1H1VA

Gelsolin g4-g6/actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
368
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Actin-binding
molecule keywords ACTIN
publication title The Calcium Activation of Gelsolin:Insights from the 3A Structure of the G4-G6/Actin Complex
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 368
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1h1vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1h1vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1h1vA04
5LY3A 1S3XA 2ZWHA 3VEXA 3WEEB 3O80A 5AQTA 3KHYA 3D2FA 3UKRA 4BVOA 1BA1A 2Q31A 3FZLA 3SK3A 4JHDB 5JLHA 1V4SA 1NMDA 1GLDG 3O8MA 5BPNA 3D2EA 3DXKB 3LDOA 5AR0A 5FPEA 1NGGA 4CZEA 2QXLA 3JS6A 3ENHA 3FLCO 4I6MA 4PL8A 1Z05A 3ZETA 3CQYA 4BRNA 2D0PA 3UKRB 5LJVA 4XEIA 3EN9A 3VEWA 1KAXA 3C0BA 4A2BA 4CBXA 4CZJA 1JCGA 1BDGA 3UE5A 2YHYA 4BR4A 4BRIA 4YDUA 4B9QA 3LDLA 3VF4A 3C7NA 3CJCA 4FOIA 3WT0A 2A41A 4BVPA 3L6QA 4BRMA 3R6MA 4WQ5A 3VESA 4CZLA 1S22A 5EY4A 1KAZA 3HSCA 4FWOA 3WXLA 5AQQA 3O1BA 3FZHA 3GE1A 3KVGA 4BGBA 1YXQA 3CIPA 3WXIA 4QS8A 4CBUA 1H1VA 1LCUA 2HF4A 2E88A 3MN9A 1E4GT 4H0PA 2V52B 3CI5A 5AQUA 4RTFD 2ZGZA 5AQZA 3MK6A 4H5NA 2GWKA 4BRKA 4FWKA 1D4XA 3VENA 3VF6A 3WQUA 3CERA 3CQXA 3SMPA 2ZGYA 4BR5A 3EKSA 5AQVA 2V51B 5KQDA 1LOTB 5AQJA 1Q18A 5CE3A 3U8XA 3DAWA 2WUSA 2QWRA 5AQNA 5AQLA 5JLFA 3ID8A 1DKGD 3WXJA 3ZX2A 4BROA 3D7EO 3CHWA 1SQKA 1WOQA 4ISEA 1K8KA 1TYQA 2I7NA 1NM1A 1BU6O 2QWMA 2V7YA 1GLCG 3HM8A 4EFHA 1JCEA 2E2QA 5AFUH 1ZC6A 3MCPA 4CD3A 4DCHA 4M7XA 1BO5O 2F9WA 3CJBA 2BUPA 4FWRA 4IJAA 3DWLA 4XH4A 5FPDA 1X3NA 4B1UB 1V4TA 2IVOA 3VPZA 2QM1A 3I33A 3QFUA 1GLFO 4PKGA 1TYQB 3ULEA 2GUPA 1XUPO 3GDQA 2NLXA 4XH5A 2UYTA 3FE1A 3H45C 2GTDA 3MN5A 4JAXA 1HUXA 4H0OA 1XQSC 4F9OA 1C0FA 2D4WA 2QWOA 2ASPA 4B1YB 3O1WA 4CZMA 4XH1A 3R8EA 5AQFA 2Q36A 2KHOA 2CH6A 4K41A 2E2OA 2HMPA 3BEXA 5AQMA 2QW9A 4DHYA 4RWTA 3ULEB 3IMXA 5AQWA 4BRCA 1NBWA 3QDKA 3H6EA 3H1QA 2QWQA 1TUYA 4H0TB 4LC9B 3HZ6A 1GLAG 3EZWA 5B8HA 4FWLA 1ATRA 4J8FA 2EWSA 4BRPA 3KZBA 4DB3A 3W3DA 4O8KA 3GBTA 4H5WA 2F9TA 3VOVA 4IJNA 4CBWA 4YDUC 5BREA 2E8AA 1MA9B 5ADXA 5AQOA 3HTVA 1MWMA 4PKHA 4K42A 2BTFA 3VEVA 1T44A 3FGUA 4QS9A 4BQLA 1GLBG 1NLVA 5AZIB 1G99A 2AP1A 4EIAA 4CD1A 1TUUA 3H46O 5E26A 3GL1A 4BQZA 4BRGA 1GLEG 3BP8A 3QBWA 1QQOA 2GEMA 4A61A 1SAZA 2FF3B 4BC2A 1J6ZA 3VGLA 1NGIA 4FSVA 2A5XA 4IZ9A 2E2NA 3ZEUA 1MDUB 3VERA 4FO0A 5AQPA 4FPAA 3VGKA 3S41A 5BN9A 1QHAA 2NZTA 4FWNA 5JMVA 5BPMA 1RFQA 4Y0WA 1NGJA 5F1XA 4E1JA 3H3NO 5BRDA 2V7ZA 2J4RA 3ZEUB 3U9ZA 5BRHA 2H3GX 4BC5A 1T6CA 2A3ZA 2A42A 3UKUA 1DGKN 4M7YA 4WQ4C 5KPRA 4BC4A 3SLCA 3MN7A 2FSNA 1ESVA 1YAGA 1YUWA 2Q1NA 4GY2B 3O4WA 1IG8A 4EHUA 1T6DA 2AA4A 3L4IA 1KXPA 4EAHD 1MWKA 3G25A 4MO4A 3U4LA 3UKUB 3WUHA 2P9SA 2P9KB 3DJCA 4BREA 3SJHA 2QWPA 3HBTA 3LDPA 2E2PA 5KQ8A 2PAVA 1SZ2A 3CETA 3FFKB 2FXUA 3AY9A 4H0XB 3VF2A 2I7PA 4A2AA 4FOEA 3HI0A 1QZ6A 2CGJA 3A8YA 4MLEA 1YVNA 3I8BA 2P9SB 2NRHA 3OHRA 5LJWA 3FZFA 5EOYA 2YCHA 3ZX0A 4FWSA 3L0QA 2P9IA 1GLLO 3FR0A 5EVZA 5FPMA 3GOIA 5AQYA 1X3MA 2E20A 3BF1A 4H0VB 2P9NA 4CZKA 1U6ZA 4AM7A 3MMVA 4CI6A 4BRDA 3CJAA 4WYBA 3A5LC 5AQRA 1EQYA 2P9IB 4IXCA 1BWFO 3F9MA 2OANA 2ASOA 4CJ7A 2DPNA 2YI1A 2P9PA 3QFPA 3A5OC 2Q2RA 1NGFA 2P9NB 4BRFA 4H5VA 3IUCA 4CZHA 2W40A 1U2VA 5AZIA 4AM6A 2E1ZA 4ISGA 2QWNA 3CJ7A 2P9PB 4NB4A 5F2RA 5EX5A 3CJ9A 4WQ5C 5AQKA 4H5RA 3IDHA 1HKGA 2FF6A 4C23A 2ZF5O 4PL7A 1U2VB 1QZ5A 5AQXA 1CZAN 4L3QA 2P9LA 3A0IX 2E1YA 3AARA 3VETA 1Y64A 4BGAA 3M6GA 3U9DA 3VGMA 2CGLA 4H0YB 4QS7A 4BC3A 3DXMB 2CGKA 3SMSA 5AQGA 4CZFA 3ATUA 4A62A 1XC3A 2A40A 1OKJA 3A5MC 1KAYA 3H3OB 4M63C 1BOTO 2P9LB 2FSKA 3R9PA 2QWLA 4BRAA 3D2FB 5BPLA 1WUAA 3QICA 1HKCA 4IO8A 4ISFA 4BG9A 5ADXH 1QQMA 4B1VA 1NGDA 2PBDA 3D2EB 3ENOA 2A6AA 4H5TA 1BG3A 4BRLA 1ATNA 3EO3A 2P9KA 4I6MB 2P9UA 3ZETB 1C0GA 2VYPA 2YJEA 3JXUA 4K43A 2FSJA 5AFUA 5E84A 1E4FT 1Z6RA 5JICA 2ITMA 4EHTA 1P8ZA 4BRHA 3CJ1A 4B1ZA 4B1WB 3C7NB 3GG4A 3LL3A 3AAQA 5AQIA 2GELA 3ZX3A 4JN4A 3MDQA 4JD2A 3W0LA 1BA0A 5AZJA 2P9UB 3UB5A 2CH5A 3B8AX 2IVNA 1JCFA 2Q0RA 1IJJA 1GLJO 3P4IA 4BR2A 2IIRA 3LDQA 3O08A 3MN6A 5EXWA 1HJOA 4KBOA 1ZBSA 4DQ8A 3VEZA 5FPNA 1RDWX 4FWMA 4JD2B 2VCPA 4Z94A 4K25A 2ASMA 4BR7A 5AZJB 2FLOA 4FWQA 2HOEA 5I9EB 4BG8A 3TPQA 3J8AA 3BF3A 5TKYA 3FZKA 3O6WA 3RSEA 1NGHA 2Q97A 5AQHA 2GWJA 1NGCA 3H1VX 3EKUA 4WQ4A 3LM2A 4FPBA 1X9JA 1NGAA 2Q0UA 1NWKA 5F0XA 5BN8A 3AAPA 3LM9A 4NO7A 4MLHA 3VEOA 4BRQA 2D0OA 4BR0A 4JNEA 1RGIA 3RSEB 3VEYA 1QQNA 2YHWA 3QB0A 1BUPA 2YJFA 3QMLA 5BR9A 4GNIA 1ATSA 3ATVA 1K8KB 2IVPA 4IWVA 1NGEA 3QBXA 3EL2A 4MO5A 5KPZA 4H03B 1HKBA 1ZXOA 1R59O 3BUZB 5BRFA 1HLUA 4BR9A 5KPTA 2HF3A 3M1FA 5ELZA 4FL9A 4HTLA 3O5BA 2VWBA 4CZGA 1HX1A 3A5NC 3WEEA 3TU5A 3IFRA 3WXKA 4B1XB 1NGBA 4O5FA 4RCHA 3LDNA 4CZIA 3FZMA 3DXMA 4JHDA 2D1KA 4PKIA 4HWIA 4FWPA 1DEJA 2YHXA 3DXKA 2W41A 5AQSA 3WQTA 3M3ZA 1HPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C24A 2O4GA 2XRIA 3MX5A 5LY3A 2JWKA 2ZWHA 3CFOA 4RW9A 3D2FA 2W6LA 4AHCA 2XY5A 3KD5E 1BA1A 2VG6A 3I55N 3SK3A 1T05A 4WCEL 3SV3A 1NMDA 1GLDG 2DFEA 3VQDA 2OZSA 4E7JA 3FLCO 1U49A 1T3VA 1MU2A 1Z05A 2EHGA 1RNHA 2WOMA 4IFEA 1TKDA 3UKRB 3EN9A 4CZJA 3J81O 1JCGA 1BHLA 4E0DA 3G0ZA 2ZJRL 1KFSA 3VQ6A 4Z4FA 3VF4A 1FK9A 3C7NA 2HNDA 3SBTA 3SV4A 4E7KA 1IKYA 3VN5A 4JKFA 3BZKA 3AVAA 3CXCM 3AVIA 3SJJA 4F8RA 4H8KA 1HYZA 2GV9A 5AQQA 1RTHA 3CPWM 3HPGA 4NYNA 4AHVA 2PYLA 4L8RB 1B92A 1JLGA 4RTFD 1BL3A 1HMVA 1EWQA 3MK6A 4JI2K 4LF8K 4FWKA 4CJSA 4JKGB 4N56A 3CERA 3SMPA 4XIUA 4B3TK 1G15A 4CJTA 3EKSA 3O4NA 5AQVA 4DTPA 5JVGL 4J2BA 3S3OA 3DAWA 1T7PA 3WXJA 3ZX2A 3B6OA 1SQKA 5CHIA 1WOQA 1YIJN 1JLAA 1TYQA 2I7NA 1NM1A 1JCEA 4ELVA 4DV5K 5AFUH 4KREA 3MCPA 2HHVA 2NRRA 3OYJA 4ID1A 3KKRA 4IJAA 3LALA 5CZ2A 3DWLA 1U47A 4B1UB 3EE8A 4Y1CA 2QM1A 4Z4EA 1T03A 4BE0A 4FJMA 4DTOA 5HL7L 3ULEA 2GUPA 2NLXA 4XH5A 2D0CA 1HUXA 3LZJA 3PO4A 4DQIA 4F9OA 2HHIA 1TKTA 5KGWA 3K5MA 1C0FA 1OVYA 1RBRA 2D4WA 3PY8A 4B1YB 3O1WA 4YFUA 3G6EN 3R8EA 5AQFA 2Q36A 5IWAK 2CH6A 4DV2K 2E2OA 3BEXA 4FK4A 5AQMA 2O8FA 4NYFA 1KTQA 5C42A 1VSLA 3H1QA 3H6EA 1TUYA 4JEPA 1WSGA 2Y1IA 1GLAG 3VQPA 2BDPA 4J2AA 4OJRA 3KZBA 3M8RA 1RDUA 4FM2A 3GBTA 2F9TA 3VOVA 4IJNA 1CXUA 5ADXA 1RCHA 2HVIA 4KV8A 4M3WA 1T44A 3ZSVA 4A5BA 4DF8A 1QSYA 3QEWA 4BECA 1N8RO 3O9SA 1O13A 1GLBG 1XWLA 2G8HA 4BQZA 4B3SK 1HNIA 4K8XA 3PIOL 3TAMA 4PUOA 2Y1JA 4BC2A 3CCSN 1B9FA 3V1RA 4BEBA 3C6AA 4KHWA 1NGIA 1GOBA 3P39A 4B8AB 4O4GA 3F9KA 4FPAA 3P5JA 1JLCA 3K2PA 3S41A 3T69A 3NAEA 3CC2N 1VHXA 4V19S 1RFQA 5J2MA 4MQ3A 3P83D 4O8UA 3V9WA 4E1JA 4FK2A 2V7ZA 5DMRA 1S1WA 3LP3A 4BE1A 2H3GX 3DLRA 4M42A 3UKUA 2OPRA 5KPRA 1ZBUA 4FJ8A 4Q0BA 3ZSRA 1NK9A 4RW7A 3SLCA 2FSNA 1YUWA 4GY2B 2IC3A 3HSTB 3OYMA 4GKJK 4EAHD 2NRVA 3DLBA 4IOXA 3BDPA 3WUHA 3KK7A 4YOXA 3OBYA 1S1XA 4QAGA 1OH7A 4UY8O 3WNGA 3V1QA 3HBTA 3LDPA 4GV6A 2E2PA 5KQ8A 3ZCMA 1P90A 1RBVA 5CY4A 3HVRA 4FZZA 2VGNA 3CC4N 2KZZA 5FLXO 3PX0A 4XJXA 3FZFA 3ZYYX 4DF4A 2O8DB 2RKIA 4M3UA 5AQYA 3IAYA 1YJWN 4H0VB 4CJ4A 4HUGA 1U6ZA 1L3VA 1L3UA 1VSFA 1K8AO 5AQRA 3V4IA 2IGIA 2RE2A 4CESA 3MECA 4CJ7A 4IOAL 3EY1A 4CJ3A 2W00A 4JI3K 3R1XA 3IUCA 4X65K 2W40A 1U2VA 5AZIA 4DU4A 2E1ZA 4ISGA 4FJGA 4DTSA 4KFBA 1KD1O 2X78A 4GKKK 3OJUA 3DOKA 4PHTX 4IBNA 2F4VK 3KLHA 4NB4A 5F2RA 3QNNA 5AQKA 2KW4A 1HQUA 2ZF5O 2ZJPL 1TK8A 5AQXA 3CG7A 1CZAN 4DS4A 1WN7A 3AARA 1VQ5N 3I8DA 1Y64A 4DR5K 5J2PA 3VGMA 1NNEA 2CGLA 4I2QA 4HUFA 4QS7A 1UOCA 2CGKA 1TK0A 3ATUA 4M3RA 1OKJA 3K9KA 4FZXC 1ASUA 1QE1A 4GW6A 2HMIA 2BGGA 2RF2A 4CEBA 1IKXA 1WSIA 3CYMA 4LFBK 2HW3A 2PBDA 4H5TA 3D2EB 1SV5A 1CZBA 1C0UA 1ATNA 4RW8A 4HUEA 3ZETB 3AGRA 1X9MA 2HHQA 3JXUA 1DTTA 1UA0A 4O0IA 2ITMA 4NLCA 1P8ZA 4JS5A 4BRHA 3VMFB 4B1ZA 4B1WB 3GG4A 1N32K 3O9UA 4KAZA 4JN4A 3MEDA 1BA0A 4KHYA 4CGGA 3ULDA 3VQQA 3B8AX 2IVNA 4CIEA 2Q0RA 1FW6A 4FXDA 1JJ2M 4LH5A 3P4IA 2OYQA 4OX9K 2IIRA 4CHPA 1WB9A 4JKBA 3O08A 4H4OA 4Z4CA 4DSFA 1ZBSA 1L3TA 4IFYA 4OPJA 3NGIA 4CGHA 4Z94A 3LPUA 4K25A 2ASMA 2XY6A 4IG0A 5HRRA 3TPQA 3BF3A 5TKYA 3RSEA 1EETA 5AQHA 1LWEA 3G4SN 1NGCA 2P5GA 3H1VX 1S9EA 1X9JA 5HOOA 5F0XA 4I9QA 2HB5A 4W5TA 2I5JA 3RMAA 1N33K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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