5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
4DCHA 3MDQA 2P9IA 3SJHA 5B8HA 1BWFO 4K41A 3VEWA 1YUWA 2IIRA 2AA4A 3DJCA 3KZBA 2FLOA 3QMLA 4BRIA 3MK6A 4IJAA 2HOEA 5AQXA 1V4TA 2Q2RA 4BRHA 2P9NB 4JD2B 3C0BA 4XH1A 5ADXH 5KQDA 3LDLA 1U2VB 2YHYA 4JN4A 3B8AX 3H1QA 4CZMA 2GUPA 3CJ9A 1E4GT 4IZ9A 1HKGA 5LJWA 3ZX3A 1MWMA 3U4LA 4BR0A 4JD2A 2NZTA 2I7NA 1U2VA 1WOQA 4K25A 3D2EB 4BRGA 2GELA 2A42A 3I33A 4FWQA 5AQJA 2YJFA 4B1ZA 1QQNA 2P9KB 3M3ZA 1TUUA 3ZX2A 1MDUB 3FR0A 1BU6O 1XQSC 3MMVA 3AY9A 4NB4A 1ZC6A 2D0PA 3FE1A 3JS6A 2QWPA 5I9EB 3ZETA 3QB0A 3A5LC 1QQOA 5F0XA 4FOIA 4BRAA 4BRQA 4BG8A 5KQ8A 1R59O 3GE1A 1NGFA 1GLDG 1GLFO 3C7NB 2P9SB 4WQ4A 3H1VX 4H0XB 5FPEA 3CIPA 3GBTA 5F1XA 2Q0UA 4I6MB 5KPRA 1NLVA 2ASPA 3LDPA 4FWMA 1S3XA 3ATVA 4BC5A 3SLCA 3R8EA 1XUPO 1QHAA 4LC9B 3CJ7A 5LJVA 5AQRA 1NWKA 3DXMA 4A61A 3R9PA 4A62A 2ZWHA 1T6DA 4H5VA 4BGAA 3WXIA 4AM6A 4H5WA 5AQTA 4CZKA 1Z05A 3ENHA 4BR4A 1BA1A 2DPNA 4BQZA 4QS8A 4WQ5C 3WQUA 3CJBA 3MN5A 5JMVA 5AQSA 4FWRA 4H0YB 3L6QA 4J8FA 2VYPA 2I7PA 1K8KA 4XEIA 1HUXA 2P9UA 1MA9B 2ZF5O 4CD3A 5KPZA 2ZGYA 3EL2A 3VEOA 4MO4A 3TPQA 3FZMA 3UB5A 2F9TA 3VEYA 1NGGA 5BREA 3QFUA 4BROA 2OANA 3F9MA 4RCHA 1TYQB 3CHWA 3VETA 2YI1A 2ASMA 2EWSA 4CZGA 3JXUA 3CI5A 1TUYA 2NRHA 1NM1A 4CBXA 4B1UB 1LOTB 4IWVA 4FWLA 1JCFA 5FPDA 1DEJA 1ATSA 2E2QA 3A5OC 4EAHD 2QM1A 2GWKA 3VEXA 4EFHA 2E2PA 3WQTA 4MLHA 2QWOA 4GY2B 1ATNA 3WEEB 3I8BA 1KXPA 4F9OA 1YVNA 1DGKN 5TKYA 3W3DA 3LM9A 1OKJA 4XH5A 3U8XA 2Q0RA 5EY4A 3SMSA 4QS7A 3WEEA 3R6MA 1C0GA 2CGJA 4B1VA 1Y64A 3ULEB 4JHDB 3SMPA 2BTFA 4A2AA 1GLLO 1SAZA 3UKRA 1KAZA 2YCHA 3WXKA 4HWIA 4A2BA 4FWPA 1T6CA 4H0PA 3HI0A 4BG9A 4HTLA 4CZFA 1XC3A 3H46O 3RSEB 2W40A 4BC4A 5KPTA 5AQQA 2J4RA 3ULEA 2VCPA 3QDKA 4WQ5A 1J6ZA 1JCGA 1HKBA 2P9NA 1NMDA 2YHWA 1NGBA 1G99A 5AQLA 5AFUA 5E84A 3M6GA 4CZJA 5BPNA 2A3ZA 3KVGA 3SK3A 5EOYA 4M63C 1EQYA 4FWNA 3VENA 3UKUB 2E1YA 5BRHA 3D2EA 5BPMA 2IVPA 1HKCA 1NGJA 3IMXA 4BVPA 2PAVA 3ID8A 3VEVA 2CGKA 3VPZA 2P9KA 5JLFA 3GOIA 4M7YA 4B1XB 3U9DA 4EHTA 3MN9A 4H03B 2Q1NA 2P9PB 3A5MC 4FOEA 1BDGA 3WUHA 2BUPA 4FWOA 2ASOA 5AR0A 3MN7A 4Y0WA 5AQHA 1IJJA 3IUCA 4KBOA 4MLEA 4BGBA 5LY3A 3C7NA 2A6AA 2P9SA 3U9ZA 2P9PA 3P4IA 3WXLA 3H3OB 3CJCA 4I6MA 3CERA 1D4XA 2GTDA 4FSVA 3QICA 3VESA 4DQ8A 1C0FA 1RGIA 2F9WA 2VWBA 3HSCA 4FL9A 3H6EA 4PL8A 4BRFA 1QZ6A 5BR9A 2YHXA 3LM2A 2IVNA 2FF6A 4QS9A 3O08A 1NGHA 4BRCA 4BRLA 3EKSA 3VF2A 2QWNA 4GNIA 3ENOA 5JLHA 5AQFA 3EN9A 2V52B 2Q36A 4XH4A 2WUSA 2GWJA 4L3QA 4B9QA 4FO0A 2P9LB 4JAXA 4C23A 3FZFA 1YXQA 4CZLA 3AARA 4YDUC 5AZJB 3L4IA 4PKGA 3CQXA 3ATUA 5BRDA 3CJ1A 3D2FB 1GLBG 5AQVA 1GLEG 1TYQA 5AQZA 1CZAN 1BO5O 3O6WA 2CH5A 3D7EO 4AM7A 3A5NC 3HM8A 4BRDA 2E2OA 3QFPA 4B1WB 4K43A 3VERA 1LCUA 1Z6RA 3D2FA 5AQYA 5AQKA 4BREA 1HX1A 2CH6A 3VF4A 1E4FT 3TU5A 3ZEUB 2ZGZA 3VF6A 4CJ7A 5BN9A 4BR5A 3VOVA 5AQNA 4BQLA 3DXKB 4BC2A 3FZKA 2CGLA 2P9IB 3LL3A 5ADXA 2UYTA 4O5FA 4CZHA 1BUPA 3LDNA 3DXKA 4BRKA 4WYBA 4JHDA 1NGEA 4PKIA 4CZEA 5BPLA 2V51B 4H0OA 2YJEA 1ZBSA 5AQOA 3AAQA 3GL1A 2QWRA 4JNEA 1NGCA 1P8ZA 2V7ZA 5AQUA 3CETA 4PKHA 3RSEA 5BN8A 2FSJA 5AQPA 1ZXOA 3LDQA 3G25A 2GEMA 1Q18A 1QQMA 4CZIA 4ISFA 2D0OA 4FWKA 4PL7A 1QZ5A 3WT0A 4EHUA 3LDOA 1RDWX 3O4WA 2HF4A 4IJNA 4CBWA 3O1WA 1S22A 4RTFD 2Q31A 3DAWA 2D1KA 5EX5A 4BRPA 4K42A 4BR7A 3O1BA 5AFUH 2FSKA 4YDUA 3UKUA 2AP1A 3IFRA 1SQKA 3EO3A 3J8AA 1DKGD 2V7YA 5E26A 3ZETB 2Q97A 3QBWA 1GLCG 3A8YA 2D4WA 5EVZA 1NGIA 4ISGA 2IVOA 5FPMA 2E88A 2QWQA 3H3NO 5CE3A 2FSNA 2PBDA 1H1VA 5F2RA 3BEXA 3FFKB 3HTVA 5ELZA 2QW9A 4FPBA 3BUZB 3QBXA 4O8KA 3GDQA 4B1YB 4BRMA 3O8MA 4Z94A 1BA0A 1WUAA 2ITMA 1BG3A 1NGAA 3VGLA 5EXWA 1T44A 3H45C 3W0LA 3BF3A 2HMPA 4CD1A 3DXMB 4BC3A 1SZ2A 4FPAA 3VEZA 5JICA 3BF1A 4BRNA 1IG8A 1BOTO 1ATRA 4BVOA 1NGDA 3GG4A 4H5RA 3KHYA 4M7XA 4MO5A 4IO8A 4BR2A 3FGUA 2KHOA 3WXJA 2H3GX 4RWTA 1KAYA 1GLJO 3FLCO 2QWLA 1K8KB 1HJOA 2P9UB 2A41A 4CI6A 3CJAA 3VGKA 5BRFA 3EKUA 5AQGA 3HBTA 5AZIB 3HZ6A 3DWLA 5AQWA 3AAPA 4CBUA 5AQIA 4DB3A 1YAGA 1HPMA 4DHYA 3O80A 2QXLA 2P9LA 2HF3A 3VGMA 3MN6A 4H5NA 5AZIA 2A5XA 4NO7A 2E2NA 3FZHA 2E20A 3L0QA 2FXUA 3A0IX 5AZJA 1HLUA 1RFQA 4E1JA 4BR9A 5FPNA 3CQYA 4ISEA 2E8AA 3FZLA 1ESVA 3MCPA 1KAXA 2A40A 4WQ4C 2W41A 1X9JA 3OHRA 4H5TA 4EIAA 1JCEA 3M1FA 3IDHA 1X3NA 1U6ZA 1MWKA 2E1ZA 1V4SA 1X3MA 3BP8A 4H0TB 3ZEUA 3UE5A 2FF3B 3ZX0A 2QWMA 4FWSA 3O5BA 4H0VB 5AQMA 1GLAG 1NBWA 4IXCA 3EZWA 3UKRB 3S41A 2NLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DCHA 3ZLJA 1JLAA 3PO5A 4WCEL 3VEWA 3PUFA 2GV9A 3P5JA 4YOVA 3QMLA 1EKEA 4BRIA 2Q2RA 2P9NB 2HMIA 4DSLA 4JKCA 1KSPA 3SCXA 3DI6A 4LH5A 5LL6Z 2YHYA 4CJTA 5FLXO 4BWJA 3B8AX 1K73O 2GUPA 3ZSVA 1MWMA 3VQ5A 4DR4K 4JD2A 4ID5A 3HL8A 5AQJA 2YJFA 3DOKA 1KLMA 1NU0A 3ZX2A 3CCUN 3HOSA 4E7LA 2F8TA 3AA4A 4FLYA 3C6TA 3G71N 3FE1A 2KQ2A 5I9EB 3E7UX 2HBLA 4IDHA 1RTDA 2O8BB 1N36K 2GUIA 4DS4A 1WSIA 4JRPA 1NGFA 2HHWA 1T0ZA 2Q0UA 5HRRA 3OVNA 2OPPA 2BH1A 3ATVA 4NCGA 1QHAA 2LKBA 1MR4A 3HPOA 2OCEA 4A61A 4A62A 2HW3A 1POIA 3P38A 2D0CA 1SS6A 3D45A 4CZKA 3ENHA 1YTAA 2B5JA 2X78A 2DPNA 4FVMA 4WQ5C 3WQUA 2G8IA 3AGRA 3CJBA 3TSPA 5JMVA 1WAFA 3VQ9A 2DY4A 1RT5A 4Q5VA 3SJJA 4QCLA 1P90A 1K8KA 1BISA 2ZF5O 5KPZA 1U48A 1T7BA 4ZTFA 3DMJA 2NRVA 4DU4A 1HMVA 2NRXA 1KV0A 4KTQA 3VEYA 3OS1A 4DR5K 2LY5A 3QETA 1K9MO 2OANA 2YNFA 2OTLN 3DLHA 5CY0A 2YI1A 3VETA 4WFAL 1CZBA 2EWSA 4CIFA 2LSNA 4CHNA 5J2PA 2P5GA 1S9GA 3LAMA 4E7KA 3JXUA 3CI5A 2F8SA 2LI7A 1D8YA 5FPDA 1ATSA 3A5OC 3V81A 3OJUA 4WE1A 4CJWA 1Q81O 4JI2K 3LAKA 3AVGA 4GY2B 1QE1A 3L3VA 4CGJA 5CR4A 1R0AA 5DM7L 1RDDA 1YVNA 1DGKN 3VQDA 3OYCA 4AHSA 3JYTA 4CIEA 4GKJK 4O4GA 2OPSA 4N56A 2YHBA 3MXIA 3R6MA 2CGJA 5KI6A 3OJSA 4BDYA 1Y64A 2GBZA 3OYGA 4A2AA 3PX4A 4JKGB 3PSFA 4KB1A 4DQRA 3HI0A 4IG3A 5KPTA 4CJQA 1NE5A 3MEGA 1Q86O 4EZ6A 3LP2A 1SL1A 1T1TA 1NMDA 4ILHA 1HNXK 1TAUA 4O8UA 2D0BA 1WSFA 4B3MK 5AFUA 1HYZA 3RMAA 3CW4A 4ICLA 3M6GA 4CZJA 3SK3A 4F3OA 4M63C 3VENA 3KP0A 3S9HA 3OYMA 1OZZA 4C8MA 3V9SA 1VQPN 5K14A 2D0AA 3C6UA 4KHPK 3IMXA 1NNEA 1NKBA 3VEVA 5FRNA 2CGKA 1XHZA 5JLFA 3AV9A 1RBTA 2HNYA 3N4PA 4HCBA 3AVLA 3QI7A 2O8EB 4CK3A 1RTIA 1NOZA 5CY4A 4Y0WA 5AQHA 1IJJA 5C12A 2NRRA 1LW2A 1HYVA 2WONA 4CJSA 3DLEA 4I9QA 4AILC 1E3MA 2E2FA 3CCJN 2FBTA 1U49A 4DLGA 3V1RA 4I6MA 3DRSA 2E5LK 3C6HA 3TAEA 3CERA 3SBTA 4FSVA 4EP4A 2F9WA 4J2EA 4FL9A 3TR8A 2XRIA 4DV7K 1IBKK 4K0KK 1ZBIA 1KVCA 4HCCA 4ZHRA 3OYLA 3D0PA 2Y1JA 3O08A 3U3YA 3THXB 3VF2A 2QWNA 4DLEA 4FJNA 2HVIA 4IKFA 2V52B 1ZYVA 3DLLL 2WUSA 2GWJA 1I6GA 4B9QA 4FO0A 4C23A 3CFRA 1KQSM 3FZFA 1S1XA 3J7ZO 5HP1A 4WFBL 3TAMA 5C0YA 1WNSA 3I8DA 3KLHA 3R1XA 3AARA 1TVRA 3HP9A 4YDUC 2P5OA 3HRGA 3LZIA 2SN3A 3ATUA 4CERA 1VSJA 2YKNA 1S6QA 5AQVA 5AQZA 1CZAN 1BO5O 4JRQA 3HM8A 5C24A 3SZ2A 3CD6N 5KK4A 4GV6A 4B1WB 3GKUA 3VERA 2QTDA 4N76A 1SN1A 3E9OA 1C55A 1W7AA 1S9EA 1E4FT 2ZGZA 4KHSA 3K5NA 3J80O 2QK9A 1BCOA 4BQLA 2IDOA 1VNAA 4UAEF 1VSHA 2VG5A 4CJ3A 3MEDA 1GOAA 2HNDA 4LY7A 4FJ8A 5J2MA 3HSTB 1OH7A 2OA8A 1DJTA 1J5OA 4WYBA 4JHDA 1WWNA 4PKIA 3ITHA 1LWEA 4CZEA 1KD1O 1JLEA 3M8QA 3MEEA 2W42A 3O9QA 2YJEA 5I3UA 3AAQA 3BK3C 4JNEA 1C56A 2V7ZA 4H4OA 4Z4CA 5AQUA 3CETA 1NKEA 2FSJA 4C8KA 1ZXOA 2ITGA 5BR8K 3KTQA 1QZ5A 3NCIA 3LDOA 4DFKA 1RT2A 3O4WA 2HF4A 4E7HA 3LP1A 1Z25A 3ZSYA 2G8VA 4Z4GA 1I39A 4E3SA 2FSKA 2KBJA 2HSTA 2AP1A 1FK9A 3AVCA 2Q97A 3AA5X 2D4WA 1TV6A 3ZSQA 4KHYA 1NGIA 4ISGA 3OBWA 1VQ5N 2IVOA 1YTUA 2LR3A 5TKWA 3L4QA 2E88A 1I94K 3I55N 3RR7A 3CFPA 1I2UA 2NRWA 4DQQA 3BEXA 2FBXA 3SAHA 3HTVA 5C2FA 4CFAA 1U4BA 2DFFA 5J2NA 4O8KA 4B1YB 4AAZA 3O8MA 1BA0A 1WUAA 2ITMA 4Z4IA 4B08A 4CD1A 4HTUA 1SZ2A 4ILJA 3BF1A 3CFOA 4DTUA 4CGDA 4C1NI 2QI2A 1VQKN 2BDPA 2N69A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DCH A;  3ZLJ A;  1JLA A;  3PO5 A;  4WCE L;  3VEW A;  3PUF A;  2GV9 A;  3P5J A;  4YOV A;  3QML A;  1EKE A;  4BRI A;  2Q2R A;  2P9N B;  2HMI A;  4DSL A;  4JKC A;  1KSP A;  3SCX A;  3DI6 A;  4LH5 A;  5LL6 Z;  2YHY A;  4CJT A;  5FLX O;  4BWJ A;  3B8A X;  1K73 O;  2GUP A;  3ZSV A;  1MWM A;  3VQ5 A;  4DR4 K;  4JD2 A;  4ID5 A;  3HL8 A;  5AQJ A;  2YJF A;  3DOK A;  1KLM A;  1NU0 A;  3ZX2 A;  3CCU N;  3HOS A;  4E7L A;  2F8T A;  3AA4 A;  4FLY A;  3C6T A;  3G71 N;  3FE1 A;  2KQ2 A;  5I9E B;  3E7U X;  2HBL A;  4IDH A;  1RTD A;  2O8B B;  1N36 K;  2GUI A;  4DS4 A;  1WSI A;  4JRP A;  1NGF A;  2HHW A;  1T0Z A;  2Q0U A;  5HRR A;  3OVN A;  2OPP A;  2BH1 A;  3ATV A;  4NCG A;  1QHA A;  2LKB A;  1MR4 A;  3HPO A;  2OCE A;  4A61 A;  4A62 A;  2HW3 A;  1POI A;  3P38 A;  2D0C A;  1SS6 A;  3D45 A;  4CZK A;  3ENH A;  1YTA A;  2B5J A;  2X78 A;  2DPN A;  4FVM A;  4WQ5 C;  3WQU A;  2G8I A;  3AGR A;  3CJB A;  3TSP A;  5JMV A;  1WAF A;  3VQ9 A;  2DY4 A;  1RT5 A;  4Q5V A;  3SJJ A;  4QCL A;  1P90 A;  1K8K A;  1BIS A;  2ZF5 O; 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