4KH5A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and ampnp
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
595
structure length
591
Chain Sequence
b'DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE'
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
total genus 178
structure length 591
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh5A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh5A02
3AGRA 4KH6A 4A5AA 4KH4A 4JEPA 4A57A 4A5BA 4KH5A 4A59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1F21A 2F9WA 2HNZA 1JJ2M 5C42A 3TSUA 2UUAK 2NRXA 4CGDA 3SZ2A 4CF9A 4AHCA 1SQKA 3CG7A 4CK2A 4DF4A 3CC4N 4RWTA 1NKBA 3TU5A 4JK8A 1VQLN 3ZSQA 3OYAA 4I6MA 2RF2A 5CR4A 5KQ8A 1EO1A 4IO8A 2PYLA 4C8NA 2FXUA 4DFPA 5C25A 3V9WA 1RDCA 2A3ZA 3ZX0A 4H0TB 1Z25A 2PYJA 1SZ2A 4BC5A 4DB3A 5AFUA 2ZM6K 4FW2A 4CGIA 4JKGA 2DY4A 2BTFA 2GX9A 4NLCA 4B8AB 4C23A 2P9IB 1N5YA 5KI6A 3HBTA 2IGIA 3LWMA 4ZTJA 3AVMA 3EEQA 3MXMA 1FKOA 4H0YB 4BWJA 1U48A 5AQOA 3BP8A 4MO5A 4BY9C 1KLNA 3CI5A 3QNNA 3K5LA 3WT0A 3JSMA 4J2EA 3P4IA 4CGFA 1RNHA 4QOZB 4CZHA 2XY7A 5LJWA 4FZZA 3HOTA 2BUPA 4XEIA 1QQOA 3AVJA 3E1YA 3M8RA 4V19S 3A5MC 3DM2A 3K58A 4CIFA 3QEPA 4Z4FA 1HQEA 4H4OA 3TANA 1T44A 2QWNA 4ILGB 2HHXA 4OPKA 3CC2N 5BPLA 5C24A 3SPYA 4JHDB 3RMCA 4K25A 5EU7A 4AF1A 3DJCA 2I7PA 4YDUA 4BRNA 1B9FA 3KK3A 3HVTA 1D9FA 4H5NA 4KHWA 3HJFA 2QEXN 4LF4K 1C0MA 4A61A 5J1EA 4O5BA 1N32K 3OS2A 3LWLA 1RTJA 2GV9A 1DTTA 1R59O 3MX5A 4CE9A 4KRFA 2YNGA 4BC4A 4CZEA 1VQ8N 3TSQA 3I55N 1HQUA 3L4QA 2P51A 1YJNN 2E88A 4U67L 4JI5K 1NGEA 2AP1A 4CHPA 3AO1A 1EWQA 3THYB 3CFOA 4DTMA 1A5WA 4IOXA 3ATVA 4FWRA 4FLZA 3UIQA 4IEIA 3PO4A 1IG8A 1K9MO 4DV5K 1LWEA 4MFBA 3TAFA 1XI1A 4WFAL 5C12A 1NJXA 1WUAA 3SV4A 3O4NA 4DCHA 4LH4A 4C8KA 2HSTA 4B3TK 3DLGA 1HYVA 3RSEA 3Q7CA 2FSNA 4BR2A 4DQ8A 4YHHK 1SL0A 4L8RB 4OPAA 2VWJA 3K59A 3W3DA 4JI8K 5BRHA 3P83D 2HHSA 1BCOA 4DV6K 2QTDA 1NWKA 3PIOL 4CECA 3UKRB 1NGHA 1T6CA 3B6OA 4G1QA 2ZGYA 1EP4A 2IIRA 4DR7K 3OYIA 1XNRK 3FZHA 3OYLA 4CJUA 2RKIA 4IWVA 2E4LA 3ZYYX 4FJLA 3CJBA 3LDLA 1QHAA 4FM2A 1VQ9N 1YHQN 1NM1A 2HNYA 5AZIA 2Y1IA 3L2QA 2P5GA 5AQLA 3QFUA 2VQEK 2WBNA 5AZIB 2FBTA 3HPHA 2OYQA 1Z26A 1X9WA 3VQPA 1YVNA 2JWLA 4KTWA 4PA1A 5F2RA 4JI4K 5JICA 4HCCA 5GAGP 2OTLN 1RBRA 4JKDA 1JL2A 3I33A 2ASPA 4B3RK 3ZLJA 4FLXA 1WAJA 1QZ6A 3CCJN 4RW4A 5JS2A 5FPDA 1I94K 4DSKA 4ELVA 4A5BA 1S9GA 1QVGM 3VQEA 2Z1IA 3KD5E 3CETA 1RFQA 1ZBIA 4JD2B 4CHQA 1XUPO 3ATUA 4BC2A 3VEZA 4BRGA 4IOAL 3HOSA 1LAWA 3SI6A 2FSKA 3HSCA 3ZSVA 4PL8A 1YXQA 1U45A 1IKWA 3F73A 4YFUA 3WXJA 4DQIA 5JVHL 3F5TA 4KI6A 3THXB 2P9UA 1Q82O 4J2BA 1U49A 1WSEA 4X62K 1IKYA 4GNIA 4KI4A 1NGFA 3H3NO 4FWOA 4ILHA 1OH7A 4I9LA 4CFAA 4CCHA 4DTXA 4OKKA 3SCXA 2FBYA 3OHRA 1REVA 4Y1CA 3GBTA 4CEOA 1WN7A 3AA2A 4KH5A 4KKOA 5AR0A 2IS3A 5C2FA 1VAZA 1TYQB 1W97L 3WXMB 2BE2A 1ATRA 2O8BA 4DKWA 4F3OA 2HVHA 5CZ2A 5AQYA 4FVMA 3TAQA 1J6ZA 1OVYA 4CJRA 2CGJA 3NVKA 3LDPA 3I0SA 3VGMA 4Z4GA 3BGRA 1JLFA 3M1FA 1XC9A 3WEEB 5AQHA 4YOYA 4GKJK 3QFPA 3VENA 3EY1A 2P1JA 3LP2A 4YOXA 1Q81O 4GMJB 1HYSA 2LSNA 1C0GA 4AM7A 4CGGA 2GUIA 1RILA 4FW1A 3CCSN 2OZSA 1I39A 4EZ6A 2HOEA 3FFIA 3L8BA 4FLUA 3LP3A 4CJQA 4LFAK 2A1SA 4PL7A 5E41A 3HK2A 4OPHA 3A5NC 4PKHA 3RVCA 1GOBA 4DTOA 1T6DA 1WSFA 2KLAA 2Q31A 3LAKA 4AHTA 3OS0A 1S1UA 5FDLA 3VESA 1JLAA 1K8AO 4FWMA 3TARA 1NG9A 4M7YA 2QI2A 1QSYA 4CZFA 4FWSA 2HBKA 1E3MA 4WQ5A 1TKTA 4PKGA 1C0UA 3BZCA 3G4SN 3K57A 1U6ZA 3QEWA 1HNXK 4QAGA 3T1HK 4FWLA 4DR4K 4DR6K 3O9TA 1YF5L 2RPIA 4M7XA 1IBMK 1TAUA 3WQTA 4K8ZA 2O8FA 2F8SA 1KAXA 2F7TA 4CGJA 4JI7K 3NFAA 4PQUA 4G9ZA 4AQYK 3H6EA 4H03B 4JS5A 3IS9A 5AQXA 3QESA 2WTUA 3EZWA 3DLEA 2Q0UA 2HBMA 3BUZB 4RCHA 3CXCM 1XWLA 4WCEL 4FM0A 2YHYA 2P9LB 4DTRA 4OLBA 4GKKK 3T1YK 4YORA 1EETA 4CESA 1NJWA 3WUHA 4K42A 4KH4A 3N4PA 2VG5A 1NGBA 4M3XA 3HRGA 3TAMA 3OTOK 4JI3K 4DTSA 3I8DA 1X9JA 4DS4A 4AHRA 3VQCA 2I7NA 1L3TA 4KHPK 3G25A 5GIOA 1VSEA 1JXBA 4BDPA 2QWQA 1FJGK 1S3XA 3U3GA 4CJKA 3LM2A 1RDBA 4BRMA 1S6QA 4FJ8A 3RR7A 4B9VA 3THWA 3V9ZA 3CIPA 4KHQA 4BGAA 4Z0UA 3AAPA 1ASVA 1WBBA 1K8KA 4BRQA 3OS1A 2GUPA 4FPAA 4U7BA 2YNHA 4RW6A 1GLCG 4DWIA 4JRQA 4IJNA 4WF9L 4Z94A 4CJTA 3OW2M 1YTUA 4CJLA 3A5OC 3NGZA 3ID8A 5SZTA 2IDOA 2FF6A 1U2VA 3O9RA 3QIPA 4CJWA 1JCFA 3VQ5A 5F0XA 4HTLA 4BE0A 1ILYA 1X9MA 2FLOA 1J5EK 3ENOA 4JI2K 3TTDA 5KPRA 3EN9A 4WFBL 4WE1A 4FK2A 3KLGA 4FO0A 2B6AA 5K14A 4NXMK 3CC7N 1RT6A 2YV0X 1IV0A 2Q1NA 1P90A 4E1NA 3WXIA 1RT1A 1RTDA 4KREA 1YTAA 1VQPN 3J81O 2HHVA 4LF5K 4I7FA 3MCPA 4DU3A 3ZSWA 4CZIA 3UKUB 2G8WA 3D45A 4CF8A 1TAQA 5AQTA 2QWRA 1C0TA 3DRSA 4ELTA 1GLJO 1CZAN 4CEBA 1BUPA 3O1WA 1NJZA 1WNSA 3H3OB 2Q36A 1TKXA 4FK0A 5J2QA 5AQMA 1XMOK 5CHIA 3BF3A 3A0IX 2ZD1A 3LZJA 3CCEN 3O8MA 2YNIA 3TSPA 2RN2A 3S41A 5HOOA 4BRFA 3ZEUA 2QKKA 3NF6A 2YJFA 3ZEUB 4H0OA 3SQ0A 2P9PA 3CYMA 4IKFA 3PSIA 3JAMO 3C0BA 3ID6A 4YOUA 5BN9A 4B9MA 1FXXA 1V4TA 2W41A 4FOEA 4BGBA 4KHUA 2A6AA 1B92A 4BG8A 4DQPA 2NRHA 3DRRA 5JLHA 3VOVA 5ELZA 1JLGA 3O08A 1HX1A 1BWFO 5FLXO 3OY9A 1U47A 3E9OA 4KAZA 5AFUH 3SMPA 3OYDA 4MQ3A 3MEDA 3O3HA 3CM5A 3DWLA 2D0OA 4KO0A 4CIEA 3HM8A 3AVKA 1IG9A 3DXKA 1Z05A 2EX3A 1XC3A 2IVOA 3QERA 3ZT0A 2E1YA 3LPTA 3ZSZA 3QBXA 2QW9A 3AA5X 5T7BA 1YI2N 1ZXOA 4FVUA 4DR3K 2QA4N 4C8MA 4DTJA 3V1OA 2GWJA 1TUUA 1N36K 1LWFA 3GOIA 5BREA 2CGKA 3MN5A 1S6PA 3H46O 3OJSA 1WSGA 3HL8A 5EY4A 1HNZK 1HUXA 3J7AP 4E19A 1QVFM 4OLAA 1HNIA 4FJ9A 3I56N 2XO7A 2Q0RA 3PUFA 3ZT4A 4GY2B 2B4JA 1QQNA 4BRDA 1FKPA 1IBKK 4I6MB 5AQZA 3O3GA 3CCLN 4M3ZA 1W9HA 2NRTA 1VQ7N 1HYZA 3NMUA 3L0QA 3L3UA 2ZJRL 4E1MA 2HW3A 2V7ZA 1N33K 4IDHA 2BANA 4CVNE 4JKGB 3DI6A 1IBLK 1XNQK 1NK7A 3PX4A 4CJ5A 2D4WA 5KRTA 4X64K 3RRHA 3F2KA 1HKGA 4Z4HA 3L2VA 2PAVA 3D2EA 3VN5A 4O8UA 3DRPA 3JS6A 3KVGA 1R0AA 1KFDA 4PWDA 4K43A 4CFDA 3SLCA 1SKWA 2IC3A 2IVPA 1KCFA 1BI4A 3AARA 3T1AA 2Z1GA 2F96A 3QEIA 4H0XB 3VEWA 4CD1A 5AQVA 3WNGA 4A62A 4DV4K 4H8KA 3SBTA 1O1WA 1RT2A 4M3YA 3B6PA 3FGUA 4CFBA 1GOAA 3AO5A 3THVA 3LPUA 4MLHA 3SK3A 1OH6A 2NRVA 1XHZA 5KRSA 4ELUA 4E1JA 1JLBA 1XMQK 3AV9A 4CBWA 1BGXT 2ZWHA 3V9UA 4I2PA 4LSLA 1KTQA 3ZT3A 2E2QA 2I5JA 5DM7L 3V6DA 2P5OA 4YOTA 5LL6Z 4W5TA 1HNWK 4O8KA 1ZBUA 3C6HA 1T05A 5HROA 4GVMA 3O4QA 3HZ6A 1SAZA 3CCMN 2QWLA 4JI6K 1JLEA 4CEZA 3HM9A 4NYFA 4IZ9A 4BR9A 3CPEA 2X6SA 1S72N 5TKWA 4ICLA 1KD1O 1ZYQA 4DV3K 3KLFA 4IBNA 1S1XA 1HKCA 3ENBA 2KHOA 1WSHA 3SUQA 1C1CA 3LANA 4LSNA 4NO7A 2ZE2A 3SQ1A 4FYDA 4DU4A 3ZETA 4BQLA 3M6GA 3KZBA 2FC0A 4KV8A 1E4FT 1KVCA 4BRAA 3IAYA 3VA3A 2AA4A 3J7YP 5JMVA 4DFKA 1CXUA 1KVBA 3L2UA 3A2FA 2Y1JA 4CEEA 2HVIA 2QWMA 3RSEB 3KKSA 3HXMA 3MWPA 4BDYA 4RTFD 2HHTA 3VQAA 3QMLA 3QNOA 4DV0K 2IVNA 3CHWA 5HP1A 5DM6L 4Q0BA 4ISGA 3VQ7A 2UUCK 3O4WA 2HMIA 5AQKA 2O8CA 2O8DA 4AH9A 1TK8A 1BA0A 4EP5A 3QEXA 4M41A 4WFNL 4BVPA 3OYCA 1JCGA 3L2WA 2OPRA 2E2OA 3PLAA 4EHTA 5KGWA 4OJRA 3MXJA 4IEEA 4BQZA 1RT7A 1A5VA 5D3GA 1VQ4N 2HHUA 3OA9A 2QXFA 4HTUA 2UYTA 3CJ7A 1HKBA 3HPOA 3KWIA 1NK9A 5CYMA 2E20A 4RG8A 4N76A 3VA0A 2NRWA 2H3GX 4I2QA 3CPWM 4PY5A 3UB5A 2OPPA 1GOCA 4AHUA 2F8TA 2A42A 3NF9A 3EKSA 2VWBA 1ZBFA 3KK2A 1HNVA 3BZKA 5M1FA 3AVCA 4Z4EA 5CZ1A 5TKYA 3KLHA 5F1XA 2YJEA 3CF5L 5HLFA 5HRPA 2F9TA 1GLBG 2AJQA 4H4MA 4W5QA 3K5OA 2YCHA 1TL3A 3NH0A 3TPQA 2QKBA 3SAGA 3NH2A 2D0AA 5KTQA 3AY9A 3LZIA 5GADP 3A5LC 1EWRA 2OANA 3LAMA 3WQUA 3JXUA 3KLIA 1SS6A 2P9KA 5LY3A 2P9SA 1VSHA 3I8BA 4DS5A 3OYKA 3VETA 1NOYA 3CMAN 3FZKA 2V51B 5B8HA 1C1BA 2P9UB 4B1YB 1M90O 3K0SA 2G8KA 2PZSA 4KBOA 2E6LA 3FE1A 4J8FA 3CJCA 4BACA 4O0JA 2YHXA 1C0FA 2RHKA 1DKGD 2D1KA 2DTUA 1DGKN 2WUSA 3C6TA 2NRRA 1DT9A 3PY8A 4FJJA 4DV2K 4WQ4C 3CMEN 1ZBHA 1GLEG 2XY5A 4M3TA 3T7ZA 3VEYA 4JI1K 2O8BB 1ATSA 2VG7A 3HPGA 4BE2A 2W6LA 1WOQA 2PFUA 3MX2A 4BG9A 4FLWA 1RCHA 3VEOA 1HRHA 5FRNA 3SQ2A 4H0VB 3M5RA 1X3MA 1OKJA 2KZZA 4M3RA 4LD0A 2A1RA 4B9QA 3SUOA 3R1XA 1QSLA 4E7LA 2OTJN 3LDOA 4RW9A 4E7IA 4CK1A 1KLMA 2E2PA 4DG1A 1TK5A 3EE9A 4N41A 3NHGA 4K8XA 1QE1A 1VSFA 4CF1A 4FJNA 3ASMA 1JKHA 4NXNK 4OKEA 3O6WA 2QWPA 2OZMA 2KZMA 5GAHP 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AGR A;  4KH6 A;  4A5A A;  4KH4 A;  4JEP A;  4A57 A;  4A5B A;  4KH5 A;  4A59 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1F21 A;  2F9W A;  2HNZ A;  1JJ2 M;  5C42 A;  3TSU A;  2UUA K;  2NRX A;  4CGD A;  3SZ2 A;  4CF9 A;  4AHC A;  1SQK A;  3CG7 A;  4CK2 A;  4DF4 A;  3CC4 N;  4RWT A;  1NKB A;  3TU5 A;  4JK8 A;  1VQL N;  3ZSQ A;  3OYA A;  4I6M A;  2RF2 A;  5CR4 A;  5KQ8 A;  1EO1 A;  4IO8 A;  2PYL A;  4C8N A;  2FXU A;  4DFP A;  5C25 A;  3V9W A;  1RDC A;  2A3Z A;  3ZX0 A;  4H0T B;  1Z25 A;  2PYJ A;  1SZ2 A;  4BC5 A;  4DB3 A;  5AFU A;  2ZM6 K;  4FW2 A;  4CGI A;  4JKG A;  2DY4 A;  2BTF A;  2GX9 A;  4NLC A;  4B8A B;  4C23 A;  2P9I B;  1N5Y A;  5KI6 A;  3HBT A;  2IGI A;  3LWM A;  4ZTJ A;  3AVM A;  3EEQ A;  3MXM A;  1FKO A;  4H0Y B;  4BWJ A;  1U48 A;  5AQO A;  3BP8 A;  4MO5 A;  4BY9 C;  1KLN A;  3CI5 A;  3QNN A;  3K5L A;  3WT0 A;  3JSM A;  4J2E A;  3P4I A;  4CGF A;  1RNH A;  4QOZ B;  4CZH A;  2XY7 A;  5LJW A;  4FZZ A;  3HOT A;  2BUP A;  4XEI A;  1QQO A;  3AVJ A;  3E1Y A;  3M8R A;  4V19 S;  3A5M C;  3DM2 A;  3K58 A;  4CIF A;  3QEP A;  4Z4F A;  1HQE A;  4H4O A;  3TAN A;  1T44 A;  2QWN A;  4ILG B;  2HHX A;  4OPK A;  3CC2 N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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