4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
1C0GA 3MCPA 1C0FA 3EO3A 1WOQA 4XH5A 5BREA 3WUHA 3F9MA 1HX1A 3MN9A 5E84A 4FOEA 5AQRA 1IJJA 4CBUA 3D2FA 4BQZA 4FWLA 5FPDA 4O8KA 4CBWA 3B8AX 3FE1A 3GOIA 3FFKB 4QS8A 4WQ5A 3RSEB 1KXPA 4BGBA 3U9ZA 4GNIA 3S41A 1XC3A 3SMSA 2IIRA 1KAZA 5JLHA 5EX5A 3D7EO 1GLCG 4BRQA 2GUPA 2ZGZA 4H0YB 2QXLA 5LJWA 5TKYA 3VEYA 1XQSC 1NWKA 2KHOA 1T44A 3ZX0A 2QWMA 4K42A 3EZWA 4WYBA 2P9UA 4H5WA 1NGBA 4BRDA 5AQTA 4NB4A 3KVGA 3O8MA 2Q36A 3A5LC 2D0PA 1BA0A 2ASMA 3R6MA 1BWFO 4XH4A 1XUPO 1GLBG 5AQUA 5AQLA 5I9EB 3H1QA 4BRCA 2ZF5O 4DHYA 5BR9A 2QWLA 1X9JA 2VYPA 3SK3A 2BUPA 2OANA 2FF3B 4AM6A 3WXIA 3MN6A 4JD2A 3ULEA 1P8ZA 5KQDA 3LDOA 3JXUA 2FXUA 2CGLA 5EY4A 2GTDA 3BUZB 4H0XB 2D4WA 2Q1NA 4YDUA 3EKSA 1GLEG 2P9PB 2V51B 1RDWX 2HF3A 2HF4A 3BP8A 3EN9A 1GLFO 1DKGD 3VENA 4FOIA 4JD2B 4BR0A 3VGLA 1NGCA 3BF3A 3AAPA 4K43A 3ZX2A 2AA4A 2HOEA 4BR7A 3QDKA 3ID8A 4DB3A 3H45C 4YDUC 4ISFA 2Q31A 3LDQA 4J8FA 3O4WA 2QWPA 2P9UB 4FWMA 4Y0WA 1NGGA 3CQYA 3QB0A 5AQYA 1GLAG 3ZEUA 4M63C 2A42A 2FLOA 4DCHA 4BRFA 1YUWA 2QW9A 5AQHA 4AM7A 1KAYA 5B8HA 2VCPA 3LDNA 3WT0A 4A2AA 3CERA 1T6CA 3ULEB 5EXWA 3DXMA 4IXCA 1YVNA 1EQYA 3FZHA 4BG8A 3O6WA 1HKGA 3EKUA 1TUUA 2P9PA 4FL9A 4A61A 4CZHA 2Q97A 3WEEB 3ZETA 3D2FB 2YHYA 3ATUA 5EVZA 3UKRB 3I8BA 3HI0A 1QZ5A 2YCHA 3QFPA 5AQGA 3EL2A 5ADXA 4M7YA 3DXMB 1MWKA 4H5NA 2ZWHA 4BR5A 4O5FA 4CZEA 3LL3A 4CI6A 1BOTO 3L6QA 2Q0RA 1X3MA 4CZLA 5KQ8A 3WQUA 3U9DA 2E1YA 2Q2RA 5AQNA 1E4FT 5AQKA 1ATNA 3LM9A 3VEWA 4L3QA 3DXKA 1TUYA 2A5XA 2FSJA 3A8YA 4MLHA 3IFRA 4IJNA 4BC3A 4F9OA 2V52B 3VEVA 4BROA 2F9WA 4MO5A 5AQJA 3O1WA 3A5NC 3M1FA 3I33A 4JNEA 5KPTA 4QS9A 3FZLA 4Z94A 5AQZA 1HKCA 1Z05A 1U6ZA 1Z6RA 4WQ4C 5BN8A 3ENHA 3IMXA 1HJOA 2CH5A 2V7YA 3A0IX 3KZBA 2GWKA 5JICA 4WQ4A 3VERA 3LDLA 1HUXA 2E20A 1SQKA 3HTVA 3R9PA 4JHDA 5E26A 3UKRA 3VF2A 5FPEA 4RCHA 3DAWA 4B1WB 2ASOA 1BG3A 1NLVA 4BC5A 3VGKA 2IVNA 3ATVA 3MMVA 4BR9A 5BRHA 4DQ8A 4H0VB 4CBXA 3BF1A 1MWMA 3QICA 1LCUA 3O80A 1E4GT 1GLDG 1X3NA 5FPNA 5CE3A 4B1YB 1SZ2A 1OKJA 2D1KA 3QBXA 1IG8A 1ZXOA 3P4IA 3SLCA 4H0OA 2QWNA 5AQQA 1V4SA 4B1XB 4BRGA 3C7NB 2A3ZA 2E88A 2FSNA 3CJ9A 3ZEUB 2E1ZA 1CZAN 4BQLA 1KAXA 2FF6A 4JAXA 2NLXA 3W3DA 4FSVA 4PL8A 3MK6A 4BVPA 3WXLA 4B1VA 4FPAA 5AQVA 4FWQA 4CZFA 4WQ5C 1RFQA 5AR0A 3LM2A 4BRKA 4BRAA 1NGEA 3WXJA 1BU6O 3TPQA 1MA9B 5BRDA 2E2QA 3R8EA 5AZJB 4KBOA 5BRFA 4FWPA 3L4IA 3GE1A 1BA1A 3D2EB 5AQOA 5AZIB 3WEEA 3ZETB 4BRMA 4IZ9A 1NBWA 5ELZA 1ZC6A 1ZBSA 2I7NA 5AQFA 2HMPA 3HM8A 5FPMA 3A5OC 2YJFA 1DEJA 2CH6A 5AQWA 4PL7A 3CETA 2IVOA 3D2EA 3GBTA 5AZIA 3MDQA 3DWLA 4EIAA 5JMVA 1ESVA 2P9SA 1JCFA 3HBTA 4HTLA 3CJCA 4ISGA 1NGFA 3FZFA 3ZX3A 5AQIA 3VGMA 3CIPA 2YI1A 3BEXA 3C7NA 3H6EA 1YXQA 5AQMA 4CZJA 4M7XA 1NGJA 1QZ6A 5KPZA 1U2VA 1ATRA 2EWSA 2NRHA 4FPBA 3VESA 1S22A 5AQSA 1G99A 4MO4A 2PAVA 3FR0A 4H5RA 4BRNA 1Y64A 1JCEA 1V4TA 3FZMA 3MN7A 4XEIA 1ATSA 1Q18A 4BGAA 1R59O 3H3NO 4PKIA 3UKUA 3MN5A 2P9KA 3UB5A 3QBWA 3FZKA 2GWJA 3O5BA 3VF6A 3O1BA 4CZIA 3FGUA 1QQOA 4CD3A 4FWKA 3LDPA 1HKBA 3A5MC 3UKUB 4FWSA 4JN4A 3SJHA 3L0QA 5F2RA 1HPMA 2J4RA 4A62A 2QWOA 4CJ7A 3H3OB 3DXKB 3CQXA 2P9SB 3QFUA 2D0OA 1GLJO 2CGKA 5JLFA 3CHWA 2AP1A 3H46O 2QM1A 4CZKA 5LJVA 2ZGYA 2FSKA 3WXKA 4A2BA 4BRPA 4K25A 5F1XA 5BN9A 2GEMA 3U4LA 2Q0UA 3GG4A 4H0TB 1D4XA 3VPZA 1QQMA 4EFHA 3G25A 4H5TA 1S3XA 1QHAA 3U8XA 4E1JA 4FO0A 3ENOA 4BRHA 5AFUA 2A40A 2W41A 4JHDB 1H1VA 1RGIA 3O08A 4BRLA 4BG9A 4H0PA 5ADXH 2H3GX 3RSEA 2CGJA 4CD1A 2P9KB 1BDGA 2W40A 5AZJA 3IDHA 3IUCA 1NGIA 3J8AA 3C0BA 4H03B 1K8KB 3CJ7A 4CZMA 4H5VA 1NGAA 1TYQA 2IVPA 3CJBA 4NO7A 5AFUH 2A41A 3QMLA 2NZTA 3H1VX 4ISEA 4MLEA 4IO8A 2E2OA 3UE5A 4XH1A 4FWOA 4IJAA 1LOTB 4K41A 4PKGA 2P9LB 5BPMA 1SAZA 2YHWA 2YHXA 4EAHD 3JS6A 3VEXA 1NMDA 3VOVA 1MDUB 4FWRA 3GL1A 4QS7A 1JCGA 3VEZA 1YAGA 4BVOA 2BTFA 5KPRA 3M3ZA 4IWVA 2P9LA 4B1ZA 1QQNA 2P9IA 1J6ZA 2V7ZA 3VF4A 2ITMA 5AQXA 1DGKN 4PKHA 3FLCO 5BPNA 3TU5A 2DPNA 1HLUA 4HWIA 3WQTA 3OHRA 3KHYA 3AARA 1T6DA 4B1UB 2UYTA 2P9NB 3CJAA 4B9QA 4BR2A 3M6GA 3VETA 2YJEA 2ASPA 4I6MB 1WUAA 5AQPA 2I7PA 4RWTA 1K8KA 4BR4A 2PBDA 3VEOA 4RTFD 2P9NA 1BUPA 1TYQB 2GELA 4BREA 2QWRA 1BO5O 4C23A 3GDQA 4I6MA 1NM1A 4EHUA 1GLLO 4BC4A 1NGDA 2A6AA 4LC9B 3AY9A 3HSCA 5BPLA 4EHTA 2E2PA 2F9TA 4BC2A 4BRIA 1U2VB 4CZGA 2VWBA 3HZ6A 2QWQA 4FWNA 3SMPA 3AAQA 2E2NA 3W0LA 5F0XA 1NGHA 2E8AA 3CI5A 3CJ1A 5LY3A 2WUSA 4GY2B 5EOYA 2P9IB 3DJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MN9A 4PHTX 1RT7A 1YJNN 4FM0A 4BQZA 3B8AX 4B3RK 4WQ5A 2KLAA 1ZBFA 4R79A 3U9ZA 1SS6A 2X6SA 4KI4A 1KAZA 1FXXA 5JLHA 4G9ZA 2DFHA 4AHCA 3T19A 4FYDA 2BH1A 4FJMA 4BRQA 3MECA 2GUPA 4CJKA 3WNHA 4YORA 1FKPA 4KFBA 4JK8A 2PYLA 4K42A 1VQ4N 1KC8O 3HPGA 3SBGA 3ASMA 3KVGA 4CJRA 4JI0K 2JGUA 4W5RA 4DLEA 2ASMA 3AA4A 3G10A 3THXB 1Z26A 4XH4A 4CGJA 3KLEA 3T69A 4FJNA 3AO1A 4JI3K 2QWLA 4AHVA 2VYPA 4AM6A 3HK2A 4C8MA 4Q0BA 2WTUA 5EY4A 3BUZB 4H0XB 1S9GA 2D4WA 2VWJA 4OJRA 4YDUA 4DQQA 2V51B 4OO1J 4A5AA 3BP8A 4KH6A 1DKGD 4JD2B 3KD1E 4ELVA 4GKJK 1BL3A 3KWGA 4K43A 3NGYA 3J81O 4B8AB 4QCLA 3QDKA 3ID8A 4KKOA 1KFSA 2Q31A 4J8FA 4FJ5A 3D45A 1YT3A 3K2PA 5C2FA 4CE9A 1GLAG 3L3UA 3AVAA 4OGCA 1TL3A 1YUWA 2QW9A 4CF0A 4BDZA 3L3VA 4A2AA 3DLLL 4IXCA 3O6WA 3EKUA 1TUUA 3WEEB 3ATUA 3UKRB 3EYZA 4BE0A 4DR3K 3T7ZA 5J1EA 4JRQA 2YCHA 3IG1A 4GW6A 5GIOA 4DTXA 3DLBA 3EL2A 4M7YA 3KKRA 1ILYA 3DI6A 1NK6A 4CZEA 4O5FA 1TAUA 1BOTO 5FDLA 4F3OA 4CHPA 3U9DA 1REVA 5AJ3K 1TK0A 4KB1A 5AQNA 2ZM6K 1ATNA 3V4IA 3LM9A 1TUYA 2FSJA 4MLHA 4E19A 4ID5A 2V52B 1NNEA 2VGNA 2F9WA 4MO5A 4ILGB 3WNEA 1IKVA 4DV4K 3O1WA 2E6MA 4HCBA 3O4NA 3FZLA 4CJWA 5AQZA 1HKCA 1Z05A 1U6ZA 1Z6RA 3VQAA 1I94K 2CH5A 4FJ7A 2OPRA 3A0IX 3E66A 4DF8A 1RTHA 3G0ZA 3OVNA 4CVNE 3VERA 1EETA 5E26A 3VF2A 5J2QA 1JJ2M 2KZZA 5FRMA 3QEPA 2ASOA 1NLVA 1WSHA 2E5LK 3VGKA 2VQEK 5C42A 1LW2A 3C95A 4OVLA 1JKHA 1Z25A 4DS4A 3BY5A 4FJ9A 1EXQA 4OKKA 1TL1A 2HMIA 2D1KA 1Q82O 5I3UA 2KKZA 2EX3A 4C8LA 4A59A 1JLFA 3MX5A 5FROA 1NMNA 3QEIA 1IH7A 2FSNA 2A1RA 4DTUA 3CJ9A 4BE1A 4CGIA 3W3DA 4JK7A 4BVPA 4FWQA 4CZFA 3O3GA 4WQ5C 1RFQA 5AR0A 3DOKA 4BRKA 1J5OA 4RW7A 1D9DA 3AVKA 5H1SQ 3SV3A 2Y1JA 4W5TA 5LMNK 1MA9B 5BRDA 1YJ9N 3OA9A 1UWBA 3QIOA 5BRFA 3I56N 5C10A 3ITHA 1BA1A 3D2EB 2UXDK 3CM5A 4NLCA 3MX2A 4B9VA 3TWHA 1NBWA 2Z1JA 3AO5A 2B4JA 3WNFA 3V9SA 1J54A 5AQFA 2HMPA 3K5LA 3DM2A 1DEJA 2CH6A 3C65A 4CF8A 5SWMA 4N41A 5AZIA 3GBTA 1BCOA 3PO5A 4ISGA 3QIPA 4XIUA 4G1QA 5AQIA 1SKWA 1CXQA 3VGMA 3U3GA 4LF9K 4ICLA 3CIPA 1VQPN 3BEXA 1GOBA 3SV4A 1QHTA 1VQ7N 4CF9A 1QZ6A 5KPZA 3O3HA 4JKHA 2EWSA 4KHNA 1S22A 5GAGP 5AQSA 1JLAA 1RBVA 3TAPA 4MO4A 1W7AA 4NCAA 1EO1A 2PAVA 1Y64A 2XRIA 3FZMA 3MN7A 1Q18A 1HNWK 3KK1A 4ELUA 3L2WA 3MN5A 4NYNA 3K0SA 5J2PA 3C6AA 4M3UA 5CZ2A 2YKNA 2GWJA 4FLTA 3VF6A 3FGUA 3SUPA 4H4OA 2W42A 4OLAA 4FWKA 3SAHA 5KTQA 3TAMA 3PX4A 3ZT1A 5EU7A 4JN4A 3SJHA 1YTUA 3CYMA 4JI4K 1HPMA 2J4RA 2NRRA 4A62A 2ETJA 2QWOA 4IFEA 3E9PA 2P9SB 3SNNA 1WLJA 3CHWA 1XI1A 1HYVA 4N47A 4IG0A 2QM1A 2FSKA 4CF1A 3NCIA 4BDYA 1BI4A 4K25A 4CK1A 5BN9A 3SUQA 4CHNA 5HBMA 4CJ5A 4H0TB 4DSFA 4DU1A 4H5TA 1S6PA 4CGGA 4E1JA 4MDBA 3RMAA 4BACA 4ILJA 4BRHA 1KQSM 3AVLA 3J7ZO 1H1VA 3VQ9A 4FZZA 4BRLA 2I5JA 4KHQA 3NAEA 4KHPK 4B9LA 1CLQA 1B9FA 3VTHA 3ID6A 3TAQA 1A5VA 3HP6A 1JLGA 2W40A 3IDHA 1NGIA 1ZYQA 2UXBK 1A5WA 1K8KB 2XY5A 4E3SA 4JI7K 2OTLN 5AFUH 3CJBA 1BIZA 4LFCK 3H08A 3EY1A 2HBMA 2FC0A 2E2OA 3UE5A 5HP1A 4IJAA 3MEDA 1Y97A 3VQ7A 5BPMA 2OA8A 1XC9A 3LAKA 4CEAA 2HHUA 1RBRA 3WNGA 1KSPA 4H4MA 3VEXA 1XWLA 3QNOA 2HHSA 5LL6Z 4I7FA 2DTUA 3QEWA 4BVOA 2BTFA 2P9LA 2P5GA 5M1OA 3CCVN 3CCQN 4Z4EA 1J6ZA 2ZJQL 3FLCO 5BPNA 1JLCA 1NJWA 2DPNA 1HLUA 3HT3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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