3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
2Q31A 4RWTA 5AQMA 5B8HA 4PL8A 3R9PA 5BRFA 4A61A 1S3XA 4BRPA 1GLEG 1C0GA 1HUXA 4CZEA 1U2VA 2P9IB 3SMPA 5JICA 3O1BA 3FZFA 1DEJA 1Z05A 4FWPA 4JN4A 3WEEA 3VENA 2UYTA 1NGJA 2J4RA 2H3GX 2FSJA 4WYBA 5EOYA 3SK3A 1X3NA 2IVPA 3AY9A 3U4LA 3MN9A 2ASMA 4WQ5C 5EXWA 3SJHA 3W0LA 3HSCA 1S22A 3UKUA 2E2NA 3DXKA 1KAYA 4FOEA 3UB5A 1IJJA 3ID8A 1BA1A 3MN6A 1YXQA 1HPMA 3KZBA 3R8EA 4DCHA 4GY2B 2YHYA 1ATRA 1NGGA 4MLHA 5AQIA 4BC2A 1NGEA 3GG4A 4CBWA 1V4TA 3BF1A 4ISEA 4JHDB 4EHUA 4FWSA 1K8KB 4H0TB 2GWKA 3CHWA 1E4GT 4H5WA 4BC4A 4CZGA 1XQSC 3A8YA 5LY3A 1BWFO 3OHRA 4H0XB 3BP8A 3QMLA 1HJOA 3H1VX 5AQVA 2P9NA 2QXLA 3FZHA 5F1XA 2P9SA 3H3OB 1BG3A 2E2QA 3EKUA 2DPNA 4JAXA 3MCPA 3O80A 5FPMA 3UKRA 5AQLA 4H5TA 1NWKA 1ATSA 4FL9A 4K43A 4B1WB 3LM2A 5LJWA 3ULEA 1SQKA 5BN8A 1HKBA 3WEEB 4YDUA 4BRCA 3VGMA 3ZETA 3O6WA 4FPBA 2F9TA 2Q0RA 5AQOA 2GEMA 3AARA 4IJAA 4JNEA 1MWKA 4BR9A 5KPRA 1X9JA 4FPAA 1BU6O 3CJBA 2QWPA 3WQTA 4FWKA 4BRFA 4F9OA 4FOIA 1QZ5A 4XH1A 3EKSA 2CH6A 5BPLA 2P9UA 3QFPA 5KPZA 3L4IA 1QZ6A 3BF3A 4BR4A 5AQFA 3O1WA 3VGKA 3DJCA 2ZGYA 2CGLA 1YAGA 2D0OA 3IMXA 3FLCO 3H3NO 2YHWA 3MN5A 4H0PA 3QDKA 1LCUA 3VESA 1NBWA 4H0YB 1OKJA 2P9SB 5ADXA 3VEYA 4PKGA 3H1QA 4AM7A 4K25A 4M7YA 1KAZA 2HOEA 3VEXA 3QBXA 3QB0A 1DGKN 3HBTA 3TU5A 3U9DA 1ATNA 3CJ9A 3WT0A 4EAHD 1WUAA 1V4SA 1NGDA 4YDUC 4HTLA 3FR0A 4JD2B 5AQZA 5AZIA 5AQTA 4K42A 4BR2A 4BRNA 2A40A 3U9ZA 1EQYA 1MWMA 3O8MA 3P4IA 3FGUA 3ZETB 2VCPA 2YHXA 3CQYA 3WXKA 1JCFA 4EFHA 4RTFD 4BRAA 4B1VA 1GLLO 1TUYA 1NGIA 4H5VA 5EY4A 3VF4A 2IVNA 2QWLA 5BREA 4CZIA 4O8KA 4BGBA 3M3ZA 3IUCA 4CI6A 4CZHA 4IXCA 4DHYA 4CZLA 1MA9B 5AZJB 2GUPA 1XUPO 3FFKB 2FF3B 3CJ1A 4AM6A 4GNIA 2FXUA 2V51B 4A2AA 3LL3A 3DXMA 4Y0WA 4H5RA 3O08A 1RFQA 2E1YA 1NLVA 5AQUA 3VPZA 3EZWA 1Z6RA 3FZMA 3ZEUA 4BQLA 4FWOA 4CD1A 4NB4A 3B8AX 5AQYA 2W41A 2W40A 2QW9A 4H5NA 3CETA 1WOQA 4BRMA 1HX1A 1TUUA 5AFUA 2A6AA 4CBUA 1G99A 4CBXA 2D0PA 3GDQA 3RSEA 1HKGA 4B1YB 1TYQB 3HZ6A 4B1ZA 5AZIB 5AQJA 3D2EA 1GLFO 1CZAN 2QWQA 1Y64A 3VERA 4A62A 3W3DA 3S41A 2P9PA 3CIPA 5E84A 1MDUB 1U2VB 2QWOA 3F9MA 2ZF5O 4ISFA 2GELA 5I9EB 4BROA 1U6ZA 5AQNA 4BRIA 3MK6A 2GTDA 2D4WA 1NM1A 5KQDA 1QQMA 4B1UB 4CD3A 1GLCG 2NZTA 4BC5A 3JS6A 3UKUB 3DXKB 3VETA 3C7NA 2D1KA 4FSVA 4I6MA 4L3QA 3MMVA 3HM8A 2QM1A 4E1JA 4KBOA 3DWLA 3FZLA 3QFUA 2NLXA 1C0FA 5ELZA 3A5NC 2YJEA 5AQPA 4BC3A 4CZMA 1GLDG 1T6CA 1X3MA 3L0QA 4MO5A 4BQZA 2QWRA 3ZEUB 5JLHA 3WQUA 2P9IA 3CERA 2EWSA 3O4WA 2QWMA 5BRHA 4BRKA 4XH5A 5AQWA 1GLBG 1QQOA 4EIAA 5AQSA 2V7YA 2P9NB 3LDLA 2BUPA 4PKHA 5FPDA 1YVNA 3J8AA 1T44A 3RSEB 1HKCA 1RDWX 2A3ZA 2PAVA 1YUWA 4BRDA 4RCHA 3UKRB 3A5LC 2HF4A 3HTVA 3BUZB 2I7PA 2FSNA 3SMSA 1NGFA 5F0XA 5BRDA 3G25A 3ULEB 1BUPA 4BRGA 3WXJA 3FE1A 5AQRA 1BOTO 3FZKA 4BG9A 3VF2A 3L6QA 1ZXOA 4BR7A 1K8KA 1SZ2A 3CQXA 4H0VB 3WXIA 1JCGA 4B9QA 4PKIA 4DB3A 3EN9A 1KAXA 2E2PA 1QHAA 2I7NA 3GE1A 5AFUH 3HI0A 5AQXA 2Q0UA 1RGIA 5JMVA 5BPNA 3O5BA 1DKGD 1ZC6A 4XH4A 4FWMA 2FLOA 2P9UB 2Q97A 4DQ8A 2AA4A 5FPNA 3C0BA 3H45C 2CH5A 4NO7A 3VEZA 3VOVA 1NMDA 4M7XA 3VGLA 4IZ9A 4K41A 2V7ZA 3WUHA 1XC3A 3KVGA 1R59O 3VF6A 4B1XB 3LDOA 4BGAA 3IDHA 2YCHA 3I33A 3LDQA 1D4XA 4WQ4A 1Q18A 3CJ7A 1NGCA 4CJ7A 3VEOA 1ZBSA 4FO0A 1JCEA 4MLEA 3TPQA 5EVZA 1GLAG 2F9WA 3VEVA 4O5FA 1P8ZA 3UE5A 1ESVA 3ENHA 1GLJO 3WXLA 4XEIA 4PL7A 2ITMA 2PBDA 3QICA 4MO4A 4QS9A 2E8AA 3I8BA 4BVOA 1KXPA 3ENOA 2CGJA 3EL2A 3A5MC 1HLUA 2VYPA 5BN9A 3CI5A 4BR0A 1BO5O 2A41A 4BG8A 5LJVA 2YI1A 5AQGA 4M63C 2P9LA 3SLCA 3MDQA 3AAPA 4BR5A 4CZKA 5ADXH 3ATUA 4A2BA 3MN7A 1SAZA 3GBTA 2FSKA 3CJCA 4IWVA 2ZGZA 2E20A 3JXUA 5AR0A 1QQNA 2WUSA 4FWQA 4JD2A 3ZX2A 2NRHA 5JLFA 1BDGA 3D2FA 3DXMB 2V52B 4WQ4C 5AQQA 3M1FA 3D7EO 5AQHA 4BVPA 3CJAA 3IFRA 4EHTA 3DAWA 5CE3A 4FWNA 2P9KA 3M6GA 2QWNA 1NGBA 5KPTA 4H0OA 3VEWA 2YJFA 2E1ZA 2Q36A 4BREA 4HWIA 2A5XA 4FWLA 2Q1NA 2KHOA 3A5OC 4QS8A 4ISGA 4Z94A 3A0IX 1NGHA 5EX5A 4C23A 3EO3A 4J8FA 4IJNA 1LOTB 5FPEA 2ASPA 3D2EB 3AAQA 2Q2RA 1IG8A 2VWBA 2GWJA 3U8XA 5AZJA 2E2OA 4BRHA 5BPMA 3QBWA 3H46O 4WQ5A 5AQKA 1T6DA 4CZJA 4LC9B 4CZFA 3LM9A 2ZWHA 3KHYA 2AP1A 2P9PB 2HF3A 2OANA 3ATVA 4JHDA 1J6ZA 2FF6A 5KQ8A 5BR9A 2P9LB 1BA0A 2CGKA 2IIRA 3R6MA 4IO8A 4H03B 3LDPA 3ZX0A 3BEXA 4BRQA 2HMPA 1H1VA 4BRLA 2A42A 1NGAA 3GL1A 3LDNA 5TKYA 3C7NB 2BTFA 2IVOA 2E88A 4FWRA 3GOIA 3H6EA 4I6MB 5F2RA 3ZX3A 1E4FT 1TYQA 3D2FB 5E26A 2ASOA 4QS7A 2P9KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EEQA 2QA4N 2W6LA 1XMOK 3R9PA 1RT2A 5E41A 1RTJA 4V19S 1C0GA 1HUXA 4CZEA 1U2VA 2YHAA 1DEJA 4JN4A 1A5XA 3S9HA 1TAUA 2A1RA 4OKKA 2OYQA 1X3NA 2IVPA 4E7IA 2ASMA 3SJHA 5H1SQ 3W0LA 1KSPA 3HSCA 3CM5A 4W5OA 4FJ5A 3DXKA 1KAYA 4X64K 4A5BA 4N5SA 2VQFK 3O3GA 2RN2A 3QINA 3MN6A 4KKOA 3RRHA 4DTSA 1YXQA 3LAKA 4AHSA 1SV5A 4DCHA 4DKWA 2YHYA 4E7KA 2ZJRL 5AQIA 1KFDA 5CHIA 1S1VA 4ISEA 1KVBA 3E1YA 1N33K 1NK9A 2GWKA 2DFHA 1VSIA 1JLCA 3BP8A 3QMLA 3ZSOA 5GAEP 3LP1A 4DTPA 2QXLA 3RRGA 4K8ZA 2P9SA 3H3OB 4BE1A 4JI4K 4JAXA 4CHOA 2NRXA 1ASVA 3L2RA 3AVKA 3T1AA 2EX3A 4OPAA 4DTNA 2F7TA 1FXXA 1JLEA 3R3LA 1FKOA 1XHZA 1BISA 4IG3A 3T3FA 2XRIA 3SV4A 3THYA 4YDUA 4U7BA 2P5GA 4CK2A 3ZETA 3QO9A 4KHWA 2Q0RA 3AARA 1Q7YO 4DWIA 1LW0A 3VQEA 3QETA 2QEXN 3VQCA 2YNHA 2QWPA 3WQTA 3AVJA 5KRTA 1NK7A 3HP9A 4CGGA 4IDHA 4I7FA 5BPLA 4DV6K 1NJIO 1QZ6A 1DT9A 4BR4A 1LW2A 4GMJB 3DJCA 2CGLA 3U3GA 3C94A 3TWHA 3M8PA 4E19A 3KLFA 3IMXA 4FLXA 2XY8A 5BR8K 1F21A 3K59A 1NBWA 3NH2A 4H0YB 4JKFA 4LFBK 3MWTA 3LZIA 5ADXA 1HQUA 3VEYA 3OYKA 1NG9A 4AM7A 4CF9A 4HTUA 2NNWA 4R79A 3QB0A 3HBTA 3TU5A 1V4SA 4HTLA 1GOBA 4JD2B 2ITGA 4M3RA 1EXQA 3ZSQA 1VQLN 2A40A 4FM1A 4AHVA 3O8MA 3CQYA 4OPKA 2B6AA 2YV0X 4CFCA 3M5RA 1OVQA 1TUYA 1HR0K 2QWLA 4CZIA 4CJWA 1UAXA 4O8KA 5IT9O 1REVA 3KD1E 1NKEA 4KB1A 4B3MK 3DYAA 4I2QA 5J2QA 3P5JA 5M1KA 3TR8A 4GNIA 1S9GA 3J7YP 1VSMA 3DXMA 2VG7A 1RFQA 1BQNA 1NLVA 4F8RA 3VPZA 3EZWA 4BQLA 4YNQA 3QIOA 4JEPA 4FWOA 4CD1A 1IKVA 3EYZA 4HHTA 2X74A 4H5NA 2Y1IA 3CETA 1ZBHA 4B08A 2ATQA 4J2EA 1TUUA 3AA2A 5HLFA 1N36K 4CBXA 4CHNA 3GDQA 4B1YB 4B1ZA 3OYAA 2RHKA 5AZIB 4BWJA 3SNNA 3D2EA 2UUBK 3KK2A 1BHLA 4DG1A 4HUFA 3KIOA 3CPEA 3OYNA 1S1XA 3W3DA 2P9PA 3O9QA 1QQCA 3CIPA 2DTUA 4CHZA 4N56A 3F2KA 3B6PA 4ISFA 2GELA 3K5MA 3E01A 3NF9A 4BROA 1TKXA 1D5AA 4DV1K 5KQDA 4B1UB 3I55N 1NK0A 4AHCA 3AGKA 4O4GA 2KZZA 1NU0A 3VETA 3C7NA 4JYAK 2HBMA 4FSVA 5T7BA 1EX4A 2VGNA 4KBOA 3FZLA 3AO3A 4IEEA 4YOXA 4O5BA 3C6UA 2YJEA 3V1RA 4W5QA 5K14A 4KRFA 2QWRA 4KV8A 4C1NI 4MQ3A 1U47A 1C1CA 5AQWA 4HVJA 1GLBG 2FBVA 3V81A 2V7YA 3MEDA 2BUPA 1TK0A 4DV5K 2A3ZA 4BRDA 4CHQA 3AA4A 3O3FA 3UKRB 3HYFA 2I7PA 4B9MA 3HM9A 5F0XA 1W2BM 3T7ZA 3ALYA 3A2FA 5AQRA 3FZKA 4BG9A 3VF2A 1ASUA 1ZXOA 3L6QA 4LF7K 4BR7A 4FZZA 2UXBK 1SZ2A 4H0VB 3DRSA 4DSLA 4DQRA 4DB3A 1Q8IA 3PO4A 2E2PA 3KK1A 4DSJA 5AFUH 3CCSN 3CMAN 3WXMB 3MXIA 1DKGD 3N4PA 4JKHA 1ZC6A 1U45A 4FWMA 1IBMK 4DLEA 3QNOA 1T05A 4IZ9A 1XC3A 3VF6A 1JL1A 1XI1A 4E0DA 3ZCMA 3OVNA 4Z4EA 4WQ4A 3CJ7A 4DTXA 4CJUA 3Q7BA 1NK8A 4DR1K 1ZBSA 3C65A 4F4KA 2HNZA 4B9TA 3NF8A 2F9WA 3VEVA 3SI6A 2HHTA 3VQ9A 1P8ZA 2OPSA 1XMQK 4DSEA 3PSIA 3NFAA 4XEIA 4QS9A 3VTHA 5C15A 4JKDA 2B4JA 4BVOA 1WAFA 3K58A 5DK5A 4FJ9A 3O9TA 2CGJA 4EP5A 1L5UA 3AVHA 4BE2A 4CIEA 3CI5A 1ASWA 1C6VA 1RT7A 2YNGA 3F5TA 5FROA 3VQAA 4CZKA 5ADXH 1Z26A 3HPGA 1W97L 1D9DA 1VQ5N 1VQ9N 3GBTA 3CJCA 4IWVA 2ZGZA 3MECA 4CJRA 5LL6Z 1QQNA 4CGFA 4JD2A 3ZX2A 3M1FA 5AQHA 4FM0A 3CCEN 4CEQA 1JJ2M 4KTZA 1B9DA 4Z0UA 4H0OA 2O8EA 4DF4A 2G8KA 3SQ2A 3HSTB 2Q3SA 2KHOA 1B9FA 4QS8A 4J2DA 4M3UA 4ISGA 3PV8A 1HYVA 1NGHA 5EX5A 1I3AA 2UXCK 4IJNA 2ASPA 3U8XA 2VG5A 5JS2A 5BPMA 1TKTA 1VQPN 4Z4HA 5AQKA 3H46O 4LC9B 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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