3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
3LM9A 1GLEG 4H0YB 4K41A 4ISGA 1X3NA 4CZIA 3CJBA 3FGUA 5F1XA 2IIRA 5LJWA 3A5OC 2IVOA 3I33A 5E26A 4A2BA 2A41A 3FR0A 4FWQA 1QZ5A 3D2EB 4H0OA 1Z05A 1TUYA 1IJJA 4FOIA 4ISEA 1OKJA 3DAWA 3DXKB 1BDGA 1TUUA 1GLLO 1HUXA 4CD1A 4B1YB 3O4WA 3DXMB 4JD2A 2E88A 5AQZA 3R6MA 3VEVA 4BC4A 5KQDA 3JXUA 4FWNA 3A5LC 3KZBA 3RSEB 3W3DA 1GLFO 2J4RA 2PAVA 5JMVA 3H1VX 1Y64A 3QBXA 2QM1A 3HI0A 2QXLA 3M1FA 3WXJA 4BRLA 1SZ2A 4BRDA 5EVZA 1RGIA 3CJ7A 3R9PA 1ATSA 1QQOA 4EHTA 3U4LA 4MLEA 3VEZA 5BN8A 2A5XA 3CJ1A 4BG8A 4DQ8A 2HOEA 3VGLA 2QWMA 1XC3A 2GTDA 2W40A 5BPLA 1QHAA 2YHXA 1RFQA 1BU6O 1T6CA 4FOEA 5ADXH 1MWMA 2CGLA 2FSJA 5F2RA 2P9LA 5AQLA 1R59O 3FZLA 1MDUB 1DKGD 2FXUA 3UB5A 3W0LA 3MN6A 1NLVA 1Z6RA 2I7PA 4CZFA 3EKSA 4H5RA 1V4SA 3M6GA 3SMPA 4HTLA 3IUCA 4PKHA 5AQPA 3C0BA 4IWVA 2ZF5O 3WT0A 4B1WB 4BR9A 2YI1A 1HKGA 1NGAA 4HWIA 3VEYA 1HKCA 3B8AX 4FWKA 1U2VA 2NZTA 3WQTA 1YXQA 2GEMA 2DPNA 4PKGA 4B1ZA 4GY2B 3UKRA 3HZ6A 4JAXA 5BREA 4BQLA 4IZ9A 3TPQA 1LOTB 2FF3B 4QS8A 2P9IB 1U6ZA 4H0TB 4GNIA 3SK3A 4MO5A 4BR4A 5BPMA 3O6WA 3A0IX 4BC5A 5AQOA 4CJ7A 4FWSA 1GLAG 1HLUA 1KAYA 1NGDA 5AZJA 4AM7A 5CE3A 5AQVA 3L0QA 4BC3A 4BQZA 2D1KA 2ZWHA 4CD3A 4WQ5C 1KAZA 5I9EB 1G99A 1WUAA 4A62A 1TYQA 4FO0A 2FSNA 4BC2A 5LY3A 3A8YA 3GOIA 5AQGA 2E1ZA 3L6QA 3ULEA 1NM1A 1V4TA 2ASMA 3AARA 4FWMA 4XEIA 5JLHA 3D2FA 3J8AA 3MK6A 4K42A 1WOQA 1BA1A 4Y0WA 1ZXOA 2YHWA 2CH5A 4M7YA 2P9KA 3MCPA 3P4IA 2IVNA 3VESA 1NGEA 3D2EA 3KHYA 1BWFO 4IXCA 5TKYA 4H5TA 2NRHA 3DJCA 3VENA 2FLOA 2GWJA 3FLCO 3VOVA 4EHUA 2HF3A 3ENHA 3DXMA 4JD2B 4QS7A 3WEEB 2V51B 1T6DA 2P9PA 3HSCA 1KAXA 5AQNA 3ID8A 4MO4A 3WXIA 3AAPA 1NGJA 2CGJA 4JNEA 1U2VB 4L3QA 1BUPA 3VF4A 3ZETA 4CZKA 2YJFA 2NLXA 4F9OA 4WYBA 2D4WA 1ESVA 5AZIB 1NGGA 1NWKA 3ZX3A 3VPZA 1XQSC 3FE1A 1YVNA 3ZX2A 4CZHA 3BUZB 4BREA 1H1VA 4H5VA 3WUHA 3AAQA 2ASPA 3A5NC 4MLHA 2P9LB 3QBWA 1BO5O 3H1QA 1EQYA 4NB4A 4WQ4C 4RTFD 4H03B 1JCGA 2CGKA 5FPMA 3MDQA 5AQMA 3UE5A 4JHDB 2YHYA 3GBTA 1Q18A 2D0PA 2AA4A 4Z94A 4IJAA 5EX5A 5ADXA 4A2AA 1HPMA 1X9JA 3C7NA 4J8FA 2QWQA 2Q0UA 3CHWA 2F9WA 1GLDG 3LDOA 4RCHA 3CJAA 4IJNA 3ZEUB 2A42A 4AM6A 5LJVA 4B1XB 4DCHA 3SJHA 4BROA 3LDPA 4EAHD 4BG9A 4CI6A 3FZFA 4XH5A 2E8AA 3VGKA 5AQWA 3WQUA 3CQXA 3S41A 3D7EO 1XUPO 3HTVA 2E20A 3UKUB 3FZMA 4BR2A 2P9UB 3U8XA 3UKRB 3G25A 2GELA 2Q1NA 1E4FT 2P9KB 5BPNA 1T44A 5B8HA 5JICA 3FFKB 4O8KA 3L4IA 4XH1A 3TU5A 4FL9A 3A5MC 5EOYA 2P9IA 4CBXA 3D2FB 4CBUA 5AZIA 1BA0A 2AP1A 2E1YA 4BRFA 4WQ4A 3KVGA 3GDQA 3MN5A 3O1WA 3EN9A 3DXKA 5AQXA 4BVPA 1QQNA 2E2PA 2FF6A 5AQFA 4A61A 4BRCA 3UKUA 5AQSA 1LCUA 2Q31A 4IO8A 3BP8A 1NMDA 2D0OA 2P9SB 3VGMA 4BRPA 5FPNA 5FPEA 2Q97A 4BRKA 4FSVA 3WEEA 1RDWX 1BOTO 1NGBA 2H3GX 2ZGYA 2V7ZA 4K25A 2W41A 4KBOA 4BRIA 4BR5A 5BRDA 4FWRA 3WXKA 2HMPA 1HKBA 2E2QA 2QWLA 2QW9A 3F9MA 1QZ6A 5AFUH 4CZGA 3SLCA 4DHYA 3GL1A 3VF2A 3O80A 3M3ZA 4BGAA 2KHOA 4QS9A 2V7YA 2GUPA 2BTFA 2CH6A 3I8BA 4C23A 2YJEA 3FZHA 1CZAN 2VWBA 1S22A 4CBWA 4M7XA 3HBTA 1JCEA 5AQKA 2BUPA 2FSKA 1X3MA 2ZGZA 4CZLA 3H3OB 5BRHA 2ASOA 4M63C 2PBDA 3VETA 2A40A 3BF1A 3H3NO 1GLJO 3IFRA 3C7NB 3CI5A 1J6ZA 4BR7A 4FPAA 1C0GA 2P9SA 3VERA 3EO3A 3H45C 5FPDA 1NGFA 3LDLA 4CZJA 5AQRA 5BR9A 3EKUA 1D4XA 1NGIA 4BRNA 2QWNA 5KPZA 3VEWA 2Q36A 3OHRA 3CJ9A 3CIPA 2IVPA 1QQMA 3ZEUA 4JHDA 5JLFA 2I7NA 1HJOA 2Q2RA 4YDUC 4H0XB 1MA9B 5F0XA 1JCFA 4E1JA 5E84A 3SMSA 1GLCG 5KPTA 2V52B 4H5NA 3EZWA 3WXLA 4BRQA 3CJCA 3O08A 4BRMA 2F9TA 4B9QA 3IDHA 5AR0A 1C0FA 3AY9A 3ENOA 3ZETB 2GWKA 3EL2A 5EY4A 3O1BA 1K8KB 1YAGA 3QICA 3ATUA 4H0PA 3CERA 2QWPA 1NGHA 4BRHA 1ATRA 4K43A 1IG8A 2P9PB 1DEJA 1YUWA 4FWLA 1ZC6A 2ITMA 2HF4A 4PKIA 3HM8A 5KPRA 2VCPA 2EWSA 3LL3A 5BRFA 4BR0A 3ATVA 3QFUA 5EXWA 5BN9A 1NBWA 4BRAA 3LDNA 4EIAA 3RSEA 4PL7A 2YCHA 5AQTA 3O5BA 4WQ5A 3MN9A 4FWPA 1S3XA 1BG3A 4I6MB 2Q0RA 2QWOA 4LC9B 4YDUA 4O5FA 3QMLA 4XH4A 3ULEB 2A6AA 3H6EA 4FWOA 2WUSA 5AQIA 4B1UB 5AFUA 2E2NA 4H5WA 5AQJA 4BRGA 2P9NB 1NGCA 5AQUA 3BF3A 1TYQB 1SAZA 4JN4A 1GLBG 4FPBA 4NO7A 5ELZA 3MMVA 3GG4A 3JS6A 1KXPA 3GE1A 1DGKN 1SQKA 1HX1A 2P9NA 4CZMA 1ZBSA 3IMXA 5AQHA 2OANA 3LM2A 2A3ZA 4H0VB 4PL8A 3QB0A 4CZEA 1P8ZA 4EFHA 4RWTA 5AZJB 5AQYA 3U9ZA 3U9DA 3ZX0A 3CQYA 4ISFA 3VF6A 5KQ8A 3MN7A 3H46O 3VEXA 3O8MA 3FZKA 3BEXA 2P9UA 2UYTA 3LDQA 3CETA 3QFPA 1K8KA 1ATNA 1MWKA 5AQQA 3QDKA 3VEOA 4B1VA 4DB3A 2E2OA 2VYPA 2QWRA 4BGBA 3DWLA 4I6MA 3R8EA 4BVOA 1E4GT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UOCA 1TL1A 4H0YB 4O55A 4JK8A 3CJBA 3A5OC 4E19A 3I33A 4A2BA 3JAMO 2A41A 4CF8A 2DTUA 1Z05A 4G1QA 3ZT3A 1VQ6N 1IJJA 1VSEA 1BDGA 4IOXA 1TAUA 3OYEA 2G8IA 2E88A 4K8XA 3R6MA 3VEVA 3NE6A 3ID6A 4FWNA 1NJIO 3A5LC 3CPEA 3W3DA 2J4RA 2PAVA 1XMQK 5M1KA 3H1VX 4EZ9A 4I7FA 4FJGA 3QBXA 1F21A 4M3TA 4JV5K 3SQ1A 3I55N 1RGIA 3RR8A 3R9PA 4CHOA 1QQOA 1S1WA 2GX9A 3U4LA 4EHTA 4MLEA 2A5XA 4FJ9A 3CJ1A 2WOMA 4DTSA 1RBVA 3AO1A 1RT2A 4X62K 4JRPA 4X66K 4FJ7A 4JI1K 2QK9A 2YHXA 1RFQA 1T6CA 4NLBA 2CGLA 3PIPL 1SUQA 3UB5A 3IS9A 5GAHP 1FXXA 1OH6A 1Z6RA 3CPWM 4CZFA 3NF8A 3O9RA 3EKSA 1KFSA 2HHHK 4KH4A 4OPAA 2O8CB 4BR9A 4B1WB 2YI1A 2B4JA 4HWIA 4ELVA 3THXB 4CJPA 4CHNA 3Q7CA 1IKWA 1RBTA 4K8ZA 5HRNA 1Q8IA 4FYDA 4GY2B 1XHZA 3TAPA 4LSLA 4ICLA 5BREA 2IGIA 4IZ9A 3VQ4A 1LOTB 4BQLA 1IBKK 1ZBIA 2ZE2A 4QS8A 2P9IB 4OLBA 3TAEA 1YJWN 4CVNE 3KJVA 5KI6A 4BR4A 1L3UA 1CLQA 5AQOA 3KK1A 3MWTA 3NGYA 4R79A 1NU0A 4NXMK 4AM7A 4OKEA 2ZWHA 4LF7K 1WUAA 4YFUA 4A62A 1TYQA 1C1BA 2W6LA 2E1ZA 2O4IA 3ULEA 1V4TA 3D2FA 3J8AA 3MK6A 1WSFA 4DU4A 4Z4EA 2HNYA 3V9SA 3RVCA 3O4NA 3MCPA 2IVNA 4H5TA 3NBPA 1VQ4N 2KFNA 3ENBA 2E6LA 3FLCO 1YHQN 4EHUA 3ZSXA 4IFEA 1XC9A 1KAXA 2ATQA 4V19S 4DR6K 3WXIA 3AAPA 3VF4A 4CZKA 1QQCA 5C24A 3D45A 3C6UA 2D4WA 1EKEA 5JS2A 1C6VA 1NWKA 1XQSC 2NRRA 5IT9O 4BREA 3WUHA 1VSLA 3AAQA 4ZTJA 3QBWA 4ZTFA 5DM7L 3RRGA 4KHYA 1BO5O 4DUYK 3V9UA 4FJLA 5A2QO 5J1EA 5FRMA 1JCGA 2KQ2A 3MDQA 4KHQA 3TARA 2JGUA 3RMBA 5CY4A 4RW7A 4KTQA 1Q18A 3IAYA 5HRSA 4IEEA 3CCRN 5GAGP 1WAFA 3VQPA 4HUEA 1HPMA 1VSDA 1X9JA 4FK0A 3DI6A 4AQYK 2F9WA 4RCHA 1QVGM 4CJTA 3EYZA 1RCHA 3OYGA 4LF9K 4AM6A 5LJVA 1CZBA 4DQPA 1N8RO 3LDPA 4TSXA 3ITHA 1REVA 3AVNA 2OTLN 5LMNK 2OPPA 4BG9A 4CI6A 4GKJK 4GV9A 3KKRA 2WBNA 4NYNA 4FW1A 3CFOA 4RW4A 1M1KO 3ZT2A 1Q86O 1HYZA 3S41A 1RT7A 4FJNA 2E20A 3KWGA 2YKMA 4DTRA 4JI4K 4GV6A 3U8XA 4I2QA 3UKRB 1WSJA 4JI5K 2GELA 2RKIA 3SAGA 4O8UA 5BPNA 4M41A 2HB5A 3MWPA 3CFPA 4N41A 3L4IA 3CQ8A 1CZ9A 3VQCA 4JEPA 2D0BA 4XIUA 4DV4K 3CM5A 2PZSA 1I39A 4CJRA 4BRFA 4O5BA 4WQ4A 1B9FA 4BVPA 3OJSA 2E2PA 3DRPA 5AQFA 1WSGA 1N33K 4CK3A 4IO8A 3NH1A 5J2MA 4FK2A 3IRXA 4OGEA 1X1PA 5M1OA 1BCOA 3AO2A 5HRPA 3DM2A 2HNDA 4BRPA 1WB9A 3LWLA 3PY8A 3AGKA 2Q97A 1WNSA 1BQMA 2D5RA 3IG1A 1BOTO 1NK6A 3MXMA 3O3FA 4BRIA 1LWFA 2E2QA 2XY7A 1B92A 1QZ6A 5AFUH 3FFIA 3CMEN 4DHYA 4DLGA 4J2AA 3VF2A 3OTOK 1VQMN 4N56A 1IV0A 4YNQA 2GUPA 1XHXA 4CBWA 4CEQA 5AQKA 1C1AA 1YVUA 4NYFA 4B3MK 4CZLA 5BRHA 2ASOA 2B5JA 1C1CA 3OW2M 3VETA 2HHUA 4B8AB 3ZSRA 1ZBUA 3CG7A 4LH5A 4FJMA 4I2PA 4E89A 4FLWA 1C0GA 1WAJA 2NRVA 2W6KA 2P9SA 1HJRA 4NCAA 1RDUA 3OYBA 1NGIA 4OGCA 3VEWA 3SQ4A 4JKBA 1VQPN 3PLAA 3CCUN 1YTUA 3OS0A 1NKEA 4H0XB 5F0XA 1JCFA 3SMSA 4I9LA 3P38A 5KPTA 2PYLA 3DYAA 1RT3A 3IDHA 3PIOL 3E9PA 1WSHA 4FVUA 3VN5A 3SZ2A 1K8KB 3L2VA 2NRZA 3QICA 3HVRA 3CERA 3V9WA 3PSIA 4DR2K 3SI6A 4M3XA 3HM8A 2EWSA 4WFNL 4B9TA 4BR0A 1S9GA 5BN9A 4JK7A 2IC3A 3MXIA 3LDNA 1EO1A 1S72N 4PL7A 1U45A 5AQTA 3O5BA 4WQ5A 4FWPA 2D0CA 1BG3A 4G9ZA 1TKTA 2FBVA 1HNIA 4FWOA 3G6EN 4HCCA 2X6NA 4CGHA 5AQJA 1QSYA 1DLOA 4RW9A 3ZYYX 1GLBG 4FPBA 5C2DA 1NK7A 4DV5K 1KXPA 3GE1A 4CE9A 3AVHA 1KLMA 1HX1A 4CZMA 3VQQA 3HOSA 1KSPA 5AQHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3THY A;  3ZSW A;  4E7J A;  4IG3 A;  1NNE A;  3ISN C;  4FSV A;  3HXM A;  3K5O A;  1HPZ A;  4KPY A;  4RW6 A;  3OYC A;  1NK4 A;  3L3U A;  4K25 A;  3M8R A;  4DR3 K;  4B3R K;  4KRF A;  2HMP A;  1BQN A;  3NF6 A;  3F9M A;  4DFM A;  2KLA A;  3GL1 A;  3KK7 A;  1JLE A;  1S9E A;  3THX A;  4BGA A;  3U6F A;  1VQN N;  1JJ2 M;  3CCJ N;  3I8B A;  2HW3 A;  4H8K A;  3RWU A;  4B9V A;  1YJ9 N;  1JCE A;  4JS4 A;  2FSK A;  5C42 A;  1X3M A;  4HTU A;  4DLE A;  3H3O B;  2VGN A;  2RF2 A;  1YTA A;  4M63 C;  1N32 K;  3K2P A;  2HHT A;  2A40 A;  2X6S A;  1GLJ O;  3IFR A;  2O8D B;  1L3V A;  3CI5 A;  4WE1 A;  4LH4 A;  4RG8 A;  4FJK A;  1NKC A;  5HOO A;  3EO3 A;  3H45 C;  3ZSQ A;  5AQR A;  4J2B A;  1D4X A;  4BRN A;  1JLC A;  3ZSZ A;  4ILG B;  5KPZ A;  4CJE A;  2F8S A;  2Q36 A;  3F2K A;  3OHR A;  2IVP A;  4CEZ A;  5MLC Q;  1IO2 A;  4B3T K;  1NOZ A;  2Q2R A;  4YDU C;  1D8Y A;  1MA9 B;  3E9L A;  3NH2 A;  2V52 B;  1W0H A;  4H5N A;  3QNN A;  5HP1 A;  1QHT A;  1JXB A;  4H4M A;  1ZBL A;  4N76 A;  3HPG A;  3EL2 A;  5EY4 A;  3NF7 A;  3V4I A;  4K43 A;  2D0A A;  3OBY A;  1I94 K;  3THV A;  4CF1 A;  3K5L A;  1DEJ A;  3V81 A;  1ZC6 A;  4OPH A;  3S3M A;  3PX4 A;  3C94 A;  3LL3 A;  4LF8 K;  4OLA A;  2WTU A;  4DV1 K;  3KKS A;  3HM9 A;  3LP0 A;  5JVH L;  1L3T A;  1ITG A;  5FLX O;  2YCH A;  3QEX A;  4YDU A;  2QWO A;  4DV6 K;  3OYA A;  2A6A A;  4JI0 K;  5AQI A;  1QSL A;  4FJJ A;  1BIU A;  5AFU A;  3F5T A;  1RDC A;  4E7I A;  2P9N B;  1NGC A;  3QET A;  1KD1 O;  1UA1 A;  1SAZ A;  4AHC A;  3KLI A;  5ELZ A;  3C6A A;  3QEI A;  4CFC A;  1WSE A;  1W7A A;  4KHP K;  3JS6 A;  1DGK N;  3AO5 A;  1C0U A;  4DF4 A;  1ZBS A;  3IMX A;  3UIQ A;  2RE2 A;  4RWT A;  3U9Z A;  4CHP A;  3VF6 A;  2DY4 A;  3HVT A;  4JKG B;  4BE2 A;  4DSE A;  3BEX A;  1E3M A;  2P9U A;  2UYT A;  1NMN A;  3LDQ A;  1LWE A;  1ATN A;  5AQQ A;  4J2D A;  5KTQ A;  3OYM A;  2QKB A;  1TKZ A;  4GV3 A;  3R8E A;  4Y1D A;  5IWA K;  1E4G T;  3LAK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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