3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
3BP8A 4ISEA 1LOTB 3OHRA 4PKGA 3CQXA 5AQPA 3ZEUA 4FWRA 4NO7A 3ATVA 3AY9A 3KZBA 4J8FA 3O1WA 1D4XA 2QWLA 3IDHA 3ZX3A 4I6MB 3QBWA 3VETA 3CJAA 4BREA 3CJ7A 4PKHA 4FWOA 4A61A 1BA1A 2A42A 3CQYA 3FLCO 3SLCA 5BPNA 4XH4A 4YDUC 5KQDA 1X3MA 3UKRA 5AQLA 4FPBA 3R8EA 3D7EO 3ZETA 3LDNA 3VEOA 5JLHA 4CI6A 5JMVA 2YCHA 2QWMA 4M7XA 4H0OA 4XH1A 3DWLA 3WXKA 3CIPA 5EXWA 2ITMA 5AQHA 4A2BA 4RTFD 4A2AA 4WQ4A 4BRGA 3U9DA 5FPDA 1SZ2A 3H1VX 1Z6RA 4BVOA 2W41A 1BDGA 3O08A 4HWIA 1MDUB 5AFUH 3MN6A 5AZIB 4BRCA 5KPRA 3BF1A 5ADXA 1TUUA 4BR7A 3LM2A 4BRKA 2FSJA 3DJCA 4FWNA 4MO4A 3ATUA 3FZMA 4MO5A 4B1YB 1RDWX 3EKUA 4EAHD 4RWTA 2P9KB 1K8KB 3FR0A 4IXCA 3VENA 4H5RA 3QBXA 1HPMA 4XEIA 1QQNA 1DGKN 2IIRA 5E84A 1QQOA 5F0XA 3I8BA 1SQKA 4BRNA 4EHTA 3O4WA 1RFQA 3CJ1A 1KAZA 5AQJA 1NLVA 3O1BA 1KXPA 2DPNA 3W0LA 3VEVA 4BC4A 5EY4A 3HTVA 1T6CA 4BG8A 4KBOA 2VCPA 3CI5A 5BRFA 3VERA 4B1VA 3HM8A 1Q18A 3KVGA 4H5TA 1TUYA 2GWKA 4Z94A 4I6MA 1XUPO 2CH6A 4CZMA 3H46O 3JXUA 5BPMA 3QFUA 5AQIA 3LDLA 1TYQB 3CETA 2AA4A 3A5OC 3AAPA 4BVPA 2V7YA 4CBWA 2P9IA 2YJFA 3FZHA 2Q36A 2P9LB 4FWMA 1Z05A 4BG9A 3WXLA 5KPZA 3MN9A 2E2QA 2CGLA 2D0PA 2QWRA 2FSKA 3HZ6A 4EIAA 3IMXA 1KAYA 2GTDA 5I9EB 2OANA 3J8AA 2A41A 4BRDA 1YUWA 4B1WB 2FXUA 4YDUA 2F9TA 5AQVA 3VEWA 1RGIA 1ZXOA 4FSVA 4H03B 2Q0UA 4MLHA 2HMPA 4GNIA 3VEYA 5EX5A 1XQSC 1V4TA 3FFKB 1NGDA 3D2EB 4BC3A 1BO5O 3EL2A 1NGEA 2BTFA 2CH5A 5AZIA 3FZKA 3O80A 1GLCG 4IJNA 4BQLA 2ZGYA 3LDQA 4K43A 1IJJA 1OKJA 2ASPA 4AM7A 5KQ8A 2GUPA 1J6ZA 3GL1A 4O5FA 2D0OA 3FGUA 3ZX0A 4ISGA 2P9KA 2GEMA 3R9PA 3C7NB 3SMPA 2P9SA 1NWKA 2IVNA 3CERA 4H5VA 5CE3A 4H0PA 2ZF5O 2E88A 4GY2B 5AQUA 4BR9A 5BN9A 3DXMA 1JCEA 4H5NA 4EHUA 4CZGA 4WQ5C 3ULEB 4FOIA 3B8AX 4CJ7A 3WEEA 4JHDB 2E8AA 2A6AA 3EN9A 4BRFA 5BRHA 1T6DA 1U2VA 5FPNA 4BRHA 3R6MA 2P9UB 4BRAA 4EFHA 2E2PA 5AFUA 5BRDA 2P9NB 5JICA 5BR9A 5AQNA 2GWJA 2E1YA 1NGJA 1ATSA 1TYQA 1WOQA 3QICA 4CBXA 1C0FA 3WQTA 2A3ZA 3D2FB 4IJAA 1QHAA 4M63C 3UKUB 3L6QA 4FWQA 2P9LA 1Y64A 1BWFO 3EKSA 4FPAA 3IUCA 4BR5A 3O8MA 4BRMA 2QXLA 4FWSA 2J4RA 3U8XA 3IFRA 2ASOA 2HF3A 3VGMA 3WQUA 1EQYA 3WXJA 4B1XB 3VF2A 1NM1A 1G99A 3FE1A 1CZAN 3I33A 1YAGA 3ZEUB 2GELA 4BQZA 2BUPA 5AQWA 3ZX2A 4JN4A 1HKCA 3W3DA 1ATNA 1IG8A 2E1ZA 3RSEB 3QFPA 3VESA 2QWOA 3HBTA 4H5WA 5LY3A 3P4IA 1WUAA 2PBDA 2Q31A 3SK3A 5AQTA 3HI0A 3D2EA 4BC5A 1U6ZA 3ID8A 5AZJB 3F9MA 3MN5A 3UKRB 4BC2A 2YHXA 3ZETB 2HF4A 3MK6A 4XH5A 5EOYA 3TU5A 3MN7A 3BEXA 3SMSA 3DXKB 1HX1A 4K42A 4BRPA 3C7NA 1JCGA 4H0VB 1DKGD 2IVPA 3WXIA 3H6EA 4PL7A 2QW9A 4Y0WA 2E2NA 5E26A 1MWMA 3M3ZA 1YVNA 1ZC6A 2P9PB 4IWVA 4BRIA 3ENOA 5AQSA 2KHOA 2E2OA 4IZ9A 1GLBG 2V7ZA 3SJHA 2FLOA 2QWPA 5AQQA 3JS6A 4AM6A 3VOVA 1NGCA 2CGKA 1GLDG 4JHDA 1E4GT 1BG3A 3EZWA 2FF3B 3CJBA 3EO3A 3LM9A 4JAXA 4DQ8A 4K25A 2HOEA 5AQOA 3A8YA 4DB3A 3ENHA 3A5MC 4L3QA 1NGHA 3H45C 5LJVA 1NGGA 3UKUA 1ATRA 3VF4A 3VEXA 2NRHA 2QM1A 4BR0A 1NGAA 3MMVA 4QS7A 1GLJO 4MLEA 1HJOA 5B8HA 3AARA 2NZTA 4QS8A 4C23A 1K8KA 2F9WA 4DHYA 5AQZA 4FWLA 1X9JA 3M6GA 4E1JA 1S3XA 5ELZA 1X3NA 3H3OB 1KAXA 1MA9B 2Q2RA 3C0BA 2YHWA 4CZKA 2NLXA 3RSEA 4ISFA 4CZJA 2ZGZA 3UE5A 4CZFA 1GLEG 3GE1A 5FPEA 5TKYA 1V4SA 4CBUA 2D4WA 2VWBA 2YHYA 3CJCA 5AQKA 2P9IB 1QZ6A 5AQMA 5AZJA 3A0IX 3CJ9A 3VPZA 4CD1A 4PL8A 1BUPA 3H3NO 5BN8A 2CGJA 1P8ZA 3DAWA 2H3GX 3L0QA 1E4FT 4FOEA 1H1VA 4JD2B 4JNEA 2QWQA 3DXKA 2ZWHA 2VYPA 2E20A 3LDPA 1BA0A 3LL3A 4K41A 4B9QA 1SAZA 3A5NC 4H0YB 2W40A 1GLFO 4HTLA 2P9PA 3GG4A 1R59O 1JCFA 4O8KA 2A5XA 2EWSA 1S22A 3GBTA 2AP1A 2ASMA 3BF3A 4FL9A 5BPLA 5AR0A 3CHWA 3QB0A 1BOTO 1DEJA 2I7PA 4QS9A 4BGAA 5KPTA 1QQMA 5BREA 5AQRA 2FSNA 4BRLA 1MWKA 5AQYA 4FO0A 1YXQA 2PAVA 3AAQA 1XC3A 4FWKA 5AQGA 5FPMA 3WT0A 5F1XA 1GLAG 4BRQA 3VEZA 3TPQA 5F2RA 4FWPA 3QDKA 3L4IA 3H1QA 3UB5A 4CZIA 3WUHA 3A5LC 2Q97A 5ADXH 2P9SB 1GLLO 4WQ4C 3U9ZA 3O6WA 1NGIA 4M7YA 2A40A 3QMLA 3M1FA 3GOIA 2WUSA 1ESVA 1ZBSA 2UYTA 3VGLA 2Q1NA 3DXMB 2QWNA 5AQFA 3MCPA 5EVZA 1NGFA 3S41A 1C0GA 2YJEA 3BUZB 2FF6A 4BROA 3WEEB 4CZHA 1HKBA 4B1ZA 5AQXA 4LC9B 4WYBA 1U2VB 1T44A 4CD3A 5LJWA 3VGKA 4DCHA 1HLUA 1HKGA 2D1KA 3ULEA 4BGBA 4BR4A 2V51B 4IO8A 4B1UB 1BU6O 2YI1A 2V52B 3LDOA 4CZEA 2P9UA 4A62A 2Q0RA 1NGBA 4H0XB 4F9OA 3FZFA 2P9NA 2I7NA 4H0TB 1HUXA 3HSCA 1QZ5A 3G25A 4JD2A 4PKIA 1NBWA 3VF6A 3GDQA 4CZLA 3MDQA 3O5BA 3D2FA 3U4LA 2IVOA 4BR2A 1LCUA 4WQ5A 1NMDA 5JLFA 3FZLA 3KHYA 4NB4A 4RCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BP8A 3LP3A 3CQXA 3NBPA 3AA5X 1WSHA 4J8FA 3O1WA 1NG9A 5LMNK 3CM5A 4ZTJA 1GOAA 3ZX3A 4I6MB 4B3SK 4Y1CA 5C15A 3CJAA 4BREA 3CJ7A 1UA0A 1TAUA 4PKHA 2UXCK 5SWMA 3K5LA 3TI0A 3FLCO 4MFBA 1R0AA 1C6VA 4B3TK 4XH4A 4YDUC 3CF5L 1HNZK 3MWPA 3TABA 3KD5E 1X3MA 3O4QA 1WNSA 4FPBA 3VQ8A 3D7EO 3E1YA 4MQ3A 4R5PA 3O3GA 5HRPA 5JMVA 3LWMA 4DR2K 1VQ9N 1XMOK 4IEEA 4FCYA 3B6OA 4H0OA 4XH1A 3SJJA 4CJUA 3PIOL 5EXWA 2ITMA 5C24A 3A2FA 4AHCA 5CY4A 1KVBA 4M45A 3H1VX 2HBKA 5M1FA 1LAVA 1BDGA 3MN6A 5AZIB 4BRCA 1OVQA 1TUUA 3DJCA 1D8YA 2AJQA 1RDBA 2G8KA 3T19A 3OTOK 3MWTA 4MO5A 1NK6A 2RN2A 1S5JA 2P9KB 4YY3K 1NU0A 4H5RA 1RTJA 1Q82O 4JI5K 4LSNA 1QQNA 1NKEA 5F0XA 1YIJN 3NF9A 4CJRA 3CJ1A 4B9UA 4BC4A 3L2QA 3HTVA 1RTDA 1T6CA 1Q8IA 4CGDA 2JGUA 1N6QA 3CCEN 3KVGA 1KC8O 5K14A 2UUCK 3MEGA 3H46O 3CD6N 3VQDA 5AQIA 4LD0A 1RTHA 4E7HA 1ZBIA 3AAPA 2VWKA 1KTQA 4CBWA 1OH7A 3P31A 3NFAA 4AQYK 3AVMA 3FZHA 2Q36A 4U7BA 4F2RA 3THWA 4BG9A 4AHUA 5CR4A 3VQ6A 2QWRA 3HZ6A 4E89A 4EIAA 4YFUA 1L3SA 3EYZA 1NKBA 3J8AA 3OYEA 1K8AO 4NCAA 4KFBA 2QK9A 2F8TA 5AQVA 4BWJA 3VEWA 1RGIA 2ZQBA 4ICLA 4FSVA 2HMPA 1XQSC 4BDPA 3FFKB 3KLHA 4BC3A 2NRTA 3EL2A 1RCHA 4M3YA 2CH5A 4IJNA 3LP2A 1SKSA 3MEEA 1B92A 2KW4A 2RPIA 2ASPA 1VQON 1J6ZA 3GL1A 3OBYA 3FGUA 4ID5A 1T05A 1LWFA 3R9PA 3LPTA 3SZ2A 4X62K 4FLUA 5CE3A 4DTNA 2E88A 3VTHA 1U48A 5AQUA 4O0JA 4CF8A 1J9AA 5C12A 3DXMA 1JCEA 4H5NA 2XO7A 4WQ5C 4BACA 3ULEB 3VQ9A 3PX0A 4BRFA 5BRHA 5FLXO 1T6DA 5FPNA 4JI4K 3KK3A 4A57A 4A59A 5AQNA 1WSGA 4DTSA 1VSHA 1ATSA 1WOQA 4DV2K 1D9FA 3PUFA 4JK9A 3UKUB 3VQEA 1NJZA 4KTQA 2P9LA 4JYAK 3O8MA 1HNVA 4IOAL 1Q7YO 4C8LA 3WQUA 1EQYA 5KTQA 3VF2A 4LF8K 1G99A 4KB0A 4MDBA 2DFHA 4FJXA 3I33A 3OBWA 1VSJA 3TTDA 1NJXA 1K73O 1LWEA 4FJ9A 4DU1A 2NRWA 2E1ZA 3OY9A 4CFDA 5LY3A 3LAMA 1CXUA 3NVMA 3G10A 3SK3A 2XY7A 3P83D 3HI0A 1BQMA 3P39A 3AVCA 3WNGA 2P51A 3LANA 3RRGA 3L2UA 3UKRB 3C6HA 1FKOA 3B6PA 4UY8O 5EOYA 2BGGA 3TU5A 1DLOA 4CJEA 1C0MA 4W5RA 3V1RA 4H0VB 4I2QA 1IKWA 2P5GA 4AF1A 3OJUA 2FBTA 5E26A 2P9PB 1XNQK 2KHOA 2E2OA 1GLBG 1WSJA 2IDOA 4B8AB 5AQQA 3JS6A 2QI2A 3VOVA 2P5OA 1N8RO 1NGCA 3NAEA 2RF2A 1FJGK 1DTTA 1GLDG 4JHDA 4N5SA 3DLHA 2HHXA 5BR8K 3EO3A 1C1AA 1VQ4N 2OPQA 4DTRA 4CEQA 4CK3A 5IWAK 5LJVA 3G4SN 3SQ1A 2HHHK 2WC9A 1NGAA 5J2PA 3J7ZO 1GLJO 2PYLA 4FXDA 1TV6A 4DSEA 3CC7N 4MLEA 4FW1A 3WXMB 3TR8A 4LFCK 4I7FA 4OPHA 4JS4A 1BISA 3M8SA 3E9OA 4F4KA 1VQNN 2VWJA 1OH6A 1NK5A 4CJ3A 3ZT4A 4CZJA 2ZGZA 4BDYA 1QQCA 4CW7B 4JRPA 1NKCA 2D4WA 1Q9XA 2VWBA 2YHYA 3CJCA 5AQKA 5AQMA 1QZ6A 4PL8A 4BWMA 3H3NO 1P8ZA 4FJHA 3TANA 5C2DA 1H1VA 3DI6A 1RBUA 2QWQA 3DXKA 2VYPA 4PA1A 4WFNL 4B9NA 2W40A 3DRRA 4HTLA 1JXBA 3GG4A 4KTZA 3PSIA 3QNNA 4Z4FA 4O8KA 3GBTA 2AP1A 4KH4A 5AR0A 3D6RA 3QB0A 2GX9A 2Z1IA 3DLRA 5AQYA 1RBTA 4B9TA 3K5OA 2O8EB 1YXQA 3OYLA 3CM6A 3QEWA 5AQGA 2E4LA 1XC9A 1BIUA 1GLAG 3V9ZA 3SAHA 1TGOA 3VEZA 1NK8A 3K2PA 1UA1A 5F2RA 3LPUA 4CJSA 3RMCA 2OZMA 3H1QA 4CZIA 3NGZA 3A5LC 3Q7BA 4OKJA 5C10A 3PX6A 4CFAA 2BE2A 1NGIA 2OCEA 3SUOA 3J80O 3CCLN 2LSNA 3V9SA 3ENBA 2WUSA 2ATQA 5FRNA 4FJLA 4OLBA 1I3AA 1JLFA 3VQCA 4BROA 3K9KA 3THVA 5AQXA 4DSKA 4WYBA 1HRHA 5GIOA 1T44A 5LMUK 4DV4K 2IC3A 1KVAA 3ULEA 1ZBLA 4BR4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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