3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
3CCMN 2QA4N 1YIJN 3CC7N 3CMAN 1YJ9N 1VQLN 1K8AO 3CC2N 4IOAL 3CCQN 5DM6L 4UY8O 1KQSM 4WFBL 5GAHP 1YITN 3CCSN 1M90O 1W2BM 5HL7L 1M1KO 1Q81O 3OW2M 5MLCQ 1VQNN 3CCEN 1Q86O 2ZJQL 5GADP 3CCRN 1K73O 1VQKN 5H1SQ 1Q7YO 1YHQN 5GAGP 1ILYA 4WFNL 3CCLN 3G6EN 1VQ5N 2QEXN 1VQ4N 4WFAL 1VQPN 4IOCL 1YI2N 1YJWN 1VQ8N 3CD6N 1VQMN 1VQ9N 3CPWM 2OTJN 1YJNN 4U67L 3PIOL 3CMEN 3CCUN 1S72N 1VQ6N 5JVHL 1QVGM 4WCEL 1Q82O 3CCVN 3J7ZO 1VQON 1N8RO 1K9MO 1KC8O 5DM7L 2OTLN 1NJIO 1VQ7N 5GAEP 3CXCM 2ZJRL 1KD1O 3CCJN 1OVYA 5JVGL 3G71N 1JJ2M 3CF5L 3G4SN 4WF9L 4IO9L 3I55N 3DLLL 3CC4N 3I56N 3PIPL 2ZJPL 1QVFM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OS2A 2OANA 3DM2A 2CGJA 4XH5A 4EAHD 1TKTA 3LAKA 4DSJA 3VERA 1YVNA 1ESVA 4Z4FA 4GKJK 1E4GT 4RW4A 2G8UA 2XY8A 2UXDK 4NLBA 1NK9A 1M1KO 3T19A 3J81O 4O55A 2RPIA 4DLEA 4DSKA 3I8BA 1T8EA 2DY4A 3CCRN 1BGXT 3EL2A 1NKBA 4DSIA 4LF8K 4KHSA 3HPGA 2OPQA 1LV5A 1N6QA 4DFPA 4OPAA 3HBTA 1WLJA 5GAGP 4QOZB 3VQAA 4FOEA 2PYLA 1HYZA 4IEEA 1GLDG 2BDPA 5HLFA 3EZ5A 1WAJA 4HTUA 4CGFA 4BRDA 4FPBA 1SKWA 4AHSA 1LAVA 1LCUA 3MN7A 4LD0A 3ATVA 2QWRA 4RW6A 4DQQA 3HK2A 3OJSA 2OTJN 2O8CB 3NF7A 1TKDA 4RCHA 2P9NB 3U8XA 2NRTA 4GKKK 2KKZA 5F0XA 3THYB 4KTWA 4W5OA 1SAZA 3T1AA 1G15A 2NZTA 3VF2A 4WCEL 3RRHA 2ASOA 1L3SA 3J7ZO 1XQSC 3FR0A 5D3GA 3MEDA 2XHBA 1IH7A 2QM1A 4CF8A 4OPJA 1QE1A 4OPHA 3A5LC 2P9SA 4B3OA 4N47A 4CF1A 3KVGA 3V9SA 4B9TA 4PWDA 1XHXA 4B1WB 1NJWA 3ENBA 1SUQA 2DFHA 3OYMA 1NGBA 5BPMA 3MN9A 3N4QA 4EFHA 1XNRK 3UB5A 4FVUA 4CJVA 2YI1A 1DGKN 3C0BA 4E1MA 4C1NI 4CFDA 3VGMA 4DTPA 1C0UA 4CJ5A 4TSXA 5AQMA 4B1ZA 3CCQN 4CBXA 4F4KA 1HX1A 5KPTA 2V51B 1Z26A 2IGIA 4JD2A 3THWB 2G8HA 4I9LA 4ELVA 5AQPA 2JWKA 4FWRA 3SNNA 3KLHA 3MN5A 4QS7A 3AO1A 3ZX0A 2FSNA 4CJ4A 1S1TA 3HOTA 2VCPA 3VA0A 4JKCA 3WNFA 4MO4A 4H5WA 3RVCA 4CEFA 4JK8A 1MU2A 3T3FA 1A5XA 3KKSA 1RT5A 3E66A 4ZTFA 1NOZA 3AO4A 2R7YA 3D0PA 1KFDA 1LOTB 2A41A 4IOCL 1JL2A 4DWIA 5C2FA 4HVJA 3NF9A 2I7NA 2YHYA 2BUPA 3TAFA 1IG9A 4IG3A 2NRRA 4M3TA 2VGNA 4W5NA 4FLTA 1KSPA 5HRRA 4YFUA 5EY4A 4DQRA 3WT0A 1TUYA 3M1FA 1GLCG 1MWMA 3TI0A 3SQ0A 1S72N 2E2NA 4KHNA 4CZIA 4A59A 2Y1JA 3OBYA 3DAWA 1NJZA 2KLAA 2VQEK 1SV5A 3LP2A 4EP4A 4BR2A 1DTTA 2RN2A 1FJGK 2UUCK 2HHHK 3QFPA 4NCGA 4BY9C 3KD1E 5M1OA 2IVPA 4M42A 3PX4A 1NOYA 4DCHA 4CJWA 4HUEA 3NVMA 3ID6A 4WYBA 4WQ5A 1RTDA 4DG1A 4FJKA 3P31A 3F2KA 2KHOA 1E4FT 3VEZA 4JD2B 3V1QA 2CGKA 2P51A 1Y64A 4FJ5A 1ZYQA 4BGBA 4A62A 1NK8A 3OYHA 3V9WA 1A5WA 1U2VB 3OYLA 1P8ZA 5I9EB 2ITMA 3LANA 3MX5A 3DLEA 4B9SA 3CJCA 2A6AA 4DV1K 3IS9A 4BG9A 3OYDA 3QNNA 2V7ZA 3ZETB 1WBDA 1LW2A 2VQFK 1T7PA 4K0KK 2YKMA 3U6FA 1JCGA 5SWMA 3FE1A 2KW4A 4AHCA 1XC3A 2QWLA 3NBPA 1HKBA 1X3NA 4WQ5C 3OVNA 5I3UA 3KK3A 1NGCA 4F9OA 3OYAA 2EHGA 3MN6A 1VQPN 1YI2N 2QKBA 4FCYA 4NXNK 4Z4EA 3ZT0A 5LMUK 3TAQA 2KTQA 1ZBUA 2DTUA 3MEGA 3O9SA 4BRIA 1Q9XA 3LDOA 3WNHA 1B9DA 3L3VA 3S3OA 3IMXA 5KGWA 3GL1A 4IWVA 4CW7B 1RTIA 3H3OB 1RT3A 4DR7K 3AVLA 1HPZA 4CEOA 2NRZA 1YT3A 4DFKA 1QZ5A 3NFAA 4AM7A 4M41A 4C8KA 2RKIA 1TGOA 2W40A 4FLZA 4CF2A 4CJFA 3PY8A 3M8PA 2O4IA 1OVYA 1T3VA 4XH4A 1JJ2M 1QZ6A 2FLOA 4JI8K 3HVTA 4BRPA 1REVA 3HM8A 1FKOA 3OYBA 2RHKA 4KHYA 3I56N 3PIPL 3ENHA 2ZJPL 3VEWA 2Z1HA 1BISA 3LPTA 3OY9A 4PA1A 3VQCA 5CHIA 4OKEA 5C24A 2F7TA 1DTQA 1NGJA 1J6ZA 1BI4A 1K8AO 4QCLA 1XC9A 2QK9A 4CFAA 4RTFD 4DV4K 3OYEA 1G99A 2O8BB 1VRUA 2P9LB 3ZSVA 3KKRA 5KPRA 3QMLA 3VEOA 4PKHA 3SPYA 1Q81O 3VETA 4BRHA 1GLLO 1D8YA 5CYQA 4B3SK 4GNIA 4A5BA 4FWQA 2I5JA 3T1YK 4DQPA 1WSHA 3SBGA 3S9HA 4NYFA 4CZKA 1Q7YO 3TAPA 2X6NA 1YF5L 2HBMA 4FW1A 1QQCA 3IRXA 5B8HA 4BC5A 1Q8IA 3DRPA 4DR3K 1ZBLA 5AQSA 1S1VA 3ZT3A 1XMOK 3C6UA 5AFUH 4BR5A 4DKWA 4AM6A 1B9FA 1HR0K 3IUCA 5AQNA 3GE1A 2Z1GA 4KFBA 1KCFA 3KIOA 1W9HA 2ASPA 4PY5A 4FWPA 4E19A 3WXKA 1YJNN 2O8FA 4YOUA 4IDHA 3QICA 4A57A 4KI6A 1XNQK 3AVBA 1VSLA 3SYZA 2D4WA 5KTQA 4DUYK 5DMRA 3ZT1A 4DR6K 4XEIA 3BZCA 1IKXA 4CBUA 5C15A 2GELA 1KC8O 3TPQA 3DLHA 3U9ZA 3C94A 3W3DA 4EZ6A 3OTOK 1SQKA 1X9JA 3GDQA 4X64K 3L2QA 3QLHA 2P9IA 4DTRA 3AGRA 4JK7A 5JVGL 3RMDA 5DK5A 1U45A 1T05A 4X65K 3LAMA 4JRPA 1VSJA 4K8XA 5KQDA 3QNOA 5AQQA 2G8IA 2BTFA 3ZSOA 3AVJA 4IBNA 4HTLA 3OYFA 3QIOA 3LM2A 3MEEA 3MX2A 1XMQK 4DS5A 3DLRA 2J4RA 4YOVA 1FXXA 4OPKA 5DM6L 1QQOA 3JYTA 5K14A 3SMPA 4H5TA 2HF3A 1RT4A 2OPRA 3K59A 3WUHA 4FYDA 5FPNA 1T6CA 2ATQA 4OLAA 1ITGA 1HLUA 3V81A 2E8AA 4CEEA 4LH5A 2O4GA 4CVNE 4GMJB 3DLBA 2D0CA 3GG4A 2P5GA 1NMDA 1J54A 5AQJA 4DFMA 4CD1A 3DYAA 1S5JA 5AZJA 3DXMA 4K43A 3QERA 3QFUA 4WFNL 4A2AA 5JS2A 2HMIA 3HRGA 4EHUA 1RNHA 5AQRA 2KFZA 4FWMA 1ASWA 5KQ8A 3MXIA 5AJ3K 1NGGA 4CGGA 1TK0A 2O8FB 2E88A 3SMSA 3CPWM 4WQ4A 3P5JA 1JCEA 2UUAK 1D9FA 3I8DA 3GBTA 3TSUA 3HP9A 1NGEA 4FLYA 1E3MA 4FWOA 5FLXO 4CERA 3TAEA 3DXKA 4BR0A 4AF1A 4E7JA 4LFAK 5JICA 3AVAA 1VQON 2D0AA 3BF3A 3HP6A 1BCMA 1WSJA 2ZJRL 4J2AA 2B5JA 5J2NA 4KTZA 1OH6A 1VRTA 1X9WA 3K57A 4JI2K 4K25A 1DEJA 1X9MA 5AQIA 4HWIA 3OS0A 1BG3A 4CIEA 4L8RB 4KHQA 4WF9L 4ILHA 1BCOA 2O8DB 2X74A 4WQ4C 3VQ8A 4GW6A 4H0OA 3O9QA 1NM1A 1YTAA 4BWJA 3K5MA 1SKRA 4M7XA 4IKFA 3LDNA 1S22A 1I94K 3O3FA 4CK2A 4KH6A 5ADXA 3MCPA 4H0PA 5GAHP 3M8RA 1WSFA 4DTJA 4F2SA 2OYQA 2D1KA 2KQ2A 4DV7K 4JKGA 1VHXA 2O8EB 1J53A 1QS4A 5FRMA 5BRDA 1KVAA 1C6VA 5CY4A 5MLCQ 2UXBK 4YOXA 5AQKA 2W42A 1VQKN 4CECA 1CZ9A 4PQUA 1IBMK 1I3AA 3C6AA 4H4MA 1HUXA 4KHUA 1O13A 4CHNA 3QB0A 1DLOA 1N36K 2PZSA 3CCLN 4Z4GA 1EP4A 1O1WA 3FLCO 3KD5E 3VPZA 1NGIA 3PO5A 4CESA 3V1RA 2Q3SA 4I7FA 2GEMA 3G10A 2KZMA 2P9PA 4O0JA 3HSCA 3C95A 4U7BA 1HKCA 3A5OC 4C8LA 2JGUA 4M3UA 3AVMA 4YNQA 3CG7A 3WNEA 4YORA 2UXCK 1RDCA 4MLHA 1JLEA 3NF8A 4DTUA 4W5RA 4DQIA 4C8MA 4AHRA 3K9JA 5AQXA 3NH2A 5JLFA 5J1EA 2ZGYA 4AHUA 4LF9K 3CXCM 1TV6A 4KAZA 1JLAA 3CJ7A 4H03B 3V6DA 5AR0A 2P9UA 3MECA 4FW2A 3S3NA 3AVFA 3CFRA 4FPAA 4IXCA 4BRLA 3ULDA 4DQSA 1U48A 2NRVA 4CJ7A 3LWLA 1NMNA 1W97L 3VENA 2KZZA 4A5AA 1S6QA 2AP1A 5LMNK 4LF5K 3T69A 1LW0A 3LALA 4BR7A 4DS4A 1Z05A 3VMFB 1BQMA 2YKNA 5LJWA 3K9KA 3M5RA 1EETA 2GWJA 2E2OA 2WBNA 1YITN 1M90O 1BWFO 4KB0A 4H5RA 3P83D 3F73A 2G8FA 4JS5A 4QS9A 4YOWA 3KLFA 1HKGA 1ASUA 5KI6A 5E26A 5HBMA 3PLAA 5JMVA 3VQBA 1ILYA 2IAJA 3UKRA 1U47A 3RWUA 1TAQA 3KLGA 4JKEA 4FJGA 2FSKA 1K6YA 2P9PB 3SZ2A 2PFUA 3LDLA 4BRAA 4CHZA 4MDBA 5F1XA 3QIPA 4B3RK 3FZLA 3U3GA 4DQ8A 1ZBSA 3QEPA 4ZHRA 3BP8A 1KRPA 2Y1IA 3JAMO 3L2WA 3L2UA 3SV4A 4M3ZA 3ALYA 2VWKA 1RDUA 4ELTA 5A2QO 2YHAA 5JS1A 4B9MA 3DLGA 4X62K 2XY6A 2ASMA 1C0GA 4KKOA 3RTVA 4B9NA 3IAYA 4O44A 2YX6A 3HPOA 1HQEA 3AVNA 3O9UA 4FJLA 4BGAA 2F9WA 2ETJA 2P9UB 4DUZK 3A2FA 4CGIA 2A5XA 3THXA 4Y1CA 1TK5A 3J7YP 3TSQA 4ILGB 2CH6A 3SLCA 4M45A 4B9VA 4F3TA 3FZFA 5J2QA 4I9QA 1U4BA 5AQHA 3D2EA 1JL1A 4ILJA 4NYNA 4B3TK 1QVFM 3VQ7A 2YCHA 2QA4N 3CC7N 1CZBA 2LSNA 2P9SB 3O1WA 4ID5A 3A5MC 5CZ1A 1RBSA 3UE5A 2Q2RA 3KLEA 1L5UA 2F8SA 5BN8A 4WFBL 3VEYA 4QS8A 5AQTA 3CERA 2YNIA 3V9ZA 5CZ2A 1BA1A 4JAXA 2HBLA 4H4OA 3JXUA 3WEEA 5FPMA 2VG6A 2XO7A 3PX0A 4FSVA 5AQLA 1L3VA 3SAGA 1OH5A 3K5LA 3UKRB 1QSLA 3ZSYA 1YHQN 4GV3A 5FDLA 4BACA 3QEVA 1JXBA 3VQQA 3L2RA 5LL6Z 3EN9A 3F9KA 2H3GX 3Q7CA 4OJRA 4KV8A 3V1OA 4KH5A 4ZTJA 4O5FA 4WFAL 3NMUA 5BRFA 3QO9A 4AQYK 3BZKA 4B9LA 3HYFA 4OKJA 4H0YB 2OZSA 4BRFA 1IG8A 1TKZA 3L4QA 2QWNA 4JKFA 1IKVA 3FFKB 1NK0A 2PBDA 2DFEA 1QHTA 3D6RA 1OH8A 3M3ZA 3EYZA 3QINA 4FWNA 1TYQA 1VSFA 4FWSA 3KTQA 3VTHA 3PSIA 3VEXA 3EO3A 3HI0A 1VSHA 2HMPA 1XUPO 1VQ7N 2YHXA 1RT1A 1TAUA 3AARA 1ZBHA 3THXB 1ZC6A 1NNEA 5HOOA 3P1GA 3RMAA 3D2EB 2QWOA 3NGZA 3KWGA 1BIUA 3P39A 2YJEA 2QWQA 4JKDA 2IIRA 4IFEA 1QHAA 2FBVA 3MAQA 1GOCA 3ZEUA 3K5OA 1YXQA 2A40A 4CZLA 4K41A 4DU1A 3AA4A 3KK7A 3CC2N 4IOAL 1RGIA 3LL3A 5EX5A 3SBTA 3SQ1A 1HPMA 1U49A 2F96A 4JI3K 3VGLA 5J2MA 4FO0A 4BROA 1VSDA 3TAGA 2GUPA 3CCSN 3GOIA 3VQPA 1JLCA 1IBLK 4CBWA 4CIFA 1KLNA 2BH1A 1RBVA 3WEEB 3VOVA 4B1UB 4EP5A 3CCEN 2ZF5O 4I2QA 1KTQA 1C1CA 3FZKA 2E5LK 5LY3A 1EQYA 5H1SQ 3V9UA 1NK5A 4K42A 3E9OA 1N33K 3NF6A 1BQNA 3RR8A 1KLMA 1WUAA 1GOBA 1FW6A 4CHPA 4CFBA 1F21A 1FKPA 2D0PA 4BE1A 3ULEA 1VQ4N 3CD6N 1HYSA 4C8NA 4CZGA 5AQYA 2YNHA 2YNGA 1SKSA 4MO5A 2BE2A 3R8EA 1MWKA 3R9PA 4JHDA 4YOTA 5SZTA 4J2BA 4L3QA 1MDUB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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