4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
2YHWA 2E2PA 4J8FA 2FF6A 4EAHD 2D4WA 3CJ1A 4BC3A 2ASOA 1GLFO 4FL9A 4IO8A 3MK6A 2HF4A 4JHDA 3ZEUB 3SMSA 2YHXA 5E84A 3O4WA 1HKBA 4JD2B 1DGKN 1NGJA 4JN4A 1TUYA 3VESA 4BRNA 4BRPA 4I6MB 3VPZA 1NLVA 1GLEG 3EL2A 2IVOA 3MN6A 3RSEB 1X3NA 3DJCA 4WQ5A 3WUHA 4IZ9A 3AAQA 3WXLA 2QWQA 2AP1A 5AQSA 1S22A 4H5NA 4CD3A 2PBDA 2E8AA 2GTDA 2IVNA 5AQMA 3HTVA 2QWOA 4K41A 4EFHA 3FLCO 5EXWA 5ELZA 1KAZA 4BROA 5KQDA 3LDLA 3LM2A 3AAPA 3D2FB 1BA1A 2P9IB 4BGAA 4FWMA 1GLAG 2HF3A 1DEJA 2QWNA 3AY9A 2Q0UA 3TU5A 3H1VX 5AQHA 2DPNA 1E4FT 1CZAN 2NRHA 2ASMA 3H46O 3L6QA 4FWRA 3O1BA 1LCUA 2D1KA 2CH5A 3R6MA 1YUWA 1KXPA 1QZ6A 3MN7A 2P9SB 5AQUA 3O08A 3C7NB 3VGMA 5AQRA 3CHWA 2W40A 4DB3A 2P9KA 3IMXA 2FF3B 3JXUA 1C0GA 1BOTO 4CZJA 3VGLA 5EX5A 5B8HA 2ZGZA 4BR5A 3U4LA 3ZETA 4FWLA 4PL8A 4BRCA 5EY4A 3LDOA 4QS9A 3FZFA 4HWIA 4A2AA 4CZIA 3CQYA 4CZEA 1MWMA 3MCPA 4B1XB 3C0BA 4CI6A 4K42A 4FSVA 5BRHA 1NM1A 4MO4A 1BWFO 3UKUB 5KPRA 4H0OA 3M1FA 3W3DA 3VF4A 3FE1A 3O5BA 4RCHA 1KAYA 3FZLA 4B1VA 5BPNA 1T44A 3I8BA 5BPMA 5LY3A 5LJWA 1MA9B 3VEVA 3EKSA 2A6AA 2WUSA 2P9PA 3ENOA 4IWVA 5AQXA 3GG4A 3LDNA 1GLBG 3R8EA 3H45C 3CJCA 2UYTA 2QW9A 2AA4A 1U2VA 3MN9A 3F9MA 3HZ6A 4A62A 3CI5A 5KPTA 2GWKA 4XH5A 3U8XA 3FZMA 3VF2A 2E2NA 1QHAA 3FFKB 5BN9A 5AQFA 3EO3A 1YVNA 2ZGYA 2ITMA 5LJVA 4CZLA 4BC2A 2GUPA 3WT0A 3VF6A 2FSJA 2YHYA 5AZJA 1K8KB 4CD1A 1JCEA 3M6GA 1XUPO 2ASPA 1Z05A 4JHDB 3A5OC 3VERA 1ATRA 1WUAA 1NGCA 3O8MA 4GNIA 4M7YA 4CJ7A 4BRAA 2E2OA 1H1VA 2A42A 3CIPA 2GEMA 1SAZA 2V7ZA 4BRHA 3DXKA 2D0OA 3WXJA 3MMVA 1HX1A 3GBTA 1S3XA 3QBWA 3WXKA 1GLDG 2IVPA 4H0PA 3DXMB 3ZEUA 4C23A 5JMVA 3FGUA 4FWQA 5KQ8A 4JD2A 3WXIA 1Y64A 2P9LB 4CZKA 1T6CA 3MDQA 4I6MA 1V4TA 4BVOA 2Q36A 3M3ZA 1TYQA 4EHUA 1QQMA 3RSEA 4BG8A 3ENHA 3A5MC 4BR4A 4BVPA 4Z94A 3BF1A 5AQIA 4CZMA 1IG8A 5TKYA 1SZ2A 2A40A 4E1JA 4KBOA 2VWBA 2E88A 3ATVA 2NZTA 4FWSA 2FSNA 1IJJA 2P9UB 2QWPA 4EHTA 3ATUA 3GL1A 4A61A 3D2FA 1RFQA 4B1ZA 2P9IA 4BG9A 5AQWA 2YJEA 3O1WA 1ZXOA 2E1YA 2HOEA 3VEXA 4BR2A 2BTFA 4CZFA 3UB5A 3I33A 4BR0A 5AZIB 1YXQA 3G25A 2H3GX 3H3OB 3CJ7A 3ZETB 4L3QA 4NB4A 2VCPA 5EVZA 1QQOA 2P9SA 5AQNA 3D2EB 5ADXA 3IDHA 2IIRA 3C7NA 1HUXA 5EOYA 2W41A 3WEEB 1BUPA 3LDQA 3QFUA 2A41A 3VEOA 2V51B 5FPEA 2E20A 4BQLA 3SLCA 2GELA 4BRLA 3HI0A 3H6EA 4K25A 2F9WA 3ZX2A 3S41A 3FZHA 2QWMA 4QS8A 4ISGA 4B1UB 3ZX3A 3CJAA 3EZWA 3ZX0A 3KHYA 4BRKA 1C0FA 1Z6RA 4QS7A 3QBXA 5FPNA 3JS6A 2CGJA 5F1XA 4PKIA 2I7NA 2P9NB 4O5FA 1HPMA 4M63C 4ISFA 3CJBA 2ZF5O 4BQZA 4WYBA 5KPZA 5ADXH 4Y0WA 2J4RA 2Q97A 2QWRA 4F9OA 3KVGA 5JLFA 1SQKA 3P4IA 5AQZA 1GLCG 2KHOA 2QM1A 3B8AX 3OHRA 3HSCA 2QWLA 3FR0A 5AQLA 3LDPA 2F9TA 1QQNA 1R59O 4FO0A 4FOEA 3A0IX 4BGBA 3QMLA 5AR0A 3WQUA 1NMDA 3VETA 1HLUA 2D0PA 2YI1A 4BR9A 1JCFA 3FZKA 1KAXA 1MDUB 3A5NC 4H03B 1X9JA 2EWSA 5AQOA 4AM6A 4IJAA 1BU6O 1P8ZA 4YDUA 3CQXA 4EIAA 1NGFA 2Q31A 3UKRA 3ULEA 1X3MA 1V4SA 4A2BA 1BDGA 3DXKB 1NGIA 3VGKA 4BC4A 1K8KA 5BR9A 2V7YA 5AQVA 1ZBSA 3CJ9A 3U9DA 2YJFA 4BR7A 3GE1A 3KZBA 5FPDA 1WOQA 1LOTB 1XQSC 3QFPA 3H3NO 2I7PA 5BRDA 1ATNA 2YCHA 3L4IA 1J6ZA 1OKJA 4K43A 2FLOA 2VYPA 5BPLA 5I9EB 4WQ4C 1NWKA 1D4XA 3CERA 4FWKA 1GLLO 5BREA 3BEXA 1NGAA 2FSKA 4NO7A 1TYQB 3D7EO 1Q18A 4B9QA 4CBXA 3AARA 2BUPA 2PAVA 4MO5A 3DXMA 5AQQA 1HKCA 3J8AA 3ID8A 4FWNA 1NGDA 2NLXA 3VEWA 1BG3A 4DCHA 3BP8A 2A3ZA 2P9LA 4AM7A 2A5XA 4H0TB 4MLEA 1JCGA 3LL3A 4H5RA 3IUCA 4FPBA 4GY2B 4BC5A 3QDKA 3VEYA 3QICA 5F2RA 3H1QA 4JNEA 4DQ8A 4BRGA 2P9KB 2Q2RA 4XEIA 4JAXA 4PKGA 4RTFD 1NGGA 3GDQA 3SJHA 4YDUC 3SMPA 2P9UA 4H5WA 3BUZB 2CH6A 1RGIA 4FWOA 4M7XA 2HMPA 3QB0A 3O6WA 5AQKA 2ZWHA 3HBTA 2E1ZA 5AQGA 3A5LC 1ATSA 5AQTA 4CZGA 4H0YB 2Q0RA 1RDWX 4H5TA 1U6ZA 5AZIA 3VENA 3DWLA 4B1YB 2GWJA 1BA0A 3WQTA 4BRMA 4RWTA 4BREA 3A8YA 2CGLA 3VOVA 1MWKA 1NGBA 1ESVA 3IFRA 3GOIA 2CGKA 1YAGA 1QZ5A 3D2EA 2OANA 5AFUA 1E4GT 4H0XB 3WEEA 1T6DA 4WQ5C 4B1WB 4H0VB 1NGHA 3HM8A 2E2QA 4BRQA 3L0QA 2P9PB 4XH4A 5JICA 3UKUA 4O8KA 1G99A 3EKUA 1NBWA 3UE5A 4IXCA 5F0XA 2V52B 4WQ4A 4IJNA 4CBWA 5AQJA 4ISEA 5AQPA 1HJOA 1U2VB 1BO5O 5BRFA 3DAWA 1GLJO 4BRIA 3LM9A 3SK3A 3VEZA 4MLHA 3TPQA 2P9NA 5CE3A 4BRDA 5JLHA 1DKGD 3U9ZA 3MN5A 5AZJB 4FOIA 4FWPA 5AFUH 4PKHA 4FPAA 5FPMA 4XH1A 1EQYA 4CZHA 5BN8A 3EN9A 1TUUA 1ZC6A 1XC3A 4DHYA 4LC9B 2Q1NA 2FXUA 3O80A 3W0LA 4CBUA 3BF3A 1HKGA 1NGEA 2QXLA 5AQYA 3R9PA 4PL7A 4H5VA 4HTLA 3UKRB 4BRFA 3ULEB 3CETA 5E26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYDA 1UAXA 3AGRA 1GLFO 4IO8A 1VRTA 3SMSA 1RBRA 1XI1A 4J2DA 4BE2A 4DTUA 4C8OA 2HW3A 4BRNA 1KRPA 1NLVA 3PX6A 3OS2A 2IVOA 3MN6A 3VQPA 1U48A 4WQ5A 2VQFK 2RE2A 3HXMA 3AAQA 3O9TA 5KRSA 2UU9K 3DM2A 1HRHA 1S22A 4H5NA 4CD3A 2GTDA 3HTVA 3DLEA 1S1TA 2YNGA 1TK8A 4N56A 3FLCO 4BROA 3H08A 3LM2A 1ZBFA 1X9SA 3G10A 4FWMA 3V9XA 1GLAG 4K8XA 3THXA 4CIEA 1DEJA 3U3GA 1HQUA 3H1VX 2FBTA 2ASMA 1QSSA 4WFBL 1RTDA 2D1KA 3CPEA 1YUWA 1QZ6A 3PIOL 2NRWA 3O08A 3C7NB 1S9EA 5CZ2A 1S72N 2W40A 5M1KA 2P9KA 2VWJA 3T1AA 3IMXA 1LAWA 1TK5A 3LP3A 4CZJA 2EHGA 4IOAL 5B8HA 2ZGZA 3ZETA 3AO3A 1UA1A 4O8UA 1RT1A 4IFYA 1EWQA 5M1FA 1U49A 2BGGA 3FZFA 5EU7A 4KTZA 4CZEA 1HMVA 3CQYA 1MWMA 4DQRA 5BRHA 3NH0A 3O3GA 3KKRA 4JKFA 4MO4A 3CC7N 1KC8O 3M1FA 2NNWA 4CEZA 4ILJA 4CEFA 2BDPA 4JKEA 4FLWA 3OYNA 3TTFA 1T44A 1DT9A 5HROA 4KHSA 4F3TA 2KTQA 1XWLA 4FJXA 5C25A 3EKSA 3ZT0A 2WUSA 4CW7B 5E41A 2P9PA 2F8SA 3ENOA 4I9QA 2F8TA 2W6LA 3GG4A 3B6OA 3LDNA 4C1NI 1J5OA 2UXDK 3H45C 3O3HA 1WAJA 2QXFA 3N4PA 1CXQA 3M8PA 3LDSA 4E7HA 3FFKB 3HT3A 4FVUA 1YVNA 2ITMA 4AHRA 1D9FA 4FK0A 3VF6A 1XNRK 4FJJA 1JCEA 5H1SQ 2ASPA 2RF2A 2RPIA 4DU1A 4CJ7A 3Q7CA 1SKSA 4FM2A 3VTIA 2GEMA 4KHWA 4M3TA 1EO1A 3TAQA 3O9QA 3ZEUA 4DSIA 3ZT1A 2QA4N 3FGUA 4FWQA 5KQ8A 4DSEA 2NRVA 1T6CA 1ZYQA 3SPYA 4CJLA 3M3ZA 1NK6A 4AHVA 1QQMA 3G6EN 2RHKA 1SV5A 4BR4A 1HQEA 3BF1A 5AQIA 3MWTA 4IO9L 2OPRA 5J2QA 4F3OA 3K0SA 4CEBA 2YKMA 4YNQA 2NZTA 1X9WA 3VQ4A 3P31A 2IS3A 3CCRN 1RFQA 2ZQBA 5LMNK 3O1WA 3FFIA 4F2RA 4AHCA 2E1YA 3VEXA 3HOSA 4KB0A 1YXQA 3K9JA 1CXUA 4L3QA 3D2EB 2IIRA 4CJ5A 1EP4A 2W41A 3NF8A 1HYVA 4CCHA 3OS0A 2X6NA 5FPEA 5C2FA 4BQLA 4JKGA 4H4OA 1NKBA 1NK7A 3I0SA 3AA4A 1REVA 3O3FA 5CR4A 4JRPA 4ISGA 2KQ2A 1WBBA 4DV3K 1C0FA 4OVLA 3QBXA 5FPNA 1NK8A 2P9NB 4CJPA 5GINA 3EY1A 1ZBIA 4LH5A 4M63C 1J5EK 4ISFA 5CYQA 4BQZA 1OH7A 4GV3A 2O8CB 1T7PA 5ADXH 3VQDA 2Q97A 3OYEA 4PQUA 1WSIA 5JLFA 1YTAA 5AQZA 4ELTA 4JI4K 3B8AX 4BDYA 1LW0A 2HNDA 2F9TA 1RT6A 1R59O 3R1XA 3ZT4A 3QMLA 5AR0A 3E1YA 4KTWA 1ITGA 3ZT3A 4FLVA 1SL1A 1JLQA 1NMDA 3OJSA 3CCJN 2YI1A 2XY8A 1UOCA 3ENBA 1KAXA 1Q7YO 3V81A 4I2PA 2EWSA 4IJAA 1X1PA 3RMBA 3SUOA 3CQXA 2Q31A 3HRGA 4CF9A 3M5RA 1K8KA 3HOTA 2GBZA 2V7YA 4B3OA 3U9DA 2YJFA 4BR7A 3MX5A 4CJ3A 1UWBA 1RTIA 2PZSA 3O9SA 5BRDA 1KCFA 2F7TA 3M8SA 1J6ZA 3S3OA 5GAGP 4HUFA 2QI2A 3AVHA 2D0AA 2VYPA 4DQSA 2G8WA 3CERA 4FWKA 4FZZA 3ZCMA 1NGAA 1ZBLA 4LF9K 2YNFA 2PAVA 2XO7A 3KK2A 1YJWN 4ICLA 3OYJA 5AQQA 2F96A 5KI6A 1WSJA 1NGDA 2NLXA 4B3TK 1R0AA 3SCXA 4CHQA 2Z1GA 4H5RA 3IUCA 4BC5A 1RT4A 3VEYA 5F2RA 4DQ8A 2P9KB 2G8HA 5CZ1A 1N8RO 1I94K 4C8LA 5DM6L 5IT9O 4FJ7A 2ZE2A 4XEIA 4FW1A 2JWLA 1HYSA 3OYBA 4AH9A 3SZ2A 3K5LA 2YHBA 3D6RA 3SJHA 4CGHA 4YDUC 1RBVA 3SMPA 4X62K 3SUPA 2P9UA 4CFDA 3Q7BA 1W9HA 3K59A 3BUZB 3VTHA 3E9OA 5GIPA 3MWPA 2HMPA 3AV9A 1YIJN 3T7ZA 1WSHA 3CM6A 3HBTA 4N47A 5AQGA 4M3UA 4CGGA 4H0YB 2HHHK 3TAFA 4F8RA 1BGXT 3G4SN 4QOZB 3DWLA 4OKEA 2GWJA 3WQTA 3DI6A 4OGEA 4BREA 4RWTA 2CGLA 1C1CA 3VOVA 1ESVA 1SKWA 3DOLA 2ZM6K 3CCMN 2P51A 3THYB 5GAHP 3WEEA 1T6DA 3NCIA 3VN5A 4H0VB 4N41A 3HM8A 1A5VA 4DSJA 2P9PB 4XH4A 4IKFA 3NF9A 1G99A 2XRIA 1NK0A 1NBWA 3UE5A 4IXCA 3K58A 2V52B 4IJNA 3KLEA 5AQJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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