3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
4H5TA 2ASMA 5AQTA 3R6MA 5AQWA 1ATSA 2PAVA 2QXLA 3ENHA 3EKUA 4RWTA 1BUPA 1IG8A 2D0OA 4H0OA 3FZMA 4HTLA 2YI1A 3ZX0A 4BR4A 2CH6A 2E1YA 3HBTA 5JICA 1EQYA 1TUYA 3LDNA 1S3XA 1NGJA 3FR0A 1NGAA 3O4WA 4YDUC 3BF1A 3FE1A 3P4IA 1K8KB 5ADXH 2YJEA 2E2QA 5BN8A 1T6DA 4GNIA 1QQNA 5E84A 3J8AA 4FSVA 1E4FT 1WUAA 2AP1A 4BR7A 3VF4A 5CE3A 4PL8A 4ISFA 3MN9A 3R9PA 4CD1A 3C7NA 3H45C 2FSJA 5AZIB 3LDQA 4ISGA 5TKYA 1BA1A 4DCHA 1KAZA 2A40A 1GLEG 1BA0A 3SMSA 2E1ZA 3O6WA 2A42A 4BRKA 4E1JA 1HLUA 1X9JA 2A5XA 3FZHA 3OHRA 3EO3A 5ELZA 5LJVA 5AR0A 4RTFD 2E2PA 5JLFA 4PKGA 3UKRB 4B1WB 3WXJA 3HI0A 5LJWA 3TPQA 1CZAN 3B8AX 2CGJA 2E2NA 3VEWA 2Q97A 1NGGA 3MMVA 4A61A 4H0XB 4B9QA 2F9TA 4JNEA 4PKHA 2GUPA 3ENOA 3TU5A 4BC5A 3EL2A 2P9LB 3UB5A 4A2BA 4BR9A 3U9DA 5BR9A 3O08A 3C7NB 4I6MB 1HX1A 4WQ4C 3CIPA 3WEEA 3RSEA 2Q31A 2F9WA 5AFUH 3CQYA 4FWQA 4BVPA 2ITMA 2P9NB 5AQRA 1V4TA 3C0BA 2KHOA 5F2RA 4YDUA 5AQJA 1DKGD 4DHYA 3H3NO 3UKRA 4H03B 3HSCA 4O5FA 4EFHA 1TYQA 5AQVA 5F0XA 4JD2A 4A2AA 5AQUA 1LCUA 1Z6RA 1X3NA 4RCHA 2GELA 4KBOA 1KAYA 2H3GX 5AQOA 3D7EO 1G99A 4J8FA 4FWPA 3EN9A 3D2EA 3A5LC 3H1VX 1QHAA 4L3QA 5KPTA 3SK3A 5BPMA 3W0LA 5ADXA 1ZXOA 1NLVA 4BGAA 4NO7A 2QWNA 4CZGA 3DWLA 2P9NA 5AQZA 3SJHA 3FFKB 3GDQA 2CH5A 4BRFA 4FPAA 2QWOA 4FL9A 4BRMA 3CERA 3M1FA 2P9UB 3DXMB 1NGCA 2QW9A 2P9KA 4EHTA 5AQIA 4BG9A 3IUCA 2D1KA 3GG4A 3VETA 5AQKA 3I8BA 3VPZA 3D2EB 1GLCG 2J4RA 4IO8A 4BC2A 4BRQA 4PL7A 2YHYA 3SMPA 3W3DA 4B1XB 3ULEB 4BR5A 3WQUA 4BG8A 3MN6A 2HF4A 3CJ9A 5AZJB 1RFQA 1RDWX 4M63C 3HZ6A 4BVOA 2PBDA 2YHXA 1LOTB 4EHUA 5BRFA 2V7YA 3HTVA 1SAZA 4K43A 3U4LA 3AAQA 1D4XA 3QMLA 3QDKA 1C0GA 5BRDA 4CBXA 2P9KB 5BN9A 4QS7A 4XEIA 5AQHA 1ATRA 1HJOA 4WQ5C 2Q36A 2QM1A 4DQ8A 5BPLA 4H0PA 3O1BA 1Y64A 4LC9B 2CGKA 3M6GA 2E8AA 1YVNA 2P9LA 1QQMA 2A41A 2WUSA 1K8KA 5BRHA 1HKCA 1NBWA 1KAXA 2IIRA 4BRGA 5AQNA 4XH1A 2NLXA 3WEEB 3IMXA 3ZX3A 1GLJO 1R59O 3KVGA 4JN4A 3O8MA 5KPRA 3IFRA 1RGIA 1BWFO 2YJFA 3FZKA 2GWKA 4BGBA 4FWRA 4Y0WA 4BC3A 5BPNA 3A5OC 5FPEA 4A62A 3WXIA 4BRIA 1TYQB 5AQPA 2EWSA 2HF3A 3LDPA 4NB4A 3MCPA 2GEMA 1YAGA 3G25A 5I9EB 1GLAG 2IVNA 1C0FA 1NGFA 5AQYA 3AY9A 4IWVA 4K41A 3O80A 2CGLA 3MN7A 3U9ZA 3F9MA 3BUZB 4FO0A 3CJ1A 5FPDA 2VWBA 4I6MA 3DXKB 4FWSA 5AQMA 3QFPA 3BF3A 3ZEUA 2P9SB 2P9PB 2ZGYA 4CBUA 3AARA 3LL3A 3LDOA 4CI6A 5AQFA 3VF2A 4K42A 4HWIA 1HKGA 3WQTA 2QWRA 3VOVA 2DPNA 1NGIA 1JCGA 3VESA 5AQSA 1P8ZA 3I33A 3VEZA 1WOQA 4GY2B 4JD2B 1NM1A 3A5NC 3GBTA 1YUWA 1E4GT 3CQXA 5FPMA 3ULEA 1Z05A 2QWPA 1NMDA 4FWMA 4CZLA 4JAXA 1XQSC 1NGHA 2E20A 4BRLA 3QBXA 4BRDA 3VEYA 3CJCA 3QBWA 4B1ZA 3AAPA 5F1XA 5AZIA 2BUPA 2P9PA 3EKSA 1DGKN 3QFUA 4BR2A 5KQDA 4CZFA 1ZBSA 3QICA 3KZBA 3LM9A 1HKBA 3CHWA 4CZJA 3R8EA 4IJAA 4EAHD 2P9IA 3GOIA 2P9UA 3DXMA 3VEVA 4ISEA 2FF3B 5EVZA 5EX5A 2E2OA 5AQLA 4MO5A 2I7NA 3JXUA 1T44A 4BREA 1XC3A 4QS8A 1U2VB 3ATVA 3MDQA 3WXLA 3ZETB 3EZWA 4K25A 4CBWA 4XH4A 2YCHA 4H5VA 4BRCA 4XH5A 1GLBG 5E26A 1Q18A 3VERA 3WT0A 5EXWA 3BEXA 2VYPA 2UYTA 1NWKA 4WQ5A 3UE5A 1MA9B 1SZ2A 4IJNA 4IXCA 2QWLA 3ZX2A 3D2FB 1BO5O 4CZIA 3SLCA 5FPNA 2W41A 3WXKA 3BP8A 5JMVA 1X3MA 1OKJA 1BG3A 2A3ZA 4FWNA 3MN5A 1MWKA 3RSEB 3FLCO 2NZTA 4M7XA 1V4SA 2E88A 3ID8A 4EIAA 1HPMA 3FZFA 1JCEA 3VENA 3ZEUB 4FOEA 2ZGZA 4DB3A 3UKUA 2ASOA 3QB0A 3FZLA 4CZMA 3LM2A 1TUUA 3GE1A 3L4IA 3CJAA 3CJ7A 2VCPA 2OANA 2ZWHA 4JHDA 3A5MC 4H5WA 4BRPA 3HM8A 3CI5A 1QZ5A 3CETA 3O5BA 4MO4A 1NGBA 2Q2RA 1ESVA 1GLFO 5JLHA 1U6ZA 3MK6A 3O1WA 4M7YA 4CZHA 2GWJA 4H0YB 2V7ZA 4O8KA 4BR0A 5KQ8A 1QQOA 4AM6A 1IJJA 1NGEA 2FLOA 3JS6A 3UKUB 5KPZA 2BTFA 3VEXA 2YHWA 4BQLA 2W40A 4F9OA 1NGDA 4IZ9A 2AA4A 4MLEA 4C23A 5EY4A 1KXPA 2FSNA 4H0VB 4CZEA 1T6CA 2P9SA 3LDLA 3H3OB 4FPBA 4MLHA 5BREA 2HOEA 4B1UB 1QZ6A 2A6AA 3VGKA 3DAWA 2QWMA 4BQZA 1SQKA 3H6EA 1XUPO 4B1VA 1U2VA 4QS9A 3KHYA 3VEOA 3WUHA 3A0IX 4FWKA 3L6QA 2QWQA 3A8YA 3GL1A 4B1YB 1MWMA 4Z94A 3VGLA 4H5RA 3U8XA 5AQQA 5LY3A 1ATNA 3ATUA 5AQGA 3H1QA 2Q0RA 2D4WA 4FOIA 3IDHA 3H46O 2P9IB 4FWLA 1GLLO 2ASPA 3VF6A 4FWOA 2V51B 4CD3A 5B8HA 2IVOA 3CJBA 1GLDG 3ZETA 4AM7A 4PKIA 2Q0UA 2FXUA 5AQXA 1BDGA 4BROA 3M3ZA 4CZKA 2IVPA 1BOTO 1MDUB 3L0QA 4BRHA 4WQ4A 1H1VA 1S22A 1DEJA 2FF6A 2ZF5O 3DXKA 2FSKA 4H0TB 1J6ZA 1BU6O 2D0PA 1ZC6A 2NRHA 1HUXA 4JHDB 3S41A 1YXQA 4WYBA 2GTDA 2V52B 5EOYA 4BC4A 3VGMA 3D2FA 4CJ7A 4BRNA 2Q1NA 1JCFA 3DJCA 4H5NA 5AFUA 4BRAA 2HMPA 2I7PA 5AZJA 3FGUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQPN 2BANA 5AQTA 2ASMA 3AO4A 2QXLA 2KZMA 3LP0A 3EKUA 4F3TA 4FW1A 5M1NA 2D0OA 2FC0A 5J2PA 2YI1A 3ZX0A 2CH6A 3NH0A 3TAQA 1EQYA 1TUYA 3AVKA 1NGJA 3FR0A 3O4WA 3ENBA 3RMCA 3KLGA 1WSEA 1KQSM 3SBTA 4JLHA 1YHQN 3P4IA 4J2DA 3L4QA 5ADXH 2HHWA 2JLEA 3HRGA 4DSLA 4GNIA 1QQNA 5E84A 5HP1A 3NVKA 1SL1A 2AP1A 5CE3A 3K5OA 3M8SA 1CXQA 3C7NA 3HPHA 5JS1A 4CEBA 4DCHA 4CF0A 1UWBA 1GLEG 2A42A 4E1JA 2D5RA 3OHRA 5ELZA 1X1PA 3EO3A 4FW2A 4HUFA 4Y1DA 1LAVA 5JLFA 4PKGA 4PA1A 3M5RA 3WXJA 3HI0A 2CGJA 4CJKA 2Q97A 1NGGA 4H0XB 3HVTA 1VSFA 2GUPA 2JGUA 4BC5A 2P9LB 4BR9A 4M45A 3MCAB 4C8OA 1TAQA 1KCFA 3AVLA 3CIPA 2RE2A 5C2FA 4FJHA 3AA4A 4C8MA 2ITMA 4AHSA 1FXXA 2G8VA 3QO9A 4W5OA 3CC2N 4M3YA 2Z1IA 3H3NO 4JK9A 3UKRA 1JLEA 4EFHA 2UU9K 4DSEA 1TYQA 1VRTA 4RCHA 4KB1A 1Y97A 3AVMA 4KBOA 3D7EO 4J8FA 3EN9A 3A5LC 3H1VX 2O8EB 5BPMA 4LF6K 3V9WA 4DUZK 1K6YA 3T1YK 4E3SA 2QKKA 3LP2A 3DWLA 1DT9A 2ZE2A 1TL1A 3O4NA 4F3OA 3SJHA 3GDQA 1N5YA 2CH5A 4BRMA 4LF9K 2FBXA 4CEQA 2ZM6K 4EHTA 2G8UA 3HXMA 3IUCA 4CJTA 2D1KA 4DR5K 1B9FA 4O55A 3OYJA 3HOTA 3P1GA 3VQ8A 3G10A 4B3RK 2OPPA 3VA3A 4B1XB 4DTUA 4WFAL 4LF7K 4CIGA 2XO7A 1WN7A 3HZ6A 3ZT1A 4FZYA 1CZ9A 4F2RA 3L2RA 1VAZA 5C42A 3THWB 2RKIA 1T7PA 1S1XA 4WQ5C 2Q36A 2QM1A 4DU4A 1M1KO 4JI7K 4LC9B 2CGKA 4KHQA 1YVNA 2P9LA 3D0PA 2HW3A 3KK7A 5BRHA 3TABA 4CJ3A 3I0SA 3S3NA 4BRGA 1RCHA 1FKPA 5AQNA 2DY4A 3VQ6A 3P5JA 1C1AA 3K5NA 1WBDA 3KLHA 3ZX3A 4X66K 1GLJO 4JKGB 3SUPA 3O8MA 5KPRA 3IFRA 3ZSZA 2O8DA 1BWFO 4BGBA 2A1SA 4FWRA 4Y0WA 4DFMA 1OVQA 3DOLA 3WXIA 1KC8O 4BRIA 3TANA 2EWSA 4CEOA 3LDPA 3CM5A 2GEMA 4DQIA 1RDDA 4DFJA 4I9LA 2IVNA 4KI6A 3AY9A 4DS5A 1BCMA 1RTIA 1ASVA 1YTAA 4K41A 1RT6A 1NNEA 3O80A 3MN7A 3U9ZA 3DRRA 5HL7L 3F5TA 2P51A 3KLIA 3DXKB 3KTQA 1Q82O 3QFPA 5M1PA 2ZQBA 2P9PB 4CJSA 2UXBK 4CBUA 4CI6A 2VG7A 3VF2A 1WSGA 4HWIA 1HKGA 1J54A 4JKFA 3VOVA 1RT4A 2O8BB 3NF6A 1JCGA 3OYCA 3NH1A 3VESA 1RDUA 2G8HA 1IKYA 1HMVA 4OLBA 4JKBA 1HNIA 1S5JA 1E4GT 1WB9A 3ULEA 2QWPA 4FWMA 5DK5A 4KTWA 4GW6A 1F21A 4DV7K 2QEXN 3K2PA 4DSFA 1RBSA 3E66A 5KTQA 3MX2A 3VEYA 3MEGA 4KV8A 4I2PA 3NVMA 4W5RA 3AVHA 4JI8K 5F1XA 4O4GA 5AZIA 2BUPA 3QFUA 3V1RA 4BR2A 3KK1A 1ZBSA 3QICA 5HRNA 5KGWA 4YY3K 4N47A 4IJAA 4J2AA 2P9IA 5FLXO 2KLAA 1J9AA 4FJKA 1T03A 3VEVA 2P9UA 5EVZA 1VSIA 5AQLA 4MO5A 1W2BM 1YIJN 4BE2A 4BY9C 4ILGB 4QS8A 4YOYA 3ATVA 3HO1A 4IBNA 4GKKK 4N5SA 3EZWA 3UIQA 4KPYA 3J81O 4C8KA 4CEDA 3RTVA 2YCHA 3DI6A 3VMFB 2Z1GA 1HQEA 4CGHA 2P5GA 3BEXA 4WQ5A 2QXFA 1T8EA 1MA9B 4OPHA 1SZ2A 4B8AB 3AO3A 4C1NI 3ZX2A 3K59A 1RT3A 3I8DA 1IV0A 3BP8A 5JMVA 4AQYK 4FWNA 1Q81O 3CPEA 1VQ7N 2Z1HA 1MWKA 3QESA 2NZTA 4M7XA 4EIAA 3KD1E 1BGXT 4FJMA 1HPMA 4JI4K 2A1RA 3UKUA 1Q9YA 3RMDA 3DRSA 1FW6A 2ZJRL 3OYGA 3LM2A 4OPKA 4FM0A 4JRQA 4ELVA 4B9TA 4FLXA 2WTUA 3OYHA 3DRPA 2VCPA 4TSXA 1JLFA 2UUBK 4H5WA 4BRPA 2G8KA 1QZ5A 1ZBHA 3CETA 4IFVA 4MO4A 3V6DA 1NGBA 1ESVA 3OYLA 1NK8A 5JLHA 5M1QA 4MFBA 4DG1A 3F2KA 5KQ8A 4AM6A 4Y1CA 1IJJA 3C6TA 5KPZA 3SQ2A 3VEXA 2YHWA 2YNHA 3NMUA 2W40A 4IZ9A 3CC7N 3K9KA 3EE8A 1HNXK 3P38A 5HLFA 2XHBA 4NCAA 4CECA 5C0YA 3KWGA 1WLJA 3RMBA 3VGKA 1U48A 4WE1A 1Q8IA 4B1VA 1GOCA 3KHYA 3TSQA 2EX3A 2IAJA 3CMAN 1RBTA 3VN5A 4OJRA 5KRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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