2FBXA

Wrn exonuclease, mg complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 63
structure length 195
sequence length 195
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbxA00
1RDDA 2G8UA 4I9QA 4M3RA 4CEEA 4DF4A 1QSLA 4DQRA 3QLHA 1QTMA 1NK6A 2HHUA 3F9KA 4M42A 1EP4A 3LP0A 1TKTA 1L3UA 4I2QA 3DI6A 4Y1DA 2OPQA 2X74A 1RBRA 2Z1IA 4CIGA 3HXMA 3TAPA 1TL1A 3NFAA 3TAQA 1X9MA 1N5YA 3IRXA 4DSFA 1NK8A 1I39A 4CJSA 3KLFA 1VSEA 5FRMA 2FBYA 1JLAA 1KVCA 3OYKA 4AHCA 1BIZA 4KB1A 1JKHA 4E7KA 3OY9A 1CXUA 1HQEA 4IG3A 1ASUA 5CYMA 3L2UA 1NJWA 2HB5A 4F3TA 1J54A 3V9SA 3V6DA 3OYLA 1JLGA 1KVBA 3ISNC 2RPIA 2D5RA 2XY8A 3VQCA 1RILA 1VRTA 1WSJA 4CHQA 4BDZA 4J2AA 3AO4A 3O4NA 4BE1A 3VA3A 2IAJA 2IGIA 3DRPA 5KGXA 4CERA 3HSTB 1EX4A 4LSNA 3NDKA 1KCFA 1VRUA 1A5VA 2GV9A 1S1TA 4BE0A 1TK5A 4FJXA 4RW7A 1D8YA 4FW1A 3RWUA 2HHXA 2FC0A 3RMBA 3NAEA 4OKKA 2VG5A 4FW2A 3WNFA 1UA0A 3SV3A 3KK2A 1XC9A 4CF2A 4E1NA 5KRSA 3IAYA 3DMJA 4PQUA 3CQ8A 2A1SA 4DFMA 3OYEA 4B9NA 1O1WA 3HP9A 3CM6A 4I9LA 1ASVA 2KW4A 3KK1A 5CZ2A 1LWEA 1BGXT 1W0HA 4CGHA 3PO4A 3NH1A 2DFEA 1LWCA 3T1AA 5CZ1A 3CFPA 3WNGA 3TANA 2XY5A 2X6SA 2B6AA 3U3GA 2RF2A 1BISA 2YNHA 1GOCA 3B6OA 3HM9A 3QNNA 5HP1A 1UWBA 3OS2A 4H4OA 1W9HA 4R5PA 4IDKA 4XIUA 4CFCA 4KHWA 4GMJB 4NCAA 2QKBA 5J1EA 4JRQA 1NKCA 2R7YA 2P51A 1TKXA 3SJJA 4Z4CA 3V9UA 5KTQA 1L3VA 4CJPA 4Z4HA 3G10A 4QOZB 1A5WA 4LSLA 3L8BA 2XY7A 2O4GA 1BQNA 3KKRA 4MQ3A 4KI6A 1SUQA 5I42A 4Z4GA 3M8QA 1JLBA 2FBVA 4OKJA 3JYTA 4KFBA 2YHAA 3IS9A 4Y1CA 3HVRA 4DQQA 3ULDA 3NBPA 5KGWA 1C1AA 4CGGA 3KK3A 1UA1A 4CK2A 1NK0A 2P5GA 1RTJA 1Y97A 3HJFA 4BWJA 3T3FA 3C6UA 3VQAA 1IH7A 1K6YA 3LPUA 1KTQA 3S3MA 4N41A 1C0TA 3PX0A 1J53A 4CFBA 2X6NA 1HQUA 2HHVA 1RT7A 1QHTA 3NHGA 4DQIA 4HUFA 4F2SA 2YKMA 3K5OA 3HYFA 1HRHA 4Z0UA 3M8PA 3V9XA 1WSEA 1JL2A 4OKEA 1TK8A 2OA8A 3OJSA 3KLEA 5SZTA 3SV4A 1SKRA 3VA0A 1WSHA 1Q9XA 4FLYA 1EKEA 1X1PA 3ZT3A 4C8NA 3ZCMA 3C94A 2RN2A 1NOYA 3OYNA 3OJUA 2AJQA 4ID5A 4B08A 2Y1IA 4M3TA 3CG7A 4FLVA 2F96A 4E7IA 1UOCA 3P1GA 1FK9A 3SUQA 2E4LA 3TR8A 4HTUA 1D9FA 1A5XA 5K14A 1JLCA 5FDLA 4CJRA 4N5SA 4E3SA 2PYJA 4FZXC 3AO2A 4AHSA 3P5JA 3AA3A 2GUIA 4CF9A 3S3NA 4CJKA 3L2RA 4DTOA 1EXQA 4CJUA 5FRNA 2KZMA 1GOAA 1SKSA 1DTTA 5JS2A 4ZTJA 3HP6A 4DTUA 1T8EA 3NGYA 4J2EA 2B4JA 4W5RA 1TAQA 1RBUA 3NGZA 3OYFA 1ZBLA 4IKFA 4RW4A 1VSDA 4GVMA 4CHPA 4W5NA 1RT2A 3EY1A 3VQ6A 4HVJA 2EX3A 4Z4IA 1B9FA 1KLMA 4FJJA 4CE9A 4FK2A 4OPJA 3H08A 3QESA 4DS5A 1T03A 1RBSA 4OGEA 2G8WA 5FROA 2IC3A 4AHUA 4CJVA 2YV0X 2QK9A 2KFZA 3AVBA 1RDAA 4DFPA 4DU3A 3AO1A 4DLEA 3DLBA 4DQSA 4B9VA 1RDBA 1KSPA 1HJRA 1YTAA 4GW6A 4KO0A 1S9EA 2W42A 2YNGA 3WNEA 4N47A 1TKZA 3CM5A 3V4IA 1J5OA 3VQ9A 2XHBA 2HHSA 2IS3A 4J2DA 4DTSA 4HHTA 3LZIA 1X9SA 1FXXA 3FFIA 1C0UA 2FBXA 4QAGA 3V81A 4FJ7A 1RBTA 3LP1A 3ASMA 3VQ4A 4DTRA 4F8RA 2DFFA 4DU1A 3AVLA 3E01A 1KVAA 3D0PA 4C8LA 3NF7A 3MECA 3SPZA 4N76A 2ETJA 4B8CA 5E41A 1YTUA 1KFSA 4F2RA 4EP4A 1NK9A 3L2VA 1B9DA 2XY6A 3K57A 1U4BA 4B9UA 4FJNA 1CLQA 4FM1A 4F3OA 3D45A 3JSMA 1RDCA 3AVFA 4W5OA 4FK0A 1C6VA 4AHTA 1EETA 2DFHA 4CFDA 1JLEA 4FJ5A 1TV6A 3ZSYA 1QS4A 1S1WA 4KTZA 3O3HA 3LP2A 3LWLA 3SI6A 2F8SA 1WSFA 3NF9A 1B92A 2YHBA 4B8AB 4CEFA 3DRRA 4G1QA 5HBMA 4NCBA 4C8MA 3PV8A 5J2NA 3MXMA 5T7BA 3L3VA 4HCBA 4DTPA 4DSKA 1HMVA 4HUEA 4FK4A 4IBNA 1CZ9A 4E7JA 1D9DA 2IDOA 4CK1A 4FJ8A 1REVA 1SV5A 3LAMA 4LD0A 1JXBA 1ZBUA 2VG7A 3KJVA 2VWKA 4CJTA 1VSJA 1S1XA 4E1MA 3QNOA 2DY4A 3OVNA 1IKWA 4J2BA 1U04A 4HUGA 3V9ZA 1BL3A 4CEQA 5J2PA 4JS4A 3ZT4A 4CK3A 3KTQA 3VQPA 5JS1A 3PUFA 3DOLA 1Q8IA 4FLWA 3AVNA 3RTVA 1MU2A 1Z26A 3OYIA 1ASWA 3U6FA 4OLBA 3V1QA 3UIQA 3RMAA 4FVMA 4N56A 4Q5VA 4CFAA 1JLFA 1BIUA 1WAJA 3SUPA 5DK5A 4DTNA 3TAFA 1ZBHA 5C42A 3VN5A 1XWLA 4LY7A 4CGFA 4DTJA 4KI4A 3RRHA 1NJZA 4KHQA 4CGDA 4YNQA 2KQ2A 2Z1HA 5CY4A 3AVJA 3QEIA 4KHNA 1HNVA 1LW0A 3QETA 4I7FA 1SL1A 4LH4A 1S5JA 1BQMA 2JLEA 3QERA 3ZT2A 4C8OA 3O4QA 5J2QA 1RBVA 2OPRA 4M3ZA 3OYBA 2OPSA 4ELVA 2I5JA 1NJYA 2ZD1A 3S9HA 3KD1E 2VWJA 3RRGA 3OS1A 1T7PA 2HMIA 3K5NA 3QO9A 4FLZA 4CCHA 4JS5A 4BE2A 3DYAA 4E7LA 4DU4A 4IG0A 4FLUA 3KLHA 4ICLA 3AA2A 4Z4FA 3OYHA 4OLAA 3NCIA 3DOKA 3OS0A 4UQGA 3P83D 2FBTA 3ZT0A 1NK7A 3AVMA 4O55A 2Y1JA 3HK2A 1TK0A 5C25A 4CGJA 4DTXA 1LAWA 3LDSA 1TAUA 4M3WA 4OGCA 5HRPA 4DFJA 2BGGA 3F73A 1WN7A 4FJGA 4PWDA 1CZBA 3G0ZA 3I8DA 4CHZA 1WNSA 4PUOA 2HHWA 4ZHRA 3K58A 3KLGA 4DG1A 3A2FA 2NUBA 3OYCA 3RMDA 3HT3A 3ZSQA 4CIEA 3SNNA 1S1UA 3NF6A 3TI0A 3VQ5A 1VSMA 3SYZA 3U3YA 4CHNA 4M3XA 1C0MA 3OYGA 4B9LA 4K8ZA 3SQ0A 1QSYA 1WAFA 1Z25A 4NCGA 2OYQA 2E6MA 3DLHA 3VQDA 4CIFA 4M41A 4FLXA 4DFKA 2F8TA 3SUOA 4B9MA 4ELTA 2LSNA 1RT4A 5HRSA 3RR8A 5KRTA 3CYMA 4M45A 4FJLA 5HRNA 3SCXA 3HL8A 5HLFA 4Z4EA 3QEPA 1J9AA 1DTQA 4B3OA 3CFRA 1Q9YA 5D3GA 2D0BA 4OPKA 3AVHA 3M8RA 4C8KA 3LPTA 1NK4A 2HVHA 4RW6A 4MFBA 1TGOA 3MXIA 1ZBFA 2ATQA 3TARA 5SWMA 1F21A 1C1CA 3OYDA 1WSGA 3TAEA 1HNIA 3LP3A 1IG9A 2HNDA 1KLNA 4DLGA 1KRPA 4KPYA 2O4IA 4JLHA 3TABA 4DSJA 2YNFA 4CF8A 4E89A 2OZMA 3HPHA 4AHVA 4O0IA 4DSLA 1RT5A 1VSHA 2XO7A 3L2WA 4K8XA 1BI4B 5HRRA 2WONA 2HNYA 3O3GA 4CGIA 2E6LA 3SQ1A 2PY5A 4YFUA 4FJKA 4PY5A 3KLIA 4O0JA 4KREA 2HW3A 1T05A 4FZYA 1GOBA 3MEEA 4AH9A 3BDPA 4IFVA 3ZSZA 2BANA 1TL3A 2D0CA 1KFDA 2ITGA 4O4GA 4CJWA 1XI1A 1NKBA 4FJHA 3M8SA 3QEWA 3PO5A 2G8HA 4O5BA 4EP5A 2DTUA 3IG1A 4LH5A 1S9GA 4F4KA 1X9WA 3ZT1A 3LWMA 3OYJA 3B6PA 1WLJA 4CECA 3NE6A 3ZSOA 3QEXA 4BDPA 4FJIA 4Q0BA 2HVIA 3NH2A 2Z1GA 3SQ2A 3AVGA 3WNHA 5I3UA 1VK0A 2ZE2A 1TKDA 1U48A 4AHRA 2IOCA 3V9WA 4H4MA 1QSSA 4E19A 2PZSA 2G8IA 3LAKA 1C1BA 4FYDA 2QXFA 3KD5E 3V1OA 4FJ9A 4KB0A 1NK5A 3AV9A 4NYNA 3SZ2A 3AO3A 1IKVA 1L3SA 4CEAA 3PY8A 5EU7A 1BCMA 3ZSXA 4CEZA 1BCOA 3TAGA 4IFYA 1HYZA 2Z1JA 3VQ8A 3HPGA 1IKXA 1RNHA 1RT3A 3QEVA 3LANA 4OJRA 1L5UA 2Q3SA 1D5AA 1LW2A 3CFOA 1TVRA 4E0DA 4L8RB 3TWHA 1VSLA 2EHGA 2GBZA 2D0AA 3VQQA 2KTQA 1SL0A 1IO2A 1LV5A 3AVKA 2BE2A 1YT3A 2ZQBA 1FKPA 4KHSA 1U45A 1WSIA 1NJXA 1ZYQA 3PX6A 4FCYA 1S6QA 1LWFA 1LAVA 1SKWA 1RTHA 1IKYA 5HROA 4KTQA 3DLKA 1SL2A 3NGIA 4EZ6A 3AA4A 4JRPA 3QIOA 3QINA 4CESA 4DF8A 4HCCA 1HYSA 1U47A 1CXQA 4CEDA 3HPOA 4DMNA 3KIOA 3K59A 4CJ4A 2WOMA 3C6TA 4CJ5A 4KV8A 3T19A 4RW9A 2XRIA 1NOZA 3I0SA 3ALYA 4FZZA 4NYFA 3KKSA 3AVIA 4TSXA 4BWMA 1RT6A 3MXJA 1RTDA 2B5JA 1U49A 2G8FA 4CHOA 4BDYA 4CJFA 4CHYA 3VQEA 3RMCA 1QQCA 4H8KA 4O44A 2JGUA 3NH0A 2G8VA 1RTIA 4WE1A 2HHQA 4EZ9A 3ITHA 4CJEA 3OYAA 4FXDA 1JL1A 4KTWA 3LZJA 4FLTA 1ZBIA 1RCHA 3O3FA 3DRSA 3SPYA 4W5TA 1ITGA 3K5MA 1JLQA 2X78A 4CF0A 2RKIA 3NF8A 2QKKA 1BHLA 4KKOA 1BI4A 4RG8A 3DM2A 3L2QA 3EZ5A 3LALA 4DSEA 2KZZA 3EYZA 2P1JA 4KRFA 2P5OA 1XHZA 1FKOA 5CYQA 4CJLA 1VSIA 3AO5A 3OYMA 1QE1A 1S1VA 4KHUA 1VSKA 4ID1A 1G15A 3QIPA 4PA1A 3VQBA 2A1RA 4QCLA 2G8KA 4DQPA 4W5QA 1DLOA 3AVCA 1YVUA 3DLEA 4CJQA 2PYLA 3DLRA 3AA5X 2OZSA 2YNIA 3S3OA 3BGRA 1JXEA 1HPZA 3VQ7A 4RW8A 3HVTA 5KI6A 1RT1A 4FM2A 3SQ4A 4KAZA 2BDPA 1NKEA 3THVA 5C24A 4AILC 3K5LA 4I2PA 4FJMA 3L3UA 1S6PA 4OVLA 3ZSRA 3ZSWA 2KFNA 1UAXA 3MAQA 1HYVA 4DTMA 3I0RA 1I3AA 3K2PA 3MEDA 4CF1A 4CJ3A 5J2MA 3PX4A 3V1RA 3SUNA 4DS4A 4ELUA 4B9TA 4DSIA 3HO1A 4ZTFA 4FM0A 4CEOA 3AVAA 4CEBA 1N6QA 3MEGA 4M3YA 1R0AA 2YKNA 3DLGA 4M3UA 4KHYA 2HHTA 4E7HA 2OPPA 3TAMA 4DWIA 3C95A 1VSFA 1XHXA 4B9SA 2HNZA 1L3TA 3RR7A 2VG6A 3ZSVA 5DMRA 4BACA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDDA 2G8UA 4CEEA 1QTMA 2P9UA 3MX5A 3LP0A 1L3UA 4I2QA 1X3MA 2X74A 3TAQA 3CC7N 1KD1O 3WQTA 1NK8A 2UUBK 1I39A 4CJSA 4LF8K 4BG9A 5FRMA 1JLAA 1KVCA 4KB1A 4QS7A 4FWKA 1HKCA 4AQYK 3L2UA 1CXUA 1NJWA 4JI8K 1KVBA 4FWPA 2XY8A 1WSJA 3J80O 4CERA 1GLLO 4LSNA 1SAZA 1VRUA 4DR7K 2GV9A 4RW7A 5C12A 1D8YA 3PIPL 2FC0A 1YI2N 5C10A 4FW2A 5CR4A 3KK2A 4E1NA 5M1PA 3IAYA 1X9JA 4RCHA 2A1SA 2UUCK 1RDUA 4YDUA 5LJWA 3R9PA 4CZIA 3G71N 3KK1A 3GBTA 1HR0K 1W0HA 1NGHA 3T1AA 4H0VB 3U3GA 4B3MK 3OS2A 5JLFA 4KHWA 3H45C 4NCAA 2QKBA 4JRQA 1NKCA 1TKXA 5ADXH 2J4RA 1BA0A 3H3OB 5LMUK 4BR0A 4YY3K 1L3VA 1A5WA 2V7ZA 2O4GA 2O8BB 5I42A 5JVGL 4Y1CA 1M90O 1BU6O 1YUWA 1C1AA 1UA1A 2P5GA 5HL7L 3HJFA 1N32K 3T3FA 4V19S 1Y64A 1C0TA 1VQ6N 1YITN 2HHVA 4DQIA 3EZWA 4HUFA 2YKMA 1HRHA 4BRNA 4OKEA 5E84A 3KLEA 1SKRA 3SV4A 3VA0A 1Q9XA 4FLYA 3FFKB 2E2PA 3ZT3A 1YXQA 4B08A 4RWTA 2Q36A 2VCPA 3SUQA 4AF1A 4FZXC 1JLCA 3O6WA 2PYJA 3P5JA 5FPMA 1FJGK 3MX2A 2GUIA 4CF9A 3S3NA 2IIRA 5FRNA 1GOAA 4CBUA 1K8AO 2B4JA 5CE3A 3CPWM 3AGRA 3IFRA 5AJ3K 1JJ2M 1E4FT 4WCEL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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