4GY2B

Crystal structure of apo-ia-actin complex
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 115
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4gy2B03
1X3MA 3WQTA 3ZETA 4AM7A 3LM2A 4BR9A 3AAQA 2ZGYA 3MDQA 4K42A 1OKJA 2Q2RA 2P9UA 3ENOA 3GBTA 4RTFD 4BQZA 5F2RA 1BDGA 4H0YB 4XH4A 3ULEB 1U2VA 1NGFA 4B1WB 3DAWA 1T6CA 4CZEA 4NB4A 4YDUA 3I8BA 4FWRA 4CJ7A 2YJEA 3MN5A 2D0OA 1GLEG 4NO7A 3J8AA 3SMSA 4BR0A 1JCFA 2HF3A 3VEVA 3BF1A 3EZWA 4QS8A 4CZHA 4BRFA 1NGBA 1X9JA 2AA4A 2P9KA 5AQSA 1S22A 4PKIA 4B1XB 4BC5A 2FSKA 4CZIA 4B1VA 3VEXA 2QW9A 5AQFA 4EAHD 5TKYA 4FSVA 3WEEA 1HLUA 1LCUA 5LJVA 1SQKA 3SLCA 2UYTA 3WXIA 2E88A 2KHOA 2PAVA 3CJ9A 4KBOA 1ZC6A 4H0OA 4BC3A 1D4XA 1JCGA 1GLAG 3ZETB 4PL8A 2P9PB 4EIAA 4ISFA 3U9ZA 4HTLA 4PKGA 2YI1A 4BRQA 2PBDA 3LDPA 1Z6RA 3FZLA 1U2VB 3O5BA 4FWOA 3FE1A 1NGCA 4Z94A 3W3DA 3ZEUA 3GE1A 1GLDG 3OHRA 3LDQA 4EFHA 5LJWA 3O80A 3UKUA 2E1ZA 1NGAA 2GTDA 2VWBA 2YHXA 5I9EB 4RWTA 4FWPA 5AQXA 1J6ZA 2P9KB 1NGDA 3SMPA 3QDKA 3TPQA 3VEOA 4CD3A 1U6ZA 5AFUA 2A3ZA 3BEXA 3VGMA 1P8ZA 4BREA 2W41A 5F0XA 3WEEB 2GUPA 2FXUA 2W40A 2Q1NA 3RSEA 4MLHA 5AQYA 1SZ2A 3GG4A 1NLVA 3JXUA 3QFUA 4CZJA 2A40A 5ADXH 3CQXA 2E20A 3HM8A 4I6MA 3VF2A 1ZBSA 4JN4A 5LY3A 5EVZA 3C7NB 3VERA 1HKBA 2FF3B 1IJJA 3ZEUB 1GLBG 1C0GA 4BRNA 4CZMA 4BGBA 1MWKA 3FZKA 3O4WA 3ZX2A 2FLOA 2IVOA 3UKUB 4F9OA 4QS9A 1Y64A 4BRDA 1YXQA 1JCEA 1KAXA 4A62A 3DJCA 5BPLA 3FZFA 5AQTA 4FPBA 3ZX0A 1G99A 3H6EA 3O1BA 5ELZA 3VGLA 3A5LC 4CBUA 1NGEA 4BQLA 3BF3A 3QBXA 4O8KA 5JLHA 3IFRA 2IIRA 3W0LA 3IUCA 3DXKB 4FWNA 4CZGA 1BU6O 4FO0A 3H46O 3FR0A 3G25A 4BRLA 3D2FB 1BA1A 5AQZA 4IXCA 4HWIA 3UB5A 4BR4A 2P9PA 5AQQA 4I6MB 3S41A 1NGIA 3A5OC 3QICA 1E4FT 1C0FA 3H3OB 2F9TA 4C23A 4FWLA 1XQSC 5BPMA 1QZ6A 4BG8A 2IVPA 3A8YA 3DWLA 3D2EB 1HUXA 4IWVA 4PL7A 3CJ7A 1GLFO 3DXMA 2QWQA 4H0VB 3C0BA 4H03B 4WQ4C 5BN9A 2P9IB 2YHYA 5AQKA 3WQUA 1T44A 1ZXOA 3HSCA 3BP8A 3MN7A 4B1ZA 2V7ZA 3VEZA 3CERA 3IDHA 4FWMA 1NGJA 2E2NA 1V4SA 1ATNA 4BGAA 2YHWA 1MA9B 4BR2A 3I33A 3O08A 2IVNA 4EHUA 5EOYA 3VEYA 5BPNA 1XC3A 5AQWA 2CGKA 4BRMA 2CGJA 3CHWA 3H45C 5AQGA 2F9WA 3AY9A 3O8MA 4O5FA 4A61A 3KZBA 3C7NA 4FOEA 4BVPA 5E26A 1KXPA 2OANA 3SJHA 3EL2A 2QXLA 5FPMA 1Q18A 4WYBA 5AQJA 3VESA 4BROA 1NMDA 3WT0A 1NM1A 4FPAA 3UKRA 3HI0A 3U8XA 4Y0WA 3DXMB 4PKHA 5AQUA 1MDUB 1E4GT 3R8EA 1NWKA 4WQ4A 4H0PA 2V51B 4BRKA 1QQMA 3CETA 3AARA 1RGIA 1H1VA 3U9DA 4H0XB 2P9SA 2Q36A 2HOEA 2E2QA 5E84A 2Q0UA 3MN9A 4WQ5C 3VPZA 4A2AA 4CBWA 4BRIA 3DXKA 4DHYA 3MMVA 1ATRA 4JNEA 1RDWX 4IO8A 4BRHA 4BRGA 4BVOA 3D2FA 3LL3A 1BUPA 1DKGD 3VGKA 5AQVA 3VOVA 4M7XA 4K43A 5KPZA 1GLJO 2BUPA 3ID8A 3FZMA 4MO4A 4H5RA 1R59O 2A41A 3H3NO 5AQMA 5B8HA 3A5NC 4CZFA 3D2EA 2QWMA 5BR9A 1BO5O 3UKRB 4H5VA 1TYQB 4CBXA 4L3QA 3EKSA 2NLXA 3WXJA 3D7EO 3VENA 2ITMA 3R9PA 1GLCG 1T6DA 2ASMA 2E2OA 2P9IA 1BA0A 4FWKA 5ADXA 3EKUA 2P9SB 3QB0A 3MK6A 1NGGA 3HBTA 2EWSA 5AQNA 2NRHA 4XH1A 4FWQA 3QFPA 3QMLA 4WQ5A 3FGUA 2D1KA 1ATSA 2AP1A 4CI6A 3WUHA 5BRHA 2CH6A 2HF4A 4BRPA 3L4IA 3FZHA 5EX5A 4CZLA 2QWPA 1WOQA 2P9LA 3HZ6A 3F9MA 2V52B 2D0PA 2FF6A 1HKCA 3VF4A 3GOIA 5FPNA 2E2PA 4H5NA 2BTFA 2E8AA 5JICA 3BUZB 4MO5A 4JD2A 4BRCA 4M7YA 4JHDA 3M3ZA 3L6QA 1LOTB 3LM9A 4GNIA 4JAXA 1QQOA 3JS6A 1HX1A 1MWMA 5AQIA 2DPNA 4FOIA 1YVNA 5JLFA 4FL9A 3GDQA 5AZIA 2QWRA 2Q0RA 2A42A 2ZGZA 2P9LB 1X3NA 1TUUA 2A5XA 2CH5A 4DCHA 3LDOA 4BR7A 4M63C 4QS7A 1SAZA 4CZKA 4GY2B 3P4IA 2VCPA 3FFKB 2HMPA 4H5TA 1ESVA 4EHTA 1YUWA 2ZF5O 4XH5A 4DB3A 3EO3A 4A2BA 4JD2B 4H0TB 3U4LA 1XUPO 1TYQA 4IJAA 4JHDB 5AQPA 4BRAA 3AAPA 4DQ8A 5EXWA 4K25A 2QWNA 3HTVA 3CJAA 2GWKA 4IJNA 5AFUH 5CE3A 2P9UB 4B9QA 5KPTA 1K8KA 1DEJA 1DGKN 1NBWA 3B8AX 3WXLA 3M1FA 5AR0A 4H5WA 5AZIB 3MN6A 3MCPA 3LDLA 5EY4A 3R6MA 1NGHA 5BRFA 4J8FA 3ZX3A 2J4RA 2I7PA 3ENHA 2VYPA 2QWLA 3CI5A 3QBWA 5KQ8A 4B1YB 3ATUA 2I7NA 5BN8A 1GLLO 4MLEA 4BC4A 2Q31A 4BC2A 3CIPA 4ISGA 1RFQA 1HPMA 5AZJA 3KVGA 4E1JA 3A0IX 2P9NA 3CQYA 5F1XA 3CJ1A 2WUSA 4BR5A 5FPDA 1EQYA 3VF6A 2GEMA 5KQDA 5KPRA 1BOTO 2A6AA 1QZ5A 1TUYA 1Z05A 5BREA 5BRDA 1V4TA 3LDNA 4ISEA 1QHAA 1WUAA 1K8KB 3VETA 5AQRA 5AQLA 5JMVA 3ULEA 3WXKA 2H3GX 3CJBA 1YAGA 2GELA 3GL1A 1HJOA 1BWFO 3O6WA 4YDUC 2QM1A 2ASPA 3KHYA 4BG9A 2Q97A 3A5MC 3M6GA 4B1UB 4FWSA 1KAZA 3EN9A 2ASOA 2D4WA 3ATVA 3TU5A 3FLCO 1BG3A 2E1YA 2QWOA 3CJCA 2FSJA 2YJFA 1CZAN 2FSNA 3H1QA 5AQHA 4K41A 2CGLA 3O1WA 4RCHA 5FPEA 1HKGA 5AZJB 3UE5A 3L0QA 5AQOA 2V7YA 2YCHA 4IZ9A 1KAYA 4LC9B 2P9NB 3VEWA 1S3XA 3H1VX 2GWJA 4AM6A 1QQNA 4CD1A 3RSEB 3SK3A 2ZWHA 2NZTA 4XEIA 3IMXA 1IG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BL3A 2OA8A 2P5GA 4JI3K 4BQZA 4E1MA 3V9SA 3VQ5A 3ULEB 3HSTB 4JI6K 1MU2A 4FJ5A 4YDUA 3I8BA 2JWKA 2YJEA 1CLQA 3EE9A 4DFMA 2GX9A 1Q9XA 2D5RA 4BR0A 3LALA 4DV2K 1NGBA 1X9JA 2AA4A 3BZKA 5HRSA 1S22A 4CZIA 4B1VA 2HHQA 3CD6N 4M45A 2FBVA 4EAHD 4DF4A 3SI6A 4FSVA 1LWCA 2UXCK 3SLCA 3NE6A 3ZETB 3N4QA 4LF4K 2P9PB 4EIAA 4JKEA 4KTQA 4PKGA 3SAHA 1OVQA 4DSLA 3FZLA 4FWOA 3K5OA 3GE1A 4CJRA 1VQON 4KB1A 2OPRA 2E1ZA 3K2PA 1EO1A 2VWBA 5I9EB 3O4NA 4RWTA 1J6ZA 3MWPA 1TL3A 1DTQA 1WAJA 2A3ZA 2VG6A 1P8ZA 5LL6Z 1N6QA 4K8XA 2W41A 3ID6A 2GUPA 4AHSA 2W40A 4FJLA 3RSEA 4G9ZA 4MLHA 5AQYA 4CJVA 1S1VA 5HLFA 4EZ9A 2Z1HA 3TAQA 2HW3A 1NLVA 3JXUA 4X64K 3NF9A 3VQ8A 1KRPA 4CEZA 1J53A 2GV9A 3C6UA 3CQXA 4UY8O 3O9SA 3VF2A 2F8SA 4NCBA 2YX6A 1N34K 4DLGA 4GV3A 3LPUA 3C7NB 3VQ4A 4DU3A 1HKBA 4KFBA 2YV0X 3QIOA 5M1OA 2WOMA 5CYQA 3AVFA 3AO2A 3L3UA 1M90O 4CZMA 3FZKA 3ZX2A 3MAQA 2HHWA 1Y64A 4KHPK 5DK5A 4Y1CA 3QO9A 2OPPA 4OLBA 3CCSN 3H6EA 3O1BA 5ELZA 4KHUA 4CBUA 1Q7YO 3T3FA 3BF3A 4YFUA 3HVRA 4PY5A 2PFUA 1JLEA 4H4MA 5LMNK 4FK4A 3AVBA 4LD0A 3UB5A 1W2BM 4IXCA 4HWIA 4BR4A 4I6MB 3S41A 3EYZA 2RHKA 3TABA 1E4FT 4N56A 2P1JA 3OYGA 3H3OB 4CEDA 4BG8A 4N47A 1C1CA 3CMEN 3D2EB 4KREA 4FZXC 4IWVA 4CK2A 3PUFA 4DS5A 1KFDA 3TAMA 4DR6K 4H0VB 1WBBA 1T3VA 1NJXA 4WQ4C 2YHYA 1NU0A 5AQKA 4M41A 3BP8A 4B3MK 4JI8K 4LH4A 1NGJA 4JK8A 1ZBLA 1V4SA 1ZBIA 4BGAA 5KTQA 1CXQA 3QNNA 3MX2A 1KCFA 5LMUK 4Q5VA 2CGJA 1A5XA 2F9WA 1YTUA 3VA0A 3LP0A 4BVPA 2HNYA 3SJHA 1ZBUA 2QXLA 3EL2A 4DFPA 5AQJA 4M3XA 3NVKA 3O3GA 3QEWA 3WT0A 3HOSA 3MXIA 1YT3A 4FM0A 4TSXA 4FLXA 4H0PA 4C1NK 1YIJN 1S5JA 1RGIA 1N32K 4IG0A 3K57A 4H0XB 2P9SA 5HL7L 3TAGA 2ZE2A 3V81A 5E84A 2Q0UA 3DM2A 1VQ8N 2KZMA 1HYSA 1Z25A 4BRIA 1HQUA 3KKSA 5C2DA 3MEGA 1L3UA 4NXMK 4C1NI 4BRGA 4BVOA 2UU9K 3LL3A 1YJNN 3VGKA 3OTOK 5AQVA 4B3SK 2E6MA 4M3WA 4Z4GA 1OH6A 4K43A 4B3OA 3QEVA 2PYLA 3TTDA 5BR9A 3LAMA 1VQ4N 4IBNA 3QLHA 2O4GA 1RDAA 2NLXA 3OY9A 1JXBA 3QEIA 1FKPA 3WXJA 1X9MA 4JI0K 1Q8IA 2C1GA 1RBVA 4FLYA 1BA0A 3EKUA 3RMDA 4AHCA 1KD1O 2NRZA 1NGGA 3HBTA 2EWSA 4FWQA 3QMLA 4KO0A 4WQ5A 3FGUA 3WUHA 5BRHA 4FLUA 4CEQA 2OZMA 2CH6A 4BRPA 5EX5A 3D45A 1JLGA 3OYDA 3F9MA 4K8ZA 2D0PA 3AVMA 4KHYA 2RN2A 3O9QA 3VF4A 1GOCA 3PSFA 3E01A 4H5NA 4DSFA 4CIFA 4KH6A 3VQBA 4LH5A 3TAPA 4BRCA 1TAUA 4L8RB 4DTXA 3L6QA 1LOTB 4CHNA 4JAXA 4PQUA 1HX1A 3E9OA 1MWMA 3WNEA 2OZSA 3AA3A 5CZ1A 3SV3A 5HOOA 1YVNA 4YORA 3VTHA 5AZIA 4C8LA 2QWRA 3NGIA 4CEOA 2DFEA 4WCEL 1SL2A 3AA2A 3AV9A 3U3GA 3IAYA 4CZKA 4M63C 1SAZA 1NK6A 3RMAA 3TSUA 2QKBA 2HMPA 4NYNA 1ESVA 4A5AA 2JLEA 2O8BA 3NF6A 3SNNA 3AO5A 1GOBA 2P51A 4JD2B 5J2QA 4DQ8A 5EXWA 5IT9O 4K25A 2QWNA 3FFIA 5KPTA 3MCAB 5CE3A 1K8KA 2W42A 4MQ3A 1NBWA 3B8AX 4ILJA 4C8MA 1ITGA 4H5WA 1IO2A 3MN6A 4AH9A 3LDLA 5EY4A 1QQCA 4CE9A 3R6MA 3DRRA 3HJFA 3CFRA 1K9MO 5BRFA 2I7PA 4CFDA 2F7TA 3QBWA 4DUYK 2IS3A 1RDUA 3ATUA 4NCAA 2I7NA 1GLLO 4BC4A 3VQ6A 5J2PA 4HUFA 3KVGA 3A0IX 3OYFA 2WUSA 4CGIA 5FPDA 4KH4A 5KPRA 2O8FB 2A6AA 1QZ5A 1Z05A 2B4JA 3RR8A 1V4TA 1NOYA 3MEEA 3NH1A 2HHVA 3C6TA 3VQ9A 5JMVA 4FZYA 3ULEA 1ASUA 3WXKA 4CHZA 3NH0A 2Z1IA 1TK5A 2G8UA 3GL1A 4FJHA 3PSIA 2W00A 1DT9A 2FBYA 2Q97A 3M6GA 3S9HA 3TU5A 1VSIA 1BG3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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