4KH4A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and amppnp
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 184
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A02
4A57A 4KH6A 4KH4A 4A59A 3AGRA 4JEPA 4A5AA 4A5BA 4KH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BEXA 5AQMA 4C8LA 1XMOK 4IXCA 3DM2A 1GLBG 3FFIA 3E66A 1O13A 3CIPA 4CGHA 2BTFA 4OLBA 2Q1NA 1OH8A 2CH5A 3SI6A 5I42A 1BOTO 4DR5K 3FE1A 4DV2K 4BRCA 5M1FA 4E1JA 3EZWA 3WEEA 1U49A 4F2SA 2KFNA 2ASPA 2DTUA 4C8NA 1SL1A 1YTUA 4KKOA 3SUQA 4GW6A 4FO0A 1QTMA 4CF2A 1X3MA 4NYFA 4CJUA 3C7NB 4H03B 3V1RA 1XQSC 3R8EA 4HUEA 1HKGA 3AVMA 4H4MA 2WTUA 1R59O 3CC2N 3OTOK 5E26A 3ITHA 2O8EA 4NO7A 3CMAN 4M63C 5AQUA 3O6WA 3ZT1A 3QEIA 1SUQA 4M42A 4PL8A 1NU0A 3FFKB 4DTJA 3VERA 3OYAA 4LF7K 1RTDA 5M1KA 2IVOA 4CECA 1VQNN 2CH6A 1X9SA 3OYKA 2G8FA 3D7EO 5TKWA 3ENBA 3VEWA 4CF8A 3CCRN 3KKRA 3LANA 2YKNA 2HMPA 2PFUA 3OYJA 1MU2A 4DV7K 3BY5A 2PAVA 2RPIA 3SJHA 4OX9K 3NCIA 4M45A 3T69A 2P5GA 2QWRA 4CD3A 3THYB 3SMSA 1TKTA 4NCBA 4CEZA 5F1XA 4OPJA 2QWNA 3ZSXA 3AO4A 4C8MA 3VPZA 2IS3A 1XC9A 3K9JA 2DFFA 2KQ2A 4JRPA 3LZJA 1YIJN 1JXBA 2VWKA 1NGAA 3LZIA 3LALA 2KZMA 3SV3A 2QK9A 4FK2A 1NGCA 3ATUA 1Q9YA 3A0IX 1VSDA 1VSLA 1BIUA 4AHCA 3ZETB 4LSLA 4OPHA 5J2MA 2DPNA 1RTHA 3A5MC 2R7YA 1TVRA 1BDGA 3L4IA 5CYMA 3KIOA 3LP1A 5M1OA 4BRGA 5SZTA 5ELZA 3LPUA 1N5YA 4CEFA 2X74A 2W6LA 3EN9A 3V1OA 1BHLA 2VG6A 3B6OA 4ILGB 3WXJA 3RSEB 5AQFA 3NGYA 3KLHA 3DXMA 3CCLN 2UUAK 1VQMN 5J2QA 2O8FA 5JMVA 3CCQN 3C65A 4DUYK 3K2PA 1QSYA 3ENHA 2BUPA 1NKEA 4KAZA 5EY4A 4DF4A 5AQVA 4BVOA 4BC3A 3OYCA 2Z1HA 1HRHA 1LW2A 3CYMA 4CE9A 1WOQA 3MCPA 2ITGA 5EU7A 1ZXOA 5ADXA 4WF9L 1TYQB 1SS6A 3T1AA 3J8AA 2HHUA 2RKIA 4IZ9A 2KKZA 4C1NI 2HSTA 3CQYA 4K42A 5HLFA 1XMQK 4PQUA 4M3UA 1YF5L 4IEIA 2GELA 1EO1A 1D5AA 4YHHK 4DTNA 1VQON 2WONA 4LFBK 1VRUA 4BRQA 3F5TA 1GLJO 3U9ZA 3V9XA 2ZJRL 2FBYA 3PIPL 4DTOA 2V51B 3WXIA 1L3VA 3CF5L 4FWOA 5AQXA 1N8RO 3ULEA 5AQKA 2Z1IA 3TI0A 2YNIA 4Y0WA 4F8RA 1NK5A 2A42A 2Q97A 4H8KA 1U47A 4RW4A 3CJ9A 2W41A 2OPQA 1FK9A 3LP2A 3EYZA 5BR9A 3F2KA 3ZSOA 3QIPA 1JL2A 3HPOA 3O1WA 2OZMA 5AZIA 2WUSA 2G8HA 1HNWK 4KTQA 1C1AA 4O0IA 2IIRA 4AHSA 1NM1A 3KTQA 2F7TA 1NGJA 1RDBA 4CGJA 3SBGA 3AV9A 3VF6A 4FWKA 1WB9A 1RBRA 4UY8O 4JKBA 4E7IA 2CGLA 3T7ZA 3SAGA 4M3RA 2VQFK 1FW6A 1S6QA 2P9UA 4DMNA 3G6EN 1BCOA 1S9GA 1XHXA 4CJ4A 4HTLA 3VA0A 1K9MO 2DY4A 5CR4A 1J6ZA 3L6QA 4CEEA 3S3NA 3KJVA 4LH4A 1Y64A 3TU5A 4CEBA 4DSLA 3VF4A 2ZWHA 3VEZA 2B5JA 4ISFA 1KXPA 1ZBUA 3ZYYX 2ETJA 1QQOA 5SWMA 5HROA 4JEPA 3CCMN 1KC8O 1B9FA 1LOTB 1HNVA 3BUZB 3SQ4A 4AHRA 3I8DA 4M7XA 1HYSA 1YJWN 4YOUA 3O9TA 1HR0K 3A5LC 4BWMA 1NMNA 3O5BA 4BGBA 1BI4B 2ATQA 3QEVA 4H4OA 2P9SA 3AVFA 4BRFA 1KAYA 1Q86O 5DK5A 4IDKA 3C6TA 3WNHA 2FBXA 1TUUA 4CEQA 3SLCA 4RTFD 4DFPA 4FM1A 3WNFA 1R0AA 1VQ9N 3SPYA 2YHAA 4MDAA 2HHWA 2FC0A 4CK3A 3V9WA 5DM6L 4BDPA 3ZSYA 1T05A 3TABA 4DV0K 1B9DA 1JLFA 1VQ4N 1NGEA 1YAGA 3TSPA 4RG8A 2VCPA 3G25A 3PUFA 1QQMA 4X65K 3UKUB 3D6RA 3QETA 3L3VA 3AVKA 5C42A 2E2PA 4DR1K 1XHZA 4BE2A 3DOKA 4DCHA 4J2EA 1RDCA 3ZSWA 1XI1A 5I9EB 1QE1A 2NNWA 3BZKA 1EWQA 3QNOA 4BR9A 3PX6A 1EQYA 1EP4A 4I2QA 1SL0A 2G8IA 3HZ6A 4CHNA 1RT5A 1J5OA 4KI6A 4RW8A 4DTPA 5HRNA 3RRHA 1Q81O 2YKMA 4CFDA 5AFUA 4GV3A 5KRTA 3HSTB 4CFAA 4YOXA 1NK0A 2H3GX 4FLYA 4FJXA 1GOCA 3RR7A 1WAJA 1IJJA 3E9PA 3MN9A 3VETA 4M7YA 3V1QA 3K5LA 1BA1A 1N6QA 5JLHA 3AVJA 5KGXA 4DTMA 4FW1A 4B08A 4R79A 4IDHA 5C0YA 1ILYA 3G10A 3VQCA 2KW4A 1UA0A 2AJQA 3CFRA 1NG9A 3WEEB 5AQPA 4A5BA 4E7JA 4A2BA 1N34K 3CCJN 1JLEA 2FXUA 4JI4K 3VEYA 3HJFA 4MFBA 3V6DA 2QWMA 1OVYA 1I3AA 1TL1A 3CJAA 5FPNA 2E1YA 3CPWM 2O8BA 1YXQA 2ZF5O 4FPAA 3QEWA 4Y1CA 4CESA 3PO4A 4BROA 1NNEA 3UKRA 3OS1A 1CZ9A 3VQ8A 5K14A 2O8EB 2BDPA 3HSCA 3M8SA 3LWMA 3MXJA 4M3WA 3KHYA 3G71N 4YOTA 4NLCA 3L2QA 4EFHA 2YNFA 2RE2A 3ZT4A 1JLAA 1X3NA 4XH5A 3OBYA 3K59A 4N76A 3R3LA 1RFQA 3IDHA 2E6LA 2VWBA 3BP8A 4BR5A 4J8FA 2G8KA 4CHZA 1HLUA 4JI3K 3CERA 3OYLA 3DWLA 3CCUN 3QEXA 4H0PA 1YTAA 4WQ4A 1DEJA 2YI1A 4KHWA 2O8CB 4KFBA 4DUZK 1GOBA 5HP1A 4CERA 2E2OA 2E8AA 3D0PA 5C2DA 3C6HA 4KHYA 3S9HA 2A5XA 4OKKA 3AVHA 3O4NA 1IKYA 1NBWA 5C2FA 1V4SA 4CD1A 4K25A 4FCYA 1RDWX 4DQSA 4AQYK 3HOTA 4CZJA 3DLGA 2W42A 4O5FA 4EAHD 3MECA 1GLFO 4DHYA 3CI5A 2WBNA 3ZSQA 3HVRA 4CJEA 3SQ2A 2VWJA 1MWKA 4FLUA 4IFYA 4A62A 3TSQA 4KH4A 1ZBHA 3V81A 1HNZK 2OPRA 5AQNA 3OYGA 4LF4K 3OJSA 4WQ5C 4XH4A 1JCGA 2UU9K 2QW9A 3IUCA 1S22A 5AQLA 2E5LK 2Y1IA 4DV3K 4CJQA 3CETA 1FKPA 1KLMA 1NGFA 4W5QA 4A57A 3H08A 2NRXA 5HRRA 4OJRA 4K8XA 3WQUA 5M1NA 4IEEA 1HJRA 1O1WA 1JCFA 2IOCA 3VOVA 3MWPA 4BR0A 1ASUA 2P9LB 3NF8A 4ILHA 3CXCM 3ID8A 1NK4A 5T7BA 2O8FB 4DG1A 4H0TB 1XUPO 4WE1A 4FWRA 2XY8A 3OYDA 3V4IA 2PYLA 3WQTA 3UKUA 4K43A 1IG9A 4JNEA 4NLBA 5FLXO 3SJJA 4FM0A 1IKVA 3CHWA 4DQRA 5KRSA 1W0HA 3CQXA 5HBMA 2A1RA 1VHXA 3SNNA 4FXDA 3GOIA 1QVFM 5BPNA 3L2UA 4QS9A 1NOZA 3CPEA 1NJZA 3NMUA 3OS2A 4FJGA 5J1EA 3AA3A 3OYHA 5EXWA 3CMEN 5GAGP 3RTVA 1RBSA 2BANA 3HTVA 2VQEK 2ZJQL 3FZFA 4FWMA 4CZGA 1VK0A 3QBXA 4H0VB 1QQNA 4KH5A 2IVPA 1G99A 4ELUA 3MX5A 2FBVA 2QWOA 4O5BA 1SL2A 4B1WB 4W5NA 3U3YA 3ULEB 4M41A 4LF5K 3VQQA 3U9DA 2YHYA 1A5XA 4CJTA 3TAQA 1RBTA 3NH0A 3QO9A 5M1QA 3IMXA 3P39A 1A5VA 3HRGA 2ITMA 3WXMB 5AZIB 3JSMA 2A6AA 2P9NA 3NF6A 4JS5A 4CJFA 2HB5A 4C8OA 2Y1JA 3C6UA 2ZQBA 4JV5K 3LP0A 1SKWA 3NAEA 2GX9A 1HQUA 3NBPA 3NDKA 3TTCA 3TAMA 3S3MA 2P5OA 3LP3A 2G8UA 3ENOA 3OYIA 1TGOA 5HRPA 4B3SK 2A41A 4ZTFA 4B1YB 4NXMK 3J7YP 1VSHA 3I0SA 4DTRA 3SUOA 2P9UB 3ASMA 3E1YA 5AQOA 3AA2A 3TAEA 5EVZA 3MAQA 3HVTA 5BR8K 5AR0A 4KBOA 4W5RA 2W40A 4HCCA 2A3ZA 3QNNA 1NK6A 1NJXA 3KK1A 4FLWA 3BZCA 2E20A 4KPYA 2E2NA 4KB0A 4G9ZA 2JGUA 2F8SA 3E9LA 3HPGA 4N41A 4Z94A 2KLAA 1OKJA 2G8VA 3TR8A 4DV6K 4LD0A 3O8MA 3U8XA 3FR0A 2PY5A 4BQLA 4LC9B 3ZT3A 2O8CA 4AF1A 1E4GT 3QICA 4WQ5A 2P9SB 1QHAA 4AHVA 4FVUA 4AM6A 3V9UA 2IVNA 3O3GA 2QA4N 2E6MA 3GBTA 4FWPA 4H0YB 4CEOA 4DU4A 3EL2A 3NF7A 4CVNE 3TANA 3MEEA 1KLNA 1QQCA 4CIEA 4WCEL 2Q31A 3PX4A 4EHUA 5F2RA 3I33A 3DLHA 4CZHA 3AGKA 4DSEA 1XNQK 5JVGL 5C15A 5HL7L 3C6AA 3CFOA 3RMBA 4C23A 3VTIA 2QWLA 3N4QA 3VN5A 1UA1A 2D5RA 2HHTA 4JI7K 4PUOA 3QFUA 4CHYA 4BRNA 1GOAA 2F96A 2OPSA 3W3DA 3RR8A 4C1NK 1VSFA 4FZXC 1N33K 4IOCL 3ZCMA 3QLHA 4GMJB 3J81O 4CFBA 3NE6A 2D0AA 1DT9A 2NZTA 1YUWA 3VESA 4N5SA 1LW0A 2YJEA 3DYAA 5BRDA 2P9LA 3CCEN 4BY9C 2FSNA 2F9WA 4B3TK 3P4IA 5LJWA 1KSPA 4B8CA 4DSKA 1A5WA 2VGNA 4HVJA 4DLEA 5JS2A 4AHTA 1RT4A 3FLCO 5I3UA 1BIZA 5ADXH 1S5JA 1EXQA 1SZ2A 4L8RB 1WAFA 4KHUA 2B4JA 3AVNA 1XNRK 4DWIA 3E9OA 3AO2A 4H0XB 4BRMA 4O4GA 4E3SA 1VRTA 4DSFA 2GV9A 1NMDA 2ASOA 4PHTX 4CHPA 3AARA 4FWSA 3L3UA 4QOZB 1L3TA 3HPHA 3SUPA 1WSIA 3CJ7A 5FDLA 4H5VA 1GLEG 1RTJA 4Y1DA 2HVHA 1Q8IA 1K6YA 3OVNA 5GINA 3DLKA 4YORA 3MCAB 4GKKK 2D4WA 3PIOL 4Z4GA 2O8BB 3A8YA 1W97L 3U3GA 2CGKA 1J54A 1QZ5A 3OA9A 4OGCA 4B9MA 4HCBA 3UKRB 4EP4A 1VSMA 4YY3K 4JI2K 1C0UA 4IG0A 3O4WA 4FJJA 4DTXA 3M5RA 3NVKA 4RW7A 4BR7A 3AVLA 2EWSA 4QCLA 5M1PA 4BREA 3LPTA 1XWLA 3LWLA 4X62K 3O3HA 3R1XA 1C0MA 1DLOA 1IBMK 1Q82O 3SUNA 4CZMA 1HYZA 2IDOA 1BQNA 4OPKA 3RMDA 1EX4A 2Z1GA 1N36K 1GLCG 2WOMA 4QAGA 3EEQA 4CEAA 2D0PA 4NB4A 1WSGA 1KTQA 2Z1JA 3L2WA 1BCMA 1VQ6N 4CZIA 5KQ8A 1K73O 2NRZA 3D2FA 4B9UA 4IO9L 1TK8A 1IH7A 2GBZA 2GTDA 3NF9A 1G15A 1OVQA 4BE0A 4GKJK 3EKSA 1EWRA 1ZBSA 4CIFA 2V7ZA 2CGJA 3F9KA 3QERA 4CJVA 4WQ4C 1JLGA 3OYFA 4BGAA 2D0CA 4JI0K 3KD1E 3VEOA 1VQKN 3HM9A 3VEVA 2JWLA 1GLLO 4JLHA 1GLDG 3MEDA 4NCGA 1KAXA 4GVEA 3K0SA 4YFUA 4JKDA 1JJ2M 4FJ9A 1B92A 2E2QA 4F9OA 4DB3A 3M3ZA 4YOWA 1OH6A 1HPZA 1X9WA 1DGKN 4H5RA 3CM6A 3A5OC 4GNIA 1T3VA 4DQQA 4FVMA 4JHDA 4WFBL 1EETA 3VQAA 3OBWA 4ELTA 1KFSA 5AQJA 5LMUK 2NRHA 1BO5O 4LFAK 4DR4K 1YHQN 3RRGA 3VMFB 3WT0A 4CZEA 4E7KA 3AA5X 5JICA 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4BC5A 2P51A 1L5UA 1HMVA 1DTQA 2PBDA 4DS5A 4JYAK 3H3OB 4R5PA 4CBUA 3EE9A 1YT3A 4YDUA 2W6KA 2J4RA 4O8KA 4FJNA 3AO3A 2YCHA 4B1UB 3ATVA 4E1MA 1IBKK 1LCUA 3KLIA 4K0KK 4DS4A 4X64K 2HBJA 1KAZA 3H1VX 2NRRA 3THXB 5AQZA 3PY8A 3QEPA 1T7PA 3DLBA 4CBXA 4Z4HA 4DV5K 2HHSA 1C0FA 3M8PA 1BUPA 1N32K 4OKEA 4CJPA 3WXKA 3O3FA 3S3OA 3IAYA 3AAQA 4FLZA 3SAFA 3OYMA 1JL1A 1VQLN 3FZLA 4ZHRA 3SBTA 4B3RK 3HXMA 2P9IA 4AILC 4RW6A 3S41A 4BRDA 3VQ9A 4H5NA 3JAMO 4FJIA 1QVGM 4DV1K 5KPTA 3KWIA 1KQSM 4H0OA 1NGDA 1ZYQA 4V19S 2LSNA 4EIAA 4E19A 3KK2A 4DU3A 2O8DA 3IFRA 3VEXA 3NGIA 1IKXA 5JVHL 1Z6RA 3PSIA 5AJ3K 1UAXA 1YJ9N 1X9MA 2I7PA 1S72N 2E88A 3R6MA 4CF1A 4BWJA 4I2PA 3VQ6A 3KZBA 2HVIA 4Q0BA 4JKEA 4JKFA 3EZ5A 3SZ2A 3QINA 5AQHA 3H46O 1ATNA 5LJVA 4EZ6A 3AA4A 4PKHA 3MX2A 4JI6K 2FSJA 2KTQA 4FWNA 2ASMA 4JI8K 5GAHP 1P90A 1NJWA 3VQBA 3AY9A 4A5AA 2D0BA 4DFKA 1U2VA 4BG8A 2A1SA 3M6GA 3MK6A 4CF9A 5GAEP 3CCSN 4PY5A 1VQ7N 4FJ8A 3OJUA 3AVIA 1XC3A 3RWUA 1VSEA 3SAHA 3HK2A 4DLGA 1U45A 1S1VA 1RDUA 2NUBA 3OYNA 3T3FA 3SQ1A 2QXLA 1TUYA 1KFDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A57 A;  4KH6 A;  4KH4 A;  4A59 A;  3AGR A;  4JEP A;  4A5A A;  4A5B A;  4KH5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BEX A;  5AQM A;  4C8L A;  1XMO K;  4IXC A;  3DM2 A;  1GLB G;  3FFI A;  3E66 A;  1O13 A;  3CIP A;  4CGH A;  2BTF A;  4OLB A;  2Q1N A;  1OH8 A;  2CH5 A;  3SI6 A;  5I42 A;  1BOT O;  4DR5 K;  3FE1 A;  4DV2 K;  4BRC A;  5M1F A;  4E1J A;  3EZW A;  3WEE A;  1U49 A;  4F2S A;  2KFN A;  2ASP A;  2DTU A;  4C8N A;  1SL1 A;  1YTU A;  4KKO A;  3SUQ A;  4GW6 A;  4FO0 A;  1QTM A;  4CF2 A;  1X3M A;  4NYF A;  4CJU A;  3C7N B;  4H03 B;  3V1R A;  1XQS C;  3R8E A;  4HUE A;  1HKG A;  3AVM A;  4H4M A;  2WTU A;  1R59 O;  3CC2 N;  3OTO K;  5E26 A;  3ITH A;  2O8E A;  4NO7 A;  3CMA N;  4M63 C;  5AQU A;  3O6W A;  3ZT1 A;  3QEI A;  1SUQ A;  4M42 A;  4PL8 A;  1NU0 A;  3FFK B;  4DTJ A;  3VER A;  3OYA A;  4LF7 K;  1RTD A;  5M1K A;  2IVO A;  4CEC A;  1VQN N;  2CH6 A;  1X9S A;  3OYK A;  2G8F A;  3D7E O;  5TKW A;  3ENB A;  3VEW A;  4CF8 A;  3CCR N;  3KKR A;  3LAN A;  2YKN A;  2HMP A;  2PFU A;  3OYJ A;  1MU2 A;  4DV7 K;  3BY5 A;  2PAV A;  2RPI A;  3SJH A;  4OX9 K;  3NCI A;  4M45 A;  3T69 A;  2P5G A;  2QWR A;  4CD3 A;  3THY B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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