3A5LC

Crystal structure of a dictyostelium p109a mg2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAALNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Gelsolin
total genus 115
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5lC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5lC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5lC03
1E4GT 4BRPA 3SJHA 4ISEA 3QFPA 3OHRA 3CIPA 4BRMA 1KAZA 2GEMA 3CHWA 5BR9A 2ITMA 4BC5A 3F9MA 1V4TA 1MWKA 4Y0WA 1NGEA 3R6MA 3HTVA 3WXJA 5AQMA 3M1FA 2PBDA 3ENHA 4DCHA 4MLEA 4QS7A 2PAVA 2E20A 3ZX2A 1NWKA 2A6AA 2F9TA 3WQUA 3DXMB 1NLVA 3CJBA 3QMLA 2QWNA 3W3DA 1IG8A 4H5RA 5BPNA 1QZ6A 3FZMA 4IXCA 3LDOA 4J8FA 4QS8A 3CJ9A 2HMPA 5AQNA 3FLCO 2A42A 1Z05A 4FSVA 1TYQB 2GWKA 3GDQA 4LC9B 5LJVA 4HWIA 5I9EB 4BRKA 2J4RA 5AFUA 2FLOA 3GE1A 1C0FA 3EKSA 3VEZA 2GWJA 2QW9A 3H1QA 1C0GA 4PL8A 4JD2A 1NGGA 2YCHA 3LDPA 2E2NA 3MN7A 4BC2A 4Z94A 2ZWHA 2H3GX 4O8KA 2HOEA 4CZMA 3GL1A 5AZJB 5AQIA 5BREA 4H5WA 1QQNA 1K8KA 4K41A 1LOTB 3ZX0A 4JHDA 1BO5O 4M63C 2E1YA 3D2FB 3C0BA 2GUPA 2BTFA 3SK3A 2V52B 4CBXA 3VF4A 2Q0UA 4BR4A 3AY9A 5EX5A 2E88A 3C7NB 3VETA 4FWNA 4A2AA 1QQMA 3O1WA 4FWRA 1E4FT 2IVOA 2QM1A 2P9IA 3H1VX 3JXUA 2P9KA 4WQ5A 5ELZA 4FWLA 3FR0A 2Q97A 2WUSA 3LM2A 1MA9B 1ATSA 3VGLA 4MO4A 2FSKA 3LDQA 2YJEA 5F0XA 4CZIA 3GOIA 3MCPA 1HPMA 2Q31A 3H3OB 3MN5A 4M7YA 3QDKA 3U9ZA 2D0PA 3TU5A 1T44A 2D1KA 4L3QA 3HI0A 3MN6A 5AQWA 4B1VA 5KQDA 1S3XA 4CBUA 1QZ5A 3WXKA 1RGIA 1HJOA 4FWSA 4JNEA 5LJWA 2NLXA 3FGUA 3HBTA 2ZGYA 2IVNA 3D7EO 3LM9A 1NM1A 1X9JA 3MN9A 1P8ZA 3DWLA 3ZETA 1ATRA 4IWVA 3VEOA 3UB5A 2CGJA 3A8YA 3S41A 3ID8A 5AQVA 4CZKA 4B9QA 1H1VA 5FPNA 4JD2B 1MWMA 1QQOA 1CZAN 2YJFA 1R59O 3AAPA 5AQZA 3JS6A 3VESA 3CQXA 5FPMA 2VYPA 1NBWA 1OKJA 3D2EA 4IO8A 1TUUA 3ATUA 4BR7A 5TKYA 4JHDB 2HF3A 4AM7A 3ZEUB 4B1YB 4B1XB 3ULEA 4BR0A 3IUCA 3LDLA 5AQSA 2CH6A 3P4IA 3W0LA 4BR2A 4BC4A 5KPTA 3M6GA 2P9PA 4BRQA 5EXWA 5BRFA 5AQYA 3H45C 3RSEB 4MLHA 3CJCA 1NGAA 5EVZA 4BRLA 2D4WA 1DGKN 2A41A 3CETA 2A40A 2P9UA 5AQGA 4K43A 3UKRA 1D4XA 5AZIB 1GLEG 5E84A 1NGJA 3CJ7A 2CGKA 4PKIA 3U9DA 4H0VB 1U2VA 2F9WA 2DPNA 1X3NA 4QS9A 4I6MA 1ZXOA 3FFKB 3BUZB 5BPMA 1NGBA 4YDUA 5AQXA 3A5NC 4CZLA 3BEXA 3LL3A 3UKUA 3WXIA 4FWKA 3KHYA 4ISGA 4WQ4A 1LCUA 2ASPA 3BP8A 3HSCA 2FF6A 2Q2RA 5BN9A 4PKGA 4BROA 3VF2A 5AQPA 5EY4A 2QWQA 2FSNA 5AQJA 3O08A 1NGCA 2A5XA 1Q18A 3BF1A 1BDGA 3WXLA 1TUYA 2P9NA 4YDUC 2VWBA 3VOVA 1G99A 3MK6A 4H0XB 4JAXA 5KQ8A 2NRHA 4BG8A 2VCPA 5EOYA 3O4WA 4WQ4C 4BRAA 4C23A 4BRIA 3R9PA 4CZGA 2OANA 2Q1NA 3A5MC 3GBTA 3MMVA 3ZX3A 5AQFA 1YXQA 3I33A 1NMDA 1IJJA 2W41A 1YAGA 1NGIA 3FE1A 3CJ1A 1GLBG 3U8XA 1RDWX 3CQYA 1EQYA 3VGMA 4A61A 3U4LA 2P9SA 2FXUA 4EHUA 5CE3A 2E8AA 5KPZA 3CJAA 5AQLA 3EO3A 3O80A 4BRGA 2QWOA 5AQOA 4BRHA 4CD3A 2QXLA 4GNIA 5AQHA 2P9UB 1BA0A 4WQ5C 3UKRB 1JCEA 4B1ZA 2BUPA 4FO0A 1HKCA 2UYTA 4RWTA 4FWMA 1XQSC 4B1UB 4BRNA 1HUXA 4CZEA 3HZ6A 1NGFA 1V4SA 4H5TA 2QWLA 2V51B 3G25A 2GELA 4FWQA 4AM6A 3CI5A 3UKUB 4XH4A 4FPBA 3B8AX 1TYQA 5AR0A 3QBXA 3BF3A 1GLAG 2CH5A 3KVGA 1RFQA 5BN8A 1X3MA 2FF3B 5JLHA 1K8KB 4FL9A 4CJ7A 5ADXH 3IDHA 4BGBA 3VPZA 4A2BA 1JCGA 2E2QA 4BC3A 4FWOA 4MO5A 2AA4A 2FSJA 4CI6A 4EIAA 4KBOA 2Q0RA 5AZJA 5BRHA 1KAXA 2ASOA 2YHYA 4BR9A 2NZTA 2I7PA 4H5VA 1BU6O 3FZHA 4PKHA 1YUWA 3O5BA 1T6DA 5JMVA 3ATVA 1GLJO 4FPAA 2P9IB 2ZGZA 3QB0A 3EN9A 5KPRA 2P9KB 4CBWA 3VF6A 2YHXA 3FZKA 2W40A 1GLDG 3SMSA 3C7NA 4CD1A 2EWSA 1ESVA 3WEEA 3ENOA 1YVNA 2V7ZA 3QFUA 5AQQA 2YHWA 3FZLA 1BA1A 1DEJA 3A5OC 3SMPA 4M7XA 5FPDA 3A5LC 3GG4A 3VEYA 3L6QA 4FOEA 4FOIA 1Z6RA 3WUHA 4BG9A 1KAYA 3QICA 1BG3A 1WUAA 1HKGA 3J8AA 5BPLA 2IVPA 3WT0A 2ZF5O 3CERA 5ADXA 2KHOA 3DAWA 4BR5A 4K25A 3ZETB 5LY3A 4H0OA 1NGDA 4HTLA 1ATNA 1XUPO 2ASMA 2V7YA 4B1WB 2YI1A 4K42A 5AQTA 5AQUA 3VEXA 5AQKA 4IZ9A 2D0OA 1DKGD 3I8BA 5JICA 1KXPA 4DHYA 3DJCA 3O1BA 4DQ8A 5AQRA 4EHTA 3D2EB 3VERA 2P9LA 1HKBA 1MDUB 4BRDA 3A0IX 4F9OA 1NGHA 1BUPA 4NB4A 3R8EA 4BQLA 3ULEB 1SZ2A 3DXKA 4PL7A 3IMXA 1HX1A 3HM8A 4XEIA 5FPEA 4EAHD 4E1JA 4H0PA 3MDQA 2E2OA 1HLUA 3AARA 2P9PB 3L0QA 3ZEUA 3VEVA 3FZFA 5F2RA 4JN4A 1BOTO 5F1XA 3IFRA 1XC3A 3L4IA 4IJNA 4BREA 2A3ZA 3H6EA 4H03B 3WEEB 1GLCG 1ZBSA 5JLFA 2QWPA 2QWRA 4DB3A 3LDNA 2GTDA 1ZC6A 2QWMA 3EL2A 3RSEA 1QHAA 1U2VB 3DXMA 4NO7A 4ISFA 2AP1A 4I6MB 4O5FA 1T6CA 3AAQA 4IJAA 5E26A 2HF4A 3VGKA 4BVOA 5AZIA 4BRCA 2IIRA 1SQKA 1JCFA 1J6ZA 4GY2B 1BWFO 4H5NA 2E2PA 3WQTA 1Y64A 4FWPA 3VEWA 1WOQA 3H3NO 1S22A 1SAZA 4WYBA 3H46O 2P9NB 4EFHA 4BQZA 3KZBA 1GLLO 4H0TB 4BRFA 4CZHA 3O8MA 1GLFO 2P9LB 5BRDA 1U6ZA 2E1ZA 2I7NA 3VENA 5B8HA 4H0YB 3D2FA 5AFUH 4RTFD 4CZJA 2CGLA 3DXKB 3TPQA 4A62A 3O6WA 3EKUA 3M3ZA 4XH5A 3SLCA 2Q36A 4BGAA 4RCHA 4BVPA 2P9SB 3QBWA 3UE5A 4CZFA 3EZWA 4XH1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBXA 2IS3A 4JI3K 4BRPA 3QFPA 3NBPA 1VSJA 2ITMA 4BC5A 3AVAA 1KC8O 1MWKA 4CJUA 4M3YA 4GKJK 2I5JA 4QS7A 2PAVA 1NWKA 3SUQA 2DFEA 1YJNN 3BZKA 1NLVA 2KZMA 4JK9A 3KK2A 2QWNA 3SUPA 4H5RA 2W00A 3FZMA 4J8FA 3KTQA 4KTWA 1VQ5N 3V9ZA 4RW8A 3LALA 1RT1A 3C6TA 1SL0A 1SKRA 1UA1A 4LF6K 4FJJA 3BDPA 1VQ6N 4DMNA 4JKCA 3GE1A 4AHTA 4BE7B 1C0FA 3EKSA 3VEZA 4DV3K 1CZ9A 3RWUA 1WAJA 3O9QA 3V4IA 2VG7A 3T1AA 4PL8A 1NGGA 2XRIA 2R7YA 2VGNA 4Z94A 4CW7B 2HOEA 5AZJB 4H5WA 1K8KA 1LOTB 1YF5L 3ZX0A 1BCMA 4B9VA 4YNQA 3LZJA 2BE2A 4NCBA 2BTFA 3OA9A 2HNDA 1HYZA 4CGIA 4FJ5A 4K8ZA 2Q0UA 2G8FA 5EX5A 1X9SA 3TTFA 3C7NB 4JLHA 4E7HA 3O1WA 2RKIA 3CD6N 1E4FT 2P9IA 2HBLA 3H1VX 4I9QA 2P9KA 3Q7BA 3I56N 3QLHA 3R3LA 2OTJN 4BDZA 4MFBA 4RG8A 3FR0A 1YITN 2Q97A 5GAEP 3LM2A 3IAYA 4KFBA 4KI4A 4CGGA 4ILHA 5F0XA 3MXIA 1XNQK 4CZIA 2QK9A 1T05A 2Y1IA 2QKKA 3MN5A 2Q31A 4M3UA 2HHQA 3QDKA 1Q9YA 2G8KA 3TU5A 1T44A 2D1KA 4L3QA 3S5TA 3OYEA 1WNSA 3P31A 5C12A 1QZ5A 3WXKA 4FWSA 4CJTA 4CJKA 4J2AA 1A5XA 1M1KO 1X9JA 4IWVA 1L3UA 3LP3A 2CGJA 4KHQA 2JLEA 3O9TA 2KZZA 3RMDA 1A5VA 1H1VA 3B6OA 1QQOA 2KLAA 4CFAA 3AAPA 4IEIA 1SKSA 3RMBA 2VYPA 4IO8A 3CC4N 2HF3A 2G8VA 1NJYA 4I7FA 1NKBA 3TSPA 2IDOA 4F4KA 4B1XB 4LF8K 2ITGA 4BR0A 2E5LK 1QVGM 3LDLA 5C42A 2CH6A 3P4IA 4IDKA 3L3VA 4DSFA 1WLJA 1LAWA 1RT6A 1TL1A 1NOZA 4ELUA 4CF1A 4CHPA 4RW9A 1F21A 2P51A 3RSEB 3PX6A 4MLHA 4BRLA 1DGKN 3SCXA 2NRXA 4IG3A 2A40A 1XHXA 3AGRA 3HVRA 2IAJA 1SL1A 3CYGA 4PKIA 3U9DA 3SV4A 3ZLJA 3VQ6A 3SQ4A 1M90O 2DPNA 4QS9A 2YNIA 2ZE2A 4OLBA 1JLAA 4FM1A 3SV3A 1U4BA 3LL3A 1TK5A 3THYA 2NRRA 5KI6A 1RT3A 1NOYA 4WQ4A 1LCUA 1RNHA 3BP8A 2FF6A 2Q2RA 4PKGA 1C1AA 3M8RA 4AHCA 4GV3A 2QWQA 4AHUA 2B5JA 3BF1A 4LF7K 1UOCA 1B9FA 3WXLA 1TUYA 2P9NA 3V9SA 1K9MO 2W42A 1VAZA 5C2FA 4H0XB 5GAHP 2HHTA 3DLBA 4WQ4C 4BRAA 2E6LA 3R9PA 3MAQA 4FJ8A 4ELVA 3MMVA 4B08A 2YKMA 4JI8K 2ATQA 4FVMA 4FJGA 2PY5A 2W41A 1KFSA 1YAGA 1NGIA 3CJ1A 1YVUA 3CQYA 3VGMA 1HNXK 3S3OA 3QO9A 4CEOA 3U4LA 3NH0A 2G8HA 2P9SA 4W5NA 5CE3A 4AHVA 1C0TA 3OYNA 1KLNA 3EO3A 3ZSOA 4CF2A 3KD5E 4CF8A 4DF4A 4LF5K 4JI6K 1UAXA 5AQOA 3NF7A 3AVNA 5M1KA 3QERA 1J9AA 4CIFA 2P9UB 4GVMA 4WQ5C 4R5PA 4ID5A 1HKCA 2UYTA 4RWTA 1JJ2M 2P1JA 3HPGA 4BRNA 1K8AO 1NGFA 1V4SA 3VQBA 4YFUA 2GELA 1VSIA 3TI0A 4AM6A 1NK7A 4DTJA 1VQ9N 3B8AX 3SAFA 2KTQA 3O4NA 4KRFA 1EWQA 4FZZA 1RFQA 5BN8A 5JENA 4IO9L 3LAMA 4BGBA 3DOKA 1RT7A 1VSLA 3VPZA 2F8TA 4CIEA 2XY6A 4MO5A 4X65K 4N41A 5KGXA 3SJJA 5AZJA 2YHYA 3OYFA 4FLZA 1GLJO 4FPAA 3NF6A 2ZGZA 1KD1O 3EN9A 1VQMN 3OYLA 4V19S 1FXXA 1IKVA 2W40A 4CJQA 2KFNA 5HRPA 4M42A 2FBTA 3C7NA 4CD1A 2EWSA 3WEEA 4CGHA 2UUAK 2G8WA 3OYIA 3DYAA 2O8CB 2D5RA 4F2RA 1IG9A 4FJ9A 1NU0A 3J7ZO 5FPDA 3A5LC 4W5RA 1YJWN 3WUHA 1YTAA 1KAYA 3VMFB 1X9MA 4LH4A 3J8AA 2IVPA 3WT0A 3VQ9A 5ADXA 4KH4A 3DAWA 4DLGA 3ZETB 3S3NA 1BISA 1R0AA 4F8RA 3EZ5A 4HTLA 1RDDA 4H4OA 1FJGK 4K42A 2G8UA 5I42A 1HNZK 3DOLA 5AQKA 2JWKA 1DKGD 3I8BA 1QTMA 4XJXA 3BZCA 2VGMA 4DHYA 4WCEL 5AQRA 1L3VA 1VQKN 3VERA 2XHBA 3OS0A 1HKBA 4BRDA 4NB4A 3CCRN 3E66A 3ZT0A 1HX1A 3J81O 3MDQA 3F5TA 3VEVA 2GV9A 2DFHA 3FZFA 3ZT3A 2B4JA 2O4IA 3OS1A 1BOTO 3G10A 4BE0A 3QEIA 1NK5A 1XC3A 1VQ4N 3R1XA 3AVJA 1KTQA 4W5QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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