4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
b'PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
5AQNA 3U8XA 4CZLA 1XC3A 1ZC6A 1ZXOA 1MWKA 3I8BA 4FWOA 3KHYA 4CZKA 5AQSA 1J6ZA 4DQ8A 2AP1A 4H03B 4FOIA 2ASPA 3FZMA 2I7PA 3VERA 4C23A 1LCUA 1H1VA 1BA1A 4JD2A 3O1WA 4M7YA 5TKYA 3O5BA 2V7YA 2QXLA 2V7ZA 4BC4A 4DCHA 4H5NA 4FO0A 4BR4A 2P9PA 1S3XA 4FWMA 3M6GA 3F9MA 3SJHA 2E1ZA 1GLEG 3FZFA 1V4SA 3L6QA 1NGBA 4JHDB 4MLHA 2P9KA 1BA0A 1GLJO 1K8KB 2W40A 5ADXH 2QWLA 1QQNA 3WEEA 1QZ5A 3QB0A 3ZEUA 5JLFA 1ATNA 3IFRA 4A2BA 4CZMA 2AA4A 2P9IB 3H6EA 3ZETB 5AQIA 2YI1A 3FZKA 2GTDA 4MLEA 1NGEA 3QDKA 4O5FA 1U2VA 1X9JA 4J8FA 1NLVA 5E26A 2FLOA 3AARA 3VEWA 2YHXA 2ZF5O 3U9DA 3D7EO 3SMSA 1XUPO 3LM2A 5AR0A 4K25A 1KAZA 1Y64A 3P4IA 1YXQA 3IMXA 1BG3A 3H1VX 4IJNA 2CH5A 1T44A 2A6AA 2GELA 3BP8A 3VPZA 4BG8A 1HKGA 2GUPA 2P9NA 3EKUA 4BR9A 2QWQA 5KPZA 1DEJA 2UYTA 3CETA 5FPMA 2YJEA 4F9OA 5LJVA 5JMVA 2ASOA 3DJCA 5LY3A 4FWQA 4JN4A 3CIPA 4FWNA 5EOYA 3A5OC 5BN8A 1P8ZA 1KAYA 4CZHA 5AQGA 4CZEA 1NGDA 5AFUH 1HKCA 3MK6A 3H3OB 3FZHA 3C7NA 1Z6RA 3MN6A 4H0VB 4BQLA 3WEEB 4BRCA 4CD3A 2YJFA 2VYPA 3L0QA 4H5WA 4JNEA 4GY2B 5AQFA 4CBXA 2E8AA 5AQRA 4PKIA 4JHDA 2F9WA 1K8KA 4BGBA 1D4XA 4H5VA 4IZ9A 4BVPA 4FSVA 4QS7A 4EHUA 3HZ6A 3WT0A 1BWFO 3O6WA 2FXUA 4BR0A 2YHWA 1T6DA 2P9SB 5AQXA 1TUUA 3ZETA 4I6MA 5I9EB 3TU5A 5AQYA 3DXMB 1LOTB 4CZIA 5KQDA 4EAHD 3WUHA 4BGAA 5BREA 1NGFA 2QWRA 3BEXA 5AQWA 2WUSA 3ZX0A 3L4IA 4FL9A 3S41A 1SZ2A 1NGHA 1NGGA 2P9NB 1BOTO 3BF1A 2VCPA 3I33A 2QWPA 3UB5A 2QWMA 4JAXA 4M63C 3G25A 1E4GT 3IDHA 2E88A 4BROA 5B8HA 2E2PA 3R6MA 1TYQA 4IWVA 5AQMA 1IJJA 3VEZA 2E20A 2BUPA 2FSNA 1SQKA 5AQVA 5JICA 1NGIA 3A5MC 3FFKB 1JCGA 3QICA 1KAXA 3C7NB 3VF6A 5BN9A 2P9LB 3SMPA 2HMPA 1YUWA 5EX5A 5AQPA 4BRMA 5KPTA 4WQ5C 3RSEA 4FOEA 2ITMA 4B1XB 4WQ4C 2IIRA 4PKGA 2FSKA 3VGKA 4AM7A 3CJ1A 4RWTA 3KZBA 3VETA 4BRPA 4CBWA 4DB3A 3H46O 1GLAG 4ISFA 4LC9B 5AQOA 4ISEA 4BR7A 1NGJA 3DXKB 1GLDG 3LDQA 4B1WB 3FGUA 4I6MB 4Y0WA 3VGMA 4EHTA 3CQYA 1R59O 1Q18A 2ZWHA 3CJBA 3VEVA 4PKHA 3H3NO 3M3ZA 3VOVA 4BC2A 3VGLA 5KQ8A 2Q1NA 2P9SA 1MA9B 2FSJA 2IVOA 5F1XA 3HBTA 3O80A 4AM6A 3DXMA 4BRFA 2GEMA 1TYQB 5EVZA 1MWMA 3HSCA 4MO5A 2V51B 3CJAA 3W3DA 1CZAN 1JCFA 1QHAA 2Q36A 1TUYA 4BREA 5ADXA 4FWLA 5AQUA 3AAPA 3MN5A 5BPNA 1DKGD 3UE5A 1QZ6A 3BUZB 4H0OA 3ID8A 3D2FA 1X3NA 1ATRA 2E2NA 4DHYA 1RFQA 4CZJA 4RCHA 3AY9A 4YDUC 1JCEA 2D0PA 2CGJA 3UKUB 3RSEB 2Q97A 3VENA 1RGIA 2A40A 3M1FA 2IVNA 1S22A 4M7XA 4CBUA 1NBWA 2ZGZA 4B9QA 3A8YA 1BUPA 4BRDA 5BRHA 2P9LA 2GWJA 5BR9A 4E1JA 4WQ5A 2OANA 3CERA 3D2EB 4QS8A 3GL1A 3ZX2A 4O8KA 1ZBSA 3AAQA 3O08A 2NZTA 4XH5A 1C0GA 4CI6A 2GWKA 2BTFA 4FPAA 5BRFA 1GLFO 3MN7A 3ENOA 5BPLA 2ZGYA 2PBDA 4L3QA 3VESA 3DXKA 3A5NC 1OKJA 5FPDA 5E84A 1HLUA 5AZJA 3GBTA 3O1BA 3EKSA 5EY4A 2A41A 2QWOA 4CZGA 4BRGA 3DAWA 2E2OA 2A3ZA 5AFUA 4H0YB 3R9PA 4GNIA 3QMLA 5BRDA 2CH6A 2FF6A 2EWSA 4A62A 1GLBG 4FWKA 4K42A 5JLHA 2NLXA 3ULEB 3VEXA 3CQXA 3D2FB 3OHRA 3QFUA 4Z94A 3FLCO 4NB4A 2A5XA 2H3GX 2VWBA 2HF3A 2HOEA 2KHOA 1C0FA 1HKBA 4IO8A 4H5RA 3WQTA 2I7NA 3KVGA 3GDQA 1YVNA 2P9UB 1IG8A 5AZIA 4IJAA 5AQTA 2HF4A 4H0PA 3TPQA 2QM1A 4BRAA 2FF3B 2D1KA 3UKUA 3ZX3A 1ESVA 1XQSC 4BVOA 1NGCA 1U6ZA 1NGAA 3O4WA 3WXIA 3LM9A 1KXPA 2A42A 3ENHA 3WQUA 5AQQA 1HJOA 3GOIA 3WXLA 4NO7A 3EN9A 3LDNA 3D2EA 1Z05A 3LDPA 2QW9A 4HWIA 3ATUA 4QS9A 2Q2RA 5AZJB 1E4FT 4BR5A 2Q0RA 3CI5A 4BC3A 3SK3A 2CGLA 3UKRB 1YAGA 1MDUB 3H45C 3LDOA 4PL7A 3O8MA 1NMDA 3HTVA 1BDGA 1QQOA 2W41A 1GLCG 3U9ZA 3U4LA 4ISGA 4BRKA 5AQJA 3CJCA 5AQKA 5F0XA 3WXKA 4BC5A 3CHWA 4BRQA 4B1UB 4B1VA 1HX1A 3JS6A 3GG4A 2D4WA 2E2QA 3EZWA 3A5LC 3EO3A 4CZFA 3ULEA 3J8AA 4BR2A 5AZIB 5AQLA 2NRHA 3LDLA 4FWSA 4XH4A 3VF2A 4H5TA 4BRHA 1EQYA 3EL2A 2QWNA 2IVPA 2YHYA 2Q31A 5EXWA 3R8EA 5AQZA 2D0OA 3GE1A 4BRIA 2P9UA 1G99A 3QFPA 3C0BA 3DWLA 1ATSA 4EIAA 4FPBA 5KPRA 3VEOA 4IXCA 3VEYA 1BO5O 3H1QA 5BPMA 2PAVA 3JXUA 4JD2B 1SAZA 3WXJA 3LL3A 4WQ4A 3MDQA 2CGKA 4K43A 2DPNA 2P9PB 4XH1A 3CJ7A 2J4RA 5FPNA 3VF4A 2E1YA 2P9KB 2YCHA 4CD1A 4H0TB 4HTLA 2Q0UA 1HPMA 4A2AA 4RTFD 3QBXA 1GLLO 4PL8A 2V52B 4WYBA 1X3MA 3FR0A 1WOQA 3ZEUB 4BRNA 4BRLA 4B1YB 1HUXA 4EFHA 4XEIA 1BU6O 4FWRA 4FWPA 3UKRA 3MCPA 1RDWX 3A0IX 1NWKA 1U2VB 3MN9A 5LJWA 4H0XB 4MO4A 1QQMA 1V4TA 5F2RA 3FZLA 4B1ZA 4CJ7A 2F9TA 3BF3A 2P9IA 5CE3A 3IUCA 1NM1A 3MMVA 3HM8A 3QBWA 4BG9A 3B8AX 4KBOA 3FE1A 3CJ9A 3SLCA 2ASMA 4BQZA 5FPEA 4K41A 5AQHA 4A61A 1DGKN 3W0LA 3ATVA 1WUAA 3HI0A 1T6CA 4YDUA 5ELZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U8XA 4CZLA 3NH1A 4FXDA 4CZKA 3KTQA 1J6ZA 4DQ8A 3K5OA 3QLHA 4M3ZA 1VSKA 4FOIA 3E9PA 1D5AA 3VERA 1LCUA 5M1FA 2V7YA 3UIQA 4A5AA 4DCHA 4H5NA 4PA1A 2ZQBA 1UA0A 1SL1A 3J7AP 4F2RA 2PZSA 2ZJRL 3F9MA 1GLEG 3DI6A 4MLHA 1SL0A 4BDPA 2W40A 4CJTA 1TKTA 1BI4A 4QAGA 2UXDK 2HBKA 3ZEUA 4OKJA 3KWGA 4E3SA 3KLHA 5LMNK 3HK2A 3SUOA 4O5FA 5E26A 3AVKA 2O8DB 1NJXA 3U9DA 3D7EO 3ULDA 3MECA 4OPJA 3NGZA 4EP5A 3RMBA 1KAZA 4M3TA 3DLKA 1BG3A 4IJNA 2GELA 2IS3A 3BP8A 4I2QA 1HKGA 4BR9A 4AQYK 1IKXA 4F4KA 1HR0K 3SV3A 2UYTA 5C10A 4DS5A 1FJGK 4Z0UA 4B3RK 4CECA 3LAMA 3VA3A 4KV8A 5JMVA 2P5GA 3NVKA 4JN4A 4IFEA 4CIGA 2OPQA 5EOYA 3A5OC 2O8EA 1P8ZA 4M41A 4C8NA 5T7BA 2KFNA 4CZEA 3F73A 1NGDA 4CJPA 3HOTA 3MK6A 3H3OB 4KTQA 1KLMA 4BQLA 3WEEB 4CJRA 4M3WA 4BRCA 4B9SA 4O8UA 4H5WA 3OYEA 4KH4A 3V9XA 4IG0A 5AQFA 1HRHA 5AQRA 1RT6A 4CHOA 4RW6A 1VQ4N 1K8KA 1D4XA 1JLGA 4JI0K 4CF1A 3L2QA 4EHUA 1NNEA 4W5QA 1BQNA 4CJ3A 2P51A 2YHWA 1T6DA 2P9SB 1C1CA 5AQXA 4DU1A 3T1AA 4I6MA 4LSLA 3TU5A 1J9AA 3DLGA 5KQDA 1U45A 4EAHD 1IKYA 4JK7A 1DTTA 3TWHA 1XI1A 3BEXA 5AQWA 4U7BA 1SZ2A 1HYVA 1NGHA 3THWB 3UB5A 2QWPA 4JAXA 4BROA 2E2PA 4FVUA 2I5JA 1NKEA 3VEZA 4CFAA 3THVA 3N4PA 2X6NA 1YITN 3A5MC 4E7LA 2O8BA 1JCGA 4CEEA 3AVIA 5I42A 2HHQA 2UUAK 3WXMB 1UWBA 3VF6A 3AO3A 2P9LB 5GADP 1EWQA 4DLEA 4AHRA 3HVRA 5KPTA 3ZT3A 3RSEA 2ITMA 4IFVA 1I94K 2YHBA 3V9SA 3VGKA 3K59A 4DB3A 4DKWA 4HCCA 4A59A 1RDDA 2BH1A 1GLDG 4A57A 3LDQA 4IFYA 5BR8K 2HNZA 3FGUA 3OYGA 3D6RA 4CF9A 1ZYQA 4LF4K 1NK8A 1IKWA 3Q7BA 3CQYA 1REVA 3SBGA 4KHPK 1HNXK 3QIOA 2ZWHA 4F3TA 1TAUA 4M3RA 4F8RA 3KLFA 2XY8A 2Q1NA 2IVOA 2HHXA 4FJJA 1BIZA 2XRIA 3DXMA 1TYQB 3HM9A 4EZ6A 5EVZA 1RT5A 4MO5A 3J7ZO 3CJAA 3C6UA 1WSFA 1QHAA 1U4BA 5ADXA 1NK5A 4FK0A 1TL1A 2HHWA 3AAPA 3MN5A 4IEEA 3TSPA 2KTQA 3UE5A 1QZ6A 3CMAN 3TAQA 1TVRA 1VQ6N 3K58A 1C1AA 5JVGL 1XMQK 2HNYA 3AY9A 4YDUC 3HT3A 3OY9A 1ZBUA 4YOWA 1HNWK 4CBUA 3C6AA 4BACA 4E1JA 4WQ5A 4LFCK 2OPPA 4HUGA 3QEPA 2FBYA 5FDLA 4DF4A 3CERA 3NH2A 3GL1A 3ZX2A 3O9QA 3AAQA 2KZMA 2DFEA 2O8CB 1LAVA 2GWKA 2D0AA 4OKKA 5J2QA 2BTFA 3M8RA 4YOVA 1GLFO 3MN7A 3M8PA 3CCLN 2ZGYA 3NVMA 3DXKA 3PO5A 2HHVA 1RTDA 5DM7L 2A1RA 2E2OA 4JI2K 4B9VA 1IKVA 1DT9A 5AFUA 4J2BA 3R9PA 5BRDA 1MU2A 4EZ9A 4OGEA 1EETA 2FF6A 4C8KA 1GLBG 4K42A 2NLXA 3VEXA 1ASVA 3PX4A 3D2FB 1YJWN 4Z94A 3SV4A 2H3GX 2VWBA 1HKBA 3E1YA 1XWLA 2F8SA 2P9UB 1IG8A 1NK6A 2GV9A 5AQTA 3C94A 2HF4A 4QOZB 4HHTA 1KFSA 3LDSA 1LW0A 2QM1A 4V19S 3V4IA 2D1KA 3KD1E 4Z4IA 2O8FA 3ZX3A 1XQSC 4BVOA 3T19A 4BE1A 1YI2N 1KVAA 3P31A 3CC4N 2HB5A 2HSTA 4NO7A 5C0YA 1N33K 1X9WA 4DTNA 4B8CA 2Z1JA 3CI5A 3BY5A 2QKKA 1QQCA 1TV6A 4RW9A 5FROA 3CCRN 3IS9A 4X65K 3H45C 1NK9A 3O8MA 4Z4HA 4G9ZA 3U9ZA 4DR4K 2UUCK 4JI6K 2VGNA 5AQJA 3T1HK 4CEBA 3CJCA 3MEDA 1Q9YA 3K5MA 5F0XA 2XY5A 2YKMA 5AJ3K 1HX1A 3SQ0A 4FW2A 3JS6A 3HPOA 1RCHA 3IKMA 1UAXA 3J81O 3GG4A 1K73O 4LY7A 2B6AA 2E2QA 3EZWA 3OS1A 3HP6A 4DTUA 1K9MO 3ULEA 3K9JA 4PWDA 4Z4EA 4DTSA 3THXA 4GKJK 1RT4A 3EL2A 2IVPA 4BRIA 1VQ5N 3ALYA 3DWLA 4FPBA 4KH5A 5CZ1A 2Z1IA 3CM6A 3NDKA 2BANA 4J2AA 4WQ4A 3E66A 2CGKA 4CHPA 1I39A 2DPNA 1FKOA 2XHBA 4DSEA 4YOXA 2G8KA 5I3UA 2WBNA 5C2DA 4CD1A 3QBXA 5C24A 3V81A 4DFMA 2YNFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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