5AQQA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqqA04
4WQ5A 3C0BA 4H0OA 3WXKA 3C7NA 3VEWA 2P9IB 3U8XA 5JMVA 4PKGA 1NGFA 1NGCA 4H5NA 4BRMA 5BRFA 3MK6A 1IJJA 3UKRA 3VENA 4FOEA 4BR2A 3SK3A 3MMVA 4EHUA 1HKBA 3CJBA 3ULEB 1NBWA 3EL2A 4BC4A 3B8AX 1C0GA 1S22A 3FZMA 3I33A 2P9UA 4JD2A 4EFHA 1Z6RA 4BVOA 3BP8A 1BU6O 4Z94A 1BWFO 4K25A 2FSNA 2E1YA 2GWJA 1NGDA 3TU5A 4BR0A 2E2NA 3WXIA 1QQOA 4K42A 4CBXA 2IIRA 4MO4A 3ENOA 5ADXA 1BO5O 1DEJA 5BPNA 3P4IA 3SLCA 1K8KA 5AQOA 1NGHA 1QQNA 4A62A 2FF6A 5AQGA 1TUYA 1OKJA 1T6CA 5AFUH 4CD1A 4AM6A 3D2FB 2QWMA 3L4IA 1ZXOA 4O5FA 3DWLA 4FWOA 4CZLA 1JCEA 4JAXA 3RSEA 3LDNA 2QWLA 3WQUA 1BG3A 5AQSA 4WYBA 1RDWX 2H3GX 2A42A 2OANA 3M1FA 1HKCA 1NM1A 4XEIA 4BRPA 2E1ZA 2WUSA 3CETA 4WQ4A 1C0FA 3UKRB 3HBTA 4H03B 1NMDA 1SAZA 3VESA 4YDUC 2GTDA 1G99A 4IXCA 4JN4A 5BN8A 2P9UB 3IFRA 4FWRA 4BRFA 2J4RA 3BF1A 3JS6A 3LDOA 3CQYA 5LY3A 1KAZA 2D0OA 3O6WA 3QBXA 3M6GA 4AM7A 3BUZB 3ULEA 3D7EO 2CGLA 4M7XA 5AQIA 3HTVA 4CZEA 5FPNA 4F9OA 3EKUA 4DCHA 3VEXA 2QWNA 4H5TA 4B1VA 4BR5A 5JLHA 4A61A 4DHYA 1MWMA 3VEZA 2PAVA 4ISGA 2YCHA 3MN9A 3O08A 1BDGA 1XUPO 4BRDA 1XC3A 3ZEUB 3UE5A 1X9JA 1GLBG 4GY2B 5KQDA 4H0YB 2BUPA 5AQNA 5AQWA 4CI6A 4BQZA 2YHYA 3WT0A 2HF3A 1RFQA 3O1BA 1GLAG 5I9EB 4I6MB 3HM8A 4PL7A 5AZIA 2Q2RA 3EZWA 4QS8A 2IVNA 2ASMA 2UYTA 3MN7A 4YDUA 2YJEA 3ATUA 2ASOA 3GBTA 3UKUB 4NO7A 2P9NB 1GLCG 2D1KA 1J6ZA 4ISFA 2E8AA 2P9PB 2P9SB 5BR9A 4RTFD 3A5LC 3H1VX 4O8KA 4PKIA 1T44A 5F1XA 3H3OB 3BEXA 5E84A 4EAHD 1ZC6A 4WQ4C 2I7NA 3WXJA 4FWPA 1E4FT 5EOYA 5AQFA 5F2RA 4K43A 1NGIA 1NWKA 2VCPA 5EY4A 3AY9A 1SZ2A 1NGAA 3A8YA 3R9PA 2FSKA 2E2OA 3UB5A 2W40A 4BC2A 1LCUA 3U4LA 3H6EA 3QFUA 3S41A 5KPZA 3CJ1A 2E2QA 4XH4A 1BA1A 3HZ6A 3SMPA 1GLJO 3WQTA 2Q0RA 5BRHA 4FWKA 3VOVA 4M7YA 4FOIA 1D4XA 4QS9A 5AR0A 5BRDA 2A41A 3H3NO 4RCHA 4BG9A 2Q1NA 5AQJA 5BPMA 5AZIB 4B1XB 3LDQA 4L3QA 2QW9A 2D4WA 1HPMA 3ZEUA 3CJ7A 5AZJB 3L6QA 3VEYA 1HLUA 1MWKA 4ISEA 5BREA 2ITMA 1YXQA 1QQMA 2FLOA 4E1JA 1BUPA 2V7YA 2CGJA 2YHXA 4I6MA 3FR0A 4QS7A 5ADXH 1YVNA 2VYPA 3GG4A 4BRHA 4H5VA 4BRNA 1ZBSA 5E26A 1SQKA 5LJVA 3H1QA 3HSCA 4BRQA 1GLEG 2Q36A 3GE1A 1HX1A 3UKUA 2P9NA 3KVGA 4CZKA 1U6ZA 4H5RA 1GLLO 4PKHA 2V7ZA 2P9PA 4BR9A 3U9DA 2P9SA 4H5WA 3CJCA 2IVOA 1KAXA 1ATNA 5AQKA 3MCPA 4BROA 5AQXA 4HWIA 4FPBA 3ZX0A 4GNIA 5BN9A 5FPDA 3AAQA 3VGKA 4K41A 3U9ZA 2ZGYA 4FWSA 3M3ZA 2AA4A 4DB3A 4C23A 3A0IX 2BTFA 4A2BA 4BGBA 1V4SA 3VERA 3KZBA 3I8BA 2P9KB 2ASPA 1Q18A 4CZFA 3VPZA 1X3NA 5F0XA 3FE1A 1ATRA 4BR7A 4MO5A 3W3DA 4IZ9A 4BC3A 5KQ8A 2QWQA 3CIPA 3DXKA 1DKGD 4B1ZA 2Q97A 4EIAA 3ID8A 3W0LA 2V51B 1ESVA 3JXUA 3EO3A 3VGLA 4BRAA 1QHAA 4IJNA 4EHTA 5KPRA 2QWPA 3FLCO 3QFPA 3FZLA 4BG8A 3VETA 4H0XB 3FFKB 1X3MA 2A3ZA 2Q0UA 4NB4A 4PL8A 5AZJA 1HUXA 4FWLA 5AQRA 5AQQA 2D0PA 2HMPA 1S3XA 3A5NC 2A40A 2DPNA 3IDHA 2YHWA 4FWMA 4CZHA 3LDPA 1MA9B 3BF3A 1CZAN 3LDLA 2CH5A 2NLXA 2CH6A 2AP1A 4BR4A 3QBWA 3VGMA 2ZWHA 3WXLA 2FXUA 3O1WA 1GLDG 4BRLA 3EKSA 5LJWA 2YJFA 3F9MA 2HOEA 3L0QA 3G25A 1XQSC 1IG8A 3VF4A 2HF4A 3CERA 3QMLA 3QICA 4LC9B 2I7PA 5AFUA 4B1YB 2QXLA 3DXKB 3A5OC 1NGBA 3SJHA 1GLFO 3DXMB 4JNEA 1MDUB 3CHWA 1YAGA 4BRCA 4FL9A 5ELZA 4M63C 1T6DA 2P9KA 3ZX3A 2P9LB 3ENHA 3ZX2A 3O4WA 1JCFA 2IVPA 2F9WA 2F9TA 1KXPA 3FZHA 3A5MC 1P8ZA 3H45C 3O80A 5KPTA 2A5XA 4CZMA 5AQLA 3D2EB 2FSJA 3KHYA 1HJOA 3FGUA 3QDKA 3CJ9A 1HKGA 3AARA 1H1VA 1TUUA 1V4TA 3VF6A 4BQLA 1DGKN 1NGJA 5AQPA 4CBWA 1WOQA 5AQMA 4BRIA 3J8AA 5JLFA 3WEEA 3LM2A 2GUPA 1NGEA 1BOTO 3O8MA 1NGGA 4DQ8A 5AQZA 4BRGA 2GEMA 3ZETB 4Y0WA 5AQUA 5AQVA 2EWSA 4BVPA 1U2VA 3CQXA 3IMXA 3C7NB 4FPAA 2E2PA 2E20A 4HTLA 4B9QA 2V52B 3VEOA 2KHOA 2GELA 4JHDA 3VEVA 3CI5A 3R6MA 3GL1A 1TYQA 4BC5A 2ZF5O 3MN5A 5TKYA 3MDQA 4CBUA 4JD2B 5FPMA 3TPQA 3IUCA 4WQ5C 4B1UB 1EQYA 1Z05A 1R59O 2P9IA 4XH1A 3HI0A 4BREA 2GWKA 4FWQA 4MLEA 2FF3B 3CJAA 1QZ6A 5AQHA 1E4GT 3VF2A 3R8EA 5FPEA 3EN9A 3AAPA 2E88A 1RGIA 5EXWA 3DXMA 3LL3A 4CZIA 3LM9A 1K8KB 3ATVA 4IWVA 5B8HA 4FWNA 2VWBA 3DAWA 4J8FA 4H0TB 5EX5A 2CGKA 2P9LA 3OHRA 2A6AA 4IO8A 2ZGZA 5EVZA 3WUHA 1LOTB 5CE3A 1KAYA 4H0VB 2NZTA 4A2AA 1WUAA 1BA0A 3MN6A 4H0PA 3WEEB 2Q31A 4MLHA 3SMSA 4BGAA 3RSEB 3GOIA 1Y64A 1QZ5A 3H46O 1NLVA 2W41A 1YUWA 4CZJA 3D2EA 5AQYA 4FSVA 2QM1A 1U2VB 2YI1A 3O5BA 3DJCA 3D2FA 4KBOA 2PBDA 4IJAA 2NRHA 4BRKA 2QWRA 4FO0A 4JHDB 4RWTA 3FZKA 3GDQA 5BPLA 4B1WB 3QB0A 1ATSA 3FZFA 1TYQB 5AQTA 4CD3A 4CZGA 3ZETA 1JCGA 4XH5A 5JICA 4CJ7A 2QWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYAA 3CXCM 4WQ5A 3C0BA 4DTSA 3WXKA 4BECA 4UY8O 2HMIA 3VEWA 2P9IB 3U8XA 5JMVA 2D0CA 4AQYK 1NGFA 1RT4A 4YOXA 3HYFA 1RTDA 3NF8A 1L3VA 1BCOA 4C8LA 5BRFA 4UJ0A 3PLAA 4DUYK 3UKRA 4BR2A 4FOEA 3QEPA 4AHCA 3QETA 3PO4A 1HKBA 3CJBA 3E9LA 3KOYA 2LY6A 3EL2A 4KPYA 4Z4IA 4I9QA 3I33A 4CQKA 1C0UA 4IG0A 4JD2A 4KHSA 4E7HA 2QK9A 2ASCA 4ILGB 4LH5A 2FBYA 4K25A 3HJFA 2E1YA 3TU5A 3MECA 1IKXA 1HR0K 3O3FA 4DQPA 3O4QA 4MO4A 4OKEA 3K5LA 1JZAA 1DEJA 3OYGA 5BPNA 3QO9A 3SLCA 2O8DA 2FF6A 4DLEA 5AQGA 1RBSA 5C42A 3L3VA 4MQ3A 3G6EN 4LH4A 2QI2A 1HJRA 1QVGM 4W5QA 1XI1A 3KWGA 1IBKK 1JLQA 4JAXA 1U04A 3SYZA 3LDNA 4CHQA 5CZ1A 4ZHRA 3L3UA 4LF8K 1EO1A 4WYBA 1C1CA 3AA3A 3SAFA 4N5SA 2ZJRL 3G71N 4DSLA 3K2PA 2E1ZA 2WUSA 3CETA 4FLXA 2YNFA 4F8RA 1SN4A 1VSKA 1SAZA 4YDUC 2YX6A 1G99A 4HCCA 4IXCA 5BN8A 1UA1A 2N66A 3HP6A 3T3FA 4MFBA 2UUCK 3J7AP 1RTIA 3BK3C 4ID1A 1XHZA 3BF1A 3JS6A 3LDOA 4DSIA 4AHUA 1I94K 1L3TA 2F8TA 3ULEA 3HT3A 3OYNA 1YJNN 2NRZA 5FPNA 4U7BA 4F9OA 4CHZA 4X66K 3EKUA 1TAQA 1QSYA 3ID6A 2QTDA 3VQQA 3NVMA 4DHYA 3O9RA 1VQ7N 3J81O 3THXA 2ATQA 2O8EA 3CC4N 2YCHA 4NYNA 3MN9A 3O08A 1BDGA 1XUPO 1T0ZA 3P38A 4B8AB 1XC3A 4CJEA 1PE4A 2VWKA 4AB0A 4H0YB 4EZ9A 5AQWA 5AQNA 2HF3A 4J2AA 3SUOA 3VQ5A 1GOCA 4I6MB 3HM8A 4AAZA 1SL2A 4QS8A 2IVNA 1X1PA 3KKRA 2WOMA 4YDUA 3WNFA 3JAMO 3QNOA 2BH1A 2P9NB 4KTQA 2D1KA 3AVIA 5FLXO 1J6ZA 1ILYA 4KTZA 1I6FA 4JI5K 5IT9O 1U48A 1L4VA 5BR9A 3KK1A 3H1VX 4DTOA 5E84A 5KRSA 4EAHD 2Z1HA 2G8VA 3WXJA 2BRZA 3OVNA 3SQ1A 5J1EA 3TR8A 3Q7BA 2VCPA 2M8BB 5J2PA 3R9PA 1FK9A 3E9OA 4DV1K 4IOCL 1N6QA 2E2OA 3IS9A 2W40A 4BC2A 1KVAA 1CLQA 3LAMA 1YTAA 3AVCA 1GLJO 3WQTA 2Q0RA 4JV5K 3G4SN 1VSFA 3OYBA 2ATBA 2Z1GA 4OPJA 3VOVA 4M7YA 1C55A 4CEFA 1TI5A 1D4XA 4QS9A 2NNWA 4RCHA 1RCHA 5H1SQ 4BG9A 5BPMA 5AZIB 4B1XB 4L3QA 3NH1A 3P1GA 1BK8A 1NRBA 1E3MA 4CHPA 1YIJN 1HLUA 3P31A 4ISEA 5KGXA 1SN1A 2YIOA 2BANA 2CGJA 2YHXA 4LF9K 1ZYVA 3ZSRA 4CF9A 5KGWA 2VYPA 4BRHA 3SBTA 4A57A 2XY5A 1NMNA 5E26A 2G8UA 3OA9A 2NUBA 2IAJA 3GE1A 3UKUA 3TTCA 4H5RA 2V7ZA 1U49A 1Z26A 1RT2A 4FZYA 4H5WA 2D0AA 3CJCA 1RT1A 1RDDA 4BROA 5AJ3K 3SAHA 4W5OA 3V9SA 2FBVA 4C1NI 4GNIA 4OKKA 5BN9A 4K41A 1W9HA 5HRSA 3KD1E 1VQ8N 4BACA 3SPZA 4BGBA 3R3LA 1V4SA 3I8BA 3OBYA 4PUOA 2ASPA 3D6RA 5GAGP 3V6DA 4O55A 4DTJA 4IZ9A 5KQ8A 3CIPA 1SEGA 3DXKA 4DU4A 4EIAA 3VQPA 4LSNA 1WB9A 3ID8A 4YOUA 1ESVA 2E0HA 1JL2A 4FJ5A 1T8EA 3EO3A 4JKBA 1QHAA 1T7BA 4KH5A 3KLIA 3VETA 4H0XB 3FFKB 3SUNA 4K8ZA 1YTUA 4AEIA 3CFRA 5M1FA 5AZJA 5GINA 4FWLA 5M1QA 4DUZK 4CK1A 1U45A 4IDKA 2O8FA 2HNZA 4I9LA 2AJQA 4FWMA 1VSIA 4CEZA 3LDLA 5C12A 2CH5A 4B9MA 2AP1A 4BR4A 3E1YA 2RF2A 4WFNL 1KLNA 2ZWHA 1SKRA 1Q9XA 4WE1A 1ZYQA 3PX4A 2FXUA 4CJ4A 1GLDG 1W97L 2G8WA 2OYQA 5LJWA 4CJ5A 4ZTFA 3G25A 3VF4A 3CERA 4GV6A 2EX3A 1TVRA 4CF8A 1TV6A 1LAVA 1GLFO 1KRPA 1WLJA 1MDUB 3OYCA 2RN2A 4BRCA 1P90A 4JS5A 1T6DA 5TKWA 3HK2A 2JLEA 4DQSA 4FZZA 5M1OA 1EWRA 3BZKA 3V9UA 2YBRC 3A5MC 1P8ZA 2A5XA 3ZSYA 3KHYA 3AVNA 3LPUA 1HQUA 4M3WA 1HMVA 4GKJK 1PTXA 5AQPA 2HBJA 1WOQA 2MBKA 4OPHA 3ITHA 4BRIA 5JLFA 5CR4A 3PO5A 3LM2A 1IBLK 4KHNA 1BOTO 5KRTA 4DQ8A 5AQZA 3ZETB 4Y0WA 1OH5A 4DFMA 4O8UA 4BVPA 4ELVA 4NCBA 3Q7CA 2UUAK 2E20A 5SWMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OYA A;  3CXC M;  4WQ5 A;  3C0B A;  4DTS A;  3WXK A;  4BEC A;  4UY8 O;  2HMI A;  3VEW A;  2P9I B;  3U8X A;  5JMV A;  2D0C A;  4AQY K;  1NGF A;  1RT4 A;  4YOX A;  3HYF A;  1RTD A;  3NF8 A;  1L3V A;  1BCO A;  4C8L A;  5BRF A;  4UJ0 A;  3PLA A;  4DUY K;  3UKR A;  4BR2 A;  4FOE A;  3QEP A;  4AHC A;  3QET A;  3PO4 A;  1HKB A;  3CJB A;  3E9L A;  3KOY A;  2LY6 A;  3EL2 A;  4KPY A;  4Z4I A;  4I9Q A;  3I33 A;  4CQK A;  1C0U A;  4IG0 A;  4JD2 A;  4KHS A;  4E7H A;  2QK9 A;  2ASC A;  4ILG B;  4LH5 A;  2FBY A;  4K25 A;  3HJF A;  2E1Y A;  3TU5 A;  3MEC A;  1IKX A;  1HR0 K;  3O3F A;  4DQP A;  3O4Q A;  4MO4 A;  4OKE A;  3K5L A;  1JZA A;  1DEJ A;  3OYG A;  5BPN A;  3QO9 A;  3SLC A;  2O8D A;  2FF6 A;  4DLE A;  5AQG A;  1RBS A;  5C42 A;  3L3V A;  4MQ3 A;  3G6E N;  4LH4 A;  2QI2 A;  1HJR A;  1QVG M;  4W5Q A;  1XI1 A;  3KWG A;  1IBK K;  1JLQ A;  4JAX A;  1U04 A;  3SYZ A;  3LDN A;  4CHQ A;  5CZ1 A;  4ZHR A;  3L3U A;  4LF8 K;  1EO1 A;  4WYB A;  1C1C A;  3AA3 A;  3SAF A;  4N5S A;  2ZJR L;  3G71 N;  4DSL A;  3K2P A; 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