3SBTA

Crystal structure of a aar2-prp8 complex
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
AMNSSNYAELFNNDIKLFVDDTNVYRVTVHKTFEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVSALVRSLPKEEQPKQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKATEPQMVLFNIYDDWLDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQWITIESQMRDLILTEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Pre-mRNA-splicing factor 8
publication title Mechanism for Aar2p function as a U5 snRNP assembly factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Splicing
total genus 84
structure length 253
sequence length 253
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.80.40 Mainly Alpha Up-down Bundle Acyl-CoA Binding Protein Acyl-CoA Binding Protein 3sbtA02
3.30.420.230 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sbtA01
4JKGA 4ILGB 4JKFA 3E9OA 4JKGB 4JKEA 3SBGA 4ILHA 3E9PA 4JKBA 4JK7A 3E66A 4JKDA 3SBTA 4JK9A 4JK8A 3ENBA 3E9LA 4JKHA 4ILJA 4JKCA 4JKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVLA 3C7NA 2HOEA 5EXWA 4WQ4C 5AR0A 4FYDA 4NLBA 4RW7A 1W97L 3SQ4A 1ZBIA 4EKUA 4IWVA 4M41A 2QXLA 4FM1A 5HP1A 4LF7K 2UXCK 4M42A 3VEVA 3U8ZA 3LDPA 2J0KA 1E4GT 5EY4A 3DYAA 4BG9A 2PFUA 1U47A 3NF7A 2FDQA 3F73A 3L6QA 4DB3A 3LDQA 4Q5VA 4DQIA 4RW6A 4A57A 2WFBA 1OH8A 4GKJK 1WSHA 3AVKA 4E0DA 4DTJA 4K8XA 4KB1A 4E1NA 4XH1A 1VQ7N 3DLHA 3LPTA 3NF9A 1WSFA 4DV3K 2ZWHA 3ZSWA 1GLFO 2NRRA 4DTOA 3ZEUA 3VTIA 4HDQA 3HT3A 4L8RB 3AO4A 3NH2A 1ZYQA 4WQ4A 2UUCK 4FJKA 3Q7CA 3TAFA 4LFBK 4NY0A 1BI4A 1I39A 2E8AA 4CGDA 2P5OA 2AL6A 2XO7A 2UYTA 3K59A 5LJVA 5CE3A 3NAEA 3CCMN 1YAGA 1NJXA 4RW4A 5AQWA 4CVNE 1YITN 3AVMA 2KHOA 2IDOA 1SL0A 3H08A 3MDQA 1ZBLA 4C8LA 1RBTA 4NCGA 2ETJA 3ENHA 3S3MA 3HM8A 1N6QA 4JKFA 4CF8A 3OYHA 4Z94A 1S9EA 3NFAA 1HNXK 3V1RA 2HBLA 4O44A 1UWBA 3GOIA 1NOZA 4DR2K 3HPOA 4FWRA 3V6DA 1TYQA 1JLQA 3SQ0A 3I0SA 2YNHA 3L2QA 4TSXA 4IOCL 4JHDB 3F5TA 2D11A 1D9DA 4YOXA 1VK0A 2GX9A 1X3NA 2E1ZA 3DRSA 3RVCA 4H03B 3TTFA 1YJ9N 3BDPA 4IBNA 2O8DB 3ZSRA 3DOKA 3AA2A 4CZFA 1Q8IA 3VA3A 3A8YA 3TANA 4KHWA 4DV4K 4H0YB 2I7NA 1S1UA 3J7ZO 5J1EA 3KTQA 5AQNA 2YNIA 4JEPA 1ACAA 4FW2A 2P9LB 3ZSVA 2ZF5O 3CD6N 2KKZA 3E9LA 3LANA 4ILJA 5HRNA 1NGDA 4QOZB 3VGMA 3QFPA 4XH4A 1JLFA 4B8CA 4X64K 3DOLA 5IJMA 3I8BA 5K14A 3M8QA 1XNRK 3AV9A 3K58A 4DR4K 4H0XB 4CJFA 1BO5O 1KAXA 2OPSA 4FK2A 4M3YA 5BPMA 1KSPA 1VQPN 1GOBA 3CI5A 4EZ9A 2OPPA 5E26A 4FJ7A 1HYSA 4C1NK 3CCJN 4DXAB 4IDKA 3A0IX 3KWGA 1BCOA 1K6YA 1ZC6A 3CCSN 4DG1A 3SZ2A 1JDEA 4CHQA 1B9DA 1QHTA 1U2VB 4E3SA 3SJHA 4BQLA 3R3LA 4ZTFA 1MDUB 2W40A 1IBLK 3PIOL 4ID5A 4NYFA 1XC3A 2EHGA 4DUYK 5JLFA 2QWOA 3AVHA 1UA0A 3QDKA 2HMIA 4PWDA 4KHQA 2QWRA 3LWMA 1Z26A 1NGFA 1QQCA 1YTUA 4A61A 1QZ6A 2YJEA 4CEBA 3FLVA 2VGMA 3HVRA 4DV2K 1NG9A 5TKWA 2J0MA 3VERA 2ABDA 1Y64A 4QS7A 3VEWA 3OHRA 2GBZA 4BVOA 3JAMO 1VAZA 1A5XA 1Z05A 3LDSA 1RT5A 4DHYA 3P39A 3K2PA 5JVLA 4JNEA 4E89A 1R59O 4LFCK 2PYLA 2BH1A 4FLUA 3J80O 4JI2K 4CGFA 3MEGA 1VQKN 1Q86O 4KTQA 2IAJA 1T6DA 4UQGA 3SQ2A 3LZJA 5AQYA 3E9PA 1YHQN 3KLGA 2FBYA 2RPIA 3QEXA 2I1KA 2G8IA 4IOAL 5FDLA 4U7BA 2O8BA 3C65A 1NNEA 2HSTA 1RTHA 2P9IB 3HP9A 3ULEB 1RTIA 4HCBA 3O6WA 4JLHA 4E1JA 5C0YA 4BRMA 3ID6A 3CQ8A 4M3ZA 2Q31A 2NLXA 2E6MA 4KO0A 4LF4K 1GOAA 1EWRA 3AAPA 4HTUA 2E4LA 3T7ZA 1GC7A 3WEEA 1NTIA 4FZZA 3PSFA 3CFRA 3B8AX 3DLEA 4CEDA 1XHXA 3CJ1A 3G10A 3TPQA 3MX2A 2ATQA 4AM6A 2COPA 3K5OA 1KXPA 3ZT2A 1K73O 3OTOK 4OO1J 2QEXN 4NCBA 4WYBA 1SQKA 4CD1A 5FRNA 4QS8A 3DLLL 4PUOA 4B9UA 4DTMA 4M3XA 2V51B 3O9TA 3T1HK 2ITGA 2AA4A 1E3MA 4E1MA 2FXUA 4WFAL 1Z6RA 2VG7A 3O9SA 4FPBA 3RMCA 3AVAA 4CZLA 2Q97A 4YNQA 2FBXA 3ZX3A 2IVNA 4CZIA 1C0MA 3CERA 2ZGZA 2ZPYA 2KFNA 5HBMA 2GUPA 2HRJA 4F3OA 3CC7N 2E1YA 3SQ1A 4OKKA 3KLHA 2CQUA 2P9IA 1EO1A 3ULEA 1RDBA 3PX6A 1VBHA 2RQ1A 3OA9A 1LAVA 2JLEA 1KTQA 2GTDA 3HO1A 3I0RA 1SZ2A 3I8DA 1C0UA 2KLAA 4CEFA 5FPMA 3S41A 1L3UA 3FP5A 3M8SA 3O5BA 3VF2A 1IKYA 4BDPA 1S22A 2E88A 3H3NO 3UB5A 3O4QA 3V9XA 4JRPA 4KHYA 3TR8A 4B9SA 1P8ZA 4BDZA 4F7GA 3RWUA 2V7ZA 4RW8A 2O8EB 3CM5A 3P83D 3J7AP 3N4QA 4HWIA 4BWJA 4WFNL 4DTRA 3QINA 1WSJA 2NRTA 1LWEA 5AFUA 1QSLA 4Z4HA 1FW6A 5DMRA 4BC3A 2P9PA 4BRLA 4FWLA 3O4WA 4B9TA 2DIKA 2IVOA 2JWKA 2Z1GA 4C23A 4BACA 2BGGA 1JCGA 1R0AA 3P38A 4DV1K 2DFFA 1GGOA 2AJQA 2P51A 3VQ7A 3ASMA 4KB0A 1W2BM 1LW2A 5KGXA 2IOCA 4CEZA 1SV5A 4O55A 3UKUB 4W5TA 1S5JA 2VQFK 1MIXA 1NGEA 1QQNA 3UIQA 4JAXA 3OYGA 1NK8A 5AQXA 2NRVA 4KV8A 4CECA 4K42A 2OPQA 3EY1A 4M63C 1XNQK 4JK9A 1C1AA 3DLGA 3QFUA 4DFJA 3F9KA 2D1KA 2QWQA 3CJBA 3MXMA 2A3ZA 2QTDA 5AZIB 2W6KA 1WBDA 4CEQA 3E9OA 1U04A 4CE9A 4CYEA 4B9VA 4YOVA 1XUPO 4JD2A 5GIOA 4OKEA 3MN7A 3HSCA 1BL3A 2XRIA 1ST7A 3MWPA 4O5BA 3OYAA 4FJ5A 4K8ZA 3UKRA 4BVPA 3E01A 5CZ1A 4PKGA 3TAEA 2ASPA 4B3SK 2YHXA 5KQDA 3TSQA 4CJ3A 1TK5A 1ASUA 1NM1A 2OTLN 3TAGA 3ZSXA 1EQYA 4I6MA 4LSLA 1ATRA 1KLNA 3CG7A 3CYMA 2F9TA 1RDUA 2V52B 4QCLA 1YVUA 4NLCA 2YJFA 3ZETA 4JI0K 2F8SA 3AO5A 2X78A 1IJJA 2WUSA 4BE1A 3PZDA 1HJOA 3OS0A 5FPNA 4OKJA 1NJYA 2Z1JA 3D2EA 3KZBA 3LAKA 3UKUA 3QEVA 3VENA 1WB9A 3NF8A 4ZTJA 4ICLA 5I9EB 2KW4A 3C7NB 2H3GX 1BDGA 1X9WA 5AQQA 3I33A 4H0VB 3NHGA 2F9WA 3CJAA 1LWFA 3IKMA 4NXNK 4DSFA 2GV9A 4OGEA 3ZSZA 2W6LA 2YNGA 4MQ3A 3LZIA 5KPRA 5AZIA 3AVIA 2HHQA 1NMDA 4IO9L 1RDWX 4DFKA 2QWLA 1RCHA 2O8CB 1KD1O 2QA4N 4IXCA 4DTUA 4FW1A 2X6NA 1IKXA 3LL3A 3SUOA 5JLHA 1J5EK 1TUYA 4F4KA 3ATUA 1LV5A 3VOVA 4DSIA 1Y19B 1ASVA 4BY9C 3OJUA 5KRSA 4A2BA 2CB8A 2IIRA 4IFVA 5FROA 3MECA 3H3OB 3HRGA 1Q9YA 1VQMN 3D2FA 3ZEUB 1W0HA 4CGHA 3TI0A 5IWAK 5JMVA 3QEWA 4CJ5A 4Y0WA 3NE6A 3O8MA 1BI4B 3KHYA 4G9ZA 1Y97A 5KTQA 5ADXA 2O8FB 4F8RA 3O9QA 4AHUA 5EOYA 4OJRA 4FJIA 1NGGA 4E19A 4YHHK 3SUQA 2HHTA 3V1OA 4GV9A 2Q36A 4E7KA 4LH4A 3BUZB 2E5LK 1VSKA 4M3UA 5AQMA 1OVQA 1T44A 1V4TA 5JS1A 4ZRJA 2QK9A 1SUQA 3TAQA 4MO5A 1VQLN 3VQ8A 2ZE2A 1C6VA 4HUFA 1KFDA 2E6LA 1NJIO 3CCUN 1SL1A 3EKUA 1G99A 4BROA 1ESVA 3R8EA 4I7FA 4CJ4A 5AQPA 1NK0A 2NRHA 3SMPA 3H1QA 2O8CA 3BY5A 4IO8A 4Q0BA 3U4LA 3ATVA 3OBYA 2YI1A 4DUZK 2HF4A 1U49A 1TYQB 5BPNA 1OH6A 5KRTA 3AAQA 2UUBK 1MIZB 4PL8A 5CR4A 3L3UA 1Z25A 3THVA 4MDAA 4KTWA 4NCAA 2FF6A 2XHBA 2NZTA 4CZEA 3TAMA 2Y1IA 1KC8O 5J2PA 1BISA 4GVMA 4Z4EA 1JLCA 3FGUA 3ZT0A 3O3GA 4B9QA 1BCMA 1OKJA 1SL2A 1MK9B 3NGZA 3CM6A 4B1VA 3SAHA 5CHIA 2O8FA 3OYFA 5LMNK 1IO2A 5BN9A 4I9LA 3EL2A 4EHUA 4DMNA 4ISGA 1SKSA 1VRTA 3NH1A 3CCLN 3JXUA 4YDUC 5JS2A 1NK7A 3G25A 3HPHA 2VG5A 4DR1K 3TTDA 3X23A 1NWKA 3DJCA 2A6AA 3FZFA 2R7YA 5CYMA 3ID8A 1N34K 1P90A 1WLJA 1XC9A 4A2AA 1RT1A 1DTQA 5LL6Z 4GMJB 3DMJA 4FPAA 3DXMB 4ISEA 3A5LC 4LF6K 2E2OA 1V4SA 1MK7B 4BRHA 5JICA 3HVTA 4H0PA 5MLCQ 3IFRA 2A1SA 1EF1A 1CZ9A 4MDBA 5AQRA 4DQRA 1HNIA 2VWKA 4BWMA 2LSNA 4M3WA 3WNHA 2YV0X 4PA1A 1HKBA 4V19S 3QICA 4CK1A 4JI6K 5J2QA 3LALA 2IC3A 2E2PA 5JVHL 4W5QA 4H5RA 4MO4A 2IVPA 1QS4A 4YDUA 1O1WA 3MAQA 4H5WA 3FFIA 3SV3A 3RMAA 2UU9K 1MU2A 4H4MA 2O4IA 1B9FA 2WONA 3BGRA 5LJWA 3E66A 5AQTA 2B4JA 3C95A 3THXA 4N41A 4M3RA 2D2QA 4JI8K 4CERA 2UXDK 4CIGA 4FVMA 3WT0A 3WQUA 2AP1A 3CFOA 1CLQA 4C8OA 2KFZA 4DV5K 4WE1A 3OYKA 2VGNA 3QESA 4BC2A 4CJWA 1C0GA 2YCHA 1YJNN 2NNWA 2AEHA 4CJKA 1DEJA 1VQNN 1D5AA 1TKXA 2FBTA 3KK7A 4CIFA 1ASWA 4CJTA 4O8UA 3HXMA 1A5WA 4FJGA 3CHWA 4ID1A 3KD1E 3H45C 4A5AA 3BZCA 4YOTA 3VEYA 1U48A 4CZMA 1BGXT 1IG9A 4CIEA 2RN2A 1VQ4N 1X9SA 4FK4A 5C10A 5AQVA 2V7YA 3DXMA 5DK5A 4KH6A 4E7JA 1FKPA 4IFEA 3L2WA 3QIPA 4KAZA 4CBXA 3TARA 4CBUA 4YORA 3KKSA 4JI1K 4BRAA 3K5LA 3OYCA 4JKDA 4AHSA 1BU6O 3DWLA 5FRMA 3SYZA 2YVCA 2RE2A 1TAUA 3NCIA 1JKHA 2O8BB 4DSJA 1QQOA 4M45A 3MXIA 3P1GA 1EP4A 1HX1A 1RT7A 3ZT1A 2YNFA 5KQ8A 1HRHA 3IVFA 4BC4A 4AHCA 2HBMA 3RSEB 3EE8A 4BRIA 4DV6K 4KH5A 3DM2A 3MX5A 4BRNA 4FSVA 3CF5L 4QAGA 3PY8A 4KRFA 3WEEB 1RDDA 4JKHA 3LM2A 3VQDA 5H1SQ 1GLDG 1QQMA 4O4GA 3FZMA 4CW7B 3K9JA 3HYFA 5E84A 2HVIA 3PIPL 4EZ6A 4AF1A 1YIJN 4JI4K 3C0BA 1WUAA 3HZ6A 4WQ5C 3O1WA 2B6AA 1QSSA 1NGJA 4DSLA 3NMUA 1CXUA 1NGCA 1T8EA 2I1JA 3GL1A 1X1PA 4HUGA 3O1BA 1S6PA 1HBKA 4LY7A 3TSPA 3U7DA 3SUPA 3A5NC 4E7LA 1NK9A 4PKHA 3KJVA 1EKEA 4E7IA 2BANA 1DTTA 3QEIA 2PBDA 2YHBA 5EU7A 2KQ2A 1XMQK 4J2EA 3Q7BA 3K0SA 4CEAA 4JKEA 4WFBL 2P9KA 1RBSA 3VF6A 3VQ6A 4CK3A 1FJGK 3PO5A 3VESA 3OYBA 3VETA 3HBTA 4FVUA 3B6OA 1BA0A 1EETA 3LP3A 4PHTX 3OYLA 3HK2A 4XEIA 1JXEA 4WQ5A 3NVKA 4AHRA 2YHYA 3M5RA 3QB0A 3DRRA 2VYPA 2EMTA 4A59A 1HQUA 4Z0UA 4CF2A 3ISNC 4MLEA 3FZLA 3CJ9A 3RSEA 1JJ2M 4IZ9A 1NLVA 1QTMA 4M3TA 5EVZA 2QW9A 5A2QO 4MLHA 2NUBA 3FZHA 4CJUA 5C2FA 1OH5A 1YF5L 2UXBK 1BUPA 1RILA 3WXKA 3GE1A 5EX5A 4DQQA 4W5RA 3VQPA 4BG8A 3FR0A 3VEZA 4ILHA 4CJSA 5HL7L 4NYNA 4O0IA 1RDCA 4JKBA 5C42A 4FZYA 4L3QA 1EXQA 4CZHA 5DM7L 1Q7YO 5HRRA 4EIAA 4B08A 1K8KA 4CI6A 4EFHA 2ZJQL 2P9PB 4AM7A 4BRGA 4BE2A 2NRZA 3VQCA 1WAFA 4J2BA 3LP2A 3BEXA 5F0XA 5B8HA 4DU4A 3CCVN 4J2DA 3R1XA 1IBMK 2D0AA 3EE9A 1HNZK 1NBWA 3O80A 3LM9A 5I42A 4HDOA 3AO1A 3W3DA 1JCEA 3THWA 4B8AB 2J4RA 4OPJA 3PVLA 2F4VK 3J7YP 2P9SA 4CJLA 2UUAK 1BOTO 1KVCA 4EP5A 4AH9A 4CK2A 2QWNA 3KK3A 1NU0A 4GNIA 1BQMA 4GVEA 4Y1CA 1HMVA 1RDAA 3J81O 2A5XA 1S6QA 2XY8A 1VSEA 3RRHA 4IJAA 3SBGA 2WBNA 4KFBA 4DWIA 3VPZA 4DQ8A 3VQAA 1TAQA 3THYA 4DTNA 5F2RA 4JD2B 3SBTA 3FLCO 2X74A 4W5OA 1T05A 4B1UB 3MN9A 3OYIA 1G15A 3PLAA 4GV3A 1D9FA 4DSEA 1S1XA 4H4OA 5AZJA 4A62A 2FLOA 1A5VA 4BRKA 1WSEA 3UKRB 3SPYA 4DR7K 4RG8A 4B3MK 5AFUH 1VQ6N 5D3GA 1N33K 4FL9A 3LDOA 5BR9A 4I6MB 1YI2N 2O4GA 3MWTA 1H4RA 5M1FA 3CMAN 4LF5K 3WQTA 1M1KO 4FJMA 3VEOA 4FJXA 3WXLA 4J2AA 3ZETB 4BR4A 2VWJA 4FJJA 2ZJPL 3GG4A 3JYTA 3L8BA 3WNGA 3WXMB 2QXFA 3CPWM 3ZLJA 1DLOA 3G9WA 1TK0A 3D2EB 4ILGB 4KH4A 4BQZA 2EMSA 5BN8A 2HHUA 1I94K 4NXMK 1ZBUA 3VMFB 4CZKA 4DKWA 3EPYA 3ZSOA 3NF6A 5BRDA 1IKWA 3U9DA 2OTJN 4CF0A 3NVMA 4CD3A 4U67L 1GC6A 5GAHP 3HTVA 1Q9XA 4B1XB 2RF2A 2Q0RA 2F8TA 3AU4A 2D4WA 5HRSA 1RT4A 1TUUA 4B9LA 3BF1A 2Q1NA 1WAJA 3C6TA 4CGIA 2HB5A 3QIOA 4IG3A 4CF9A 3KLFA 4OPKA 3TABA 4DF4A 3G71N 1K8AO 1YUWA 3TTCA 1L3VA 3V9WA 2WC9A 3H6EA 3U3YA 1CXQA 1XHZA 4Z4FA 1S1WA 3AGRA 3EZWA 1T6CA 4CESA 3JS6A 1X9MA 2A42A 3AVBA 2OPRA 5GIPA 4DTPA 4FWQA 4J8FA 3V9SA 3D2FB 5HROA 3PSIA 4FJ8A 2Q3SA 4PQUA 2GUIA 3GBTA 2ITMA 1HKGA 2WTUA 1HLUA 3HPGA 3MK6A 1Q82O 2HNYA 1KVBA 3TWHA 3MCAB 3CC2N 4FXDA 4LH5A 2CGLA 1NK4A 3IS9A 3MEDA 4FWNA 4HTLA 3MCPA 4M7XA 5AQSA 4DCHA 4JS5A 1RBVA 2BTFA 3C6UA 3I56N 1BHLA 4FLYA 4PKIA 2PYJA 1I3AA 4G1QA 5BPLA 1XWLA 1NKEA 1KQSM 3NBPA 1NJWA 3P31A 3WNFA 4ELVA 3AVFA 3M8PA 4FLWA 3KLEA 4FCYA 5LMUK 3FE1A 1SS6A 3PX0A 3ENOA 3T1AA 4CFDA 1ITGA 3QBWA 1JLEA 1Q81O 1X9JA 3ZT4A 2GWKA 3SCXA 4KHUA 2P9NB 4FLXA 3CQYA 1GLLO 3NDKA 4DS5A 4JK7A 3AU5A 2E2QA 3OJSA 2P9UA 2G8KA 4OLBA 1ZBSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JKG A;  4ILG B;  4JKF A;  3E9O A;  4JKG B;  4JKE A;  3SBG A;  4ILH A;  3E9P A;  4JKB A;  4JK7 A;  3E66 A;  4JKD A;  3SBT A;  4JK9 A;  4JK8 A;  3ENB A;  3E9L A;  4JKH A;  4ILJ A;  4JKC A;  4JKA A; 
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