2Q0RA

Structure of pectenotoxin-2 bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
total genus 122
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0rA03
4CI6A 1X9JA 4CZJA 1TYQA 5FPNA 2ASOA 3EO3A 3L6QA 4FWRA 3DJCA 1CZAN 2F9TA 2FSKA 2E1ZA 4BRNA 5AQXA 2H3GX 3MN9A 5EY4A 4K42A 1E4FT 1SQKA 3UE5A 5AQWA 1BO5O 1HKBA 3ENHA 3QICA 4FWNA 4IWVA 3IDHA 3WXIA 4CZEA 5BPNA 1HKGA 1KXPA 5KQDA 5AQHA 2FXUA 2WUSA 3DXKB 3A5LC 1LOTB 1T6DA 1TUUA 4BRKA 5KQ8A 1MWKA 3D2EA 4H0XB 3EZWA 1DEJA 3VOVA 1DKGD 2GWJA 3P4IA 2FSNA 1HUXA 3O6WA 2QWOA 5LJWA 2FF3B 1XQSC 2FSJA 3CJAA 5FPMA 1T6CA 4BRQA 3JS6A 3FZKA 3HSCA 2P9SB 4I6MB 4BC5A 3AAPA 3R9PA 2QWRA 4YDUA 1X3NA 3LDOA 3S41A 2AP1A 3U9ZA 3WXLA 2D1KA 5AZIB 4BR4A 3WEEA 1ZC6A 4PKGA 4EAHD 4FWOA 3VPZA 2I7NA 5AQTA 5AQYA 4NO7A 5AQKA 5BPMA 3BF3A 3HM8A 1QQOA 4H5RA 1ESVA 1C0GA 1NMDA 2EWSA 4H5VA 2OANA 3VGKA 1HX1A 1BWFO 4K25A 3GE1A 5E26A 3A5OC 4ISGA 3FZHA 3SLCA 4BG8A 2BTFA 4GNIA 1V4TA 3D2FA 3DXMA 2ASMA 3KZBA 3GG4A 4BRGA 1V4SA 4XH1A 2PAVA 2VYPA 2IVOA 2QWPA 4PKIA 2YCHA 4RCHA 4BREA 4NB4A 1KAZA 4IJAA 2YJEA 4BRHA 5E84A 2KHOA 4J8FA 3GDQA 2VCPA 5ADXH 4H03B 5EXWA 3EL2A 3SMSA 2A3ZA 4BR9A 5F1XA 5LJVA 5AQSA 4EIAA 4BR7A 1NBWA 3IFRA 3CETA 5KPRA 3GOIA 3GL1A 3MN7A 3VF6A 1X3MA 2D0OA 2QW9A 3EKUA 1MWMA 4BRPA 4BRIA 2CH5A 4FPBA 3TPQA 2CGLA 3WQTA 1QQMA 4EFHA 4WYBA 4BC4A 1NGAA 4DHYA 3O4WA 3D7EO 5AFUH 1GLDG 3LDLA 1S22A 3VGMA 4AM7A 2A6AA 3QMLA 1ATSA 5AQZA 4BGBA 5AZIA 3CIPA 1J6ZA 3CJBA 5JLFA 3WEEB 4HWIA 1GLJO 2Q0RA 4IZ9A 5AQFA 4FL9A 3C7NA 3CJ7A 4H5NA 4K41A 4BVOA 5KPTA 2E2NA 1JCEA 4WQ5C 1H1VA 4CZKA 1GLFO 2E2OA 2V52B 4AM6A 4PL8A 3D2FB 2D4WA 3DXMB 3H46O 4FWSA 4QS8A 2CGJA 4BR2A 5BRHA 4PKHA 1NGGA 3I8BA 3QBXA 3WXKA 1TUYA 1HKCA 1Z05A 4WQ5A 3M3ZA 1D4XA 3KHYA 2QWLA 4A2AA 5AQOA 3A5MC 3H3OB 3ZX3A 5I9EB 4BC2A 1BA1A 2CH6A 2V7YA 4CZIA 3DAWA 3MCPA 1SAZA 2IVNA 3BP8A 1NWKA 1HJOA 1MDUB 1DGKN 4IXCA 4BRMA 2NZTA 4GY2B 1YUWA 3VGLA 2Q1NA 3AARA 4H5TA 4DCHA 2E88A 1NGFA 1RDWX 3H3NO 3VEVA 3I33A 1Q18A 1ATNA 4EHUA 3SK3A 5F0XA 3FLCO 2Q31A 3H1VX 5FPDA 2W41A 5BN9A 3A8YA 1XUPO 4FWQA 4CBXA 1ZXOA 3W3DA 2GTDA 5AR0A 2IIRA 1HPMA 2BUPA 3O8MA 3ZETA 4CBWA 5JICA 1NLVA 1Z6RA 3QFUA 3SMPA 1YXQA 3M6GA 4M7YA 3LDPA 2CGKA 4FWMA 4Z94A 3FE1A 4QS9A 5LY3A 2P9IA 1BUPA 2QM1A 4XH4A 5AZJB 3CI5A 4KBOA 1ATRA 3VESA 3C7NB 3FZFA 3H6EA 2P9UA 1GLLO 4WQ4C 5EX5A 3WT0A 4B1WB 2GUPA 1NGCA 2A42A 4CD1A 3LDNA 4H0PA 2P9NA 4BR0A 5AQMA 5AQVA 1U2VB 3O1WA 1BG3A 4FWPA 5JLHA 5AQIA 5JMVA 4QS7A 1K8KA 4DB3A 3VEXA 1Y64A 3ZX0A 1KAYA 4BRAA 3QDKA 3DWLA 1C0FA 3QFPA 2Q36A 3ATVA 2E2PA 2V7ZA 1QZ6A 4FWKA 1IG8A 4ISFA 3ULEA 3R8EA 2YHYA 4M7XA 4CZMA 4CZFA 4C23A 3ATUA 4B1XB 4MO5A 3QBWA 5KPZA 1OKJA 3LM2A 3UB5A 4B1ZA 3M1FA 4EHTA 3EKSA 1HLUA 1T44A 4CBUA 2QWQA 4BRLA 3LL3A 3HTVA 3ENOA 1R59O 3VERA 2P9KA 1RGIA 4F9OA 3O5BA 3WXJA 3H1QA 2P9PB 3ZX2A 4A62A 3FZMA 3IMXA 3WQUA 3WUHA 2E20A 3UKUB 1SZ2A 3ZETB 5BRFA 2GELA 4XH5A 1XC3A 3VF2A 3CERA 1BDGA 5EOYA 2AA4A 5AZJA 2P9IB 3HBTA 3R6MA 4IO8A 5BRDA 5AQJA 4CD3A 2ASPA 2DPNA 3FGUA 2A40A 4M63C 3HI0A 2ZF5O 3BF1A 2P9UB 2V51B 3KVGA 3O1BA 3OHRA 4HTLA 4BR5A 3G25A 3JXUA 1YVNA 2P9NB 1U2VA 3IUCA 3MDQA 4A61A 2NLXA 2VWBA 1K8KB 2P9LA 3FZLA 3AAQA 5AQQA 4B1YB 2GWKA 3EN9A 3CJ9A 1NGJA 3BEXA 4Y0WA 2E2QA 4BQLA 1EQYA 2GEMA 3LM9A 4CZHA 2D0PA 3HZ6A 4L3QA 3ULEB 1NGDA 4H0TB 2E8AA 1NGIA 2A5XA 3L4IA 1NGEA 4H0OA 1LCUA 3W0LA 3LDQA 1S3XA 2ZGZA 1GLBG 4FOEA 2FF6A 4B1UB 3FR0A 3QB0A 1IJJA 4BRDA 2P9KB 1BA0A 1BU6O 4MLHA 2P9PA 4MO4A 4DQ8A 1NM1A 1BOTO 1RFQA 3UKUA 5AQRA 1WOQA 3RSEA 3B8AX 2Q97A 4JHDA 5BR9A 3U4LA 5AQNA 3ZEUA 3MN6A 4YDUC 5BPLA 2YHXA 3O08A 2HF4A 3VEYA 4MLEA 5ELZA 2ITMA 3H45C 3VETA 2A41A 4A2BA 3A5NC 5EVZA 4JN4A 3CJCA 5BREA 3BUZB 4BG9A 5AQUA 3VENA 4BVPA 4BRCA 2Q2RA 2W40A 3L0QA 4JD2A 3F9MA 5ADXA 2IVPA 3CJ1A 2Q0UA 4BRFA 3A0IX 1U6ZA 1QHAA 4FWLA 1GLEG 4WQ4A 4BC3A 2P9LB 3UKRA 4CJ7A 2YHWA 4FSVA 4O5FA 1NGBA 1GLCG 2E1YA 5CE3A 1GLAG 4CZGA 1TYQB 3CHWA 3VEWA 2QXLA 4JNEA 3VF4A 4PL7A 2HOEA 2ZWHA 3VEOA 2NRHA 4B1VA 5BN8A 1YAGA 5AFUA 4BGAA 3MN5A 3O80A 1G99A 2HF3A 3GBTA 5TKYA 1JCFA 3TU5A 5FPEA 5F2RA 5AQLA 1KAXA 2QWMA 1E4GT 3DXKA 5AQGA 3VEZA 5B8HA 2I7PA 2YJFA 4ISEA 3MMVA 4RTFD 5AQPA 3U8XA 3FFKB 1WUAA 2J4RA 3RSEB 2YI1A 3D2EB 4JHDB 1QQNA 3ID8A 1P8ZA 4O8KA 2HMPA 3ZEUB 1QZ5A 4CZLA 3AY9A 4LC9B 4XEIA 2F9WA 4BROA 4H0VB 3J8AA 2UYTA 4FPAA 2P9SA 2PBDA 4I6MA 3SJHA 3C0BA 4B9QA 1MA9B 4K43A 2ZGYA 3U9DA 1ZBSA 3CQYA 4BQZA 4JD2B 4JAXA 4H5WA 1JCGA 1NGHA 2FLOA 4FOIA 3CQXA 4RWTA 2QWNA 4H0YB 3MK6A 4FO0A 4E1JA 3UKRB 4IJNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TYQA 3V1RA 2OYQA 3KKRA 2DY4A 1VQ9N 2F9TA 1BIZA 3P39A 3U6FA 1T05A 4N76A 1WBDA 4RG8A 4J2BA 1YI2N 1O1WA 2RF2A 1RTDA 4O4GA 3NHGA 4KHPK 1HKBA 3ENHA 1NK5A 4BEBA 5BPNA 1HKGA 5KQDA 1YVUA 2FXUA 4J2DA 2OPPA 4CW7B 3CCLN 4BE2A 4Z4GA 4H0XB 3VQPA 3SAGA 1VQ8N 2RN2A 3AVAA 4DR3K 1DEJA 3AVHA 3LP3A 2DFHA 1DKGD 4OGCA 1HUXA 2QWOA 1YJ9N 1XQSC 4I9QA 5FPMA 4KKOA 1T6CA 3OS2A 3HSCA 5H1SQ 1N33K 4BC5A 5I3UA 2QWRA 3NH2A 2UXCK 3LDOA 3S41A 2AP1A 1KLNA 3WXLA 3MX2A 3AVJA 3QIOA 3QO9A 5AQTA 5AQYA 3BF3A 1RTHA 1ESVA 2EWSA 3VGKA 2OANA 4E72A 3NDKA 4Z4FA 1I3AA 5C2DA 4JKEA 3GE1A 4PA1A 3DM2A 4ISGA 4E7KA 4JKHA 4FXDA 1NK9A 3D2FA 3RTVA 2RE2A 3GG4A 3CC2N 1KD1O 4KO0A 2VYPA 5C10A 1RT1A 2IVOA 1RDCA 2RKIA 4PKIA 4B08A 4BREA 4NB4A 3L2RA 1HJRA 2YJEA 2F8SA 3RRHA 3R1XA 4FJGA 1JXEA 3E9PA 4JI0K 3C6HA 3TSPA 5KI6A 3EL2A 3SMSA 2E4LA 1NK6A 4GMJB 4GKKK 1QE1A 1WN7A 3K5NA 1TGOA 2PZSA 3IFRA 3OYCA 1VSKA 4YHHK 1NK8A 1CXUA 3VF6A 3HOTA 1SKWA 2QW9A 3DI6A 1S9EA 4I2QA 4FPBA 3TPQA 1C0MA 1BHLA 2CGLA 3WQTA 5J2NA 1T3VA 4WYBA 4W5OA 2D5RA 3D7EO 3QEXA 4B3TK 2UUAK 1GLDG 3LDLA 1S22A 4CEBA 5KGWA 4XJXA 4BGBA 3O9UA 4FZXC 3CJBA 5HOOA 4HWIA 1GLJO 2Q0RA 4IZ9A 4BECA 3N4PA 4CJUA 3L2QA 2VGMA 1JXBA 1KFDA 2E2NA 1JCEA 4B9MA 4A59A 3V9XA 3G6EN 4GV3A 3ZCMA 3AO4A 4M41A 3WXMB 3CM5A 3D2FB 3SPZA 1EP4A 3RMCA 3H46O 3LAKA 3MAQA 4DV1K 1VSEA 2RHKA 5EU7A 1SS6A 1A5WA 4KTWA 1Z05A 4KB1A 3HPOA 3KHYA 3J7YP 2QWLA 3MEGA 4IFVA 2O8EA 2HBLA 3NH0A 3CPWM 2IVNA 1HJOA 3I56N 1E3MA 3AARA 4DCHA 1DT9A 1RDWX 4M3TA 4O0IA 3VEVA 4DSIA 5T7BA 3Q7CA 4AH9A 2P5OA 1RBRA 4JI8K 1BQNA 4LF8K 3TAFA 2Q31A 3IG1A 1TAQA 5IT9O 1XUPO 3TARA 1QSLA 4DS5A 3P83D 2KFNA 2IIRA 3J7ZO 2HBJA 1B9DA 5JICA 1BI4A 1Z6RA 1YXQA 1NK0A 3M6GA 4Z94A 3LDPA 1YIJN 3CYGA 2QM1A 4H4MA 1S72N 1U4BA 4JK9A 2PY5A 4LF6K 3QIPA 4LSNA 4EP4A 2PFUA 3QERA 4KFBA 4O5BA 4KI6A 1Z26A 1NGCA 2YHAA 2PYJA 4FM0A 3MWTA 1L5UA 1U2VB 1BG3A 5AQIA 5JMVA 3ZX0A 1EX4A 3QDKA 1C0FA 3CFPA 1ZBIA 2E2PA 4JYAK 2O8EB 4IOCL 4U67L 4ISFA 2KFZA 3QEIA 1NK7A 1RCHA 3R8EA 3CMEN 3I55N 2YNHA 3VTHA 4KAZA 5KPZA 5SWMA 4CCHA 2FBVA 4GV9A 4F2RA 1TKTA 1S1UA 3TTFA 1RT5A 3TAEA 4CBUA 3HTVA 4DV4K 1ASVA 3ENOA 3OA9A 1RGIA 3L2UA 1YJNN 3O5BA 4MFBA 4Z0UA 4DR1K 3FZMA 3IMXA 2ZQBA 1BI4B 5C0YA 4DR6K 4B3OA 5BRDA 4CJ5A 4CD3A 1VQNN 1W9HA 4M63C 1BQMA 3VQAA 2GV9A 4DFPA 4FJ7A 3KLGA 3CCRN 2ZF5O 3BF1A 2V51B 3KVGA 3G25A 5C15A 3MDQA 2VWBA 3AA3A 3THVA 2P9LA 1YF5L 3ISNC 4FK4A 3AAQA 2GWKA 4B8AB 3CJ9A 1NGJA 4Y0WA 3P5JA 1WSGA 3HYFA 4OJRA 3AGRA 1WBBA 2XY8A 3DMJA 3VQDA 2A5XA 3L4IA 1NJYA 3THWB 1X9MA 1N8RO 1LCUA 4CJRA 1TAUA 3SUPA 1GOBA 2ZGZA 5GINA 3RWUA 4DQSA 3O9SA 4DFJA 1VSFA 4MLHA 2NRTA 4IFYA 4IOXA 4W5QA 4DQ8A 4CECA 3UKUA 3ZT0A 3IAYA 1YTAA 5BR8K 3MN6A 5BPLA 3OYFA 1KVBA 4MLEA 4DLEA 4E7JA 4DTJA 4JK8A 3A5NC 1S6QA 1IO2A 2AJQA 3CJCA 5BREA 4BG9A 3SBTA 4BRCA 2W40A 3AGKA 3F9MA 4RW8A 2Q0UA 3K5MA 3UIQA 2HHHK 1S5JA 1QHAA 2VQFK 1S1XA 4O44A 4NCAA 4WQ4A 4LSLA 2P9LB 3D6RA 2YHWA 1IBMK 2HHWA 1RBSA 1XWLA 1BCMA 2YKMA 1YT3A 1XMOK 4W5NA 2HHQA 3CCJN 4CHYA 3VEWA 1Q82O 2QXLA 2HOEA 2NRHA 4E7IA 3TR8A 4CIFA 2W6KA 1VQPN 3CD6N 3O80A 1FK9A 1QQCA 5TKYA 3TU5A 2JWKA 4AHTA 3LANA 4F4KA 4KHNA 2C1GA 1KAXA 3P1GA 3DXKA 5FRMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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