4MLEA

Human glucokinase in complex with novel amino thiazole activator
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 159
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mleA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mleA01
1YAGA 3C7NA 4BR0A 4CZHA 4BRHA 5AQFA 1NLVA 2QWNA 5FPNA 4IZ9A 4PKGA 3EO3A 1LCUA 5AQZA 4CZGA 5ADXA 3L6QA 1K8KB 5BPNA 1XUPO 2KHOA 5AZIB 1HUXA 2E20A 1KXPA 1QQMA 1BA1A 3HSCA 2P9LB 4WYBA 5E26A 3GBTA 3J8AA 4ISGA 4CBWA 1ZC6A 5KPTA 2YHWA 4ISFA 3FLCO 1U2VA 2P9SA 4H03B 2GWJA 4XH1A 4JN4A 3UKRB 4I6MA 4AM6A 5AFUA 2VCPA 1G99A 2PAVA 1YUWA 2P9PA 2NZTA 4EAHD 4KBOA 5BPMA 3RSEB 2Q31A 2A42A 3DWLA 3WT0A 3CERA 5AQSA 4BC4A 5AQYA 4H0YB 1BU6O 3O08A 5AQOA 3IMXA 4PL7A 3ULEB 2HMPA 3A5NC 1NGCA 2FF6A 3U9DA 4H0PA 2FF3B 3CJ9A 4B9QA 4FSVA 3MK6A 2CGLA 4BRNA 4FWPA 1NGGA 3WQUA 1NWKA 1D4XA 4FWRA 3BUZB 1JCEA 3TU5A 2A40A 4H5WA 4PL8A 1R59O 3HTVA 2BTFA 3BP8A 4HWIA 1H1VA 2P9IA 1JCFA 2V7YA 1Q18A 3SMSA 3UKUB 1C0GA 4FWNA 1TYQA 3LDLA 3DXMB 3KVGA 4MLHA 3HZ6A 3MN9A 2DPNA 4BR9A 3QICA 3VF6A 2FXUA 2E2QA 1GLFO 2YCHA 4IJAA 5AQRA 1ATSA 1QZ5A 3ZETA 2IIRA 4B1XB 4GNIA 4ISEA 4DQ8A 3SJHA 4BQZA 1ATNA 4K41A 1TUYA 2IVNA 4CZJA 5AQMA 1Y64A 1HJOA 3CQXA 5AQKA 3KZBA 5BREA 1NGFA 4BC3A 2YJEA 2AP1A 4K42A 5AZJA 2YJFA 2Q2RA 3I8BA 1GLAG 3GL1A 4BG8A 4B1WB 4H0VB 3AAPA 4BREA 5CE3A 4YDUC 2P9KA 5JLHA 1NMDA 3IUCA 1NGHA 3B8AX 3VERA 3LL3A 4YDUA 4EHUA 4H0OA 4A2AA 4BRPA 3CQYA 3ZEUA 2E1YA 2FSNA 1NGBA 4MO5A 1U2VB 2QWQA 4H5VA 5LJVA 1QHAA 3M6GA 3LM2A 3FR0A 2ZWHA 1IG8A 2D1KA 1LOTB 4BRMA 3IDHA 2CH6A 3C0BA 3CETA 3ATUA 3FZLA 4M63C 4XH4A 3FGUA 4M7XA 5AQUA 3U4LA 4HTLA 4BRLA 2GUPA 4LC9B 1NM1A 4CD3A 1ZXOA 5BPLA 1YVNA 4CZKA 4JHDA 2IVOA 5FPDA 5JLFA 2ITMA 5AQPA 2P9UA 2UYTA 3DXKA 4JD2A 1CZAN 5BRHA 2Q97A 1BUPA 3ENHA 4PKIA 3D2FA 3SMPA 4FOEA 2VYPA 1SZ2A 3CJ1A 3QFPA 1Z05A 1X9JA 2E2OA 4WQ4C 5AQNA 4BG9A 3DAWA 2E2NA 4K25A 3SLCA 2P9NA 5TKYA 5I9EB 1RGIA 4XEIA 3CJBA 3QBWA 4WQ4A 2OANA 4CZMA 1T6CA 1MWMA 3CJ7A 3CHWA 2QM1A 5AQIA 3WEEA 2ASMA 1WOQA 4RWTA 4JAXA 3OHRA 1SQKA 1QQOA 1GLEG 2A3ZA 3WXIA 4MO4A 3H45C 3VEXA 3VF4A 1ZBSA 5FPMA 1DEJA 2D4WA 1HLUA 4BR4A 2CGJA 4B1UB 3S41A 4FWMA 5EVZA 1JCGA 1QZ6A 3O4WA 2EWSA 3AARA 3HBTA 3FFKB 1E4FT 2J4RA 2GWKA 2F9WA 3VEWA 1T6DA 2I7PA 2A5XA 4BRCA 3ZX2A 3LDNA 4BRKA 4CI6A 3BF1A 3ZX0A 1NGEA 3JS6A 4FWKA 2NLXA 5EX5A 3ATVA 1BG3A 3ENOA 3I33A 5AQXA 1GLBG 1YXQA 2E1ZA 4AM7A 3U9ZA 2QXLA 1WUAA 4RTFD 5F1XA 3R9PA 4Z94A 3FZFA 4B1ZA 1EQYA 4FWOA 3MN7A 2GEMA 1K8KA 3D2EA 3VEZA 3LDPA 5AQQA 4B1VA 4BRDA 2Q1NA 1GLLO 3GDQA 5AZIA 2V51B 3EKUA 5KQ8A 3QBXA 3FE1A 3KHYA 4IJNA 5KQDA 5E84A 5FPEA 4IXCA 1HKCA 2YHYA 3C7NB 3VETA 3MDQA 4QS9A 4CZLA 2H3GX 1HX1A 2Q36A 3EKSA 3LDOA 3ZX3A 4BROA 2FSJA 2YHXA 2Q0RA 5AQJA 1KAZA 2ASPA 3FZMA 4NO7A 1BWFO 3UKRA 3FZHA 3VF2A 1IJJA 4F9OA 5AQLA 1NGDA 2QWLA 1XC3A 2YI1A 4H5TA 3WUHA 4EFHA 2VWBA 3D2FB 1XQSC 3M1FA 3RSEA 3D7EO 4BRFA 1S22A 3W0LA 3QMLA 3CIPA 1GLDG 2W41A 4IO8A 5LY3A 3BEXA 2P9NB 5AQTA 2HOEA 4BR5A 5KPRA 2P9SB 1BO5O 3MN5A 3GG4A 1SAZA 3QB0A 3QDKA 4FL9A 4PKHA 4DB3A 4I6MB 5B8HA 3A5OC 3BF3A 4L3QA 3MMVA 1HKBA 4H5RA 5ELZA 2P9PB 3TPQA 3VEYA 5JMVA 4H5NA 4E1JA 5ADXH 3VEVA 5AR0A 4WQ5C 4BR2A 3W3DA 3UKUA 1RFQA 3AAQA 2QW9A 3H3OB 4H0TB 3VENA 4BR7A 3M3ZA 4MLEA 4WQ5A 4O5FA 3L0QA 2PBDA 4IWVA 3H1VX 3LDQA 3P4IA 2HF4A 3GE1A 3IFRA 4XH5A 3EL2A 2A6AA 3WXKA 3O1BA 4QS7A 2ZGYA 1V4TA 5AFUH 5JICA 3AY9A 4A2BA 4BVOA 4JNEA 2P9IB 1HPMA 3O80A 1TYQB 3CJCA 3O1WA 4BGBA 3JXUA 2GTDA 4RCHA 2E8AA 2FLOA 4O8KA 3D2EB 4C23A 1DGKN 3FZKA 2BUPA 4BRIA 1Z6RA 2F9TA 2D0OA 3ZETB 3VEOA 2I7NA 3O6WA 1ESVA 4FOIA 1X3NA 3WQTA 4Y0WA 3WXJA 1MA9B 3R6MA 5F0XA 2GELA 5AQGA 5EY4A 3H6EA 4A62A 2HF3A 2E2PA 1NBWA 4GY2B 5LJWA 5AZJB 2V52B 3H46O 2QWOA 2P9KB 4K43A 4BVPA 4BC2A 1QQNA 1E4GT 4B1YB 1GLCG 2Q0UA 5AQWA 4FWLA 3VOVA 4DHYA 3G25A 3ZEUB 1X3MA 2ASOA 1TUUA 2WUSA 5EXWA 4FWSA 3O8MA 4FO0A 4A61A 2QWRA 4CBXA 5KPZA 2P9LA 2CH5A 1RDWX 5BN8A 5AQVA 3A8YA 4M7YA 5BRDA 3F9MA 4FPBA 1P8ZA 3CI5A 4JHDB 4DCHA 1J6ZA 4BQLA 4CBUA 1HKGA 3SK3A 2ZGZA 1BOTO 2D0PA 2P9UB 1NGAA 3H1QA 3DXKB 4JD2B 4NB4A 1NGIA 2W40A 3VESA 4QS8A 4EIAA 4CZEA 3EN9A 2QWPA 2E88A 1BDGA 3L4IA 3A5MC 4H0XB 2CGKA 4CZIA 4BRAA 1S3XA 4EHTA 1GLJO 3GOIA 3VGMA 3O5BA 3WXLA 1U6ZA 1V4SA 3R8EA 3ULEA 3ID8A 3U8XA 2IVPA 3MCPA 5BR9A 3LM9A 3UE5A 2AA4A 2A41A 3A5LC 1T44A 3VPZA 3WEEB 3MN6A 4FPAA 2ZF5O 1ATRA 5F2RA 5AQHA 1C0FA 2QWMA 3QFUA 3CJAA 3DJCA 3HM8A 4BC5A 1MWKA 2V7ZA 3HI0A 5BN9A 3EZWA 1BA0A 1DKGD 1OKJA 4BGAA 1NGJA 1KAYA 4CJ7A 1KAXA 3DXMA 2NRHA 4J8FA 4FWQA 5BRFA 3H3NO 4BRGA 3UB5A 2FSKA 3VGLA 1MDUB 3A0IX 3VGKA 4CZFA 4BRQA 5EOYA 4CD1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHQA 1S1TA 4RG8A 4B3OA 4CZHA 5D3GA 5AQFA 1DLOA 4BDPA 1KFSA 4DU1A 3M8PA 1Q81O 4BACA 4IZ9A 1QVFM 4JI2K 1LCUA 3OYEA 2G8KA 3NF6A 1HMVA 1XUPO 1W97L 1FJGK 2E20A 1BA1A 1ZBIA 3OYJA 5KPTA 3CM5A 1ZC6A 2YHWA 3K0SA 3ZSRA 3FLCO 1U2VA 4CJKA 2A1SA 1IH7A 2YNGA 4I6MA 2HNZA 2VCPA 5M1KA 1QSLA 4KHNA 1RT1A 4JI6K 4E7IA 2P9PA 2OTLN 3KD1E 1MU2A 1Q86O 1N8RO 4JK8A 3TARA 2O8DB 3IAYA 1B9DA 1LWFA 1WBBA 3M8SA 3SPYA 4H0YB 1RTJA 4WFBL 4DSKA 4PL7A 2HMPA 2FF6A 1RDDA 1QS4A 1IBLK 4B9MA 2HBLA 3K2PA 1KTQA 3P5JA 3MK6A 3K9JA 4FWPA 3OYAA 2ZM6K 3K58A 1L3VA 3WQUA 1IKYA 1NWKA 4NLBA 4JKAA 1R59O 4CJ4A 1XNQK 3CM6A 3VQPA 2P9IA 3SMSA 3OYLA 1OH8A 4LD0A 1RBRA 3KVGA 3AVMA 1K8AO 4HCCA 3CYMA 3HZ6A 2DPNA 2KZMA 4DTOA 4JI7K 3RTVA 2OYQA 2YCHA 4IJAA 5AQRA 5DM7L 3NF7A 2HBMA 3ZETA 2E6MA 2UXDK 3LALA 3L3VA 5AQMA 5BREA 2VQEK 3DLLL 4CK3A 5AZJA 2YJFA 4BREA 4H0VB 5JLHA 2NRZA 2QKBA 1HYZA 5HRPA 3B8AX 4YDUA 4JKGB 5LL6Z 4H0OA 4CJEA 3SCXA 3CQYA 2W42A 4C1NK 3QNNA 3I56N 1NNEA 2UXBK 1J54A 4MO5A 4ELVA 3HO1A 1VRUA 4C8LA 2UXCK 2OTJN 3EZ5A 4B9VA 3SUOA 3RMCA 4AHSA 3KK3A 2D1KA 3CMEN 4M7XA 1ASUA 1VHXA 4HTLA 3E66A 3VQ6A 4LC9B 2HB5A 3IG1A 5BPLA 3UIQA 1HNXK 4CEQA 1CZ9A 1NK8A 1N32K 5FPDA 1VSKA 4M3WA 3SJJA 3WNEA 2P9UA 4JS5A 4DFKA 1CZAN 4IBNA 2Q97A 4M3TA 4M42A 2DY4A 2O8FA 1JLQA 2OZMA 3HVTA 1YHQN 4LH4A 4JRPA 1JLGA 1XC9A 4BG9A 3KKSA 5I42A 1B9FA 2HBJA 3SLCA 4DS4A 3QO9A 2P9NA 1RGIA 3OYFA 4GV9A 3LAKA 3F73A 4IDKA 3CHWA 1WSFA 3THWB 4JI5K 4JAXA 3Q7BA 1SQKA 4CK2A 2A3ZA 3WXIA 3KWGA 3VF4A 4B9LA 2D4WA 2W6LA 1HLUA 3ZYYX 2WONA 3S41A 4FWMA 5EVZA 3O4WA 2EWSA 3SBGA 3AARA 4DTJA 1BGXT 1JLCA 5GIOA 3THVA 3OY9A 1T6DA 1JL1A 4DSLA 3ZT4A 2NRRA 1D9DA 3J80O 1RT5A 3VQ9A 4BRCA 3LDNA 4ELUA 3SUQA 1NGEA 1QE1A 4CJSA 3E9PA 2Y1IA 3JS6A 5M1NA 3QESA 3ENOA 3ZT2A 2E1ZA 3R9PA 4Z94A 4KAZA 4DQRA 3THYA 5LMUK 3ZLJA 1SL0A 5AQQA 2ZJQL 3IS9A 3OTOK 2WTUA 4DV2K 4N56A 3RRHA 4CVNE 4QS9A 2X78A 4AF1A 3LDOA 4FLTA 2FSJA 3TABA 1JLFA 3V6DA 3KK2A 3UKRA 3VF2A 1RBTA 4E1NA 4DTNA 1HQEA 5AQLA 2FBYA 3S3MA 1U45A 3DOLA 4DUZK 1JLBA 4H5TA 2YHBA 3F2KA 2ZE2A 4RW9A 3VA3A 2BANA 4AQYK 4N41A 3LAMA 3BEXA 4MFBA 5BR8K 1T03A 4ZTJA 2GX9A 3GG4A 2DFHA 4YOWA 3TR8A 1TL3A 4I6MB 1VSJA 1HKBA 1VQ4N 3T19A 5FRNA 5ELZA 4M3RA 2P9PB 3TPQA 1HJRA 1UAXA 4H5NA 1Q9YA 4KI6A 3F9KA 1NOZA 2QI2A 4KHQA 3CC4N 4BR2A 1BIZA 3UKUA 3W3DA 3TAPA 1SS6A 3AAQA 3BDPA 4RW6A 4MLEA 3NGZA 4WQ5A 4O5FA 4CJUA 3DLHA 1S6PA 3L0QA 2VGNA 1Q8IA 3LDQA 3J7YP 5C42A 3IFRA 3KLIA 3CCEN 3PSFA 3O1BA 4CECA 3HYFA 2OCEA 3LP2A 4LFBK 1HQUA 3AY9A 4CJQA 3CFOA 4CIFA 2P9IB 4JI0K 4NCAA 3L2RA 2VG5A 2GTDA 4RCHA 3R3LA 3D2EB 1NJYA 1NK4A 1D8YA 2BUPA 2RN2A 4BRIA 1Z6RA 2D0OA 3ZETB 1TK5A 3AGKA 3D6RA 1VQPN 3WQTA 3QETA 2QEXN 3C65A 3ZSWA 2GELA 5AQGA 3OYCA 5C2DA 1T8EA 4OJRA 3QEWA 3T3FA 5AZJB 2V52B 4CEFA 1KLNA 2QWOA 1LAVA 2EHGA 5JS1A 1BQNA 4F2RA 4CIEA 4C8MA 1FKOA 1X3MA 1SL2A 3O3FA 4PUOA 1TUUA 4CEOA 5J2PA 4OLBA 4FCYA 3C94A 2X6NA 4WCEL 4B9UA 3SQ4A 1T05A 5KPZA 3AA2A 1WAFA 1SUQA 2CH5A 2NRXA 1RDWX 5BN8A 5AQVA 5BRDA 3TAEA 3AO4A 5CZ2A 1P8ZA 4DCHA 4MQ3A 1S6QA 4BQLA 4M41A 4CW7B 3SK3A 4YOUA 4CJTA 2D0PA 1WSHA 2P9UB 3SQ0A 4NB4A 3AVAA 3O9UA 2KZZA 4DSFA 1NJZA 1RDUA 4CFAA 2E88A 1S5JA 1BDGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YAG A;  3C7N A;  4BR0 A;  4CZH A;  4BRH A;  5AQF A;  1NLV A;  2QWN A;  5FPN A;  4IZ9 A;  4PKG A;  3EO3 A;  1LCU A;  5AQZ A;  4CZG A;  5ADX A;  3L6Q A;  1K8K B;  5BPN A;  1XUP O;  2KHO A;  5AZI B;  1HUX A;  2E20 A;  1KXP A;  1QQM A;  1BA1 A;  3HSC A;  2P9L B;  4WYB A;  5E26 A;  3GBT A;  3J8A A;  4ISG A;  4CBW A;  1ZC6 A;  5KPT A;  2YHW A;  4ISF A;  3FLC O;  1U2V A;  2P9S A;  4H03 B;  2GWJ A;  4XH1 A;  4JN4 A;  3UKR B;  4I6M A;  4AM6 A;  5AFU A;  2VCP A;  1G99 A;  2PAV A;  1YUW A;  2P9P A;  2NZT A;  4EAH D;  4KBO A;  5BPM A;  3RSE B;  2Q31 A;  2A42 A;  3DWL A;  3WT0 A;  3CER A;  5AQS A;  4BC4 A;  5AQY A;  4H0Y B;  1BU6 O;  3O08 A;  5AQO A;  3IMX A;  4PL7 A;  3ULE B;  2HMP A;  3A5N C;  1NGC A;  2FF6 A;  3U9D A;  4H0P A;  2FF3 B;  3CJ9 A;  4B9Q A;  4FSV A;  3MK6 A;  2CGL A;  4BRN A;  4FWP A;  1NGG A;  3WQU A;  1NWK A;  1D4X A;  4FWR A;  3BUZ B;  1JCE A;  3TU5 A;  2A40 A;  4H5W A;  4PL8 A;  1R59 O;  3HTV A;  2BTF A;  3BP8 A;  4HWI A;  1H1V A;  2P9I A;  1JCF A;  2V7Y A;  1Q18 A;  3SMS A;  3UKU B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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