1H1VA

Gelsolin g4-g6/actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
368
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title The Calcium Activation of Gelsolin:Insights from the 3A Structure of the G4-G6/Actin Complex
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Actin-binding
total genus 113
structure length 368
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1h1vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1h1vA04
3KZBA 4CZMA 5AQHA 3ZETB 4PKHA 2ZF5O 4A62A 4JD2A 4B1ZA 1NMDA 3U4LA 5AQSA 4EFHA 3HM8A 4WQ4A 2ZGYA 1KAYA 1NBWA 3A5OC 3CJCA 2OANA 2P9LA 4BRFA 3O8MA 3TPQA 4FWOA 2V7ZA 4BR9A 1U2VB 5LJVA 2V51B 1MA9B 4CZLA 1ZBSA 1G99A 1NGIA 4KBOA 4MO5A 3A5LC 5F0XA 3WXIA 5BPLA 3TU5A 3ZEUA 3H3NO 3KHYA 2F9WA 5FPMA 1NLVA 4WYBA 4ISEA 1Y64A 3FFKB 2IVOA 2W41A 3IFRA 3WUHA 4H03B 3UKRA 1HJOA 1BO5O 2E1ZA 5EOYA 3GL1A 4H0XB 3DXMA 3BEXA 4BRCA 3R8EA 3WT0A 2IIRA 4CZGA 3QICA 3WXJA 1Z6RA 4IXCA 2P9LB 4BR2A 3WXKA 2J4RA 2NLXA 1GLCG 2GELA 3BP8A 1SAZA 4BR5A 4A2AA 2FLOA 3U9ZA 4AM6A 3KVGA 2CH6A 2CGKA 5JLHA 4H5VA 4IZ9A 4BRPA 3CJ1A 3H45C 1HKBA 5AQPA 3ATUA 3ZEUB 3L4IA 4F9OA 3ENOA 3CERA 2P9NA 4H0OA 4I6MA 3MCPA 5AQUA 5BRHA 3ULEB 2YHYA 2QW9A 4CZJA 3VERA 4CBXA 1IG8A 2D4WA 3O4WA 4JAXA 4BRNA 1QQOA 2QWNA 3DXMB 3R6MA 3M1FA 3O6WA 5AQIA 1Q18A 3DWLA 3FZKA 4M7XA 3BUZB 3JS6A 3HTVA 2P9PA 3BF1A 2V7YA 3FZHA 4DQ8A 1WOQA 3A0IX 4ISFA 1BU6O 3S41A 1ATSA 5BREA 4CZKA 3FGUA 5AZJA 1X9JA 4XH5A 4Z94A 4B9QA 5I9EB 3B8AX 5BPMA 1NGBA 3SMPA 2P9NB 2GTDA 2Q36A 4I6MB 4J8FA 2QM1A 1GLEG 2P9KA 3LM9A 2D0OA 1BDGA 5AQMA 4GNIA 4WQ5A 5AQYA 4DB3A 3C0BA 4B1VA 5BRDA 3VEOA 4BRIA 4CBWA 2P9SA 2P9PB 4BC2A 3A5NC 3EKSA 4FL9A 3VEWA 4BRKA 5AQNA 3LL3A 3UB5A 3M6GA 2H3GX 2VCPA 1IJJA 1YUWA 4FWKA 2HF4A 3FZLA 4FWLA 4BVOA 1HKCA 2I7PA 1XQSC 2QWOA 1LOTB 2CH5A 3VEYA 3MN5A 2AA4A 1HUXA 4H5TA 5AQFA 1MWKA 5AQTA 1BA1A 3WQTA 4E1JA 3F9MA 4PKIA 4BRMA 1GLJO 3I33A 1NGAA 2HOEA 2P9SB 2HF3A 2P9UB 5LJWA 3C7NA 3A5MC 1E4GT 2W40A 3QDKA 2GEMA 3MN6A 1GLLO 4L3QA 1KAZA 3WEEA 4FSVA 1HPMA 2Q2RA 4H0TB 3RSEA 3D2EB 4QS9A 2YI1A 1TUUA 2FXUA 3LDNA 1YXQA 2V52B 1KXPA 3FR0A 3MK6A 2WUSA 1ZXOA 3DJCA 4EHTA 3W3DA 1D4XA 2QWRA 3O08A 4NO7A 4EIAA 4JHDA 3D2FA 1CZAN 3CJ9A 2Q97A 3DXKA 4XEIA 2D1KA 3FE1A 3HSCA 1XC3A 2GUPA 3UKUA 2ASMA 4FWQA 4JD2B 4MO4A 5ELZA 3C7NB 3SLCA 4BR7A 2E2QA 1QQNA 2ITMA 4QS7A 4AM7A 3LDPA 2IVPA 3U9DA 4FOIA 1NGEA 4H0PA 4CZFA 4Y0WA 2YHWA 3WEEB 3FZMA 1TYQA 1NGGA 3RSEB 5LY3A 2AP1A 2ZGZA 3CQYA 1XUPO 1BOTO 5TKYA 3P4IA 1KAXA 4BRQA 5AQWA 3UKUB 1ATRA 2ZWHA 5AQJA 3UKRB 2QWMA 1V4SA 2A3ZA 4BR0A 2FF6A 5AQQA 4A2BA 4CBUA 3MMVA 1BUPA 4EAHD 4RWTA 1T6DA 5AQVA 3MN7A 4NB4A 5ADXH 1U6ZA 4CD1A 3GBTA 4IWVA 2F9TA 4BRGA 1HKGA 1H1VA 2ASPA 1RDWX 3IUCA 3GOIA 3WXLA 4JNEA 1E4FT 3SK3A 4BG8A 4BREA 4IO8A 3GDQA 2A41A 3ATVA 3ENHA 3LDQA 5E84A 3CHWA 3VF4A 5F2RA 1HX1A 4PKGA 4FWNA 2GWKA 2A42A 1DEJA 1ESVA 3HBTA 2A40A 5JICA 5KPTA 3VENA 4RCHA 4CZHA 4XH1A 2ASOA 1GLDG 4B1UB 1GLBG 1RFQA 2Q31A 1Z05A 5BN8A 1MDUB 5KPRA 2PAVA 4BG9A 1JCEA 3HI0A 3H1VX 4FOEA 3I8BA 1NGJA 1J6ZA 1DKGD 1ATNA 4B1XB 4YDUA 3CJAA 3VEZA 4BRDA 1X3MA 3EL2A 5AZJB 1MWMA 3DAWA 5AQGA 5JMVA 1S3XA 5CE3A 4WQ5C 1T6CA 4K41A 2P9IA 5EXWA 4BQLA 4BR4A 4K43A 3ZETA 5JLFA 2QWLA 4BRLA 4GY2B 3IMXA 2P9KB 2VWBA 2DPNA 3SJHA 1TUYA 5AQKA 3W0LA 3GG4A 3VESA 1YAGA 1K8KA 3EO3A 1JCGA 3FZFA 4QS8A 5AQZA 3O5BA 2D0PA 3CJBA 2GWJA 3VOVA 3QBWA 5AQLA 5FPNA 2CGJA 2BTFA 3EN9A 5EVZA 3O1WA 2QWQA 3R9PA 1GLFO 3CETA 3VGLA 2YJFA 1C0FA 2E2NA 5AZIA 4CZIA 2FF3B 1YVNA 4DHYA 5E26A 2P9IB 4CJ7A 2YJEA 3CI5A 2A6AA 2KHOA 1OKJA 2QWPA 4FWSA 1QHAA 2UYTA 1S22A 5F1XA 1HLUA 5ADXA 2E2OA 4WQ4C 1K8KB 5EX5A 5AFUH 4DCHA 3VF6A 2FSNA 4PL7A 1X3NA 1NGFA 4BGBA 2E2PA 2FSKA 3CIPA 3L0QA 2BUPA 5B8HA 1NGHA 4B1YB 4H0VB 3ZX2A 5AQRA 3L6QA 4BQZA 4H0YB 4JN4A 3G25A 2YHXA 4PL8A 5AZIB 3LM2A 5BN9A 5BPNA 5FPDA 1QZ6A 3LDLA 4O5FA 4CI6A 1T44A 3ID8A 1BWFO 4CD3A 2Q0UA 3ULEA 4JHDB 3D2FB 4FPAA 1JCFA 4K42A 3DXKB 3IDHA 1EQYA 3QB0A 4IJAA 2I7NA 4FWPA 1NM1A 2E1YA 2E8AA 3UE5A 4IJNA 1ZC6A 3SMSA 5BRFA 4LC9B 4MLEA 2E20A 3O1BA 4RTFD 2NZTA 4BC3A 3VGMA 4FO0A 1BG3A 2IVNA 4HTLA 3M3ZA 3J8AA 1SQKA 1TYQB 3QBXA 3MDQA 1WUAA 3H1QA 5EY4A 1P8ZA 2Q0RA 1C0GA 2E88A 3ZX3A 4BC4A 1RGIA 3QMLA 5BR9A 1NWKA 3U8XA 3AY9A 3CQXA 1LCUA 4K25A 4BRAA 3CJ7A 2A5XA 1QQMA 1SZ2A 3AAPA 3D7EO 5AQXA 3VF2A 2Q1NA 5FPEA 5KPZA 5KQDA 4B1WB 3WQUA 4MLHA 3H46O 2NRHA 3BF3A 1QZ5A 3ZX0A 4BGAA 3VPZA 4BRHA 3QFUA 3AARA 3O80A 4A61A 4FPBA 4BROA 4H5WA 3QFPA 4C23A 4H5NA 3H3OB 5AFUA 4HWIA 3VETA 2FSJA 3HZ6A 5KQ8A 4M63C 3EZWA 3VGKA 3H6EA 2CGLA 1GLAG 1BA0A 2EWSA 4M7YA 3VEVA 5AQOA 3GE1A 4ISGA 4H5RA 2HMPA 4BC5A 4YDUC 4BVPA 2P9UA 1R59O 4EHUA 3LDOA 1NGDA 2QXLA 4FWMA 3OHRA 1DGKN 3MN9A 4O8KA 4CZEA 2YCHA 3A8YA 1V4TA 1NGCA 3FLCO 1U2VA 2PBDA 3D2EA 2VYPA 3EKUA 3JXUA 4FWRA 3AAQA 3VEXA 4XH4A 5AR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D6RA 2KW4A 4QAGA 1XNQK 3OYIA 3M8QA 4CZMA 4DV1K 2EHGA 5AQHA 3ZSRA 4CESA 4KH6A 5JVGL 4DQIA 3PX4A 4A62A 4JD2A 1Y97A 1TL1A 3WNFA 1CLQA 4ILHA 4EFHA 3DLLL 1LW0A 1VSHA 3I55N 4NXMK 5FROA 3TPQA 4FWOA 1RBUA 2V7ZA 4BR9A 1U2VB 1LWEA 4CJPA 3NMUA 4PY5A 3NH0A 2GBZA 4RW6A 3KKRA 4DR2K 5EU7A 3PUFA 5F0XA 5BPLA 5FPMA 2HHTA 3HL8A 3FFKB 2IVOA 3WUHA 5MLCQ 4Q5VA 3LP2A 3KLGA 1BO5O 3I56N 2F4VK 3RWUA 4H0XB 4I9LA 2HHWA 2XY6A 3NCIA 4CJWA 1N6QA 3QICA 4BR2A 3MWTA 1YIJN 2J4RA 4B8CA 3T1YK 4CFDA 2DFEA 4BR5A 3VN5A 4X66K 4YNQA 3HVTA 4AM6A 3KVGA 3CJ1A 3RMAA 2D5RA 2QXFA 4Y1CA 1J5EK 2YNHA 3L4IA 3QIOA 4OPAA 4E1NA 3VQEA 4CJEA 1WSGA 3OS2A 3QIPA 2RF2A 3ULEB 4CJ5A 2DFHA 1OH6A 4B3OA 1QQOA 3T3FA 1B9DA 4CHYA 4DSIA 4M7XA 3JS6A 4KH4A 3HTVA 2P9PA 4F2RA 3FZHA 1ATSA 3O3HA 1K73O 1KVBA 3Q7BA 3DYAA 4DSLA 5BREA 4E19A 4XH5A 3SYZA 4B9QA 1BIZA 2XHBA 1CXQA 3VMFB 3B8AX 3THWB 3SMPA 2P9NB 3M8RA 2G8VA 4YOTA 1GLEG 1NNEA 1BDGA 3AA5X 1KD1O 4GNIA 1SUQA 4WQ5A 2HBKA 3C0BA 4ILJA 3HOTA 4B9TA 1N34K 3NHGA 3VEOA 5KTQA 2QKBA 2P9SA 4KRFA 4BC2A 2HBLA 4FL9A 2W6LA 4MDAA 4B3TK 4BRKA 1WBBA 5AQNA 3UB5A 3S3MA 1QSYA 2XO7A 5HOOA 3HXMA 3WXMB 2O8EA 2HF4A 1NKEA 1Z25A 3NDKA 1HR0K 1YJNN 4DTNA 2UUCK 1M90O 3P39A 3VEYA 1Q81O 2G8KA 3E66A 1C0MA 3MN5A 1BCOA 1ZBIA 4DSKA 3KK3A 3PO5A 1BA1A 2P1JA 4BRMA 3O4NA 3THYB 1OH8A 4BDZA 2GX9A 3G6EN 1RT7A 3MN6A 3VQ6A 3WNEA 3TSQA 4L3QA 1ZBHA 1HPMA 2Q2RA 2HHQA 4CJ4A 3RSEA 4MQ3A 3D2EB 4QS9A 4JS4A 4F8RA 1YXQA 3U3YA 1ZXOA 3DJCA 4EHTA 2ZM6K 4NCBA 3TTFA 4JYAK 3OYNA 2PZSA 2QKKA 3S3OA 3CJ9A 3DXKA 4XEIA 2D1KA 3K58A 3UKUA 4FM0A 1HYZA 2JLEA 2HNZA 3V4IA 1VQKN 4KI4A 4M3WA 4K8XA 1L3VA 3C7NB 1QQNA 2IVPA 3SZ2A 3U9DA 3TAGA 3NF8A 4RW7A 1NGEA 4J2EA 3OTOK 1NG9A 1ASUA 4CZFA 3WEEB 4OGCA 4CJTA 3T1HK 1VRTA 2HVIA 3L3VA 2VGNA 3CQYA 1WB9A 2KFNA 3RMBA 2E5LK 4FJIA 2OPSA 3R1XA 4EZ6A 4CEOA 2O4IA 4IDHA 2E6MA 2WC9A 3N4PA 3QESA 3ZSWA 3VQ7A 2A3ZA 4CJ3A 2FF6A 4E1MA 3EZ5A 4CBUA 4FW1A 1BUPA 4RWTA 1EWRA 5KGXA 5AQVA 3MN7A 2QTDA 1U6ZA 3CFRA 2ASPA 4BG8A 1QE1A 2NRTA 2OZSA 1DTTA 1WLJA 3MXMA 1WSFA 1HMVA 2VG6A 3SAFA 3J80O 3V9SA 3L2WA 1XI1A 5HROA 2E4LA 1ESVA 5JICA 3VENA 4E7HA 4RCHA 4X65K 4B1UB 4OLBA 5GIOA 1MDUB 4JI5K 4KHPK 1U47A 2HMIA 4FOEA 1HJRA 3QEVA 1W7AA 1BQNA 1ATNA 1DKGD 4X62K 3CJAA 4BACA 3VEZA 1X9WA 4JI3K 1RT2A 5AZJB 2YKNA 3DAWA 3AVLA 5CE3A 2UUAK 4K41A 1O1WA 3HSTB 5C15A 3HJFA 4FJXA 3HYFA 5DM6L 4O8UA 4G9ZA 2P9KB 5AQKA 1YAGA 2PFUA 3T7ZA 5CY4A 4HHTA 4CJLA 3SUOA 3HT3A 1ZBUA 2D0PA 4DU4A 1FJGK 5FPNA 4IFVA 2BTFA 4YOUA 3QNOA 1I3AA 3LP3A 5M1OA 2HB5A 3QEXA 4CZIA 4DHYA 2VWKA 5E26A 2P9IB 1YJ9N 1XHXA 3ZSVA 2YJEA 5E41A 4GVEA 2A6AA 3OYMA 1T8EA 3CCEN 5F1XA 1T05A 2O4GA 1K8KB 5EX5A 3MXJA 4CIGA 5HLFA 3VF6A 3ULDA 3IS9A 1ASVA 1X3NA 3NGIA 1KQSM 4DTJA 4W5OA 5C24A 3CIPA 4JLHA 1BQMA 5CZ2A 4CVNE 1CZ9A 3CPEA 3ZX2A 3L6QA 4BQZA 1XMOK 2YHXA 4PL8A 5AZIB 3LM2A 3TWHA 5BPNA 4K0KK 4LF6K 4OPHA 4FVUA 4CF2A 4IOAL 4KH5A 4CD3A 3AO2A 2PYLA 1JXEA 2Q0UA 3RMCA 3D2FB 4E7JA 4IJAA 3BZKA 3KJVA 3CC4N 4FWPA 3NH1A 1IO2A 2RHKA 3O1BA 4XJXA 5I3UA 4FJ5A 3M3ZA 1SQKA 3QBXA 4LF4K 1N33K 4AHVA 1WUAA 4NLBA 3H1QA 5M1NA 1C0GA 3ZX3A 2A1SA 1JLGA 1IBMK 1S1UA 1M1KO 3AY9A 4CHNA 1UWBA 3JSMA 3RMDA 4K25A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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