1Q18A

Crystal structure of e.coli glucokinase (glk)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
TKYALVGDVGGTNARLALCDIASGEISQAKTYSGLDYPSLEAVIRVYLEEHKVEVKDGCIAIACPITGDWVAMTNHTWAFSIAEMKKNLGFSHLEIINDFTAVSMAIPMLKKEHLIQFGGAEPVEGKPIAVYGAGTGLGVAHLVHVDKRWVSLPGEGGHVDFAPNSEEEAIILEILRAEIGHVSAERVLSGPGLVNLYRAIVKADNRLPENLKPKDITERALADSCTDCRRALSLFCVIMGRFGGNLALNLGTFGGVFIAGGIVPRFLEFFKASGFRAAFEDKGRFKEYVHDIPVYLIVHDNPGLLGSGAHLRQTLGHIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of Escherichia coli ATP-dependent glucokinase and its complex with glucose.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 92
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1q18A01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1q18A02
5AQMA 5JLHA 2AP1A 3O1BA 3A5LC 2P9IB 3WT0A 2F9WA 1NGBA 3ATVA 4QS8A 5BRFA 1NGAA 1Q18A 2D4WA 1DGKN 3EKUA 2NLXA 3ENHA 2V52B 3LDOA 3LDNA 5EY4A 1TUYA 1LOTB 1NLVA 3AARA 3GE1A 1NGEA 2IIRA 5EVZA 1RGIA 1NGDA 3S41A 3VF2A 1J6ZA 5FPDA 4BR7A 1S22A 3LM2A 5EXWA 4H5TA 3W3DA 5BRDA 3CI5A 4GY2B 3DXMA 1SAZA 3ULEA 4H0VB 4HTLA 4H0XB 2D0PA 3IMXA 1NWKA 1HUXA 3A8YA 3DXKB 1HLUA 3VENA 3QBXA 4HWIA 3RSEB 4BRKA 3ZEUA 4B1ZA 3LDQA 2CH5A 5BR9A 4JHDB 2F9TA 3MDQA 2NZTA 1GLAG 4H0YB 4J8FA 2P9KA 3BP8A 4CZJA 4FOIA 3CERA 2P9SA 3ZETA 2Q36A 2BUPA 3BEXA 3EN9A 2P9PA 4FPAA 2YJFA 5LY3A 2ASMA 4F9OA 2IVPA 4IWVA 3VEOA 1E4FT 3OHRA 5TKYA 1GLCG 4BVOA 3QMLA 4K43A 4H0PA 5BPNA 1BG3A 4XH1A 1R59O 2FLOA 3D7EO 3A5MC 2VCPA 3SK3A 3UKRB 3U8XA 4E1JA 1QZ5A 2YJEA 2Q1NA 2YHYA 2ITMA 3VGMA 4WQ5A 5AQFA 4QS9A 4FWNA 1QHAA 3WXLA 3GDQA 4WQ4C 4B1XB 4FWRA 4CZFA 3J8AA 4WYBA 5JLFA 3ID8A 2Q97A 4PKHA 3VF4A 5ELZA 2P9NA 1SQKA 2E88A 3FZLA 2OANA 4B1VA 4JAXA 3MN5A 2P9UB 3CQXA 5LJWA 1HKGA 3H45C 3C7NB 3D2EB 3H6EA 1GLFO 1T6DA 5BRHA 3IUCA 4BRAA 2QWLA 3VOVA 4M63C 2FSKA 3QFUA 3MK6A 2D1KA 3BUZB 4BRHA 2DPNA 2A41A 3LM9A 4EFHA 3H3NO 4BRIA 4MO5A 2Q2RA 4MO4A 4C23A 3HM8A 3MN7A 2E2NA 1QQNA 2W41A 4Y0WA 3O1WA 4BRCA 2GELA 5FPEA 1JCGA 2QW9A 4M7XA 1ZBSA 2GWJA 4NB4A 2VYPA 5AQVA 3CJ1A 3CJCA 1KAYA 1NGHA 4CI6A 3GBTA 3B8AX 2FSNA 4BR4A 3A0IX 3GL1A 5AQIA 4FWLA 2E2PA 4CZHA 3JXUA 1GLBG 5AFUA 4BG8A 2ASOA 3VGLA 1Y64A 1KAZA 4DCHA 3DXMB 1G99A 1RFQA 4GNIA 4JN4A 3ULEB 1NGFA 2IVNA 5EX5A 5AZIA 4BREA 5KPZA 2UYTA 1MDUB 4I6MA 1U2VA 3CJ9A 1YXQA 1NMDA 4FO0A 5AQNA 1ATSA 4ISFA 3ZEUB 1Z05A 2E1YA 1TYQA 2E8AA 4PL7A 2ZWHA 3LL3A 1C0FA 2YHXA 4B1UB 5AQWA 1NM1A 2P9KB 2QWNA 2CGJA 1HKCA 4K41A 2J4RA 4EAHD 3ZETB 5CE3A 1K8KB 2HMPA 3UKUB 2P9PB 3VERA 3P4IA 2QWPA 1JCFA 5E26A 5AQYA 3WXIA 4KBOA 1ATNA 3KZBA 4H5NA 2Q0UA 3U9DA 4O5FA 3AAQA 5JICA 4CJ7A 1IJJA 3VF6A 4YDUC 3WQUA 1QZ6A 5I9EB 3H3OB 3MN9A 1KAXA 3TPQA 2GUPA 1ZXOA 3F9MA 5AQXA 4BRMA 3CHWA 3GG4A 3WEEB 3HZ6A 4JNEA 3L0QA 3VESA 4BC3A 2HF4A 5BPLA 2QWQA 4CZMA 3D2FA 3EKSA 1S3XA 3LDPA 5F1XA 3DXKA 4BC4A 3DJCA 1V4TA 5E84A 5AQQA 3UB5A 1NGIA 5ADXH 2P9NB 5AZJB 4BR2A 4H5VA 3DWLA 1V4SA 3H1VX 4FWOA 3H46O 2QWRA 4XH5A 1NGCA 3O80A 2P9LA 4BQLA 4BR5A 1HJOA 1BU6O 1T44A 1TUUA 3BF1A 1C0GA 4FSVA 2FF3B 1X3NA 5AQOA 3O5BA 3ZX2A 4FWKA 1H1VA 3M1FA 4RCHA 5EOYA 4FWSA 4K42A 4CZIA 4ISGA 4JD2A 5AQZA 4A2AA 1CZAN 2FXUA 3ZX0A 1QQOA 1GLLO 3CQYA 1U6ZA 4L3QA 2Q0RA 1JCEA 4MLHA 3VEXA 4EHUA 4BG9A 1BUPA 2GEMA 5LJVA 5AFUH 2V51B 1GLEG 5JMVA 3M3ZA 4FPBA 4RWTA 3QFPA 3H1QA 2YHWA 3EZWA 3ATUA 2QM1A 4BGAA 2V7YA 3L6QA 3I33A 1BDGA 2E1ZA 3GOIA 2CH6A 3WXKA 4AM7A 3HI0A 3TU5A 3FLCO 3MN6A 2ASPA 3FZHA 4CZKA 3EL2A 3G25A 4YDUA 5AQPA 5F0XA 5AQTA 1WUAA 2E2QA 3A5OC 3VETA 1DEJA 4PKGA 1T6CA 4BRFA 2P9UA 3MCPA 2H3GX 4IO8A 4IXCA 4A2BA 4IJAA 2PAVA 3VPZA 3D2EA 4LC9B 5AQSA 1U2VB 4BRNA 4FL9A 5AQUA 5F2RA 3SJHA 3QB0A 2ZF5O 2AA4A 1TYQB 3CETA 1MWKA 3FZKA 4B9QA 4BR9A 2W40A 5KPRA 1BO5O 2A40A 3HTVA 4DHYA 3WXJA 1XC3A 2GWKA 3WQTA 1NBWA 4WQ5C 4B1YB 1BA0A 4WQ4A 4BQZA 3SMSA 2V7ZA 1KXPA 2QWOA 5FPNA 3IDHA 1IG8A 3O4WA 5BPMA 3VEVA 4Z94A 2A6AA 5AQRA 1SZ2A 2P9SB 2P9IA 3VEZA 3C0BA 4CBWA 1P8ZA 3CIPA 5B8HA 1GLDG 3O8MA 4A62A 4BR0A 2A42A 1ESVA 3R9PA 4B1WB 1XQSC 2A5XA 1HX1A 4H03B 4PKIA 3VEWA 5KQ8A 3KHYA 3ZX3A 3FGUA 4MLEA 3FR0A 2E2OA 1ATRA 1YAGA 3I8BA 1MWMA 4CZGA 2IVOA 3D2FB 1Z6RA 4CD1A 3JS6A 4CZEA 2HOEA 4BRDA 2EWSA 5KPTA 3AY9A 1EQYA 2D0OA 1BA1A 1XUPO 3MMVA 4M7YA 3R6MA 4RTFD 1HKBA 1HPMA 4FWMA 3QBWA 4BRPA 4CZLA 2P9LB 1RDWX 4XEIA 1K8KA 3SLCA 4XH4A 4BRLA 3UKUA 3RSEA 4IJNA 3VGKA 1X3MA 4QS7A 4JHDA 1YUWA 4NO7A 4JD2B 1QQMA 3FFKB 4EIAA 3O6WA 5BREA 3FZFA 2WUSA 3CJAA 3U9ZA 4BC5A 3WUHA 4CBXA 1GLJO 4FOEA 2FSJA 5AR0A 3CJ7A 5KQDA 2QWMA 3A5NC 3ENOA 2ZGYA 2A3ZA 5AQLA 2CGLA 1OKJA 3LDLA 5BN8A 2PBDA 3FZMA 2I7NA 4DB3A 1WOQA 3VEYA 3WEEA 1D4XA 2VWBA 1BOTO 1MA9B 1NGJA 2FF6A 3W0LA 4EHTA 4BGBA 2BTFA 2CGKA 2YCHA 4H0TB 4H5RA 4K25A 3UKRA 5AQKA 4BRGA 4CBUA 1YVNA 4FWQA 4O8KA 2GTDA 4H0OA 5AZJA 5AQGA 2QXLA 5FPMA 1LCUA 1X9JA 2KHOA 4IZ9A 3CJBA 3EO3A 4PL8A 3HBTA 3KVGA 2ZGZA 3O08A 3FE1A 3HSCA 5AQHA 2Q31A 4BC2A 3IFRA 4BRQA 3M6GA 4H5WA 4ISEA 3SMPA 2HF3A 1ZC6A 1E4GT 3AAPA 2E20A 5AQJA 4CD3A 3QICA 1NGGA 5ADXA 5BN9A 4BVPA 3U4LA 5AZIB 3UE5A 4FWPA 4A61A 1BWFO 3C7NA 2I7PA 4I6MB 4DQ8A 3DAWA 3QDKA 2NRHA 4AM6A 3R8EA 3L4IA 2YI1A 3BF3A 1DKGD 4BROA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JLHA 4JI7K 2AP1A 3CPWM 2HNYA 1TKDA 2JWKA 3QO9A 1X9SA 3KK3A 1C0UA 3LALA 4B3MK 2Z1JA 5C42A 3VQ6A 1DGKN 4JYAK 3PX4A 2V52B 3LDOA 1LOTB 1N36K 4FM2A 4JKFA 3WNFA 4FLUA 4DFKA 4Y1CA 2IIRA 3R3LA 4FVMA 1RGIA 1XWLA 3VF2A 2F8SA 4M3XA 5C15A 4I7FA 1SL1A 3LM2A 5HROA 4CK1A 4H5TA 4CJPA 4IO9L 1DLOA 4B3RK 3SCXA 4H0XB 2D0PA 1HUXA 4M3YA 3MECA 3P31A 1SV5A 4WF9L 4R79A 4E7LA 4ID5A 3ZEUA 3TSUA 4B1ZA 4GKJK 3MDQA 3SZ2A 3VQAA 2O4GA 4JKDA 4O4GA 4H0YB 4OKJA 4FOIA 3CERA 2P9SA 2Q36A 4C1NK 3OYNA 3FFIA 4O5BA 4CHOA 2P9PA 2ASMA 3OHRA 1VSMA 4JKBA 1VSIA 1DT9A 4GMJB 4KFBA 1BGXT 3JAMO 4FJIA 3AO5A 1R59O 2FLOA 2XY8A 4PHTX 4CIFA 4FK4A 4N76A 4Z0UA 1IH7A 4OPAA 3VGMA 3NCIA 4WQ5A 3DRRA 4KHQA 3G71N 1TAUA 3WXLA 4WQ4C 1QSLA 3AA4A 4CZFA 4JI5K 2QXFA 3THWA 3ID8A 2Q97A 3VF4A 1NNEA 1SQKA 2KZZA 5J2QA 3QEVA 3MN5A 4JI3K 4IDHA 4CFDA 5LJWA 4OX9K 3LAKA 3MEDA 2OYQA 3D2EB 4IOXA 3H6EA 3P39A 4KH5A 1QSSA 1T6DA 4M41A 5BRHA 3P5JA 3NHGA 4FZXC 1XC9A 1RBTA 1B9DA 1TGOA 4EFHA 2A41A 3LM9A 2PY5A 3H3NO 2Q2RA 2DFEA 4MO4A 3HM8A 4CK2A 3K58A 3SJJA 4ILJA 3LZJA 2HHXA 4BRCA 2GELA 1JCGA 1WSHA 2JWLA 3SQ4A 1EP4A 4Z4FA 5AQVA 3CJ1A 1RCHA 1VQMN 3CJCA 1KAYA 3VQ7A 4JV5K 1RILA 4DR1K 3NGYA 4JI8K 1YVUA 2NRWA 3B8AX 3HYFA 3SAFA 3HVTA 5EU7A 3C95A 1DTTA 1RT2A 3KK7A 3KLEA 1ASVA 3SAHA 1HNXK 4CZHA 3I0SA 1IBLK 4FJLA 1CZBA 4BG8A 4OKKA 2OA8A 1Y64A 4BE2A 4DQIA 4F8RA 4J2EA 1YTAA 1VAZA 1RDAA 4BREA 2PYLA 5J2PA 1MDUB 3V1OA 3MXJA 3L2UA 1U2VA 3AVNA 1ATSA 4ISFA 3ZEUB 4DR3K 3C6AA 1Z05A 1TYQA 4PL7A 2VWJA 5GINA 1NM1A 1TK0A 4O0IA 2KFZA 3CFOA 4HVJA 2P9PB 4DWIA 3TSPA 3P4IA 5TKWA 3OVNA 4NLCA 4DSLA 4H5NA 3TAPA 2Q0UA 4GV6A 3F5TA 3OYIA 3KWGA 4AILC 3TAEA 4CJ3A 3KD1E 4CHNA 3AA3A 1X1PA 3AVKA 4KI4A 3L3VA 4FXDA 1HNVA 1VQ5N 1TKTA 3LP3A 1RBVA 3TAQA 4BRMA 4CESA 4X62K 4B3TK 1CXQA 3TSQA 3VESA 2HBLA 2HF4A 3U3YA 1S3XA 3DLRA 3THWB 3UB5A 5E84A 4IOCL 1OH5A 1YI2N 4CF2A 2VG6A 3NF6A 4FK2A 4FLYA 1RT4A 3H1VX 4FWOA 2Z1IA 1RT3A 4DR7K 1NGCA 2FC0A 3PO5A 4UQGA 2UXDK 3M8PA 3ZSWA 1T44A 2FF3B 2HHVA 1X3NA 1VRUA 3O5BA 2PYJA 4U7BA 1H1VA 3M1FA 4RCHA 4CZIA 4ISGA 4NXNK 3VEXA 4DFMA 4DV1K 1XI1A 1S6PA 3ZSVA 5LJVA 3DOLA 3OS2A 4DLGA 4KTQA 1C1BA 3DYAA 3MXMA 3KK2A 4IFYA 2XY6A 4RWTA 2F96A 3H1QA 3T19A 2YHWA 3AVBA 5FROA 3MCAB 3I33A 1WSJA 4IG0A 1VSEA 2CH6A 5KRSA 3WXKA 2DFHA 3V9WA 1NK0A 3B6PA 4FJ8A 1Q86O 3IG1A 4F2SA 3LPTA 3VTIA 3DLGA 3OY9A 2ASPA 3EL2A 3G25A 3L8BA 4YDUA 4JEPA 4OGEA 4GV9A 4J2BA 1JLBA 4PY5A 1DEJA 2D0CA 3P1GA 4UY8O 4FLZA 4CJ4A 4IJAA 4O0JA 3TTDA 1XHXA 4BE0A 1U2VB 3C6HA 4BRNA 2NNWA 5AQUA 3QEIA 1KC8O 5LL6Z 1TYQB 3QEWA 4FJ9A 3FZKA 4YHHK 2W40A 4DQPA 5KPRA 4Z4EA 2A40A 1NKEA 2IGIA 4OLBA 4B1YB 2O4IA 1BA0A 4A57A 3IDHA 3PIOL 4Z94A 1TL1A 1YJ9N 4LFAK 3VEZA 1JL1A 1P8ZA 1U4BA 1J9AA 3CM6A 3O8MA 3OYGA 4CEFA 4BR0A 1WLJA 2A42A 3AVFA 4B8AB 3V9XA 2XHBA 4GW6A 2YNIA 4PKIA 3O9TA 4DU4A 2HBKA 4DG1A 4W5TA 4KH6A 4MLEA 3AO3A 2GX9A 3WNEA 3ZLJA 3SQ1A 1YAGA 5KTQA 3NH0A 2ZD1A 1MWMA 2OTLN 4CD1A 3SUNA 4CZEA 2HOEA 3ZT3A 4B9LA 4CIEA 3R6MA 2WTUA 1KTQA 1C6VA 1N32K 4QCLA 2ZM6K 4RW7A 4XEIA 5KGWA 4LF5K 3SLCA 4OLAA 4B3SK 4IBNA 5SZTA 3UKUA 3VGKA 2BGGA 4OPHA 3NMUA 4DTOA 2QKKA 5BREA 2WUSA 4IFVA 2QKBA 4BC5A 1ZBLA 3CJ7A 2NRVA 2QWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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