3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
3WXJA 4PKGA 4EAHD 1V4TA 3VF2A 5LJVA 1SAZA 5BPLA 2J4RA 3WXLA 2D1KA 1GLJO 3GBTA 5E26A 3CETA 3FZFA 3DXMB 3FZMA 4I6MA 5JLFA 4FWOA 2Q2RA 4IJNA 4BC5A 2FSJA 1T6DA 4FWLA 4EHUA 3ENOA 4JD2B 4CZFA 4H0PA 3H6EA 4FWQA 1C0GA 3FFKB 2YJEA 2Q36A 3CIPA 4IZ9A 3RSEA 5B8HA 3UKRB 2YCHA 3DXKB 5AQSA 3ID8A 1LCUA 3C0BA 2QW9A 4RCHA 5EX5A 2P9PB 3WXKA 1P8ZA 3M3ZA 1TYQA 1NGJA 3GG4A 4B1VA 4DQ8A 3O08A 5JICA 3C7NA 4L3QA 4BREA 3MDQA 3LDLA 1NGBA 3H3NO 1BOTO 3LM9A 4HTLA 3VEXA 3CJ7A 3EN9A 3HTVA 3GDQA 3A5MC 4M7YA 1BA1A 1QQMA 4BR5A 4BRGA 4XH5A 3U9DA 2YHWA 2E20A 1YVNA 4H0VB 4QS8A 4FWRA 1NGHA 3VGMA 3CHWA 1MWMA 3FZLA 4MO5A 1GLFO 1Y64A 1TUYA 1BDGA 3QBXA 5BN9A 4CBWA 2W40A 3MCPA 5AQTA 5AQLA 2ASPA 4DB3A 4JNEA 1H1VA 2A40A 4BRFA 2A5XA 4PKHA 4I6MB 4JN4A 2V51B 2AA4A 1NGIA 2QWLA 3D2FA 4BVPA 1E4GT 1BUPA 4WQ4C 3EL2A 1EQYA 4J8FA 2YHXA 3AARA 2D4WA 2HMPA 1BO5O 3CQXA 1HKBA 4EHTA 1BU6O 5I9EB 1V4SA 3QDKA 1T6CA 2QXLA 5BRHA 3BF1A 5BRFA 2IIRA 3ZX2A 2VWBA 4FWKA 3VEZA 5EOYA 3OHRA 2FF6A 4BC3A 5AQIA 5AZJA 4BRAA 4BRKA 3QBWA 4JHDA 3C7NB 3WEEA 2AP1A 3QB0A 3DJCA 3A5LC 4BVOA 3O8MA 5BRDA 3SMPA 1KAXA 3I8BA 3R6MA 4FWPA 1BWFO 4FO0A 2P9SA 3G25A 3FGUA 2A3ZA 3ENHA 2IVNA 3D7EO 3ATVA 3ULEA 4H5RA 5AQXA 4JAXA 3WQUA 5LJWA 2GEMA 3UKUA 2Q0UA 4KBOA 3LDQA 1NGFA 3O6WA 4K25A 4F9OA 4M7XA 5BREA 3D2EA 1DGKN 4WQ5C 1Q18A 1S22A 3VEWA 5LY3A 3WUHA 1NGGA 3FR0A 3AAPA 3R9PA 1LOTB 2I7PA 4BC4A 3GE1A 3BEXA 4FPAA 4IJAA 3WXIA 3BP8A 3D2FB 4H5NA 2FSNA 5AQNA 5KPTA 4A62A 1XUPO 2ASOA 2W41A 1IG8A 1GLEG 2PAVA 1ESVA 3VOVA 3UB5A 3VPZA 2D0OA 5KQ8A 2QWMA 4GY2B 1KAYA 1X3NA 3VERA 1GLLO 2P9IA 5BPNA 3VENA 3SJHA 2BUPA 3O80A 3BF3A 5AQUA 4B9QA 3CQYA 4B1ZA 2F9TA 2NRHA 3WEEB 2PBDA 3LDOA 4QS9A 1RDWX 5AQOA 3KVGA 2GWJA 5ELZA 1ATRA 4BR7A 4CZHA 2E88A 3ZX0A 2A42A 1GLCG 3SK3A 1BG3A 3BUZB 1NM1A 2V52B 2NZTA 5AFUA 2GTDA 3J8AA 3ULEB 3O1WA 2HOEA 2E8AA 5KPRA 1SZ2A 3A0IX 3ZEUA 4EIAA 4XEIA 4IO8A 3UKUB 5EY4A 4BRMA 4BQLA 5AZIA 3CJBA 2EWSA 3D2EB 4BRIA 4BC2A 2ZGZA 3ZX3A 4ISFA 1HKCA 2IVPA 4K42A 2H3GX 5FPEA 3GL1A 4BR2A 2CH6A 5AR0A 4A61A 3CJAA 5AQRA 5AQFA 1C0FA 3AY9A 5AFUH 3EZWA 4H0OA 4C23A 4CI6A 1HPMA 2P9UA 2I7NA 1GLDG 1NGAA 4WQ4A 4CBUA 1RFQA 1YXQA 2YI1A 4IXCA 3L6QA 3MN6A 4FL9A 5AQYA 1J6ZA 3VETA 1NGCA 2GWKA 2D0PA 4FOEA 1QQNA 1HUXA 2HF4A 1TUUA 3HM8A 4BR9A 2E2NA 2P9IB 3IDHA 4M63C 3RSEB 4YDUA 4B1YB 3LDPA 3EKUA 2OANA 1JCEA 1TYQB 2Q97A 4FOIA 1QHAA 2E2PA 1HX1A 2E2OA 4NO7A 1U2VA 2FSKA 1JCFA 3IUCA 3ZETA 3H1VX 4CD3A 4A2AA 4CJ7A 4JD2A 3FLCO 3A5OC 4CZLA 3QMLA 2QWQA 1S3XA 2E1YA 5AZIB 5EXWA 5AQJA 1NBWA 4BG8A 3W0LA 2IVOA 5KPZA 1Z6RA 4WQ5A 5AQQA 3CJ1A 4AM7A 5AQWA 2Q31A 4BRLA 3TU5A 3MK6A 4BRQA 1X9JA 1E4FT 1G99A 3DWLA 3M6GA 1MWKA 3MMVA 2P9UB 3FZKA 4XH4A 2F9WA 5JLHA 1X3MA 4DCHA 4Y0WA 1R59O 2YHYA 1JCGA 3O1BA 5AQMA 4FSVA 1WUAA 1ZBSA 4H0XB 4BRPA 1QZ6A 3CI5A 3KHYA 2GUPA 3VEYA 2BTFA 4EFHA 3IFRA 3QFUA 5E84A 3O4WA 4O5FA 3QFPA 4ISGA 3VGLA 1D4XA 5AZJB 2CGKA 3FZHA 1ZXOA 1ATNA 3JXUA 4B1XB 5FPDA 4JHDB 4BG9A 1HJOA 4FPBA 1U2VB 4XH1A 1HKGA 2V7YA 2Q0RA 3ZETB 5ADXA 4CZKA 3HSCA 1GLBG 5AQZA 2A6AA 1NWKA 3W3DA 4MLEA 3P4IA 2P9SB 4CZIA 3AAQA 4CZGA 2A41A 3CERA 3H1QA 2QWNA 2UYTA 4AM6A 1IJJA 1KXPA 1HLUA 3F9MA 5BR9A 3MN9A 5FPNA 2P9KA 3EKSA 1DEJA 1YAGA 3CJCA 3VGKA 3WQTA 1XC3A 4FWNA 5AQVA 3U8XA 3L0QA 3KZBA 2VCPA 4FWSA 5CE3A 5AQHA 4QS7A 1WOQA 5TKYA 1QZ5A 4PKIA 1ATSA 1QQOA 1SQKA 1RGIA 4Z94A 5ADXH 3MN7A 3MN5A 2CH5A 5JMVA 1NMDA 1KAZA 3H45C 4GNIA 2NLXA 3A5NC 4K43A 4CD1A 1K8KA 3U4LA 4B1UB 5AQGA 1Z05A 1DKGD 3HZ6A 2HF3A 4BRCA 1CZAN 4H5VA 4H0TB 2P9NA 2QM1A 3TPQA 3WT0A 2CGLA 3SLCA 4BRHA 2FLOA 3IMXA 2QWPA 1U6ZA 2P9LA 2DPNA 3A8YA 3JS6A 4MLHA 4PL8A 3U9ZA 2CGJA 3VESA 3VF4A 4BROA 4BRDA 2ASMA 4BR0A 4CZEA 1NGEA 1OKJA 3DXMA 1ZC6A 3HI0A 4H5WA 1BA0A 1NLVA 2YJFA 5FPMA 4RTFD 4H03B 4CBXA 2FXUA 1NGDA 3O5BA 4WYBA 4IWVA 2GELA 2ZGYA 4A2BA 2P9KB 3ATUA 4YDUC 2ITMA 2V7ZA 3ZEUB 4E1JA 2QWOA 1GLAG 2KHOA 4CZMA 1YUWA 4DHYA 3S41A 3I33A 2VYPA 3R8EA 3UKRA 3DAWA 1XQSC 3DXKA 3CJ9A 3VEVA 2P9PA 4BGBA 3B8AX 5F0XA 2QWRA 5BPMA 3EO3A 3UE5A 2Q1NA 5AQKA 5EVZA 4K41A 4BGAA 4HWIA 4H5TA 4LC9B 3H3OB 1K8KB 5AQPA 4BR4A 2WUSA 5F2RA 2E2QA 2FF3B 5KQDA 4CZJA 4FWMA 2ZF5O 4ISEA 3HBTA 1MDUB 4BQZA 3VEOA 3VF6A 3LL3A 1T44A 2P9NB 3L4IA 5F1XA 4RWTA 4BRNA 2ZWHA 3FE1A 5BN8A 2E1ZA 4O8KA 4H0YB 3SMSA 4NB4A 4B1WB 2P9LB 3H46O 3LM2A 3QICA 4PL7A 3LDNA 3GOIA 3M1FA 1MA9B 4MO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LDSA 1MU2A 4FJGA 4XJXA 3OS0A 4JKFA 1NJYA 3DLLL 4BDYA 5E26A 5M1KA 5GAHP 3SQ4A 2Q2RA 4O0IA 3V9WA 3WNFA 5C15A 1HNWK 3KD1E 1VQ5N 4OPHA 4KREA 3P31A 3L2VA 4NXMK 3I0RA 4C8NA 3HPOA 5CR4A 3FFKB 3IS9A 4JKGA 1VSLA 2Q36A 2ZQBA 3CIPA 4FM1A 3DXKB 5AQSA 5I3UA 2O8CB 1XNRK 1RDBA 4A5AA 1S9GA 1P8ZA 1NGJA 3VMFB 3PIPL 1KVCA 3K59A 1OVYA 3C6AA 4AHCA 4K8XA 1J53A 3EN9A 1D5AA 1VQNN 4M7YA 4IDHA 1ASUA 1BA1A 3Q7BA 3VA3A 3SQ2A 4JYAK 3TI0A 3U9DA 4H0VB 3C6HA 1RTDA 3VGMA 3CHWA 4E0DA 3HO1A 1VSKA 3ZT1A 3LPTA 1GLFO 4DV3K 1TUYA 1BDGA 4CBWA 1NK5A 1TKZA 3CYMA 4O0JA 2KW4A 3KLEA 4PY5A 3M8SA 1REVA 1CZBA 3J80O 3HYFA 3RRGA 2AA4A 2OCEA 3PLAA 2Y1IA 3E9LA 3TTDA 4IBNA 3D2FA 4BECA 3NBPA 2QEXN 3V4IA 3EL2A 4DV1K 4FZYA 1EQYA 1NU0A 1XWLA 4X65K 4CF9A 4DTXA 1VSMA 1BU6O 1V4SA 4AF1A 1T6CA 4L8RB 1C1AA 1B9DA 4IEEA 1YT3A 3AO3A 4AHVA 1DTQA 2O8DB 4DTMA 4Z4GA 4CJLA 3KD5E 5DMRA 3PX4A 1NJZA 3CFOA 5SWMA 2O8FB 4JKCA 3L3UA 3FGUA 4ZTFA 2A3ZA 4OPAA 4OKKA 3D7EO 3ATVA 3NH2A 3D45A 3LP1A 4N47A 1RT7A 3SV3A 3HP9A 1UOCA 4KV8A 3UKUA 4DQSA 4KBOA 3LWLA 3O6WA 4K25A 4M7XA 3D2EA 4FYDA 1RDUA 1NGGA 3AAPA 3CC4N 1S9EA 4CJRA 1LOTB 2I7PA 1QQCA 2VGNA 4JKHA 4FPAA 4DTRA 2D5RA 2YNIA 4ZHRA 4FJ7A 1GOBA 3QEPA 5AQNA 2WFBA 4WE1A 3THYB 2KKZA 4JI5K 2OYQA 1KAYA 2B6AA 1S5JA 4CEDA 5LL6Z 1GLLO 5BPNA 4CIEA 3VENA 3SJHA 5TKWA 3O80A 2UU9K 2G8IA 1SKSA 1NK9A 3HVTA 1QTMA 4W5OA 4QS9A 2GWJA 2YNGA 5ELZA 3LZIA 4KTQA 1FXXA 3QLHA 5FDLA 1HPZA 2HB5A 1TVRA 4CJEA 3SK3A 5FRNA 4DFJA 1G15A 2QK9A 2V52B 1S1UA 2NZTA 2GTDA 3ULEB 2X6NA 3VQQA 5KPRA 4KHSA 1JKHA 4IO8A 3CPEA 5EY4A 4BQLA 4X64K 2P1JA 4KI6A 2VQFK 3CCMN 4JKEA 2ZGZA 4ISFA 3M5RA 2PYLA 2H3GX 5FPEA 4DV0K 1LW2A 4LFBK 1HQEA 3P38A 2IOCA 1C0FA 1OH7A 4CJWA 4H0OA 4C23A 2KQ2A 4MDAA 1U4BA 4FK2A 3KJVA 3THVA 1GLDG 1RFQA 4KKOA 1JLEA 1RDCA 4DG1A 2D0PA 2NNWA 3BY5A 4FJMA 4FLYA 2P9IB 3OBWA 3IDHA 3A2FA 4IKFA 4M63C 1VAZA 3EKUA 5HL7L 2OANA 3TAGA 2RKIA 1TYQB 3D6RA 4M45A 4FOIA 3PSIA 3QETA 3ZSOA 4NO7A 2HMIA 1RT1A 4DR3K 4I9LA 3ZLJA 3AA4A 1U49A 4FZXC 2BANA 1WB9A 3AVCA 1S3XA 2E1YA 4DSJA 3S5TA 4WF9L 1BI4B 2G8WA 2O8EB 3CCLN 3VQAA 3W0LA 1ASVA 5AQQA 5AQWA 1Y97A 4DU3A 4I7FA 3AVLA 1RILA 3MK6A 4DUYK 4BRQA 3DWLA 3M6GA 3FFIA 1HNZK 2HNZA 1VQMN 3MMVA 3DLRA 2NRVA 5MLCQ 3K5MA 1IBKK 4JRQA 4BDZA 3DRRA 4FJXA 3F9KA 1ZBSA 4BRPA 1I3AA 4DF8A 4CHNA 3VQDA 4LD0A 2EHGA 4GKJK 4FLVA 4FVMA 4Z4HA 2VG6A 3KTQA 4RW8A 2CGKA 4KHQA 3NDKA 4JHDB 4BG9A 1NJXA 1HJOA 2V7YA 2Q0RA 4BE0A 5ADXA 1RT4A 4DSKA 2A6AA 3W3DA 4MLEA 3ZT0A 3O4NA 1KQSM 4CZIA 4YHHK 2W6KA 3AAQA 4CZGA 3I0SA 3RR7A 2A41A 2GV9A 4PA1A 3HRGA 2G8UA 4N76A 4ID1A 1RT3A 1KXPA 1FKPA 2WONA 3EKSA 4FJNA 1IKVA 1I39A 3O4QA 3CJCA 2YV0X 3JAMO 1K9MO 1VQLN 4FWNA 3HP6A 5AQVA 3U8XA 5J2MA 4FWSA 2UXDK 5TKYA 3E9OA 1QZ5A 4DR4K 1ATSA 1QQOA 4RW4A 2KZZA 4Z94A 3RRHA 3DRPA 2ITGA 4AH9A 4B8AB 2CH5A 5CZ1A 1HR0K 1NMDA 4GNIA 4CF8A 4K43A 4CD1A 3U4LA 4C1NI 3WNEA 4BRCA 4H5VA 5FRMA 4DSLA 2QM1A 4DFPA 2CGLA 5HROA 4IFYA 3CCVN 3K5NA 1DLOA 3V9ZA 3IMXA 3T69A 2OPRA 2DPNA 4JEPA 3U9ZA 1QSLA 3VESA 2EX3A 3HVRA 4OPKA 3OYNA 4AHSA 4BR0A 1L3SA 1E3MA 2FBVA 2YX6A 1OKJA 1ZC6A 4CBXA 1NLVA 2YJFA 4CGHA 1QHTA 1TK5A 5J2QA 3BZKA 2GELA 3WNGA 1TKTA 3L8BA 4YDUC 1Q9XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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