3CJBA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with gelsolin-segment 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 104
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjbA04
3C0BA 3VENA 1MWKA 3FZMA 4MO4A 3L4IA 4I6MB 1XUPO 1HPMA 4WQ5A 2ASMA 5AQMA 4CZHA 5KPZA 2E2QA 2QWMA 3GE1A 3M3ZA 4JAXA 3DXMA 4WQ5C 4EHUA 4PKGA 3TPQA 5BN9A 1IJJA 3QFUA 3SJHA 3CETA 4O8KA 3UKUA 2E20A 3SMSA 3VEZA 3KZBA 3ID8A 4HWIA 2V7YA 1ZBSA 4MLHA 5E84A 4NO7A 2A41A 3WEEA 4BRLA 4BC4A 3OHRA 3MDQA 3CJCA 3UKRA 4JNEA 2BTFA 5AQWA 2E2PA 5AQNA 3RSEB 1MDUB 4B1WB 3CJ1A 1P8ZA 2P9PA 4BR7A 3O8MA 2IVPA 4J8FA 1GLJO 3IMXA 2GUPA 4FWPA 2I7PA 2ZGZA 3SMPA 3VF2A 3WXLA 2YCHA 3CI5A 3AAPA 2P9KB 2D0PA 3A8YA 4JN4A 4MLEA 2E1ZA 3I8BA 5E26A 3VGKA 4CD1A 1H1VA 5AQKA 5AQPA 2A5XA 4BR2A 3CIPA 3WQUA 2Q31A 3J8AA 3CJAA 2QWQA 3WUHA 4FWNA 4CZJA 3UKUB 1NGEA 4CBXA 2W40A 2P9UA 1HLUA 4H5RA 4FWSA 4CZGA 4BGBA 5BN8A 3QFPA 3DWLA 4QS7A 4BRKA 4B9QA 1CZAN 2NRHA 3HI0A 5BREA 3H45C 2Q0UA 4BR4A 3UKRB 3A5NC 4FWOA 4H03B 1ZXOA 2HMPA 1XQSC 3A5OC 1T6CA 3HM8A 4H5WA 5AFUH 4AM7A 5I9EB 1BDGA 2NLXA 2EWSA 1SZ2A 5AQUA 3MN5A 3U8XA 2Q0RA 4FWRA 3ZETB 2P9IA 4M7YA 3QMLA 1V4TA 3W3DA 3H46O 1QZ6A 4GY2B 3ENHA 2ZF5O 2GELA 3IUCA 1RGIA 5CE3A 3EL2A 4H0OA 4K41A 3D2EB 3IDHA 3R6MA 2GWJA 3EKSA 1R59O 3WQTA 5AQTA 1MA9B 4KBOA 4BRFA 1NGCA 3QBWA 2QWNA 1ESVA 1D4XA 5F1XA 3M6GA 2VYPA 2VWBA 2FLOA 4FL9A 1C0GA 5EXWA 4BRMA 3AARA 4FSVA 4BREA 4CZIA 1U2VA 2HOEA 2D1KA 4CD3A 4EHTA 3LM9A 1MWMA 1Q18A 1ATRA 4BRNA 3O1BA 3ATUA 4FOEA 2V7ZA 2CGJA 5ELZA 4BC5A 4K42A 3FZLA 3JXUA 4BRAA 5AZIB 3FR0A 2ZWHA 3FZHA 3RSEA 5KQ8A 3H1VX 4CI6A 3CQXA 4PL8A 3VERA 3FFKB 1NGAA 3D2FA 1SAZA 4QS8A 4FPBA 2P9KA 4H0YB 5AQIA 4Y0WA 2IIRA 1RDWX 1E4FT 4ISGA 4LC9B 3FGUA 1KXPA 1HX1A 4DB3A 3UB5A 5AR0A 4CBUA 2YHXA 1U2VB 2ZGYA 3VEVA 1QQOA 4BG8A 4GNIA 1NGFA 3HSCA 3DJCA 3VEOA 2IVOA 1S3XA 1T6DA 1JCFA 2YJEA 4CBWA 2UYTA 1C0FA 5BPNA 2CGKA 4Z94A 2QW9A 3ATVA 5LJVA 3LDLA 4IWVA 4E1JA 3D2FB 3VOVA 5FPNA 3CQYA 2HF3A 4BRGA 1TUUA 3ENOA 5KQDA 4B1XB 2VCPA 5FPDA 2FSJA 3C7NB 2P9NA 1U6ZA 1V4SA 5KPTA 1JCEA 3ZETA 3QDKA 4RWTA 4NB4A 1GLFO 3MK6A 4RCHA 5AQRA 5AZJB 4RTFD 3D2EA 2J4RA 1KAYA 2GTDA 3ZX3A 4A2BA 5AQVA 5LY3A 5AQSA 2E1YA 2YI1A 4YDUA 5B8HA 3MN7A 5EOYA 2CGLA 4DHYA 4YDUC 2H3GX 2OANA 1YAGA 4CZEA 1G99A 1HKBA 2AP1A 3L6QA 3LDNA 2P9NB 1HUXA 5BPMA 3EZWA 5LJWA 3GDQA 4BRCA 1NBWA 1TYQB 1QQNA 2E2OA 1EQYA 3BEXA 4FWLA 4C23A 1JCGA 3BF1A 5EY4A 1GLEG 4BC2A 5JMVA 4ISFA 5AZIA 5ADXH 2P9LB 4H0VB 3R9PA 1NMDA 1J6ZA 2QXLA 4FWQA 4IJNA 5AQFA 4K43A 2I7NA 3WXIA 3CJBA 1X9JA 4H0TB 3MMVA 3LL3A 4XH4A 4BR5A 1HKGA 3LDQA 4IJAA 4H5VA 4BG9A 5EX5A 1QHAA 5F0XA 3FZFA 3DAWA 5AQOA 4BGAA 2W41A 3AAQA 3LDPA 1WOQA 3WT0A 3MN9A 4A61A 1QQMA 1BUPA 2KHOA 2FSKA 2BUPA 4BRPA 3FZKA 2P9SB 1X3NA 4CZFA 1K8KB 3HBTA 5AQYA 1HKCA 4F9OA 3EN9A 3KHYA 4B1YB 2E88A 2FSNA 3H3OB 3DXKB 3BP8A 3U9ZA 4M63C 5AFUA 3WXKA 4IXCA 3VGLA 4A2AA 3ZEUB 2AA4A 3MN6A 3H6EA 4HTLA 4ISEA 3WXJA 1YXQA 3LM2A 3C7NA 3VEYA 3I33A 3MCPA 2QM1A 3BUZB 4FWKA 5JLFA 2QWOA 2PAVA 3QBXA 4O5FA 2FF6A 4DQ8A 5BR9A 1KAZA 2FF3B 3VPZA 2E8AA 1BG3A 3KVGA 1NGGA 5AZJA 4FOIA 2YJFA 4AM6A 1RFQA 1BWFO 4H5TA 5AQHA 2ASOA 3O08A 4DCHA 3ZX2A 4BQLA 3UE5A 5F2RA 5AQLA 2HF4A 1XC3A 4JHDB 5JICA 4FO0A 1ATNA 2YHYA 3QICA 2IVNA 3O6WA 4CZKA 1SQKA 4BRQA 2FXUA 4BR0A 2NZTA 4PL7A 1NLVA 3VGMA 4BR9A 1Z6RA 3FE1A 2Q36A 4H0XB 1TYQA 3LDOA 5AQGA 1NGIA 2YHWA 3QB0A 1LOTB 2CH6A 1E4GT 4H0PA 2F9TA 2Q2RA 2A42A 2P9LA 1WUAA 5KPRA 3CERA 3B8AX 2WUSA 5BRFA 3BF3A 2DPNA 1IG8A 3HZ6A 3O5BA 3GBTA 4XEIA 3U9DA 4WYBA 1OKJA 3L0QA 2A3ZA 4A62A 2ASPA 4BQZA 3U4LA 2D4WA 5BPLA 4WQ4A 1LCUA 3DXMB 3GOIA 2F9WA 3SK3A 3O80A 3A5MC 1BA1A 1GLDG 4WQ4C 1S22A 3IFRA 3ULEA 1DEJA 2CH5A 4XH1A 5EVZA 4JD2A 2V51B 2P9SA 3M1FA 2QWLA 1K8KA 4K25A 2ITMA 1YUWA 4IO8A 3AY9A 3EO3A 3WEEB 3EKUA 3F9MA 3VEXA 2GEMA 3P4IA 2P9PB 3DXKA 1GLBG 1NGBA 2D0OA 5FPEA 1BA0A 1X3MA 4BC3A 1ZC6A 3ZEUA 4CZMA 2Q97A 1HJOA 2QWRA 2V52B 3A0IX 1TUYA 4QS9A 4CZLA 1BO5O 5BRHA 4PKIA 1GLLO 4H5NA 3GG4A 3VESA 4IZ9A 3CJ9A 4XH5A 4BRIA 2A40A 2GWKA 5TKYA 1Z05A 4MO5A 3ZX0A 1BOTO 3ULEB 3FLCO 3R8EA 4BRDA 4EIAA 4JD2B 3O4WA 2P9UB 1KAXA 3VEWA 1QZ5A 1NGDA 1Y64A 3GL1A 1DGKN 4BRHA 1DKGD 1NGHA 4EAHD 2QWPA 3H1QA 3A5LC 4I6MA 3O1WA 4CJ7A 2PBDA 3VF4A 4B1ZA 4EFHA 3H3NO 4B1VA 2A6AA 4M7XA 4JHDA 4FWMA 4PKHA 4BVPA 1NWKA 4FPAA 1YVNA 3G25A 3CHWA 3JS6A 5BRDA 3TU5A 1ATSA 2P9IB 1T44A 1NM1A 2E2NA 5JLHA 1BU6O 5ADXA 2Q1NA 1GLAG 1NGJA 5FPMA 3W0LA 1GLCG 4B1UB 4L3QA 3VF6A 3S41A 3VETA 4BVOA 5AQZA 5AQXA 5AQJA 5AQQA 3HTVA 4BROA 3D7EO 3CJ7A 3SLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G8IA 3VENA 1MWKA 2UUAK 3FZMA 3L4IA 3IRXA 4CJWA 5AQMA 3CCRN 2ASMA 3SBGA 4O5BA 3K2PA 4CZHA 4JAXA 1TL3A 4WQ5C 2WOMA 4FW1A 4ZHRA 1RTIA 1ZBFA 3TAEA 4KREA 1FW6A 2E20A 3KZBA 2V7YA 1L3SA 1O13A 2UU9K 1VQ4N 1WBDA 3OHRA 3MDQA 3AVAA 3CJCA 3UKRA 4JNEA 4B1WB 1HNIA 4BR7A 2PY5A 1P8ZA 4FYDA 4BDPA 2GUPA 4DUZK 3P83D 3A8YA 3TWHA 3CG7A 2E1ZA 4YOXA 3K9KA 1H1VA 3F5TA 1QQCA 3B6OA 3CPWM 1WSJA 3OYNA 1XNQK 4DU3A 5FROA 1SV5A 2B6AA 2Q31A 1WSHA 4JI6K 4CHNA 3WUHA 1D9FA 4F2SA 1MU2A 5J2MA 4CZJA 3UKUB 3LP3A 1VQ7N 3CC7N 4Q5VA 1HYZA 2HHVA 3Q7CA 5BN8A 4CEOA 3AVNA 4B9QA 1CZAN 3J7ZO 3ZSRA 1SKRA 4H03B 2UUBK 4G9ZA 4H4OA 5DM7L 3HM8A 5AFUH 1BDGA 1VQON 4KHNA 1SZ2A 5AQUA 2WC9A 2UXBK 4JLHA 4CVNE 2Q0RA 4FWRA 1VHXA 1IKXA 1ASVA 2IDOA 4GV3A 1RBSA 4GY2B 3MWPA 2GELA 3MEEA 3LP0A 4K41A 4OLBA 2VG7A 3QETA 1VRUA 3QEIA 3L3VA 3E9LA 4CEQA 3IKMA 4BRFA 3OYAA 1NGCA 3I55N 2OA8A 2O8BB 4DTPA 1IKVA 3AO1A 3DRPA 1VQ8N 1C0GA 5GAHP 4BRMA 1DLOA 1ASUA 4CEAA 2HOEA 2D1KA 1JL2A 3P5JA 3VQ8A 1YHQN 4Y1CA 3OJSA 1ATRA 5GAGP 4DLEA 1Q8IA 3SV4A 1A5XA 1OVQA 3FZLA 3WNEA 3CC4N 3KK2A 3FR0A 2ZWHA 3RSEA 3NGIA 4RW8A 1NOZA 3THYB 3C95A 4BE0A 3S3NA 1NKCA 4OLAA 2VQEK 1NK9A 4DSJA 2HB5A 2GV9A 3OS2A 3CMEN 3VQ6A 4DUYK 1B9FA 2KZZA 4DV4K 4Z4CA 4FJLA 3HSCA 3NCIA 4JKAA 2IVOA 1S3XA 1T6DA 4FM1A 2QK9A 1WNSA 3OBYA 3TR8A 3KTQA 2CGKA 4U7BA 3ATVA 1EO1A 2GX9A 3AO3A 3I56N 1RCHA 2HHQA 2FBYA 4Z4HA 4LF8K 3ZSZA 3SAGA 3AGRA 2P9NA 3CFPA 2HMIA 1E3MA 2HBMA 4MFBA 4MQ3A 3V9ZA 2BANA 3OYJA 3TAQA 5AQRA 1C0UA 2J4RA 2ZJRL 1IH7A 3IAYA 3L3UA 4JI1K 1I3AA 3DLLL 3PX0A 5EOYA 4A5BA 2CGLA 2H3GX 2OANA 1I39A 1W9HA 2AP1A 1TKTA 4OPAA 3VQEA 3LDNA 1HUXA 4BRCA 2YKMA 5C42A 1TKXA 1QQNA 4FWLA 1EQYA 3BEXA 4CGJA 1JCGA 1TAQA 3SPYA 4IG0A 3QNNA 4BC2A 5JMVA 5JVHL 5AZIA 5EU7A 1T7PA 1C1CA 3QNOA 3CFOA 4IJNA 4K43A 2O8FB 3CJBA 3DM2A 3S3OA 4FVMA 1YF5L 1QHAA 5F0XA 4DU1A 3DAWA 5AQOA 4WF9L 3E9OA 1BUPA 2FSKA 3MWTA 1X3NA 3G4SN 4CZFA 4DR2K 1DTTA 3QIOA 2E4LA 2YX6A 4F4KA 3EN9A 3KHYA 1NK7A 2E88A 2FSNA 4M63C 5AFUA 3VGLA 3RVCA 3AVFA 2D5RA 5HRSA 5C15A 3MN6A 3WXJA 2FBXA 1YITN 2XY7A 2ETJA 2FBTA 1M90O 4I2PA 3I33A 2O8CA 1BI4A 2QM1A 2OZMA 4M42A 3ZSQA 2PAVA 5C12A 1QHTA 4JI3K 3KVGA 3C94A 1T3VA 1BWFO 4H5TA 4I2QA 2ASOA 2RKIA 4CJVA 1NMNA 3O9RA 3UE5A 2PYLA 3KD5E 1XHZA 3O3GA 5FRNA 2HF4A 3LZIA 3DI6A 4JHDB 4J2DA 1JLBA 1FJGK 3O6WA 4JI5K 4FJGA 1NK4A 3PY8A 1NLVA 3DOLA 2XY5A 4M45A 4FLZA 1B92A 1HRHA 4N5SA 4HCBA 4DU4A 2YHWA 3OYGA 3OYKA 1KQSM 3NF7A 3MAQA 2P9LA 1WUAA 5KPRA 2WUSA 3BF3A 1NJIO 4CF0A 3QEPA 3OTOK 4A59A 1JLQA 1W97L 3L0QA 4M3RA 3CF5L 1T8EA 3TANA 1BGXT 4LSNA 3V9UA 1LCUA 3NFAA 2P1JA 1BA1A 2XY8A 1GLDG 2W42A 4WQ4C 3IFRA 3ULEA 3HPOA 4JI7K 4JD2A 1DT9A 2P9SA 1VSHA 3M1FA 4K25A 1NK0A 4DTNA 3AY9A 3S5TA 1IBMK 1VSJA 3F9MA 3P4IA 4CHOA 1QE1A 2RN2A 2VGMA 1KTQA 1BA0A 1ZC6A 1HJOA 4DR5K 2QWRA 2V52B 3VQ9A 4FZZA 5IWAK 3A0IX 4WCEL 4DQRA 4B3RK 4QS9A 4CZLA 5BRHA 3TAMA 1GLLO 2ITGA 4H5NA 4IZ9A 3CJ9A 3M5RA 2A40A 4XIUA 4MO5A 5M1OA 2VGNA 4AHUA 2DFFA 1YT3A 3CQ8A 3R8EA 3P38A 3O4WA 1KAXA 3SYZA 3MX5A 1NJXA 3ITHA 1GOAA 2GUIA 2ATQA 1KD1O 4I6MA 4CCHA 3O4NA 3TSQA 4AHSA 3C6AA 4EFHA 5HRPA 3CM6A 3MX2A 4M7XA 4CIGA 1OVYA 1HYSA 4FWMA 3P39A 2ZJQL 2YHAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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