3M6GA

Crystal structure of actin in complex with lobophorolide
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Two molecules of lobophorolide cooperate to stabilize an actin dimer using both their "ring" and "tail" region.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 125
structure length 353
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m6gA03
4FWMA 4XH4A 3WUHA 2GELA 4E1JA 1QZ5A 2W41A 3UE5A 5AQVA 5AQHA 4IJAA 2GUPA 4ISEA 1NGJA 4CBXA 4PKHA 1QHAA 3S41A 1H1VA 4B9QA 4K25A 4BRMA 1BG3A 1NBWA 3D2EB 3ZX0A 2AA4A 5FPEA 1E4GT 3LM2A 2FF3B 4GY2B 5F2RA 1OKJA 3BUZB 3CJAA 3WXLA 2H3GX 1JCFA 1NGEA 1KXPA 1U6ZA 5AR0A 4CBWA 5E84A 1HKBA 2Q36A 3MMVA 5EY4A 5E26A 2CGJA 4JN4A 4EAHD 1X3MA 3H45C 4B1ZA 4BRCA 3D2EA 5AQTA 3LDNA 4BR4A 1IG8A 2ZGYA 2GTDA 3GDQA 1HKGA 1JCEA 3IFRA 3M6GA 3CJ7A 1MDUB 2QWQA 5AQXA 3CIPA 3LDQA 2FSNA 4ISGA 5LY3A 4ISFA 5CE3A 1GLFO 4FSVA 5AQQA 3WEEB 5AQLA 2YHWA 1QQOA 2V52B 3I8BA 4CZEA 4H5VA 4M7XA 4BC4A 5BRHA 1TUYA 2V7YA 4IXCA 3QB0A 3LDLA 5BPLA 4FWOA 5AQWA 4BRHA 2P9KB 2QWRA 3CJCA 3FZMA 4MLHA 3A8YA 2Q2RA 3VEZA 4BRFA 2D4WA 3DXKB 5ELZA 4BROA 3GE1A 3FE1A 3UKRB 4WYBA 2IVOA 3QICA 3A5LC 3MN7A 3WEEA 1YAGA 2P9SB 5I9EB 4XH5A 3WQUA 4CZMA 2ASPA 1ATRA 3H46O 5EX5A 2Q0UA 4BRPA 2GWKA 4C23A 2P9KA 4K43A 1QZ6A 3QDKA 4Y0WA 3CJ1A 4JD2B 3DXKA 3HTVA 3MN9A 4H5NA 1KAXA 2HF4A 3U8XA 3UKRA 1QQNA 2NZTA 1BDGA 5LJWA 3U4LA 1T6DA 4M7YA 2IIRA 3AARA 4O5FA 2QWPA 3ULEB 3VF2A 1TYQB 2P9SA 4DB3A 1RFQA 2YI1A 3QBWA 4H0XB 4I6MB 1J6ZA 3O4WA 4BRLA 2QM1A 4IO8A 3UB5A 5AQPA 1Y64A 2NRHA 3U9ZA 5AQFA 5F1XA 1XC3A 4MO4A 4JD2A 2YHYA 3ENOA 3R8EA 2D1KA 1GLLO 3I33A 4FWSA 3GG4A 2QWOA 4CJ7A 2PBDA 2A5XA 4RTFD 4A61A 2YJEA 3ULEA 1TYQA 4BRKA 1R59O 4I6MA 2CH5A 4CZLA 4BR7A 4H0TB 3WT0A 3ZETB 4FO0A 4IWVA 3AAPA 3D7EO 2DPNA 3AAQA 3CI5A 4IJNA 1ZC6A 2QWLA 1JCGA 4A62A 4BC3A 2BTFA 1NMDA 4MO5A 3EZWA 4BR9A 4BG9A 2NLXA 1C0GA 3CQXA 3SLCA 3L0QA 4K41A 3W3DA 5BREA 4HWIA 4FWQA 2P9UB 3ZETA 1D4XA 3HZ6A 3VENA 3ENHA 3WXKA 3P4IA 3TU5A 3BF3A 1ATNA 4H03B 1BA1A 1MA9B 4CZHA 3D2FB 2YCHA 4BRAA 3G25A 5FPMA 1HLUA 5AQZA 2F9TA 3BP8A 2P9LB 4DHYA 2D0PA 3A5NC 3MDQA 4PL8A 3WXJA 3O1WA 3QBXA 3DXMB 1C0FA 2P9UA 3L4IA 1LOTB 4QS7A 4LC9B 2BUPA 3D2FA 3EKUA 2A6AA 3H1VX 3R6MA 3EKSA 5B8HA 5JICA 3EO3A 2AP1A 3UKUB 3A0IX 5AZIB 3L6QA 3JXUA 2A41A 3FZFA 2I7NA 3FZHA 3MN5A 4WQ5A 2P9LA 2F9WA 1GLCG 1LCUA 2E88A 4A2AA 2E2PA 4RCHA 1WUAA 3DXMA 3LDOA 4JNEA 2EWSA 2CGKA 4BRGA 1IJJA 2VYPA 5KQDA 2QWNA 4H0VB 4BRIA 3UKUA 5AZIA 2ASMA 1SAZA 3FGUA 5F0XA 3LL3A 4KBOA 3M1FA 4EFHA 5JLFA 4QS8A 4XEIA 2E1ZA 1GLEG 5AQSA 2E2QA 2VWBA 1NWKA 2ASOA 3A5MC 2QW9A 3VERA 4B1YB 2E1YA 2HOEA 3WXIA 3GBTA 4FWNA 3JS6A 5AQOA 4IZ9A 2P9PB 1MWMA 4Z94A 5LJVA 2IVPA 3LM9A 3H1QA 5BRFA 1BUPA 1CZAN 4CD1A 1NGFA 4BR2A 5JMVA 2Q97A 4BR0A 2HF3A 3HM8A 4CBUA 3WQTA 1GLJO 4HTLA 4WQ4A 4YDUC 3CERA 3O6WA 1EQYA 1T6CA 3DAWA 2ZF5O 3ATVA 3FLCO 2P9PA 5AQNA 3ZEUB 2J4RA 1WOQA 4JAXA 2FSJA 3W0LA 1ATSA 4BGBA 4RWTA 1HJOA 2ZGZA 4B1UB 4EHTA 4EHUA 1RGIA 3GL1A 4BQLA 3A5OC 2CH6A 1NGBA 1NM1A 1X3NA 3U9DA 5AQKA 1BU6O 4PKGA 3VF4A 4DCHA 1U2VB 3ZX3A 1NGDA 1ZBSA 2Q31A 1NGCA 3CJBA 1S22A 3BF1A 3CETA 3ZEUA 4A2BA 1TUUA 1Z05A 5JLHA 2GEMA 3QFPA 5AQIA 4BQZA 1P8ZA 4FOEA 4QS9A 1BOTO 2E2NA 3GOIA 2ITMA 3SK3A 3EL2A 5FPDA 2W40A 3MK6A 4CI6A 5AQJA 4F9OA 5BPNA 1U2VA 3VEXA 5EXWA 3DWLA 1HUXA 4BR5A 4B1XB 5KPZA 1BWFO 1KAZA 2YHXA 2V51B 4FL9A 1V4SA 1S3XA 5AFUA 1DEJA 4H0YB 3HSCA 1V4TA 3ZX2A 3MCPA 3MN6A 1X9JA 4NO7A 2FSKA 4B1VA 3SMSA 1KAYA 3VETA 1GLDG 1RDWX 2IVNA 5TKYA 3FZLA 4MLEA 3VEWA 1Z6RA 4CZKA 2FXUA 3ATUA 3VEOA 4AM7A 1E4FT 5FPNA 2HMPA 1YXQA 4XH1A 1NGIA 2PAVA 5KQ8A 3KVGA 4FWRA 3VPZA 1NGAA 2FF6A 4B1WB 4FPAA 3ID8A 4CZJA 5ADXA 2V7ZA 5AZJB 5AQRA 4WQ5C 3VEVA 4JHDB 5EOYA 1Q18A 3DJCA 4BREA 1QQMA 4FWPA 4AM6A 3VGKA 3KHYA 3VF6A 2A3ZA 3CJ9A 4BRNA 2Q0RA 2UYTA 1GLBG 2GWJA 4PL7A 2KHOA 1ZXOA 3H6EA 5KPRA 5KPTA 1MWKA 4J8FA 3HBTA 3TPQA 2ZWHA 2D0OA 2E20A 3O1BA 3QFUA 3SJHA 5AZJA 3IMXA 5EVZA 4JHDA 4CZIA 3QMLA 4H5RA 3SMPA 3H3NO 3O08A 3C7NB 1BA0A 3CQYA 4BC2A 4M63C 1HPMA 5AQMA 1HKCA 1G99A 2CGLA 4K42A 3FZKA 3J8AA 4FOIA 4O8KA 3VESA 2P9IB 4BVOA 2E2OA 3B8AX 4FWLA 3FR0A 3IUCA 3LDPA 3C0BA 3C7NA 3O80A 1DGKN 3OHRA 5BN9A 5BN8A 3M3ZA 2QWMA 3FFKB 5AQGA 1XQSC 4H0OA 1DKGD 1K8KB 4WQ4C 5AFUH 4H5TA 3HI0A 2VCPA 3RSEB 1HX1A 1NGHA 2E8AA 2P9IA 3F9MA 3VOVA 3H3OB 2WUSA 3EN9A 2A40A 3KZBA 4BRQA 4YDUA 1GLAG 5BRDA 5BR9A 3O8MA 1NLVA 1BO5O 1SQKA 4FWKA 5AQUA 4FPBA 2P9NB 2A42A 4BG8A 3VEYA 1K8KA 3VGMA 4BVPA 1SZ2A 1NGGA 2Q1NA 3BEXA 2YJFA 4CZFA 2I7PA 5ADXH 5BPMA 3RSEA 1T44A 3O5BA 4GNIA 3R9PA 4CZGA 4NB4A 1YVNA 4BGAA 4CD3A 2FLOA 3CHWA 4BC5A 1XUPO 3IDHA 4L3QA 4DQ8A 4BRDA 1YUWA 4H5WA 1ESVA 5AQYA 3VGLA 2QXLA 4H0PA 3AY9A 2P9NA 4EIAA 2OANA 4PKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THYB 2B5JA 4E1JA 3RR8A 2W41A 4LF6K 3ZSYA 4X65K 4YHHK 1SV5A 3WNEA 1NGJA 3OYEA 1QHAA 4DG1A 4B9QA 5EU7A 1BG3A 4YY3K 1NK8A 5IT9O 3CCEN 3DOKA 3ZX0A 4DV1K 5HL7L 2IGIA 3ZYYX 4CF1A 1RNHA 3BUZB 4EP5A 4PHTX 3M8SA 2IS3A 2H3GX 3CCQN 1JCFA 1NGEA 1U6ZA 2BE2A 3MMVA 3TSQA 3VQBA 5J2PA 4AH9A 5E26A 2OPSA 4JN4A 2HVIA 3T1YK 4B1ZA 2RKIA 4DR2K 4E0DA 3LZJA 3RMDA 1IV0A 1IG8A 4DSIA 2JLEA 4F4KA 4JS5A 4JRQA 1HKGA 3IFRA 3M6GA 3NF9A 1EP4A 3CJ7A 4CGGA 1MDUB 4FK4A 3P5JA 2O4IA 3VQ4A 4ISGA 4E1MA 4KHNA 3CC2N 4FSVA 2QKKA 4FW1A 2C1IA 4LF4K 2YHWA 1QQOA 2V52B 3KK2A 1VSDA 2F96A 2PYLA 3WNFA 3QB0A 4FZXC 4FLUA 4FWOA 4YOWA 4BRHA 2UUCK 3CJCA 3LANA 3VEZA 4BRFA 2OA8A 4F3TA 4MDAA 1JLQA 1D9FA 1NJXA 1VQ5N 2ITGA 4GVEA 5HBMA 4WYBA 1OH7A 2HHQA 3L2QA 4CJLA 4CF9A 4IOCL 2P9SB 4OO1J 2VQFK 1BISA 4XH5A 3WQUA 3BGRA 1VQKN 4CZMA 2ASPA 2YNFA 1ATRA 3QLHA 4A57A 3F5TA 4FXDA 4BRPA 5C2FA 1QZ6A 4JK9A 1Q86O 1IKVA 5H1SQ 3SZ2A 3U3YA 2UXBK 4AF1A 2IIRA 3AARA 4MQ3A 4O5FA 1TVRA 5M1FA 2P9SA 1VQON 4BRLA 4DSKA 1HJRA 5AQPA 2NRHA 4YOUA 4B8AB 3M5RA 4MO4A 3ZSWA 3SUNA 1WAJA 1HR0K 3R8EA 2D1KA 4BECA 1GLLO 3GG4A 3MEGA 3ZSZA 4A61A 4O5BA 4RG8A 3V1QA 3MEDA 3J7YP 4IG0A 1R59O 1Z26A 3ZETB 1VHXA 1ZBLA 4BE7B 1NJIO 1TGOA 4M42A 3QESA 5DM7L 3OS2A 4IJNA 3N4QA 4Y1CA 4A62A 4KH4A 1TK0A 4CJ5A 1NMDA 3TAPA 4BR9A 4BG9A 1X9MA 2PZSA 1VSMA 2O8FB 1Z25A 5BREA 4HWIA 2ZE2A 4AHSA 3ZETA 2WTUA 2F7TA 4KHYA 1JXEA 3HZ6A 4CJSA 5IWAK 1EWRA 4CZHA 3D2FB 3TSUA 4AQYK 4CJVA 4BRAA 3G25A 1M90O 1HLUA 1I3AA 1RDDA 1L5UA 4DMNA 3SAGA 3L2UA 1OH6A 2DTUA 2O8FA 3MDQA 4PL8A 3WXJA 2HHUA 5C12A 2NNWA 3OYHA 2JGUA 3D2FA 4CHNA 3EKUA 4BWJA 3H1VX 3R6MA 5JICA 1T8EA 2AP1A 3L6QA 3K5MA 2A41A 3FZFA 3CM5A 4HVJA 3LWMA 3NF6A 4TSXA 3LALA 1KRPA 2DFHA 1U04A 1ZBFA 3LWLA 3LDOA 5HLFA 3DLGA 4JNEA 3P31A 4H4OA 1Y97A 1C6VA 4DFMA 4L8RB 3KK7A 5A2QO 4CGHA 3CXCM 5KQDA 4CERA 1A5VA 3IS9A 1TKDA 1N32K 4N47A 1VSJA 4H4MA 5F0XA 4DV5K 1HYZA 4NXNK 4FYDA 1DLOA 4CFDA 4IOXA 4QS8A 1TKXA 2KQ2A 4V19S 4FJNA 5HRPA 2HOEA 5CYMA 3GBTA 3JSMA 4YFUA 1C1CA 1RT6A 1KTQA 2PYJA 4W5RA 4W5OA 2G8FA 1MWMA 4C8KA 3THXB 3HRGA 3LM9A 2VGMA 3OS1A 3SPYA 4FZYA 1BUPA 3Q7CA 1C0TA 4OVLA 3U3GA 4Z4GA 3WNHA 3DI6A 1KVBA 4BR0A 4I2QA 1P90A 3HM8A 3P38A 3WQTA 4HTLA 5GAGP 3O6WA 1TL3A 2RPIA 5GAEP 3SI6A 4XIUA 2J4RA 3THXA 3W0LA 4DTJA 4J2EA 2B6AA 2BH1A 4I2PA 3NVKA 3K5NA 4B1UB 3CMEN 4DTMA 3V9ZA 1RGIA 2VG6A 4BQLA 3A5OC 1NM1A 1BIZA 5GINA 1NGDA 2Q31A 3Q7BA 3CJBA 2Y1JA 1XHZA 1WAFA 3AVCA 5AQIA 4BQZA 1P8ZA 2YKNA 1BOTO 1LAVA 2E2NA 4PY5A 3EL2A 5FPDA 2W40A 2OPPA 3RVCA 4FM2A 4HTUA 2FC0A 3VEXA 4DFJA 3NMUA 3NF7A 4Z4EA 4B9MA 4B1XB 1NK9A 2V51B 4FL9A 1ILYA 4NXMK 1SS6A 3ZX2A 3OYLA 3B6PA 3K0SA 3KLIA 5HRRA 3SMSA 2IVNA 4MLEA 3VEWA 4CGJA 4JYAK 2FXUA 3R1XA 2Y1IA 5BR8K 4X66K 4CEEA 4CK1A 2HMPA 3G71N 2PAVA 4WE1A 3KVGA 1SL1A 4ILGB 4JI5K 5J2QA 4FPAA 3ID8A 4CZJA 5AZJB 5CR4A 1D9DA 1YTAA 4N76A 5EOYA 2YKMA 4BREA 5LMUK 3V6DA 1YT3A 4KTZA 4B9NA 1LWEA 4FWPA 3OYKA 2EHGA 3CJ9A 3AA3A 1FKOA 4OKEA 3V1OA 4CK2A 2HHVA 3TAMA 4PL7A 4KH5A 5KPRA 5KPTA 4J8FA 1VSEA 1F21A 3HBTA 5HROA 2G8HA 2ZWHA 3RR7A 4JKFA 2E20A 3O1BA 5AZJA 3HT3A 1YITN 5GIOA 3IMXA 2HHXA 4E72A 2G8KA 3O3HA 3SMPA 3H3NO 3C7NB 1B92A 3VA3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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