3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
b'MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Conserved archaeal protein
publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
5LJWA 3VEVA 1BU6O 3GOIA 4PKHA 4H5NA 4B1YB 3R6MA 1CZAN 1BUPA 1T6CA 5AQWA 3CJCA 4MO5A 3EL2A 3O4WA 5BN9A 4YDUC 4PL7A 3HM8A 3AAQA 3A5OC 3LDOA 4QS7A 5AQNA 1BA0A 1HUXA 4IJNA 3H45C 5AQRA 4IWVA 3O8MA 1ATNA 2NLXA 2P9PB 3HBTA 3BP8A 5AQPA 3ZX3A 2ASMA 4IZ9A 3ZX0A 3H46O 2VYPA 2E2PA 4FWPA 2Q31A 4FWLA 3CJ9A 4BGBA 5LY3A 4NO7A 1BO5O 2Q0RA 3FFKB 2D0PA 1RFQA 3I33A 4O5FA 2E2NA 2P9KA 2BTFA 3C0BA 5AZJB 3UB5A 5AQVA 4BG8A 3AY9A 3HTVA 2FSNA 5AQKA 3VEOA 4BG9A 4RCHA 1GLAG 3VEWA 2YJFA 3CETA 1XC3A 1Z6RA 1GLLO 4GY2B 3WQTA 1DKGD 2A40A 3M1FA 4GNIA 3M6GA 3H3OB 4B1WB 3DXKA 3WXIA 3U9ZA 4O8KA 2YHWA 4H0VB 3HSCA 4CZGA 5BRDA 3C7NA 4DQ8A 4JAXA 4YDUA 3MN5A 3R9PA 5AR0A 2GTDA 3H1QA 1X3NA 1HKCA 3VPZA 4XH5A 1NGAA 2A5XA 4BRAA 1KXPA 3DXMA 1ZXOA 3B8AX 3J8AA 3MN6A 1GLEG 1T6DA 2Q36A 2Q1NA 3MN9A 2QWRA 3D7EO 4WQ5C 4ISFA 3A5NC 3W0LA 2CH6A 2I7NA 4RTFD 1G99A 2FLOA 2CGJA 2GWKA 2D4WA 4BRCA 3EKSA 5E84A 3ULEB 4CZFA 3O80A 1E4GT 1BG3A 3A5MC 2HF3A 3UKUA 3U4LA 3WEEA 4DHYA 3L6QA 2A42A 2IVPA 5E26A 3IMXA 1XQSC 4H0TB 4BR0A 3L0QA 1SQKA 3DXMB 4M63C 2AP1A 4BR7A 4BRQA 2Q97A 1HPMA 4RWTA 5FPEA 3UKRB 1HKBA 3UE5A 1QZ6A 4L3QA 4FWQA 2YI1A 4BQZA 3TPQA 4FO0A 3MDQA 4M7YA 2D0OA 1RGIA 1MDUB 4BRDA 4CI6A 4CZEA 4Z94A 3FZFA 5AQHA 1EQYA 1NGIA 3VESA 4I6MB 3VEXA 1RDWX 4JN4A 4XEIA 3GDQA 2P9PA 2QWMA 3P4IA 5AQFA 1BDGA 3WQUA 4K41A 2CGKA 4WQ5A 3LDQA 2GUPA 2HOEA 3EKUA 2CH5A 4WQ4C 3S41A 1X9JA 4EAHD 1H1VA 3FLCO 2QXLA 3U8XA 3VEZA 5AZJA 3L4IA 4JNEA 3CJ1A 3BUZB 4AM7A 5ADXH 3DWLA 3JXUA 4QS9A 1P8ZA 3IDHA 3CJBA 2CGLA 3KHYA 4B9QA 4CZHA 3LL3A 3QDKA 3SLCA 1IJJA 3LM9A 1C0GA 1NGEA 3FZLA 3JS6A 2V7ZA 1GLBG 5AFUH 1KAZA 1ZBSA 4JHDB 1ATRA 5AQOA 5BREA 4ISEA 1IG8A 3OHRA 5AQTA 4BROA 2FXUA 4XH1A 4CD3A 3AAPA 3VGMA 4BVPA 5EOYA 5AQMA 5JMVA 1HX1A 4H5WA 5FPMA 5BRHA 3SMPA 2Q0UA 5EVZA 2IVNA 2P9LB 3FZHA 3HZ6A 4B1XB 3VF4A 4FWMA 4FWRA 3VERA 3MK6A 4Y0WA 1GLJO 3EO3A 4F9OA 4EHTA 4A2BA 1YAGA 3CERA 4FPAA 2D1KA 2HMPA 4J8FA 1K8KB 1NWKA 4WYBA 2GELA 3D2FB 3VF6A 4WQ4A 4H0XB 2E1YA 4BGAA 4FOIA 4C23A 3D2EB 2QWNA 4JD2B 3ULEA 4FWSA 1NGCA 4NB4A 1GLDG 2BUPA 3LDPA 1X3MA 3VENA 3CI5A 5FPDA 1NGBA 1DEJA 2V51B 4BRHA 5CE3A 3QFPA 1NLVA 1S3XA 1Z05A 1C0FA 1NGGA 1U2VB 4BRLA 1ZC6A 3G25A 4K43A 4BREA 1TUYA 1NGJA 5I9EB 4CZJA 4FWNA 1MA9B 4KBOA 3UKRA 4K25A 3U9DA 4BR2A 3DJCA 1JCGA 4PL8A 5KPTA 1WOQA 3GE1A 3O1BA 1R59O 3R8EA 3CJ7A 1V4TA 3DAWA 3FE1A 5AQJA 4BR9A 1GLFO 3MN7A 3SK3A 4BRIA 2IVOA 2QM1A 3AARA 3FZKA 2H3GX 1YVNA 3HI0A 2I7PA 3O5BA 4FPBA 2ZGZA 3W3DA 3GBTA 1NGDA 4I6MA 1QQNA 4CZKA 1HJOA 4BRFA 2ASPA 3LDNA 3LM2A 4CZIA 1YUWA 3BF3A 2A6AA 2E20A 4H5VA 4H5TA 5AQLA 1NM1A 5B8HA 3FR0A 4H5RA 3H1VX 4DB3A 5JLFA 5TKYA 2V7YA 3ATVA 4FWKA 1HLUA 1LCUA 2YCHA 4MLHA 3KVGA 5EY4A 5F2RA 5ELZA 4BRGA 2F9TA 5BPMA 2QWOA 5AZIB 3SMSA 4M7XA 4PKIA 5AQXA 2P9NA 3A0IX 3O08A 5JLHA 5BPLA 1QQMA 1BA1A 1QZ5A 2QWLA 2AA4A 4FSVA 4K42A 3VGKA 4H0OA 1U6ZA 2YJEA 3ZETB 3H3NO 3A8YA 3QBWA 4CZMA 5KQ8A 2W41A 3RSEB 3FZMA 3ATUA 2ZWHA 1D4XA 2P9SB 4BRNA 3QFUA 2NRHA 5AQUA 4BRMA 3CQYA 3H6EA 4JHDA 4IXCA 2J4RA 4E1JA 2YHYA 2P9NB 2ZGYA 3IFRA 3O1WA 2P9IB 5BPNA 3WXLA 4BC5A 1T44A 4H0YB 4BR4A 2PAVA 1KAYA 2P9UA 2P9LA 3QBXA 1TYQB 2Q2RA 1BOTO 4MLEA 3QMLA 3GL1A 1S22A 2QW9A 5EX5A 2UYTA 5EXWA 1E4FT 2A3ZA 5BRFA 1LOTB 1HKGA 2GEMA 1K8KA 2YHXA 3D2FA 1Q18A 4EHUA 5F1XA 5KPRA 1WUAA 1KAXA 1NGFA 1JCEA 4LC9B 3D2EA 4JD2A 3WUHA 5KPZA 4QS8A 3CJAA 4EIAA 2P9UB 4CZLA 1JCFA 2FSJA 2KHOA 4XH4A 5AQGA 3VETA 2QWPA 3CIPA 1U2VA 2ASOA 2W40A 1QHAA 4ISGA 3EN9A 2E2QA 3LDLA 3WXKA 3MMVA 1OKJA 2HF4A 1NBWA 1TUUA 1MWMA 2QWQA 3GG4A 3ID8A 2ITMA 4DCHA 5AQYA 2E8AA 4CJ7A 2PBDA 4A61A 1J6ZA 1NMDA 4HTLA 2P9KB 3O6WA 4PKGA 5ADXA 2V52B 2E2OA 1DGKN 2A41A 3F9MA 4IO8A 4BRKA 3CQXA 2DPNA 3IUCA 4CBUA 2IIRA 3ENOA 1MWKA 3KZBA 5AFUA 3WXJA 4BC4A 2E1ZA 4EFHA 4HWIA 3A5LC 4BVOA 4H0PA 5F0XA 1V4SA 3DXKB 5AQIA 4BQLA 2FSKA 5AZIA 3VEYA 4FOEA 3C7NB 4CD1A 4H03B 1ATSA 3ZEUA 4BC3A 4FWOA 3TU5A 5FPNA 2NZTA 3ZETA 4B1VA 3BEXA 5KQDA 3RSEA 3VF2A 4BRPA 4BC2A 2WUSA 1SZ2A 2ZF5O 1ESVA 3EZWA 2P9SA 2EWSA 4AM6A 4MO4A 1SAZA 3M3ZA 3SJHA 4CBWA 4A2AA 3ZX2A 5AQZA 3ENHA 3QICA 4BR5A 1BWFO 3CHWA 3ZEUB 2P9IA 3FGUA 4CBXA 3WT0A 4A62A 2E88A 3BF1A 1NGHA 4B1UB 1GLCG 5AQSA 5BR9A 3QB0A 5AQQA 3VGLA 4FL9A 4B1ZA 5LJVA 2OANA 3UKUB 1Y64A 2F9WA 2FF3B 3WEEB 2VWBA 3I8BA 3MCPA 3VOVA 1QQOA 2VCPA 2FF6A 1TYQA 1YXQA 5BN8A 4IJAA 1XUPO 5JICA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ4A 4KH6A 1TK5A 2XY6A 1BUPA 5CR4A 1BIUA 4FJNA 4DV4K 3CXCM 1JLQA 4E7HA 1RBRA 1SKRA 2JWKA 3EL2A 1RNHA 1OH7A 4M3ZA 4B3MK 3MWTA 1LW2A 3AVNA 3HM8A 1VSHA 1O1WA 3VTIA 4C1NI 3VQAA 1KTQA 5LL6Z 1X1PA 4F8RA 3PIOL 4O5BA 4CHZA 4JI5K 5AQPA 3THYA 4YOVA 4IZ9A 3ZX0A 4FW1A 2VYPA 3NF8A 4A5BA 1IBLK 4CJ3A 5LY3A 4NO7A 2WONA 1TK0A 1RFQA 4DV5K 1ITGA 3T69A 1L3UA 1U04A 3HTVA 2VWJA 1LAWA 4BG9A 1GLAG 4CFCA 3OYDA 4DTPA 3CM6A 1B9FA 1QSSA 5MLCQ 3I8DA 1D5AA 1GLLO 4GY2B 1W9HA 3ZSVA 1NJIO 4X65K 2FBYA 4YORA 3M6GA 3VQPA 3C95A 3DXKA 4B1WB 1RBUA 4CHOA 3AVIA 3HT3A 4IOAL 4JKGA 1TKTA 3HSCA 5BRDA 4KREA 1SKSA 4DQ8A 2QKBA 4G9ZA 4YDUA 5M1QA 3MN5A 1XNRK 3H1QA 5CZ1A 1X3NA 5FRNA 5BR8K 1HKCA 3VPZA 1TVRA 4DFMA 2A5XA 4N47A 3DXMA 4DFKA 4IKFA 4GV6A 1GLEG 2Q36A 3LZIA 4WQ5C 4FJ5A 1VQPN 3A5NC 3SUOA 4RTFD 4K0KK 1OH5A 2FLOA 1YITN 2GWKA 2VGNA 4B9SA 3NCIA 4I9QA 4I7FA 4FLWA 3ULEB 4CZFA 1S6QA 1VQNN 2HF3A 2W6KA 3U4LA 3L6QA 3IG1A 2WOMA 2KFZA 3BY5A 4H0TB 5KI6A 2HHSA 2Z1JA 3QETA 4CIFA 2IOCA 1X9SA 4FW2A 3UKRB 1BHLA 1HKBA 4O0JA 4RG8A 4CECA 1EX4A 4HUFA 3ITHA 3DI6A 2YI1A 5C12A 5M1FA 2NRXA 4KO0A 3ZYYX 3SUQA 1BIZA 3MDQA 2YKMA 1RGIA 1MDUB 3G71N 3SI6A 5AQHA 1EQYA 1NK9A 3VESA 4AHUA 1RTIA 1ASVA 4XEIA 4FCYA 3L3VA 1VAZA 4ZTFA 4FK4A 4K41A 2CGKA 3K58A 2X6NA 4LFAK 3I0RA 3LDQA 5KGWA 2HOEA 2HHTA 4GV3A 3EKUA 4EAHD 3OYKA 1H1VA 1QSYA 1QHTA 1HNZK 4UQGA 3U8XA 5AZJA 1BL3A 3QNNA 3CJ1A 4NXNK 1JXEA 1I94K 3DWLA 3JXUA 3IDHA 1QE1A 2CGLA 4CZHA 3QDKA 3SLCA 1C0GA 3FZLA 1KRPA 2KTQA 3CYMA 1ATRA 5JVHL 1VSFA 1W2BM 5EU7A 2JWLA 5C0YA 4ISEA 1IG8A 2FXUA 3ZT2A 4HTUA 3V9SA 3THWB 5EOYA 3KLFA 1IKXA 1OVYA 2I5JA 3QERA 2P9LB 3HZ6A 4FWMA 4DMNA 3F5TA 3EO3A 1KVBA 4F9OA 4A2BA 1YAGA 3TAMA 4J8FA 3AVKA 4C8KA 2DFFA 3HOTA 4BGAA 4FOIA 4JD2B 2QWNA 4N76A 3QO9A 3O9SA 2BH1A 4KPYA 4NCAA 1S72N 1Z05A 2ATQA 4CW7B 1C0FA 1NGGA 1U2VB 4BRLA 3NVKA 4ID1A 3VQEA 1YHQN 4KBOA 3SYZA 4CCHA 3KD5E 2E6MA 1J5OA 3CJ7A 1V4TA 1HYZA 4GW6A 4A59A 2QM1A 3FZKA 4BE2A 3HI0A 2O4IA 4NXMK 3O5BA 4JV5K 2NRVA 4CGJA 1U47A 1NGDA 3M8PA 2EHGA 5C2FA 4BDYA 1RTJA 2E20A 3OBWA 4H5TA 3DLKA 3FR0A 4WCEL 2V7YA 2G8VA 4LY7A 4DLEA 4FWKA 1S5JA 4MLHA 4BRGA 5BPMA 1NKEA 4M3YA 2P9NA 3A0IX 3O08A 5JLHA 5BPLA 1QQMA 4FLUA 5HROA 2QWLA 1NOZA 3WNGA 4E7KA 4OGEA 3ZETB 3ZT0A 3H3NO 4CZMA 3QBWA 1QTMA 1TKZA 2HB5A 3SPZA 3FZMA 4CERA 1UA1A 3ATUA 3SCXA 1IG9A 1NJWA 3QFUA 4ELTA 2NRHA 4BRMA 4DR1K 4E7LA 4ZHRA 1A5XA 3AO4A 4J2AA 2ZGYA 3PSFA 3O1WA 4DFJA 4DUZK 1NKCA 4DR4K 1YT3A 1RDUA 3MXJA 2WFBA 3BGRA 4N56A 2P9UA 2HBKA 3QBXA 2Q2RA 3B6PA 1C0MA 2O8EA 1P90A 1LOTB 4BACA 3CG7A 3IAYA 1K8KA 4EHUA 5F1XA 4YOUA 5KPRA 5CZ2A 1JCEA 3AA5X 4LC9B 3D2EA 4F3TA 3QIOA 4EIAA 4CZLA 4DSFA 5AQGA 2KHOA 5GIPA 3DLBA 4K8ZA 1KLNA 1XI1A 3CIPA 1S9GA 3DRSA 3OYCA 5TKWA 4AQYK 4Z4CA 4Z4IA 1LW0A 3O3FA 4X64K 2E2QA 1OKJA 1A5VA 4KHPK 1EO1A 2QWQA 5HP1A 4IG3A 1NKBA 4IDHA 4AHVA 2KZZA 3MX5A 4WFBL 3P83D 1NMDA 2W6LA 3DOKA 4CF2A 5ADXA 3QNOA 3PY8A 3ENBA 3C94A 3MECA 4CJEA 2A41A 3F9MA 4IO8A 4BRKA 2DPNA 3IUCA 2YNFA 2IIRA 4KHYA 2PFUA 3KZBA 5AFUA 5C25A 1XMQK 4EFHA 5C10A 3HP9A 4BVOA 3KLEA 4CJ4A 3DXKB 4DQIA 4RW9A 4BQLA 2VQFK 3KWIA 5AZIA 4LSLA 4JKGB 2Y1IA 4CFDA 3Q7CA 1GOBA 3ZEUA 2Z1HA 4KAZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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