4MLEA

Human glucokinase in complex with novel amino thiazole activator
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mleA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mleA01
3VOVA 1U6ZA 5BPMA 3DXMB 3W3DA 5KPRA 1ATNA 3H1QA 3EL2A 4BRFA 1SZ2A 1HKGA 3BF3A 2I7PA 5AQLA 2BUPA 2Q1NA 4BR5A 3KHYA 4BR9A 4CD3A 3QFUA 1BUPA 4QS9A 4FOEA 2D0OA 3G25A 3QFPA 5ADXH 4HWIA 2VCPA 3JS6A 1HKBA 1E4GT 2P9LA 4CZFA 1NWKA 1GLAG 4FWKA 4IJAA 5LJVA 5E84A 5AQFA 1BO5O 3HBTA 2QWRA 1C0GA 1D4XA 5KPTA 3UKRA 2E1ZA 1BA1A 1BOTO 4B1ZA 3CIPA 3HTVA 4JHDB 2GELA 4JD2A 1QZ5A 5LJWA 4AM7A 3FZMA 4M63C 3A0IX 3EO3A 4MO5A 3SJHA 4B1XB 1NGFA 3U8XA 3VENA 1NGAA 2P9SB 1XUPO 2IIRA 1BDGA 4XH4A 3FZKA 3EN9A 3FE1A 3ULEB 4B1YB 4BGBA 5KQDA 1XQSC 2NRHA 2Q0UA 4FWPA 4FWLA 2ASOA 3UKUA 4XEIA 4BR2A 3DWLA 4BC5A 4H0PA 4B9QA 1DEJA 4BR7A 5EVZA 4AM6A 2FSJA 3MMVA 1TUYA 2P9NB 4JAXA 3ZETA 3QBWA 4Z94A 2NLXA 3DJCA 3H3NO 2E2OA 2W41A 1ATSA 3HM8A 2GWKA 5BR9A 1YUWA 5AQKA 2V7ZA 3O1WA 1QHAA 1YXQA 5AZJB 5BN9A 3BUZB 3J8AA 1S22A 3EKSA 3BP8A 3U9ZA 1NGBA 4F9OA 1YAGA 1H1VA 3L4IA 1IG8A 2E8AA 2PAVA 2FF3B 3WQTA 3BEXA 4B1UB 2CGLA 3CETA 4O8KA 4FPAA 4BG9A 4CBWA 3QBXA 1QQMA 2FSNA 4FL9A 1JCEA 4QS8A 4RCHA 3ZEUB 4BRIA 5AQUA 2A42A 3CI5A 3W0LA 1YVNA 5AFUH 4BRCA 2CH6A 2E2QA 1U2VA 2YHWA 5B8HA 2ZWHA 4WQ4A 2E2NA 3VPZA 1EQYA 2ZGZA 2P9UB 4CZMA 2GUPA 4H0YB 3AARA 1QQNA 3ENOA 5AQPA 3CJ9A 2A40A 4A2BA 4FO0A 4BG8A 4CZIA 4BR0A 2HF3A 5AQJA 1Q18A 4PKIA 2D1KA 3WQUA 1K8KA 3D2EA 4BRKA 2QW9A 3H46O 3DXKB 4EAHD 2P9KB 4IO8A 3GL1A 3O6WA 4M7YA 5AQIA 2P9PA 4PL8A 4BVOA 2QWNA 2HMPA 2BTFA 4JN4A 1WOQA 3B8AX 3VESA 4BRQA 1S3XA 4ISFA 3C7NB 1TYQA 4HTLA 4BQZA 2AP1A 2I7NA 3GG4A 3R6MA 4IJNA 5BREA 3EKUA 3LM9A 5EXWA 2YCHA 5AZIB 1MA9B 1NGDA 2GWJA 4FWRA 4FOIA 3LM2A 2A41A 2ITMA 3U9DA 1E4FT 3SK3A 4I6MA 2Q36A 1ZXOA 3BF1A 2GEMA 5AQOA 1BWFO 3UE5A 3CHWA 3TPQA 3A5MC 3HZ6A 3D2FB 3MN7A 2IVNA 3R9PA 3LDQA 5FPDA 5JMVA 1BU6O 3DXMA 5BN8A 2QWMA 1DGKN 1NMDA 4BRHA 2Q0RA 1BA0A 2HOEA 3UB5A 4CD1A 2PBDA 3GOIA 1ZBSA 2F9WA 3F9MA 3GE1A 2DPNA 4WQ5A 5JLFA 5E26A 2E1YA 2J4RA 2GTDA 4ISEA 3VEWA 1ZC6A 3L6QA 4IWVA 3MN6A 1MWKA 3FR0A 3O4WA 3FZFA 2Q97A 1NBWA 4CBXA 2YHXA 1G99A 5AQHA 5CE3A 3HI0A 5AQWA 3VGLA 4FSVA 4FWNA 5EOYA 3C0BA 3VEOA 1NLVA 4FWMA 2YI1A 4GNIA 2A6AA 4NB4A 4QS7A 1HPMA 3TU5A 3VF2A 4EFHA 4JHDA 3QDKA 2V52B 1JCFA 3ATUA 5AQTA 5F1XA 1OKJA 1SAZA 4BRGA 4NO7A 1GLCG 3RSEB 2P9SA 3VF6A 4BROA 4CZGA 2QWQA 5BPNA 2V51B 2Q2RA 3ULEA 4YDUA 1NGGA 4BQLA 3H3OB 1Z6RA 1HUXA 4FWQA 3IMXA 5AR0A 4CI6A 3M3ZA 5BRDA 3FZLA 1QQOA 5AQMA 4BC3A 4CBUA 1RFQA 1KAZA 3CJAA 2P9IB 5AQRA 1QZ6A 1GLFO 4H0OA 3CJCA 3WXIA 3LDNA 2P9NA 2NZTA 2QWOA 5ELZA 1NGCA 3VEYA 5EY4A 3GDQA 1KXPA 1T44A 4EHUA 3WEEB 5KQ8A 1NGHA 3WT0A 5F2RA 4PL7A 1X3MA 1IJJA 3ID8A 3ZX2A 4BGAA 1V4SA 1T6CA 3LDPA 2VWBA 1NGIA 2D0PA 4CZLA 5AZJA 4EHTA 1MWMA 2QXLA 1SQKA 3CJ1A 5AQNA 2ASMA 4DQ8A 4IXCA 2H3GX 5JICA 4H0VB 4E1JA 4XH1A 5AFUA 3ATVA 2KHOA 1Y64A 3CQYA 1TUUA 4RWTA 3ZEUA 2P9LB 5LY3A 3VF4A 1GLEG 4H0TB 3S41A 3R8EA 4BC4A 3WUHA 3UKRB 4BC2A 4WQ5C 3AAQA 4B1WB 2V7YA 2WUSA 2CH5A 4CZHA 2QWPA 4JD2B 4XH5A 3FGUA 1RGIA 3A5OC 2P9UA 2VYPA 4MLHA 3LDOA 3H6EA 2YJFA 4FWSA 5FPEA 1X9JA 4BRPA 1NM1A 4H5RA 1MDUB 4A61A 4BRLA 5BRFA 3JXUA 3IFRA 1X3NA 3O08A 3SMPA 5JLHA 4K43A 4O5FA 3UKUB 4CZEA 3GBTA 1HJOA 1WUAA 3DXKA 1P8ZA 2P9KA 1DKGD 4K41A 2A3ZA 5ADXA 4GY2B 1JCGA 1J6ZA 1GLBG 4PKGA 5AQZA 3SLCA 2A5XA 3MDQA 3ZETB 2FLOA 1C0FA 2QWLA 3OHRA 4WYBA 4H5TA 4YDUC 4BRMA 3C7NA 3QMLA 2W40A 1KAXA 4IZ9A 2D4WA 3VEVA 3A5LC 3FFKB 3LDLA 2CGJA 4BR4A 5AZIA 5EX5A 2UYTA 4H5WA 2IVPA 5TKYA 5BRHA 3CERA 1LCUA 4PKHA 5AQQA 4DHYA 3DAWA 4K25A 1HKCA 1HX1A 3D7EO 4H0XB 4JNEA 3VERA 2E20A 3O5BA 3QICA 4M7XA 2FF6A 5AQXA 3D2FA 3CJ7A 2FXUA 4WQ4C 1CZAN 3WXJA 3ZX0A 3A5NC 3CJBA 5AQGA 4DB3A 4MLEA 3LL3A 2E2PA 3I33A 2FSKA 3FLCO 3SMSA 2ZF5O 3O8MA 3VGKA 1Z05A 3O1BA 5F0XA 4H5VA 3KVGA 1U2VB 3VEZA 1ESVA 4BRDA 4L3QA 2YJEA 4H03B 2OANA 3CQXA 1LOTB 3MN5A 1R59O 4KBOA 3VETA 1GLDG 1NGEA 4B1VA 1T6DA 2Q31A 2ZGYA 4J8FA 4A2AA 3EZWA 4BVPA 1V4TA 4FWOA 3U4LA 3MCPA 3HSCA 2E88A 2F9TA 3IDHA 3L0QA 2AA4A 2CGKA 1HLUA 5FPMA 1ATRA 5BPLA 3H1VX 5AQSA 2IVOA 2YHYA 5I9EB 4BRAA 4CZJA 1KAYA 3P4IA 4A62A 3QB0A 1XC3A 3WXLA 4BREA 1K8KB 3D2EB 3FZHA 3ZX3A 1GLJO 3RSEA 3KZBA 3ENHA 3MK6A 1GLLO 2QM1A 3A8YA 3MN9A 1RDWX 2P9PB 4DCHA 4BRNA 4EIAA 2EWSA 5KPZA 4ISGA 4Y0WA 1TYQB 2P9IA 3VEXA 3M1FA 3H45C 4FPBA 4CZKA 5AQVA 4CJ7A 1NGJA 4H5NA 2HF4A 2ASPA 3AY9A 3I8BA 3M6GA 4K42A 3WXKA 4I6MB 3VGMA 3WEEA 4RTFD 4C23A 3O80A 5FPNA 4LC9B 1BG3A 3IUCA 4MO4A 3AAPA 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LH5A 3AV9A 4ELVA 2UXCK 3DXMB 3M8RA 3C6HA 1NJZA 2FBYA 1EETA 3ZYYX 5AQLA 2UUCK 2BUPA 1BGXT 2Q1NA 4BR5A 4FOEA 1W0HA 1KVBA 3SUQA 2D0AA 4CJEA 4DS4A 2AJQA 4JK9A 5ADXH 4AHVA 4HWIA 1E4GT 3J7YP 1OVYA 4CZFA 3VQ6A 3N4PA 3ZT1A 1ZBFA 2QI2A 5AQFA 4CK1A 4HCBA 3HBTA 3L3VA 1WSEA 3MECA 4YOYA 3TARA 4CJPA 3UKRA 4E89A 2E1ZA 3HTVA 4HVJA 1O13A 2GELA 2GV9A 3L8BA 5LJWA 1TK8A 3LPTA 3MX2A 3U8XA 1GOBA 1YTAA 3N4QA 4CF9A 1EX4A 1RCHA 3CCJN 4XH4A 3EN9A 3FZKA 1DTTA 1NNEA 2O8BB 1Z25A 2NRHA 3I55N 2WTUA 3F73A 1T03A 4IG3A 4B8AB 4BC5A 2R7YA 1RBVA 3LAMA 4H0PA 4CK3A 1DEJA 4BR7A 5EVZA 4E7IA 4AM6A 2FSJA 1RNHA 4ID1A 2P9NB 1VQON 3F5TA 3AO2A 4Z94A 4DLEA 2X78A 2HW3A 3SQ0A 1YUWA 3L2UA 1HPZA 3NH0A 2V7ZA 3SQ4A 1NKCA 3O1WA 3TTFA 1OH5A 1QHAA 4JLHA 1KD1O 1N34K 1I94K 1WAJA 3KTQA 1TL1A 1NK6A 3SUNA 3O3FA 2P51A 3U9ZA 1NGBA 1YAGA 3L4IA 1CXQA 4NXMK 3BEXA 1J9AA 4B9LA 2CGLA 2UUAK 4FPAA 4CBWA 1RTJA 3ALYA 3VQDA 3OYAA 4B3OA 2G8KA 1JCEA 5J2PA 1L3VA 3CI5A 3W0LA 4JKCA 4GV6A 3JYTA 1O1WA 4J2AA 2YHWA 1Q9XA 3E1YA 3ZSQA 1YJWN 4LFCK 1FKPA 3Q7BA 5C24A 1RDBA 3CD6N 4C8LA 4OLAA 4FJ5A 2GUPA 4AHUA 2YV0X 3OYDA 3ENOA 5AQPA 4E7JA 2UUBK 1VSDA 3K9KA 4WFBL 3LP1A 4N5SA 3KWIA 1K8KA 3V4IA 4IFYA 3DXKB 4IO8A 3GL1A 3OY9A 1HQEA 2X6SA 4DF8A 3ISNC 4BVOA 2KFNA 4DUZK 2BTFA 3QNOA 4FJ8A 2DTUA 1S3XA 4ISFA 4W5OA 3HPOA 4BQZA 3GG4A 4DTNA 1VSMA 3EEQA 3ZSYA 4WFNL 1JXBA 4F4KA 4LFAK 3CFRA 2QK9A 4NLCA 4NCGA 5C25A 2Q36A 3LP2A 3T7ZA 3TI0A 4DSJA 1NK9A 3UE5A 3OW2M 2BANA 3R3LA 5IT9O 3QINA 4K8XA 3R9PA 3KK2A 4I9LA 2QWMA 1DGKN 1NMDA 3AO5A 2YNHA 2JLEA 3K5NA 4HTUA 2XY7A 3S3NA 3GOIA 4KHQA 1ZBSA 1EWRA 3F9MA 4WQ5A 4OLBA 5E26A 3L2VA 2J4RA 3KD5E 4YNQA 3VEWA 3L6QA 5C2DA 4FK0A 1MWKA 3FR0A 2A1SA 1TKTA 1NBWA 4CECA 1G99A 1JJ2M 2O8FA 4GMJB 1NK5A 4JKGB 1NLVA 4FWMA 4HHTA 4NB4A 1HPMA 3P1GA 3K58A 2NRZA 3QDKA 3LP0A 2V52B 1ITGA 1Q82O 4O44A 4BROA 5C42A 2IAJA 5I3UA 5BPNA 2V51B 3OYNA 3ULEA 1BIUA 4HUEA 3H3OB 5AR0A 3M3ZA 3FZLA 5AQMA 1KAZA 3CJAA 2P9IB 3CM6A 4H0OA 1HQUA 3HPGA 3WXIA 4PA1A 2NZTA 4AHRA 3PY8A 1NGCA 3VEYA 5EY4A 4AH9A 4QCLA 4DR1K 1LV5A 4EHUA 1YVUA 3LZIA 1JXEA 2XY5A 1X9MA 1IBLK 1YHQN 4M3TA 1IJJA 3VN5A 4FLYA 3OTOK 3QEPA 5AZJA 3H08A 1RT1A 5KGWA 4CIEA 1MWMA 3NAEA 4JI2K 4B9MA 1SS6A 4DMNA 1S9GA 3HOSA 2WFBA 5GINA 3KLFA 4XH1A 5AFUA 3ATVA 4CEAA 4FJGA 3ZEUA 4EP5A 4H0TB 4CJUA 5MLCQ 3S41A 3VMFB 4W5NA 4BC4A 1EKEA 4WQ5C 2V7YA 4JI6K 3CMEN 4EZ9A 5JVGL 1RGIA 3A5OC 2VYPA 4DUYK 3LDOA 3OS1A 3CM5A 5FPEA 3LDSA 1X9JA 4WFAL 3IAYA 2ZJRL 5GAEP 1MDUB 2ZE2A 4CIGA 5BRFA 3THYB 3IFRA 4AQYK 1VQ6N 3O08A 3D45A 4K43A 4FVUA 1Z26A 3DLRA 1RBSA 2P9KA 3RMBA 3THXA 5ADXA 5AQZA 3SLCA 5M1KA 3CCMN 4H5TA 4BRMA 3KKSA 4LH4A 4ZHRA 5M1NA 1RDAA 3C7NA 3M8QA 1XMQK 2W40A 2VWJA 3A5LC 2Z1HA 4MDAA 3TABA 4L8RB 4K0KK 2W6KA 5AZIA 4FJLA 4GV9A 4N47A 4OO1J 1NJYA 3CERA 4E1MA 1LCUA 3AA5X 4B9TA 3HVRA 2DFFA 1UA1A 3VQ8A 4LSNA 1TK5A 4JNEA 1SL2A 2KTQA 3QICA 1NOYA 1VSKA 3D2FA 3CJ7A 3VQQA 2VG7A 3VQCA 3CCSN 3PX6A 2KFZA 4MLEA 1ASWA 4Q5VA 3LL3A 1RT5A 3B6OA 3C6AA 3I33A 1XMOK 4CJ4A 3J80O 1IKYA 3U3YA 2HBLA 4H5VA 4IFVA 4YHHK 3HP6A 3L2WA 2OANA 5D3GA 4IBNA 1GLDG 1NGEA 2ZGYA 3DLBA 4BVPA 2HHSA 3OA9A 4DR2K 3CPWM 3TANA 4O4GA 4A57A 2AA4A 5FPMA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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