4GY2B

Crystal structure of apo-ia-actin complex
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 115
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gy2B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4gy2B03
1MWMA 4IWVA 4C23A 3R8EA 3O8MA 1HX1A 3MN7A 3GBTA 2P9KA 5AZJB 3M3ZA 3QICA 4A62A 4BRIA 3MN6A 2YCHA 1JCEA 3AY9A 2E2QA 1HKGA 2YJEA 2E2NA 2Q31A 4BC5A 4FWNA 4JN4A 5AQOA 2YHYA 1QHAA 2D1KA 4B1YB 5KPTA 4RTFD 1ATNA 4M7XA 3MN5A 3TU5A 5BN9A 3D2FA 3BEXA 4H03B 4QS7A 4IJNA 5KPRA 3LDQA 4H5RA 5AR0A 4ISEA 4DCHA 3SK3A 1OKJA 1NBWA 3G25A 4MLEA 4A2BA 3VEVA 2GUPA 2AP1A 1NGBA 3ENHA 1DGKN 3FZFA 3ULEB 3FZKA 1BUPA 5BPNA 1NGFA 3EO3A 3H6EA 3C7NA 1T44A 4ISFA 1ATRA 4M7YA 2IIRA 2FF6A 5JMVA 2P9NB 1LCUA 3VEOA 4JAXA 2OANA 5I9EB 3LDLA 1GLBG 4JNEA 2Q0UA 3R6MA 3JS6A 3VGLA 3FZMA 1Q18A 3U8XA 5ADXH 2QWPA 1ZXOA 2F9WA 4XH4A 4BRMA 3CETA 2Q2RA 2PBDA 1GLFO 1X3MA 4H0PA 4XEIA 4BC3A 3KVGA 3IUCA 1HUXA 4YDUC 1ESVA 2YHWA 2Q36A 3CHWA 2CGJA 1J6ZA 5AQFA 3ULEA 2V7YA 4ISGA 3I33A 3VGKA 2IVOA 3ZETB 4CZKA 4BQLA 1DEJA 2D4WA 4BGBA 5B8HA 3UKUA 2P9UB 4JHDA 5ELZA 1T6DA 5ADXA 5F2RA 1TYQB 1E4FT 1ZC6A 1YXQA 2QWRA 1GLEG 5AQXA 2FSKA 4WYBA 3IMXA 4RCHA 3B8AX 1LOTB 2ZGYA 1K8KB 4IO8A 1TUUA 4FWMA 3VESA 3CQXA 4EHTA 3FZHA 5AQYA 3UKRA 1T6CA 1GLDG 3QB0A 2P9LA 3LM9A 2P9KB 3QFPA 4WQ4A 2H3GX 3A8YA 3MDQA 4CZHA 2P9SA 3ZX2A 3CJ7A 4DHYA 5F0XA 2D0OA 2IVPA 4BRLA 2W41A 4B1WB 4HWIA 2AA4A 1TYQA 1QQMA 4BR2A 1U2VA 1XC3A 4GNIA 3D2FB 1YVNA 2E1ZA 2ASMA 1YUWA 3A0IX 1D4XA 3R9PA 1NGGA 4BREA 4B1VA 2QWLA 3BUZB 3F9MA 1HKBA 2Q0RA 2ZGZA 5EVZA 3WEEA 3J8AA 4F9OA 3DXMA 3L4IA 3WT0A 5BR9A 3C7NB 2QWQA 4FO0A 4A61A 1BG3A 1GLJO 2YHXA 4BG9A 5KQ8A 4CZGA 2Q97A 4FOEA 5AQWA 2ZWHA 3O4WA 3IDHA 3AARA 3VEWA 2P9IA 3H3NO 4B9QA 1RGIA 1BOTO 2HMPA 4B1ZA 2E88A 3VEZA 1EQYA 3A5MC 5AQMA 2V51B 3DAWA 3O1WA 2QWNA 4H5TA 2E20A 2NLXA 1SZ2A 2GTDA 4M63C 4CZMA 4BROA 4I6MA 3ZX0A 4CD3A 3QBXA 5AQLA 4DQ8A 5EX5A 2QWMA 4FWKA 4BQZA 3O80A 3UKUB 1JCGA 2FF3B 3H1QA 4JHDB 4CI6A 3CJ1A 5CE3A 2ASPA 2HOEA 1E4GT 3SMSA 3BF3A 4BC4A 1QZ5A 3MCPA 3WXIA 2A5XA 1WUAA 4BRKA 1NMDA 2ITMA 1JCFA 4FWRA 2NZTA 4QS8A 4O5FA 5AQIA 3CI5A 2P9PA 5KPZA 2W40A 1GLLO 5AQJA 3UKRB 3AAQA 3A5LC 4PL8A 3SJHA 2P9LB 5AZIA 4A2AA 1BWFO 4CBXA 3DXKA 3M6GA 4Z94A 2QXLA 3WUHA 5AFUH 3SMPA 4CBUA 2P9SB 3ID8A 5E26A 3LM2A 3GG4A 4QS9A 1NGCA 4BR9A 5EY4A 2DPNA 5BRDA 3WXKA 2EWSA 4EHUA 1S22A 3VF2A 1U2VB 4CZIA 1G99A 2D0PA 4H5VA 3DWLA 3D2EA 2VWBA 4BG8A 2YJFA 3MMVA 2V7ZA 2IVNA 3P4IA 2QW9A 1C0GA 4K41A 5BPLA 5F1XA 1KAXA 5JLHA 4WQ5C 2J4RA 3C0BA 1Z6RA 4CZEA 1BA1A 2HF3A 3QMLA 3MN9A 5AFUA 3VERA 1ATSA 2CH5A 3WEEB 3DXMB 1HJOA 3LDNA 1NLVA 2CGLA 5AQVA 3VOVA 5AQGA 4HTLA 3CIPA 5AQKA 3CJCA 2E2OA 4B1UB 1MWKA 3FFKB 4PKHA 4PKIA 4H0TB 4YDUA 1V4TA 3EKUA 1NGEA 2A40A 4PKGA 5TKYA 2P9IB 4BVPA 4IJAA 3FR0A 3BF1A 1QQOA 3OHRA 3GL1A 4EIAA 5AQSA 4IXCA 1R59O 4PL7A 4MLHA 2NRHA 1HKCA 1HLUA 2GELA 1BO5O 2A42A 3IFRA 5EXWA 2VCPA 1GLAG 3GDQA 3LDOA 3TPQA 1NWKA 1NGHA 1GLCG 4L3QA 4BC2A 4CD1A 5BREA 1BU6O 3L0QA 3CQYA 4I6MB 3U9ZA 3U9DA 4CZFA 4BRAA 2A6AA 2E8AA 4FOIA 3VETA 4CJ7A 3O08A 2GEMA 2FLOA 4J8FA 1V4SA 3H45C 5AQRA 4H0VB 4IZ9A 3VF6A 3VF4A 3H1VX 2ASOA 5AQUA 5FPMA 3RSEB 1SAZA 3ATUA 3HTVA 3CJ9A 3VEXA 4RWTA 4FPAA 2A3ZA 4BRQA 2P9PB 1S3XA 3AAPA 4AM6A 1RDWX 4LC9B 2V52B 2CH6A 2QM1A 3BP8A 5BN8A 3QBWA 5AZIB 2Q1NA 2CGKA 4BVOA 4JD2A 3A5NC 3DXKB 3CERA 5BPMA 1KXPA 1H1VA 3W3DA 1BA0A 4FSVA 3EL2A 2UYTA 3HBTA 3JXUA 5AQZA 5LJVA 5AQHA 2VYPA 4FWPA 2E1YA 5LY3A 3QFUA 4FWOA 3D2EB 1HPMA 3RSEA 3UE5A 1X3NA 1ZBSA 4H5NA 3SLCA 3EN9A 3GE1A 3O1BA 4DB3A 3WXJA 5AZJA 4H0XB 5FPEA 2GWKA 2I7PA 1TUYA 3FE1A 2WUSA 3KZBA 4BGAA 5EOYA 3DJCA 3S41A 1BDGA 2QWOA 4FL9A 4BRGA 1U6ZA 3ATVA 3FGUA 2F9TA 3HZ6A 3WQTA 5LJWA 1MA9B 4MO5A 3ZX3A 4CZJA 2YI1A 4BR7A 3M1FA 4WQ4C 1Y64A 4CBWA 4E1JA 1NM1A 2I7NA 3D7EO 1QQNA 2HF4A 4BR0A 1C0FA 4H5WA 4FWQA 4FWSA 4H0OA 1XQSC 3QDKA 2BUPA 4BRNA 2PAVA 4FWLA 1MDUB 5JICA 3HSCA 2E2PA 1X9JA 4K43A 4NB4A 1P8ZA 4BRPA 3GOIA 4BRDA 2FSNA 3EZWA 3CJAA 1NGJA 4O8KA 1KAZA 4BRHA 3HI0A 4BR5A 4K25A 3A5OC 1QZ6A 3LL3A 4FPBA 2P9NA 1SQKA 3I8BA 3ENOA 5AQQA 3VPZA 4Y0WA 4CZLA 5KQDA 4GY2B 3VENA 1XUPO 4BR4A 1YAGA 5FPDA 3O6WA 3ZEUB 3H3OB 3UB5A 1DKGD 5JLFA 5BRHA 5AQTA 2ZF5O 3KHYA 3VGMA 5FPNA 3W0LA 4MO4A 4KBOA 4EAHD 3FLCO 4EFHA 1NGAA 3MK6A 5BRFA 1CZAN 5AQPA 4BRCA 4B1XB 4XH1A 3WXLA 4AM7A 4BRFA 5E84A 3U4LA 2KHOA 3ZETA 4NO7A 5AQNA 1IG8A 3VEYA 4JD2B 3CJBA 3FZLA 1WOQA 3LDPA 4H0YB 4XH5A 3WQUA 2P9UA 2FSJA 1KAYA 3L6QA 4K42A 2FXUA 1NGIA 2BTFA 4WQ5A 1Z05A 3EKSA 1K8KA 1RFQA 2A41A 3ZEUA 3O5BA 1IJJA 1NGDA 2GWJA 3HM8A 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MWMA 3PY8A 4IOCL 4DMNA 4CHOA 1VQPN 3O8MA 3MN7A 3OYGA 3NF8A 1YJ9N 4I2PA 3AGRA 5C42A 3T1YK 5IT9O 3QICA 3OVNA 4JS5A 1IKYA 3MN6A 3F5TA 1JCEA 1IBMK 3AY9A 1B92A 4CJKA 1EO1A 3MXIA 2Q31A 3J81O 4FJ5A 4CHPA 4CJ5A 3LAKA 3PO4A 3AVAA 4FZXC 2IOCA 1ATNA 4PUOA 3MN5A 1RTDA 5BN9A 1IBKK 4FK0A 3HOTA 3SK3A 3VQ6A 3G25A 4A2BA 2GUPA 5BPNA 3H6EA 3Q7BA 4O55A 4ISFA 4B9LA 1W97L 2RN2A 3OYJA 4W5RA 4M45A 3RWUA 2P9NB 1LCUA 3VEOA 4CFCA 1WAJA 5I9EB 1HYZA 1GLBG 1I94K 4JNEA 1WBBA 4Q0BA 3VGLA 1Q18A 4DS5A 2F9WA 3CYGA 3CCVN 2Q2RA 2IAJA 1J9AA 1GLFO 1X3MA 4XEIA 5HLFA 4YDUC 2EX3A 2YHWA 3M8PA 1IO2A 4FLXA 2CGJA 3NE6A 1WSFA 1T3VA 4LH4A 1RT4A 4BQLA 2NRZA 3KLIA 3Q7CA 5B8HA 2XHBA 3UKUA 3NAEA 4F3TA 3OYBA 5HP1A 4FLTA 1TYQB 1E4FT 5I3UA 4JV5K 2JWKA 1GLEG 5TKWA 3KIOA 3IMXA 4ID5A 3L8BA 1K8KB 4BDZA 4FWMA 1ITGA 1WNSA 3OY9A 3HVRA 2P9LA 4A57A 3LM9A 2Y1IA 4O44A 5HRSA 3SV4A 3C94A 3DLBA 2HBKA 5C0YA 3A8YA 4ZHRA 4A5AA 4CZHA 3ZX2A 3D45A 4DHYA 5M1NA 1YJNN 4FJHA 3C65A 2F4VK 3PIPL 3LZJA 4Z0UA 2QKKA 3CC4N 4E19A 1KFDA 4B3TK 5J2PA 2E1ZA 1F21A 1NK6A 3A0IX 3ALYA 3R9PA 1NGGA 3QEVA 4B1VA 2QWLA 4DU1A 4CF9A 4CFDA 4F9OA 1U49A 4FJ8A 1QHTA 4YOUA 2QWQA 4DU3A 1RBRA 2YHXA 1KTQA 4BG9A 3AVGA 1JLGA 2Q97A 3NDKA 3IDHA 3OJUA 1BOTO 2HMPA 2HVIA 2E88A 1FKOA 4ELVA 4AQYK 4JKBA 4F4KA 4H5TA 1BHLA 3OYFA 3MWTA 1JLEA 2E20A 4LSNA 4E7HA 1SZ2A 3NF9A 1RDBA 5GINA 2YX6A 3ZX0A 4CD3A 3E9PA 1TKTA 5EX5A 1BQMA 4BQZA 1NKEA 3UKUB 3H1QA 4NCBA 4G1QA 3CJ1A 1BISA 4DR5K 4FVUA 3DM2A 3CCQN 3MCPA 3E9LA 4BRKA 1NMDA 3IAYA 1JCFA 4DV7K 4BY9C 1C0UA 1VK0A 3F9KA 3VA0A 3WNHA 1ZBUA 5AQJA 3CMAN 4AHCA 1EKEA 2O8BA 2P9LB 3ZSVA 2E6MA 1S1WA 4KHPK 4KKOA 4N76A 4DSFA 2QXLA 5AFUH 3WNGA 4QS9A 1NGCA 3ZT3A 4BR9A 2OYQA 1VSKA 3LANA 5CZ1A 4W5TA 1R0AA 3AVLA 3WXKA 2EWSA 3T1AA 1S22A 3D6RA 3VF2A 4IOAL 1G99A 2XRIA 3ZSXA 3SQ4A 2V7ZA 4DQRA 3AO4A 3LALA 4A5BA 3LAMA 5F1XA 5JLHA 4WQ5C 1RTIA 1Z26A 3AVIA 2D0AA 3VERA 1ATSA 2KFZA 1HJOA 1NLVA 3O9UA 3K58A 2OPQA 5AQGA 3F2KA 4HTLA 2O8EA 3CJCA 3PX4A 4B1UB 4FZZA 1BL3A 1EX4A 3I8DA 4H0TB 2XO7A 2A40A 4PKGA 2FBVA 1CZBA 5KGWA 3LP3A 4B9TA 3QERA 2NRHA 2HB5A 3WXMB 2VCPA 1EP4A 4QOZB 1GLAG 3GDQA 4CIGA 1HR0K 4DSKA 1NGHA 1GLCG 5BREA 2PFUA 4FXDA 4AHSA 3CQYA 4CGJA 3BY5A 3CCEN 3AVCA 3VETA 3V9WA 4KI6A 2FLOA 5GAGP 1U45A 1KC8O 1FXXA 4IZ9A 3HOSA 3H1VX 5AQUA 5FPMA 1NG9A 3O4NA 4JI7K 4DS4A 3AA3A 4ELTA 2LSNA 3FFIA 3H08A 3CJ9A 3VEXA 4PQUA 4AM6A 3HP9A 2CH6A 2O8BB 4MQ3A 3RMDA 1ZYQA 3QESA 2WFBA 4KPYA 2WC9A 2G8UA 3NH0A 1BA0A 2B4JA 3LWMA 1FJGK 3EL2A 2VWJA 1ASVA 3CCLN 4JI0K 2XY5A 4HUGA 3QNOA 4BE1A 1S6QA 2OCEA 2IDOA 4QCLA 4J2DA 3SLCA 3SQ2A 3NGIA 4DB3A 4CJQA 3WNFA 1TUYA 3VQQA 4DTJA 4B9UA 4WE1A 4KFBA 2WUSA 1WSJA 3QLHA 4BGAA 3S41A 4FJ9A 4IG3A 1S1XA 2QWOA 1ZBFA 3ATVA 2O8EB 3CFOA 5LJWA 4J2EA 3QEWA 3VQAA 5MLCQ 1NJXA 3BZKA 3AVNA 1NM1A 2UUAK 2HF4A 4H5WA 4FWQA 3T7ZA 1ZBIA 5T7BA 1OH7A 2OPRA 2KFNA 2BUPA 3AO1A 2PAVA 4FZYA 1LWFA 4NB4A 2BANA 1TKXA 1XMOK 3GOIA 1X1PA 5GADP 4UQGA 3EE9A 3NF6A 3AA4A 4O8KA 1KAZA 4M41A 1NKBA 2G8KA 3LL3A 4DV5K 1XMQK 1WSHA 5A2QO 1BGXT 3JSMA 4JI2K 4E89A 4GMJB 3UB5A 3VQDA 4MDAA 5JLFA 5BRHA 3MEDA 4RW7A 2OPSA 5HOOA 2R7YA 3W0LA 2BDPA 4EAHD 1NGAA 2HVHA 1CZAN 3M8RA 3THXA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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