2QW9A

Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the apo state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qw9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qw9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qw9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qw9A04
4H5RA 4BR0A 3O1BA 3M1FA 4FO0A 4EAHD 1ZBSA 5JMVA 3CETA 5F2RA 3ZEUB 1WOQA 4CD3A 3VGMA 1YXQA 3WQTA 4DB3A 5F1XA 4QS8A 4B1VA 3ATUA 3AAPA 3A8YA 5AZIB 3UKUB 5ADXA 3QFUA 3SK3A 2P9KA 1T44A 2P9IB 1MWMA 4XH5A 4YDUA 3WEEB 3SMPA 4XH4A 4BRDA 1NM1A 3J8AA 3IMXA 3CJCA 5AQMA 3ENOA 5FPMA 1R59O 3A5NC 5AQGA 1HX1A 2CH6A 1RFQA 4K25A 1HLUA 2FLOA 2P9NA 4H0YB 1NBWA 5AQVA 2P9PB 4CZEA 3M3ZA 3H6EA 1NGAA 5EOYA 4IJAA 4BQLA 3EZWA 3TPQA 3MCPA 5AQTA 3G25A 2Q1NA 3ID8A 4CJ7A 1TUYA 5AQPA 2H3GX 4BRHA 4BRIA 1K8KA 2AP1A 4H0PA 2CGKA 3CQYA 4H5TA 4MO5A 3LDQA 3EL2A 3VERA 2HF3A 1JCGA 3A5OC 2P9IA 3CIPA 2PAVA 2OANA 3QICA 4M7YA 3CJ7A 5LJWA 4XH1A 3U9DA 3U9ZA 2P9SB 1NGHA 3D2EA 2GUPA 3FZFA 2QWMA 3M6GA 3H3NO 4I6MA 3EKUA 1QHAA 2Q2RA 5AQUA 3BUZB 3VPZA 4H0TB 3VENA 3BEXA 3D7EO 4NB4A 4H5VA 2V52B 5JLHA 3UB5A 3DAWA 4CZLA 1HJOA 3W0LA 2WUSA 1BWFO 3MDQA 1BDGA 4A2AA 4BQZA 3I8BA 3DXKB 4AM6A 3UKRB 3CI5A 5BN8A 2A5XA 1NGCA 5LY3A 1YAGA 3AARA 4K41A 3LL3A 3F9MA 4BRGA 1ATNA 4MLEA 3IFRA 3LM2A 4BR5A 1SQKA 3HSCA 3QMLA 1BA1A 2YJEA 2E2NA 4ISGA 4K42A 5KPRA 1BU6O 4QS9A 4CD1A 1NGIA 4KBOA 3HZ6A 1BO5O 3H3OB 1QQNA 1Z05A 2V7YA 1GLJO 4B9QA 4BR7A 2I7PA 3MN5A 1WUAA 4J8FA 1S22A 2GTDA 2P9KB 4H0XB 3C0BA 2QWQA 4FL9A 3A5MC 3S41A 3GE1A 3VGKA 4CBWA 2YI1A 5BPLA 3A0IX 5AQKA 5FPDA 2FF3B 5AQNA 4IO8A 3ZETA 3WXJA 3FZLA 5FPEA 2FSNA 3ATVA 2P9NB 4CZMA 4FWPA 3WXLA 2D4WA 2GELA 3D2FA 2V51B 2ZGZA 5TKYA 3R9PA 3QB0A 4L3QA 1DGKN 1C0GA 1Z6RA 4BRFA 4BGAA 5BR9A 3HM8A 2ASMA 3ULEA 1RGIA 4HWIA 3FGUA 4BVPA 1XQSC 1ZXOA 4RTFD 5AQZA 3JXUA 3WUHA 1BG3A 1K8KB 1GLFO 1T6CA 2I7NA 3QDKA 5AQJA 1NMDA 4FWKA 2Q0UA 4H0VB 3KVGA 4Y0WA 3VEYA 2E88A 3FE1A 5AR0A 2HF4A 3MN9A 3VEVA 3O6WA 5AFUH 4BVOA 1XUPO 2J4RA 4BRAA 3L6QA 5B8HA 1EQYA 3D2EB 3EKSA 3GOIA 5BRHA 1ATRA 3VETA 4I6MB 1KAXA 1P8ZA 4ISEA 2YHWA 4O8KA 5AQXA 3QFPA 1HKBA 2YJFA 3ZX2A 1JCFA 5I9EB 3B8AX 1YUWA 4CBXA 1GLDG 5F0XA 5JICA 1C0FA 3UE5A 2DPNA 3JS6A 4WQ5C 2BTFA 5ADXH 4CZJA 1BA0A 5AQYA 3LDOA 4B1ZA 3WT0A 3LM9A 3GG4A 3C7NA 3MMVA 4C23A 4XEIA 4H0OA 3AY9A 4BRMA 4JD2A 3VF4A 3BF1A 3FFKB 4LC9B 4CZFA 4RWTA 3O1WA 4GY2B 4JHDA 2E2QA 4BR9A 2P9LA 3A5LC 4BG9A 4BRKA 2VYPA 5KPZA 1ZC6A 3R6MA 1X9JA 2ZWHA 4EHTA 4A2BA 5AQHA 4ISFA 1SZ2A 3W3DA 4FWMA 2AA4A 5BREA 3U8XA 3HBTA 3ZETB 1X3NA 1NGDA 4RCHA 1LOTB 4A62A 5KQDA 3HTVA 5AQLA 5E26A 2IVOA 3ENHA 5AQIA 3FZKA 2ASOA 3D2FB 1HUXA 2W41A 3H45C 5EVZA 5AQWA 1IJJA 2HMPA 1NGFA 2YCHA 3BF3A 4DQ8A 3ULEB 1V4SA 4FOIA 3KHYA 1YVNA 3DXMA 2VCPA 2VWBA 2D1KA 5BPNA 3H46O 5FPNA 3EN9A 3O4WA 4BRLA 2QM1A 3QBXA 2HOEA 1IG8A 2A40A 2QWLA 2E1YA 4M63C 3KZBA 1RDWX 4FWLA 4BR4A 1BUPA 4PL8A 1QQMA 1GLCG 4BRQA 2QXLA 3VF2A 1KAZA 5EY4A 4FWOA 2A6AA 3MN6A 3CJ9A 4HTLA 5AQOA 3CERA 1QZ5A 1S3XA 3LDLA 2QWPA 2QW9A 1E4FT 1GLAG 3O80A 4B1XB 4FPAA 4B1YB 2ZF5O 4DCHA 3RSEA 4FWRA 5LJVA 4BC4A 1MA9B 3MK6A 1DEJA 5CE3A 3LDPA 1GLBG 2CGLA 1TYQB 4CI6A 2P9UA 4YDUC 4CZKA 2GWJA 3VEOA 5AQFA 2ITMA 3VESA 3C7NB 5EX5A 4BC3A 4IWVA 1DKGD 4M7XA 3H1QA 3VEWA 4H5WA 1XC3A 4JD2B 3U4LA 3CQXA 5EXWA 2CH5A 4CZIA 1NGEA 3LDNA 1T6DA 2NLXA 2F9WA 3IUCA 3O5BA 2QWOA 1KXPA 4JHDB 2P9LB 3VF6A 2CGJA 2YHYA 3CJ1A 2A3ZA 4JAXA 4BC2A 2E2OA 4E1JA 2A42A 3SJHA 4PL7A 5AZJA 4BRNA 3MN7A 4IXCA 2NZTA 1X3MA 3DJCA 2F9TA 4JN4A 1J6ZA 1SAZA 4BROA 3FLCO 1HPMA 1CZAN 2FSJA 4FWSA 4BRPA 3GBTA 1TYQA 5KQ8A 3P4IA 3ZX3A 3EO3A 4WYBA 2GWKA 1BOTO 1NLVA 3VOVA 5JLFA 2E8AA 4QS7A 4CZGA 2E1ZA 1V4TA 5ELZA 4PKGA 3VEZA 1E4GT 3L0QA 3ZEUA 3IDHA 5BN9A 3DXMB 4WQ5A 2QWNA 2NRHA 1D4XA 4CZHA 1H1VA 4O5FA 2UYTA 5AZIA 1GLEG 3HI0A 2D0PA 4FPBA 3UKUA 4A61A 3O08A 3WEEA 4AM7A 5AQQA 2IIRA 3H1VX 4EIAA 2E20A 3I33A 4FWNA 1MWKA 4CBUA 1JCEA 4F9OA 2ASPA 2GEMA 4NO7A 1NGGA 1QZ6A 4PKIA 1LCUA 2W40A 4GNIA 4H5NA 4JNEA 4IJNA 2D0OA 2P9PA 2Q31A 1NGBA 3WQUA 5KPTA 3CJBA 3QBWA 4BC5A 3O8MA 1OKJA 3FR0A 2YHXA 3AAQA 4MO4A 2FSKA 1QQOA 3ZX0A 3BP8A 4FWQA 3TU5A 2Q36A 3DWLA 4MLHA 3WXIA 3FZMA 1ESVA 4BGBA 2BUPA 2E2PA 3VEXA 2QWRA 3CJAA 2ZGYA 2Q0RA 4BRCA 5BRFA 3RSEB 4PKHA 1Y64A 2A41A 2EWSA 4FSVA 4B1WB 1TUUA 1MDUB 2PBDA 1HKCA 4FOEA 2P9UB 1U2VB 5E84A 4DHYA 3GDQA 1NWKA 3SMSA 5BRDA 5AQRA 2P9SA 3L4IA 2IVPA 4IZ9A 1U6ZA 1G99A 2FXUA 4WQ4C 3VGLA 3R8EA 3FZHA 4EFHA 1GLLO 5BPMA 1KAYA 4EHUA 2V7ZA 4BREA 4K43A 3OHRA 5AQSA 3DXKA 2Q97A 1NGJA 3SLCA 3UKRA 5AZJB 3CHWA 2KHOA 4Z94A 1Q18A 5AFUA 2FF6A 4WQ4A 3WXKA 4B1UB 1HKGA 4BG8A 1ATSA 3GL1A 1U2VA 4H03B 4BR2A 2IVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A5XA 3O1BA 3M1FA 3OS1A 4FO0A 3WNGA 5JMVA 3L56A 3OYFA 2O8CA 3V1RA 3VTHA 1VQLN 3OYKA 1VQ6N 3MX2A 3VGMA 3ATUA 3CC4N 1WN7A 1NK4A 4CJEA 2NY9X 2HHUA 1RDCA 4XH5A 4YDUA 3WEEB 4BRDA 3SAFA 3E7RL 4X65K 3RMBA 1VQPN 2O4IA 3J8AA 1BIZA 1EWRA 1NK0A 1HNIA 1P00A 2NRXA 1VQ8N 1JLEA 1ZFUA 1HX1A 3CCRN 2KSKA 4JI4K 2P9NA 2F8TA 5CYMA 2B4JA 1NG9A 3M3ZA 5EOYA 1NGAA 4GV9A 3O3GA 5KI6A 4BQLA 1A5WA 2GUIA 5I42A 3VQQA 1PE4A 1NK7A 4U7BA 1DTTA 4BRHA 1K8KA 4DF4A 2AP1A 1KVCA 2KKZA 3CQYA 4H5TA 3EL2A 4DF8A 4BEBA 4DQSA 3G6EN 2DFEA 4UJ0A 4J2AA 2P9IA 2HHXA 4CGDA 1T7PA 5CYQA 1XWLA 4LSNA 3HYFA 1NGHA 2GUPA 1FKOA 1SN4A 3M6GA 4NYNA 4ZTJA 4KFBA 4C8LA 5GIOA 2X6SA 1FXXA 3NBPA 1IKXA 2IDOA 2LR3A 3UB5A 4CZLA 1HJOA 3CM5A 4MQ3A 2UXCK 3M8SA 3O9RA 4LF9K 3I8BA 3F9KA 3N4QA 4LFAK 2KJAA 2LJMA 2D0BA 3CI5A 4WFNL 3HPGA 2OA8A 2PY5A 3NH2A 3IAYA 1L5UA 4B9TA 4CERA 3LL3A 1JLAA 3F9MA 4BR5A 3D45A 2YJEA 2E2NA 2E5LK 4LF7K 1TKZA 2HSTA 5KPRA 4CD1A 4W5OA 1NGIA 4KBOA 3HZ6A 2Z1HA 2PYJA 3VQAA 1C6VA 4HUFA 1NK5A 4B9QA 3UIQA 4BR7A 3SUQA 3K9KA 5E41A 2P9KB 3SF4D 1S72N 4H0XB 3C0BA 4FL9A 2XY8A 1CZ9A 4FK2A 3A0IX 3PY8A 4BDZA 1OVYA 4KB1A 2HBMA 3KJVA 4RG8A 1HNVA 3FZLA 3P31A 4CZMA 3LP3A 3WXLA 2D4WA 3ZSQA 3D2FA 3R9PA 4L3QA 1LW0A 5HROA 3QESA 2ASMA 1VSFA 3ULEA 1TAQA 2B68A 4BVPA 1ZXOA 1Z25A 2HNZA 1T6CA 1ZU3A 3HOSA 1HPZA 3ZT0A 4LF8K 4KHUA 2G8IA 1ZYWA 3AVHA 4KTQA 2O4GA 4Y0WA 4CGIA 4CJFA 1C0TA 2OZSA 2O8EB 5GADP 2HF4A 1JJ2M 4FJXA 2YX6A 4DTMA 4BVOA 3L6QA 4CVNE 1RDAA 3D2EB 3SQ2A 3GOIA 3VETA 5A2QO 1LWCA 1P8ZA 4FJ7A 4YOTA 5AQXA 3QFPA 2QXFA 3VTIA 3KK1A 1LAVA 3ZX2A 4ELTA 3G71N 1YT3A 1GLDG 1NKCA 4N56A 3UE5A 3CCMN 5FRNA 1X1PA 4BWJA 3I0SA 4WQ5C 3T69A 1C1AA 1U49A 4FLUA 1CXUA 4B1ZA 2VG5A 4EP5A 1YTUA 3C7NA 4XEIA 4I7FA 2KQ2A 4CJKA 1RBUA 3AY9A 4BRMA 1J54A 3BF1A 4IOCL 3AO3A 2W00A 3M8RA 1VSLA 5HRRA 1T1TA 1SKWA 3K0SA 4GV6A 1NK9A 4Q5VA 4BR9A 3HRGA 3NF6A 3A5LC 3AVNA 5FLXO 1S1VA 3THYB 2Y1IA 4JKGB 3L4QA 5AQHA 1PX9A 4JKFA 4LF5K 1XNRK 1YJNN 4LFBK 3MWTA 1QSYA 5BREA 3KLEA 1DJTA 3CMEN 3ZETB 2HBLA 4CJQA 3OBYA 3PX0A 3HTVA 3WNFA 4B3RK 3ENHA 1DQ7A 2ASOA 3K5OA 3H45C 3NE6A 1VRUA 3IKMA 5AQWA 1IJJA 2HMPA 3ZSRA 3BF3A 4DQ8A 1M1KO 3KHYA 3AVJA 3DRSA 4CF2A 4BY9C 2ZD1A 5DMRA 3S9HA 3H46O 3ZLJA 1BCMA 1DT9A 2O8DB 1FH3A 3CCSN 1WNSA 3OYCA 3QBXA 2A40A 2E1YA 1MR4A 4IDHA 3JAMO 4PUOA 1BGXT 2IS3A 1U04A 1OH6A 4YOVA 4OPAA 3MWPA 3DLLL 4CHPA 4HUGA 4EP4A 1EO1A 2QXLA 3VF2A 5J2PA 3SAGA 1BIUA 4FWOA 4DTNA 5KRTA 3HXMA 3T3FA 3CCLN 4CFAA 1U48A 3AVIA 4CJ5A 2QWPA 2QW9A 1E4FT 4JKCA 3TAFA 1N32K 4B1XB 1RTIA 2LY6A 4DCHA 2BRZA 2XY5A 4AHTA 1MA9B 5CE3A 1GLBG 2CGLA 3SBGA 4BE0A 4YDUC 2WONA 2E3GA 4CJPA 4HVJA 1F21A 3VESA 3K58A 3KKRA 1UGLA 4BE2A 1DKGD 1D9DA 3KOYA 2HHTA 3VEWA 4JD2B 4FM1A 3CQXA 2CH5A 3PO5A 3O9QA 3LDNA 5SZTA 1YI2N 3VQ6A 2NLXA 1W97L 1I39A 1NOZA 4JKAA 1Z26A 1TK0A 4FJKA 2YHYA 3ZCMA 4QAGA 4HE7A 3V9UA 2YIOA 2E2OA 4E1JA 4CEOA 3CQ8A 2YEOA 1RT1A 4BRNA 3MN7A 1SAZA 1OH7A 1HPMA 1NJIO 3CFOA 4FWSA 1WWNA 3AVKA 1N8RO 4FLWA 3MEEA 4Z4GA 2BE2A 4CZGA 2E0HA 1ASWA 1RDUA 5ELZA 1VSKA 4DV4K 3L0QA 4E89A 3BY5A 5BN9A 5HLFA 3DXMB 4HUEA 4CZHA 1H1VA 1LW2A 3K5MA 1ZBLA 3UKUA 4FLTA 4IO9L 3AV9A 4A61A 1D8YA 1LAWA 5FDLA 4EIAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1A5X A;  3O1B A;  3M1F A;  3OS1 A;  4FO0 A;  3WNG A;  5JMV A;  3L56 A;  3OYF A;  2O8C A;  3V1R A;  3VTH A;  1VQL N;  3OYK A;  1VQ6 N;  3MX2 A;  3VGM A;  3ATU A;  3CC4 N;  1WN7 A;  1NK4 A;  4CJE A;  2NY9 X;  2HHU A;  1RDC A;  4XH5 A;  4YDU A;  3WEE B;  4BRD A;  3SAF A;  3E7R L;  4X65 K;  3RMB A;  1VQP N;  2O4I A;  3J8A A;  1BIZ A;  1EWR A;  1NK0 A;  1HNI A;  1P00 A;  2NRX A;  1VQ8 N;  1JLE A;  1ZFU A;  1HX1 A;  3CCR N;  2KSK A;  4JI4 K;  2P9N A;  2F8T A;  5CYM A;  2B4J A;  1NG9 A;  3M3Z A;  5EOY A;  1NGA A;  4GV9 A;  3O3G A;  5KI6 A;  4BQL A;  1A5W A;  2GUI A;  5I42 A;  3VQQ A;  1PE4 A;  1NK7 A;  4U7B A;  1DTT A;  4BRH A;  1K8K A;  4DF4 A;  2AP1 A;  1KVC A;  2KKZ A;  3CQY A;  4H5T A;  3EL2 A;  4DF8 A;  4BEB A;  4DQS A;  3G6E N;  2DFE A;  4UJ0 A;  4J2A A;  2P9I A;  2HHX A;  4CGD A;  1T7P A;  5CYQ A;  1XWL A;  4LSN A;  3HYF A;  1NGH A;  2GUP A;  1FKO A;  1SN4 A;  3M6G A;  4NYN A;  4ZTJ A;  4KFB A;  4C8L A;  5GIO A;  2X6S A;  1FXX A;  3NBP A;  1IKX A;  2IDO A;  2LR3 A;  3UB5 A;  4CZL A;  1HJO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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