4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
3VGLA 4I6MA 2A3ZA 2GTDA 5F2RA 1YVNA 3W0LA 4B1VA 1HUXA 4MLEA 4HWIA 3FE1A 5ADXH 2V51B 4BR7A 5LJVA 3RSEB 3R8EA 4DCHA 2P9LA 3L0QA 2E2NA 4H5WA 3ATUA 1P8ZA 3IMXA 3ENHA 4BRFA 1NGGA 4FL9A 5BRHA 2P9NB 3MN7A 4EHTA 4WQ4A 2E1ZA 3WEEB 4CBUA 4B9QA 3C7NB 3A8YA 3VESA 5FPEA 4CZFA 1XQSC 4B1ZA 5EX5A 3FFKB 4CD1A 2P9SA 2EWSA 2PAVA 3VERA 2E2PA 3VPZA 1JCFA 5AQXA 4RTFD 4QS9A 2P9UB 1NMDA 4CZEA 5KQDA 4H5TA 3D7EO 5BREA 4H0VB 3IFRA 3FZKA 2A42A 2J4RA 2QWNA 4ISGA 3A5MC 3BUZB 3TU5A 2Q0RA 3EL2A 3O1BA 3QMLA 3BP8A 1E4FT 1TUUA 3MMVA 4GNIA 4BRAA 4DQ8A 5AQKA 1TUYA 1NGJA 2Q1NA 4CBWA 3ZEUB 4BGBA 3HI0A 3O5BA 3QICA 4BRCA 2E20A 3FGUA 1QQNA 2HF3A 3ATVA 2KHOA 5EY4A 1NGHA 3M3ZA 3BF1A 2ZF5O 5AQZA 2BUPA 5AQJA 2GUPA 2AA4A 4BR0A 1ZC6A 4EIAA 2H3GX 4CZIA 1S3XA 2CH5A 3CQXA 3EKSA 2HMPA 5AZJA 4HTLA 3S41A 4BR5A 1KXPA 3SMSA 2ZWHA 2I7PA 3D2EB 4JHDA 5KPTA 1XUPO 4FOIA 3MCPA 4BVOA 3QFUA 1U2VB 3KVGA 3KZBA 4K25A 4JD2B 1BWFO 5BRDA 5AQLA 4PKIA 1YUWA 4RCHA 4H0XB 2A41A 4DB3A 1QQMA 3DXMA 4WQ5A 3CQYA 3QDKA 2ASPA 3WXKA 4BQLA 4JN4A 1LCUA 1BA0A 5AQOA 5BN9A 3FLCO 5E84A 5AQTA 4IWVA 3WQUA 4DHYA 3A5OC 3LDNA 1JCEA 5AZIB 2ZGZA 1SAZA 4BROA 1NLVA 5F0XA 2P9KB 1RFQA 1T6DA 2P9IB 2UYTA 2VWBA 1ATRA 5KQ8A 4BRLA 2ASOA 3O8MA 2E8AA 1TYQB 3HTVA 1E4GT 3VOVA 4BG9A 3M1FA 5AQMA 1V4SA 4H5RA 4Y0WA 4GY2B 4BRDA 3VF4A 4BR4A 2QWPA 4BRPA 2Q0UA 2P9PB 3GBTA 4CBXA 3ZX0A 3D2FA 2FSKA 3DXKB 1NGCA 3VF2A 2F9TA 3DWLA 5EVZA 2E2QA 4IXCA 3H6EA 4FOEA 4BRQA 4CZGA 2Q2RA 3JS6A 3ZETB 3CJBA 2E1YA 1NGAA 3CJCA 1YXQA 1MA9B 1NGIA 2QWLA 3UKRA 4BRHA 3HSCA 1XC3A 2CGKA 5KPZA 2IVOA 4BREA 3U9ZA 5I9EB 2HOEA 4H0TB 4IJAA 2Q97A 1QZ6A 1RDWX 4CZHA 4H5VA 3JXUA 1EQYA 1MWMA 4FWMA 3VEZA 1GLJO 4A61A 3ULEA 4PKGA 4PL8A 1HKBA 3WXLA 3LM9A 4H5NA 3MK6A 1X3MA 5AFUH 3HM8A 3O4WA 4FSVA 1V4TA 5FPNA 1ZXOA 2BTFA 2E2OA 3UE5A 5AQVA 4BRGA 2YHYA 4PKHA 1T44A 5BPLA 2I7NA 5AQUA 3TPQA 5AQPA 4FWQA 2A40A 2QXLA 3IDHA 4BRIA 4Z94A 2PBDA 3FZMA 4FPAA 4CZMA 2FLOA 3H3OB 5AQHA 5AR0A 4I6MB 3B8AX 3AARA 3EKUA 5JLHA 4H0PA 2IVNA 4FO0A 2GEMA 3DJCA 2D0OA 2GWJA 1GLFO 1DGKN 1SZ2A 3I8BA 5ELZA 4B1WB 4CZKA 1DEJA 2NLXA 5E26A 4WQ5C 1NGFA 2P9LB 1BO5O 2F9WA 2W40A 4BC5A 3H3NO 1HPMA 5AQQA 5EXWA 1X3NA 3GL1A 1Y64A 3L6QA 3ID8A 2QWMA 3H45C 4PL7A 5ADXA 4QS7A 4BVPA 3VGKA 3CETA 4BQZA 1QHAA 4M7YA 5FPMA 3WXIA 3QBWA 4AM7A 1KAYA 3UKUA 3CERA 5B8HA 3GOIA 4MO4A 3O1WA 4B1XB 2P9SB 1BU6O 1D4XA 3FZLA 3A0IX 1Z05A 1K8KA 2FF6A 2YJFA 3SJHA 4FWNA 3VEVA 4B1UB 2ASMA 4M63C 1IG8A 4EFHA 4JNEA 1Z6RA 5KPRA 4CZLA 3MN9A 4FWSA 1YAGA 2FSJA 2WUSA 1J6ZA 1G99A 3MN6A 1GLAG 1NWKA 4A2AA 4A2BA 3O6WA 1BDGA 2OANA 4WYBA 3ZX2A 4L3QA 4BGAA 2YJEA 1GLEG 2IVPA 4BRNA 4FWRA 4KBOA 2D0PA 3EO3A 3RSEA 3QBXA 2NRHA 4IJNA 3F9MA 2CGJA 5TKYA 5AQSA 3HBTA 4RWTA 3LDPA 1MDUB 5AZJB 1GLCG 3FR0A 2P9NA 3BEXA 3QFPA 4BRKA 3LL3A 3AAQA 3WEEA 2AP1A 4JHDB 3C7NA 1T6CA 4CJ7A 3FZHA 4EHUA 1ATSA 4NO7A 4K43A 5AQIA 1HX1A 3U9DA 3DXMB 1NBWA 4IZ9A 4FWLA 4NB4A 2A6AA 2DPNA 3SMPA 3VEXA 4CZJA 3R6MA 3U4LA 4F9OA 5LJWA 1KAXA 4K42A 3SLCA 3VEWA 2E88A 5AQFA 4K41A 3ZX3A 4BC2A 4CI6A 4M7XA 1BA1A 1KAZA 3H46O 1H1VA 2FSNA 4XH4A 4BG8A 3L4IA 3IUCA 2GELA 2QWRA 3ZEUA 3OHRA 4H0OA 1NGDA 1IJJA 3G25A 4H0YB 5BR9A 3GE1A 1GLDG 1LOTB 4MLHA 3CJ9A 3LDLA 1X9JA 3U8XA 2QWOA 3D2FB 4MO5A 1NM1A 4QS8A 4ISFA 1BOTO 2GWKA 3CI5A 1WUAA 3QB0A 5BN8A 4ISEA 4C23A 3H1VX 2NZTA 1BUPA 3D2EA 2ITMA 3UKRB 5FPDA 1HLUA 1WOQA 2QM1A 4A62A 1QZ5A 4B1YB 3AAPA 1U2VA 1C0FA 2YCHA 3FZFA 3A5LC 4XH1A 4JD2A 3VENA 4BRMA 4JAXA 1NGEA 1OKJA 3ENOA 2D4WA 3KHYA 2YHWA 3P4IA 3DAWA 4XH5A 3VEYA 2D1KA 3ULEB 4YDUC 5AQNA 2V7ZA 3AY9A 1GLLO 1U6ZA 3LDOA 2QW9A 4O5FA 4XEIA 5JICA 3R9PA 3VGMA 5AZIA 1Q18A 4FPBA 3UB5A 2P9KA 2P9IA 5BPNA 4EAHD 4BC4A 4J8FA 1ZBSA 3WT0A 5AFUA 2CGLA 3VEOA 1TYQA 2YI1A 3C0BA 1SQKA 1ESVA 5CE3A 5JLFA 3CJAA 1HKCA 1C0GA 2V7YA 5AQYA 2P9PA 3VF6A 5JMVA 5AQGA 3H1QA 4E1JA 1CZAN 4AM6A 3CJ1A 1JCGA 2FF3B 3DXKA 3HZ6A 5LY3A 4FWOA 3MN5A 3W3DA 3SK3A 1R59O 3O08A 2CH6A 4CD3A 1DKGD 1BG3A 3ZETA 5BPMA 4YDUA 5F1XA 3EZWA 3M6GA 2W41A 3CHWA 3GDQA 5EOYA 2VCPA 1S22A 3I33A 3LDQA 3J8AA 4BC3A 3EN9A 1ATNA 2Q31A 2V52B 2YHXA 2ZGYA 3WXJA 3UKUB 2FXUA 4H03B 2QWQA 3A5NC 3WUHA 5BRFA 4FWPA 4BR9A 1HKGA 2A5XA 1NGBA 3WQTA 1K8KB 3O80A 2HF4A 1RGIA 3CIPA 3CJ7A 4WQ4C 5AQRA 2Q36A 5AQWA 3LM2A 4O8KA 4BR2A 3VETA 4IO8A 1GLBG 2P9UA 1MWKA 4LC9B 1QQOA 3BF3A 1HJOA 2IIRA 4FWKA 3GG4A 2VYPA 3MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1IA 4KHQA 4KHWA 3VGLA 4FLVA 3W0LA 1YVNA 4KTZA 1E3MA 4B9TA 2F8TA 4DS5A 4BR7A 4BE2A 1TKXA 2XY5A 3K2PA 4IEIA 4CGHA 2Z1HA 4H5WA 3ATUA 1P8ZA 4CJRA 4LF4K 4I9QA 1BGXT 3DLKA 3DRSA 3ZT1A 1HYVA 4RG8A 3QNOA 4H4OA 3MN7A 3TAFA 3C7NB 3A8YA 4DV7K 3OYKA 3OYAA 1XQSC 5EX5A 2F7TA 1L3VA 2EWSA 1VSMA 3OBYA 2NUBA 4DTRA 3ULDA 3AVBA 4RTFD 4QS9A 2YNFA 2W6KA 1JLBA 4CZEA 3DLGA 4H5TA 3L2QA 1OH8A 4IDHA 4CW7B 4FJJA 3OS1A 1YTUA 2FC0A 4N76A 2A42A 3A5MC 1VQPN 4AF1A 5J2MA 3CD6N 1T03A 3BP8A 3TWHA 1TUUA 3MMVA 1NGJA 1LAVA 1NJYA 4BRCA 5CZ2A 3NH1A 3SBGA 3FGUA 4W5OA 2FBTA 4DR2K 3TAEA 1NGHA 5FROA 3BF1A 3ZT3A 4Z4IA 2AA4A 3V9UA 1ZC6A 4FJMA 4CZIA 2CH5A 4HTLA 3S41A 1KXPA 4N56A 3C95A 3T69A 4IOXA 3KVGA 3KZBA 3PY8A 4B3RK 1BWFO 5AQLA 4JI1K 3PLAA 3CMEN 4DV1K 4B9UA 3NAEA 1QQMA 1S9EA 1TGOA 3CQYA 4JRPA 5LMUK 2YX6A 3CPWM 3QO9A 5BN9A 5M1FA 3O9QA 3VA0A 3NVMA 1JCEA 4BE0A 3DLEA 4DTPA 4BROA 3CQ8A 2UYTA 2HMIA 4CF8A 4KPYA 5KGXA 3VA3A 2B5JA 4BRLA 2D0CA 4JI7K 4IEEA 3DLHA 1E4GT 3VOVA 4BG9A 3I56N 1ILYA 3R1XA 2JGUA 2XY7A 3SYZA 2QWPA 4F4KA 4O55A 2ITGA 3GBTA 4DMNA 3LDSA 3SQ0A 3D2FA 1TL1A 2FSKA 5J2NA 1W97L 3PUFA 1VSLA 2E2QA 4IXCA 4BRQA 1JLQA 1WBDA 3L4QA 3QEPA 3ZT2A 3NBPA 4BREA 5I9EB 2WTUA 2YHBA 2HOEA 1A5WA 1QZ6A 1ITGA 5KGWA 1VSEA 1HKBA 1N8RO 4B9SA 3LWMA 1X3MA 5AFUH 3THYA 5KI6A 3THWB 1V4TA 3AVHA 2BTFA 2O8EB 2YHYA 1SKWA 1C0UA 5M1QA 4PKHA 1T44A 2I7NA 5AQUA 2P1JA 3E9OA 2XY8A 3QEWA 3IDHA 4MQ3A 3L2UA 1YT3A 5E41A 4LH5A 5AR0A 4ILHA 3PSFA 4E7IA 3RRGA 3B8AX 4CF9A 4CHYA 1U45A 4KI4A 4H0PA 1N36K 5A2QO 2GEMA 3DJCA 5ELZA 4CF1A 4DSIA 1DEJA 4G1QA 1NGFA 5C10A 2P9LB 4CJ5A 2BH1A 4BC5A 3H3NO 5AQQA 4O0IA 3HP9A 3LPUA 2DFHA 1WLJA 5EXWA 3L6QA 4JK9A 3H45C 1J9AA 4PL7A 5ADXA 3NGIA 2VWJA 3BDPA 2ZE2A 1NK7A 3KK2A 1U04A 3S3MA 5I42A 1KAYA 3HL8A 3RMBA 4M3TA 3TSUA 4I2PA 1BU6O 2D0BA 3DI6A 5C42A 3SJHA 4FWNA 2HHTA 1B9FA 2O8CB 1RT4A 1VRTA 2P51A 3O3HA 5CYMA 5KPRA 4W5NA 4FWSA 3G4SN 4M3ZA 1NK9A 1HYZA 1WAFA 3OYNA 4GV9A 3ZT0A 4EZ6A 4A2AA 2KFZA 3O6WA 1BDGA 2OANA 4WYBA 2NNWA 1VQ6N 1JL2A 3PX0A 4H4MA 4FWRA 4ID5A 3ZSYA 4W5RA 3QBXA 2JWKA 1VQ8N 3O9RA 3RMAA 3F9MA 4GVMA 1U47A 4IG3A 3HBTA 3TARA 4F8RA 3HPHA 1IKYA 3WNFA 5FLXO 2QA4N 1J54A 4C8KA 1C0MA 4CJ7A 4CJKA 3O9SA 4NCGA 3LAKA 4NO7A 5FDLA 3P38A 3J7YP 2QTDA 3F9KA 3WNGA 2JLEA 2WFBA 3DXMB 4JKBA 3I0SA 2I5JA 4IZ9A 4O8UA 4FK4A 3NMUA 4FWLA 4DFKA 3ZSRA 1VHXA 3VEXA 3B6PA 1QSSA 2X6NA 4K42A 3SLCA 3CC2N 2E88A 2O8DA 3T7ZA 3ZX3A 4BC2A 3FFIA 1S5JA 3H46O 4BG8A 4XH4A 4FCYA 1LW2A 3OHRA 5GADP 4J2EA 4CK1A 5HOOA 1NJZA 4PQUA 4RW4A 1LOTB 3CJ9A 3CCVN 3U8XA 3VQCA 4CECA 4IDKA 3LZIA 3MEEA 1BOTO 2GWKA 2OZSA 5BN8A 1BQMA 3DLRA 2UUAK 3M5RA 1RDCA 1U2VA 4RW7A 1C0FA 1TL3A 2YCHA 4LD0A 1KVAA 3A5LC 1NK0A 2EHGA 3VENA 5LMNK 5C2DA 4Z4EA 2F4VK 3SQ2A 4YOTA 3DAWA 4B8CA 3MAQA 2HHVA 2D1KA 5HROA 1HQEA 4YDUC 4CJEA 2UXCK 1C0TA 1D8YA 4JKGA 1HNVA 3AY9A 1U6ZA 3LDOA 1RTIA 4O5FA 3CPEA 4JI4K 3VGMA 4GW6A 4CHPA 3ENBA 5AZIA 3QEXA 1UAXA 3LPTA 3G0ZA 2P9IA 5BPNA 5CYQA 4EAHD 4FJ7A 4JK7A 1JL1A 3EE9A 2XY6A 1R0AA 3WT0A 2RN2A 4B3OA 2YI1A 3NCIA 1YTAA 2RHKA 1ESVA 5CE3A 1HKCA 1RDBA 3VF6A 5JMVA 5AQGA 5IWAK 3H1QA 4E1JA 3LANA 1VQ7N 3I0RA 5LY3A 4CGIA 3P31A 1S6PA 4CD3A 1BG3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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