3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule keywords Conserved archaeal protein
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
4MLHA 3EZWA 4FWMA 4H5RA 5AQFA 5AZIB 3CIPA 5AQXA 3CJ7A 4BR2A 3R9PA 4A2AA 3IDHA 2P9SB 2NZTA 3D2FB 3MDQA 1SAZA 1NGHA 2D0OA 4BR9A 3KVGA 4IJAA 2HF3A 5AQPA 4F9OA 1HKCA 1QQNA 5I9EB 5F1XA 2FSJA 3L6QA 4B1UB 2HMPA 4E1JA 5TKYA 3A5LC 3DXMB 3U9DA 5AZJA 5AFUH 3ZETA 4BRNA 1LCUA 1KAZA 1GLBG 4EIAA 3I8BA 1EQYA 5AQHA 3CJAA 3I33A 4BVPA 2KHOA 1ZXOA 2P9IB 2NLXA 3A5OC 3A5NC 4NO7A 4PKIA 2W41A 3ZETB 5FPDA 1WUAA 3GBTA 2ASPA 3L4IA 1DKGD 3WUHA 3C0BA 1D4XA 3D7EO 1X9JA 2P9NB 2QWLA 2Q2RA 2P9KA 4K41A 3GOIA 2Q36A 3VF4A 3CETA 3FZMA 4BQZA 3ID8A 4PKGA 2P9PA 4IO8A 3UKRA 4BREA 3SJHA 1WOQA 3WEEA 5AQWA 5JLFA 4BR0A 2EWSA 5KQ8A 1C0GA 3ULEA 3HBTA 1Z6RA 2P9PB 3UKRB 5KQDA 4RCHA 3JS6A 2YJEA 1SQKA 3LDQA 4WYBA 5AQGA 4IZ9A 3LM2A 4EHUA 1NM1A 2QWPA 2ASOA 3QMLA 3IUCA 2QWQA 4CBWA 1BA1A 1C0FA 2QWRA 3MN7A 1Z05A 3DXKA 4FWRA 5AQSA 1TUYA 4GNIA 4BG8A 2ZGYA 1S3XA 3A8YA 1R59O 5EY4A 3O5BA 2IIRA 4JHDA 3FZKA 4CD1A 3DXKB 3FR0A 1RGIA 2J4RA 3DJCA 2IVNA 3W3DA 5CE3A 3ATVA 4K42A 1TYQB 2ZGZA 2YCHA 3GL1A 3EO3A 4JHDB 4A2BA 4IJNA 1MWMA 3WQTA 3H3OB 4IWVA 1ESVA 3MN9A 1NLVA 4H0OA 4M63C 3ZX2A 5EOYA 4FL9A 5AQOA 2BUPA 2YHWA 5KPTA 1GLEG 1HKGA 3H6EA 3O1WA 4H5TA 1JCFA 4BRIA 2HOEA 3EN9A 1NGDA 2ASMA 1QHAA 1CZAN 2IVOA 5AFUA 3VGKA 3M1FA 1BG3A 3O6WA 3BF3A 1YAGA 5EXWA 2ITMA 2V7YA 3MMVA 2Q0UA 5KPRA 3CJCA 1IJJA 4BROA 3WXKA 3ZX0A 4NB4A 3H45C 5AQNA 1BA0A 4ISGA 3TPQA 4CZIA 4DB3A 1KAYA 2E20A 4BVOA 1HLUA 1GLJO 4CZMA 2AP1A 5BRDA 2YI1A 4JD2A 1BWFO 5LJVA 3TU5A 4K25A 2ZF5O 4AM6A 3EKSA 4BRGA 3QICA 3AY9A 4PL7A 4BC3A 2GEMA 5BRFA 3QBXA 3MK6A 3VF2A 1BU6O 1JCGA 2FSKA 4BG9A 3DAWA 5JICA 3GE1A 3MN5A 2QWMA 4ISEA 2D0PA 5AQJA 4BRLA 5AQUA 1NGGA 5KPZA 1Y64A 5E84A 1NGAA 2GELA 1QQMA 1TUUA 3R8EA 4PKHA 3AAPA 4B1VA 4FPBA 3VOVA 4O8KA 1U6ZA 4I6MA 5AZJB 1XC3A 1QZ6A 3SLCA 5JLHA 2I7PA 3HSCA 2UYTA 4MO4A 2CH6A 2FSNA 3O4WA 4M7YA 2E88A 4H0TB 3U4LA 2ZWHA 4BGAA 4QS8A 4I6MB 5AQIA 2A5XA 1HKBA 3CERA 1YXQA 3UKUA 5B8HA 5AR0A 2Q97A 1JCEA 3VPZA 1MDUB 2Q0RA 2V51B 2P9LA 3FZFA 3O8MA 2QM1A 4FWSA 1J6ZA 2P9KB 3SK3A 4XH4A 5AQVA 4L3QA 3WQUA 4B9QA 2OANA 3VENA 1GLLO 3QB0A 5FPMA 3H1VX 5JMVA 3M3ZA 2P9LB 3S41A 5BRHA 1LOTB 4FSVA 2A42A 2GUPA 4DCHA 1HX1A 5ELZA 3WEEB 3U9ZA 4XH1A 4EFHA 2CGKA 4Z94A 2QW9A 3OHRA 3ULEB 3VEOA 3C7NA 2GWKA 3W0LA 1BDGA 2PAVA 3BP8A 2QWNA 2E2NA 1RFQA 4RWTA 1ATSA 3IFRA 2YHXA 4CZGA 1NGBA 1K8KA 4BRKA 3QDKA 4B1WB 4MLEA 4EAHD 1V4SA 4BGBA 1XQSC 2AA4A 3L0QA 4H5NA 4K43A 4LC9B 3A5MC 3RSEA 2V7ZA 4CD3A 3CQXA 5BREA 5AQKA 4CZFA 3VEYA 2PBDA 2Q1NA 4ISFA 3UB5A 3FZLA 5BN8A 3O80A 3AAQA 4QS9A 4B1ZA 3MN6A 1BUPA 1XUPO 3ZEUA 5AQMA 1E4GT 3WXIA 4FWNA 1DEJA 2DPNA 2H3GX 1HJOA 1QZ5A 4CZEA 2FF3B 5BR9A 3ZEUB 3BEXA 3LM9A 3VEVA 2CGLA 4DQ8A 3FGUA 3KZBA 3ZX3A 4M7XA 5AQRA 4B1YB 1T6CA 4BQLA 3WXLA 4EHTA 1NMDA 3LDOA 2FF6A 4H0XB 1G99A 1NGJA 3FE1A 1GLFO 3D2EA 2YJFA 4WQ4C 3EL2A 4BR7A 1S22A 2FLOA 1H1VA 1X3NA 4A61A 5E26A 3LDNA 3CHWA 5BPNA 4HTLA 3D2EB 5EX5A 2FXUA 4FOIA 2E1ZA 3FFKB 3H46O 4FWOA 4WQ5C 4BC4A 4YDUC 2P9SA 2E1YA 3D2FA 4MO5A 4BRHA 2BTFA 2VYPA 1QQOA 2QWOA 3G25A 3HI0A 4A62A 4AM7A 2D1KA 4CZKA 4JAXA 1NGIA 3VEZA 1KAXA 2E2OA 1P8ZA 3FZHA 3QFUA 4JD2B 2E2QA 2E8AA 4BRQA 1NGFA 4H5VA 3WXJA 4BR5A 1HPMA 1ZBSA 1T6DA 4H0PA 2E2PA 3MCPA 5AQLA 4BC5A 2D4WA 2A6AA 3J8AA 4JN4A 4Y0WA 3B8AX 5EVZA 4CZHA 2WUSA 5LJWA 2IVPA 4BR4A 1RDWX 3DXMA 3GG4A 1MWKA 4CZLA 2VWBA 3HTVA 4CJ7A 3QBWA 5AQYA 4H03B 5F2RA 4BRPA 3F9MA 4H0YB 2P9IA 3H3NO 4CZJA 3VGLA 4PL8A 4FOEA 5ADXH 4H0VB 4RTFD 4BRAA 4FWKA 3HM8A 3VETA 3CI5A 3DWLA 4B1XB 4BRDA 2CGJA 3ENHA 2NRHA 3QFPA 2CH5A 3O08A 2P9UA 3UKUB 2P9NA 3VF6A 4KBOA 2YHYA 2Q31A 5AQQA 3VEXA 4CBXA 2VCPA 3JXUA 3R6MA 3CJ9A 3ATUA 2P9UB 4IXCA 1SZ2A 3LDLA 3SMSA 2V52B 1BOTO 4J8FA 2GWJA 4CBUA 1DGKN 4DHYA 4GY2B 1T44A 3BF1A 1MA9B 1E4FT 1NWKA 1BO5O 5FPNA 4BRFA 2HF4A 4O5FA 3WT0A 3HZ6A 3C7NB 3FLCO 3VESA 1NBWA 1NGCA 1GLAG 3H1QA 3CJBA 1U2VA 1YUWA 2F9WA 1KXPA 1K8KB 3P4IA 4H5WA 2I7NA 3LDPA 1OKJA 3SMPA 1YVNA 3ENOA 4C23A 1U2VB 4WQ4A 3RSEB 3CJ1A 1NGEA 3U8XA 4BRCA 1HUXA 2QXLA 1IG8A 1TYQA 2A40A 3UE5A 3KHYA 2W40A 3GDQA 1X3MA 3VGMA 2F9TA 4WQ5A 2GTDA 5BPMA 3IMXA 4YDUA 4QS7A 3CQYA 1GLDG 3LL3A 4FWLA 1ATRA 5BN9A 4BC2A 2A3ZA 3M6GA 4FWPA 3A0IX 4FPAA 4BRMA 3VERA 3EKUA 4XH5A 1ATNA 5AQZA 3AARA 4FO0A 5ADXA 5FPEA 1V4TA 2A41A 5AQTA 5AZIA 1Q18A 5LY3A 3BUZB 4CI6A 4XEIA 4FWQA 4JNEA 5BPLA 5F0XA 1GLCG 1ZC6A 3O1BA 4HWIA 3VEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH1A 5KGWA 3QETA 4MDAA 4A2AA 4Z4GA 3SUNA 1NK8A 4HCBA 4M3UA 4FLUA 3PUFA 4F9OA 1JLFA 4FLVA 3UIQA 3E01A 4B1UB 3K5LA 5TKYA 4DSJA 3QEXA 3NDKA 2HBJA 4DQQA 1IKXA 4BRNA 3KLEA 4E7JA 3G4SN 1JJ2M 4BVPA 1K8AO 4KREA 2NLXA 4PKIA 3T3FA 2W41A 4RW9A 3VQEA 3ZSWA 5FPDA 1WUAA 3HPHA 3QIOA 4JV5K 2ASPA 3L4IA 1DKGD 5T7BA 1D4XA 3ASMA 2OCEA 5AJ3K 1HYZA 3RVCA 1YIJN 4JK9A 3D6RA 4FJ5A 3ZT1A 3NF8A 2YKNA 4PKGA 4H8KA 4IO8A 3UKRA 4BREA 4DSKA 4OPKA 4OVLA 4DFJA 4GVMA 3HP9A 4YOYA 4FJNA 3HBTA 1RBSA 5KQDA 1SL1A 1T03A 1SQKA 1K9MO 3KIOA 3LM2A 5JS1A 4CIGA 3ALYA 3DLKA 2ASOA 1RDCA 3IUCA 2QWQA 4B9TA 1BGXT 1BA1A 3MN7A 2QWRA 4WE1A 1LAVA 4J2AA 5JVGL 3HJFA 2QA4N 4IEEA 1J53A 4BG8A 4Z4FA 3K59A 1S3XA 1ZBIA 5EY4A 3O5BA 3ITHA 3M8QA 3DXKB 1VQPN 1RGIA 2J4RA 3DJCA 4OGCA 3TAMA 3RRHA 2OZMA 3PIOL 2ZGZA 3OS2A 3BDPA 3CG7A 4ZTFA 4A2BA 4JHDB 2WBNA 3DLGA 3MN9A 4M63C 2P5OA 5AQOA 1S1VA 2UU9K 5KPTA 4OO1J 1HKGA 2JGUA 1O1WA 4BRIA 3AVKA 2HOEA 2G8FA 4CHZA 3U3GA 3TTDA 3R1XA 2V7YA 3E9OA 3SZ2A 1IJJA 4CW7B 3RMAA 3ZX0A 3H45C 1XC9A 1QSSA 1BA0A 4DB3A 2OPRA 1NJWA 1Q86O 2E20A 4BVOA 4CJPA 3L2QA 1KFSA 1QHTA 4JD2A 5LJVA 1VSMA 3TU5A 1X1PA 1EXQA 2VWKA 2ZF5O 1VQ5N 4AM6A 5KRSA 4BRGA 1A5VA 1ZBLA 1Q81O 1J9AA 3AY9A 4BC3A 4DSEA 4B9NA 1S5JA 1TAUA 4JI2K 1NU0A 4FLXA 1JCGA 3IS9A 3C94A 4M3RA 2HVIA 1A5XA 4JEPA 3ZCMA 3MN5A 2D0PA 5AQJA 1G15A 3PSFA 5E84A 4A57A 5M1FA 2O4GA 2R7YA 4B1VA 3HVRA 3BZCA 3VOVA 4O8KA 1ILYA 1JLQA 2O8CB 1BI4A 4DLEA 3TAGA 4DR3K 2E4LA 2ZD1A 1KC8O 2I7PA 4IDHA 1OH8A 2E88A 4H0TB 1FXXA 5AQIA 3CC4N 3CERA 4LF9K 3UKUA 4DSIA 3C6TA 1ZBFA 3A2FA 1TGOA 2KLAA 3WNFA 2QM1A 2P9KB 4XH4A 1SV5A 2OANA 4N56A 1TVRA 4B3OA 4LF8K 1QQCA 4PQUA 2Y1IA 4GV3A 1HX1A 3OYNA 3U9ZA 3ID6A 3T1AA 4Z94A 1X9SA 3QERA 3C7NA 2NRTA 1RDBA 2GWKA 2PAVA 2QWNA 1RFQA 3CF5L 2G8HA 1ATSA 4FJ7A 3IFRA 4B8CA 4KHSA 1GOAA 2YHXA 4DTUA 1UOCA 4E89A 1K8KA 3QDKA 3TABA 3CC7N 3BZKA 4B1WB 4BGBA 2WTUA 2O8EA 4K43A 1VQ7N 1BQNA 5GAGP 2PBDA 4ISFA 3UB5A 1LW0A 5BN8A 3O80A 4I2PA 3CFPA 4QS9A 2IOCA 1D8YA 1DEJA 3NVMA 1KVCA 3F73A 4DV4K 2HHSA 4CZEA 4CF2A 3MXJA 4CGJA 2G8UA 1IKWA 3LM9A 4FZXC 5KTQA 4CGHA 2ZJRL 3ZX3A 4PUOA 3MX5A 1YITN 4EHTA 1NMDA 2YNGA 3LDOA 4FJIA 4DUYK 5HLFA 1S72N 3EL2A 4CEEA 4A61A 2FLOA 4FJGA 1NKCA 3RMDA 1WSGA 4IOCL 3D2EB 3AVGA 5CYQA 2O8DB 3V9UA 3FFKB 3E9LA 1N33K 1TV6A 3HYFA 4CERA 4YDUC 3D2FA 1NK0A 2IAJA 3PV8A 3SQ0A 3G71N 1WSHA 1CXQA 4CZKA 4FVUA 4FK2A 1KAXA 1P8ZA 1NGFA 1HPMA 4J2EA 1T6DA 2E2PA 2A6AA 4EZ9A 4JKDA 4CZHA 3I56N 2KKZA 2W6KA 2IVPA 3GG4A 4ID5A 3HOSA 3KLHA 1IH7A 4CZLA 4M3XA 1M1KO 4FK0A 3TWHA 5AQYA 4X62K 4H03B 4BRPA 4W5OA 2NUBA 4H0YB 4UQGA 3EYZA 2P9IA 3H3NO 4KH5A 5FROA 4N41A 4QOZB 4PL8A 3KK3A 1U48A 4H0VB 4RTFD 1C6VA 3P38A 1TK8A 3CI5A 3RMBA 4F4KA 3CXCM 1UA0A 2CGJA 3IG1A 3ZSOA 1NKEA 3O08A 1NOYA 2P9NA 2X74A 2UXDK 2ZE2A 3AVHA 2Q31A 4C8OA 2HNYA 1TL3A 4CBXA 3JXUA 3ATUA 3C6HA 2E6MA 3J7ZO 3QEPA 3LAMA 1T05A 2Z1JA 1VSFA 1HNXK 2GWJA 4CBUA 4DHYA 4AHUA 3VTHA 3ZT3A 1YHQN 3NGZA 4WF9L 3VQBA 4DF4A 5GIOA 4JI1K 3WT0A 5J2NA 3V9XA 3LANA 3VESA 1JXBA 1QVFM 1VSEA 1YUWA 4CJQA 5A2QO 3AGKA 4IG0A 3P4IA 4FW1A 5JS2A 3CMAN 2XHBA 3OTOK 3THXA 3RSEB 3CJ1A 4ELVA 1RT4A 4DTOA 3S3MA 2A40A 3CCRN 4NCGA 4K8XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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