 3P39A 3AVIA 4LD0A 1EQYA 1NK7A 2UUBK 4DMNA 4C8NA 3W3DA 4O8KA 3PSIA 5FPNA 1NMDA 2D56A 2ITGA 4ELUA 4DTOA 3I33A 3IRXA 5KGWA 1DT9A 3I0SA 1J9AA 4RW7A 5GIPA 1ZBUA 2G8IA 4I9QA 1EKEA 3QFUA 4NYNA 1S1UA 3FZFA 2ZJPL 3CG7A 4TSXA 4ELTA 4C8OA 1O13A 1B92A 3IKMA 3MMVA 4BRPA 4DV2K 1POIA 4IDKA 4UAEF 5JS1A 1YJWN 1B9DA 3MDQA 2YV0X 4B1YB 3D7EO 2A3ZA 2GTDA 4LH4A 2PY5A 4NLBA 4C8MA 4BE2A 2VCPA 1U45A 3L2QA 4Y0WA 2O8BB 2QWPA 4CHOA 4DSFA 5CHIA 3LM2A 1S1XA 3VQ7A 1NNEA 4BRLA 3LM9A 4DR2K 2GELA 2OZMA 4K41A 4LF4K 3VTHA 2GBZA 2OCEA 3MWTA 4PA1A 3RMDA 3MX2A 1KLMA 4CERA 1LAVA 1NK0A 1NOYA 5C2DA 5KGXA 3LDQA 4FWMA 4O55A 2P51A 3I8BA 2YNGA 1Z6RA 3O3HA 4FOEA 3UB5A 3A5NC 3V9SA 3AVCA 4J2AA 4EP5A 4H4MA 3ULDA 4DS5A 3CFRA 4Y1CA 5JENA 5GAHP 1JZAA 4Z4CA 2I61A 5IT9O 5ADXH 3K0SA 2HVHA 1HNZK 1N6QA 3ID6A 4LF6K 2E88A 5JLFA 1JCGA 1MU2A 4B1WB 2O8FA 3CXCM 3SUQA 3CCEN 3DAWA 4YFUA 2WFBA 5LMNK 3O9RA 2KJAA 4W5OA 1OH8A 5AQOA 4CJLA 4JYAK 3HOSA 3BF1A 3MCPA 2AJQA 4DSLA 1AYJA 1AHOA 1XWLA 3UKUA 1KAYA 3ZETA 3VEYA 4IKFA 5BRDA 4NLCA 2P9LA 3IUCA 4DR5K 5M1QA 2ZWHA 1EWQA 4AH9A 4JKDA 3E9OA 2A1SA 2WC9A 3AO5A 3DRPA 3P38A 3TAEA 1EO1A 2YJEA 2IGIA 4FJ9A 4O44A 2YIOA 1KLNA 3RMAA 4WFBL 1D8YA 1K8BA 3BUZB 4DSEA 2MN5A 2ZD1A 4M3TA 3OS0A 1GLFO 3LWMA 1ITGA 4QAGA 4CFBA 4Z4GA 4CFCA 1FXXA 3QBXA 1RTDA 1K8KA 4N76A 2V7ZA 3E1YA 1T7BA 2NLXA 1BI4A 4FLWA 5FPDA 1T7EA 4DTSA 2P9NB 1YIJN 3SV3A 3ZSYA 2FLOA 5I42A 3HSTB 3J81O 3TAQA 4RW9A 3FFKB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WT7 A;  5E84 A;  1IG9 A;  3P31 A;  5C42 A;  4BQZ A;  4ILH A;  1VHX A;  2JGU A;  4F2S A;  3FGU A;  4KO0 A;  4YY3 K;  4FJX A;  3QNO A;  1X9W A;  1Q82 O;  3SF4 D;  3NDK A;  4FZY A;  3QI7 A;  4J2E A;  1QQN A;  2LJM A;  4DTJ A;  3CCU N;  1RBT A;  3C65 A;  4YOU A;  5C0Y A;  4MO5 A;  3WEE B;  3OYI A;  1W9H A;  3GL1 A;  3U3G A;  2O4I A;  3MEE A;  2W41 A;  3DXK A;  1VQ6 N;  3TR8 A;  3LZJ A;  2XY5 A;  1GLD G;  3EO3 A;  4YOT A;  1VRU A;  4PUO A;  4JEP A;  3CCQ N;  3OBW A;  3LL3 A;  3THX B;  3QB0 A;  2YHW A;  4IG3 A;  4KTZ A;  5J2P A;  2Q31 A;  3MWP A;  4RG8 A;  3NH2 A;  3L56 A;  1ESV A;  2JWL A;  1A5W A;  1KFD A;  4QCL A;  2W40 A;  1IBL K;  3VGK A;  4PHT X;  4L8R B;  1RDC A;  1D5A A;  2QI2 A;  1TV6 A;  1P0A A;  1OVQ A;  1IV0 A;  2GMO A;  1JL2 A;  5JLH A;  2VY6 A;  4AIL C;  2KW4 A;  4JN4 A;  2HHV A;  2P5G A;  2OPQ A;  3J7A P;  3LDP A;  4DR3 K;  1L4V A;  4DFJ A;  1HLU A;  1RT7 A;  4K0K K;  4CHP A;  3E7U X;  4CGF A;  2QXF A;  5JS2 A;  4UAD E;  1RT4 A;  1VQ4 N;  3AVN A;  2QA4 N;  5JVH L;  5AZI A;  4E7J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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