3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
3CMEN 1YHQN 1Q81O 1KC8O 1KQSM 5HL7L 3CCMN 3CPWM 1Q86O 2OTJN 1YIJN 1VQ9N 1VQ4N 5GAHP 1N8RO 5DM6L 3DLLL 1M90O 4WFAL 1OVYA 1M1KO 3PIOL 5GADP 3I56N 1VQMN 3CXCM 1W2BM 1QVFM 4WFNL 2OTLN 3CCRN 1VQ6N 5H1SQ 3CCEN 4UY8O 1VQNN 3CCUN 1YI2N 1KD1O 3CCVN 3J7ZO 1YJWN 3G6EN 1VQON 3CCLN 5GAGP 1VQ5N 3CF5L 1VQKN 3CD6N 1VQ7N 5GAEP 1VQ8N 3CMAN 3PIPL 4U67L 1QVGM 3G4SN 2ZJRL 2ZJQL 5JVHL 1K9MO 3CC7N 3CCQN 1VQLN 3I55N 1Q82O 1K73O 5MLCQ 3CCJN 4WFBL 1K8AO 1ILYA 3G71N 1YJNN 2QA4N 4IO9L 3OW2M 3CC4N 1S72N 5DM7L 3CCSN 4WCEL 4IOCL 4IOAL 5JVGL 2QEXN 1YITN 3CC2N 1JJ2M 1NJIO 1Q7YO 1VQPN 4WF9L 1YJ9N 2ZJPL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F8SA 3TAQA 4W5TA 1S1TA 1HKGA 2VG5A 4ILGB 5F2RA 1BA0A 5C0YA 3WT0A 4OPAA 5C2FA 1NK7A 1TKTA 3A5NC 4BR5A 4B1UB 3ZT2A 3K9KA 4DR1K 4FXDA 4FJ7A 2HHVA 3L6QA 3LWLA 1KRPA 3CJCA 3J8AA 1T8EA 1RTIA 2OTLN 2IOCA 2NRWA 3HOTA 1B9FA 5CE3A 3ULEA 3SZ2A 2G8HA 5FPEA 3MEDA 4DSJA 4YDUC 3GBTA 3K57A 4TSXA 4CJPA 3G25A 2A42A 1RNHA 4CZJA 1BIZA 2PFUA 3WNEA 4YFUA 2HVHA 3JAMO 4CK3A 4CI6A 4LFCK 3EE9A 3WEEA 3CMAN 1NMNA 1UWBA 1BO5O 3VQ7A 3ZSXA 3ID8A 5J2NA 4XEIA 2HF3A 1QVGM 3CJ9A 3C6AA 1MA9B 2RF2A 4B9NA 1TYQA 3L2RA 2XO7A 1HQEA 1LW2A 1JCGA 4FJXA 3SJJA 1T05A 3P1GA 3S9HA 5AQIA 1A5XA 4JI7K 1X9SA 1NOYA 2A41A 1CZAN 4M3RA 1C1CA 2ATQA 3D2FB 4NCGA 4CZGA 1IKWA 3SMPA 4BRLA 4MDBA 3TR8A 3QLHA 5JVGL 2FBTA 2O8EA 4NXMK 1NJIO 5AQGA 1VSIA 2E88A 1VQPN 2UXCK 4RW9A 3KLGA 3K5MA 4C8LA 4ELVA 3BZCA 4CW7B 4CFBA 2E2OA 1DGKN 3CPWM 3FGUA 1EKEA 3FZLA 3BP8A 2KFNA 3DWLA 2X74A 3SV4A 3TU5A 3AVJA 4MFBA 3D7EO 4B08A 2EX3A 4WFAL 1RDAA 4CZLA 1Q8IA 3KK3A 3FE1A 3CM5A 1WSJA 3MN7A 3J7YP 3PO4A 1SV5A 4DV2K 4FWPA 1SUQA 2R7YA 2KLAA 4Z4EA 4HHTA 2YHWA 3MX5A 4CJWA 5FPDA 2GEMA 3G10A 2B5JA 4JLHA 1XC9A 4QOZB 3A2FA 4ISFA 2Z1GA 3H08A 4CK1A 4JKGA 4A57A 2P5OA 3P83D 3OYGA 5C42A 3IS9A 3CFRA 2A1RA 4OKEA 4RW6A 3Q7CA 4DQQA 3NFAA 3QICA 2ASPA 4QS9A 4Y1DA 4B1WB 4HUGA 5ADXA 2PAVA 2FF6A 3O08A 3M8QA 2Q0UA 3LDPA 3NGYA 3LP2A 3L2VA 1RGIA 5AFUH 4BE2A 4AHRA 3VQCA 1D9DA 3NDKA 4FJKA 2P9SB 4BC5A 1ATNA 3VPZA 3PO5A 2HHSA 4MQ3A 1L3VA 4DV7K 3O8MA 1L3UA 1S9GA 3V1OA 3K9JA 4FL9A 3A8YA 3NF9A 4J2AA 5TKYA 1HPMA 4U7BA 4RG8A 3CCSN 4JI2K 4KREA 3K0SA 3NAEA 1JLFA 4PY5A 3CG7A 5M1KA 3KD5E 1ASUA 2W41A 4CHNA 2F9WA 2QTDA 1LWEA 1G15A 3HM8A 3LDQA 2OZMA 1YHQN 3V81A 1VRTA 1RT5A 4DR7K 4IDKA 5C12A 3DXKB 2Q0RA 3QINA 3ZSQA 1OVYA 4M42A 1MWKA 4FZYA 3IDHA 1RT1A 3U6FA 1J5EK 1SAZA 1QQOA 3IRXA 3P4IA 4YNQA 2VWBA 4JI6K 2I7PA 4LF7K 1BGXT 3VTIA 2E2QA 1MU2A 2IVOA 4W5RA 3THYB 1KLNA 1KAXA 1XHZA 1H1VA 4KAZA 2Y1IA 4CJRA 1L3TA 3VF6A 2Q3SA 5AQNA 3ZX0A 3LDNA 5J2MA 4EZ6A 3QIPA 4BRAA 1CZ9A 3F5TA 5FDLA 1VQ8N 4BC2A 1BG3A 4FWOA 5AQYA 5GIPA 4LF9K 3VQPA 4KB1A 1QQCA 2ZWHA 1DTTA 3H6EA 5AQXA 4DTOA 1IJJA 3ENBA 4CEQA 2HBJA 5KQ8A 2KFZA 4LH4A 3SBTA 3CJ7A 4DS4A 2QWQA 4BRFA 4IJNA 1WUAA 4CIFA 4JI1K 3LDLA 4CHYA 1HUXA 4DFJA 1Q82O 1YAGA 1BUPA 4FK2A 1K73O 3TSPA 5MLCQ 3C6UA 4DQIA 1WSEA 2QI2A 4F3OA 3T69A 3ULEB 4OLAA 2E20A 3G71N 3KK1A 4FJNA 2P9KA 4Z4GA 1RT4A 2OPPA 4IO9L 5KI6A 2VGMA 2GUIA 1ZBSA 1C0GA 1NGBA 4ELTA 1WAJA 2IDOA 2AP1A 3V1RA 4PHTX 1HNXK 2P9UA 3MN6A 3QBWA 1VSLA 3L2UA 3WEEB 2IS3A 4BACA 1XWLA 1RBVA 2O8DA 3QNOA 3OYEA 2O4GA 4DTXA 1SL1A 4I9QA 5E84A 3AA4A 1S6PA 3OBYA 1TYQB 1QSSA 4E3SA 3DXMB 2V7ZA 4CGJA 4EP5A 4M63C 5BPLA 4DS5A 5GAHP 1N8RO 1LV5A 2B4JA 1S1WA 3MN5A 4BVOA 1M90O 1R0AA 2P51A 1NWKA 2D0BA 4I6MA 3E9LA 3V9WA 4F2RA 5LJVA 4DUYK 4E89A 4KKOA 4JKFA 2JLEA 4WFNL 3KLIA 3VQ9A 3O6WA 3JYTA 1VQNN 4LSLA 1YXQA 3VQDA 1ZYQA 1HNIA 1WAFA 2A6AA 3VMFB 4N41A 3NF7A 3G6EN 4DTMA 2Q2RA 4EAHD 4FW2A 3U9DA 2G8VA 2YJEA 3QDKA 4NLCA 4ZHRA 1DT9A 4H4OA 3CPEA 2P9LA 4CEFA 2NZTA 4X65K 3F73A 1E4GT 3O3GA 2D0PA 1VQ7N 4XH4A 4CHZA 2HNZA 3SPYA 2UUCK 4B3MK 3VERA 5JS2A 3CQ8A 2XRIA 4EFHA 4JS4A 3DLBA 4MDAA 2P9IB 1S6QA 3ZT3A 3PX6A 2V52B 1RDWX 3CHWA 3I55N 2XY8A 4BROA 5EVZA 3RSEB 3SQ1A 3DI6A 4JKGB 3IMXA 4JKAA 4AM7A 1YJNN 1W97L 3NH2A 4KHQA 2NRZA 3AVNA 3CC4N 4CECA 5DM7L 3V9XA 3QEXA 1JCFA 3M1FA 4NYNA 4H0VB 2EHGA 4JKEA 3VEOA 4O5BA 1QTMA 4ZTJA 1CXQA 4J8FA 3IFRA 5T7BA 3L3UA 4LC9B 1YJ9N 5HOOA 3I8DA 2HBLA 3BF3A 3DLGA 2O8BA 1LWFA 4JV5K 3OYFA 3W3DA 2XY7A 3EL2A 3ISNC 1U47A 1XMQK 4B3RK 1N6QA 4B3TK 5AQRA 3SYZA 3AGKA 3PV8A 1NK0A 4BRCA 3U9ZA 4AF1A 4B9TA 1IO2A 1V4TA 2HMPA 5KGXA 1W2BM 2G8KA 2VGNA 1BOTO 1WSGA 1T03A 3L4IA 3U3GA 4B1XB 3QIOA 3TI0A 4K8ZA 3HI0A 1CXUA 4Z4CA 1GLBG 2P1JA 5KRTA 4DTJA 1C6VA 3ASMA 3O80A 1RDDA 1NM1A 2HNYA 3RWUA 2VWKA 2ZE2A 1X9MA 2CH6A 3PIPL 4XH1A 3HVRA 4PL8A 1VSJA 3M8SA 4JKHA 1RT3A 4IKFA 1QE1A 3EO3A 2OPQA 3MWPA 4DV5K 1MWMA 3ZSYA 3L4QA 4BG8A 2G8UA 3HL8A 1XHXA 3K58A 3HVTA 3TANA 3C7NA 1TK0A 1D4XA 2VQFK 3SAFA 4CZHA 4H5TA 4BQZA 1HJRA 3KK7A 1N32K 4DLEA 1U04A 3DOKA 3MN9A 4A61A 4NLBA 3ZCMA 4B3SK 1J54A 3WXIA 4JHDA 2QWPA 1TL3A 4CZEA 3E66A 4RW8A 4HCBA 3ZSWA 5BRHA 4JKBA 4CZFA 4Z4IA 3AGRA 5KPRA 2AA4A 3L0QA 1X9WA 4IFEA 3BGRA 4DMNA 3FLCO 3SCXA 2XY5A 1A5WA 2P9PA 3N4QA 4AHCA 5BRFA 2ITGA 4CERA 3UKRB 4CJFA 4E0DA 2G8WA 1K8KA 2ASMA 4B1YB 1UOCA 4EHUA 3SAGA 4IZ9A 4CF8A 1IG8A 2IIRA 3EY1A 3HSCA 1ATRA 5KGWA 1J5OA 1ZBFA 4DHYA 1X3NA 3PIOL 5GADP 4KHUA 4BRKA 1OVQA 3P39A 3O3HA 1KTQA 1QS4A 2P9KB 3OJSA 1NKBA 1SL0A 3KD1E 1TK5A 4BGAA 4O55A 4KFBA 1KVBA 2QW9A 1BU6O 4K43A 3KLHA 4CEZA 3O1BA 2RE2A 3QEPA 4DV4K 5GINA 1U48A 5F1XA 3HSTB 5AQWA 3ATVA 2FSKA 2O8DB 4CJEA 4AILC 3O9SA 1YT3A 1Q9YA 3QEIA 3S3OA 2I5JA 3LWMA 2BDPA 1VSFA 4BQLA 2DFFA 4Q0BA 2BANA 2QWRA 5F0XA 4CGDA 1ASVA 4ILJA 4KBOA 1P90A 3OS0A 1BHLA 5EX5A 3O4WA 4I6MB 5AR0A 4BRHA 2RHKA 4H0YB 1EETA 4FCYA 1RT7A 2CGLA 3DRSA 2ZJQL 3VEXA 3LDSA 3RRHA 5AQFA 1U2VA 4GKJK 2Z1JA 4BWJA 3VN5A 3ZT4A 1EXQA 1NBWA 2O8CA 3V9UA 1EO1A 3C95A 4YOTA 3OYJA 1JLGA 2GV9A 1HX1A 4IG3A 4CJKA 4ISGA 3FZKA 5D3GA 2D1KA 2FC0A 5I3UA 4CJLA 1BA1A 3B6OA 2YI1A 4O5FA 4CJ3A 2OZSA 4H0TB 4H5NA 3VA0A 5M1NA 3NH0A 3VGMA 4CJUA 2BH1A 4K0KK 1XI1A 1WB9A 3ZETA 1HPZA 2HB5A 3O9UA 4BDYA 4BRGA 2P9NA 4B9QA 4OVLA 4KH5A 3LDOA 3VEZA 5AZIA 5K14A 1D5AA 3WQTA 1XC3A 4HUEA 4X66K 4FW1A 3VQAA 1Q81O 4RTFD 3I0RA 1TV6A 4CJVA 2D4WA 4A59A 3LZIA 4JEPA 2KQ2A 1VHXA 2HNDA 3KKRA 4XIUA 5JS1A 1EX4A 3H46O 4IG0A 3OYBA 4Q5VA 4KTWA 4CF0A 2CGJA 5BR9A 1W9HA 1U49A 3DLRA 2YHYA 4IEIA 2E4LA 4A62A 3E1YA 1NGIA 1NK6A 1QVFM 2IC3A 1XNRK 2HHWA 2GX9A 1T44A 4BE1A 1JLEA 4BRIA 4FJLA 3CFPA 3HZ6A 3FFIA 3SBGA 4CEAA 1HYVA 5LMUK 3O9TA 1KD1O 4YOVA 3QFPA 4NYFA 4A2AA 3J7ZO 4B9SA 4IFYA 2YHXA 2NRVA 5KQDA 3WXKA 3CCLN 1L3SA 1X3MA 4A5AA 4PL7A 3MCPA 5AQZA 3AVFA 3NVKA 4KHPK 4BC3A 1VQ5N 2O8BB 1XQSC 2A3ZA 1TVRA 3BF1A 2Q31A 3WNHA 5JICA 3JS6A 4CIGA 2Q36A 2FF3B 2UUAK 2HVIA 1BL3A 2QWOA 5GIOA 3K59A 3HT3A 1KCFA 4E7JA 1YF5L 3RRGA 4FLZA 2E1ZA 3AY9A 3QEWA 1FW6A 2KZMA 4H5RA 4I7FA 2Z1HA 4F9OA 5AZJA 4BDPA 1SS6A 1REVA 4GVEA 3MCAB 5DK5A 1WSIA 2UYTA 3LPTA 4QS7A 1IV0A 2WFBA 3AO3A 4M3ZA 3IUCA 4FYDA 1QSYA 1N34K 3RTVA 3UE5A 4CJ5A 5LY3A 4K41A 1S1XA 4M3UA 3KLEA 3HXMA 3OW2M 1RBRA 1TAUA 1BDGA 4NXNK 3AAPA 3O1WA 4KHYA 4OO1J 2HHHK 1F21A 4IO8A 3T1HK 4LF8K 3T3FA 4K42A 4E1MA 3KWIA 3EEQA 5M1PA 2PZSA 2QKBA 2NRRA 3WXJA 3U3YA 1TUUA 2QWMA 2OANA 4I2QA 2BE2A 3ZT1A 3TAPA 4GY2B 5SZTA 4CF2A 1G99A 1EWQA 2YNFA 1HNZK 3KWGA 4FK0A 3HOSA 3MEGA 1ESVA 3VEVA 1DEJA 1T3VA 4B9LA 3H1VX 4C23A 3ZSVA 4M3YA 4BRMA 3CQXA 1ATSA 2D0CA 4UY8O 3OS1A 3CCUN 4LF4K 4CGGA 3KLFA 4B9VA 4FLVA 1YJWN 3AVMA 4BGBA 1RCHA 3KK2A 4CBUA 1QZ5A 3HYFA 3R8EA 1WNSA 1GLAG 1YUWA 5GAGP 1JCEA 5B8HA 1FK9A 5AQVA 4E7HA 4K8XA 2P9PB 1C0TA 1VQKN 1ZC6A 1UA1A 3CJAA 5BREA 4CEBA 4H4MA 1K8KB 5M1FA 3IKMA 3ENOA 4KI4A 4QS8A 3ZEUA 2Y1JA 4M3WA 4N5SA 3D2EA 1S5JA 4DTUA 4PWDA 3ZX3A 4X62K 1T6CA 1Z05A 4LF5K 3Q7BA 3DMJA 1HRHA 3MXIA 3LAMA 3SV3A 1NGFA 4FWQA 2VG7A 3GL1A 3SMSA 4WQ5C 2UUBK 1TK8A 3NE6A 4M7YA 4FZXC 1X1PA 3TWHA 3SUQA 1JXBA 5AQJA 4F2SA 4FWNA 3F9MA 4OGEA 1GLEG 3G0ZA 4JI5K 1ILYA 4GVMA 3SK3A 3VQ5A 3P31A 3ZSZA 5BPNA 4IFVA 1KSPA 3PX0A 4M45A 3MK6A 2HHXA 4FWLA 4GMJB 5KPZA 4R5PA 1S72N 2ZF5O 4ICLA 2E8AA 2YX6A 5BPMA 4CGFA 3HP9A 2NRHA 4MO5A 4FM1A 4FZZA 4CJ4A 3K5NA 1TAQA 2YNHA 5FRNA 2ZJPL 5HBMA 1VSEA 3TABA 1Y64A 5AFUA 3CETA 4QAGA 4KH4A 2H3GX 3I0SA 2HBMA 2OTJN 2RN2A 3H3OB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CME N;  1YHQ N;  1Q81 O;  1KC8 O;  1KQS M;  5HL7 L;  3CCM N;  3CPW M;  1Q86 O;  2OTJ N;  1YIJ N;  1VQ9 N;  1VQ4 N;  5GAH P;  1N8R O;  5DM6 L;  3DLL L;  1M90 O;  4WFA L;  1OVY A;  1M1K O;  3PIO L;  5GAD P;  3I56 N;  1VQM N;  3CXC M;  1W2B M;  1QVF M;  4WFN L;  2OTL N;  3CCR N;  1VQ6 N;  5H1S Q;  3CCE N;  4UY8 O;  1VQN N;  3CCU N;  1YI2 N;  1KD1 O;  3CCV N;  3J7Z O;  1YJW N;  3G6E N;  1VQO N;  3CCL N;  5GAG P;  1VQ5 N;  3CF5 L;  1VQK N;  3CD6 N;  1VQ7 N;  5GAE P;  1VQ8 N;  3CMA N;  3PIP L;  4U67 L;  1QVG M;  3G4S N;  2ZJR L;  2ZJQ L;  5JVH L;  1K9M O;  3CC7 N;  3CCQ N;  1VQL N;  3I55 N;  1Q82 O;  1K73 O;  5MLC Q;  3CCJ N;  4WFB L;  1K8A O;  1ILY A;  3G71 N;  1YJN N;  2QA4 N;  4IO9 L;  3OW2 M;  3CC4 N;  1S72 N;  5DM7 L;  3CCS N;  4WCE L;  4IOC L;  4IOA L;  5JVG L;  2QEX N;  1YIT N;  3CC2 N;  1JJ2 M;  1NJI O;  1Q7Y O;  1VQP N;  4WF9 L;  1YJ9 N;  2ZJP L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F8S A;  3TAQ A;  4W5T A;  1S1T A;  1HKG A;  2VG5 A;  4ILG B;  5F2R A;  1BA0 A;  5C0Y A;  3WT0 A;  4OPA A;  5C2F A;  1NK7 A;  1TKT A;  3A5N C;  4BR5 A;  4B1U B;  3ZT2 A;  3K9K A;  4DR1 K;  4FXD A;  4FJ7 A;  2HHV A;  3L6Q A;  3LWL A;  1KRP A;  3CJC A;  3J8A A;  1T8E A;  1RTI A;  2OTL N;  2IOC A;  2NRW A;  3HOT A;  1B9F A;  5CE3 A;  3ULE A;  3SZ2 A;  2G8H A;  5FPE A;  3MED A;  4DSJ A;  4YDU C;  3GBT A;  3K57 A;  4TSX A;  4CJP A;  3G25 A;  2A42 A;  1RNH A;  4CZJ A;  1BIZ A;  2PFU A;  3WNE A;  4YFU A;  2HVH A;  3JAM O;  4CK3 A;  4CI6 A;  4LFC K;  3EE9 A;  3WEE A;  3CMA N;  1NMN A;  1UWB A;  1BO5 O;  3VQ7 A;  3ZSX A;  3ID8 A;  5J2N A;  4XEI A;  2HF3 A;  1QVG M;  3CJ9 A;  3C6A A;  1MA9 B;  2RF2 A;  4B9N A;  1TYQ A;  3L2R A;  2XO7 A;  1HQE A;  1LW2 A;  1JCG A;  4FJX A;  3SJJ A;  1T05 A;  3P1G A;  3S9H A;  5AQI A;  1A5X A;  4JI7 K;  1X9S A;  1NOY A;  2A41 A;  1CZA N;  4M3R A;  1C1C A;  2ATQ A;  3D2F B;  4NCG A;  4CZG A;  1IKW A;  3SMP A;  4BRL A;  4MDB A;  3TR8 A;  3QLH A;  5JVG L;  2FBT A;  2O8E A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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