5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
1BU6O 2VYPA 3O08A 5AQFA 3VEOA 1NGDA 5AQKA 1QQOA 3QDKA 4H03B 4CZLA 3LDNA 2PBDA 4BRFA 3VESA 5AQNA 4O8KA 2V7ZA 4DHYA 2P9SA 4B1YB 5F2RA 1RDWX 4WQ5C 4PKHA 1CZAN 4H5RA 2QWNA 2YCHA 2YI1A 3DXKA 1MWMA 3C7NB 5AQLA 1NM1A 4QS7A 3VEYA 2H3GX 3AAQA 4JNEA 5KPTA 4BVPA 1D4XA 3ZX3A 1QQMA 3L0QA 3O8MA 4B1WB 1Z6RA 4H0VB 3VGMA 2V52B 4K25A 3FLCO 3QB0A 3CJCA 1ZBSA 1H1VA 1BDGA 3VGKA 4FWSA 2FF3B 4H5TA 1KAZA 4XH1A 4CBWA 2E2QA 1NGJA 4DCHA 3IUCA 3MN7A 4CD1A 4H0PA 3UKRB 3HZ6A 1NGEA 3M1FA 2Q1NA 2YHWA 3H45C 3D7EO 1ATSA 4A2BA 1V4SA 2FSJA 4IWVA 5FPEA 4JAXA 1K8KA 3HM8A 2P9KA 3WXKA 3WQTA 5BRDA 3MDQA 3C0BA 3O6WA 3CQYA 4MLHA 2QWRA 3H3NO 1NWKA 4ISFA 1LCUA 3A8YA 3EKSA 5KPRA 3CHWA 2CGJA 4CZFA 3AARA 3KZBA 2VCPA 3CJ9A 4CZKA 3SMSA 3VETA 5FPDA 4NB4A 4K42A 5I9EB 2Q31A 2P9NB 2ZGYA 1NGFA 1HKBA 3H46O 5BREA 3C7NA 4BG9A 3O80A 5KQ8A 3UKUB 5E26A 3BP8A 4EHTA 1Y64A 3IDHA 4K41A 2CH6A 3JXUA 1MWKA 4Y0WA 5AZJB 3FZLA 5F1XA 3CETA 4AM7A 3ZETA 4H5NA 4H5VA 2ASPA 4FOEA 2GTDA 4CBXA 2KHOA 4WQ4A 5AQTA 1ZC6A 1S3XA 3ATVA 1K8KB 1XC3A 3BF3A 3H1VX 3MCPA 2P9KB 5CE3A 5AQRA 2NZTA 4BREA 3ZX0A 4FSVA 4BRDA 4BVOA 4FWKA 1TYQB 1GLDG 4FWNA 4FO0A 4CBUA 3ULEA 5AQYA 5BPLA 3L4IA 5EXWA 2ZGZA 3EL2A 3VF6A 3D2FA 4BC2A 5EY4A 4BRLA 3HBTA 5FPMA 3MN5A 2Q0RA 3WXJA 3BEXA 4WYBA 4FWLA 1RFQA 3KVGA 3U9DA 1QZ5A 4EFHA 2Q97A 1E4GT 3I8BA 2E88A 2A6AA 2YJEA 5JLHA 1YXQA 3U4LA 1QQNA 3VF2A 3M3ZA 1X9JA 2IVNA 4H0TB 5AR0A 4O5FA 4QS8A 2HF4A 2YHYA 2P9UA 3AY9A 3ENHA 4BQZA 5AQUA 5AQGA 1MDUB 4RWTA 5AQPA 5AQOA 5AZIB 3ZETB 3QBWA 4JHDA 4HTLA 4E1JA 4XEIA 4PL8A 1X3NA 2V51B 5AQQA 3D2EA 4BRPA 2E2OA 3IMXA 1ATNA 2E2PA 3BF1A 3B8AX 4BQLA 4XH4A 1R59O 5AQVA 3TU5A 4IO8A 5BRFA 3GL1A 2FLOA 4BRGA 2E8AA 1GLCG 3UE5A 1NGBA 3LL3A 3CQXA 2UYTA 5BPMA 2Q36A 1X3MA 3H3OB 3W0LA 3O1BA 3P4IA 1U2VA 3R6MA 1KAYA 1NMDA 4CZMA 2F9TA 3DWLA 5AFUA 1NGCA 1NLVA 4BRHA 5BRHA 2QXLA 3CJAA 4JD2A 4AM6A 4PL7A 4WQ4C 2ASMA 1T6DA 4H5WA 2Q2RA 3A5LC 5EOYA 3WT0A 4Z94A 3GOIA 3WEEA 3CIPA 2QWLA 1HLUA 2QWQA 2VWBA 3MN9A 3CI5A 4LC9B 3J8AA 2AA4A 2FSNA 2P9UB 3DJCA 4BGAA 3H6EA 5AZIA 2GEMA 4JHDB 1J6ZA 3QFUA 4M7YA 3SLCA 3BUZB 4ISEA 3ZX2A 3R8EA 4H0OA 5JICA 4L3QA 4XH5A 2CGLA 1P8ZA 3VOVA 4EAHD 2PAVA 4BRKA 4BC5A 5B8HA 4K43A 1QHAA 4B1VA 3LDOA 5JLFA 3ID8A 4MO5A 2EWSA 2P9NA 1GLAG 3L6QA 1E4FT 4YDUC 5FPNA 1NGGA 4FL9A 1BG3A 1TUYA 3VEVA 4ISGA 3QFPA 2CGKA 3FR0A 1HJOA 2GWJA 2GUPA 4M7XA 3SMPA 4YDUA 5AQSA 3HSCA 3DXMA 2QWOA 4MLEA 1NBWA 4BR4A 3FE1A 2J4RA 1KXPA 4B1UB 2P9IA 4EIAA 2D1KA 3CJ1A 5AQWA 2YHXA 1ATRA 3G25A 4FWPA 1SAZA 5AQZA 1RGIA 1T6CA 4A2AA 3FGUA 4RCHA 4CZHA 1JCGA 3WEEB 2FXUA 2W41A 4A62A 2E20A 3QBXA 2P9LA 4I6MB 4J8FA 4CD3A 4PKIA 4BR2A 2HMPA 4QS9A 3ZEUA 4BR5A 5JMVA 4IZ9A 3IFRA 3GE1A 3R9PA 4FWQA 1YVNA 1SZ2A 5AQIA 3MN6A 4H0YB 4FPBA 1GLLO 1TYQA 1HX1A 4IJAA 3A0IX 2F9WA 2A41A 2ZWHA 3LM9A 4M63C 3ULEB 1KAXA 1HKGA 5LJWA 3M6GA 1IJJA 4C23A 1LOTB 5AQXA 5EX5A 1U6ZA 2GWKA 4FPAA 2WUSA 1BA0A 2P9SB 2DPNA 1OKJA 3LDQA 2CH5A 1GLBG 4JN4A 3A5OC 4GY2B 4BRAA 1BO5O 1DKGD 3VEZA 3SJHA 2YJFA 3TPQA 2BUPA 1WUAA 5LJVA 3DXMB 1Z05A 3QICA 2IIRA 5LY3A 2P9IB 2OANA 2A42A 2Q0UA 3OHRA 1HKCA 1GLEG 4B1XB 1ESVA 3ENOA 2QWMA 5BN8A 3LM2A 3VENA 3D2EB 1BOTO 2A5XA 3GBTA 2AP1A 3HI0A 4RTFD 4FOIA 4H0XB 1XUPO 1C0FA 1JCFA 3UB5A 4BRMA 3O4WA 3RSEA 3S41A 1DGKN 3QMLA 5TKYA 1S22A 1NGIA 1JCEA 2GELA 3U8XA 2I7NA 5ELZA 2I7PA 3W3DA 1U2VB 2E2NA 1BA1A 2ASOA 3EZWA 5ADXH 3WXLA 3KHYA 4BRCA 5BN9A 3VEXA 1Q18A 1GLJO 3O5BA 5EVZA 5KPZA 3F9MA 1IG8A 4WQ5A 2NLXA 1NGHA 3A5NC 4JD2B 3DAWA 5BPNA 4FWMA 1GLFO 3ATUA 1XQSC 2QM1A 3UKUA 3CJBA 2IVPA 3VERA 2P9PB 3MMVA 3FZHA 3GDQA 4CZGA 2D0PA 2QW9A 4FWRA 1ZXOA 4BC3A 5AZJA 3I33A 2D0OA 4CZIA 1BUPA 2W40A 4A61A 3O1WA 3LDPA 3EN9A 3JS6A 2A3ZA 2FF6A 5ADXA 5BR9A 1V4TA 2A40A 4MO4A 2E1YA 1YAGA 2IVOA 5AQJA 3EO3A 3VF4A 3A5MC 3FZKA 3FFKB 4BR9A 3CJ7A 4CI6A 3CERA 1DEJA 1G99A 5KQDA 4CZJA 1HPMA 1HUXA 2BTFA 3RSEB 3FZMA 3H1QA 3DXKB 4F9OA 1WOQA 2HOEA 4BR0A 3VEWA 1C0GA 4HWIA 1EQYA 1SQKA 4BRNA 2QWPA 2ITMA 3U9ZA 4BROA 1QZ6A 1T44A 4GNIA 4CZEA 3WXIA 4CJ7A 3D2FB 3AAPA 4BG8A 1TUUA 3FZFA 4FWOA 2NRHA 5AQMA 2V7YA 4IXCA 4IJNA 3SK3A 4BC4A 4EHUA 1YUWA 3GG4A 3VPZA 3UKRA 4BRIA 4DB3A 4BR7A 3WUHA 5AQHA 4KBOA 1BWFO 3VGLA 2P9PA 3HTVA 4I6MA 5AFUH 5F0XA 2P9LB 5E84A 2ZF5O 4BGBA 3ZEUB 3EKUA 3LDLA 1MA9B 3WQUA 2FSKA 4BRQA 4DQ8A 4B1ZA 1NGAA 2D4WA 2E1ZA 4NO7A 4B9QA 3MK6A 4PKGA 2HF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW9A 5JS2A 3AVBA 3VEOA 1VQLN 1QQOA 4RW8A 2E3FA 2X74A 4O8KA 2V7ZA 2N66A 4A5BA 5F2RA 3QERA 4WQ5C 1T7EA 4DU3A 1TKXA 1CZAN 2QWNA 2YI1A 4IKFA 1NM1A 4QS7A 1FXXA 3TTFA 4C1NK 1VSMA 2YX6A 3ZX3A 1D8YA 3O9RA 5HBMA 3QNNA 1IBKK 1OH7A 3THXA 3QO9A 4BE1A 1H1VA 1TK8A 1M90O 3SUOA 2UUCK 1Y97A 1MR4A 1KAZA 4CHOA 4CBWA 2KBKA 2HVHA 3IUCA 1WSJA 1WB9A 4H0PA 4M3ZA 1WSHA 3UKRB 4OKEA 3UIQA 1O13A 2KTQA 3TAFA 3TAPA 3O9TA 1TI5A 3OYJA 3L2UA 5FPEA 3HM8A 2P9KA 3WXKA 2LT8A 4N47A 2QWRA 5CR4A 4DV2K 1LWFA 2B6AA 4HHFA 1TV6A 2JDQD 3A8YA 3M8QA 3CHWA 3IRXA 2FBXA 5D3GA 4C8MA 3OYAA 3KZBA 3SMSA 2E2FA 3TAEA 5I9EB 4LF6K 2Q31A 1TAQA 4KAZA 3AO2A 3C7NA 1C0UA 3O80A 5KQ8A 2O8CA 5JVHL 4I2PA 1Y64A 3BGRA 4R79A 4K41A 3JXUA 4RW6A 4Y0WA 5AZJB 2G8HA 4DR4K 5M1KA 1WSEA 4AM7A 4KTZA 3ZETA 5CYQA 2ASPA 4DV5K 4RW4A 1HMVA 2C1IA 2ZM6K 4QAGA 2KHOA 4A57A 4CEQA 2O8EB 1NK5A 5GIOA 1ZC6A 4K0KK 2RHKA 3OW2M 2FBTA 2KQ2A 1B92A 4OPHA 3PV8A 4OPAA 1GOAA 2KFNA 3DLRA 2IOCA 4E3SA 4JI5K 4CE9A 3OYKA 5C12A 2ZGZA 1ZBLA 2O8FB 1HNZK 3SI6A 4GMJB 4NCAA 1T05A 2W00A 3O9QA 3RTVA 3WXJA 5FDLA 4DTRA 3BEXA 1RFQA 2E4LA 4DLGA 1IV0A 4DV3K 4FCYA 1QZ5A 1K8BA 4EFHA 2E88A 3PIOL 3G10A 3KKRA 2OZMA 3OYNA 4DSFA 3SPYA 2ITGA 3M3ZA 1X9JA 4KPYA 5BR8K 4F2SA 3KOXA 3KWIA 4OGCA 4QS8A 1VNBA 2X78A 4UJ0A 5C10A 4X65K 3CMAN 1MDUB 3ZSVA 4RWTA 5AZIB 3OYFA 4JS5A 3QBWA 4LY7A 1IBMK 4JV5K 4HTLA 3DOKA 4CGIA 2XY5A 5AQQA 2O8DA 5TKWA 4DR2K 4HCBA 2RPIA 3SUQA 2O8BA 2KKZA 1ZUTA 2E2PA 4A5AA 2OPPA 4GKJK 3THYB 3S3OA 3TU5A 3K58A 1QSLA 1T8EA 4U67L 3UE5A 4BACA 3W0LA 2Y1JA 4M3XA 2GUIA 1TL1A 4AAZA 4DR6K 3P4IA 1LW0A 1U2VA 1FK9A 5HRNA 1S1XA 3AVAA 2YILA 2XY8A 3C95A 3DLKA 4B3OA 2F4VK 2O8FA 1HNIA 3BDPA 3OYIA 2F9TA 2JLEA 3DWLA 5AFUA 3THWB 3V1RA 1RILA 2QXLA 3CJAA 4JS4A 3LALA 4KHPK 4M3UA 4H5WA 5KK4A 5EOYA 3V9UA 4GVEA 3WEEA 4CJVA 4IEEA 1BHLA 4B8AB 2QWQA 2VWBA 3MN9A 2ZQBA 2AA4A 2FSNA 1SKRA 4UY8O 5AZIA 3KC6A 3U6FA 3R8EA 4H0OA 5JICA 3KK3A 3NE6A 3MX5A 1ZVGA 1BMRA 2CGLA 3L8BA 3D6RA 4EP4A 1HNXK 2VWKA 3L2QA 3NGZA 1QHAA 4CK2A 1N4NA 1ASUA 3DLLL 4PUOA 4YOTA 1SKSA 4B9UA 1I3AA 3OS0A 5KTQA 1ZYWA 4JRPA 1J5EK 1HJOA 4JEPA 1WMTA 3V81A 2DFFA 1UOCA 4MLEA 4EZ9A 4BR4A 1S1WA 4H4MA 4JLHA 3ZSQA 1KXPA 3H08A 1HPZA 4B1UB 1YTAA 3V9XA 1XC9A 3KOWA 1RGIA 3U3YA 2YC1C 1KVAA 4UQGA 3KD5E 4FJ8A 1SL0A 4A62A 2HBJA 4CJQA 3ULDA 4J8FA 4QS9A 5JMVA 3GE1A 3SNNA 3SV3A 4HUGA 4AEIA 3MN6A 4H0YB 1L3UA 4CEAA 1TYQA 5DM6L 4FM2A 2F9WA 2A41A 3G0ZA 4NCGA 3HRGA 3CM6A 3KIOA 1HKGA 1VK0A 1DTQA 1KQSM 5AQXA 3SUPA 3ZT3A 2DPNA 1WNSA 4ZHRA 4DFKA 1WSGA 2CH5A 4KB0A 2YHAA 2A7TA 4BECA 1S1VA 2W6KA 3DM2A 3SAHA 3SJHA 3QEPA 3AVKA 2QKKA 1NH5A 1WUAA 5CHIA 1KVCA 4OPKA 2YNIA 1RDCA 2MZ0A 2NRZA 1VRUA 1NJXA 1K8AO 3ENOA 2O8DB 4KB1A 3ZYYX 1HYZA 2JWLA 4FYDA 1IKWA 1TGOA 2O8BB 1XUPO 4E1NA 5CYMA 1FKPA 4KHSA 1ASVA 4FJ7A 1JCEA 4IDHA 1HRHA 3AVNA 3U8XA 2VG7A 5ELZA 4WF9L 1VAZA 3AA2A 3KOZA 3E9OA 1XNQK 1Q18A 2E5LK 1RBTA 3O5BA 3T69A 4YNQA 1N32K 2ZJPL 1NGHA 2E6MA 3MECA 3VQ6A 5BPNA 3TSPA 2SN3A 3ATUA 4UAEF 3K5LA 4FLUA 2IVPA 3ZSOA 3VERA 1ZYVA 3OS1A 4E7LA 1LQHA 4FWRA 1KV0A 1OZZA 1NKBA 4FXDA 4TSXA 3JYTA 4NYNA 1QE1A 4CEFA 3LDPA 3JS6A 2HHXA 5ADXA 4DTNA 2G8WA 3OYCA 4FJXA 3CFOA 2OPSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RW9 A;  5JS2 A;  3AVB A;  3VEO A;  1VQL N;  1QQO A;  4RW8 A;  2E3F A;  2X74 A;  4O8K A;  2V7Z A;  2N66 A;  4A5B A;  5F2R A;  3QER A;  4WQ5 C;  1T7E A;  4DU3 A;  1TKX A;  1CZA N;  2QWN A;  2YI1 A;  4IKF A;  1NM1 A;  4QS7 A;  1FXX A;  3TTF A;  4C1N K;  1VSM A;  2YX6 A;  3ZX3 A;  1D8Y A;  3O9R A;  5HBM A;  3QNN A;  1IBK K;  1OH7 A;  3THX A;  3QO9 A;  4BE1 A;  1H1V A;  1TK8 A;  1M90 O;  3SUO A;  2UUC K;  1Y97 A;  1MR4 A;  1KAZ A;  4CHO A;  4CBW A;  2KBK A;  2HVH A;  3IUC A;  1WSJ A;  1WB9 A;  4H0P A;  4M3Z A;  1WSH A;  3UKR B;  4OKE A;  3UIQ A;  1O13 A;  2KTQ A;  3TAF A;  3TAP A;  3O9T A;  1TI5 A;  3OYJ A;  3L2U A;  5FPE A;  3HM8 A;  2P9K A;  3WXK A;  2LT8 A;  4N47 A;  2QWR A;  5CR4 A;  4DV2 K;  1LWF A;  2B6A A;  4HHF A;  1TV6 A;  2JDQ D;  3A8Y A;  3M8Q A;  3CHW A;  3IRX A;  2FBX A;  5D3G A;  4C8M A;  3OYA A;  3KZB A;  3SMS A;  2E2F A;  3TAE A;  5I9E B;  4LF6 K;  2Q31 A;  1TAQ A;  4KAZ A;  3AO2 A;  3C7N A;  1C0U A;  3O80 A;  5KQ8 A;  2O8C A;  5JVH L;  4I2P A;  1Y64 A;  3BGR A;  4R79 A;  4K41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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