4GY2B

Crystal structure of apo-ia-actin complex
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 115
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4gy2B03
4LC9B 3DXKA 3MCPA 1HKBA 1R59O 4PKGA 2Q0RA 2QWLA 5AQZA 5BRFA 2A3ZA 1GLFO 4BGAA 1RGIA 1BOTO 3A0IX 4FWKA 5AQSA 3VF4A 3WXJA 1JCGA 5AQXA 3VGLA 3M3ZA 2E8AA 3O6WA 5BREA 1S22A 3GBTA 4WYBA 3HTVA 3DXKB 5KPZA 3FGUA 3WT0A 3QB0A 4XH4A 3H6EA 4PL7A 4C23A 3MN5A 2FSKA 3DXMA 1SAZA 2D0PA 1JCEA 1ZXOA 2IVPA 3L0QA 3CI5A 1NGIA 3CQYA 4FWQA 2CH6A 3BP8A 4HTLA 3ZX0A 3BUZB 2P9PB 5TKYA 5F2RA 3AARA 5BRDA 3HM8A 2FLOA 3L6QA 2YHXA 4O5FA 2P9NA 1NBWA 2F9TA 2EWSA 3ZX2A 1YXQA 2GWJA 4BRCA 4MO4A 4IZ9A 4K42A 3FZLA 2GEMA 4Y0WA 3U4LA 3LDOA 3D2FA 1NGAA 1BU6O 3MMVA 3QMLA 5CE3A 4H5WA 5AFUA 1C0FA 2V52B 4CZKA 1D4XA 4IWVA 4A2BA 1HX1A 2I7PA 1RFQA 1T6CA 1NGBA 2UYTA 4BR9A 3VENA 2P9LA 2IVNA 2A6AA 3UKRA 3WXIA 5E84A 3VESA 4IJNA 1V4TA 5F0XA 1X3MA 3IUCA 4I6MA 1DEJA 1ATRA 1KAXA 4BRQA 4JD2B 3GG4A 3KVGA 4L3QA 2ASPA 1NGEA 4Z94A 1IJJA 2P9LB 2BUPA 3UKRB 4BG8A 1YUWA 4MLHA 3LDNA 1C0GA 4I6MB 2PAVA 4FWPA 2KHOA 3AAPA 3GL1A 3L4IA 4FWMA 4FPBA 4BREA 4RWTA 2CGLA 1XC3A 4BR2A 2QWPA 3QBWA 2FXUA 3WXKA 4CBWA 2YJFA 4BGBA 5EOYA 1NLVA 3EN9A 5AQJA 5E26A 3GDQA 4B1YB 3D7EO 2V51B 5LJWA 4WQ4A 3H46O 3ZETA 4MO5A 1BA0A 2QWMA 1LOTB 3F9MA 3ENHA 3IMXA 2A42A 4CZIA 5AQNA 5BN9A 4BR5A 1GLAG 1T6DA 4AM7A 4B1VA 5BR9A 2FSJA 5ELZA 3O08A 3ENOA 3EO3A 2W40A 3M1FA 3DWLA 4CBXA 2AA4A 1ESVA 4CD1A 4CJ7A 2E2NA 3UKUB 2CH5A 3O1BA 3ZETB 4M7XA 3SJHA 1ZC6A 4BVOA 4NB4A 5AFUH 4BROA 1GLJO 2J4RA 1P8ZA 3S41A 5AQKA 4B1WB 2P9KA 2H3GX 3IFRA 5EY4A 1XQSC 1NGFA 2QM1A 5BPNA 3CERA 3KZBA 3ZX3A 1NWKA 2VCPA 4BRGA 4DB3A 2WUSA 3A5OC 5F1XA 2P9PA 1U2VA 4JN4A 4O8KA 5EXWA 2QXLA 5AQRA 3AAQA 3H45C 1BO5O 3SLCA 3J8AA 4XH5A 3ULEA 1Q18A 1S3XA 3CJ7A 4ISGA 4RCHA 2P9KB 4H5RA 1E4FT 1HUXA 2ITMA 4CZJA 3QDKA 2DPNA 5AQIA 4BR7A 2BTFA 2V7ZA 3U9DA 5B8HA 4JHDA 3ZEUA 3A5MC 1E4GT 4IO8A 4BR4A 1GLEG 5BPMA 1U2VB 3FZHA 3O4WA 5LJVA 4EAHD 1NGDA 5AQYA 3ULEB 2NZTA 3UB5A 4NO7A 3VEZA 1HPMA 3IDHA 4CZEA 2Q36A 4FWLA 4BRLA 1IG8A 2ASOA 3GOIA 4A2AA 1YAGA 4JHDB 3ZEUB 3VEOA 3CJCA 3EZWA 1QQNA 2NLXA 2P9UB 3A5LC 1KAZA 1DGKN 3O8MA 3MN7A 4WQ5C 4B1ZA 2E2OA 3LDQA 4EHUA 1X9JA 3CQXA 4JD2A 1G99A 4IJAA 1QZ5A 4BQLA 1GLLO 3QFUA 1EQYA 1MWKA 2FF6A 1U6ZA 1BWFO 3VF6A 4WQ5A 1LCUA 4PKHA 1WUAA 3BF1A 4JAXA 5FPNA 1TUUA 2V7YA 3VEVA 5AQPA 1X3NA 4BR0A 4F9OA 3D2EB 3MK6A 4BRPA 2FSNA 2E1YA 5BPLA 3HZ6A 3SK3A 1MA9B 4H03B 2FF3B 2AP1A 2QWNA 3FZFA 3G25A 3TU5A 5BN8A 4WQ4C 4YDUA 2HOEA 3VETA 4IXCA 1BUPA 3H1QA 4QS7A 2IVOA 4CZLA 4K43A 5EVZA 3HBTA 2Q1NA 5EX5A 3MDQA 2E20A 4B9QA 1HKCA 4H0VB 4BC2A 3LM2A 4CBUA 2P9SA 3H1VX 1QQOA 3UKUA 4QS8A 2GTDA 2A40A 3WUHA 4H0YB 3JXUA 1MDUB 2HMPA 3VOVA 4GY2B 1QHAA 4H0TB 4FWOA 1WOQA 4BVPA 5KPTA 1NGGA 4EFHA 3HI0A 1Y64A 5FPMA 1DKGD 4XEIA 1BA1A 4FOEA 4BRDA 5FPEA 5AZJA 3SMPA 4PKIA 2P9SB 2QWQA 3VGMA 3H3OB 4FPAA 2E1ZA 1Z6RA 5JLFA 2Q97A 4JNEA 3MN9A 2GWKA 3CJBA 3FR0A 5AQFA 3WQUA 4BG9A 4CZFA 3VPZA 3CJ1A 3FLCO 3QICA 4A61A 4FO0A 1JCFA 4M63C 4DCHA 2GUPA 2IIRA 4ISFA 4H5TA 1CZAN 5AR0A 4BC5A 4FWNA 5KPRA 3VGKA 1J6ZA 1ATNA 2I7NA 3FZKA 5AZJB 4DHYA 3W0LA 3ATVA 4QS9A 3WQTA 3U8XA 1V4SA 5I9EB 3ATUA 3DJCA 2D1KA 2PBDA 5ADXA 3O80A 3U9ZA 4K41A 3I8BA 4BRFA 3C7NB 4DQ8A 4CI6A 3O1WA 2YHYA 2YHWA 4H0PA 4BRHA 5AQQA 2HF4A 3R8EA 2F9WA 2ZWHA 1NGHA 4BRIA 2CGKA 2P9UA 3P4IA 3KHYA 3A8YA 3AY9A 4FOIA 1KAYA 2VYPA 2YCHA 3BEXA 3WXLA 3H3NO 5AZIA 2GELA 4FSVA 3VF2A 4CZGA 1GLDG 3BF3A 4ISEA 3QBXA 5AQHA 5LY3A 3CHWA 3CJ9A 1GLCG 3HSCA 1NGJA 1TUYA 1NGCA 1RDWX 2VWBA 5KQ8A 3ID8A 4XH1A 5AQTA 4H5NA 2ZGZA 3LL3A 3DXMB 4BRNA 2ASMA 2E88A 5AZIB 2QWRA 2QWOA 4H0XB 1Z05A 1SQKA 1BDGA 3B8AX 2YJEA 3D2EA 4B1XB 3EL2A 2CGJA 2ZGYA 4CZHA 2P9IA 4B1UB 2A41A 1QZ6A 5JLHA 3LM9A 4MLEA 3VEWA 1H1VA 3VEXA 3JS6A 4RTFD 3MN6A 4H0OA 3VERA 3VEYA 4YDUC 5AQMA 4CZMA 2P9NB 4BC3A 1XUPO 1GLBG 2A5XA 3EKUA 2ZF5O 5JMVA 3WEEA 3TPQA 4PL8A 2P9IB 2QW9A 2NRHA 3R6MA 1HLUA 3D2FB 4EIAA 3FZMA 5AQOA 5ADXH 4KBOA 4M7YA 3RSEA 1TYQA 3OHRA 4BC4A 1NMDA 1BG3A 3QFPA 4FWRA 4BQZA 5BRHA 3FE1A 5JICA 2E2PA 3WEEB 1OKJA 3FFKB 1K8KA 1ATSA 3EKSA 4CD3A 1NM1A 3W3DA 3A5NC 5AQWA 1SZ2A 1HJOA 4A62A 5AQGA 1MWMA 3RSEB 1TYQB 3SMSA 3LDPA 2D0OA 2W41A 4FWSA 3R9PA 1YVNA 2YI1A 1T44A 2D4WA 4FL9A 1K8KB 1HKGA 3UE5A 5FPDA 4H5VA 4EHTA 1KXPA 3CETA 3M6GA 3C0BA 4GNIA 2Q0UA 2Q31A 4J8FA 4AM6A 3I33A 2E2QA 4K25A 3CJAA 2HF3A 3LDLA 3C7NA 1ZBSA 4BRMA 3GE1A 3O5BA 4E1JA 4BRAA 4BRKA 5AQVA 5KQDA 1QQMA 4HWIA 5AQLA 3DAWA 2Q2RA 5AQUA 2OANA 3CIPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSHA 4LC9B 3MCPA 1WNSA 4KHSA 1HJRA 4KHQA 3KKSA 4LY7A 1TKXA 2HBLA 4W5TA 1FKOA 5AQSA 4E7LA 4C8LA 3NMUA 1B92A 1S1UA 4BE2A 4B9TA 4JYAK 4YHHK 1S22A 4JK8A 4CEQA 5E41A 4FJ7A 2DFFA 5KPZA 3WT0A 2X6NA 3NF9A 4N5SA 4FZZA 2A1SA 2D0PA 4CK2A 1NJZA 1JCEA 1RCHA 2YHBA 3HPOA 3DOLA 1NGIA 1T8EA 1BCMA 1NJYA 1BISA 1S1XA 3BP8A 3L8BA 4X62K 1A5XA 1BCOA 4E72A 5BRDA 3HM8A 3OYDA 2X74A 3SJJA 2D0BA 2JLEA 3MEDA 4JS4A 2G8IA 1Q86O 2F9TA 3HP6A 2EWSA 1JKHA 1YXQA 2GWJA 1B9FA 3PX4A 4F2SA 2GEMA 3AVLA 4LFAK 2C1IA 4ZHRA 4JKAA 1UWBA 3D2FA 4H8KA 3DLHA 3QMLA 3HSTB 4KPYA 4O5BA 4KHNA 3WXMB 4E7JA 3SPYA 4DR3K 4CZKA 3U3YA 4IWVA 2UXBK 3NCIA 2PYLA 2UYTA 4BR9A 2HBMA 4W5NA 2A6AA 5IWAK 3WXIA 1IG9A 5E84A 2QKBA 4IG3A 1VQON 4IKFA 2ZJPL 4I6MA 1DEJA 1CZ9A 3RR7A 1FKPA 5CZ2A 1VSLA 2ZD1A 3KVGA 3M8RA 1S1TA 3NVKA 4JKEA 1YITN 3RRGA 2BGGA 3V9UA 1YUWA 4MLHA 1C0GA 1QS4A 4I6MB 5HROA 3L4IA 2HHUA 1VQKN 4G1QA 1YF5L 1XC3A 4BR2A 4FJMA 4YOWA 3MWTA 3WXKA 4BGBA 1J53A 5E26A 2O4GA 3CFPA 4GKKK 2D0AA 4B1YB 3THXA 3PX6A 4WQ4A 3ZETA 4MO5A 4DUZK 3F9MA 1BIUA 2A42A 4KI6A 1TAUA 1A5VA 5AQNA 4BR5A 3PX0A 4JI5K 3OA9A 4B1VA 2FSJA 3CD6N 3O08A 1XNRK 4F8RA 5BR8K 2W40A 3P1GA 4CEDA 2AA4A 3THXB 1C1AA 4KHWA 4CJ7A 3OYMA 2E2NA 4CERA 3ZETB 1U47A 4KTQA 1FK9A 4BE7B 3NFAA 4M42A 1P8ZA 3PO4A 3C6AA 4Z4HA 4CF2A 3IFRA 1NGFA 3TSQA 4CGHA 1NWKA 4BRGA 4DB3A 3A5OC 4CHYA 4DV3K 4KB1A 4Z4CA 4B3RK 4DTSA 1U48A 4O8KA 5DM7L 1TV6A 3OJUA 3J8AA 2RN2A 4KAZA 4F4KA 2OPSA 3C94A 4YY3K 4H5RA 4CFBA 3DLKA 1S9EA 1VQ7N 3DMJA 3CM6A 1WBBA 4DTXA 4JK7A 3LAKA 1GLEG 2WBNA 1VQLN 4CHNA 4EAHD 4A5BA 3SNNA 3UB5A 1WSEA 3IDHA 5GAEP 5HOOA 4K8XA 1NNEA 3CC4N 1J54A 4BRLA 4N76A 4DTNA 4U67L 1TK0A 3QNOA 1XMQK 2Z1HA 1T7PA 1I3AA 1QQNA 1W9HA 3DLEA 3A5LC 3AVJA 2E2OA 1VQMN 4CEFA 1X9JA 5GAHP 4X66K 1RTDA 4JD2A 4YOYA 1QZ5A 4BQLA 3O3GA 4CFDA 1KFSA 1U45A 3VQDA 1JLFA 3VF6A 1WUAA 2BH1A 3BF1A 4CIFA 5CHIA 3LPUA 1NK7A 3DLRA 4E3SA 1M90O 2HHHK 1N34K 4FJNA 4DU1A 2IAJA 2FSNA 5DK5A 1JL2A 4BWMA 3SK3A 2AP1A 4YOTA 3D0PA 3G25A 3CCVN 4QS7A 2IVOA 3MXJA 3VQ7A 4K43A 5EVZA 3S3MA 1HKCA 3HK2A 2G8VA 3CCJN 4GV6A 3IRXA 5FROA 3SBTA 4CBUA 3EYZA 2A40A 3WUHA 3JXUA 1MDUB 2HMPA 3N4QA 4B9NA 2FBVA 4BVPA 2E6MA 3LAMA 3TSPA 3QEWA 1DLOA 3AVAA 4YORA 3SUPA 5KTQA 4F2RA 1IBMK 3VGMA 3H3OB 1Z6RA 3KK7A 3SUOA 3RRHA 3K9JA 1NJWA 1IKWA 3FR0A 3LPTA 3EEQA 5AQFA 3ZSRA 4BG9A 1BIZA 3FLCO 1JCFA 1VSJA 2GUPA 1CZAN 5AR0A 4YFUA 4I7FA 3VGKA 2I7NA 3W0LA 3WQTA 3OS2A 4FJ8A 3L4QA 4JI1K 3OYBA 4BRFA 4CEAA 1HNVA 3DYAA 1D8YA 3S3OA 1ZYQA 2YHWA 4H0PA 4KKOA 3QEVA 2F9WA 1TGOA 4CEEA 3L2VA 3WNFA 1SL1A 1JXBA 3QESA 2VWKA 1RNHA 3G6EN 4DV1K 2OPPA 2VYPA 3BEXA 3WXLA 5AZIA 2NUBA 2GELA 1TK5A 4C1NK 3VF2A 4J2EA 1TAQA 3QBXA 5SZTA 1RBSA 3HM9A 4JI7K 1KVCA 2A1RA 2KTQA 3VTHA 1NGCA 4CGDA 2HHQA 3F9KA 3ID8A 4K8ZA 1WAJA 1WAFA 3DXMB 3OBWA 3KD5E 3CCMN 5AZIB 1LWFA 2QWRA 5TKWA 2QWOA 4H0XB 1Z05A 2QKKA 1BDGA 2YJEA 3D2EA 5CZ1A 4OPHA 1OH6A 1K8AO 2YNHA 3EL2A 3V6DA 4DSJA 2IC3A 4OKEA 4NCGA 3O4QA 5JLHA 3VEWA 4BECA 5JS2A 4RTFD 4KI4A 4X64K 3CCEN 3HRGA 4EZ6A 2ZF5O 4KHYA 2XHBA 4LFCK 1NU0A 4PL8A 3R6MA 1HLUA 4FM1A 4DSFA 5ADXH 4KBOA 4M7YA 3BY5A 2NNWA 4CFAA 1VAZA 3T3FA 1D5AA 1NMDA 3PIPL 5C24A 3QFPA 4BQZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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