4GY2B

Crystal structure of apo-ia-actin complex
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 115
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4gy2B03
1NGGA 3O8MA 3MDQA 2Q1NA 3LM9A 1R59O 5BREA 5ELZA 3QBWA 4BRQA 3ULEA 4IZ9A 5AZIA 1S22A 1H1VA 2WUSA 3BP8A 4M63C 3AY9A 3HBTA 3ULEB 2FXUA 5FPMA 2VWBA 3O80A 3FZHA 3H6EA 5AZIB 3WQUA 2QWPA 2IVNA 4QS9A 2FSKA 3D2FB 3MN5A 1V4TA 2E88A 3WQTA 5LY3A 1J6ZA 5AQQA 3S41A 4CI6A 1SAZA 1QZ6A 1G99A 3GG4A 2FLOA 1BA1A 2E1YA 4JHDA 3KZBA 4A62A 4WQ4C 2A6AA 4JHDB 4PKIA 3HTVA 5BRDA 4A2BA 2UYTA 3VEZA 5KPZA 5AFUH 4B1WB 3EKSA 4PKHA 4FL9A 1Z05A 3F9MA 3I33A 1MWMA 5AQKA 3QFPA 4ISEA 4FWMA 3M3ZA 4BRDA 3UKRB 2QWOA 1YUWA 1TYQA 4FWPA 4BC2A 1EQYA 2HF4A 2F9TA 1BOTO 4FPBA 4BVOA 4LC9B 4BRGA 2GTDA 2GWKA 4MLEA 3VEVA 2GEMA 1TYQB 4L3QA 2IIRA 1KAYA 4B1YB 4BREA 5AQNA 3IFRA 5AQUA 3J8AA 2YI1A 1RGIA 4H0VB 4B9QA 5BR9A 3EN9A 2VYPA 3WXIA 3UB5A 1JCGA 3C7NA 5EOYA 3R6MA 3FFKB 1X3MA 5JLFA 1GLCG 3LM2A 1BA0A 2P9LB 5KPTA 4DQ8A 1BDGA 1ZC6A 3BUZB 2A41A 5AR0A 1NGHA 1U2VB 4IJNA 5AZJB 2PBDA 2PAVA 1K8KA 3CERA 5E84A 3D7EO 3CETA 3P4IA 4FOEA 1NGEA 2VCPA 4BR0A 3M6GA 2ASPA 1K8KB 1U6ZA 2ASOA 3ZEUB 3A5OC 3U4LA 4DHYA 1NGCA 3CHWA 2V7ZA 1ATRA 4BVPA 5JMVA 1IG8A 3VESA 2V7YA 3DXKA 2DPNA 2P9NA 3EL2A 2Q36A 3FR0A 3GOIA 2P9KA 3DXKB 4XH4A 2P9NB 2E2NA 1MWKA 1QQNA 3RSEA 2CH6A 2YHYA 3H1QA 4WQ5A 3W3DA 4YDUA 1ATSA 4CD3A 4Z94A 4H5RA 2ITMA 5LJWA 1IJJA 2J4RA 4F9OA 3AAQA 4XH1A 5AQIA 3RSEB 1V4SA 1T6CA 3CJ1A 3VENA 3SK3A 3CJAA 1JCFA 5AQVA 1NGJA 3QDKA 3UKUB 4Y0WA 1RDWX 4FWNA 4CJ7A 1HLUA 1SQKA 3L0QA 2P9PB 2Q0RA 4BC5A 1JCEA 4IO8A 1DKGD 4BRAA 4FSVA 3R9PA 1BO5O 5BRFA 2FSJA 2ZWHA 4FWSA 4WQ5C 2EWSA 4YDUC 1NGAA 1X3NA 3LDPA 3TU5A 5EX5A 3WEEA 4K42A 2NRHA 4WQ4A 3CIPA 4BRPA 3IMXA 3A5MC 2QXLA 4FOIA 4FPAA 1KAXA 2P9IA 4EFHA 2Q31A 2QWQA 4K41A 3VEOA 3FE1A 5FPEA 4B1UB 4BGBA 2E2OA 3A5LC 3QB0A 2E1ZA 5AQPA 4HTLA 2V51B 4CBUA 1ZBSA 1GLBG 5F0XA 1WUAA 3AAPA 4H5TA 3OHRA 2HMPA 2P9UA 1TUYA 4ISGA 2Q0UA 3GE1A 3UE5A 2D4WA 3HM8A 4PL8A 3VEYA 1NBWA 2P9UB 3H3NO 3H1VX 1QHAA 3O6WA 5AQZA 5AQOA 3WXKA 1QQOA 1OKJA 3VEWA 1XC3A 3H45C 3WXLA 5CE3A 3JXUA 1NGBA 4CD1A 3LDNA 1T44A 3U8XA 4CZGA 4RTFD 5BN8A 3DWLA 4BRFA 3VF4A 4EHUA 1NM1A 2W41A 5FPNA 2YHXA 3KVGA 1HPMA 4PKGA 2ZGYA 3VGKA 4JNEA 1XQSC 1KAZA 3SMSA 4BRLA 1RFQA 3H46O 5EVZA 3FLCO 4M7YA 2GUPA 3C7NB 3EO3A 1DEJA 4IWVA 3LDLA 5TKYA 3CJ7A 5B8HA 3EKUA 1NLVA 4FWKA 3O08A 4BC3A 3DJCA 3KHYA 5AQLA 4C23A 3MMVA 4DB3A 3ZETA 2QWMA 5AQYA 3IUCA 4H0TB 1C0FA 2Q2RA 2P9SA 4FWOA 2E20A 5AQMA 4I6MA 5FPDA 4RWTA 3QBXA 3MN9A 1HKCA 2HOEA 2P9SB 2IVPA 3HZ6A 4H5WA 4BG9A 2CGLA 2E2PA 4I6MB 1BUPA 1E4FT 1NGIA 2F9WA 4BROA 3LDOA 3O1BA 4H0OA 4BR5A 4CZIA 4WYBA 4BQLA 4ISFA 2BTFA 3CJ9A 3M1FA 4GY2B 1LOTB 3ZX3A 2YJEA 2P9KB 3ENOA 1ZXOA 2A3ZA 5AQXA 4PL7A 3DXMA 3MN7A 1HX1A 4E1JA 1T6DA 3CQYA 1S3XA 4B1XB 1GLDG 3A8YA 2GELA 3DXMB 4NB4A 3W0LA 1BU6O 3VGMA 4B1VA 4EHTA 3ATUA 2D1KA 2FF6A 3TPQA 4BRNA 4FWRA 1NGFA 3ZX2A 3EZWA 3LDQA 3ATVA 4CZLA 4BRHA 5AQWA 4CBWA 5F2RA 2NZTA 3QFUA 3MN6A 4RCHA 2ASMA 2YJFA 3BF1A 3B8AX 3FGUA 3VGLA 1WOQA 2E2QA 5AQFA 3H3OB 3WEEB 2QW9A 3GDQA 3LL3A 5E26A 4MLHA 3SLCA 3FZLA 2A42A 3VPZA 2QM1A 1Q18A 2FF3B 1NMDA 1P8ZA 2QWRA 5ADXA 3FZFA 4H0XB 1NGDA 2P9IB 4HWIA 4CZEA 3IDHA 3HSCA 2CGKA 3ID8A 3U9ZA 3D2EA 4EIAA 2BUPA 3FZKA 1XUPO 4O8KA 5EXWA 4H03B 2GWJA 5BRHA 3L4IA 3D2EB 2AA4A 1D4XA 1X9JA 1TUUA 1C0GA 4FWLA 3CJCA 2E8AA 5LJVA 5AQSA 4CZFA 5JICA 1KXPA 4B1ZA 4A61A 1ESVA 3D2FA 3QICA 4H0YB 4K43A 4FWQA 1CZAN 1YAGA 2AP1A 3CJBA 1YXQA 4M7XA 5KQ8A 3WXJA 1DGKN 5AFUA 3MCPA 4EAHD 3A0IX 2CH5A 5F1XA 3DAWA 1BWFO 4BRKA 4BC4A 3C0BA 2QWLA 3GBTA 1QQMA 4BRMA 2A40A 3UKRA 2KHOA 3ENHA 4JN4A 1NWKA 1ATNA 4IXCA 4BRIA 3VETA 1BG3A 4K25A 2A5XA 4H0PA 3G25A 4AM6A 2D0PA 4IJAA 1LCUA 1MA9B 4CZKA 4BR9A 4KBOA 5JLHA 3ZX0A 3JS6A 4BQZA 2D0OA 1HKBA 3HI0A 4CBXA 4O5FA 2Q97A 3A5NC 4H5VA 2ZGZA 3VEXA 1E4GT 2P9LA 3L6QA 4QS8A 5KPRA 2OANA 1GLEG 3BEXA 3SMPA 2V52B 4MO4A 3ZETB 4QS7A 1U2VA 3CQXA 3SJHA 3WT0A 4CZHA 3VF2A 3MK6A 5AZJA 3CI5A 5BPLA 1HUXA 5BPMA 4BR4A 2NLXA 1SZ2A 3AARA 5AQGA 2H3GX 2HF3A 5EY4A 3VERA 4XEIA 3ZEUA 4AM7A 4JAXA 1YVNA 4XH5A 2I7PA 4CZJA 3O1WA 2CGJA 4BRCA 4NO7A 4H5NA 5BPNA 4J8FA 5AQJA 1GLAG 3BF3A 5AQHA 3R8EA 2QWNA 1HKGA 4A2AA 4JD2A 3FZMA 5AQRA 1MDUB 1QZ5A 3QMLA 3GL1A 2I7NA 3VF6A 4JD2B 4GNIA 4DCHA 3UKUA 1GLJO 2YCHA 1GLLO 4MO5A 3WUHA 4BG8A 3O5BA 4FO0A 3VOVA 2P9PA 5AQTA 4BR7A 1Y64A 5BN9A 1HJOA 2W40A 4BGAA 1Z6RA 1GLFO 2FSNA 2YHWA 4CZMA 3O4WA 2ZF5O 3I8BA 4BR2A 2IVOA 5KQDA 5I9EB 5ADXH 3U9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPRA 5M1PA 5J2PA 4C8KA 1TGOA 4CEOA 3OS2A 1JJ2M 1RDAA 3KLGA 1DT9A 3QEVA 1H1VA 2WUSA 2ZJQL 5FPMA 3FZHA 1P90A 3LZJA 1KD1O 4OKKA 4QS9A 2FSKA 1YTUA 4IDKA 2ETJA 1BA1A 3P5JA 4Z4GA 4CIFA 2A6AA 2X74A 2E5LK 4PKIA 3HOSA 3U3GA 3DOLA 3F9KA 3VEZA 3CXCM 5HROA 3CCJN 4B1WB 3EKSA 4LF7K 3HPOA 4ZTFA 3F9MA 4BY9C 1MWMA 4FWMA 1NJIO 3QEWA 1EQYA 3L2RA 2IOCA 2GWKA 4E89A 1KFSA 5AQUA 3J8AA 2YI1A 5BR9A 4JKEA 3WXIA 3UB5A 3KD5E 1JCGA 1K8AO 3JYTA 1X3MA 2O8FA 5K14A 5JLFA 1BA0A 2P9LB 4AH9A 4Z4FA 3TABA 2O8FB 3ZSXA 1GOBA 5AR0A 1VQ6N 4YOTA 3I56N 1U2VB 1YJ9N 3T19A 3HP6A 2PAVA 4J2AA 5E84A 3THYB 4FOEA 4LSNA 2VCPA 4I2QA 2ASPA 2QEXN 4DV2K 3LWLA 3K5NA 4GV6A 1WBBA 3AO3A 4DHYA 4OGEA 1RT1A 4CFDA 2ZJRL 2G8HA 3VESA 4DTSA 2P9NA 3FR0A 3GOIA 3G71N 1QS4A 5FDLA 2P9NB 4WQ5A 3K57A 4H5RA 2ITMA 1IJJA 4EZ9A 3FFIA 1SUQA 1JCFA 3ZSRA 4GKKK 3N4QA 1HNZK 4C1NI 1UOCA 3SBTA 4CEZA 2D0BA 5FRMA 3WNGA 1JLFA 4OKJA 4BRAA 3R9PA 3BY5A 4CW7B 2UXCK 1C0TA 2ZWHA 4WQ5C 1NGAA 3LDPA 3RRHA 4WQ4A 3QLHA 2OPSA 4DV4K 3A5MC 1EWRA 4JI2K 3ZSVA 1BGXT 4QAGA 3T1AA 1IKYA 2P9IA 3QEPA 3CPEA 1RILA 3IS9A 2FBVA 4B3OA 4E7LA 1QVFM 3VEOA 3FE1A 4XJXA 3SUOA 4BGBA 4E19A 2IAJA 4N76A 3E9PA 4C8NA 1KFDA 5DM7L 4O0JA 4JKCA 1VSIA 1GLBG 5F0XA 1WUAA 3AAPA 2GV9A 3TAQA 3GE1A 1X9SA 3UE5A 4PL8A 4CEBA 3LDSA 3O6WA 5AQZA 3EEQA 1QQOA 3IG1A 5KI6A 1OKJA 2G8KA 3NFAA 5DM6L 5CE3A 2OTJN 1XC9A 3G6EN 2GX9A 3LDNA 4CERA 3TAFA 1NK4A 3U8XA 2HSTA 3PUFA 1XMOK 1TKZA 3DWLA 4BRFA 4DTMA 4DTJA 3TARA 3K59A 1M90O 1A5VA 1FK9A 2JWLA 3MECA 2YHXA 3MX5A 4DSFA 4DSLA 3O9SA 2FBTA 4JNEA 1XQSC 2NRVA 4W5TA 1KAZA 4DLEA 4BRLA 1RFQA 3H46O 3SQ0A 1RBRA 5EVZA 3FLCO 2GUPA 3EO3A 3AVAA 2IC3A 1Q9XA 4CJ4A 1RT4A 1BQMA 1RT7A 4ID5A 3O08A 3QIPA 3S9HA 3MMVA 2O4GA 1VSEA 3ZETA 3SV3A 3TTCA 3IUCA 2HNYA 1OH7A 2D0CA 1ZYQA 2E20A 5H1SQ 1HKCA 1RT5A 4BG9A 2E2PA 4GV3A 1SS6A 1NGIA 4OGCA 3IAYA 3K9KA 1RDDA 4BR5A 4WYBA 4C8LA 4BQLA 4ISFA 4ELVA 2ZE2A 2BTFA 3M1FA 4CCHA 3QEIA 3E66A 3CC4N 3BDPA 4ZHRA 3VQPA 3CQYA 3A8YA 3R3LA 4KHPK 2D1KA 1XNRK 3HVTA 3TPQA 4FJNA 4IOXA 3ZX2A 1Q86O 1UA0A 4BRHA 4CBWA 4E1MA 1X1PA 4FK0A 5JVGL 5M1FA 3MN6A 1JLAA 3O9UA 5HP1A 3NF9A 2YJFA 5GADP 1WOQA 5AQFA 2W6KA 1VRTA 3MXMA 1EETA 4CJWA 4M42A 3GDQA 2ZJPL 1L5UA 4MLHA 4BE0A 4UY8O 4ID1A 1S9GA 5LMNK 4DUYK 3CCSN 2QM1A 1A5XA 1NMDA 4YOWA 3THVA 1RBUA 3FZFA 4LFBK 3VQ9A 1K73O 2O8CA 3D2EA 4EIAA 1U45A 3FZKA 1XUPO 2YKNA 3CCQN 3L2VA 3D2EB 4DR7K 4B3MK 1D8YA 3VQ8A 4FK4A 2E8AA 4LF8K 5LJVA 4LY7A 4CF1A 4KB1A 3DLKA 3V9WA 1RCHA 3CJBA 4KAZA 3DI6A 2UUCK 2NRZA 4Z4EA 4HTUA 2VGMA 1NK6A 5F1XA 4Y1DA 1NOZA 4BC4A 3C0BA 2Q3SA 4JEPA 2W42A 3TR8A 4BRMA 3L3VA 3TAMA 3EYZA 4KHNA 2XRIA 3D45A 4IXCA 4CGIA 3DLHA 3OYKA 4DTXA 3JAMO 3VETA 1BG3A 3KLEA 4Q0BA 3TTFA 1HRHA 4IJAA 3ZT2A 4CZKA 4BR9A 5KGWA 3JS6A 4W5QA 4DU3A 1HKBA 5J1EA 4O5FA 2Q97A 4H5VA 3TANA 1E4GT 3LZIA 3U6FA 3S5TA 2OANA 1GLEG 4QOZB 3LWMA 4MO4A 4E3SA 4QS7A 4UQGA 3CQXA 3SJHA 3OYGA 3SCXA 3VF2A 2Y1JA 1SL2A 2IDOA 2OZMA 5BPMA 1KVAA 1SZ2A 3KWGA 2H3GX 5EY4A 1J53A 3SQ4A 4XH5A 4F3TA 1ZBHA 3O1WA 4LH5A 4KTWA 2RE2A 2YNHA 1VQKN 4B9LA 5GIPA 2HNZA 3HPGA 4AQYK 4DTNA 4QCLA 3BF3A 3CCLN 4JYAK 2BDPA 4A2AA 3M8QA 5AQRA 1QZ5A 3QMLA 1R0AA 4FW1A 1RBSA 4JK8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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