2Q0RA

Structure of pectenotoxin-2 bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 122
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0rA03
3GBTA 2E1ZA 1NMDA 2ZGYA 5AZJA 2J4RA 1GLDG 1NGAA 4BC4A 1X3NA 2E2OA 1DEJA 3LDPA 1T6DA 5LJVA 4M7YA 1Y64A 1LOTB 4F9OA 4BR7A 4CBUA 3GDQA 2HF4A 3FZFA 3SJHA 5BN9A 3HTVA 4BRMA 3LDOA 5AQUA 3D7EO 4BRHA 1Z05A 3D2EB 1GLJO 3R6MA 4XH4A 4BRGA 2QWNA 4H0VB 3KZBA 4H0XB 4XH1A 4BC3A 3IFRA 5ELZA 4WYBA 1GLFO 3VGKA 3DXMA 2NLXA 5AZIB 1NGGA 3U4LA 1J6ZA 3UE5A 5AQKA 3I33A 4EIAA 3DXKA 4BQZA 2P9LB 1BU6O 1CZAN 5AQLA 4AM6A 3DAWA 5F1XA 2VYPA 2P9NB 1Q18A 3ZETB 4CZKA 2P9IB 3OHRA 1NLVA 2F9WA 2GTDA 3O6WA 1SZ2A 3R9PA 4FWSA 3WEEA 5AZIA 3KHYA 3L4IA 3CJ1A 2GELA 4MO4A 1TUUA 4JAXA 4A2BA 2VWBA 5EX5A 1JCEA 3WQTA 5LJWA 4JNEA 4CBWA 2P9SA 4PKIA 4BRLA 3U9ZA 5FPMA 2QWMA 1BG3A 1NWKA 4CI6A 5JLFA 3LM9A 3BF3A 4CZLA 3JXUA 2IVOA 3AY9A 3CQXA 4MLHA 4FWLA 3QICA 1XC3A 1QQNA 2A6AA 4LC9B 3WXIA 4BR4A 2Q97A 5JMVA 3ENOA 2DPNA 4BRPA 3S41A 3GL1A 1QQOA 4FWKA 4M63C 1TYQB 5AQJA 2Q0RA 3A5MC 3MN5A 4M7XA 2NZTA 3VETA 4BGAA 1HX1A 4K42A 4B1UB 3CJCA 4BRAA 4QS7A 2ITMA 3UKRB 3LDNA 5FPNA 2H3GX 2PBDA 2D1KA 4H5RA 3SMSA 3MN9A 4WQ5A 4FWMA 4IZ9A 2CGLA 2NRHA 4CD3A 5FPDA 1ATRA 3ZEUA 3ULEB 3EL2A 1IJJA 1BA1A 3HSCA 4CZJA 4Y0WA 5E26A 5FPEA 1U2VB 4ISGA 5BN8A 5AQZA 5AZJB 4BC5A 3O8MA 4I6MA 4BR2A 1XQSC 3MMVA 1ATSA 1WUAA 3A0IX 4JHDA 2CGKA 3AARA 1GLBG 2YHWA 5AQYA 1K8KA 4PKGA 3D2FB 5CE3A 1LCUA 3QFPA 1U2VA 2FSNA 2BTFA 1ZXOA 3QBXA 3VENA 2QWPA 3LDQA 3O4WA 1SQKA 1Z6RA 5AQVA 3O80A 1ZC6A 3MN7A 1MWMA 3LL3A 3VEWA 3U9DA 1EQYA 4MO5A 1C0GA 2HMPA 3D2FA 3DXMB 4CZEA 4CZGA 2E2NA 4CZIA 5JLHA 4FPAA 4B1VA 5ADXA 5I9EB 4RTFD 4EAHD 4H0YB 5AQHA 3DXKB 1ATNA 4FOEA 3QDKA 4RCHA 3L6QA 2E8AA 1E4FT 3BUZB 2FF3B 4FL9A 1V4SA 4RWTA 1NGJA 3UB5A 3B8AX 4CZHA 4E1JA 3BEXA 3WEEB 3ZX0A 3A8YA 2A42A 4H0OA 3ZX3A 5LY3A 5AQQA 4FWQA 2D0OA 3KVGA 4IJAA 1NBWA 4PKHA 2Q1NA 4FO0A 4BVPA 4A61A 1NGCA 4BRIA 5AFUA 2QW9A 5AQRA 2A5XA 2PAVA 2IIRA 5EY4A 2HF3A 2P9KB 3VGLA 3CETA 2P9SB 4BRFA 2W41A 3VF4A 4JD2A 3A5NC 3J8AA 4IXCA 2HOEA 3TU5A 3HM8A 3QBWA 3O5BA 3WUHA 1YXQA 3AAQA 4B1ZA 4DQ8A 1T44A 5AQXA 3CJBA 1ZBSA 3EO3A 2P9PA 4GY2B 4BREA 2P9UB 4YDUC 1JCGA 4WQ4C 4FWOA 2FSJA 2P9KA 1QQMA 3BP8A 5F2RA 4BRKA 1HKBA 3O1BA 4BG8A 1ESVA 1GLCG 3HBTA 4BRNA 3MCPA 3H3NO 3RSEA 1GLEG 2Q0UA 4QS9A 2P9UA 4XH5A 4A62A 3A5LC 3SMPA 2D4WA 2AA4A 3H1VX 3G25A 3GG4A 3P4IA 4NO7A 5KQ8A 2GWJA 3R8EA 3VEZA 5BPNA 3M1FA 2QWLA 3JS6A 3CERA 3DJCA 1BUPA 3ZEUB 4IO8A 4FWPA 3SLCA 3FLCO 3CI5A 2QWRA 2E88A 1BO5O 2V51B 5BRFA 2ZF5O 4CZFA 2A41A 1HPMA 1P8ZA 3WXKA 4H5TA 4I6MB 3C7NA 4FWNA 5AQNA 3QB0A 3C0BA 1MDUB 3W3DA 4JHDB 2V7YA 2E2QA 1K8KB 1GLLO 1KXPA 4K25A 4YDUA 5BREA 1NGEA 1QHAA 3A5OC 4WQ4A 1S22A 3L0QA 3VGMA 3FZKA 2E2PA 4EFHA 1MA9B 3U8XA 1HKCA 1NGFA 1QZ6A 4H03B 4PL8A 4FSVA 4BRCA 2Q31A 3FZLA 4B1YB 2QXLA 3EZWA 1YAGA 5E84A 4AM7A 2F9TA 4CJ7A 3MDQA 1G99A 3FGUA 1X3MA 4H0TB 4O5FA 2BUPA 1SAZA 4K43A 2V52B 5ADXH 2V7ZA 3IUCA 4K41A 1RDWX 5B8HA 2YCHA 4ISFA 4DHYA 1NGDA 3F9MA 2E20A 4ISEA 5AQGA 2QWQA 3VEVA 4Z94A 4BG9A 4EHUA 2EWSA 3CJ9A 2WUSA 4B9QA 2D0PA 3VEYA 5TKYA 1HJOA 3H3OB 3IMXA 5AFUH 1NGBA 5F0XA 4BRQA 1RFQA 4JD2B 1KAZA 1BDGA 2ASMA 2A3ZA 2ASPA 4DB3A 5EVZA 5KQDA 1IG8A 3FFKB 1WOQA 2P9PB 4BQLA 5AQFA 5KPRA 4C23A 3M3ZA 2UYTA 1U6ZA 3WT0A 4PL7A 5JICA 3H6EA 3BF1A 2YJFA 3UKUB 4BR0A 1BWFO 5BPLA 2GWKA 4BRDA 1TUYA 5BR9A 2AP1A 3MN6A 3VESA 4L3QA 3RSEB 3D2EA 2ZWHA 4MLEA 4CBXA 5EXWA 3WXLA 1E4GT 3FZMA 3I8BA 3W0LA 3TPQA 3UKUA 3CIPA 4IJNA 5KPZA 4KBOA 4WQ5C 3QFUA 2QWOA 4BROA 3FE1A 4BC2A 5BRDA 3WQUA 1H1VA 1S3XA 3H46O 1YUWA 2E1YA 3VERA 4QS8A 3CQYA 5AQSA 4H5WA 2I7NA 1MWKA 1XUPO 4BGBA 2P9LA 3O1WA 4B1WB 2ASOA 4A2AA 4FWRA 4NB4A 4XEIA 4IWVA 1GLAG 2P9NA 3VPZA 1KAXA 5AQTA 3ZETA 3H45C 1DGKN 2GUPA 2P9IA 4EHTA 2CH5A 3VEOA 5KPTA 3HZ6A 5BPMA 1JCFA 3LM2A 3VF6A 5AQPA 3VOVA 3ZX2A 2IVPA 1R59O 3C7NB 3LDLA 3MK6A 1NGHA 4H5VA 3DWLA 1BOTO 2KHOA 5AQMA 1T6CA 3GOIA 1HLUA 5BRHA 3ENHA 4H5NA 3QMLA 3EKSA 3M6GA 4J8FA 1C0FA 2ZGZA 3VEXA 4CZMA 5AQWA 1OKJA 2GEMA 4FPBA 3CHWA 3VF2A 3EKUA 4DCHA 4BVOA 4HWIA 3ATVA 1D4XA 1NM1A 1BA0A 4B1XB 1X9JA 4FOIA 1V4TA 4H0PA 2CH6A 3AAPA 2I7PA 3H1QA 2YJEA 1KAYA 4O8KA 2FLOA 5AQOA 1TYQA 2Q36A 3FR0A 4JN4A 3SK3A 2Q2RA 2FXUA 3CJ7A 3IDHA 1HKGA 3ATUA 1QZ5A 2YHYA 4GNIA 3UKRA 2W40A 1RGIA 2QM1A 2IVNA 5AQIA 3EN9A 1YVNA 5AR0A 3FZHA 3ID8A 4BR5A 3HI0A 3ULEA 4BR9A 2A40A 3CJAA 4CD1A 1DKGD 1NGIA 4HTLA 2OANA 3GE1A 2VCPA 3WXJA 2YI1A 1HUXA 2FSKA 5EOYA 2FF6A 2YHXA 3O08A 2CGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GBTA 2E1ZA 3NH0A 1KTQA 2ZGYA 4E7IA 1GLDG 2UXBK 3KK1A 3HO1A 3O9SA 1YTUA 1RT4A 4M3XA 1DEJA 3LDPA 1T6DA 4CJTA 4FJLA 1Y64A 3O9TA 3MWTA 4FJ8A 4BR7A 3GDQA 2HF4A 1XMOK 5BN9A 1N5YA 4BRHA 4E19A 1VSEA 3PIPL 2C1GA 4ELVA 2QWNA 4H0XB 4CEDA 1HYZA 4XH1A 5GIOA 4M3RA 1BHLA 3IKMA 3VGKA 1TKXA 5AZIB 1A5VA 4E0DA 1NK9A 5AQKA 2QKKA 3I33A 1OVYA 3AVCA 5GIPA 5M1QA 4C8LA 1CZAN 4AM6A 1N34K 3DAWA 1ITGA 4CGHA 2P9NB 4CF8A 3CCUN 4DSKA 1VSIA 3FFIA 4FWSA 3VN5A 4E7HA 1KQSM 1WSIA 1VAZA 4JAXA 1VSKA 1N6QA 2VWBA 3DYAA 1NKBA 2O8EB 1JLBA 2G8WA 1IBLK 5EX5A 1JCEA 4DR4K 3TWHA 2G8IA 4CBWA 1U47A 4CJEA 3U3GA 2A1SA 3HJFA 1BG3A 3LP2A 3CCVN 3L8BA 1J5EK 3LM9A 3BF3A 3SPYA 1WSHA 3JXUA 4MLHA 4DTMA 1RBSA 4FWLA 3QICA 4JS5A 3Q7CA 2A6AA 1OH7A 1JL2A 4U7BA 1DT9A 3LPUA 1WSGA 4O55A 1ZBLA 5C15A 3KK7A 1TYQB 1HX1A 2XRIA 4MFBA 5FPNA 4KH6A 2H3GX 1UA0A 2W42A 1NKEA 5KGWA 2ZM6K 4WQ5A 3HPHA 4FWMA 3J81O 2CGLA 1SV5A 1SL0A 1U45A 3MEEA 3EL2A 1BA1A 3HSCA 4ZTJA 5FPEA 3L2WA 3KLFA 1FK9A 4LFCK 2XY6A 4CECA 1XQSC 4YFUA 2X6SA 2DFEA 3KTQA 1C0MA 1GLBG 4AHCA 5AQYA 3D2FB 3L3UA 2G8HA 3QFPA 3S9HA 1VQ8N 3O4WA 1FJGK 2RKIA 1SQKA 4KB1A 3O80A 4CK1A 1NJIO 4X66K 2KFNA 4CEBA 5HRNA 4CGIA 2KKZA 3U9DA 1EQYA 4MO5A 2HMPA 4C8KA 2PYJA 1I3AA 1A5WA 5SZTA 3NGYA 4DTUA 5JLHA 5M1KA 4DMNA 1LAVA 4FPAA 5I9EB 1HNXK 4FOEA 3QDKA 4RCHA 2UU9K 3JAMO 5J2PA 1E4FT 1B9FA 4NLBA 2FF3B 4U67L 1NGJA 4B3MK 4KHUA 3AVBA 2HHIA 3F9KA 2D0OA 3VQPA 4A5AA 1TK8A 2O8CA 4A61A 5FDLA 4BRIA 2Z1GA 4DKWA 2A5XA 5EY4A 3QETA 4BRFA 3IAYA 4JK8A 4RG8A 4FK4A 4AQYK 3SUPA 4DTXA 1VRTA 3LDSA 3A5NC 4IXCA 3QBWA 3O5BA 3WUHA 4YOUA 2HHSA 3HM9A 4YDUC 1SL2A 3VQAA 1BGXT 3OYGA 4F8RA 1SS6A 2FSJA 1QQMA 3BP8A 5DMRA 1HKBA 3CD6N 4HCBA 3L2VA 1O13A 1RBUA 4BRNA 1FKPA 4A62A 4QS9A 4XH5A 4FLTA 2AA4A 3H1VX 4BDPA 3GG4A 1BIUA 3D0PA 4LF5K 3OYKA 4O44A 3SYZA 3O4NA 3NF7A 4CJKA 5HLFA 1C1CA 4OPKA 4IO8A 4CIFA 2D0BA 4FWPA 3SLCA 4O4GA 3OYAA 3CI5A 4DTPA 4CF0A 4ICLA 3K57A 3QEVA 1CZ9A 2A41A 1QVFM 3RR8A 2O8BA 3C7NA 1J54A 3QB0A 4HUEA 3K58A 2WONA 1VQ7N 5GAEP 4PUOA 4CIGA 5BREA 1QHAA 2HHWA 3DLLL 3CC2N 4Z4FA 3VGMA 3FZKA 3ZCMA 2E2PA 5CZ1A 4KHYA 3NCIA 1RTJA 3NGZA 4OPJA 4FSVA 4BRCA 2Q31A 4BWMA 2QXLA 3EZWA 1YAGA 3T7ZA 5LMUK 3J80O 3HVTA 4B9NA 5KI6A 5M1PA 4CFDA 1NK6A 4O5FA 2BUPA 4B9UA 4K43A 1KCFA 4Z4HA 3WNGA 3QERA 3IUCA 4K41A 1J53A 2OPPA 5B8HA 4GV9A 2KLAA 5K14A 4JI8K 2O8CB 4ISEA 5AQGA 3RVCA 4EHUA 1TK0A 2QA4N 3M8RA 3VEYA 1S1VA 3O4QA 4AHSA 3L2UA 3IMXA 5C10A 4BRQA 2ASMA 1WOQA 3E9OA 4C23A 3WT0A 3BF1A 3UKUB 3CMEN 3CFPA 1VQ9N 5GAHP 2HHQA 5BR9A 1KVCA 3V9ZA 4CEZA 1P90A 4L3QA 3D2EA 4FLZA 4XJXA 3FZMA 2EHGA 2YKNA 3IG1A 3K9JA 1Z26A 4WQ5C 3FE1A 4DR7K 3SV3A 4PY5A 3AO1A 4QS8A 5AQSA 4H5WA 2I7NA 3VQBA 4DTSA 3O1WA 4EP5A 3AVMA 4FW1A 4FWRA 3VPZA 3M8SA 3E01A 3H45C 1DGKN 2P9IA 4KV8A 4EZ9A 2NRXA 3HZ6A 2HW3A 5CR4A 1JCFA 3VOVA 4DWIA 1S1WA 1VSLA 1WNSA 5C24A 3ZX2A 2O8BB 3C7NB 4RW7A 3CCEN 3LDLA 3MK6A 2KHOA 1S1UA 4DR1K 1D5AA 3THXA 3ENHA 3TANA 3MXJA 1HRHA 3L2QA 4FM1A 2YKMA 3OJSA 2VQEK 1RT2A 2Y1JA 1JLGA 3CCLN 2GEMA 4FPBA 3T1AA 2BH1A 4HVJA 4O5BA 4G9ZA 1TAQA 5HROA 4DUZK 1D4XA 1NM1A 3HOTA 4H4MA 3VQ8A 2XHBA 4IFVA 4H0PA 2CH6A 3ZSQA 3H1QA 2YJEA 3CC7N 5AQOA 3ATUA 3ZT1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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