3CJBA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with gelsolin-segment 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 104
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjbA04
1H1VA 4WQ5A 2QW9A 1R59O 3DJCA 4IJAA 5KQ8A 4MO4A 3VERA 2V52B 4JAXA 4I6MA 4I6MB 3O1BA 2IIRA 4RTFD 2P9LA 3S41A 4B1UB 2GELA 4BR5A 1EQYA 3H6EA 4CZLA 3HBTA 4CZIA 2A5XA 3LDLA 2CGKA 2I7NA 1JCEA 2VWBA 3HI0A 2IVPA 1ATNA 4MO5A 1HJOA 2QWMA 5AZIB 4IO8A 1HUXA 1KAXA 4FPAA 4H0TB 1SZ2A 5BREA 3UKRB 1QZ5A 1MWKA 3AAPA 3QDKA 3MN6A 1Y64A 5BN9A 4B1YB 3LM9A 3VEXA 1BUPA 1MWMA 1U2VB 4H5NA 1KAYA 5I9EB 4ISFA 4FO0A 2Q0RA 4J8FA 4K25A 3P4IA 1C0GA 4FWPA 1ZXOA 4H0YB 5AQMA 3C0BA 3MCPA 4XH5A 2ASOA 3FFKB 5KPTA 3CETA 3FLCO 1BO5O 1G99A 4CJ7A 5AQTA 1NGIA 3MMVA 3WUHA 5BN8A 1MDUB 4BG9A 3ZEUA 1Z05A 3ULEA 5AQOA 1YVNA 1CZAN 4JHDB 1E4FT 1BA0A 2IVOA 2FSNA 3MN7A 3A0IX 4MLEA 5AQJA 4BVPA 3DWLA 2E2PA 4IXCA 1C0FA 5AQPA 2E88A 5KPRA 1K8KA 3LM2A 1S22A 3M6GA 2P9LB 4BRGA 4H0OA 2CGJA 5AZJB 1QQMA 2QWLA 3ATVA 4EAHD 1NLVA 4JN4A 4BRFA 3FE1A 2P9PA 4QS8A 2P9KB 3D2EB 3VPZA 1GLLO 3G25A 4BRCA 3EKSA 3I8BA 3RSEA 2P9SA 3DXMB 3ZETA 4FWRA 3U4LA 1TYQA 1IG8A 1NGFA 3VESA 4BR0A 3O8MA 4FWOA 5BPMA 4EFHA 4EHUA 3M3ZA 2EWSA 4BC3A 3EN9A 3I33A 4ISGA 3CJ1A 2D4WA 2Q0UA 4C23A 4CZKA 4A62A 3CI5A 3EL2A 3KHYA 3W3DA 5AQUA 4CBWA 3HM8A 3WEEA 3LDOA 4H5TA 4BC5A 3FZMA 3H3NO 5JMVA 3H3OB 5KPZA 3VF2A 1GLCG 2YCHA 5CE3A 1GLDG 3VEYA 3MN9A 4H5RA 1NM1A 2VYPA 3GOIA 3VGLA 1YXQA 4AM6A 1GLBG 3QFPA 1QQOA 1SAZA 5ELZA 3CIPA 4FPBA 3SJHA 3ZX0A 1TYQB 3L6QA 4ISEA 4BVOA 5BPNA 2FF6A 4O5FA 1QHAA 4M7XA 4HWIA 5JLFA 1K8KB 5JICA 4B1WB 3VF6A 2P9KA 1JCGA 2PBDA 1XQSC 1V4TA 4M7YA 4WQ5C 3CJ7A 3FZKA 3SMSA 1X3MA 2P9IB 5E84A 5AQVA 1YUWA 2Q31A 1HPMA 2ASPA 4CZHA 1BG3A 4NB4A 3FGUA 3IUCA 1BDGA 3OHRA 2W41A 3AAQA 2ITMA 2A40A 1WOQA 2Q2RA 5F0XA 2FF3B 2CH5A 2A3ZA 3ZEUB 1TUYA 3ENOA 4DB3A 5KQDA 2YI1A 3D7EO 3VETA 1E4GT 3BUZB 2J4RA 3MDQA 1WUAA 3A5NC 3FZLA 3A5MC 2E2QA 2ZGZA 5FPNA 5BPLA 3VENA 4BRPA 3QMLA 3BF1A 2D1KA 3KVGA 3DXMA 3R6MA 3ZETB 3O5BA 5AQGA 4MLHA 2BUPA 2F9TA 3HTVA 3QFUA 2D0OA 5AQZA 1MA9B 4H5WA 4FOIA 4CBUA 2FXUA 5LJVA 3JS6A 3KZBA 3B8AX 1OKJA 5B8HA 3DAWA 5AQIA 1U2VA 3FR0A 3QBWA 4CD3A 1T44A 2YHXA 3H46O 3QBXA 4PKHA 4YDUA 1ZC6A 5F1XA 4BRNA 3RSEB 2QWPA 3O4WA 3O6WA 3DXKB 4GNIA 5AQXA 4H5VA 4XEIA 4PL7A 3WEEB 4NO7A 1RGIA 5AQRA 4FWQA 5LJWA 2P9NB 4BR4A 2F9WA 3O08A 3QICA 5AQSA 4FWMA 4BC2A 3VEWA 1NGJA 4BC4A 5AQYA 2GWKA 4B1VA 3BP8A 1NGBA 1T6CA 2DPNA 1IJJA 1NGCA 2P9NA 1NMDA 3C7NA 3BF3A 3VGKA 4QS7A 5LY3A 3WQUA 1YAGA 2NZTA 4FOEA 3U8XA 5ADXH 1HKGA 1NGAA 2P9PB 3WQTA 4A2AA 3ID8A 1P8ZA 4H0XB 1X9JA 4PKGA 2QM1A 2P9UB 1HLUA 4BREA 3SK3A 5BRHA 2ASMA 3ULEB 1GLJO 1U6ZA 4BRIA 4BROA 4FWSA 3J8AA 4RWTA 3VGMA 3IMXA 4L3QA 1GLFO 4RCHA 3CERA 1BA1A 4BRDA 4FSVA 5EY4A 1X3NA 2UYTA 3EKUA 4K43A 1J6ZA 4IWVA 3VOVA 2ZGYA 3JXUA 3MK6A 4HTLA 5AQLA 2E20A 1HKCA 3O80A 2V51B 5AFUH 1ATRA 3FZFA 4XH4A 3ZX2A 3EO3A 2E8AA 4CI6A 4M63C 2I7PA 4PKIA 2A41A 4KBOA 4AM7A 1NGHA 4JNEA 3LL3A 2E2OA 2D0PA 2E2NA 4PL8A 2YHWA 1HX1A 3H1QA 5AZJA 3CQYA 2ZWHA 3CJBA 1KAZA 3ATUA 3R8EA 4BG8A 4BGAA 2GUPA 1XC3A 4H0PA 2W40A 3D2EA 1ATSA 3CQXA 5FPMA 2QWOA 2HF4A 5BR9A 5AZIA 3C7NB 5JLHA 4BRMA 2V7ZA 3WXJA 4A61A 3IFRA 4CD1A 4BGBA 1BWFO 2NRHA 2H3GX 4DHYA 5TKYA 3SMPA 1QQNA 4GY2B 3HZ6A 5EVZA 1NWKA 3FZHA 3CJAA 4JHDA 4BRKA 3CJ9A 2QWNA 1HKBA 5AQKA 4IJNA 3DXKA 4BR7A 1RDWX 4QS9A 3WT0A 5E26A 1GLAG 2QWRA 2KHOA 1Z6RA 3ENHA 4WQ4C 4EIAA 4Z94A 5AQFA 4CZJA 3TPQA 2A42A 3CHWA 2AA4A 5FPDA 1V4SA 5BRFA 5EOYA 2HF3A 4CZMA 4JD2A 3U9DA 3D2FB 2YHYA 3LDPA 4E1JA 3H45C 4FWNA 1NBWA 4B1XB 2CH6A 5ADXA 4YDUC 3D2FA 1S3XA 2AP1A 3EZWA 4H0VB 3AY9A 4XH1A 4BRAA 3SLCA 1BU6O 2CGLA 2GWJA 2IVNA 3M1FA 1QZ6A 1LCUA 1DEJA 4FL9A 4BQZA 5FPEA 2NLXA 3W0LA 3LDNA 2QXLA 4LC9B 3UKRA 4BQLA 2GTDA 4BRLA 1TUUA 2HMPA 3AARA 4CZFA 3WXKA 2P9SB 1DGKN 5AR0A 3GG4A 1NGEA 2P9IA 4BRHA 1DKGD 3A8YA 3U9ZA 5AQHA 1LOTB 2GEMA 2A6AA 3ZX3A 1ESVA 5EX5A 1NGDA 1D4XA 3UB5A 1GLEG 3GL1A 3IDHA 5AFUA 3VF4A 4BR9A 4A2BA 4DCHA 4WQ4A 2E1YA 1KXPA 5AQNA 4CZEA 2WUSA 5AQWA 2FSKA 4F9OA 4CZGA 4FWKA 2OANA 4O8KA 4B9QA 2BTFA 2Q36A 5F2RA 4B1ZA 2P9UA 2Q97A 4K42A 2ZF5O 1RFQA 1BOTO 4BR2A 3TU5A 3WXLA 4Y0WA 3MN5A 3QB0A 3GDQA 4JD2B 3GE1A 1SQKA 3UKUA 3H1VX 3UKUB 1XUPO 2VCPA 3F9MA 3L4IA 5AQQA 3UE5A 3L0QA 3R9PA 4EHTA 2QWQA 3VEZA 2FLOA 2YJFA 3A5OC 3HSCA 3LDQA 3O1WA 4WYBA 4FWLA 4BRQA 2FSJA 2PAVA 4CBXA 3VEVA 2Q1NA 3WXIA 5BRDA 3A5LC 2YJEA 4IZ9A 1Q18A 2V7YA 5EXWA 1ZBSA 1JCFA 1NGGA 3VEOA 3CJCA 2HOEA 2E1ZA 4K41A 4DQ8A 3BEXA 1T6DA 3GBTA 4H03B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1H1VA 4ZHRA 1NJXA 3CCJN 1NK8A 4J2BA 4JI1K 4MO4A 4JAXA 4I6MA 3TTDA 2P9LA 2UU9K 4CW7B 3M5RA 3O9RA 4CZLA 4PWDA 2A5XA 1U48A 4DWIA 3HI0A 1OH5A 2IVPA 3PSIA 4QAGA 1RTIA 4B9VA 4MO5A 1HJOA 4DV2K 1UA0A 4IFEA 4IO8A 1HUXA 2QTDA 1KAXA 1QSLA 3UKRB 4AHVA 2O8EB 4JKHA 3CFRA 1JLFA 3MXJA 3K59A 1QZ5A 5BR8K 4KKOA 1IBLK 1N32K 1C0UA 1Y64A 2EX3A 3LM9A 4MDBA 1MWMA 1U2VB 1KFSA 4DSFA 1BIUA 3AA4A 4UY8O 1KTQA 4K25A 4CHQA 3ZCMA 3C0BA 3AV9A 3MCPA 3AVFA 5FDLA 3AVJA 2NRVA 3AVLA 4LF9K 3CETA 1G99A 3WUHA 3DLHA 3O9SA 2Z1HA 1ASVA 1SS6A 1T3VA 3QETA 2RHKA 5E41A 4IBNA 1E4FT 2IVOA 3CCQN 4GV9A 3MN7A 3VQPA 4YNQA 3HVTA 2E2PA 4YOXA 1N5YA 4B08A 4PA1A 1XHXA 3HYFA 4E19A 3VQ6A 1MU2A 4E7JA 4RW8A 4JN4A 2HVHA 3NAEA 1ILYA 2YHAA 3EKSA 3I8BA 3RSEA 3V81A 4FLTA 4NXMK 3ZETA 4FWRA 3ASMA 2ITGA 4JS5A 1IG8A 3V1OA 3VESA 3LPUA 3I55N 4WE1A 5CY4A 3AVGA 3OYEA 4DV5K 3T1AA 3M3ZA 3MEDA 3T1YK 3I33A 2D4WA 2Q0UA 2Z1IA 3CI5A 4KHNA 3KHYA 3KIOA 3HM8A 3NF9A 2F8SA 2O8DB 3DI6A 4DQIA 5JMVA 4I2PA 1M1KO 3SBGA 1TAQA 3VF2A 1XNRK 1GLCG 3ZSYA 4A5AA 2OPQA 4RW6A 5C42A 3V9SA 3MN9A 5H1SQ 1YXQA 4AM6A 3AVAA 3TR8A 4B3TK 2GBZA 5JS2A 1DTQA 4FPBA 1J9AA 1TYQB 4NCGA 4BVOA 4JRPA 4HWIA 2P9KA 3KLHA 1XQSC 4J2EA 3T1HK 4TSXA 4BWMA 4CJ5A 1KLNA 4FJNA 4IDHA 2UUAK 1N33K 4FLWA 3CYGA 3SI6A 1NJIO 4K8ZA 4KI4A 1JLAA 4C8MA 1KVAA 1E4GT 3BUZB 3G0ZA 4Z0UA 2J4RA 3MDQA 4C8NA 3A5MC 1YJ9N 2ZGZA 4CK3A 4CJLA 4W5NA 1LWCA 1ITGA 3ZETB 3HJFA 4CEEA 5AQGA 2F9TA 4OLBA 2D0OA 1MA9B 4W5OA 1EO1A 4CGGA 2FXUA 3KZBA 4DQRA 5B8HA 4QOZB 3DAWA 3ZSOA 1T44A 3JSMA 3ZSVA 3NF6A 1FXXA 3DRSA 4JI3K 3S5TA 3O4WA 3O6WA 4DG1A 2W6LA 4XEIA 4WCEL 3V9UA 1BGXT 3WEEB 3TAQA 1OH6A 5SZTA 2VGNA 1L3TA 4FJLA 4YOUA 4FWQA 2UUCK 2P9NB 4WFBL 3C94A 4DFMA 3O08A 3QICA 3PV8A 5HROA 3CF5L 2ETJA 4FLYA 1QTMA 3L2QA 4M41A 1X9MA 1VSIA 2GX9A 2JWLA 4FZZA 1NGBA 4HUFA 1NGCA 3G4SN 1RDAA 3BF3A 2NRTA 3VGKA 4JK7A 1TK5A 4CJWA 2C1GA 4YOVA 3WQUA 3I56N 2DY4A 1TAUA 1HNXK 3AVMA 4KHPK 5ADXH 1SKSA 1BL3A 4LF6K 1HKGA 2P9PB 4H0XB 1X9JA 1UA1A 2P9UB 1REVA 4LF4K 4BREA 5HP1A 3ULEB 1GLJO 4KTQA 4BROA 4FWSA 3VQEA 3DMJA 3SUNA 2QXFA 4OJRA 3VGMA 4Q0BA 3IMXA 1QSYA 4PUOA 4CFBA 4L3QA 4CEOA 4RCHA 3CERA 3O3HA 3M8QA 4BRDA 5KTQA 3CMAN 3IKMA 4BE7B 5EY4A 3Q7CA 2B5JA 5IT9O 1FK9A 3OJUA 3L8BA 3JXUA 3BDPA 2OTLN 1X9WA 1UAXA 2E8AA 2E6MA 3HP9A 2A41A 4CF9A 4AM7A 4JNEA 2E2OA 3KKRA 1HPZA 3DM2A 3H1QA 5AZJA 3CQYA 3SAHA 3JAMO 3U3GA 2BGGA 4JI0K 3CJBA 1KAZA 4YY3K 1B92A 3CQXA 5LL6Z 1LW0A 1WNSA 2HF4A 4E89A 1L5UA 2BE2A 1HRHA 4BRMA 1VQ7N 2V7ZA 2PFUA 3HOTA 3WNHA 4A61A 3HO1A 2H3GX 3SMPA 3I0RA 5HLFA 3HZ6A 5EVZA 1LWEA 3L3VA 1O13A 3KWIA 3AVHA 4PY5A 1HKBA 4DFJA 1R0AA 4CEZA 2OZSA 1FKPA 5E26A 4WQ4C 2KHOA 1Z6RA 4CZJA 2HMIA 4KREA 3TPQA 2A42A 3MWPA 5BRFA 2F96A 3CCSN 5EOYA 3K0SA 1KSPA 4CZMA 2O8DA 3VQ7A 1WSIA 4C8OA 3U9DA 4U67L 4KI6A 4E1JA 3KKSA 4MFBA 1I94K 1NBWA 2CH6A 4OX9K 4FJIA 5C25A 1S3XA 4B8CA 5KRTA 2OCEA 4AILC 4E1NA 3M1FA 1QZ6A 1LCUA 1VRTA 3ZT0A 1DEJA 4FL9A 4BQZA 5FPEA 1TGOA 2NLXA 3W0LA 2QXLA 4BQLA 3OYLA 4OPAA 2HMPA 3AARA 2RE2A 1S1XA 3I8DA 5M1KA 4H8KA 1RDBA 1VQPN 5LMUK 3GG4A 4BRHA 2GUIA 3A8YA 4Z4GA 5EX5A 4CGIA 3VQCA 4R5PA 4CIEA 3UB5A 3DLRA 1GLEG 4FJ9A 3HXMA 2E1YA 1KXPA 2WUSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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