5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
1U2VA 3O4WA 4ISEA 5BN8A 5F1XA 3LDPA 3BEXA 2GWKA 4FPBA 3FLCO 5LY3A 2E8AA 4MO4A 3CJ1A 4JHDB 3HI0A 4BRAA 1QZ5A 1X3MA 3BUZB 3OHRA 3UKRA 3WXIA 3H1QA 3UE5A 2F9WA 3VESA 3RSEA 2EWSA 5AZIB 5BPNA 3AARA 5ADXH 1ZBSA 3WXLA 5LJWA 1NGDA 3ZX2A 3WEEA 2A41A 4WQ5A 2QWRA 2P9KA 3H3OB 2Q36A 1S22A 4BC3A 1NMDA 3RSEB 3U9DA 4FWMA 4BR0A 4FWPA 2QWNA 3MCPA 2V7ZA 2IVNA 3CETA 1KXPA 3CJBA 3QMLA 3DXKA 3AY9A 1RFQA 3GG4A 3CJ7A 5AQTA 3AAQA 1T6CA 3EN9A 3CHWA 4CBUA 3HSCA 5AQVA 2H3GX 3VEWA 4I6MA 1ATSA 3VF6A 3D2FA 2FSJA 3KHYA 2P9LA 4CBXA 3A5OC 1NGBA 2E88A 1RDWX 5KPTA 2A5XA 5BR9A 3IUCA 3U9ZA 4B1YB 3CIPA 3DWLA 5E84A 5AQQA 4PL8A 1Z6RA 4B1VA 3UKUB 4CZGA 2ASPA 2ASOA 4H0YB 4ISFA 4JHDA 2Q31A 2QWMA 4CI6A 2FXUA 2FSKA 4CD3A 1V4TA 4K43A 5AQMA 1V4SA 4BR7A 3WQTA 4BRLA 2P9KB 3IDHA 4QS8A 2QWOA 2ZF5O 3HBTA 3C0BA 3FFKB 3TPQA 2PAVA 3VEXA 1SAZA 1DEJA 1JCGA 1GLAG 2E1ZA 1GLDG 3QBWA 4BRKA 5AQJA 4BGBA 4WQ5C 3LDLA 4IXCA 1NM1A 4O5FA 5JMVA 3I33A 4J8FA 1BU6O 3A0IX 3H45C 4CBWA 1QZ6A 2P9IA 3M6GA 3IMXA 1XUPO 2GWJA 2E2PA 4JN4A 1ESVA 4FL9A 1YUWA 1WOQA 5KPRA 2E1YA 2DPNA 3VF2A 3HTVA 4EIAA 5JLHA 4EHTA 2CGLA 3BF3A 3VEYA 1KAYA 2V7YA 5ELZA 2BUPA 3QBXA 4BRFA 2QWQA 1GLBG 4EFHA 3SK3A 3ZETA 4H5RA 4BROA 1BA0A 4H0TB 2QXLA 3UKUA 4PL7A 5CE3A 2GUPA 2F9TA 4A2AA 1BOTO 1Y64A 2P9SA 3SMPA 2P9PA 3ZETB 1MA9B 3GDQA 3VPZA 5BPMA 1C0FA 1ZC6A 3HZ6A 1XQSC 3EKUA 3SMSA 4B1WB 2GELA 1IJJA 4QS7A 5EXWA 4E1JA 3S41A 4BR5A 3J8AA 2YI1A 3H3NO 3A5MC 3LM9A 2D1KA 3FGUA 1GLJO 2KHOA 4EAHD 4PKGA 2ITMA 2ZGYA 4B1XB 1YXQA 3QICA 3LDOA 4BR2A 3DXMA 4FO0A 3SJHA 4F9OA 5AFUA 4CZFA 3ENOA 4KBOA 1NGJA 1WUAA 3ULEB 2Q0UA 2YHXA 3QDKA 5AZJB 3UB5A 3ZEUB 2GTDA 4A2BA 1HLUA 1NWKA 3W0LA 4BC2A 4K25A 4JNEA 4HWIA 1QQMA 4PKHA 4H5VA 2WUSA 1TYQA 4FWSA 4DHYA 2NLXA 4IO8A 1RGIA 3CQXA 5AQLA 4H0PA 3FZKA 2E2OA 4JD2B 1BDGA 4CJ7A 4EHUA 2ASMA 3VGLA 5AQIA 3A5LC 4CZMA 4NO7A 4RCHA 2E2NA 4M7XA 2HOEA 4C23A 5KPZA 4IZ9A 3G25A 3VERA 2P9IB 3LL3A 3WQUA 2P9UA 3ZEUA 4A61A 1BO5O 1G99A 4BGAA 5FPNA 4FWNA 2YHWA 3QFPA 4FPAA 2FSNA 4O8KA 3O5BA 3DXKB 1QQOA 2E2QA 2E20A 3MN5A 4BVOA 5AQOA 5FPMA 2P9PB 2CGKA 4YDUA 1GLCG 3CERA 3M1FA 4FSVA 1CZAN 5BRFA 3ID8A 2BTFA 3IFRA 4LC9B 4WQ4A 1K8KA 1E4GT 2Q0RA 4IWVA 3MK6A 4RWTA 1IG8A 5BREA 3L6QA 4H5NA 3B8AX 5AQUA 2D0OA 4FOIA 1GLEG 2HF3A 5AR0A 3H1VX 5AQHA 3HM8A 3ATVA 4FWRA 1XC3A 3H6EA 1GLFO 1K8KB 3GOIA 1T6DA 5FPEA 1JCFA 1Z05A 5TKYA 3QFUA 2IVPA 1SZ2A 3LDQA 1BA1A 2YJFA 3VGMA 3VF4A 4I6MB 1J6ZA 4BRQA 1GLLO 3VETA 5JLFA 4WQ4C 3O08A 2QM1A 4B9QA 1KAXA 1TYQB 2A40A 1R59O 2J4RA 2Q1NA 1ATRA 3A8YA 3WXJA 5KQDA 5ADXA 4DB3A 4WYBA 1NLVA 3JS6A 4BVPA 3R8EA 4BG8A 3VEZA 2Q97A 4BRHA 5BRHA 2V51B 1MWMA 5AQZA 1X3NA 3TU5A 1OKJA 5JICA 3U4LA 4B1ZA 1NGGA 3W3DA 4Y0WA 5AQPA 2W41A 3FE1A 1NGIA 3LM2A 1C0GA 2P9LB 2V52B 1JCEA 2PBDA 4BR9A 3WXKA 1NGHA 3O1BA 5BPLA 4BQZA 4L3QA 3UKRB 4FWQA 1MWKA 4BC5A 1P8ZA 4M63C 4H5WA 3ZX3A 2A3ZA 2AP1A 3DXMB 3FR0A 4DQ8A 3GL1A 4JAXA 2VYPA 1NGFA 3FZMA 4CZHA 1KAZA 3ZX0A 3DJCA 3LDNA 2YHYA 4CZJA 3JXUA 3VEOA 4CZEA 4XH4A 1U6ZA 2I7NA 4RTFD 1NGEA 4BQLA 1Q18A 2FF6A 1LCUA 1DKGD 3R9PA 2P9NB 4IJNA 3O6WA 4FWKA 2P9UB 3SLCA 5LJVA 4H0XB 4QS9A 4XH5A 1LOTB 3M3ZA 2D0PA 1BUPA 4BREA 4FWLA 4FWOA 4CZIA 3EL2A 1U2VB 2Q2RA 4MLEA 3ENHA 3O8MA 4MLHA 2VCPA 3CQYA 2CH5A 1X9JA 2I7PA 3F9MA 5EX5A 1HPMA 2P9NA 3I8BA 5AQKA 1BWFO 3WUHA 5BRDA 1BG3A 3ULEA 4YDUC 5AQRA 3CJAA 4BRPA 2HF4A 1MDUB 2D4WA 3O1WA 3FZHA 4PKIA 4BRCA 3EZWA 2P9SB 5AQWA 4XEIA 2A42A 1HUXA 4K42A 5AQFA 4HTLA 3EO3A 3VEVA 1ATNA 3MN6A 2IVOA 2FLOA 4BR4A 1HKGA 3MN9A 2ZGZA 3L4IA 1EQYA 1T44A 2IIRA 4IJAA 2HMPA 4ISGA 4B1UB 3U8XA 1TUYA 3O80A 5AZIA 2QWLA 4CZLA 3DAWA 4GY2B 5AZJA 4GNIA 3GE1A 4M7YA 4AM6A 2QW9A 3EKSA 3FZFA 1NGCA 4BRMA 3CJCA 1HKCA 4DCHA 1H1VA 4Z94A 3BF1A 1YAGA 5KQ8A 2W40A 5EVZA 4BRNA 5FPDA 5AQYA 4NB4A 2CGJA 3D2EB 4A62A 4CD1A 3VENA 3QB0A 5E26A 4BC4A 1HKBA 2FF3B 3VOVA 3WT0A 1DGKN 5F0XA 2AA4A 3P4IA 5AQXA 3FZLA 1QQNA 2OANA 4H5TA 5EOYA 2QWPA 1NBWA 3AAPA 5AQSA 2NRHA 3C7NA 4BRGA 5I9EB 3ATUA 4H0OA 3CJ9A 3MDQA 3BP8A 3CI5A 3MN7A 2YCHA 5AFUH 4BG9A 5BN9A 1TUUA 3GBTA 3WEEB 4JD2A 4AM7A 3D2FB 2ZWHA 4BRIA 5AQGA 2UYTA 3C7NB 1QHAA 2A6AA 3D7EO 4XH1A 2YJEA 3MMVA 4MO5A 1S3XA 2CH6A 5B8HA 3R6MA 3KVGA 4CZKA 1NGAA 4FOEA 1HJOA 1HX1A 1SQKA 2VWBA 3L0QA 3KZBA 3VGKA 3D2EA 5EY4A 3A5NC 5F2RA 4BRDA 4H03B 2GEMA 1D4XA 2NZTA 5AQNA 4K41A 1YVNA 4H0VB 3H46O 1E4FT 1ZXOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4WA 5BN8A 3HP6A 2LY5A 2O8DA 4YNQA 3BEXA 5LY3A 4MO4A 1QSSA 4FLUA 4I2PA 3H1QA 1NNEA 5AZIB 5C25A 3KOYA 3WXLA 5M1OA 1RT4A 1NE5A 2KFNA 3LANA 4CK3A 2UU9K 4IBNA 4F4KA 4FWMA 2YHAA 3OYJA 1VSLA 2IVNA 3CETA 4CJKA 3SAGA 3DXKA 3ZSWA 1W7AA 4E7KA 3CJ7A 2VG6A 4KHWA 4OKEA 3LPTA 1T6CA 3EN9A 3CHWA 1HNVA 3LAMA 5AQVA 4CBUA 5GAGP 2KTQA 4I6MA 1C55A 1W97L 1VSJA 3V9WA 2XY7A 2A5XA 4X62K 3U9ZA 3AA4A 2B6AA 5M1KA 4X65K 3DWLA 5IT9O 4B9VA 3OYEA 1N8RO 1Z6RA 4F3OA 5BR8K 4DV4K 3UKUB 1KC8O 1OVYA 1LQHA 2ASPA 4HUFA 4H0YB 4JLHA 4FJNA 5J2NA 2UUCK 4DTJA 3CCMN 2Q31A 5C15A 1HQEA 4BECA 3B6PA 1WSEA 4WFNL 4JRPA 1YJNN 4CD3A 3CCQN 1OH5A 3VN5A 5AQMA 4DG1A 4E7IA 3M8RA 4BR7A 3WQTA 1NK5A 1KRPA 2P9KB 3DLBA 2OPRA 1HNIA 5CYMA 1S5JA 3L2VA 4CFBA 1JL1A 5GIOA 1WAJA 3HVRA 1BCOA 4CJWA 1ZU3A 1VNBA 3KOXA 3FFKB 4LF9K 4CEAA 4NCAA 5I42A 1TK8A 4CGGA 4ZHRA 4X64K 4FM2A 4FJMA 1IG9A 5AQJA 4BGBA 2ITGA 4IXCA 4CEOA 4FK2A 1NM1A 1ZBUA 1CHZA 3I33A 4ELVA 1A5XA 2BGGA 2YKNA 3OS2A 1QZ6A 3SAHA 2NNWA 3M6GA 4B9UA 4A59A 3VTIA 4FL9A 5KPRA 2E1YA 2GV9A 4KHNA 4CHZA 5T7BA 4EIAA 1WAFA 2A1RA 5JLHA 3O9RA 4BDZA 4W5TA 1VQKN 2CGLA 3BF3A 1KAYA 2V7YA 5ELZA 3M5RA 1IKWA 2JLEA 4TSXA 2N2RA 4FLTA 1UA0A 4KKOA 4FLYA 4H5RA 4DV0K 3DOKA 4BROA 1RNHA 5MLCQ 4FLZA 2JWLA 4EZ9A 2QKBA 2QTDA 3UKUA 2F8SA 2O8DB 2ATQA 1VQ8N 4KPYA 2Y1IA 1RTIA 1BOTO 2P9SA 1XNQK 3ZETB 1S9GA 1PX9A 1IKXA 5BPMA 1C1BA 3K58A 1ZC6A 1G15A 1ASWA 3ZSYA 2NRXA 3EKUA 4CJLA 4MDAA 5A2QO 3MECA 5EXWA 1POIA 4E1JA 3KHWA 1JKHA 4OPHA 4BR5A 2F4VK 3J8AA 3H3NO 3A5MC 1N6QA 2G8HA 2O8FA 3TAEA 5J2MA 3P31A 3K2PA 2KKZA 2ITMA 3VTHA 3CD6N 3MEGA 1NK6A 3DXMA 4F9OA 5AFUA 4CZFA 1NGJA 1OVQA 2EX3A 3SQ4A 2P1JA 1Y97A 1WBDA 4JKGB 2ZQBA 4BC2A 1Q86O 3F9KA 2IC3A 2QK9A 3LP0A 4PKHA 4H5VA 2WUSA 1TYQA 3PSIA 4FWSA 2DFFA 4MQ3A 3RRHA 1RGIA 3QIPA 3FZKA 4Z0UA 1BDGA 2HMIA 4HCCA 1JXCA 5AQIA 1VQ7N 4ILGB 1Q9XA 1IBLK 1NOYA 3NH2A 1XC9A 1EWQA 1VSDA 4DTRA 1KFSA 1SV5A 4K8XA 4A5AA 1Z25A 3MEDA 3ZEUA 4AH9A 1BO5O 3VQQA 1S1UA 4CJ3A 4FWNA 2YHWA 3QFPA 4FPAA 3T1YK 2FSNA 1VQ9N 1C0MA 2G8IA 2VG5A 3NHGA 4NCGA 3M1FA 4HUEA 4M3ZA 1VSIA 3IFRA 4OPAA 4IWVA 4E7LA 4YOXA 3G4SN 4KHUA 3L2WA 1OMYA 3B8AX 2YEOA 3HPGA 3OYLA 3UIQA 1GLEG 3VQ7A 2WTUA 2HB5A 2HF3A 1U48A 4GV6A 3HM8A 3ZCMA 3H6EA 5M1QA 3J81O 1RTDA 1XI1A 4YY3K 2IVPA 4PHTX 3LDQA 1SKSA 1BA1A 1XMQK 3AVMA 3VGMA 4I6MB 1J6ZA 3HO1A 3CG7A 3F73A 1VQPN 1T7AA 3L3UA 1DTTA 3O08A 4B9QA 1ITGA 3KLGA 2O4IA 3AO2A 3HRGA 4CEDA 2GX9A 1NLVA 1REVA 1K9MO 4XIUA 3R8EA 2UUAK 1TGOA 4FJIA 1PE4A 1MWMA 4QCLA 4AHUA 3QERA 2RN2A 3V81A 4AHVA 1P0AA 1JLQA 1NGGA 4E0DA 3W3DA 4CIFA 2KFZA 2W41A 4OX9K 4GVMA 3FE1A 1L5UA 3CPEA 3AVBA 2XY8A 3SPZA 2V52B 2X6NA 3D45A 4FW1A 2HHIA 4L3QA 4O44A 1NRBA 3QEPA 4FWQA 4HE7A 3CM5A 1Z26A 4CERA 3P5JA 3O4NA 2HSTA 3DXMB 3HXMA 5JS1A 4JYAK 4C8KA 2O8EA 3GL1A 4FLXA 4L8RB 4IOAL 4IOCL 4CZHA 3FZMA 4KHQA 1KAZA 1LQQA 3CCUN 1VRUA 2O8FB 3VQ5A 3NDKA 1VSKA 5FLXO 3OW2M 4DSKA 3K5MA 3PX6A 1LCUA 4IG3A 4F2RA 4KB1A 1UGLA 1SKWA 2P9UB 5KRSA 2QEXN 4WF9L 4DSIA 1YJ9N 1OH6A 3ZSRA 3CQ8A 4KO0A 2Q3SA 3VQ8A 1C56A 3O9TA 2DFEA 1U2VB 1N32K 3AVCA 1C1AA 1NU0A 2B3CA 4F3TA 3TAMA 4BE1A 4R5PA 2D0CA 3LP3A 4OPJA 3D0PA 4Y1CA 3F9MA 3L4QA 3HYFA 1K8BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3O4W A;  5BN8 A;  3HP6 A;  2LY5 A;  2O8D A;  4YNQ A;  3BEX A;  5LY3 A;  4MO4 A;  1QSS A;  4FLU A;  4I2P A;  3H1Q A;  1NNE A;  5AZI B;  5C25 A;  3KOY A;  3WXL A;  5M1O A;  1RT4 A;  1NE5 A;  2KFN A;  3LAN A;  4CK3 A;  2UU9 K;  4IBN A;  4F4K A;  4FWM A;  2YHA A;  3OYJ A;  1VSL A;  2IVN A;  3CET A;  4CJK A;  3SAG A;  3DXK A;  3ZSW A;  1W7A A;  4E7K A;  3CJ7 A;  2VG6 A;  4KHW A;  4OKE A;  3LPT A;  1T6C A;  3EN9 A;  3CHW A;  1HNV A;  3LAM A;  5AQV A;  4CBU A;  5GAG P;  2KTQ A;  4I6M A;  1C55 A;  1W97 L;  1VSJ A;  3V9W A;  2XY7 A;  2A5X A;  4X62 K;  3U9Z A;  3AA4 A;  2B6A A;  5M1K A;  4X65 K;  3DWL A;  5IT9 O;  4B9V A;  3OYE A;  1N8R O;  1Z6R A;  4F3O A;  5BR8 K;  4DV4 K;  3UKU B;  1KC8 O;  1OVY A;  1LQH A;  2ASP A;  4HUF A;  4H0Y B;  4JLH A;  4FJN A;  5J2N A;  2UUC K;  4DTJ A;  3CCM N;  2Q31 A;  5C15 A;  1HQE A;  4BEC A;  3B6P A;  1WSE A;  4WFN L;  4JRP A;  1YJN N;  4CD3 A;  3CCQ N;  1OH5 A;  3VN5 A;  5AQM A;  4DG1 A;  4E7I A;  3M8R A;  4BR7 A;  3WQT A;  1NK5 A;  1KRP A;  2P9K B;  3DLB A;  2OPR A; 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