5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
1GLCG 1XC3A 2IVPA 1P8ZA 5F0XA 2D1KA 4C23A 3ULEA 4BG9A 1G99A 5ELZA 3IUCA 2F9TA 1X3NA 3CJ9A 5AQQA 3LDNA 1CZAN 2D4WA 3LM9A 3I8BA 3O8MA 4IWVA 4ISGA 1NM1A 1WUAA 5B8HA 3CJCA 3H3NO 3VEWA 3LDPA 4M7XA 5KQDA 1ATSA 5KQ8A 5BPMA 1HX1A 4K42A 3MN5A 2E2NA 5I9EB 4FL9A 3DXKA 3EKSA 3KZBA 3O4WA 1BUPA 3FZKA 4HTLA 3VF6A 4BRAA 4E1JA 2FSNA 4CZMA 1HLUA 5AZIA 1SAZA 3UB5A 4DQ8A 3C0BA 1BG3A 3QFPA 1NGFA 3SMSA 1HJOA 1LOTB 2Q0RA 4CZGA 4QS8A 4FOEA 2YJEA 1QHAA 1H1VA 2P9UB 4CD3A 3ATVA 2IIRA 1E4FT 2QM1A 3ZETB 4PL7A 2ZGZA 5AQXA 4BR4A 3R6MA 4HWIA 3CI5A 1HKBA 3BF3A 3CQYA 2BTFA 4MLEA 4BRFA 4BQZA 1NGAA 1RGIA 3CJAA 3GBTA 4FWQA 4CZLA 4BRLA 5AQYA 3BP8A 3HTVA 5E84A 2IVOA 1NBWA 4FPAA 3U8XA 1K8KB 1T44A 1ZC6A 4BQLA 1BDGA 3QICA 5AZJB 4BC2A 3H46O 3EL2A 5JICA 1Z6RA 4K43A 4F9OA 3DXMA 3U9DA 3IFRA 4A61A 2VWBA 3H6EA 3GE1A 3GDQA 3ULEB 1GLBG 4MLHA 3QBWA 3UKRA 4CBWA 4XEIA 2A6AA 4RWTA 1D4XA 5JLHA 2D0OA 2PBDA 1C0FA 5BPLA 3SLCA 1QQMA 3TPQA 5FPMA 3QFUA 3AY9A 4IJNA 3UKUA 3D2EA 2I7PA 3VF2A 1R59O 3QB0A 4PL8A 2W41A 4GY2B 2F9WA 3DXKB 3R9PA 2YHXA 2FF6A 2Q36A 2CGKA 4H5VA 4YDUA 4BGAA 5AZIB 4EAHD 4BG8A 1MWKA 3WQTA 3ATUA 2Q97A 1KAYA 3MMVA 5AQJA 2E2OA 3WQUA 4WQ5A 3KVGA 3CERA 1ZXOA 1YAGA 3EKUA 2CGJA 4I6MA 5BRHA 3MN9A 2YI1A 1GLDG 1GLJO 4GNIA 4IO8A 4PKIA 4CI6A 2ASMA 3WXJA 1JCFA 3CJBA 1GLEG 4PKGA 2QWRA 4ISEA 4XH1A 2ASPA 4BR5A 1S22A 1Q18A 3M6GA 5LJWA 5AQTA 4DHYA 3CIPA 1KAZA 2P9SA 3ZEUA 3O5BA 4CZIA 1QZ6A 5KPTA 2FSJA 4LC9B 3WUHA 3FZFA 4H5WA 3UKRB 3C7NA 2QWOA 4JAXA 2UYTA 3D2EB 2GEMA 3QBXA 4BROA 3A5NC 2ZF5O 1NLVA 2YHWA 1NGCA 2I7NA 3QMLA 2GWKA 1GLAG 2CH6A 3H1VX 2PAVA 2KHOA 5AQZA 3MN7A 4IZ9A 1S3XA 2V51B 2EWSA 5AQVA 4EIAA 1KAXA 3AARA 4Y0WA 5BRFA 5AFUH 3U9ZA 3ENOA 3KHYA 4NB4A 2P9PA 3FR0A 1NGGA 4H0OA 1YXQA 4WQ4A 2QWPA 2HMPA 5EXWA 4I6MB 2QXLA 4FSVA 3WT0A 1WOQA 3SJHA 1MDUB 4A62A 4B1WB 3A0IX 3DAWA 1IJJA 4FWKA 5BREA 3FZHA 5F2RA 3TU5A 3MN6A 3ZX2A 3A8YA 2WUSA 4H0YB 3O6WA 2HOEA 2YCHA 4FO0A 1BOTO 4M7YA 4A2AA 4BRKA 4MO4A 4BREA 3VESA 3JXUA 4DCHA 2P9SB 3VGKA 3ZEUB 1NGDA 1JCGA 3FE1A 2A5XA 4FWRA 5EY4A 4JHDA 3C7NB 3OHRA 3L4IA 3HSCA 3LDOA 1QQNA 2GUPA 3ENHA 1BO5O 3U4LA 3EN9A 4BRHA 5BR9A 3IDHA 1XUPO 3FLCO 4CZKA 4L3QA 2P9NA 1GLLO 4RTFD 5AQGA 3VEXA 2E88A 3IMXA 4XH4A 2GELA 3FZLA 4CD1A 3GL1A 4B9QA 3VOVA 1YUWA 4BC3A 2OANA 4BC4A 2D0PA 4CZHA 4B1XB 3QDKA 2FSKA 4CBXA 2AP1A 1X3MA 4H0VB 2IVNA 3AAQA 4J8FA 5ADXH 4YDUC 4FWOA 4FWSA 4CZFA 3L6QA 1ZBSA 3D7EO 3ZX0A 2E8AA 2Q2RA 2P9PB 2AA4A 5AQMA 3WXLA 5AQNA 4BRQA 4O8KA 5AFUA 3VEOA 3H3OB 2E2PA 5AQHA 3CJ1A 2ITMA 3J8AA 3CHWA 4BVOA 5CE3A 1HKGA 3RSEA 1QQOA 3VF4A 4CJ7A 1RDWX 3FGUA 3L0QA 5FPEA 1LCUA 4B1ZA 4MO5A 1SQKA 2FLOA 2NZTA 2V52B 3G25A 3W0LA 3O80A 3VEVA 3DXMB 1T6CA 4H0PA 4EFHA 3F9MA 3M3ZA 1DGKN 3VETA 1ATNA 2DPNA 2CH5A 1TUUA 5AQOA 4JHDB 5EX5A 3HM8A 1XQSC 3UKUB 1V4SA 2NLXA 1E4GT 4BR9A 4H5RA 2GWJA 2A40A 2ZWHA 4NO7A 1BWFO 4BR7A 5TKYA 1RFQA 2H3GX 3HBTA 1HUXA 2P9NB 1BA0A 2V7ZA 4BGBA 4B1UB 4QS9A 3BF1A 2QWNA 1U2VA 2P9LA 1C0GA 4A2BA 1ESVA 1TUYA 3VERA 4K41A 4JNEA 4JD2A 5LY3A 2YHYA 5E26A 3S41A 4FWPA 1HKCA 5EVZA 4H5NA 5AQUA 3A5MC 4EHUA 2P9IA 2VCPA 5AQKA 2P9KA 1BU6O 3MK6A 4FWLA 5ADXA 1T6DA 2A42A 4IXCA 3DJCA 4B1YB 2A41A 2ASOA 3BEXA 3LL3A 4H5TA 3LDQA 1X9JA 4WQ4C 2HF4A 4PKHA 2Q1NA 5AQLA 1NMDA 5F1XA 3EZWA 3RSEB 2E1YA 5AR0A 1U6ZA 2NRHA 3CETA 3FFKB 4EHTA 2E2QA 4BRCA 5BN8A 3VENA 3P4IA 4FWMA 2FF3B 1NGBA 1TYQA 2E20A 3A5OC 4FWNA 4BRIA 2HF3A 3LM2A 4BRGA 1YVNA 4BRMA 4AM6A 2J4RA 5KPZA 5FPNA 2Q0UA 1NGEA 3B8AX 3MCPA 4BR0A 5KPRA 4B1VA 4QS7A 3GOIA 3AAPA 1NWKA 4KBOA 5FPDA 3D2FA 4O5FA 3VPZA 3WEEA 1Z05A 2GTDA 4CZEA 4AM7A 1JCEA 4CZJA 3ID8A 1DEJA 3SK3A 1GLFO 2ZGYA 3ZX3A 2P9LB 1U2VB 3UE5A 1MWMA 1J6ZA 1ATRA 4CBUA 4Z94A 3H45C 4JD2B 4M63C 5EOYA 5AQFA 4BRNA 4BR2A 2BUPA 1IG8A 1NGHA 5JLFA 2FXUA 1NGJA 3FZMA 3BUZB 2P9IB 3O08A 3MDQA 4ISFA 4BVPA 5BRDA 4FOIA 2P9KB 2V7YA 3A5LC 4JN4A 4BRPA 3SMPA 3LDLA 2VYPA 3O1BA 4DB3A 5BPNA 2YJFA 1OKJA 3I33A 1MA9B 4WQ5C 1NGIA 5JMVA 4BC5A 2CGLA 3O1WA 1HPMA 3W3DA 3R8EA 3CQXA 1EQYA 1KXPA 4K25A 4BRDA 2P9UA 3VEYA 2QWQA 5AQRA 3ZETA 5AQPA 1BA1A 3EO3A 4XH5A 2QWMA 3HZ6A 1QZ5A 2W40A 1TYQB 5AQSA 3DWLA 3WXKA 5LJVA 5BN9A 5AQWA 1SZ2A 3M1FA 4H0TB 2A3ZA 4IJAA 1Y64A 2Q31A 4WYBA 4H0XB 3VGMA 3JS6A 2E1ZA 4H03B 4RCHA 3WXIA 3HI0A 1DKGD 1K8KA 3GG4A 3VEZA 5AZJA 4FPBA 2QW9A 3D2FB 3CJ7A 3H1QA 5AQIA 3VGLA 3WEEB 1V4TA 2QWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLCG 2IVPA 4ICLA 1RCHA 2FC0A 4EP4A 1YT3A 4DKWA 2LY6A 4DFJA 2KPYA 4KFBA 1OH6A 4ELTA 5ELZA 3IUCA 1S1TA 3V1RA 4IWVA 3LM9A 1KCFA 4ISGA 4FJLA 3CJCA 3OYMA 3AVMA 3H3NO 4FK2A 4CJWA 4M7XA 3L8BA 3KK7A 4NLBA 5KQDA 2NRWA 4IOCL 2E3GA 4K42A 1LWFA 4FL9A 3EKSA 4OPAA 3I56N 4BRAA 2SN3A 3K9JA 4FVUA 2UXDK 3UB5A 1BG3A 3IG1A 2HHQA 1KFSA 1LOTB 2NUBA 4RG8A 1RDUA 4DR6K 4FOEA 3VQQA 4MDAA 2GMOA 1QHAA 3SCXA 4H8KA 4CD3A 2IIRA 3NF7A 3S3MA 5AQXA 3HT3A 1VSLA 2PY5A 1RDCA 3VQPA 4FZZA 1NGAA 3CJAA 4HUGA 4CHOA 4DTOA 1TK0A 4CGIA 3C6AA 3RRGA 1IKYA 2G8IA 5AQYA 3BP8A 1B7DA 3HTVA 5H1SQ 3IAYA 1NBWA 3GKUA 2VWKA 3U8XA 1Q82O 3LPTA 4BQLA 3MX5A 5JICA 2KKZA 3DXMA 1NJYA 5GADP 1SUQA 4E72A 4CF0A 3UKRA 4YOUA 2E2FA 4RWTA 1WSEA 1K8AO 1D4XA 4BECA 2PBDA 3CPEA 3SLCA 3TPQA 2VY6A 4IJNA 3D2EA 2I7PA 4QOZB 2O8FA 2W41A 1BHLA 1A5WA 1VAZA 4CJSA 4OGEA 2F9WA 3U6FA 3R9PA 2N66A 2WBNA 3SBGA 3HYFA 2Q36A 4H5VA 1AYJA 3OYNA 1TKTA 3RVCA 4BGAA 5AZIB 4Z4CA 2RF2A 1Z26A 4PY5A 4KH6A 4BG8A 1MWKA 2MZ0A 1U45A 5FROA 2WFBA 5JVGL 3VQAA 3OYBA 1J5EK 4EZ6A 3AGRA 3WQUA 4WQ5A 3KVGA 4NXNK 3OYJA 2CGJA 4I6MA 3MN9A 3E7UX 2KYQA 3VQ9A 1RTIA 1GLDG 1FJGK 4I7FA 1C0MA 4PKIA 5HRSA 1XMQK 2E3FA 5EU7A 4JKCA 3WXJA 2O8EA 1GLEG 3ZSXA 4CCHA 4M42A 1P0AA 4XH1A 3VQ4A 1ZYVA 1NOYA 3M6GA 1S1VA 1XC9A 1DJTA 1TKZA 3CIPA 2P9SA 3O5BA 4JKGA 5IT9O 2FSJA 4LC9B 3WUHA 3AVKA 3FZFA 4DS5A 3PSFA 5KRTA 2F8SA 2UYTA 4DV7K 3AGKA 1KVCA 3SQ1A 1KLMA 4YOYA 3EE9A 1VQ9N 3A5NC 2ZF5O 1KFDA 4FJIA 4CEOA 3SQ2A 2GWKA 3OW2M 2CH6A 3OJSA 5IWAK 4CJPA 3OS2A 3E9OA 5AQZA 3MN7A 4NCAA 4IKFA 3VQEA 2EWSA 4EIAA 1KAXA 3NGYA 4IOAL 4DQQA 1U48A 3U9ZA 3ENOA 2LJMA 3O9SA 3KHYA 4NB4A 3CFOA 1NPIA 3HOSA 1N32K 5M1NA 3WNHA 2QWPA 2HMPA 3H08A 1NK6A 3NVMA 4M45A 2FBYA 4A62A 5I42A 4DUZK 4PQUA 5BREA 4FWKA 1ZU3A 1S5JA 4CHNA 3VTIA 3TI0A 1N5YA 4ZTFA 1LV5A 1KSPA 4FO0A 1DLOA 4YFUA 1BOTO 5FRMA 1VQ6N 4B9UA 4BRKA 2IAJA 2GX9A 4JK8A 4MO4A 3ZSQA 3VESA 3OYAA 3OYHA 3VGKA 1MR4A 2X78A 4O0JA 3ZT4A 1JCGA 3TWHA 1QSLA 1NKEA 1BO5O 3U4LA 3AVFA 4EP5A 3BGRA 3IDHA 5BR9A 1ASVA 4CZKA 4HVJA 4IO9L 3QIPA 5J1EA 1SL0A 3O9RA 3J7YP 3IMXA 4XH4A 2IDOA 4JKDA 3TAMA 4DR5K 3JSMA 4FVMA 3VOVA 1YUWA 4YORA 2OANA 2YNGA 4BC4A 1S6PA 4IFYA 4B1XB 1BQNA 3QETA 2IVNA 1KVBA 3CFRA 3HPOA 3UIQA 1BISA 1JZBA 4LD0A 1ZBSA 2OPQA 3NBPA 3V9WA 2AA4A 1UA0A 3O9QA 3THYA 2E2PA 4DV5K 5AQHA 1KV0A 4BVOA 5LMNK 2UUCK 5M1FA 4ID1A 4ELUA 4CERA 3AA2A 2WONA 3QERA 1NK7A 4N47A 3AVLA 3VQBA 1HNZK 3ASMA 5KGWA 1LCUA 4B1ZA 4MO5A 1YVUA 2PYLA 2FLOA 3G25A 1RTHA 3O80A 5M1OA 3VEVA 2HHSA 4W5TA 3D45A 3NMUA 3F9MA 2UXBK 1RBUA 4OPHA 5AQOA 5EX5A 2Y1IA 1XQSC 3UKUB 4UJ0A 1V4SA 4GKJK 4O0IA 4H5RA 2GWJA 3CCEN 1BWFO 2QI2A 1T1TA 4X64K 2P9NB 2DFFA 1U49A 3LP3A 3P38A 2HBLA 3LANA 2KTQA 4B9VA 1EKEA 4FWPA 1A5VA 4H5NA 5AQUA 1TL3A 2QXFA 3CYGA 5M1PA 1ZBIA 5ADXA 4IXCA 4AH9A 4DQRA 2Z1GA 1ZVEA 2ASOA 2KBHA 4H5TA 1X9JA 3L3UA 2LT8A 1NU0A 1T3VA 2HF4A 5JVHL 4KHUA 4PKHA 2Q1NA 5F1XA 3EZWA 1U6ZA 3ITHA 5KI6A 4PWDA 4LFBK 3KIOA 4EHTA 2E2QA 1CZ9A 4J2EA 4LF6K 1L3UA 1BCGA 3P4IA 1IKVA 2FF3B 4B3MK 1TYQA 2E20A 4KTQA 2BDPA 4WFBL 4XIUA 4E1MA 3M8RA 1YVNA 3S5TA 5J2PA 2J4RA 1HNVA 5KPZA 4W5NA 3G10A 5KPRA 4IFEA 3THWB 4LF4K 1REVA 4FW1A 4JS5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GLC G;  2IVP A;  4ICL A;  1RCH A;  2FC0 A;  4EP4 A;  1YT3 A;  4DKW A;  2LY6 A;  4DFJ A;  2KPY A;  4KFB A;  1OH6 A;  4ELT A;  5ELZ A;  3IUC A;  1S1T A;  3V1R A;  4IWV A;  3LM9 A;  1KCF A;  4ISG A;  4FJL A;  3CJC A;  3OYM A;  3AVM A;  3H3N O;  4FK2 A;  4CJW A;  4M7X A;  3L8B A;  3KK7 A;  4NLB A;  5KQD A;  2NRW A;  4IOC L;  2E3G A;  4K42 A;  1LWF A;  4FL9 A;  3EKS A;  4OPA A;  3I56 N;  4BRA A;  2SN3 A;  3K9J A;  4FVU A;  2UXD K;  3UB5 A;  1BG3 A;  3IG1 A;  2HHQ A;  1KFS A;  1LOT B;  2NUB A;  4RG8 A;  1RDU A;  4DR6 K;  4FOE A;  3VQQ A;  4MDA A;  2GMO A;  1QHA A;  3SCX A;  4H8K A;  4CD3 A;  2IIR A;  3NF7 A;  3S3M A;  5AQX A;  3HT3 A;  1VSL A;  2PY5 A;  1RDC A;  3VQP A;  4FZZ A;  1NGA A;  3CJA A;  4HUG A;  4CHO A;  4DTO A;  1TK0 A;  4CGI A;  3C6A A;  3RRG A;  1IKY A;  2G8I A;  5AQY A;  3BP8 A;  1B7D A;  3HTV A;  5H1S Q;  3IAY A;  1NBW A;  3GKU A;  2VWK A;  3U8X A;  1Q82 O;  3LPT A;  4BQL A;  3MX5 A;  5JIC A;  2KKZ A;  3DXM A;  1NJY A;  5GAD P;  1SUQ A;  4E72 A;  4CF0 A;  3UKR A;  4YOU A;  2E2F A; 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