5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
5EXWA 3FE1A 1TYQB 1JCFA 3I33A 2NRHA 3VGMA 5ADXA 3DJCA 1WUAA 1U2VA 4FPAA 3VOVA 4JN4A 2Q0UA 4H5VA 1NGIA 1ATNA 3EZWA 5AZIB 5BPMA 4FWSA 3MMVA 3A5LC 2P9PB 2I7PA 5BN8A 2CGLA 2D0PA 3ENHA 4HWIA 3U8XA 4BG8A 3WXIA 3UKRB 3CJAA 1CZAN 3WUHA 1R59O 3ULEA 3BEXA 2CH6A 3MDQA 4WQ5A 4WQ4A 1H1VA 4BRFA 2NZTA 2VYPA 1U2VB 4H0OA 1ATRA 1GLJO 2GUPA 3CJ9A 2A5XA 3MN6A 3ZEUB 1BO5O 2P9NA 1NGGA 4H0XB 1DEJA 1NGCA 4PKIA 4B1XB 3M3ZA 3D2EB 3DXKA 1T6CA 4BR7A 1U6ZA 3VPZA 3B8AX 3VF4A 4B1VA 3DWLA 2Q97A 5E26A 1NBWA 1MA9B 1MWKA 3EL2A 3JS6A 2GEMA 1D4XA 3WXJA 1MWMA 5AQNA 2IVOA 2P9LA 2YJEA 2QWMA 5LJVA 2FF6A 2WUSA 1V4TA 2J4RA 3C0BA 3IDHA 3CQXA 3KVGA 3DXKB 5AFUA 4FWMA 3SMSA 4CBXA 5FPNA 3AARA 3ZX3A 4K25A 3CIPA 4EIAA 3QBWA 5ADXH 3O8MA 4XH5A 3LDOA 2Q1NA 5AQIA 2PAVA 3HZ6A 4BG9A 5AR0A 2CGJA 3M1FA 4HTLA 3FR0A 4FO0A 2QWLA 2P9LB 3KHYA 1ESVA 4BRNA 2YHXA 4EFHA 2E2NA 3AY9A 3UE5A 3VEZA 5AQKA 3HM8A 3QDKA 4XH1A 4CBUA 3LL3A 2QM1A 2ZGYA 3SJHA 3VETA 4CZJA 4QS7A 1K8KA 1RDWX 3HI0A 3F9MA 3VENA 5AQPA 5CE3A 2QWPA 4BRCA 3CQYA 4I6MB 5AQOA 4BC4A 1QHAA 3IMXA 4XH4A 3ZETA 2E20A 1KAXA 3D2FA 1HUXA 3M6GA 3P4IA 1SQKA 5LJWA 1BUPA 2KHOA 4JAXA 1NGHA 4H5RA 4NO7A 1E4GT 2AA4A 1GLCG 4BR4A 3QB0A 4FPBA 4YDUC 4B1UB 1NGBA 4ISEA 1JCGA 5JMVA 1K8KB 2D0OA 3VEWA 5F2RA 3FZMA 2E2PA 2ZWHA 5AQGA 1ZBSA 4M63C 2V51B 3LM2A 4BC2A 5BR9A 3O08A 2HOEA 2Q31A 5F0XA 1KAZA 4IZ9A 3ENOA 4K43A 4PL7A 5AFUH 2YHWA 3CERA 2DPNA 5AQXA 3C7NB 2CGKA 4BRAA 1HX1A 2P9UA 3VGKA 3GOIA 5JICA 3O5BA 3WEEA 5BPNA 2YCHA 3MK6A 4GY2B 3U9ZA 5AQRA 1HKBA 1KXPA 2E1YA 3A5OC 3VGLA 2HMPA 4O5FA 5KPTA 3BP8A 1BOTO 4H03B 2GTDA 2E2OA 3VEXA 1NWKA 1HJOA 3LDQA 3J8AA 3R9PA 4JHDA 1HPMA 3LDNA 3FGUA 5FPDA 2W41A 3FZLA 2FSJA 2I7NA 1G99A 1QZ5A 4Y0WA 4PKGA 3GBTA 2A3ZA 4B9QA 3A5MC 3O80A 4DQ8A 4A2AA 1QQMA 3VESA 1Z6RA 5FPMA 3L0QA 1ZXOA 4E1JA 1YVNA 3FFKB 2P9IA 3O4WA 3DXMA 2V7ZA 1T44A 2GWKA 3U4LA 5BRFA 5EVZA 3ULEB 4CBWA 4FWRA 5AQTA 4FWKA 2FSKA 4JHDB 1BU6O 5AQVA 1YAGA 5BRDA 4AM6A 5EX5A 2GWJA 4ISFA 4BRKA 5JLFA 5E84A 2P9NB 3SMPA 4F9OA 2QWQA 4FOEA 1ZC6A 4DHYA 4BRQA 3QBXA 3QFPA 3R8EA 5AQWA 4BRIA 4BROA 2OANA 1X3NA 4H0TB 1NLVA 3FZHA 5TKYA 1HLUA 4H5NA 3H3NO 2P9IB 1BA0A 3DXMB 2A41A 3EN9A 4BR5A 4M7YA 2AP1A 3WQUA 3MN5A 3ATVA 2E1ZA 1TUUA 2FXUA 4BRDA 2VWBA 4H5WA 1T6DA 1E4FT 4CD1A 1XQSC 4FWQA 2Q0RA 3MN9A 5BRHA 4CJ7A 1Y64A 4BGBA 2A6AA 2BTFA 1Z05A 1V4SA 2D4WA 4FWLA 1X3MA 3UKUA 4BR2A 2E88A 1Q18A 3IUCA 1C0FA 4GNIA 4Z94A 5KQ8A 4K42A 4BVPA 1MDUB 1KAYA 2QWNA 2Q36A 4KBOA 2FLOA 4PKHA 2P9SA 3FZFA 4IXCA 3VEOA 4BVOA 2ASPA 3QICA 3LM9A 4BREA 2FSNA 3HBTA 4CZMA 1LCUA 2W40A 1GLAG 3BF3A 5AQYA 4JD2A 1NGJA 1SZ2A 3CETA 4BRLA 5KQDA 4A62A 4BR0A 5AQMA 2Q2RA 4BQZA 4CI6A 3HTVA 4M7XA 5EY4A 5EOYA 1SAZA 3IFRA 2PBDA 2F9WA 4FOIA 4J8FA 3CI5A 1ATSA 5FPEA 1NGDA 2P9SB 3ZX0A 3RSEA 1QQNA 2BUPA 3MN7A 4H0PA 4IJAA 1TYQA 2IVPA 4YDUA 1HKCA 3ZETB 4BQLA 1NGEA 4LC9B 2E8AA 3D2FB 3VF2A 4MO4A 4EHUA 4EHTA 5BN9A 1WOQA 4BC3A 4IO8A 4CZFA 3O6WA 5AQLA 4MLHA 5AZIA 2ITMA 2P9PA 2V7YA 3ID8A 4IWVA 5AQFA 4BGAA 1IJJA 3O1WA 4JNEA 5I9EB 3A0IX 3RSEB 5KPRA 2D1KA 4L3QA 5LY3A 2CH5A 3JXUA 3EO3A 5AQJA 1GLBG 1S3XA 4C23A 3ZEUA 4NB4A 3DAWA 1C0GA 4FWPA 3WXLA 4O8KA 3H45C 4ISGA 4QS9A 2P9UB 1BA1A 3D2EA 2YI1A 4CD3A 3H1VX 4WQ4C 3GDQA 4WQ5C 2YJFA 4H0YB 4RCHA 3WEEB 3WT0A 3OHRA 2QXLA 1J6ZA 5AQQA 1GLFO 3VEVA 3VERA 3GE1A 3WQTA 1OKJA 3H1QA 4PL8A 4B1ZA 4B1WB 1QQOA 2YHYA 4IJNA 4B1YB 5AQUA 3W0LA 4DB3A 1EQYA 1HKGA 2NLXA 2HF3A 1LOTB 1JCEA 1BDGA 2HF4A 3H6EA 3D7EO 5BREA 4DCHA 1YUWA 4EAHD 2P9KA 3BF1A 3L6QA 3EKUA 2V52B 4FWNA 2A40A 2GELA 4CZHA 4BRPA 2IIRA 3TPQA 5KPZA 3G25A 2QWRA 3SK3A 1IG8A 3FLCO 1GLEG 3QFUA 3S41A 3U9DA 4WYBA 3A8YA 3O1BA 3I8BA 3MCPA 5B8HA 3GL1A 4BR9A 2P9KB 3FZKA 4CZKA 4MLEA 5AQZA 4XEIA 2E2QA 1RGIA 2UYTA 4BRGA 1TUYA 2F9TA 5AQSA 1BG3A 4A2BA 2ZF5O 3L4IA 4BC5A 4BRHA 2A42A 3QMLA 4I6MA 4K41A 2FF3B 1GLDG 3HSCA 3H46O 3TU5A 3AAPA 3A5NC 2ZGZA 3ZX2A 2VCPA 3W3DA 1XUPO 3LDPA 4H5TA 5BPLA 3KZBA 2ASMA 1NGFA 4CZEA 3ATUA 4CZLA 2ASOA 5ELZA 4FL9A 3CJBA 4CZGA 5AZJA 3UKUB 5F1XA 5AQHA 1YXQA 4RWTA 4BRMA 4H0VB 1DKGD 2IVNA 1X9JA 2EWSA 1NGAA 1BWFO 3H3OB 2QW9A 3WXKA 1DGKN 1NM1A 3AAQA 4QS8A 1GLLO 4FWOA 4MO5A 4JD2B 4FSVA 1S22A 3EKSA 3C7NA 4AM7A 1NMDA 2QWOA 3CJCA 3R6MA 2H3GX 3LDLA 5AZJB 1QZ6A 3VF6A 3VEYA 3GG4A 4CZIA 1RFQA 4RTFD 3BUZB 3SLCA 3UB5A 3CJ1A 3UKRA 1XC3A 3CJ7A 5JLHA 4A61A 3CHWA 1P8ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TYQB 3OYDA 3VGMA 4JRPA 3IG1A 3ZSXA 5GIPA 4CEZA 1L4VA 3VOVA 4JN4A 4IFVA 4YFUA 3D0PA 5LL6Z 5T7BA 5AZIB 3SUNA 2G8FA 3A5LC 4K8XA 4FK0A 3AVJA 1ZBHA 2I7PA 4M42A 2QTDA 5BN8A 2CGLA 4NYNA 4M3WA 4IFEA 1UWBA 2X78A 4DUYK 4DFJA 4M41A 4Z4CA 4DU1A 1CXQA 3V1OA 3NMUA 4IDHA 4NXMK 3HK2A 1B7DA 2VYPA 1MYNA 1ZUTA 4FLXA 1CLQA 3V9XA 1ATRA 1GLJO 3MN6A 3B6OA 2P9NA 4O44A 1NGGA 4H0XB 1DEJA 2DFHA 1NGCA 4PKIA 4B1XB 1IH7A 3RWUA 3HRGA 1Y97A 4CHOA 2OA8A 4BR7A 1U6ZA 4DTOA 1ITGA 1QE1A 4H4MA 3C6TA 2VQEK 4B1VA 3G6EN 3DWLA 4ELVA 5E26A 4HCBA 3JSMA 4MFBA 1NJIO 2I61A 2GEMA 3WXJA 1MWMA 1ICAA 5AQNA 4J2DA 1YITN 2HMIA 1VQ6N 4JI7K 4IKFA 2UU9K 4AHUA 1V4TA 3WNFA 1XI1A 3CQXA 4FJKA 1IBKK 2G8KA 5SZTA 4GMJB 3L3VA 4CBXA 3AARA 4CEDA 2IGIA 4K25A 4EIAA 3T69A 1QTMA 4CF1A 3LDOA 2IOCA 2LN8A 3NDKA 2G8IA 5JVHL 5AR0A 3SQ2A 3CPEA 2QWLA 4X66K 1ESVA 4BRNA 2BDPA 2KBJA 1VSJA 3DRPA 3HM8A 4JK9A 3HVRA 4DTNA 2QM1A 3SJHA 1K8KA 2QWPA 2YNHA 2LJ7A 4J2BA 3CQYA 4B9SA 1JZAA 3AVLA 4BC4A 2X74A 4OO1J 3P4IA 4EZ9A 3SBGA 1SQKA 3L4QA 3DLRA 1BUPA 4YOXA 4H5RA 4NO7A 5KK4A 2OPRA 3AVHA 3ENBA 4CJ5A 4B1UB 4DV6K 3THVA 4ISEA 5JMVA 1NKBA 1K8KB 2OPPA 3QIOA 2NRZA 5AQGA 1JJ2M 4M63C 5I3UA 4CHPA 2V51B 3LM2A 2HBKA 3P38A 4BDZA 2B6AA 1RT6A 5F0XA 3OYKA 4IZ9A 1O1WA 2LR3A 1EETA 3VQ6A 5AQXA 4C8OA 2CGKA 1J9AA 3VQ9A 4BRAA 1WBBA 4E7HA 1HX1A 1YIJN 1T05A 2GUIA 3WEEA 5BPNA 4GY2B 3U9ZA 5AQRA 4B3OA 4CK1A 1POIA 3A5OC 1S6PA 1NU0A 2HMPA 1SKWA 4H03B 2ZJPL 1VRTA 3M8QA 4LH4A 3L2VA 1YTUA 1S1UA 1RDCA 4DSLA 5KTQA 3NGZA 2A3ZA 4A2AA 1QQMA 2YNIA 3SUQA 2O8DA 4G1QA 3FFKB 4B08A 2V7ZA 3CCUN 3P1GA 5C12A 3PSIA 2UXBK 3ULEB 4F4KA 3HSTB 3THWB 1HMVA 4LFBK 3HJFA 4FJHA 4FWKA 4OJRA 1LQIA 5AQVA 4HUGA 2LI7A 1L3TA 5E84A 3TAFA 4E19A 3FFIA 4F9OA 3DLLL 4C8LA 1O13A 4DHYA 4BRQA 3LP2A 2XO7A 4DV3K 3R8EA 3C65A 2OANA 1X3NA 2HBMA 1NLVA 1BCMA 4H5NA 1HLUA 3H3NO 3THYA 4CFDA 1PE4A 5GAHP 3EN9A 4YNQA 2BH1A 2AP1A 3ZSRA 4FJJA 4BRDA 2YC1C 5D3GA 3J80O 5BRHA 1GPSA 1Y64A 3K5MA 3IAYA 4FLUA 1YT3A 4CJWA 2D0AA 4YOTA 3VQ7A 3HL8A 2R7YA 4KHWA 4BWJA 2KBKA 1C0FA 4GNIA 3KLIA 3EYZA 4HE7A 3AVMA 2FLOA 2P9SA 2ASPA 1HNZK 3LDSA 3KD5E 1DTTA 1LCUA 4KHSA 1YJNN 5AQYA 4NLBA 2XY8A 3J7ZO 4BRLA 3S9HA 2IS3A 5KQDA 2OYQA 3L56A 1RBSA 2Q2RA 1RTDA 3O9SA 4FJ7A 3CW4A 3KTQA 3SAGA 3DI6A 1SAZA 2GL1A 3O9QA 5FRNA 2KSKA 4DV1K 4FOIA 1NOYA 1CN2A 3SAFA 2P9SB 3RSEA 1QQNA 3OYMA 3O3FA 4H0PA 2G8WA 2IVPA 4YDUA 1HKCA 4BQLA 3AO1A 4EHUA 1WOQA 4BC3A 4IO8A 2RE2A 5J2PA 2P9PA 3TABA 3KK1A 4DFMA 1DLOA 1XMQK 3O1WA 5J2MA 3RSEB 2KBHA 2CH5A 4IG3A 3OYHA 3LANA 4UAEF 1GLBG 4AHTA 5H1SQ 4CF0A 3DAWA 1C0GA 3H45C 4W5QA 3D2EA 3D6RA 4DWIA 3H1VX 2F7TA 4WQ5C 4JKBA 3CM6A 3CPWM 3OHRA 5AQQA 3CG7A 3V81A 4DV5K 3ZYYX 2PYJA 1MR4A 4JLHA 4OPKA 3Q7CA 4AF1A 3DRRA 3P83D 3QI7A 4DB3A 1EQYA 2IC3A 3SZ2A 4YOWA 3RMDA 1LOTB 2XY5A 1JCEA 2E6MA 1JLQA 2HF4A 3H6EA 2W6LA 3PO5A 5BREA 1YUWA 4B3MK 4BE7B 3BF1A 3V1QA 3L6QA 2LT8A 1BI4A 3LP0A 4X64K 4CZHA 2E4LA 1GOAA 4R5PA 1NJXA 1WBDA 5KPZA 4F3OA 3R3LA 4I7FA 3SK3A 4CVNE 2HVHA 1IG8A 1ZBIA 3V9WA 4NCAA 4DS4A 5HP1A 1C55A 3ID6A 3A8YA 3O1BA 3I8BA 1OH7A 2VG5A 5B8HA 4M45A 4YOYA 1X9SA 4BR9A 4CZKA 5AQZA 2B68A 1FH3A 3RVCA 1BI4B 1RT2A 4NLCA 2F9TA 5GINA 1BG3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TYQ B;  3OYD A;  3VGM A;  4JRP A;  3IG1 A;  3ZSX A;  5GIP A;  4CEZ A;  1L4V A;  3VOV A;  4JN4 A;  4IFV A;  4YFU A;  3D0P A;  5LL6 Z;  5T7B A;  5AZI B;  3SUN A;  2G8F A;  3A5L C;  4K8X A;  4FK0 A;  3AVJ A;  1ZBH A;  2I7P A;  4M42 A;  2QTD A;  5BN8 A;  2CGL A;  4NYN A;  4M3W A;  4IFE A;  1UWB A;  2X78 A;  4DUY K;  4DFJ A;  4M41 A;  4Z4C A;  4DU1 A;  1CXQ A;  3V1O A;  3NMU A;  4IDH A;  4NXM K;  3HK2 A;  1B7D A;  2VYP A;  1MYN A;  1ZUT A;  4FLX A;  1CLQ A;  3V9X A;  1ATR A;  1GLJ O;  3MN6 A;  3B6O A;  2P9N A;  4O44 A;  1NGG A;  4H0X B;  1DEJ A;  2DFH A;  1NGC A;  4PKI A;  4B1X B;  1IH7 A;  3RWU A;  3HRG A;  1Y97 A;  4CHO A;  2OA8 A;  4BR7 A;  1U6Z A;  4DTO A;  1ITG A;  1QE1 A;  4H4M A;  3C6T A;  2VQE K;  4B1V A;  3G6E N;  3DWL A;  4ELV A;  5E26 A;  4HCB A;  3JSM A;  4MFB A;  1NJI O;  2I61 A;  2GEM A;  3WXJ A;  1MWM A;  1ICA A;  5AQN A;  4J2D A;  1YIT N;  2HMI A;  1VQ6 N;  4JI7 K;  4IKF A;  2UU9 K;  4AHU A;  1V4T A;  3WNF A;  1XI1 A;  3CQX A;  4FJK A;  1IBK K;  2G8K A;  5SZT A;  4GMJ B;  3L3V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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