5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
3JS6A 2A40A 1BO5O 5FPEA 5LJWA 1Z05A 4GY2B 4BRGA 5F1XA 4ISGA 3CJ1A 2F9WA 3AARA 3O08A 2CH5A 4NO7A 1RDWX 3O6WA 4EAHD 3HBTA 4WYBA 1QZ6A 1KXPA 2V7ZA 1K8KB 1NM1A 5CE3A 3VOVA 1ATSA 4HTLA 5F0XA 3BF1A 4B1VA 1YXQA 1E4FT 4B1YB 3O1WA 4BRMA 1G99A 1IJJA 2IVNA 3ULEB 2FSNA 2AP1A 1BA1A 5FPMA 4JNEA 4BRPA 4DB3A 4IJAA 2EWSA 2Q31A 5KPTA 4I6MB 3D2FB 3VGLA 2ZF5O 3U9DA 1GLDG 2CGLA 1KAYA 1TYQA 2Q0UA 2BUPA 2E88A 3BEXA 5BRFA 2QWNA 2HMPA 3MN7A 4IWVA 1MWKA 4FPAA 3CHWA 2VYPA 4Z94A 4CBXA 2YJEA 3KVGA 3GOIA 4LC9B 2FXUA 1S22A 3ZETA 2FF6A 3DWLA 5AQQA 5BR9A 2IVOA 1NGIA 3C7NB 3DJCA 1U2VB 5BRHA 1XUPO 3FE1A 4AM7A 2P9NA 3A8YA 4O8KA 3OHRA 3HZ6A 4A2AA 4DHYA 3FFKB 1GLLO 2UYTA 5EXWA 2OANA 2YJFA 4WQ5A 4RCHA 2GTDA 5EY4A 3MN6A 3A5LC 2A5XA 3ATUA 5JMVA 5AFUA 3WQTA 4BROA 1K8KA 3VEOA 5EOYA 1ATRA 4AM6A 4H03B 1T6CA 4YDUA 3CERA 3LDLA 3WXLA 3EZWA 4PKHA 2QWLA 1TUUA 3LM2A 4FL9A 3CJ7A 3VEWA 2D0PA 3FZLA 2E2NA 1JCEA 3U4LA 2E2PA 1X3NA 1XC3A 4MO5A 2YI1A 1CZAN 2A3ZA 1QQNA 4I6MA 3D2FA 3H3NO 4IZ9A 1NGCA 4BR0A 1MWMA 1IG8A 3UKUB 3CJCA 3SJHA 4H0PA 4A2BA 1S3XA 1LCUA 4BC2A 5KPRA 3MN9A 1BG3A 1JCGA 2AA4A 3D2EB 3AAPA 1KAZA 3B8AX 4JD2A 4BC3A 4CJ7A 1YAGA 3WXJA 1C0GA 3C7NA 3HTVA 1DKGD 3A0IX 1GLAG 3VPZA 5F2RA 3LDOA 2HF4A 4RTFD 1ZXOA 1HJOA 4QS7A 1D4XA 1T6DA 5JLFA 4FWSA 3BF3A 5I9EB 3FGUA 3VEYA 4WQ5C 4BC4A 3SK3A 3DXKB 3WXIA 2P9UB 4ISEA 2E8AA 2CGJA 1BWFO 1NBWA 3HI0A 3WT0A 2I7NA 4BR4A 4WQ4C 4IXCA 3U9ZA 3CIPA 1XQSC 3O5BA 5BPLA 2GUPA 2VCPA 3DXMA 3VGMA 4YDUC 4FWOA 4L3QA 2ZGYA 5B8HA 3U8XA 4H5RA 1YVNA 4CZKA 3WQUA 4FWRA 3QMLA 4JHDA 5AZIA 2E1ZA 2I7PA 5FPDA 2NRHA 3CQYA 5BN9A 4CZLA 3WEEB 2KHOA 3SMPA 5BN8A 2E1YA 4B1ZA 2P9KB 4BR9A 3ENHA 2P9PB 3TU5A 5AZJA 1ESVA 4A61A 1QQMA 3ZEUB 3WXKA 3QFUA 3VETA 3D2EA 1SZ2A 2V52B 2IIRA 1NGFA 3MK6A 3QICA 1YUWA 4CBUA 5LY3A 2ZWHA 4EHUA 4FWKA 3GL1A 2ASMA 5AQGA 3QB0A 1Z6RA 4K41A 1P8ZA 3A5MC 3EN9A 4H0YB 2Q97A 3R6MA 3R9PA 3RSEA 2GEMA 3O4WA 4CZMA 5AQUA 3DXKA 3UKRB 2YHYA 3WUHA 3DAWA 3L0QA 4BRNA 3CQXA 2IVPA 3VESA 4RWTA 3H1VX 3I33A 4MLHA 2FLOA 4H5NA 5AQHA 5JLHA 1TUYA 5AQXA 4NB4A 2QM1A 4BRHA 1BOTO 3EO3A 2QWQA 3BP8A 2Q1NA 2DPNA 1SQKA 2W40A 1U6ZA 4C23A 3J8AA 2P9SB 5EX5A 4XH4A 4BRCA 2FSKA 1HKGA 3CJ9A 5KPZA 1J6ZA 3WEEA 3ULEA 4ISFA 4MO4A 3VF4A 3ZX0A 5ADXA 4DQ8A 5AFUH 2P9KA 3ZX3A 4B1UB 4PKIA 2F9TA 2P9PA 1ZBSA 1WUAA 3ENOA 3UB5A 3VGKA 1HKBA 5AQFA 3GDQA 1X3MA 2QWOA 5ADXH 4BG9A 5AQVA 4BGAA 2NLXA 4B1WB 4BRKA 4EHTA 3GG4A 1NGGA 1LOTB 1GLEG 2YHXA 2YCHA 3QBWA 2NZTA 4BVOA 2A42A 2QWRA 2PAVA 5AQIA 1Y64A 2QXLA 5AQRA 4CD1A 3EKSA 2A6AA 4QS8A 4PL7A 4FOIA 3G25A 1U2VA 3L4IA 1HX1A 5AQSA 5JICA 5FPNA 5BRDA 4K42A 4QS9A 1ATNA 1QHAA 2QW9A 2Q2RA 4H0TB 5AQJA 4PL8A 3UKRA 3ID8A 1OKJA 2QWPA 4J8FA 3D7EO 1TYQB 1QZ5A 4M7YA 4BG8A 5AQOA 4Y0WA 3EL2A 4BRLA 1MDUB 4F9OA 3C0BA 2D4WA 2BTFA 2HF3A 3M6GA 2V51B 3H1QA 1RGIA 2VWBA 2ASOA 2W41A 1GLCG 3ZETB 2P9LB 1V4SA 2GELA 4FWQA 4K43A 5E84A 3KHYA 3QFPA 1BDGA 4B1XB 4CZGA 4CZHA 3MN5A 1X9JA 5AQKA 1H1VA 3FZMA 4HWIA 4H5WA 3MMVA 3UKUA 3VEXA 3GE1A 3LDNA 3O8MA 3ATVA 2P9IB 5AQNA 2Q0RA 5AQPA 3TPQA 3KZBA 3CETA 5AQTA 4GNIA 3A5NC 4B9QA 5LJVA 2FF3B 4FWLA 3H45C 4H0VB 1DEJA 4FWMA 1NGAA 1GLFO 3LDQA 2J4RA 3IDHA 1GLJO 3O1BA 4FWNA 4XH1A 5TKYA 5AQYA 3FLCO 1NGBA 3LM9A 3QBXA 4CBWA 3W0LA 4CZFA 3VENA 3A5OC 4BVPA 2HOEA 1T44A 2E2QA 4BREA 4H0OA 4BC5A 2P9UA 1NGHA 2D0OA 3IMXA 3HSCA 4O5FA 5E26A 2ASPA 1NGDA 4M63C 4BQLA 4CI6A 1NGJA 3VEVA 5AR0A 3HM8A 1HKCA 1HLUA 2D1KA 2P9LA 4JN4A 4JD2B 3M3ZA 4JAXA 4CZEA 1ZC6A 5KQDA 3CJBA 3FZHA 4FPBA 5AQLA 4H0XB 2CH6A 1GLBG 3W3DA 2Q36A 4BR7A 3BUZB 4BRFA 2GWKA 3QDKA 2YHWA 5AQZA 3FR0A 4EFHA 4H5TA 4FO0A 2P9IA 1Q18A 5BPNA 3L6QA 2WUSA 3S41A 4XH5A 2FSJA 1C0FA 4WQ4A 3ZEUA 4BGBA 1QQOA 4FSVA 4DCHA 2ITMA 4FOEA 1HUXA 1NMDA 4PKGA 3IFRA 2QWMA 1BU6O 3DXMB 3I8BA 3VERA 4A62A 1E4GT 3H3OB 2CGKA 4CZIA 3SLCA 1NWKA 4IJNA 2ZGZA 1V4TA 3VF2A 4BRDA 2H3GX 1WOQA 2GWJA 4JHDB 5AZIB 3R8EA 4FWPA 4KBOA 5BPMA 5EVZA 1KAXA 4BRQA 3H6EA 3O80A 1EQYA 4BR5A 1HPMA 3FZKA 3FZFA 3JXUA 5AQWA 1DGKN 4K25A 5BREA 4BR2A 5AZJB 1RFQA 4EIAA 3M1FA 3EKUA 3AY9A 1R59O 3MCPA 4XEIA 4IO8A 2PBDA 3VEZA 4BRIA 3LDPA 4H5VA 1NLVA 3IUCA 1SAZA 3GBTA 4CZJA 2A41A 3H46O 1MA9B 3AAQA 3LL3A 4E1JA 3UE5A 4M7XA 3P4IA 1NGEA 3VF6A 1BUPA 3F9MA 5AQMA 3ZX2A 4MLEA 2E2OA 2P9SA 5KQ8A 4BRAA 4CD3A 5ELZA 3CJAA 3SMSA 2V7YA 3CI5A 1JCFA 3MDQA 2E20A 3RSEB 4BQZA 1BA0A 2P9NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZT0A 1EP4A 1K6YA 3PSIA 3KOWA 2YKNA 1UOCA 2QXFA 4WFBL 3LAKA 4UQGA 1KV0A 5GINA 2CH5A 2NRXA 4EAHD 4JS4A 1ILYA 1Q8IA 3SF4D 1JZAA 3E01A 3AVIA 1NM1A 1XC9A 3VOVA 1T7AA 5F0XA 3BF1A 4MDAA 3TTFA 4DR2K 4B1VA 3OYNA 4B9UA 4KRFA 1JKZA 3O1WA 3M5RA 4JKAA 4KHSA 2IVNA 2LT8A 4KHNA 2FSNA 2AP1A 5DK5A 4JNEA 2QEXN 3TANA 1SKRA 3KK2A 4F2RA 1NOYA 1TYQA 4CK2A 3WNFA 3M8QA 2E88A 1GOCA 3MECA 4CEBA 3HPHA 1T1TA 1QSYA 3AVBA 2HMPA 3MN7A 4IWVA 3E7UX 1C0MA 2PYJA 4AF1A 2KQ2A 2W6LA 2HBMA 2YJEA 2K35A 1B9DA 3KKSA 2XY6A 2FXUA 4B9TA 3DWLA 2O8EA 4CJLA 2OYQA 1AHOA 3C7NB 3DJCA 4C8MA 4FM0A 5MLCQ 3A8YA 1K9MO 4FJNA 5KRSA 1QVGM 4OLBA 4CF8A 2E6MA 3HZ6A 1QSLA 3Q7BA 4DQRA 4JK9A 5CY0A 2Z1JA 3VQ8A 4GV3A 4RW6A 3J81O 2YJFA 3O4QA 3SUQA 3MN6A 1WT7A 4GMJB 4LF7K 1MU2A 5JMVA 1K8KA 3VEOA 1YJNN 5EOYA 1ATRA 4Y1CA 3CFOA 4YDUA 3CERA 3C6AA 1TUUA 4FL9A 3J80O 2D0PA 2NRZA 2YHAA 4N56A 4BE2A 3L8BA 4JKCA 2HBLA 1CZAN 4I6MA 1QQNA 3ID6A 4IZ9A 1NGCA 4IOAL 3CJCA 1T0ZA 4CJQA 3HJFA 4AHSA 4BC2A 5KPRA 3QIOA 3MN9A 1ZBHA 2PZSA 2P5GA 4ZTJA 4CJ4A 3OBWA 3PIPL 3P5JA 4JD2A 4BC3A 1YF5L 4C8NA 4CGJA 3G10A 3DLKA 2M8BB 1S1TA 3AVJA 3AVGA 1D4XA 4DV1K 5HLFA 4FWSA 3SPZA 2UUCK 4CF2A 4WQ5C 2A7TA 1SKSA 4E7JA 1RT1A 4DUYK 2CGJA 3V81A 3KOYA 3BK3C 4WQ4C 1BRZA 3U9ZA 4BWMA 3CIPA 3RRGA 4YY3K 3EE9A 2XY8A 3C6TA 3KD5E 5BPLA 3DXMA 4FWOA 2ZGYA 1NRBA 3NDKA 1J5OA 4FK0A 4JI0K 1YVNA 1B9FA 3EZ5A 3TI0A 1P90A 4FLXA 4LH5A 3NH0A 2E1ZA 3OW2M 4ID5A 2NRHA 3LALA 4CZLA 2D0CA 2GX9A 5BN8A 3SMPA 1VQ5N 3ZLJA 2E1YA 3LDSA 1EKEA 2G8WA 4G1QA 3QEXA 3HYFA 3RMBA 3TU5A 5AZJA 4A61A 3WXKA 3QFUA 2V52B 5HRNA 4CJ3A 3QICA 1EO1A 1J5EK 3HL8A 3P31A 3THVA 4DV2K 1W7AA 3HSTB 3R1XA 3ZSOA 2ASMA 1M90O 2YEOA 4DQSA 4BE7B 1KC8O 3ISNC 2B68A 1P8ZA 3EN9A 2LR3A 1YI2N 4YORA 1Q7YO 1IG9A 4FJLA 3R6MA 1BCOA 1BL3A 4KTZA 3OA9A 1ZBIA 5GAEP 3DAWA 3PX0A 2KW4A 1RDBA 1NKBA 4OO1J 3QINA 2OPQA 1BISA 2ASCA 4RW9A 3KLFA 3O9RA 4NB4A 3CD6N 2QM1A 4KFBA 4BRHA 4CECA 4LH4A 3LANA 1SQKA 1JLCA 3J8AA 2QK9A 1I2VA 2FSKA 3HVRA 3NGZA 1KVAA 3ULEA 3O3GA 1C6VA 1POIA 3ZX3A 3E9OA 4FVMA 1WUAA 3UB5A 3CCSN 5FRMA 4DFKA 2SN3A 4WCEL 1UA0A 1JLBA 4N47A 4UAEF 1VQ7N 5E41A 2EX3A 2XRIA 3PX6A 2G8VA 2X6SA 3C94A 4BG9A 4BGAA 3ENBA 4C8OA 3AO2A 4DSFA 2KPYA 4LF9K 3QBWA 3QO9A 2IC3A 2YHXA 1LW2A 4CJVA 4FJXA 2MZ0A 5AQRA 1OH6A 1CLQA 2Z1GA 3ZSYA 2RF2A 3G25A 5FPNA 2NUBA 3EE8A 5BRDA 3K59A 3S3OA 5AQJA 2G8FA 3ID8A 4LFBK 1YJ9N 2UU9K 4GW6A 2QWPA 4JKGB 3OJUA 2KZZA 4B8AB 1L3UA 3EL2A 4O8UA 4O5BA 2HF3A 3QEIA 3NGIA 1LWCA 3JSMA 2ASOA 3R3LA 4CJRA 3L2WA 4B9VA 5CZ2A 1V4SA 4FWQA 3Q7CA 5C24A 3KHYA 2QA4N 1SV5A 3NF7A 4CZGA 4DR6K 5AQKA 4KHQA 5D3GA 1DQ7A 1IBKK 4G9ZA 3ZYYX 2O8DA 3ATVA 2P9IB 4BDPA 1S9GA 5AQPA 3TPQA 4AHTA 3ZT3A 1BMRA 3TAMA 1VAZA 2OTJN 5EU7A 4H4MA 4FWLA 3H45C 4IEEA 2J4RA 1GLJO 3O1BA 4FWNA 2HHWA 5TKYA 1N36K 5AQYA 4OGEA 3VENA 1NH5A 2HOEA 2E2FA 2HHHK 4GV9A 2Z1HA 4W5OA 4W5QA 3OYEA 4H0OA 5M1FA 1HRHA 1LV5A 1TAQA 4YHHK 1FW6A 4B08A 3LP0A 5E26A 3JYTA 3TAGA 1OVQA 4M63C 1VSHA 1X9SA 3HM8A 1A5VA 1RT6A 1NK0A 1HLUA 4JN4A 2P9LA 4Z0UA 1YT3A 1NJIO 3LPTA 4CZEA 1ZC6A 3DRSA 4FPBA 2VG6A 2NRWA 3AV9A 3BUZB 2ATBA 4BRFA 2GWKA 4U7BA 2YHWA 5J2QA 3K5OA 5AQZA 3FR0A 4DQQA 4EFHA 2HHVA 3BDPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZT0 A;  1EP4 A;  1K6Y A;  3PSI A;  3KOW A;  2YKN A;  1UOC A;  2QXF A;  4WFB L;  3LAK A;  4UQG A;  1KV0 A;  5GIN A;  2CH5 A;  2NRX A;  4EAH D;  4JS4 A;  1ILY A;  1Q8I A;  3SF4 D;  1JZA A;  3E01 A;  3AVI A;  1NM1 A;  1XC9 A;  3VOV A;  1T7A A;  5F0X A;  3BF1 A;  4MDA A;  3TTF A;  4DR2 K;  4B1V A;  3OYN A;  4B9U A;  4KRF A;  1JKZ A;  3O1W A;  3M5R A;  4JKA A;  4KHS A;  2IVN A;  2LT8 A;  4KHN A;  2FSN A;  2AP1 A;  5DK5 A;  4JNE A;  2QEX N;  3TAN A;  1SKR A;  3KK2 A;  4F2R A;  1NOY A;  1TYQ A;  4CK2 A;  3WNF A;  3M8Q A;  2E88 A;  1GOC A;  3MEC A;  4CEB A;  3HPH A;  1T1T A;  1QSY A;  3AVB A;  2HMP A;  3MN7 A;  4IWV A;  3E7U X;  1C0M A;  2PYJ A;  4AF1 A;  2KQ2 A;  2W6L A;  2HBM A;  2YJE A;  2K35 A;  1B9D A;  3KKS A;  2XY6 A;  2FXU A;  4B9T A;  3DWL A;  2O8E A;  4CJL A;  2OYQ A;  1AHO A;  3C7N B;  3DJC A;  4C8M A;  4FM0 A;  5MLC Q;  3A8Y A;  1K9M O;  4FJN A;  5KRS A;  1QVG M;  4OLB A;  4CF8 A;  2E6M A;  3HZ6 A;  1QSL A;  3Q7B A;  4DQR A;  4JK9 A;  5CY0 A;  2Z1J A;  3VQ8 A;  4GV3 A;  4RW6 A;  3J81 O; 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