2FSKA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, semet data
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
326
structure length
321
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
total genus 90
structure length 321
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA01
3FZFA 3QFUA 5F0XA 1R59O 5FPNA 4E1JA 5ADXA 2QWMA 2P9NA 3EN9A 4BRAA 2F9WA 3FFKB 3IDHA 3W3DA 5AQFA 3H1VX 3TU5A 1QZ5A 3JS6A 1S22A 4FWKA 1NGAA 2A5XA 4BC4A 3FR0A 2CH5A 3D2FB 3O4WA 2P9PA 3O80A 4Z94A 1K8KB 2YCHA 4QS7A 3O6WA 3D2EB 1TUUA 1U2VA 1D4XA 2QWPA 4XH1A 4BRCA 1GLCG 2V51B 3CJAA 1CZAN 2QWRA 4LC9B 2ASMA 1HX1A 3A5NC 3DAWA 3CJBA 1OKJA 4CI6A 3KHYA 2QWOA 1HPMA 3RSEB 4RCHA 3O08A 4JN4A 4NO7A 3DJCA 1GLAG 1S3XA 3LDNA 4DHYA 3C7NA 3VF2A 2IIRA 1WUAA 2FSKA 4M7XA 4WQ5A 1DKGD 1RGIA 2OANA 2A3ZA 5AQLA 5FPMA 4BR7A 2I7NA 1H1VA 2E1YA 2ZGZA 5AQUA 2ITMA 5KPRA 5EOYA 5EVZA 4H5TA 2P9SA 4JD2B 1X9JA 5I9EB 5EXWA 3CIPA 3J8AA 3WXJA 4BR9A 1TUYA 3I33A 4GY2B 4BRPA 1RDWX 3A8YA 1ZXOA 1V4SA 5AQNA 5AQSA 4O8KA 5BREA 3P4IA 5ELZA 1TYQB 4RWTA 4NB4A 4M7YA 2UYTA 3CJ9A 4CZHA 2QWLA 3R8EA 3TPQA 1Y64A 3ULEB 1C0FA 3C0BA 3SJHA 3ZETB 2YHXA 1ATRA 4FO0A 3MK6A 2P9IA 3QDKA 3CETA 3MMVA 4I6MA 3FZMA 1NMDA 5BPLA 4B1WB 5AQPA 3LDLA 3VETA 1GLEG 1MA9B 2NRHA 1BUPA 4QS8A 4L3QA 5AFUA 3QICA 3GE1A 2D0OA 4H5WA 3EO3A 3FLCO 3JXUA 1NGJA 4CBXA 4FWLA 3R9PA 1BU6O 3FZHA 3H45C 3HTVA 4MO5A 4CZEA 5KPZA 3D7EO 2P9LA 5ADXH 3U9ZA 4QS9A 4EFHA 3M3ZA 2ASOA 1DEJA 2D4WA 2P9NB 5JLHA 3VEOA 1SZ2A 2FSJA 2GTDA 3QBWA 4BRMA 3DXMB 1HKGA 3LDPA 2W41A 1BDGA 4K25A 1EQYA 4BRFA 1BOTO 4BQZA 4GNIA 5F2RA 2HF3A 5EY4A 3BF3A 3QMLA 1T44A 3FZKA 3UKUA 5FPEA 4AM7A 3QB0A 2YHWA 4K43A 1YAGA 3A5LC 1YUWA 1RFQA 4EIAA 2YJFA 4B9QA 4H0XB 2CGLA 3MDQA 4IZ9A 4PKGA 3A0IX 3VGKA 4K41A 4XH5A 3W0LA 3L0QA 1BA0A 4FWPA 1SQKA 3LDOA 5B8HA 1J6ZA 1NGEA 4PKHA 3C7NB 1JCGA 2KHOA 1XQSC 5AQZA 3CQYA 4MLHA 3UB5A 2VYPA 1X3MA 5AZJB 5AQHA 5BN9A 4FSVA 2P9KA 1JCEA 1KAXA 3LM9A 5BRHA 4RTFD 3WEEA 3VGMA 1GLJO 4HTLA 1QZ6A 2P9SB 2E1ZA 5AQJA 3MN9A 3VEZA 1IJJA 1HKCA 2HOEA 3M6GA 4CZMA 3VGLA 3MN7A 3CJ7A 3SK3A 2E8AA 4B1UB 1KAYA 2GWJA 3LM2A 1BA1A 1NGFA 3ATVA 3UE5A 4H0PA 4MLEA 4BRQA 1BG3A 2PBDA 1ZC6A 2IVPA 3DWLA 3VF4A 3QBXA 4BVOA 3VESA 3GL1A 4CZFA 4KBOA 2E88A 3MN5A 3O1WA 4BR5A 1ATNA 4BRLA 2P9UA 5AZIB 5KPTA 5LY3A 4CZIA 3SMSA 3ZEUA 4AM6A 3VPZA 5BN8A 2P9IB 4B1ZA 4M63C 4I6MB 5LJVA 2FXUA 1SAZA 2CH6A 4CZLA 1KAZA 4BROA 4H0VB 4JHDB 3IUCA 5KQ8A 3VF6A 4IXCA 1WOQA 5TKYA 4WQ4A 2FLOA 3EZWA 4PL7A 3KVGA 3LL3A 4BC5A 4XH4A 4FWMA 2A40A 3DXKA 2BTFA 5AQXA 3WXIA 2A41A 4CZJA 4BR0A 5BRDA 2ZF5O 2VWBA 4BR2A 3GOIA 3MN6A 1QQOA 3IFRA 4BRGA 3IMXA 4YDUA 3VERA 4BVPA 5BPNA 3HM8A 5FPDA 4EHTA 2NLXA 4HWIA 3CQXA 1Q18A 4JD2A 3BEXA 4IO8A 4J8FA 1GLLO 4BG9A 3WQUA 1T6CA 1ZBSA 2YI1A 2Q36A 3ENHA 1LCUA 2QXLA 3WQTA 3VOVA 5BPMA 5E26A 4FWSA 4CJ7A 2Q0UA 4FL9A 4FWQA 1E4FT 4WQ4C 3UKUB 2E2NA 3ULEA 5AQKA 2E2QA 2V52B 2D1KA 2QWNA 3CI5A 4DQ8A 2Q0RA 4JNEA 4A61A 4ISEA 5CE3A 2FF6A 4BC2A 4YDUC 1MDUB 3BF1A 3L4IA 2P9PB 3ENOA 4BC3A 4H5VA 3CJ1A 1HJOA 2V7ZA 1U2VB 4H5NA 1DGKN 1NWKA 4CBWA 1X3NA 5E84A 5JICA 3O5BA 3GBTA 2P9KB 4B1XB 3WEEB 2BUPA 3BP8A 2ASPA 3ZX0A 1LOTB 4BGBA 4B1VA 5AQIA 2YHYA 1Z05A 2QWQA 2AA4A 2GWKA 3L6QA 3OHRA 2E2PA 3UKRA 1NGBA 5AQOA 1C0GA 4XEIA 4BRKA 1HLUA 1YXQA 3H46O 3ATUA 4PKIA 3DXMA 4JAXA 1MWMA 4MO4A 1JCFA 2CGKA 3H3NO 5JLFA 2P9UB 3A5MC 3VEVA 5AQTA 4H0TB 3ID8A 4BRDA 3ZEUB 2WUSA 3WXKA 4BRHA 4C23A 5AQQA 3I8BA 3O8MA 3SLCA 3HI0A 4ISFA 2QM1A 1XUPO 2PAVA 3HSCA 3B8AX 2NZTA 4H0OA 4IWVA 1T6DA 3LDQA 2V7YA 2Q1NA 3FE1A 1NGGA 1YVNA 3D2FA 1XC3A 1K8KA 4A2AA 1U6ZA 5LJWA 1NGIA 3D2EA 4BRNA 3DXKB 3U4LA 2GELA 2FSNA 2I7PA 5AZJA 4IJAA 2W40A 1MWKA 4FOEA 3GG4A 3M1FA 4FWRA 3H3OB 3U8XA 2EWSA 3RSEA 3CHWA 5AQMA 3HZ6A 4Y0WA 5AFUH 4A62A 2D0PA 4DB3A 3HBTA 4H03B 5BRFA 4FPAA 1BWFO 1ATSA 2CGJA 3VEXA 1P8ZA 2E20A 4CBUA 3WUHA 3H6EA 4K42A 5AQYA 2F9TA 1BO5O 4EAHD 4IJNA 2P9LB 4H0YB 3EL2A 1Z6RA 4B1YB 5AZIA 3EKSA 4FWOA 4BQLA 1V4TA 3KZBA 5EX5A 5AQRA 3O1BA 1NGHA 4BG8A 2A6AA 3CERA 4WQ5C 4EHUA 2VCPA 3R6MA 4O5FA 3MCPA 5AQVA 1TYQA 3GDQA 2J4RA 1GLFO 2QW9A 5BR9A 3WXLA 1NLVA 3BUZB 1QQNA 4JHDA 3CJCA 1IG8A 2GUPA 5F1XA 2Q31A 4F9OA 4CD1A 3FGUA 2DPNA 3EKUA 2HF4A 1NGDA 3SMPA 2E2OA 5AR0A 1NM1A 3AAQA 3ZETA 4FPBA 3S41A 3ZX2A 3A5OC 5AQGA 1HKBA 4BR4A 3VENA 4DCHA 5AQWA 1QQMA 4A2BA 4CD3A 2ZGYA 1GLBG 4FOIA 4BGAA 2AP1A 5JMVA 1ESVA 1KXPA 3AAPA 4H5RA 4PL8A 2H3GX 4BREA 3UKRB 3ZX3A 4CZGA 2HMPA 2Q2RA 3VEYA 2YJEA 3AY9A 3G25A 3QFPA 5KQDA 4BRIA 4FWNA 3H1QA 2IVNA 2IVOA 4WYBA 3WT0A 1HUXA 2FF3B 4CZKA 1NBWA 1NGCA 2Q97A 3F9MA 2A42A 1E4GT 3VEWA 1G99A 2ZWHA 3U9DA 3FZLA 1GLDG 4ISGA 2GEMA 1QHAA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OVNA 1WSFA 3ZYYX 3VA3A 3OYNA 4LFAK 4KHNA 3EN9A 4BRAA 3OS0A 1K8AO 3LANA 4E7LA 3IKMA 3NGIA 1IBMK 3TU5A 3IG1A 4DF8A 4DF4A 4BWJA 4BC4A 4KFBA 1IO2A 1LWEA 1WNSA 4HVJA 3O4WA 2P9PA 4Z94A 1K8KB 4E7JA 4IFVA 3O6WA 4X62K 3AA3A 2JWKA 2QWPA 1GLCG 1ZBFA 1GOBA 3J81O 4CEEA 3A5NC 2HHWA 2BGGA 3DAWA 4KHYA 1OKJA 1BIUA 3MXIA 3MEEA 3RSEB 4C8OA 3EYZA 4NO7A 3DJCA 1X1PA 3C6HA 3OJUA 4BR7A 1XMOK 1H1VA 3RMBA 2WC9A 2QEXN 5EVZA 4JD2B 4F2SA 5I9EB 1HYVA 3CIPA 4H4MA 3LP2A 4BR9A 4GY2B 1V4SA 2XY7A 4DUZK 3MECA 1EETA 1TYQB 4KHWA 3E9LA 2DFEA 4FLWA 1RT1A 4CJUA 4CF0A 2UYTA 3L8BA 3IRXA 4CZHA 2QWLA 3R8EA 4DTPA 5IT9O 3AVBA 1HYSA 5C2FA 2HSTA 3ULEB 4FJMA 2QA4N 3C0BA 3SI6A 4CEDA 4CJVA 1N32K 1ATRA 4FO0A 3MK6A 2P9IA 3CETA 4I6MA 3BZCA 3O3FA 5AQPA 3VETA 1KVBA 1MA9B 5TKWA 1RTDA 1YI2N 4BY9C 2VG5A 4CJ5A 3K57A 4DFPA 4DV2K 5HLFA 1HNWK 3QEWA 4L3QA 5CY4A 2D0OA 1W97L 3THWB 3RTVA 1U49A 4FLTA 3R9PA 4CZEA 4HHTA 1U47A 3NVKA 1ZBHA 2HHSA 3L3UA 2P9LA 2WFBA 3K9KA 4GV9A 3HL8A 3M3ZA 1J9AA 3TSQA 3SZ2A 2UXCK 1VSJA 3AVFA 4YORA 4CHQA 1SZ2A 1WBDA 4BRMA 4CGFA 1TKTA 3BZKA 4IDHA 4DR4K 1NOZA 3AVNA 4GMJB 3BF3A 1CZBA 3QMLA 4CFCA 3FZKA 1WLJA 1NK5A 2YHWA 3O9SA 4K43A 4CF2A 4FJ5A 3AVIA 2QXFA 1RFQA 3MDQA 4PKGA 2O8BA 3L0QA 1BA0A 3RVCA 4MDAA 1UA0A 5HRSA 3TARA 2PYJA 2ATQA 3E66A 1JCGA 3CG7A 2OTJN 1FJGK 3QEXA 3CQYA 4F2RA 5AZJB 1NG9A 5AQHA 4M3ZA 3SBTA 1JCEA 1KAXA 3WEEA 3VQ4A 4HTLA 4YY3K 1T7PA 1QZ6A 3I0SA 4KTQA 3ZSOA 2HOEA 3M6GA 4CZMA 3VGLA 4DSIA 1KAYA 2GWJA 1BA1A 2YHAA 3K5LA 3R3LA 4XIUA 1SL2A 4BRQA 1BG3A 2OYQA 3NF6A 1NK4A 1VQLN 5FRMA 3DWLA 4WF9L 4FM0A 2HHXA 3DYAA 2UXDK 4CZFA 2E5LK 1QVFM 4CFDA 3MCAB 4BRLA 4DQSA 3RR7A 3V81A 4AM6A 5BN8A 1QHTA 1JL1A 4ILGB 3V1RA 2X6SA 1M90O 2RF2A 3ZSWA 2O8FB 2YNHA 4Q5VA 4GW6A 4H0VB 3P38A 5KQ8A 5LL6Z 1UWBA 4WQ4A 3EZWA 4PL7A 1HMVA 1TKZA 2XY8A 4NXNK 3HSTB 1NU0A 5FDLA 4KAZA 4JI0K 3NGYA 2BTFA 4R79A 1BI4A 4DSEA 4BE1A 3K2PA 2ZF5O 4OJRA 3OYMA 4BVPA 3VERA 4DR1K 4BE2A 4RG8A 1J53A 2NLXA 2YKMA 5C10A 4HUGA 4O8UA 3THXA 1T8EA 1VRUA 4J8FA 4ICLA 3OYBA 4BG9A 1OVQA 3S3OA 1ZBSA 3ENHA 3R1XA 4O0IA 5HRRA 1NJWA 5MLCQ 3SV4A 4OGEA 1NMNA 2G8KA 5E26A 3OY9A 2G8WA 3C65A 4Y1CA 2FF6A 2W42A 5E41A 4JRQA 1MDUB 1RDAA 3L4IA 1QSSA 4IFEA 2P9PB 4CIEA 4FJHA 3CJ1A 1BCOA 3O9UA 4JS4A 4E7HA 5M1PA 1DGKN 1WSIA 4C8NA 4M3WA 4RW4A 3K9JA 1S6QA 2P9KB 3ASMA 1A5VA 2ASPA 5BR8K 1B9DA 4BGBA 5AQIA 3G4SN 1LW0A 2ZE2A 1Z05A 2QWQA 2AA4A 3OHRA 1SKRA 5LMUK 4BDZA 1D5AA 4OX9K 4JK8A 1C0GA 4XEIA 3UIQA 1HLUA 1GOCA 1VSMA 4PKIA 1K73O 3DXMA 4FJ8A 4JAXA 3J7AP 1VSKA 1ASUA 1I39A 5JLFA 2NNWA 3B6PA 5AQTA 4H0TB 3TAMA 2BH1A 2WUSA 4OKKA 4BRHA 4C23A 1OVYA 1A5WA 1KLNA 4N76A 1I3AA 2QM1A 4ISFA 2HHHK 4QOZB 3SUPA 3SPYA 2QKBA 3Q7CA 4N47A 2NZTA 3M8SA 3O9QA 5J2NA 3LDQA 4E3SA 4KI6A 4DSFA 2V7YA 2Q1NA 3SQ2A 3VQ6A 1K8KA 5K14A 1QSLA 5LJWA 3K0SA 4GVMA 3QNNA 1K6YA 3U4LA 1ASVA 2I7PA 3C95A 1QE1A 2W40A 1MWKA 1VQKN 3ZT3A 3AO4A 4W5QA 4C8LA 2ZD1A 3RSEA 4A62A 4B3SK 4DB3A 2HBLA 3NHGA 4NCGA 4EP4A 5IWAK 4ZTJA 1RT5A 1WN7A 1NK0A 1P8ZA 3SAFA 4DTXA 3AVJA 2IGIA 4BACA 1JLCA 2F9TA 1BO5O 4EAHD 1XI1A 4IJNA 2P9LB 1Z6RA 1JJ2M 3F9KA 5AZIA 1VSDA 2VG6A 4FWOA 1KTQA 4IKFA 3HPHA 4WQ5C 3CCVN 2VCPA 4O5FA 3MCPA 1DLOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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