2Q0RA

Structure of pectenotoxin-2 bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
total genus 122
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0rA03
4XH4A 5AZIB 4BRHA 4CZLA 3RSEA 2W41A 5AR0A 3TPQA 4BRGA 1ATSA 1NGGA 4H5RA 1KAZA 3R9PA 2IVPA 2YJEA 3WXIA 1EQYA 3A8YA 5EXWA 4BRQA 3WQUA 4BROA 3ULEB 3L4IA 5BN8A 3H46O 4ISGA 1HKCA 2E2OA 3LM2A 4K43A 1NGEA 3MK6A 4DB3A 5KPTA 3VPZA 5BPNA 4QS9A 2A42A 2A41A 3CQYA 3VF4A 2P9UA 2YCHA 3VERA 2J4RA 3J8AA 3A5LC 2CGKA 1J6ZA 5KPRA 1BUPA 3FZFA 4H0TB 3AAQA 3IFRA 1QQMA 4MLEA 4H5NA 4WQ4C 4PKHA 1X3NA 3ZETB 5CE3A 4KBOA 2AA4A 3CQXA 3FZLA 4CZMA 1QHAA 5AQJA 3CIPA 3MN7A 1NGCA 1GLCG 3EO3A 3VEOA 4IJNA 2EWSA 4K25A 4AM6A 1TYQB 1JCEA 4BRCA 2P9KA 4J8FA 4DCHA 4JNEA 1MWKA 5AQFA 4A2BA 5BPMA 5AQKA 3KHYA 4BRMA 1GLDG 4YDUA 1TUUA 3WEEB 3QICA 2E2NA 1V4TA 3DXMB 3ATVA 2QWPA 4M7YA 5AQQA 3MN5A 2QW9A 3O8MA 4FOEA 4H0OA 2QWOA 4GNIA 3EZWA 2NRHA 3DWLA 1T44A 2WUSA 2FSNA 4BRPA 4EHUA 3VESA 3A5NC 5F1XA 2ASPA 2E2QA 4EAHD 2F9TA 4FWNA 1NGHA 5AQZA 1DEJA 3U4LA 3U9DA 3IMXA 4WYBA 4EFHA 3ZX3A 4BRLA 2GWKA 3O1BA 3GDQA 1E4FT 3HSCA 4FOIA 1HPMA 3IDHA 4K42A 1DKGD 1ATRA 1ESVA 2P9PB 1RDWX 2PAVA 4FPAA 3ENOA 4JN4A 1LOTB 2E88A 3FZMA 4DHYA 3H45C 3JXUA 3CJ9A 3AARA 1K8KA 4FSVA 5BR9A 5AQXA 2Q1NA 3WT0A 5ADXH 2F9WA 2NZTA 2YHWA 2A6AA 5AFUH 2FSKA 2QXLA 4BC2A 3AY9A 5BRHA 5ELZA 2BTFA 5E84A 3ENHA 3ZEUB 3I33A 3LDLA 1D4XA 4A2AA 4B1XB 5AQLA 2YHXA 3CETA 3C7NA 2QWNA 5BREA 3VEXA 3O5BA 3H1VX 3QDKA 2GEMA 3H3OB 2ZWHA 2FSJA 4H0VB 2CGJA 1V4SA 4XEIA 3VGLA 2CH6A 1NM1A 5AQUA 1HKBA 1MA9B 5E26A 3ULEA 4RWTA 1QZ5A 5AQGA 5LJVA 2E20A 4CZFA 5KPZA 2P9NB 5LJWA 1ZC6A 3FZKA 4I6MA 2P9KB 2HF3A 2E8AA 2ZGYA 3KVGA 3VEWA 3CJ7A 2GELA 1U2VA 3FFKB 4H0XB 2P9IB 2A3ZA 3QFUA 3SK3A 1Z05A 2FXUA 3A5MC 4BRKA 1S22A 3QBWA 3LDOA 2CGLA 3GOIA 1XQSC 3AAPA 4XH5A 3DXKB 3LM9A 4BREA 3BF1A 4M7XA 4BRNA 1KXPA 4HWIA 1R59O 1ZBSA 1NGFA 4MO4A 3VEYA 3CJ1A 3VF2A 3RSEB 5FPEA 4Y0WA 1JCGA 1SZ2A 3JS6A 4LC9B 3WXJA 3EKUA 4B1VA 4JHDB 1NGBA 4BR0A 2P9PA 1U2VB 3LDQA 3VEZA 5JMVA 3FZHA 1C0FA 5BPLA 5F2RA 2YI1A 3CI5A 2VYPA 2P9LA 1QZ6A 4EIAA 3QB0A 3C0BA 2P9IA 3BF3A 4BRAA 2A40A 1LCUA 2ZF5O 5EOYA 3HZ6A 1BWFO 3OHRA 4H0PA 3D2FA 2CH5A 1G99A 3QBXA 2P9NA 2Q0RA 4CZIA 5FPDA 3IUCA 5FPNA 1T6CA 2I7NA 2VCPA 3ZETA 2D1KA 4BC5A 1YXQA 3VENA 1XUPO 2QWMA 1TYQA 3WUHA 2FLOA 3DXMA 4B1UB 4I6MB 4CZKA 4MLHA 3C7NB 2DPNA 4CD3A 3MN6A 1BG3A 3W0LA 4Z94A 3FGUA 4PKGA 3WQTA 2V52B 1KAYA 4BR5A 4IWVA 1MDUB 4BG9A 4WQ5A 1T6DA 4PKIA 4BQLA 4CJ7A 4BVPA 3SMSA 3EN9A 3R6MA 4HTLA 1NGDA 4IJAA 5AQRA 1BA1A 1XC3A 4H5TA 5AQIA 5LY3A 1GLAG 3KZBA 1Y64A 4ISEA 2AP1A 1HKGA 4BR9A 1ATNA 2VWBA 5JLFA 2GTDA 3UE5A 4B1YB 4NB4A 3LL3A 4FWLA 4K41A 3L6QA 2GWJA 4QS7A 1IJJA 1YVNA 1NGIA 3DXKA 3MCPA 4ISFA 2Q36A 4BC4A 4RTFD 1U6ZA 3SLCA 4CZEA 4NO7A 3L0QA 1K8KB 4BGBA 2D0PA 1OKJA 3D2EB 1NGAA 3QFPA 4B9QA 3ATUA 2Q2RA 3DAWA 3VF6A 3VOVA 4FWMA 1HJOA 1RGIA 2FF6A 1MWMA 3UKRB 3EL2A 2QM1A 2QWLA 1CZAN 1C0GA 4FWOA 3SJHA 2QWRA 4BR4A 4BRFA 5B8HA 4IO8A 4C23A 4FWRA 4CZGA 1X9JA 5BN9A 3GE1A 2PBDA 4CZJA 3GL1A 4H5WA 4JAXA 2ASOA 4JD2A 3U9ZA 2P9SA 2BUPA 2IVNA 1SQKA 3R8EA 2HF4A 5AQHA 4WQ4A 3VEVA 4BR7A 4CBWA 1E4GT 2YHYA 3H1QA 1HX1A 4XH1A 3TU5A 4RCHA 1X3MA 3G25A 4CBXA 5AQWA 3O1WA 4MO5A 3HBTA 5EY4A 3QMLA 4A62A 4B1ZA 3D7EO 3MDQA 4FWQA 5AQYA 4PL7A 4IXCA 3M1FA 5AQSA 3VGMA 2Q31A 5AQPA 4YDUC 2IVOA 5AZIA 5AQNA 4BRDA 2KHOA 4IZ9A 4BVOA 1GLLO 3O4WA 3CERA 1GLFO 5KQDA 3W3DA 4WQ5C 4H03B 2NLXA 3FE1A 3O6WA 3O80A 4JHDA 5AQVA 4CD1A 3ZX0A 3H3NO 5AQTA 1GLBG 3LDNA 1WUAA 1HLUA 4BRIA 1HUXA 2GUPA 4H5VA 5JLHA 2QWQA 5KQ8A 5AQOA 4O5FA 3EKSA 3UKUA 1TUYA 4FPBA 3O08A 2FF3B 1BOTO 1JCFA 2IIRA 5FPMA 3ID8A 2A5XA 3BEXA 1ZXOA 3B8AX 4BGAA 5JICA 4BG8A 3HM8A 1QQOA 1H1VA 1NLVA 1KAXA 1Z6RA 3UKUB 4CZHA 1Q18A 3D2EA 4EHTA 4DQ8A 4F9OA 2ASMA 5AZJB 3MMVA 4AM7A 2E1YA 4B1WB 4FWPA 1P8ZA 1NBWA 3FR0A 1IG8A 1NMDA 3DJCA 3BP8A 3CJBA 2ITMA 4E1JA 1SAZA 4FO0A 3CJCA 5AQMA 3HTVA 3I8BA 4GY2B 3F9MA 4H0YB 5I9EB 3SMPA 4FWSA 3M3ZA 4BQZA 1YUWA 2YJFA 3LDPA 3WEEA 1BO5O 1S3XA 1BU6O 3BUZB 3CHWA 3U8XA 3CJAA 2E1ZA 3GBTA 1WOQA 2Q0UA 3ZEUA 2Q97A 4QS8A 1BDGA 2P9UB 2D4WA 4JD2B 5AFUA 3P4IA 2P9SB 3D2FB 4A61A 1DGKN 2V7YA 3UKRA 3VETA 5BRDA 5F0XA 2HMPA 2V7ZA 1RFQA 4L3QA 5EVZA 5EX5A 2E2PA 2HOEA 4BR2A 2P9LB 2OANA 3A5OC 3A0IX 4O8KA 3WXKA 5TKYA 4PL8A 3H6EA 5AZJA 5BRFA 4BC3A 1NWKA 2D0OA 2V51B 3GG4A 3VGKA 4CBUA 1YAGA 3M6GA 5ADXA 1GLEG 3UB5A 1QQNA 3FLCO 3MN9A 4FL9A 2UYTA 4M63C 2H3GX 3WXLA 3ZX2A 4CI6A 2I7PA 4FWKA 1GLJO 2W40A 1NGJA 1BA0A 3HI0A 3S41A 2ZGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YY3K 5AZIB 3MXJA 1EWQA 4CZLA 1JLGA 5AR0A 4HTUA 1ATSA 3Q7CA 4M3RA 2OPRA 3NCIA 3R9PA 3L2VA 2IVPA 1KRPA 1FK9A 5BR8K 1TK0A 1VHXA 1FXXA 1NKCA 4MDAA 4AILC 4M45A 4I9LA 3ENBA 3O9UA 2QKKA 3L4IA 3H46O 2QTDA 3TTFA 4FJ5A 1IBLK 3MK6A 3VPZA 1VQPN 2DFFA 4CF0A 2A42A 1W0HA 2J4RA 4ILGB 2CGKA 1SUQA 3FZFA 2HHTA 4H5NA 1XI1A 3ZETB 1X3NA 3AVHA 1JXEA 5CE3A 4KBOA 4KHUA 1VSJA 4DTNA 3MN7A 1NGCA 4CGFA 3CC7N 3EE8A 4K25A 4AM6A 1JCEA 1KVCA 2P9KA 4DCHA 2HHVA 1N36K 2X78A 4LFBK 5BPMA 5AQKA 3KHYA 4I7FA 2F4VK 4DTXA 1VQ8N 4F4KA 1TAQA 4JK9A 5AQQA 2BANA 3OYMA 4JKEA 5HRNA 3O8MA 4FOEA 4DR7K 4H0OA 5DM7L 2Z1GA 3K5LA 1T44A 4JK8A 3TARA 3M8QA 2XY6A 3P1GA 2UU9K 4GVEA 3J7ZO 1JJ2M 4HUGA 1DEJA 3U9DA 4WYBA 1Z26A 4JI3K 4CGDA 1VSIA 2JWLA 2VQEK 3HSCA 4FOIA 4B9LA 4CJUA 2AJQA 3NF9A 1D9FA 2KW4A 1A5VA 2P9PB 1LOTB 3IKMA 4DHYA 1VSHA 4DFKA 1VRUA 4R79A 4CJKA 2G8KA 3PSIA 4FSVA 4DV6K 1VAZA 4LSLA 3WT0A 5ADXH 2F9WA 4C8KA 2NZTA 2A6AA 5HLFA 4O55A 5HRSA 4BDYA 1KQSM 4OO1J 1SV5A 3R1XA 2GX9A 1KD1O 2RF2A 1RBUA 1IKWA 3LDLA 3VQ7A 4A2AA 2E6MA 2FC0A 5AQLA 4DTJA 1TK5A 1B9FA 5BREA 4CE9A 3OS0A 5A2QO 2I5JA 2ZWHA 1HR0K 2HHHK 3VGLA 2OYQA 2X6SA 3KLHA 1HKBA 2RHKA 5E26A 4RW8A 5AQGA 3KTQA 2E20A 5KPZA 2VGNA 4DUZK 4NXNK 3LWLA 3AGRA 2PYLA 3LALA 5IT9O 2ZGYA 3VEWA 3CJ7A 2GELA 2E4LA 2A3ZA 2HNYA 1RILA 1LAWA 4BRKA 3OA9A 1VQ9N 4BRNA 3KD1E 4CJFA 4E72A 3O9SA 4MO4A 3VTIA 1YJWN 3HO1A 3VF2A 3RSEB 3PIPL 4LC9B 3JS6A 4YOUA 4FJMA 1VQLN 4N41A 1S1UA 2Y1IA 3HM9A 3O3GA 1FJGK 2ITGA 4FLYA 3MAQA 3SNNA 4DU4A 1NGBA 3HVTA 1RT4A 2QI2A 3TSPA 2HVIA 5JMVA 1C0FA 5C10A 5BPLA 2YI1A 1NK4A 4Z4GA 3QB0A 3VQ9A 4RW7A 4WE1A 3OBWA 3ZLJA 1NU0A 5JVHL 1HNVA 4KH4A 4H0PA 3MEDA 5M1NA 1EP4A 3ITHA 1T6CA 5FPNA 2VCPA 3ZETA 1IO2A 4BC5A 4DTRA 2QWMA 3CM5A 4C8MA 3WUHA 2FLOA 1RBSA 4CZKA 2G8UA 4IG3A 3ZT2A 3C7NB 4UY8O 4KO0A 3S3OA 4KHNA 1BG3A 4DSKA 5JS2A 3FGUA 3WQTA 2B4JA 2V52B 5DM6L 3QINA 1MU2A 1S1WA 3WXMB 4BQLA 5GADP 2WFBA 4OPKA 4DFPA 3EN9A 4DUYK 4DQQA 4IJAA 4X62K 5AQRA 3NGIA 1BA1A 4IBNA 4IDKA 5LY3A 3QNOA 1Y64A 3DOKA 1T3VA 4CJTA 3TANA 1N5YA 3HSTB 4ILJA 1Q82O 2JGUA 1IJJA 1YVNA 3DXKA 2WOMA 3SLCA 3TTCA 3CM6A 2PZSA 4JRPA 1XNRK 1A5WA 1VQNN 3CQ8A 3PO4A 4DR4K 2D0PA 4LF5K 2A1RA 3WNGA 1E3MA 2E5LK 5KI6A 3SI6A 2YHBA 4CK2A 3M8RA 3T1AA 1TKZA 5HBMA 2D0BA 2Q2RA 2O4IA 2KKZA 1HJOA 3VQAA 1MWMA 1D5AA 3UKRB 1IBMK 1K6YA 4E7IA 3SPZA 2QWRA 4UQGA 3HOTA 1X9MA 4DWIA 4GW6A 4C23A 3PY8A 1VQ5N 4FWRA 3VQBA 3AVLA 2IS3A 4YFUA 4JKBA 5CHIA 3SBGA 3LP2A 4B9UA 3D0PA 2GUIA 1I3AA 3V1OA 2P9SA 2IVNA 1SQKA 3MEGA 3R8EA 2HF4A 1SL2A 4WQ4A 3E01A 3AA2A 3KLEA 4QCLA 5HL7L 3VQ5A 3TU5A 1LWEA 1JL2A 4YNQA 1IBKK 5EY4A 4A62A 4B1ZA 1B9DA 3TSQA 1VSFA 3SAHA 1JKHA 5EU7A 4FLWA 4BWJA 2O4GA 3M1FA 2VG6A 4JI6K 4N56A 4KI4A 4RW9A 1A5XA 5AZIA 5AQNA 3S5TA 5KTQA 3OYFA 1HJRA 3CERA 5FROA 3HPGA 2HHIA 3FE1A 3H3NO 3LP0A 5AQTA 2HMIA 2JLEA 1WUAA 3NF6A 3TSUA 2OTLN 3SAGA 1T05A 3N4PA 5C12A 4H5VA 5TKWA 5GAGP 4LD0A 3TAPA 1U4BA 1TL1A 4W5NA 5AQOA 4O5FA 3EKSA 2O8FA 4CK1A 3TTDA 1JCFA 3AVJA 3VA0A 2IIRA 4GKJK 3BEXA 3JYTA 2HSTA 2C1IA 4BG8A 1NLVA 4NCGA 4LF6K 3BGRA 3UKUB 4EHTA 4F9OA 3CC4N 4KTWA 5FRMA 4AM7A 3LAMA 4NLBA 1WSEA 1P8ZA 1NBWA 1K8AO 1IG8A 1GOBA 3G10A 4YOWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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