2W41A

Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
506
structure length
506
Chain Sequence
SEFGSMNVILSIDQSTQSTKVFFYDEELNIVHSNNLNHEQKCLKPGWYEHDPIEIMTNLYNLMNEGIKVLKDKYTSVIIKCIGITNQRETVIIWDRITGKPLYNAIVWLDTRVEELVTEFSAKYNNNDIQKKTGTYFNTYFSAFKILWLIQNNPEIKQKIDDGTAVIGNINTWLIFNLTKGNCYTDVTNASRTLLMDINTLQWDEKMCKIFNITNMSVLPEIKSNCSNFGLVKSEHVPDYLNIPITGCIGDQQSACIGQAIFDEGEAKCTYGTGVFLLINTGEKVVYSTCGLITTICYKFNDNDKPKYALEGSIGTAGSGVSWLLKNKLIDDPSEASDIMEKCENTTGVIFVPAFSGLYAPRWRSDARASIYGMTFNTERSHIVRALLEGIAFQLNEIVDSLTSDMGIEMLHVLRCDGGMTKNKPFMQFNSDIINTKIEVSKYKEVTSLGAAVLAGLEVKIWDSLDSVKSLLRRSDAVFHSKMDDKKRKKKTSEWNKAVERTLIQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords GLYCEROL KINASE, PUTATIVE
publication title Structure and Non-Essential Function of Glycerol Kinase in Plasmodium Falciparum Blood Stages.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 185
structure length 506
sequence length 506
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A01
3VENA 3ZX3A 2P9UB 3C7NB 3UE5A 1HKBA 2VCPA 2YJFA 2FXUA 2GWJA 4JN4A 3DWLA 5ADXA 4CZKA 1D4XA 5F1XA 1RGIA 1BWFO 4EFHA 4BG9A 3ENOA 1T6DA 4ISEA 5EX5A 3ID8A 5AQTA 1RDWX 3LM9A 5BRHA 3WUHA 3C0BA 3IDHA 2F9WA 4Y0WA 3R8EA 1WOQA 4K42A 3CJBA 3LDQA 5I9EB 4FSVA 3UB5A 1BUPA 1ZC6A 1BOTO 4WQ5A 1GLEG 1TUUA 2HF3A 4CZMA 3HM8A 1S3XA 3IUCA 5AQVA 2QWRA 2YI1A 3DJCA 1BA0A 5BN9A 3CETA 4C23A 4FWLA 5AQNA 4H5RA 4BC5A 1C0GA 1ESVA 5BPNA 2UYTA 3VETA 5EXWA 1ZBSA 3FGUA 3U9DA 2HMPA 4O5FA 2CH6A 4JNEA 1NLVA 2DPNA 4H0XB 2QWNA 2Q97A 5EVZA 2KHOA 4Z94A 3VGMA 2AA4A 3QFPA 3EL2A 5AQKA 3VESA 4CI6A 4CZLA 2Q0RA 2GTDA 5F0XA 5LJWA 1HKGA 4IJNA 3QBWA 4QS9A 4CZHA 2P9KB 4L3QA 5BREA 2QWPA 2P9PA 2EWSA 5AFUH 1BU6O 1V4SA 3F9MA 1H1VA 3L4IA 4EIAA 4F9OA 3LDPA 2P9SA 1SZ2A 3GE1A 3RSEA 4B1ZA 3MDQA 4FPAA 3GG4A 4CD1A 1MWKA 4RTFD 5E84A 3R9PA 3FLCO 2V7ZA 4B1YB 2P9PB 3L0QA 4JD2B 3WQUA 1NWKA 4NB4A 3SMPA 3MN6A 2P9SB 3CERA 2P9IA 4H0YB 4BC4A 1MWMA 3KZBA 1QZ6A 4MLEA 4BR0A 5AQFA 3HI0A 4WQ4C 4FOIA 2ASOA 2Q36A 5JICA 2CH5A 3FE1A 3CJAA 4FWNA 4QS8A 3S41A 2YJEA 3CIPA 4I6MA 1NGCA 5BRDA 2YHXA 4MO4A 5AQIA 2Q2RA 3G25A 1KAXA 2NZTA 3I33A 3VF6A 4ISGA 5BPLA 1JCGA 1NMDA 3MN9A 3LDNA 3O1WA 4I6MB 2ASMA 3B8AX 2A3ZA 1IG8A 3A5NC 4CZFA 4AM7A 1NGEA 4BRGA 5AFUA 2Q1NA 4XH5A 1ATSA 1X3NA 4IJAA 4BR2A 1QQMA 1SAZA 3C7NA 1HKCA 3D2FA 4JHDA 5AQPA 2Q0UA 3R6MA 2W41A 4GY2B 4K41A 4DCHA 4BRDA 2E2NA 4CZGA 1K8KA 3MMVA 3H6EA 4HWIA 5AQQA 3UKRA 4E1JA 2FSJA 1EQYA 1NGAA 4PL8A 5AQSA 4A2AA 3O08A 5KPZA 2V51B 2PAVA 3WT0A 4B1VA 2V52B 4BREA 1NGGA 3D2FB 4JHDB 4H0TB 2E2QA 4BRNA 4B1UB 1LCUA 1E4GT 1K8KB 3UKRB 4XH1A 2BTFA 3DXKA 2E2PA 3HBTA 4B9QA 3GL1A 1MDUB 1TUYA 3JS6A 4A62A 3KVGA 4FWPA 4O8KA 3SMSA 3W3DA 4BG8A 4BRCA 3MK6A 1DKGD 3DXKB 2YHWA 3AAQA 1C0FA 3VF2A 4BC3A 4IXCA 2GELA 4YDUA 3H1QA 3BEXA 1XUPO 3QBXA 3SK3A 1GLDG 4BRFA 5EY4A 2P9LA 4CZIA 3QB0A 4BQLA 2GEMA 2W40A 1YXQA 4CD3A 4BVPA 1J6ZA 1YVNA 3L6QA 2F9TA 3CQXA 1U6ZA 5AQXA 4ISFA 3BF3A 4FPBA 2IVPA 4EAHD 2OANA 2A6AA 4BRLA 5E26A 2WUSA 3CJ7A 2QW9A 2P9KA 3QDKA 2CGKA 3DAWA 2P9LB 3WXIA 2BUPA 4JAXA 4A2BA 3A0IX 1GLBG 1NGJA 3O4WA 4XH4A 1Z05A 3EN9A 3FZFA 1TYQA 3EO3A 1HUXA 3FZHA 3VEVA 3QMLA 4CBWA 3EKSA 2P9NA 5BPMA 1HX1A 2NLXA 3EKUA 3LDOA 2HOEA 2QM1A 4IZ9A 1LOTB 3AY9A 1DEJA 4BRMA 1RFQA 3FZLA 1R59O 3QICA 2AP1A 4H0VB 4CZEA 4JD2A 3IMXA 1BG3A 3O1BA 4IWVA 1TYQB 3WXLA 4WQ5C 4BGAA 2P9NB 5AQJA 4MO5A 5F2RA 3SLCA 2A42A 2QXLA 3TU5A 3M1FA 1ATNA 2E1YA 5JMVA 3A5OC 3A8YA 3EZWA 1ATRA 1ZXOA 4FWRA 2E8AA 1IJJA 1NM1A 4GNIA 3AARA 4PKHA 1XC3A 1HPMA 1QQNA 4H5TA 2Q31A 1QHAA 3VERA 3LM2A 1V4TA 4FWQA 4NO7A 1SQKA 3VEZA 5AQZA 5TKYA 3CI5A 4B1WB 4LC9B 1YUWA 3FZKA 1JCEA 2PBDA 3P4IA 4H03B 2ITMA 5BN8A 4BGBA 1BO5O 1CZAN 4BR4A 4MLHA 3A5MC 3M6GA 4FL9A 4CBXA 3VGKA 4FOEA 3FR0A 2A5XA 1KAYA 3ENHA 3FFKB 5AQHA 3VGLA 2GWKA 4BR9A 3WXJA 3ULEA 4BROA 2CGLA 2J4RA 4RCHA 3ZEUA 3ZX0A 3D2EA 4BRKA 1MA9B 5AQYA 5LY3A 1NGHA 1NGFA 1NBWA 3BF1A 5FPEA 3VEXA 3J8AA 3SJHA 2E88A 2YHYA 4FWKA 3ULEB 5KQ8A 3A5LC 3O5BA 2H3GX 2IIRA 3ZEUB 5AQGA 4PKGA 3D2EB 1Z6RA 4BRQA 4DQ8A 5FPMA 1QZ5A 2A40A 3CJ1A 2QWQA 3ZX2A 3ATUA 3MN7A 2QWLA 4M7YA 2HF4A 3OHRA 3CHWA 3ATVA 4BRHA 3KHYA 1E4FT 4K43A 5JLHA 4CBUA 4H0OA 4A61A 3QFUA 2YCHA 3D7EO 3LL3A 5KQDA 2GUPA 4WYBA 3U9ZA 2IVNA 4PL7A 4B1XB 3H3OB 3MN5A 5KPTA 2ZF5O 2NRHA 4DB3A 5AQUA 2E1ZA 2D1KA 5FPDA 4FWSA 3UKUA 1YAGA 5AZJA 5BR9A 3JXUA 2A41A 3BUZB 2FLOA 4BR7A 4AM6A 3HSCA 3O6WA 4RWTA 2D4WA 3O8MA 3LDLA 1GLAG 1WUAA 4J8FA 2E2OA 1Y64A 5EOYA 2I7PA 3UKUB 5B8HA 5AZJB 1Q18A 2FSNA 1P8ZA 4K25A 3W0LA 1BA1A 2IVOA 3VPZA 4XEIA 3CQYA 3H1VX 1DGKN 4H5NA 4IO8A 4QS7A 4BVOA 4WQ4A 1S22A 4EHUA 5AQMA 1HJOA 4M7XA 1NGDA 1NGBA 4DHYA 1GLLO 3CJCA 4YDUC 5CE3A 2V7YA 5FPNA 4H5VA 3I8BA 4BRAA 3IFRA 1GLCG 3WEEA 3GOIA 3MCPA 3DXMA 2QWOA 4H5WA 2FF3B 3GDQA 2I7NA 2VYPA 4KBOA 3WEEB 3O80A 1KXPA 3H3NO 3DXMB 5AQRA 3ZETA 3AAPA 4BQZA 3RSEB 2QWMA 3M3ZA 5ELZA 5ADXH 4CJ7A 1JCFA 1GLFO 2D0PA 2E20A 4HTLA 2ZGYA 4M63C 5AZIA 4FWMA 3VOVA 3VEOA 3ZETB 3GBTA 3CJ9A 1U2VA 5KPRA 4BRPA 4BRIA 1G99A 2P9IB 2ASPA 1OKJA 2FF6A 3TPQA 1HLUA 3BP8A 5AQLA 1GLJO 1QQOA 5AR0A 4EHTA 4CZJA 4FO0A 5AZIB 2D0OA 3U4LA 3WQTA 1KAZA 1U2VB 1X3MA 3HTVA 5BRFA 1NGIA 1BDGA 3H45C 2FSKA 3VF4A 4PKIA 5LJVA 4BC2A 3WXKA 4BR5A 1XQSC 4FWOA 3VEYA 1T44A 2CGJA 2P9UA 2ZGZA 3U8XA 3FZMA 3HZ6A 3VEWA 1X9JA 2VWBA 5AQOA 5JLFA 2ZWHA 5AQWA 1T6CA 3H46O 4H0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EETA 4JKFA 4AHSA 3V1RA 2FXUA 2WC9A 1EKEA 3DWLA 1T3VA 1T6DA 1X9WA 3OYKA 2UXCK 1RDWX 4I9LA 4CJTA 3IDHA 2KFNA 3DRSA 4CEFA 1QQCA 3O9SA 3SCXA 4B9UA 2PYLA 3LDQA 5I9EB 1ZC6A 4AHVA 4HTUA 4JK7A 4C1NK 3K5MA 2QWRA 1HNXK 4DV7K 3F9KA 1NJYA 2Q3SA 5AQNA 1UA1A 1C0GA 1KFDA 3VETA 4PUOA 3C6HA 3LPTA 4F2RA 4DQRA 2XY5A 1ZBSA 1VSEA 3U9DA 1SL1A 1FW6A 3SQ1A 3D0PA 4JNEA 2DFEA 1VQ6N 5C25A 3F2KA 4Z94A 4DV5K 3NAEA 3KLHA 3MX5A 4LF8K 4QS9A 1XNRK 2YNFA 1S9EA 4NXNK 4L3QA 2QWPA 2P9PA 2WOMA 4Z4HA 4O55A 4LY7A 2O8DB 2P9SA 4B1ZA 4M41A 3MDQA 3QNNA 4CK3A 4O5BA 3AA3A 1IKWA 3KK2A 3R9PA 3SV4A 3SJJA 4A5BA 3TABA 4JD2B 3WQUA 3TTFA 4DLEA 1NK4A 1ZBFA 3SMPA 3OYDA 1NNEA 3CC7N 4Q5VA 1C1CA 3CERA 3DRPA 3THYB 3KZBA 1WAFA 4BR0A 4CJLA 3KTQA 2ASOA 2Q36A 5JICA 2A1RA 3FE1A 4BDYA 3LANA 1TVRA 3S41A 4KHQA 4CJVA 2YJEA 1W7AA 3R3LA 3ULDA 4O44A 4FLUA 2HNZA 1L3UA 3TAMA 4DTMA 3O4QA 1JCGA 1SUQA 4B8CA 1BISA 3VTHA 2ASMA 1IG8A 3A5NC 4DTPA 4DF4A 2QTDA 3MXJA 5AFUA 4KO0A 4CHQA 4LH5A 4BR2A 1QQMA 1ZBIA 4G9ZA 4JI6K 1HKCA 4CEEA 3SQ2A 1NJZA 4CZGA 3PO5A 4LD0A 2W6LA 4E1JA 1EQYA 3ZCMA 2PAVA 1NGGA 3D2FB 3NH0A 1QHTA 4LF6K 4BRNA 1W97L 4M3XA 3TTCA 4IG0A 1K8KB 3FFIA 4XH1A 1HNIA 5KI6A 2E2PA 1HQEA 4QCLA 1C0MA 1REVA 2JGUA 1RT5A 4F3OA 3AVLA 1TUYA 4CJSA 1TAQA 3ZT1A 5HROA 1JLQA 3MK6A 4YOUA 4DQQA 1NKCA 3AAQA 3VF2A 4IXCA 3HSTB 4CJRA 1XUPO 3J80O 4KHNA 5EY4A 3AVCA 2P5OA 2P9LA 4BE2A 3K59A 4CD3A 3L6QA 4KPYA 3CQXA 4OX9K 4M3YA 4ISFA 4IEEA 3BF3A 3DM2A 2IVPA 4EAHD 3EYZA 2A6AA 3QDKA 1XMQK 1SV5A 1WSJA 3TSPA 4A2BA 4JK9A 1NGJA 3HYFA 3O4WA 3L3VA 2O8DA 3PSIA 3EO3A 3FZHA 1HUXA 1HX1A 1U48A 4YY3K 3EKUA 3QETA 2QM1A 1LOTB 1SKWA 1LWEA 3KK1A 1DEJA 3QICA 3AVHA 4JD2A 3IMXA 1BG3A 5FROA 4CF0A 2IAJA 3CXCM 4BGAA 3SLCA 3WNHA 3TU5A 3M1FA 4BE0A 1ATNA 1RT2A 2ZJRL 3J7YP 2VG7A 3EZWA 3JSMA 1ATRA 4CJ4A 4DR5K 4FWRA 2HNDA 5M1PA 4JKCA 4DG1A 4GNIA 4CFCA 3AARA 4PKHA 4OLAA 1XC3A 3DLRA 4PA1A 4IFEA 3MXMA 3LM2A 3VQBA 3OYNA 1V4TA 1RT3A 4FWQA 2YNIA 1KVAA 1HQUA 5AQZA 5TKYA 1YJWN 3IRXA 3CI5A 3L4QA 4B1WB 1N36K 3TAGA 3FZKA 3CM5A 2PBDA 4KHYA 2ITMA 3OYFA 4KB0A 3OYGA 3KWIA 2Z1IA 3M6GA 4CBXA 4X62K 4FOEA 2KKZA 1KQSM 1WSIA 4RW4A 4WFBL 3VGLA 2NRXA 3WXJA 2HHTA 2HBLA 4BROA 4FYDA 2CGLA 1VSDA 2J4RA 1RBSA 4ILJA 3DLBA 5GAEP 1Q86O 4PHTX 5AQYA 3M5RA 4B9LA 1NGHA 5FPEA 3VEXA 2Z1HA 1QVFM 3O5BA 2H3GX 1TK5A 2IOCA 3ZYYX 3D2EB 3G0ZA 1IKVA 3WNGA 4KH4A 4MQ3A 4BRQA 1NOZA 1K73O 5D3GA 3I8DA 2KTQA 2Z1GA 5M1FA 3CJ1A 2QWQA 1KVCA 1FKPA 3CHWA 3KHYA 2JWLA 4FM0A 1TGOA 3VQ9A 4CBUA 4NLCA 3QFUA 3LL3A 5KQDA 4JKHA 2GUPA 4JI1K 3U9ZA 3V6DA 4AQYK 3H3OB 5CYMA 4DB3A 4DV6K 1NU0A 2D1KA 3N4QA 5FPDA 4FLVA 3PSFA 3MWPA 3JXUA 5BR9A 2UXBK 2A41A 3AO1A 1A5WA 4IO9L 3AGKA 2ZJPL 2E2OA 1WB9A 2I5JA 1Y64A 5EOYA 2I7PA 4CJEA 4FK2A 3W0LA 3OYAA 4XEIA 3CQYA 4FCYA 1WAJA 1C1AA 1HJRA 1DGKN 1YTAA 3CQ8A 4WQ4A 3TANA 4EHUA 3BZKA 1HJOA 3EZ5A 1CXUA 4DHYA 1YJNN 5CE3A 1NJIO 5FPNA 1GOBA 3RMBA 5IWAK 4H5VA 4NCBA 5BR8K 3I8BA 4GV6A 3WEEA 2XY6A 5K14A 3VQQA 4DU4A 4Y1DA 2Y1IA 1NK5A 1RTHA 3O3GA 1U04A 2QWOA 3TSUA 1D5AA 1JXEA 2I7NA 4DUZK 5J2QA 1JLCA 3O80A 2QK9A 4B3TK 3AAPA 1EWQA 4CFAA 2UUAK 3KLFA 5CHIA 2D5RA 4HVJA 1JLBA 4B3MK 2WTUA 3DRRA 3E66A 1RT1A 4MDAA 4Z4FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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