1GLDG

Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 160
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1994-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG01
2E88A 2VWBA 1BUPA 3HSCA 3MN5A 3FZHA 4JHDB 3G25A 5BPMA 3L0QA 5AQGA 1Y64A 4Z94A 3WXKA 1GLJO 3BUZB 3IUCA 1Z6RA 1ATRA 4O5FA 3UE5A 1U2VB 1V4TA 1TYQB 2CGLA 4WQ4A 5KQDA 4MLEA 4CZFA 2ZGZA 4FWQA 3VGLA 5LY3A 2CH6A 2V51B 5LJWA 4DQ8A 4FWRA 4CZJA 1BDGA 4IJNA 3UKUB 5AZIA 2NRHA 1GLAG 1YXQA 3VENA 4CZHA 4KBOA 4BR0A 4H0XB 4BC2A 4GY2B 5AQSA 2IIRA 4IJAA 5AFUA 3WXJA 1RFQA 3KHYA 5EVZA 1EQYA 4J8FA 1JCGA 3UB5A 4CJ7A 5JICA 5KQ8A 1MWMA 3H1QA 5EOYA 2P9PA 3O5BA 3IFRA 2V52B 1NGAA 2A3ZA 1ESVA 3H45C 2A5XA 4BRAA 3QBWA 4JN4A 1ZXOA 1BG3A 2CGJA 2VCPA 3CJCA 1G99A 1KXPA 2Q0UA 3BF1A 5F2RA 2E8AA 3UKRA 4EFHA 3ID8A 3O8MA 4BREA 4DCHA 5AQOA 2ZF5O 5AQTA 4BG8A 3RSEA 3OHRA 2UYTA 3WEEB 3ENOA 1J6ZA 4M7XA 3VOVA 1NLVA 3ZX3A 3IDHA 3J8AA 1KAXA 3FZFA 3MN6A 3VEZA 3ZEUA 2FSKA 1HUXA 5KPRA 5AZJA 2Q0RA 2FLOA 4H0TB 4L3QA 5ELZA 2P9NA 3LDOA 2KHOA 3MCPA 3WXIA 4O8KA 4K42A 2QWQA 3U9ZA 4CZLA 4K25A 3FZLA 3O4WA 5AQKA 3CI5A 2CH5A 4BR5A 1NGBA 4I6MA 4MO4A 4BC4A 1BWFO 2QXLA 3FZKA 5AQFA 4BRQA 3GBTA 1KAYA 5JLFA 4FSVA 2HF4A 4BRKA 1U2VA 4Y0WA 1XUPO 4IWVA 1TYQA 1HLUA 3VEXA 2ZWHA 2I7PA 1QZ6A 2BUPA 3IMXA 2QW9A 1Q18A 2Q31A 2OANA 3BEXA 4JAXA 3FZMA 4JD2B 2ASMA 3UKUA 2FF6A 2P9UB 3CJ9A 3LDPA 2V7ZA 3BF3A 4EHTA 3P4IA 5LJVA 3M6GA 1XQSC 3A5LC 3GL1A 3DWLA 3R6MA 4YDUC 4WYBA 1S3XA 5BR9A 4FOEA 2F9WA 5AQVA 5ADXA 5AQNA 3DXKB 3SK3A 4FPBA 3CJAA 5FPMA 4XH4A 2YHWA 3WUHA 3AAQA 4M7YA 4CD1A 4DB3A 3F9MA 4FWOA 2YCHA 3FGUA 4H5RA 3VEOA 1DEJA 4B1YB 3VETA 3H3NO 4BRFA 2P9KB 2FSJA 5BN8A 2H3GX 3WEEA 4BRMA 4FWSA 3FR0A 1GLLO 5BRFA 4CBXA 4BROA 4BRDA 3VEVA 3H3OB 5AFUH 3LDLA 3WQUA 1JCFA 2AA4A 3FFKB 2YI1A 2QWRA 4QS7A 1NGEA 5AQJA 4QS8A 3L4IA 2CGKA 4A2AA 2D0OA 2W41A 2GWJA 3VF2A 4NB4A 3MMVA 3JS6A 2J4RA 1HPMA 4BQLA 3HM8A 1QZ5A 3I8BA 1S22A 2WUSA 1Z05A 4CZKA 3CETA 2E2PA 3HTVA 3A5NC 3D2FB 3GDQA 3CIPA 5EX5A 3QMLA 1BA1A 4HWIA 4FWPA 1ATSA 3GE1A 4B1VA 2QWMA 2ITMA 1X9JA 3EZWA 3A8YA 4FWLA 5AQIA 4CZIA 4CZGA 3WQTA 4C23A 2PAVA 1GLFO 1DGKN 4BRIA 2W40A 3WT0A 3GG4A 3VGMA 4FOIA 5BRHA 1C0GA 5TKYA 5BREA 1NGCA 2HMPA 1BOTO 1P8ZA 4JD2A 4YDUA 1WUAA 1T6DA 3CHWA 3R8EA 4AM6A 4MO5A 3QFUA 1D4XA 1LOTB 3O08A 3O6WA 1MWKA 3A0IX 3W0LA 5AR0A 3HZ6A 3MN9A 3KVGA 2E20A 4BRNA 2P9IB 4E1JA 5AQQA 1TUYA 4XH5A 1QQNA 3U4LA 3MDQA 4LC9B 2QWNA 3SLCA 5FPNA 2BTFA 1IJJA 3U8XA 4JHDA 4BRCA 2FXUA 2FF3B 5AQXA 3HBTA 4ISGA 3A5MC 3DXKA 1NM1A 3SMPA 3ZETB 1SQKA 1C0FA 2GEMA 1U6ZA 1RGIA 1NGDA 3FLCO 4H5NA 4IXCA 2Q1NA 1QQMA 1T6CA 1HKGA 3H1VX 1HKBA 3QICA 4BRPA 1GLEG 2PBDA 3CJBA 1GLCG 1NGJA 4RTFD 4EHUA 5BRDA 3SMSA 2HOEA 1RDWX 2E2OA 3L6QA 4CBWA 2P9PB 2E1YA 3AARA 4K43A 5E26A 4FPAA 5E84A 4K41A 2ZGYA 5AQUA 4BQZA 3O1BA 3VESA 2V7YA 5JMVA 3D2EB 3ULEB 1KAZA 5BPLA 4B1ZA 3QFPA 3LDNA 2ASOA 2QWOA 4M63C 4BGAA 1JCEA 3DJCA 4CZEA 1YAGA 3CQYA 3I33A 4QS9A 4H0YB 4BR9A 5ADXH 4EAHD 4PKIA 2HF3A 3VPZA 3LL3A 2DPNA 3LDQA 3ATVA 2I7NA 4FWMA 5KPZA 3R9PA 1QHAA 4HTLA 4BRHA 5AQPA 2Q97A 5F0XA 4BRGA 1NGIA 1NGFA 4MLHA 2D0PA 3SJHA 4H0VB 4BR4A 2IVPA 2A6AA 2YHXA 3BP8A 3C7NB 3M1FA 2FSNA 5EY4A 1DKGD 2D4WA 3VF6A 3ZX0A 3ENHA 3VGKA 2NLXA 1MA9B 5BPNA 3FE1A 4BVOA 1E4FT 1K8KB 1V4SA 5EXWA 2P9SB 4I6MB 3ATUA 3CJ1A 3DXMB 3WXLA 1QQOA 5AQHA 2AP1A 1XC3A 2P9IA 5FPDA 2YJFA 1NGHA 4BC3A 2A41A 4NO7A 1HX1A 1E4GT 5JLHA 1GLBG 1BU6O 2E1ZA 4FL9A 5BN9A 1NBWA 2Q2RA 4FWKA 2P9LB 3KZBA 4H03B 1MDUB 1ZC6A 4A2BA 3CJ7A 4PL7A 4H5WA 2Q36A 1T44A 5CE3A 3AAPA 3W3DA 3ZETA 4BVPA 2GWKA 4IO8A 4BC5A 3D7EO 4FO0A 3DAWA 3H46O 3VEYA 3B8AX 4PKGA 1NMDA 4CI6A 4B1XB 1OKJA 2QWLA 4BGBA 3TU5A 2EWSA 4GNIA 4RWTA 4H0PA 5AQYA 2P9UA 2GELA 2IVNA 4WQ5C 5FPEA 2A42A 1HJOA 1NGGA 5AQLA 3D2EA 2ASPA 3ULEA 3EO3A 1YUWA 4B1UB 3CQXA 2IVOA 3CERA 3O1WA 3VF4A 3VEWA 3H6EA 5AQRA 4B9QA 3EL2A 1IG8A 4BG9A 2YJEA 3QDKA 3HI0A 4EIAA 1H1VA 1SAZA 3VERA 4CD3A 1ATNA 5AZIB 2NZTA 1TUUA 1HKCA 5AQWA 4IZ9A 4RCHA 3ZX2A 4BR7A 3EN9A 3JXUA 4H5VA 4CBUA 4PL8A 4WQ4C 3C7NA 1GLDG 3EKSA 2P9KA 1BA0A 4A62A 1K8KA 3GOIA 4FWNA 2P9SA 3DXMA 3LM2A 3MK6A 4ISEA 3M3ZA 3S41A 1CZAN 2GUPA 4CZMA 4F9OA 4H5TA 4A61A 2VYPA 4XH1A 4B1WB 1R59O 1BO5O 2F9TA 1YVNA 3AY9A 3EKUA 3UKRB 4AM7A 5I9EB 1X3MA 4DHYA 1X3NA 5AQZA 3MN7A 4H0OA 1LCUA 3RSEB 1ZBSA 3C0BA 2P9LA 4XEIA 3QB0A 3TPQA 1WOQA 2E2NA 3D2FA 4BR2A 3LM9A 2YHYA 3QBXA 5B8HA 4WQ5A 3ZEUB 2QM1A 3U9DA 3O80A 1NWKA 5AZJB 2D1KA 2A40A 2GTDA 5F1XA 2QWPA 2P9NB 4PKHA 3A5OC 5AQMA 1SZ2A 4BRLA 4ISFA 2E2QA 4JNEA 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL1A 3KD5E 3MWPA 4E0DA 3AVNA 5BPMA 3EYZA 5AQGA 1Y64A 2QEXN 3IUCA 5M1QA 1WSEA 1V4TA 2KKZA 1WLJA 2WOMA 4CJVA 4W5QA 3O4QA 4OKKA 2CGLA 1L3VA 4WE1A 3O9UA 5LJWA 4DQPA 4CJEA 3CPWM 4C8OA 4DTSA 4DQ8A 4FWRA 4CZJA 4IJNA 5M1FA 2R7YA 1NNEA 3QEPA 4KBOA 1NJWA 2BGGA 3C65A 4LF5K 4GY2B 5AQSA 2IIRA 1K73O 1JLEA 3KHYA 1WSJA 1S9EA 4FJ5A 3K5NA 4CJ7A 5HOOA 1T05A 4KAZA 4CJSA 3H1QA 5EOYA 4X64K 1SL0A 3CD6N 3QEVA 1RNHA 1SKRA 1HYVA 3OYIA 4DQIA 3H45C 4B08A 4DU4A 1NJIO 4CK2A 1G99A 2HHXA 3BF1A 1N6QA 2E8AA 3BGRA 3NF6A 3UKRA 1WSGA 3AVAA 4RW6A 1VK0A 3RSEA 1C1AA 4FW2A 3WEEB 4M3RA 3OYGA 1BCOA 2X6SA 3VTHA 1NLVA 1YI2N 1WN7A 3N4QA 3IDHA 1KAXA 5GINA 3SPZA 3PX4A 2JWLA 2UUAK 3NH2A 5ELZA 3KD1E 3ASMA 4K42A 4CZLA 3U9ZA 2LSNA 4JI2K 3K9JA 2ZJRL 3E9PA 4JRPA 1JKHA 4BE1A 2WTUA 2HVHA 1CLQA 4LH5A 1ZYQA 1RBUA 4BRQA 3PLAA 3FZKA 5AQFA 4BE0A 4JLHA 5JLFA 4BRKA 4DS5A 2NRRA 4LF9K 4F4KA 1HLUA 2I7PA 1NK4A 2QW9A 4EZ9A 3MXMA 1BI4A 2Q31A 3BEXA 4CEOA 2G8VA 2ASMA 2FBVA 2FF6A 2P9UB 3KK1A 1BIZA 5KRTA 4BWMA 3CJ9A 1E3MA 3ZSXA 5C10A 1JLFA 3PUFA 3OS0A 3A5LC 4OGEA 4JI5K 1HQEA 4JS5A 1QTMA 4WYBA 4FLXA 3CM6A 5BR9A 3SAGA 4CF8A 3DXKB 3SK3A 4DV1K 4FPBA 3CJAA 4FJKA 2NNWA 1X1PA 4DV7K 4FW1A 2F96A 2VWJA 3TANA 5CYQA 4H5RA 1DEJA 4B1YB 4LD0A 4BRFA 3CCRN 3O9RA 3VMFB 2XRIA 4KPYA 4LSLA 3LP0A 2VQEK 4CJFA 5GADP 2KFZA 5BRFA 4CBXA 4BROA 2PYJA 1NG9A 5D3GA 4CF2A 1JCFA 4QS7A 1TK0A 3PSFA 3K5MA 5AQJA 4FM0A 1NKBA 5IT9O 2D0OA 2W41A 4E1MA 3TAFA 4OVLA 4B9TA 3HM8A 4E7IA 2WUSA 4CJ5A 3V9XA 2AJQA 1LWCA 1RBTA 1B92A 3HP9A 3OYBA 1JLQA 2OTLN 5EX5A 2KLAA 4FWPA 2QWMA 4ELVA 4O0IA 3EE9A 4JI0K 3A8YA 2X6NA 2VG6A 3WQTA 3KLHA 2W40A 3P39A 3T19A 4JRQA 2Z1JA 5BREA 3L2UA 1BOTO 4X66K 3WNGA 5GAGP 4JD2A 4KTWA 1WUAA 3CHWA 4B3MK 3O6WA 1JLGA 2JGUA 5AR0A 2E20A 5KGWA 4BRNA 2WONA 4H4MA 3F5TA 1U47A 1RTDA 4ILJA 3U4LA 1I3AA 4LC9B 2QWNA 5FPNA 3U8XA 4BRCA 1J9AA 2YNHA 4ISGA 4YOWA 2NRXA 3SMPA 4WFBL 1SQKA 4IFYA 2GEMA 3PIOL 1U6ZA 2DFHA 4FJ9A 2P51A 1NGDA 3KWGA 2Q1NA 1QQCA 1HKGA 4BRPA 3QICA 1YJ9N 3PO4A 2HHQA 3VQCA 5BRDA 3MXIA 2G8IA 1DT9A 1LAWA 1IV0A 4DTPA 4E89A 1NK9A 4M41A 3DLRA 4K41A 2ZGYA 4BQZA 1TAUA 3VQ8A 3D2EB 1KAZA 4YNQA 2O8EB 4JKAA 2D0BA 3QIPA 1JCEA 3DJCA 1YAGA 4DQQA 3I33A 5ADXH 4PKIA 2P5GA 1T03A 5E41A 4CHYA 3TAGA 2DPNA 4ZTFA 2I7NA 3OYMA 5KPZA 3R9PA 2Y1JA 3K5LA 1VQPN 2Q97A 5F0XA 1NGFA 4E7LA 2FBTA 4MLHA 1RBRA 4LFCK 4H0VB 2IVPA 2DFEA 2YHXA 3BP8A 3DOLA 3M1FA 2FSNA 5EY4A 3ZX0A 2O8BB 4FJMA 3VGKA 3K59A 2A1SA 1D9FA 5BPNA 4JI1K 1NJXA 2P9SB 4I6MB 3DXMB 3SBTA 4KKOA 5AQHA 1D5AA 4YOTA 2AP1A 1C0TA 4DMNA 1XC3A 2P9IA 2FBYA 5M1PA 1HNWK 4RW7A 1N33K 3DLKA 4JI3K 1GLBG 4KRFA 3SQ4A 3L2WA 3KZBA 2RKIA 5BR8K 1YF5L 3NMUA 4QCLA 1T44A 1RT7A 4OLAA 3CYMA 1WB9A 4IO8A 3CFOA 3D7EO 3THYB 5KRSA 3H46O 3B8AX 1U4BA 1OKJA 4CEBA 4W5OA 3C6UA 4AQYK 4HVJA 3L2VA 4H0PA 1VSLA 2NRTA 4KTZA 2QXFA 3DI6A 3P5JA 3TTCA 3QLHA 3PX6A 3EO3A 3DLEA 1YUWA 4B8CA 3O1WA 3VF4A 3VEWA 3VQPA 2VG7A 3H6EA 3KLFA 3EL2A 4JK7A 5C0YA 3NCIA 3RRGA 3VQBA 4EIAA 1H1VA 4CHNA 3VERA 2ZM6K 4M3ZA 1TKXA 3L8BA 1WSIA 3BY5A 4BY9C 1ZBUA 3MX2A 2O8FB 1RTJA 4GV3A 3ZX2A 4CBUA 3JXUA 4H5VA 1S1UA 3BZCA 4UQGA 3OS2A 1C1CA 1JL1A 3C7NA 4KH4A 1BA0A 3AV9A 5DM7L 4ISEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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