3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
3CC2N 1VQ7N 3CMAN 1KC8O 5GAHP 3G71N 1YI2N 1Q82O 5DM6L 2ZJRL 1QVFM 1S72N 4WFBL 1YJWN 2OTLN 5HL7L 5H1SQ 3CCQN 4WCEL 3G4SN 4WFNL 3G6EN 1ILYA 3I56N 3DLLL 3CPWM 4UY8O 2QEXN 4IOCL 1Q81O 3CF5L 3CXCM 1YJNN 1VQMN 1M1KO 3OW2M 1YIJN 1NJIO 4WFAL 1N8RO 4IOAL 3CMEN 4WF9L 3CCLN 3CCMN 1VQ8N 3CD6N 1KQSM 1VQ9N 1Q7YO 1Q86O 1W2BM 1VQNN 1YHQN 2QA4N 2ZJQL 1VQLN 1YITN 3CCUN 1VQPN 3CCEN 5JVHL 3CCRN 1YJ9N 1VQ6N 1VQ4N 3CCSN 1JJ2M 3I55N 3PIPL 1QVGM 1VQON 1VQ5N 5DM7L 1K9MO 5GADP 1VQKN 3CC4N 1KD1O 4IO9L 5JVGL 1M90O 3CCVN 2OTJN 3J7ZO 5MLCQ 3PIOL 1K8AO 1OVYA 2ZJPL 5GAEP 3CCJN 4U67L 5GAGP 1K73O 3CC7N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T8EA 3KZBA 3R8EA 4JKEA 1RT4A 3CJBA 3DI6A 4DKWA 3O9UA 2O8FB 4JRQA 3CPEA 4WE1A 3ZEUA 1I94K 4H5RA 3OBWA 5AQWA 2NNWA 3N4QA 5KRSA 1NK9A 3UKRA 3K58A 3FZFA 1LWFA 4WFBL 2UU9K 2NRZA 1F21A 4CEOA 3VEOA 1NGBA 4AHRA 1GLCG 3VQEA 4C1NK 4X62K 5KPRA 5C2DA 4LFAK 1IH7A 3A8YA 4C8OA 2W6LA 5M1NA 2QXLA 4H0YB 4B9SA 1UOCA 1WNSA 2GBZA 1CXUA 3P5JA 3SMPA 3ITHA 1NG9A 2P9IB 3IKMA 4ELVA 3BEXA 4CK1A 1J5EK 4NCBA 4ELTA 4EIAA 3ZSRA 4CI6A 4PY5A 1JKHA 1D9DA 4KHYA 3H1VX 4IOAL 1H1VA 5BR8K 1D4XA 4CEQA 1ZBLA 4WF9L 5JMVA 3HOSA 4OVLA 2YJFA 3OY9A 1Q7YO 5KQ8A 2VG7A 5ADXA 2ZGZA 1HQEA 1WAFA 4YOXA 3F2KA 2P9KA 3OJSA 1YHQN 1IKXA 2WOMA 3A2FA 2UYTA 3NBPA 3QB0A 1L3UA 4LH5A 3L6QA 4LF4K 1VQ4N 4DR6K 3I8BA 3SJJA 3EZWA 3P39A 1HMVA 3E66A 4CZJA 1OVQA 2OCEA 2GX9A 5SWMA 3DXKA 1HRHA 2P51A 3LL3A 1W0HA 4DTSA 4B9LA 4CECA 4Z4CA 2Y1JA 1Z25A 3BGRA 5CYMA 5GAEP 3EEQA 2D5RA 3LDSA 1A5XA 5GAGP 1QSSA 3CC7N 2AA4A 4A61A 4QS9A 4BR5A 2E4LA 5HRSA 5AFUA 5CHIA 3OYAA 4ICLA 1RGIA 3ZSWA 3LP2A 1NGCA 4IFYA 1NU0A 4JI8K 3DLEA 3LDLA 4TSXA 2O8EB 4KFBA 4FLZA 3TTDA 2FBXA 3ID6A 3ZT2A 4DR5K 1RTHA 1ZBIA 1RBVA 3I8DA 1NK4A 2IGIA 2XRIA 2ZF5O 4DS4A 3D2FB 3U4LA 4DFMA 1JLCA 3I0SA 4W5OA 3P38A 3VOVA 1NMNA 3G4SN 1BU6O 4NXMK 3VEVA 4CEDA 4BG8A 4ZHRA 1KVCA 5M1KA 2P9UA 1FXXA 3NMUA 1TYQB 3NF9A 4BVPA 2YNGA 4QAGA 1Q81O 3QFPA 3GBTA 3D45A 1N5YA 4DLGA 4AHTA 1OKJA 1VSDA 3LAMA 3VERA 1HYVA 4DTXA 1GLEG 1P90A 2HHXA 4DR4K 1SZ2A 3BY5A 4I6MA 3LP0A 3PSIA 4E0DA 1XMQK 3HZ6A 3VQQA 4KHNA 1KSPA 4G9ZA 1CLQA 1Q9YA 1HNVA 3NVMA 3J81O 1ATSA 3WXKA 5HRPA 1OH5A 3T1YK 4DU1A 1D5AA 4DV5K 1BI4B 3OBYA 4Z94A 2F8TA 2XY7A 3VEZA 1I3AA 2FF3B 2E88A 1VQPN 2HOEA 3CCEN 4AHCA 5CY4A 5FPDA 3QMLA 4DTUA 4RWTA 2V7YA 4B3SK 3U6FA 3L4QA 1C0MA 1LCUA 4M41A 1EO1A 1JLBA 1NK7A 5C15A 1RT5A 4F2RA 1TL1A 1FK9A 1RT6A 4GKKK 4M45A 2HW3A 1TGOA 5D3GA 4DQPA 3O9RA 3TABA 2VGMA 3AO5A 2D4WA 1TKXA 4CF0A 5I42A 2WUSA 4DV0K 2HHTA 3WNHA 2A6AA 1QS4A 3KK3A 3MEGA 1B9DA 4FK0A 4IJNA 3TARA 4AH9A 3OYMA 2XO7A 3QIOA 2OTLN 1BL3A 5DMRA 1WSEA 4X66K 3L2VA 2P9PA 4CBWA 2V52B 5J2QA 1S3XA 1TL3A 5B8HA 5FPEA 3NF6A 4DU4A 3MX2A 3E1YA 4MLEA 4KH5A 3AA3A 3P83D 1TVRA 2LSNA 2PAVA 3RMDA 4CZKA 4AHSA 4JKBA 3RRGA 4FJ5A 2E8AA 3HBTA 3O1WA 2GEMA 3QEWA 4CF2A 3MXIA 3VQ7A 4LC9B 4F8RA 2OZSA 2G8KA 3AO2A 1NBWA 3QESA 3AO1A 3ULEB 2PYJA 3SUPA 1JLGA 1WUAA 2DFEA 2RE2A 4GW6A 1W9HA 4Z4HA 3PLAA 3EZ5A 3KWGA 3QLHA 3LM9A 1S9EA 1VQNN 1B92A 5AQRA 2O8DB 3CFOA 5EVZA 3QNOA 3BZKA 4FWKA 2FXUA 1G99A 5C42A 3SBTA 2Y1IA 3AVKA 3F73A 3DRPA 2NRXA 3MN9A 4OJRA 3FZLA 2IDOA 2HB5A 2IOCA 2FSJA 4EZ6A 3SUOA 4J8FA 1U47A 1M90O 4KHUA 1RBRA 3EY1A 1XI1A 3QEVA 1T6DA 1X9SA 5KGXA 3KKRA 3HRGA 4ISFA 4X64K 1HLUA 4ILHA 3U3GA 2HBJA 1VSFA 3O8MA 1K73O 1V4SA 2W41A 3CC2N 1FKPA 3THWA 4O5FA 4CJKA 4LF7K 3IFRA 4BRFA 5AQMA 1E3MA 1X1PA 1WSGA 1U49A 2P5GA 1RT1A 3FE1A 4FJ9A 3SNNA 4BR2A 3V9WA 2FF6A 4EP5A 3RTVA 1C1AA 4CGJA 3HO1A 1OH8A 3VF2A 3D2FA 4WCEL 5E41A 2ITMA 3V81A 1SL0A 4H5VA 3QFUA 2UUBK 3VQ8A 3AVCA 3DLLL 4IG3A 1VSKA 1TAQA 3O9QA 2VYPA 3OS2A 3OYCA 5LMUK 3FGUA 4H0VB 2A1RA 4CJ7A 3C6TA 4KKOA 3PO5A 4O55A 4KPYA 2EHGA 1RTIA 2WTUA 4JI6K 4DTMA 4L8RB 1ZBFA 2QKKA 3O08A 3CMEN 5KTQA 3IMXA 4Z4FA 4DTNA 3ZSXA 1GLBG 5BN8A 1BCOA 1YAGA 4BRGA 1SL2A 4EHUA 3BF1A 4FLUA 3CJ1A 2HSTA 4O8KA 3VGMA 4F9OA 2NRHA 3VTHA 4DV7K 4OX9K 3LDNA 3NVKA 2B4JA 2W40A 5ADXH 4NLCA 3MX5A 3U9DA 1C0UA 4FJMA 1BA1A 3QICA 5HRNA 4MFBA 4DTRA 4CJEA 3BF3A 1TK0A 3M1FA 3ENOA 1TKZA 1MWKA 3CC4N 1U04A 4YFUA 3CCVN 2ZGYA 4KTWA 2FC0A 4BDPA 5I9EB 4RW9A 4IEEA 3ZCMA 4FM2A 2D1KA 3BDPA 5AZJB 3FFIA 3VQ5A 1X9WA 5LY3A 1HR0K 4IDHA 3RMAA 3LANA 3O9SA 3E9OA 3G71N 4V19S 3ULDA 1HNIA 2HMPA 1Z05A 4IJAA 2GUIA 4CHNA 2ZM6K 5HRRA 3HL8A 1HNXK 3HI0A 2KFNA 4JEPA 1WB9A 3L2WA 3DOKA 1UAXA 3THYB 1UA0A 1NGAA 3THXB 2I7NA 3C65A 3M8PA 3J80O 4DF8A 2X6NA 3SMSA 2E20A 3AO3A 4FJNA 1RTJA 2YHAA 1VAZA 1NJYA 3KLEA 3DJCA 1JLQA 2UXDK 1BOTO 3L3VA 4BC5A 1ITGA 2QWRA 4FWLA 3VA3A 1YIJN 2ITGA 4M3WA 2RPIA 4BR7A 4BRDA 3B6PA 4WQ5C 4DG1A 3SPYA 3R9PA 1RT3A 4M42A 3M6GA 1VQ8N 4H4OA 4WQ5A 2P9NB 2QWPA 4AHVA 2KW4A 1Q86O 1CXQA 4PKHA 5BRHA 3DOLA 4YORA 2CGLA 3WNEA 5F1XA 3F9KA 4JS4A 1NNEA 5JS2A 3H3OB 4CZMA 1JJ2M 1VRUA 4FXDA 1KAYA 2G8FA 3DLKA 3ZLJA 1ASUA 3CJ9A 2F9TA 3CFRA 4MO5A 5AQGA 4DR1K 3UKUA 3LWLA 4CK3A 4CJWA 5BPLA 1OVYA 5JLHA 2HHWA 2YHYA 4K8XA 2O8BB 4PWDA 3EL2A 4K8ZA 2Z1GA 3GL1A 4OPHA 3J7YP 3GG4A 1E4GT 1U2VB 2P9SB 4DR7K 4DSKA 3H6EA 3H46O 4BRCA 2KTQA 3V9UA 4CHYA 2UXBK 3ATVA 3K0SA 1NJZA 1S72N 3OYKA 3MWTA 4XIUA 3K5NA 3TAQA 3P1GA 3HXMA 3DRRA 1EWQA 3DAWA 1EX4A 1GLJO 1KVAA 1NWKA 3AGRA 1GLAG 5KRTA 3TR8A 3Q7BA 1D9FA 3DLBA 3G6EN 3KLGA 4DSJA 1Q8IA 4CFAA 4IOCL 3AVMA 3PO4A 4FLYA 1JCEA 1U45A 1VSHA 4ELUA 1RBTA 5BN9A 2QW9A 4KH6A 3H45C 3SLCA 3L8BA 4FZXC 3TTFA 4KI4A 1RFQA 2YJEA 2Z1IA 2GUPA 3TAEA 3CCMN 1T6CA 4FJXA 2F8SA 3K5MA 3E01A 3CERA 1S1UA 3DWLA 3BUZB 3K9JA 4RTFD 3TAMA 1XUPO 3M8RA 4FWNA 1JLEA 1NGDA 4JKGB 5CE3A 1VSLA 4O8UA 4B08A 3AAPA 2YI1A 3O3GA 4CJQA 4MQ3A 3FZKA 3V1RA 3GDQA 4JI3K 4M3XA 3MEDA 4BE2A 5CYQA 2VQEK 3BP8A 4IXCA 2HMIA 3KWIA 1IV0A 3FZMA 4CW7B 1NGHA 5K14A 5C12A 1WSFA 4FJIA 3TSQA 4CJVA 1CZAN 4E1NA 1K8AO 2IVPA 2BDPA 1HQUA 3K59A 2UUCK 2A1SA 3AA2A 3SJHA 2IIRA 1RILA 1HYZA 3CMAN 1NOZA 3JSMA 3U9ZA 4LF8K 4JHDB 4BACA 3SUNA 4JI4K 4HVJA 2VWJA 5TKWA 3AY9A 4K0KK 1RDUA 1T7PA 4PHTX 1Q18A 5HOOA 3D2EB 4JD2B 1KTQA 3IG1A 4FOIA 5KGWA 3ZT0A 3AVHA 5FROA 1L3SA 4LSLA 4J2BA 1WBBA 4WYBA 2KKZA 4IFEA 4IG0A 3AGKA 1C0GA 4FZYA 4KTQA 4MDAA 5J1EA 3ZYYX 3H1QA 4NCAA 2WONA 1HPZA 2CGJA 2FBTA 2RHKA 3AVBA 1EQYA 1T3VA 4GV3A 3QERA 2G8HA 4ISGA 4KHQA 4H4MA 5KPTA 3AA4A 4DR3K 4FM0A 1WSHA 3ZETB 2GWKA 3S3OA 3SAHA 2E1YA 4A5AA 4Q0BA 4YY3K 3CCUN 1P8ZA 2F7TA 3HVTA 5JVHL 1HYSA 3KK7A 4AILC 2HVIA 4E19A 5AQZA 4JYAK 4B3TK 1S1VA 3A5MC 3LAKA 4RW4A 3LP3A 3F5TA 2OZMA 3I55N 1KAXA 1MU2A 5GADP 1XC3A 4BRHA 5JVGL 4H0OA 2NZTA 4FOEA 3EE8A 3M5RA 4CZIA 4C8MA 1C6VA 4OO1J 1ESVA 3WEEA 4A62A 4IFVA 2YHBA 1DGKN 4HCCA 4ID5A 5AJ3K 1K8KB 4KREA 2HBLA 3G10A 5FPNA 4BR4A 3TANA 3HVRA 1ZBHA 1C1BA 2A3ZA 1G15A 4K25A 3CHWA 4CZLA 4KV8A 4N41A 4GNIA 4NCGA 1RTDA 3H3NO 2P9SA 3PSFA 4I7FA 3MN5A 4YHHK 4HHTA 4IEIA 1U6ZA 5HP1A 3O4NA 3HM8A 3HPHA 5AQVA 2X78A 2WFBA 4WQ4C 2E2OA 4CGDA 5E26A 4PQUA 3CJAA 1RDCA 3CQYA 2BH1A 4GVMA 4F4KA 2CH5A 4OLAA 3DLHA 4IOXA 4DUYK 1LW2A 2P1JA 1TKTA 5AZIB 3SCXA 4CCHA 4C1NI 2GWJA 2O8FA 1IBMK 3CM6A 1TK5A 3EYZA 3AVNA 4H8KA 2VGNA 3K5LA 2ZQBA 2PBDA 4YOYA 5A2QO 3L2RA 1M1KO 4CD1A 1WAJA 3JXUA 3GE1A 3OYNA 5F2RA 5HBMA 2YX6A 3KK2A 5CR4A 4FW1A 3TAFA 3SYZA 1Z26A 3CCLN 3MEEA 5AQJA 2P9LB 5KQDA 3G0ZA 2FBVA 2P5OA 2XY5A 1W7AA 2P9IA 5E84A 4EP4A 3PX0A 1ATRA 5AQUA 4FWSA 2HF3A 2QA4N 1TK8A 1SKRA 1N36K 1HJRA 3OJUA 4Q5VA 4B3OA 4E3SA 3SUQA 2VWKA 1NGEA 2O8CB 3NH1A 4ZTJA 3A5NC 3ZSOA 3EKSA 3T7ZA 4A5BA 3VEXA 4CZEA 3O4WA 4CEZA 1BHLA 5FRMA 3SK3A 1VQKN 2E6LA 2YV0X 4JI5K 1DKGD 2XY6A 4JK9A 3RSEB 2OTJN 3D6RA 4LH4A 3RR8A 2XY8A 2NRRA 1IBLK 4DV3K 1C0TA 3DMJA 4JN4A 4LSNA 2QWQA 4NXNK 4OPAA 4RW6A 3VQ6A 1J54A 4DSEA 4DFPA 3AVIA 3TSUA 2KQ2A 2JLEA 2A41A 4H03B 4CEFA 4EZ9A 4DU3A 2HVHA 3MK6A 5LL6Z 4YDUC 4ILJA 1R0AA 5AQIA 4R5PA 2PYLA 2X6SA 1IKVA 3VA0A 4YDUA 5M1FA 3DXMB 1TV6A 1SQKA 1IJJA 1KLNA 3NGZA 1S1TA 2BGGA 1QTMA 4BDYA 1NMDA 5KPZA 2HNZA 2HF4A 4NYNA 1WOQA 4BWJA 3SAGA 3NAEA 1NK8A 2O8EA 3CXCM 4QOZB 2BTFA 4MO4A 1KAZA 5JS1A 4BDZA 4FCYA 3C6UA 1NOYA 2YNIA 1E4FT 5HLFA 2YNHA 3VESA 3VQ9A 4CZFA 4ID1A 3OW2M 4CBUA 4E1JA 4LF9K 1YTUA 1X9MA 3AVAA 3S3NA 1HKBA 4M3YA 1TUYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC2 N;  1VQ7 N;  3CMA N;  1KC8 O;  5GAH P;  3G71 N;  1YI2 N;  1Q82 O;  5DM6 L;  2ZJR L;  1QVF M;  1S72 N;  4WFB L;  1YJW N;  2OTL N;  5HL7 L;  5H1S Q;  3CCQ N;  4WCE L;  3G4S N;  4WFN L;  3G6E N;  1ILY A;  3I56 N;  3DLL L;  3CPW M;  4UY8 O;  2QEX N;  4IOC L;  1Q81 O;  3CF5 L;  3CXC M;  1YJN N;  1VQM N;  1M1K O;  3OW2 M;  1YIJ N;  1NJI O;  4WFA L;  1N8R O;  4IOA L;  3CME N;  4WF9 L;  3CCL N;  3CCM N;  1VQ8 N;  3CD6 N;  1KQS M;  1VQ9 N;  1Q7Y O;  1Q86 O;  1W2B M;  1VQN N;  1YHQ N;  2QA4 N;  2ZJQ L;  1VQL N;  1YIT N;  3CCU N;  1VQP N;  3CCE N;  5JVH L;  3CCR N;  1YJ9 N;  1VQ6 N;  1VQ4 N;  3CCS N;  1JJ2 M;  3I55 N;  3PIP L;  1QVG M;  1VQO N;  1VQ5 N;  5DM7 L;  1K9M O;  5GAD P;  1VQK N;  3CC4 N;  1KD1 O;  4IO9 L;  5JVG L;  1M90 O;  3CCV N;  2OTJ N;  3J7Z O;  5MLC Q;  3PIO L;  1K8A O;  1OVY A;  2ZJP L;  5GAE P;  3CCJ N;  4U67 L;  5GAG P;  1K73 O;  3CC7 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T8E A;  3KZB A;  3R8E A;  4JKE A;  1RT4 A;  3CJB A;  3DI6 A;  4DKW A;  3O9U A;  2O8F B;  4JRQ A;  3CPE A;  4WE1 A;  3ZEU A;  1I94 K;  4H5R A;  3OBW A;  5AQW A;  2NNW A;  3N4Q A;  5KRS A;  1NK9 A;  3UKR A;  3K58 A;  3FZF A;  1LWF A;  4WFB L;  2UU9 K;  2NRZ A;  1F21 A;  4CEO A;  3VEO A;  1NGB A;  4AHR A;  1GLC G;  3VQE A;  4C1N K;  4X62 K;  5KPR A;  5C2D A;  4LFA K;  1IH7 A;  3A8Y A;  4C8O A;  2W6L A;  5M1N A;  2QXL A;  4H0Y B;  4B9S A;  1UOC A;  1WNS A;  2GBZ A;  1CXU A;  3P5J A;  3SMP A;  3ITH A;  1NG9 A;  2P9I B;  3IKM A;  4ELV A;  3BEX A;  4CK1 A;  1J5E K;  4NCB A;  4ELT A;  4EIA A;  3ZSR A;  4CI6 A;  4PY5 A;  1JKH A;  1D9D A;  4KHY A;  3H1V X;  4IOA L;  1H1V A;  5BR8 K;  1D4X A;  4CEQ A;  1ZBL A;  4WF9 L;  5JMV A;  3HOS A;  4OVL A;  2YJF A;  3OY9 A;  1Q7Y O;  5KQ8 A;  2VG7 A;  5ADX A;  2ZGZ A;  1HQE A;  1WAF A;  4YOX A;  3F2K A;  2P9K A;  3OJS A;  1YHQ N;  1IKX A;  2WOM A;  3A2F A;  2UYT A;  3NBP A;  3QB0 A;  1L3U A;  4LH5 A;  3L6Q A;  4LF4 K;  1VQ4 N;  4DR6 K;  3I8B A;  3SJJ A;  3EZW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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