5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
b'MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
1SQKA 4FL9A 3WQUA 3CQYA 1U2VA 3GDQA 1XC3A 2Q0RA 5E84A 4BRIA 3MMVA 4M7XA 3F9MA 2A42A 2ASMA 2YHXA 3GE1A 4BREA 4XEIA 3EN9A 1LOTB 3L0QA 4I6MB 4B1ZA 4CD1A 4B9QA 2P9UA 1Y64A 3ZX0A 4FWMA 4EIAA 2IVPA 1QHAA 4MO5A 2QXLA 4FOIA 4B1YB 4WQ5A 4BR2A 2IVNA 4CI6A 4YDUA 2J4RA 2QM1A 4HWIA 1X3MA 4ISFA 3IFRA 5F1XA 4BR4A 2QWPA 2BUPA 3EZWA 4CZGA 3VF4A 5KPTA 5KQDA 3AY9A 1HX1A 4F9OA 2H3GX 3HSCA 1WOQA 3WEEA 3GOIA 3D2FB 1IG8A 1GLDG 4FO0A 3CERA 1NGJA 2ZF5O 3CJCA 3EKSA 3H6EA 1ESVA 5AZIB 1MDUB 4CJ7A 3DXKB 3A5MC 4PKIA 4EHTA 5F0XA 2A6AA 3CHWA 1QQNA 3FZKA 3U9ZA 4BRQA 5AQZA 5FPEA 3CJ1A 3U9DA 5AR0A 1NWKA 5BPMA 4BRPA 5LJWA 1IJJA 1JCFA 1ATSA 4PKGA 4XH4A 1WUAA 2CGJA 2P9KB 4H5WA 1RDWX 3B8AX 3BF3A 4JHDB 1HKCA 2YJEA 4A2BA 5ADXH 1BG3A 3VETA 3DAWA 4NO7A 1V4TA 1GLJO 5AZJA 3ZETA 4RWTA 3IDHA 3HM8A 2D0OA 4PKHA 3AAPA 2P9NB 1ZXOA 4FOEA 3VGMA 4MLEA 2VYPA 1QZ5A 1NGAA 3LL3A 2A5XA 3U8XA 4NB4A 4B1XB 3H45C 3JXUA 3ZX2A 3R8EA 4IWVA 3O6WA 1CZAN 2A41A 3D2EA 4H5VA 4FWOA 4CZLA 2QWNA 4H5RA 5AQTA 5F2RA 2YCHA 3BF1A 3WXJA 3MN9A 2HF3A 3L6QA 3MN6A 1ZC6A 1ATRA 4H0XB 4DB3A 3QICA 1HJOA 5JICA 3VEWA 1ATNA 3VESA 4BRLA 3C7NA 1D4XA 1DGKN 5AQRA 4K42A 3MCPA 3WXKA 3GBTA 3MN5A 4BC2A 3ULEA 1K8KB 3QFUA 4H0YB 1KAXA 3UKRA 4WQ4C 4BG9A 4JAXA 1TUYA 1LCUA 3TU5A 3LM2A 4IJNA 1XUPO 1GLLO 3EO3A 1TYQA 4KBOA 4CD3A 3IMXA 1HLUA 4CZKA 3DXMB 3VEZA 5EVZA 4BR0A 1HUXA 3VF2A 5JLFA 5AQIA 2Q1NA 4JD2A 5BN9A 3LDLA 4K25A 1J6ZA 2IIRA 5ADXA 3SMSA 3U4LA 1MWMA 4BRGA 3FGUA 3A5NC 3ZEUB 2E2PA 3VOVA 3S41A 2Q31A 4IJAA 3VF6A 4O8KA 3H46O 1GLFO 2I7NA 4M63C 3ENHA 2P9LB 5JMVA 4CZIA 5BPNA 5AFUH 1P8ZA 3HI0A 3J8AA 4BC5A 2W41A 1JCGA 2HOEA 3BEXA 1GLAG 3LDPA 2D1KA 4K43A 5AQGA 3UKUA 3MN7A 2V52B 2YJFA 2PAVA 2CH5A 4AM7A 4E1JA 3GL1A 5AQMA 5EXWA 1NBWA 2AA4A 4LC9B 3QFPA 5AQFA 5AQUA 4K41A 4BRKA 1HKBA 2NZTA 3R9PA 5EX5A 5AQQA 3FE1A 3D7EO 2QWRA 1QZ6A 3ATUA 2A3ZA 1SZ2A 3CIPA 1RGIA 2ITMA 4BROA 3MK6A 3RSEA 2P9SA 4I6MA 4BRMA 3AARA 2QWOA 1E4GT 3LDNA 3QB0A 1E4FT 4A2AA 3WXLA 3VEXA 3ATVA 1S3XA 2CH6A 3LM9A 1BA0A 4B1WB 3QDKA 3FZLA 4BRDA 4CZHA 2DPNA 1NM1A 1YVNA 3HTVA 3UB5A 3D2EB 4HTLA 1NMDA 2P9IB 1GLCG 4IO8A 4A62A 3O80A 2Q36A 4J8FA 5AQXA 3O08A 5AQVA 3VEOA 4BRNA 4Y0WA 3A8YA 3CJ7A 3IUCA 1BDGA 3D2FA 3I33A 4FWQA 4QS7A 5AQOA 1DEJA 2WUSA 4BR5A 4BC4A 1QQMA 4BRAA 1SAZA 5AZIA 3O4WA 3SJHA 3DXKA 4A61A 3VGKA 2P9PB 5KPRA 1NGHA 4BG8A 3CI5A 2QW9A 2BTFA 4H0PA 2PBDA 4IXCA 2W40A 4BQLA 5AQPA 1Z05A 2ZGYA 5FPNA 4AM6A 5AQWA 1U2VB 3TPQA 3HBTA 5ELZA 2EWSA 2P9KA 3KZBA 4H0TB 2V7YA 2OANA 4FPAA 2V51B 4PL8A 4CZFA 3EL2A 4BC3A 4JNEA 2QWMA 2GWJA 2P9UB 2Q0UA 2ZGZA 3CJ9A 3O8MA 3WUHA 4M7YA 2P9NA 2Q2RA 2KHOA 3ENOA 3O1WA 2D0PA 5BRDA 4JN4A 4QS8A 4CZEA 3SK3A 1KXPA 4BRFA 2GELA 1KAZA 3WQTA 4BQZA 1G99A 2AP1A 3A5OC 4BR9A 4O5FA 4BVPA 4WQ4A 1HPMA 4B1UB 2GWKA 3W0LA 3A5LC 3WEEB 2ASPA 5AQYA 2YI1A 3BP8A 4Z94A 3HZ6A 4FWRA 5AQLA 2HF4A 4CZMA 2E20A 4WYBA 1Z6RA 2HMPA 2QWQA 5LJVA 4RCHA 3SMPA 4DCHA 5BRHA 3QBWA 5BRFA 3VEVA 3M6GA 1GLBG 4BVOA 2Q97A 2VWBA 5KPZA 2E8AA 4WQ5C 4BGBA 4YDUC 2ASOA 3AAQA 5EOYA 5BREA 3RSEB 2P9SB 3KVGA 2QWLA 1R59O 1X9JA 3DWLA 1K8KA 1T6DA 2FSKA 4FWKA 4FPBA 2E1ZA 3CQXA 4H5NA 4RTFD 1JCEA 4MLHA 2GEMA 3ZX3A 5EY4A 1HKGA 2E2NA 3H3OB 5AQKA 3WT0A 3P4IA 2ZWHA 3VERA 1QQOA 1GLEG 3H1QA 4EFHA 4XH5A 4H0OA 1ZBSA 1RFQA 5AQNA 5AZJB 3ZETB 4FSVA 3DXMA 2FLOA 4BR7A 3H1VX 1EQYA 1NGBA 1BO5O 1NGGA 3OHRA 1DKGD 2FXUA 2YHYA 3CJAA 5AQSA 5FPDA 4EHUA 5JLHA 1X3NA 3CETA 1BA1A 3ZEUA 3LDOA 3QMLA 3MDQA 1NGFA 4PL7A 5E26A 3FLCO 1H1VA 1MWKA 4EAHD 2E88A 2P9LA 1XQSC 3JS6A 3WXIA 4BGAA 4DHYA 4BRHA 2NLXA 4H03B 1BU6O 2E2QA 3CJBA 3FZHA 2CGLA 4CBXA 3FZFA 3VEYA 1MA9B 4CBUA 4GNIA 3C7NB 4XH1A 4ISEA 5FPMA 2I7PA 4CBWA 1BUPA 4GY2B 4FWNA 1YUWA 3ULEB 1KAYA 1OKJA 2IVOA 3UE5A 2F9TA 3FZMA 3A0IX 3GG4A 3UKRB 2A40A 3VENA 4ISGA 5AFUA 3BUZB 4IZ9A 4DQ8A 1TYQB 1BWFO 3I8BA 1S22A 1C0FA 5AQHA 5AQJA 3DJCA 1NGIA 3M1FA 4JHDA 1V4SA 2VCPA 4L3QA 3VGLA 1U6ZA 1BOTO 1Q18A 2F9WA 4JD2B 1NGEA 2FSNA 1C0GA 3QBXA 5LY3A 3R6MA 5TKYA 5BR9A 2P9IA 3H3NO 4QS9A 2FF3B 3C0BA 5B8HA 4CZJA 4C23A 1NGCA 2FF6A 4B1VA 4H5TA 3KHYA 4FWLA 3O1BA 3FR0A 3ID8A 4FWPA 1TUUA 3SLCA 2YHWA 4FWSA 2CGKA 3LDQA 2D4WA 2GTDA 4BRCA 3EKUA 3W3DA 3VPZA 2FSJA 2NRHA 5BN8A 1NGDA 5CE3A 2V7ZA 2E2OA 3M3ZA 2UYTA 1YXQA 2P9PA 3UKUB 1T6CA 1NLVA 5KQ8A 2GUPA 3G25A 3FFKB 3L4IA 2E1YA 5I9EB 1YAGA 3O5BA 5BPLA 4MO4A 1T44A 4H0VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ7N 3CQYA 1VQ5N 1XC3A 3B6OA 2P51A 2BH1A 1WSIA 2ZJQL 2Q0RA 3HXMA 1HNZK 3MMVA 3QNNA 4JS5A 4AHSA 3F9MA 3GE1A 3E7UX 5IWAK 4KH4A 3ZT4A 1JLCA 4KTWA 1HQUA 4KB0A 1I94K 4FWMA 5D3GA 4MO5A 4B1YB 3LPUA 3ENBA 2LJMA 4Q0BA 3SJJA 2J4RA 3PUFA 4HWIA 4KH6A 1N34K 4KHNA 3ZSZA 2B6AA 2E6MA 5F1XA 4BR4A 2QWPA 3EZWA 3PSMA 3AY9A 1HX1A 1GOBA 1NJXA 3SPZA 2KBKA 3DLRA 5C24A 3WNEA 3CERA 2G8UA 3CJCA 2G8FA 3S9HA 1LW2A 1ESVA 1OH5A 4M3ZA 2W00A 1RT6A 1VQKN 4CJ7A 3T1AA 4EHTA 2N66A 1QSYA 3AVMA 4X64K 4CIGA 1T7EA 3U9ZA 3PLAA 3NVKA 3CJ1A 3U9DA 4CESA 3QEPA 3AO4A 1LWFA 1S72N 1GPSA 1ATSA 4ILJA 3QEVA 4HUEA 4FCYA 3BF3A 1ZVGA 4LF4K 4R79A 3ZCMA 1V4TA 4HE7A 4JI1K 4CFCA 4B9LA 1I6GA 4RWTA 3CYMA 3AA5X 2Z1IA 3AAPA 5DMRA 4JV5K 1POIA 3G0ZA 4YOXA 3M8PA 1XNRK 1Y97A 2D5RA 5C42A 5C12A 3MXMA 1NGAA 3DLEA 3C6UA 1JLFA 4GKKK 4CEDA 4JRQA 4H5VA 5C15A 3OYCA 2HMIA 5KRSA 4H5RA 4DR2K 3SAGA 3VQ7A 5GAEP 2DY4A 1KC8O 2Z1GA 5GAGP 1HRHA 4E7LA 3THXB 5JS2A 5JICA 3VEWA 4Z4CA 3C7NA 1DGKN 3HK2A 4K42A 4O5BA 2MBKA 3WXKA 3GBTA 4BC2A 3OYAA 3QFUA 3LZJA 1NK8A 4BG9A 4JAXA 1TUYA 5C0YA 3OJUA 4ICLA 3OYKA 2UXCK 4C8OA 2NRTA 3SV3A 5J1EA 4OPKA 1UGLA 5EVZA 4DTMA 1F21A 5AQIA 2Q1NA 3TABA 3LDLA 2DFEA 2IIRA 3SMSA 3K5MA 3N4PA 1YJNN 3OYHA 5J2QA 1NK9A 1UWBA 2O4IA 1CZBA 2LSNA 1WB9A 1BMRA 4O8KA 3H46O 5AFUH 4FLYA 3J8AA 3NH0A 4BC5A 1NOZA 3ISNC 4M3XA 1JZAA 3BEXA 1GLAG 2UUAK 1DTTA 5AQGA 1NU0A 2F96A 3I55N 1VAZA 4WFBL 3O9UA 2PAVA 2CH5A 4E1JA 5EXWA 2AA4A 4LC9B 1S1XA 1KTQA 4K41A 2NZTA 2NNWA 4E72A 1N33K 4B08A 4CEZA 5AQQA 4O44A 3CIPA 1RGIA 2KBHA 1S1UA 4KRFA 4OVLA 5CY0A 4O55A 1J5OA 3V9ZA 3QO9A 4A2AA 3PX4A 3DLLL 3C95A 3ATVA 2CH6A 3LM9A 4E1NA 1W7AA 3KIOA 3FZLA 4BRDA 1DT9A 2DPNA 1KVBA 1ZVEA 3T1YK 1ASUA 2P9IB 4DV0K 3K9JA 4A62A 1T7BA 4NYFA 4LF7K 5AQXA 5AQVA 1WBBA 4FJKA 4BRNA 1SL0A 1A5VA 3RVCA 3A8YA 3IUCA 1WSJA 4FWQA 2BGGA 4BR5A 1DEJA 5BR8K 1S9EA 4V19S 4UJ0A 4JI4K 4O8UA 5AZIA 4KAZA 3VGKA 1SN1A 5KPRA 1NGHA 2P1JA 3L2WA 2BTFA 2PBDA 1N36K 1SN4A 1RT3A 3E1YA 1RILA 4DSEA 2O8BA 5T7BA 3TSPA 1Z05A 4FJHA 5HBMA 3CFOA 1ASWA 1ZYWA 3TTDA 2P9KA 3KZBA 2V51B 3DYAA 1DTQA 4ZTFA 3PIOL 2Q0UA 1RDCA 2ZGZA 4OPHA 3KKSA 2HHXA 1FJGK 2Q2RA 3SUPA 3NH1A 2KHOA 1LQQA 1GOAA 3CM5A 2QEXN 1T7PA 5TKWA 4M3RA 5CZ2A 4BQZA 1QE1A 3HPGA 4BR9A 4K8ZA 1HNXK 3HYFA 2B4JA 3U3GA 1KV0A 3KHWA 3AV9A 3KOWA 3A5LC 4ZHRA 4N56A 2YI1A 5AQYA 3SAHA 4A5AA 1REVA 3OTOK 3JYTA 2WC9A 5HLFA 2YKNA 4IG0A 2OPQA 3T1HK 2IOCA 2N69A 2QWQA 2HMPA 5LJVA 4EZ6A 2RF2A 3QBWA 4B9NA 3K5LA 2VWBA 1NJZA 2LY6A 4ELUA 3T19A 3AAQA 5BREA 4CJFA 5GIOA 5C2FA 3RSEB 4J2DA 2QWLA 1R59O 3ALYA 3ITHA 3CQ8A 3LALA 3ZX3A 3NAEA 1N32K 3OA9A 3BDPA 3LP2A 1RT2A 4NYNA 4XH5A 3QNOA 4H4OA 2FLOA 4BR7A 1BO5O 2HBMA 4M3WA 1NH5A 2HBLA 1CN2A 1KLMA 4PA1A 5AQSA 4EHUA 1LQIA 3SUQA 3WNGA 1X3NA 1FH3A 1LWEA 5KI6A 3ZEUA 3MDQA 3TTFA 1D5AA 4DS4A 1SKRA 3M8SA 1ZUTA 4EAHD 1MWKA 3VQ5A 5FRMA 4DSIA 4IKFA 3WXIA 4JI2K 4H03B 1PTXA 4PWDA 4B9MA 2LJ7A 2XY8A 4DR7K 3NGYA 4CBXA 3V4IA 4B9TA 3VEYA 1NKCA 3C7NB 4NCAA 2FBTA 5FPMA 2I7PA 4ISEA 4F8RA 1WNSA 4ZTJA 1XMOK 3KWIA 1KAYA 4NCBA 4M3YA 4CHQA 1OKJA 2IVOA 3IS9A 3TAFA 4G1QA 4J2BA 3OYLA 3ZSYA 1P0AA 3BUZB 4BE2A 4IZ9A 1M1KO 2DTUA 2ZJPL 4NXMK 1RNHA 5HL7L 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VQ7 N;  3CQY A;  1VQ5 N;  1XC3 A;  3B6O A;  2P51 A;  2BH1 A;  1WSI A;  2ZJQ L;  2Q0R A;  3HXM A;  1HNZ K;  3MMV A;  3QNN A;  4JS5 A;  4AHS A;  3F9M A;  3GE1 A;  3E7U X;  5IWA K;  4KH4 A;  3ZT4 A;  1JLC A;  4KTW A;  1HQU A;  4KB0 A;  1I94 K;  4FWM A;  5D3G A;  4MO5 A;  4B1Y B;  3LPU A;  3ENB A;  2LJM A;  4Q0B A;  3SJJ A;  2J4R A;  3PUF A;  4HWI A;  4KH6 A;  1N34 K;  4KHN A;  3ZSZ A;  2B6A A;  2E6M A;  5F1X A;  4BR4 A;  2QWP A;  3EZW A;  3PSM A;  3AY9 A;  1HX1 A;  1GOB A;  1NJX A;  3SPZ A;  2KBK A;  3DLR A;  5C24 A;  3WNE A;  3CER A;  2G8U A;  3CJC A;  2G8F A;  3S9H A;  1LW2 A;  1ESV A;  1OH5 A;  4M3Z A;  2W00 A;  1RT6 A;  1VQK N;  4CJ7 A;  3T1A A;  4EHT A;  2N66 A;  1QSY A;  3AVM A;  4X64 K;  4CIG A;  1T7E A;  3U9Z A;  3PLA A;  3NVK A;  3CJ1 A;  3U9D A;  4CES A;  3QEP A;  3AO4 A;  1LWF A;  1S72 N;  1GPS A;  1ATS A;  4ILJ A;  3QEV A;  4HUE A;  4FCY A;  3BF3 A;  1ZVG A;  4LF4 K;  4R79 A;  3ZCM A;  1V4T A;  4HE7 A;  4JI1 K;  4CFC A;  4B9L A;  1I6G A;  4RWT A;  3CYM A;  3AA5 X;  2Z1I A;  3AAP A; 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