3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
3PIOL 3DLLL 3PIPL 3G71N 3CCUN 3CCVN 5DM7L 3CCEN 1YJ9N 3J7ZO 4WFAL 3CXCM 1S72N 5JVGL 1YI2N 4WFNL 3G4SN 1VQON 1K73O 5DM6L 3CC4N 1M90O 4WCEL 3CPWM 1Q82O 5JVHL 5GAGP 1YHQN 3CCSN 1Q81O 3CCLN 1VQPN 1VQMN 3CCRN 1KD1O 1VQ9N 2OTJN 1W2BM 2ZJPL 4IOCL 5GAHP 3CMEN 5H1SQ 3CMAN 3CD6N 1VQKN 1ILYA 5GAEP 1NJIO 3CC7N 1Q7YO 1VQ6N 1JJ2M 4UY8O 1QVFM 3CCMN 4IO9L 5GADP 1N8RO 4WFBL 1VQLN 2QA4N 1K9MO 1OVYA 2OTLN 1K8AO 5HL7L 1VQ8N 1YJWN 4U67L 1YIJN 2QEXN 3G6EN 4WF9L 2ZJQL 1M1KO 1Q86O 5MLCQ 1KQSM 4IOAL 3OW2M 1QVGM 3CCQN 1VQ7N 3I56N 1VQNN 1VQ4N 1VQ5N 2ZJRL 1YJNN 3CC2N 3CF5L 3CCJN 3I55N 1YITN 1KC8O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUOA 4LFAK 3WXMB 2FF3B 3BZKA 4KTWA 4LFBK 5DM7L 4JLHA 3UKUA 4HTLA 4KHSA 4RTFD 1MU2A 3CJBA 1BA0A 3D6RA 3VQQA 1XHZA 1S22A 1VRTA 4CECA 2FXUA 3DAWA 4H5VA 1IV0A 3V6DA 2HOEA 5AZIB 3N4QA 4A57A 4BRGA 2ZF5O 4FWKA 3ASMA 4E89A 4Z4CA 4JHDB 4BG8A 1DLOA 4O4GA 4MDBA 1N32K 1T3VA 5FRNA 1YTAA 4RCHA 1ZBFA 4PHTX 3H3NO 3G0ZA 4CBUA 1ZBIA 4FLVA 5HRRA 4YOXA 4CBXA 4FJGA 4CJ4A 1BL3A 3G25A 3OVNA 2UU9K 4DV3K 1NGJA 4G1QA 2NRVA 3C95A 5C15A 3WNGA 1QZ6A 3QBXA 3V4IA 3R3LA 1VQKN 4DUYK 2QWOA 4AHRA 2G8UA 4B9SA 3ATUA 2YKNA 2RHKA 5HROA 2RKIA 4DKWA 1NGIA 4ILHA 1LW2A 3SCXA 2W41A 1BGXT 3ZX3A 4FOEA 5KGXA 3Q7CA 4IO9L 3SZ2A 1NMNA 3QINA 2OTLN 4JHDA 3P83D 5IT9O 3UKRB 3OY9A 4ISFA 3DLRA 3QEPA 1NG9A 3VEVA 3EL2A 1BIZA 4WF9L 5CR4A 1RBSA 2F8SA 1LAWA 4AHUA 3KVGA 1O13A 1Q86O 2P9IA 1TL1A 1JXBA 3SMSA 3ZT0A 3MN6A 4BVOA 4HVJA 5AZJB 4N76A 4NCAA 4FW1A 4DSFA 3MN7A 5KQDA 3HM8A 5C42A 3SAGA 1RTIA 4E1MA 4MO5A 2HHQA 3M3ZA 4AM6A 3NDKA 4CJQA 1WAFA 3ZETB 2P9PB 5LJWA 3QBWA 4DV2K 4KHNA 4B9VA 3F9KA 1J53A 3SLCA 1DEJA 4Y1DA 4KFBA 3I0SA 4WFAL 3TAGA 4H0VB 1T7PA 2P1JA 4BR2A 3SPZA 4YOWA 5C0YA 1QZ5A 3VQBA 3AVKA 3CETA 4LSNA 4B1WB 3UKRA 2PFUA 4B3MK 3ULDA 4PY5A 5AQJA 3BP8A 2P9LB 4H0PA 1VSHA 3H3OB 4ID1A 1NGBA 1SUQA 5AZJA 5BRDA 3CPEA 3OHRA 3RSEB 3ALYA 3NGYA 4EFHA 4B3SK 3FR0A 2PYJA 1ZBSA 2YV0X 5BPLA 3WNFA 4CERA 3ENBA 3ZETA 3R8EA 2FSKA 2P9PA 3CMAN 3I33A 2FC0A 4Y0WA 1KLMA 1VSEA 3HOTA 2O8CB 1JCEA 4IG3A 2RE2A 4CJWA 4FPBA 3S9HA 4JI3K 1TUUA 1D8YA 4H0YB 4JKHA 4XH5A 5JLFA 3ZSZA 4CFAA 2P9NB 5M1KA 1KAYA 4CF0A 1OH6A 1OVYA 5C24A 4FWRA 3MECA 4W5QA 4CIEA 3QDKA 3O5BA 2D0PA 5HP1A 2P9LA 4FXDA 3ZLJA 5AQMA 2HB5A 3O3HA 1A5WA 4N41A 2ITMA 2DFHA 3TWHA 3EZWA 4FWQA 3O8MA 1X9MA 3RSEA 1D4XA 1X9SA 5F0XA 4B9TA 3PO5A 5C12A 1RT6A 4FJ5A 2G8IA 2HHXA 3CCJN 3I55N 2ASPA 2ZE2A 4CGDA 4Z4HA 1KFSA 2YNGA 1HKBA 1IBLK 4GW6A 1TV6A 3T3FA 5BN8A 3WQUA 2O8CA 5A2QO 4K0KK 1RGIA 1REVA 3CCEN 4LF9K 4W5OA 4CF1A 3L2QA 2GBZA 1XHXA 4CD1A 4M3WA 2XY5A 4ILJA 2ATQA 1X9JA 1BDGA 3BZCA 4K42A 1YVNA 1W7AA 2X74A 3U4LA 4CJPA 3K59A 1NJZA 4UQGA 2ZQBA 3HRGA 4CEZA 5J2PA 3D7EO 4EP4A 2E2OA 2QWRA 1LWFA 5JVHL 1YHQN 4WQ4A 3L3UA 5M1OA 4CW7B 3B6PA 5ADXA 4BRFA 1HUXA 2WBNA 4K8XA 1HYSA 3QEVA 3K2PA 1HJRA 4LF7K 1VQ9N 2YJEA 1HLUA 3ZSRA 4A62A 4CGGA 3JSMA 2HW3A 3JAMO 3CQXA 4MDAA 2F9WA 4M3RA 1U6ZA 3NE6A 1KAXA 4ELVA 5H1SQ 1D9FA 2OYQA 3SV4A 4I6MB 1EWRA 2HHWA 1SKWA 4F2RA 4DSEA 2G8VA 1O1WA 3HPOA 4IFVA 1WSJA 3ZSVA 3BF1A 2F8TA 1WB9A 2DTUA 4IEIA 4X66K 2QK9A 1BO5O 2GWJA 4IFEA 1QSYA 3S41A 3QO9A 4B9NA 3O9QA 2QA4N 3WT0A 3RRHA 4ILGB 3AVFA 4H0XB 4BROA 3M8PA 3OYBA 4FZXC 3PUFA 4PL7A 3LAKA 4CJRA 3CQ8A 3KLGA 4B9LA 4DFPA 3TI0A 1HQUA 2OZSA 4JKCA 1SAZA 2JGUA 2Z1HA 4IOAL 1XWLA 1WOQA 2KFNA 4JI5K 4FWLA 1WUAA 2ZJRL 4FJKA 2XY6A 1MA9B 4IDKA 1EX4A 1SKSA 1S1UA 3PIPL 3MN9A 4B1UB 3L0QA 4DV5K 3UB5A 1KXPA 3LDPA 1MWKA 4BRMA 1GLFO 2XY7A 2IS3A 4FO0A 5BR8K 1QS4A 4CI6A 4IDHA 3GE1A 1JLCA 4DR5K 3DXKB 3NF9A 3AVBA 3OS1A 4CZLA 4BG9A 1B9FA 4BRCA 1J5OA 4HWIA 2VG5A 2Y1JA 3VQ9A 3HOSA 3CC4N 1M90O 5I42A 1BQMA 5CZ1A 1KRPA 3JXUA 4H8KA 4WCEL 3EKSA 4QAGA 1JLEA 5TKYA 4H4OA 1HNIA 4C1NI 1JKHA 3P4IA 2Q0UA 1UA1A 1BHLA 5FPMA 4B9MA 2YX6A 3L4QA 3CFPA 4KHPK 4B8AB 4O0IA 4YORA 4KHWA 4NYNA 1HPMA 3L2VA 3OYEA 3QERA 1IJJA 4B1ZA 3E01A 3DXMA 2YNIA 3ENHA 1ZYQA 4U7BA 1U04A 4IKFA 3AARA 5LY3A 1QSLA 3O1WA 2P5OA 3NHGA 1OVQA 5KQ8A 1ATSA 2AJQA 1I94K 1IBMK 4OPHA 4H5TA 4AHVA 4CEBA 4JI8K 5T7BA 3U8XA 3IDHA 5F2RA 1K9MO 1GOBA 2AA4A 4A5AA 4IEEA 2DPNA 3T19A 4RW7A 1RCHA 4CHPA 1RBVA 1WN7A 4HUEA 3I56N 1RBTA 4BR7A 3FE1A 1VQ4N 3AVMA 4BC5A 4FZZA 3JYTA 3FZKA 2P51A 3MK6A 3LDSA 4JS4A 4F9OA 5I3UA 2Y1IA 3G71N 2ZGYA 1Z26A 3CYMA 3N4PA 4ELUA 2QWPA 2A1RA 3QNNA 5C10A 3HPGA 1A5XA 4DUZK 1VSKA 3J80O 3OBWA 3RMDA 4W5NA 3O08A 5BRFA 3KWGA 4FLXA 5JVGL 3TAPA 1GLJO 3KTQA 3K57A 3ZSXA 1NKCA 4CCHA 3H1VX 4XEIA 4BR4A 4RW9A 4RWTA 3ZT1A 3AVAA 5M1PA 1YF5L 4KI4A 4J8FA 4E19A 3C6AA 5AQFA 2KZZA 4FM1A 4KPYA 2VWKA 5FPEA 3VENA 3RR7A 3NH2A 2HHHK 3MWPA 5IWAK 4OVLA 1LWEA 1RNHA 2YHXA 3AVHA 5AQHA 2YCHA 3ZT3A 3ITHA 1E4FT 1CZ9A 3MWTA 1NU0A 4OGCA 1C0FA 5CYMA 3WEEB 4H5RA 3U3YA 1SV5A 3C7NA 1QHAA 3OBYA 3K9JA 3TABA 1FW6A 2O8FB 4DLEA 1HKCA 5LL6Z 4C8KA 4JKBA 4GV9A 3WNEA 1SS6A 2WONA 1NWKA 3MDQA 1JJ2M 2QKKA 3SAHA 4B3OA 3AA3A 4KRFA 2E20A 1VHXA 4NB4A 4FLWA 4RW8A 3QESA 4KREA 3V81A 3D2FB 3L3VA 2FSNA 3ULEA 3VTHA 4DTNA 4DS5A 1BWFO 1Q9XA 2NRZA 4DR2K 4CEQA 4AH9A 2J4RA 3SQ4A 3AVIA 3TAEA 1S9GA 3P31A 1HR0K 3OW2M 4AM7A 1ASUA 3M8RA 3AAQA 3VOVA 3A2FA 5AJ3K 4K41A 3O3GA 3V9SA 4JYAK 1SQKA 4OPJA 2O8BB 1TKZA 4BACA 3ZEUA 3QIOA 1IH7A 1VK0A 1TAQA 2R7YA 3T69A 4A59A 5KRSA 1NJXA 3J7AP 3VGMA 2O8EB 2O8FA 3QNOA 2CH6A 3SUNA 4JKDA 2W42A 4H0TB 5AQSA 4K8ZA 1WNSA 3VGLA 3RMCA 5AQZA 3LPUA 3TSPA 4BQZA 4RW6A 4BRDA 1ZXOA 1U48A 4FVUA 1J5EK 3W3DA 1IKVA 3A8YA 4JKGB 1QE1A 3HPHA 4JD2A 2HHSA 4BREA 1X3NA 2E6LA 1NJYA 1YUWA 4BRHA 1KD1O 3P1GA 5BN9A 3IMXA 2QWMA 3QFUA 1RDDA 3PX6A 5FLXO 4YHHK 3F9MA 2O8BA 3ZSYA 2QW9A 1NGGA 1EETA 4M63C 4CHYA 4DB3A 1NK8A 1BUPA 4CE9A 1HQEA 4B9UA 2VQFK 3PX0A 2VQEK 3OS0A 4CJLA 1RFQA 2FBTA 4CJEA 2HNDA 4CJ7A 3VEOA 2D0AA 1TL3A 4RG8A 3HYFA 3SNNA 1CZBA 2ETJA 2NNWA 2E5LK 2BTFA 4WYBA 4M7YA 2XRIA 5AFUH 2E88A 3LDNA 3T7ZA 4KO0A 3UIQA 5M1FA 3PO4A 4OPAA 4LF6K 3VERA 3AO5A 3M5RA 3ZSOA 4JS5A 2V7YA 4DQQA 3LM9A 3THVA 4DSIA 1JL2A 3NVKA 4CHNA 3OYLA 2IIRA 3TSQA 1KQSM 3NF7A 3I8BA 4PKIA 3AVCA 2UYTA 4AHCA 5AZIA 3OYGA 4V19S 3R1XA 2KW4A 3AO1A 4DTRA 3HO1A 4KI6A 5J2QA 1EP4A 4C8NA 2Q2RA 4C8LA 5FRMA 4G9ZA 3AVGA 1NGEA 3V9XA 2IDOA 4LC9B 1N5YA 1C6VA 1DT9A 2E4LA 5SWMA 5CY4A 4NXNK 3CERA 4FWNA 3MEEA 1IO2A 2QXFA 4FLYA 3LWLA 4MFBA 3LANA 5FDLA 5FROA 1WSHA 3NCIA 4NCGA 1ZBUA 1YT3A 2P9UB 4BRAA 1N6QA 3OJSA 2X6NA 3CCSN 4A2BA 3CCLN 1VQMN 1S9EA 4BQLA 4BRPA 1YTUA 2JWLA 1GLCG 3S3NA 1VSLA 3MXIA 5BR9A 4WQ5A 2ZJPL 4YFUA 3S3MA 2G8HA 3SYZA 4FJLA 2QWQA 5FPDA 3C6TA 5EXWA 3A5NC 1XUPO 4BGAA 1NJIO 5EVZA 4X64K 3MEGA 2O4GA 1NGHA 4TSXA 4CHOA 3V1OA 4PL8A 4AF1A 4DSJA 4OLBA 5CYQA 4BRQA 3K5NA 5GADP 3O9RA 4M3ZA 5CHIA 2NRRA 1K8AO 5GINA 4F2SA 5HL7L 4F4KA 3EKUA 3WUHA 4U67L 1V4SA 1NK4A 4DV7K 4YOTA 4DG1A 3NF6A 5HRPA 3IG1A 1M1KO 4KAZA 3C6HA 3HI0A 2QWLA 3CCQN 3DYAA 2QXLA 5JLHA 2WFBA 3P5JA 1BOTO 1UA0A 4KB1A 4BRLA 1KC8O 4BC4A 4Z4EA 3WXIA 2WUSA 3VF6A 1VSJA 3LZJA 4CHQA 3VEXA 4B3RK 4H03B 2QKBA 3NBPA 4HCCA 3CJ9A 3EY1A 1S72N 3SJJA 4DLGA 1VSMA 2VYPA 3HP6A 2DFEA 3D0PA 3O1BA 1ESVA 5AQWA 2YHAA 5F1XA 3AVJA 4CBWA 4W5TA 4HCBA 4MQ3A 3QEXA 2YNFA 4B1XB 4O44A 4PKHA 3TTCA 4PQUA 1KTQA 1J6ZA 4FLTA 4I9LA 3IUCA 1V4TA 2A41A 4DTUA 4JK9A 1I3AA 4CJ5A 5AQGA 3VEZA 4OO1J 1WLJA 1D5AA 2X6SA 2P9NA 3FZHA 4OKEA 3K0SA 1W2BM 3M6GA 4BVPA 1HNVA 2FBVA 1UWBA 1EKEA 4E7HA 1OKJA 3LZIA 1BQNA 4CFCA 5GAHP 2HF3A 5GIPA 2CGKA 1G99A 3C65A 3ZYYX 4BC3A 4LF4K 3C0BA 4EP5A 2I7NA 2GWKA 1RT7A 2UXBK 4JEPA 1NK9A 1WSGA 4ID5A 1N36K 1VQLN 1HNWK 1QHTA 3VA3A 4CFDA 4CJVA 4JK8A 3E9PA 1VAZA 4C1NK 4IOXA 4BE1A 1FXXA 4NLCA 1NOYA 1KAZA 4FJ9A 2GUPA 3MCPA 1NOZA 1RTDA 3HZ6A 3EEQA 4A2AA 5KPRA 5KI6A 3TARA 1VQ5N 1HNZK 3V9ZA 4M45A 3L8BA 4FJHA 5AQPA 1NGAA 2LSNA 4FK2A 3SK3A 2V51B 3PIOL 4O5BA 2ASMA 4M42A 2E1ZA 3SQ0A 3E1YA 1W9HA 3OS2A 4BDYA 2HSTA 1NLVA 4FCYA 3ID8A 1T03A 3AGKA 3B6OA 2HHUA 1BG3A 3TTDA 2UXCK 4DWIA 4DF8A 4CZFA 4GV3A 5C2FA 4WFNL 2Q0RA 1R0AA 4E3SA 5K14A 2D4WA 1XQSC 4CF2A 4NCBA 3FLCO 3TSUA 1DGKN 1WSIA 4FWSA 3ZT4A 3HT3A 1ATNA 3KIOA 4CGHA 1TKTA 4I6MA 2JWKA 1J9AA 2QM1A 2PZSA 1BI4B 4EHUA 2A40A 1U47A 4GVMA 3W0LA 2BDPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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