1GLDG

Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
total genus 160
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1994-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG01
5AQSA 3HI0A 2P9SA 2E88A 2V52B 4O5FA 1GLLO 3VGMA 3ZEUA 3UB5A 2Q97A 2NZTA 3I33A 1IJJA 1KAYA 4WYBA 2IIRA 3LDNA 3MK6A 4GNIA 3TPQA 1ESVA 2GWKA 1KXPA 3SLCA 1BOTO 4B1ZA 1NMDA 1GLBG 4A2AA 3H46O 3VOVA 2ASPA 1XUPO 4WQ5A 2YHXA 2I7PA 2Q1NA 3BF1A 4CBUA 3VESA 3QDKA 1QHAA 1TYQA 4EIAA 2A5XA 1BG3A 4M63C 3ULEA 3I8BA 4O8KA 3OHRA 3LDLA 1GLAG 1ZC6A 3DJCA 3C7NA 4CZKA 4XH1A 1HX1A 4IJNA 4E1JA 2GELA 3VGKA 1GLJO 2IVOA 4KBOA 5AZIB 4RWTA 4XH4A 2NLXA 5AZJB 4BRHA 5BN9A 4PL7A 5AZJA 4CZFA 5BN8A 3BP8A 1QZ5A 1DKGD 2PBDA 4QS9A 3VF6A 1SZ2A 4FWOA 5KQDA 4CZHA 2QWRA 4H5VA 3HSCA 4MO4A 1NGEA 3FZMA 4YDUA 3GE1A 2CGLA 1C0GA 2DPNA 3O1BA 4M7XA 2GWJA 2W40A 2GEMA 4B1UB 2P9KB 3ATUA 3VGLA 5BRFA 4CD1A 2CH5A 1QQMA 1RFQA 4FL9A 4BROA 4BRIA 4CZGA 3O80A 4BQZA 1SAZA 3QFUA 2D1KA 3ZETB 1V4TA 2FF3B 3FLCO 3LM9A 5CE3A 4BRGA 2F9WA 3AY9A 4BRFA 2BTFA 4B1WB 3WQUA 4XEIA 3CIPA 1NGGA 1HLUA 4FO0A 4PL8A 3WXIA 4CZLA 2VCPA 3FE1A 2ASOA 3U4LA 3WXJA 4A62A 4BVPA 3EKSA 3WUHA 3GOIA 3A5LC 4HWIA 1SQKA 2FSJA 2ITMA 3RSEB 1RDWX 2P9NB 5AQNA 4H5TA 3TU5A 1R59O 5LJWA 3RSEA 3FZHA 3UE5A 2P9NA 4JN4A 3A8YA 2ZGYA 2ZWHA 4B1YB 5AQFA 4YDUC 5AQHA 3AAPA 3VEOA 4CI6A 5LJVA 1MWKA 3VETA 5EXWA 1YVNA 3J8AA 3C0BA 3U9ZA 3H3OB 4BVOA 5AQWA 1K8KB 5KPTA 4H5WA 2Q0RA 1YUWA 1GLFO 1S3XA 2P9LA 2WUSA 1K8KA 4MLHA 3FGUA 3G25A 1NGBA 3MN7A 2E1ZA 1HJOA 3CETA 3CHWA 3BUZB 3WEEA 5LY3A 2P9SB 2BUPA 3QICA 3S41A 2Q36A 1LOTB 2YJEA 4K41A 1GLCG 1NWKA 3VEYA 3HM8A 4BC5A 5I9EB 2A6AA 3L4IA 2PAVA 2YCHA 3EO3A 1C0FA 4IJAA 3A5OC 3D2FA 1Q18A 2FSNA 2AA4A 5TKYA 2D0OA 3HTVA 3UKUB 1XC3A 2QXLA 3UKUA 5BPNA 4BG8A 4BR0A 1T44A 4JNEA 4DB3A 4F9OA 1NGHA 2P9IA 4BRNA 1TYQB 3ENOA 2D0PA 3ULEB 1YAGA 5AR0A 1BDGA 3R9PA 4CJ7A 3C7NB 2QWPA 2VWBA 3ZX0A 1MA9B 3IMXA 1H1VA 3L0QA 2FF6A 5AQGA 4AM6A 2FXUA 4FWKA 4ISFA 5BR9A 2GTDA 1S22A 4JHDB 1JCFA 3H1QA 1Z05A 1D4XA 3WXKA 3QBXA 4H5NA 4JHDA 1TUYA 3FZFA 3CI5A 3BEXA 4J8FA 2A3ZA 4BRKA 3D7EO 5ELZA 2V7YA 1BUPA 3VF4A 3H3NO 1J6ZA 3VEVA 2A42A 4BRDA 1BU6O 3CJ9A 4WQ4A 5E84A 5JLHA 5AQMA 3H45C 1GLEG 3GDQA 1CZAN 1X9JA 4WQ5C 5EVZA 1NGFA 3IDHA 3EZWA 4EAHD 4BRQA 4B1XB 4ISGA 1ATRA 3AARA 1T6CA 3ATVA 2QWLA 2IVNA 2E20A 2A40A 2P9UA 3O5BA 4FPAA 4BG9A 2VYPA 3CQYA 4K42A 2V51B 4RCHA 4BC2A 4BQLA 5FPEA 1HKGA 1X3NA 4H0XB 2Q2RA 1RGIA 3KVGA 5ADXH 5AQVA 5EY4A 2QW9A 5AQXA 3O8MA 2UYTA 2KHOA 5AQOA 3DAWA 1X3MA 4FWLA 4FPBA 4Z94A 4FWPA 4NO7A 2Q0UA 3A5NC 1NLVA 5JICA 4H0YB 3U9DA 3FZKA 5AQUA 3SMPA 1ZBSA 3SJHA 5KQ8A 5F0XA 3O08A 4CZEA 5BRHA 2IVPA 4BC3A 5KPZA 1WOQA 4I6MA 3QB0A 4BC4A 3GL1A 4JAXA 1T6DA 1OKJA 3WT0A 1JCGA 3U8XA 4CZMA 4EFHA 3CJBA 4XH5A 2P9LB 3L6QA 4L3QA 2ZGZA 4H0TB 3O6WA 3AAQA 3F9MA 1QQNA 3WEEB 4FWMA 3MDQA 2EWSA 3R6MA 5AQIA 2H3GX 5BPMA 5JLFA 1EQYA 2P9PB 3CJCA 3QFPA 3JS6A 1MDUB 4H0OA 2P9PA 2YJFA 3DXKB 1NM1A 3DXKA 3O4WA 4FWNA 1QZ6A 2YI1A 3QMLA 4BR7A 2E1YA 1NGIA 2I7NA 4JD2A 4PKIA 2YHYA 1ATNA 3JXUA 3H6EA 3D2FB 3KHYA 1ATSA 4LC9B 4IXCA 3P4IA 3WXLA 2CH6A 1KAZA 3EKUA 4CZIA 5FPDA 3CQXA 4RTFD 4PKGA 1JCEA 4DHYA 2F9TA 2P9IB 4QS7A 5BREA 1WUAA 2HOEA 3A0IX 4FWRA 5AQKA 5AQLA 4CBXA 5EX5A 4BREA 1BA1A 3W3DA 2A41A 4BRAA 1Y64A 1E4FT 1MWMA 4QS8A 4Y0WA 3VENA 2E2OA 4A61A 4H03B 2Q31A 2HF4A 4B9QA 4A2BA 1ZXOA 3MCPA 4H0VB 4K43A 3VF2A 2QWNA 3B8AX 2QM1A 5EOYA 2AP1A 3LDOA 3HZ6A 1NGAA 1HUXA 2NRHA 3VERA 1BO5O 3ID8A 3CJAA 3ENHA 3ZX2A 2FLOA 1YXQA 1IG8A 1GLDG 3MN9A 3M1FA 4IZ9A 4BR4A 4DQ8A 1TUUA 3MN5A 2E8AA 5BPLA 1U6ZA 3D2EB 4FOEA 4CD3A 4CBWA 3D2EA 3DWLA 4EHUA 4BR2A 5AZIA 4BRLA 1G99A 1HPMA 1Z6RA 4MLEA 5F2RA 2E2QA 3SK3A 4BGBA 1U2VB 3CJ1A 3O1WA 1V4SA 5AQYA 1DEJA 3VEZA 3VPZA 2ZF5O 2P9UB 1U2VA 4H5RA 4H0PA 1DGKN 3UKRB 4NB4A 4M7YA 4HTLA 4BRCA 1LCUA 1KAXA 3UKRA 4FWSA 3ZX3A 3IUCA 3W0LA 1BA0A 3EL2A 4GY2B 5ADXA 2V7ZA 5FPMA 3QBWA 3LM2A 2P9KA 5AQZA 3M6GA 2FSKA 4MO5A 3LL3A 2CGKA 4BGAA 3MN6A 2OANA 3GG4A 4FWQA 2QWOA 5E26A 5AQTA 4FOIA 5BRDA 3IFRA 3LDQA 3ZETA 4BR5A 1BWFO 5AQPA 5AFUA 1HKBA 5AFUH 3FR0A 5F1XA 1NGJA 4I6MB 5AQJA 3KZBA 3H1VX 2HF3A 4WQ4C 3FFKB 2E2NA 5AQRA 3CERA 4C23A 2E2PA 1NBWA 3A5MC 1HKCA 3GBTA 5AQQA 3CJ7A 2D4WA 3SMSA 2QWQA 1E4GT 2QWMA 3EN9A 4FSVA 3DXMB 3FZLA 2ASMA 1P8ZA 3BF3A 3LDPA 4IO8A 2YHWA 4ISEA 4IWVA 4BRMA 3DXMA 4K25A 1QQOA 1XQSC 2W41A 3R8EA 5FPNA 4JD2B 4DCHA 2HMPA 4CZJA 5B8HA 4PKHA 4B1VA 3M3ZA 1NGCA 4BRPA 4AM7A 5KPRA 3HBTA 1NGDA 2CGJA 4BR9A 3WQTA 2J4RA 3VEXA 4EHTA 2GUPA 3MMVA 3ZEUB 3VEWA 5JMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X6NA 4DTOA 2V52B 3ZEUA 3THXA 1NKBA 1HYSA 4WFBL 4YY3K 3H08A 4E1MA 4DLEA 1DTQA 3OBWA 4GV3A 1C1CA 1VAZA 3SLCA 5C10A 4B1ZA 5LL6Z 3VOVA 2ASPA 1XUPO 4WQ5A 3VQDA 2I7PA 2OTLN 3P83D 4CBUA 3VESA 1RCHA 3SBGA 3AVFA 4DU3A 3MWPA 3QO9A 1TYQA 4CEZA 4LF6K 2A5XA 2G8WA 5C24A 3I8BA 3PX6A 3LDLA 4DG1A 3KD5E 3C7NA 1TAUA 4IJNA 4E1JA 3VGKA 5AZIB 4JRQA 5JS1A 1YF5L 1S9EA 2PY5A 2NLXA 3O4QA 3HYFA 1ILYA 4CZFA 5C12A 3BP8A 4OKJA 1LWFA 1QZ5A 4CHQA 1SZ2A 2HHUA 2QWRA 1UA1A 4H5VA 3HSCA 1U4BA 3VA3A 4YDUA 3SZ2A 2UUBK 2NRVA 4JI4K 5KRTA 4ZTFA 4WFAL 2WTUA 4E89A 3PO5A 4DSIA 1QSLA 4FJNA 4QCLA 3VGLA 3CC2N 4BROA 4CZGA 4DKWA 3O80A 2HNZA 2Z1HA 4OPJA 3O9SA 2FF3B 3WNGA 4YORA 4YOUA 4KHSA 4PL8A 4WCEL 3ZT3A 1YVUA 4H8KA 4A62A 3WUHA 4BDYA 4M3YA 3BDPA 5AQNA 3QEXA 5LJWA 3HVRA 2ZGYA 4KB0A 4CJTA 3WNEA 1YJWN 4B9LA 1R0AA 2VG5A 1QTMA 2OPRA 4FJKA 3SJJA 1FK9A 2Z1IA 4CE9A 4KHWA 1BL3A 3C0BA 2KQ2A 3H3OB 1VQON 2PYJA 3L4QA 3V1QA 2Q0RA 3I56N 5DMRA 2P9LA 4FZZA 1FXXA 3G25A 1NGBA 1T05A 3VQ6A 3AA2A 1W97L 4LH4A 5GADP 2Q3SA 3TSPA 1BIZA 3SBTA 4DSKA 2P9SB 2BUPA 3QEIA 4CHOA 3TAMA 4HUGA 3QICA 3N4PA 3SUQA 2Q36A 1HR0K 3AVMA 4Z4EA 4CERA 2G8UA 4EZ9A 4BC5A 4DMNA 3MXJA 2D0AA 3DLRA 3A5OC 4BE0A 4IEIA 1Q18A 4B9TA 4NLCA 3MECA 4N5SA 2O8FA 2QXLA 3PO4A 1RBUA 2HHQA 3PSIA 1T44A 1QE1A 5CZ2A 1XMOK 1NGHA 1VRTA 3OYFA 1KVAA 5FLXO 3ULEB 1YAGA 4CF1A 4CHYA 4DV3K 3V1OA 3P38A 3OJUA 4NYFA 4FWKA 5GAGP 3R1XA 3NVKA 1D4XA 3QBXA 3HT3A 3FZFA 3BEXA 3AVHA 3D0PA 5C2FA 4WFNL 3VF4A 4JKEA 5I3UA 3NAEA 3L3VA 4C8MA 2ZJRL 1OVQA 1M90O 4R5PA 1L5UA 1WSJA 5JLHA 3RRGA 4N56A 1IKYA 4X64K 1HNXK 4B9MA 1A5VA 1NU0A 3AVKA 4FLVA 1NJZA 1X9JA 1YT3A 1NGFA 3KLIA 4DTMA 4DR6K 1DT9A 4DFKA 3DRSA 4JKDA 3CQYA 3NGIA 4RCHA 2OCEA 3T1YK 1X3NA 4FJ8A 1RBTA 4WF9L 1RGIA 3ULDA 1S1UA 1S1WA 4F4KA 3ITHA 2QW9A 3ZYYX 4W5RA 2UYTA 5HRSA 3L2UA 3NF8A 4OO1J 4NYNA 5AQOA 1X3MA 4CJUA 1VSKA 3HP6A 1J9AA 4IOAL 1WSIA 3ID6A 3CFPA 2QK9A 1NLVA 4CVNE 5JICA 3U9DA 3HPOA 5AQUA 3VA0A 1ZBSA 5KQ8A 4CZEA 3E01A 4JAXA 1T6DA 1OH6A 2XY8A 4CZMA 1TL1A 1XNRK 3L6QA 4L3QA 4O4GA 3SQ1A 3AAQA 1VQNN 3E9OA 2EHGA 4FK2A 4M3WA 1QQNA 4DTXA 1WBDA 2RE2A 2YV0X 2YNHA 5AQIA 5BPMA 1EQYA 1XHZA 4CCHA 2P9PB 2PZSA 3LP1A 2P9PA 4KH6A 1VHXA 1Q86O 4YOVA 2YJFA 3DXKB 1U48A 1JLFA 1VSIA 1WSFA 3DXKA 1QZ6A 1Z25A 4FW1A 3LANA 3UIQA 1YI2N 1HRHA 4FVMA 4JI1K 1ATNA 1I3AA 1VQKN 3D2FB 4B3SK 4AILC 1KFDA 4IXCA 2OYQA 4O0JA 1YIJN 4FJXA 3WXLA 4CZIA 2CH6A 1KAZA 3OYIA 4CJKA 4RTFD 4PKGA 4Q0BA 2HB5A 2F9TA 2P9IB 3AGKA 5M1PA 2YNGA 1JLBA 3NVMA 5EX5A 1BA1A 4BRAA 1TK5A 3T1HK 4CF9A 1S6QA 4O55A 1VQ8N 4FVUA 3CFRA 2HF4A 3ZSYA 3HPGA 4UQGA 2XO7A 4KHPK 4YOYA 1EWQA 3VQ8A 3V9WA 4DV0K 3CCQN 1RDDA 2YNFA 3EZ5A 3V9SA 1CXUA 2QWNA 2RPIA 4JYAK 3LDOA 5LMUK 1VSJA 1YXQA 3LZJA 3OYCA 4CFAA 1JJ2M 4FM0A 2E8AA 5BPLA 1U6ZA 5H1SQ 4FOEA 4ID5A 3SQ2A 3T7ZA 4CBWA 4CJ3A 2HBKA 3OBYA 5HBMA 4EHUA 4OPKA 1N32K 5C0YA 1B92A 4BRLA 4MQ3A 1I39A 1G99A 1HPMA 5CR4A 2NUBA 1FJGK 3HP9A 1U2VB 3F73A 1V4SA 3VEZA 3VPZA 2ZF5O 3HRGA 1EXQA 2P9UB 1U2VA 1BCMA 4H0PA 3UKRB 1QSSA 1TL3A 3MCAB 5I42A 4AH9A 1KAXA 3UKRA 5MLCQ 3AVIA 5GINA 4M3UA 3W0LA 4DR7K 4FYDA 5FPMA 2EX3A 4E7JA 3LM2A 4JK9A 1YHQN 2R7YA 3M6GA 2XY7A 3LL3A 1UA0A 4FM2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5AQS A;  3HI0 A;  2P9S A;  2E88 A;  2V52 B;  4O5F A;  1GLL O;  3VGM A;  3ZEU A;  3UB5 A;  2Q97 A;  2NZT A;  3I33 A;  1IJJ A;  1KAY A;  4WYB A;  2IIR A;  3LDN A;  3MK6 A;  4GNI A;  3TPQ A;  1ESV A;  2GWK A;  1KXP A;  3SLC A;  1BOT O;  4B1Z A;  1NMD A;  1GLB G;  4A2A A;  3H46 O;  3VOV A;  2ASP A;  1XUP O;  4WQ5 A;  2YHX A;  2I7P A;  2Q1N A;  3BF1 A;  4CBU A;  3VES A;  3QDK A;  1QHA A;  1TYQ A;  4EIA A;  2A5X A;  1BG3 A;  4M63 C;  3ULE A;  3I8B A;  4O8K A;  3OHR A;  3LDL A;  1GLA G;  1ZC6 A;  3DJC A;  3C7N A;  4CZK A;  4XH1 A;  1HX1 A;  4IJN A;  4E1J A;  2GEL A;  3VGK A;  1GLJ O;  2IVO A;  4KBO A;  5AZI B;  4RWT A;  4XH4 A;  2NLX A;  5AZJ B;  4BRH A;  5BN9 A;  4PL7 A;  5AZJ A;  4CZF A;  5BN8 A;  3BP8 A;  1QZ5 A;  1DKG D;  2PBD A;  4QS9 A;  3VF6 A;  1SZ2 A;  4FWO A;  5KQD A;  4CZH A;  2QWR A;  4H5V A;  3HSC A;  4MO4 A;  1NGE A;  3FZM A;  4YDU A;  3GE1 A;  2CGL A;  1C0G A;  2DPN A;  3O1B A;  4M7X A;  2GWJ A;  2W40 A;  2GEM A;  4B1U B;  2P9K B;  3ATU A;  3VGL A;  5BRF A;  4CD1 A;  2CH5 A;  1QQM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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