4KH4A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and amppnp
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
total genus 184
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A02
4KH6A 4A5AA 4A5BA 4A59A 4A57A 4KH4A 4JEPA 4KH5A 3AGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GBTA 4RTFD 1KXPA 1L3UA 4FK2A 2OCEA 4H0YB 1RDUA 3ZSWA 1OKJA 3AVHA 4JD2A 4CJ7A 5CR4A 1MWKA 2HBJA 1DT9A 3PSIA 2KHOA 2XY8A 3WNEA 3OYKA 5M1KA 1UA1A 3KVGA 3MN6A 1VK0A 4M3YA 2YNGA 4LSNA 4JK8A 3FE1A 1FJGK 1NK9A 5ADXH 1TL1A 2VG5A 1JL2A 2Q1NA 3HYFA 3ZT2A 4JKFA 5LJVA 4KHPK 4JEPA 4O4GA 4FWMA 3EEQA 2OZSA 4AHUA 4NXNK 5AQXA 1B9DA 1Q18A 3OHRA 3L6QA 1Q81O 5AFUA 5AR0A 1BIZA 4I2QA 4JS5A 4YOVA 1KRPA 4N76A 4FWQA 3KJVA 2P9SA 1U4BA 1W7AA 4Y1DA 1EKEA 2B5JA 3QFPA 3S3NA 5DM6L 5AZJB 4M3WA 3A8YA 3BZCA 4YOTA 2F9WA 1LWFA 5A2QO 5KRTA 5JMVA 4KPYA 2UYTA 2CGLA 1QHAA 2OTLN 4DV1K 3M8PA 2E8AA 5BN8A 4IFEA 2R7YA 2QWPA 1Q9YA 2PY5A 2O8CA 1TAUA 3T1AA 1QVGM 4DQIA 4B3MK 1L3TA 4E89A 1G15A 3VQAA 1JCGA 4CJRA 4B8AB 1TK5A 2P9LB 4CFCA 3S3MA 2YHWA 4CJLA 5IWAK 5JS2A 4IG0A 4CEAA 3VA0A 3O9SA 4E1MA 2O4IA 1LCUA 3CI5A 3IRXA 3LAKA 3TPQA 3U3GA 1TK8A 1TAQA 3ITHA 1SL0A 4CF9A 3U4LA 3VQQA 1SL1A 3CCUN 3CF5L 3FZFA 2QW9A 5LMNK 3D2FB 3AO2A 3CQYA 3P5JA 3NGIA 3ZETB 2P9UB 4DSLA 3LP2A 4MQ3A 3OJSA 1VQ5N 5BRDA 4AF1A 4J2BA 2P9PA 3UKUB 2IS3A 4TSXA 3FZLA 1LWEA 4KB0A 2JWKA 3OBYA 4F2RA 3DXMB 2FBXA 1VRTA 2AJQA 3C0BA 4J2AA 5AFUH 3FFKB 1QZ6A 4GMJB 1YHQN 2FLOA 2OPPA 5I3UA 3D45A 4B3RK 1C1BA 4I7FA 1HKCA 2ZJRL 4A62A 4FK4A 3FZKA 2XRIA 3AY9A 4LSLA 4WE1A 1L3VA 3HL8A 2P9SB 4DUYK 4AH9A 2Q0RA 5BRFA 2WONA 5HRNA 4E19A 4K43A 2WFBA 4FJLA 3K5MA 2Q0UA 1SKRA 2BTFA 3OYEA 1LOTB 3CETA 2W6KA 2WUSA 3NFAA 3VGMA 2YHBA 3IG1A 4IKFA 4FWLA 1DLOA 3OYDA 4EZ9A 2ZE2A 4DU4A 4AHSA 1ZXOA 4CJ4A 3RSEA 1C6VA 3L2QA 2ITMA 4FW1A 3EE8A 3BDPA 1KVAA 4RWTA 3EZWA 1KLNA 4CEZA 1S9GA 2J4RA 4B1UB 1NGHA 5KPRA 1ASUA 2FSJA 3SAGA 2CGJA 3SLCA 3HRGA 1RT2A 3QEVA 4JRPA 2E6LA 3VQDA 3V4IA 1GLAG 1K6YA 2IVPA 4WQ4C 3BUZB 3T1HK 1SUQA 3ZSRA 4FOIA 3TSPA 4JI4K 3HM9A 2B4JA 3P31A 4X64K 1RDAA 1C1CA 1E4FT 4QOZB 3L0QA 5M1OA 4H5RA 3HPHA 4QS7A 3AVLA 3CERA 3R8EA 4IOCL 4QAGA 3FLCO 1W2BM 4E1NA 3DAWA 4YFUA 4ELTA 4HHTA 2A1RA 2OPSA 4DV4K 4KTZA 1GLEG 3AVMA 3K9KA 3CC7N 1WSGA 4DWIA 4Z4FA 1BISA 1SQKA 2UXDK 3ZSXA 1DEJA 1EXQA 1RGIA 3ZLJA 3P1GA 3OVNA 2YNFA 1HNVA 4H0XB 4GV9A 3KLIA 1RBSA 4B8CA 2GEMA 5C24A 2A5XA 3VERA 4C8KA 4DB3A 3SUPA 3ZSVA 1KQSM 2BANA 3D6RA 4NCAA 4DCHA 1M1KO 3SJJA 4DSFA 1VQKN 3UE5A 5CHIA 4WF9L 3RMCA 1C0TA 3QB0A 2WTUA 3OYCA 4CE9A 1S1TA 4DQSA 4IBNA 4IOXA 3NF8A 5KPZA 5GIOA 2Q2RA 4X66K 1JJ2M 1ZBSA 4XH5A 3MN7A 4CJWA 1X9SA 4DHYA 1EQYA 3MXMA 4ID1A 5KPTA 2QWRA 4DSIA 3I56N 1T7PA 1S6PA 1ASWA 1U48A 1NMDA 1IKWA 4B9TA 1JLCA 1A5VA 2ZJPL 1CZ9A 1GLCG 4YHHK 2ZGZA 3T1YK 5DMRA 1NJYA 1JLBA 3VEYA 1WAFA 3LZIA 3M8QA 1WSIA 3AVNA 4PKHA 1NM1A 2VGNA 2KZMA 3PSFA 3F9MA 1XWLA 5AQOA 5F0XA 1VSIA 5KQ8A 5IT9O 4DR2K 1RBVA 3O9RA 3P38A 1SS6A 2KTQA 1VQON 2E2NA 1ATSA 1QSSA 2Z1HA 3AVGA 1X3MA 3QETA 1L3SA 1DTTA 2D0BA 3DLEA 4CEFA 3LP3A 2P9NB 3LWMA 3MWPA 4EP5A 3SMPA 3QBWA 3WQUA 1P8ZA 4Z4GA 5FRNA 3V9UA 2O8EA 4BDPA 1LV5A 2E2PA 3VGLA 2OA8A 1NGEA 4MDBA 1ESVA 1YXQA 4CF8A 2HHVA 4CHPA 2PFUA 4DV2K 1BHLA 4DFMA 4DTPA 1HUXA 5D3GA 3EZ5A 1DGKN 4X65K 1VQMN 3RVCA 2QA4N 2X78A 1HYZA 1TYQA 3T3FA 3AVAA 3ZSQA 1K9MO 4KHNA 4HUEA 1IG9A 5ADXA 3DRPA 3GOIA 1FW6A 1RT4A 2V7ZA 2KQ2A 5AZIA 1NGIA 3VQCA 3QNOA 1KVBA 1V4TA 5HL7L 1RT7A 4M63C 3FZMA 5EY4A 2Z1IA 1HJOA 4Z94A 2BUPA 3NF6A 3VOVA 2XY5A 2WC9A 4O5FA 4CGHA 4BWMA 4DR7K 3DJCA 5E41A 5DM7L 4CZFA 3VMFB 3O9QA 1WSHA 5SWMA 3O4NA 2OTJN 3T19A 4O5BA 4OPAA 1YAGA 4HCCA 4KRFA 4FVUA 1NGFA 2E6MA 2P9PB 4ISGA 2P9KA 1LW0A 4JN4A 4C8MA 1Y64A 4MO4A 2I5JA 4BC2A 3ZETA 3ZYYX 4CZIA 3HP9A 2Q3SA 1E3MA 3O9TA 4IJNA 3ZSYA 1IG8A 4ICLA 4IZ9A 3VEWA 3CIPA 3T7ZA 3S3OA 1RFQA 1ATRA 3PIOL 3VTHA 2ZGYA 2QI2A 1JLAA 4AQYK 1YVUA 1SZ2A 1TKZA 1S6QA 2YV0X 1BQMA 3NGYA 5AQNA 4GVMA 3BZKA 4KBOA 5HRPA 4DS4A 4DQRA 4CFBA 4BDZA 1BA1A 2YNIA 4MFBA 3CCQN 3N4PA 2P9LA 1VQ9N 1JXBA 1RILA 4JI6K 4CW7B 2HHHK 2RF2A 4BE2A 3MXJA 1RTHA 2UU9K 3MECA 3LDPA 3LDNA 3WEEA 1NKEA 2D4WA 2V7YA 5LY3A 1RTIA 1KTQA 2IAJA 3CJ7A 2O8FB 3JS6A 2AP1A 1OH8A 3D2EA 1TVRA 3MK6A 1U2VB 4NCBA 3G10A 4BRKA 3G71N 2W41A 3PLAA 2D0PA 3M1FA 3AVFA 3UKRB 4XEIA 4ISEA 4F4KA 3UIQA 3CHWA 5CE3A 1U49A 3B6OA 2FF3B 1VQNN 1NK7A 2Q36A 3DXKB 1YI2N 5M1NA 4FLZA 3VESA 3DI6A 2GWKA 3CJAA 3O80A 2ZM6K 4O0IA 2ETJA 3NMUA 1Y97A 2ITGA 3TAQA 3LDLA 4BR4A 1I39A 4CD1A 1DTQA 3NE6A 4JS4A 3VA3A 4B3OA 1HKGA 4Z4HA 1RCHA 3L3VA 4JI1K 2D0OA 4DTJA 3CYMA 3L2WA 2A3ZA 2HBKA 5TKYA 3I0SA 3TANA 3AGKA 3V9ZA 3RR8A 3VEXA 4QCLA 3SZ2A 4OPHA 1JKHA 2HHSA 3NCIA 2Q97A 1S5JA 4H5WA 1NGCA 1VQ6N 4E7IA 3RR7A 1TL3A 5I42A 3Q7BA 3GDQA 4AHVA 3VEZA 3V1RA 1W0HA 3EYZA 1VQLN 4H0VB 4JI3K 1IBLK 4DLGA 2HHTA 1Q9XA 2FXUA 2RPIA 1U47A 3THYB 2IC3A 4FL9A 1M90O 4IDKA 4FK0A 5GADP 3K5NA 1L5UA 1CXUA 4CZGA 3HBTA 4DUZK 2HHWA 3O1BA 1I3AA 3D2EB 5BN9A 4AM7A 4CERA 3CCEN 1T3VA 4JHDA 2P9KB 1LAVA 1WB9A 3AV9A 4CJ5A 3MCAB 3LDQA 4CZMA 4KREA 1XHXA 2QWOA 1SL2A 4FZXC 4CZKA 3SAFA 4DKWA 2OYQA 2HOEA 3M5RA 4BVOA 4DQPA 2XY7A 4CESA 1NKBA 4KV8A 4FWKA 5AQSA 2JGUA 1CXQA 5C42A 2OANA 3C95A 4BRIA 2A1SA 1VQ8N 2G8IA 5AZIB 4CBXA 5LMUK 3O3GA 3THYA 3H1QA 4CHOA 4Q5VA 3F2KA 4K41A 1K8KB 3C6HA 4BGBA 4BRMA 1N34K 4CEOA 4JKCA 1TKTA 4B9MA 2QKKA 3JSMA 4CIGA 5HOOA 1YJNN 2W40A 4O44A 3SPYA 3HVTA 3NH1A 1NGJA 1OVQA 3O6WA 4ZHRA 1I94K 1ZBHA 1KFSA 1YTAA 5BPLA 3SUQA 3K2PA 2YHYA 2WBNA 5BPMA 2X6SA 3K58A 4YOWA 4BG8A 1VQ4N 1EO1A 3NBPA 4E3SA 2VWKA 1GOAA 3KKSA 5EOYA 4JYAK 5E84A 1ITGA 3E9OA 4CJEA 4FWRA 5LL6Z 2NRRA 4Z0UA 4DTSA 4H03B 1NOYA 1TKDA 2F8SA 3CXCM 4W5RA 4N47A 2KZZA 5BRHA 4KHWA 3W0LA 3LDOA 4DV7K 2YJFA 4BQLA 3F9KA 4JI2K 2A40A 3OYFA 3A2FA 1TYQB 3V6DA 5C15A 3GE1A 1X3NA 2PBDA 5AQPA 1BCOA 2PYLA 4CEEA 1Z26A 3V81A 1C0GA 5M1QA 3WXMB 5J1EA 3LM2A 1X9WA 3RWUA 3JXUA 4IDHA 3HVRA 2NRHA 1KAZA 4DR1K 1EETA 2NRTA 3K5LA 4JKDA 3ZT4A 2HSTA 4UY8O 4F3OA 2YI1A 5AQJA 3QEPA 1T6DA 3OYJA 3CCLN 1XNQK 4M42A 1T8EA 1MA9B 5J2NA 4JD2B 1NGDA 2ASPA 1KLMA 1NNEA 4FYDA 4JI7K 4BR7A 3R9PA 3TSQA 2X74A 5AQFA 4A61A 4YOXA 1OVYA 4IO8A 3AVKA 3PO5A 4B08A 5KQDA 4B9VA 2G8HA 3ZEUA 4YOYA 4FJGA 3UKRA 4FO0A 2IDOA 2YKNA 3PX0A 1W97L 5ELZA 2D5RA 2HB5A 4LD0A 1NU0A 4CF1A 1O1WA 2QWLA 2IGIA 4DSEA 2HF4A 3G25A 3VENA 5HRRA 4BGAA 4B9NA 3OS0A 3EKSA 3AA2A 4PA1A 4FLUA 3OYHA 4LF7K 3ID6A 5CZ1A 1VSEA 4CVNE 4KAZA 2I7PA 4AM6A 3M8SA 4OKJA 1Q7YO 3VQ5A 3SNNA 4OGEA 1TK0A 1NOZA 2QKBA 3OW2M 2O8BB 3CCVN 4NO7A 1JCEA 1X9JA 4RCHA 1MU2A 1T05A 4OPJA 2P9IB 5KTQA 1CZAN 1VHXA 4DFKA 1N8RO 4V19S 1XNRK 3E66A 4CBUA 3AGRA 3EN9A 4B3SK 4RW6A 3S41A 1FK9A 1TKXA 1QQMA 4DQ8A 1B92A 1JLFA 4A2BA 5LJWA 3G6EN 3ENHA 2HVIA 4IG3A 2KKZA 4H4OA 1GOBA 5FRMA 4H8KA 3DMJA 3BGRA 3BF3A 2F4VK 4GV6A 4DSJA 4M3XA 1J5EK 3VF4A 4WFAL 3O8MA 1NWKA 1HYSA 3AA5X 2YNHA 5J2PA 4CK3A 1WSJA 3V1QA 4XH1A 3MAQA 2NZTA 3RRHA 3L4QA 4PQUA 1WUAA 3K0SA 1KD1O 3ISNC 1JLQA 1GOCA 1BIUA 1BQNA 2OZMA 5FROA 4FJKA 1R0AA 3H6EA 3CM6A 3K5OA 3DLKA 2E4LA 3HO1A 3CMAN 3THWA 3O3HA 1S22A 5HBMA 5C25A 3OYMA 3E1YA 4CF2A 2HNDA 1S72N 2FF6A 4YNQA 4KTWA 4FLVA 4PKIA 5C0YA 1MWMA 2D1KA 5FPNA 3KK3A 4HTUA 3CCSN 5CY4A 1EX4A 4QS9A 1NK6A 2HHUA 5SZTA 5B8HA 1HPZA 2GUPA 2GV9A 2F9TA 4BE0A 1QSYA 2ZWHA 3PX6A 3M6GA 3AO3A 3EKUA 1BL3A 4JK7A 4FM1A 2BGGA 3SQ4A 4IFVA 4I6MB 1QE1A 3TAMA 1VAZA 3MWTA 5I9EB 1IV0A 3AARA 1EP4A 1UA0A 1TUUA 3ZT0A 3PO4A 3VQEA 3O3FA 1RDDA 1S3XA 1NKCA 4GKJK 3L2RA 3HZ6A 4DS5A 2FSKA 4G1QA 4WYBA 4ILHA 1ZBIA 3ZX2A 1BCMA 1QQOA 1ZC6A 3QFUA 3TWHA 1QHTA 4JHDB 4J8FA 3F73A 2VWJA 1HKBA 3QMLA 4MLEA 3O4WA 5GAGP 4DU1A 1WN7A 3BEXA 3CPEA 1QVFM 3NDKA 3LZJA 4FJ9A 1BI4A 3AO5A 3AVBA 1XC9A 3ZEUB 2D0CA 5EVZA 3LPTA 5CYQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KH6 A;  4A5A A;  4A5B A;  4A59 A;  4A57 A;  4KH4 A;  4JEP A;  4KH5 A;  3AGR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GBT A;  4RTF D;  1KXP A;  1L3U A;  4FK2 A;  2OCE A;  4H0Y B;  1RDU A;  3ZSW A;  1OKJ A;  3AVH A;  4JD2 A;  4CJ7 A;  5CR4 A;  1MWK A;  2HBJ A;  1DT9 A;  3PSI A;  2KHO A;  2XY8 A;  3WNE A;  3OYK A;  5M1K A;  1UA1 A;  3KVG A;  3MN6 A;  1VK0 A;  4M3Y A;  2YNG A;  4LSN A;  4JK8 A;  3FE1 A;  1FJG K;  1NK9 A;  5ADX H;  1TL1 A;  2VG5 A;  1JL2 A;  2Q1N A;  3HYF A;  3ZT2 A;  4JKF A;  5LJV A;  4KHP K;  4JEP A;  4O4G A;  4FWM A;  3EEQ A;  2OZS A;  4AHU A;  4NXN K;  5AQX A;  1B9D A;  1Q18 A;  3OHR A;  3L6Q A;  1Q81 O;  5AFU A;  5AR0 A;  1BIZ A;  4I2Q A;  4JS5 A;  4YOV A;  1KRP A;  4N76 A;  4FWQ A;  3KJV A;  2P9S A;  1U4B A;  1W7A A;  4Y1D A;  1EKE A;  2B5J A;  3QFP A;  3S3N A;  5DM6 L;  5AZJ B;  4M3W A;  3A8Y A;  3BZC A;  4YOT A;  2F9W A;  1LWF A;  5A2Q O;  5KRT A;  5JMV A;  4KPY A;  2UYT A;  2CGL A;  1QHA A;  2OTL N;  4DV1 K;  3M8P A;  2E8A A;  5BN8 A;  4IFE A;  2R7Y A;  2QWP A;  1Q9Y A;  2PY5 A;  2O8C A;  1TAU A;  3T1A A;  1QVG M;  4DQI A;  4B3M K;  1L3T A;  4E89 A;  1G15 A;  3VQA A;  1JCG A;  4CJR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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