4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
3DXKB 2CGJA 4L3QA 3FZKA 4A62A 3EZWA 4QS7A 3WEEA 4DCHA 3M1FA 3KHYA 4RCHA 3SJHA 5AQJA 4ISGA 3VPZA 3D2FB 2VWBA 5AQNA 1BUPA 1QQOA 3QDKA 4MLEA 4IO8A 5TKYA 3DAWA 4H0VB 3ATUA 1DGKN 4HTLA 4H5NA 2ITMA 1DKGD 1ZXOA 4FWQA 3VEWA 3A5NC 4IXCA 1HKGA 3O1BA 1X9JA 4J8FA 5I9EB 3ZX2A 2IIRA 3VESA 2QW9A 3EN9A 1JCFA 2P9PB 4JHDA 5AQQA 4BRMA 1Z6RA 3CETA 3CHWA 3WXIA 1BA0A 3FZHA 3GBTA 3CERA 4CBUA 3WUHA 4K42A 1GLFO 1NGFA 5E26A 1BDGA 3LDNA 1MWKA 2CH6A 2QWQA 1NGGA 3SK3A 3TU5A 3SMSA 3ZETA 4F9OA 1Y64A 3ATVA 4B1WB 5FPNA 4CZGA 3A8YA 3MK6A 2A40A 3CJ1A 5AQMA 5EX5A 5AQGA 2ASMA 2P9LA 4CI6A 5ADXH 2CGLA 3B8AX 2QWLA 3O08A 1NLVA 3GOIA 2HOEA 3LM9A 4XH4A 1V4SA 1D4XA 2YHYA 3FGUA 5BREA 3VENA 4Z94A 2YHWA 4WQ4C 3WQTA 3ZEUB 4K25A 2P9KA 4AM6A 5ELZA 4H0XB 1TUYA 2H3GX 4RTFD 5EY4A 2E8AA 4M7YA 2ASOA 4XH1A 2E88A 2P9NB 3DJCA 5KQ8A 3L6QA 3QBWA 2P9SB 1IJJA 2YJEA 4JAXA 3QFPA 5LY3A 2VCPA 3H46O 5AZIA 3EKUA 3FLCO 4JN4A 1YAGA 3IFRA 3QBXA 1XUPO 3JS6A 3IMXA 1E4FT 4BVPA 1MWMA 3MCPA 5AQOA 2IVPA 3L0QA 4A2AA 3CQYA 3VEVA 3AAPA 4GY2B 5AQTA 4BR0A 1NGCA 3D2EA 3DXMB 4JD2B 1NGEA 1S22A 3R6MA 1QQNA 3OHRA 3VGKA 4ISEA 4DQ8A 5KQDA 1TYQA 4FWMA 3UKUA 3HZ6A 4CZFA 2Q1NA 2F9WA 4BR4A 4I6MA 2V52B 2Q36A 5KPTA 4H03B 1V4TA 3KZBA 3F9MA 5AQWA 3VEZA 4O5FA 2QWPA 4BGBA 1YVNA 4EHTA 3ULEA 4IZ9A 3QMLA 5KPRA 4BRDA 4H5WA 5BN9A 3ZX3A 4BRFA 3VF6A 3SMPA 1BG3A 1U2VA 3CJAA 4EIAA 4CZHA 4NO7A 1NGIA 3GDQA 1XC3A 4ISFA 2QWRA 5AQLA 4BR9A 3UB5A 1BOTO 4WQ5C 2KHOA 2ZGYA 2GTDA 3S41A 1YUWA 4CBWA 4LC9B 2AA4A 1K8KA 2I7NA 5AZJA 1BA1A 3MMVA 2FLOA 2ZWHA 2YHXA 2V7YA 4BRQA 2OANA 2QM1A 3U4LA 1HX1A 2ZGZA 4O8KA 4BQZA 2QWMA 3LL3A 4GNIA 4IJAA 5AQFA 2YJFA 1YXQA 3ZX0A 2P9IB 2A5XA 2V51B 4FOEA 1KXPA 1J6ZA 4CD1A 3UKRB 3KVGA 3O6WA 3H6EA 1ATRA 2P9UA 2E1ZA 3C7NB 4QS9A 1HLUA 2IVOA 4RWTA 4EAHD 1JCGA 1G99A 5AR0A 1QHAA 2BTFA 4FWSA 2Q2RA 4BRAA 1GLBG 2FF6A 3BUZB 2A3ZA 4K43A 3W3DA 1SZ2A 3LM2A 3RSEB 4FWPA 4BRPA 2QXLA 3VERA 2A6AA 1KAXA 4IJNA 4FPAA 4MLHA 4CZKA 1NWKA 3QICA 3WQUA 3CQXA 3W0LA 1BO5O 5JLHA 1ATNA 3DXKA 4MO5A 1IG8A 3MN6A 5CE3A 5AQIA 1GLLO 3H3NO 3GE1A 4H5TA 3H1VX 4BG8A 4H5RA 4BROA 4BGAA 2VYPA 4NB4A 3FZFA 4K41A 3AAQA 3D2FA 4CJ7A 1T6DA 1BWFO 2YI1A 1E4GT 3LDQA 2AP1A 5AFUA 1CZAN 4FPBA 5EOYA 2ASPA 2CGKA 3WXKA 3FZLA 4BC3A 3CJBA 4FWRA 4BRIA 1WOQA 5EXWA 4XH5A 3H3OB 2GWJA 4BC4A 1ZBSA 2FXUA 5AQRA 1LCUA 2FSJA 2BUPA 4H0PA 3ENOA 3C0BA 4BRGA 5BN8A 2HF3A 1NBWA 2D0PA 2NRHA 4C23A 4WYBA 4YDUA 1GLCG 2P9PA 4H0TB 4BQLA 1RDWX 3A0IX 4BR2A 3WT0A 3C7NA 1C0FA 2V7ZA 4EHUA 3VOVA 2QWNA 3WEEB 5BPMA 4PL7A 4PKGA 1EQYA 3L4IA 4EFHA 5BRDA 4BR5A 3CI5A 1HPMA 2HMPA 1BU6O 3MN5A 2Q31A 3LDPA 4CZMA 3O1WA 3U9ZA 4FWNA 4HWIA 4FO0A 2WUSA 2E20A 2Q97A 1OKJA 2E2NA 1TUUA 1GLDG 4KBOA 3ZEUA 5BPNA 1R59O 3I33A 3CJCA 4FWOA 5AQKA 5BR9A 4B1VA 3IDHA 3O8MA 5FPEA 2I7PA 3HTVA 2A42A 4JHDB 4PKIA 3VEOA 3QFUA 1ESVA 1KAYA 1HUXA 4CBXA 3FR0A 2P9NA 3R9PA 2P9SA 2QWOA 1C0GA 1QQMA 4B1UB 3VEXA 2A41A 4QS8A 1U6ZA 4BRHA 3GL1A 5AFUH 2PBDA 3ZETB 5AQUA 4JNEA 1LOTB 3A5MC 1S3XA 3A5OC 2P9LB 3G25A 1MDUB 1Z05A 3DXMA 4JD2A 3R8EA 1Q18A 4DHYA 4AM7A 1NM1A 3JXUA 4H0YB 4Y0WA 1KAZA 3WXJA 3EL2A 4M63C 5BPLA 4DB3A 2GELA 1NMDA 5AQYA 1JCEA 2P9KB 3VGMA 5BRFA 1GLAG 4FSVA 3O80A 4B1XB 4WQ4A 3EO3A 4PL8A 2D1KA 1T6CA 2W40A 3VGLA 1SAZA 3EKSA 1WUAA 4BG9A 2D0OA 2DPNA 3U8XA 1HKBA 3VEYA 1X3NA 5AZIB 3ENHA 5B8HA 1T44A 3SLCA 3FFKB 3CJ7A 3AY9A 4BRLA 3D7EO 2NLXA 3HSCA 5F1XA 3UE5A 3WXLA 3D2EB 1GLEG 1RFQA 3O5BA 4E1JA 1GLJO 3A5LC 2GUPA 2Q0RA 1TYQB 4BRCA 3UKUB 2YCHA 4FOIA 3HBTA 3QB0A 3TPQA 4I6MB 1DEJA 1X3MA 4FWKA 5AQZA 4CZEA 4A2BA 1NGJA 1ATSA 2NZTA 4BVOA 4IWVA 2D4WA 3BP8A 4BC2A 2E2PA 1XQSC 5AQPA 2P9IA 3J8AA 3BF3A 3ULEB 3M6GA 4FWLA 5F0XA 4BC5A 4FL9A 2FSNA 3FZMA 4A61A 3GG4A 3UKRA 1U2VB 1HJOA 3ID8A 1QZ6A 2Q0UA 3I8BA 5LJVA 2J4RA 2GWKA 3LDLA 4WQ5A 4BR7A 5JMVA 1P8ZA 3LDOA 2HF4A 1K8KB 4M7XA 4H5VA 4BRKA 5EVZA 3RSEA 5AZJB 3MN7A 2CH5A 4CD3A 2UYTA 3BF1A 2FF3B 4XEIA 5AQXA 3H1QA 3O4WA 4CZJA 2GEMA 1MA9B 2E2OA 1HKCA 1NGBA 3MDQA 5FPDA 3DWLA 1NGDA 5FPMA 4B1ZA 5JLFA 4BREA 1SQKA 5AQVA 3MN9A 1NGHA 4B9QA 2ZF5O 3HM8A 5JICA 1QZ5A 2FSKA 1ZC6A 3VF2A 3VF4A 5E84A 3VETA 4CZLA 3HI0A 5LJWA 2W41A 3FE1A 2P9UB 5F2RA 2E1YA 3AARA 1RGIA 3IUCA 4H0OA 3CIPA 5ADXA 4BRNA 3M3ZA 5AQHA 5BRHA 2PAVA 2E2QA 1NGAA 2IVNA 3BEXA 4YDUC 4B1YB 2EWSA 4CZIA 4PKHA 5AQSA 3P4IA 3H45C 3CJ9A 3U9DA 5KPZA 2F9TA 4MO4A 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EO1A 4KO0A 4L3QA 3HPGA 4A62A 5HRPA 5KGXA 3QEPA 2KTQA 1ZYQA 4DTMA 3SJHA 4A59A 5M1KA 2VWBA 4AQYK 1BUPA 1QQOA 1G15A 4MLEA 3LANA 3EE8A 2HNDA 1OVYA 4NCBA 3LP1A 4ELTA 1BQNA 5KRTA 4DV6K 4H0VB 4HTLA 2OPSA 4Z4FA 3NGYA 2ITMA 1ZBUA 4F4KA 3T1AA 4KHYA 1HKGA 1X9JA 5I9EB 1C0UA 4MDAA 2IIRA 5FRMA 2QW9A 4HVJA 2UUCK 2P9PB 4C8LA 3MXIA 3R3LA 5C15A 4M3WA 1NOZA 1C0TA 1S5JA 3PSFA 2KFZA 3WUHA 4K42A 1GLFO 1NGFA 4IKFA 1WSEA 3V9ZA 3LDNA 3QEVA 1SS6A 4AHUA 1N32K 4M42A 3ZETA 4F9OA 4DQPA 1HNIA 4B1WB 5FPNA 3A8YA 4I2PA 3SNNA 3ZSRA 5EX5A 5C0YA 5ADXH 4YORA 4ID5A 2HBMA 4CJEA 4DR2K 3NH0A 1FW6A 4FW2A 3LM9A 1D4XA 3OYNA 1R0AA 2A1SA 3SUPA 4Z94A 5CHIA 3MXJA 2YHWA 3PO4A 4WQ4C 4C8KA 4LF9K 4DLGA 1YF5L 3TSQA 4CGDA 2E8AA 4M7YA 2OZSA 4KV8A 2O8FB 3LAKA 2O8BB 1GOCA 4XH1A 5GIOA 5KQ8A 3L6QA 4AILC 1IJJA 4JAXA 4CEEA 3OTOK 1JLBA 3LP3A 3TAFA 3R1XA 3FLCO 4JN4A 3IFRA 1XUPO 3TARA 3JS6A 1E4FT 4BVPA 3THYB 5AQOA 3L0QA 3G71N 4QAGA 4DQRA 3K9JA 1N6QA 2Q3SA 1S22A 1ASUA 3OHRA 3NAEA 2W42A 3TR8A 4ISEA 4DQ8A 5KQDA 4CZFA 3NHGA 2Q1NA 1BCMA 3U6FA 3OYDA 4I9QA 4JI8K 2O4IA 1LV5A 5KPTA 4H03B 3KZBA 4E89A 2QKBA 1LWEA 1TAUA 4O5FA 4PY5A 4B3TK 3ULDA 4IZ9A 2WONA 3VQAA 3QMLA 2HBJA 1VQ6N 2XY7A 5KTQA 1TGOA 3F5TA 5HOOA 3IKMA 1SV5A 3NBPA 3I8DA 4YOVA 2GUIA 4NCGA 3VN5A 4BR9A 3CCSN 4CFAA 1TKXA 3CCJN 2KHOA 4R5PA 4YOYA 1YUWA 3OVNA 3C94A 2I7NA 4JK8A 1BA1A 5HRRA 2FLOA 2YHXA 2OANA 3U4LA 4DR6K 4KHSA 4GV6A 5I42A 4BQZA 4JKFA 3LL3A 4GNIA 1KFSA 1YTAA 3PY8A 4YHHK 4CK1A 1OH8A 5H1SQ 2B5JA 2A5XA 1NK9A 4PQUA 1S1WA 1KXPA 4M3ZA 2B4JA 3L3UA 1J6ZA 1SUQA 3KVGA 2UXDK 2GV9A 5C2FA 2P9UA 1JJ2M 4OO1J 1VQPN 2PYLA 4LFBK 1HLUA 4PHTX 4CK3A 4CW7B 3O9RA 4KPYA 2X74A 1GLBG 2FF6A 3MX2A 4K43A 3KTQA 1SZ2A 4CF0A 4O8UA 3RSEB 2VWKA 1VQNN 2E4LA 3VQ7A 2O8DB 1NWKA 3TWHA 4DSKA 3CQXA 3DRSA 2XHBA 4IEIA 4DSJA 2OTJN 1S1UA 4H5TA 4BG8A 4RW6A 1VSMA 4H5RA 4MDBA 4CJ7A 1BIZA 4MQ3A 3J7AP 1BWFO 1E4GT 4O5BA 4J2BA 1EWQA 3CFRA 1CZAN 5EOYA 2ASPA 4LSNA 1J5OA 3JAMO 3FZLA 1KVBA 1LAVA 4CK2A 1JL2A 3HM9A 2GWJA 3O9UA 5LL6Z 2ETJA 2FXUA 3N4QA 2BUPA 4FLZA 3C0BA 4DG1A 5BN8A 1NBWA 3CC2N 2D0PA 4WYBA 1GLCG 4DSFA 4BQLA 3C7NA 4FCYA 3QIPA 3AVBA 3OBWA 3Q7BA 4FJ7A 1QE1A 1WN7A 4EFHA 4B9NA 4BR5A 3CI5A 1J5EK 4OPJA 3DLLL 3MN5A 4C8OA 5I3UA 3KKRA 1W0HA 5SWMA 4CF9A 3HO1A 2W6KA 3LWMA 1VSDA 3T19A 3TAEA 2X6SA 1GLDG 2ZE2A 3P31A 4IOXA 4KBOA 4LSLA 3ZEUA 1EXQA 1KTQA 4IFEA 5BR9A 5EU7A 1F21A 5FPEA 2I7PA 3HTVA 2DTUA 4FVUA 1ESVA 1HUXA 1X1PA 4CESA 4KB1A 2P9NA 3R9PA 2P9SA 2QWOA 2XY8A 4CHYA 3VEXA 4DF8A 3HRGA 3NMUA 1JXBA 2PBDA 1ASVA 5AQUA 3ZETB 1NK4A 5DM7L 4DKWA 2KZZA 3A5OC 4B9SA 4GW6A 4KI6A 4H4OA 1NM1A 2OPRA 2Z1HA 4O4GA 4Y0WA 3VA3A 4O55A 4DB3A 3AVFA 3IRXA 3KJVA 3L2VA 5AQYA 4OPHA 3K2PA 4B1XB 3O4QA 3DMJA 4WQ4A 4DFPA 2F8SA 4OJRA 2FC0A 1ZBFA 2VGMA 4DUZK 4K8ZA 1WUAA 4BG9A 3VQDA 4N76A 3ZSYA 5HBMA 3V9WA 3VEYA 1X3NA 3KK1A 4E0DA 2HB5A 2NRZA 4KHUA 2I5JA 3SQ1A 1BQMA 1P90A 3CG7A 2F8TA 2NLXA 1QVFM 4AHSA 3UE5A 4F2RA 4KHPK 3O5BA 3E9PA 4FW1A 3HOSA 3BY5A 3HXMA 4FLTA 4BRCA 2JWKA 1DEJA 1X3MA 4LH4A 4CZEA 4GV9A 4EZ9A 1X9WA 1JLEA 1B92A 2DFEA 2BH1A 1VQ8N 3NH1A 2E2PA 5DMRA 1JLAA 2P9IA 3ASMA 4CERA 1UA1A 4I7FA 3MWTA 3FZMA 4X62K 3ZSVA 3UKRA 2IS3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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