4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
4RWTA 3R6MA 4EFHA 1ATRA 2ASMA 4FWLA 4ISGA 2ZWHA 5BPMA 3FE1A 3DWLA 3GG4A 4HTLA 5EOYA 4WQ5A 2HF4A 2CGJA 4PKHA 3EKSA 1SAZA 3C7NB 3H6EA 3AAQA 4B9QA 3RSEA 3VEWA 2IVOA 3LDPA 4CZEA 5AR0A 1LCUA 4BR4A 5AFUH 4FSVA 3U8XA 4JHDB 5KQ8A 2A40A 3L0QA 3VGKA 4CZHA 4FPAA 1E4FT 5AQRA 3CETA 3DXMB 2YHXA 5B8HA 2ZGZA 4H0XB 3CJCA 4CBUA 4B1XB 3ENOA 2UYTA 4CBXA 4GY2B 3FZKA 5JLHA 3VEVA 4BG9A 4ISFA 3ENHA 3IMXA 4K43A 1ATSA 1HKCA 1QQMA 3VERA 1IJJA 4BRCA 4WQ5C 5AQJA 2QWRA 5LJVA 5BN9A 3EN9A 3U9DA 2FSKA 4MLHA 3OHRA 4M7XA 3ZEUA 4CZIA 5AZIA 3QMLA 1YAGA 5AQXA 3ATUA 1U6ZA 4BQLA 2CGLA 3HZ6A 3UKUB 5EXWA 4FWOA 4QS8A 1HLUA 1NM1A 3O80A 1SZ2A 2GEMA 2GUPA 4IWVA 4BRMA 3VEXA 2CGKA 4FO0A 5KPZA 1V4TA 4MO5A 3WXKA 4BRIA 2ASPA 3UE5A 3H45C 1WOQA 3D2FA 4M63C 4EIAA 4Z94A 1NGBA 4BROA 4B1VA 2Q31A 1NWKA 2GELA 3JS6A 5BREA 1K8KA 3RSEB 5KQDA 2A5XA 4MO4A 4DHYA 1YUWA 3ZETB 3VESA 2P9IB 4CZJA 3D7EO 4ISEA 4IJAA 5TKYA 1HJOA 3LDOA 1NGCA 2YCHA 2Q0UA 3CJ1A 3GDQA 1NGDA 3IFRA 1NGGA 3AAPA 4H5NA 1R59O 3WXLA 3I8BA 2EWSA 5JICA 2AP1A 2YJEA 2Q2RA 5AQHA 4H5TA 5AQMA 5AQQA 4BC2A 4LC9B 1NGEA 1E4GT 2J4RA 1TUUA 4CD3A 1NGJA 5FPDA 2Q1NA 1BUPA 4CBWA 3WXIA 4H0OA 3O08A 4K42A 3LDLA 1GLBG 4BR7A 4BRGA 1QQNA 3W3DA 1TYQA 2IVNA 3CJAA 2P9PA 5AQFA 4Y0WA 4BRAA 1BG3A 2VYPA 4BRFA 5AQKA 4FOEA 4FL9A 4DQ8A 3LM2A 3IUCA 4NO7A 5FPNA 2D0PA 5FPMA 2Q97A 2YHYA 4BG8A 5AQVA 3UKUA 3A0IX 1P8ZA 2NLXA 2P9NA 3MN5A 4PL8A 4CZMA 3LL3A 3D2FB 3BUZB 3WT0A 3VGMA 3VF4A 5BRHA 5AZJB 2FSJA 1MA9B 4A61A 1K8KB 2FF3B 2PBDA 3M3ZA 1JCGA 1HPMA 2HMPA 2D4WA 1BO5O 1DGKN 3H3OB 3QICA 3EKUA 4K41A 2YHWA 3VEZA 5ADXH 3MMVA 3HM8A 3MN7A 4FOIA 3HTVA 3VEOA 4F9OA 3HSCA 3ZETA 4E1JA 5FPEA 2YI1A 3P4IA 3FGUA 3FZFA 4PL7A 1BU6O 3CJ9A 3CIPA 3CJ7A 3VENA 3WQTA 3DXKA 1DKGD 4H5WA 2W41A 2QWOA 4H5RA 2H3GX 1BWFO 1XC3A 2E1YA 2QXLA 2WUSA 4DCHA 4FWRA 4EHUA 4JAXA 3CQYA 1TYQB 3GE1A 3O6WA 2P9PB 3CQXA 3VETA 4M7YA 4BC4A 4BRLA 2GWJA 1GLFO 2QW9A 2ASOA 3QBXA 2NZTA 1GLDG 1YVNA 2VCPA 3A8YA 4BC3A 1KAYA 3ID8A 3H3NO 4BREA 3MCPA 1GLLO 2P9NB 4AM6A 1T6CA 2OANA 2V7YA 1BA0A 3B8AX 4A2AA 2NRHA 3FFKB 1Z6RA 1XQSC 1QZ6A 1G99A 1HKBA 3HBTA 2GTDA 1RGIA 3TPQA 3EO3A 3CJBA 3SLCA 2Q0RA 1JCEA 1HKGA 2ITMA 5ADXA 1GLJO 4A62A 5JLFA 2F9TA 2E20A 5AZJA 4C23A 3VPZA 4O5FA 3CERA 2VWBA 1U2VA 4EAHD 3KVGA 1ATNA 3O1BA 2F9WA 2QWLA 2P9UB 3MN9A 3VF6A 4EHTA 4I6MA 4YDUA 5AFUA 3QBWA 4AM7A 3LDQA 3BEXA 3TU5A 5F2RA 3F9MA 2FLOA 3ATVA 3EL2A 2E2QA 4XH5A 3LDNA 4KBOA 2P9KA 1BDGA 4A2BA 1Q18A 3GBTA 3O4WA 1KAZA 2E2PA 3U9ZA 3DXKB 1S3XA 1NGHA 1X9JA 5CE3A 5EX5A 4BR2A 3AY9A 3FZHA 4CZGA 4JNEA 3LM9A 4BRQA 3EZWA 2BUPA 4FWNA 3UKRA 3ZX0A 2PAVA 1JCFA 4IJNA 1ZC6A 4GNIA 3O8MA 4IZ9A 3VGLA 4J8FA 5BPLA 4CJ7A 5AQIA 3ULEB 1RDWX 3ZX3A 1NMDA 1KAXA 4YDUC 2FSNA 4RTFD 3QFPA 2E1ZA 4CZLA 1J6ZA 2A6AA 3GL1A 4BRHA 2BTFA 1MWMA 1T6DA 2CH6A 3G25A 3O1WA 4B1WB 2ZGYA 3SMPA 4JD2B 1GLEG 3KZBA 1U2VB 1C0GA 3DJCA 4XH4A 4BRPA 4H0YB 1SQKA 2CH5A 4WQ4C 4BR0A 4I6MB 3SMSA 1LOTB 4BRNA 1IG8A 3MN6A 2A42A 2P9UA 1NGAA 2QWNA 3D2EA 4B1UB 5AQOA 5BRDA 1YXQA 2P9KB 4BRKA 1X3NA 3L4IA 3FR0A 5LJWA 2HOEA 1EQYA 1BA1A 3L6QA 3R8EA 3QB0A 5AQPA 4L3QA 1ZXOA 3A5LC 3MDQA 1XUPO 4PKIA 1ESVA 3SJHA 3VOVA 5BN8A 4O8KA 2E88A 4FPBA 5EVZA 3UKRB 5BR9A 4H5VA 2DPNA 3FLCO 2I7PA 5AQGA 3QDKA 1NLVA 3WEEB 3ULEA 2P9LB 2E8AA 3WXJA 5JMVA 5BPNA 5F1XA 2D0OA 4H03B 5AQTA 1QZ5A 1OKJA 1RFQA 1QHAA 5KPRA 3O5BA 2E2OA 5AQSA 4BGAA 1GLAG 1ZBSA 1Y64A 3MK6A 5KPTA 3J8AA 3I33A 4H0VB 2QWMA 3VEYA 4CI6A 3AARA 1MDUB 4QS7A 2A41A 1BOTO 1T44A 3S41A 4JD2A 2D1KA 4HWIA 3KHYA 2KHOA 4DB3A 1X3MA 1WUAA 3D2EB 4B1YB 2W40A 4FWMA 4BVPA 3R9PA 1HUXA 2P9SA 2V52B 1Z05A 3A5NC 4K25A 3A5MC 5AQLA 4QS9A 4CZFA 4RCHA 2IVPA 5E26A 2P9IA 2Q36A 4BGBA 3JXUA 3FZMA 4BC5A 4CZKA 4H0PA 3DAWA 3VF2A 3BF1A 3IDHA 1GLCG 1S22A 3SK3A 3A5OC 4BVOA 4NB4A 1V4SA 3HI0A 5AQZA 5AQUA 1MWKA 4JN4A 4WQ4A 1KXPA 3BF3A 5AQNA 5EY4A 3H46O 3GOIA 2A3ZA 2V7ZA 5LY3A 2FF6A 3H1VX 2I7NA 3C7NA 4FWQA 2FXUA 4FWKA 3ZX2A 2GWKA 4XH1A 1TUYA 5F0XA 4BR9A 4BRDA 1NGIA 3CI5A 2HF3A 3WUHA 4JHDA 5ELZA 1HX1A 5BRFA 5AQYA 3M6GA 3FZLA 2QM1A 4PKGA 3WEEA 3DXMA 4FWPA 2YJFA 5I9EB 2P9LA 1CZAN 4CD1A 3M1FA 4BR5A 2ZF5O 4WYBA 1D4XA 2QWQA 4B1ZA 2AA4A 1C0FA 2E2NA 4MLEA 3C0BA 3ZEUB 5AZIB 1H1VA 3W0LA 2IIRA 3CHWA 1NBWA 4IO8A 3WQUA 3U4LA 1NGFA 3QFUA 1QQOA 3UB5A 4BQZA 4FWSA 5E84A 2P9SB 4XEIA 3H1QA 4IXCA 2V51B 5AQWA 2QWPA 4H0TB 1DEJA 3BP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q82O 3JAMO 4RWTA 5M1KA 3RMDA 3NVKA 2QKBA 5GIPA 1TAUA 4FWLA 4JYAK 5BPMA 2GX9A 3CG7A 3DWLA 5C15A 1EO1A 2OTJN 5KI6A 2HF4A 2CGJA 3TSUA 4LSNA 3E66A 1Q81O 3AAQA 4B9QA 4IOAL 3KLGA 1T8EA 3TABA 3ZSWA 1OVQA 3RTVA 4DU3A 4FSVA 1S9GA 3VGKA 4CZHA 4E7JA 2KZMA 5AQRA 4C1NI 3NBPA 3EE9A 5GAEP 5CZ2A 4H4MA 3AVAA 3FZKA 2D0CA 1BI4A 4BE1A 3IMXA 2OTLN 2O8CB 3LPUA 5J2MA 4Z4IA 3VERA 4JKAA 2QWRA 5SWMA 3EN9A 2FSKA 4QAGA 3C6TA 3QMLA 1YAGA 4M3RA 1U6ZA 4RW7A 2ITGA 4OO1J 4QS8A 4A5BA 4GKJK 2GUPA 3VQQA 4IWVA 4OX9K 2RKIA 5KPZA 3CC4N 3QETA 4YOVA 2RN2A 2ASPA 4M63C 1WSGA 1VQMN 1KCFA 4DV4K 4KI6A 1GOAA 4KH6A 1XC9A 3HRGA 1KD1O 4DF4A 3VESA 2HHWA 4CZJA 4B9NA 1U47A 2D5RA 4ISEA 5HOOA 1O1WA 1RT3A 4DTSA 3HVTA 1HJOA 3LDOA 4J2BA 3CJ1A 1WNSA 4DFMA 4H5NA 2VQEK 2QI2A 2O4IA 2AP1A 2DFFA 4QCLA 5AQQA 1WSHA 3OYFA 1NGJA 2XO7A 4B9UA 4AHUA 2HHTA 4BR7A 3LDLA 1TYQA 3VQ5A 2BANA 4DLGA 4BRAA 4CJQA 4JI5K 2ZJPL 1A5XA 4FXDA 5AQKA 4FOEA 3PX4A 4HTUA 3ZSVA 3VA3A 1ZBHA 3NF6A 1X9MA 2Q97A 4ID5A 2P5OA 2KFZA 4DR7K 2NLXA 3MN5A 4PL8A 3D2FB 4W5OA 5LMUK 3CPEA 4HUEA 4NYFA 5BRHA 5AZJB 4A61A 5JVHL 3M8QA 1HPMA 3AVMA 5M1PA 3QO9A 3VQCA 3TARA 1DGKN 2O8DB 3H3OB 3PUFA 4K41A 4E3SA 1G15A 1JL2A 4DSEA 3HTVA 3V6DA 2B5JA 3OJUA 4E1JA 2NRVA 4Z4FA 3P4IA 2P51A 3AO2A 1TL1A 2NRZA 2E5LK 4CGFA 3O3FA 4C8NA 4Z0UA 1C0MA 3WQTA 1VSMA 3DXKA 4YFUA 4H5WA 5KGWA 2QWOA 3PV8A 3NH1A 3OY9A 3SAHA 2E1YA 4FWRA 1IV0A 4JAXA 1W97L 2X74A 4PY5A 3ZSXA 5GAGP 3L3UA 4CESA 4CHZA 3DI6A 1RDAA 2GWJA 1GLFO 3IG1A 4KTWA 1TKTA 3HPGA 3QBXA 3SUOA 2VWKA 5HP1A 2VCPA 2WONA 1N34K 2BGGA 3E1YA 4BC3A 5C25A 1BA0A 3B8AX 4A2AA 3CD6N 3AVKA 1XQSC 3C95A 1HKBA 3HBTA 1RGIA 4CIGA 3CCMN 4FJ9A 4C8MA 5HRNA 1QHTA 3SLCA 4FM0A 1JCEA 2BE2A 5JLFA 1HMVA 2F9TA 2E20A 5AZJA 4O5FA 3CERA 4W5NA 3O1BA 4CHOA 2QWLA 4YOUA 4I6MA 4FW2A 4AH9A 3NFAA 5AFUA 4L8RB 3AV9A 1D9FA 3TAMA 3ZCMA 1EETA 3MEGA 1JLFA 3EL2A 3A2FA 4XH5A 5DM7L 2P9KA 4J2AA 3U9ZA 1KAZA 4RW6A 4IFEA 1T05A 3KLFA 3MX5A 4E19A 3ZT2A 1NGHA 4YOYA 4J2EA 4NLCA 5CE3A 5EX5A 4BR2A 3LM9A 4BRQA 3UKRA 3LAKA 2PAVA 4KHSA 3AVNA 1ZC6A 3O8MA 3RVCA 3HSTB 3P39A 5BPLA 2O8BA 4JEPA 3DMJA 4Z4CA 1KAXA 2FSNA 3G71N 1J6ZA 2ZQBA 3MXIA 2Z1JA 1VSFA 4BRHA 1T6DA 2CH6A 4CEAA 3O1WA 2HMIA 3THYA 3HPHA 3SAFA 3KK1A 3K0SA 3KZBA 4IO9L 1U2VB 3VA0A 4XH4A 1JXBA 4DSIA 4BRPA 2UU9K 4BR0A 3TAQA 3MEDA 4FJJA 1L3VA 4RW4A 1LAVA 3BY5A 3JYTA 2KQ2A 2HBKA 4ZTFA 1NGAA 4B1UB 4JV5K 1RT1A 3OYMA 4B3TK 1NK0A 3L4IA 5LJWA 1IH7A 3F9KA 3NGYA 3SI6A 1BA1A 2ZM6K 5AQPA 4LF5K 4N5SA 3NGIA 3MDQA 4ELVA 1JKHA 1WAFA 3EEQA 3S3OA 4JKEA 4BWMA 3DLRA 4FJIA 1Z25A 4E0DA 3DLGA 3ID6A 1KC8O 2IGIA 3IS9A 3QDKA 2UXCK 3DOLA 5M1QA 3G6EN 1TVRA 3Q7CA 4WCEL 3O9UA 2E8AA 3OYCA 4H03B 5AQTA 2JLEA 4FJKA 5HLFA 4DUZK 2GV9A 5AQSA 4CGHA 4CGIA 1GLAG 3IAYA 3L3VA 5KPTA 4FJGA 1MDUB 4M3YA 3S41A 1REVA 4LF8K 3LP1A 2KHOA 4DUYK 1IBMK 4CK3A 3D2EB 1DTTA 2WFBA 4CJKA 1HNIA 3G0ZA 3ZLJA 1HUXA 4O55A 1NK4A 2JGUA 4B3MK 1B92A 1J53A 4CZFA 4BE0A 4RCHA 1U04A 2FBYA 2Q36A 4BGBA 3J7ZO 3L2VA 1I3AA 1TAQA 3SQ2A 4H0PA 5CR4A 3BF1A 5J2NA 1S22A 3SK3A 3V9SA 3D45A 1N6QA 1V4SA 3HI0A 1TKXA 3OS0A 3MX2A 4WQ4A 3AVBA 3QNOA 3V9ZA 1KXPA 5AQNA 4CHNA 4B8CA 4CJWA 4AHRA 4PWDA 3GOIA 2A3ZA 2V7ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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