5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
3ENHA 2D4WA 2VWBA 1T6DA 2QWRA 2V7YA 3C7NB 2AA4A 4BRLA 4CZHA 1ATSA 1KAZA 3DXKA 4I6MA 1SQKA 3MN5A 2Q1NA 4H5VA 3UE5A 2E1ZA 2EWSA 1J6ZA 1XC3A 4BGAA 4BR7A 1NGJA 4F9OA 2FSJA 3QFPA 4PKHA 3W3DA 4FWOA 1TUUA 1E4FT 4B1XB 3CERA 4IO8A 2E2PA 4CZEA 4XH5A 3FZFA 2FF6A 5JLFA 1R59O 2VYPA 3LL3A 4FPBA 5AQLA 1RFQA 4EAHD 2NRHA 2P9KA 1KAXA 3M3ZA 3WXLA 3FGUA 4FWLA 1RDWX 1YXQA 4EHTA 5BR9A 1YAGA 1GLEG 5AQWA 1BG3A 1H1VA 4M7XA 3VF2A 4B1WB 4C23A 3J8AA 2P9PB 1ZXOA 3ULEB 1SAZA 3GE1A 1P8ZA 4CI6A 3IDHA 4WQ5A 2E2NA 3BF1A 4WYBA 2D1KA 3U8XA 5LJVA 4DB3A 4BG9A 5AQZA 3DJCA 4CD3A 3WEEB 4BR9A 2VCPA 4FWMA 1X3MA 1JCFA 4JNEA 3WT0A 3L4IA 3FZLA 4XEIA 1V4SA 3A5NC 1BA1A 3O08A 3OHRA 5AQNA 2Q36A 5ADXA 3TPQA 4BRKA 3HTVA 2YHWA 1Z05A 4DHYA 1NWKA 4K42A 4HWIA 2YCHA 2CGJA 4IWVA 2A5XA 5AZJB 1MDUB 4GNIA 1WOQA 2H3GX 4AM6A 4J8FA 5KPTA 4JHDA 4B1VA 3O1WA 4EFHA 4BG8A 2I7PA 2D0PA 5AQGA 2CH5A 2YJFA 4FSVA 1HJOA 3WQUA 3L6QA 2P9UB 4BC3A 3AAQA 4M63C 4BR2A 5AR0A 3A5MC 4KBOA 4BROA 4Y0WA 4H03B 3HBTA 4BRHA 2P9LB 5BPMA 3AAPA 3MDQA 5AQJA 2GTDA 3A5LC 3ATUA 1QQNA 2IVPA 1NBWA 4Z94A 3LDNA 4CZMA 4I6MB 1TYQA 2E2QA 5B8HA 3CI5A 3ZX2A 1S3XA 2CGKA 4WQ4C 1EQYA 4H0YB 2D0OA 1ATRA 1DKGD 1T44A 3ZEUA 1U2VB 4BR4A 4H0OA 2ZGYA 5BPLA 3FLCO 4CBXA 1QHAA 3QICA 1CZAN 1D4XA 1X3NA 4A62A 2QW9A 2P9NA 3L0QA 4BC4A 1NGBA 2HMPA 3D7EO 1K8KB 3C0BA 3D2FA 4O8KA 5I9EB 1NGDA 4QS9A 5AQTA 4BC5A 2V51B 4YDUA 4CZJA 3LDOA 3WXKA 1HX1A 3EO3A 5CE3A 3QBWA 4CZGA 5KPRA 1GLDG 1BA0A 2QWOA 4BC2A 3O1BA 1Z6RA 4BREA 1G99A 2ZWHA 4DCHA 4B1YB 5AQHA 4QS7A 3DXMA 1XUPO 3H3NO 5AQVA 2P9SB 1ZC6A 2HOEA 5FPDA 2Q0RA 3I8BA 2YI1A 3LDLA 4FO0A 3FFKB 1TUYA 3QB0A 3UKRB 4QS8A 4B9QA 1NGIA 2Q0UA 1QQMA 5F0XA 4RTFD 2J4RA 3CQXA 1GLJO 2QWLA 2FXUA 5F1XA 5AFUH 1QQOA 2ITMA 4K43A 1LOTB 1WUAA 5AQUA 3VEYA 2GUPA 3I33A 3O8MA 4ISEA 3RSEA 4FWKA 1IJJA 2FSNA 4FWPA 3FZMA 3WXJA 5AQKA 3CHWA 1BWFO 5BN8A 2CGLA 2GWKA 3BF3A 4PL8A 3C7NA 3M1FA 4PL7A 3LDPA 2GELA 3ENOA 3MN6A 4BRQA 4IJAA 3VGMA 1HUXA 4CZLA 3A5OC 4CBWA 1QZ5A 5AQPA 1ESVA 3MCPA 5BRDA 3A0IX 2ZGZA 4DQ8A 5AZIA 5BPNA 3CQYA 1TYQB 3VERA 2V52B 3KHYA 5TKYA 3W0LA 4A61A 3BUZB 5BRHA 1U6ZA 3VEOA 4IXCA 2GWJA 4E1JA 5AQXA 1GLFO 1OKJA 1BU6O 3JXUA 4AM7A 3O6WA 5FPNA 4O5FA 5E84A 2A3ZA 4L3QA 4EHUA 5AQYA 3ZX0A 2PAVA 4CD1A 3VEWA 2P9PA 4BRCA 3ULEA 3GOIA 3H6EA 2IIRA 1XQSC 3LM9A 4BR0A 4MO4A 2YHYA 1NGHA 3VEZA 4JAXA 3CJAA 2HF3A 1QZ6A 3DXKB 3TU5A 3CJ7A 5F2RA 3H1VX 3HSCA 3HM8A 2Q31A 2ASMA 1DGKN 1KXPA 3VF4A 2E1YA 1HPMA 1NGCA 3H1QA 1MWKA 3BP8A 2F9TA 3SLCA 3UKUA 2A6AA 5AQMA 1ATNA 4K25A 3SMPA 3VEVA 2F9WA 1KAYA 4CZIA 2QXLA 3VESA 3VENA 3QBXA 5ELZA 3UB5A 3U9ZA 4H0PA 1GLCG 2P9IA 4H0TB 3IUCA 1ZBSA 4H5WA 2P9KB 3SMSA 4BQZA 4XH1A 3HZ6A 3EL2A 5EVZA 3LM2A 4BRFA 5AZJA 5EOYA 4BRGA 2E88A 3D2EA 1HKBA 3R9PA 3S41A 4BRMA 4H0VB 3EN9A 4BRPA 3M6GA 1NGEA 4A2AA 3VOVA 3U4LA 5KPZA 2P9UA 3SJHA 2QWMA 3KVGA 1NMDA 3U9DA 1IG8A 5EX5A 1DEJA 2P9LA 3QMLA 3AARA 2FLOA 2NZTA 3MN7A 5LJWA 1NGAA 2ASOA 1MA9B 5AQSA 3EKSA 3AY9A 4BQLA 5KQDA 4CJ7A 4BRIA 4PKGA 4NB4A 3FR0A 3H3OB 1MWMA 3ZETA 4B1UB 4YDUC 2E2OA 3QDKA 1C0GA 3H45C 5EXWA 2A41A 5AZIB 2A40A 1U2VA 4RCHA 3LDQA 5KQ8A 2I7NA 3O80A 5JICA 3QFUA 3FZHA 5AQRA 4BRNA 2E8AA 2GEMA 2V7ZA 4JHDB 4EIAA 3B8AX 3CETA 4JD2A 3F9MA 4A2BA 3VF6A 4K41A 5LY3A 2QM1A 2ZF5O 1HKGA 2QWNA 3FZKA 4BGBA 5AQIA 1K8KA 3O5BA 3VGKA 4CBUA 2ASPA 4BVPA 3GL1A 2YJEA 4FOIA 1NM1A 4H5NA 2W41A 3DWLA 5AQFA 1NGFA 3VPZA 2AP1A 3FE1A 4H5RA 2BTFA 4XH4A 2BUPA 4FWNA 3R8EA 1LCUA 4WQ5C 4H0XB 4CZFA 4MLHA 4BRDA 2IVNA 2W40A 1NLVA 3GBTA 1SZ2A 2HF4A 3GG4A 4PKIA 3WQTA 3EKUA 1Q18A 2OANA 3SK3A 1HKCA 5JLHA 3A8YA 2P9SA 3UKUB 3CJ9A 5EY4A 4MLEA 5FPMA 3JS6A 3MMVA 3ZEUB 4M7YA 4FWQA 3ATVA 2FSKA 4HTLA 1BOTO 3UKRA 2FF3B 4LC9B 5FPEA 2P9IB 1HLUA 2PBDA 3ID8A 4FWSA 2A42A 4IJNA 3IFRA 4MO5A 2P9NB 1X9JA 4GY2B 5BREA 1RGIA 5E26A 1GLLO 3D2FB 3D2EB 1YUWA 3H46O 3BEXA 3O4WA 4BVOA 4BRAA 3WXIA 4B1ZA 4WQ4A 1BO5O 1Y64A 2IVOA 1C0FA 4H5TA 4NO7A 3WEEA 3KZBA 2KHOA 2QWQA 1JCGA 1NGGA 2Q2RA 3CJCA 2QWPA 1JCEA 3DAWA 3CIPA 5AFUA 2DPNA 3IMXA 3DXMB 3CJBA 2NLXA 3ZX3A 2CH6A 5AQOA 2UYTA 4CZKA 4RWTA 1GLAG 1BUPA 3WUHA 2YHXA 3VGLA 1E4GT 5BN9A 2Q97A 3ZETB 3VETA 1T6CA 3VEXA 1BDGA 4ISFA 1V4TA 3CJ1A 3MN9A 4FPAA 4BR5A 4FOEA 1YVNA 3G25A 3MK6A 2WUSA 4FL9A 3GDQA 4IZ9A 3P4IA 5AQQA 3HI0A 3R6MA 5BRFA 5JMVA 4JN4A 3EZWA 3RSEB 4JD2B 5ADXH 1S22A 2E20A 4ISGA 1GLBG 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF6A 3AO5A 4CFCA 2D4WA 4FYDA 1VSHA 3KOWA 3LPTA 3OYFA 1LV5A 4DR5K 5CHIA 3UE5A 2D0CA 2E1ZA 3VQEA 3OYMA 4BEBA 4WE1A 3NE6A 4BR7A 1WBBA 3QFPA 4PKHA 4ZHRA 4DQSA 1TUUA 5GIPA 2IC3A 1E4FT 4B1XB 3CERA 1IBLK 4CZEA 1DJTA 1R59O 3DLEA 3CMAN 1C6VA 3P31A 5M1NA 1RFQA 2G8WA 3E9OA 4DSKA 1VQ6N 2QK9A 3VF2A 5EU7A 1C1CA 4KHPK 4BY9C 4B1WB 3J8AA 4BECA 1NK5A 4WFNL 4H4MA 2O8CB 1HRHA 3GE1A 1VAZA 3BF1A 3E7UX 4CCHA 3J7ZO 2SN3A 3VQQA 5LJVA 3QEPA 1UGLA 1SUQA 2HHHK 3CCSN 1T7BA 3WEEB 2GMOA 1VQ4N 4BE7B 5IT9O 3RR8A 4FJHA 3AVHA 3BK3C 1NG9A 1X3MA 4HE7A 4Z4EA 4CGDA 3L4QA 4CF8A 3NFAA 4M42A 4FZXC 4XJXA 4DFJA 5AQNA 3TARA 2HHQA 3VTHA 2Q36A 5ADXA 1SKRA 3G10A 4BRKA 3HTVA 2YHAA 3AVJA 1Z05A 5K14A 2ATBA 4HWIA 4GW6A 4E89A 4IWVA 5AZJB 1BK8A 4JHDA 4C8OA 3KP0A 1CZBA 4W5OA 4FLWA 4BG8A 2I7PA 4DU4A 3D6RA 2CH5A 1HJOA 4F2SA 3L6QA 1EKEA 4BC3A 3V9ZA 4FXDA 4M63C 5AR0A 4IO9L 3HBTA 1CHZA 1QS4A 4CJKA 2HHUA 4BRHA 5CZ1A 4GV3A 3RR7A 3A5LC 1VSJA 3ATUA 1NBWA 1HMVA 1S1TA 1B92A 3OW2M 1TYQA 4EZ6A 4DG1A 1VQON 3J7YP 2KLAA 2B6AA 3SAGA 4CIFA 1S3XA 4AB0A 2BGGA 3QETA 2QXFA 3C6UA 3SV3A 3CCQN 1HYZA 4IG0A 5C42A 4OKJA 1MU2A 4ID1A 1K6YA 1NJXA 4KTZA 3P1GA 2IOCA 1CZAN 1X3NA 4YNQA 3F73A 2QW9A 2Z1GA 4JKAA 4BC4A 1WT7A 3D7EO 3C0BA 4O8KA 1WSIA 2JWLA 2F8TA 4CQKA 1BHLA 5I9EB 1NK4A 1N6QA 4OKEA 3M8RA 1VHXA 2LI7A 3WXKA 5CE3A 4BE0A 1RT1A 1BI4A 5LMNK 1SN1A 2W6LA 5KPRA 3AO4A 3VA3A 1XRSB 2XY7A 2NY8X 3CCUN 1Z6RA 1G99A 2ZWHA 1IBKK 3P39A 1DTQA 4B3SK 2VY6A 1XUPO 4JS5A 3EEQA 3H3NO 4CW7B 2KGQA 2E3GA 1ZC6A 1KD1O 4B9TA 2YI1A 1KLNA 1N34K 3LDLA 1EO1A 1KC8O 4N5SA 2Q0UA 1NJWA 2JLEA 3CMEN 1TKZA 5FROA 1QQMA 4N41A 4KTWA 3E1YA 3QEWA 2J4RA 3CQXA 1X9SA 2AJQA 1RT7A 2GL1A 2ITMA 5C25A 3RMDA 2GUPA 3I33A 5MLCQ 1Q7YO 3O8MA 4ISEA 4FWKA 1DTTA 1IJJA 4Z4IA 4KI6A 1I39A 1HNVA 3TAMA 5AQKA 3CHWA 3KIOA 3SQ2A 3PLAA 1AHOA 1FW6A 3S3NA 4LFAK 3C7NA 5JS1A 1RT2A 4PL7A 4Y1CA 3LDPA 1RT3A 4HUGA 3VGMA 4FLXA 1TKDA 1QZ5A 1ESVA 1TAQA 1KTQA 1RTJA 1ZBIA 1VQ5N 3CQ8A 5AZIA 5BPNA 1QSSA 3U3YA 2V52B 2HSTA 3W0LA 1Q9YA 2VG7A 4J2EA 4E1JA 3QI7A 1OKJA 1BU6O 3PY8A 3B6PA 4EZ9A 4PA1A 2NRWA 3NH1A 4L3QA 5AQYA 4HHFA 4NXMK 1JZBA 4TSXA 4CD1A 3VEWA 1NK7A 1TL3A 2JGUA 3GOIA 1VRTA 3H6EA 5SZTA 4OPAA 1KVAA 1XQSC 3EY1A 2RN2A 4I2PA 2OCEA 4JAXA 3HVTA 3CJAA 1BISA 2NRRA 1QZ6A 4DMNA 4NXNK 1VNAA 3HP9A 4FM1A 2Q31A 4DS4A 2ASMA 2F4VK 1KXPA 1ZYVA 3J80O 1JLAA 1MWKA 4Z4FA 2E0HA 3UKUA 3ZT2A 3T1YK 1ITGA 4M3WA 2UUAK 1TKXA 4YOYA 1I3AA 3IUCA 1IBMK 2YV0X 4H5WA 3SMSA 3QESA 3CM6A 3AA2A 3LM2A 3OYCA 3SJJA 2E88A 1KVBA 3S41A 4CJTA 1JLFA 2HHTA 3CM5A 4LSNA 3M6GA 1NGEA 4JEPA 4A2AA 4KHSA 4CERA 1A5XA 2GX9A 4MDAA 2QWMA 1ICAA 3K5NA 3SPZA 1OH8A 1NMDA 1ZYQA 1XMQK 3S9HA 3VQDA 3I56N 5AQSA 1ASVA 4BQLA 1J9AA 3FR0A 4YDUC 3QDKA 3VA0A 1SEGA 5EXWA 4CFDA 3K57A 1U2VA 5J2NA 4QAGA 4N76A 1C0UA 1HR0K 3QFUA 1VQLN 3FZHA 5AQRA 2E8AA 5M1OA 3LPUA 4JS4A 4JHDB 4EIAA 4JD2A 3C94A 4A2BA 3VF6A 5GAEP 1RILA 4DV2K 2W6KA 5AQIA 1S1XA 1WSFA 4U7BA 2EX3A 4CBUA 3GL1A 4BACA 4A59A 1YJNN 4AHTA 2AP1A 3L56A 4KHWA 3O4QA 2BANA 2BUPA 4FWNA 2D0AA 3N4PA 3C6AA 2PFUA 3NAEA 4BRDA 4Z4HA 2IVNA 1TVRA 1SZ2A 4R5PA 3SK3A 2ZE2A 3A8YA 4DSEA 3CJ9A 2KBKA 4JRPA 5EY4A 3VQ7A 2VG6A 4IOAL 4FWQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NF6 A;  3AO5 A;  4CFC A;  2D4W A;  4FYD A;  1VSH A;  3KOW A;  3LPT A;  3OYF A;  1LV5 A;  4DR5 K;  5CHI A;  3UE5 A;  2D0C A;  2E1Z A;  3VQE A;  3OYM A;  4BEB A;  4WE1 A;  3NE6 A;  4BR7 A;  1WBB A;  3QFP A;  4PKH A;  4ZHR A;  4DQS A;  1TUU A;  5GIP A;  2IC3 A;  1E4F T;  4B1X B;  3CER A;  1IBL K;  4CZE A;  1DJT A;  1R59 O;  3DLE A;  3CMA N;  1C6V A;  3P31 A;  5M1N A;  1RFQ A;  2G8W A;  3E9O A;  4DSK A;  1VQ6 N;  2QK9 A;  3VF2 A;  5EU7 A;  1C1C A;  4KHP K;  4BY9 C;  4B1W B;  3J8A A;  4BEC A;  1NK5 A;  4WFN L;  4H4M A;  2O8C B;  1HRH A;  3GE1 A;  1VAZ A;  3BF1 A;  3E7U X;  4CCH A;  3J7Z O;  2SN3 A;  3VQQ A;  5LJV A;  3QEP A;  1UGL A;  1SUQ A;  2HHH K;  3CCS N;  1T7B A;  3WEE B;  2GMO A;  1VQ4 N;  4BE7 B;  5IT9 O;  3RR8 A;  4FJH A;  3AVH A;  3BK3 C;  1NG9 A;  1X3M A;  4HE7 A;  4Z4E A;  4CGD A;  3L4Q A;  4CF8 A;  3NFA A;  4M42 A;  4FZX C;  4XJX A;  4DFJ A;  5AQN A;  3TAR A;  2HHQ A;  3VTH A;  2Q36 A;  5ADX A;  1SKR A;  3G10 A;  4BRK A;  3HTV A;  2YHA A;  3AVJ A;  1Z05 A;  5K14 A;  2ATB A;  4HWI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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