3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
2FSNA 3SLCA 3IFRA 2YHXA 4AM6A 2HF4A 1WUAA 3CJCA 2PBDA 3EL2A 3HSCA 5ADXH 4NB4A 2P9UA 2GEMA 2Q0UA 2P9NB 4K41A 1WOQA 1BU6O 4YDUC 5EXWA 1NGFA 1LCUA 3CHWA 4WYBA 4BRGA 3BUZB 3D7EO 3D2FB 2NRHA 3VPZA 4BGBA 4CZMA 2YI1A 3MMVA 5FPMA 4PKHA 4FWKA 4BVOA 4L3QA 4CZIA 3M6GA 3HM8A 2ITMA 4BR7A 1ATSA 2GELA 4CZFA 4IXCA 2A42A 2CH6A 1EQYA 1YXQA 1G99A 1TUUA 3WEEA 2FXUA 4MO5A 3DXMA 2YHWA 4DHYA 2P9KB 4FWMA 5AQFA 3FZHA 4XH5A 3CJBA 3LDOA 2Q0RA 4MLEA 1K8KB 2NLXA 3SK3A 1ESVA 2IVOA 5EOYA 1NGGA 4JNEA 1X3NA 4BVPA 2P9LB 4EHUA 1YVNA 4IWVA 2NZTA 2E1ZA 3ENOA 1TYQA 3BEXA 2EWSA 2FF3B 2PAVA 2ZGZA 2HMPA 5FPDA 1SQKA 3HBTA 3TPQA 3LM9A 4M7XA 2E2PA 3EZWA 4B1XB 3VEZA 2E2OA 5F2RA 3O8MA 4IO8A 3HI0A 5AQXA 4B1ZA 2P9NA 3LL3A 2W40A 1V4SA 3VF6A 3D2FA 4HWIA 2QWLA 5BPMA 3VEYA 4BR5A 1QHAA 1Y64A 2UYTA 2QWNA 4HTLA 4H5NA 3O4WA 3VETA 1HLUA 4NO7A 2ZGYA 3MN7A 4BRFA 2QM1A 2V7ZA 1NGJA 3O1BA 1Z05A 1XQSC 2E8AA 4CJ7A 1OKJA 4O8KA 3VGKA 4A62A 5KPZA 5E84A 4EAHD 3UB5A 5KPTA 1NGEA 4RWTA 2GWJA 4B9QA 2P9KA 3ZX2A 5LJWA 2E2QA 2QW9A 3WXJA 1NGCA 5AQWA 5I9EB 2GWKA 5AQOA 1KAXA 1HKCA 5AQHA 3R9PA 3WQUA 3B8AX 5AR0A 2Q97A 2A40A 3M1FA 2E20A 4PKIA 5E26A 3RSEB 3ZETB 1K8KA 4XH1A 1T6CA 5AQIA 1BA1A 2DPNA 4H0PA 5BREA 1T6DA 3WXKA 2P9LA 3MCPA 3HZ6A 4M63C 5BPNA 4WQ4C 2CGKA 3QFUA 5FPEA 1QQOA 3GL1A 5JLHA 5AFUA 2VCPA 5EVZA 1C0GA 1NWKA 1J6ZA 2QWPA 1HPMA 5AQVA 1JCEA 1Q18A 4QS7A 3BF1A 1LOTB 1IG8A 3D2EB 3FZKA 3H45C 5AQMA 3ZEUB 4B1WB 2ASMA 4BC2A 2QWOA 4BGAA 2ZF5O 4FWNA 3IUCA 4BRIA 1U2VB 2F9TA 3ENHA 4WQ5A 3M3ZA 1D4XA 3VENA 1ATNA 2WUSA 1RFQA 1NBWA 5LY3A 3L4IA 1YUWA 2IIRA 4CBXA 1HJOA 3O80A 3SJHA 1ZBSA 4EFHA 3F9MA 3KHYA 5KPRA 5JMVA 4CI6A 1RDWX 1KXPA 3GDQA 5AQJA 3WXLA 3C0BA 3DJCA 3CJ9A 3BF3A 3EN9A 2V7YA 3H3NO 4CD3A 3UE5A 1R59O 3EO3A 3VF4A 4JAXA 4M7YA 3ULEB 4BRNA 4H5WA 4FWLA 4ISFA 5AZIB 3VEVA 3RSEA 3VEWA 4FL9A 4B1UB 1BOTO 4H5RA 3VESA 3QFPA 1GLLO 1SAZA 2D4WA 2KHOA 4H0VB 3EKSA 4BR2A 4KBOA 1JCFA 5FPNA 2YCHA 3LDPA 4A61A 1GLDG 1HUXA 1BG3A 1NLVA 1NM1A 5JICA 4XH4A 1MDUB 5B8HA 4BROA 2I7NA 1X9JA 4BRCA 5AZJB 4BG9A 3LM2A 5ELZA 3D2EA 4DCHA 3ZEUA 1X3MA 5BPLA 4YDUA 4FOIA 3MN5A 3G25A 3ZX0A 5BR9A 3R6MA 3ATVA 4H0OA 2CGLA 1YAGA 1U2VA 1NMDA 3VEXA 1MWKA 3JXUA 4PL7A 4JD2B 1QZ6A 3AAQA 5AQYA 3TU5A 4H5VA 2ASPA 2A5XA 3ATUA 3W3DA 1ZC6A 1BWFO 4O5FA 1BUPA 4XEIA 1XC3A 5AQSA 3UKUB 5AQPA 4PKGA 1MA9B 4BRMA 5AQQA 2YHYA 5BRHA 4QS9A 1RGIA 3QICA 3DWLA 4B1VA 4QS8A 1QQNA 2AA4A 3FGUA 4H0YB 1GLAG 2V51B 5AQNA 3ULEA 4FO0A 2A41A 4BRPA 3BP8A 5KQDA 5AZIA 2VWBA 4JN4A 3AY9A 4BREA 4BRLA 4AM7A 5KQ8A 5EX5A 1H1VA 5AQKA 3LDLA 3CJ7A 3GBTA 2QXLA 3U9ZA 4ISEA 4BR9A 4E1JA 3VEOA 4BC3A 2Q2RA 3FFKB 3J8AA 4CBUA 1IJJA 3AARA 4A2AA 1Z6RA 1DGKN 4K43A 2Q1NA 1KAYA 5AZJA 2IVPA 1NGIA 4I6MB 4RTFD 4FWPA 3QBWA 1S3XA 3H46O 4BRHA 1JCGA 4CZLA 2FLOA 3DXKB 4DB3A 5AQUA 3CQXA 4H5TA 5AFUH 4JD2A 4FWOA 3A5OC 1KAZA 3FZMA 2A3ZA 4EIAA 1S22A 1V4TA 1ZXOA 3JS6A 3UKUA 1GLEG 3AAPA 1E4GT 4FOEA 4EHTA 4FPAA 1BA0A 3O1WA 3A5LC 1NGHA 5AQGA 3WT0A 2D0PA 2P9SB 1QQMA 5ADXA 2D0OA 3MDQA 2A6AA 4BRKA 2AP1A 3DAWA 3GG4A 3MN9A 3H6EA 3FZFA 2E1YA 4MLHA 2GTDA 1NGBA 2E88A 4BC4A 3KZBA 4CZJA 5AQRA 5AQZA 2QWRA 4B1YB 5AQLA 5BRFA 4FWQA 4ISGA 2H3GX 2HF3A 3FR0A 3ZETA 4WQ4A 4CZHA 3A0IX 1XUPO 2J4RA 2IVNA 3W0LA 2ASOA 2P9IB 4FWSA 1GLBG 4MO4A 3L6QA 3H1VX 3QB0A 2P9PB 1MWMA 2E2NA 2HOEA 2QWMA 3HTVA 3CIPA 4FSVA 4Z94A 4I6MA 5F0XA 3O5BA 3O6WA 3VGMA 3CQYA 2FSKA 3CETA 1T44A 2I7PA 4GY2B 3IDHA 2GUPA 5EY4A 5LJVA 3ZX3A 1CZAN 3DXKA 3LDQA 4CBWA 4FWRA 1ATRA 3LDNA 3C7NB 2FSJA 3QBXA 2Q36A 5TKYA 4H03B 3UKRB 3H1QA 3IMXA 3QMLA 3VOVA 1HKBA 2V52B 1DKGD 5BRDA 4IJAA 2D1KA 1U6ZA 1HKGA 4A2BA 5BN8A 4IJNA 3WUHA 4K42A 2Q31A 4JHDB 4BC5A 2BUPA 2P9SA 2YJEA 3U8XA 4GNIA 2QWQA 3OHRA 2F9WA 3MN6A 3CERA 4H0TB 4K25A 5BN9A 3EKUA 4BG8A 1GLCG 3A5MC 1QZ5A 3FLCO 3WXIA 1BO5O 3GE1A 4BR0A 4H0XB 3P4IA 5AQTA 3S41A 4F9OA 1SZ2A 3SMSA 4DQ8A 3QDKA 3I8BA 3VERA 4PL8A 2P9UB 2VYPA 4C23A 2P9IA 2CGJA 3CI5A 4CD1A 2YJFA 2OANA 2P9PA 3L0QA 3VGLA 1P8ZA 4BRQA 4WQ5C 1GLFO 4BR4A 3CJ1A 4CZGA 5F1XA 4BRAA 3C7NA 3SMPA 3MK6A 1C0FA 3UKRA 5CE3A 4IZ9A 4J8FA 3U4LA 5JLFA 3I33A 4BRDA 3KVGA 3WEEB 4Y0WA 3DXMB 1DEJA 3GOIA 2ZWHA 3WQTA 4BQZA 3H3OB 4JHDA 1HX1A 3A8YA 2CH5A 1TUYA 4FPBA 1NGDA 3FE1A 3VF2A 3R8EA 2BTFA 4BQLA 2FF6A 4RCHA 1E4FT 3CJAA 3U9DA 4LC9B 3FZLA 3A5NC 2W41A 1GLJO 1TYQB 4CZKA 3O08A 4CZEA 1NGAA 1BDGA 3ID8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UXCK 3SLCA 2YHXA 4B8AB 1LV5A 3CJCA 3C6AA 2PBDA 3HSCA 1JXEA 1W9HA 4CJKA 2P9UA 3U6FA 2GEMA 5CHIA 3BZKA 4BE0A 4CGGA 4KKOA 4IG3A 1LCUA 3CHWA 1YIJN 3D2FB 4BGBA 4FZZA 1OH5A 5GINA 2OCEA 3MMVA 1IH7A 4ELTA 4CEZA 3SPYA 4PKHA 4MDBA 4DFKA 1FW6A 4Z4EA 3PO4A 4AQYK 2WFBA 5M1FA 3TAQA 2UUAK 4LF6K 4CZFA 1Q81O 1YXQA 3T3FA 1TUUA 1YITN 2P9KB 4PY5A 3Q7CA 3WXMB 4DQQA 4XH5A 2ZJQL 3LDOA 3NGIA 4DTRA 4CIEA 3CMAN 4DUYK 4MLEA 4LSNA 1K8KB 1ESVA 3KLFA 2Y1IA 2ZQBA 4OPKA 2VWKA 1I39A 1X3NA 2ETJA 3CM5A 4DSFA 1IV0A 3TR8A 3BEXA 3HPGA 2EWSA 2FF3B 5FPDA 1TK0A 4DQIA 1LW2A 4FZYA 3HT3A 1RT5A 3TPQA 2E2PA 1R0AA 1LW0A 4CJLA 4C1NK 3TTDA 4FVMA 3NAEA 3NDKA 4JI3K 1YJWN 1IBLK 4B3TK 3LL3A 4YY3K 4Z4IA 5BPMA 4C1NI 1L5UA 3LPUA 4RW6A 3O4WA 2UUCK 3AGKA 2ZGYA 3NH2A 3HVTA 1RTHA 4BRFA 3G10A 3M8QA 1IKXA 1B92A 4CJ7A 3VGKA 3AVGA 5KI6A 4EAHD 1XMOK 4H4OA 4JS5A 4LF5K 1NGEA 4A5BA 5HRPA 4N5SA 1C1BA 1HNZK 5AQWA 1DT9A 4PA1A 1HKCA 5AQHA 3R9PA 4JKFA 2A40A 1F21A 5CY4A 5JS2A 3MWTA 1S1WA 4YOUA 4DS5A 1QHTA 1A5VA 4OVLA 4DR3K 4YFUA 2O8DB 5BREA 4NXMK 3MCPA 2IAJA 4PQUA 4M63C 5MLCQ 1C0UA 2F8TA 1RTIA 4WQ4C 1RDBA 2CGKA 2XY7A 3AV9A 4CJFA 4FLVA 5LMUK 1NK5A 3VQ6A 5FPEA 4ICLA 3AVFA 4FK4A 5AFUA 4B9TA 2VCPA 3TAPA 1NWKA 1J6ZA 4UQGA 1JCEA 4OKEA 3CQ8A 4BE2A 3ALYA 1JKHA 3IRXA 3L8BA 2AJQA 5AQMA 1RNHA 4O0JA 4HTUA 3S5TA 4B1WB 4BC2A 1JLFA 2GV9A 1WSIA 5GAHP 3IUCA 1U2VB 4FLWA 4WQ5A 3M3ZA 4E7LA 1ATNA 2WUSA 1X9MA 2IIRA 4O0IA 4Z4FA 4M3TA 5CYQA 3MECA 4FM2A 3F9MA 1VSJA 5KPRA 1VQNN 2O8FB 5JMVA 2X6NA 3GDQA 4IOXA 4FW2A 4Z4GA 4CD3A 2V7YA 3H3NO 2G8IA 4J2EA 1TL1A 3ULEB 3OY9A 3MXMA 4JYAK 1FXXA 4FJ5A 4CFDA 1BOTO 1KVAA 1WN7A 4RW4A 3VESA 4KB1A 2C1GA 1BISA 3OS1A 2D4WA 5HL7L 3NHGA 4B3RK 5FPNA 4J2DA 1GLDG 1HUXA 1NLVA 4ILGB 3TABA 1NM1A 4MFBA 4XH4A 2HHVA 3ZSWA 3RRHA 3QEWA 5AZJB 1ZBUA 3D2EA 4DCHA 3ZEUA 5DK5A 1JLGA 3ZX0A 3MWPA 1M90O 1SV5A 4H0OA 4W5NA 1B9DA 3VEXA 1TGOA 4JLHA 4H5VA 4OLBA 2P5GA 1ZC6A 1BWFO 2PFUA 1VSFA 2G8VA 4U7BA 3OBYA 2E5LK 3UKUB 4PKGA 4BRMA 2YHYA 3ZSRA 1RGIA 5FLXO 3VQ8A 5M1NA 3TSPA 4BWMA 3CPEA 3FGUA 2XY6A 2O4GA 1U4BA 4FO0A 2A41A 4BRPA 5KQDA 4B3MK 3PY8A 2OA8A 2O8CB 1DLOA 4LFAK 3MXIA 3GBTA 3RVCA 1RTDA 4F8RA 3K57A 3U9ZA 3FFIA 4E1JA 4FJMA 2YX6A 3VEOA 4BC3A 3K9JA 3LP0A 3P5JA 3M8RA 2Q2RA 1IJJA 1UA0A 2Q1NA 4QCLA 4ELUA 4FWPA 3H46O 4KH5A 4BRHA 2O8EB 3HVRA 3DLHA 4CFAA 2FLOA 2GUIA 4DB3A 3OS0A 1S6PA 4H5TA 2OZMA 4JD2A 3RMCA 3A5OC 3CCRN 1BHLA 1KAZA 4FLUA 4ZTFA 2FBYA 1VQKN 2X78A 2KQ2A 4Y1DA 3AAPA 4CEEA 1ZBIA 3EE9A 3ID6A 4EHTA 1NJXA 3OS2A 1OH6A 3A5LC 1SL1A 2BE2A 4KI6A 3TANA 3RRGA 2AP1A 4DLGA 4JI0K 1WB9A 4MLHA 1SL0A 2GTDA 3EEQA 2YNIA 3QINA 1U47A 2RKIA 5AQRA 5AQZA 2QWRA 3CYMA 4B1YB 5FRMA 2NRXA 4FWQA 4ISGA 5HP1A 1IBMK 2PY5A 1RDAA 3THVA 4DR7K 2J4RA 3WNGA 2FBXA 4FM1A 4CJQA 2P9IB 4FWSA 5GADP 2HHHK 3H1VX 2P9PB 1MWMA 2VWJA 4DF8A 1T44A 2I7PA 4DR4K 3KKRA 5EY4A 5LJVA 2A1RA 1RCHA 3K2PA 4JKHA 4OKJA 3QEVA 3VQ5A 4H03B 4YOWA 3QMLA 3ITHA 4FJIA 3LP1A 4JRQA 4JKGA 1T8EA 3OJSA 3WUHA 4K42A 3PX6A 1W2BM 3K0SA 3AVMA 5GAEP 4F2RA 2YJEA 3U8XA 3CFPA 1TV6A 1TK5A 3NE6A 4LFCK 3D0PA 2NRZA 1BI4B 4FYDA 3I56N 3MEEA 5SZTA 3V9UA 1GLCG 4DU1A 1L3SA 3GE1A 2NNWA 5AQTA 2FBTA 4F9OA 3F2KA 1WBDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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