4KH4A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and amppnp
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
total genus 184
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh4A02
4A5AA 4KH4A 4A57A 4KH6A 3AGRA 4A59A 4A5BA 4JEPA 4KH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XRIA 1OH5A 1EWRA 1SL2A 1T8EA 4B9QA 3H1QA 3Q7BA 2GWJA 4BWMA 4CCHA 3SPYA 3U9ZA 3RMAA 5ADXA 4B9MA 2WTUA 2IVOA 5M1PA 1BIZA 2VGMA 4M7YA 3VGMA 4F8RA 4YHHK 4GV3A 5M1FA 4AHTA 3MN7A 3EKSA 4CGFA 2E8AA 3VA0A 2HBMA 4KHWA 2ZGZA 2UXCK 4E7LA 1Q86O 3LM2A 4CK2A 2ZQBA 3HSCA 1IBKK 3CQXA 4CF2A 4B3TK 2E1ZA 2E2QA 3AO5A 3CFOA 4DSJA 3DRPA 1Q18A 4CK3A 2F8TA 3OBWA 4DUYK 4FSVA 4E7IA 1YIJN 3LZJA 1ILYA 4HHTA 2NRWA 4BRGA 4FLYA 4DUZK 4HWIA 3VESA 1WSFA 1C1BA 5GINA 3QETA 5IT9O 1NK6A 3WNFA 1GLAG 4FLUA 3T1YK 1A5XA 2KTQA 5BRHA 1HPMA 2IVNA 2OPRA 3O8MA 2EWSA 4YOUA 1S6PA 3ZCMA 1IH7A 1LOTB 4CGDA 4H5VA 3OS0A 4RW4A 2QWOA 3CJ1A 4MO5A 4MLEA 1VSFA 3RR7A 2DFFA 3SMSA 5BR9A 3TR8A 2QK9A 2UXDK 4KI6A 4H5NA 5AQZA 4ISFA 5AQNA 1NOYA 2IAJA 4LSLA 1NK5A 3CPEA 3MXMA 1QHTA 2FSKA 3K5MA 1BUPA 4BR9A 1Q81O 3SQ4A 1XI1A 1G15A 3MN6A 1GLLO 1VRTA 3G25A 3O3FA 4DG1A 3OJUA 1RT7A 2XHBA 2PBDA 4FJKA 1Z6RA 2P5OA 3RRHA 2RHKA 4CZHA 1HMVA 3NF8A 4DR3K 3DXMB 4PKHA 3G0ZA 1BQMA 2YNHA 1NK7A 3TARA 4BR4A 3LALA 4AHSA 5FPEA 3VN5A 2D0CA 4FWMA 3DLEA 1QZ5A 2P9KB 4ELTA 3AV9A 5C0YA 4IFYA 3UIQA 3M6GA 4CJ4A 3D2EA 3QEXA 4LFBK 2P9SB 4QS9A 3KK3A 1EKEA 3HRGA 4W5OA 1U04A 5CZ2A 4LF6K 4CJTA 2HNYA 5CE3A 4K42A 3VQ9A 4BVOA 2CH5A 4KTWA 4FLWA 2OYQA 5AQIA 4NYNA 2CH6A 3OYGA 3DLHA 5FPDA 3AA5X 2A1SA 3DXMA 4I7FA 3ID8A 5AZJB 4L3QA 5BRDA 1VQ7N 2A42A 3L4IA 1KLMA 2VG6A 1Y64A 3CMEN 3WEEB 1ZXOA 3CCEN 4OPJA 3CM5A 3CJCA 3SV3A 2P9SA 2QXFA 4JRQA 5FPNA 5BPLA 2G8UA 4BE2A 3HOSA 3TSPA 3G71N 4DF8A 1DT9A 4CK1A 4CEDA 1TL3A 3ITHA 4BDZA 4GKJK 2O8CA 3QB0A 2D5RA 4JK7A 2Q97A 4RWTA 3TWHA 4FM2A 3HT3A 5KQDA 4BRDA 3SUPA 1TKDA 4MDAA 4K0KK 1XMOK 1ZBHA 1SZ2A 2VGNA 1V4SA 4FWKA 1NGFA 4CHPA 2UUBK 2HHTA 1KAYA 4E1NA 3SJJA 3PX4A 4XEIA 2GWKA 2FLOA 4XH1A 4DSLA 5E26A 4B1YB 2QW9A 1RT4A 4F2RA 4KHNA 4O4GA 2HVIA 2P9IA 1NU0A 1VSKA 5EVZA 1Z05A 3F9MA 4FW1A 5I3UA 4CIGA 4AM7A 1YT3A 4CF1A 1JLGA 4YNQA 4DTRA 3ULEA 3ENHA 1HQUA 4CJ5A 2NNWA 4J2AA 5JLHA 2A1RA 2D0PA 4HTUA 4JKBA 2JLEA 4BQZA 5FRNA 4FJIA 3O80A 3H1VX 4DTMA 4ILJA 3LZIA 3THYB 1LCUA 1RNHA 4OGCA 4BRAA 3FE1A 4Z94A 1M1KO 2E2NA 3AVAA 4V19S 1RBVA 4F9OA 1BL3A 5J2MA 3HM9A 3ZSOA 3ULEB 3SAGA 5GAHP 1KVBA 1BCOA 2JGUA 3DMJA 1TAUA 5EU7A 2ZGYA 5EY4A 4DTXA 5AQSA 5F1XA 4CZGA 4MLHA 4G9ZA 4OKJA 4MFBA 1HJRA 2ASMA 3L3UA 5EXWA 4LFCK 3I0SA 3A5LC 3OBYA 5AQXA 4M3YA 3C7NB 4NLCA 1H1VA 1HLUA 4LF5K 1T6CA 4QCLA 5TKYA 3CXCM 1O13A 4JK9A 4CJWA 3B8AX 2ASPA 4ZTFA 3ENOA 4FK2A 4KTZA 3S9HA 1S1WA 5C15A 4H0XB 3J80O 1NK0A 1RDWX 3PIOL 3SUQA 1K9MO 4JD2A 1IKXA 3P31A 2HBJA 4O8KA 4Z4IA 3OHRA 4DMNA 3J7AP 4WQ5C 3THWA 2ZE2A 3C7NA 2O4GA 3CHWA 5AQKA 4JKFA 3R1XA 4B9NA 2OPQA 4DWIA 1P90A 1NGHA 2QWMA 1BQNA 4BE0A 1TUUA 1YTUA 4CBUA 4JI8K 2LSNA 5AQWA 3VQAA 5CZ1A 2O8BB 4DV7K 1Z26A 3C94A 2WFBA 4B3RK 3CD6N 2GV9A 1NGEA 5DK5A 3VQDA 1VQNN 5SZTA 1CXUA 4BC2A 4DU4A 1JCFA 4DTSA 3P39A 1YXQA 1DTQA 3MN9A 3THWB 3O5BA 4PUOA 1DTTA 1BISA 3O4WA 1KXPA 2QWPA 3FFIA 4BROA 2NLXA 5GIPA 3BEXA 4RW7A 3HBTA 4NO7A 3DXKA 3O3HA 3ID6A 3KK2A 1RBTA 1TKTA 1BIUA 4H5WA 4LH5A 3TTDA 1IBLK 4CZEA 4E1MA 3VEWA 4DQRA 1OKJA 4CEBA 2BUPA 4NB4A 5KPTA 3WUHA 3TAEA 4CHQA 4JYAK 4CZIA 1EETA 3ZT0A 3T1HK 2FC0A 4DHYA 3JAMO 1LW0A 4FYDA 4U67L 3A2FA 5ELZA 3O6WA 4MDBA 3E9OA 1FW6A 1ZC6A 4NYFA 2HHXA 4JI1K 1O1WA 3DXKB 1JXBA 2A5XA 3VQ8A 1BA1A 3IKMA 3VF2A 4DQ8A 1D4XA 2F9TA 3PO4A 4A5AA 4BRFA 4CFAA 3ZETB 4B1ZA 1ZYQA 1BU6O 3AVFA 1YI2N 2YI1A 3RTVA 3UB5A 3M5RA 3DM2A 1RDBA 4UQGA 2O8FA 3M1FA 3CFPA 1HKCA 3SUOA 3QIPA 2P9KA 2NZTA 2A3ZA 1BA0A 5AQOA 4I6MB 4YOXA 5JVGL 3H45C 1VQ6N 1VQ4N 1VHXA 5HRPA 4JS4A 5KRSA 4OKKA 4FM1A 4GW6A 1ATSA 3TTFA 2D0OA 1T44A 4DTPA 4WFNL 2F8SA 3N4QA 3AO4A 3ZETA 3L2WA 4HUGA 2BGGA 4YY3K 3KVGA 3H3OB 1JLEA 3AARA 5BN9A 1CZBA 4UY8O 2W41A 3CCVN 1GLJO 5JLFA 2P9UB 4PWDA 4KH4A 3DLGA 3B6OA 3FFKB 2HBLA 3O1BA 2Q31A 1KFSA 4CJRA 4N76A 1IV0A 4JKCA 4OKEA 3HK2A 3QBWA 4WF9L 2QWRA 2Q2RA 4KB1A 2O8CB 1KAZA 3QIOA 3G10A 1TKXA 3MXIA 1LWEA 1NJWA 4O5FA 3LWMA 3AVHA 4JHDB 1ATNA 1S9EA 2A6AA 5JVHL 3V9ZA 3KKSA 3DAWA 3IRXA 1J5OA 2RKIA 3QESA 3O9RA 4KO0A 4DLGA 1L3SA 2A41A 3VQQA 4J2EA 4JEPA 1IBMK 5LJWA 1MDUB 1ASVA 3PO5A 3HPGA 5LMNK 1RILA 3TSUA 3JSMA 3DOLA 4M41A 3A5NC 3DJCA 4CEAA 3T3FA 3OVNA 3LPUA 4EP5A 2F9WA 1VRUA 1RT3A 2FF6A 3S41A 2HMIA 4GVMA 2HHHK 2RE2A 4FPAA 3C6HA 2P9IB 1XMQK 4WCEL 2IIRA 3SAFA 3VEOA 3E9LA 3SCXA 4PKGA 4BWJA 2YX6A 5AZJA 4LC9B 3AGRA 5T7BA 3SUNA 3AVIA 1XNRK 1FXXA 5JS1A 3R9PA 4OGEA 1L3VA 2ZM6K 4ILHA 2NUBA 1NMNA 3CJ7A 3E66A 2P9LB 2OPSA 1TL1A 1WSJA 4IOAL 1J53A 4A57A 1HNIA 3CQYA 1VQKN 4M3XA 1U4BA 4FWRA 2G8FA 2IGIA 1L3TA 3K59A 1C0MA 4HCBA 1RDCA 4CJEA 4H03B 2YHXA 1RDDA 5BRFA 1YHQN 5C12A 4XH4A 4B9VA 4B1UB 2KHOA 2WONA 4DTOA 2CGKA 2X6SA 1S3XA 5HBMA 5CYQA 1IKYA 2IDOA 3UKRA 1HR0K 3CG7A 2OPPA 3LANA 3V9UA 1I94K 2HHVA 4JK8A 4JN4A 1WBBA 1CLQA 3SK3A 3E01A 4B1VA 3CCMN 4DSIA 2RPIA 2XY7A 5I42A 3NDKA 5BREA 4Y0WA 4CHNA 3VENA 4RW9A 5FLXO 4EAHD 3C65A 1X9WA 5FDLA 1GOCA 3GL1A 1OH7A 1RBSA 3OYKA 1QZ6A 1I39A 3V81A 1QSLA 3AVJA 3THXB 3EKUA 2CGLA 3J81O 1C1AA 3NF9A 1IG8A 5KGXA 4X62K 3NGYA 4C1NI 3CQ8A 1OVYA 2QA4N 1JCGA 3NAEA 5JS2A 4CFDA 4KB0A 4Z4CA 1T03A 1F21A 1TGOA 4FXDA 4DV3K 2GELA 4CBWA 3ATVA 4JI4K 3K5LA 4CESA 4WQ4A 3MEGA 4O0JA 5EOYA 4OX9K 4M3RA 4B3OA 1Q9YA 4Z4FA 2PZSA 2GUIA 2IOCA 3KK7A 3T1AA 2PFUA 1I3AA 3VEXA 4DU3A 1KQSM 3LL3A 3CC2N 4CZMA 1EO1A 3QLHA 3LDOA 1VAZA 2I5JA 3RMBA 4IZ9A 2CGJA 1WBDA 1WSGA 4XH5A 1BG3A 5AQJA 3WXKA 1E3MA 2Z1HA 1HPZA 3C6UA 1NJZA 3ZSXA 4PHTX 3EZ5A 4KRFA 3MX5A 1VQMN 4CGIA 4U7BA 3SJHA 3V1OA 2GTDA 3GOIA 3KWIA 4MQ3A 3J7ZO 3EY1A 3ZSZA 3OYAA 1YVUA 4C8LA 3DLRA 1WOQA 3U3YA 1WSEA 4CI6A 3I33A 2QWQA 1S72N 3LP0A 4GV6A 4NXNK 2HMPA 4CERA 3AA3A 3A0IX 2G8KA 1T7PA 5BPNA 4B1WB 2KZMA 2P9PA 4X66K 3QINA 3BDPA 3ALYA 4IJAA 3VQBA 2JWLA 4DQPA 1TVRA 4AHCA 2OZMA 4LF9K 4BDYA 1J6ZA 1MWKA 3DI6A 2V52B 4BGAA 3VQ6A 4AM6A 1C1CA 2KW4A 3LP3A 4GVEA 4J8FA 3GE1A 5KI6A 4A2AA 5CR4A 4OPHA 4PA1A 4FLTA 2NRZA 1HKGA 4DQSA 3DLKA 3JXUA 2QEXN 1CZAN 3RWUA 3L4QA 3K0SA 3M8QA 2P9PB 3TAQA 1BO5O 2FXUA 3VTIA 4DTNA 2HHQA 3PSFA 3ZT2A 1JJ2M 3OYLA 2O8EA 2V7YA 3HI0A 4YDUC 2YJEA 2WUSA 4R79A 4B9SA 3MXJA 3AO2A 4N41A 2E2OA 3O9SA 4E3SA 4PY5A 1SKWA 3I8BA 2UUCK 1GLCG 4Z0UA 5C25A 2P9UA 4F3OA 3OYJA 1UOCA 4LD0A 3WQTA 5MLCQ 2KQ2A 5AQHA 3WXMB 5KPRA 3I55N 2UYTA 4EHUA 2ZWHA 1OH6A 1B9DA 1ZBFA 2P9NB 1SL0A 4CGHA 3R3LA 3SAHA 4DTUA 1RTHA 4BACA 1S1XA 4KTQA 4JHDA 2E6MA 1V4TA 4IXCA 4B9UA 4G1QA 3OYDA 3MWPA 3TAFA 3PX6A 3CC4N 2XY6A 4FCYA 2QWNA 2E20A 4BVPA 4CJFA 3DRRA 3NMUA 2OANA 1SS6A 3KLHA 4CJQA 2E88A 4KH6A 3CPWM 1JLBA 1T05A 4C8NA 3PIPL 2OZSA 4IDHA 1CZ9A 4LSNA 4A2BA 2FSJA 4IOXA 3EEQA 2NRRA 1IJJA 2IS3A 3VMFB 3OYHA 4Q0BA 3D45A 2I7NA 2NRHA 4FJGA 1K73O 3H08A 3ZSVA 3HPOA 3U6FA 2P9LA 1YITN 1NGGA 2GX9A 2HNDA 3UE5A 4YOYA 1BCMA 3M8PA 3AY9A 4E19A 3KLEA 4CEOA 3FR0A 3Q7CA 4CE9A 3RSEA 5J2PA 2UXBK 1GOBA 3OY9A 4IJNA 3VEYA 1SAZA 4IDKA 4CBXA 5LJVA 4FM0A 3EE9A 4FLZA 3V9WA 3KTQA 1S1UA 4JI3K 5TKWA 5BPMA 2YHYA 1NGAA 1XWLA 3TAPA 1U49A 3B6PA 3N4PA 3QO9A 4BC3A 4BDPA 2E4LA 3AVBA 3L2RA 1KVAA 5SWMA 2XY5A 1NG9A 4JKGB 3SV4A 1HX1A 4M3TA 2W42A 3LDSA 2ZD1A 3WT0A 4BRIA 1LWFA 3OYMA 4HUEA 5AJ3K 3OJSA 3CCUN 4Z4HA 2ATQA 3J7YP 5M1KA 5E41A 2A40A 3SBGA 1EQYA 4AILC 5M1NA 1M90O 3ZT4A 3K58A 3H3NO 1TK0A 4KHPK 2VWKA 2VG7A 5GAEP 1NGJA 3P1GA 1NM1A 4CJUA 3A8YA 1X9SA 1NK8A 3HYFA 3MX2A 3O3GA 4DFMA 2DY4A 3K57A 4IEEA 4DR2K 3MN5A 2DPNA 2VQEK 4CEZA 5AQQA 3SQ2A 1YTAA 5E84A 4BQLA 3QNNA 3PSIA 3T19A 1SQKA 3KWGA 3CCQN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A5A A;  4KH4 A;  4A57 A;  4KH6 A;  3AGR A;  4A59 A;  4A5B A;  4JEP A;  4KH5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XRI A;  1OH5 A;  1EWR A;  1SL2 A;  1T8E A;  4B9Q A;  3H1Q A;  3Q7B A;  2GWJ A;  4BWM A;  4CCH A;  3SPY A;  3U9Z A;  3RMA A;  5ADX A;  4B9M A;  2WTU A;  2IVO A;  5M1P A;  1BIZ A;  2VGM A;  4M7Y A;  3VGM A;  4F8R A;  4YHH K;  4GV3 A;  5M1F A;  4AHT A;  3MN7 A;  3EKS A;  4CGF A;  2E8A A;  3VA0 A;  2HBM A;  4KHW A;  2ZGZ A;  2UXC K;  4E7L A;  1Q86 O;  3LM2 A;  4CK2 A;  2ZQB A;  3HSC A;  1IBK K;  3CQX A;  4CF2 A;  4B3T K;  2E1Z A;  2E2Q A;  3AO5 A;  3CFO A;  4DSJ A;  3DRP A;  1Q18 A;  4CK3 A;  2F8T A;  3OBW A;  4DUY K;  4FSV A;  4E7I A;  1YIJ N;  3LZJ A;  1ILY A;  4HHT A;  2NRW A;  4BRG A;  4FLY A;  4DUZ K;  4HWI A;  3VES A;  1WSF A;  1C1B A;  5GIN A;  3QET A;  5IT9 O;  1NK6 A;  3WNF A;  1GLA G;  4FLU A;  3T1Y K;  1A5X A;  2KTQ A;  5BRH A;  1HPM A;  2IVN A;  2OPR A;  3O8M A;  2EWS A;  4YOU A;  1S6P A;  3ZCM A;  1IH7 A;  1LOT B;  4CGD A;  4H5V A;  3OS0 A;  4RW4 A;  2QWO A;  3CJ1 A;  4MO5 A;  4MLE A;  1VSF A;  3RR7 A;  2DFF A;  3SMS A;  5BR9 A;  3TR8 A;  2QK9 A;  2UXD K;  4KI6 A;  4H5N A;  5AQZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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