5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
3D7EO 3LM2A 5LJVA 1NGIA 1HPMA 1GLDG 1NGEA 3M3ZA 2GELA 3AY9A 4MO4A 1MWKA 1KAYA 1S3XA 5AQNA 3VEOA 3O8MA 5AQJA 5AQUA 1RFQA 4A2AA 5BREA 4B9QA 5EX5A 2P9IA 3LDQA 2H3GX 3LDPA 4PL7A 4FL9A 3CJ1A 3EKSA 4CZKA 3LL3A 3BEXA 2QXLA 3ZETA 3GOIA 2QWRA 3QBXA 3A5MC 2YHXA 3VETA 4EHTA 3MMVA 2EWSA 3FE1A 3HBTA 5JICA 3MDQA 3MN6A 5KQDA 4NO7A 3MN5A 2DPNA 4EHUA 3CETA 4ISFA 1XUPO 4BC5A 3HSCA 5AQPA 3F9MA 2UYTA 3HZ6A 1NGFA 4H03B 4BR9A 3O6WA 4QS7A 3SLCA 1ZC6A 1NGHA 4CBWA 5EY4A 5F0XA 4BRHA 5KPRA 2HF3A 3EL2A 2GWKA 4CZFA 3QMLA 1HX1A 3FZFA 3SMPA 4H5RA 5AQYA 1HLUA 4FPBA 5BRFA 4FWOA 3ZEUB 1CZAN 3CQYA 4IJAA 2Q0UA 5AZIB 2ITMA 2PAVA 3JXUA 3WEEB 2P9NA 4CZHA 3QFPA 3RSEB 2E20A 3OHRA 3GBTA 1BU6O 2YJFA 2IVOA 1XQSC 2GEMA 5EOYA 3UB5A 2D4WA 2E88A 3CHWA 2YI1A 2QWLA 2GUPA 4CZEA 2HF4A 4BG8A 3M1FA 4BG9A 3H6EA 3EZWA 1X3NA 1QQMA 1NGCA 1TUUA 3UKRB 3B8AX 1HJOA 3BP8A 4MLHA 4A61A 3QB0A 5AQWA 1QHAA 5AQQA 4EFHA 2V7YA 2IVNA 2P9PA 2WUSA 3C7NB 3MK6A 4JAXA 3VEZA 1NWKA 2ASPA 4YDUA 1SQKA 3WXIA 3L0QA 2AA4A 2CH5A 3FZMA 3BF1A 1ATRA 3VGMA 1C0GA 1S22A 1WUAA 4XEIA 3WQTA 1QQOA 4H5VA 2P9IB 3D2EA 3CJAA 4AM6A 4H0TB 3ZETB 2QWQA 4CZIA 4CD1A 1JCFA 1RDWX 1BO5O 4CZGA 5I9EB 1NBWA 3GE1A 1V4TA 5EVZA 3FZKA 5JMVA 3LDLA 4BRDA 2FSKA 4PKGA 3FGUA 1BUPA 3J8AA 5AQKA 3M6GA 4BRPA 2ZWHA 1RGIA 1NLVA 2ZGYA 3AARA 4H0XB 3ULEA 4MLEA 4FWQA 1HKGA 4PL8A 1NGBA 4L3QA 1BDGA 2QWOA 3UKUA 5AQOA 3WXLA 4BVPA 3VESA 1DKGD 2A40A 3BUZB 2VYPA 4JD2A 1GLLO 3H1VX 4QS9A 4BRIA 1EQYA 4IWVA 4B1ZA 4CD3A 2KHOA 2P9NB 3AAPA 4GNIA 4H5TA 2P9UA 3CI5A 4H0PA 4EIAA 5BPMA 2Q1NA 3EO3A 1HKBA 2CGLA 3GL1A 5AQIA 2P9KA 3G25A 4JHDA 4XH4A 4RWTA 1HKCA 4MO5A 3O80A 2CGJA 1GLJO 1BA0A 3ENOA 3LDNA 1KAXA 3EN9A 4K42A 3SJHA 4BR0A 1JCGA 3SMSA 1T6CA 2P9PB 2V52B 4BC2A 3VF6A 4JN4A 3DXKA 4A2BA 4WQ4A 4BR5A 5BRDA 2FSJA 3WUHA 3O4WA 5AQHA 4BC4A 4DHYA 5BR9A 3U9DA 3CJ7A 4B1WB 4HTLA 1SAZA 3CERA 3D2EB 3HTVA 3TU5A 4B1VA 3IDHA 1U2VA 4IXCA 1T6DA 3MN9A 4BRQA 1ZXOA 2F9WA 1C0FA 5E84A 3O1BA 2A42A 1XC3A 5B8HA 2PBDA 3HM8A 2HMPA 4DQ8A 3VENA 4ISGA 1ATNA 4LC9B 3O1WA 4BRCA 3W3DA 4AM7A 2E1YA 1NM1A 1SZ2A 3VF2A 3UE5A 5AQFA 1GLFO 3ULEB 4HWIA 4FWPA 4BQLA 2NRHA 3MCPA 4BQZA 3A8YA 1KAZA 2YJEA 1WOQA 5AQZA 4M63C 4O5FA 1GLBG 2CGKA 3UKUB 2ASMA 2CH6A 5KQ8A 5F2RA 2FSNA 3VERA 4BGBA 1QZ6A 2D0OA 2I7PA 4JD2B 3FR0A 3O5BA 1V4SA 3DXMA 2QWNA 1Z6RA 5BPLA 5AQGA 5AQVA 4YDUC 4BROA 2V51B 1NGJA 1GLCG 1NGGA 1GLAG 3A5LC 2P9UB 3VEWA 3U9ZA 4QS8A 3H45C 2NLXA 2P9KB 4JHDB 4CBUA 5AQXA 5FPMA 4E1JA 5BN8A 2YCHA 2QWMA 3KHYA 2AP1A 4PKIA 2FLOA 4K43A 3VGLA 3C0BA 5AZJA 3DXKB 3VEXA 4DCHA 5LJWA 2A5XA 4BR4A 2FXUA 3ATVA 2VWBA 3LDOA 1U2VB 4NB4A 5F1XA 1LOTB 5AQRA 2QM1A 2V7ZA 3DAWA 5ADXA 3H1QA 4CI6A 4BR7A 1JCEA 4IZ9A 5KPTA 4BR2A 4BVOA 5FPEA 2P9SA 3FZHA 4CZLA 2E1ZA 4F9OA 2Q31A 2ZF5O 4FWRA 4FPAA 1OKJA 4ISEA 4WQ5A 4H0OA 4BGAA 1TYQA 1BWFO 3GG4A 1G99A 2QWPA 4GY2B 1GLEG 4O8KA 3U8XA 3HI0A 1X9JA 3H3NO 2A41A 4FWMA 3R6MA 1ZBSA 2HOEA 3KVGA 4XH5A 1HUXA 4Y0WA 4PKHA 4BRLA 3I33A 1MDUB 2IVPA 3DXMB 1IJJA 3CJCA 3ID8A 2ZGZA 3WXJA 1Y64A 3CJBA 4FOIA 1LCUA 4WQ4C 3CQXA 5AQSA 1P8ZA 4BRMA 3VF4A 4IO8A 2D1KA 1NMDA 3C7NA 2P9LA 3LM9A 1DGKN 3A5NC 1BG3A 3ENHA 4CBXA 4CZMA 3I8BA 4FO0A 2E2QA 4RCHA 4B1UB 3CJ9A 2F9TA 3ZX3A 2E2NA 1DEJA 3QBWA 2J4RA 3IFRA 4H0VB 4FOEA 3EKUA 5AZJB 5JLFA 3ZX2A 1NGDA 1ATSA 1K8KA 5BRHA 1Z05A 2Q0RA 2VCPA 3D2FA 1E4GT 4XH1A 3DJCA 4BC3A 5JLHA 3H3OB 4H5WA 3FZLA 4BRKA 3QICA 3QDKA 5TKYA 2YHYA 3GDQA 4BRAA 4J8FA 2A3ZA 4I6MA 2P9SB 2FF3B 3FLCO 3VGKA 4C23A 1J6ZA 3BF3A 3H46O 1E4FT 4M7XA 3O08A 3R8EA 3A5OC 1QQNA 1TYQB 2BUPA 1MA9B 2E8AA 4FWKA 3CIPA 1ESVA 4DB3A 5E26A 3L4IA 4EAHD 2OANA 2Q97A 3IMXA 1X3MA 3VEYA 3DWLA 3U4LA 4FWNA 2QW9A 3WT0A 3WQUA 3L6QA 1R59O 3ZX0A 5EXWA 1YVNA 3MN7A 4FWLA 1YXQA 2E2PA 1YAGA 5BPNA 3W0LA 5AQTA 1H1VA 1YUWA 1KXPA 1NGAA 3QFUA 5AFUH 3IUCA 2P9LB 3S41A 3SK3A 4KBOA 2E2OA 2D0PA 5ADXH 4JNEA 5AFUA 1D4XA 3KZBA 2NZTA 5AQMA 4BRGA 3AAQA 3P4IA 4RTFD 2A6AA 5KPZA 3JS6A 4Z94A 1QZ5A 2I7NA 1Q18A 3A0IX 4B1XB 5CE3A 5AQLA 4A62A 1TUYA 3FFKB 1K8KB 1BA1A 2GTDA 4WQ5C 4BREA 3D2FB 4H0YB 4M7YA 3TPQA 2ASOA 4K25A 3ATUA 5AR0A 4WYBA 2BTFA 5LY3A 3ZEUA 4K41A 1IG8A 2Q36A 5AZIA 1T44A 2W40A 2Q2RA 3WEEA 4CJ7A 3RSEA 2IIRA 5ELZA 1BOTO 3VOVA 1U6ZA 3R9PA 4BRNA 5BN9A 4I6MB 4B1YB 4H5NA 4CZJA 5FPDA 4FSVA 2YHWA 2W41A 5FPNA 3WXKA 1MWMA 3VPZA 4IJNA 3VEVA 3UKRA 2FF6A 4BRFA 4FWSA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HPMA 2GELA 3AY9A 4NCAA 1BL3A 1MWKA 4JI1K 3TAQA 2HHWA 1C6VA 3O8MA 5AQJA 3HM9A 3DRRA 1TKDA 4KV8A 5EX5A 2HMIA 2H3GX 4XIUA 2DFFA 1YITN 3DRSA 3LL3A 3VQ9A 2QXLA 1KRPA 2IC3A 2QEXN 5C24A 3QBXA 4RW9A 3VETA 4EHTA 4DV2K 2MN5A 1JLGA 5M1OA 1VQ4N 3HBTA 3OYLA 3MN6A 5KQDA 3NFAA 4FM1A 1RBVA 4JI3K 2DPNA 1N33K 3CETA 4BC5A 1DJTA 2ATQA 3F9MA 3DI6A 2A7TA 2KFZA 1L3TA 5AJ3K 3O6WA 4B3TK 4KTZA 3SLCA 4LF5K 3E01A 4NXNK 3C6TA 4CE9A 1XI1A 1POIA 3SV4A 3QMLA 1HLUA 5BRFA 4DLGA 3CQYA 3VTHA 4K8XA 1KQSM 2PAVA 3DMJA 2P9NA 1NK4A 4CZHA 4DR4K 1Y97A 3GKUA 2NRXA 1D9DA 3CHWA 1O1WA 1UAXA 2GUPA 2OPQA 2HF4A 2JDQD 3H6EA 2FC0A 2D5RA 3IKMA 1X3NA 1MYNA 1BK8A 3B8AX 2NUBA 1NK7A 3C6UA 4OPHA 5AQQA 2V7YA 2IVNA 2WBNA 3C7NB 3PO5A 4GMJB 1SQKA 3KKSA 3O3HA 4BY9C 4CHOA 3IAYA 4IKFA 3FZMA 1NE5A 1OZZA 4CIFA 1C0GA 3WQTA 4CFAA 2HW3A 1QQOA 3CCVN 2YKMA 1W9HA 1JKZA 4CK3A 2YNIA 1X9MA 1WT7A 4B8CA 1SV5A 4CZIA 3TAMA 4HHFA 2GV9A 4CZGA 1HMVA 1NBWA 4OLAA 1RILA 4U7BA 4PKGA 2PYLA 1XWLA 4O0JA 4JKCA 3M6GA 5AQKA 4BRPA 1RGIA 3HRGA 3AARA 3VA3A 2KW4A 3WNHA 1N32K 2Z1HA 5DM7L 1N36K 3K58A 4C8MA 3WXLA 4CJEA 4ID1A 2ZQBA 4E7KA 3BUZB 2BANA 5TKWA 4DTOA 3LP0A 3KOXA 2P9NB 3AAPA 4BDPA 3PSIA 4H5TA 1BIZA 4J2AA 1B3CA 1RBSA 2X6NA 3CI5A 4H0PA 4Z4CA 3VQPA 4DLEA 4RWTA 2CGJA 1GLJO 1NK8A 1BA0A 3LDNA 1KAXA 3SJHA 4BR0A 2KZMA 3LANA 3CFPA 4M3TA 1LWEA 3SMSA 5JVHL 4BC2A 4BE1A 4JN4A 5KGXA 4DSJA 4HVJA 4WQ4A 2YKNA 3WUHA 1YJ9N 1QQCA 3KWIA 1T7AA 1NRAA 1J5EK 1XNQK 3RRGA 1SAZA 3CERA 5C12A 3HTVA 1IBKK 1NOZA 2GBZA 3VQDA 4IXCA 1T6DA 3MN9A 3O1BA 2A42A 5B8HA 3HM8A 1NKCA 3KOYA 4Z4HA 4RG8A 2QTDA 1ATNA 4GV6A 3O1WA 3W3DA 2LT8A 4IOAL 4CEAA 5AQFA 4H4MA 3CD6N 4BECA 4DR3K 2OTLN 4JI0K 3MCPA 1WOQA 3NF7A 4CHYA 4O5FA 1GLBG 3TAEA 3F5TA 2ASMA 3Q7CA 5KQ8A 3OJSA 2UUBK 3ZYYX 5E41A 1VQ5N 5K14A 3OY9A 2G8IA 5H1SQ 2HHTA 2I7PA 1TI5A 1V4SA 4FJIA 3J7ZO 1S1VA 5AQGA 4B8AB 3KKRA 1A5WA 1GLCG 3A5LC 3LZJA 3U9ZA 4JYAK 3H45C 1S9GA 3RMBA 3L2QA 4CBUA 3L4QA 4Z4GA 4E1JA 4GV3A 1IG9A 2B68A 4UAEF 5BN8A 1IKYA 4CF9A 1KVAA 2FLOA 4K43A 4FJKA 1NKBA 1SN1A 3DLEA 3TABA 1BMRA 3NF8A 4BE2A 3SQ4A 2A5XA 3C94A 1VQ7N 3BZKA 3ATVA 3K2PA 4AB0A 4IFYA 3DOKA 3V81A 4FZYA 3THXA 1K73O 2UXCK 3RMAA 1L5UA 4YY3K 1ASWA 1SS6A 3I8DA 4CJTA 1ZBIA 5GAHP 4AAZA 4QCLA 2YNFA 1RTJA 2KTQA 2D0CA 3Q7BA 5FPEA 2P9SA 3FZHA 3R3LA 5KGWA 4CZLA 2E5LK 2FBTA 1JLFA 2Q31A 3AVAA 4FWRA 3HOSA 1W7AA 4E3SA 1PX9A 3HVTA 5C15A 4EZ9A 3VN5A 2GL1A 2QWPA 3MEDA 5JVGL 1J9AA 1JL1A 3PV8A 1HNXK 3AO5A 3NE6A 4BE0A 3AGKA 2QKKA 1HUXA 4Y0WA 4PKHA 4BRLA 4JKDA 3I33A 3AVKA 2NRWA 4ILHA 1Q9YA 5A2QO 3C6AA 3O9QA 5M1PA 3MEGA 3VF4A 3CC2N 4R79A 4E72A 1YI2N 2P9LA 3SUPA 3ZSXA 4FK2A 1TKXA 4FO0A 1EWQA 4GVMA 4C8KA 4FCYA 3SPZA 3CJ9A 2F9TA 3ZX3A 3NH0A 3K57A 3KLEA 3DLLL 4HCCA 3QBWA 3IFRA 3LDSA 3EKUA 3QEIA 2YX6A 2XY8A 1ATSA 2LY5A 1KLNA 1S5JA 4OKJA 3TSUA 4XH1A 3DJCA 4DU1A 4JK8A 1P00A 3THXB 2G8FA 4H5WA 1WN7A 3I0RA 1RBUA 3AVLA 1HYVA 3O9RA 1LW0A 2P9SB 4BWMA 3V1RA 3FLCO 4E7IA 2D56A 3VGKA 1E4FT 3O9TA 3VQBA 4B3MK 3R8EA 1HYSA 1GOCA 3DYAA 5GADP 2E6MA 2F4VK 1RT7A 1QE1A 1U47A 4CESA 3M8RA 4MQ3A 1B92A 1KVCA 2D0BA 3THWA 1RCHA 4BACA 4DKWA 3CPEA 4AQYK 3L6QA 1X9SA 3ZX0A 2PZSA 1YXQA 4AILC 1YAGA 3K9JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HPM A;  2GEL A;  3AY9 A;  4NCA A;  1BL3 A;  1MWK A;  4JI1 K;  3TAQ A;  2HHW A;  1C6V A;  3O8M A;  5AQJ A;  3HM9 A;  3DRR A;  1TKD A;  4KV8 A;  5EX5 A;  2HMI A;  2H3G X;  4XIU A;  2DFF A;  1YIT N;  3DRS A;  3LL3 A;  3VQ9 A;  2QXL A;  1KRP A;  2IC3 A;  2QEX N;  5C24 A;  3QBX A;  4RW9 A;  3VET A;  4EHT A;  4DV2 K;  2MN5 A;  1JLG A;  5M1O A;  1VQ4 N;  3HBT A;  3OYL A;  3MN6 A;  5KQD A;  3NFA A;  4FM1 A;  1RBV A;  4JI3 K;  2DPN A;  1N33 K;  3CET A;  4BC5 A;  1DJT A;  2ATQ A;  3F9M A;  3DI6 A;  2A7T A;  2KFZ A;  1L3T A;  5AJ3 K;  3O6W A;  4B3T K;  4KTZ A;  3SLC A;  4LF5 K;  3E01 A;  4NXN K;  3C6T A;  4CE9 A;  1XI1 A;  1POI A;  3SV4 A;  3QML A;  1HLU A;  5BRF A;  4DLG A;  3CQY A;  3VTH A;  4K8X A;  1KQS M;  2PAV A;  3DMJ A;  2P9N A;  1NK4 A;  4CZH A;  4DR4 K;  1Y97 A;  3GKU A;  2NRX A;  1D9D A;  3CHW A;  1O1W A;  1UAX A;  2GUP A;  2OPQ A;  2HF4 A;  2JDQ D;  3H6E A;  2FC0 A;  2D5R A;  3IKM A;  1X3N A;  1MYN A;  1BK8 A;  3B8A X;  2NUB A;  1NK7 A;  3C6U A;  4OPH A;  5AQQ A;  2V7Y A;  2IVN A;  2WBN A; 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