4MLEA

Human glucokinase in complex with novel amino thiazole activator
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a New Class of Glucokinase Activators through Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 159
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mleA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4mleA01
2P9PA 1K8KA 1BWFO 4GNIA 4I6MB 2VYPA 2KHOA 3KVGA 3VGLA 3O4WA 2P9IA 4CJ7A 1TUYA 1LOTB 4FWLA 2ITMA 2P9PB 5ELZA 4PL8A 1NGHA 5BPLA 3DXMA 1BU6O 3QDKA 3TPQA 5ADXA 1RFQA 2VCPA 4XH5A 3DXKB 3TU5A 1DKGD 4B1YB 2VWBA 5FPDA 5JICA 3GBTA 3WEEA 1XQSC 3AY9A 1RDWX 1C0GA 4JN4A 1U6ZA 3ENOA 3BF3A 1ZXOA 3WUHA 2WUSA 3B8AX 4HWIA 1GLBG 3RSEA 4IZ9A 2QWNA 1QQNA 2CGKA 3HI0A 3VEZA 5KQDA 1NGDA 4YDUA 1YUWA 1XUPO 4RCHA 5EOYA 4IJAA 1G99A 4BGAA 2UYTA 3VETA 1HLUA 1T6CA 3FZKA 4B1XB 3O08A 5KPRA 5AQMA 4CBXA 4QS9A 4BRFA 1NGGA 2V51B 3QMLA 4ISGA 2YJEA 4O5FA 2Q0RA 4A2BA 3C7NB 1E4GT 1GLFO 4BROA 3FZMA 3SJHA 3A5LC 4CZFA 2FSNA 2OANA 2CH6A 2P9IB 3UKRB 1V4SA 3MN7A 2I7PA 2FXUA 2FF6A 3M1FA 4JD2B 1NGFA 5AZIA 3ID8A 5LJWA 1NGBA 4FWQA 4PKHA 4JNEA 4K25A 4BR0A 4H0TB 3CJ1A 2GELA 5BRHA 3O80A 4ISFA 3RSEB 4CZIA 4BRIA 2ZWHA 4C23A 3U4LA 1XC3A 5AQYA 4FWSA 3EKUA 4BREA 2PAVA 1J6ZA 1NWKA 3CERA 4FPBA 3D2EA 3VF4A 1HKCA 3FFKB 3R8EA 1NGEA 3BP8A 5AQZA 1X9JA 1WUAA 5AQWA 2W40A 3VEOA 2P9UA 1TYQB 3UKUA 4BR5A 2AP1A 3CJCA 4BVOA 4B1WB 3R6MA 5AFUH 4FOEA 1C0FA 3SK3A 3VEYA 1S3XA 3ZEUA 4K42A 4AM6A 3W3DA 2YCHA 5FPNA 4CZJA 4FWMA 2ASOA 2J4RA 4CZKA 1JCFA 3H45C 2YHXA 3UKRA 2CGJA 1KAZA 5AQHA 3L0QA 3H1VX 2YHWA 2QWRA 4FWRA 1MA9B 2E88A 2FF3B 5AFUA 2Q31A 5AQFA 2QWLA 2YI1A 3ZX0A 3CETA 4DQ8A 2FSJA 1NM1A 2QXLA 1DEJA 3EZWA 3BUZB 5AQUA 3CJ9A 4BRPA 2A5XA 3H46O 4O8KA 4WQ5C 4A62A 5AR0A 4BC2A 2NRHA 3ULEA 2P9SA 4CZMA 4CD3A 3VEWA 5AQKA 3O1BA 2I7NA 3JXUA 1QHAA 2E2QA 5E26A 2E2OA 2W41A 4HTLA 3LL3A 3VPZA 1QZ6A 3VEVA 1X3NA 2IVPA 2Q0UA 3U9DA 2ZF5O 3O5BA 3QICA 2GEMA 1KAXA 4BRAA 3U9ZA 1YXQA 1U2VB 4QS7A 4BR7A 1ATSA 4FSVA 3EN9A 1HPMA 3U8XA 5BRFA 3DAWA 3WXIA 4CBWA 3CQYA 3UB5A 5EXWA 4CZEA 5JLFA 1GLJO 4MO5A 1ESVA 1NGJA 4BRQA 1SQKA 4MLHA 4RTFD 4H0VB 2CGLA 2V52B 2E1ZA 5BPNA 3ATUA 3LM2A 5AQVA 1JCGA 2NZTA 3A0IX 5AQGA 3SMPA 3BF1A 1ATNA 1NLVA 5KPZA 4BQLA 3MMVA 2F9TA 1Z05A 2Q36A 3C7NA 3ENHA 1TUUA 3HM8A 3LDPA 2IIRA 4M63C 2H3GX 2P9LB 2GWJA 5F1XA 3C0BA 1Y64A 4FWNA 3MDQA 3HZ6A 2HF3A 1ZBSA 3A8YA 3HSCA 4BVPA 2V7ZA 4PKIA 5AQXA 3GG4A 5EX5A 4EFHA 3M3ZA 1BG3A 3CIPA 1BDGA 4FWPA 3VGKA 2E20A 1NMDA 4RWTA 3O1WA 4BRCA 3VESA 3O6WA 3FZLA 1HKGA 3CHWA 1BOTO 5AZJA 2A3ZA 3DXKA 4XEIA 5AZIB 3ZX3A 1DGKN 3GDQA 4B1UB 3IMXA 2QWMA 4K41A 2E1YA 4FPAA 1WOQA 1IG8A 1GLLO 3MK6A 4CI6A 4Z94A 2BTFA 1CZAN 4JHDA 5BN9A 3WQTA 4BGBA 3MN6A 4H0YB 4PKGA 3WT0A 3VF2A 4B9QA 3VF6A 1BA0A 3LDNA 1S22A 3ATVA 3LDQA 1V4TA 5LJVA 2A6AA 2D1KA 3DJCA 4B1VA 4I6MA 3FR0A 3WXLA 3IUCA 3QB0A 5AQLA 2P9NB 3GOIA 5EY4A 4BG9A 3D2EB 1OKJA 2GUPA 4WQ5A 3WQUA 4BC3A 2QW9A 2FSKA 4BRKA 3J8AA 4MLEA 1MWMA 3FZFA 4FOIA 3H1QA 3WXKA 4AM7A 3MCPA 3MN9A 3CJ7A 3A5OC 4L3QA 3P4IA 3R9PA 1BUPA 3AAPA 2HMPA 4MO4A 4F9OA 4EHUA 1GLAG 3GE1A 4M7YA 1X3MA 2P9UB 1HKBA 1GLDG 3H3OB 4FO0A 1R59O 1NGCA 1MWKA 2QWQA 1HX1A 3JS6A 1NBWA 2CH5A 4WYBA 3QBXA 3QFUA 1LCUA 4NB4A 5AZJB 3HTVA 2IVOA 4B1ZA 5I9EB 1HUXA 3LDLA 2EWSA 1SZ2A 1QQOA 3ZETA 1GLCG 3VGMA 2QWOA 2BUPA 4GY2B 1P8ZA 1RGIA 1YAGA 3OHRA 4PL7A 2Q97A 4FWKA 5AQOA 3IFRA 3UE5A 3HBTA 4JAXA 3O8MA 4IO8A 5JLHA 1K8KB 1QZ5A 4CZHA 3VEXA 3GL1A 4A61A 5AQNA 3EKSA 1ZC6A 4BG8A 3D2FB 4H5VA 4DHYA 2Q2RA 1NGIA 4H03B 2HOEA 2ZGYA 3FE1A 3SMSA 5AQIA 4BRNA 4BR9A 2E2NA 2P9KB 5CE3A 5AQRA 3MN5A 2A40A 2YHYA 3D7EO 4FWOA 2A42A 2YJFA 4BQZA 5B8HA 4BRHA 2ZGZA 1QQMA 3LDOA 2A41A 1EQYA 4JD2A 5F2RA 2D0OA 1D4XA 4KBOA 3ULEB 2FLOA 2NLXA 3KZBA 4LC9B 4DCHA 2D0PA 4A2AA 2PBDA 2E8AA 3QBWA 3A5NC 4XH4A 4BC4A 2AA4A 3AAQA 5F0XA 3L6QA 1H1VA 3A5MC 3DXMB 4BRLA 4ISEA 5JMVA 1T6DA 2P9KA 4WQ4C 5TKYA 1KXPA 2ASMA 2QWPA 4BC5A 1U2VA 4H0PA 3M6GA 5AQQA 3ZX2A 3EO3A 1KAYA 4H5NA 2D4WA 4IXCA 4BRGA 4EHTA 1HJOA 3IDHA 5AQSA 3L4IA 3FZHA 4JHDB 3I8BA 2P9NA 1JCEA 3BEXA 1Z6RA 2QM1A 1GLEG 3SLCA 5BREA 5AQJA 3WEEB 3AARA 1BA1A 3CJBA 4BRDA 4BRMA 3CJAA 1Q18A 5FPEA 5AQPA 4BR2A 4EIAA 4IJNA 4XH1A 1YVNA 3G25A 3LM9A 3FGUA 4H5RA 4BR4A 5ADXH 1NGAA 3VERA 2HF4A 5BPMA 5KQ8A 3I33A 4CZGA 5FPMA 4H0XB 3W0LA 4Y0WA 5E84A 3D2FA 1ATRA 4NO7A 3FLCO 1MDUB 4YDUC 2E2PA 2IVNA 2Q1NA 4DB3A 3VOVA 3ZEUB 5EVZA 1E4FT 2F9WA 4CZLA 2DPNA 2ASPA 1BO5O 4FL9A 3F9MA 3H6EA 3QFPA 3ZETB 1T44A 3CI5A 3WXJA 4EAHD 2GWKA 3S41A 4CBUA 4QS8A 4M7XA 4CD1A 5KPTA 5BR9A 3H3NO 3EL2A 4H5TA 4H0OA 4E1JA 5AQTA 3KHYA 5BN8A 5LY3A 1IJJA 1TYQA 3UKUB 4WQ4A 2GTDA 4H5WA 2P9SB 2P9LA 3DWLA 4K43A 3VENA 2V7YA 4IWVA 1SAZA 4J8FA 3CQXA 5BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9PA 1RT7A 5FDLA 4E7LA 1OVQA 3T19A 3G0ZA 2HHTA 1VSMA 2KHOA 4DTOA 2GBZA 4KFBA 3D45A 5C10A 3CG7A 3MAQA 3D6RA 5I3UA 1TUYA 3MX5A 3BZCA 1JJ2M 4PL8A 1RBUA 4MQ3A 5LMNK 2DFHA 3L2RA 5ADXA 1NNEA 3NH1A 2UU9K 2VCPA 3DOKA 5JS2A 2KKZA 3LP2A 3DXKB 1DKGD 5KGXA 4FM1A 3SPYA 3D0PA 3LZIA 5KI6A 1EO1A 4CJFA 3ENOA 4IBNA 2D0AA 4HWIA 1RDBA 2HHXA 1YIJN 4C8LA 2UXDK 1NGDA 1SUQA 4CVNE 1YI2N 1YUWA 1XUPO 4RCHA 1CZBA 5EOYA 4JI3K 3TAQA 4N76A 4KH5A 1RCHA 1T6CA 4DQSA 3QESA 3AGRA 1X9WA 4CBXA 1NGGA 2V51B 4KHYA 2YJEA 4O5FA 2Q0RA 5M1OA 2G8WA 3C6HA 4DQRA 3A5LC 2FSNA 2VGNA 3U3YA 2FF6A 4CIFA 3M1FA 4F3OA 1NGFA 4CGHA 1S6PA 4NCGA 3ID8A 1NGBA 4GMJB 4E7IA 3CM5A 5SWMA 4FM0A 1NKEA 4ISFA 2X74A 3WNHA 2IGIA 3U4LA 4DR5K 2PYJA 1KRPA 1EX4A 3DYAA 2PAVA 2XHBA 1XC9A 4FPBA 1UAXA 3NGYA 2YNIA 3NHGA 4M42A 3FFKB 4U67L 1CXUA 1NGEA 3BP8A 5HRSA 4HUGA 3S9HA 1X9JA 1CZ9A 4LSNA 3TWHA 2W40A 3V6DA 1TYQB 4JK7A 3UKUA 4BY9C 4BR5A 4FJNA 1B9DA 4BVOA 3HVRA 4MDAA 4C1NK 3R6MA 3ZSVA 3M8RA 1VQMN 3DM2A 4AF1A 3AVFA 5FPNA 3VTHA 4FWMA 1TKDA 1JCFA 1KAZA 2YHWA 3SAFA 2QWRA 2FF3B 1NK7A 1SL1A 3ZX0A 4LY7A 4CJKA 4RW4A 4GVMA 4ZTJA 3EZWA 3S3OA 5AQUA 4B9SA 2ZQBA 4BC2A 4A62A 5AR0A 4DTNA 3O9QA 3I0SA 2NRXA 2ZM6K 3VEWA 4ZHRA 5E26A 3AGKA 3SUNA 4WFAL 3VEVA 4GVEA 3E1YA 2IVPA 2Q0UA 2ZF5O 5CZ1A 2VWJA 4BRAA 4DV3K 1WLJA 1YXQA 1HQUA 4QS7A 3AO1A 2VG6A 4B8CA 2VWKA 3EN9A 1JLAA 4Y1DA 3U8XA 5BRFA 2WTUA 4TSXA 3ENBA 5EXWA 4CZEA 3MXMA 4ICLA 2BE2A 4MO5A 2HBKA 5LMUK 1D9DA 2CGLA 2XY7A 2E1ZA 4GKJK 3LM2A 3L2WA 4DV4K 3THYB 4DTMA 3SMPA 3BF1A 5M1QA 1VQ8N 4DSKA 3AO2A 2GUIA 2F9TA 1KLNA 1Z05A 3P39A 3ENHA 1M1KO 2IIRA 3NGIA 4E1MA 2P9LB 3CM6A 4O5BA 1QS4A 3CCUN 1XI1A 4Z4EA 4KHUA 4OKKA 3OYFA 3MDQA 4QOZB 1CLQA 2OTJN 3LP1A 2HF3A 4RG8A 3SCXA 3HSCA 5AQXA 4JK8A 3GG4A 5EX5A 5GIPA 3HT3A 1DLOA 3O1WA 5GAGP 3MEGA 4JKAA 4FVUA 3FZLA 1RDUA 2F8SA 4LF7K 1BOTO 3ZCMA 4CHPA 4CEAA 5AZIB 3ZX3A 4LF5K 1GOBA 1YTUA 4JYAK 3PUFA 4O8UA 4UY8O 3M5RA 1HNWK 3AVCA 1O13A 1T8EA 4WE1A 4IDHA 2OTLN 3CQ8A 3EEQA 3K5NA 4DR3K 3LP3A 4AH9A 1BA0A 3KLGA 5LJVA 1WBBA 2A6AA 1R0AA 1K8AO 3DJCA 3T7ZA 4FM2A 2P9NB 2FBYA 4I2PA 4IOCL 2HBJA 2WBNA 3V1OA 1I94K 4WQ5A 3WQUA 3F9KA 4FLTA 1HMVA 1TKTA 1MWMA 3FZFA 3H1QA 4AM7A 2NRTA 3OYGA 3CJ7A 3A5OC 1KVBA 4L3QA 4GKKK 3P5JA 1QE1A 1A5WA 3O9RA 2P5OA 3AAPA 2QI2A 4MO4A 2F8TA 1GLAG 4B9TA 1X3MA 3OBWA 1HKBA 2IS3A 1GLDG 3KIOA 3ZLJA 4O0IA 2G8UA 4BDYA 5FROA 2QWQA 1HX1A 2QEXN 3LWMA 2CH5A 3SQ2A 3QBXA 5CZ2A 1ZYQA 5DM6L 4CE9A 4M41A 2RPIA 3ZYYX 4YOVA 3K59A 2B4JA 5I9EB 3LDLA 1JLQA 4Q5VA 1NG9A 3WXMB 3OYAA 4DSJA 4NXNK 4CF1A 3QEXA 1QQOA 3ZETA 3J81O 3SYZA 4CECA 4BWMA 1BHLA 4IDKA 4PL7A 4IOXA 1ASUA 3LWLA 4KH6A 4FJXA 4IO8A 4CZHA 2JWLA 4BG8A 1ZC6A 3D2FB 2HHHK 2O8CA 4DHYA 2Q2RA 1WSJA 1M90O 2P9KB 4KREA 4DV7K 3DLRA 1BI4B 2HBMA 3HK2A 3D7EO 1C6VA 1Z26A 4FJMA 4AHVA 2D0OA 4DUYK 2FC0A 1C0TA 2NLXA 2OZMA 3CCRN 3TAPA 2PBDA 4CJ3A 3HP6A 2HVIA 1YHQN 4BC4A 2NRWA 4YOYA 3KLHA 5F0XA 2OPSA 3L6QA 4H4OA 3A5MC 3HO1A 1WB9A 3ZSZA 3HPHA 2UUBK 3NBPA 2P9KA 3IAYA 4DV1K 3J80O 1KXPA 1TGOA 3SBGA 4BC5A 1U2VA 2XRIA 3OYEA 4DV0K 2F96A 4KHSA 3CCVN 4IXCA 4BRGA 4FJKA 3LDSA 4E7KA 4AHTA 3EE9A 5AQSA 2QKBA 4E7HA 1JCEA 2W6LA 1BIUA 2QM1A 1GLEG 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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