1H1VA

Gelsolin g4-g6/actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
368
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Calcium Activation of Gelsolin:Insights from the 3A Structure of the G4-G6/Actin Complex
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Actin-binding
molecule keywords ACTIN
total genus 113
structure length 368
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1h1vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1h1vA04
1SAZA 1HJOA 2A40A 5AQYA 1WUAA 3W0LA 4B1UB 2ASOA 3HTVA 2D0OA 4BRCA 5EY4A 5EX5A 3UKUA 2WUSA 5AQKA 5AQLA 1NM1A 2F9TA 2E8AA 2GELA 4BRPA 3LDPA 2P9PB 1J6ZA 4FSVA 3I8BA 1S3XA 3FFKB 3SMSA 5EVZA 1HKCA 4IJNA 2P9SA 3HM8A 4K25A 1P8ZA 4H0TB 2HF3A 1DGKN 3CI5A 3ZETB 3VF4A 2VCPA 2H3GX 4B1ZA 3H1VX 1LOTB 3M6GA 4CZJA 4Z94A 4H0XB 4XH4A 3AAPA 3O4WA 3LDLA 4PL7A 1BO5O 4ISFA 1ATNA 3O1BA 4BROA 2FSJA 4FPBA 4BRQA 3ENOA 3HBTA 1Y64A 3ZX0A 2VYPA 3C7NA 1NGEA 4CZMA 2P9UB 1JCEA 4CD1A 1GLAG 2P9LA 5KPTA 4C23A 5KPRA 2ZWHA 4BR0A 4K42A 3M3ZA 5LJWA 3QB0A 5F0XA 1Q18A 1BDGA 2QWLA 3FR0A 3AAQA 1ESVA 2QWOA 4MO4A 2IVNA 1T6CA 3LL3A 4BQZA 1U2VB 3SJHA 4F9OA 2DPNA 3JS6A 5BN9A 3LDOA 1TYQB 4CZHA 4CD3A 3SK3A 1GLEG 1XUPO 2W40A 2CH6A 3RSEA 3L6QA 3WXIA 1GLLO 4JHDA 2QWNA 2E88A 1YXQA 4CBWA 1BOTO 1GLCG 4EHTA 4QS8A 1GLJO 1GLBG 4AM6A 1K8KA 2ZF5O 1R59O 3MN6A 3QMLA 2P9UA 3VETA 1ATRA 2IVPA 1DKGD 1QZ6A 2FXUA 1LCUA 5JLFA 5AR0A 4H5WA 3BF3A 3O08A 4MLEA 2YCHA 2QWPA 4FWOA 2UYTA 4BR2A 4E1JA 2PAVA 2PBDA 3GDQA 3R6MA 3ID8A 4BRMA 2HMPA 3DXMA 3VEXA 4BRNA 5JMVA 5AQJA 5EXWA 4HTLA 4XH5A 4CZFA 3O5BA 3FZLA 1MDUB 4O5FA 4ISEA 3U8XA 3VF2A 4GY2B 2P9KA 3WEEB 3BP8A 4WYBA 3UB5A 1X9JA 5E26A 4CI6A 3O1WA 2IVOA 1S22A 1X3MA 1NGGA 4FO0A 2A41A 4A62A 2QWQA 4IO8A 4A2BA 3H3OB 4CBXA 3CJBA 1Z05A 3MK6A 4BQLA 1IJJA 3IFRA 5JLHA 1RDWX 4J8FA 2ZGYA 1MWMA 2GUPA 2NRHA 4EIAA 5AZJA 1TUYA 3D2EA 2AA4A 4DQ8A 3CETA 5AQSA 4XH1A 4DB3A 1NMDA 1ZBSA 4CZEA 1BUPA 1WOQA 3H1QA 2FSNA 1RGIA 3FZHA 2E2NA 4IJAA 3M1FA 1NGFA 5BREA 1E4FT 3ULEA 4BVOA 3GBTA 1NGDA 3A5OC 3WUHA 3U4LA 4RWTA 2IIRA 4I6MA 3WQTA 1SZ2A 1T6DA 1V4TA 4FWQA 4PKIA 3AARA 5AQWA 3UKUB 5BRHA 3VEWA 4BC2A 3FZMA 5ELZA 5AQRA 3CHWA 3CJCA 3EO3A 4H0VB 3KZBA 1JCGA 1X3NA 1HLUA 2D0PA 4L3QA 3DXKA 3GL1A 4QS7A 4FOIA 1YAGA 3QICA 3CERA 4CZIA 5BRFA 1OKJA 1ATSA 2ZGZA 2FF6A 4YDUA 4BR7A 4BRHA 3D2EB 3QDKA 5AQVA 1MWKA 3IUCA 3VOVA 3OHRA 4IWVA 3CJ7A 3LDNA 5AZIA 4DHYA 3ZEUA 3GE1A 3SMPA 2AP1A 4FPAA 3O80A 4BR5A 3WT0A 2YI1A 2F9WA 3VEZA 2Q0UA 3BF1A 1KAZA 4NO7A 3MMVA 3IMXA 2D1KA 1NGAA 3TPQA 4FWRA 4H5NA 4JD2B 3VERA 2Q97A 4FWLA 4WQ5C 4BR9A 3DAWA 3KHYA 2W41A 2J4RA 3A0IX 4BVPA 3CJ1A 4FWPA 2HOEA 3VEYA 2A5XA 5AQUA 2E2PA 2YHWA 5AQFA 2EWSA 4JHDB 3ATUA 2D4WA 4BRGA 1KAYA 1NWKA 4FWNA 4AM7A 5BPLA 4FL9A 4BC5A 2YJEA 4FWSA 4BR4A 3L0QA 3R9PA 4BRKA 1Z6RA 4CZKA 5BPMA 3LM2A 3SLCA 2A6AA 1DEJA 1T44A 2NZTA 3J8AA 2YHYA 3EKUA 5EOYA 4H0YB 3U9ZA 2QW9A 2P9IB 4BC3A 2I7NA 4PKGA 4B1XB 3ZEUB 4GNIA 5AQNA 4BGAA 1YUWA 4XEIA 2BTFA 2FSKA 3H3NO 1C0GA 3EZWA 2QWRA 4WQ4A 3RSEB 3VF6A 2P9LB 5CE3A 3DJCA 3I33A 2ASPA 2GWKA 4CZLA 1KAXA 2FF3B 4BGBA 1XQSC 3CJAA 4HWIA 5AFUH 5AQMA 4FWKA 3UE5A 3HZ6A 3P4IA 3VGKA 5FPEA 3EL2A 3VGMA 3FE1A 3WEEA 1NGIA 1MA9B 1ZC6A 4K43A 3WXLA 4Y0WA 5AFUA 4B9QA 3ULEB 3FZFA 2Q36A 3QFUA 1TYQA 3QBXA 3WXKA 3GOIA 3A5MC 2Q31A 2CH5A 4M63C 2VWBA 4MLHA 4B1VA 3A5NC 1U6ZA 4B1WB 1HX1A 5I9EB 2YHXA 3JXUA 4ISGA 1BA1A 4A61A 1K8KB 5AQOA 4BG9A 5ADXH 3ZX2A 4CZGA 4K41A 5AZJB 2E1YA 1GLFO 1QZ5A 3VPZA 1QQOA 3FGUA 4CJ7A 3ZX3A 5B8HA 5ADXA 4IZ9A 4JD2A 5LY3A 1BA0A 5AQZA 3GG4A 4PKHA 2A42A 1BU6O 5KQ8A 5BR9A 4DCHA 2QWMA 3IDHA 3MDQA 1U2VA 2V52B 4EFHA 1KXPA 4WQ4C 4BRDA 4JNEA 5AQXA 4M7YA 2V51B 3R8EA 3MN7A 4BRLA 2Q2RA 2P9NA 3A5LC 3HSCA 4H0PA 2V7ZA 3LDQA 2E2OA 5KPZA 1NGJA 3ENHA 4PL8A 3KVGA 4BRFA 1H1VA 2NLXA 2ASMA 1TUUA 4FOEA 4H5RA 3VENA 4RCHA 5TKYA 3D7EO 1XC3A 4MO5A 3AY9A 2GEMA 2CGLA 3FZKA 5FPNA 5FPMA 3WQUA 4CBUA 4B1YB 2BUPA 2P9KB 1SQKA 4O8KA 4H5VA 3CIPA 3H6EA 3BUZB 3D2FA 3LM9A 1CZAN 2GWJA 3VESA 4BC4A 1IG8A 5F1XA 4A2AA 5BPNA 1NGHA 1RFQA 4JN4A 2I7PA 1BG3A 4M7XA 3FLCO 4YDUC 2E1ZA 1QQNA 3L4IA 1HKBA 3DXMB 1HUXA 1HPMA 1NLVA 4BG8A 1NGCA 1QQMA 1JCFA 2P9NB 2YJFA 4H5TA 5LJVA 5F2RA 1NGBA 3B8AX 3O8MA 3CQYA 3ZETA 2Q1NA 2ITMA 3CJ9A 3H45C 2E20A 5AQHA 5BN8A 3DXKB 1GLDG 3EKSA 3WXJA 3G25A 2OANA 3QFPA 5AQPA 3MN5A 3H46O 1YVNA 3TU5A 2QXLA 3VEVA 5BRDA 3U9DA 1BWFO 1D4XA 1ZXOA 5JICA 4NB4A 5AZIB 4I6MB 3ATVA 3C0BA 3C7NB 2V7YA 4RTFD 3F9MA 4EAHD 2A3ZA 2CGJA 3CQXA 2P9PA 4FWMA 1NBWA 3D2FB 5FPDA 2P9IA 4H0OA 4WQ5A 1C0FA 4H03B 4JAXA 4IXCA 4EHUA 2Q0RA 3UKRA 1V4SA 2KHOA 2P9SB 2HF4A 3DWLA 4LC9B 3BEXA 4BREA 3QBWA 2CGKA 5AQIA 1HKGA 1E4GT 5E84A 5AQGA 3S41A 5AQQA 3HI0A 5KQDA 1EQYA 1QHAA 4KBOA 3VEOA 3VGLA 3O6WA 3UKRB 3W3DA 2E2QA 2GTDA 3A8YA 2FLOA 3MN9A 4QS9A 1G99A 4BRIA 5AQTA 3MCPA 4BRAA 3EN9A 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S9GA 1W2BM 4N76A 3O4NA 4YOTA 3UKUA 5GAGP 1RTHA 4ID5A 1J6ZA 5CZ2A 3I8BA 3TSQA 3FFKB 3SMSA 5EVZA 5J1EA 4IJNA 2QK9A 4DLGA 3IG1A 1P8ZA 4IG3A 4HVJA 4JI6K 1DGKN 3VF4A 2VCPA 3CCQN 2D0BA 4FZYA 4Z94A 1TKDA 1D5AA 1Q9YA 3OYKA 3O1BA 4JKEA 1RDAA 4BRQA 3HBTA 1LWFA 4DTOA 1JL2A 4LD0A 3C7NA 4IBNA 4GV3A 2D0CA 1NK9A 5SZTA 4CJ5A 4HHTA 4M41A 4OLAA 5LJWA 4GV6A 3K57A 1Q18A 1BDGA 3L2RA 4K0KK 4IG0A 4Z0UA 3AO4A 3EE9A 4FLYA 2UUBK 3L2QA 3LL3A 2YNIA 1TK5A 4BQZA 1U2VB 3S5TA 1RCHA 1WLJA 3THXB 3SJHA 3K58A 4F9OA 4FJHA 1VQ4N 2DPNA 4JS4A 4F2SA 4CZHA 3QNNA 1XUPO 3I0SA 1NKBA 1VQ9N 3WXIA 1U47A 1J5EK 2QWNA 2E88A 1YXQA 1QSYA 5HRRA 4CJSA 2RE2A 1SS6A 4QS8A 4DTJA 2ZF5O 3CFRA 3CCVN 3ID6A 1C1AA 1ATRA 2IVPA 2ZE2A 3MCAB 2Y1JA 3O9RA 2QWPA 1JL1A 4FWOA 4AHRA 4E1JA 3HO1A 2XRIA 2PBDA 2NRTA 3E9LA 4BRMA 3DXMA 5J2PA 4JLHA 4KO0A 1QSSA 5AQJA 2PFUA 5EXWA 1DTQA 3ZSZA 3FZLA 1MDUB 1VQ8N 3HK2A 3NF6A 5C0YA 4WYBA 3MXJA 4CI6A 2HBJA 1A5XA 1S22A 1X3MA 1HYZA 3DLHA 4FO0A 3O3GA 4M3WA 1EO1A 3LPTA 2QWQA 4A62A 2KKZA 4A2BA 2WTUA 1NK7A 4KHPK 1U04A 4JRQA 3K9KA 3NF9A 1Z05A 1VQMN 1SL0A 1WAFA 1IO2A 4LSNA 4B08A 3OYCA 1RDWX 4I9QA 1KVCA 1GOCA 1VK0A 5CR4A 4XIUA 1TUYA 2RF2A 4CHQA 4DQ8A 5AQSA 2FBTA 1J5OA 4DB3A 2YHAA 1OH7A 1WOQA 3H1QA 4JV5K 4YOXA 3L2WA 2VGNA 2G8UA 2F4VK 1WSEA 4CE9A 1SV5A 5BREA 3CPWM 4CIGA 1E4FT 3T1HK 3ZSVA 4BVOA 4H8KA 3S3NA 3NH0A 4CEOA 3LWLA 1YVUA 4DV7K 3A5OC 3U4LA 4I6MA 1S6QA 1WNSA 4QAGA 3VEWA 3ITHA 1L3TA 5GAEP 3AA2A 1JLBA 3J7AP 1JCGA 4M3TA 3THWA 5KGXA 4RW4A 3OYHA 3RWUA 3SBTA 4KKOA 3CERA 4CZIA 5BRFA 1C1BA 4GKJK 3G0ZA 2FF6A 4BR7A 4BE2A 3B6OA 4BRHA 1VSIA 4OJRA 5HP1A 4R79A 4FJIA 4CGIA 3O9QA 3O80A 1YJ9N 4FW2A 5LL6Z 4CEEA 4NO7A 1VQPN 4DF8A 3TPQA 4A5BA 3TR8A 4FWRA 1EP4A 2Q3SA 2Q97A 4CERA 4FJLA 3CMEN 2W41A 1DTTA 4BVPA 4JKGB 3CJ1A 3LP2A 5LMNK 3VEYA 2E2PA 3ATUA 3VA3A 1LAVA 3U6FA 4BRGA 2HSTA 4OPAA 4FWNA 3ZSOA 1A5VA 5BPLA 4FWSA 1A5WA 1JJ2M 3IS9A 4Y1CA 3I56N 3AVBA 4NYFA 5C15A 1T44A 2NZTA 3J8AA 2HHVA 2VG7A 4H0YB 4KH5A 1CXUA 2P9IB 5AJ3K 3HRGA 4AILC 2KW4A 4GNIA 4BGAA 1YUWA 3H3NO 2G8IA 3DLEA 4N5SA 4J2EA 4KHNA 3CCRN 4M3RA 5HL7L 2P9LB 4DG1A 3I33A 4BDYA 2GWKA 3AV9A 4M3UA 1W9HA 1KC8O 4FYDA 5AQMA 1I3AA 4O8UA 3HZ6A 3VGKA 2XY8A 2OPQA 1NGIA 1MA9B 1ZC6A 4Y0WA 1BGXT 5FDLA 3FZFA 3QIOA 5JS1A 1CXQA 3MECA 4ILGB 3L3UA 3KD5E 5I9EB 3DLKA 3JXUA 3CCEN 2ZJRL 1HNXK 4FJ8A 1G15A 3CYMA 3ZSRA 2X74A 3D0PA 4FCYA 4YNQA 3SQ2A 2HHQA 2E1YA 4E19A 4Q5VA 3VPZA 2HW3A 2GX9A 4CJ7A 3ZX3A 4AHVA 3IRXA 4JD2A 3L2UA 4AHUA 4NCAA 3MAQA 4FJXA 2DFFA 5KQ8A 1QVGM 5C25A 4DQRA 4BRDA 3R8EA 2I5JA 2Q2RA 4BRLA 4DSFA 1S1VA 3KKRA 4KB0A 1RNHA 4DS4A 3LDQA 3P39A 2O8FA 4DV5K 1H1VA 2E6LA 5CYQA 4KRFA 3KJVA 2ASMA 5HRPA 3RRGA 3VENA 2ZD1A 3D7EO 1XC3A 4MO5A 4Y1DA 2CGLA 5FPNA 1SQKA 4KB1A 3BUZB 4B3SK 1HYSA 3D2FA 2GWJA 1VSFA 3ZT1A 3PLAA 5F1XA 3EY1A 5BPNA 1TAUA 3F73A 2HBKA 3LWMA 2I7PA 1BG3A 2OPRA 4RW8A 4BWMA 3CF5L 5CYMA 3FLCO 2ZQBA 2E1ZA 1IKXA 4PUOA 3WNEA 1L3VA 4FJGA 3CCJN 4O55A 3QIPA 1HPMA 4CJ4A 5CZ1A 4BG8A 2P9NB 1QQMA 4H5TA 4IFEA 4ID1A 3V9SA 5F2RA 3I0RA 1FK9A 3CQYA 4F2RA 1NOZA 4BY9C 3SUOA 2Z1JA 2Q1NA 3M8RA 4GW6A 4DV2K 1GLDG 3EKSA 3WXJA 4W5QA 3G25A 2FBYA 4DS5A 3IAYA 4E7KA 3K59A 4B9VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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