2FSKA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, semet data
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
326
structure length
321
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 90
structure length 321
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA01
3WXKA 4BRNA 3BP8A 1WOQA 3O1BA 4BR9A 2V52B 1RFQA 1HLUA 1T6DA 2Q2RA 3RSEA 4A2AA 5BN8A 1K8KA 1YXQA 1Y64A 2CH5A 1BOTO 4YDUC 3EL2A 2QWQA 1DEJA 3UKUA 1NGHA 5ADXH 2PBDA 4BQZA 2P9UB 1TUUA 4EHUA 4BR0A 5AZIB 3WXLA 4JD2B 5JLHA 2GEMA 5AQRA 5AQOA 3P4IA 2VWBA 2QXLA 4FWRA 4BRFA 2YI1A 1SQKA 1QQOA 3MMVA 2OANA 4CZKA 1U2VB 1E4FT 3VF4A 5KQDA 2H3GX 1MWMA 4FO0A 2E1ZA 2HMPA 3UKRA 3VERA 3AAPA 2GUPA 3CHWA 2PAVA 2FSNA 5F2RA 1ZBSA 1T44A 2P9IA 3MDQA 3U4LA 2DPNA 5AZJA 4B1ZA 5KPZA 1RDWX 3U9DA 4FWQA 1NGGA 1TYQA 3CJAA 1BWFO 1JCFA 3H1QA 1X3NA 1NLVA 1Q18A 3LL3A 4H0YB 2P9LB 4EHTA 4FL9A 3SMPA 1LOTB 3GE1A 3H3OB 4IZ9A 2E2QA 5I9EB 2CGKA 4A2BA 3F9MA 4XH5A 1GLFO 2Q0UA 3FZHA 4B1VA 4CZMA 1DKGD 3L6QA 1H1VA 3SMSA 1HKBA 2ZWHA 5AQNA 5E26A 4BC2A 3WT0A 5AQVA 2P9UA 2F9WA 3HTVA 4O5FA 5AZIA 2FF6A 3CJ9A 3HM8A 4JD2A 4I6MB 3ZX2A 5TKYA 3VF2A 3DXMB 3MN5A 1U2VA 3VETA 5BPMA 4PKGA 1BG3A 3CJBA 4BGAA 3MN9A 3WUHA 1P8ZA 5KPTA 2A41A 1NM1A 4FWLA 5EOYA 1JCGA 4GNIA 4PKHA 3SJHA 4NB4A 1X9JA 3A0IX 5LJVA 2P9LA 2IVOA 3WQUA 1C0GA 3M3ZA 3KVGA 4BRHA 2F9TA 2FF3B 3QFPA 1KAXA 3D2FB 2ITMA 4H0TB 1MWKA 4FWKA 2KHOA 4H0XB 2BTFA 1J6ZA 1XUPO 5BR9A 1KXPA 1OKJA 5AQWA 4MLEA 2P9KB 2V7YA 4H0OA 5FPEA 4C23A 2A40A 3R9PA 3DAWA 3WXJA 4H0PA 4QS8A 4BC3A 4K43A 2WUSA 4I6MA 5EX5A 4BRGA 4GY2B 4RCHA 4CZGA 3I8BA 3LM9A 2E2PA 1GLBG 2CGJA 3DXMA 4WQ4A 5AFUH 3JXUA 3S41A 1GLCG 4AM7A 3VEVA 1NGEA 5EY4A 4CZJA 1NGCA 2QWPA 3H45C 4M7XA 3H3NO 2UYTA 3A5NC 2E8AA 3FZMA 5ELZA 4XH4A 3ULEB 2P9SB 2NLXA 4KBOA 3FR0A 4XEIA 4ISEA 2D0PA 3TPQA 5ADXA 4WQ5A 3BEXA 4HTLA 3U9ZA 5JMVA 4BR2A 1ATNA 2CH6A 2A5XA 4EAHD 1TUYA 2BUPA 1NGAA 4DCHA 5LY3A 2YCHA 4M63C 5KPRA 4BR7A 2ZGYA 5EVZA 5AQJA 3D2FA 5AQXA 2YHXA 5BRFA 2HF4A 3FLCO 3WXIA 3IDHA 5EXWA 3TU5A 3FE1A 3AAQA 2YHWA 4BR5A 2FLOA 2V7ZA 2FSKA 2P9KA 5E84A 2Q31A 4M7YA 5B8HA 3EZWA 3CI5A 2CGLA 3EO3A 5FPNA 4BGBA 1QHAA 4QS9A 1X3MA 1BA1A 3VOVA 1QZ5A 4CZHA 3BF1A 2YJFA 4YDUA 1GLLO 2D1KA 3ATVA 4MLHA 4AM6A 4CZLA 4DQ8A 1HX1A 1GLEG 3ZETB 4H5RA 4XH1A 4FWSA 1BDGA 3VGLA 4CBUA 3ENHA 3MK6A 1ATRA 1GLDG 4FPAA 3GDQA 4BRQA 3D7EO 5CE3A 4CI6A 4FSVA 4CBXA 3ULEA 3SLCA 2P9SA 4BROA 2Q97A 4BRPA 5BPLA 2QWOA 2D4WA 3CJ1A 4B1UB 4A62A 4Y0WA 3VEZA 3H6EA 1WUAA 4E1JA 3MN6A 2QWRA 2E2NA 4BVPA 5BPNA 4CD3A 3O4WA 2GWKA 2QWLA 3C7NB 4PL7A 4DHYA 2ASPA 3W3DA 2AA4A 1YAGA 4IXCA 3VESA 3QMLA 1HKCA 3HSCA 3QBXA 4JHDB 3IMXA 3MN7A 4BRKA 1ZXOA 4MO5A 1NGJA 1T6CA 3CQYA 2QW9A 2NRHA 5JLFA 3M6GA 1Z05A 3AY9A 4PL8A 3A8YA 4H5NA 3H46O 5BREA 3VGKA 3VF6A 3G25A 3O1WA 5AQMA 4JAXA 1BUPA 3GG4A 3GOIA 2YHYA 3ZETA 2I7PA 4JN4A 1DGKN 3C0BA 2W41A 1KAZA 4K42A 3CETA 3ENOA 4MO4A 4CBWA 3KZBA 3EN9A 3KHYA 3QFUA 4FWOA 5F0XA 1GLAG 2GWJA 3FFKB 3ZX3A 4BRMA 3JS6A 3QB0A 4NO7A 3ZX0A 4IJAA 1HUXA 4DB3A 5AQQA 1ATSA 4BC5A 3O5BA 3C7NA 4Z94A 3LDNA 1IG8A 3CERA 4L3QA 3CIPA 2E88A 1NGIA 3GBTA 4B1XB 3BF3A 3UB5A 4JHDA 4O8KA 4H0VB 4CZEA 3DWLA 2P9NB 5AQKA 5AQZA 2YJEA 2ASOA 1S3XA 1YUWA 3O8MA 2ASMA 4FPBA 4J8FA 3WEEB 3FZKA 5LJWA 2VCPA 5AQTA 3R8EA 4FWNA 1SZ2A 4WYBA 4FOIA 1ESVA 1XQSC 5KQ8A 1MA9B 3LDQA 3OHRA 3L0QA 1HJOA 5FPDA 2FXUA 2D0OA 4BRAA 3W0LA 2A42A 3CJCA 3VEYA 3CJ7A 3IUCA 1LCUA 1MDUB 2FSJA 2HF3A 2J4RA 3WQTA 5AQIA 4H5WA 2A3ZA 4CZIA 4BR4A 3DJCA 1R59O 3HZ6A 2QM1A 5BN9A 3J8AA 3D2EB 4PKIA 2P9PB 4BG8A 4B9QA 2V51B 3O08A 4BRDA 1NWKA 4LC9B 1NBWA 4BVOA 1JCEA 1NGBA 1U6ZA 3MCPA 1HKGA 4RTFD 5AQPA 5AR0A 1Z6RA 4A61A 4F9OA 1CZAN 4IO8A 2EWSA 2GELA 3EKSA 4CZFA 3VENA 3I33A 5BRDA 3H1VX 3HI0A 3VEOA 4B1WB 3FZLA 3ZEUB 4BRCA 2QWNA 3GL1A 2VYPA 2P9NA 1SAZA 3DXKB 3VEXA 3U8XA 2E1YA 3WEEA 4BC4A 2ZGZA 3LM2A 4HWIA 4RWTA 4IJNA 5AQHA 4ISFA 1IJJA 1G99A 3VGMA 3A5OC 3LDPA 3L4IA 2QWMA 2ZF5O 3LDLA 2GTDA 4JNEA 5F1XA 1NMDA 4FWMA 4BRIA 1V4SA 2E2OA 3M1FA 1E4GT 4BREA 2Q36A 4FOEA 3BUZB 1BA0A 4B1YB 1QQMA 3D2EA 3UE5A 3SK3A 1RGIA 2P9PA 4CJ7A 3B8AX 3QBWA 2W40A 2HOEA 1EQYA 1GLJO 4K41A 1YVNA 3A5MC 4FWPA 1S22A 3IFRA 5AQYA 3RSEB 3O80A 1K8KB 2E20A 3ID8A 4IWVA 3FZFA 5AQFA 4WQ4C 1QZ6A 3UKUB 3HBTA 5AQUA 4BG9A 2I7NA 1NGFA 4EIAA 1XC3A 3ATUA 3VPZA 5AQSA 4BQLA 3ZEUA 2IVPA 3DXKA 4EFHA 4QS7A 4K25A 4H5VA 3EKUA 5FPMA 3QICA 1C0FA 4BRLA 3VEWA 1HPMA 4H5TA 5AQLA 1D4XA 4H03B 1ZC6A 1NGDA 2A6AA 5BRHA 4WQ5C 3UKRB 2NZTA 2Q0RA 5AFUA 1V4TA 3O6WA 1BU6O 1QQNA 2P9IB 3A5LC 3R6MA 4CD1A 2IVNA 2Q1NA 2AP1A 3FGUA 2IIRA 3AARA 5AZJB 3CQXA 1KAYA 1TYQB 1BO5O 5AQGA 3LDOA 5JICA 4ISGA 3QDKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8EA 1OVQA 3BP8A 1WOQA 1HYVA 1T6DA 3DRRA 4OKKA 2Y1JA 5BN8A 4JLHA 2YNHA 1ZYQA 1IG9A 1NJXA 4CK3A 3MWPA 2QWQA 4CJRA 4FLTA 1NGHA 4DV4K 2QKBA 2PBDA 2X6NA 2P9UB 4JD2B 2HHUA 2OPRA 4KB0A 5AQOA 2HBKA 2VWBA 4LH4A 4BRFA 2YI1A 3PX4A 1SQKA 3ZLJA 4GKJK 3MMVA 2OANA 4CZKA 1U2VB 4Z4HA 4JI4K 5KQDA 2H3GX 3L8BA 2A1RA 5C24A 1A5WA 3U4LA 4NYNA 2DFFA 2FBYA 4B1ZA 4OGEA 4FWQA 3WNEA 1RBRA 1NJZA 1QSYA 1JCFA 3F5TA 4I9QA 4CGGA 2P9LB 4FL9A 3SMPA 1LOTB 4IZ9A 5I9EB 4CHYA 1OH7A 4U67L 4CZMA 4B1VA 2Q0UA 4KHQA 1DKGD 1VQ9N 4AILC 1RT7A 5AQNA 4IFVA 4DUZK 5K14A 3ZCMA 3KK2A 5AZIA 4JKHA 3B6OA 4DR7K 4E1NA 3AVKA 2QTDA 4NLCA 1YI2N 4N41A 4CJ5A 4OX9K 1QSLA 1BG3A 3TAPA 4BGAA 1TKDA 2OZMA 4GVEA 1GOAA 4JK7A 3IRXA 2A41A 4FWLA 3VQ9A 4CVNE 3QIOA 4YNQA 4KTZA 1NK9A 4FJMA 1NJYA 4DR4K 4DTUA 3A0IX 5LJVA 1TV6A 3M3ZA 4BRHA 5GINA 3L2WA 1RDDA 2F9TA 2OPSA 1VQ6N 4KI4A 2WC9A 2ITMA 2KHOA 5BR9A 4LY7A 1KXPA 1OKJA 3BZCA 3G0ZA 5AQWA 4CEAA 5FPEA 4C23A 3R9PA 3THVA 2D5RA 1RCHA 4K43A 4I6MA 3U3GA 4CJWA 3EY1A 5KRSA 2OTLN 3DXMA 4WQ4A 3VQ7A 3JXUA 4YY3K 2W42A 5C10A 3N4PA 3CG7A 4JEPA 2VG5A 3H3NO 2UYTA 3A5NC 3SNNA 1VRTA 2HBMA 4NXNK 2NLXA 4O5BA 2B6AA 5M1QA 2D0PA 1D9DA 1ATNA 2A5XA 1VSJA 3LWLA 4KTQA 3ZSYA 2F7TA 4B8CA 2NRVA 3NE6A 4M63C 3TAMA 4KHPK 1LWFA 3DLBA 3N4QA 5EVZA 1L3TA 3NBPA 2X78A 5AQJA 3D2FA 4O44A 2YNGA 2KFNA 3WXIA 4J2BA 5EXWA 3FE1A 3AVLA 3AVFA 2FLOA 3HPHA 4CEBA 2KLAA 4X62K 3TI0A 3OJSA 3OYDA 1FJGK 3EZWA 4E0DA 5C2DA 4FJXA 4IBNA 1RTDA 2BH1A 4PWDA 3DLLL 1QHAA 2F8TA 4CFDA 5C2FA 1HPZA 2O8CA 4CZHA 2YJFA 4M42A 3OYHA 3OVNA 1GLLO 3ATVA 4MLHA 5CZ1A 1N36K 4CZLA 2KKZA 3TARA 1UA0A 1WB9A 4DQ8A 1HX1A 1GLEG 3HP6A 1LW2A 3VMFB 1BCMA 4FWSA 5M1NA 1GLDG 4FPAA 3NH2A 5CE3A 4KHUA 1B9FA 4FSVA 1K9MO 3ULEA 2P9SA 3AGKA 3CM5A 1KFDA 1VSHA 3MEEA 2HBLA 3VEZA 3H6EA 1WUAA 4CJEA 4JKGA 3NH1A 4J2EA 4A59A 4RW8A 1QVGM 4PUOA 3O4NA 1YAGA 2VG6A 3CCVN 4UY8O 3ISNC 4JHDB 3IMXA 3MN7A 4JKAA 1T6CA 3E9OA 3LWMA 3THWB 4LSLA 3S3NA 4F2SA 3A8YA 3CCLN 3R1XA 5BREA 4M45A 2AJQA 3VGKA 2GUIA 2UXDK 3O1WA 3NGIA 4JAXA 1BUPA 3EZ5A 3GOIA 2GX9A 4IFYA 5CZ2A 1RT1A 4GMJB 2ATQA 1S1TA 4K42A 4MO4A 4CBWA 3OYIA 4OKEA 3RR8A 3OYKA 5C25A 3KHYA 4IKFA 1HR0K 1BL3A 1WSIA 4DSJA 1BQMA 4BRMA 4Z4CA 2XO7A 3RMAA 5T7BA 4FJ7A 3SAHA 3J7YP 1WSEA 2FBVA 2JWLA 3NF6A 4BC5A 3O5BA 4YOXA 1ZBFA 3C7NA 4CJ4A 3LZJA 1RILA 3CERA 1TAUA 5H1SQ 3GBTA 3NVKA 3AA2A 3BF3A 3UB5A 3O9SA 4JK8A 1VQ4N 4H0VB 1EWQA 4CZEA 1UWBA 3SPYA 4CW7B 1TK0A 3WEEB 2ASMA 2VCPA 3AVIA 2HHQA 4FWNA 3QEVA 5M1KA 2QI2A 4DV5K 1W97L 3LDQA 1HJOA 4Z4EA 3NF9A 3VEYA 3I55N 3LAMA 2IOCA 3CJ7A 5GIPA 1LCUA 4FLUA 4OGCA 3SQ0A 4B3MK 5FLXO 1DTTA 4CZIA 3JAMO 4BR4A 1R59O 3HZ6A 3O3GA 3K5LA 1QSSA 3J8AA 1KQSM 3D2EB 5JVGL 1VQ7N 3C6HA 4JI5K 4LF4K 4E7LA 3Q7CA 4BRDA 3CCEN 4BVOA 4CESA 1SUQA 1X9MA 5M1OA 2ITGA 4CGIA 1Z6RA 2BE2A 4F9OA 1EXQA 4FZXC 4IO8A 2GELA 3EKSA 1L3VA 4DWIA 4GKKK 3H1VX 2KW4A 3HI0A 3ZSVA 3FZLA 4DTXA 1XMQK 2QWNA 3TSQA 5BR8K 2P9NA 1SKWA 3U8XA 2HHXA 1OH6A 4RWTA 3OYBA 5AQHA 3MXJA 1IBKK 3RRGA 3QERA 1G99A 3A5OC 2ZJQL 4FK2A 2E5LK 4W5QA 3V9SA 4YOVA 4LF8K 3QO9A 1T7PA 3KD5E 2E2OA 3M1FA 3HPOA 4YOWA 4O4GA 4DV1K 1JL2A 1BI4A 1NG9A 1N33K 4FM1A 1NJIO 4DQQA 1EETA 3WNGA 4G9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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