3CJBA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with gelsolin-segment 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjbA04
3VF6A 2IIRA 5AQLA 4RCHA 1Z05A 3ID8A 3I33A 3VEWA 4CZHA 4XH1A 1GLFO 5JICA 2V51B 4BC5A 2V7ZA 3C0BA 2QW9A 2E8AA 1EQYA 1NGGA 1QQOA 3AAQA 4DHYA 2YHYA 3ZEUB 4IJNA 2IVNA 4FWSA 2FXUA 1BDGA 1E4FT 4XH4A 4BR2A 4CBWA 5EXWA 3QBXA 4B1VA 3GBTA 4FSVA 3CHWA 3CJ1A 2J4RA 5BPLA 1Y64A 1NGDA 4CZKA 3ATUA 3JXUA 2QWOA 1D4XA 3FZKA 1Z6RA 1QZ6A 3H3OB 3DXMA 5JLHA 5KQDA 2PAVA 4FOEA 1NGFA 5F1XA 4EAHD 3FLCO 3ZEUA 4K41A 4J8FA 1Q18A 3B8AX 2E1YA 3EN9A 4O5FA 1BUPA 3RSEB 5TKYA 2EWSA 3LDNA 4BC2A 4BR0A 3FR0A 3A5LC 1ATSA 3VF2A 5AQHA 2NZTA 2FSNA 1QQMA 4JN4A 1T6DA 4WQ5A 3M6GA 5LJVA 3VETA 4YDUA 4I6MB 3A0IX 3U4LA 3H46O 5BR9A 1XC3A 4AM7A 4FWLA 1E4GT 4EHTA 1CZAN 3L4IA 1MDUB 1GLJO 3D2FB 3L0QA 3GDQA 4H5NA 5AQMA 4A61A 4FWQA 5AZIB 5AQSA 3IMXA 3M1FA 2E2QA 3O08A 1TYQB 2P9PA 3QDKA 3WXKA 1JCGA 2Q0UA 3DWLA 3FFKB 2YJEA 4M7YA 2GTDA 3VESA 3H45C 4H0XB 2Q2RA 3FZHA 4Z94A 4MO4A 4WQ5C 3VEXA 4DB3A 4YDUC 3AARA 3I8BA 3BF1A 5JMVA 3HBTA 1RDWX 4H03B 3FZLA 1NM1A 1MWKA 3CIPA 1TYQA 5EOYA 2ASMA 4CZEA 4BRPA 4JD2A 3LM9A 3DJCA 4A2AA 4BQLA 3HZ6A 5BN9A 1NGJA 1U6ZA 4H5TA 1HX1A 3VF4A 5AQPA 1S3XA 2ZGZA 3EZWA 4BRGA 1WOQA 3S41A 3VEYA 2FLOA 1G99A 2UYTA 3WXLA 3FZFA 2P9IA 4JNEA 4FWKA 4JHDB 4WQ4A 2P9SB 2NRHA 3QFPA 3P4IA 1GLEG 3DXKB 1S22A 1RGIA 4A62A 2I7NA 4DQ8A 3CJ9A 4E1JA 1JCFA 2P9LB 3ZX3A 3GG4A 3BP8A 2V7YA 4PKIA 5AQYA 2CGLA 3G25A 5AFUH 3CI5A 3UKUA 1J6ZA 2ZGYA 3QMLA 3CQYA 2H3GX 5FPEA 4FL9A 2HMPA 2VYPA 5AQVA 3WT0A 3SLCA 5AQNA 4IXCA 1NGBA 4O8KA 3DAWA 5KQ8A 3UKRA 5LJWA 3MN7A 5AQFA 5AZJB 4KBOA 1X9JA 3O80A 4WQ4C 2GELA 2E20A 3QICA 2Q1NA 2F9TA 2VWBA 4BRMA 2YCHA 3HM8A 4L3QA 2P9UA 1HUXA 2VCPA 4CZIA 4B1ZA 1GLAG 1BOTO 2CH5A 4K25A 2ZF5O 5AQWA 3CJBA 5F0XA 5BN8A 1ZC6A 3QB0A 3VGMA 1NWKA 2QWLA 3MN5A 4GY2B 3A5MC 2Q0RA 3R6MA 4IWVA 2HF4A 4BC3A 5AQIA 4K43A 4PL8A 3A8YA 2A6AA 3D2EB 1YUWA 2GWJA 1MWMA 3IFRA 5E84A 2BUPA 5AQKA 4PKGA 2A42A 3O5BA 1RFQA 4JAXA 2NLXA 4LC9B 1ATNA 1OKJA 2QWPA 4BG8A 3CETA 4BGAA 2ASPA 2WUSA 4CZJA 3LL3A 3HTVA 3H1QA 1KAXA 1R59O 3CJAA 5AQQA 3VGKA 4ISGA 2IVPA 3D2EA 4QS9A 5EVZA 1KAYA 3TPQA 2Q36A 2P9NB 3FE1A 2P9KB 4FO0A 3RSEA 1DEJA 4CZGA 4H0VB 2ITMA 3SJHA 5EX5A 2QXLA 1SQKA 3ZETB 1NGCA 1TUUA 3L6QA 3BF3A 2D4WA 2CH6A 3KZBA 2Q97A 2YI1A 4FWRA 4FPAA 4BVOA 1DGKN 3ZX2A 1JCEA 2GEMA 4I6MA 1BA0A 2DPNA 3A5NC 3O8MA 4IJAA 4BRIA 2W41A 4B9QA 1X3MA 4XH5A 1BA1A 4BGBA 1C0FA 2QWNA 1T6CA 4HWIA 4EIAA 3UE5A 1YAGA 4F9OA 1HPMA 3D2FA 4MLEA 5AQOA 2E88A 5AQZA 3LDLA 5AZIA 4CI6A 5AQXA 3WEEB 5JLFA 2OANA 3VEOA 4BRNA 2YHWA 3MMVA 2GWKA 4QS8A 3SMPA 4BREA 2A3ZA 4BRLA 3ULEB 3O1WA 4CBXA 1ESVA 3ENOA 1NLVA 1WUAA 4C23A 1QHAA 4K42A 4CD1A 1BG3A 1X3NA 2ZWHA 3FGUA 5B8HA 4BG9A 2QM1A 2YHXA 5FPDA 4M7XA 2QWMA 1XQSC 5KPTA 2Q31A 1P8ZA 2D0OA 1K8KB 1YXQA 5BPMA 1SZ2A 2F9WA 3HSCA 3LDPA 4ISEA 4H5RA 2FSKA 1ZBSA 4AM6A 3C7NB 2CGJA 3TU5A 3CERA 3GOIA 3WXJA 3F9MA 4CZMA 4JHDA 2P9SA 3MN6A 3DXKA 4BRDA 3M3ZA 4B1XB 5AQJA 5BRDA 3H6EA 2P9LA 1IG8A 2I7PA 3OHRA 4GNIA 4CJ7A 4RTFD 3O6WA 1U2VB 5CE3A 4FWOA 3VERA 3U8XA 4B1YB 3VENA 5I9EB 4DCHA 3KHYA 4BRCA 1T44A 2KHOA 5KPZA 2V52B 3O1BA 4B1WB 5KPRA 3ENHA 5ADXH 5AR0A 5AZJA 5BREA 1HKBA 5ADXA 4CZFA 2HOEA 1U2VA 1ZXOA 1HLUA 3AAPA 3VEVA 5AQGA 3R9PA 3MN9A 1H1VA 2D1KA 2QWRA 4FWPA 4WYBA 3DXMB 4FOIA 3VGLA 3EO3A 3BUZB 3MCPA 3IUCA 2A40A 4B1UB 4IO8A 4CBUA 3EKUA 4BRHA 3GL1A 1V4SA 4BR4A 5ELZA 4FWMA 2BTFA 4EFHA 3SMSA 3AY9A 3VOVA 4H5VA 3A5OC 3U9DA 3BEXA 1QZ5A 3GE1A 1LOTB 1MA9B 3ATVA 4MO5A 4MLHA 1NGEA 1SAZA 3QFUA 4NO7A 2AP1A 3HI0A 5AQUA 4IZ9A 3H1VX 4BC4A 2W40A 1QQNA 1BO5O 1HKGA 1GLBG 4ISFA 4BR7A 1TUYA 3MK6A 5AQRA 3SK3A 1NGAA 4FPBA 2P9PB 2CGKA 2P9NA 1YVNA 3J8AA 2IVOA 2D0PA 2P9KA 5FPNA 4FWNA 4BROA 3D7EO 1C0GA 3LDOA 2AA4A 4HTLA 3JS6A 3ZETA 2FF6A 4H0PA 3WQTA 3O4WA 3LDQA 4EHUA 3MDQA 2E1ZA 3ZX0A 1HJOA 1GLLO 1V4TA 4PL7A 3WUHA 3W0LA 1KAZA 3KVGA 4JD2B 3QBWA 3VEZA 3VPZA 4H5WA 3CJCA 2FF3B 2YJFA 3CJ7A 1BWFO 4XEIA 5AQTA 2A41A 3IDHA 4NB4A 3WEEA 4CZLA 5FPMA 2FSJA 2P9IB 2GUPA 5BRHA 5BRFA 3EKSA 4BR9A 1NGIA 1LCUA 4BRFA 4BRKA 1ATRA 4BRQA 1IJJA 4PKHA 3ULEA 3W3DA 4BQZA 5BPNA 3CQXA 4Y0WA 3LM2A 2E2PA 2E2OA 2PBDA 3UKUB 5LY3A 1NGHA 2ASOA 1GLCG 4H0TB 3WQUA 4BRAA 3H3NO 4M63C 4CD3A 4A2BA 4QS7A 5F2RA 4RWTA 1NMDA 1K8KA 3EL2A 2A5XA 4H0OA 3UKRB 1XUPO 2HF3A 3FZMA 1HKCA 1KXPA 2E2NA 4H0YB 1GLDG 3C7NA 5E26A 3R8EA 3U9ZA 1BU6O 1NBWA 2QWQA 3WXIA 1DKGD 4BR5A 4BVPA 5EY4A 2P9UB 5AFUA 3UB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF8A 2GBZA 5AQLA 5C24A 3QNOA 3ID8A 4JKFA 4QAGA 3L2VA 4YHHK 3CCRN 3CD6N 5GAGP 3DLKA 2HMIA 5JICA 3SAHA 2EX3A 4OKKA 5HP1A 3RVCA 4CJTA 3LALA 3KLIA 1EQYA 1UA0A 2B6AA 3OJSA 3HO1A 1QQOA 1OVQA 5C2FA 3AAQA 4DHYA 2A1SA 4B9NA 3ZEUB 1A5VA 2IOCA 4IJNA 3K5MA 1E4FT 3N4PA 1NK9A 5EXWA 4B3MK 3RMDA 2KQ2A 3CHWA 2J4RA 4YOUA 1Y64A 1NGDA 3ATUA 5JLHA 5KQDA 2G8HA 3S3MA 4EAHD 3FLCO 3ZEUA 4J8FA 2E1YA 1W7AA 3C95A 4FYDA 3FR0A 4OGEA 3E9LA 3A5LC 4JI1K 3ID6A 4LF6K 3VF2A 4CK1A 4A57A 2FSNA 1LW0A 3KWGA 3RRHA 1T6DA 1RNHA 4WQ5A 4KFBA 5LJVA 4FM2A 3Q7CA 3L2QA 3U4LA 3A0IX 1T03A 4AM7A 3SUOA 3THXB 3EYZA 4JI6K 1CZAN 5HROA 4LF7K 4B8AB 4CFDA 4KV8A 1RT2A 3TTFA 5AQSA 3IMXA 1XC9A 3EY1A 3QDKA 3HL8A 2Q0UA 3DWLA 3M8SA 1TAUA 1EXQA 1IBMK 1RBUA 1OH8A 3FZHA 4WQ5C 1SKSA 4CVNE 4B9TA 2G8WA 3AARA 1J5OA 3QEWA 3WNGA 3HPGA 1WSEA 4YOWA 1NM1A 1MWKA 3CC4N 5EOYA 3OTOK 1VQ8N 2ASMA 5C25A 2ITGA 3ALYA 3TR8A 5M1NA 3LM9A 4A2AA 4JRPA 5BN9A 1IKWA 1HX1A 3VF4A 5AQPA 1S3XA 4BRGA 1G99A 3FZFA 1TKXA 4WQ4A 4JHDB 5GIPA 2P9SB 5FLXO 5CYMA 3QERA 1S22A 1SV5A 2I7NA 1QVFM 3DRSA 3CJ9A 1JCFA 4E0DA 4ELTA 4IOXA 3DLLL 1F21A 3HYFA 1YJNN 2F8SA 2E5LK 3SQ2A 1EWRA 3LDSA 1U45A 2YKMA 2NRWA 1RTIA 1ZYQA 3QEIA 2C1IA 2H3GX 5FPEA 4TSXA 1HNXK 5AQVA 3WT0A 3SLCA 1U04A 3PLAA 3QEPA 3DAWA 1NJXA 2NRXA 4DFPA 5AZJB 1SL2A 3O80A 5M1QA 5HRNA 4WQ4C 3AVBA 2VWBA 4J2BA 1NKCA 4L3QA 1HUXA 3AO5A 1BI4A 4CZIA 3MXJA 4B1ZA 5KGWA 4K25A 3E01A 3L2WA 4DKWA 1IBLK 4CEAA 5AQWA 4F2RA 4DFMA 3QB0A 3LP3A 3AVHA 3VGMA 5DM7L 1CZ9A 4BC3A 3PSIA 4W5RA 4KH5A 4AHRA 4PL8A 2DFHA 5HRSA 2A6AA 1VQ7N 2UUBK 4DUZK 3D2EB 1YUWA 3OYDA 1MWMA 5HOOA 2A42A 2OTLN 1D8YA 2NLXA 3EE9A 4Q0BA 3SQ4A 1OVYA 1XI1A 3QIOA 2PYJA 3WNFA 2YKNA 2WUSA 4CJEA 3HTVA 5C2DA 3D2EA 1KAYA 3CPEA 5HRRA 4CF9A 3FE1A 1JLBA 4CZGA 2ITMA 3V6DA 4FK4A 5EX5A 1RTJA 4F4KA 2O8CA 3QINA 4DV1K 3OYIA 3SV3A 1FW6A 4YOXA 4CIGA 4M41A 5GIOA 1VQ9N 3ZCMA 2FBTA 2XO7A 2EHGA 3KKRA 2HB5A 3O9UA 4I6MA 3AO3A 3CFPA 1YIJN 1L3TA 4CGHA 5KGXA 3RWUA 4BRIA 3NGYA 1X3MA 1BA1A 2YNHA 2QWNA 4UQGA 2BH1A 3UE5A 1TV6A 1HPMA 4KHSA 4DV6K 1NK6A 3V1OA 4RW6A 1X9SA 2QKKA 1KCFA 1ITGA 1JL1A 3NF6A 5J2MA 2GWKA 4QS8A 1NK7A 4DR7K 2G8UA 4EZ6A 2W00A 2A3ZA 4OGCA 3ULEB 1NKBA 3H08A 3T3FA 2HBMA 4B3SK 3ZSQA 4DSIA 4CD1A 1X3NA 2ZWHA 3FGUA 4FJHA 1WSIA 1S5JA 1VQPN 4GVMA 3TANA 1RILA 2Q31A 3HM9A 2BGGA 2D0OA 2E6MA 1RBTA 4CGJA 4CJSA 3HSCA 1XNQK 3E9PA 2FSKA 4CIEA 3PIOL 4CJ4A 3WXJA 1T05A 4ILJA 3VQDA 3ZSZA 3D45A 4BRDA 2HHUA 3K57A 3HT3A 3RRGA 2P9LA 1QHTA 1JLAA 4PWDA 1LWEA 3MCAB 4CJ7A 3TAMA 5I9EB 5KTQA 3DI6A 4A59A 1O1WA 4MFBA 1T44A 2KHOA 3TAFA 4CJFA 1NOYA 4CHZA 1J9AA 1IG9A 4JKBA 4OPAA 3QEVA 4HCCA 3CC2N 5T7BA 4ILGB 4GVEA 4CZFA 5ADXA 2HOEA 4C8MA 2XY6A 5AQGA 3DLGA 3OYGA 2D1KA 4IO9L 4DU3A 2D5RA 1NK4A 1YVUA 3DXMB 5HLFA 3AVAA 3BUZB 1UOCA 4BECA 4IO8A 4LSNA 1WLJA 1V4SA 4FZZA 3O9TA 4WE1A 1S72N 2HNDA 4H5VA 4JEPA 1NGEA 3QFUA 4CJLA 3LWLA 5CY4A 2W40A 2QKBA 4IG0A 3OYBA 1KVCA 2FBVA 2FBYA 1HKGA 2Q3SA 2G8VA 1GOBA 3QEXA 3ENBA 4LF4K 1SL0A 4JI8K 1TK8A 1GOCA 1CZBA 1TUYA 3PO5A 3MK6A 3HSTB 1VQ5N 3KK3A 2CGKA 3IKMA 2IVOA 2O8EA 1JLFA 3TSQA 4BROA 1C0GA 1NMNA 4HTLA 1HR0K 1S9GA 3E66A 4I9QA 5J2QA 4JRQA 3WQTA 4M3TA 3MDQA 1FKPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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