4MLEA

Human glucokinase in complex with novel amino thiazole activator
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 159
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mleA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mleA01
1U2VA 3L0QA 3MN5A 3U9DA 1NGJA 2Q0UA 4CZGA 2P9IA 3ATVA 1Z05A 3D2FA 2V7ZA 2A3ZA 4MO4A 1U2VB 4FOEA 1YVNA 5AQZA 4BRMA 1OKJA 3VF4A 3FGUA 4FWRA 4J8FA 2ITMA 2IVPA 3LDQA 4BREA 1IG8A 2DPNA 2I7PA 4CZLA 3MCPA 2EWSA 4FPBA 3EZWA 3O5BA 3UKUB 3FZLA 1HKGA 2BUPA 5EOYA 4L3QA 3VF6A 1GLBG 1NGGA 4JAXA 3MN9A 4FWQA 2OANA 4DB3A 1GLLO 4HTLA 1XQSC 1JCFA 2V51B 2P9PB 2CH5A 5AQUA 4BRHA 4FWSA 3FZHA 4GNIA 4H5TA 4BRDA 4CZIA 4BRFA 1GLDG 1ZXOA 2J4RA 3QB0A 2FXUA 4CZMA 2FF3B 4CZJA 2IVOA 1HLUA 5AQOA 3DXMB 5AQNA 1QHAA 3QMLA 1BUPA 4RCHA 3WUHA 4ISEA 4BRCA 4Z94A 5AQWA 3KVGA 5FPMA 3WEEA 3ZETA 3R6MA 3UE5A 1Z6RA 3QFPA 3VGMA 3C0BA 5AFUA 4PKIA 1V4TA 3MN7A 3VOVA 4EAHD 1R59O 4WQ5C 1BOTO 3GE1A 4M7XA 5BN9A 4EFHA 4K41A 3RSEA 4A62A 2P9LA 3S41A 4BRNA 1GLJO 1E4FT 5ELZA 5KQ8A 1DEJA 1J6ZA 2IIRA 3QBXA 3ZX3A 1QZ5A 1ATNA 3CQXA 3SLCA 3L4IA 5AQLA 2GWKA 5LY3A 2VCPA 3LL3A 3VGLA 4NO7A 2E2PA 2P9PA 3SK3A 1GLFO 3DJCA 1XC3A 3W0LA 3B8AX 2QXLA 4BGAA 3VEYA 3A5MC 5CE3A 3ID8A 3O8MA 2D0PA 3UKRB 3FZMA 4IO8A 4H5VA 4FL9A 2P9SB 5BRDA 4O5FA 2QWQA 4BQZA 4BQLA 3IDHA 2ASPA 4H0TB 3U8XA 3O4WA 2P9UB 4KBOA 3M1FA 4IXCA 3DAWA 3KHYA 1RGIA 2QWOA 2W40A 3GBTA 4FSVA 5LJVA 4CBUA 3CJCA 1QQMA 3ENOA 3W3DA 4IJAA 4PL8A 3ZX2A 3VERA 3RSEB 3U9ZA 3VENA 1NM1A 2GUPA 4B1XB 1BDGA 4FPAA 3SJHA 2UYTA 2HOEA 1XUPO 3FFKB 3AARA 3LDNA 3CJ7A 4CD1A 5AQXA 1NGHA 2VYPA 5AQPA 2QWLA 1JCGA 3ENHA 3R8EA 2E2NA 3CI5A 5AQJA 4BR9A 4BR7A 2YHYA 4FO0A 3IFRA 4GY2B 4H0OA 1BU6O 3EKSA 1Q18A 3IMXA 4A2BA 1MWMA 3KZBA 5AZJA 3ULEA 3D2FB 1K8KB 4B9QA 2CH6A 3QBWA 3UKUA 2AP1A 4EHUA 1RFQA 3A0IX 2ZF5O 2FLOA 4CBWA 3CERA 4PL7A 2P9NA 2PBDA 1EQYA 2BTFA 4BRKA 1SQKA 2GWJA 1GLAG 1GLEG 3A5OC 3MDQA 2D1KA 3AAQA 4QS9A 4WYBA 4A2AA 4BC4A 5AQYA 2YJEA 3DWLA 3I33A 2F9TA 2HF3A 3FR0A 3ZEUB 3BUZB 4CI6A 4EIAA 4EHTA 4AM7A 3D7EO 4M7YA 4Y0WA 1HUXA 1BO5O 2YHXA 1T6DA 3DXKA 1TUUA 4I6MA 2P9IB 2IVNA 3BEXA 1X3MA 3A5LC 1HKCA 5BR9A 1HKBA 4H0YB 4B1ZA 5FPEA 4ISGA 5JICA 2D4WA 1P8ZA 3G25A 1ATRA 4BR5A 4FWKA 4H0XB 2FSKA 4NB4A 4BG9A 3O1BA 1YAGA 3WXIA 1HJOA 1T6CA 3TPQA 2PAVA 2YI1A 2A41A 1C0GA 4CD3A 4M63C 4BRQA 1TYQA 2A40A 5AQGA 2AA4A 3WXKA 1KXPA 2QWNA 4IWVA 4XH4A 3ZX0A 4QS7A 4H5NA 2CGLA 1C0FA 2E20A 3HI0A 2YCHA 1T44A 1BA1A 2ZGYA 3P4IA 5AQFA 2W41A 2A42A 1NGCA 4LC9B 1WOQA 3HBTA 4E1JA 2P9KB 5AQMA 2H3GX 4BR0A 1JCEA 3H3NO 3VEWA 3HTVA 1K8KA 5FPDA 3TU5A 1ZC6A 1NGEA 3FLCO 4JD2A 3ULEB 2Q36A 5F0XA 2YJFA 4QS8A 3AAPA 4H0VB 4DQ8A 2HF4A 5KPZA 4CZHA 4BVPA 3LDPA 5E26A 3D2EA 2WUSA 1YXQA 4BRLA 3CJBA 1QQOA 3A8YA 3H1QA 2Q31A 4IJNA 2KHOA 4IZ9A 3QDKA 4RTFD 2ASOA 1NWKA 2GELA 1V4SA 1TUYA 5EXWA 4XEIA 4WQ4C 5LJWA 4PKGA 1HX1A 4BC5A 5BREA 1NBWA 3VEOA 3LM2A 5AQSA 4BC2A 4JHDB 3VEZA 2F9WA 2FSNA 5ADXH 4C23A 1WUAA 4XH1A 5AQVA 1S22A 5ADXA 4H03B 4B1YB 5EX5A 1KAYA 3WT0A 2NZTA 2Q1NA 2Q97A 4FWMA 3D2EB 3WXJA 5FPNA 1DGKN 3VPZA 4CZEA 4MO5A 4XH5A 1BG3A 3CHWA 2A6AA 3LM9A 4K42A 1HPMA 4JNEA 5AFUH 3UB5A 1H1VA 1DKGD 3H3OB 4HWIA 5AQTA 3QICA 1QZ6A 1NLVA 4BR4A 1LCUA 4WQ5A 1X3NA 3BF1A 5JLFA 3VGKA 1MDUB 5AZIA 2E2OA 3UKRA 4CZFA 1U6ZA 1NMDA 1RDWX 5BPNA 5JLHA 3SMSA 4FWPA 1ZBSA 1IJJA 3VETA 5BPMA 3OHRA 3M6GA 4JD2B 4MLHA 3U4LA 4H5RA 4JHDA 3EL2A 3ATUA 5BRFA 5EVZA 2CGJA 4B1VA 2VWBA 3H1VX 3AY9A 3FZKA 2D0OA 4H5WA 2P9UA 5AQRA 4AM6A 2V52B 1MWKA 2GEMA 3MN6A 4K25A 4BVOA 5KPRA 4JN4A 3IUCA 1SZ2A 2HMPA 4ISFA 5E84A 3WEEB 2NLXA 2FSJA 3R9PA 1BWFO 3WQUA 3CJ9A 1TYQB 2Q2RA 4YDUC 3O1WA 2YHWA 3CIPA 3DXMA 5F1XA 3HSCA 5AQIA 5B8HA 4YDUA 4BC3A 2E8AA 2QW9A 4FWNA 3ZEUA 4BR2A 4BRAA 2P9SA 1SAZA 3H46O 3BP8A 2A5XA 1BA0A 4FOIA 1D4XA 3EO3A 4DHYA 5BN8A 4RWTA 2GTDA 3F9MA 5AR0A 2CGKA 3WXLA 3CQYA 4BRIA 3O6WA 5AZIB 3GL1A 3O80A 4WQ4A 4BRPA 1G99A 2P9LB 4MLEA 3JXUA 2ZWHA 2E1YA 3CETA 5KPTA 3GOIA 4PKHA 2NRHA 4DCHA 3FZFA 1Y64A 3CJ1A 3SMPA 1CZAN 1NGBA 4O8KA 1NGDA 3FE1A 3ZETB 2E2QA 3C7NB 3MMVA 3HZ6A 2P9KA 3O08A 4BG8A 4FWOA 3CJAA 2V7YA 3H45C 1X9JA 5JMVA 3A5NC 3H6EA 5BRHA 2QWPA 3I8BA 1LOTB 5AZJB 4CBXA 2E1ZA 3VF2A 3HM8A 2QWRA 1S3XA 1NGIA 1NGAA 3QFUA 4K43A 5AQHA 4FWLA 5F2RA 3LDLA 4A61A 4F9OA 2I7NA 3BF3A 2FF6A 5AQKA 1KAZA 1QQNA 3VESA 4I6MB 3LDOA 3L6QA 4CJ7A 4B1UB 5I9EB 1ATSA 1GLCG 3WQTA 2ZGZA 3EN9A 3GG4A 4BRGA 4BGBA 1E4GT 1YUWA 4H0PA 1NGFA 3JS6A 3MK6A 1MA9B 2ASMA 1KAXA 2E88A 4BROA 5BPLA 3J8AA 2QM1A 3DXKB 2Q0RA 2QWMA 5KQDA 3EKUA 3VEVA 4B1WB 1ESVA 5EY4A 3C7NA 4CZKA 5TKYA 3GDQA 2P9NB 5AQQA 3VEXA 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4NA 3THWB 4DWIA 3K0SA 2JWKA 1RDBA 4CZGA 3E9LA 1YJWN 1TAQA 3TAEA 3SQ0A 4F4KA 2A1SA 4FM1A 4MO4A 2HBLA 4CFCA 4J8FA 1JKHA 4X66K 2BH1A 3JSMA 2HMIA 4DUZK 2VWJA 4JI7K 4FZYA 4YY3K 4NCAA 3MCPA 3EZWA 3UKUB 3EY1A 4NCBA 1RTJA 4CJ5A 2PY5A 3T7ZA 1NGGA 1GLLO 4CJUA 4C8OA 5J2QA 4OX9K 3MXJA 1TK0A 4IG3A 4BRHA 1EETA 3CG7A 3FZHA 4CZIA 4Z4IA 3HP9A 4FLZA 4IFYA 2FF3B 4CZJA 1HLUA 5IWAK 4Z94A 5AQWA 5FPMA 3KKRA 4NXMK 2KFZA 4LFAK 1K6YA 1YITN 2QEXN 4GMJB 5M1NA 3VGMA 3C0BA 1VQMN 4B9TA 5KRSA 2KTQA 2HNZA 5BN9A 4G1QA 1IO2A 2VG6A 1FXXA 5KGWA 1U48A 1TKZA 4OLAA 1J6ZA 2IIRA 3KTQA 1QZ5A 1ATNA 3SLCA 5HRPA 3KK3A 1WB9A 4E7IA 2VCPA 1W7AA 2WFBA 2P9PA 1KLNA 3SK3A 1XC3A 2HHXA 3W0LA 3B8AX 1KVCA 4M3RA 4M3TA 5HLFA 3OJUA 4LFCK 2D0PA 3DYAA 4KPYA 1S9EA 5BRDA 1HYVA 1C6VA 4DKWA 4CJKA 4CF9A 1W9HA 1WLJA 3KKSA 1HJRA 1XWLA 2O8CA 2O8EA 3LP0A 4BQLA 3IDHA 4KBOA 3ZSRA 3DAWA 2W40A 1RT2A 3AO4A 3GBTA 4FSVA 1JLQA 2HHTA 3CJCA 2ZJPL 3H08A 2ZD1A 4FJXA 3ENOA 3W3DA 4KHWA 3ZSQA 4PL8A 1BQMA 5AJ3K 2P5OA 2D0CA 1TAUA 4DTPA 2UYTA 1KQSM 3AARA 1J9AA 3OYCA 2D0AA 3CC7N 1NGHA 1HRHA 1XNRK 3AO3A 5AQJA 1J5EK 2X78A 1CZBA 4FJHA 4H0OA 4GY2B 3TAGA 1B9DA 3SUNA 1Q18A 4YOYA 3ULEA 2B4JA 4DR3K 1X9WA 1K8KB 2O4GA 4CEFA 3G0ZA 3A0IX 2FLOA 3LZJA 4CBWA 3EYZA 4M3YA 2GX9A 3TWHA 2P9NA 5I42A 3BY5A 4DTSA 4CHZA 1EQYA 4ZTJA 1SQKA 3DLBA 1YJNN 3HRGA 3J7AP 3MDQA 3MECA 4E7HA 3AAQA 5FROA 4A2AA 3OYDA 1CXQA 2YJEA 4CK3A 3AA3A 1LW0A 3TAQA 4AHSA 4LD0A 3AVGA 2YHXA 3WNFA 2P9IB 4OKEA 1KTQA 3BEXA 1NK7A 1HKCA 1WSJA 4I2PA 4H0YB 1BISA 4OKKA 3THXB 1G15A 3CM6A 4DSLA 4DTUA 3G25A 3AVHA 2FSKA 3TI0A 2XY5A 4FK4A 4DG1A 3TAMA 1YJ9N 1U47A 3QIPA 4J2EA 2DTUA 1WSIA 4FJNA 1RTDA 1HYSA 3TSQA 5CZ2A 1SKSA 4BRQA 1NJWA 1TYQA 4BE1A 2UXBK 3NGIA 3RMCA 2LSNA 2G8HA 2QKKA 1KXPA 3AVIA 4AHUA 2OTLN 2E20A 3OYBA 3DRSA 2A1RA 4LF9K 3P4IA 2ZGYA 2W41A 4F2SA 2R7YA 2VGNA 1Q9YA 4KHSA 5AQMA 4FK2A 3HJFA 2ZM6K 1ZC6A 2HBJA 1HNVA 4NXNK 4Q0BA 1NJIO 3LP3A 1OH8A 3VTIA 4BVPA 3OY9A 1QE1A 1ASUA 4DU1A 1YXQA 1S1UA 3RRHA 4LY7A 2Q31A 4IJNA 2KHOA 2GELA 1VSMA 4HHTA 1GOBA 5C15A 1V4SA 2BANA 1NK0A 4WE1A 5LJWA 4DV6K 1TKTA 4JHDB 3MCAB 1RT7A 4NYFA 3VEZA 4JRPA 5M1OA 1NKBA 2X6NA 4IBNA 1W2BM 3ASMA 3LANA 1A5WA 1WUAA 3O3FA 4JKEA 4XH1A 5AQVA 5DK5A 1FKOA 4KTZA 2FC0A 4FW2A 2HBMA 3WT0A 2F4VK 3HL8A 4I9QA 5M1PA 5C0YA 4WCEL 1KD1O 3CHWA 3DLRA 4GV6A 3PY8A 1IKVA 2O8CB 4CFDA 3OYLA 3CMAN 1DKGD 3RMBA 5CYQA 1T7PA 4BR4A 3L4QA 3MX5A 1KC8O 5IT9O 1NNEA 1RT3A 5AZIA 4U7BA 1NMDA 4AHRA 1RDWX 1RBRA 4DMNA 3VETA 2XY6A 2VQEK 5BPMA 3M6GA 3WNEA 2XY8A 5M1QA 1F21A 4JYAK 3EL2A 4C8NA 4Y1DA 3SNNA 1XC9A 2VWBA 3H1VX 3VMFB 5J2MA 4YOVA 5AQRA 3AO1A 5J2NA 2YNFA 3DLEA 4BDZA 2WBNA 2GV9A 4N56A 4AHCA 2HMPA 5GAGP 3WEEB 1N36K 3V9SA 2IAJA 2KW4A 3ZT0A 1JJ2M 2WOMA 1NMNA 3NGYA 2YHWA 3CIPA 3DXMA 5B8HA 1N34K 4M3XA 1IBMK 3R3LA 1TKDA 3VQAA 4AQYK 2QW9A 1C1AA 3C6AA 4BRAA 1SAZA 4OPKA 2RN2A 3BP8A 2ZJQL 2A5XA 1BA0A 4RWTA 2CGKA 4BRIA 1S72N 1HNWK 4KHYA 1TGOA 4BRPA 4CEBA 2ZWHA 3CETA 1S9GA 5KPTA 4DLGA 3GOIA 4C8MA 2NRHA 4B3RK 1Y64A 3SZ2A 4DTMA 3SV3A 4JV5K 3NDKA 5GAHP 4B9SA 1RDDA 4CGIA 1YTUA 1S1VA 4LH5A 4OGEA 5GIOA 4BG8A 1X9JA 1LWFA 2O8FA 4AHTA 5SWMA 4JS5A 4CJTA 3VF2A 1K9MO 1BI4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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