1H1VA

Gelsolin g4-g6/actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
368
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title The Calcium Activation of Gelsolin:Insights from the 3A Structure of the G4-G6/Actin Complex
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Actin-binding
total genus 113
structure length 368
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1h1vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1h1vA04
3U9ZA 2E88A 2YCHA 3BP8A 4CZKA 2HOEA 3IMXA 2QM1A 2E1ZA 3MDQA 1YXQA 1D4XA 1SZ2A 4BRLA 3I33A 4CZJA 2QWPA 5AQIA 3CQXA 4FWLA 2Q36A 1HKCA 4BQLA 3FZKA 1GLEG 1ESVA 2VCPA 3VEVA 4K42A 5AQUA 3H3OB 3WEEB 1MWKA 1RFQA 3A5MC 5E26A 3QBWA 2YHWA 4JHDA 4BRAA 4K25A 1U2VA 5CE3A 4BC2A 1XQSC 3A0IX 1NGCA 5BRFA 4H0TB 4BRMA 5AFUA 3HM8A 3M3ZA 1NGBA 4IJNA 3S41A 4A61A 3U8XA 2P9PA 4CZGA 4BRNA 2P9UA 1KAZA 3L0QA 2P9KA 1HKBA 5AQPA 3H3NO 2PAVA 3A5LC 3QBXA 4JHDB 4I6MB 3VF6A 5BRDA 1U2VB 3H46O 3U4LA 2FSJA 1T44A 2FSKA 1X9JA 1S3XA 3WUHA 3CERA 3KVGA 3VEWA 3H6EA 3FLCO 2QWMA 1HKGA 5EVZA 3MN6A 1GLBG 3MMVA 1Z05A 4LC9B 4EHUA 1X3NA 2F9TA 3ZETA 4BREA 3EL2A 5KQDA 2P9PB 3O4WA 5I9EB 2E8AA 4CBUA 4H5RA 3EZWA 1DEJA 3JS6A 5BPMA 4ISEA 5AQTA 2YHYA 3IFRA 1GLJO 4BRGA 3QB0A 5E84A 2D4WA 2YJFA 4CZHA 1NGHA 2E20A 4WQ5C 4DHYA 4A62A 4H5TA 3VEXA 5JLFA 1BA0A 1KAXA 2VYPA 5AQKA 2Q1NA 2CH5A 4IXCA 3ZETB 3BF3A 2QWNA 4FL9A 2CGJA 3GL1A 3O6WA 3LDNA 1ZC6A 5AZJA 1U6ZA 3CJ9A 1BU6O 1LOTB 4PKGA 3VOVA 5BN8A 4H5VA 3ZEUA 3MN7A 4FOEA 3HTVA 4E1JA 2IVNA 2NLXA 3VEOA 4YDUC 2D0OA 3UE5A 4FSVA 1MWMA 1ATSA 2A3ZA 3VETA 3MK6A 5ADXH 1QZ6A 2QXLA 2QWRA 5LJVA 4WYBA 2GTDA 1GLCG 3UKRA 5AQLA 2NZTA 3QFUA 2V7YA 2YHXA 1BUPA 3HBTA 1C0FA 2V51B 4H0XB 1H1VA 4EAHD 5AQQA 4BR9A 3VEYA 4B9QA 1E4GT 4BR2A 5AZJB 2Q31A 1SAZA 1ZXOA 3CJ1A 3FZMA 3R6MA 3IUCA 3SLCA 3ZEUB 3SMPA 2IIRA 3O5BA 4AM7A 4H0PA 3ENOA 4H5NA 5EY4A 3D2EA 1ATNA 5AQVA 2ZGZA 4XH5A 5BN9A 1JCEA 3UKUA 4FPAA 5FPDA 2HF3A 1G99A 1MA9B 5F0XA 4EIAA 3WQTA 3MN5A 4CZFA 4NO7A 5BR9A 5BPNA 4XEIA 3EKSA 4AM6A 4BC4A 4BRFA 2WUSA 1QHAA 4GNIA 1XUPO 1P8ZA 1C0GA 3GDQA 2YJEA 5AQOA 5AQGA 1HLUA 1V4SA 4BR4A 1NM1A 5BPLA 3D7EO 4FPBA 4BR5A 4EHTA 1NGDA 1BWFO 3D2EB 3QFPA 2FF6A 4CJ7A 4IZ9A 4IJAA 5EXWA 4B1VA 4FWQA 1Z6RA 4H0VB 3UKUB 2Q0UA 4BRHA 4H03B 3VEZA 2FLOA 3WT0A 5BRHA 4FWSA 4CZIA 3FZFA 3O1BA 3VGMA 4BQZA 2FSNA 4FWOA 3LM9A 4FWMA 4BG8A 3O80A 1NGJA 4J8FA 4QS8A 2ZF5O 3JXUA 1NBWA 3GE1A 2P9NA 4B1YB 4BRCA 4K43A 1HPMA 4ISFA 1J6ZA 2Q97A 2UYTA 4BGAA 1CZAN 3M1FA 3F9MA 5AQXA 2QWQA 1KXPA 5TKYA 2IVPA 1NGAA 4WQ5A 2H3GX 5LY3A 3QDKA 4BGBA 4O8KA 3L6QA 2VWBA 5FPEA 3W0LA 5KPRA 3DJCA 3FGUA 1RGIA 4Z94A 2P9UB 1NGEA 4IO8A 4A2BA 2P9KB 2QWOA 4H0YB 2NRHA 3CJAA 2P9NB 2BUPA 2Q0RA 1DKGD 3ZX0A 2IVOA 2EWSA 4BR0A 2W40A 2E2QA 4DCHA 1K8KA 4NB4A 5ADXA 3A5NC 3W3DA 1QQMA 1Q18A 3ID8A 2V52B 2P9SA 3LL3A 3LDPA 3BUZB 4MLHA 3C0BA 4RCHA 4CZEA 3OHRA 4H0OA 4M7YA 4O5FA 2E2PA 5AQFA 1WOQA 2ASOA 3H1VX 4PKHA 2CGKA 3BEXA 1QZ5A 1V4TA 5EOYA 3P4IA 4PKIA 4CD3A 4BVOA 4L3QA 5ELZA 3WQUA 4M63C 5FPNA 2I7PA 5B8HA 3WXLA 4CBXA 3CETA 2ZWHA 4RWTA 3TPQA 3EKUA 3RSEA 5AQWA 3CI5A 3C7NA 1QQNA 4CZMA 1NLVA 1T6DA 1ATRA 1GLLO 3GG4A 4MO4A 4FOIA 3VESA 1GLFO 1NGIA 1BG3A 1TUYA 1BOTO 3AY9A 4JD2A 3FR0A 1YVNA 1JCFA 2ASPA 1XC3A 2E2NA 3HSCA 3DXKA 5AQRA 3D2FA 3VGKA 1TYQA 2D0PA 4ISGA 3VERA 2FF3B 4M7XA 2A6AA 4CD1A 3UKRB 1JCGA 3AAQA 2ASMA 4BRPA 4FO0A 2W41A 3DAWA 3DXMA 1BDGA 3KZBA 4PL8A 3RSEB 2OANA 3FZLA 2QWLA 1NWKA 3SMSA 3FE1A 3QICA 4KBOA 5AR0A 3FFKB 1R59O 2P9IA 4EFHA 1YUWA 1BA1A 4JD2B 4MLEA 5KPZA 5EX5A 2F9WA 3DWLA 3DXKB 5KQ8A 3D2FB 1E4FT 4QS7A 3ULEA 1TYQB 2YI1A 5AQJA 3L4IA 3ENHA 1NGFA 3LDOA 4Y0WA 2GWKA 3DXMB 4WQ4C 3O1WA 5AQSA 2A5XA 5F1XA 1EQYA 3CJ7A 5FPMA 5AQHA 4IWVA 3LDLA 2P9IB 3O8MA 3EN9A 2BTFA 2CGLA 5JMVA 4MO5A 4FWRA 4HTLA 2KHOA 4I6MA 5LJWA 2E1YA 3ULEB 4K41A 1QQOA 3VPZA 3WXIA 2CH6A 3ZX2A 3U9DA 2QW9A 1HX1A 4CI6A 4QS9A 4JAXA 2HMPA 4B1ZA 3IDHA 1T6CA 4BC3A 4H5WA 3MN9A 4XH1A 2A41A 4PL7A 4BG9A 3VGLA 4BRQA 4F9OA 3R8EA 3GBTA 4DQ8A 2DPNA 3SJHA 1MDUB 5KPTA 3HI0A 2HF4A 3SK3A 1NGGA 1LCUA 5AZIA 3H45C 3LM2A 3CHWA 3G25A 5AQYA 4BVPA 5AQNA 1X3MA 5AFUH 3GOIA 2ITMA 4C23A 4YDUA 4BC5A 1KAYA 3ZX3A 2AP1A 3AAPA 4CBWA 3CJBA 3KHYA 3QMLA 2FXUA 3FZHA 2P9LA 4RTFD 1ZBSA 2A42A 2ZGYA 5JICA 4XH4A 5F2RA 1Y64A 4FWKA 3VF2A 3BF1A 3R9PA 1BO5O 3VF4A 5AQZA 5AZIB 4BRKA 3WXKA 1TUUA 3B8AX 3WXJA 5AQMA 1HUXA 4CZLA 1GLDG 1K8KB 1IJJA 1SQKA 2GEMA 5JLHA 4FWNA 5BREA 2P9SB 3H1QA 3CJCA 3M6GA 3A8YA 3UB5A 2P9LB 4BR7A 2V7ZA 2D1KA 1IG8A 3O08A 4B1XB 4B1UB 3LDQA 4HWIA 3VENA 4A2AA 1NMDA 4JNEA 4BRIA 4FWPA 3MCPA 3CIPA 3AARA 3ATVA 1OKJA 3J8AA 4GY2B 2E2OA 2GELA 2Q2RA 4B1WB 2AA4A 4BRDA 1S22A 1DGKN 2A40A 3EO3A 4BROA 3I8BA 3C7NB 1RDWX 4WQ4A 2GUPA 2I7NA 4JN4A 1GLAG 3CQYA 3TU5A 2J4RA 3ATUA 3A5OC 2PBDA 4DB3A 1HJOA 3WEEA 1YAGA 3HZ6A 2GWJA 1WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U9ZA 4BDYA 4L8RB 2E88A 4DFMA 1N32K 4FW1A 1X9WA 4I2QA 3OYEA 5I3UA 2E1ZA 2KW4A 1YXQA 3ZSWA 1S6QA 1REVA 3LWLA 2OTJN 4BRLA 1Q82O 5AQIA 1KQSM 1WNSA 1ESVA 2VCPA 1S6PA 4M41A 3WEEB 2ZJRL 1QE1A 1EWQA 4X65K 2YHWA 4GV9A 3ZLJA 3DLLL 4ID1A 1GOCA 3ZT2A 2WTUA 5LL6Z 4ID5A 2FBTA 3NGZA 2VG6A 2G8VA 3NVKA 3THXB 4BRMA 4KHNA 3M3ZA 1IKYA 4IJNA 2P9PA 2RN2A 1QS4A 2VQFK 4BRNA 2P9UA 1YJWN 1KAZA 2QKBA 2P9KA 2O8EA 5AQPA 4DLEA 4OGCA 4J2DA 2Q3SA 4FJHA 1X9JA 1S3XA 1VHXA 3L8BA 1O13A 4JKGB 1HKGA 5EVZA 5HP1A 3IG1A 4AHRA 2IC3A 4LC9B 3O3FA 4EHUA 1C0UA 2F9TA 4X62K 4WE1A 2E4LA 1NK4A 1L3TA 3EZWA 3JS6A 1QSLA 2G8FA 5BPMA 3NF7A 5AQTA 3IFRA 4CGDA 4B08A 3V1QA 2XO7A 5H1SQ 3OTOK 1C1BA 1NGHA 4BECA 3VA3A 3F73A 1M90O 4DHYA 4A62A 3CM6A 3AO3A 2HHWA 2HHVA 2CH5A 3ZETB 4LF5K 5FLXO 1SKSA 4FL9A 4DQRA 2CGJA 3D6RA 5SWMA 5JS2A 5BN8A 3CJ9A 4PKGA 1J5EK 3VOVA 1JLAA 1RBRA 1RTHA 3MN7A 3AVKA 4E1JA 2NLXA 3V9ZA 3UE5A 4FSVA 4CIEA 1MWMA 1ATSA 5DM7L 2A3ZA 3MK6A 4DR7K 4BDZA 5ADXH 2D0AA 2NRZA 3L3VA 5K14A 2OPQA 5LJVA 4WYBA 2OPPA 4DSEA 4DG1A 1P90A 3QFUA 4RW7A 3HBTA 3DOLA 3ZSOA 1C0FA 3OYJA 1RILA 3IAYA 1E4GT 1SAZA 4O55A 3O9TA 3R6MA 3RR7A 3ZSQA 3ZSVA 4JI0K 3MECA 4ICLA 3SMPA 1A5WA 3C65A 2QTDA 1YT3A 3AA5X 4AHVA 1NK5A 5EY4A 4ILHA 1EP4A 2R7YA 4M3ZA 3SI6A 3L2UA 3UKUA 4FPAA 5HL7L 1JJ2M 1D9DA 4AILC 2Z1HA 1BL3A 4CZFA 1S1UA 3EKSA 4BC4A 2WUSA 4A5BA 1BIUA 2QK9A 1QHAA 5CYQA 1VRTA 3IS9A 2O8CB 1HQEA 3NBPA 1HLUA 3E9PA 3ZYYX 4Y1CA 3PO5A 4B9TA 4EHTA 3E9OA 3RRGA 4JI3K 1BWFO 4CJ7A 3KK1A 2Z1IA 4KHWA 1Z6RA 1D9FA 5HBMA 1YTUA 2Q0UA 1HR0K 1T8EA 3NMUA 4IG3A 3VEZA 1NK7A 2OPRA 5BRHA 3CCQN 4E72A 2JWLA 3FZFA 3O1BA 5FROA 3VGMA 3MXJA 4KREA 3O9UA 3LM9A 1S9EA 4FWMA 2F7TA 3HRGA 3NE6A 2ATQA 4O0JA 4AH9A 3PSFA 3JXUA 3SZ2A 2P9NA 3CD6N 4Q5VA 2ZD1A 1J6ZA 3PX0A 2UYTA 3KTQA 1CZAN 3M1FA 3O4QA 5AQXA 3CQ8A 4FLWA 3RMCA 3OYAA 3KD1E 1KXPA 5TKYA 2IVPA 3ZSYA 3KWIA 3QDKA 4O8KA 3RMBA 2WC9A 3LZIA 1OH7A 5FDLA 3TSPA 3KLFA 3DJCA 3V9SA 4KTQA 1ASWA 3CMEN 1RTJA 1RNHA 1ZBIA 2IVOA 1TK8A 2GUIA 5ADXA 1J54A 4BEBA 5KRTA 2O4GA 1FK9A 1N33K 1NK9A 4HHTA 3C0BA 4RCHA 1NU0A 1YIJN 3AVFA 3AA2A 2UUBK 1VQLN 4MQ3A 4N56A 2XY5A 4DV7K 4F8RA 4Q0BA 2QA4N 2P51A 4BVOA 4L3QA 4DF4A 5JVHL 5ELZA 3VQ6A 3M8PA 4W5TA 4DTMA 4KHUA 4RWTA 1SS6A 3QO9A 3DRSA 3C7NA 1QQNA 1GLLO 3CFPA 1XMQK 1GLFO 4B8CA 4CF1A 4JD2A 1NKBA 1XMOK 3DM2A 4RG8A 3C6AA 2E6LA 2XY8A 4LD0A 3CXCM 3VGKA 1F21A 4JI1K 2D0PA 4ISGA 4M7XA 1JCGA 4PQUA 4LSNA 1HYSA 2W41A 4HUFA 1TL1A 2XRIA 1RTIA 4E19A 3CPWM 3VQ9A 3FZLA 1NWKA 3SMSA 4KI6A 3P38A 4FJGA 4KBOA 4EFHA 1YUWA 3RRHA 3CPEA 4OJRA 5DM6L 2IGIA 4JRPA 1RT6A 5DMRA 4M3YA 5KQ8A 4PWDA 5GAGP 1S1VA 1IH7A 3LDOA 4Y0WA 1C1CA 3DXMB 4WQ4C 5IWAK 2Y1JA 1B9DA 4ZHRA 4JK7A 4OPKA 1BISA 1HNIA 4JEPA 2O8DA 1BI4A 1FKPA 4B9VA 3O8MA 1KRPA 2BTFA 4NLBA 4FWRA 3OYBA 4H4MA 2VG5A 3KKSA 1QQOA 3O9RA 2OZSA 1J9AA 3J81O 1BCOA 4B3RK 2HMPA 4B1ZA 3KK2A 2G8WA 2QXFA 1YF5L 4PL7A 4BRQA 4CESA 4F9OA 3R8EA 4DQ8A 2DPNA 2HSTA 3M8QA 1OH8A 3QEPA 3V9XA 3KLEA 4CERA 2HF4A 3AVHA 2HMIA 3P39A 2VGMA 4FJNA 3H45C 3CHWA 2Y1IA 1WAJA 2F4VK 4C23A 1Q8IA 1JLEA 3CCUN 3QLHA 4EP4A 2P5OA 3EY1A 4KRFA 4J2EA 3ULDA 4AHUA 4DR5K 2UXDK 2P9LA 1JL1A 4N47A 3I56N 5JICA 3AVAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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