3EZWA

Crystal structure of a hyperactive escherichia coli glycerol kinase mutant gly230 --> asp obtained using microfluidic crystallization devices
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
b'KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIDGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Crystal structure of a hyperactive Escherichia coli glycerol kinase mutant Gly230 --> Asp obtained using microfluidic crystallization devices.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 196
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA01
3ENOA 5F2RA 3QFUA 3M1FA 2YHWA 3O1WA 3UKUA 3A5LC 1KXPA 2GTDA 1KAYA 3FZKA 3WXIA 4BR0A 1BOTO 4B1YB 2QWOA 3CJ1A 1GLLO 5AQHA 4BVPA 3FZFA 2Q31A 2D1KA 2P9SB 3ZETB 1GLEG 4BRAA 3VF6A 1BWFO 3ULEA 3FZHA 1SQKA 2V51B 3MN7A 5BPNA 2I7PA 3VEWA 4HTLA 2BUPA 3WEEB 4CZEA 1GLAG 2P9LB 3VESA 1RDWX 4EFHA 4F9OA 3I33A 4KBOA 5AQYA 2YHXA 2NRHA 4DCHA 4I6MB 1NWKA 2QWMA 4FWRA 4O5FA 3DXKA 3A5OC 3M6GA 4L3QA 3BUZB 3H3OB 1QQMA 4J8FA 4CZMA 3BEXA 1QQOA 4B9QA 1ATNA 2E2PA 4BGBA 2YHYA 2HF4A 3EL2A 4XH5A 1D4XA 4ISFA 5EY4A 5AQNA 1NGFA 4B1ZA 1T6DA 4M7XA 3C7NB 1LCUA 2YI1A 5AR0A 4CZGA 2QXLA 4O8KA 4IJAA 4QS9A 2QWNA 1BUPA 3CJBA 3D7EO 4A61A 3FZMA 3QBXA 4HWIA 1V4SA 2YJEA 2HMPA 3CETA 3HSCA 2GWKA 3HTVA 1NM1A 3CJCA 2IVPA 3RSEA 3D2FB 1NGDA 4BR9A 3SMPA 2E88A 2Q36A 2P9SA 3ZETA 3UKUB 5AZJA 2E1YA 3MN5A 3WXKA 1NGEA 3EKSA 1HJOA 3QICA 1YXQA 4K42A 4A2AA 3R8EA 2ASPA 4BVOA 5JMVA 2P9LA 3ZX3A 3MCPA 4CZIA 3C0BA 4H5VA 5CE3A 4MLHA 3O08A 2GEMA 2P9UB 3EKUA 1TUUA 3DWLA 5F1XA 2A5XA 3O5BA 1MDUB 3FZLA 5EX5A 2GWJA 2FF3B 4MLEA 4CJ7A 5KPRA 1ZC6A 3BF3A 3MDQA 3WUHA 5FPNA 1XUPO 3H3NO 5JLHA 4BGAA 2IVNA 3VF4A 4PKHA 3FE1A 4H5NA 2P9KB 5ELZA 5EXWA 4JD2A 1GLFO 3HM8A 3JS6A 3IDHA 4PL7A 3DXMB 1SAZA 5BN9A 4E1JA 5AQUA 3O1BA 1HUXA 4CD1A 3MMVA 3LDNA 1S22A 5BN8A 4H0TB 4BC4A 5I9EB 5AQIA 5AQVA 1BA0A 3ZX0A 2E2NA 4IO8A 5AQZA 1DGKN 3FGUA 4PKIA 4BQZA 3IMXA 3HZ6A 1LOTB 1Z05A 2QWLA 1ATRA 3CHWA 2Q0UA 1U2VA 3WQUA 1NBWA 3P4IA 4FOEA 1KAZA 2GUPA 4FOIA 3RSEB 4CD3A 4DHYA 1NGGA 3ZEUA 2V7YA 3U9DA 2W41A 3F9MA 1RFQA 5FPEA 2YCHA 2ZGZA 3U8XA 5AZJB 4Y0WA 3OHRA 4RTFD 2A42A 1QZ5A 4IJNA 2E2OA 2P9UA 2Q2RA 1T6CA 2ZGYA 4XEIA 4LC9B 4BRHA 4Z94A 3BP8A 2CH5A 2GELA 1K8KB 3KZBA 4BG8A 2D0OA 1BO5O 3VGMA 4CZKA 5BRFA 1GLCG 3AAPA 2FSJA 5KQDA 4B1VA 3VEVA 4NO7A 1GLDG 1NGCA 5AZIB 3VEZA 5AQKA 4K43A 3LDPA 1S3XA 3JXUA 4PKGA 2CH6A 4A2BA 2ZWHA 3WXLA 1YUWA 3TU5A 3O4WA 1V4TA 4BR2A 1JCEA 1DEJA 3WXJA 1GLBG 2P9KA 1G99A 2V52B 1TUYA 2A41A 2EWSA 1C0GA 2VCPA 3J8AA 2H3GX 3HI0A 4FSVA 4CI6A 3D2EB 3DXMA 1SZ2A 4M7YA 3VEYA 4YDUC 4BRNA 3AARA 3L6QA 2Q0RA 1HPMA 4H03B 3BF1A 1J6ZA 4H0YB 4QS8A 4BRLA 4JNEA 1TYQB 3CJ7A 4H0XB 5F0XA 1JCGA 4JD2B 5AQWA 4C23A 3GL1A 4FWMA 5LJWA 1ZBSA 3QBWA 3VPZA 5EOYA 2E8AA 3O8MA 5KPZA 1HX1A 3L4IA 2P9NB 4BRPA 4B1XB 4WYBA 2CGKA 2PBDA 5AQJA 2IVOA 4FWOA 4BC2A 3U4LA 3VEXA 1ZXOA 1U2VB 1K8KA 2BTFA 4B1UB 2AA4A 2W40A 2AP1A 3ZEUB 5BREA 4FWSA 3SK3A 4EAHD 3VGLA 1WOQA 2FLOA 3CIPA 1XQSC 5AQMA 4BRFA 3H45C 5ADXA 3KHYA 5AZIA 4EHTA 3VGKA 3R6MA 1NGHA 2P9IA 3O80A 4DQ8A 2ASOA 1X3NA 2A40A 3CQXA 5KPTA 4FPAA 1WUAA 5AQGA 1MWKA 2VWBA 4BG9A 3M3ZA 4XH1A 3D2EA 3U9ZA 5FPDA 2ZF5O 5BPLA 4EIAA 4K41A 2ITMA 2I7NA 1IG8A 1U6ZA 1TYQA 3CJ9A 3LM2A 4BR5A 3VETA 2QWQA 2E2QA 3LDOA 3WT0A 4JHDB 2DPNA 5BRDA 4AM7A 4IXCA 4CZJA 5BR9A 4BROA 1C0FA 3W0LA 5JLFA 1CZAN 3IUCA 4FWKA 2P9NA 3IFRA 3CQYA 4ISGA 4BC3A 1BA1A 1E4FT 5BRHA 4NB4A 1NGJA 2FSNA 3FR0A 5AQTA 4MO4A 5AQLA 5TKYA 3LM9A 1HKGA 1GLJO 3GOIA 1E4GT 4BRGA 3LDLA 5JICA 3I8BA 3A0IX 4GY2B 3QMLA 2P9PA 3EO3A 4FWLA 2QW9A 3VF2A 3H46O 4CBUA 3EN9A 5EVZA 1ATSA 2A6AA 2ASMA 3A8YA 5FPMA 3GDQA 3SMSA 4BRDA 1KAXA 3R9PA 2QWRA 4RCHA 3LDQA 4H5TA 4FO0A 4BRCA 1ESVA 1Q18A 3VEOA 3UKRA 5KQ8A 1NMDA 5B8HA 2Q1NA 2P9IB 1P8ZA 2WUSA 4H0VB 3UB5A 3DAWA 3GG4A 3KVGA 4ISEA 4EHUA 4MO5A 4WQ4C 3ID8A 3AY9A 3QDKA 4AM6A 2E20A 1HLUA 4IWVA 4JHDA 3VENA 3ENHA 2HF3A 1JCFA 3G25A 4BR4A 5E26A 2PAVA 1QZ6A 3MK6A 4CBWA 2F9TA 1DKGD 4DB3A 4BRMA 2FSKA 3MN9A 4CZLA 4GNIA 3MN6A 3VOVA 1MWMA 4H0OA 4IZ9A 4BREA 5LY3A 4PL8A 3H1VX 2KHOA 3ATVA 1Y64A 5ADXH 3DJCA 4K25A 3QB0A 2IIRA 4WQ5C 3VERA 3ATUA 2A3ZA 4BR7A 3EZWA 1BU6O 2UYTA 3WQTA 2VYPA 1Z6RA 5AQXA 4BC5A 1XC3A 4CZFA 2P9PB 5AQFA 3W3DA 2E1ZA 2HOEA 2F9WA 3A5MC 4FPBA 3LL3A 1T44A 3SLCA 3SJHA 5E84A 4FWNA 4CZHA 2NLXA 4FL9A 2QM1A 4RWTA 1HKCA 1HKBA 1NGBA 3H1QA 4M63C 3A5NC 1H1VA 2D0PA 4B1WB 4CBXA 5AQPA 1OKJA 3FLCO 3GE1A 4WQ4A 4H5RA 3B8AX 3WEEA 3HBTA 2CGJA 4BRKA 3S41A 4YDUA 3UKRB 5BPMA 1IJJA 4XH4A 5AQOA 1NLVA 4I6MA 2FXUA 5AQQA 3ULEB 1BDGA 3GBTA 2QWPA 2CGLA 1YVNA 4BRIA 5AFUH 3O6WA 3L0QA 1R59O 2V7ZA 4FWPA 4JAXA 3H6EA 3CERA 2OANA 3CI5A 2FF6A 1MA9B 3FFKB 1YAGA 4BRQA 3DXKB 2Q97A 1NGIA 1QHAA 3C7NA 3ZX2A 5AFUA 4H5WA 1QQNA 3TPQA 4BQLA 4WQ5A 4H0PA 4FWQA 5AQRA 1RGIA 2J4RA 3QFPA 3CJAA 3AAQA 4A62A 1EQYA 1NGAA 5AQSA 4QS7A 1X3MA 2NZTA 4JN4A 2D4WA 1BG3A 5LJVA 2YJFA 3D2FA 3UE5A 1X9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5M1OA 3K5NA 5F2RA 4CIGA 4RW6A 2QTDA 4JRQA 4C8MA 5M1FA 4IEEA 4CJLA 1QSYA 2GTDA 2R7YA 3THVA 3HVTA 3MEEA 1W9HA 4GW6A 4HCBA 4KPYA 3CJ1A 1GLLO 4ICLA 5C2FA 4DSKA 1RT1A 3SJJA 4DFPA 3CCSN 3SQ4A 3VQ8A 1I3AA 3TSQA 4CJRA 5HRPA 4X66K 4BRAA 3VF6A 1BWFO 3TTCA 3ITHA 3HPGA 4FJLA 2BUPA 1RDWX 5M1NA 4J2EA 2OZMA 5FROA 3DLRA 4KB0A 2DFHA 3QINA 1IBKK 5AQYA 4JI0K 4DCHA 3AO3A 5HOOA 4N76A 3BUZB 5JVHL 1ZBIA 2OZSA 1QQMA 4CJ3A 3OYEA 3E01A 4CHOA 4DTPA 3SYZA 1WSIA 4M42A 3P5JA 4BGBA 4KHUA 1Q86O 1N5YA 3PX4A 2HF4A 3EL2A 2YHAA 3B6OA 1D4XA 4ISFA 4DTXA 3SQ0A 3FFIA 1YF5L 3LWMA 4JKHA 4M7XA 5C15A 1O1WA 3HYFA 1LCUA 1OVYA 2QXLA 4IJAA 4QS9A 2QWNA 4I2PA 3CJBA 4A61A 1IO2A 3CD6N 1V4SA 3THXB 3HSCA 4C8OA 1NM1A 4A5BA 3AVLA 3CJCA 4M3WA 2VQEK 2QKKA 1TKXA 1KVAA 4DSFA 3UKUB 2HVHA 1S5JA 2QEXN 2E1YA 3WXKA 1NGEA 1HJOA 3QICA 3HK2A 4CEFA 3SV3A 3ZX3A 3HSTB 3VTHA 3C0BA 4LH4A 4KB1A 1R0AA 4MLHA 3O08A 4CCHA 3DWLA 3VA0A 3CCLN 4E19A 4OLAA 2GWJA 4J2DA 3LP0A 2W42A 2NUBA 3QNOA 1IBLK 3HM9A 4DV1K 2G8WA 3Q7BA 1IV0A 4BGAA 2O8CA 4H5NA 2P9KB 1J5EK 5ELZA 1GOBA 4AHCA 3THXA 3MX5A 1N33K 3L3VA 2G8KA 1SAZA 5BN9A 5AQUA 4B9NA 3MMVA 3LDNA 1S22A 1BQMA 2KQ2A 4Z4IA 1BA0A 1NKEA 1ZBUA 1TL3A 1VSFA 3BZCA 4PKIA 3LP1A 4BQZA 5H1SQ 4JS5A 1OH7A 2G8VA 1LOTB 1Z05A 2QWLA 1ATRA 3CHWA 2Q0UA 3WQUA 1NBWA 3OS2A 4FZZA 2GUPA 1BHLA 1NGGA 2F8TA 2E4LA 1OH6A 2V7YA 3ZSOA 4Y1DA 1S9EA 2W41A 1W7AA 5FPEA 3I0RA 2ZGZA 4KV8A 4FJJA 4KHSA 5AZJB 4JI6K 1QZ5A 4IJNA 4X65K 4FJ5A 2B6AA 1T6CA 4XEIA 3OYNA 4CGJA 2CH5A 1K8KB 3KZBA 3CC7N 2D0OA 1D8YA 4UY8O 2B4JA 1C1BA 1GLDG 4HHTA 3VQPA 3PO4A 4MDBA 2PY5A 4WFNL 4FVMA 2XY8A 1LW2A 2KTQA 1V4TA 1RT6A 2P9KA 4CF9A 4BDZA 1TUYA 2A41A 3RMCA 3J8AA 2H3GX 3VQAA 1HYVA 1VAZA 4M7YA 1FK9A 1YJWN 3L6QA 1HPMA 4H03B 3J7ZO 4QS8A 4DSIA 4Z0UA 4JNEA 1YIJN 1TYQB 2UXCK 3TABA 2PFUA 3BZKA 1TKDA 2Y1JA 1EP4A 4FWMA 1KD1O 3T19A 1ZBSA 4BE0A 3VPZA 5EOYA 4CHQA 4AHUA 2E8AA 4CGFA 3L4IA 1RBRA 3I0SA 1SKRA 4EP5A 4BC2A 4DTSA 4H8KA 5IWAK 1RTDA 1ITGA 4I2QA 4IG3A 1K8KA 4B1UB 4CEOA 2AA4A 1RT3A 4KH6A 4I9LA 2AP1A 3ZEUB 3VQCA 4CEBA 5J2PA 3HP9A 4DV2K 3ZSZA 3CIPA 5LMNK 5ADXA 4CHPA 4ID1A 3THWB 1NGHA 2P9IA 1EX4A 3AVMA 1X3NA 5CHIA 5KPTA 4FPAA 4YORA 1MWKA 2HHQA 4XH1A 4WE1A 1XWLA 2OPPA 2HBMA 5BPLA 4K41A 1D9FA 1U6ZA 3OJUA 5I3UA 1TYQA 3L2VA 5C0YA 1Y97A 4B9TA 2QWQA 2XO7A 1TK0A 4JI2K 1SL0A 4GV9A 1UA1A 5LL6Z 4FLXA 3PX0A 4Z4HA 4DU4A 4C1NK 4CZJA 3EY1A 2KFNA 5BR9A 3DLBA 4BROA 4DLEA 3KLIA 3IUCA 2ITGA 1IKYA 3O9TA 4GV3A 5AQLA 4FJ7A 4BRGA 3LDLA 3OYKA 3I8BA 4CJFA 3RMAA 1XMQK 3P83D 3A0IX 4JEPA 4CJVA 3K57A 4GY2B 4DR1K 2P9PA 4FWLA 4M3UA 1K6YA 3H46O 4CBUA 4FLWA 4ZHRA 3OYFA 1XNRK 4FLUA 2QWRA 5KI6A 4RW7A 3J7AP 4JKEA 3CMEN 4CJ4A 3C95A 1RT7A 3O4NA 1Q18A 5KQ8A 1NMDA 1YI2N 4DSEA 2Q1NA 4A5AA 4H0VB 3TAPA 4BWMA 3KVGA 4ISEA 3SI6A 4FJXA 2VWJA 4MO5A 4O0IA 4JI5K 3R3LA 5C12A 2UUAK 4FLYA 3ENHA 2HF3A 3KLGA 4AHSA 4DUZK 4M3YA 4CBWA 2F9TA 5HROA 4DB3A 4B8AB 4MQ3A 1RDAA 3MN9A 4B3SK 1FKPA 4GNIA 3AVFA 4H0OA 2O8DB 4CEAA 2IS3A 3H1VX 2KHOA 4V19S 4W5QA 5J2QA 1X9MA 3QB0A 2IIRA 3VERA 3ATUA 2G8FA 2UYTA 4WF9L 2PYJA 4Q5VA 1KTQA 3G10A 1XC3A 4CZFA 3S3NA 4OJRA 3KLHA 4R79A 3VQBA 5HRRA 5E84A 4RWTA 1HKBA 4U7BA 1NJYA 3H1QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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