3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Conserved archaeal protein
publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
1QZ5A 3WQUA 4QS8A 4J8FA 2P9SB 5EOYA 3ULEB 4MO4A 3BP8A 3CJ1A 4BROA 4BR7A 4FSVA 2GELA 5ADXA 4PKHA 1GLCG 4A2BA 3ZEUA 4BR5A 3ID8A 3UB5A 2VYPA 4BRGA 3RSEA 2Q31A 2GUPA 4BRNA 4E1JA 1NMDA 5KPRA 3H3NO 5AQYA 4CZKA 3EN9A 4Z94A 2YJFA 1YUWA 3D7EO 1J6ZA 3DAWA 4WQ5A 2UYTA 3QMLA 2P9UA 1QHAA 1T6CA 2PBDA 4BREA 3MN5A 4BC3A 1CZAN 3HTVA 4XH4A 2V52B 1KAZA 5AQTA 4CZMA 2QWNA 3A0IX 2A40A 2QWPA 1BA0A 5LJVA 4BRLA 4JHDA 1DGKN 1LCUA 2IVPA 1S3XA 4BG8A 1MWMA 3LM9A 2E2QA 1V4SA 2FLOA 1YXQA 4BRHA 2GWJA 1D4XA 4BQLA 1NGBA 3ZX0A 4H5VA 3CJCA 3UKUA 2HMPA 5AQVA 1NGDA 2QW9A 3S41A 3DWLA 3FZHA 2Q36A 5CE3A 3H46O 2V51B 3GBTA 4WQ4C 3U9ZA 4BRFA 1HX1A 2J4RA 5AQXA 3GE1A 3ZETB 2A5XA 3BEXA 1ZC6A 3C0BA 3R8EA 3CQXA 2FXUA 2F9WA 4H03B 2P9NA 2HF3A 3FR0A 3FZMA 4BQZA 3QBWA 3ENHA 2DPNA 4FOIA 1DKGD 3BF3A 3FZFA 3LDNA 2IVNA 4I6MA 2E2OA 2FF3B 1QQMA 2ZGZA 4YDUA 2H3GX 5AQSA 3R9PA 2AP1A 2YHYA 3I8BA 2F9TA 4JD2B 3SMSA 4B1WB 3QICA 5BRFA 2QXLA 3ATUA 3VENA 1H1VA 3CI5A 3M3ZA 5AZJB 3R6MA 2P9PA 3WEEB 4IZ9A 2Q1NA 2YHXA 2E2NA 1OKJA 1Q18A 3BUZB 4KBOA 5AQRA 1LOTB 4H5RA 4BRKA 4NB4A 3QBXA 2P9LA 3DXKA 3HI0A 4FWLA 3VF6A 4EAHD 2CGKA 1X3MA 5F2RA 2D0OA 3L0QA 3I33A 1IG8A 4CD3A 1ZXOA 1G99A 1HKBA 5BN9A 4BRIA 3AAPA 1SAZA 1BG3A 5F0XA 3H1VX 2P9KB 4K43A 2E2PA 4BGBA 3D2FA 4QS7A 4BRMA 2KHOA 1EQYA 2GWKA 5BPLA 3U8XA 5KPTA 1NLVA 5BPMA 3HBTA 2GTDA 3CJ7A 1MDUB 2V7YA 3O8MA 3VEYA 5JMVA 4GY2B 1TYQB 5EY4A 4BVPA 4BRCA 4EFHA 3SK3A 3H6EA 3LDQA 1JCGA 4RCHA 4NO7A 2QWMA 1GLEG 5AZIA 3P4IA 5BN8A 3TU5A 5BRHA 4FWSA 3LM2A 3J8AA 1MWKA 4BR9A 1QQOA 1NM1A 1X3NA 4WQ5C 2P9IA 2ASOA 1XC3A 4IXCA 4FPBA 4BR4A 3IMXA 3ZEUB 4H0VB 1ZBSA 3RSEB 3GL1A 4BC5A 4BRPA 5ADXH 2HF4A 1WUAA 2E1YA 3FFKB 1Y64A 3WXLA 3VETA 4LC9B 4BRDA 4A2AA 3ZX2A 3FGUA 3FZKA 1X9JA 4CBUA 4JN4A 2V7ZA 3AARA 3IFRA 4F9OA 4GNIA 5AQNA 1HJOA 2D0PA 1K8KA 3VESA 1MA9B 4K42A 2P9UB 3IDHA 3O4WA 3A5MC 4BVOA 1RGIA 3ZX3A 4M63C 4CZLA 4XH1A 2Q2RA 3ZETA 4H0XB 4A62A 1U2VA 3D2EA 5AQWA 4CBWA 4PKGA 1T6DA 2YJEA 5FPNA 4MLHA 3W0LA 3VEOA 3UKRA 3EZWA 1DEJA 3VEVA 3A8YA 4CZHA 3KHYA 3L6QA 2YCHA 2QM1A 5FPDA 3W3DA 3DXMA 4CD1A 3CJBA 5F1XA 1NGAA 4FWPA 5AQGA 3A5NC 4BGAA 4PKIA 2VCPA 4DHYA 1BO5O 3JXUA 5EXWA 4M7XA 3JS6A 5B8HA 3O1WA 3UKUB 3U4LA 4ISFA 3WXIA 2A6AA 1QQNA 1E4FT 1XUPO 3LL3A 5EX5A 3MN9A 4B1YB 4K25A 2ASMA 4MO5A 2YI1A 4YDUC 1KXPA 1NWKA 3LDOA 3CQYA 2NLXA 4FWKA 1S22A 1C0FA 4M7YA 3WQTA 2P9NB 3GG4A 2I7PA 5AQFA 2NZTA 5JLHA 4O5FA 4PL7A 4L3QA 1Z6RA 4I6MB 4H0TB 2NRHA 5I9EB 4H0OA 2BUPA 4XEIA 1QZ6A 3C7NA 1BU6O 1NBWA 2QWQA 3LDPA 4CZGA 2A42A 3H45C 4ISEA 5AQLA 4HTLA 4FPAA 3CJ9A 5KPZA 1NGHA 2P9KA 2P9SA 1GLFO 2D1KA 4FL9A 5LY3A 3ULEA 1HKCA 1GLAG 5AR0A 1KAXA 1NGIA 5AQUA 3VEZA 2P9PB 4BRAA 3EL2A 2FF6A 3ATVA 4JAXA 3VPZA 2FSJA 3GDQA 5AQPA 1HKGA 5ELZA 1BWFO 3O5BA 4HWIA 3WXKA 3VERA 4B1UB 4Y0WA 4RTFD 4CI6A 4CZFA 3HZ6A 2P9LB 3DXKB 1SZ2A 2Q0UA 4O8KA 1ATNA 5FPMA 3VGLA 3WUHA 3VEXA 1TYQA 3CETA 1RDWX 4FOEA 4C23A 4EHUA 3SJHA 5E84A 3CERA 5AQQA 4B1ZA 3DJCA 4BG9A 3LDLA 4H5WA 1ATRA 4FWOA 1NGJA 4K41A 4BR2A 4DCHA 1HLUA 3KZBA 1ATSA 2CH5A 2FSKA 3CIPA 3D2FB 2QWRA 3U9DA 4H0PA 4EIAA 4ISGA 2YHWA 2GEMA 1NGCA 3SMPA 4CZJA 5E26A 1Z05A 1P8ZA 1E4GT 1XQSC 2EWSA 2OANA 3QFPA 3H1QA 4QS9A 4B9QA 4FWQA 3OHRA 3AY9A 3L4IA 4AM7A 3A5OC 3FLCO 4CZIA 4CJ7A 2Q0RA 3B8AX 4IO8A 3VEWA 4MLEA 5AZIB 1TUYA 3MK6A 2A41A 2IVOA 2Q97A 2FSNA 4B1VA 3FZLA 4WYBA 5EVZA 3MN7A 5JICA 3MDQA 5BRDA 3GOIA 1BUPA 2QWOA 1JCEA 1YAGA 3F9MA 3HSCA 4FWNA 1GLLO 2P9IB 1R59O 5BREA 3M6GA 2QWLA 2VWBA 5AQOA 3MCPA 2IIRA 3EKUA 1GLDG 2A3ZA 4JHDB 1BA1A 4DB3A 4BR0A 5JLFA 4BRQA 3VGMA 3MN6A 3KVGA 5AFUA 5AQJA 4WQ4A 4H5TA 5AQKA 2W40A 1HPMA 1K8KB 2D4WA 5BPNA 1RFQA 3HM8A 1U6ZA 3VF4A 3IUCA 1TUUA 4FWMA 4EHTA 3VOVA 4BC4A 4IWVA 3VF2A 4CZEA 1NGEA 4BC2A 3BF1A 2W41A 4JD2A 4JNEA 4FWRA 5AQIA 5AZJA 3O08A 1U2VB 5TKYA 2ZGYA 3VGKA 3D2EB 4H5NA 3WEEA 4IJNA 3QFUA 2PAVA 3H3OB 3WXJA 4FO0A 1GLBG 4DQ8A 3UKRB 2AA4A 5AQZA 3UE5A 3TPQA 2CH6A 3SLCA 2HOEA 4AM6A 4CBXA 5FPEA 3DXMB 3G25A 3CJAA 5AQHA 3ENOA 1KAYA 2BTFA 5AFUH 2WUSA 2E88A 1NGGA 3AAQA 4PL8A 3QDKA 4XH5A 1T44A 1V4TA 2ITMA 4H0YB 4RWTA 1ESVA 3EO3A 1BOTO 3FE1A 1IJJA 2E1ZA 1NGFA 3M1FA 2E20A 1GLJO 1WOQA 1C0GA 1SQKA 3O6WA 1BDGA 3WT0A 2ZF5O 1YVNA 5LJWA 3QB0A 4A61A 5KQ8A 3O80A 1HUXA 5AQMA 2CGLA 2CGJA 3MMVA 3CHWA 2I7NA 4B1XB 3A5LC 1JCFA 5KQDA 3O1BA 3EKSA 4IJAA 2ZWHA 3C7NB 2ASPA 5BR9A 2E8AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PO5A 4QS8A 1I94K 1KFDA 3NMUA 5TKWA 1XWLA 3PLAA 1LAWA 4MO4A 3RMBA 1NU0A 3CJ1A 3V1QA 4BR7A 2GELA 3KIOA 3O9RA 5ADXA 1GLCG 4Q5VA 1YJWN 1HNZK 1EO1A 3ID8A 2VYPA 4E1JA 4BRNA 1NMDA 3EN9A 1YUWA 4QCLA 1J6ZA 4DWIA 2VG6A 4E0DA 3QMLA 4LSNA 1JXEA 4FM1A 1RT7A 3M5RA 1OH5A 1NKEA 4IOCL 4BREA 1CZAN 3RMDA 2V52B 1ZBLA 5A2QO 2QWPA 3DOLA 4KTZA 3SCXA 3HRGA 3L2RA 3SQ0A 4DUYK 1RTIA 4CF2A 1WAJA 1C0MA 2E2QA 4CIGA 1YXQA 3SBGA 1D4XA 1NGBA 1NK9A 3NFAA 1Q7YO 1HQUA 4GV9A 2HMPA 5AQVA 4B9SA 4WCEL 3C95A 3FZHA 3ENBA 5CE3A 3KK3A 3H46O 2V51B 4WQ4C 3U9ZA 4DV3K 3O4NA 1N6QA 3AVFA 4K8XA 4KKOA 3BEXA 1WSJA 5I3UA 4H03B 3QBWA 2DPNA 3ENHA 4FOIA 1IBLK 3EYZA 3KWIA 2IVNA 4FJXA 2D0BA 5HRPA 2KTQA 1VQLN 4YDUA 4DFPA 1NJZA 1U48A 3I8BA 4W5OA 1K8AO 4DS5A 2F9TA 3KD1E 4JD2B 3CQ8A 3DLEA 2A1RA 2QXLA 1H1VA 1KRPA 3O9QA 2A1SA 4I7FA 2E2NA 2ETJA 4DTRA 3E9OA 4OX9K 1LOTB 4NCBA 3A2FA 2QEXN 2KZMA 2W6KA 3HI0A 1XHZA 3Q7BA 4BE0A 1QQCA 4N5SA 4DR7K 2D0OA 3L0QA 3TTDA 3P31A 4IG0A 4CD3A 3NGYA 4CEZA 4L8RB 5BN9A 4K8ZA 4BRIA 1SAZA 3CC4N 1BG3A 4K43A 1CZ9A 3HYFA 4DR4K 1RBRA 2E2PA 4BGBA 4FM0A 3QNNA 1RBSA 2PY5A 3O9UA 3ZSYA 1UA1A 4KHUA 3V9ZA 2LSNA 1EQYA 2GWKA 3OYKA 2HNZA 3AVKA 5BPMA 2GTDA 1REVA 1HPZA 1CXUA 1ZBFA 4BRCA 3C6UA 1L3VA 3SK3A 2HNYA 3LDQA 4YORA 1KCFA 5J2NA 2QWMA 2UUBK 4E1NA 1VQPN 1UA0A 1VQ9N 2E6LA 5LL6Z 1HNXK 3T19A 5BRHA 1L3TA 1MWKA 1TL3A 1YVUA 5J2QA 4NXMK 5CZ2A 4KH4A 3KWGA 1QQOA 4C1NK 3PO4A 4WQ5C 2ASOA 2DFEA 1BQNA 4FJ9A 4FPBA 4BR4A 5HOOA 4NLCA 1SL2A 3E1YA 4BC5A 5HP1A 3KD5E 4FLZA 1BCMA 1Y64A 4A2AA 3BY5A 4I2PA 3ZX2A 2FBVA 3CC7N 3FZKA 2IDOA 2D0PA 4CGFA 1RT1A 3SV3A 3VESA 4GVMA 4A5BA 1J53A 1SL1A 3A5MC 3N4PA 4M63C 1SL0A 3QNOA 2Q2RA 3ZETA 3LP2A 2PYLA 4A62A 4JS5A 1U2VA 4O0JA 3CCRN 4CBWA 2FBXA 3SI6A 5SZTA 2Q3SA 3B6PA 5FPNA 1W9HA 3DYAA 1DEJA 4FCYA 4GKKK 2YCHA 4FJIA 3DXMA 3CJBA 4FWPA 4PKIA 1TK8A 3NF7A 3ZT1A 3EEQA 3O1WA 1VQ7N 4KHSA 1VSEA 4R5PA 4ISFA 3E66A 3WXIA 1KTQA 3KLEA 4B9TA 3CM6A 1WSFA 4CERA 4H8KA 1J5EK 2NRXA 4MO5A 1NWKA 3LDOA 3CQYA 4AHUA 5C25A 4CJTA 4FWKA 3SAHA 2G8WA 4M7YA 1Q86O 1EP4A 3AO1A 4L3QA 4AH9A 2NRHA 5DM6L 2BUPA 1QZ6A 3C7NA 1NBWA 1YITN 4GVEA 4DLEA 2DFFA 5KPZA 1ASWA 3OS0A 2KZZA 2YNFA 3SUOA 4YOYA 4KB1A 4TSXA 5M1FA 4E7KA 4Q0BA 3I0RA 5C10A 1C0UA 1NGIA 2WONA 2O8DA 2JWLA 4BRAA 4ILHA 2FSJA 3RRGA 2NRZA 5ELZA 1BWFO 3AO2A 4DFKA 2FC0A 3VERA 4Y0WA 4N47A 4AHRA 4CI6A 1VSJA 4A57A 1SZ2A 4ELVA 3CETA 1WBDA 1RDWX 4EHUA 1BIUA 3EE9A 1NOYA 4FLVA 4FWOA 4K41A 4DV0K 1VHXA 3DM2A 3HPHA 3T1YK 1HLUA 3SZ2A 4HUEA 3AO4A 4U67L 2XHBA 4IFVA 2OZSA 1YJ9N 3DRSA 3U9DA 3G10A 4EIAA 4ISGA 5GAHP 3TAEA 3SJJA 4Z4EA 3ID6A 3TSQA 3VQ9A 1NK5A 3NH2A 1P8ZA 2EWSA 2OANA 2Z1IA 2HB5A 1MU2A 1VAZA 3OJUA 4CGHA 3CPWM 1KSPA 3L4IA 4RW4A 1ITGA 3NBPA 4CZIA 1NK7A 1L5UA 4JRQA 1IH7A 4ILJA 3VEWA 4MLEA 1TUYA 2HBMA 1A5VA 1Q82O 4DR3K 3VQCA 1RT4A 4RG8A 1JLFA 3V4IA 4DR6K 1LWEA 3UIQA 1JCEA 3KJVA 4ICLA 4DFMA 1YJNN 2QWLA 4KTWA 5HL7L 3CCJN 1HQEA 4M3UA 4BY9C 2ZJQL 3N4QA 4BR0A 4JYAK 2GV9A 4ELTA 2ATQA 2D4WA 4C8LA 3PX6A 3HSTB 4CECA 3IUCA 4JKHA 4FXDA 3OA9A 5JS2A 1ZBIA 3VOVA 2HBJA 2WC9A 3VF2A 2UXDK 4PQUA 4CZEA 1S72N 4BC2A 3ZT0A 4JNEA 4GV3A 4FJ7A 4WFBL 2F96A 3AA4A 5AZJA 4OPJA 3O08A 1U2VB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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