5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
1E4GT 5AFUH 4H5WA 5BREA 4J8FA 3QBXA 1SAZA 4CI6A 5AQOA 2PBDA 2YHXA 3MN9A 3W3DA 4CZHA 2ZWHA 5AQPA 4BR7A 1ZBSA 1HUXA 2P9UA 4AM7A 3EL2A 4XEIA 3UKRA 5BN8A 1XUPO 3QICA 3SK3A 1YUWA 3VF4A 4I6MA 4B1UB 4BRHA 4H03B 3BF3A 5BPNA 4JNEA 3ZETA 4CZEA 1X3NA 2FSJA 1LCUA 3FZMA 3QFUA 4MLHA 5AZJB 1BA0A 2A40A 4XH4A 3BP8A 4BC5A 1C0GA 3I33A 2GUPA 5AQQA 5CE3A 3D7EO 4CJ7A 4BR2A 1V4TA 2FF6A 5AZIA 1C0FA 2P9PA 2IVOA 4BVPA 1ATSA 3WQUA 1V4SA 3D2FA 2P9IA 1T44A 1IJJA 3VF2A 1U6ZA 4BGAA 2D1KA 3ATUA 4FPBA 3U9ZA 3FFKB 3VF6A 2CH5A 4IZ9A 2E8AA 1J6ZA 2QWRA 4H0TB 1NGFA 4CZMA 5LY3A 2E1YA 4BG8A 4DCHA 3LDLA 1QZ6A 3M6GA 3GDQA 4WQ4C 1QQOA 2Q2RA 4GY2B 3FZLA 2YHYA 1EQYA 3WXKA 3DXMA 3OHRA 2A41A 3HSCA 2D4WA 3AARA 3VEYA 1YAGA 5AQXA 4ISFA 5EXWA 1BUPA 3VPZA 2D0PA 3A5OC 3U4LA 4BRIA 1GLDG 3O6WA 5E26A 1BDGA 2P9UB 1HKBA 3B8AX 4I6MB 3QFPA 5AZJA 3EN9A 3ULEB 1ATRA 3FZKA 1GLEG 3SLCA 2E20A 2Q1NA 2ITMA 4FOIA 3C0BA 4BRAA 1BA1A 1KXPA 5AQGA 3CJCA 4H0PA 4RCHA 1BU6O 3HM8A 3FLCO 5FPMA 4B9QA 1TYQA 2F9WA 5F0XA 4M7YA 5AQFA 1NBWA 4HWIA 3SMSA 5AZIB 4IXCA 2QWMA 4O5FA 4QS8A 2GWKA 3CETA 4FWRA 4PKGA 2HOEA 2QWOA 1K8KB 4YDUA 3LDNA 2E1ZA 1YXQA 2UYTA 2YCHA 2QXLA 5EX5A 1BOTO 2VWBA 1HKGA 1QQMA 5ELZA 2AP1A 4B1VA 5JLHA 4WQ5C 4HTLA 4H5TA 1GLLO 2V7ZA 1RFQA 1KAXA 3DXMB 3CHWA 3AAQA 5E84A 3QMLA 3BUZB 3EO3A 4BR4A 1MWKA 4DQ8A 4BRQA 4XH5A 4MLEA 5AR0A 2A42A 2KHOA 5AQUA 3UB5A 4BC2A 3AY9A 3CI5A 5BN9A 2NRHA 3ULEA 5I9EB 4IWVA 3VGKA 5KPRA 3FZFA 3HI0A 2FSKA 1U2VB 2H3GX 5KQDA 1T6CA 2ZF5O 3LDOA 4BREA 5FPDA 2VYPA 3GG4A 3QDKA 1HJOA 3WXIA 3O08A 4RWTA 4H5NA 3A5NC 3VENA 3R6MA 3VETA 3IUCA 1TYQB 5AQSA 3TU5A 4Z94A 2E2QA 4NB4A 1TUUA 5TKYA 3VEZA 4BRPA 3FR0A 3F9MA 4K42A 3EKSA 1K8KA 4BRFA 3ZX3A 1GLFO 5JICA 1D4XA 1G99A 4YDUC 1T6DA 2GWJA 2E2NA 3MK6A 3MN6A 1TUYA 1GLCG 1JCEA 2D0OA 3MMVA 5KQ8A 1S22A 2P9SA 5BRFA 4JAXA 3P4IA 3ID8A 3WEEA 3FGUA 4FL9A 3CJ7A 3L6QA 2CGLA 5F2RA 2HMPA 3VEOA 4BQLA 3GE1A 2GELA 1HPMA 3KVGA 4CBWA 1R59O 5BRHA 2FF3B 5EVZA 2V7YA 3I8BA 4FWPA 5KPTA 5AQJA 2ASPA 3IFRA 4FWLA 3WQTA 2VCPA 3CQXA 3H45C 4BG9A 4EAHD 3DXKA 1KAYA 1GLAG 4MO5A 5BPLA 3A5LC 1HX1A 1JCFA 4A2AA 1NGIA 1U2VA 2ZGZA 4H0VB 4IJNA 4DHYA 1GLBG 1NGCA 4FO0A 1JCGA 2P9NA 3U9DA 3CIPA 1X3MA 3H3OB 3O5BA 1Z6RA 3LM9A 2NZTA 2IIRA 1WOQA 2QWQA 1RDWX 1Z05A 2I7PA 3ENHA 1MA9B 5LJVA 4FOEA 1DKGD 4K25A 3BF1A 3A8YA 4EIAA 5B8HA 4IO8A 4LC9B 1MDUB 3WUHA 1Y64A 3EZWA 4B1XB 4CBXA 4FWSA 1NGDA 1NGEA 3C7NB 3O80A 1NGJA 4BVOA 4FWNA 3L0QA 1X9JA 5FPNA 2Q97A 3VEXA 4CZKA 4H5VA 1YVNA 3ZEUB 4FWOA 4RTFD 1SQKA 4CD3A 2EWSA 2P9SB 3WEEB 1NGGA 2V52B 3M1FA 3ZX2A 1ZC6A 1XC3A 3M3ZA 3VEWA 3IDHA 2CGKA 5EOYA 4BRNA 4ISEA 3WXLA 2Q36A 2E2OA 4BC3A 2GTDA 3HTVA 3CJAA 2P9LB 4B1ZA 3HZ6A 4CBUA 4FWQA 4PKIA 3SJHA 4BGBA 1NMDA 4WQ4A 1HKCA 3RSEB 3DAWA 2Q0RA 3DXKB 2WUSA 1BO5O 4PKHA 4CZJA 4IJAA 2YI1A 3TPQA 2I7NA 2IVNA 2YHWA 3H46O 4K41A 4H0YB 2QWNA 5AQMA 4C23A 5AQLA 2P9NB 1SZ2A 3ENOA 2DPNA 3UKUA 2W41A 5AQTA 4XH1A 5AQYA 3WXJA 4ISGA 3R8EA 4A61A 2IVPA 3EKUA 1Q18A 3A5MC 3G25A 5BPMA 3SMPA 5LJWA 5AQHA 1WUAA 2PAVA 3D2EA 4E1JA 5EY4A 1BG3A 1ATNA 5ADXA 1ESVA 4PL8A 1KAZA 3C7NA 2GEMA 4H5RA 4EFHA 3VESA 4BQZA 3UE5A 1XQSC 5AQWA 1CZAN 4FPAA 2W40A 3ZEUA 5KPZA 3JS6A 3R9PA 4GNIA 5AQVA 3DJCA 2FSNA 2HF3A 4A2BA 2QM1A 3GBTA 3AAPA 2A6AA 1QZ5A 3HBTA 3H6EA 1GLJO 2QW9A 1QQNA 4JHDB 2ZGYA 3QB0A 4O8KA 5ADXH 2J4RA 4MO4A 3VERA 4H0OA 4CZFA 1H1VA 2QWPA 2E2PA 3J8AA 4BRDA 5JLFA 3CJ1A 3DWLA 3LM2A 2P9LA 1DEJA 3L4IA 2FXUA 4JD2A 1NLVA 2F9TA 4FWMA 3ZX0A 2OANA 1BWFO 4BRMA 4BRKA 1IG8A 3RSEA 2AA4A 4BR0A 2P9KB 3MN5A 5JMVA 2CGJA 3ATVA 3H1QA 4WQ5A 4CZIA 1NM1A 4CD1A 4M7XA 4B1YB 1P8ZA 1DGKN 1OKJA 4NO7A 5AQIA 3MDQA 4QS9A 4BRCA 4BR9A 1HLUA 5FPEA 3O8MA 5AQRA 3VGLA 1S3XA 3UKUB 2Q0UA 2ASMA 1MWMA 3FZHA 3UKRB 5AQNA 3KZBA 3FE1A 3VEVA 5BRDA 4BRGA 4KBOA 3GL1A 3CERA 3ZETB 3CJBA 3JXUA 3MN7A 4EHUA 3D2EB 4B1WB 3S41A 1ZXOA 3H1VX 2QWLA 2NLXA 3MCPA 3H3NO 3A0IX 2BTFA 2V51B 3IMXA 3WT0A 3BEXA 3O1BA 3QBWA 4Y0WA 2A3ZA 4DB3A 4WYBA 2CH6A 4BR5A 3LDQA 4JHDA 4F9OA 3U8XA 3VGMA 4CZLA 2P9PB 2HF4A 4FSVA 2YJEA 4PL7A 2A5XA 2YJFA 4BC4A 2Q31A 3D2FB 4M63C 2ASOA 2P9IB 2BUPA 4QS7A 1NGAA 4JN4A 5AQZA 5AQKA 1NGBA 1NGHA 3VOVA 4FWKA 1NWKA 4JD2B 5AFUA 3KHYA 1QHAA 2P9KA 3LL3A 3W0LA 2FLOA 4K43A 4AM6A 4CZGA 4H0XB 1RGIA 4A62A 1LOTB 3O4WA 4BRLA 4BROA 5F1XA 4EHTA 3LDPA 3GOIA 3O1WA 5BR9A 1E4FT 2E88A 4L3QA 3CJ9A 3CQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BREA 4J8FA 1IKXA 4C1NI 5FRNA 5AQOA 3LP1A 4FLTA 2ETJA 3AVGA 3W3DA 1XI1A 5AQPA 4BR7A 1UA1A 4FK0A 1HUXA 3HVRA 3AGKA 3ZSRA 3OY9A 4I9LA 5BPNA 3ZETA 2XHBA 2NRRA 2FSJA 1WSJA 3MXMA 4OPHA 3FZMA 4MLHA 3MECA 4BC5A 3ZT1A 3WNGA 1C0GA 5C0YA 1IG9A 4F2RA 3M8RA 2X74A 2HW3A 2FF6A 3IRXA 2P9PA 1ZFUA 3M8QA 4JK9A 1V4SA 3WQUA 3D2FA 3K59A 4F2SA 3I55N 4HVJA 2ATQA 3RVCA 3VF2A 2D1KA 3VF6A 4F3OA 2CH5A 2E2FA 3AVFA 3EEQA 2QWRA 4LF7K 1NGFA 2E1YA 3AVAA 4DCHA 3M6GA 4WQ4C 1SKWA 4GY2B 4DQSA 5HROA 1EQYA 3NF7A 4NYNA 3HSCA 2KYQA 4DLEA 1RBSA 2E6MA 1I6GA 4JKGB 3HYFA 1EXQA 2WBNA 3OA9A 1W7AA 1YAGA 3NF8A 4ISFA 5EXWA 4OKJA 3CCUN 4M41A 2W6KA 4IDHA 3F73A 2G8IA 3A5OC 3U4LA 2GBZA 4BRIA 1JL2A 3O6WA 3T3FA 2HSTA 4DV2K 1HYSA 3E7RL 4DR6K 3FZKA 3NDKA 4FOIA 1VQPN 2NNWA 3C0BA 2ZE2A 2DTUA 2B5JA 4LD0A 4CEQA 1WSIA 3CJCA 4RW7A 1BU6O 4BWMA 2HHTA 4H4OA 4KTZA 2ZJRL 4NCAA 3NVKA 1ZBHA 3WNFA 3KLHA 3AVMA 3NAEA 4M7YA 1YI2N 4O5FA 1NH5A 5KI6A 3AVKA 4CJKA 4CIEA 3U3YA 4PKGA 4UQGA 3HXMA 5HRRA 2GL1A 3LDNA 4O4GA 3KKSA 1HNXK 1YXQA 3DM2A 3OYBA 2QXLA 4EZ6A 2VWBA 1PX9A 5M1PA 2RHKA 4BE7B 2BDPA 1F21A 4KHQA 1CXUA 1GLLO 1RFQA 1KAXA 3J7AP 3SV3A 3DLBA 2QKKA 4DTNA 1J5EK 4A5BA 4MLEA 3VQQA 3BZCA 3L4QA 2IOCA 4JKHA 3NH0A 3PX4A 5J1EA 5KGWA 4CHNA 3VQ9A 3CC4N 4FM0A 3AY9A 4RW6A 1T7PA 1JXCA 3TABA 1BQMA 4CF2A 2HHUA 2JWLA 5BR8K 1CZBA 4IWVA 3ZT3A 3FZFA 3RWUA 5GAEP 3E01A 5KQDA 3Q7BA 3DLEA 2IDOA 2ZF5O 1J53A 1NOYA 3GG4A 3TWHA 3PUFA 4DQQA 1TK8A 3O08A 2G8FA 4AHRA 1NPIA 2N2QA 5TKYA 1TUUA 5C15A 3VEZA 3THYB 3NBPA 4CHQA 4M3XA 1JLBA 4CK1A 4K42A 1K8KA 2QA4N 3R2VA 1D4XA 2NUBA 3E9LA 1RDDA 3MK6A 3B6OA 4FJIA 1JCEA 2D0OA 1DQ7A 3MMVA 5KQ8A 2KBKA 1JLQA 3C94A 4FL9A 2UUBK 4ZTJA 3CJ7A 5M1OA 2HMPA 2QEXN 4C8OA 1U47A 4X66K 3K5NA 1EWRA 1HPMA 1K8AO 3HP6A 5BRHA 3S3OA 4XJXA 2FF3B 2D0BA 4ID1A 4FWPA 2FBTA 5KPTA 2RKIA 1QHTA 2HBKA 1NJXA 1LQHA 3PSMA 3KTQA 3BDPA 3CQXA 3QIPA 4EAHD 4K0KK 3DXKA 5IT9O 1NKCA 5BPLA 3NVMA 4BE2A 1JCFA 5FDLA 3OYMA 4YOVA 3PIOL 4JI4K 4IO9L 4KAZA 3H08A 4QCLA 4DS5A 4FO0A 2YIPA 3HPHA 3PO5A 2XY6A 1EO1A 3U3GA 4JS5A 4JRQA 3V9XA 2QWQA 2I7PA 2X78A 3I0RA 1DKGD 4K25A 1KVCA 1KD1O 2G8KA 2HMIA 4IO8A 4NLCA 1Z26A 4DWIA 2NRZA 3P39A 2YNIA 2N69A 4KKOA 3WUHA 4FJLA 4B9NA 4B08A 3L2WA 4MFBA 4KHPK 1Q7YO 1UWBA 1ZYWA 4X65K 4N5SA 1FXXA 1NGDA 1NGEA 3C7NB 2IGIA 3OTOK 3ENBA 1NGJA 1SV5A 3L0QA 4JI0K 2KFZA 4CIGA 2Q97A 3F2KA 4N76A 5HRPA 5CHIA 4B3SK 1CHZA 1SQKA 4JKFA 2P9SB 3SBGA 1M90O 4WFBL 1NGGA 1RBRA 3ZX2A 4W5RA 1ZC6A 4DR7K 3KWIA 3K57A 4CJRA 4DV3K 2KBHA 1REVA 4I9QA 4EP5A 4IG3A 3O3GA 4NXMK 3CJAA 4O0JA 4JI8K 1NJYA 4B3TK 3C6UA 2YIOA 4FWQA 4PKIA 3SJHA 3P31A 1T7BA 4WQ4A 1HKCA 3QETA 2P1JA 3WNHA 1BO5O 4X64K 3AV9A 1NK8A 4OPJA 1RBUA 3VMFB 3AO1A 4H0YB 5AQMA 2BE2A 5AQLA 1POIA 1XRSB 4RW4A 2GMOA 3ENOA 4GKKK 1T03A 2DPNA 1R0AA 4KTWA 1HR0K 1ZVEA 2O8CB 4Z4EA 3VQDA 2WTUA 3R8EA 5DMRA 3MAQA 2IVPA 1D9DA 1Q18A 3DLHA 1P0AA 2GV9A 2RN2A 1Q81O 2PAVA 4E1JA 1BG3A 5ADXA 1C56A 4JS4A 1WSFA 4PL8A 4CECA 5DK5A 4EFHA 2NRWA 3JYTA 4V1DC 1FKOA 1XQSC 4UAEF 3P38A 2VQFK 1YT3A 4AHUA 1J5OA 1M1KO 4AB0A 3LDSA 4CJ3A 4KO0A 1QQNA 4JHDB 2ZGYA 3CPEA 4O8KA 3VQCA 4MO4A 3CPWM 3CCQN 1S6PA 1NJZA 4LF5K 3J8AA 4OJRA 4PHTX 3SZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BRE A;  4J8F A;  1IKX A;  4C1N I;  5FRN A;  5AQO A;  3LP1 A;  4FLT A;  2ETJ A;  3AVG A;  3W3D A;  1XI1 A;  5AQP A;  4BR7 A;  1UA1 A;  4FK0 A;  1HUX A;  3HVR A;  3AGK A;  3ZSR A;  3OY9 A;  4I9L A;  5BPN A;  3ZET A;  2XHB A;  2NRR A;  2FSJ A;  1WSJ A;  3MXM A;  4OPH A;  3FZM A;  4MLH A;  3MEC A;  4BC5 A;  3ZT1 A;  3WNG A;  1C0G A;  5C0Y A;  1IG9 A;  4F2R A;  3M8R A;  2X74 A;  2HW3 A;  2FF6 A;  3IRX A;  2P9P A;  1ZFU A;  3M8Q A;  4JK9 A;  1V4S A;  3WQU A;  3D2F A;  3K59 A;  4F2S A;  3I55 N;  4HVJ A;  2ATQ A;  3RVC A;  3VF2 A;  2D1K A;  3VF6 A;  4F3O A;  2CH5 A;  2E2F A;  3AVF A;  3EEQ A;  2QWR A;  4LF7 K;  1NGF A;  2E1Y A;  3AVA A;  4DCH A;  3M6G A;  4WQ4 C;  1SKW A;  4GY2 B;  4DQS A;  5HRO A;  1EQY A;  3NF7 A;  4NYN A;  3HSC A;  2KYQ A;  4DLE A;  1RBS A;  2E6M A;  1I6G A;  4JKG B;  3HYF A;  1EXQ A;  2WBN A;  3OA9 A;  1W7A A;  1YAG A;  3NF8 A;  4ISF A;  5EXW A;  4OKJ A;  3CCU N;  4M41 A;  2W6K A;  4IDH A;  3F73 A;  2G8I A;  3A5O C;  3U4L A;  2GBZ A;  4BRI A;  1JL2 A;  3O6W A;  3T3F A;  2HST A; 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