3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
3OW2M 1YJWN 5GAHP 1NJIO 1YIJN 4WFNL 1VQ8N 1Q82O 3PIOL 3CCMN 3DLLL 4U67L 3G6EN 1KD1O 1VQ9N 3CCUN 4WFAL 3CCSN 2QA4N 2ZJPL 3CF5L 5GADP 4IOAL 1YJNN 1M1KO 5JVHL 1QVGM 5DM7L 3PIPL 5MLCQ 1VQNN 1YI2N 1W2BM 2ZJRL 3I56N 3CMEN 5HL7L 1VQKN 3CCLN 1YITN 1VQON 1OVYA 3G4SN 5GAGP 5H1SQ 3J7ZO 4IO9L 3CD6N 3CCJN 1S72N 4WCEL 4IOCL 1KC8O 4UY8O 1YJ9N 5DM6L 5GAEP 3CCQN 1VQ5N 3CPWM 3CC7N 2ZJQL 1VQ6N 3G71N 1VQMN 3I55N 3CC4N 1K8AO 1JJ2M 4WFBL 1Q7YO 4WF9L 3CMAN 1VQLN 3CCVN 2QEXN 1Q81O 3CC2N 1VQ7N 1QVFM 2OTJN 1KQSM 3CCRN 1VQPN 1K73O 1YHQN 1ILYA 1N8RO 1Q86O 1M90O 5JVGL 1VQ4N 2OTLN 3CCEN 1K9MO 3CXCM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 2KFZA 1I39A 3AA5X 3QBXA 1C6VA 1XUPO 1IG8A 3K58A 1L3VA 1KVAA 3H3NO 3VQPA 3ZLJA 1RBTA 3CQYA 1KLNA 4TSXA 5FDLA 3QERA 3A5NC 2IGIA 2V51B 2KTQA 4GY2B 2HMIA 4JD2B 4DFMA 5GIPA 4CIFA 1QSSA 1YJNN 2O8FB 1D5AA 3LDNA 1HPZA 5KI6A 3F9KA 1C0GA 1YI2N 1W2BM 4BACA 5EU7A 3V81A 1VQKN 2KHOA 3TI0A 3AARA 1BCMA 3EEQA 5J2MA 2QWNA 4DR3K 1BDGA 2ASMA 1RNHA 4IG0A 3ZX2A 4I2PA 4NYNA 4JS5A 1HNXK 4DTRA 3V1QA 1DLOA 3W0LA 2E6LA 3V9WA 3HPHA 4ILHA 1LW0A 4DFJA 3NF6A 3TSPA 5M1QA 2HF3A 4CJ5A 3PX4A 2OPPA 4CJSA 4FL9A 3T1YK 3SK3A 2Z1IA 3SUPA 2V52B 5AQXA 2XY8A 3CIPA 1N5YA 5AZJA 4WQ5A 3MWPA 4BG8A 1EX4A 4FJ8A 1SL0A 3H45C 1VSLA 3A0IX 3N4QA 3ID6A 1KCFA 3KTQA 1RDDA 4KHYA 1U45A 3BEXA 1TKXA 3E66A 1FXXA 3P5JA 3ZSWA 3HPGA 3M8QA 3OYIA 3KK7A 1R59O 1NNEA 3O1WA 1KFDA 1GOCA 1X3MA 2YNIA 2ATQA 3NE6A 3R9PA 3SUNA 4X65K 3OJUA 4DSJA 4FSVA 5LMNK 2VGMA 3C94A 3MCAB 3TTDA 1IO2A 4HVJA 3HJFA 2HHQA 3HM9A 2YJEA 3NH2A 3QEPA 4CESA 5I42A 3AVJA 3LP3A 5JVHL 4FLXA 1NJYA 1ITGA 3V9SA 5MLCQ 2P9LA 2OPQA 2OANA 3EZWA 1MWMA 1S1WA 1SKRA 3RTVA 4F9OA 4KI6A 5DMRA 4ZTJA 4KTQA 3I56N 3QB0A 4FPAA 1MA9B 3D6RA 1LW2A 4NXNK 2FBTA 1S22A 4R5PA 2FSNA 3AAQA 4H5TA 1U48A 3NCIA 5AQJA 1VAZA 4JYAK 3THYA 1HMVA 5KTQA 3HP6A 1LOTB 5AQNA 3IAYA 3P83D 4L3QA 3CC4N 4DF4A 1U49A 1CZBA 3VF4A 2YHXA 3PO4A 4RW9A 2KQ2A 2QWPA 1Z26A 1VRTA 1U6ZA 2ZM6K 4DV2K 3L2QA 4M63C 2HHTA 2Q31A 4FM2A 1Q81O 3J80O 1H1VA 3ZT1A 2GELA 1GLAG 2FBVA 3THWB 4MDAA 3RWUA 3SPYA 1QHTA 4M7YA 3S3NA 2D1KA 5HROA 2FC0A 3AA4A 1ATRA 5KRSA 2VQFK 3CFRA 3BY5A 4K41A 2O8FA 2PZSA 1WNSA 3TTFA 4GVMA 4BRLA 4K8XA 5SWMA 1U2VA 3ZEUA 1HKCA 3K2PA 5GAHP 2DFHA 3I33A 4HTUA 4WFNL 1VQ8N 3NGIA 1L3TA 2EHGA 4KTZA 3CJAA 4RTFD 2W42A 3K9KA 4DR6K 3VPZA 4HUEA 3MAQA 3MN5A 3WNGA 4K8ZA 3KLGA 4G1QA 5C2DA 3L3VA 4JNEA 4DG1A 2WONA 2IVOA 1NKEA 2O8CB 1VSEA 3HZ6A 2GUIA 3NHGA 1HYZA 3MXJA 4CJQA 1NMNA 4K0KK 3VOVA 1WN7A 4KTWA 2KZZA 4EZ9A 1E4GT 5KPTA 2G8IA 2HHUA 5HL7L 3DRRA 2QTDA 4BC3A 3BZKA 3TAFA 2P9PA 3K0SA 3IS9A 3AVGA 1NU0A 2UXBK 4JI6K 2E2QA 1UA0A 2ZE2A 4K42A 4EZ6A 1X9SA 3AO3A 3VEZA 4LH5A 1EQYA 4FWPA 5AZIA 2CH5A 1RDWX 3G10A 1RFQA 5KPZA 4OLBA 5FRMA 1NWKA 4Y1DA 3DMJA 3OYNA 4FW2A 2G8WA 3L2WA 1CZAN 2D4WA 3EKSA 3WNEA 3H6EA 1S9EA 1W97L 2NRTA 4IEEA 2HBLA 4O44A 2YCHA 1RT1A 3QICA 3VQQA 1EWRA 2RF2A 1RDUA 1JCGA 2GX9A 1I3AA 4B1XB 3UKRB 4FJLA 1DGKN 2FSJA 3OYKA 4HTLA 2PY5A 3OS1A 2Q0RA 4FJMA 2WOMA 4B9SA 1CXUA 4FCYA 4FJGA 3D2FA 4DMNA 4QOZB 1BU6O 4M3ZA 2P9IA 1VK0A 1QE1A 4FJNA 2O8EA 1TUYA 3FE1A 3LAMA 2XY5A 4J8FA 4A62A 4CK3A 1BA0A 1JXBA 1TYQB 4Q5VA 1Q18A 1QZ6A 4BR5A 1BIZA 2OZMA 1HX1A 1QQNA 5BRDA 3VTIA 1NK7A 1C1BA 4CJ3A 4CIGA 4DTJA 3F9MA 4O5BA 2BGGA 2VYPA 1ESVA 4RW4A 4IFYA 5BPLA 1HR0K 3U4LA 1XI1A 2HBMA 4IOAL 3UKUB 3TSQA 2P5OA 2NRZA 3O9UA 3MN6A 4CFBA 4CK1A 1NK9A 4DLEA 1LV5A 3PSFA 3HI0A 4E0DA 5LL6Z 4CJ4A 4W5RA 1NKCA 3T1HK 1XWLA 1EETA 2PBDA 1Q9YA 1BA1A 5F1XA 2P9PB 5GINA 3ZX0A 4ID1A 2VGNA 3HBTA 2OCEA 3CJ1A 2E20A 3RRHA 4JHDA 4BWJA 4X66K 1RTIA 3RMCA 4GKJK 5AQQA 4XH5A 2EX3A 3T69A 3SQ0A 1R0AA 1GOBA 3A5LC 3CJ7A 2D0CA 2F96A 1DTQA 4CGIA 1K8AO 3SQ1A 4DTPA 2DY4A 4AHTA 3DLKA 4KHUA 4CBUA 5CR4A 4H4MA 4B9QA 1NG9A 1SKSA 3DXKA 4WF9L 3FLCO 4HCCA 1YTAA 2HF4A 3CYMA 3K5NA 1MU2A 1IG9A 1Y64A 5AQIA 1HNZK 4KFBA 1YAGA 1U2VB 3M5RA 1UAXA 1WBDA 1LWCA 3U3YA 2QWMA 2YKMA 3O4NA 2P9SB 2WFBA 3D2EB 3RSEB 3U6FA 2VWBA 3CJBA 1Z25A 4E1MA 1A5VA 1O1WA 2P9UB 4YORA 4FWNA 3OYFA 4KB0A 3O5BA 3MXMA 5A2QO 4MLEA 3HM8A 4K43A 4FLVA 1B9FA 3QIOA 2O8EB 2ZGZA 2YV0X 1A5WA 1RBVA 1QQCA 3V9XA 3SQ2A 4W5TA 1XQSC 4N41A 5HRRA 1BQNA 4UQGA 3CF5L 1J6ZA 4CGFA 4Z4EA 4YOWA 3UKRA 4J2DA 4CZHA 1L3UA 5KQDA 2YJFA 4CFDA 4JI3K 2E88A 1NGHA 4XIUA 2W6KA 2FXUA 4O0JA 5BR9A 3F73A 3ZSZA 1ASWA 3PSIA 4R79A 3CI5A 3D2EA 3G4SN 1KFSA 3HL8A 3VMFB 1RDAA 3AO4A 4GV9A 4CZLA 1GOAA 3R1XA 1XMOK 2Q0UA 1D4XA 3KLEA 1LCUA 4B9TA 4OVLA 3DLBA 4KI4A 4B1WB 1VQMN 4YOTA 4CGDA 4WFBL 3OBWA 1IBKK 3T3FA 4LFBK 4B1YB 3OYGA 3THXA 1SL2A 1LAVA 3RMDA 3M1FA 4O5FA 3VGMA 4DU4A 4E7JA 4J2EA 4I9QA 1RT5A 3NGZA 4AF1A 2HHSA 3BUZB 2QK9A 3W3DA 4B9LA 3CCRN 4E7KA 3WEEB 4J2AA 2X6SA 1Q86O 1N32K 3MCPA 4CEEA 5AQVA 3J7YP 3C95A 1JCEA 3O9RA 4O55A 1JLEA 1XMQK 4E7LA 2IC3A 2HVIA 3NH1A 1HNIA 1HUXA 1VSJA 5EXWA 3OYMA 4BG9A 3DXMB 2BUPA 4JLHA 3VN5A 2GV9A 1RTJA 1HRHA 4DSLA 2P9KB 1I94K 1VHXA 3G6EN 4B8CA 3K9JA 2ASOA 4PKIA 5AQFA 3BF3A 1TYQA 4BC2A 3WQUA 4W5OA 2V7ZA 1WAFA 3KLFA 3IMXA 3KHYA 3UB5A 1HNVA 1QQOA 3N4PA 4CFAA 4A59A 4CEOA 3PIPL 5EOYA 3JAMO 4N76A 4JK8A 1QSLA 3EN9A 3GG4A 3CMEN 1YITN 1BWFO 4C23A 3RMBA 4KH5A 4E89A 3MK6A 3CFOA 3ZSQA 3MMVA 4FWMA 3VGKA 3LP0A 5JMVA 5AQLA 2P9KA 1SS6A 2NRXA 3ENOA 4LF6K 2RPIA 4CW7B 4KHNA 5ADXH 2G8UA 1IKVA 3GOIA 3VQCA 2RKIA 3G0ZA 1EO1A 3AO5A 1GLFO 1ZBLA 4BRKA 1BQMA 4JKGB 4F8RA 1WUAA 3E1YA 3OA9A 1Q7YO 2F9TA 4HUGA 3JS6A 4A2BA 3TAGA 4IFVA 4DU1A 1S9GA 3NGYA 5AQUA 1SUQA 3OYHA 3VQBA 4YNQA 1BO5O 3BZCA 5HRSA 4EHTA 1KRPA 4H0VB 3NMUA 4DR1K 3V9ZA 3L6QA 4FLYA 4Q0BA 3L8BA 3WEEA 3ZETA 4JK7A 3DYAA 1FW6A 2HMPA 3S9HA 2OTLN 3WQTA 1EP4A 5IWAK 2JWLA 3KK3A 1U04A 2YHAA 4CHZA 2BDPA 4Z4GA 2NRWA 4NXMK 4BRPA 4B1ZA 4WQ4C 1J9AA 3CFPA 3K5MA 1V4TA 3H1QA 4JHDB 4ELUA 1V4SA 3PY8A 3ENBA 5AQRA 1D8YA 3PIOL 3KVGA 1NGFA 2I7NA 4FJ7A 4U67L 5KPRA 1KLMA 4GV3A 1ASUA 1KVBA 1NGJA 4FW1A 3EY1A 4BDPA 4CJPA 1L3SA 4EP5A 3RMAA 3OYLA 2O8BA 3LDPA 1GLCG 1WSIA 4EP4A 4JKCA 1GLDG 3I8BA 4DQ8A 3LPUA 1GLBG 2NNWA 4DFPA 2E2NA 4BE2A 2JLEA 2OPRA 4Z94A 4MDBA 1NK0A 3AA3A 4CJUA 4BR2A 4JKEA 3THWA 4LF7K 1CZ9A 4YOVA 1ZBUA 4DR4K 4DV7K 5CE3A 4H0OA 3NF8A 3CQXA 1QSYA 4DTNA 4DTMA 1WSGA 4FLUA 4OO1J 3SAHA 2P9IB 1Z05A 4IG3A 1TVRA 1RT6A 4H4OA 3HVRA 2HNZA 2Q3SA 2ZD1A 3ITHA 4PA1A 2QM1A 3J8AA 1BI4B 2P9UA 1J54A 4DUZK 1XHZA 3AVFA 2KLAA 3RSEA 1BUPA 4KRFA 3IRXA 2NLXA 4CHQA 4KKOA 4PL8A 4JI8K 4OPKA 3WXLA 3DLGA 2RN2A 1LAWA 4ISFA 4BY9C 4FVMA 1B92A 1MDUB 2KKZA 2F8SA 1DT9A 4JD2A 1NGBA 2UUAK 4FZXC 3LP2A 3O3GA 3LPTA 3OYCA 3QFUA 2D0AA 2W6LA 2O4GA 1FJGK 2GBZA 3QEVA 1WLJA 2P9LB 3AVIA 4RCHA 2UUCK 4FWKA 5BPMA 1G15A 3P31A 3QEIA 1DEJA 1NLVA 2UXDK 4C8LA 1YIJN 3CM5A 4FOIA 5BRFA 3VQDA 2Z1JA 3T1AA 3K5OA 2KFNA 1YTUA 3TTCA 2ZQBA 1RGIA 3VEXA 4L8RB 1N6QA 3MX2A 3L4QA 2YKNA 4AHSA 1VQ9N 1X3NA 4DSFA 2ZJPL 3LM9A 1JKHA 5CZ1A 5T7BA 5GADP 3DOKA 2VG5A 3C65A 4KPYA 4FVUA 1YXQA 1F21A 4H0XB 4YDUC 2HB5A 3DRPA 4JN4A 1K8KB 3SV3A 5J1EA 4OKKA 4CJLA 4BRCA 1KXPA 1T3VA 4FK0A 4OLAA 4AHCA 3J7ZO 1YT3A 2D0BA 1ZXOA 3CJCA 4FZZA 3C6UA 4WYBA 3MEDA 3L4IA 3TWHA 1S72N 3ATVA 3VEOA 5FRNA 4WCEL 1RT7A 5KGWA 4IOCL 4BRFA 1RBRA 3AY9A 1E3MA 1IJJA 2AJQA 5CY4A 3ZEUB 3EYZA 2P5GA 4BR7A 3CPWM 4LF8K 4YDUA 1UWBA 5IT9O 4DTOA 3TABA 1JLBA 1T44A 4CZJA 3BF1A 5C0YA 3OYBA 3ZSOA 4CHNA 4CZKA 3ENHA 1NGAA 1WAJA 4CEDA 5HRNA 1KAYA 1S6PA 4BR4A 4KHWA 3UE5A 2HW3A 4Z4HA 5ELZA 1RT4A 1XNRK 4KHSA 3IG1A 1REVA 2F8TA 1QVFM 3VF6A 4BQLA 2P51A 3LDSA 1KQSM 1T03A 4DQIA 1VQPN 3GL1A 1S1TA 1N8RO 3HRGA 2KZMA 4AH9A 4CZIA 5F2RA 5AQHA 1TGOA 3V4IA 2FBXA 1VSMA 2O4IA 4O4GA 1BG3A 4FK2A 1VRUA 3ZT4A 3OVNA 1QTMA 1YJWN 2HBJA 4MQ3A 3ZX3A 2UUBK 4BGAA 3TANA 5C42A 4E1JA 4M42A 3THVA 1NJZA 1XC9A 1NOYA 4F3TA 1C0UA 3BP8A 4FWOA 4DCHA 3TAPA 3TAQA 4I7FA 5CHIA 5AQWA 1KD1O 1WSHA 3E9PA 1ASVA 2PAVA 4WFAL 2HVHA 3AGRA 5C12A 1VSKA 3DI6A 4X64K 5AQYA 4CZMA 5AFUH 2E1YA 1HYVA 2G8KA 3ISNC 3O80A 4CVNE 4E1NA 3MN7A 3JYTA 3S3OA 2DFEA 3ZSXA 4BR0A 1JCFA 5HOOA 4B3MK 3CM6A 3O4QA 4CHOA 4DWIA 3QEXA 4B3OA 5KQ8A 3VA0A 4Z4IA 3LZIA 1E4FT 3LZJA 1YJ9N 3RR7A 1S1VA 1RDCA 4CE9A 4CEAA 4EIAA 5DK5A 4CJVA 4M45A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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 3OW2 M;  1YJW N;  5GAH P;  1NJI O;  1YIJ N;  4WFN L;  1VQ8 N;  1Q82 O;  3PIO L;  3CCM N;  3DLL L;  4U67 L;  3G6E N;  1KD1 O;  1VQ9 N;  3CCU N;  4WFA L;  3CCS N;  2QA4 N;  2ZJP L;  3CF5 L;  5GAD P;  4IOA L;  1YJN N;  1M1K O;  5JVH L;  1QVG M;  5DM7 L;  3PIP L;  5MLC Q;  1VQN N;  1YI2 N;  1W2B M;  2ZJR L;  3I56 N;  3CME N;  5HL7 L;  1VQK N;  3CCL N;  1YIT N;  1VQO N;  1OVY A;  3G4S N;  5GAG P;  5H1S Q;  3J7Z O;  4IO9 L;  3CD6 N;  3CCJ N;  1S72 N;  4WCE L;  4IOC L;  1KC8 O;  4UY8 O;  1YJ9 N;  5DM6 L;  5GAE P;  3CCQ N;  1VQ5 N;  3CPW M;  3CC7 N;  2ZJQ L;  1VQ6 N;  3G71 N;  1VQM N;  3I55 N;  3CC4 N;  1K8A O;  1JJ2 M;  4WFB L;  1Q7Y O;  4WF9 L;  3CMA N;  1VQL N;  3CCV N;  2QEX N;  1Q81 O;  3CC2 N;  1VQ7 N;  1QVF M;  2OTJ N;  1KQS M;  3CCR N;  1VQP N;  1K73 O;  1YHQ N;  1ILY A;  1N8R O;  1Q86 O;  1M90 O;  5JVG L;  1VQ4 N;  2OTL N;  3CCE N;  1K9M O;  3CXC M; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3C6A A;  2KFZ A;  1I39 A;  3AA5 X;  3QBX A;  1C6V A;  1XUP O;  1IG8 A;  3K58 A;  1L3V A;  1KVA A;  3H3N O;  3VQP A;  3ZLJ A;  1RBT A;  3CQY A;  1KLN A;  4TSX A;  5FDL A;  3QER A;  3A5N C;  2IGI A;  2V51 B;  2KTQ A;  4GY2 B;  2HMI A;  4JD2 B;  4DFM A;  5GIP A;  4CIF A;  1QSS A;  1YJN N;  2O8F B;  1D5A A;  3LDN A;  1HPZ A;  5KI6 A;  3F9K A;  1C0G A;  1YI2 N;  1W2B M;  4BAC A;  5EU7 A;  3V81 A;  1VQK N;  2KHO A;  3TI0 A;  3AAR A;  1BCM A;  3EEQ A;  5J2M A;  2QWN A;  4DR3 K;  1BDG A;  2ASM A;  1RNH A;  4IG0 A;  3ZX2 A;  4I2P A;  4NYN A;  4JS5 A;  1HNX K;  4DTR A;  3V1Q A;  1DLO A;  3W0L A;  2E6L A;  3V9W A;  3HPH A;  4ILH A;  1LW0 A;  4DFJ A;  3NF6 A;  3TSP A;  5M1Q A;  2HF3 A;  4CJ5 A;  3PX4 A;  2OPP A;  4CJS A;  4FL9 A;  3T1Y K;  3SK3 A;  2Z1I A;  3SUP A;  2V52 B;  5AQX A;  2XY8 A;  3CIP A;  1N5Y A;  5AZJ A;  4WQ5 A;  3MWP A;  4BG8 A;  1EX4 A;  4FJ8 A;  1SL0 A;  3H45 C;  1VSL A;  3A0I X;  3N4Q A;  3ID6 A;  1KCF A;  3KTQ A;  1RDD A;  4KHY A;  1U45 A;  3BEX A;  1TKX A;  3E66 A;  1FXX A;  3P5J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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