1BDGA

Hexokinase from schistosoma mansoni complexed with glucose
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
445
structure length
444
Chain Sequence
b'FSDQQLFEKVVEILKPFDLSVVDYEEICDRMGESMRLGLQKSTNEKSSIKMFPSYVTKTPNGTETGNFLALDLGGTNYRVLSVTLEGGKSPRIQERTYCIPAEKMSGSGTELFKYIAETLADFLENNGMKDKKFDLGFTFSFPCVQKGLTHATLVRWTKGFSADGVEGHNVAELLQTELDKRELNVKCVAVVNDTVGTLASCALEDPKCAVGLIVGTGTNVAYIEDSSKVELMDGVKEPEVVINTEWGAFGEKGELDCWRTQFDKSMDIDSLHPGKQLYEKMVSGMYLGELVRHIIVYLVEQKILFRGDLPERLKVRNSLLTRYLTDVERDPAHLLYNTHYMLTDDLHVPVVEPIDNRIVRYACEMVVKRAAYLAGAGIACILRRINRSEVTVGVDGSLYKFHPKFCERMTDMVDKLKPKNTRFCLRLSEDGSGKGAAAIAASC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEXOKINASE
publication title The structure of mammalian hexokinase-1.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
molecule tags Hexokinase
total genus 148
structure length 444
sequence length 445
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1998-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bdgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1bdgA01
3LDQA 4PKIA 2I7PA 5AQTA 2P9IB 5FPEA 1HX1A 4HTLA 5AQLA 5BREA 3D2FB 1NGEA 1ATNA 2IVPA 5ADXA 2CH5A 5LY3A 1BDGA 2P9UA 2P9UB 3ZX2A 5EX5A 3KZBA 1WUAA 3O1WA 1GLEG 3MN9A 3CHWA 2A41A 1NGJA 2ZF5O 3ZEUA 3H6EA 3EN9A 1X3NA 3BEXA 4H5NA 3A5MC 3VERA 4LC9B 5B8HA 2W40A 1R59O 5FPNA 2V52B 3CQXA 1NGBA 4H0TB 1OKJA 4BRAA 3L4IA 2Q36A 1BWFO 4FWNA 3M6GA 4K41A 4CZIA 4HWIA 1XUPO 1MDUB 2P9LA 5JLFA 4PL7A 4JD2B 2P9KA 4BG8A 2A42A 1Z05A 4BRCA 1GLLO 3D2EA 1U2VA 1U2VB 4FWPA 1C0GA 2E2NA 3EL2A 1TUYA 3ZETA 3F9MA 3ZETB 4M63C 4IWVA 3FZLA 5AQRA 3EKUA 2YHYA 3QFUA 1NWKA 4CZMA 3ULEA 5F0XA 1QQOA 3VGMA 3ATVA 4FWKA 3U8XA 3H1VX 2H3GX 3LDPA 5E26A 4RTFD 1S22A 2ASPA 2VYPA 4BRHA 1SQKA 4JHDB 3WEEB 4FPBA 4JNEA 2KHOA 5AQSA 3MN5A 1Q18A 2A3ZA 4BG9A 5KPZA 4B1VA 4BREA 5BPNA 2GEMA 5F2RA 4DCHA 2YHXA 4FPAA 3UKUA 4BR9A 4CBUA 5ADXH 3RSEB 4IO8A 3EO3A 3O08A 3U9ZA 2E1YA 4ISFA 3FE1A 4GY2B 2QWLA 4FOIA 1K8KA 1K8KB 4BR7A 3WXLA 3I33A 3A5NC 4H0OA 1KAXA 4K25A 5ELZA 5EVZA 3FLCO 5AQYA 2ZWHA 3CQYA 4CD3A 3EKSA 1HJOA 4CBWA 1IG8A 1MA9B 2GWJA 1NMDA 1RGIA 3LDOA 4CZGA 2YJEA 1TYQB 3DXMB 4BC2A 3MK6A 1BA0A 1BG3A 3A5LC 1NGAA 2NRHA 1BO5O 1GLDG 3QFPA 4O8KA 4KBOA 3HI0A 3ZX0A 5KPRA 1XC3A 2GUPA 5AQIA 1ATRA 1HKGA 3QMLA 2Q0UA 5KPTA 3OHRA 4MLEA 4NB4A 4B1XB 2QM1A 4BRDA 4E1JA 5AQOA 4MO5A 1BA1A 1Y64A 2ITMA 1YVNA 2FLOA 2IIRA 4FOEA 4BVPA 3FFKB 2Q0RA 3LM2A 3GDQA 4JAXA 3SLCA 3BP8A 3MMVA 1BOTO 4B1UB 3M1FA 4BR0A 1S3XA 4EHTA 3DAWA 3FZHA 4IJAA 2E2PA 3AAPA 3AARA 4BC5A 1T6DA 5F1XA 1BUPA 4CBXA 2VCPA 3TPQA 4CZKA 1LCUA 1GLJO 1RDWX 3O80A 4YDUA 5AQPA 3U9DA 4FSVA 4BRFA 4QS7A 4CZLA 1KXPA 4A2AA 5AZIA 3ZEUB 3HSCA 1NGCA 3AAQA 4FWMA 5JLHA 1NGGA 4YDUC 2ASMA 4B1YB 4CZJA 2QWMA 4BC4A 3LDNA 2DPNA 1NLVA 3CJCA 2QWNA 3A8YA 1Z6RA 2Q2RA 1HUXA 1ESVA 5BPLA 2P9LB 5AFUA 1TUUA 3DXKA 1DGKN 2P9KB 2QW9A 2FSKA 1NGFA 3HTVA 5KQDA 1QZ6A 2AP1A 3CJAA 3D2EB 1YXQA 3VEYA 4ISGA 2ZGYA 1HPMA 3O4WA 1D4XA 1NM1A 5AQJA 4CZFA 1KAZA 5BRDA 3GE1A 4H0VB 4BC3A 3ULEB 4O5FA 4WQ5C 1ZC6A 2YJFA 3P4IA 3G25A 2IVNA 3EZWA 5AQQA 4BRLA 2EWSA 5LJVA 1H1VA 2QWOA 3J8AA 1V4SA 3CJ1A 4NO7A 4A61A 2BUPA 5AQUA 1T44A 3LM9A 3VGKA 5AQZA 3IMXA 5EY4A 4H5TA 3VEWA 4BRNA 4J8FA 4EFHA 4BVOA 5AQHA 2A40A 3HBTA 2NZTA 3W3DA 3SJHA 3D7EO 3UKUB 4BGAA 3W0LA 2GWKA 2FXUA 4ISEA 5FPMA 1J6ZA 3HM8A 3VEZA 1LOTB 2WUSA 4XH4A 1V4TA 3C7NA 4RWTA 1GLAG 4PKHA 4M7XA 4XH5A 3C0BA 1DEJA 1QZ5A 2F9WA 3MDQA 3FR0A 1HKBA 2P9SA 1T6CA 2P9SB 3ID8A 5AFUH 3CJBA 2E2QA 4Y0WA 3KVGA 3VEVA 3VEOA 4C23A 2CGKA 4GNIA 2NLXA 4WQ4C 3B8AX 2UYTA 4RCHA 2A6AA 2Q97A 3DWLA 4BGBA 4FL9A 3CETA 2FF3B 4H03B 3LDLA 2V7ZA 3FGUA 4QS8A 2P9NA 3SK3A 4AM6A 4PKGA 3KHYA 2OANA 3L0QA 4H0PA 5AQKA 4BRMA 3FZMA 4BQLA 5TKYA 1SAZA 3BF1A 4BRKA 1HKCA 3H46O 4BRPA 4XH1A 2E20A 2GTDA 3QICA 3VETA 3TU5A 1YUWA 3QBWA 2E2OA 3WUHA 1XQSC 3R9PA 4B9QA 5I9EB 4BROA 4FWRA 3R8EA 1IJJA 5CE3A 5BPMA 5AZIB 2GELA 2D4WA 1ATSA 3CERA 1JCGA 3R6MA 3DJCA 3WQTA 3H3OB 5BN8A 3M3ZA 5AQWA 2P9IA 2F9TA 3S41A 1BU6O 3D2FA 5AQNA 1P8ZA 1SZ2A 3A0IX 4JN4A 1EQYA 3QBXA 2HMPA 3A5OC 2A5XA 1G99A 3DXKB 1E4GT 1E4FT 2CGJA 3I8BA 3ZX3A 4EAHD 4H5WA 2PAVA 1GLCG 1RFQA 1HLUA 3VF4A 2V51B 2Q1NA 3CIPA 2FSNA 4WQ5A 3H45C 1NGIA 3ENHA 4F9OA 2AA4A 1C0FA 3GBTA 4FWOA 1NGHA 2QWQA 4MO4A 4IXCA 1JCEA 3VPZA 3O8MA 4CJ7A 5FPDA 4JD2A 5AQFA 4K43A 1DKGD 2QWRA 4FO0A 3VEXA 5JMVA 3QB0A 5AQGA 3O5BA 4B1ZA 4BRGA 2VWBA 3GG4A 2ZGZA 1QQNA 3ENOA 1QQMA 3WQUA 4BRIA 4H5VA 2E88A 2ASOA 3BF3A 2J4RA 4M7YA 4BRQA 5AQVA 2YI1A 5AR0A 5KQ8A 4A2BA 4MLHA 3HZ6A 3QDKA 5AQXA 4CD1A 3GOIA 1WOQA 4CZEA 4CI6A 3FZKA 1U6ZA 3IUCA 4DQ8A 2BTFA 4JHDA 3WEEA 4BR4A 2P9PA 2P9PB 4BQZA 5BRHA 4CZHA 3AY9A 2HF4A 5AQMA 1JCFA 3C7NB 3WT0A 3LL3A 3O6WA 3L6QA 4A62A 2D1KA 3WXIA 4XEIA 3H1QA 2D0OA 2E1ZA 3VESA 1NBWA 3VGLA 3MN7A 2QWPA 3MCPA 4AM7A 1X9JA 2IVOA 3JS6A 3UE5A 3VENA 3RSEA 2YHWA 3MN6A 5BN9A 5BRFA 3GL1A 4WQ4A 1ZXOA 3IDHA 1ZBSA 3IFRA 2D0PA 4K42A 2YCHA 4EIAA 2E8AA 4FWSA 3WXJA 3FZFA 1X3MA 3JXUA 2W41A 5EXWA 2PBDA 2CH6A 4WYBA 3UKRA 2FSJA 3UKRB 3SMSA 4Z94A 5LJWA 3WXKA 3CJ7A 2Q31A 2P9NB 2FF6A 2V7YA 5AZJB 5AZJA 1TYQA 3DXMA 4H5RA 3BUZB 5BR9A 3O1BA 1YAGA 4IZ9A 1MWKA 5E84A 3CJ9A 5EOYA 4FWQA 3VF6A 2QXLA 3VF2A 2HOEA 4QS9A 4I6MA 4I6MB 1CZAN 3CI5A 1GLBG 3UB5A 3ATUA 4H0XB 2HF3A 3U4LA 2I7NA 4EHUA 3SMPA 4FWLA 4B1WB 1QHAA 1NGDA 4IJNA 3VOVA 1MWMA 5JICA 4L3QA 4PL8A 2CGLA 4BR5A 4BR2A 1KAYA 4DB3A 4DHYA 4H0YB 3H3NO 1GLFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NJZA 1T05A 4PKIA 5AQTA 2I7PA 5FPEA 4LSLA 1LAVA 4FJ5A 3L2RA 5EX5A 2NRVA 3O1WA 4Z4CA 1Q86O 3NDKA 1S6PA 3CHWA 3OYMA 2ZF5O 2W42A 3EN9A 2O8EA 4KHUA 5B8HA 2W40A 3KLFA 2VWKA 1NGBA 4CHOA 1T8EA 1OVYA 2NRTA 1U4BA 3M6GA 4DTXA 5JLFA 4HWIA 3TSQA 2P9LA 3E66A 4PL7A 3HRGA 2OA8A 3TWHA 2VG7A 2A42A 4BRCA 3K5LA 1U2VB 1RT2A 4YFUA 1C0GA 3QETA 1WSFA 3EL2A 1BI4B 1I94K 3QFUA 2HVHA 3ULEA 4JI1K 5F0XA 3VGMA 4CFBA 2H3GX 2ASPA 3O3FA 3I0RA 3WEEB 1ZYQA 3NCIA 1VHXA 2NRXA 2A3ZA 1Z25A 1I3AA 3HSTB 4B1VA 4CEBA 5I42A 3CPWM 4K0KK 4FM1A 4CJSA 3DLHA 3CCRN 4DV7K 4CBUA 3RSEB 4OPHA 4IO8A 4C8OA 3FE1A 4M3RA 1J5EK 1T3VA 4GY2B 2QWLA 1K8KB 3TR8A 4BR7A 3ZSYA 3BY5A 4DQSA 1XWLA 4OPKA 3QEIA 2RPIA 4C8LA 5AQYA 4KREA 4CVNE 3G6EN 5C15A 1HJOA 2KKZA 4JKGA 1IG8A 3VTHA 3AGRA 4CBWA 3TI0A 2UUBK 1HNXK 2F8TA 1HNWK 1BA0A 2NRHA 1BO5O 4FJ7A 1A5WA 4O8KA 3HI0A 2ATQA 2E4LA 1W97L 4FM2A 2Q0UA 1KFDA 5C10A 2KLAA 4ELTA 1EO1A 4MLEA 3AVHA 4NB4A 3VA0A 3ZSRA 2ITMA 5HRNA 1WSHA 3U3GA 4E7IA 3HL8A 4JK8A 3BP8A 1BOTO 3KLGA 4EP5A 3ZT1A 1IO2A 1S3XA 3K5OA 4EHTA 4F2SA 3DAWA 2HSTA 2E2PA 2Z1HA 3G10A 3V4IA 4CBXA 4U7BA 1RDWX 3O80A 5CYQA 2VQEK 4FK2A 3L2VA 4FJLA 4FLTA 2FBYA 4F8RA 3WNGA 4A59A 1N32K 1SKWA 4B1YB 4F3OA 4M3WA 3L2QA 1NLVA 1A5VA 2Q2RA 1HUXA 1RTHA 1KSPA 1HYZA 1SV5A 2OYQA 1TUUA 3DXKA 1EWRA 1DGKN 2AP1A 3CJAA 3L3VA 4ISGA 3RMDA 3VQPA 1Q82O 3PY8A 3K5MA 4I7FA 3O3GA 4CJ5A 3NE6A 1NU0A 5FRMA 1K8AO 1CXQA 4JRQA 4DQRA 2YX6A 1X1PA 4BRLA 3D45A 1H1VA 4Z4HA 1SS6A 2QKKA 2BUPA 1T44A 3CQ8A 3VGKA 3IMXA 3NGIA 4BRNA 1RBUA 4J8FA 4GV9A 1NOZA 1EKEA 2DFFA 2A40A 3W0LA 1YTUA 4HUEA 4NCAA 1JXBA 2GWKA 3J7ZO 4DFMA 1SUQA 3O9TA 3EY1A 2Z1IA 1K73O 3NH2A 3CM5A 3TTFA 1C1BA 4KFBA 2WUSA 1L5UA 4CJLA 3I0SA 1TV6A 1WSJA 3KWIA 4PKHA 4DSEA 3O4NA 1DEJA 4FJ9A 4W5NA 2P9SA 4CF0A 3ID8A 4DR6K 1EP4A 3CD6N 3CJBA 4KRFA 3KVGA 3ENBA 5LL6Z 3T3FA 3LWMA 2NLXA 3JAMO 2ZJRL 4RW8A 3IAYA 4BGBA 3J81O 3DWLA 4Q5VA 3CETA 2D0CA 2DFHA 3CPEA 2FF3B 4H03B 1ASVA 2V7ZA 1N6QA 2ZM6K 4QS8A 3RR8A 2P9NA 3SK3A 1TAUA 4HVJA 4H8KA 3HO1A 4YOUA 3MWPA 3QIOA 4BQLA 1X9SA 3BZKA 3HJFA 4BDZA 1HKCA 4CEAA 5JS2A 1KCFA 3AVCA 4IEIA 3VETA 1YUWA 1ILYA 1XQSC 2E6LA 4LH4A 3TANA 1QVFM 1P90A 4FWRA 1HNIA 1VQ4N 4CW7B 5BPMA 2OPSA 4BWJA 1RTDA 4YOTA 4AH9A 3R6MA 3DJCA 1WAFA 3WQTA 3QEWA 4B9LA 3M3ZA 3V9SA 3OS2A 1Q7YO 3A0IX 4RW9A 3HVRA 4MDBA 2HMPA 1N5YA 4DTOA 3TAMA 3OYHA 1E4GT 1E4FT 3P31A 3ZX3A 4FLUA 4KHSA 1VSIA 2PAVA 1RFQA 1JLFA 4CJUA 2HNYA 2V51B 1TVRA 3LALA 2FSNA 1YJWN 4DFJA 1NGIA 3ENHA 3WNEA 3GBTA 3KD5E 1NGHA 3I8DA 4BDYA 1NK4A 1VRUA 4CHNA 3C6UA 4Z0UA 3IG1A 1WBBA 1ZBLA 4CGIA 3QEVA 5AQGA 4J2DA 1YIJN 1NKBA 2VWBA 3RRHA 2ZGZA 3ENOA 1BI4A 3O9UA 1WB9A 3AA4A 2O8CA 2E88A 4KHYA 2YI1A 1TK0A 5KQ8A 3NF8A 3OYIA 3GOIA 4CZEA 4CI6A 1UWBA 3FZKA 4CJRA 2X78A 5M1KA 2OZMA 1HJRA 2NRZA 3WEEA 4BQZA 4JKAA 3WNHA 4CZHA 3AY9A 5T7BA 3ITHA 3VMFB 1RNHA 3V9WA 4DSLA 1I39A 3LL3A 1KQSM 2E1ZA 3PX6A 1NBWA 3MCPA 3SPZA 1NKCA 5HOOA 1O1WA 5CR4A 3RSEA 1C0UA 5BN9A 4ILGB 3GL1A 4WQ4A 4FLZA 3KWGA 5M1QA 4HTUA 1WSIA 1A5XA 4AHSA 1GOAA 1J5OA 3WXJA 4FJ8A 3AVJA 1NK9A 2IGIA 4KV8A 1RBSA 4DV0K 3NMUA 4AHTA 1TKZA 4WYBA 1TGOA 3HPOA 4E89A 2JGUA 2FSJA 5C2FA 2Z1GA 2Q31A 5MLCQ 2FF6A 2NRRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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