3EZWA

Crystal structure of a hyperactive escherichia coli glycerol kinase mutant gly230 --> asp obtained using microfluidic crystallization devices
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIDGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of a hyperactive Escherichia coli glycerol kinase mutant Gly230 --> Asp obtained using microfluidic crystallization devices.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
total genus 196
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA01
5JLFA 2P9UB 1NGAA 1XQSC 4BC5A 4A2AA 4CZFA 4CZEA 4FWQA 2NRHA 4CZGA 4CBUA 2EWSA 4BRAA 1RDWX 3LM2A 2F9WA 2GELA 5AZIB 3M3ZA 4DQ8A 3FGUA 4WQ5A 4QS9A 4BR0A 1BA0A 3CJAA 1E4FT 2HMPA 2ITMA 3ZEUB 5AQFA 2QM1A 1C0GA 2FF3B 4BQLA 3CI5A 5F1XA 2FLOA 4JNEA 1HLUA 3QICA 2QWNA 4BRGA 4PL7A 3SMSA 5AFUH 3AAQA 3UKRB 5FPDA 1NGCA 4BRIA 2NLXA 3O8MA 3FZLA 2YCHA 3BUZB 2VCPA 2P9SA 4WQ5C 2GTDA 3BF1A 3WEEB 4H5TA 2QW9A 3ZETA 1YAGA 3ATUA 4JHDA 3G25A 3MN9A 2YHWA 1ATSA 3WXKA 3TU5A 4FPBA 3AARA 2FF6A 4K25A 3H1VX 1P8ZA 3EL2A 2AA4A 1SQKA 2IVOA 3W3DA 1U2VB 5ELZA 4EAHD 4FWRA 3CJBA 3FR0A 3O6WA 4QS8A 1BA1A 3VF2A 3LDNA 3VETA 1DKGD 1E4GT 4WQ4A 2DPNA 3QFPA 3DXMB 4FWKA 5AQHA 4K43A 3A5OC 3IDHA 3A5NC 3IFRA 1QZ6A 2F9TA 1HX1A 2WUSA 2P9NA 3CQYA 2A41A 3LDOA 1HKGA 4JD2A 4I6MB 4ISFA 2CH5A 5AQNA 4YDUA 1DEJA 3FE1A 3QBWA 4ISGA 1BU6O 4BRHA 1HPMA 3IMXA 3IUCA 3U9ZA 4FO0A 2HF4A 1NGBA 3CJCA 1T44A 4PKHA 3O80A 1ZBSA 1KAZA 3J8AA 1BOTO 1S22A 3GOIA 4CBXA 4E1JA 2V52B 4B1UB 3WXLA 5F0XA 5BR9A 4Y0WA 4M63C 3FZHA 4H5WA 1D4XA 3BEXA 2GUPA 2V7ZA 4MO5A 4BRLA 1RFQA 5BPMA 1R59O 5E26A 4O8KA 2IIRA 4GY2B 4B1WB 4PKIA 3CIPA 4BG8A 4IJAA 1HKCA 3VEWA 4BVPA 3GL1A 1MDUB 1MWKA 4IJNA 2P9IA 1RGIA 1JCEA 5EVZA 1ESVA 3M6GA 5AQSA 3U8XA 3VGMA 5AZIA 3KVGA 3CQXA 1EQYA 1WUAA 5EY4A 2ASOA 2E1ZA 1Y64A 4B9QA 5BRHA 4F9OA 4H03B 4FWSA 4RWTA 1J6ZA 2J4RA 2QWQA 5TKYA 1BDGA 3F9MA 3H3OB 1HKBA 3WXJA 5JMVA 2D1KA 3MN6A 3KHYA 4FL9A 3ENOA 3VERA 3U4LA 3QDKA 2KHOA 3LDLA 5BRFA 4FOEA 3ENHA 2FXUA 2W40A 2YHYA 3ID8A 4A61A 4BRNA 4BR2A 2A5XA 3ZETB 5EX5A 1SAZA 1NWKA 3I33A 1GLLO 5FPEA 4XH1A 5AFUA 2BUPA 1T6CA 3CHWA 3UKUB 1XC3A 4AM7A 1H1VA 3JS6A 3FZFA 2E8AA 1U2VA 5B8HA 1GLCG 3R9PA 1GLBG 3W0LA 3BF3A 3LL3A 5LJWA 1S3XA 2QWMA 4H5NA 1DGKN 3D2FB 4JN4A 3HSCA 5AZJB 5LY3A 1OKJA 2IVPA 3HM8A 3EN9A 2CGJA 2D0PA 1TUYA 3BP8A 2ZGYA 2H3GX 3JXUA 4IXCA 1TUUA 4EHTA 4JD2B 3VEZA 1T6DA 4AM6A 4BC2A 1YXQA 1X9JA 3TPQA 4L3QA 5AQZA 3WQUA 3UB5A 2A6AA 3B8AX 3DJCA 1GLJO 1TYQA 2A3ZA 3WXIA 4H5VA 5AR0A 3O5BA 3HZ6A 4NO7A 3ULEB 1ZXOA 4EIAA 4RTFD 5ADXA 1ZC6A 5EOYA 4HTLA 3SLCA 3OHRA 2ZF5O 4BRKA 3FFKB 4JAXA 1BUPA 5AQLA 1GLAG 5AQXA 4BRFA 3H3NO 1NGDA 4MLHA 3VOVA 2FSKA 4FOIA 1X3NA 1V4SA 3KZBA 3VESA 2HF3A 3L4IA 3QBXA 3R8EA 2P9IB 3GBTA 3WUHA 4BREA 1Z05A 3O1WA 2BTFA 4CI6A 2Q2RA 3DWLA 2V7YA 1CZAN 5AQJA 2QWPA 5I9EB 3VGKA 2GEMA 5AQYA 4BR4A 4BC3A 2A40A 2E1YA 1HJOA 4FWPA 1SZ2A 5AQPA 2HOEA 2E2QA 2Q1NA 1GLFO 4XH4A 2I7NA 4NB4A 3QMLA 3CJ7A 3RSEB 1JCFA 2D0OA 3A5MC 5FPNA 4WYBA 3SK3A 1U6ZA 5BPLA 5ADXH 2ZWHA 2CH6A 3WT0A 2P9KB 3U9DA 1WOQA 3EO3A 1HUXA 3LDQA 2E2OA 4FPAA 1NGJA 1NBWA 5JICA 3L6QA 2P9PB 2QWOA 5AQIA 4BR9A 1YVNA 2GWJA 2QWRA 4BRQA 2Q36A 4M7YA 1Z6RA 3HTVA 4H0XB 4PKGA 1LOTB 2ZGZA 4BG9A 3UKUA 1QQNA 5BN8A 3GDQA 1MWMA 3MN7A 3GG4A 3MK6A 2Q31A 3M1FA 3ZX0A 4CZMA 1QZ5A 4A2BA 5BPNA 4BQZA 1LCUA 4M7XA 1NGGA 2Q97A 3ZX2A 4FWLA 4KBOA 1NGIA 4BRCA 4EFHA 3D7EO 3QFUA 4MO4A 1NLVA 3D2FA 4J8FA 4CBWA 2AP1A 5AZJA 3FLCO 3O1BA 1QQOA 5AQMA 5KPTA 3H1QA 3DAWA 2P9LA 5AQRA 1K8KA 3O4WA 2ASMA 2FSJA 4BGAA 2VYPA 3CJ9A 1XUPO 1NM1A 4K41A 2GWKA 4EHUA 1MA9B 1IG8A 2CGKA 3AY9A 4B1VA 1TYQB 3VENA 5BRDA 1V4TA 3VEYA 4IZ9A 3ULEA 4BR7A 2I7PA 4HWIA 2PBDA 4DB3A 2OANA 2V51B 3MCPA 4LC9B 4BC4A 4BRPA 3AAPA 3LM9A 3VEVA 2ASPA 1NGHA 3C7NB 3DXKA 3C0BA 3L0QA 5E84A 2QWLA 3D2EB 2A42A 5KQDA 4IO8A 4CZIA 2P9UA 3EKUA 3CERA 3VGLA 3VF4A 5KPZA 5LJVA 4CD1A 3LDPA 5AQGA 3CJ1A 4H5RA 4A62A 5FPMA 3ZX3A 3QB0A 1IJJA 2QXLA 4GNIA 3I8BA 1NMDA 1BWFO 5KPRA 4B1XB 5AQKA 4CZHA 3ZEUA 3S41A 3MN5A 5KQ8A 4FWOA 5BN9A 3VPZA 3RSEA 4DHYA 2YI1A 5AQOA 3FZMA 5BREA 4CJ7A 2P9KA 3UKRA 4BRDA 4C23A 3P4IA 5AQVA 5EXWA 3GE1A 2P9SB 4PL8A 4BR5A 3WEEA 4FWMA 4B1YB 4QS7A 4FSVA 3VF6A 1BG3A 4MLEA 4JHDB 2P9PA 2E2PA 4K42A 4B1ZA 1GLEG 4CZLA 2E2NA 4H0VB 2FSNA 1Q18A 3WQTA 2UYTA 5AQWA 3MMVA 4WQ4C 4ISEA 4DCHA 1ATRA 2E88A 4RCHA 2NZTA 2E20A 4BGBA 3A0IX 4Z94A 3VEOA 1ATNA 1GLDG 2VWBA 3R6MA 1YUWA 1NGEA 3FZKA 3HI0A 4YDUC 3SMPA 2PAVA 3DXMA 1JCGA 5CE3A 1KAYA 3H45C 5AQQA 4H0OA 4CD3A 3A5LC 4BVOA 2YJEA 2IVNA 4CZKA 2P9NB 4H0PA 4O5FA 2P9LB 3UE5A 1K8KB 1X3MA 4H0TB 2D4WA 1KXPA 1C0FA 4I6MA 1NGFA 3O08A 3HBTA 3EKSA 5JLHA 2Q0UA 5AQTA 3EZWA 3SJHA 3MDQA 4BRMA 1QQMA 3A8YA 2W41A 2YJFA 3VEXA 4FWNA 2YHXA 4BROA 4CZJA 1BO5O 4XEIA 1QHAA 4H0YB 1G99A 1KAXA 2Q0RA 3H46O 3C7NA 3CETA 4IWVA 3DXKB 5AQUA 3H6EA 4XH5A 3ATVA 2CGLA 3D2EA 5F2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AO2A 1QQCA 1NGAA 2ATQA 4BC5A 4DR3K 4A2AA 1N36K 3AA2A 4JS4A 2BANA 4CERA 2EWSA 4DTNA 2O8BA 4M45A 2G8VA 3LM2A 2F9WA 3K9KA 3A2FA 1R0AA 4EZ9A 3M3ZA 4WFAL 3FGUA 3LAMA 1HYSA 2UUBK 1E4FT 5JVHL 2QM1A 3CYMA 1C0GA 4BE1A 3CI5A 2QWNA 4PL7A 1ZBLA 4DFKA 5KRSA 1Y97A 4BRIA 3OA9A 3T19A 3LWLA 3WEEB 4CFDA 4ELUA 4KHYA 3DYAA 4JHDA 4O5BA 3MN9A 4C8MA 1BQNA 2KKZA 1ATSA 4OPHA 4KO0A 1NK4A 1OVYA 2E6LA 3PUFA 3E9LA 4K25A 4NXMK 3OTOK 1SQKA 2IVOA 1N32K 1U2VB 3BGRA 4KPYA 4CEQA 4FWRA 3MECA 3CJBA 3P31A 3CFPA 1G15A 2HVIA 4B3RK 1GOBA 4WQ4A 2DPNA 3QFPA 3DXMB 4K43A 4FM2A 4DV1K 4HUEA 2R7YA 3ZYYX 2F9TA 1HX1A 3RMAA 3O4QA 3MX5A 4JI8K 4DSLA 2WONA 4IOCL 2X74A 3HSTB 2HSTA 5IWAK 3P1GA 4B9MA 5AQNA 4GVMA 4BDPA 3HRGA 3V9XA 2B5JA 1HPMA 2FC0A 4C8LA 4FO0A 3V1QA 4YORA 4PKHA 3L2RA 4CBXA 4DR4K 4CGIA 5BR8K 5F0XA 4GMJB 3J7ZO 4CK2A 4YOVA 3M8RA 3BEXA 4CJFA 4FJ9A 1SV5A 4CHZA 4FJMA 3S9HA 3PSFA 1R59O 3NFAA 3OYBA 2UXDK 1B92A 1RDUA 4I9QA 1VQNN 3L3VA 4Z4IA 4JI7K 3VEWA 4FM0A 4LF9K 3R3LA 4DSFA 2P9IA 5FDLA 5EVZA 1WAJA 2O8DA 4IDKA 4CJWA 5AQSA 1A5VA 5AZIA 3C95A 2NRWA 2QA4N 2WOMA 1Y64A 4KB0A 3CPWM 4FWSA 3V9ZA 1TK8A 3L8BA 3NGZA 2QWQA 3KLIA 1HKBA 4CEAA 2D1KA 1JLFA 3E9OA 3VERA 4CJKA 2W40A 4AHVA 2A5XA 3ZETB 4HUGA 3OYKA 5FPEA 4IBNA 2ZD1A 4LY7A 1BQMA 3KD5E 1H1VA 3DOLA 1QSYA 4O8UA 2HMIA 3PO4A 1U2VA 3PSIA 1FJGK 4YHHK 2YNFA 1GLCG 3R9PA 1LWCA 3I56N 3LL3A 4C8KA 5LJWA 2QWMA 1S1WA 3LZIA 4R79A 5AZJB 1BL3A 1NKEA 2UXBK 2HHUA 3O3FA 3OY9A 2PFUA 3HM8A 2CGJA 3V9UA 3AVFA 4IXCA 3OYGA 4EHTA 1SKSA 1IKWA 1T6DA 4AM6A 4FYDA 3RRGA 1Q9XA 4MQ3A 3L2VA 4JV5K 3WQUA 2A6AA 4CJ4A 3CPEA 2XO7A 1KFDA 3AO5A 4WFBL 2A3ZA 4B08A 5AR0A 3HZ6A 4NXNK 2HW3A 4NCGA 1VRTA 4IFVA 3RRHA 1ZXOA 4KI4A 5ADXA 4J2BA 3AVJA 3OHRA 3ZSRA 3ISNC 3PX4A 2ZF5O 5C0YA 3ZLJA 5AQLA 4CHOA 4DLEA 1U45A 4AHUA 3I0SA 3VQAA 3HPOA 3AO1A 3NAEA 1X3NA 3KWIA 3BY5A 3TTCA 1RBSA 4B8CA 1OH7A 3M8QA 1KVCA 1ZBFA 4CHYA 5AQJA 1L3SA 4BY9C 2YKNA 3V4IA 4BR4A 3OYMA 4LH5A 1HJOA 3NHGA 4AHTA 2HHVA 5AQPA 2HOEA 2E2QA 1JLGA 1GLFO 4NB4A 3SUQA 1S1TA 3KLGA 3CJ7A 4NCAA 3A5MC 5FPNA 1U6ZA 5ADXH 2ZWHA 3PX0A 2W6LA 4OLBA 3EO3A 4CJVA 5SWMA 3OYNA 4B3TK 4GVEA 4OLAA 3L6QA 2QWOA 1YI2N 1LAWA 1RBUA 3L2QA 3T1YK 2Q36A 1Z6RA 4H0XB 5FROA 3RMDA 1KLNA 4PQUA 5J1EA 3UKUA 1UOCA 1J54A 4XIUA 1WAFA 4JI6K 3F9KA 4CZMA 4B3MK 3G71N 4FWLA 1HR0K 1TKTA 1YHQN 3DLBA 1C0MA 3DRSA 3QFUA 4MO4A 1MU2A 1NLVA 3D2FA 4KTZA 1IBLK 2QKBA 4KTWA 1IV0A 5LL6Z 3U3GA 3THXB 3FLCO 2A1RA 1QQOA 3KKSA 3SQ1A 1RCHA 3N4PA 3LALA 2P9LA 5AQRA 4CHQA 1K8KA 3V9SA 1YT3A 3D45A 2FSJA 2NRXA 3TWHA 1XUPO 3SUPA 1NM1A 4K41A 4NCBA 1JXBA 3RMCA 5M1NA 3JAMO 1V4TA 3WNGA 4IZ9A 4UY8O 3QEIA 4Y1DA 4BR7A 5J2NA 2I7PA 2PBDA 4DB3A 1TV6A 5C24A 3MCPA 4LC9B 4BC4A 4IOAL 4BRPA 4CF9A 3AAPA 2OTLN 3NH2A 1VSLA 4V19S 1NGHA 2O8FB 3SQ0A 2XRIA 3D2EB 4JS5A 2P9UA 2ITGA 3VTIA 4DFMA 4IG0A 3VF4A 3O4NA 1VQ8N 2XY5A 4E1NA 1I39A 5KPZA 4KREA 3JYTA 3L2UA 3TAGA 3VMFB 3QETA 2HHSA 2YHBA 2HNZA 1HNXK 4DQRA 1WN7A 1NOYA 2O8EB 3VQPA 5AQKA 3AA4A 4JI5K 4DTMA 3S41A 1KFSA 4J2AA 2FBTA 4FWOA 5BN9A 1ZBHA 3T1AA 3AO4A 4J2EA 4BDYA 2I5JA 5BREA 2BE2A 1UA0A 3UKRA 4C23A 5EXWA 4KHPK 4BR5A 1S9GA 4B1YB 4QS7A 2P5OA 3P38A 4MLEA 4JHDB 5M1FA 2E2PA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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