2W41A

Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
506
structure length
506
Chain Sequence
SEFGSMNVILSIDQSTQSTKVFFYDEELNIVHSNNLNHEQKCLKPGWYEHDPIEIMTNLYNLMNEGIKVLKDKYTSVIIKCIGITNQRETVIIWDRITGKPLYNAIVWLDTRVEELVTEFSAKYNNNDIQKKTGTYFNTYFSAFKILWLIQNNPEIKQKIDDGTAVIGNINTWLIFNLTKGNCYTDVTNASRTLLMDINTLQWDEKMCKIFNITNMSVLPEIKSNCSNFGLVKSEHVPDYLNIPITGCIGDQQSACIGQAIFDEGEAKCTYGTGVFLLINTGEKVVYSTCGLITTICYKFNDNDKPKYALEGSIGTAGSGVSWLLKNKLIDDPSEASDIMEKCENTTGVIFVPAFSGLYAPRWRSDARASIYGMTFNTERSHIVRALLEGIAFQLNEIVDSLTSDMGIEMLHVLRCDGGMTKNKPFMQFNSDIINTKIEVSKYKEVTSLGAAVLAGLEVKIWDSLDSVKSLLRRSDAVFHSKMDDKKRKKKTSEWNKAVERTLIQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords GLYCEROL KINASE, PUTATIVE
publication title Structure and Non-Essential Function of Glycerol Kinase in Plasmodium Falciparum Blood Stages.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Transferase
total genus 185
structure length 506
sequence length 506
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A01
1NGEA 3GL1A 4H0PA 4BR7A 4BREA 2GEMA 3VEYA 4E1JA 1NBWA 2Q97A 3QBXA 1MA9B 2NZTA 3KZBA 3VEVA 2V7ZA 1GLEG 1BA1A 5JMVA 3AY9A 2A41A 2CGJA 3C0BA 5AQMA 4FWSA 1SAZA 1KAZA 3OHRA 2QM1A 1RGIA 1E4GT 4IJNA 5ELZA 3QICA 2P9PB 5AQKA 4CZFA 4M7YA 2F9WA 3ZX2A 3LM2A 5AQSA 3U4LA 2ASPA 2YI1A 2QWPA 1SZ2A 2E2PA 3SLCA 4BRGA 5BR9A 1RDWX 3FFKB 4BRFA 4JHDA 3FZHA 4MLEA 1K8KB 1J6ZA 1G99A 5AZJB 3JXUA 3FGUA 4JD2B 2VWBA 5BN9A 4FWNA 4WQ4A 4CZMA 1IJJA 1GLFO 2FF3B 3O1BA 1BWFO 1LCUA 1RFQA 5F1XA 5AQFA 3UKUB 3QB0A 5KPTA 1JCGA 1ATRA 3I33A 2HMPA 1U2VB 3QFPA 3FR0A 3IMXA 4K41A 5BREA 1NWKA 1X3MA 2YJEA 3HM8A 4FSVA 3WEEB 1CZAN 1U6ZA 5I9EB 5BPNA 3BEXA 2WUSA 3FE1A 4H0XB 2QWOA 1NMDA 3VOVA 1MWMA 5AQOA 3TPQA 4EHUA 3DJCA 4PL7A 1DEJA 3HZ6A 2Q0UA 5AQRA 5E84A 4PKHA 2A3ZA 3L6QA 4FPBA 5AZIB 2PBDA 4LC9B 3ENHA 1TYQA 4AM6A 1QZ5A 4H5NA 4B1WB 3ATUA 3LDOA 1NGGA 4MO4A 2IVNA 3DXMB 3H45C 4BC2A 2DPNA 2HF3A 1H1VA 3HTVA 2P9IB 3LDLA 3CETA 1C0GA 3DXKA 2P9SA 2GTDA 2AP1A 1QZ6A 3A5LC 4XEIA 4K43A 2E2NA 1XQSC 2P9UA 5ADXA 4IZ9A 1NGAA 4BROA 3H46O 4BRDA 2IIRA 4BGBA 3MN7A 3FZFA 3MCPA 5ADXH 4JNEA 4A61A 1BG3A 3ZEUB 3HSCA 3R6MA 3D7EO 2QWRA 4H5TA 3BP8A 3P4IA 5LJVA 1T6DA 3WXIA 3MMVA 2A40A 3ID8A 4O5FA 5EXWA 3J8AA 2A6AA 1YXQA 3ENOA 4FWQA 3SMPA 2P9KA 2KHOA 3D2EA 3O1WA 1ZXOA 2D1KA 4FWKA 2ASMA 1NGCA 2A42A 3AAPA 5BN8A 2HOEA 3IUCA 2GELA 3FZMA 1ATNA 2A5XA 3LM9A 3EN9A 2CH5A 4PL8A 5AQLA 3A5MC 4ISFA 5BRDA 3VEWA 1Q18A 3A5OC 3CJ1A 4I6MA 4BC3A 4A2BA 4CD3A 3UB5A 5KPZA 1V4TA 1EQYA 4BG9A 4BQZA 3RSEA 2QXLA 3IDHA 5TKYA 5EX5A 4FWLA 2H3GX 4BR9A 3CJBA 3EL2A 3BF3A 2NLXA 2CH6A 4BR2A 4BVOA 4NB4A 4BR0A 2ASOA 5JLHA 1BO5O 2P9NA 3M6GA 1SQKA 3DWLA 3UKRA 3VENA 4CD1A 1E4FT 1T6CA 4FL9A 4BR4A 3GBTA 4XH4A 3ULEB 2W41A 2QWLA 2AA4A 5LJWA 4HTLA 3D2FA 4BVPA 5BRFA 1X9JA 3W0LA 5BPMA 5KQDA 1WOQA 2V7YA 4F9OA 3U9DA 4CBXA 4EIAA 4B1VA 2F9TA 3LDPA 2E1ZA 2QWMA 3LDNA 5FPMA 3L0QA 4XH1A 2QWNA 4CZGA 2E20A 4QS7A 4PKIA 2EWSA 4AM7A 2PAVA 2UYTA 5AQQA 5F2RA 3WQUA 3JS6A 3R8EA 3WXLA 4K42A 3L4IA 3GDQA 2P9KB 2V51B 3C7NB 1NGFA 2YHXA 3QMLA 2P9LB 3G25A 1T44A 1BUPA 4JN4A 4DCHA 4RWTA 2E2OA 3CJAA 3ZETA 1HX1A 4H5WA 1BDGA 5LY3A 5AQYA 4ISEA 4M7XA 4BR5A 1P8ZA 3U8XA 3CERA 3O4WA 2FF6A 4QS9A 3EO3A 3H6EA 2FSNA 1HKGA 1YAGA 3FZKA 1KAYA 4PKGA 4BGAA 1HKCA 4GNIA 2BTFA 1BOTO 4B9QA 3VPZA 4FWMA 4FOEA 4BRPA 5AQUA 3ZX0A 5BRHA 5FPDA 1NGBA 3M3ZA 1ESVA 5AQHA 4BRNA 1GLDG 2D4WA 4RTFD 2Q1NA 4BRMA 4JHDB 3CJCA 3IFRA 1NGJA 3GG4A 4IWVA 1BU6O 3EZWA 4CZHA 1R59O 3CI5A 3KVGA 2J4RA 4O8KA 1QQNA 2I7PA 2Q2RA 4CZLA 3FLCO 2P9PA 3MDQA 3VEXA 2ZWHA 4WQ5C 3M1FA 1WUAA 2OANA 2QW9A 5BPLA 5AQZA 4RCHA 4BC5A 2Q36A 1NGHA 3VEOA 4A2AA 2GWKA 4B1ZA 1K8KA 3SMSA 3WT0A 1HPMA 1NGIA 5JLFA 3BUZB 2FLOA 5AZJA 2VCPA 1TUYA 3QDKA 4JD2A 4CZKA 4EAHD 2E2QA 5AQPA 2E8AA 4KBOA 3O80A 5EOYA 1TUUA 3A5NC 3UKUA 4YDUA 5JICA 1U2VA 5AFUA 1ZBSA 2FSKA 4J8FA 3VGKA 3MN6A 3FZLA 1ATSA 1HLUA 1TYQB 5AQVA 4B1UB 3WEEA 4GY2B 1DKGD 2YCHA 4IO8A 3HBTA 1YUWA 3GOIA 5AFUH 2YHYA 2VYPA 4IJAA 5AQXA 4QS8A 3DXKB 2P9SB 3AARA 4BRCA 1QQOA 3CJ7A 3VERA 2W40A 2CGLA 1Z6RA 2P9UB 4FWPA 2ZGYA 3B8AX 3U9ZA 1XC3A 5AZIA 5E26A 3LL3A 4BRHA 2GWJA 3WQTA 1OKJA 1C0FA 3H3NO 2IVPA 1D4XA 1XUPO 3VGLA 5AQJA 3DXMA 4L3QA 3ATVA 4C23A 1DGKN 3TU5A 3CQXA 2YJFA 4K25A 4BRQA 2FSJA 2P9IA 4WQ5A 4BRLA 3DAWA 3SK3A 1ZC6A 3CHWA 1GLLO 2ZGZA 1IG8A 3D2EB 3VESA 1HKBA 5AQNA 4BQLA 1GLBG 4CBUA 3LDQA 3CJ9A 1GLJO 4IXCA 4JAXA 3EKUA 2QWQA 3VF4A 1JCFA 4MLHA 4CBWA 1KAXA 3GE1A 3R9PA 4B1XB 4CZIA 3ZEUA 4I6MB 1S3XA 3HI0A 3WXKA 4DB3A 3O08A 1HUXA 5B8HA 2NRHA 4YDUC 3RSEB 3VF2A 1QQMA 3EKSA 4H0YB 3BF1A 4BRIA 5CE3A 2HF4A 5AQGA 2D0PA 4Y0WA 4H03B 1QHAA 1GLCG 3CIPA 2IVOA 4M63C 4BRAA 3O8MA 3WUHA 2P9NB 5KQ8A 2E88A 2YHWA 3A8YA 4FO0A 5EVZA 5EY4A 3UKRB 3VETA 1JCEA 4FWRA 4CI6A 1BA0A 4A62A 3H3OB 3W3DA 1HJOA 4H0VB 3H1VX 3D2FB 4FOIA 4BRKA 5FPNA 1MDUB 3MK6A 3CQYA 4WYBA 3A0IX 1YVNA 3S41A 4BC4A 3SJHA 1Y64A 2CGKA 5FPEA 4XH5A 4H5VA 4MO5A 3AAQA 3MN9A 2Q31A 3F9MA 4DHYA 4CJ7A 3QBWA 4FWOA 4B1YB 1Z05A 2E1YA 3ULEA 3VGMA 4EFHA 2FXUA 3O5BA 4BG8A 3KHYA 1V4SA 4H5RA 3UE5A 5AQTA 4H0TB 3I8BA 3ZETB 1LOTB 3H1QA 1MWKA 4CZJA 4FPAA 4CZEA 3VF6A 2D0OA 4NO7A 4WQ4C 2ITMA 3ZX3A 3VEZA 1GLAG 2Q0RA 4Z94A 5KPRA 4ISGA 1NGDA 4DQ8A 1NLVA 1X3NA 4HWIA 5F0XA 4H0OA 2GUPA 4EHTA 3O6WA 3QFUA 1S22A 2ZF5O 3C7NA 1NM1A 2P9LA 1KXPA 2V52B 5AQIA 2I7NA 2BUPA 3WXJA 5AR0A 5AQWA 3MN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GL1A 1RTJA 4DSIA 4KHSA 4N5SA 3DOLA 1JJ2M 3HPHA 4Q5VA 3VEVA 3MCAB 1GLEG 5JS2A 3SV3A 2XY5A 5JMVA 2RF2A 3AY9A 3SAGA 3AO3A 5GINA 2UXDK 4O44A 1A5XA 1KAZA 3OYNA 3WNFA 5K14A 4IJNA 3QICA 4CZFA 3P5JA 4AHSA 3LM2A 4BRFA 4B3SK 3J81O 4FLTA 4X62K 2DFFA 4CJFA 3DLBA 4DFJA 3AO1A 5BN9A 3QINA 3T1HK 4NXNK 3O1BA 3TSPA 5AQFA 3UKUB 1FW6A 1HPZA 5KPTA 1ATRA 3WNEA 4HHTA 1U2VB 2OCEA 3AO4A 1RBVA 1L3VA 3QFPA 1TL1A 2HBJA 1X3MA 2YJEA 4O5BA 5KRSA 3CCEN 3WXMB 1U6ZA 4ID1A 4BE0A 2JWKA 3KLFA 5BPNA 3BEXA 2WUSA 4JI4K 4H0XB 2QWOA 3T1AA 2RHKA 5J1EA 3TPQA 5AQOA 2FBTA 5AQRA 3EZ5A 1T3VA 2Q0UA 4H8KA 4CEOA 3ZSYA 1HQUA 4CF0A 1XMQK 2NRXA 2PBDA 3K5NA 4FXDA 5DM6L 5DK5A 4H5NA 1J5OA 4BC2A 2DPNA 1RDCA 1YITN 3LDLA 3DXKA 3VQ5A 1KLMA 4CK2A 1XMOK 4C8KA 2F4VK 3KWIA 4CJVA 3AVNA 3OYMA 4DLGA 1EWRA 1LWFA 4JKHA 4BROA 1LAWA 3SNNA 4J2EA 2IIRA 4BGBA 3LP2A 4FJMA 3FZFA 1O1WA 2HNZA 4FK2A 1CXQA 4DTNA 3ZEUB 3ZYYX 3MEGA 3HSCA 3D7EO 1BL3A 2QWRA 1TK8A 4B9TA 5GADP 3WXIA 1I3AA 3MMVA 2A6AA 3OBWA 3SQ4A 1ZXOA 1NK7A 2ASMA 2PYLA 3ZT3A 2A5XA 1YJWN 3EN9A 2CH5A 4DV5K 4LF4K 5AQLA 3VEWA 1Q81O 3NHGA 3VQ9A 4I6MA 2HBKA 1XNQK 1ITGA 3VQCA 2KTQA 4OPKA 4B9VA 2QKBA 4M41A 1YVUA 3QEXA 2H3GX 3CJBA 3EL2A 4BVOA 2FBVA 4MDBA 4LFAK 2P9NA 3M6GA 1SQKA 4E19A 3DWLA 3RMAA 4DR4K 3UKRA 3VENA 1VQ9N 1QSYA 4DSEA 3M8QA 4LF8K 4BR4A 2BGGA 3AVGA 1Q8IA 3LZJA 2AA4A 1DT9A 4FJNA 3AVJA 3W0LA 2P5GA 1TAQA 4F9OA 1RDDA 3HP6A 2G8FA 3U9DA 2DTUA 3SI6A 4B1VA 2F9TA 2E1ZA 3LDNA 2PY5A 4M3YA 3SUNA 5KGXA 1S1VA 4IDHA 5C25A 2UYTA 3AVMA 1RTHA 1WN7A 4DU3A 4EZ9A 4PA1A 4LF9K 2IDOA 2RPIA 2HNDA 3GDQA 4IEEA 3F73A 3MWTA 1RBUA 4CJEA 4I7FA 4JKEA 1KQSM 2HBLA 1BDGA 3C6UA 5AQYA 4CGJA 2EX3A 5CY4A 1UA0A 1FJGK 3U8XA 3QLHA 3CFRA 1HKGA 4PY5A 1EO1A 4FJ8A 1BOTO 4B9QA 1CLQA 3R3LA 1VAZA 4Z0UA 2ZQBA 4FOEA 2VQEK 3EEQA 4AQYK 1EKEA 5AQUA 4BRPA 5BRHA 4JK9A 4CJ5A 3KK1A 2KKZA 3HK2A 5AQHA 3DRRA 3NCIA 3RR7A 4FJ7A 3IFRA 3ZT4A 1NGJA 3GG4A 1F21A 3EZWA 1WSGA 4CZHA 3CI5A 3KVGA 3T7ZA 3PIOL 5LMUK 1X9WA 1HJRA 5GAEP 3NE6A 3E9LA 1VRUA 2ZWHA 4YOTA 3HO1A 2NRTA 5CYQA 1WUAA 5BPLA 4M3TA 5AQZA 3SBGA 3QEPA 4BC5A 1EETA 2GWKA 5JLFA 2HHWA 2IC3A 4CHPA 4ZHRA 4JD2A 2XY8A 2YX6A 4OPAA 4CZKA 4KRFA 2G8WA 4F8RA 3P1GA 4KBOA 5M1OA 1L3SA 1NKCA 4DV2K 1VHXA 4YDUA 1CZBA 1ZBUA 4KTQA 2FSKA 1YIJN 4BY9C 4CJSA 3CCJN 5FRMA 3WEEA 1HNVA 2HSTA 4FVMA 2GV9A 1S5JA 2HHHK 3HBTA 1JXBA 3GOIA 2YHYA 1NNEA 4QS8A 3DXKB 5J2MA 2A1RA 3CJ7A 4O4GA 2W40A 2OA8A 3P83D 3KLGA 4FWPA 5KGWA 4W5OA 4IO9L 1WNSA 4FZXC 2R7YA 3O9UA 1W97L 4FW1A 2IVPA 4GV9A 4FYDA 1XUPO 5AQJA 4FM0A 4PQUA 3TAFA 4C23A 4FJLA 4CCHA 3OYFA 2P9IA 2VQFK 4BRLA 2FC0A 4OPJA 4CW7B 1ZC6A 4KTZA 4IOCL 4A5AA 5C15A 3RMBA 3CJ9A 4IXCA 1BCMA 1JCFA 2E6MA 4DQPA 1RT5A 3KLIA 4CEBA 2O4GA 3AVCA 4CZIA 2HHUA 4I6MB 3OW2M 2IAJA 3L2QA 1NJXA 1RT2A 4MDAA 3VF2A 1QQMA 3G71N 5CE3A 3QIPA 5AQGA 1C6VA 2BANA 4JI2K 3HSTB 4BRAA 2P9NB 2E88A 4FO0A 5EVZA 3UKRB 3C65A 1BA0A 4A62A 4E1NA 3W3DA 3OYIA 2YV0X 3NVKA 4E1MA 4KHUA 5FPNA 3VA0A 3MK6A 3CQYA 4OKKA 4WYBA 3TABA 2VWJA 1VQ6N 4RW7A 2Q31A 3H08A 1D9DA 1BI4A 3KLHA 4FWOA 4B1YB 1Z05A 3G4SN 5CZ2A 3ULEA 3CM6A 3VGMA 1J54A 1TGOA 3K9JA 4B8AB 3MX5A 4U7BA 2G8HA 3H1QA 4JI5K 2D0OA 4WQ4C 1WLJA 3VEZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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