5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
2KHOA 2YI1A 3MCPA 1Y64A 4WYBA 5AQLA 4BR5A 2V7YA 3FE1A 3CJ9A 5F2RA 4FWPA 1LCUA 2E2OA 3KHYA 3CJBA 4IJAA 5AQTA 1NLVA 2YCHA 3QFUA 4CZKA 1YVNA 2GWJA 1S3XA 4MO4A 3BF3A 5ADXH 2A40A 4Z94A 4PL8A 5AQIA 3KVGA 5KQDA 4K43A 2E1YA 1ZXOA 4CD1A 3P4IA 4H5RA 1BDGA 5AQMA 1Q18A 4H0PA 2A3ZA 3ATVA 4LC9B 5FPMA 4BG9A 3VGKA 5KPZA 1BA0A 2PAVA 3IFRA 4FPBA 4FWKA 4IZ9A 1H1VA 3IMXA 3QBWA 3VEZA 1T6DA 5JLFA 3O1WA 3VESA 4BRMA 2E2NA 2CGJA 4I6MA 5F1XA 3LM2A 3SJHA 4I6MB 4H5TA 1IJJA 3H1QA 3SMPA 2WUSA 2QWOA 4BGAA 3M1FA 5AZIA 3AY9A 2FXUA 2FF6A 4FWMA 5AZIB 4BC5A 3I8BA 4A2AA 3AARA 3O1BA 2D0PA 2P9PA 5EX5A 4BR2A 2P9PB 5LJVA 4CZHA 4K41A 1S22A 2V51B 3CETA 4BRLA 4M7YA 5F0XA 3FR0A 5AQRA 3DXMA 2UYTA 4CZJA 5AR0A 3HZ6A 5AQFA 3DXMB 4HWIA 2VCPA 1D4XA 3IDHA 4FWOA 1GLCG 4BRHA 2I7PA 1T6CA 3MMVA 1XQSC 2QWLA 4BQZA 1NGAA 2HF3A 3WXJA 3A8YA 3EO3A 1NM1A 1QQMA 4IO8A 2FSKA 1NGBA 4E1JA 1J6ZA 4AM6A 3EZWA 3VETA 5BR9A 4JD2A 3UKUA 5AQHA 3GG4A 3UB5A 2Q0RA 4JD2B 1BG3A 4QS8A 3UKUB 5AQVA 3VEXA 4BRQA 2GEMA 3QB0A 3FLCO 1HKCA 2E1ZA 3FGUA 4PL7A 4B9QA 3M3ZA 1R59O 3AAPA 4GY2B 3ZX3A 3CJCA 4A61A 5AQYA 3H1VX 1QZ5A 1YUWA 1GLAG 3C7NA 2YJEA 3VF2A 4BVOA 1NGDA 1ZBSA 3LDNA 3C7NB 3HI0A 3H6EA 1GLLO 3MN7A 4JAXA 3ID8A 4B1XB 2P9SA 3CJAA 2P9SB 3FFKB 4WQ4A 3J8AA 5EXWA 2CH6A 1BUPA 3FZKA 2YJFA 4BC4A 4IXCA 3L0QA 4BVPA 2D1KA 1BA1A 2F9TA 3VENA 4CD3A 3H45C 2NRHA 4DB3A 4RWTA 2Q1NA 4XEIA 3S41A 3WXIA 3F9MA 1NGIA 3SK3A 3BF1A 2A41A 1TUYA 4FWQA 3CERA 3O08A 3GDQA 4A2BA 4BRDA 3B8AX 3ENHA 2P9UA 1WOQA 4FOEA 3U4LA 1CZAN 2P9UB 1IG8A 5KPRA 2QWNA 1HLUA 2W40A 3A0IX 1SQKA 1XUPO 5EY4A 1K8KA 3ZETA 3M6GA 5AFUH 5TKYA 1K8KB 2CGKA 1RDWX 2IVOA 3ZETB 4NO7A 3LDOA 3DJCA 3VOVA 1YXQA 2Q97A 2YHWA 3H3OB 5EOYA 4FWRA 5BN9A 3EN9A 4B1ZA 3OHRA 3D7EO 2HMPA 4BC3A 4BRGA 3SLCA 4FL9A 2GUPA 5CE3A 4JHDA 2Q0UA 3EL2A 1ATRA 3HM8A 4JHDB 2A5XA 1KAYA 1HUXA 1U6ZA 5E26A 4B1UB 3MK6A 4EHUA 2FSJA 4BRFA 1HKGA 1SAZA 1NGFA 1V4SA 4O8KA 2NLXA 4O5FA 3WEEA 4H5WA 4CBWA 3UKRA 3BUZB 3WEEB 2ASMA 3BP8A 3UKRB 4CZFA 4WQ4C 4XH1A 2A42A 2E2QA 5AQXA 1BU6O 3CQYA 5AQWA 4H5VA 3U9ZA 4DCHA 1NGEA 3FZLA 3FZMA 3DWLA 1HKBA 3VEOA 4BRKA 4EAHD 2BUPA 3WXKA 1ATSA 4BR0A 1C0GA 2FLOA 1GLFO 3FZHA 3ZX2A 2QWMA 4FSVA 3LL3A 3LDQA 1QHAA 4EIAA 4XH4A 3WXLA 2OANA 5BRDA 4BGBA 2VYPA 3QDKA 1JCFA 3MN5A 1BWFO 1KAZA 4FWLA 3GOIA 4BQLA 2DPNA 3SMSA 3D2FA 2QWRA 1ZC6A 3BEXA 4H0VB 1DGKN 3D2FB 4A62A 3VERA 1HPMA 3QBXA 3VGMA 4ISGA 1KAXA 1BOTO 3R9PA 3UE5A 5ADXA 4HTLA 3WQTA 3ZEUA 2QXLA 2QWPA 3VF4A 4K42A 3ATUA 5AQOA 3ZEUB 5AFUA 3L4IA 1HJOA 4JN4A 2Q31A 5AQUA 5AQQA 2EWSA 5AQGA 2GELA 1RFQA 4H03B 3ZX0A 5BREA 5FPEA 3CQXA 3O5BA 4QS9A 1NGHA 3KZBA 2NZTA 2Q2RA 1C0FA 2IIRA 5BPMA 4RTFD 3U8XA 3QMLA 1X9JA 1WUAA 4ISEA 3ENOA 1MWMA 3CHWA 1Z6RA 2D4WA 2QM1A 2ZGYA 2ITMA 5AZJA 4B1VA 1TYQA 4EHTA 1JCEA 2HOEA 2E20A 4WQ5A 5AZJB 4BRIA 1TYQB 5KQ8A 1NGJA 4CJ7A 4BRAA 2AA4A 3W0LA 4B1WB 3LDLA 4FO0A 2FSNA 5ELZA 3QFPA 1QQOA 1KXPA 3DXKA 4BROA 1NWKA 3DXKB 4F9OA 4K25A 3VPZA 3CJ7A 2E8AA 3CI5A 2E88A 1E4FT 3O6WA 3VEWA 2P9KA 4H5NA 3HTVA 5JMVA 2P9KB 3L6QA 1ESVA 4BC2A 3A5LC 2YHYA 4PKHA 2Q36A 3GE1A 2PBDA 4RCHA 4H0YB 4M63C 2ASPA 4C23A 4Y0WA 4MLHA 4CBUA 1E4GT 4FWSA 5KPTA 3W3DA 1U2VA 5AQNA 3EKUA 1U2VB 4YDUA 4CZMA 2P9LA 3JS6A 2V7ZA 4ISFA 2P9LB 3IUCA 1NGCA 1GLDG 2GTDA 4BREA 3GL1A 4BR9A 1EQYA 3TU5A 2A6AA 1RGIA 4CBXA 1NGGA 3VF6A 2IVPA 4CI6A 2AP1A 4MO5A 3G25A 3R8EA 4BG8A 4QS7A 5FPNA 4M7XA 3JXUA 5BN8A 4J8FA 4DHYA 4CZLA 3LDPA 4BRNA 3HBTA 2ZWHA 1G99A 1MWKA 3CJ1A 2V52B 3A5MC 3O8MA 1GLEG 4WQ5C 5BPNA 3VEVA 4IWVA 3H46O 1SZ2A 1QZ6A 5LY3A 2P9NA 3MN6A 4CZEA 1MA9B 2P9NB 2E2PA 5AQSA 2YHXA 4XH5A 1XC3A 4H0XB 5B8HA 1ATNA 5AQJA 2P9IA 1YAGA 2FF3B 3GBTA 5JLHA 2P9IB 5JICA 2HF4A 4KBOA 2VWBA 3D2EA 3H3NO 4PKIA 1Z05A 4FWNA 4CZIA 4L3QA 3D2EB 1GLBG 2J4RA 2ZF5O 4MLEA 5AQZA 3A5OC 4B1YB 2D0OA 3DAWA 1TUUA 1X3MA 2QWQA 4IJNA 3RSEA 4BR7A 2I7NA 3RSEB 3VGLA 3EKSA 3FZFA 4JNEA 2CGLA 3MN9A 4BRCA 1DKGD 1LOTB 4BR4A 3VEYA 4AM7A 4GNIA 4YDUC 5BPLA 3ULEA 4EFHA 2GWKA 2QW9A 3ULEB 3WT0A 5LJWA 3I33A 1X3NA 1V4TA 3MDQA 1NMDA 3U9DA 4H0TB 4H0OA 1GLJO 2W41A 3WUHA 5EVZA 1P8ZA 1NBWA 2BTFA 3O80A 3O4WA 3WQUA 1OKJA 4FOIA 1MDUB 2CH5A 1QQNA 2H3GX 5FPDA 5E84A 2F9WA 1BO5O 5BRFA 4PKGA 2ASOA 3TPQA 5AQPA 1JCGA 4BRPA 3HSCA 3LM9A 3QICA 3R6MA 5AQKA 4FPAA 2ZGZA 5BRHA 1HX1A 2IVNA 4CZGA 3A5NC 4NB4A 1DEJA 3CIPA 4DQ8A 5I9EB 3C0BA 3AAQA 1T44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YI1A 3EYZA 4CK2A 3DI6A 1JLQA 4CGFA 1EKEA 3CJ9A 5F2RA 3V81A 4FWPA 3OA9A 1T7AA 1QVGM 4E7JA 1UGLA 1YVNA 4LSLA 4E1MA 4WFBL 4NXMK 2R7YA 3B6PA 4ZTJA 4HTUA 3CCQN 4Z94A 3KVGA 3HXMA 2E1YA 3CFRA 2N2RA 4AB0A 3LP1A 3HL8A 4IDKA 1Q18A 2SN3A 3VQ5A 2E2FA 5KGWA 3VGKA 2PAVA 4U7BA 2JLEA 1ASWA 4KI4A 4FWKA 4JLHA 5HOOA 4BRMA 2E2NA 3H08A 4KPYA 3BY5A 1WSHA 3VN5A 2WUSA 4BGAA 3O9RA 3DM2A 5AZIA 1NRBA 4FJGA 3AV9A 3I8BA 1HNVA 4OLAA 5EX5A 3D45A 3SJJA 2P9PB 5LJVA 5EU7A 4CZHA 1S1TA 2V51B 4RW7A 3L8BA 2HW3A 5F0XA 3AVKA 4DLEA 4Z4CA 4JKHA 3DXMA 1UAXA 2WBNA 5AQFA 4CJPA 4HWIA 1IKWA 3ULDA 4CF8A 1GLCG 3AO3A 4B08A 3KLIA 3ZT0A 3OW2M 1T6CA 2QWLA 4BQZA 2VQFK 1BMRA 3A8YA 4CJQA 4DV6K 3OVNA 4AHRA 1EWQA 4PUOA 3V9UA 2O8EA 1BQMA 4JD2A 1FH3A 1ITGA 5AQVA 2Z1HA 5C15A 4E0DA 1VQ6N 3FLCO 3QERA 3C6TA 2E1ZA 1NPIA 5C2DA 4PL7A 3VQ8A 3TARA 4FZZA 3VQCA 5AQYA 5LL6Z 4JI7K 3VF2A 1GLAG 4YOVA 4CGHA 2LJ7A 3QEWA 1RT2A 3RRHA 4CF1A 2O4IA 3MN7A 1KLMA 3ID8A 1ZBLA 1TAUA 2P9SB 5EXWA 2CH6A 1CLQA 2YNHA 4BC4A 1P00A 3L0QA 3MCAB 4CK3A 4BVPA 5M1KA 4DTMA 1NJWA 4NLCA 2QKKA 1RDDA 2KZMA 1OZZA 4RWTA 2Q1NA 1NKCA 1F21A 3S41A 3WXIA 3F9MA 3SK3A 4JRQA 1BIZA 4KHYA 1K8AO 3CERA 4DQRA 3RR7A 2P9UA 1YTAA 1S6QA 4FOEA 3TTCA 3TAQA 1CZAN 1IG8A 4C8NA 3A0IX 4DTRA 4Z4HA 4N76A 3V9ZA 1XUPO 5EY4A 4CEOA 4G1QA 2B3CA 4NO7A 3OYFA 3LDOA 3VOVA 1W7AA 2YHWA 3VQDA 3H3OB 4N5SA 4IFEA 3G10A 4B1ZA 1XNQK 5HROA 1ASUA 3SLCA 4B8AB 2K35A 4DSFA 5CE3A 3TAPA 2RN2A 3EL2A 1ATRA 4JHDB 2NRXA 1VHXA 4OPAA 2O8DA 4BRFA 4DV5K 4AH9A 3O9UA 4O8KA 4JI2K 1I2VA 3CF5L 1QVFM 2PYLA 4CZFA 4Q0BA 2BANA 1S72N 4ZHRA 2Y1JA 3I0RA 2KKZA 1BU6O 4H4MA 3FZLA 3FZMA 3VEOA 3QI7A 2BUPA 3WXKA 1T7EA 1KLNA 3DLKA 1GLFO 3SAFA 1OH5A 4AILC 4CF0A 3FZHA 2BH1A 3IS9A 3ZX2A 2A7TA 4W5NA 4FSVA 1RDCA 3LL3A 3LDQA 3I56N 5BRDA 1N32K 3SPZA 3QDKA 1JCFA 3MN5A 4FLUA 1YTUA 4FWLA 2KW4A 4DQPA 2WC9A 3D6RA 1EO1A 4DQIA 1NU0A 3SMSA 3D2FA 2QWRA 1DGKN 4QAGA 3CMAN 1HPMA 2ZM6K 3R9PA 1KAXA 1Q86O 5HLFA 3NMUA 3VF4A 1XMQK 3K5OA 4FJMA 2HHIA 3TSPA 5CZ1A 4DTPA 1Q9YA 2EWSA 3RWUA 3AVLA 3MXJA 5BREA 4CFDA 1KV0A 3T1HK 3THXA 1NGHA 2UUAK 1Q9XA 1VQON 4FZXC 5BPMA 3PV8A 4RW4A 4BACA 3QMLA 2YKNA 4MDBA 1X9JA 2QM1A 4KB0A 4B1VA 4FM1A 4EHTA 1DLOA 2HOEA 5AZJB 1TYQB 4RW9A 3MAQA 1KSPA 4M3TA 3PIPL 1XWLA 4BRAA 2AA4A 3W0LA 3LDLA 2N69A 3L2VA 3QINA 4BROA 3MEDA 5SWMA 4CJ3A 1E4FT 3VEWA 3CCJN 2HHVA 1WSFA 4R5PA 2LY6A 2YHYA 4PKHA 3SNNA 4XIUA 3IAYA 4GW6A 3WNEA 4MLHA 2O4GA 4CBUA 4LF8K 2VG5A 5J2NA 3BDPA 1BGXT 3GKUA 3LAMA 4ILHA 1HJRA 3OYLA 4WFAL 1NK8A 1RT5A 1U2VB 4YDUA 4CZMA 4ILGB 2V7ZA 4KH5A 2P9LB 4DR2K 4IEEA 1PTXA 3QEXA 1RGIA 4CBXA 4AF1A 3SV4A 1GOAA 1SL0A 2GL1A 3BZKA 1D8YA 4MO5A 3MWTA 5J1EA 1T03A 2A1RA 4M7XA 5C2FA 4YOYA 1CZ9A 4DHYA 3T7ZA 1YITN 3HBTA 3J80O 3A5MC 1GLEG 3KK7A 4O4GA 3KOWA 5KGXA 4WQ5C 1J53A 4N41A 1QZ6A 3CM5A 3U3YA 3MN6A 3O9TA 5HRNA 2HHXA 2YHXA 3JSMA 5AQJA 3HOTA 5JLHA 2RE2A 3SBTA 2P9IB 4KB1A 3THWB 4M3RA 4CZIA 3OBWA 3K5NA 4B3SK 1HYZA 3K0SA 3D2EB 2IS3A 3L2QA 3U6FA 2J4RA 4KREA 5AQZA 3RMBA 4DR6K 1GPTA 3KIOA 1WT7A 3EE9A 4JKGB 1D9FA 4C8OA 2EX3A 3AVAA 1QSSA 4O8UA 4IJNA 3CD6N 4FXDA 2XHBA 4JNEA 1QS4A 3MN9A 4X62K 4GKJK 1BIUA 3VEYA 2P5OA 2EHGA 1YF5L 3ULEA 3O3GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YI1 A;  3EYZ A;  4CK2 A;  3DI6 A;  1JLQ A;  4CGF A;  1EKE A;  3CJ9 A;  5F2R A;  3V81 A;  4FWP A;  3OA9 A;  1T7A A;  1QVG M;  4E7J A;  1UGL A;  1YVN A;  4LSL A;  4E1M A;  4WFB L;  4NXM K;  2R7Y A;  3B6P A;  4ZTJ A;  4HTU A;  3CCQ N;  4Z94 A;  3KVG A;  3HXM A;  2E1Y A;  3CFR A;  2N2R A;  4AB0 A;  3LP1 A;  3HL8 A;  4IDK A;  1Q18 A;  2SN3 A;  3VQ5 A;  2E2F A;  5KGW A;  3VGK A;  2PAV A;  4U7B A;  2JLE A;  1ASW A;  4KI4 A;  4FWK A;  4JLH A;  5HOO A;  4BRM A;  2E2N A;  3H08 A;  4KPY A;  3BY5 A;  1WSH A;  3VN5 A;  2WUS A;  4BGA A;  3O9R A;  3DM2 A;  5AZI A;  1NRB A;  4FJG A;  3AV9 A;  3I8B A;  1HNV A;  4OLA A;  5EX5 A;  3D45 A;  3SJJ A;  2P9P B;  5LJV A;  5EU7 A;  4CZH A;  1S1T A;  2V51 B;  4RW7 A;  3L8B A;  2HW3 A;  5F0X A;  3AVK A;  4DLE A;  4Z4C A;  4JKH A;  3DXM A;  1UAX A;  2WBN A;  5AQF A;  4CJP A;  4HWI A;  1IKW A;  3ULD A;  4CF8 A;  1GLC G;  3AO3 A;  4B08 A;  3KLI A;  3ZT0 A;  3OW2 M;  1T6C A;  2QWL A;  4BQZ A;  2VQF K;  1BMR A;  3A8Y A;  4CJQ A;  4DV6 K;  3OVN A;  4AHR A;  1EWQ A;  4PUO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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