4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
3MN5A 1X3NA 2FF3B 3P4IA 5JICA 5EY4A 5BPMA 3FZHA 3CJAA 5F0XA 2V51B 1NGCA 5AZJB 4B1VA 5JMVA 1TYQA 4BR0A 3CIPA 2BTFA 2A6AA 3H46O 1KAYA 1BDGA 2AP1A 3VENA 1LOTB 3AARA 3F9MA 3DXKB 4BR7A 4JNEA 4F9OA 2YCHA 1CZAN 2E1ZA 2I7NA 4MO4A 3S41A 5F1XA 5E26A 5AQKA 3TPQA 1HJOA 2A41A 1GLFO 3J8AA 2CGKA 4B1WB 3H3NO 2P9PA 3FZMA 1MA9B 3GL1A 3LM9A 1GLDG 1NGIA 4H5TA 5BRDA 1NGDA 4B1XB 1ATSA 1HPMA 3IDHA 2YJEA 1C0GA 1SQKA 3QDKA 5CE3A 4H0VB 3ATVA 3BEXA 1BA0A 4CZKA 4H5VA 4PL8A 3IMXA 4IXCA 3QBXA 5AFUH 3ID8A 4BRCA 1BWFO 4FWOA 2HF3A 1E4FT 1GLAG 1V4TA 2QWQA 2UYTA 1HKGA 2IVPA 5EOYA 5E84A 3JS6A 4FWSA 3LL3A 2OANA 3VGKA 4B9QA 3U9ZA 3WEEB 5B8HA 5AQNA 4XH5A 5BPNA 2P9IB 3DWLA 2GTDA 2QWPA 2P9UB 3ZETA 4BGAA 3O6WA 3MMVA 1SZ2A 4NB4A 2QWOA 4BROA 4BC5A 1BA1A 2FSNA 5AQSA 4MO5A 4A62A 3U9DA 4H5WA 5ELZA 3VF4A 1KXPA 1NM1A 4A2BA 2FSKA 1XC3A 3EKSA 3VGLA 3ZEUB 1NGFA 3A5MC 5ADXA 3CERA 4WQ4C 4CJ7A 4CZEA 1QQOA 3UKUA 2E2QA 1K8KB 1QHAA 4M7YA 3A5NC 4H0YB 3CJ7A 1GLBG 5AQGA 1J6ZA 2CGJA 3EN9A 1LCUA 3VF6A 1GLEG 3LDNA 3QMLA 2VCPA 1WUAA 2P9NA 3L6QA 2ASPA 3M6GA 2CH5A 4BVPA 3UB5A 3JXUA 2QM1A 2GWJA 3LM2A 2E20A 3O80A 3VEXA 5BRFA 3A0IX 3WEEA 2VYPA 4HWIA 5LJVA 1HLUA 4O5FA 2HOEA 3FLCO 4IJNA 1Q18A 1QZ6A 4FWRA 3HSCA 1SAZA 3ZETB 4WQ5A 2GELA 5AQLA 2DPNA 4FWLA 1GLJO 1BG3A 3R6MA 1XUPO 1ESVA 5LY3A 4CZJA 3BP8A 3O5BA 4YDUA 2A42A 3QB0A 5AQJA 2ZGZA 3CQYA 2E2OA 2P9SA 5BPLA 4RTFD 4K42A 3D2EA 3M3ZA 2KHOA 3BF3A 5AQXA 4I6MA 3DXKA 3ATUA 1C0FA 4L3QA 4PKIA 3R8EA 5AQMA 3AY9A 1Z05A 1ZBSA 5AQOA 2FLOA 3IFRA 3MDQA 4JAXA 4DQ8A 1S22A 4XH4A 1E4GT 4CD3A 4BGBA 3EL2A 2E8AA 4BG9A 2QWRA 5AQWA 1U6ZA 3CETA 2Q0UA 5AZJA 4BC4A 4BRPA 2P9LB 3FZKA 4CZMA 1YVNA 2GEMA 4FPAA 4FWQA 4JN4A 2Q2RA 3U8XA 4A2AA 2FSJA 2AA4A 2H3GX 1OKJA 3CJBA 3R9PA 4IZ9A 3B8AX 1TUUA 4Y0WA 5F2RA 3MN9A 3SMSA 2W41A 1T44A 1NBWA 2P9KA 5BREA 5FPNA 3D2FB 2QW9A 3WXIA 4WQ4A 4CD1A 4EHUA 1NWKA 2YJFA 1Y64A 3HI0A 3SK3A 2Q97A 3CJ1A 2IIRA 2ZF5O 3VGMA 3H45C 4CI6A 3RSEA 4A61A 4DHYA 2ZGYA 2Q36A 4BRGA 4XH1A 1Z6RA 3QFPA 3VEYA 3AAPA 1MWKA 3UE5A 4IJAA 3LDOA 4H0PA 2A40A 2V52B 3UKUB 3BUZB 1X9JA 4K25A 4LC9B 1KAZA 1IJJA 4BC2A 5AQZA 4GY2B 4WQ5C 5BR9A 5AQQA 1BUPA 4K43A 5LJWA 3EZWA 4CZHA 3HBTA 4QS7A 3HZ6A 3EO3A 3GBTA 2EWSA 5KPRA 3VEVA 4CZIA 2GUPA 1TYQB 1YAGA 2D0PA 4PKHA 4EHTA 1D4XA 5BN9A 5ADXH 4BRDA 4IO8A 3A8YA 3CHWA 4XEIA 4B1YB 4BRLA 4BRAA 3MCPA 3O4WA 3VEWA 3DJCA 4Z94A 5BN8A 3D7EO 2YI1A 5KPTA 5AFUA 3VF2A 4BG8A 3KVGA 3VPZA 3H3OB 1HX1A 2F9WA 4FSVA 5AQYA 4QS9A 3LDPA 3WXLA 1HUXA 1YUWA 4DB3A 1GLLO 2E2PA 3TU5A 1DKGD 2P9NB 4KBOA 4EFHA 3C7NA 3DXMA 4JHDA 5AQUA 1BOTO 3C0BA 1XQSC 1GLCG 3MK6A 1RFQA 1NGEA 2IVNA 4IWVA 5AQVA 3AAQA 3FGUA 3ZX0A 4H0OA 3ZX3A 2P9KB 3VEZA 1H1VA 2A3ZA 1QQMA 4JHDB 4M7XA 3GDQA 5JLFA 4RWTA 5AQIA 1NGAA 4NO7A 3I33A 4BC3A 2FXUA 1WOQA 2VWBA 2P9SB 4GNIA 2E88A 4BR9A 3ZX2A 1T6DA 4RCHA 2IVOA 4H5RA 2BUPA 3MN6A 2YHXA 2CGLA 3KHYA 3UKRA 4EIAA 4ISFA 2ITMA 4BREA 3QBWA 3FE1A 3CQXA 3IUCA 4CBUA 4BR4A 2HMPA 2YHWA 3HM8A 5AQFA 3ENOA 4BRNA 3BF1A 3H1VX 2V7ZA 4QS8A 3DAWA 3RSEB 3O8MA 4B1UB 3G25A 4FOEA 3GE1A 1JCFA 1NGJA 3VERA 1ZC6A 3H1QA 4J8FA 2NRHA 4FWMA 4AM6A 1BO5O 2NLXA 3SJHA 4BQLA 3ULEA 4E1JA 3O1BA 1MWMA 2Q1NA 3O08A 1IG8A 2HF4A 4DCHA 4BRFA 1EQYA 3QICA 3KZBA 3W3DA 5I9EB 4CZFA 2I7PA 2WUSA 3W0LA 2Q0RA 5AQHA 3WQTA 5EXWA 2QWLA 4BR2A 5AR0A 2FF6A 3A5LC 5FPEA 1JCEA 1U2VA 2CH6A 3ZEUA 4CZLA 3ULEB 4H5NA 2QWMA 3I8BA 2P9UA 4FO0A 2P9LA 1JCGA 4CBXA 1K8KA 3A5OC 1NGBA 3L4IA 5BRHA 1NGGA 3CJCA 4MLHA 2Q31A 4BQZA 3WQUA 3LDLA 3H6EA 2P9IA 2A5XA 1HKBA 4FOIA 5KQ8A 3D2EB 3WXJA 3VESA 1NMDA 4I6MB 1MDUB 4K41A 5EX5A 1NGHA 2ASOA 3LDQA 4C23A 3GOIA 2D0OA 3FZFA 3VETA 4FPBA 4JD2A 5AQPA 4BRMA 4BVOA 3WT0A 1DEJA 3FFKB 3HTVA 4YDUC 3CI5A 5FPMA 4FWNA 3C7NB 3DXMB 2E1YA 3WXKA 4PL7A 1RDWX 3OHRA 5AZIA 5AQTA 1BU6O 3SLCA 4H03B 1ATRA 3ENHA 4MLEA 4PKGA 5TKYA 1G99A 1TUYA 2J4RA 3UKRB 4M63C 3VEOA 4BRIA 4EAHD 4JD2B 5EVZA 1U2VB 1R59O 1HKCA 2ZWHA 2PAVA 1X3MA 4FL9A 1ZXOA 3L0QA 2W40A 5KPZA 3O1WA 4FWKA 1DGKN 2PBDA 2ASMA 2V7YA 3SMPA 4HTLA 4B1ZA 1S3XA 4BRQA 1V4SA 1NLVA 2NZTA 3QFUA 2E2NA 3D2FA 4AM7A 1QZ5A 4ISEA 2D1KA 2QWNA 5KQDA 1KAXA 4BR5A 2F9TA 3U4LA 1QQNA 5JLHA 4BRHA 2YHYA 3FZLA 2P9PB 2QXLA 1YXQA 4H0TB 5AQRA 3MN7A 4CBWA 5AZIB 5FPDA 1RGIA 4O8KA 3VOVA 3CJ9A 4FWPA 4WYBA 3M1FA 1P8ZA 1T6CA 3EKUA 4BRKA 3GG4A 4ISGA 4H0XB 1ATNA 3FR0A 3WUHA 2D4WA 4CZGA 2GWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1X3NA 1YJ9N 4AHCA 3P4IA 5JICA 1N36K 5MLCQ 5EY4A 3AVJA 5F0XA 2V51B 4IOAL 2HBKA 3O9TA 2ZJPL 1TYQA 3L2WA 2W6LA 3QEPA 1BDGA 2AP1A 3ULDA 3AVKA 3T69A 3VENA 2Z1JA 3AARA 4FJGA 2HHXA 3O3GA 4HTUA 1BHLA 4LF9K 1CZAN 3S41A 3HJFA 4C8MA 2RN2A 5E26A 4YHHK 4HUFA 3TPQA 1IG9A 4FJMA 2O8BB 3J8AA 4B1WB 4KPYA 2Y1IA 3LM9A 4KV8A 4H5TA 1NGDA 4Q0BA 1ZBFA 1UA0A 2VGMA 1Q9YA 1L3VA 4KH6A 1UAXA 4NCAA 3TAMA 4E3SA 3C95A 5C12A 3DLLL 1GOBA 4EP5A 3D45A 3ID8A 4Z4FA 3AO4A 1GLAG 4FM0A 1V4TA 2PYLA 3QLHA 4FLXA 3JS6A 2OANA 1REVA 4IG0A 5B8HA 4XH5A 1I94K 3DOLA 4FVUA 2HBMA 4I2PA 3AA5X 4EP4A 1S1TA 5EU7A 2FSNA 5AQSA 1L3TA 2KLAA 1NKEA 1T3VA 1VSHA 4Z4HA 3QINA 1RTIA 3EKSA 3VGLA 4FLZA 1NGFA 3A5MC 3D0PA 3JSMA 3SNNA 3TABA 4B9SA 4FVMA 3VQBA 1U45A 4OGEA 2O8CB 1QHAA 4M7YA 3THYA 3KIOA 3CJ7A 5AQGA 2CGJA 3HPGA 3LDNA 3QMLA 4JRQA 4DV1K 2P9NA 3M6GA 2KKZA 3V81A 2P51A 3UB5A 3HOSA 3JXUA 3KWIA 2GWJA 4C8KA 4DQQA 2YKNA 3E1YA 1JLQA 4O5FA 3SBTA 1WBDA 4ELUA 1J5OA 5FRNA 3LWMA 4OX9K 1ESVA 2IOCA 3F2KA 4ID1A 1SS6A 2ZGZA 4E1NA 5HRPA 4OO1J 1IKXA 3ZT2A 2RKIA 3D2EA 3OJUA 1HQEA 5AQXA 4I6MA 2QKKA 1UOCA 4L3QA 3R8EA 3DLGA 1QS4A 1RT6A 3F5TA 1WAJA 3OTOK 3MDQA 3ZSOA 1Q8IA 4JS4A 4YOVA 3HP6A 1DT9A 4BGBA 1FJGK 2QWRA 1KLMA 1YIJN 3CETA 2Q0UA 2HNYA 4BC4A 1BIUA 4LFAK 3T1YK 3AA4A 3O9RA 2B4JA 4M3ZA 2KW4A 4B8CA 1KRPA 1HNIA 4BY9C 4X66K 1YVNA 3AGRA 2OYQA 4RW6A 1HYSA 3TR8A 4A2AA 1OKJA 4CGFA 2FBTA 3R9PA 1QSLA 4CJRA 3B8AX 1U47A 1TUUA 4Y0WA 2G8KA 3LP3A 3MN9A 2VG6A 1NBWA 4OPAA 5BREA 5FPNA 3D2FB 4NYNA 4FK2A 4WQ4A 4CD1A 4FZXC 1N33K 2PFUA 3HI0A 3SK3A 3SUOA 1EXQA 1KQSM 3P5JA 1IKYA 4CESA 4A61A 1J5EK 1WSJA 3G6EN 2XY6A 4KB0A 2NRTA 2KZZA 3DMJA 3PIOL 3AAPA 3RRGA 1RTHA 3SAHA 3LDOA 3VA3A 2V52B 3SJJA 2P5GA 1RT2A 4K25A 4LC9B 4DR1K 1BI4A 3K58A 5BR9A 3IRXA 1BUPA 4R79A 4O44A 3WNHA 4QS7A 4E7KA 2NRRA 4YOWA 4RG8A 4FZYA 2GUPA 1A5VA 4U67L 3NH1A 1CLQA 1Q7YO 4W5NA 1HNVA 4RW8A 4BRLA 4JKGA 3MCPA 3OYMA 3N4QA 3SPZA 2YI1A 3NF6A 3T7ZA 4CF8A 4KHYA 1TKTA 3VF2A 4OPKA 3VPZA 4FSVA 2PZSA 1UWBA 3LDPA 4GKKK 3KLIA 1YUWA 4OJRA 4DB3A 4WFNL 3I55N 2E2PA 1DKGD 3SQ0A 2IDOA 5T7BA 2GX9A 4H4MA 4JHDA 3M5RA 3NVKA 1XQSC 1GLCG 4DV7K 3G4SN 1S9EA 5BR8K 4IWVA 5AQVA 1SKRA 1TV6A 3T1HK 3VQ6A 1OVYA 1JKHA 2XO7A 3RTVA 3VQ9A 4JKCA 3VEZA 3VQ8A 1C1AA 4M7XA 5KGXA 5JLFA 3HPHA 1RT5A 5J1EA 4GV3A 1YI2N 1NGAA 4NO7A 4BE1A 2OPPA 1J53A 2VWBA 3OYEA 2E88A 1T6DA 4TSXA 2BUPA 3CPEA 4F3OA 1U48A 4DS4A 2YHXA 4KTWA 1KLNA 3QEIA 1HR0K 4JKEA 3TI0A 4W5TA 3QBWA 3FE1A 2KFNA 3ENOA 3EZ5A 3MEGA 4IBNA 4JK8A 3G10A 4G9ZA 1B92A 3TSQA 3NVMA 4QS8A 2QXFA 3ZSYA 1U4BA 4QOZB 5HP1A 3VERA 1OH5A 1ZC6A 4J2BA 3H1QA 5KTQA 2O8BA 1NU0A 2VWKA 4BQLA 4DTPA 5CY4A 1KFSA 2OZMA 4E1JA 1JJ2M 1FK9A 3G0ZA 1P90A 3O08A 4BRFA 3O4NA 3QICA 3P38A 1EWRA 5I9EB 4CZFA 5C25A 3SV4A 3RR8A 3WQTA 2B6AA 5EXWA 2QWLA 4BR2A 4C8OA 5AR0A 5FPEA 1JCEA 4CERA 1HNXK 3ZEUA 4CHYA 3O9SA 4CZLA 3CMAN 2QWMA 4J2AA 4FO0A 2P9LA 4RW9A 3O3HA 3LP2A 1K8KA 3A5OC 4JRPA 3L4IA 1NGGA 3SUPA 5TKWA 1QSSA 1EP4A 1VSMA 2E6LA 3WXJA 3D2EB 1D8YA 4CHPA 4FK0A 3THVA 3HL8A 3L2RA 4DUYK 1RTDA 3LDQA 3OBWA 3QNOA 1KVCA 3CMEN 2WOMA 4FPBA 4E7IA 4BRMA 2F8TA 3ZT4A 3CI5A 3TWHA 3C7NB 2B5JA 3WXKA 1BL3A 1RDWX 4Z4EA 3OHRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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