3EZWA

Crystal structure of a hyperactive escherichia coli glycerol kinase mutant gly230 --> asp obtained using microfluidic crystallization devices
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIDGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Crystal structure of a hyperactive Escherichia coli glycerol kinase mutant Gly230 --> Asp obtained using microfluidic crystallization devices.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 196
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA01
1WOQA 3CJ7A 4HTLA 1H1VA 5AQWA 4WYBA 4ISEA 3BP8A 3GL1A 3VEWA 3SMSA 1S3XA 3WEEA 4XEIA 4H5VA 3KZBA 4MO4A 4FPAA 3VEVA 5AQFA 2P9PA 2YHYA 4NO7A 4KBOA 3LL3A 1HUXA 3LDPA 5AQKA 5EY4A 2ZGZA 4FWLA 4H5RA 4BG9A 3J8AA 5BRFA 1GLBG 2Q97A 4BR0A 3WXIA 3FZFA 4QS9A 2E2OA 3SMPA 4CZMA 1T44A 4WQ4A 2P9IB 5JICA 3M6GA 4XH1A 2ZWHA 4H5TA 5F1XA 4CBUA 1U6ZA 4CZHA 2P9LB 4IJNA 5B8HA 1Z6RA 3MCPA 3AAQA 5E26A 3HM8A 1LOTB 1QZ6A 2P9UB 3GOIA 1NGFA 4BR9A 1Y64A 1QQNA 2YHXA 3H46O 4JNEA 1X3NA 4PL8A 5KPZA 3HTVA 2BTFA 2QWQA 4I6MB 1BO5O 4HWIA 2ASPA 1QQMA 4DB3A 5I9EB 3L6QA 3ATUA 1JCFA 3CIPA 1P8ZA 3R9PA 2ASMA 3R6MA 1BOTO 1NGAA 2QWNA 4BC2A 4PL7A 5AR0A 1ATRA 3VOVA 3I33A 2FF6A 2P9SB 3AAPA 4BGBA 2A42A 2P9NB 3ULEB 5AFUH 3AY9A 1JCEA 1G99A 1MWKA 3H1QA 3CJBA 3VPZA 2HF4A 4CI6A 2A6AA 4BRCA 1MA9B 2PAVA 3DXMA 3O5BA 4BRKA 4EAHD 3SK3A 1GLDG 2H3GX 4H0YB 4JN4A 1MDUB 4WQ4C 3L4IA 4H5WA 2V7YA 2FLOA 4M7YA 1DEJA 3QB0A 2P9IA 4IZ9A 3WQUA 5BN9A 4B9QA 3O1BA 4L3QA 3ZETB 1BU6O 3IFRA 2UYTA 2P9LA 5AQRA 1YUWA 5ELZA 5JLFA 1D4XA 3QMLA 1NMDA 2QWRA 2GTDA 2QXLA 2ASOA 2HF3A 1NGJA 1TUUA 4H0OA 4H0PA 5ADXA 4WQ5A 1NGEA 2P9UA 3HBTA 3TU5A 4EIAA 3U9DA 3M3ZA 3R8EA 4I6MA 5KQ8A 2VYPA 3ZX0A 4F9OA 3A5NC 2IVNA 4FWNA 3UKRB 4CBWA 3ZEUA 3CQXA 3LM9A 5LJVA 3JS6A 3BUZB 1NGHA 5BPLA 3W0LA 2P9SA 2P9KB 3L0QA 4CD1A 2OANA 2Q0RA 2P9NA 5AQMA 4IWVA 3O8MA 1OKJA 3IMXA 5AQPA 3HSCA 3W3DA 3UE5A 1QQOA 3ULEA 5AQGA 5AFUA 3C0BA 3LDNA 3OHRA 3QBXA 1KAYA 5AQYA 4A2AA 3I8BA 3EZWA 4H03B 3VERA 5AZIB 2ZGYA 3CETA 3HZ6A 1HJOA 1SQKA 2IIRA 1GLEG 4BRAA 2HMPA 2I7PA 4YDUC 2QWPA 4EHUA 1SZ2A 4K25A 3A5LC 2GWKA 3MN7A 4JHDA 3D2FB 5AQVA 1BUPA 3VGLA 2E1YA 3IDHA 2Q1NA 3H1VX 3HI0A 3LDQA 4MO5A 1BDGA 3VEXA 1IG8A 4JD2A 1ZBSA 3CERA 4RCHA 5EXWA 4FPBA 4A2BA 4BR7A 3H3OB 3MN5A 4J8FA 4BG8A 4WQ5C 5F0XA 4CZKA 4BRDA 2F9WA 3LM2A 3D2EA 4FWRA 4JAXA 3A8YA 3EKUA 1NGBA 3G25A 4IXCA 2E2QA 2W40A 1YAGA 4M7XA 2QWOA 5AQQA 4FWOA 4XH5A 2Q2RA 5AQXA 2A40A 4B1WB 3UKRA 1TUYA 4BRHA 3MN9A 5FPEA 4K42A 4BRQA 1K8KB 3MK6A 4RWTA 2YCHA 3WT0A 1V4SA 2D1KA 5F2RA 1R59O 4PKHA 4PKIA 3VGKA 1TYQB 3CJAA 1C0FA 4BC4A 1J6ZA 3A0IX 3D7EO 4RTFD 2A5XA 4DQ8A 1BG3A 5AZIA 2E8AA 1RDWX 1ATNA 3A5OC 1U2VB 3UB5A 1X9JA 4FWSA 4C23A 5KPRA 4EFHA 3D2FA 4B1YB 3EN9A 2QWLA 3H45C 4BREA 4BR4A 4EHTA 2QM1A 2PBDA 1X3MA 3BF3A 1T6CA 3C7NB 4BGAA 3UKUB 1QZ5A 2CH6A 5AQJA 2VCPA 3CJCA 3VESA 4A62A 4BRLA 2Q36A 2WUSA 4MLEA 3JXUA 3FZKA 4FWMA 4BRGA 5EX5A 3EL2A 2E2PA 2AP1A 4BR5A 2D4WA 3VF6A 3CJ1A 4DCHA 3WUHA 5JMVA 1HPMA 3O1WA 2GUPA 5AQHA 3VGMA 4BRIA 5EOYA 3FGUA 4B1ZA 1ZC6A 5AQUA 2CGKA 3QDKA 2CGJA 2EWSA 2A41A 5EVZA 4Z94A 3WXJA 2P9PB 5AQNA 1NWKA 1HLUA 4IJAA 4FWPA 2FXUA 1K8KA 4ISFA 1HKGA 3CJ9A 3QFUA 4FO0A 2W41A 3S41A 5AZJB 3H3NO 4BC3A 4AM7A 4H0XB 4IO8A 2Q31A 3QICA 1YVNA 3MDQA 2FSKA 3U4LA 1E4GT 3MMVA 5BN8A 1C0GA 1WUAA 1ESVA 4B1XB 5KQDA 2IVPA 1HKBA 4MLHA 2E1ZA 1NGCA 4FOEA 3P4IA 1ATSA 2FSNA 4FWKA 3VENA 1XUPO 4BQLA 4CZGA 1RGIA 1XQSC 5BPMA 5AQTA 3C7NA 1HKCA 3DXKB 1IJJA 2QW9A 3DAWA 4O5FA 1Q18A 4BRNA 4B1VA 4ISGA 5FPNA 1NGGA 3WQTA 3SJHA 5BPNA 3F9MA 3LDOA 3ID8A 1DGKN 2GELA 4Y0WA 3EO3A 3VEYA 3ZETA 3RSEB 4CZJA 4CBXA 5AQZA 3WXKA 1KAXA 3AARA 3GE1A 3CI5A 3CHWA 5BRDA 4FSVA 3KVGA 4GY2B 1RFQA 4BR2A 3B8AX 2I7NA 2NLXA 3VEZA 4AM6A 5AQLA 2NZTA 2VWBA 3DXMB 3TPQA 1JCGA 5AQSA 4FL9A 2D0OA 2FF3B 5AZJA 2E20A 1XC3A 2DPNA 5BRHA 2QWMA 5CE3A 2YJEA 3GG4A 1NGDA 2P9KA 2HOEA 3H6EA 4BVPA 1KAZA 3QBWA 3IUCA 2E2NA 5FPDA 3KHYA 2D0PA 5ADXH 3CQYA 2IVOA 4CZEA 3DXKA 3ATVA 1BWFO 1GLCG 1V4TA 1GLFO 5AQIA 1BA1A 3O4WA 3QFPA 4H0VB 3M1FA 1S22A 3ZX3A 4BQZA 1QHAA 3ZEUB 3RSEA 4BC5A 3O6WA 3U8XA 3VF4A 2CH5A 1GLJO 3DWLA 3EKSA 2ITMA 5KPTA 1GLAG 1EQYA 4A61A 3O08A 3BF1A 5E84A 1NM1A 4CZFA 1GLLO 1NBWA 3LDLA 1SAZA 2KHOA 5LY3A 2YJFA 1MWMA 3FFKB 3BEXA 4DHYA 4XH4A 5AQOA 4E1JA 2YHWA 4O8KA 4PKGA 3ZX2A 3ENHA 3WEEB 1YXQA 1Z05A 2CGLA 4CZLA 3GBTA 2ZF5O 4GNIA 4CJ7A 4CZIA 5BREA 2J4RA 3FZMA 4LC9B 4K43A 4JHDB 5LJWA 4B1UB 2AA4A 4YDUA 3FLCO 4JD2B 2NRHA 3FR0A 3SLCA 4M63C 2FSJA 3VEOA 2E88A 4QS8A 3U9ZA 5JLHA 3O80A 1TYQA 3ENOA 4BVOA 3D2EB 1DKGD 3A5MC 4BRPA 4H5NA 3GDQA 4FWQA 2GEMA 2BUPA 1U2VA 2GWJA 4QS7A 5TKYA 2F9TA 3WXLA 3VETA 3FE1A 4BRFA 5BR9A 3DJCA 3FZHA 4NB4A 4BRMA 1CZAN 1NLVA 1T6DA 1ZXOA 1BA0A 1KXPA 2V52B 3UKUA 1NGIA 2Q0UA 5FPMA 3FZLA 2V51B 1LCUA 4K41A 3VF2A 2V7ZA 4BROA 2YI1A 4CD3A 3MN6A 4H0TB 1HX1A 2A3ZA 4FOIA 1E4FT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTLA 3K57A 1JLGA 4DTJA 3O9QA 4EZ9A 2D5RA 1S3XA 4H5VA 4KI4A 4FPAA 2P9PA 4NO7A 3LL3A 1HUXA 1S1WA 5EY4A 5HRNA 4JI4K 4BG9A 2ETJA 2BDPA 4IG3A 3T69A 2FC0A 2G8IA 4YFUA 3WXIA 3CFOA 4CIGA 5JICA 5GIOA 2ZWHA 4AHVA 3OW2M 4CBUA 1U6ZA 3CG7A 1HQEA 3J80O 4ID5A 2HHTA 2F8TA 5B8HA 4CF0A 1Z6RA 3DOLA 3DLBA 4DU1A 4NYNA 3VA0A 1ASWA 4ICLA 4BR9A 2O8BB 1HNZK 2QWQA 4PY5A 1S72N 2OCEA 1BO5O 3VQ5A 4LFBK 1TL1A 3L6QA 3VTHA 3Q7CA 4RW8A 3CIPA 4EP5A 5GADP 3I33A 5K14A 3L2UA 2IC3A 4DFMA 4OO1J 2Z1IA 2X74A 1TKTA 3ULEB 1YJWN 3NFAA 2JWLA 3VPZA 4FLYA 2A6AA 4E7JA 1MA9B 1XI1A 3DXMA 4BRKA 2FBTA 3SK3A 4FJGA 5J2PA 4HVJA 3F5TA 1MDUB 3C94A 3B6PA 4M7YA 3M8SA 3SQ0A 1VAZA 4JI5K 4IZ9A 5BN9A 4CEQA 1EP4A 3ZETB 1JLAA 1WBDA 4DWIA 4OKJA 2UYTA 5JS2A 2P9LA 3TSPA 3I0SA 5ELZA 5C10A 3QMLA 3QLHA 1NMDA 2QWRA 2D0BA 2QXLA 1TKZA 1NGJA 4H0PA 1NGEA 1U4BA 1HYVA 1I39A 3TU5A 4EIAA 3R8EA 1XMQK 4KHUA 2PZSA 1RDBA 1T05A 5GAGP 1FKOA 1N8RO 3A5NC 4KV8A 3ZSYA 1LAWA 3LM9A 3B6OA 3JS6A 1NGHA 3OYCA 1QSLA 2ZQBA 5GAHP 4FYDA 2D0AA 1WSHA 4OKEA 1QQOA 1JLFA 3SNNA 3U3GA 4FJLA 5KGXA 3CETA 3NF7A 4PHTX 1HJOA 1SQKA 3RRHA 1GLEG 4Z4FA 2I7PA 1JXBA 2QWPA 3VQAA 3VQ9A 4WFNL 5M1QA 5AQVA 1BUPA 3VGLA 1WSIA 2E1YA 4B3MK 4BDPA 2Q1NA 1BDGA 2HB5A 3VEXA 3F73A 5HRSA 3KK1A 3G10A 3RMBA 4JK9A 4A2BA 4BR7A 3THWB 1X9SA 4J8FA 2KZZA 1VQMN 3D2EA 4QCLA 4E1NA 4FWRA 4JAXA 1VRUA 4NXNK 2YKMA 3TABA 4KHNA 3H08A 2UUAK 1TAUA 2HVIA 3MEDA 4B3SK 4Z4HA 4DSKA 1K9MO 3LPTA 5AQXA 2Q2RA 1W2BM 4Q5VA 3P1GA 4CEDA 1KFDA 4JKHA 4E3SA 4K42A 4M3WA 4OX9K 1VSIA 4DTPA 4YOUA 4CJ3A 3WT0A 4FJ5A 3NHGA 5F2RA 3QEPA 3K0SA 1QSYA 4O55A 1VSLA 4PKHA 4E19A 4FLVA 3NGIA 1C0FA 4NCGA 2A5XA 3ENBA 4DQ8A 1XNQK 5AZIA 1EKEA 4KAZA 2E8AA 1WNSA 1ATNA 3CFRA 1U2VB 4FM2A 4GKKK 1YTAA 4C23A 1U04A 5KPRA 3CQ8A 3D2FA 4CHZA 4EZ6A 1WSGA 1XHZA 1KLNA 4BR4A 4EHTA 2PBDA 1X3MA 3BF3A 3AVAA 2VCPA 2P5OA 4CGDA 2WUSA 3JXUA 1LV5A 4BRGA 4IKFA 3TTDA 2D4WA 3CJ1A 4KREA 1ASVA 3WUHA 3ITHA 5AQHA 4KRFA 5KGWA 4A5BA 4B1ZA 4CHYA 1ZC6A 5AQUA 2CGKA 3RR8A 3KLGA 4FW1A 4ILHA 3M8QA 2O8BA 4FWPA 2YV0X 1NKEA 1LW0A 1IKYA 3QFUA 3KWIA 4KHYA 1QSSA 4GV6A 4B9MA 2EHGA 3K5OA 1YVUA 3QICA 4KH5A 3OYFA 1YVNA 4DR7K 2FSKA 2ZE2A 3NAEA 3MMVA 1M90O 4R5PA 3V4IA 2KLAA 2QEXN 1ESVA 1OH7A 2OPQA 3ZSZA 3ZT3A 3K59A 3J7YP 4CEBA 4FWKA 4U7BA 3VENA 1XUPO 3AVBA 4BY9C 4PUOA 1RGIA 1XQSC 3OYAA 1RTJA 1TK0A 1I94K 4DQIA 4I9LA 4DV2K 1RILA 4ISGA 1KVCA 1IBMK 1KQSM 1OH5A 3LDOA 4BDYA 2GELA 3ZETA 4FW2A 4OVLA 4AF1A 3CCVN 3OYNA 4IDHA 1S9EA 4JKGB 4DV3K 3FFIA 4FSVA 4GY2B 3EY1A 3I8DA 1ILYA 4HCCA 4B8AB 4CEOA 5AQLA 4WFBL 3ZT1A 3AGRA 4FL9A 2D0OA 1SS6A 3RMDA 2FF3B 5AZJA 2AJQA 5AJ3K 3HVTA 1XC3A 2NRRA 2QWMA 4C8KA 3IG1A 4M3TA 4E1MA 4JS4A 3OYDA 2ZJQL 3QIPA 1NK5A 3CCEN 4DQPA 3HJFA 3LWMA 3KJVA 2E2NA 3NF9A 4YOWA 3HM9A 1FK9A 3KHYA 4C1NK 4DFJA 5ADXH 1D8YA 3CQYA 2P51A 1YIJN 5CR4A 3DXKA 4E0DA 3SBTA 1V4TA 3AVKA 5M1NA 1GLFO 5AQIA 2DFHA 3C65A 4J2AA 4H0VB 3M1FA 1S22A 5HOOA 1Q86O 4B9TA 4FJIA 4O8UA 2P1JA 3THWA 4AHTA 3KLEA 2A1SA 4JI6K 4A61A 3BF1A 5E84A 3HPOA 1B9DA 3HXMA 3AVHA 4CZFA 2KHOA 4DHYA 1KFSA 5AQOA 3VQ4A 1U47A 1C0TA 1HYZA 3NGZA 2F96A 2CGLA 4N56A 1GOBA 2ZF5O 3GBTA 4CJ7A 2OZMA 4UY8O 4JHDB 4AHSA 5FRNA 2VWJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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