5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
1SQKA 1WUAA 1K8KA 4CZEA 2NLXA 4DQ8A 2YJFA 3R6MA 4PL7A 3HSCA 4F9OA 4A62A 1G99A 4IWVA 4RTFD 3ZX3A 3GBTA 4BRAA 4BRKA 4A2BA 4CI6A 4H0YB 1OKJA 5KQDA 2P9SB 3S41A 5AQQA 2GUPA 4BRNA 3DJCA 2NRHA 1SAZA 3MDQA 4BRIA 5AQSA 3M6GA 1ZC6A 3WQTA 2W41A 3LM2A 4H0XB 4RCHA 5AQYA 5BPLA 4BRLA 4FPAA 4C23A 2W40A 3ATVA 3MCPA 3CETA 2IVNA 1BA0A 3WEEA 5AQMA 1QZ5A 1NM1A 4PKGA 3VEOA 2Q0UA 4K43A 4K25A 3W3DA 3D2EB 1XUPO 4H5VA 2D0PA 3VOVA 5KPRA 3FE1A 3ULEB 4ISFA 2YHYA 4FWLA 3LDQA 1HKCA 3VEZA 1GLJO 5B8HA 2GTDA 3IFRA 3ZETB 2Q1NA 1RFQA 5BRDA 5LJVA 3GG4A 4B1XB 3BP8A 3FZHA 5AQTA 1Z6RA 3CJAA 3R8EA 2QXLA 4NO7A 2GELA 3LM9A 1GLFO 4O8KA 1CZAN 3B8AX 5BPNA 1V4TA 3VF6A 3WQUA 4BGBA 4CD1A 4ISEA 1QZ6A 1P8ZA 3VETA 1HKBA 3DWLA 2P9IA 3SMSA 4JNEA 4FWOA 5EXWA 3UKRB 1Y64A 5JICA 4BVPA 3L0QA 1NGGA 4HTLA 3LDPA 3JS6A 2A5XA 4BC5A 2H3GX 4WQ4C 5AZIB 3D2FB 1U2VB 2V51B 3O1WA 5AQOA 3A5OC 3VEWA 4B1UB 1D4XA 3SK3A 1TYQA 2VWBA 4Y0WA 2D4WA 3BF3A 1DEJA 5EOYA 2FLOA 2P9UB 4AM6A 4BRDA 3HBTA 4FO0A 4IO8A 1Q18A 1J6ZA 1E4FT 3U9DA 1YAGA 1QQMA 3VEXA 3CHWA 4QS7A 1IJJA 5AQKA 5JMVA 1BDGA 5AQLA 1BOTO 3EO3A 2EWSA 5EX5A 2P9KA 1KAXA 1MWKA 2ASMA 4H0TB 4H0PA 4EHTA 5AZJA 2FXUA 4BC3A 4CD3A 4JD2B 2E1ZA 3FZLA 3QFPA 3GE1A 4FL9A 2V7ZA 2ASPA 4FSVA 3H1VX 1NGJA 2QWLA 5AQNA 2FSJA 2V52B 4M63C 1GLDG 3MMVA 1C0GA 4GNIA 1BA1A 3C0BA 4O5FA 4MLEA 2P9SA 5F1XA 3SMPA 4M7XA 2I7PA 3KZBA 3ZX2A 3GL1A 4BR0A 5EVZA 1NWKA 3FFKB 5F0XA 1BG3A 2YI1A 1NBWA 4FWKA 3O80A 5AQUA 2FF3B 4A2AA 3A5MC 5BR9A 3QMLA 2QWQA 3I8BA 5ADXA 3A5NC 2D0OA 2HF4A 3RSEB 1TUYA 4AM7A 1IG8A 5E26A 5FPMA 1GLBG 3M3ZA 3FR0A 5E84A 3WUHA 1ZXOA 2AA4A 3WXJA 1GLCG 4XH5A 3BEXA 4DCHA 1E4GT 3J8AA 2A42A 4MLHA 2A3ZA 3ULEA 4CZKA 1NGEA 1EQYA 2DPNA 2Q36A 3O8MA 3QBXA 1BU6O 4MO4A 3W0LA 2QWMA 5I9EB 3C7NA 3ENOA 2Q97A 2E8AA 2ZF5O 3HM8A 1T44A 1YUWA 2VCPA 4BRHA 4BGAA 2HF3A 3F9MA 2E2OA 3UB5A 2QWPA 2P9PB 1MA9B 3CI5A 3ID8A 1JCEA 1NMDA 4BR2A 3VENA 3SJHA 2HOEA 5AR0A 2F9WA 3H1QA 1LOTB 1NLVA 3MK6A 5AQGA 4IJAA 3VGLA 4B1VA 3UKRA 4H0VB 2D1KA 5BN9A 1HUXA 2QWRA 4H5RA 3VF2A 2A6AA 4ISGA 3WEEB 2GWKA 3UE5A 3D2FA 3VERA 2V7YA 1U2VA 1MDUB 1DKGD 1ZBSA 1NGHA 3AARA 3VF4A 2QWNA 4MO5A 3SLCA 5AQWA 2WUSA 4I6MA 4BVOA 5EY4A 1T6DA 3DXMB 5TKYA 1V4SA 4KBOA 1QHAA 4YDUA 2E2QA 1HLUA 1NGFA 1SZ2A 3VESA 4FOIA 4B9QA 4FWNA 4CZMA 3DXKA 3MN5A 5JLHA 4BRQA 2P9NB 2PBDA 4IZ9A 5ADXH 3I33A 2E2NA 3TU5A 2I7NA 4BR4A 4BG9A 3ZEUB 5JLFA 1LCUA 4IJNA 4M7YA 4GY2B 1HX1A 3H3NO 4CZHA 1KAZA 2GWJA 2E1YA 2ZGZA 4B1YB 1XQSC 2A41A 3O5BA 4JD2A 2HMPA 1NGCA 5BREA 3DAWA 3P4IA 1GLAG 4QS8A 1JCFA 2P9IB 4BQLA 3UKUB 3QFUA 3OHRA 1GLEG 5AQZA 2P9LA 4EIAA 3CQXA 3HTVA 3ATUA 2ITMA 4CZFA 4FWSA 1ATNA 1KXPA 5AQIA 2E2PA 4FWQA 1ATRA 3A0IX 3AY9A 1X3NA 3HZ6A 4CZGA 2FSNA 4BG8A 2CGKA 4BROA 3CQYA 3AAPA 3O1BA 1NGAA 5BPMA 3CJ1A 1U6ZA 4H0OA 1NGDA 4BR5A 5BN8A 3LDOA 3CJBA 3LDNA 3CERA 5LJWA 4CJ7A 5KQ8A 4BRPA 3MN6A 4BRFA 5AQRA 1S3XA 1NGIA 4JHDB 4FOEA 3VEVA 1QQOA 5AZJB 4PL8A 5FPDA 1R59O 3EL2A 5AQJA 1YVNA 4QS9A 1GLLO 3QDKA 4BREA 3O08A 4PKIA 4J8FA 3A5LC 3D2EA 3L4IA 4CZLA 3KVGA 4XH1A 2AP1A 1QQNA 5AQHA 4A61A 4BR7A 3IMXA 4FWPA 2P9PA 4WQ5C 3U4LA 1K8KB 4CZIA 3LL3A 3WXLA 3EKUA 4BRCA 3ZX0A 3ZETA 4H03B 3BF1A 4DHYA 3VPZA 2VYPA 5ELZA 4B1WB 3QB0A 4WQ5A 3O4WA 4K41A 4HWIA 5FPNA 5KPZA 2UYTA 3AAQA 5F2RA 2YCHA 1X9JA 2ZWHA 3A8YA 4BRMA 2FF6A 2YHXA 4RWTA 1Z05A 2BTFA 4DB3A 3QICA 3D7EO 4BC4A 4PKHA 3CIPA 3KHYA 1HKGA 4WYBA 4LC9B 2NZTA 3O6WA 5AFUA 5CE3A 3JXUA 2CH6A 2Q31A 3CJ9A 2ASOA 3DXMA 3CJCA 1RGIA 3VEYA 5AZIA 1BWFO 4B1ZA 1NGBA 2IVPA 2ZGYA 1X3MA 4YDUC 3H45C 5AQVA 4K42A 3C7NB 2P9NA 3EN9A 4L3QA 2QM1A 4CBUA 2CH5A 3QBWA 4BR9A 3H3OB 5AQPA 3H6EA 3ZEUA 4Z94A 2P9UA 2KHOA 1ESVA 3IDHA 1ATSA 3WT0A 1BUPA 1BO5O 3L6QA 3U9ZA 4XH4A 5AQFA 3MN7A 3G25A 3UKUA 2F9TA 4BRGA 5FPEA 1HJOA 1WOQA 2J4RA 3FZKA 4CBXA 5LY3A 1DGKN 3GDQA 4BC2A 2IVOA 3M1FA 3CJ7A 1C0FA 3MN9A 4FPBA 3BUZB 1JCGA 4E1JA 4WQ4A 5BRFA 4EFHA 4I6MB 3GOIA 3VGKA 4JAXA 1YXQA 3EKSA 4H5WA 4BQZA 2IIRA 1T6CA 2QWOA 1HPMA 1RDWX 3TPQA 2Q2RA 3LDLA 3DXKB 1S22A 2OANA 3ENHA 3WXIA 2FSKA 4H5NA 3R9PA 1TUUA 3EZWA 1TYQB 4JN4A 2CGJA 4H5TA 3H46O 3FGUA 4FWMA 1H1VA 2E20A 3FLCO 4JHDA 5AFUH 2A40A 2BUPA 4CZJA 4EAHD 5BRHA 5KPTA 2GEMA 1XC3A 5AQXA 3HI0A 4CBWA 2YJEA 3RSEA 3WXKA 2E88A 2YHWA 3U8XA 3FZFA 2QW9A 3FZMA 4NB4A 3IUCA 2PAVA 4XEIA 4FWRA 4EHUA 2P9LB 2P9KB 2Q0RA 1KAYA 4IXCA 1MWMA 2CGLA 3VGMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLYA 1WUAA 3IRXA 1E3MA 3HSCA 4A62A 4IWVA 4RTFD 4DSLA 4CJFA 4X66K 4A2BA 3SV4A 1GOBA 1OH5A 5GINA 1ZBIA 1CZBA 3AA5X 2P9SB 3CQ8A 4DS5A 4CJVA 4KFBA 3T1AA 3DJCA 4BRNA 5M1NA 3I56N 2GL1A 1MU2A 3LP2A 4KO0A 1EO1A 5BPLA 3VQDA 4FPAA 1NJWA 4C23A 2W40A 3ATVA 5CZ1A 3CM6A 5H1SQ 1BA0A 3WEEA 4CJ3A 2O8CA 2GV9A 3VEOA 4I7FA 1BHLA 1HQUA 5M1QA 4MDBA 4HE7A 2LN8A 4MDAA 3ASMA 3D2EB 3FE1A 1SN1A 3LALA 4BECA 5M1KA 2KBHA 4E7JA 1GLJO 3IFRA 3K5LA 1SL1A 3OYLA 1Q81O 3ZSOA 5LJVA 2OPPA 3CC2N 2G8VA 3CJAA 3R8EA 1MYNA 2QTDA 5LMUK 1WWNA 1IG9A 1P8ZA 3B6PA 3HO1A 3IKMA 4CJPA 2KZZA 4CJLA 2HBLA 3SF4D 4IFEA 3VQQA 3IAYA 2KW4A 4HHFA 5FRMA 3JS6A 2A5XA 4Z4IA 4WQ4C 1DTTA 2XHBA 4JKAA 2R7YA 4CEFA 4BE1A 1L5UA 2MBKA 4H4OA 3LAMA 4C8MA 1TYQA 1JLAA 2QK9A 2D4WA 3BF3A 1VSFA 4CHQA 4C8OA 2YNIA 3OS1A 4K8ZA 5EOYA 1VSJA 3O3GA 1GOAA 4BRDA 3HBTA 1XNQK 1LAWA 1NG9A 3CPWM 4JK7A 2HB5A 2IS3A 1E4FT 3LAKA 1RDAA 1HQEA 1JLQA 3LZIA 4E7LA 4KHYA 2E3FA 4CEOA 1IJJA 5JENA 1BDGA 1J9AA 2XY8A 3N4PA 1VQNN 3K57A 5EX5A 2P9KA 4OKEA 4FYDA 1MWKA 4H0PA 3PX6A 3KKSA 3V9XA 2Z1IA 4CEBA 4BC3A 1UA0A 2PFUA 4LFCK 5DMRA 3NF6A 4CJRA 2V7ZA 4FL9A 1C1AA 4DTSA 2ATBA 3R3LA 5AQNA 2FSJA 1GLDG 2HNYA 3MMVA 4KB0A 2YKNA 3K9JA 4JI0K 4O5FA 5J2QA 3TAGA 2P9SA 1YF5L 4IEIA 3KZBA 3GL1A 4R79A 4JI1K 1TI5A 3ZSRA 3RRHA 4CW7B 1BG3A 1NBWA 4AHVA 4IG3A 4ID1A 4CJ5A 4A2AA 1S72N 5A2QO 4DTXA 4FLZA 2QWQA 4KH5A 4DWIA 1Q8IA 4FJLA 1KC8O 2D0OA 4X62K 2GBZA 4YOUA 3WXJA 4DCHA 3V1QA 1IKWA 4DSKA 2A3ZA 2Q36A 5KI6A 3QBXA 3W0LA 5I9EB 3L2WA 3ENOA 3ZT0A 2ZF5O 4BRHA 2VCPA 1TK0A 4Z4GA 2QWPA 2HW3A 2P9PB 1NMDA 3OYHA 3VENA 4YOVA 3SJHA 4YOXA 3K0SA 3CCMN 4N5SA 1NLVA 3MK6A 3OYGA 2HHWA 2PY5A 1PX9A 4KI4A 4IJAA 3VGLA 4B1VA 3LP0A 4GVMA 1NJXA 4I2PA 3T1YK 4H5RA 4A5BA 2LR3A 4FJIA 3P1GA 3AV9A 1Q9YA 2QEXN 1TV6A 4FXDA 3AARA 4HUEA 2JWLA 2QWNA 4AHUA 5AQWA 2WUSA 4NLCA 4BVOA 2GX9A 3G4SN 1LV5A 1K73O 1N36K 1LAVA 4YDUA 5C24A 4J2AA 2ZD1A 1TAQA 3VESA 3VQ9A 4FWNA 2A7TA 4JK8A 2X74A 2QA4N 4HTUA 1QVGM 1RT3A 2DFFA 4BG9A 3J81O 3VQBA 1NRBA 4GY2B 1KAZA 4QAGA 2DFHA 3MXMA 1VNBA 3NGIA 3B6OA 1S1XA 1GLEG 5AQZA 4AF1A 1RTHA 1CXQA 2NRWA 2P9LA 4EIAA 4DQRA 1NOZA 2ITMA 3HRGA 1KXPA 1OVYA 5FDLA 1ZYQA 4R5PA 1OH6A 2UXDK 3LDSA 1NK5A 2ZJPL 2CGKA 3V9ZA 4Y1DA 1C56A 1VSDA 2HNDA 4Y1CA 1B9DA 4CGHA 4DV2K 1NK0A 2HSTA 4LSLA 4DFKA 4IFYA 1WNSA 3BZCA 4CJ7A 2GMOA 2ZJQL 1ZBFA 4GV6A 4E1MA 1CZ9A 4BE2A 4M45A 3EE9A 3E9OA 3V4IA 1I6FA 3O9RA 3VQ5A 4ICLA 1YVNA 1N4NA 5AJ3K 4KYPA 3AVLA 3O08A 1OH8A 3FFIA 4IKFA 2RN2A 1N34K 5KK4A 3KVGA 3C6UA 1CHZA 4BR7A 4XJXA 4CZIA 2P9PA 4E1NA 1EWRA 1K8KB 4LF8K 3ZX0A 3ZETA 3AVIA 3BF1A 3VPZA 1BMRA 5ELZA 4IEEA 4B1WB 3AVBA 4DV1K 1WBBA 3VQ6A 4K41A 1TL1A 4K0KK 3NGZA 3AAQA 4AHRA 1X9JA 4AQYK 4C8KA 1ICAA 1Z05A 3VQ7A 5C12A 3CD6N 1SKSA 4DB3A 4PKHA 3VQ4A 1IBMK 3CIPA 3LWLA 4LC9B 2YILA 1GPSA 2KTQA 1W2BM 4FLVA 2IDOA 1BISA 3JXUA 3CJ9A 3L4QA 4ZHRA 2ASOA 3CJCA 3VEYA 3CFPA 1K8BA 3ITHA 4RW7A 4N56A 1X3MA 4YDUC 3L56A 4WF9L 2UUCK 4L3QA 4RW4A 3DM2A 5C2FA 3KOYA 4CFCA 1R0AA 3RMBA 2P9UA 2ZE2A 1ESVA 3M8SA 3HL8A 4FJGA 3AGKA 3JYTA 1SN4A 5AQFA 1XNRK 2D0BA 2F9TA 4BRGA 1JXEA 3F73A 5KGXA 2Y1JA 3KIOA 1VHXA 2RHKA 4CBXA 5LY3A 4IG0A 2LY5A 1D9FA 3GDQA 4BC2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FLY A;  1WUA A;  3IRX A;  1E3M A;  3HSC A;  4A62 A;  4IWV A;  4RTF D;  4DSL A;  4CJF A;  4X66 K;  4A2B A;  3SV4 A;  1GOB A;  1OH5 A;  5GIN A;  1ZBI A;  1CZB A;  3AA5 X;  2P9S B;  3CQ8 A;  4DS5 A;  4CJV A;  4KFB A;  3T1A A;  3DJC A;  4BRN A;  5M1N A;  3I56 N;  2GL1 A;  1MU2 A;  3LP2 A;  4KO0 A;  1EO1 A;  5BPL A;  3VQD A;  4FPA A;  1NJW A;  4C23 A;  2W40 A;  3ATV A;  5CZ1 A;  3CM6 A;  5H1S Q;  1BA0 A;  3WEE A;  4CJ3 A;  2O8C A;  2GV9 A;  3VEO A;  4I7F A;  1BHL A;  1HQU A;  5M1Q A;  4MDB A;  4HE7 A;  2LN8 A;  4MDA A;  3ASM A;  3D2E B;  3FE1 A;  1SN1 A;  3LAL A;  4BEC A;  5M1K A;  2KBH A;  4E7J A;  1GLJ O;  3IFR A;  3K5L A;  1SL1 A;  3OYL A;  1Q81 O;  3ZSO A;  5LJV A;  2OPP A;  3CC2 N;  2G8V A;  3CJA A;  3R8E A;  1MYN A;  2QTD A;  5LMU K;  1WWN A;  1IG9 A;  1P8Z A;  3B6P A;  3HO1 A;  3IKM A;  4CJP A;  2KZZ A;  4CJL A;  2HBL A;  3SF4 D;  4IFE A;  3VQQ A;  3IAY A;  2KW4 A;  4HHF A;  5FRM A;  3JS6 A;  2A5X A;  4Z4I A;  4WQ4 C;  1DTT A;  2XHB A;  4JKA A;  2R7Y A;  4CEF A;  4BE1 A;  1L5U A;  2MBK A; 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