3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
2ZGYA 1GLEG 3UKRA 2A41A 3M3ZA 2A42A 4BC5A 2YI1A 4M7XA 3D2FB 4FPBA 4QS9A 4CZHA 4CZIA 1NGBA 4C23A 5F0XA 1KAZA 1SQKA 2P9IB 4ISFA 1V4SA 2CGLA 4WQ5C 4O8KA 5JLHA 3HBTA 4JD2A 3A8YA 4EHTA 3S41A 3MN9A 4IXCA 4JN4A 5AQSA 1GLJO 3VESA 4H5NA 3VF4A 3TPQA 5I9EB 2P9UB 3VF6A 5AQGA 3WXIA 1T6CA 4H0TB 4K41A 2FLOA 3UKUB 3DXMB 5AZJB 3VEOA 3GBTA 1NGCA 3RSEA 1OKJA 3QFUA 4RCHA 1HLUA 4IWVA 2V7ZA 1WUAA 4JHDB 5E26A 4A61A 3R8EA 2CGKA 1SAZA 5EXWA 3ZETB 1BO5O 3EO3A 4EHUA 4XH1A 1RDWX 5AQQA 3W0LA 3FZFA 4BROA 4GY2B 2YJFA 4BQZA 4BG8A 1S3XA 1D4XA 1NGJA 3LDPA 2KHOA 3GE1A 1C0GA 3WT0A 3BEXA 1HKBA 3D2EA 3SLCA 2E2OA 1QZ6A 2P9IA 3QBWA 2QWQA 2IVNA 3L0QA 1NGFA 1T44A 4CD3A 2IIRA 1HPMA 5AQJA 3HM8A 3DAWA 1RGIA 4CBWA 4A62A 2P9SB 4MLHA 3VPZA 4BR4A 1Z6RA 2Q0UA 3FZMA 4BC3A 4EIAA 1X3NA 4NB4A 3UKUA 5BREA 5AQMA 5AR0A 1GLBG 2W40A 4I6MB 2ASMA 4WQ4C 3DWLA 1DGKN 4PL7A 2V51B 3L6QA 3O8MA 2GEMA 2E88A 3U9DA 1KAYA 2J4RA 1NBWA 3AARA 4YDUC 2AA4A 4A2BA 2P9LB 3EZWA 2Q1NA 3ZETA 3HI0A 2GWJA 2E2QA 1KXPA 4BGAA 5AQWA 4CZEA 1BUPA 2VCPA 4B1UB 2Q36A 5FPNA 2E1YA 2QWNA 3MDQA 3F9MA 3SMPA 4BRKA 3HTVA 5AQVA 3IDHA 1BA0A 4K42A 4BRNA 3FZKA 3EN9A 3U8XA 3ZEUB 2D0PA 4BR0A 4FWRA 1GLDG 3MN7A 3P4IA 4WYBA 2YHYA 2P9KB 1WOQA 1HKCA 2IVPA 1MDUB 5AQIA 3BUZB 2HOEA 5AZIB 3JXUA 4BREA 4CBUA 3QMLA 3VERA 3EL2A 3GG4A 3CIPA 3VENA 2A40A 4PKIA 4FWQA 5AQNA 1NMDA 2E2NA 3DXKB 5FPMA 2VWBA 3VF2A 4JNEA 5BRFA 4I6MA 1SZ2A 4FWMA 1R59O 3CI5A 4XEIA 3CJBA 1TYQA 3LL3A 3U4LA 3CQYA 3WEEB 5KQDA 1ZBSA 4FL9A 1NGEA 3H6EA 4M63C 1YAGA 3A5NC 5BN8A 1NGAA 1YVNA 4BR7A 3WXKA 4BRPA 5KPRA 3WXLA 4BVOA 5EY4A 4H5RA 1HX1A 3L4IA 2P9PA 3FR0A 3JS6A 3ZX0A 3CERA 1MWMA 4Y0WA 2V52B 2FF6A 2Q2RA 4HTLA 2E2PA 1J6ZA 4DCHA 1DKGD 2NZTA 3H46O 5FPDA 3ZX3A 4FWOA 4H0VB 4IJNA 3TU5A 1HUXA 4K43A 5BPNA 3AAPA 1ATSA 2YHXA 4EAHD 4BR5A 3VEZA 3D7EO 3CETA 3O5BA 3I8BA 4BRIA 3ULEB 4BGBA 3D2FA 1X9JA 4FOEA 2GUPA 1HJOA 3GDQA 3WQTA 3LDNA 5F1XA 1ZC6A 2QW9A 3C0BA 5FPEA 3SMSA 3WXJA 4B1WB 3LDQA 4BRMA 2ITMA 4CBXA 1BA1A 3C7NB 3I33A 1QQMA 1TUYA 5EVZA 3O1WA 4IO8A 5AQRA 5JICA 4PKGA 4ISEA 4DB3A 2NLXA 3O80A 2I7NA 1JCFA 2P9UA 3EKSA 4CZKA 2E1ZA 3VEWA 1NWKA 5E84A 1T6DA 2FSJA 4IJAA 3LDOA 1BDGA 3ENHA 3DXMA 4JAXA 5AZJA 5AQPA 4CZFA 1U2VB 4CZLA 1NGDA 3H45C 5AQYA 5KPZA 1GLFO 3MMVA 1NGIA 4FWSA 3BF3A 2VYPA 1XUPO 1YUWA 4B1XB 4JHDA 2YJEA 5LJVA 2QWRA 2QWPA 3LM9A 4GNIA 4EFHA 3B8AX 4FPAA 2Q0RA 3UB5A 3UE5A 3ATUA 1RFQA 5AQOA 3IUCA 4A2AA 2IVOA 4IZ9A 1DEJA 3QICA 1EQYA 3BF1A 4CI6A 3GOIA 4H03B 4H0PA 3VETA 3O4WA 1NLVA 5AQLA 3H1VX 4FSVA 4CD1A 2ASOA 1GLLO 2D4WA 1BU6O 4ISGA 3A5LC 4BR2A 3O1BA 4JD2B 3LM2A 2QWMA 3W3DA 4F9OA 2QM1A 4FWKA 3A0IX 2E20A 4XH4A 4O5FA 3MN5A 5EOYA 1CZAN 3VEVA 4YDUA 2P9SA 4B1VA 2PBDA 3H3NO 3J8AA 2F9WA 5AQTA 3ENOA 3RSEB 4RTFD 4B1ZA 1QHAA 3SJHA 2FXUA 1U2VA 4CZJA 2H3GX 3MK6A 4BRDA 2V7YA 2EWSA 1ESVA 1NGHA 2QWLA 3IFRA 1YXQA 1C0FA 4H5WA 3VGLA 3FZHA 2P9LA 2OANA 5KQ8A 1E4GT 5AQUA 3VEYA 4FO0A 2A3ZA 2UYTA 3R6MA 5BPLA 1QZ5A 3ATVA 2ZGZA 4MO4A 4H0XB 4J8FA 3LDLA 2YCHA 5TKYA 4DHYA 3CJCA 4Z94A 1BWFO 4BRLA 5BRHA 2CH5A 1ATRA 3D2EB 2Q97A 3ZEUA 3HSCA 2WUSA 3O6WA 3ZX2A 3MCPA 4H0YB 1KAXA 3AAQA 2PAVA 1LCUA 3CJ7A 2P9KA 5EX5A 3G25A 1Y64A 1IJJA 3KZBA 4WQ5A 4KBOA 5AQHA 2AP1A 5AZIA 4FWNA 4QS7A 3A5MC 4FWPA 4BG9A 4AM7A 5AQZA 1HKGA 1NGGA 3FFKB 3ID8A 5KPTA 3QBXA 4H5VA 4BRCA 3DXKA 2YHWA 4K25A 5JMVA 1U6ZA 4MO5A 5LJWA 3FE1A 1G99A 3O08A 4LC9B 3FLCO 4QS8A 3WEEA 1ZXOA 2HMPA 5ELZA 4M7YA 3VGMA 3QB0A 2NRHA 3DJCA 2A5XA 4MLEA 2E8AA 2W41A 1P8ZA 1XC3A 3U9ZA 2HF3A 2ASPA 2BTFA 2GWKA 1QQOA 1JCEA 2F9TA 3EKUA 2QWOA 5BRDA 2QXLA 1IG8A 4AM6A 2FSNA 1Z05A 2GTDA 4CZGA 5ADXH 2P9NB 1GLCG 3VOVA 3BP8A 4BR9A 2FSKA 4HWIA 3VEXA 2DPNA 3CQXA 5BPMA 2BUPA 3FGUA 3SK3A 4H0OA 1K8KB 4DQ8A 5ADXA 5B8HA 3KVGA 3UKRB 2HF4A 3H3OB 5AFUH 5CE3A 2CH6A 5LY3A 3GL1A 3CJ1A 3R9PA 4FWLA 3ULEA 4BQLA 1JCGA 4CJ7A 4BRHA 4BC2A 5JLFA 1V4TA 1XQSC 3VGKA 3M6GA 3QDKA 1QQNA 5AFUA 1TYQB 1MWKA 1BOTO 1NM1A 2FF3B 3CJAA 2GELA 5AQXA 5AQFA 1E4FT 2I7PA 4WQ4A 2Q31A 1ATNA 3C7NA 1TUUA 3MN6A 4BRGA 4PKHA 3A5OC 2ZF5O 4XH5A 4RWTA 2P9PB 4B9QA 2CGJA 4NO7A 3IMXA 4BC4A 4BVPA 1MA9B 3AY9A 2D0OA 5F2RA 4BRFA 3HZ6A 3H1QA 4B1YB 3WUHA 3WQUA 4E1JA 3M1FA 1BG3A 4FOIA 4H5TA 2D1KA 2P9NA 1LOTB 2ZWHA 3CHWA 3QFPA 4CZMA 1X3MA 3OHRA 5BN9A 3CJ9A 1GLAG 1H1VA 5BR9A 4BRQA 3FZLA 1S22A 4L3QA 4BRAA 2A6AA 4PL8A 3KHYA 1K8KA 5AQKA 1Q18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZGYA 2QKKA 2G8IA 3M3ZA 1VQMN 4WE1A 3D2FB 4CZHA 3NH0A 4HUFA 4M3XA 5JVGL 4C23A 1BI4A 4C8NA 1LV5A 1KAZA 1SQKA 1F21A 4AHVA 1IBKK 4ISFA 2CGLA 3SUQA 1VQPN 3S41A 3SUNA 1J5EK 4JN4A 2ZJPL 2HNDA 3VTIA 4N56A 4CHOA 3VESA 4KO0A 3QIPA 1QSYA 5AQGA 3QNOA 4FZXC 2RHKA 1C1AA 1T6CA 4K41A 3UKUB 3DXMB 1CXQA 1RT2A 3L4QA 2WC9A 3LP0A 2P51A 3TSPA 4A61A 3R8EA 3MXJA 3HVTA 1SAZA 5EXWA 4LFAK 1BO5O 1EETA 1RDWX 2D0AA 4Z4CA 1NKEA 1ASUA 2G8HA 2ZJQL 3NAEA 4DUZK 3CMAN 3M8RA 4B9UA 4OPKA 3NF8A 2VGMA 3TAMA 1S3XA 3KLFA 4KTZA 4A57A 3LDPA 2FC0A 1C0GA 1HNIA 4FJKA 2O8CB 2KTQA 1FKOA 2P9IA 3VQ4A 3SJJA 2W6LA 1LW0A 2JLEA 5CYQA 1YF5L 1ZBUA 4KAZA 4DR4K 2P9SB 3VPZA 1SKSA 5DK5A 1Z6RA 5J2PA 3FZMA 4OPAA 3THWA 4NB4A 3OJUA 1A5VA 2IDOA 4FJ7A 4GVEA 1DT9A 4LF7K 1VSEA 1GLBG 2W40A 3L2RA 1S5JA 3E01A 1DGKN 4E7LA 3O8MA 1DLOA 3ZSWA 3B6PA 2J4RA 3AARA 5C25A 4A2BA 3TABA 2Q1NA 1B92A 1SKRA 3ZETA 2XO7A 4BGAA 5AQWA 4CZEA 5KTQA 1ZBLA 2QXFA 1D9FA 4CEOA 2OPQA 3CYMA 3ZT4A 3IDHA 4K42A 5A2QO 4BRNA 4ZTJA 1M1KO 3U8XA 2D0PA 4Q5VA 4BR0A 3HPOA 3HK2A 4KH6A 1WAFA 3MN7A 1ILYA 3WXMB 4CECA 4XJXA 5J1EA 3S9HA 3K5OA 3BUZB 5AQIA 2RF2A 3DLHA 1ASVA 4FJGA 4FJ9A 3VENA 3CPEA 2D5RA 3VQAA 3CFRA 3CCLN 3E1YA 1NMDA 2ZM6K 2PYLA 4O44A 3DXKB 1OVYA 2HHXA 5FPMA 1HQEA 5BRFA 1TL3A 4I6MA 1JLFA 2ZE2A 1R59O 4XEIA 3EZ5A 3U4LA 3JSMA 3HP6A 2HSTA 3WNEA 4Y1DA 1RDBA 4BVOA 3DRRA 4H5RA 4CJVA 4JI4K 5HROA 2OTJN 2FF6A 4C8LA 3TSUA 1UOCA 4KHNA 3CC4N 1UA1A 3D0PA 3PV8A 5FPDA 3V1QA 3VA3A 2O8BA 1J5OA 3CMEN 4DV5K 1HUXA 1ATSA 4MDAA 3AA5X 3TAGA 1EO1A 4CK1A 4CESA 4N5SA 3SQ1A 1REVA 4B9NA 2Z1HA 4N76A 1EXQA 3K9KA 3CG7A 4DUYK 3I8BA 4M42A 4IFEA 4C1NI 2UUBK 4F2RA 3THYB 2GUPA 2DFHA 4CJWA 1X9WA 2FBXA 5DMRA 1EX4A 4UY8O 4W5OA 2G8KA 1OVQA 5FPEA 3OTOK 3MCAB 3LDQA 1BHLA 3CCSN 2ITMA 3C7NB 3I33A 3NH1A 1N33K 1TUYA 1RT3A 3O1WA 4IO8A 4ISEA 4BWMA 2NLXA 5KRTA 2ZD1A 4CJ3A 1JCFA 1WAJA 4CJ4A 2F7TA 4CZKA 3QINA 2KFZA 5GIPA 2HHHK 5E84A 1T6DA 4IJAA 2UXDK 2Z1IA 1C0TA 3T1AA 3T69A 3PO4A 2YKMA 4CZLA 3OBWA 3MMVA 3NVMA 5CR4A 1XUPO 4JHDA 3BDPA 1NK6A 1T7PA 4GKKK 3ID6A 4GNIA 3I56N 2B6AA 3UE5A 5C10A 3IUCA 1DEJA 1HRHA 3QICA 4YY3K 3O4NA 4YOYA 1EQYA 1QSLA 1VQLN 4OLBA 3GOIA 2QK9A 4CHNA 3OYGA 2A1SA 4OKJA 4IKFA 3VETA 2ETJA 4Z4HA 4AHUA 1NLVA 5AQLA 4FSVA 2VQFK 2WFBA 1BI4B 1RCHA 1BU6O 3EY1A 4BR2A 5GAEP 1T3VA 2QI2A 3VQ5A 1Q7YO 4CJFA 4TSXA 4F9OA 1YHQN 1NJWA 3A0IX 4CJLA 4XH4A 4U7BA 3MN5A 4YDUA 3Q7BA 4B1VA 3TI0A 1TK0A 3SBTA 4GVMA 1JL1A 4FJXA 4B1ZA 5HRNA 2FXUA 1U2VA 4CERA 2H3GX 4CZJA 3ZSRA 3E9LA 3IRXA 5SWMA 1YXQA 1C0FA 4ZHRA 2OPPA 4NYNA 4X66K 4H5WA 4DSKA 1KLNA 2Y1IA 2NRZA 3VQ7A 2OANA 2HB5A 5AQUA 3VEYA 3HT3A 4PY5A 3R6MA 1IH7A 3VQDA 4OKKA 1Q9YA 1NKBA 3ATVA 4O4GA 2KZMA 2ZGZA 1QSSA 4H0XB 2YCHA 3TTFA 1BWFO 4NCGA 4M41A 4LF8K 3OJSA 3ZEUA 3HSCA 2VG6A 2X6SA 5KGWA 4O5BA 5EX5A 3ZLJA 3CXCM 3CCMN 4KHYA 2AP1A 3THWB 3AA4A 3A5MC 3M8PA 3HVRA 4BG9A 3RRGA 5AQZA 1WB9A 1NGGA 3FFKB 5E41A 1N6QA 5DM6L 3QBXA 1NK7A 3S3MA 4MO5A 4CF9A 5CYMA 3O08A 3WEEA 5ELZA 3LP2A 3ITHA 4KREA 5C15A 1I39A 3QB0A 4JI2K 3DJCA 1WBDA 4IEEA 4MLEA 1E3MA 2W00A 1XNRK 4CGHA 1JXEA 4JI6K 5BRDA 3OYFA 4AM6A 1N5YA 1S72N 4IDKA 1G15A 2GTDA 1D9DA 1QVFM 5IWAK 2OTLN 1TV6A 4OPJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1P8Z A;  4Z4F A;  3U9Z A;  2HF3 A;  2GWK A;  2F9T A;  3EKU A;  2HNY A;  1IG8 A;  1WNS A;  5I3U A;  1Z05 A;  2B4J A;  3DRS A;  4KTQ A;  2P9N B;  4BE7 B;  1Q86 O;  5HRP A;  4KV8 A;  4PUO A;  1XC9 A;  3G10 A;  1W7A A;  4B8C A;  3R3L A;  1K73 O;  1L3S A;  3MX5 A;  4KKO A;  4DQ8 A;  1K8K B;  1QE1 A;  3UKR B;  5AFU H;  1JLA A;  3TSQ A;  3R9P A;  3ZSY A;  4BQL A;  4FLZ A;  2HNZ A;  4C8M A;  4B9V A;  4BC2 A;  1B9D A;  1NJI O;  1XQS C;  3M6G A;  2C1I A;  3OYC A;  1NMN A;  1QQN A;  1ZYQ A;  2YNG A;  3DMJ A;  3QET A;  1BOT O;  2YX6 A;  3RR7 A;  1L3U A;  4JS5 A;  3SUO A;  4WQ4 A;  4YNQ A;  1ATN A;  4E3S A;  4I9Q A;  3C7N A;  4QCL A;  3AVN A;  4FM0 A;  1S9E A;  4CEE A;  4DTU A;  2E6M A;  3A5O C;  4XH5 A;  2YV0 X;  1YT3 A;  4GV6 A;  4BC4 A;  2Y1J A;  2C1G A;  4O55 A;  4CGG A;  4E7I A;  3KWG A;  2X78 A;  4GV3 A;  3WQU A;  4WCE L;  4E1J A;  1C0U A;  4E72 A;  3V81 A;  2UUA K;  1LOT B;  3QFP A;  4CVN E;  3OYN A;  1H1V A;  4BRQ A;  3FZL A;  4EP4 A;  4CFB A;  2KLA A;  3V9S A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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