3M6GA

Crystal structure of actin in complex with lobophorolide
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Two molecules of lobophorolide cooperate to stabilize an actin dimer using both their "ring" and "tail" region.
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 353
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m6gA03
4FOIA 1HUXA 1T44A 4Z94A 1YXQA 2YI1A 4QS8A 2GUPA 2YJEA 3S41A 4BVPA 3KVGA 1NGFA 1YUWA 3EKSA 4PL7A 3A8YA 4BGBA 2P9LA 5AQIA 2HMPA 3WT0A 2A3ZA 3H1VX 3MN6A 4BC2A 5AQNA 1GLBG 1GLCG 4BRQA 3UKRB 2D4WA 2P9PA 2ITMA 4BRCA 4BROA 2P9PB 4BR7A 4JN4A 2P9IA 3LDOA 2P9IB 4BVOA 1P8ZA 1HKBA 1BG3A 3VGMA 4O5FA 4CI6A 3QFUA 3CI5A 4IJNA 3ENHA 3FZFA 2W41A 4FWRA 3R9PA 3H46O 1ATNA 1QQMA 1TUYA 4XH5A 4B9QA 1K8KA 1K8KB 4BC5A 2FLOA 4J8FA 5JMVA 3HSCA 5I9EB 2YCHA 4B1UB 3UKUB 1X3MA 3SJHA 4BRPA 2I7PA 2ASOA 3ID8A 4BC3A 4H0XB 1ATRA 2VYPA 3AAQA 4EHTA 3O1BA 3MCPA 5AZJA 3MN9A 2VWBA 4K42A 1NGJA 3FFKB 4RTFD 5LY3A 5AQMA 3MN7A 4K25A 1HKGA 2OANA 3QBXA 5CE3A 1OKJA 3ATUA 2GWJA 5ADXH 1BA1A 2BUPA 1RDWX 2IVOA 3VEXA 4BRKA 3VGLA 4XH4A 4BQZA 4DQ8A 2AA4A 4BRHA 2A6AA 1BA0A 1RFQA 4CZKA 3A5LC 3I8BA 4H0PA 1X3NA 1Y64A 2A42A 1E4GT 2Q2RA 4FWMA 3OHRA 2P9UA 3A5NC 5KQ8A 1BUPA 1DKGD 2GWKA 3J8AA 3QFPA 3HZ6A 2J4RA 2P9KA 4FSVA 5JLHA 2P9KB 2E2OA 3A5MC 3G25A 5BPNA 1BDGA 2IIRA 3VEYA 1R59O 2QWLA 1XC3A 3SLCA 3FR0A 2F9WA 3HM8A 3WUHA 3DJCA 3DXMB 3ATVA 3EZWA 3LM2A 5ADXA 1NBWA 4BGAA 2YJFA 3VF4A 5JLFA 4B1WB 1GLEG 1BO5O 5AQKA 2FSNA 4H03B 2ASPA 2NRHA 5FPEA 3WXJA 3MMVA 4JNEA 2W40A 3VOVA 4CZGA 3VEVA 4CZLA 3HBTA 2QWRA 2BTFA 3VF6A 4CBUA 4CZJA 5JICA 4HWIA 2V7YA 4JHDA 3LDPA 3O1WA 4MO5A 2E88A 3CJ9A 3CJAA 5LJVA 5BRDA 3ZEUA 4BRMA 3ENOA 1S3XA 5AQWA 3F9MA 3ZEUB 3MN5A 4HTLA 3GOIA 5AQUA 3HI0A 2Q31A 4EIAA 1HJOA 4IO8A 2CGLA 3MDQA 3RSEA 1QQNA 3EN9A 3RSEB 2ASMA 3O6WA 1HKCA 4BR5A 1MWMA 1JCGA 4CJ7A 4CBWA 1GLLO 5ELZA 5BRFA 3JXUA 1TUUA 2DPNA 5F1XA 4AM6A 3CIPA 2P9LB 3W3DA 5AQGA 5BN8A 4BG8A 2HF4A 5AQJA 4WQ4C 3TU5A 4H0OA 2CH5A 1NGCA 2E8AA 2ZGZA 2FSJA 1YVNA 4FPBA 5BPLA 3H3OB 1E4FT 1LOTB 3I33A 5AQVA 4WQ4A 1NGIA 4CZEA 3KZBA 3WEEA 4FPAA 3WEEB 1NGGA 3UB5A 4QS7A 4BRFA 2PAVA 2A40A 1SZ2A 5AQZA 4MLEA 5EOYA 2Q0RA 5BN9A 1H1VA 1U2VA 3SMSA 2QWPA 2NLXA 4CD1A 5AQYA 2ZGYA 4FWSA 4H0YB 5KQDA 4LC9B 3CQXA 1ZBSA 1NWKA 3SMPA 1XUPO 4IJAA 3B8AX 3U4LA 3FZMA 4H5NA 2H3GX 1ESVA 3A5OC 5AZJB 4DB3A 1Q18A 3WQUA 2E2NA 4C23A 3H1QA 2NZTA 3BUZB 4H5WA 2CH6A 2GELA 4BR2A 2YHYA 1EQYA 1QHAA 2EWSA 3DXKA 3DXKB 2D1KA 1T6CA 3QMLA 4CZFA 5AQLA 4H0VB 4I6MA 3IDHA 4I6MB 3C0BA 4BC4A 3BF3A 4RCHA 2QM1A 1G99A 3CERA 1BWFO 4FWLA 1IG8A 1S22A 5AFUH 3IFRA 4E1JA 3A0IX 3M1FA 3U8XA 3VESA 1GLFO 2KHOA 2P9UB 3CJ1A 4M7YA 3LL3A 5AQFA 5AQOA 2IVPA 1CZAN 4FWQA 3CQYA 4ISFA 5B8HA 2F9TA 3DAWA 4H5RA 3BF1A 4CZHA 3ULEA 5AQPA 5AR0A 5F2RA 3BEXA 3D2EA 4H5VA 3D2EB 5BRHA 3KHYA 2GTDA 3FZLA 3M3ZA 3DWLA 4GY2B 4IXCA 4L3QA 4BR0A 3ZX3A 4FO0A 3WXKA 2HF3A 3CJ7A 4BRDA 5EX5A 3LDQA 5AQRA 1LCUA 1BOTO 3R8EA 2VCPA 1GLJO 3MK6A 1TYQA 1TYQB 4H0TB 4BR4A 2YHWA 3AAPA 1NGBA 3EO3A 4M63C 3VEZA 1MA9B 5AZIA 5AZIB 2E1ZA 2CGJA 3O4WA 4B1ZA 5AQQA 5BREA 4XEIA 5LJWA 4JHDB 3CHWA 5FPNA 2FSKA 2QWQA 4CZIA 4FWPA 1NLVA 5AQHA 3VGKA 2E20A 4ISEA 4PL8A 5E26A 3FE1A 3UE5A 3FZKA 4FWKA 2Q36A 3U9ZA 3D7EO 4FWOA 4FOEA 4JD2A 3CJCA 2P9SA 4Y0WA 1U6ZA 3VERA 1HPMA 3O08A 2WUSA 5TKYA 5AQSA 3VETA 4DCHA 1KAYA 2UYTA 3LM9A 4MLHA 1T6DA 3IMXA 1RGIA 3M6GA 4RWTA 4CBXA 1WOQA 1ZXOA 1KAXA 3EL2A 4O8KA 4BREA 2AP1A 1V4TA 4K43A 5BR9A 4BRIA 4PKGA 5EY4A 4QS9A 2V7ZA 5EXWA 4WQ5C 4FWNA 3LDNA 2QW9A 3AY9A 3VEOA 3C7NA 2PBDA 3EKUA 3C7NB 3GG4A 4NB4A 1MWKA 3D2FA 3CJBA 4ISGA 3UKRA 1KAZA 3D2FB 5KPZA 1U2VB 3L4IA 1WUAA 4WQ5A 4EAHD 2QXLA 4BRNA 1QQOA 3H6EA 3QB0A 3O8MA 1ATSA 2P9NA 2P9NB 5KPTA 4AM7A 4IZ9A 3R6MA 2Q1NA 3U9DA 5F0XA 2HOEA 4JAXA 1NGDA 3GDQA 1V4SA 4PKHA 1QZ5A 1SAZA 4B1VA 1C0GA 2E2PA 3VF2A 2ZF5O 3UKUA 3BP8A 3VENA 1GLAG 4IWVA 5KPRA 2I7NA 2D0OA 3GBTA 3H3NO 4EFHA 2Q0UA 3HTVA 4K41A 3CETA 2E2QA 3IUCA 3W0LA 4EHUA 4BG9A 3JS6A 1SQKA 4BQLA 4DHYA 3QDKA 4H5TA 2QWMA 1NGEA 3LDLA 4CZMA 3QICA 3L0QA 1IJJA 3FLCO 5E84A 4GNIA 2QWNA 3ZX2A 4B1XB 4WYBA 2YHXA 1JCFA 3GL1A 2A41A 1J6ZA 4M7XA 2FXUA 3ULEB 2V51B 2FF3B 3ZETA 3QBWA 3ZETB 4BRGA 2IVNA 2D0PA 5BPMA 2FF6A 3H45C 1QZ6A 1ZC6A 2CGKA 1NGHA 3AARA 2QWOA 3VPZA 4PKIA 1NMDA 1DEJA 4A2AA 3GE1A 3WXLA 2ZWHA 1GLDG 1Z05A 1KXPA 1MDUB 4B1YB 5AFUA 1JCEA 1Z6RA 4MO4A 2V52B 3SK3A 4A2BA 3DXMA 4F9OA 1YAGA 3VEWA 4BRLA 5FPDA 5AQTA 1BU6O 5EVZA 1X9JA 2E1YA 4NO7A 1HLUA 5FPMA 4BRAA 4YDUC 1HX1A 4XH1A 4KBOA 1NM1A 3WQTA 1C0FA 4A62A 4BR9A 3TPQA 3FGUA 3ZX0A 1NGAA 3WXIA 4YDUA 3O80A 2Q97A 1XQSC 2A5XA 2P9SB 3FZHA 1DGKN 3L6QA 4JD2B 5AQXA 2GEMA 1D4XA 3O5BA 4CD3A 4A61A 3P4IA 4FL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HUXA 3TAFA 4J2AA 5C0YA 2G8VA 4DS4A 1X9SA 2HVIA 1VSMA 2YI1A 1RBUA 3VQ7A 2YJEA 3PUFA 1NGFA 3V81A 4PL7A 3HPOA 2HHTA 1RCHA 2A3ZA 3L3VA 3M5RA 4R79A 1L3VA 2YHAA 5K14A 3TARA 4I7FA 1SUQA 3S3MA 5GADP 3G6EN 3LDOA 3HP6A 4FZXC 1HKBA 2E5LK 1TL1A 3QFUA 5J1EA 1OH6A 4IJNA 4KHWA 1SV5A 3ENHA 4FWRA 4N41A 2UUBK 4XH5A 1VK0A 2AJQA 2IOCA 2FLOA 5JMVA 3HSCA 3M8QA 2YCHA 4OKKA 3LPUA 3OBYA 4DSJA 1KC8O 2O8DA 2O8DB 4BC3A 1T8EA 1KLNA 4KI4A 3AAQA 4BACA 2ITGA 4KHYA 4B3RK 3C6TA 1R0AA 2OANA 1N33K 2QEXN 4DKWA 1BA1A 4CVNE 2VWKA 4DTPA 3ENBA 2XY5A 3TTCA 4BRHA 1BA0A 1RFQA 3IKMA 4NCGA 3HT3A 3NE6A 1OH8A 3G4SN 2A42A 1E4GT 2Q2RA 3ZSRA 2O8EA 2P9UA 2ZQBA 4FSVA 2P9KA 4QAGA 1Y97A 2P9KB 3DYAA 4GV3A 4B9MA 3T1HK 4LY7A 4LD0A 5JVGL 1XC3A 2D0CA 3LAKA 4G1QA 4GV9A 3MWTA 3SJJA 1C0MA 3DXMB 4FM1A 1BISA 1WSGA 1RTIA 3JYTA 2YJFA 1NJWA 4WFBL 5JLFA 3IAYA 3K59A 1GLEG 1BO5O 5AQKA 4H03B 2NRHA 3VQ8A 5C2DA 3WXJA 3MMVA 2G8HA 3IS9A 2HHHK 3KKRA 4DV3K 5KI6A 1S6PA 2BTFA 4H8KA 2KFZA 5JICA 3NHGA 1LWEA 3LDPA 2HBMA 4MO5A 3KD5E 3QEXA 1RT2A 1S3XA 5AQWA 1IO2A 5J2PA 1KFDA 1BIUA 2Q31A 4BE7B 4DFPA 1RBRA 4IO8A 1OH5A 2FBYA 1VQ7N 2HW3A 2NUBA 2FBXA 5CHIA 3O6WA 3RMAA 1HKCA 1JCGA 5C24A 2VWJA 5BRFA 1VSFA 3JXUA 2DPNA 5M1KA 2P9LB 2R7YA 4C8MA 2HF4A 5AQJA 3K5LA 1S9EA 1BQNA 2CH5A 2ZGZA 1EXQA 2KKZA 1Q9YA 4AHCA 5BPLA 4FK0A 4CK3A 1JL2A 1U49A 2KZZA 1RBTA 3Q7BA 1S9GA 3SUOA 1NGGA 3UB5A 1VSJA 3E9PA 4QS7A 4BRFA 4CJWA 1SZ2A 4JRPA 3VTIA 4KH6A 4B3TK 3J80O 3SMSA 1U2VA 5FDLA 3QEVA 4DQQA 3SUPA 1BGXT 1VQ6N 4ELVA 5AQYA 2HHSA 4NYFA 1QS4A 2A1RA 4X62K 3QLHA 4K8XA 4IFEA 4BWMA 1NWKA 3DRPA 3VTHA 3FZMA 4H5NA 5AZJB 4DB3A 4DQPA 4F2RA 3VQCA 4LFBK 1Q18A 3R3LA 1VQ9N 4NCAA 2I5JA 2UXCK 1QE1A 4C23A 2KZMA 2OTJN 1RT1A 1BCMA 1YTAA 1TK0A 3DXKA 4M42A 3DXKB 3SYZA 3QMLA 4CZFA 5AQLA 5HBMA 4I2QA 1VRUA 2F8TA 2QM1A 4TSXA 5M1QA 3QEWA 4FWLA 1XNRK 3IFRA 1QHTA 3ZSZA 3U8XA 4CFDA 4B9UA 4FLZA 1J5OA 4DF8A 2D0AA 4FWQA 4ISFA 1SKWA 4JI2K 3NBPA 4JI0K 5AQPA 5F2RA 5BRHA 3SQ1A 1MU2A 3DWLA 4GY2B 3I0RA 1WNSA 2HF3A 3AVIA 5EX5A 2HHUA 3J7YP 3TAPA 2JGUA 2HHQA 3SCXA 3R8EA 2VCPA 4CJQA 4JI8K 4NCBA 1Z25A 3AAPA 3EO3A 3T7ZA 1BCOA 5HROA 4DR3K 2CGJA 4DU1A 1O13A 3HK2A 1KVBA 2QWQA 4FVMA 3TTFA 1EKEA 4YOXA 1NJYA 1QSLA 1VQMN 4ISEA 1BIZA 4PL8A 2YNGA 3TAQA 4M41A 4B3SK 4WF9L 3FZKA 4EP4A 3L2QA 3LWMA 1KVCA 3BDPA 4OX9K 1U6ZA 3K5OA 1U4BA 3DMJA 2G8FA 3SQ2A 3PX6A 3SPZA 4MLHA 1KVAA 4DQRA 3V4IA 3DLGA 3S3OA 3OYCA 4AHSA 4O8KA 1HNVA 1NOYA 3V9SA 2PYJA 5BR9A 2ZJRL 5JENA 4PKGA 4FCYA 3OJSA 4E72A 4FW2A 1JLEA 4FWNA 2QW9A 3AY9A 2PY5A 4DLGA 3FFIA 1NK0A 3KK3A 4DV6K 4NB4A 1Q81O 3OYHA 3L4IA 3AVCA 1QQOA 4Z4HA 4R5PA 3H6EA 3DLKA 5I42A 4OLAA 3AO2A 4CJLA 1WN7A 4CE9A 2PZSA 4L8RB 4AM7A 2YKMA 4FJJA 5CYQA 2YKNA 1L3UA 4BDZA 1JKHA 2HOEA 4JAXA 4OGCA 4X64K 1C0GA 3BP8A 4IWVA 1J5EK 2D0OA 3ZT1A 1ASWA 1NKBA 3N4PA 4LF8K 2XO7A 4OJRA 1Q82O 2Q0UA 2IDOA 3CETA 4NXMK 1L3TA 4EHUA 1HQUA 5HOOA 4RW9A 1OH7A 1RDDA 4DR1K 1TKDA 3NFAA 4IOCL 4ELTA 3LDLA 2GX9A 4MDBA 1TKXA 1JLQA 2RKIA 3E1YA 4CZMA 3WNFA 3K2PA 3P38A 4CEEA 3LDSA 1QVFM 1D9FA 1HNIA 4PHTX 4X66K 1JCFA 2FXUA 3CQ8A 1ZBIA 3ZETA 3ZETB 4BWJA 4BRGA 2WONA 2IVNA 1HYZA 4CEQA 3H45C 3HRGA 1QZ6A 1JXEA 4RW7A 1NGHA 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5FRMA 5KQ8A 4ELUA 1HJRA 3AV9A 3NF6A 4E7JA 3K58A 5JLHA 2E2OA 3TSPA 1RT4A 1BDGA 2IIRA 1XMQK 4PY5A 2QWLA 5C25A 3VN5A 5TKWA 4B9SA 2HBJA 3DJCA 1KD1O 3ATVA 1YITN 3UIQA 3EZWA 3KLFA 4C8LA 2QTDA 3VF4A 1YI2N 3EEQA 4B1WB 4H4OA 2ASPA 3PSFA 2HHWA 3SQ4A 4A57A 5FPEA 4CF1A 2W40A 3O3FA 4CZGA 5CZ2A 3VEVA 3VF6A 4CBUA 1K9MO 4CZJA 3O1WA 1KLMA 2E88A 4JK7A 4F8RA 2NRTA 4BRMA 3MN5A 3GOIA 4F2SA 2JLEA 1HJOA 5KRSA 2WOMA 3ZT3A 3D0PA 1W97L 1S1UA 1LAVA 1A5WA 1QQNA 1UAXA 3B6PA 1TL3A 3SBTA 5I3UA 1K73O 3QIPA 1GLLO 3C6UA 1TUUA 4CEAA 3U6FA 3NMUA 3HYFA 4H0OA 4QCLA 4IOAL 2E8AA 1IV0A 3V9UA 1IH7A 3TAGA 5AQVA 1NGIA 3KZBA 3RRGA 2ZD1A 2GBZA 3OW2M 4PUOA 2PAVA 2Q0RA 1EETA 5C15A 2FC0A 1WSHA 3RRHA 2KLAA 3DOKA 3IG1A 1QSSA 3AVGA 4OPHA 4CD1A 4CJSA 1VQ8N 4DTSA 2O8FA 4Y1CA 4FJGA 3L2WA 1FW6A 5HRSA 1OVQA 3C6AA 3MX5A 1YIJN 4KH4A 2F8SA 2E2NA 1JXBA 2NZTA 4H5WA 4BR2A 2Z1HA 3NH1A 4YOTA 1VSIA 4I6MA 4DQSA 4I6MB 1HRHA 1RILA 2VQFK 4O0IA 4GVMA 4RCHA 1S22A 4B3OA 3V1OA 4E1JA 4WFNL 1VQON 3VESA 2O8EB 3THYA 3DLEA 2KHOA 3THYB 2P9UB 1ASVA 5AQFA 1SL2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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