4I6MA

Structure of arp7-arp9-snf2(hsa)-rtt102 subcomplex of swi/snf chromatin remodeler.
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
465
structure length
399
Chain Sequence
TLNRKCVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQCIIPSSYIKRTEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEEQKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQENNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKECYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASISPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of an actin-related subcomplex of the SWI/SNF chromatin remodeler.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transcription/hydrolase
molecule keywords Actin-related protein 7
total genus 107
structure length 399
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4i6mA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4i6mA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4i6mA03
2A40A 4H0YB 2ITMA 2HMPA 4FPBA 1HKBA 2A5XA 5EX5A 5AFUA 2Q36A 3A5NC 1HKCA 3AY9A 2Q0RA 4Z94A 3A0IX 5AQFA 2F9TA 4BRAA 4BRPA 1E4FT 1X3NA 4BG8A 5AFUH 1ZC6A 3MN6A 4FWOA 2BUPA 2PBDA 4BVPA 1YXQA 5E26A 2QWLA 5F2RA 5ADXA 3ZX2A 4JHDB 2QWRA 1IG8A 4RTFD 4BQZA 1WOQA 3CI5A 5EOYA 3VENA 1HJOA 1K8KA 3VEWA 3FR0A 5AQMA 2D4WA 1NGDA 2I7PA 4B1ZA 1NGHA 4PL7A 1YAGA 3ZETA 4BR2A 3JS6A 4BRHA 4IZ9A 1BWFO 4FL9A 1RFQA 3U4LA 4DQ8A 3W3DA 3JXUA 3O1BA 3FFKB 1SZ2A 5FPNA 4BR0A 5BREA 2ZWHA 4DCHA 1MWKA 2FF3B 3IDHA 3WEEA 4DHYA 2VCPA 3O6WA 3HSCA 3UKUB 5AQQA 3EO3A 2D0PA 2P9IB 3CJCA 4BG9A 1J6ZA 3H45C 4M7XA 3C7NA 4B1WB 1P8ZA 5ELZA 3W0LA 3BF1A 3LDPA 3R9PA 4B1VA 2ZF5O 2A6AA 2Q97A 3M6GA 2P9SA 4H0TB 4BRNA 5E84A 1Y64A 3VF2A 4BR4A 1SAZA 2E2NA 3EKUA 2P9LB 1EQYA 2V7ZA 4BC4A 1ATNA 3VEOA 3UKUA 3O4WA 3AAPA 4A2AA 4JHDA 3GBTA 2ASOA 3D2EB 4GY2B 2GWKA 3H3OB 2IVPA 5TKYA 4B1UB 2E20A 3HZ6A 4JN4A 3UB5A 1KXPA 3BP8A 5BN9A 5LJVA 3CQYA 3BF3A 1T6CA 4H5RA 3GL1A 3SMSA 3O8MA 4C23A 4BRIA 1DGKN 2YHWA 5AR0A 4IO8A 2GELA 4MO4A 4LC9B 4CZGA 2QWQA 1RDWX 2H3GX 3KVGA 3GDQA 4FWKA 4BRFA 3MMVA 4FWLA 2FSNA 3G25A 2NRHA 3SK3A 3LDOA 1QHAA 4NO7A 4CBWA 3AAQA 1G99A 4YDUC 5FPDA 3ATUA 3ID8A 4MLEA 4CZIA 1NBWA 3TPQA 5AQJA 5BRFA 1KAZA 1QQMA 4BRLA 4BRCA 1DKGD 4CBXA 5BPMA 4CBUA 3C7NB 5BPLA 5KPTA 2BTFA 1CZAN 3WT0A 3M3ZA 5AQVA 4I6MB 4CD1A 3WXIA 1IJJA 2P9LA 2FLOA 2IVNA 1GLFO 2HF3A 1NWKA 4WYBA 3FZFA 1XUPO 1MA9B 1LCUA 3CIPA 2FSKA 4JD2A 2AP1A 3DWLA 3EL2A 2W41A 4WQ5C 4FSVA 2QWOA 3A5LC 4EFHA 3LM9A 5AQZA 3D7EO 4JNEA 4IJAA 1HLUA 1YUWA 1GLJO 4XH5A 5JMVA 1HUXA 1BDGA 4AM7A 3KHYA 3C0BA 3ENHA 4FOIA 1S3XA 2ZGYA 2P9KB 3H6EA 3B8AX 4A2BA 3D2FB 3MK6A 3OHRA 3A8YA 2YJFA 3DXMA 1QZ5A 1XQSC 3O1WA 3FGUA 3WQTA 2CGLA 2CGJA 2GUPA 2P9PB 3UKRA 3VEYA 5LJWA 3L4IA 4CI6A 3FE1A 4BVOA 1GLEG 3VPZA 2YJEA 3BUZB 3H46O 5JLFA 3LM2A 4FWQA 4QS8A 5AZJB 3VEZA 4I6MA 2P9UB 1NGAA 4BRMA 5BPNA 2A3ZA 3I33A 5FPEA 3IFRA 4H0OA 1NMDA 2DPNA 3EZWA 4NB4A 5AQKA 3R6MA 1T44A 1NLVA 1ESVA 3QFPA 4A61A 4B9QA 2E2QA 3ENOA 4JAXA 5JLHA 2ASMA 2D1KA 2P9SB 1E4GT 3QBWA 4BROA 4CZFA 5CE3A 4FO0A 3O80A 1Z05A 1TUUA 3WUHA 5F0XA 4H0XB 4H0VB 4B1XB 3CJ9A 3ZX0A 3CJBA 2UYTA 4FOEA 1KAXA 4BREA 3H1VX 1V4TA 4YDUA 5I9EB 3BEXA 2D0OA 4M63C 2CH6A 3VOVA 2IIRA 2P9NA 1R59O 3QDKA 3CQXA 3CJAA 2P9PA 3SJHA 2A41A 3S41A 4BR5A 3I8BA 4BC5A 1JCEA 5AQUA 4CZHA 2GTDA 1HPMA 3J8AA 3MN7A 4H0PA 3VGLA 3CERA 2E8AA 4MO5A 3HTVA 5AZJA 1BG3A 4HWIA 4ISGA 3MN9A 5KPRA 3VEXA 2QWMA 3LDNA 4FWPA 1BUPA 5JICA 2F9WA 1U6ZA 3M1FA 3VGKA 4B1YB 2HF4A 1WUAA 5AZIB 3IUCA 4K41A 3KZBA 3DXKB 4CZKA 4Y0WA 2QWNA 4IXCA 1ATRA 1RGIA 4IWVA 4H03B 2P9NB 1ZXOA 4EHUA 1GLLO 3ZEUA 1NGGA 1MWMA 3ATVA 4CJ7A 4BR7A 3VGMA 3QICA 1SQKA 3FZHA 3A5MC 2AA4A 1V4SA 3VF6A 2KHOA 3GE1A 4K42A 3MCPA 5AZIA 1QQOA 4WQ4A 4A62A 2VYPA 4BGBA 4BRQA 2VWBA 1GLBG 3FZKA 4EIAA 1YVNA 4M7YA 3U9DA 3GOIA 4L3QA 3F9MA 2QW9A 4WQ5A 2I7NA 3WQUA 1TYQA 3CETA 2V7YA 4O8KA 4FWRA 2Q0UA 2GWJA 5AQXA 3DJCA 1C0GA 4IJNA 3VETA 3ZETB 5AQLA 2CH5A 2NZTA 3O08A 5BRDA 2QWPA 4QS7A 3ZX3A 2E1ZA 1K8KB 1D4XA 4FWMA 2E2PA 3VERA 3DXKA 1NM1A 1XC3A 4PL8A 2Q31A 3EN9A 4WQ4C 1Z6RA 3DXMB 3MDQA 1U2VA 1TYQB 2E88A 3CJ1A 1T6DA 3FLCO 3LDLA 4DB3A 5KQ8A 2J4RA 2P9KA 2IVOA 2FXUA 3ZEUB 1MDUB 1NGCA 1BU6O 1NGIA 4CZEA 4F9OA 2E2OA 4H5TA 5KQDA 3AARA 5BRHA 1X9JA 2V52B 3D2EA 4PKGA 4BR9A 4KBOA 2ZGZA 4K43A 3VEVA 3A5OC 2GEMA 1LOTB 4GNIA 4H5NA 4ISEA 3EKSA 4BQLA 4CD3A 2YCHA 2PAVA 2QXLA 3U9ZA 2WUSA 2P9IA 3RSEB 3WXKA 4BRKA 5BR9A 3MN5A 4FPAA 4H5WA 2Q1NA 4RWTA 1KAYA 1NGBA 3CJ7A 3HI0A 2W40A 3WXLA 3QFUA 4PKHA 3IMXA 2P9UA 5F1XA 1BA1A 3SLCA 4FWNA 2FF6A 3P4IA 1NGFA 3O5BA 5AQPA 1GLAG 1NGEA 1X3MA 1S22A 3LL3A 3R8EA 1BO5O 2ASPA 2EWSA 3CHWA 4XEIA 3UKRB 3ULEA 5ADXH 4PKIA 1JCGA 1U2VB 4XH4A 2YHXA 4AM6A 3FZLA 3VESA 2NLXA 4CZJA 1H1VA 1HKGA 5B8HA 4RCHA 2OANA 4MLHA 3VF4A 5BN8A 1GLDG 2A42A 5AQTA 3QB0A 1TUYA 1GLCG 5AQOA 2E1YA 3U8XA 5LY3A 3LDQA 3H3NO 3UE5A 2QM1A 5AQNA 4H5VA 5EXWA 1JCFA 4BRGA 3HM8A 4FWSA 4BGAA 2V51B 1Q18A 3FZMA 4JD2B 2YI1A 5EVZA 1QQNA 4XH1A 3SMPA 2CGKA 4EAHD 4CZLA 4ISFA 4O5FA 1QZ6A 3GG4A 3QBXA 5AQGA 2YHYA 3RSEA 5AQIA 3QMLA 4BRDA 4HTLA 3L0QA 4BC3A 5AQYA 4EHTA 2FSJA 4K25A 1OKJA 2HOEA 3D2FA 5FPMA 2Q2RA 1BOTO 4QS9A 1ZBSA 3DAWA 5AQHA 4BC2A 5AQWA 5AQRA 1DEJA 4CZMA 1BA0A 3WXJA 3ULEB 1C0FA 4E1JA 3L6QA 4J8FA 5AQSA 3TU5A 1HX1A 3WEEB 3HBTA 3H1QA 1NGJA 5EY4A 1ATSA 5KPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RILA 2P51A 2ITMA 1KD1O 4KI4A 3TSUA 5BR8K 5AFUA 3KD1E 4W5QA 1RBTA 2Q36A 2HW3A 4BRPA 3N4QA 4BG8A 4C8KA 1Q81O 1KVAA 1IKYA 4FWOA 1Z26A 1KQSM 2PBDA 2G8VA 4LF6K 3U3YA 5ADXA 5F2RA 1K73O 3NHGA 3MXJA 3T69A 3PLAA 1BIUA 3LAMA 3QO9A 3VENA 1HJOA 4FJJA 3ZSVA 1NOYA 3AGKA 3VQ8A 1NGHA 3ZETA 3JS6A 4BRHA 4JS5A 2YNFA 3RRHA 4FLTA 1L3SA 1RFQA 2O8BA 4C8MA 4JKGA 3RMDA 4FJIA 3O1BA 4BR0A 2FBVA 2ZWHA 4DCHA 1HNZK 3ALYA 2PYLA 2VWJA 3QEIA 1NK9A 4A5BA 3ZSQA 5AQQA 3EO3A 1J6ZA 4B9NA 3DLGA 4M3WA 2ZD1A 1LW0A 4K8ZA 4B1WB 1P8ZA 3W0LA 3SUNA 3BDPA 1VSKA 1QQCA 3SI6A 1BISA 2Q97A 3M6GA 3HVRA 4H0TB 1KSPA 5E84A 4BR4A 4C8NA 3G10A 1SAZA 4DQRA 2I5JA 4E7IA 2E2NA 1FJGK 3VEOA 4Q0BA 3UKUA 4A2AA 1SL1A 4JHDA 1WLJA 2KQ2A 2ASOA 3OYCA 4PY5A 1ITGA 2IVPA 4KHYA 1VQKN 3NH2A 1VQ4N 4OKJA 1DTTA 3KK1A 4MFBA 3SMSA 2G8WA 1NNEA 4BRIA 3SNNA 4LC9B 5C0YA 4CZGA 3QESA 3KVGA 5KRTA 1GOAA 3CCSN 3AVGA 1JKHA 4CIGA 1VQ9N 2FSNA 4JLHA 3OYGA 4J2EA 4NO7A 4OGEA 2IGIA 4FM0A 5FPDA 1RDBA 4LFAK 3KLEA 3TPQA 5AQJA 5CZ1A 4M3XA 4IOAL 4CBUA 4CF9A 5BPLA 1TAUA 4YY3K 3WT0A 3IG1A 3AVLA 3DLEA 4CD1A 3B6OA 4GVEA 2IAJA 3WXIA 4DG1A 1S6PA 3HO1A 2VG6A 2NNWA 3VQ5A 1LCUA 3AA4A 4JD2A 2AP1A 2ZJPL 3CM6A 4IFVA 4WQ5C 4DSIA 5SWMA 5DMRA 4DSKA 1HLUA 4N5SA 4YOUA 4IOXA 5LMUK 3KWIA 4DKWA 3NGZA 4DV7K 4FOIA 4O44A 4G9ZA 3H6EA 2YNIA 4A2BA 4GV9A 3MK6A 4FJKA 4E3SA 3I0SA 5JENA 1UA0A 4RW8A 2KFNA 3IKMA 1VQ7N 2CGLA 1NJIO 5C25A 2CGJA 4BEBA 1WBBA 3UKRA 3L4IA 4BWMA 3P39A 2KTQA 3LM2A 1L5UA 1KC8O 4BRMA 5BPNA 3OA9A 2C1GA 3K5OA 3I33A 2P5GA 2DPNA 4CJ5A 5C12A 3AO2A 2IS3A 1NLVA 1QHTA 4OGCA 3I0RA 1REVA 4CW7B 3NF9A 1HMVA 4B9QA 4OJRA 4X65K 2P9SB 1E4GT 1KLMA 4U67L 4G1QA 4H0XB 5HRPA 2OZSA 1NKCA 4FJNA 3LALA 4DFKA 2UUCK 3CJBA 1VK0A 1X9MA 4ELUA 4B9VA 3OYDA 4M63C 2D0OA 5GAEP 4X64K 3VOVA 3NF7A 5CZ2A 3F9KA 3CCJN 4C1NI 5A2QO 3SJHA 4BR5A 2G8IA 4BC5A 4LY7A 4MQ3A 1JCEA 4CZHA 4DV0K 3MN7A 3ZSOA 2E8AA 3HTVA 4HWIA 4U7BA 2X6SA 3MN9A 3SBTA 3VEXA 3HM9A 5C24A 4FWPA 4O55A 2W00A 4DR2K 1TK8A 4DV6K 2HF4A 3EY1A 3G0ZA 1C1AA 2Q3SA 2QKBA 3DXKB 1SKSA 1C6VA 3NDKA 3NH0A 3R1XA 1RGIA 4IWVA 4DV4K 4EHUA 1WSIA 3ZEUA 1QS4A 1C0UA 2QK9A 1SQKA 4EP5A 4KREA 3EE9A 4X66K 4FLWA 4DWIA 1GOCA 1KRPA 4LF5K 1KVBA 4JI5K 1VQNN 3VTHA 4EIAA 3T19A 3U9DA 3PIOL 4L3QA 2OPPA 3F9MA 3PX0A 1EKEA 3DOKA 4Y1CA 3CMAN 1EO1A 1TYQA 1SKRA 1A5WA 2V7YA 2DY4A 3MWPA 1JLEA 3F5TA 4W5OA 3DJCA 4F2RA 3VETA 2HMIA 5AQLA 1HYSA 2NZTA 3RVCA 2E6MA 3CC7N 2RN2A 2QWPA 4QS7A 3ZX3A 1QSLA 2HHTA 3DXMB 2NRZA 5LMNK 4LFBK 2FXUA 1MDUB 2O8FA 4DTPA 5J2NA 3AARA 5BRHA 4M3ZA 3QINA 1X9JA 1XNRK 1QVGM 2ZGZA 3FFIA 3CFRA 3VEVA 1FKOA 3OBYA 2AJQA 4E1MA 4GNIA 4H5NA 4ISEA 1T8EA 2Y1JA 1WSJA 1XMOK 1JLQA 1N34K 2WUSA 5I42A 4CJSA 4BRKA 3MN5A 4H5WA 2Q1NA 2YKMA 2W40A 1WSHA 3WNFA 4PKHA 3IMXA 2P9UA 1CXQA 3KLFA 3SLCA 3HJFA 2FF6A 3I55N 1YT3A 3O5BA 3OJUA 3PV8A 4CFDA 3TAQA 1BL3A 4CIFA 4W5NA 3LL3A 2OPQA 4B9MA 3O9SA 3UKRB 2OTLN 3LPUA 2Y1IA 4JS4A 1S72N 2FBTA 3QIOA 1H1VA 2FBXA 4F3OA 1Q8IA 1TKZA 3HP9A 5BN8A 2PYJA 3KTQA 4V19S 3ZT0A 2PY5A 1GLCG 3U8XA 3C94A 1EP4A 1FW6A 4HVJA 3K59A 2QM1A 4H5VA 4DFMA 1UAXA 4BRGA 4FK4A 4DV2K 4OX9K 1Q18A 4JD2B 3V6DA 4B8AB 3AO5A 4IKFA 2DFFA 4HUFA 4O5FA 5H1SQ 4JYAK 5C15A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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