3EZWA

Crystal structure of a hyperactive escherichia coli glycerol kinase mutant gly230 --> asp obtained using microfluidic crystallization devices
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIDGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Crystal structure of a hyperactive Escherichia coli glycerol kinase mutant Gly230 --> Asp obtained using microfluidic crystallization devices.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 196
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA01
5KPZA 2P9UA 2P9PA 5AQVA 3L6QA 3GG4A 1GLFO 4PL8A 5FPNA 1TYQA 2AA4A 3C0BA 2QW9A 3M3ZA 1RFQA 3VGMA 1JCGA 4JD2B 3I33A 4F9OA 4I6MA 5AQJA 3DXKA 3CIPA 3O8MA 1V4TA 2E1YA 4BROA 5LY3A 1RDWX 2ZGZA 3DWLA 3DXMA 4WYBA 4FOIA 1LOTB 1JCEA 2ITMA 4BRAA 4FWSA 4HTLA 4ISFA 4H5VA 2CH5A 3EKUA 4CD1A 3FR0A 3CERA 4BC5A 4E1JA 3FZHA 4BR2A 3CQXA 3ZX2A 3L0QA 4H0YB 3VGLA 3O5BA 1X3MA 2D1KA 5AFUH 2E88A 3W3DA 3CJ7A 4Y0WA 2HF3A 3LDQA 3VEYA 5E84A 2V52B 3D7EO 2QWMA 5EXWA 1U6ZA 1QHAA 4BRPA 5AZJB 3UKUA 4BGBA 4BR9A 3AARA 5FPEA 2GELA 3MMVA 3RSEB 4B9QA 4CBWA 3HTVA 4H0TB 3SJHA 4CJ7A 1MA9B 5AQOA 5AQGA 1Z6RA 3C7NA 2A40A 2ASPA 5AQHA 3CJAA 4PKGA 3VERA 1IJJA 4JHDA 1GLAG 1U2VB 3EZWA 3O1WA 2P9UB 4BC3A 3KHYA 2P9PB 2QWRA 3ID8A 1NM1A 5B8HA 3HSCA 4BRIA 1ESVA 2UYTA 4CZMA 4BR4A 1BU6O 2ASOA 1TYQB 2YI1A 4O5FA 4WQ5C 4FWQA 1ZC6A 3OHRA 5AQFA 2FSKA 5F0XA 4K42A 4B1WB 3VGKA 5EOYA 3WXJA 4BRDA 4RWTA 2YHXA 4I6MB 2E20A 2NZTA 2Q2RA 3DXKB 3QICA 1EQYA 1TUUA 2ZGYA 3VF2A 4YDUC 3WEEA 1KXPA 3DXMB 4BRCA 2OANA 3WT0A 3UKRA 3VEOA 4BREA 3CJ1A 1QQMA 2IVNA 3LM2A 4CZJA 3MDQA 4MO5A 3LDPA 3WXIA 4B1YB 3AY9A 3EN9A 3CJCA 3SK3A 3ATVA 1ATRA 5LJVA 4BRHA 3LL3A 1KAYA 3QMLA 4H03B 3TPQA 1Z05A 2ZF5O 3TU5A 4NO7A 3GBTA 3VEXA 1LCUA 2A3ZA 5JLFA 3SMPA 1YAGA 5AZIA 4BG8A 3BUZB 5BPLA 1QQNA 4EIAA 3P4IA 2W41A 1NWKA 3O80A 1DGKN 1Q18A 4CZFA 1HJOA 4FO0A 3D2EA 5EY4A 1YVNA 3VOVA 2EWSA 1X9JA 4IJNA 4CZHA 4QS7A 1P8ZA 4FL9A 2CGJA 3VEWA 3UKUB 2AP1A 1ATSA 3R6MA 3CQYA 4M7YA 2CGLA 2GEMA 4BQZA 4BRFA 1NGHA 4GNIA 4JNEA 3BF1A 4A2BA 3KZBA 2V7ZA 1QZ6A 2NLXA 2V51B 5AQSA 5EVZA 3C7NB 4CZIA 2Q1NA 3S41A 3FLCO 4JHDB 2H3GX 4FWMA 1KAZA 3GDQA 2P9NA 4RCHA 1SAZA 1SZ2A 3WQTA 5E26A 4BR7A 3VEVA 3ZX3A 3L4IA 1GLEG 2E8AA 2HOEA 3A8YA 4CD3A 3ATUA 3H1QA 2YCHA 3QDKA 3WXLA 4K41A 2IVOA 4PKHA 4XH1A 1DKGD 2NRHA 2FSJA 3ZETA 5ADXA 5BREA 3MCPA 2FSNA 5AQYA 3WEEB 1HLUA 3UKRB 5AQWA 1V4SA 2QWNA 5BPMA 3W0LA 1XUPO 4QS8A 3WUHA 4H0OA 2QWOA 4BRNA 4JN4A 2ASMA 3QFUA 1YXQA 5KQ8A 1BOTO 1CZAN 5JLHA 1NGBA 2PBDA 3VETA 1GLLO 2BUPA 5EX5A 4BRGA 4CBXA 2I7PA 5AZIB 3DJCA 4O8KA 3A5NC 4BRKA 1K8KA 5LJWA 3VF4A 1T44A 1MDUB 3D2EB 4B1VA 3UE5A 3GE1A 4K25A 5AQMA 4Z94A 2ZWHA 3IDHA 3VPZA 1NBWA 3MK6A 2YJEA 2GTDA 3ZEUA 1NLVA 3LDLA 5BRFA 1NGIA 2CGKA 4H5TA 3BP8A 2F9WA 2HMPA 5BRHA 4WQ4A 2Q36A 5ADXH 3FGUA 1T6CA 2HF4A 2E1ZA 5ELZA 3UB5A 4J8FA 4A2AA 1NGDA 3EO3A 2E2PA 4XEIA 2P9NB 3FE1A 1R59O 2FLOA 1S22A 4DCHA 3QBXA 1IG8A 2P9SA 2P9LA 2Q31A 3M1FA 1NGJA 3IUCA 3MN5A 1OKJA 4BRMA 5JMVA 3ZETB 1H1VA 1Y64A 5BN8A 2YHWA 4PKIA 2P9IA 5AQTA 5KQDA 2E2NA 3H46O 3O4WA 5TKYA 3R9PA 2PAVA 4H5WA 1BUPA 4BQLA 1SQKA 3EL2A 4M63C 2E2QA 1QZ5A 2A5XA 1NGGA 3CETA 4IWVA 1NGCA 1TUYA 1XQSC 2Q97A 3GL1A 2P9KA 3QB0A 2DPNA 3O1BA 1C0FA 4K43A 4L3QA 1K8KB 3VENA 3LDOA 3KVGA 3A5LC 4BC2A 3H3OB 4CI6A 5KPRA 1HX1A 4FWLA 3DAWA 3QFPA 4DQ8A 4IJAA 3ZEUB 4XH4A 4BVPA 4IZ9A 1BDGA 4A61A 1X3NA 4CBUA 2I7NA 4BR0A 1NGFA 1MWMA 2A42A 4DHYA 3D2FA 4DB3A 2W40A 2D4WA 5AQZA 1J6ZA 4MLHA 3O08A 2CH6A 3ULEA 1YUWA 1GLBG 3FZMA 4NB4A 4CZEA 4FSVA 3HI0A 2VWBA 4GY2B 4EHTA 4FWNA 5AR0A 1NMDA 5KPTA 3CJBA 4B1ZA 5BRDA 2P9SB 3G25A 1S3XA 4BRQA 2P9LB 2D0OA 4EHUA 2GUPA 1BO5O 4AM7A 3IFRA 3H1VX 3VEZA 5BN9A 5BPNA 3WXKA 1HKGA 4JAXA 5JICA 4IXCA 3BEXA 2P9IB 3WQUA 3FZKA 4FWPA 5AQIA 1ZBSA 5AQRA 4BRLA 4RTFD 5AQLA 3SMSA 2KHOA 3HM8A 5AQUA 2J4RA 1NGAA 2QXLA 1BG3A 1E4GT 1HPMA 4BVOA 4H5NA 2WUSA 1DEJA 3O6WA 4BR5A 3JXUA 4C23A 3F9MA 5I9EB 2P9KB 2FXUA 3MN9A 2Q0RA 4WQ5A 3JS6A 1T6DA 3FZFA 1E4FT 3ENOA 4LC9B 4AM6A 1ATNA 3GOIA 4MO4A 4EFHA 3AAPA 3BF3A 4YDUA 1D4XA 3A5OC 2A41A 2FF6A 1G99A 2YJFA 2QWPA 1QQOA 2BTFA 2Q0UA 5AQQA 1NGEA 3CHWA 5FPMA 3D2FB 3H3NO 1XC3A 4FWKA 4FPAA 4JD2A 5BR9A 2QM1A 1BWFO 1C0GA 3ULEB 4FWOA 2E2OA 3AAQA 3H45C 2VYPA 3SLCA 4QS9A 5F2RA 3QBWA 4A62A 1GLCG 4EAHD 4KBOA 2V7YA 3J8AA 3HBTA 1BA1A 1GLJO 4B1XB 3ZX0A 1WOQA 5AQNA 4FWRA 1MWKA 2IIRA 4WQ4C 3LDNA 4H0PA 1HKCA 4FOEA 1GLDG 4PL7A 4M7XA 5FPDA 5AQXA 4XH5A 4BG9A 4BGAA 4CZGA 3FFKB 2GWKA 2QWLA 3MN6A 5AQKA 2YHYA 3MN7A 3A0IX 4H5RA 2IVPA 4IO8A 2FF3B 3CJ9A 3VESA 4HWIA 3HZ6A 1KAXA 2QWQA 2F9TA 3U9ZA 1WUAA 4BC4A 3LM9A 5AZJA 3U8XA 1ZXOA 3CI5A 3ENHA 3IMXA 1HKBA 3B8AX 4ISGA 5AQPA 3FZLA 3RSEA 5AFUA 4H0VB 4CZKA 4FPBA 1BA0A 4ISEA 3R8EA 5CE3A 1JCFA 4B1UB 4MLEA 2GWJA 2D0PA 3VF6A 3U9DA 3A5MC 1HUXA 4H0XB 4CZLA 3EKSA 2VCPA 1RGIA 3H6EA 3I8BA 2A6AA 3U4LA 5F1XA 1U2VA 3M6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBSA 2P9PA 4YHHK 5AQVA 3L6QA 4ZTJA 2HBMA 1GLFO 4PL8A 4G9ZA 5IT9O 3CG7A 1NKCA 1KQSM 4F9OA 2HNDA 4I6MA 3THWA 3LZJA 3ALYA 1RBVA 3CIPA 3QEWA 4ELTA 3N4PA 1SUQA 4BROA 3OYGA 1BIZA 1RDWX 1YTAA 2ZGZA 3DWLA 4AHVA 3C6TA 4WYBA 2QKKA 1JCEA 2E5LK 5J2MA 4FWSA 4DFJA 3NVMA 4CW7B 4E1NA 3TTCA 3AVNA 3NGZA 5I3UA 4CD1A 4JKCA 4E1JA 3NF8A 4FLTA 1RBUA 3ZX2A 3VGLA 2D1KA 2E88A 3W3DA 3CJ7A 2W42A 1JXEA 3KIOA 3CD6N 3EZ5A 4NXNK 3DRSA 2F8TA 4E7KA 3VEYA 3OA9A 2V52B 3D7EO 1QS4A 4DSEA 4BWJA 4U67L 5BR8K 1NK6A 4JKGB 3UKUA 4CJQA 2VQEK 1XHZA 4IG0A 3ZT4A 3CCVN 1HNXK 1XNQK 4ZHRA 5KGXA 5AQGA 1LV5A 1KSPA 2ITGA 3LP1A 4CJKA 5C2FA 3M8SA 4JHDA 1NNEA 2DY4A 2BDPA 4B9VA 1VQNN 4N47A 2P9PB 4FM0A 3HSCA 1ESVA 3SYZA 3WNFA 1BU6O 4AHUA 4K42A 1YIJN 4I6MB 3THWB 4FJXA 3ZSVA 3VF2A 4YDUC 4V19S 2Q3SA 1KXPA 3WT0A 5HROA 3VEOA 2W6LA 4KI6A 5DM7L 4CESA 1QSSA 4R5PA 2YHAA 1ATRA 4O8UA 3QERA 3NGYA 3IAYA 4DU3A 4H03B 3TPQA 4BDPA 2ZF5O 1L3TA 4YY3K 1L5UA 5AZIA 4BG8A 4E7IA 3MWTA 1T03A 1EXQA 4EIAA 3P4IA 4DSKA 4Y1CA 3O80A 5FRMA 1Q18A 1M1KO 1VSLA 1KFDA 4IJNA 3RMCA 4NXMK 4CGDA 5GAHP 1P8ZA 4FL9A 3UKUB 4IO9L 2QEXN 4M7YA 4BRFA 4JNEA 1VRUA 1QZ6A 2NLXA 5AQSA 5JVGL 5J2QA 4FJJA 1JLAA 3K5LA 5CZ2A 4CGFA 4CZIA 4F8RA 2Q1NA 3S41A 1KD1O 3FLCO 2FBTA 4JHDB 4CJVA 4DSFA 1T3VA 3TSQA 1O1WA 4FK0A 4GV6A 1IG9A 2E8AA 3MAQA 3MEGA 5HOOA 1VQKN 4JK8A 4PKHA 3V6DA 1DKGD 2PFUA 3KLHA 2FSJA 1TKDA 4QCLA 3NH2A 1HLUA 4YOXA 4BE1A 4CHPA 4O0JA 3CCLN 4JI7K 5BPMA 4W5OA 2NRVA 5HLFA 1QVGM 1XUPO 3WUHA 3PIOL 3OVNA 4OPJA 3L4QA 1BHLA 3LAMA 2HHVA 1BOTO 4CGHA 3PY8A 3CM6A 2ZJQL 3OYNA 3ZLJA 1GLLO 3NF6A 5EX5A 5GINA 5AZIB 2YNGA 4O8KA 4DR1K 3E66A 4IEIA 4CHZA 4BRKA 5LJWA 1ZBLA 5CZ1A 1VQMN 2UXCK 4RG8A 1NKBA 2YNFA 3IDHA 2YJEA 3VQDA 1REVA 5E41A 3EE9A 3LDLA 5BRFA 3QESA 1BL3A 5JS1A 4CE9A 3CCUN 4GKJK 4DTXA 1WAJA 3VMFB 2F9WA 5BRHA 3OYIA 5ADXH 4HCCA 1GOAA 2E1ZA 5LMUK 4QOZB 1IKYA 4A2AA 1ZBIA 4XEIA 3CMAN 1VHXA 4KPYA 3FE1A 4BE2A 3ZSRA 1TGOA 2FLOA 1S22A 4DCHA 4FW2A 4H4OA 3ZT3A 1M90O 1DLOA 3AVJA 1UOCA 4DTRA 5JMVA 3PIPL 2YHWA 4CF0A 3J7AP 3O9UA 3J80O 4WFNL 3PSIA 3PX0A 4CEBA 3RTVA 4DU1A 3J7ZO 2UUBK 4LF6K 4H5WA 3OYLA 2FBVA 3EL2A 2RKIA 1U04A 4FM2A 3BZCA 2OPRA 1NGGA 2RE2A 3CETA 3O3HA 4A5AA 3ZSOA 1CXQA 2ZD1A 4CJTA 4LF8K 5KRTA 1RDUA 3BDPA 3V1QA 4CHYA 3QO9A 5J1EA 3A5LC 4IOAL 3NF7A 3QFPA 4RW6A 4JV5K 4IJAA 1BGXT 1VQ9N 5GIPA 3B6PA 5CYQA 3TABA 3K9JA 4FZYA 1BQMA 3AVFA 3DLEA 4DSLA 3ZSQA 3O08A 2KTQA 3KWGA 1S1VA 1Z25A 5SWMA 2Z1GA 1IH7A 4NB4A 5FDLA 4CZEA 4FSVA 4DTOA 5GIOA 3HT3A 3MXJA 1UA1A 1NMDA 3MEEA 2O8CA 2HNZA 3CJBA 3THVA 5BRDA 4DSIA 3NH0A 1S3XA 1C1CA 4EHUA 2GUPA 3H1VX 5BN9A 5AJ3K 4JAXA 1OVQA 5JICA 5KRSA 3AO5A 3MXIA 4M3UA 5AQIA 4RTFD 5AQLA 1T05A 2KHOA 2HHSA 4ELVA 1NGAA 4OX9K 4OKEA 1N34K 2F4VK 3O9RA 3AVMA 4C23A 4ID1A 1S1TA 1YT3A 4CEQA 3E9PA 1YJNN 3ENOA 4YORA 4AM6A 3K5NA 4OKKA 3BF3A 1KVCA 4YDUA 1BISA 4FJ7A 2ZQBA 3A5OC 2A41A 3PO5A 2XO7A 4O0IA 4J2BA 4I2PA 1QQOA 2Q0UA 4IDHA 3QETA 2VG5A 4B9UA 4IFEA 3BZKA 1NGEA 3CHWA 3CFRA 4HUGA 1SL2A 3H3NO 2GUIA 3VA0A 3EEQA 1VSHA 4Z4GA 3RR8A 2X6SA 5CYMA 4FCYA 4I9QA 1C0GA 3E1YA 3VN5A 4F3TA 2Z1HA 3THXA 3AAQA 4DU4A 3H45C 1NJZA 3SLCA 2E6MA 5F2RA 3QBWA 3VQEA 4A62A 4AF1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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