1NLVA

Crystal structure of dictyostelium discoideum actin complexed with ca atp and human gelsolin segment 1
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
372
structure length
364
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEQEMATAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of Non-Vertebrate Actin: Implications For The ATP Hydrolytic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Actin
total genus 115
structure length 364
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nlvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nlvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nlvA03
4BC5A 5AQMA 2ITMA 4H0PA 4BQLA 1QHAA 5CE3A 3HTVA 3O8MA 3FR0A 1ATSA 4IZ9A 4K43A 2P9LA 2ZGZA 2P9KA 3S41A 4BR7A 3C0BA 4XH1A 4CZGA 3W0LA 2KHOA 1WUAA 3M1FA 1NMDA 2YI1A 4AM6A 1OKJA 4EHUA 1H1VA 3MN7A 5E84A 1BWFO 4CZLA 1HKCA 5AZIB 3GOIA 4QS7A 1BA0A 2Q97A 3DAWA 1SZ2A 2E2OA 1GLEG 1NGCA 2F9WA 3UKUB 1ESVA 2QW9A 2Q0UA 1QQMA 2Q36A 5BRFA 5AFUH 3FZMA 4FO0A 1K8KA 2V51B 2BTFA 1U2VB 3CERA 4B1UB 3LDQA 5BRHA 2HOEA 1NLVA 4BGBA 1V4TA 5BPMA 2HMPA 4RTFD 3ULEB 3BEXA 4FWRA 4NB4A 1D4XA 4A2AA 4BRNA 5AQJA 3WXKA 1BG3A 1BOTO 3CJCA 3LM9A 2W40A 2HF3A 1SQKA 4BROA 1P8ZA 5ELZA 3FZHA 5EX5A 3QMLA 4CZMA 1NM1A 3LDPA 1IJJA 2ASMA 2P9NB 3O1WA 3CQXA 1E4FT 3H3NO 4PKIA 4BRFA 1RFQA 3KZBA 4FWQA 4AM7A 4BRGA 5BR9A 1GLFO 5KPZA 3ULEA 4F9OA 1YUWA 1R59O 4B1XB 3I33A 2P9UB 3OHRA 1GLCG 3VF2A 3MN9A 1HLUA 3EKSA 4WYBA 4CBUA 2V7YA 4XEIA 1TUYA 2QWRA 3SMPA 4A62A 2WUSA 5AQPA 2I7NA 2QWMA 3M3ZA 3MCPA 3L4IA 3D2FB 1GLJO 4B1WB 1HX1A 5EOYA 1NGHA 3DJCA 3M6GA 4BRPA 1DEJA 3JXUA 1CZAN 5AQWA 2GTDA 5FPEA 5JMVA 3EL2A 1V4SA 4I6MB 1GLLO 5AQYA 4WQ4C 2AP1A 3B8AX 3H6EA 1G99A 4IJNA 1C0GA 4MLEA 2GEMA 1NGIA 2Q1NA 2ASOA 4MLHA 4CZKA 3LL3A 3R9PA 2CGKA 5F2RA 1ZXOA 3A5LC 3DXMA 1BO5O 4BG8A 5AFUA 1XUPO 4J8FA 1LOTB 3IFRA 2FSNA 4CZEA 5AZJA 5LJWA 5AQFA 3U9DA 1TYQB 3BF3A 4H5TA 3VETA 4CD1A 1BUPA 2E2PA 3GE1A 4FOEA 1MWMA 5KPRA 3O80A 4O5FA 3WXJA 3GL1A 1KAYA 3ID8A 5I9EB 1HKBA 2GWKA 3C7NB 1JCEA 3SMSA 1ZC6A 4FL9A 5FPMA 3ZEUB 4M7YA 4FOIA 2PAVA 1Q18A 5BPNA 4H0VB 2D0PA 3CJAA 3ENOA 2CH5A 3DXKB 1S3XA 2YJFA 2GWJA 3HI0A 3R6MA 2D0OA 5AQOA 2QWQA 4JHDB 2YCHA 3GDQA 1T44A 3VGMA 4M7XA 3O6WA 3QDKA 4RWTA 3C7NA 3TU5A 2Q31A 3VEVA 4IXCA 2AA4A 5AQZA 2CGJA 2D4WA 1NGGA 1YVNA 3ENHA 3QFUA 4FWMA 1BU6O 4Z94A 3UKRB 4YDUA 1GLAG 3FGUA 3RSEB 1QQOA 1EQYA 5ADXH 2W41A 3A0IX 4YDUC 3HZ6A 4FWSA 3BP8A 5AQTA 4FWLA 3HSCA 5EXWA 3SK3A 5EY4A 2A6AA 2H3GX 5AZIA 2NZTA 2VWBA 3H1VX 1JCGA 3BF1A 3UKUA 2E1ZA 2E2QA 5EVZA 4CZHA 3UKRA 2A42A 3GBTA 3IUCA 1U2VA 4DB3A 4BRLA 1X3MA 3RSEA 4ISGA 5KQ8A 2PBDA 3CQYA 5FPNA 3U4LA 4BC3A 4GNIA 4CD3A 3IDHA 1BDGA 4BR4A 3DWLA 2FSJA 2QXLA 2VCPA 2E2NA 4O8KA 3WQTA 3CJ1A 3P4IA 3WEEB 5AR0A 4K41A 3VESA 4BRHA 2A41A 2GUPA 2GELA 3F9MA 4DCHA 2Q2RA 1X9JA 4CBXA 4MO5A 3WQUA 4FPAA 1WOQA 5AQKA 4BRCA 2P9NA 1T6DA 4CJ7A 3O08A 3QBWA 1TUUA 3IMXA 4XH5A 3EO3A 1J6ZA 1Z05A 1IG8A 4PKGA 4H5WA 2YHWA 1T6CA 4BRKA 3MN6A 4BRAA 2E1YA 3TPQA 3MDQA 1U6ZA 4DQ8A 1S22A 2P9UA 4K25A 3ATVA 3LDLA 3CJBA 4FWKA 1ZBSA 4JNEA 4PKHA 1DKGD 4BG9A 4CI6A 2J4RA 4BQZA 1KAXA 1YXQA 4CZJA 1MA9B 1NWKA 3R8EA 4FWNA 3D2FA 2P9IB 1Z6RA 1DGKN 5AQHA 1QZ6A 4BRDA 5BN8A 3CHWA 2EWSA 4JD2B 5BN9A 1MWKA 2ZF5O 3U9ZA 5ADXA 3KVGA 3ZETB 1E4GT 2E8AA 4ISFA 2IIRA 4FWPA 4I6MA 4IJAA 4LC9B 2DPNA 4BR5A 2FSKA 3CIPA 1XC3A 2Q0RA 4H03B 1QQNA 2FLOA 4XH4A 2A40A 5AQUA 4BR2A 3BUZB 3MK6A 3QBXA 1ATNA 5KQDA 5TKYA 1LCUA 2FF6A 3EN9A 3FZKA 2FF3B 1MDUB 2P9IA 3LDNA 4HTLA 2P9LB 1NBWA 5AQQA 5AQRA 2P9KB 4E1JA 4EIAA 5FPDA 3H1QA 1TYQA 3GG4A 2A5XA 3FE1A 3D2EB 4A61A 3WT0A 4CBWA 5BPLA 4QS8A 3L0QA 3CI5A 5JLHA 1NGBA 3CJ7A 5AQLA 3O1BA 2QM1A 4Y0WA 3H45C 3AY9A 3FLCO 3I8BA 3ZEUA 3FZLA 3VEOA 1K8KB 1NGJA 2QWLA 3CETA 3EKUA 5AQVA 3VEYA 4B1ZA 3LDOA 3ATUA 2YHXA 3DXKA 4C23A 5F0XA 1NGAA 5JLFA 2E20A 3KHYA 4ISEA 4CZIA 3D2EA 3WXIA 5AQIA 4JHDA 2F9TA 4BVPA 4DHYA 4M63C 4K42A 3H3OB 5F1XA 1KXPA 1RDWX 1HJOA 5LY3A 4FWOA 4H5NA 1GLDG 4A2BA 4BR0A 3VPZA 4FSVA 3ZX2A 1ATRA 3JS6A 5KPTA 5BREA 3FZFA 1HPMA 2IVOA 3VF4A 1Y64A 4KBOA 4BREA 4BVOA 1KAZA 1HUXA 3AAPA 3VOVA 4B1VA 3EZWA 4PL8A 2I7PA 2P9SB 5AQXA 2NRHA 4BGAA 2IVPA 2A3ZA 1JCFA 3ZX3A 4B9QA 1QZ5A 1HKGA 3A5MC 2ASPA 4H0YB 2V52B 3MMVA 1YAGA 3ZX0A 2P9PB 4BRIA 3L6QA 3UB5A 3SJHA 3U8XA 3W3DA 2D1KA 2NLXA 4L3QA 3QICA 3AARA 1X3NA 2VYPA 2BUPA 2HF4A 1BA1A 4H0TB 4H0XB 4EHTA 1NGDA 4B1YB 2P9SA 3VEZA 4MO4A 2ZWHA 3VEXA 4EAHD 3G25A 4H5RA 3VEWA 4H5VA 2QWOA 1NGEA 2YHYA 3QFPA 3VERA 4WQ5A 3D7EO 2E88A 1RGIA 3LM2A 2P9PA 3H46O 3VENA 2IVNA 5E26A 1C0FA 4BC2A 3WEEA 3J8AA 3O4WA 3FFKB 3DXMB 4WQ5C 3CJ9A 3O5BA 3VGKA 4WQ4A 3WXLA 3AAQA 2CH6A 5AZJB 3VGLA 2FXUA 4BRQA 3QB0A 5AQNA 2UYTA 2YJEA 3HM8A 4NO7A 1SAZA 2QWNA 2CGLA 5B8HA 3UE5A 4GY2B 4PL7A 3WUHA 4H0OA 4IWVA 1GLBG 1NGFA 3A5OC 5AQGA 5JICA 4CZFA 4QS9A 3SLCA 3VF6A 3A8YA 2V7ZA 4EFHA 4HWIA 3HBTA 2QWPA 4JAXA 4BR9A 4FPBA 4IO8A 4JN4A 4RCHA 4JD2A 4BC4A 4BRMA 2OANA 3ZETA 5LJVA 5AQSA 1XQSC 2ZGYA 3MN5A 5BRDA 3A5NC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CFAA 1EXQA 4FJGA 4L8RB 4FJNA 3QNOA 2ITMA 4BQLA 4WFNL 3CC2N 1ITGA 4DR7K 1L5UA 1QHAA 1WAFA 3DRSA 5CE3A 3E9PA 3P83D 2ZJQL 3NH2A 3HTVA 2Y1IA 3KIOA 4BACA 4B9UA 1L3TA 3VQBA 4OX9K 3C65A 3CXCM 2KFZA 2B6AA 2ZGZA 3S41A 2KLAA 4CJUA 3O3HA 1ILYA 3C0BA 3S3MA 5HRNA 1NKCA 1WUAA 4LF6K 1NMDA 4CGHA 4FJ9A 3Q7BA 1OKJA 1H1VA 1NJZA 2DY4A 4Q0BA 1BWFO 5SWMA 3LP3A 3ZT2A 2HHTA 1T03A 3GOIA 3DLBA 3BY5A 1SZ2A 2E2OA 1A5VA 1KVCA 1NGCA 1R0AA 3HL8A 3RTVA 1TL1A 3FZMA 1U2VB 2OPSA 3L4QA 3CYMA 3CCEN 1N34K 4BGBA 5BPMA 2HMPA 3VQ4A 3J7YP 4RTFD 3ULEB 4NB4A 5HL7L 4BY9C 1IKYA 3WXKA 3LM9A 2W40A 5DM7L 4JKGB 4JKDA 5EX5A 1NM1A 1IJJA 2ASMA 4BWMA 5J2MA 2QI2A 4NCBA 3P39A 4CF1A 3M8QA 4AM7A 1NK8A 1GLFO 1B9FA 5KPZA 4F9OA 1R59O 5JENA 3L3VA 1VRTA 4B9NA 4DQPA 3MN9A 3OYAA 4CBUA 1A5XA 3CCSN 1TL3A 2UUCK 1VQMN 1LAWA 2WUSA 4CEZA 2I7NA 4DS5A 3MCPA 3L4IA 3D2FB 4A5AA 4B1WB 4MQ3A 3K5MA 5EOYA 5AQWA 3O9UA 3MWPA 5AQYA 5HBMA 4JRQA 4WQ4C 1NK7A 3AVKA 3T7ZA 4RW7A 1JLEA 4MLEA 4FXDA 3DYAA 4CEAA 2ASOA 4MLHA 2O4GA 1YI2N 5FRNA 3C6UA 4B8AB 5H1SQ 2CGKA 5F2RA 2G8HA 1BO5O 3ZT1A 3CCMN 5KRSA 1LOTB 4BE1A 2YNHA 2FSNA 3MX2A 4CZEA 4FVUA 5GAHP 3U9DA 4YORA 4CEQA 4H5TA 5CZ2A 3VTIA 5KPRA 3WXJA 3GL1A 3ID8A 1RBVA 4I9QA 4KRFA 3ZEUB 4M7YA 2HHWA 1WN7A 4MDBA 2D0PA 3ISNC 1N36K 2CH5A 3OYEA 2D0OA 4CJ5A 3VQAA 3KLHA 5AQOA 5M1OA 4G1QA 4AHVA 3V9XA 4O4GA 3QETA 1T44A 3VGMA 4M7XA 3QERA 4CJ4A 4NLBA 1N5YA 4YY3K 2HHUA 3DOLA 1RCHA 4DV7K 1Q9XA 3PO4A 4IXCA 2HBMA 4BDYA 3O9SA 5I42A 1YVNA 3ENHA 3QFUA 1YJ9N 3CCLN 1YITN 4FJMA 4FLTA 1TK5A 3UKRB 3J80O 1Q86O 3LALA 3HT3A 1HPZA 3OYNA 1QQOA 4CK3A 5ADXH 4HUGA 4YDUC 3O9RA 4IO9L 2ETJA 1GOBA 4B08A 4DV5K 4B9LA 4M3RA 4E7KA 5M1KA 5EY4A 4CHNA 4IDKA 3VN5A 3H1VX 4FJJA 2HHSA 1LWCA 3BGRA 3DLRA 4HUEA 4CJLA 4EP4A 1S9EA 2B4JA 3IUCA 5IT9O 1DTQA 2O8EA 3RSEA 4CCHA 5KQ8A 4TSXA 5FPNA 4BC3A 1DLOA 4FLVA 4ZTJA 4CJKA 2KZZA 1VSMA 3DWLA 4Z0UA 4O8KA 4DCHA 1DT9A 2KQ2A 4NXNK 1TAUA 4MO5A 3WQUA 3PIOL 2QXFA 2P9NA 5IWAK 1T6DA 4HVJA 4JKBA 4CEEA 3DRPA 3WNHA 4XH5A 3PV8A 4KO0A 3T1YK 2OA8A 3MDQA 1F21A 3ATVA 1YF5L 3CJBA 4F8RA 1VQ4N 3RR8A 1T8EA 2J4RA 3RWUA 1KFSA 1VSDA 2QA4N 3I8DA 3T1AA 4E7JA 5AQHA 1QZ6A 4JD2B 4KFBA 4NCAA 1XHZA 1MWKA 1IH7A 3KVGA 5CHIA 4Y1CA 1RDAA 4I6MA 2DPNA 2A1RA 1U4BA 5M1PA 3M8SA 1IKWA 2HW3A 4KHYA 1UA0A 3HVRA 1J9AA 3EN9A 3TSPA 2FF3B 3V81A 2P9LB 1X9MA 4ILGB 2G8WA 3H1QA 3AVNA 1TKDA 2QKKA 1TYQA 3IG1A 2A5XA 3JSMA 3TSQA 3MXIA 3D2EB 3VQCA 1D8YA 5M1QA 3WT0A 5JLHA 3V9UA 5AQLA 2VG7A 2QM1A 3SAHA 4LD0A 4Y0WA 3I8BA 4CJRA 3FZLA 4CGIA 4M3UA 3V1QA 3C6HA 3T19A 3FFIA 1NGJA 4W5RA 3QEVA 2QWLA 1VQ7N 3VEYA 4KI4A 4B1ZA 4C23A 5JS2A 1C0TA 3OYBA 3AA3A 2F8SA 3OYFA 5AQIA 4JHDA 2F9TA 4FW1A 4K42A 5F1XA 2F96A 4JI7K 1RDWX 4LFCK 4CW7B 4H5NA 3OYCA 3DLHA 1GLDG 5JS1A 4CF2A 3THVA 1ATRA 5KPTA 2O8BA 4ELTA 1HPMA 3ZSZA 3KLEA 1SS6A 3MEDA 2YX6A 4DFKA 1KAZA 5GIPA 4BE0A 1VSJA 1U48A 4FLZA 3THXB 3QEIA 3EZWA 4DSEA 1RBRA 3G6EN 5AQXA 4HHTA 2IVPA 4DTMA 3VQ6A 4Z4IA 3SBGA 4B9QA 2VG6A 2YKNA 3F73A 3A5MC 1HKGA 1KQSM 1KSPA 2ASPA 1BQNA 4H4MA 3L6QA 1S1TA 3RMBA 2NLXA 3LDSA 2VYPA 2BUPA 3V9SA 4H0TB 3HPOA 3MEGA 4CJPA 5JVHL 4EHTA 1J53A 3TAMA 1NGDA 4B1YB 1QVGM 2P9SA 4NCGA 2VWJA 4KI6A 4HTUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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