3CJBA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with gelsolin-segment 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 104
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjbA04
2KHOA 4K25A 2P9LA 2FF3B 4BRDA 2Q31A 3CI5A 1MDUB 4H0TB 5AQQA 4IO8A 4BR9A 4GNIA 5ADXA 3A8YA 4RCHA 4BRKA 3DAWA 4H03B 1V4TA 2P9KB 1BO5O 3WQTA 3WXKA 5AQRA 3LDNA 4ISFA 3O6WA 1LCUA 3GBTA 4BG9A 4H0PA 1YXQA 2YI1A 3I8BA 4FO0A 2FXUA 2E2OA 3H3NO 1XUPO 3IMXA 5F1XA 1IG8A 1QQMA 4HWIA 1NGAA 3LDLA 3UE5A 4B1WB 5BPLA 2V51B 4RWTA 3FR0A 4FWRA 5AQJA 3R9PA 2FLOA 4A62A 4B1XB 1KAXA 3QBXA 4WQ5A 4BREA 5AQLA 3GG4A 5AZJB 4FOIA 3ZETA 5AFUH 3CJ9A 3M3ZA 2PAVA 5ELZA 3L6QA 1RGIA 5JLFA 1E4FT 1R59O 5KPRA 4O5FA 3C7NB 5F0XA 3WXLA 5BRDA 4RTFD 3EZWA 4CI6A 1QHAA 3EO3A 4ISEA 3P4IA 1NGHA 5FPMA 4XEIA 5AQIA 3WEEB 2QW9A 3VEWA 3QMLA 5AQVA 3FZLA 3M6GA 2P9SA 1GLLO 4JHDB 5AQOA 4CZKA 4K42A 3QDKA 3RSEA 1G99A 4BRGA 4MLHA 1K8KA 1ATNA 5E84A 1GLEG 1DKGD 2Q2RA 1KXPA 1BWFO 3A5OC 3IFRA 4DHYA 1BU6O 1KAZA 2HF3A 3OHRA 1KAYA 3JS6A 4CBWA 4MO5A 4QS9A 4BRQA 4IZ9A 3LM2A 5AFUA 3U8XA 2FSKA 5I9EB 3DXKA 1YUWA 4CZMA 5AQFA 2HMPA 2F9WA 4FWKA 3F9MA 1Y64A 1SZ2A 3FE1A 5FPDA 2P9IB 3LM9A 2CH6A 1XC3A 3HM8A 1E4GT 1EQYA 2NZTA 5CE3A 2A41A 1U2VA 2BUPA 3O8MA 1TYQA 4BVOA 2IVPA 5JICA 3UB5A 3SLCA 1ATSA 5AQWA 3CQXA 1NGIA 4FWOA 4QS7A 2GEMA 2QWOA 4AM7A 4CZLA 2P9LB 3GL1A 5AQYA 5BRHA 3ATUA 4CBUA 3VEOA 2AP1A 4CZIA 1RFQA 1NGGA 2AA4A 3AY9A 4DB3A 3CHWA 4B1ZA 2E1ZA 2ZGZA 5AZIA 1MWKA 1J6ZA 3ZX2A 3KHYA 3VEXA 1U6ZA 3VEZA 3UKUA 4FL9A 3J8AA 1GLDG 1NGDA 4M7XA 3ZEUB 1HLUA 3CJ1A 3MN9A 5JLHA 1HKCA 3D2FA 1ATRA 4I6MB 4K43A 3BUZB 4BR0A 3A0IX 3MN7A 4B1UB 2Q0UA 4NB4A 2P9UA 3HZ6A 3D2EA 3AAPA 2V52B 2PBDA 4Y0WA 2V7YA 1X3NA 2QWNA 2V7ZA 2D1KA 1MWMA 2CGJA 5LY3A 3GDQA 4H0OA 3GE1A 3A5MC 4BR2A 3FLCO 1JCEA 3QFPA 2ZF5O 3SMSA 3FZHA 4PKGA 4MO4A 4O8KA 3LDPA 4B1YB 4XH4A 1BA0A 3H46O 4J8FA 4BRHA 3HBTA 4HTLA 1Q18A 2P9PA 3L0QA 4FWQA 3O1WA 4BRNA 3DXMB 4IXCA 2E8AA 4CZHA 2P9SB 2CH5A 3HTVA 2GTDA 4FWNA 5E26A 4H5RA 3RSEB 1Z05A 3MDQA 1X3MA 4CZFA 4BVPA 3D7EO 4BC3A 3ATVA 4A61A 3UKRB 1ZC6A 1SQKA 5B8HA 3SJHA 3WUHA 1MA9B 1DGKN 3H6EA 3H1QA 2F9TA 2P9KA 3A5LC 3DXKB 4NO7A 1D4XA 1OKJA 3ULEB 3BF3A 4BR5A 5JMVA 4WYBA 2ZGYA 2A3ZA 4BROA 3QB0A 5AQTA 4BRMA 4JD2B 3VESA 3EN9A 3CETA 2QWRA 4B9QA 1NWKA 4BR7A 3WT0A 1CZAN 2A42A 1U2VB 3C0BA 1SAZA 2W41A 3ZX3A 1V4SA 3KVGA 3R8EA 3W3DA 1ZBSA 3VF2A 2GWJA 4WQ4C 4BC5A 1GLAG 4E1JA 2YJFA 3H3OB 1NM1A 3O1BA 4BRCA 2E88A 3C7NA 3LDOA 4YDUA 2ASPA 1WUAA 4JAXA 1LOTB 2ITMA 3VOVA 4CJ7A 3IDHA 4BRLA 5LJWA 3FZMA 4BGBA 5BREA 1NGCA 2D0OA 3ENHA 1HX1A 4XH5A 1T44A 2GELA 3VGMA 4JNEA 1S22A 3WEEA 5KPZA 5EX5A 3UKUB 4CZEA 4JHDA 1DEJA 5FPEA 2QM1A 3QICA 5TKYA 4BQLA 2I7PA 3D2FB 4BRPA 3O4WA 4F9OA 3JXUA 4EHUA 4A2BA 2P9UB 4QS8A 5AQPA 2A5XA 2QWMA 1BUPA 4FPAA 4H5WA 1GLBG 5AQHA 4CBXA 2IVNA 2E2NA 5AQXA 4BR4A 2UYTA 4BRFA 3DWLA 3ENOA 4JN4A 4C23A 2P9IA 5KPTA 1RDWX 4H5TA 4A2AA 2YHYA 3VETA 5EVZA 3AAQA 4H0YB 2OANA 2QWQA 3H45C 2D4WA 4FPBA 4M63C 4EAHD 2W40A 1GLFO 4FWSA 1GLJO 3M1FA 5AQMA 2P9PB 2EWSA 2Q1NA 5BPMA 4FSVA 3ZETB 3MN5A 4EIAA 2Q97A 3QFUA 1YAGA 2FSJA 4KBOA 2E20A 1BG3A 3DJCA 1IJJA 4IJNA 1HUXA 2P9NA 4BRAA 1NBWA 3EKUA 5AQNA 4IJAA 3U9ZA 2QXLA 3VGKA 5BRFA 2VYPA 4BRIA 3VEYA 1NLVA 5EY4A 2A40A 3I33A 3WXIA 4DQ8A 4AM6A 4FWLA 4BG8A 5F2RA 3BF1A 1NGEA 1NMDA 4H5NA 5AQUA 2YHXA 3A5NC 2NRHA 5EXWA 5FPNA 2HF4A 4BGAA 4EFHA 3ID8A 4L3QA 3CIPA 3CJBA 3ZEUA 1K8KB 3CERA 2FSNA 2HOEA 2VWBA 3VF4A 1NGJA 4I6MA 3R6MA 3LL3A 3SMPA 3TPQA 1QQOA 3CQYA 5BN8A 2J4RA 2YHWA 2H3GX 1X9JA 3AARA 4H0XB 4B1VA 3WXJA 3VGLA 2ASOA 3LDQA 2E2PA 3H1VX 1HJOA 5AQGA 4WQ4A 1C0FA 2A6AA 3O80A 2DPNA 2Q0RA 5AQSA 4FOEA 1GLCG 1T6DA 2GUPA 4GY2B 4WQ5C 1Z6RA 2IVOA 3HSCA 3VEVA 4BC4A 1P8ZA 1TYQB 1HPMA 3MMVA 1H1VA 4BC2A 3L4IA 1BOTO 4DCHA 3DXMA 4ISGA 4EHTA 5AZJA 3FFKB 1BA1A 3U4LA 3FZKA 1YVNA 2ZWHA 1NGFA 2YCHA 5AR0A 3U9DA 2D0PA 3VENA 3WQUA 2QWLA 1QZ5A 2E2QA 3KZBA 1QQNA 2QWPA 3CJ7A 3FGUA 3FZFA 4BQZA 3UKRA 2NLXA 3EL2A 5BR9A 4K41A 4PL8A 1HKBA 2CGKA 3O5BA 5AZIB 2I7NA 3ULEA 1QZ6A 5BPNA 2GWKA 4IWVA 3MK6A 1C0GA 3CJCA 1S3XA 2Q36A 4FWMA 4JD2A 2FF6A 3VF6A 3HI0A 1TUYA 5AQZA 4CD1A 4XH1A 2YJEA 4PKIA 3SK3A 4H5VA 4M7YA 3D2EB 5AQKA 5LJVA 1XQSC 4CZJA 5ADXH 3MN6A 1JCFA 3B8AX 4LC9B 4YDUC 1ESVA 2BTFA 5KQDA 2CGLA 3S41A 4MLEA 2VCPA 2P9NB 4PL7A 1TUUA 3GOIA 4FWPA 4PKHA 2IIRA 2WUSA 5BN9A 4CD3A 1ZXOA 1JCGA 2ASMA 3IUCA 3QBWA 3ZX0A 5KQ8A 3BP8A 1NGBA 4Z94A 3W0LA 4H0VB 1T6CA 3VPZA 3TU5A 1HKGA 3VERA 3CJAA 1BDGA 3MCPA 3O08A 4CZGA 1WOQA 3G25A 3EKSA 3BEXA 5EOYA 2E1YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRDA 2PYJA 4BR9A 3F9KA 4IO8A 4GNIA 1SL0A 1WAJA 4FLZA 4YOVA 4M3WA 1X9SA 1S1TA 3AVBA 3O6WA 4GV9A 3GBTA 3DLLL 1XUPO 5F1XA 4HWIA 2C1GA 4ELVA 3LALA 1LAWA 4L8RB 3FR0A 1RDDA 4DFJA 5AQJA 3R9PA 1SV5A 1GOBA 4FM2A 2HNYA 3OYEA 3E01A 4ID5A 3S3NA 3H08A 3LP1A 1S72N 4KHSA 4FOIA 2PZSA 1IG9A 5ELZA 5KPRA 1E4FT 4OKKA 3HPOA 3V9UA 3EEQA 5F0XA 2OZSA 2O4IA 3HVTA 4OX9K 1SKSA 3O4QA 3EO3A 3O9RA 3T1YK 1RDUA 4HUEA 4RG8A 1KCFA 4XEIA 2QW9A 3N4QA 1JKHA 1U48A 3M6GA 1A5XA 4CZKA 2XO7A 3LANA 2VWJA 4K42A 3RSEA 1G99A 5KRTA 1ATNA 2HF3A 4KH5A 3JS6A 4A5BA 4CBWA 1KTQA 4QS9A 4I2PA 5LMUK 3DYAA 1E3MA 2O8DB 4YHHK 3Q7BA 3ZSVA 3DXKA 5I9EB 3QIOA 4CZMA 2P5GA 4FWKA 3TSUA 5SWMA 4Z4IA 3NF6A 4DV3K 5FPDA 4DSFA 2OPSA 3HM8A 1E4GT 1S9EA 3AVLA 1EQYA 1VRUA 4KV8A 4J2EA 4CGGA 1IKYA 5IWAK 1Z26A 3O8MA 2XY8A 4BVOA 3SQ0A 1T8EA 4B8CA 5JICA 3SLCA 3OA9A 2DFEA 1RT3A 1NGIA 1VAZA 2O4GA 1C1CA 4QS7A 2FBXA 1BGXT 1Q9XA 3I55N 2DTUA 2PFUA 3CXCM 4HHTA 3KK7A 5BRHA 2YX6A 3ZSZA 5DM7L 4CHPA 1RFQA 1NGGA 3AY9A 4CEFA 2VQEK 4CF1A 4CJSA 4BACA 3TI0A 5JVGL 5AZIA 3KHYA 3VEXA 3MAQA 3J8AA 1CZ9A 1NGDA 3ZEUB 2G8HA 5EU7A 4MDAA 4CJLA 4HUFA 3VQBA 1ATRA 4I6MB 3NH2A 1XHZA 3MXIA 2VQFK 3BUZB 4FLXA 1BI4A 1D9DA 3SPZA 3PSFA 4YOTA 2P9UA 3V9ZA 3D2EA 1Q8IA 2UXBK 1XI1A 2QWNA 5DM6L 2HHSA 4FZZA 3OVNA 3V81A 1TL1A 1HYZA 1JCEA 4LF6K 4PKGA 4O8KA 3TAEA 4X66K 1BA0A 2B4JA 1Q18A 4FWQA 3O1WA 2ZQBA 4YOUA 2XY5A 1JLCA 4BE0A 4DU4A 3SI6A 3PX0A 3AVJA 4WFNL 1Z05A 4AHCA 1X3MA 3K59A 3ZSRA 2W42A 4E19A 1ZC6A 3ZT2A 1C0UA 1ZBHA 4AQYK 4NO7A 3VQ5A 1KFSA 2ZGYA 1B9DA 2B6AA 3CPEA 5KGXA 3QB0A 3MEEA 1O13A 3SV3A 2QWRA 4B9QA 4BR7A 3AO1A 1CZAN 4M41A 4H4OA 4KO0A 3M5RA 5J1EA 2W41A 2OA8A 1V4SA 5M1PA 4DV6K 3W3DA 2GWJA 4WQ4C 4IOXA 4FLUA 1IKWA 4IO9L 1FKOA 4FM0A 2HVIA 3LDOA 1WUAA 4BRLA 3FZMA 3KK2A 3ENHA 3QO9A 3WEEA 4Q0BA 5EX5A 4CZEA 4YFUA 2KKZA 5FPEA 1FK9A 3BZKA 3WNFA 2E6MA 3QESA 4DQIA 2I7PA 1WSJA 1ASVA 4DF8A 3O4WA 3JXUA 2QI2A 3K9KA 3SPYA 5AQPA 4DTNA 1ZBFA 2QWMA 3TANA 4B3TK 4FPAA 4DR3K 4H5WA 3C6HA 3NBPA 4CGHA 5AQXA 3EE9A 3HSTB 3R1XA 3DWLA 4J2BA 4JN4A 2P9IA 1IO2A 4H4MA 3VETA 5EVZA 4X65K 3O3HA 1YF5L 1VK0A 4FPBA 2D4WA 2F4VK 3HXMA 4FWSA 2P51A 2VGMA 2UU9K 1NK8A 1RT6A 1S1VA 2EWSA 1M1KO 2Q1NA 1HNIA 1C1AA 4W5OA 4RW8A 4EIAA 1YAGA 1C1BA 3DLBA 1XNRK 3SJJA 4BRAA 1HUXA 2P9NA 3EKUA 4DV0K 4O4GA 2KZMA 2W6KA 3U9ZA 4W5TA 5BRFA 3JAMO 4NLBA 4BRIA 4JKFA 4A59A 3P38A 1TKDA 3U3GA 4FWLA 4BG8A 4CIEA 3OS0A 2HB5A 3I56N 4H8KA 4W5QA 2E4LA 2YHXA 2NRHA 5CZ1A 4BGAA 3WNGA 4EFHA 3ID8A 3ULDA 4TSXA 3VF4A 3CFRA 3I0SA 2ZM6K 4A57A 2D0CA 3LL3A 1K9MO 4CHQA 4CF0A 1NG9A 3HPHA 1X9WA 3VGLA 3E9OA 2ASOA 1D5AA 4CEEA 5AQGA 3RMDA 1C0FA 2A6AA 1KVAA 4M3XA 4IFYA 4FK0A 1ILYA 4WQ5C 3HO1A 5DK5A 1WLJA 2FBYA 4BEBA 3VEVA 2HBKA 4DSEA 1IBLK 2G8VA 1HPMA 1U4BA 4WE1A 4JV5K 1NK7A 3U3YA 1YT3A 4C1NK 3FFKB 2JWLA 1YVNA 1NGFA 2NRXA 2D0PA 3WQUA 5SZTA 4CFCA 3K5LA 3S9HA 4GKJK 5HRNA 1L3VA 1VQ7N 3EL2A 4JI2K 1J9AA 5C24A 1K73O 3VQ7A 5AZIB 2I7NA 4U7BA 1P90A 1DTTA 5BPNA 4ID1A 3THWA 1SL1A 4YOWA 1TUYA 4LY7A 2HVHA 4PKIA 3T1AA 4H5VA 4M7YA 1RNHA 1GOCA 3D2EB 3VA3A 4ICLA 1XQSC 4PWDA 3IG1A 4LH5A 3OW2M 3MN6A 3NVKA 3M8PA 5C2FA 3LZIA 4DLEA 5KQDA 3FFIA 2KW4A 4CIGA 4MLEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3RRG A;  2ZWH A;  2FC0 A;  2EHG A;  3U9D A;  3VEN A;  2KQ2 A;  3QIN A;  4FLY A;  1RT5 A;  4B9N A;  1IBK K;  2ZJR L;  3FZF A;  3FGU A;  2UXC K;  4DSL A;  1X9M A;  3DI6 A;  4K41 A;  1K6Y A;  4GKK K;  1JLE A;  2CGK A;  3O5B A;  5CZ2 A;  3KLE A;  3KLH A;  1RDA A;  1QSS A;  3NGY A;  4KRE A;  3KJV A;  2GWK A;  4FJX A;  1IV0 A;  3IKM A;  4V19 S;  4A5A A;  1S3X A;  2O8F A;  3AA4 A;  1HQE A;  2FF6 A;  4HCC A;  4DS4 A;  4F2R A;  4JKE A;  4XH1 A;  1QQC A;  4CEQ A;  1NJI O;  1SL2 A;  3VQE A;  4DV7 K;  4LFC K;  1C0M A;  1WSF A;  3KKS A;  3HRG A;  3OBY A;  4W5N A;  4MQ3 A;  1X1P A;  3B8A X;  4LC9 B;  3ISN C;  4B9S A;  2BTF A;  1W7A A;  3S41 A;  2VCP A;  3L8B A;  4CJW A;  1T03 A;  2P9N B;  3TWH A;  2IIR A;  3ZSW A;  2ASM A;  3IUC A;  1C0T A;  4DTO A;  4E7L A;  3TAF A;  4AHU A;  4Z94 A;  1EWR A;  4YOY A;  1YTU A;  3TU5 A;  3CFP A;  1HKG A;  4N76 A;  1HNV A;  5IT9 O;  2DY4 A;  2HBJ A;  4FJ5 A;  1UWB A;  3HK2 A;  1YIJ N;  2Z1J A;  4I9L A;  3BEX A;  3S3M A;  1TL3 A;  1CXQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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