2W41A

Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
506
structure length
506
Chain Sequence
SEFGSMNVILSIDQSTQSTKVFFYDEELNIVHSNNLNHEQKCLKPGWYEHDPIEIMTNLYNLMNEGIKVLKDKYTSVIIKCIGITNQRETVIIWDRITGKPLYNAIVWLDTRVEELVTEFSAKYNNNDIQKKTGTYFNTYFSAFKILWLIQNNPEIKQKIDDGTAVIGNINTWLIFNLTKGNCYTDVTNASRTLLMDINTLQWDEKMCKIFNITNMSVLPEIKSNCSNFGLVKSEHVPDYLNIPITGCIGDQQSACIGQAIFDEGEAKCTYGTGVFLLINTGEKVVYSTCGLITTICYKFNDNDKPKYALEGSIGTAGSGVSWLLKNKLIDDPSEASDIMEKCENTTGVIFVPAFSGLYAPRWRSDARASIYGMTFNTERSHIVRALLEGIAFQLNEIVDSLTSDMGIEMLHVLRCDGGMTKNKPFMQFNSDIINTKIEVSKYKEVTSLGAAVLAGLEVKIWDSLDSVKSLLRRSDAVFHSKMDDKKRKKKTSEWNKAVERTLIQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords GLYCEROL KINASE, PUTATIVE
publication title Structure and Non-Essential Function of Glycerol Kinase in Plasmodium Falciparum Blood Stages.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Transferase
total genus 185
structure length 506
sequence length 506
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A01
4IXCA 4CZLA 1X3NA 3EL2A 1P8ZA 4CZFA 1HX1A 3DJCA 2ASMA 4O8KA 4CZHA 1OKJA 2GWJA 1HKBA 3WXKA 1TUUA 2E2PA 4CZMA 4HWIA 4H0TB 2H3GX 5AFUH 5LJVA 1ATRA 5EOYA 3KZBA 4H0PA 4WQ5C 4BRQA 2CH6A 2P9PB 3FZLA 1GLFO 4BR7A 1SZ2A 2KHOA 3LDQA 2QM1A 4FPAA 1HJOA 3CJ1A 1YUWA 2GTDA 3ZX0A 3G25A 1YXQA 1XUPO 5KPZA 4PKGA 4BRMA 4FPBA 1G99A 3QFUA 1ATNA 3CJ9A 2QWRA 2WUSA 5AQKA 2AP1A 4JN4A 2UYTA 2OANA 3VEOA 5I9EB 5FPMA 2HMPA 4B1ZA 3MN5A 2P9NA 1HKCA 5AQIA 4JHDB 3WXIA 2P9SA 1X3MA 4BVPA 4EAHD 3SMSA 1ZBSA 1QQNA 4H0VB 3FLCO 4A62A 3VERA 4B1WB 1K8KA 1WOQA 4BRHA 1Y64A 2Q2RA 3EKSA 3A5OC 3MCPA 1BDGA 3D7EO 4PKIA 3UKUA 4DQ8A 4H5WA 1KAXA 1J6ZA 1C0GA 3FZMA 1MA9B 4CJ7A 4EHUA 2A41A 4FWKA 4M63C 5BPNA 4FOEA 1IG8A 5AQTA 2Q31A 2FXUA 1NGHA 5LY3A 5KQ8A 4B1XB 3LM9A 5AQNA 2F9WA 3HI0A 4GY2B 5KPTA 3H3NO 3VESA 5AQQA 2CGKA 1WUAA 4IJAA 4FL9A 2QW9A 1BO5O 3CQYA 3L6QA 3LM2A 5F2RA 4BRCA 1U2VA 2D0OA 1ZXOA 4BRKA 2QWPA 5BRDA 3QBWA 1NGBA 5AR0A 1RGIA 3WQUA 2Q0RA 3VEVA 2QWOA 4JD2A 3VF6A 5KPRA 3ZEUB 1TYQA 3WXJA 3GE1A 5AZJA 3AAPA 4EHTA 4JNEA 1EQYA 3AY9A 3ID8A 3BF3A 3D2EA 4CBUA 3TU5A 4MO4A 2W41A 4H5VA 4XH1A 3ZETA 3W3DA 3ENHA 3CHWA 2ZWHA 3O6WA 3R8EA 2P9UA 4BRIA 4FWQA 3BP8A 4B1YB 3M3ZA 2FSJA 5E26A 2E1YA 3GL1A 3M6GA 3CETA 3I33A 4CZEA 1T6CA 1RFQA 2ZGYA 4H5NA 5JLFA 3C7NA 2A5XA 4BR4A 3A5LC 3H3OB 4FOIA 5AQYA 2I7NA 1DEJA 2P9KA 3WXLA 4MLHA 2E1ZA 3GOIA 5AQSA 1QQMA 5B8HA 5AQUA 2HF3A 4FWPA 5AQPA 2GWKA 1NGGA 3FZFA 1NM1A 2CGJA 3QB0A 3R6MA 2IVPA 2ZGZA 3U9ZA 2FF3B 3CIPA 4CZGA 5CE3A 2YHXA 2P9SB 4BVOA 1T44A 3DXKA 4J8FA 4Z94A 3BEXA 1K8KB 4I6MB 1BG3A 2V7ZA 5E84A 4NB4A 3VETA 3FFKB 3UKUB 2IIRA 4DHYA 1HKGA 3GBTA 5AZIA 3QFPA 5AQGA 3WEEB 4XEIA 5BPMA 3IMXA 4MLEA 3VGMA 5BPLA 3MDQA 3VF4A 3HZ6A 2QWNA 1YAGA 1GLCG 4A61A 2V52B 3O5BA 1Z05A 4EIAA 3H6EA 4FSVA 5ADXA 1Q18A 3MMVA 1JCGA 4BRDA 4FWNA 1BA0A 4IJNA 3GG4A 4FO0A 2DPNA 4M7XA 1QZ6A 2ITMA 2P9PA 3CJCA 4Y0WA 3W0LA 4PL7A 2Q0UA 5JMVA 3QICA 3VEZA 4PKHA 2HOEA 3HBTA 3IUCA 4H5RA 3CERA 2P9LA 3MN7A 3LDNA 1ESVA 5AQHA 1BOTO 1NGAA 4H0OA 4BR9A 2F9TA 3CI5A 4JAXA 1U2VB 4K41A 3SJHA 2J4RA 1HPMA 3UE5A 4CZKA 3SMPA 4O5FA 4E1JA 4XH5A 3A5NC 2FSKA 3DXMA 2PAVA 3C0BA 3FGUA 4JD2B 4CD3A 4B1UB 1TYQB 5AQRA 4BQZA 2NRHA 3LL3A 2BTFA 1R59O 2BUPA 3ULEB 4C23A 4CI6A 3UKRB 3MK6A 5EVZA 3ZX3A 4H5TA 2FF6A 3EZWA 4H03B 1DGKN 1KAZA 3DWLA 3VPZA 3ZX2A 3ZETB 2A42A 2FLOA 3B8AX 5AQMA 2P9UB 4PL8A 1BWFO 2IVOA 4KBOA 5JICA 3VF2A 2A3ZA 3TPQA 3LDOA 1NBWA 2E2OA 3JS6A 1GLEG 4FWLA 2CH5A 1SAZA 5KQDA 4CD1A 3C7NB 1Z6RA 4B9QA 1X9JA 1LOTB 4K43A 3O1WA 4A2BA 2P9KB 4HTLA 5EY4A 4BC2A 4B1VA 4ISEA 5AQOA 3I8BA 3EKUA 2QWQA 2E2QA 3MN9A 3QMLA 3EO3A 3AAQA 1T6DA 1NGJA 1CZAN 2PBDA 2P9IA 3GDQA 3M1FA 3WQTA 2YI1A 4DCHA 3VEXA 3ATVA 5AFUA 2V51B 5FPEA 5AQLA 4BROA 4BR5A 3VGKA 3FZKA 5BRFA 1NGCA 1D4XA 3SLCA 3HSCA 3FZHA 4RTFD 3ZEUA 1RDWX 2QWMA 3RSEA 3A0IX 2NLXA 1ATSA 2YJEA 2GEMA 3P4IA 3FE1A 5TKYA 4CBXA 3JXUA 5F0XA 5JLHA 1E4GT 1NGEA 3QDKA 2D0PA 2Q36A 2P9NB 3QBXA 1LCUA 2HF4A 1V4TA 5AZIB 4WQ4A 3OHRA 2NZTA 2D1KA 4MO5A 4RWTA 2CGLA 5LJWA 3O4WA 3BUZB 2W40A 3SK3A 3O08A 3ATUA 2FSNA 2YHWA 3D2FA 3U9DA 1KAYA 4BGAA 4YDUA 3S41A 4BRAA 1NGIA 5AQFA 1JCEA 1NGDA 4LC9B 5ELZA 1S22A 4A2AA 4BRPA 5AQVA 3R9PA 4RCHA 3CQXA 2P9LB 4CBWA 1S3XA 3DAWA 4M7YA 4BC4A 5BN8A 5F1XA 1E4FT 2ASOA 3WUHA 1C0FA 5BREA 1BU6O 4IWVA 4K25A 1KXPA 1ZC6A 4BQLA 2ZF5O 2QWLA 3O80A 4ISFA 4WQ4C 4ISGA 4EFHA 3KHYA 3DXMB 2A40A 4DB3A 1GLAG 1MWKA 4FWRA 1IJJA 4YDUC 4I6MA 1YVNA 2YCHA 4WYBA 4BR2A 1H1VA 4H0XB 2YJFA 5EXWA 4IO8A 3HTVA 4JHDA 2VWBA 2ASPA 2E8AA 3WT0A 1NMDA 4F9OA 2E20A 3WEEA 4QS9A 1QZ5A 5AQJA 5BN9A 5AZJB 3UB5A 1U6ZA 1DKGD 1HUXA 2YHYA 3AARA 3H1VX 5AQZA 2GUPA 2IVNA 4QS7A 5ADXH 1NGFA 1NWKA 3H1QA 5BRHA 3D2EB 4BRGA 3HM8A 1XQSC 3VENA 3A8YA 1QQOA 5EX5A 1GLJO 3BF1A 1XC3A 3KVGA 1NLVA 2E88A 3FR0A 1MWMA 4FWSA 2Q97A 1BA1A 2P9IB 3ENOA 3VOVA 3F9MA 3LDPA 3VEWA 1QHAA 4AM7A 4BRNA 4CZJA 3O8MA 3A5MC 4BGBA 4IZ9A 4CZIA 1V4SA 3IFRA 2VCPA 5AQWA 2QXLA 2I7PA 3H45C 3J8AA 3O1BA 3CJAA 5AQXA 1GLDG 2D4WA 5BR9A 3CJ7A 5FPDA 4BRFA 1HLUA 5FPNA 2GELA 4FWOA 2EWSA 4K42A 4FWMA 3RSEB 2Q1NA 4NO7A 4AM6A 4BR0A 2VYPA 3H46O 3ULEA 4BC5A 3UKRA 2AA4A 4BRLA 1TUYA 4BG9A 3U8XA 4WQ5A 3VEYA 3LDLA 4XH4A 4QS8A 3L0QA 2V7YA 1BUPA 3EN9A 2E2NA 3MN6A 3IDHA 4H0YB 2A6AA 3CJBA 1JCFA 1MDUB 1SQKA 3L4IA 4L3QA 3VGLA 3DXKB 4BC3A 1GLLO 4GNIA 3U4LA 4BREA 1GLBG 4BG8A 3D2FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L3TA 4AHUA 4OLBA 1C1AA 4O0JA 1NJWA 3VQDA 1HX1A 4O8KA 2ASMA 4QAGA 1OKJA 4FJHA 1KVAA 1HKBA 4CZMA 3OVNA 5KI6A 5DMRA 5EOYA 4WQ5C 4O5BA 5LMNK 4BRQA 4NYFA 4LFBK 1SZ2A 5BR8K 4MDAA 4JKBA 4B9LA 1Q8IA 2GTDA 4HCCA 2JWLA 2GUIA 4JK7A 1IKYA 2WUSA 4A5AA 2EHGA 3VEOA 3LZIA 3SPYA 1KD1O 1U04A 3MN5A 5AQIA 3ASMA 2XY8A 3CPWM 3J81O 4KB1A 4H8KA 1X3MA 4EAHD 3SMSA 3AVBA 3AA3A 3E01A 2GV9A 1VQPN 3FLCO 4A62A 1WOQA 1IV0A 4C1NK 3PX4A 2UXDK 1F21A 4NXNK 4CEDA 3D7EO 3UKUA 4F3OA 4CERA 1KAXA 1J6ZA 3ID6A 3V9SA 5LL6Z 4C8KA 3P83D 4E89A 4KHQA 4HTUA 5C25A 1VSHA 2D5RA 1NNEA 1IG8A 1EWQA 3SUPA 1OH8A 1LW2A 4Z4EA 2FXUA 2FBTA 3LP1A 5KQ8A 3QIOA 4WE1A 1HYVA 5AQNA 3THWB 3CMEN 2YNIA 4BE2A 2QEXN 1T05A 3VESA 3LALA 4B8CA 3ZSWA 2QW9A 1RTHA 3ISNC 4CHPA 1U2VA 5DM6L 1E3MA 4BRKA 2O8CA 3LDSA 2E4LA 4FZZA 3WQUA 3VF6A 5KPRA 5GAHP 4YNQA 1TYQA 3AAPA 4FJMA 4JNEA 3SQ2A 3AY9A 1Q9YA 2VGMA 3ID8A 4IOXA 3E66A 1IBMK 3HRGA 4CBUA 2W41A 2YHBA 4H5VA 3S3OA 3KD5E 4EP4A 3W3DA 3CHWA 4JKEA 4BRIA 1TK0A 2G8UA 4CJ3A 1KFSA 3GL1A 3M6GA 3O9TA 1EP4A 1HNZK 4F2RA 1XMOK 1T6CA 1RFQA 2ZGYA 4H5NA 4FLTA 2PFUA 2P9KA 4I9LA 3RR8A 2HHWA 2NRWA 3D45A 3GOIA 5AQSA 4CEBA 3CFOA 3T1AA 4N41A 1NK5A 4AHVA 2YNFA 4W5NA 4DV4K 4DR7K 3MEGA 1RTJA 4CVNE 1S6QA 3R6MA 4IO9L 4ID1A 1WBDA 2R7YA 4GKKK 4FM2A 4OKJA 1LWFA 2YNGA 4ELUA 2YHXA 1R0AA 4CW7B 1J9AA 2IOCA 4WFNL 3ZT2A 3G6EN 4DSLA 1X9WA 3VETA 4J2DA 4FW1A 1SKSA 4L8RB 5HL7L 3RR7A 4OVLA 1S1UA 5AQGA 2D0CA 4N76A 3K9KA 3WEEB 4BE1A 4XEIA 3NMUA 2HSTA 3RMDA 3SQ0A 4MLEA 3C6TA 1YAGA 1GLCG 2ZE2A 1OH6A 4EZ9A 3H6EA 5ADXA 1K8AO 4BRDA 3G10A 4FWNA 1BA0A 3NF6A 5CR4A 3GG4A 4C1NI 4DTPA 4Y0WA 1SV5A 3IUCA 1HNXK 4C8MA 2P9LA 4CIEA 1ESVA 3AVAA 4H0OA 3VQ9A 1UWBA 4JV5K 3CI5A 1KLMA 4FJLA 4JS5A 3UE5A 3CYMA 3NH1A 1VHXA 4O5FA 2O8BA 1FKOA 3DXMA 4FM1A 3C0BA 4JD2B 2G8WA 3KWGA 4WFBL 2BTFA 5KRTA 1R59O 3R1XA 3ULEB 1WBBA 4CI6A 1LW0A 1IG9A 4IDKA 4CGJA 3J7AP 1RBVA 4CHYA 4FK2A 3OJSA 3ZETB 1T7PA 2FLOA 4OGCA 2P9UB 3K2PA 4O55A 5JICA 4DR1K 2HBLA 3CQ8A 3LP2A 4DUZK 3C7NB 4AHSA 1X9JA 2IC3A 4K43A 4E1NA 2QXFA 2FBVA 5EY4A 1KSPA 3Q7CA 4JKHA 4CJRA 3MX2A 1C0TA 4CGHA 3WQTA 1TV6A 3PV8A 2FBYA 2YI1A 4I9QA 4DTNA 4DS5A 3ZSZA 3OYCA 4KH5A 1VQ7N 2G8VA 4DTUA 5JS2A 5AQLA 1NKEA 4JKGA 3V9ZA 4DU1A 3FZHA 4RTFD 3THXB 1JJ2M 4CJQA 1QTMA 3K5LA 3U3YA 4CJWA 2GEMA 5TKYA 4CBXA 3SUNA 3OS0A 5F0XA 1E4GT 5HBMA 2D0PA 1Q9XA 4LD0A 3OHRA 2RHKA 2NZTA 4MO5A 1QS4A 2D0BA 4J2AA 5HRNA 3I0RA 2YHWA 5GAEP 2W6KA 3SBTA 3DYAA 4YDUA 4DFJA 4MQ3A 1JLCA 3RMBA 3QO9A 4M42A 4B3RK 2ZQBA 1B9FA 3V6DA 4A2AA 1N32K 3AVFA 4U7BA 3NCIA 4CBWA 1S3XA 3TAEA 1NK7A 1N8RO 4IWVA 3AVIA 4CFBA 1VSJA 3HJFA 4IG3A 1NK9A 3K5OA 3LWLA 2OTLN 4ISFA 4WQ4C 3OYAA 3CMAN 3KHYA 3QNNA 4IEIA 4CEOA 5FLXO 3DRRA 5FRMA 4QCLA 2Z1HA 2DFFA 2P1JA 2KKZA 3C6HA 4FWRA 2YCHA 1H1VA 3MWPA 3U3GA 4H0XB 4DR3K 3PY8A 1YHQN 4M3WA 3WT0A 2VQEK 3NGZA 4QS9A 5BN9A 3AARA 3H1VX 3D0PA 1VRUA 2GUPA 4QS7A 4DG1A 3ZLJA 3KD1E 3H1QA 3TAPA 1IKXA 1K73O 4KHWA 1XQSC 3PUFA 3KK1A 4YOUA 4KKOA 1S5JA 4DV5K 3IKMA 3VOVA 2ETJA 3LDPA 3HK2A 1U4BA 3L2QA 4PY5A 4IZ9A 1UAXA 4CFDA 1FK9A 1RILA 2QXLA 5GINA 3CJAA 2D4WA 3CCRN 1QSYA 4BRFA 4NO7A 3QEXA 2GBZA 3WNEA 3H46O 3WXMB 3UKRA 2AA4A 3AGRA 4BG9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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