4KH4A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and amppnp
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
b'DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
total genus 184
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A02
3AGRA 4KH5A 4KH6A 4A5AA 4JEPA 4A59A 4KH4A 4A5BA 4A57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E3MA 3VF2A 1S6PA 4PL8A 2OPQA 4CEQA 4CJPA 2VGMA 4FOEA 1HX1A 1LW2A 5EY4A 3KLFA 3E1YA 3LZJA 2G8IA 5MLCQ 5C2DA 3QLHA 2OYQA 4M45A 3JAMO 3OYKA 3I0RA 2E6MA 3MWPA 3PX6A 5F2RA 2WONA 5CR4A 2ZQBA 1K73O 1KFDA 2YHAA 2X6NA 4B1ZA 1YUWA 4KFBA 1RBUA 5JS2A 3O08A 2P5OA 1I39A 4WFNL 4Q5VA 2P9SB 4JKFA 3F9KA 4I9QA 4I2QA 1X9SA 1QS4A 5E84A 1N32K 2HHWA 4JI7K 1IBLK 5BRDA 4GV9A 1JCFA 3CCJN 4B1UB 4B1XB 4CGIA 1NGHA 3TR8A 3V1QA 4DF8A 1SZ2A 1S3XA 4HUEA 3PIPL 4GV3A 2XY6A 1VSKA 4FJKA 3CETA 4M3WA 3VEVA 4C8MA 2E20A 2KLAA 1NGDA 3HSCA 1VQMN 1VHXA 4WQ4A 3PV8A 2OANA 3OYAA 4FPBA 3J81O 3NF8A 5H1SQ 2Q3SA 2HB5A 4FJXA 5D3GA 1Q9YA 3P5JA 4PY5A 5M1OA 1RTDA 4MDAA 3IS9A 4DSLA 4O0IA 4F2RA 2V52B 3L3VA 4TSXA 3CF5L 3QIPA 4FWPA 4B8CA 4KHUA 3QESA 1QVGM 4EP4A 4H0XB 2CH6A 3CM6A 4JV5K 2P9KA 2ZJQL 1ASVA 4FLVA 4AHUA 3FE1A 4N5SA 2HHTA 2FBXA 5EXWA 4YHHK 3KVGA 3AO2A 4BRDA 1GLDG 1YJNN 2O4IA 4DU3A 2JGUA 4FJ5A 2NRHA 4OPJA 1T44A 2Y1JA 3ZSOA 4UY8O 4HCBA 3SUQA 2FF3B 1VAZA 4F3OA 1C0GA 3SBGA 4FJMA 3NCIA 2P5GA 3ULEB 1NK4A 3VEOA 1TAUA 1VSMA 4C23A 3THXB 1XMOK 1OH7A 4KRFA 2GTDA 3F5TA 5LL6Z 2W41A 3QETA 4PL7A 4OGCA 3AA2A 3LDQA 4YOWA 5I9EB 4CZGA 4CW7B 3O80A 4RW4A 1WOQA 2F7TA 4KHYA 2O8FA 4B8AB 5FPNA 3FR0A 4AHRA 2CH5A 2IGIA 1NM1A 3VQQA 3QEVA 1WNSA 2X74A 4BQZA 3LM9A 4HVJA 1MWKA 5TKYA 2ZGYA 2JWKA 1NNEA 2QA4N 1HRHA 3DLKA 4KTWA 3G10A 2FSNA 2B6AA 3NF9A 4ZTFA 4LSLA 2FXUA 5LJVA 3J7AP 1NGIA 4JK9A 3L0QA 4CIFA 1VQKN 4UQGA 4BACA 4FJGA 3D2EA 3VGLA 1WUAA 1GLJO 5GIPA 3OYIA 2E1YA 4DMNA 1S6QA 2E2QA 1BISA 3V9SA 2BE2A 3A2FA 4IG0A 3CCEN 4NCBA 1TKTA 5CYQA 4H0TB 4CIEA 3A5OC 3VTHA 4IO9L 3CERA 3ZT0A 4CJLA 2I7PA 1K9MO 1RT7A 2VQEK 2QI2A 3THYB 4DUYK 4ISEA 4E7LA 4ILGB 1OVYA 4E7HA 3HK2A 3MCPA 4I9LA 2UYTA 4K41A 2O8DB 3O4WA 5C24A 1DKGD 3G25A 3LL3A 2G8UA 4CBXA 3L6QA 2Q97A 4FK4A 2HMPA 3GOIA 1YF5L 3VQ4A 4ID1A 2WBNA 3CJ7A 3DMJA 2HBJA 3CQXA 1Q82O 3VQ6A 1S1UA 2RHKA 4KBOA 4B1VA 3AVAA 1GOAA 2VWBA 5HBMA 2J4RA 4CF2A 3OJSA 3RWUA 1REVA 1NMDA 4IBNA 1Z6RA 4DTUA 1RBRA 1T7PA 1XHXA 3DRSA 1RT1A 1NK5A 3CFPA 5C15A 4DWIA 4E1NA 1KTQA 3CCQN 3D2FA 2IOCA 1NKEA 1E4FT 1CZ9A 1IBMK 4CJSA 1RBTA 1HPMA 2IDOA 2QXFA 3WT0A 2VG6A 4HUGA 1TYQB 4DTMA 4H0YB 3C95A 3ISNC 4Z4IA 3UKUB 3KZBA 2NNWA 1X9JA 2OA8A 4L8RB 1U6ZA 1BI4A 4EFHA 1VRUA 3U9ZA 2G8HA 1BIZA 3MN7A 4CE9A 4CF8A 2E6LA 4AHSA 3O8MA 5KTQA 2O8CA 4FO0A 5AFUH 5AQSA 3EE8A 4NO7A 4JI3K 1C0TA 4LF5K 2Q1NA 3N4QA 3VETA 3V4IA 4RCHA 2F9WA 4FJNA 4DFKA 4BG9A 5IWAK 3VQ5A 3NDKA 4DV7K 4LH4A 3T1AA 4FWQA 3SZ2A 3QFPA 2A1RA 2FSJA 4DG1A 4CGHA 3B6PA 3O9TA 1NG9A 1U49A 3CJCA 1F21A 3SBTA 3OYDA 2HSTA 1ASUA 3J80O 2P9PB 1U2VA 3K9KA 2NRWA 4IO8A 2BUPA 3KLIA 5GIOA 1K8KB 3CI5A 5AQWA 3J7ZO 2FF6A 1BGXT 3VEWA 5ADXA 1RDBA 1X9MA 2KZZA 1NK7A 4EAHD 1T8EA 2HHXA 1WSIA 2CGJA 1RT6A 3HPGA 4CHZA 4C1NI 3VQPA 5KRTA 4E7KA 4DU4A 3PX4A 3CMEN 4WYBA 2FSKA 4DTRA 5JVHL 5HLFA 1XC9A 1B9FA 3RMCA 4E1MA 4Z4HA 2UU9K 4KB0A 2ZE2A 3VQEA 4CGJA 1WSHA 2QWQA 3C6HA 4BRLA 3D7EO 5E26A 4YOTA 2D0OA 4KTZA 3DLHA 3J8AA 3ZT3A 3KK3A 3KK7A 1RT3A 1IG9A 4FWSA 5C25A 2GWJA 3AVLA 2F9TA 5KI6A 3CFRA 3VOVA 1LV5A 1BO5O 4E1JA 3UB5A 5FRNA 1YIJN 4KI6A 1VQ8N 5SWMA 3HVTA 4DCHA 3KLGA 2PYJA 4DSIA 4Z4FA 3RTVA 4CHNA 4FLYA 1V4SA 4LC9B 4CFCA 3EO3A 5KQ8A 3CPEA 3G71N 1QSSA 2RN2A 3GDQA 3F73A 3SPYA 2Q31A 1NWKA 2HVHA 3LAMA 3EKSA 4DTPA 3VQAA 2NZTA 4NXMK 3L2UA 3RRHA 4B3RK 2FBTA 2H3GX 5T7BA 4ICLA 2UXBK 2VG5A 3BZKA 3ZT4A 1KVBA 4JEPA 5C0YA 3DXMA 2IS3A 2Y1IA 5AZJA 3DOLA 4BRCA 2YX6A 4A61A 2OCEA 2CGKA 3K5OA 1GLFO 3M8SA 2Z1IA 4CGFA 4BRPA 4JK7A 3VEZA 3ZCMA 4G9ZA 1VQ4N 4DV4K 4C1NK 3L2WA 1RFQA 4KH5A 4DQQA 4CEFA 1L3SA 5JLHA 2OPRA 4IOCL 2ASMA 3HPHA 1JLFA 1NGGA 3AO3A 3QB0A 4CJKA 5GAHP 5KRSA 3AO5A 3NF6A 1VQ5N 1J5OA 1TL3A 4ID5A 4GV6A 4JKGB 4FJHA 2YJEA 2UXDK 2FC0A 4OKEA 2D0PA 2HOEA 4DSJA 3JS6A 1Y64A 2P9LB 1WAFA 4IOXA 4KI4A 1GLLO 1VRTA 3ATUA 3OVNA 4I2PA 5HRPA 3TSPA 4CJ3A 4DS4A 4FVUA 1VSFA 3AVCA 2G8WA 1IJJA 1J53A 3QICA 1HQEA 3TAEA 4OLAA 3UKRB 3FZHA 2E2OA 2KQ2A 3O3GA 4B3SK 3HTVA 3SMPA 3WUHA 3QIOA 4CK1A 3ATVA 3HO1A 1YAGA 3DM2A 1DEJA 5GADP 1BA1A 4E3SA 2ZJRL 1DGKN 4IXCA 3NGZA 4GKJK 4IDHA 4IKFA 5AQIA 4YOUA 4DTXA 1UOCA 3PUFA 1QZ5A 4B9MA 1KVCA 4J8FA 4B3OA 2EWSA 4MO5A 2ETJA 2KZMA 2QWPA 3BF3A 4JI2K 4CK3A 4FOIA 2Q0RA 4DQRA 3U8XA 4JYAK 1X3MA 1B92A 3Q7BA 3IG1A 3IAYA 1K6YA 1S1TA 4H03B 1BWFO 4H0VB 2A3ZA 1DTQA 1TK0A 3IRXA 2AA4A 4DS5A 2YNGA 1C6VA 1CZAN 3EY1A 5F1XA 1A5XA 4KV8A 1BDGA 4Q0BA 1TKDA 2OPSA 1BQMA 1QZ6A 4QAGA 1CZBA 3AAPA 3GG4A 2YI1A 4DR3K 4FK2A 4KH6A 1U04A 1N33K 3AO1A 2DTUA 4JHDB 4MDBA 4CJQA 3AY9A 2QKKA 4OPKA 3NFAA 4JKDA 3VQDA 4DSEA 5AQXA 4BDPA 4A5BA 2A1SA 4B9VA 4AM7A 5AZIA 3U6FA 3ENBA 3AVHA 3SK3A 2O8BB 1EQYA 3MEDA 3SJJA 4JN4A 4JLHA 3VEYA 3MN5A 2GUIA 1SKSA 3CCLN 3MXJA 3AARA 5K14A 2IVPA 4BR2A 3ENHA 2P9NB 4CVNE 3NGIA 2RF2A 3F9MA 3ZEUA 3BGRA 4CJWA 1D9DA 4WCEL 1SKRA 4O55A 3IFRA 3C0BA 5ADXH 4DR6K 5AJ3K 3OBYA 1NGJA 1EETA 3NH1A 3SI6A 2UUAK 4CD3A 4ILJA 2BH1A 4EP5A 4FWRA 4E0DA 4LFAK 2AP1A 4E89A 4CECA 3FZKA 2BTFA 1J5EK 1A5WA 4B9QA 4EZ6A 2G8VA 4B9TA 1C0FA 4N41A 4CHOA 4RW9A 3L2RA 3TTDA 1J6ZA 1S9EA 5KQDA 4BVPA 1LWEA 2QXLA 3DXKB 4BRFA 5J2PA 3RSEB 3HM9A 1KLMA 3SAHA 3I8DA 4A57A 1TGOA 2ZF5O 2DFFA 1SL0A 3T69A 4FCYA 4DTNA 1IO2A 4CI6A 2F4VK 1S9GA 5EOYA 3AA5X 3MEEA 3TPQA 3BZCA 1GOCA 2XHBA 1Q7YO 3DOKA 4FLZA 3E9OA 3K59A 4IEEA 4YDUC 3LDNA 3I0SA 4GVMA 5CYMA 4CZMA 2IAJA 3QINA 1W2BM 1VQNN 4J2EA 1L3UA 1R59O 3FZLA 4CF9A 4H8KA 3ZSWA 3KKSA 2NRZA 3H1VX 3DRRA 2HNDA 1QSLA 1IKVA 2EHGA 4M3YA 5BN8A 5AQRA 2HHSA 3N4PA 3CCMN 2YJFA 1NGAA 5KPTA 2Q36A 5M1KA 3SLCA 4JKCA 1UAXA 4BRNA 2W6KA 3CCVN 4FJ7A 2O8DA 1YJ9N 3L3UA 3R9PA 1EX4A 3D45A 1S1VA 1JLBA 3L4IA 2ZD1A 2YKNA 1TL1A 3QNNA 1D8YA 1EKEA 3J7YP 1HKBA 3T7ZA 4MLHA 1VQ7N 2P9UA 3HBTA 3LP2A 4I6MA 3MECA 3QDKA 1S72N 3NGYA 1QE1A 3OYFA 4CEZA 2ATQA 2VG7A 2NRXA 4CJRA 1ASWA 3IUCA 1WSEA 3SYZA 3KHYA 1UA0A 3EN9A 4WF9L 3OYMA 5HRRA 4DV3K 3H45C 3HP6A 3AVFA 3A5LC 3NHGA 1B9DA 1HQUA 3OHRA 4CBWA 4DQIA 2ASPA 1EWQA 3AA3A 2HMIA 3BY5A 3QFUA 3GBTA 1JLAA 4Z4EA 4FLTA 1IG8A 1BA0A 3UKUA 3SQ4A 3WEEA 2DFHA 1T3VA 2GX9A 2VCPA 3RVCA 3WNEA 4Z94A 5C10A 3U9DA 3K58A 4PKIA 5GAGP 4FLXA 4FWOA 4B9SA 1LAWA 4CHYA 4DLEA 3FZMA 4AH9A 3LDPA 1TUYA 2ZGZA 4EIAA 1QHTA 3QEIA 4NXNK 1KXPA 1XNQK 1IBKK 4H5WA 5AQFA 4KKOA 3ZLJA 2W40A 1SQKA 1Y97A 1ZBIA 4CF0A 1Q18A 1C1AA 5M1FA 1C1CA 2O8EA 4RW6A 4YOYA 4BRHA 4W5QA 1FKPA 2D0CA 3ZX0A 2X6SA 3TTCA 1A5VA 3H1QA 3ZSXA 3TAGA 2UUCK 1YT3A 4AF1A 3ZETA 1K8KA 3WQUA 1NMNA 5LMUK 4PA1A 5AR0A 1KSPA 4DHYA 4BRMA 3QMLA 1HJRA 2O8FB 1R0AA 2EX3A 4DFPA 5DM7L 5M1PA 1E4GT 5KPRA 5HL7L 5AQLA 3AVBA 4PUOA 1MU2A 4BE0A 2HBMA 1H1VA 4M41A 2HF3A 2DPNA 5BPNA 4DTSA 4CZIA 5AQUA 3EL2A 4HCCA 3E9PA 4FZYA 3HL8A 5A2QO 4FWLA 1P8ZA 4ZHRA 3WXKA 4E19A 3DLRA 4JNEA 4CJEA 3K5LA 3O1WA 1RTIA 3I8BA 3NBPA 2IVOA 5DM6L 2RKIA 3ZSRA 4DFJA 4BC4A 3R1XA 4PWDA 2ZJPL 3D2EB 5I42A 4CEBA 4FXDA 4LY7A 1U45A 1BIUA 1KVAA 4CJVA 3QO9A 4A62A 4BR5A 3WXLA 4FM0A 2YHYA 5LMNK 4BE1A 4HTLA 3O9UA 4BC3A 5AQKA 3O6WA 3PSIA 4QS8A 4K8ZA 4CEOA 3L2QA 3RMBA 4MQ3A 3A8YA 4Z4GA 2Z1GA 2PYLA 1S5JA 1TV6A 1Z26A 4BR4A 3PY8A 3VERA 3NAEA 3SMSA 1L3VA 2PY5A 3MMVA 5EU7A 5BPLA 1U47A 2YHXA 2WUSA 2PAVA 1P90A 3K57A 5ELZA 4E7JA 3ID6A 5KGWA 4N76A 2P9IA 3ZT1A 2IVNA 4ZTJA 1HYVA 3V6DA 3MN9A 4N56A 3OJUA 3LWMA 3DRPA 4HTUA 4QCLA 5AQOA 1BL3A 3P83D 1WAJA 2X78A 1I3AA 5FPDA 1KCFA 4LF4K 4BRQA 2KW4A 4F9OA 1MA9B 4MO4A 3VF6A 2FBYA 4BY9C 3TU5A 2DY4A 1O1WA 3OYEA 2A6AA 4ILHA 2JWLA 3CYMA 3QERA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AGR A;  4KH5 A;  4KH6 A;  4A5A A;  4JEP A;  4A59 A;  4KH4 A;  4A5B A;  4A57 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1E3M A;  3VF2 A;  1S6P A;  4PL8 A;  2OPQ A;  4CEQ A;  4CJP A;  2VGM A;  4FOE A;  1HX1 A;  1LW2 A;  5EY4 A;  3KLF A;  3E1Y A;  3LZJ A;  2G8I A;  5MLC Q;  5C2D A;  3QLH A;  2OYQ A;  4M45 A;  3JAM O;  3OYK A;  3I0R A;  2E6M A;  3MWP A;  3PX6 A;  5F2R A;  2WON A;  5CR4 A;  2ZQB A;  1K73 O;  1KFD A;  2YHA A;  2X6N A;  4B1Z A;  1YUW A;  4KFB A;  1RBU A;  5JS2 A;  3O08 A;  2P5O A;  1I39 A;  4WFN L;  4Q5V A;  2P9S B;  4JKF A;  3F9K A;  4I9Q A;  4I2Q A;  1X9S A;  1QS4 A;  5E84 A;  1N32 K;  2HHW A;  4JI7 K;  1IBL K;  5BRD A;  4GV9 A;  1JCF A;  3CCJ N;  4B1U B;  4B1X B;  4CGI A;  1NGH A;  3TR8 A;  3V1Q A;  4DF8 A;  1SZ2 A;  1S3X A;  4HUE A;  3PIP L;  4GV3 A;  2XY6 A;  1VSK A;  4FJK A;  3CET A;  4M3W A;  3VEV A;  4C8M A;  2E20 A;  2KLA A;  1NGD A;  3HSC A;  1VQM N;  1VHX A;  4WQ4 A;  3PV8 A;  2OAN A;  3OYA A;  4FPB A;  3J81 O;  3NF8 A;  5H1S Q;  2Q3S A;  2HB5 A;  4FJX A;  5D3G A;  1Q9Y A;  3P5J A;  4PY5 A;  5M1O A;  1RTD A;  4MDA A;  3IS9 A;  4DSL A;  4O0I A;  4F2R A;  2V52 B;  3L3V A;  4TSX A;  3CF5 L; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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