1H1VA

Gelsolin g4-g6/actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
368
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title The Calcium Activation of Gelsolin:Insights from the 3A Structure of the G4-G6/Actin Complex
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Actin-binding
total genus 113
structure length 368
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1h1vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1h1vA04
3L6QA 3CJAA 4ISEA 4J8FA 5F1XA 2QM1A 3VERA 3O4WA 2E2QA 3HM8A 1GLAG 2CGJA 2QXLA 3HBTA 4FOEA 1BDGA 3RSEA 4CZJA 3J8AA 3ZX0A 3MDQA 1GLDG 2QWOA 3RSEB 3FR0A 3JS6A 1NMDA 3O1WA 4H0TB 3D2FA 3H3NO 2V7ZA 3LDPA 4WQ4C 2ITMA 3WXJA 3A5NC 1ZBSA 3WXKA 2DPNA 4FWRA 3DAWA 5AQNA 3D2FB 4FSVA 4JHDA 2YCHA 1ZC6A 4CZGA 4CZHA 1BU6O 4FWPA 3CETA 5BRDA 4BRHA 1HPMA 4EAHD 3W3DA 4JHDB 3JXUA 2E2OA 4WQ4A 3EL2A 4BRLA 4BG8A 5EXWA 2Q31A 3GBTA 4FWNA 4H5TA 3DXMA 1NGFA 3A0IX 5KQ8A 4K42A 2IVNA 5E26A 3EO3A 3ATVA 3HSCA 1BOTO 3O1BA 1P8ZA 4JAXA 3DXMB 1ATSA 3GG4A 3FZFA 1WUAA 3WQUA 1ESVA 4IWVA 1BO5O 3OHRA 4YDUA 4EIAA 3DXKA 3CJ1A 5AR0A 5BPLA 3ZX2A 4H0VB 3ZEUA 4FO0A 4H5VA 4B1XB 1V4SA 4BQLA 1RFQA 1GLJO 4DCHA 4FWMA 3DXKB 4CD1A 2HF3A 2V51B 3ZEUB 4MO5A 4IJAA 3FGUA 2IIRA 4CZMA 3CJ7A 1QQMA 4GY2B 3VF4A 3P4IA 1X3MA 2VYPA 3DWLA 3EZWA 1GLBG 2A3ZA 1KAYA 4H03B 3H3OB 3UB5A 2F9TA 4GNIA 3IDHA 5BR9A 1SQKA 2ZGYA 5AQGA 5FPMA 4JD2A 5ELZA 5AQKA 5BREA 4BRPA 1NGBA 3CJBA 3VOVA 2QWLA 3S41A 4JD2B 4FWQA 5AQZA 3VEZA 3B8AX 1QZ5A 5LJWA 2A6AA 3HI0A 4MLEA 4XH1A 4BR4A 5ADXH 4K25A 1BA1A 2P9IA 3FZKA 5KQDA 5AQHA 4CZKA 4M7YA 2P9IB 4B1UB 4BVOA 4BVPA 1NGIA 5AQWA 3SK3A 3LDLA 5AQJA 1LCUA 3D2EA 1NGEA 1NGGA 2YI1A 4WYBA 2P9NB 1YXQA 4C23A 1CZAN 3VEVA 4IJNA 5ADXA 3D2EB 4BQZA 4BRIA 1DEJA 4BRCA 3M3ZA 5FPNA 3FZMA 3VGKA 1H1VA 3WXIA 5KPZA 3GE1A 4EHUA 3FE1A 1Z05A 5AQXA 1NLVA 4EFHA 3AY9A 4EHTA 2H3GX 1T6CA 2YHYA 3IFRA 5BN9A 4QS7A 5AQVA 5AQUA 4O8KA 1BWFO 2D4WA 4CZFA 1EQYA 2GELA 4MO4A 5AQMA 2GTDA 2QWNA 3I33A 1JCEA 3O8MA 2F9WA 2I7PA 1QZ6A 4FWSA 3ENOA 3WQTA 5BN8A 2YHWA 5KPTA 3C0BA 5EVZA 3FFKB 3CERA 3R9PA 2W41A 5AQSA 3ID8A 4DQ8A 5EOYA 1ATRA 1U6ZA 5EX5A 1GLLO 1GLCG 3AAPA 4MLHA 3H1VX 1BG3A 5JMVA 3D7EO 5AQYA 4JNEA 4CZLA 4XEIA 3H6EA 2ASOA 5AQTA 1RGIA 2HF4A 3ZX3A 3O6WA 4BROA 5BRFA 4BRGA 3A8YA 3LM2A 4H0OA 1E4GT 3GOIA 3KHYA 1MDUB 3CHWA 3CQXA 4H5NA 1IG8A 1K8KA 4PL7A 3CJCA 5AQRA 4BRFA 4DHYA 4BC5A 3VEXA 2A41A 2CH6A 3U8XA 1J6ZA 4HTLA 4CBXA 3ATUA 2A40A 1T6DA 4M7XA 2P9KA 3CIPA 2P9UA 2V7YA 1R59O 5FPDA 3A5LC 3O80A 1ZXOA 2P9KB 4XH5A 2P9UB 2E2NA 1D4XA 3I8BA 3SJHA 3MN7A 4FL9A 1X3NA 1YAGA 1GLEG 1S3XA 4FOIA 1G99A 2NZTA 4NB4A 3SMPA 1JCGA 3VF2A 2FXUA 5I9EB 3L0QA 2FF6A 4BR9A 2QWMA 3AARA 2NLXA 1HX1A 4BRNA 4XH4A 3IMXA 3QFPA 2AA4A 5LJVA 2Q97A 1YVNA 3QBWA 1XQSC 4NO7A 3VETA 4AM6A 2FLOA 2ASPA 3C7NA 3MK6A 4CJ7A 3SLCA 2E8AA 2VCPA 3BF3A 3FZLA 3C7NB 5AQQA 4LC9B 3MMVA 4CD3A 3O08A 5E84A 2FSJA 2D0OA 4KBOA 2OANA 3EN9A 1QQNA 1SZ2A 4QS9A 3UKRA 3VESA 4DB3A 1IJJA 2CGLA 4FPAA 5AZIA 4L3QA 3UE5A 4E1JA 3O5BA 4F9OA 3VGMA 4BRAA 1BA0A 4RTFD 4IZ9A 3MN6A 3UKUA 2Q36A 4Y0WA 2YJFA 3ULEA 3M1FA 2I7NA 3WT0A 3UKUB 5BPMA 3LL3A 1V4TA 1KAXA 2E88A 3ULEB 5TKYA 3H45C 2ZF5O 3R8EA 5BRHA 1NM1A 1GLFO 2KHOA 5B8HA 1NBWA 2PAVA 3CQYA 4B9QA 5KPRA 4PL8A 4BGBA 4A62A 3QB0A 3EKUA 3MN9A 4BR7A 5AQPA 4BC2A 4H5RA 1NGAA 3SMSA 2QWRA 4BREA 4K41A 3KVGA 4CZIA 3WEEA 5CE3A 3H1QA 1TYQA 3GDQA 3HTVA 1MWKA 3WEEB 4B1ZA 3CI5A 2YHXA 3BF1A 4BR5A 1TYQB 2W40A 2GEMA 3QICA 3TU5A 2ZGZA 1RDWX 1MWMA 1XUPO 4RCHA 1NGHA 3QFUA 3BEXA 1HJOA 3VPZA 1DKGD 5JLFA 1C0GA 2BUPA 4QS8A 4A2BA 1XC3A 4H0XB 2E1YA 2HMPA 2A42A 2E20A 2WUSA 3DJCA 4BRKA 4HWIA 1T44A 2AP1A 5LY3A 4ISFA 4Z94A 4A2AA 2GWJA 3LDNA 2ZWHA 3ZETA 4BRDA 2P9LA 3F9MA 5AQOA 4A61A 1ATNA 3M6GA 2GUPA 2Q0RA 3MCPA 4H0YB 1NGDA 5AQFA 4BRQA 3ZETB 4CI6A 3BUZB 2P9LB 4H5WA 5JICA 2PBDA 2J4RA 2QW9A 1HLUA 2GWKA 5F0XA 3FZHA 4FWOA 1K8KB 3QBXA 4BR0A 4BR2A 1QQOA 5AQIA 5AFUH 1OKJA 4PKHA 2Q2RA 4AM7A 3CJ9A 4M63C 1JCFA 2QWQA 4YDUC 4CZEA 4ISGA 1TUYA 1HUXA 1HKBA 3GL1A 5AFUA 4B1YB 2UYTA 2D0PA 3A5OC 4BC3A 1NGJA 2P9SA 4B1VA 2IVOA 5BPNA 2FSKA 4BGAA 1U2VA 2P9SB 1C0FA 1DGKN 2BTFA 1U2VB 4IO8A 4B1WB 1BUPA 3LDOA 1QHAA 4PKGA 4CBUA 4K43A 3L4IA 4FPBA 3AAQA 3VF6A 4PKIA 4JN4A 3WXLA 1NGCA 3VEWA 2NRHA 2CH5A 3ENHA 1SAZA 3LDQA 2E1ZA 3WUHA 2A5XA 1S22A 2P9PA 1KAZA 1Z6RA 1HKCA 2QWPA 3UKRB 1YUWA 5AZIB 4BG9A 5JLHA 2P9PB 2ASMA 5EY4A 2YJEA 4CBWA 3MN5A 2Q1NA 3U9DA 4BRMA 4RWTA 1Q18A 1WOQA 4H0PA 4IXCA 1HKGA 2VWBA 1E4FT 3H46O 1KXPA 5AZJA 3VEOA 2EWSA 1TUUA 3R6MA 3A5MC 3FLCO 2V52B 1LOTB 2Q0UA 3BP8A 4WQ5C 5AZJB 2CGKA 2FSNA 2P9NA 3U9ZA 4FWLA 4FWKA 2FF3B 3HZ6A 1MA9B 3EKSA 4WQ5A 3IUCA 3W0LA 3VGLA 3VENA 3G25A 3VEYA 3LM9A 3QDKA 2E2PA 4O5FA 5F2RA 1NWKA 3QMLA 5FPEA 3TPQA 4BC4A 4I6MA 2IVPA 5AQLA 2D1KA 2HOEA 1X9JA 3KZBA 4I6MB 3U4LA 1Y64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJAA 2YNFA 1NJYA 5F1XA 1A5VA 2QM1A 3SPZA 1VQ6N 1HNIA 1GLAG 3VQPA 4BEBA 3NGYA 3RSEA 1XHXA 3CPWM 3ZX0A 1WSJA 2HBJA 2G8VA 1GLDG 3FR0A 4IDHA 1QTMA 3JS6A 3SAGA 1I94K 1WBBA 1IBKK 3D2FA 4WQ4C 3AVHA 3WXJA 2IC3A 3LP1A 4W5QA 3TSUA 4FWRA 3TTDA 4M3WA 1KD1O 1JKHA 2UXDK 1TKXA 2YCHA 3ZSVA 1REVA 1KQSM 1L3TA 1IKWA 4DQIA 3W3DA 5HL7L 4YOTA 2FBYA 3EL2A 4BG8A 2RPIA 4FJIA 4JV5K 2G8UA 4H5TA 3OYJA 2HW3A 3HSCA 5TKWA 4JKAA 2G8HA 3SQ4A 3DLGA 1WUAA 4LSLA 4PWDA 1QQCA 3K59A 2WOMA 5AR0A 1FKPA 3ZX2A 1VQON 4H5VA 4BQLA 4V19S 1RFQA 5LMNK 3HK2A 3RVCA 3PV8A 2HF3A 3ZEUB 3SNNA 1HRHA 4DTJA 1QQMA 1QE1A 1B9FA 3R1XA 3P4IA 4FJHA 2VYPA 3EZWA 2D5RA 2KFNA 1KAYA 4H03B 3EEQA 2F9TA 4GNIA 4DTNA 4DTPA 4UY8O 1VQLN 4KAZA 2ZM6K 4DU3A 5CR4A 3SAHA 1VSLA 4HTUA 2PZSA 4YORA 1IV0A 3B6OA 5BREA 3QLHA 3VOVA 4JD2B 2HMIA 4DLGA 1EXQA 1X9WA 2A6AA 3CCJN 3HI0A 1U04A 1YJ9N 4LFAK 4K25A 4FK4A 3FZKA 5C12A 4BVPA 1NGIA 3SK3A 3LDLA 4WFNL 1X9SA 1B9DA 1T03A 4C23A 3DLKA 3VEVA 4IJNA 3QIPA 4JLHA 3K5MA 4BRIA 2I5JA 1DEJA 5DM7L 5FPNA 3KK2A 2HBKA 3L4QA 1Z05A 3J7AP 1NLVA 3M5RA 1RDBA 1NJIO 2YHYA 4ILJA 5BN9A 1WLJA 4O8KA 1BWFO 2HNYA 1VSEA 3S9HA 4C8NA 4MDAA 1EQYA 1IKXA 2GELA 1I3AA 2QWNA 3I33A 3KIOA 2DTUA 2F9WA 1QZ6A 3ENOA 1NJZA 4TSXA 5T7BA 5H1SQ 4JI3K 1QSSA 5KPTA 4WF9L 3E1YA 5EVZA 3FFKB 2X78A 3R9PA 4IKFA 4FLXA 2W41A 4CF8A 3T69A 4NXMK 5CZ1A 2UXCK 1CXUA 3M8SA 1GLLO 4MLHA 3AVGA 4ELTA 1BG3A 1F21A 5AQYA 3PUFA 2ASOA 5AQTA 1Y97A 1TVRA 3BY5A 2HF4A 3E9OA 4KTZA 3KHYA 3CQXA 4H5NA 5E41A 3LP0A 2WFBA 1C1CA 4KTWA 1GOBA 4JKCA 3ZT0A 4DHYA 3I56N 1HQEA 1EP4A 2CH6A 3ISNC 1QSLA 1EETA 1T6DA 3WNEA 3CIPA 2P9UA 3A5LC 3PSFA 1J5OA 4LF4K 5GINA 4GW6A 3I8BA 3SJHA 1HNVA 2QK9A 4FL9A 1YAGA 3LWMA 1ZBUA 1TAUA 3L0QA 3AARA 4GMJB 3HOTA 1S1TA 1NK0A 1K9MO 2GUIA 4BRNA 4C8OA 2O8CB 2Q97A 4C1NI 4DTUA 3VETA 4AM6A 2FLOA 3MK6A 4AQYK 1RCHA 4C8KA 4CEZA 2E8AA 2VQEK 3PIOL 3BF3A 3FZLA 5AQQA 5J2QA 1DLOA 3CCLN 2BANA 4CIEA 3UIQA 1SZ2A 1IJJA 2CGLA 4FPAA 4LFBK 3TABA 4E1JA 3KLEA 3DLBA 2HBMA 4CJTA 1BA0A 5GIOA 2Q36A 3DRPA 4Y0WA 1YITN 4CEBA 4L8RB 3ULEA 3B6PA 3NHGA 3UKUB 2JWLA 4DFMA 3LL3A 1KAXA 4CCHA 2WONA 5C24A 4B3OA 2ZJRL 4KHWA 2YNIA 5B8HA 3KWGA 3K0SA 4DU1A 3TAMA 2B4JA 4PL8A 4OPJA 3EKUA 1RDAA 3MN9A 4CJ5A 1NGAA 1YT3A 4OLAA 2QWRA 4BREA 5GAHP 3QEXA 3AO3A 1XWLA 1WB9A 4E7KA 1BCOA 2O8BB 5KRTA 1JLQA 3CI5A 5SWMA 2YHXA 3MECA 1VK0A 1TYQB 3QICA 1NKEA 3TU5A 2ZGZA 3ZSRA 3BEXA 1XC3A 3T1HK 1YTAA 2A42A 4MQ3A 4BRKA 2HHQA 4HWIA 4CECA 4K8XA 4BECA 4DV7K 4FLVA 4IFVA 4BRDA 1YI2N 2P9LA 3F9MA 1KLMA 1VSJA 4M3YA 2WBNA 4H0YB 4CI6A 1T3VA 2J4RA 3NF6A 1FKOA 1ZBHA 1HLUA 2VG5A 4M42A 3K9JA 4CFBA 3U6FA 3K5OA 4FZZA 4YOYA 3SQ2A 4ILHA 3CJ9A 3LZIA 3OYIA 4AHTA 3CFPA 1WSGA 4CJQA 1JCFA 3F73A 1O13A 3KLFA 3AO2A 4JI7K 3QEIA 3OYEA 4ID1A 4BE7B 4O4GA 3GL1A 4C8MA 4B1YB 2D0PA 4EP5A 3OYNA 4JRQA 2P9SA 4H8KA 5GADP 1ZBLA 2IVOA 2NNWA 4LD0A 4OPAA 4DV0K 3VQEA 3Q7CA 4KO0A 4FJGA 4U7BA 4B1WB 4BE1A 2OPQA 3MXMA 3E66A 5DMRA 1BHLA 4K43A 4FPBA 4PKIA 4IG0A 1LWFA 3S3OA 4JN4A 3DYAA 3IKMA 4OKEA 3WXLA 3SI6A 3ENHA 2NRTA 3DRRA 4FLWA 1SAZA 3AVBA 2E1ZA 3MX5A 3WUHA 4E0DA 3DLHA 1S22A 3T7ZA 1HKCA 1RDUA 4HUFA 3G4SN 4W5NA 3L8BA 4BG9A 2ASMA 2YJEA 3AGRA 4AHSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3VQ7 A;  1WAJ A;  1DGK N;  1BIU A;  4N5S A;  3OY9 A;  4GKK K;  4HHT A;  2BTF A;  1U2V B;  1W2B M;  4LF9 K;  1BGX T;  1BUP A;  4CBU A;  3QO9 A;  2RF2 A;  1HNZ K;  4GV3 A;  4DR7 K;  3AAQ A;  3VF6 A;  4IO9 L;  4CJF A;  4DQS A;  2G8F A;  2E6L A;  4FJL A;  4E19 A;  4W5O A;  2NRH A;  1N8R O;  4FLT A;  4KHP K;  2A5X A;  1KAZ A;  1Z6R A;  2QWP A;  3UKR B;  1YUW A;  1NMN A;  3VA0 A;  4CBW A;  2IGI A;  2NUB A;  3RRG A;  3U9D A;  4KRE A;  4CJ3 A;  2KW4 A;  2FBV A;  3HPH A;  4IXC A;  4B3R K;  4FM2 A;  2EWS A;  3A5M C;  2Q0U A;  4NYF A;  4J2D A;  4PA1 A;  4CE9 A;  1XI1 A;  1IBM K;  2CGK A;  3E9L A;  2FSN A;  3U9Z A;  4F4K A;  4FWL A;  5FRM A;  1W9H A;  3NAE A;  3AVL A;  1WSF A;  2JWK A;  4WQ5 A;  4M3Z A;  1VRU A;  4J2A A;  3P83 D;  3THV A;  3I0R A;  4JKG A;  3QDK A;  2G8K A;  2E2P A;  3KKR A;  4I2P A;  5F2R A;  1NWK A;  1QVF M;  3TPQ A;  4LFC K;  2AJQ A;  4DSJ A;  1HJR A;  1BQN A;  3ZSO A;  3OYB A;  2FBX A;  1XMQ K;  4U67 L;  3NH1 A;  5HOO A;  3CFO A;  3RTV A;  1Y64 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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