2W41A

Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
506
structure length
506
Chain Sequence
b'SEFGSMNVILSIDQSTQSTKVFFYDEELNIVHSNNLNHEQKCLKPGWYEHDPIEIMTNLYNLMNEGIKVLKDKYTSVIIKCIGITNQRETVIIWDRITGKPLYNAIVWLDTRVEELVTEFSAKYNNNDIQKKTGTYFNTYFSAFKILWLIQNNPEIKQKIDDGTAVIGNINTWLIFNLTKGNCYTDVTNASRTLLMDINTLQWDEKMCKIFNITNMSVLPEIKSNCSNFGLVKSEHVPDYLNIPITGCIGDQQSACIGQAIFDEGEAKCTYGTGVFLLINTGEKVVYSTCGLITTICYKFNDNDKPKYALEGSIGTAGSGVSWLLKNKLIDDPSEASDIMEKCENTTGVIFVPAFSGLYAPRWRSDARASIYGMTFNTERSHIVRALLEGIAFQLNEIVDSLTSDMGIEMLHVLRCDGGMTKNKPFMQFNSDIINTKIEVSKYKEVTSLGAAVLAGLEVKIWDSLDSVKSLLRRSDAVFHSKMDDKKRKKKTSEWNKAVERTLIQL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords GLYCEROL KINASE, PUTATIVE
publication title Structure and Non-Essential Function of Glycerol Kinase in Plasmodium Falciparum Blood Stages.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Transferase
total genus 185
structure length 506
sequence length 506
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A01
1OKJA 3L0QA 2P9PA 1NGEA 2P9LA 4BGAA 3O1WA 4BRHA 1JCEA 3HM8A 2A5XA 4BRPA 4CBWA 3C7NA 4CBUA 2YJEA 4BR5A 4K42A 2A6AA 4BRFA 5AQSA 3VEYA 1NGFA 4FO0A 3M1FA 2AA4A 2FSJA 1X3MA 2GTDA 4YDUC 1ZC6A 3QFPA 4XEIA 3IDHA 1ATRA 3ZETB 3BEXA 2BUPA 2FXUA 4BR9A 2YHXA 4FPAA 4ISFA 2D0OA 4CZIA 1CZAN 1KAXA 3P4IA 4MO5A 5BRDA 2E1YA 4H5NA 1BA0A 2Q36A 4FWMA 2W41A 1NM1A 1YVNA 1NWKA 4BC3A 2OANA 4M7XA 2D0PA 4B1WB 4CZLA 3VESA 3VEOA 3VEVA 2VWBA 3GG4A 4K43A 3ID8A 3QBWA 3VF2A 5E26A 1X3NA 4BROA 4JNEA 2P9SA 2HF4A 3W0LA 4RTFD 3ZX0A 4CJ7A 2E2NA 1NGBA 4XH4A 2CH5A 5FPMA 1GLEG 4H5RA 2QXLA 5KQ8A 2P9NB 1NMDA 3WQUA 2YJFA 3LDPA 1U6ZA 4JHDB 3VPZA 5JLHA 5F1XA 2AP1A 5AQUA 3CIPA 3U9DA 3VGKA 4A61A 4C23A 4K41A 3MK6A 4H5VA 1RGIA 3FR0A 3GOIA 5EX5A 1TUYA 1XC3A 4GNIA 4FOIA 3UKUB 5AQWA 2ZGZA 1TYQB 2QWPA 3SK3A 1Y64A 1C0FA 3H6EA 1H1VA 2E2QA 1QZ6A 1BDGA 4FWRA 2Q31A 3H46O 4IXCA 4BR4A 2E20A 3DXMB 3UKRB 3D7EO 3F9MA 1BG3A 3CERA 1T6CA 3WXLA 3FE1A 3ENOA 5AQMA 5AZJA 1T44A 1YUWA 4BC4A 2YHWA 4CZEA 3BF1A 4FWSA 4BGBA 1BA1A 3D2EB 2P9LB 4L3QA 4Z94A 5LJWA 4RCHA 3ZX2A 2GWKA 4HTLA 2A41A 3CJCA 3FZKA 3TU5A 1EQYA 3CI5A 3GBTA 3SLCA 4BRQA 3QDKA 2KHOA 1U2VA 2P9IA 5AQFA 4EHUA 1S22A 3DWLA 4I6MA 4FWLA 3MCPA 5AR0A 4CZFA 1X9JA 3QMLA 2D1KA 3LDNA 4MO4A 3B8AX 1IG8A 1GLLO 3ULEB 2FLOA 3SJHA 1GLFO 5AQVA 2YHYA 3QBXA 4JN4A 4A2AA 4O8KA 3VGMA 1GLCG 3DXKA 3LM2A 3QB0A 1GLBG 4BRKA 4EFHA 3L6QA 4IWVA 4WQ4C 2A3ZA 5JICA 4FL9A 4M63C 2HMPA 3VETA 3A5MC 1Q18A 3W3DA 3TPQA 3EO3A 3MN9A 3CJBA 4AM7A 4EHTA 4BRDA 3HZ6A 1QQNA 3O6WA 1HKGA 2CGLA 4H0PA 4NO7A 5AQQA 4CD3A 4PL7A 1KAZA 4B1XB 4O5FA 1BWFO 3AAQA 5B8HA 2F9TA 3CJ7A 3A0IX 4FSVA 2WUSA 1HLUA 1WOQA 1NLVA 1XQSC 2QWLA 4CI6A 4CZHA 4AM6A 5BREA 1NBWA 5F0XA 5AQZA 3AARA 5EXWA 2ZGYA 5CE3A 3AAPA 2Q0UA 3BP8A 4E1JA 4FWKA 5FPEA 2E1ZA 1HKBA 5AQIA 1RFQA 3O80A 3VENA 5JLFA 2UYTA 1ATSA 2HOEA 4CZKA 2IVNA 3VEZA 4BRAA 1J6ZA 1HUXA 4FWOA 2QWMA 3FZMA 3HTVA 4DCHA 3A8YA 3ZX3A 4H0OA 3AY9A 5F2RA 3O5BA 4WYBA 3O1BA 3VGLA 3WXIA 4WQ5C 1JCFA 3CQXA 3FZLA 5AQOA 5I9EB 3DAWA 4K25A 3MN7A 2QWOA 1HJOA 5AZIB 2ASMA 3BF3A 4EAHD 3ENHA 4CZMA 4JD2B 3EKUA 3WEEA 5AQRA 1NGGA 5LJVA 1MDUB 1QQMA 5AZJB 1NGJA 4FPBA 2BTFA 4BC2A 4A62A 1ZXOA 1K8KA 3ZEUB 3S41A 4B1ZA 1ATNA 2FSNA 2VCPA 5AQGA 2A40A 3UE5A 1LCUA 3FLCO 2ITMA 3O8MA 4B1UB 2V52B 3R9PA 3D2FA 4H0XB 4J8FA 3RSEB 5ADXH 2NLXA 3VOVA 2E88A 2HF3A 2FF6A 5AQTA 3VEXA 5ADXA 4CZJA 4BR0A 5BRFA 3KVGA 2F9WA 2D4WA 4H5TA 3JXUA 2P9UB 4FWPA 5JMVA 1HPMA 1MWKA 2QWNA 2NRHA 4EIAA 3U8XA 1XUPO 2P9PB 5BN9A 2QW9A 3WXJA 4H0VB 4RWTA 4IJNA 3C7NB 5FPDA 1IJJA 5FPNA 3LM9A 4H0YB 3WQTA 3M3ZA 3WUHA 1E4FT 3R8EA 2I7NA 4H0TB 5BR9A 4B1VA 1T6DA 4Y0WA 1P8ZA 2V7ZA 4LC9B 3UKUA 1GLAG 1TYQA 3ATUA 4A2BA 3IMXA 2VYPA 4QS8A 3UB5A 2I7PA 2E2PA 1NGCA 3U4LA 1NGIA 4KBOA 3H1VX 3I33A 3IFRA 3DXMA 4QS7A 4BG8A 5BN8A 2Q2RA 3FZFA 1GLDG 1RDWX 3CJ1A 5AFUH 3A5OC 5AQKA 1BUPA 5AFUA 2A42A 4PKIA 2CGJA 4ISEA 3EKSA 1NGHA 3CETA 3D2EA 1MA9B 4BRCA 3FZHA 2FSKA 4PKHA 5EOYA 4DHYA 2ZF5O 2P9SB 1QZ5A 3QFUA 5BRHA 4IJAA 3OHRA 4GY2B 1YAGA 3MN5A 3H3NO 2QWRA 2ASOA 4BRIA 1LOTB 2GWJA 1NGAA 2GEMA 3O4WA 2CGKA 3BUZB 3DJCA 4BR7A 4IO8A 3SMPA 4F9OA 2YI1A 5ELZA 1BO5O 2DPNA 2Q0RA 4B1YB 1S3XA 4BC5A 4M7YA 4BREA 1ESVA 2IVOA 1DGKN 4FWNA 1DEJA 2P9KA 3ULEA 4DB3A 2GELA 3CHWA 2Q97A 1KXPA 1ZBSA 1C0GA 3H45C 4BRMA 3WEEB 1Z6RA 3LDQA 2QM1A 3A5NC 3LDLA 4XH1A 1K8KB 3IUCA 5BPLA 2J4RA 4H03B 2IIRA 1WUAA 2E2OA 4IZ9A 1V4SA 1QHAA 1G99A 2ZWHA 3D2FB 1DKGD 2GUPA 3LDOA 3ZETA 4BVPA 3KHYA 2PBDA 3CJAA 2NZTA 4FWQA 2E8AA 1HKCA 1KAYA 1V4TA 4JAXA 4PKGA 4BRNA 3J8AA 4BVOA 1MWMA 5AQJA 4FOEA 5BPMA 3CJ9A 5KPZA 4XH5A 1HX1A 4B9QA 3EZWA 5EVZA 5TKYA 3GL1A 4BRGA 3GE1A 2QWQA 2CH6A 3VEWA 5AQNA 4CBXA 4BR2A 1YXQA 4H5WA 3H1QA 4MLHA 3H3OB 3JS6A 3G25A 4WQ4A 1R59O 3I8BA 2H3GX 2V7YA 1U2VB 2P9IB 3A5LC 3O08A 3VF6A 3SMSA 4BQZA 4YDUA 3M6GA 3VERA 1SQKA 4BRLA 3R6MA 4I6MB 2YCHA 1BU6O 3KZBA 3EL2A 4CZGA 3C0BA 4CD1A 2P9NA 2EWSA 3L4IA 1SZ2A 4JHDA 3MMVA 3HI0A 3DXKB 1Z05A 1NGDA 3GDQA 1E4GT 5KPRA 1TUUA 4PL8A 4NB4A 3HBTA 5AZIA 5BPNA 1BOTO 4JD2A 1GLJO 5AQYA 2PAVA 3HSCA 2ASPA 5EY4A 5E84A 1SAZA 4BG9A 3MN6A 3ZEUA 4HWIA 3MDQA 2IVPA 5AQLA 3U9ZA 4DQ8A 3VF4A 3ATVA 4MLEA 3FFKB 5AQPA 2FF3B 2W40A 3FGUA 3RSEA 3WXKA 4QS9A 3QICA 2Q1NA 3UKRA 3WT0A 4BQLA 5LY3A 1QQOA 3EN9A 3CQYA 5KQDA 5AQHA 4WQ5A 4ISGA 3LL3A 1D4XA 2P9UA 5AQXA 2V51B 1JCGA 2P9KB 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJJA 1UAXA 4OKEA 2P9PA 1N34K 3L2QA 4BGAA 3O1WA 1JCEA 3V6DA 2OCEA 4KHYA 3K9KA 4JI1K 4TSXA 4K42A 3VTHA 1TKDA 1LWEA 5AQSA 1NGFA 3E9OA 5J2NA 2FSJA 1O13A 4O0JA 1NK6A 1ZC6A 1XC9A 4JK8A 3IDHA 1JLFA 3MX5A 1ATRA 3ZETB 3BEXA 2BUPA 2FXUA 3DRSA 2YHXA 4JRQA 4DTRA 1KAXA 2E1YA 3HM9A 1J9AA 1NKCA 3DLEA 5KI6A 4CIGA 1NJIO 2W41A 1WSGA 2VWKA 2E6MA 3C6HA 2D0PA 4F8RA 1G15A 3VESA 3VEVA 2VWBA 3JYTA 2XY7A 3NMUA 1I39A 3L3VA 1YJ9N 3OBWA 1SKWA 1TL3A 3ID8A 3K9JA 1X3NA 4DF8A 3L8BA 4YY3K 4BROA 4EP5A 1WBDA 2KLAA 1WB9A 4FXDA 2YNIA 2E2NA 2YNHA 4XH4A 3VQ7A 1GLEG 4H5RA 3VQDA 4HUFA 1JL2A 1REVA 4JRPA 1C6VA 4CESA 1YJWN 5F1XA 2OPQA 5AQUA 3T1AA 4AILC 5KRSA 4K41A 3KLFA 4DSJA 3GOIA 3LZJA 1XC3A 4GNIA 4HCBA 4FOIA 5KRTA 1Q82O 5AQWA 4YOUA 5DMRA 1VSDA 4E19A 1J5OA 2YV0X 2YKNA 3CCSN 1C0FA 5JVGL 3OJUA 5HRRA 3DLHA 3F73A 4IEIA 4YOYA 2Z1IA 3CC2N 2HBMA 4AHRA 1IKWA 1YTAA 2NRWA 4CFDA 3F9MA 5LMUK 3ZCMA 1RTJA 3WNEA 3I8DA 3FE1A 2HHWA 2RN2A 4OKKA 4CZEA 1DT9A 1BA1A 4C1NK 4CF9A 3P38A 1K6YA 4Z94A 4LY7A 3VQCA 4BE2A 4U67L 4E0DA 3CJCA 3TU5A 3Q7BA 1JXEA 2YX6A 1WBBA 3SLCA 3KKSA 3QDKA 2P9IA 1S22A 4G9ZA 1NK8A 4MDBA 3CCRN 3B8AX 1IG8A 1GLLO 3ULEB 2FLOA 3KWGA 3VN5A 2KZMA 3BDPA 4JKHA 4JN4A 3LALA 1RT6A 1GLBG 4BRKA 2NRXA 4IWVA 3V1OA 4FL9A 1N8RO 4OX9K 1U48A 3A5MC 3W3DA 5CHIA 4JI0K 1KTQA 4EHTA 1YHQN 3O6WA 1HKGA 5AQQA 4NCAA 4LF6K 4CD3A 4DV3K 4NXMK 4N76A 3G10A 4ZTJA 4O5FA 1BWFO 4CJ4A 1Q9YA 4DTXA 2F9TA 3OYIA 4FZZA 5C0YA 1RTIA 2WUSA 4LF9K 4DG1A 3V9XA 1NBWA 4KB0A 5GAHP 2ZGYA 5CE3A 3C94A 4CJSA 2VQEK 4E1JA 5FPEA 3AVGA 3KK1A 2HBJA 5AQIA 2YNGA 4CJRA 2UYTA 1ATSA 1TAQA 1XNQK 1I3AA 3HPOA 3OS2A 4CK1A 4BRAA 2VG6A 3SAHA 5HRSA 3L4QA 4W5OA 4GVMA 1RT2A 3CPWM 4NCBA 3AY9A 5MLCQ 3B6PA 3NF6A 1JCFA 3FZLA 3AVAA 4N5SA 2QWOA 4FK0A 4JKBA 4CEZA 2ASMA 3BF3A 2ETJA 3J81O 1RBTA 5M1OA 3NF8A 2X6NA 3LPTA 3EKUA 3VA3A 3AGRA 1QQMA 5AZJB 4GV6A 1QTMA 1SKSA 1OVYA 4JKDA 1K8KA 4B1ZA 4OGCA 1ATNA 1WAFA 2OZMA 1LCUA 3KD1E 4DV6K 4GV9A 3R9PA 3D2FA 4H0XB 3CCJN 4H4OA 4B9UA 3OYKA 2E88A 1SUQA 3QEIA 2FF6A 3MAQA 3V4IA 4CJ3A 5BRFA 2UXDK 1ZYQA 3DLGA 1QHTA 4FWPA 3SUOA 3NAEA 1MWKA 3QLHA 2UU9K 1VQ4N 4I9QA 4KTQA 4FLXA 4RWTA 2QA4N 4DV2K 3LM9A 4H0YB 3NDKA 3CM6A 3O3FA 1EX4A 1P8ZA 2ZJRL 4FZYA 1TYQA 4A2BA 3IMXA 4OKJA 3FFIA 1WNSA 3TAQA 3JAMO 3K58A 2G8HA 1J53A 3PO4A 3LANA 1EO1A 1UOCA 3MEEA 2E2PA 3U4LA 1NGIA 1S72N 3IFRA 3BZCA 3DXMA 1RBRA 4QS7A 2ZJPL 2HHXA 3FZFA 4EZ9A 3I0SA 4LF8K 4A5AA 3I0RA 1ASWA 3CJ1A 3A5OC 2F96A 5FRMA 3WNHA 1WSIA 4BE0A 1TV6A 4GKJK 3PX0A 3CETA 1NOYA 4BRCA 3FZHA 4DV1K 3NVKA 3OHRA 1YAGA 1XWLA 4BRIA 4JI5K 2GWJA 2CGKA 3OY9A 4B9TA 4BR7A 3SMPA 5ELZA 5DM7L 1BO5O 4FLZA 1A5VA 4B1YB 1S3XA 4BREA 3L3UA 1C0MA 3ITHA 4DQQA 4YHHK 3KLGA 1KXPA 1SV5A 3H45C 3NBPA 3EEQA 3WEEB 5GADP 4JI3K 3A5NC 4CIFA 4XH1A 4DR2K 2KTQA 3TAGA 1FK9A 3IUCA 4M41A 1YJNN 3O4QA 2IIRA 4E1MA 2ZJQL 1U45A 3LDOA 3C65A 2IDOA 4YNQA 3KHYA 1T05A 2NZTA 1BHLA 1KAYA 4BVOA 1Q9XA 3PY8A 3RTVA 3EZWA 3DRPA 1ZBLA 2KFZA 3GE1A 4X64K 5BR8K 4FJGA 2CH6A 1JKHA 4E1NA 1RDDA 3SPZA 3DYAA 1R59O 1UA0A 3SMSA 2AJQA 4YDUA 3VERA 4E89A 1W2BM 1N33K 4BRLA 3R6MA 1EWRA 1BU6O 4ELVA 3CD6N 4QAGA 1E3MA 1QSSA 4DR6K 3C95A 2P9NA 3ZSWA 1OH7A 4YORA 4JHDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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