1GLDG

Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
total genus 160
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1994-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gldG01
3BF3A 4I6MA 4NO7A 3GE1A 1BA1A 3EN9A 1SQKA 3O5BA 5FPDA 2Q31A 1U2VA 1YUWA 3FE1A 5EY4A 3VEXA 1GLLO 4DHYA 1HPMA 2HF4A 2E1YA 3EKUA 3WUHA 4CBXA 3C7NA 4XH1A 1QQOA 3KHYA 4CZIA 5BRHA 5JLHA 4H0TB 4B1UB 3L0QA 1NGBA 5AQZA 1U6ZA 3HI0A 5JICA 3MMVA 4BRDA 3QICA 2I7NA 4FSVA 5AQTA 4BRGA 2CGKA 4YDUA 3QMLA 4BC3A 3UB5A 2ASMA 4FL9A 1BDGA 5FPNA 4A2AA 4MLHA 3VF6A 2QW9A 3VEZA 4H0OA 4H5NA 3GG4A 2NZTA 3ID8A 1BA0A 3SMSA 3VENA 4LC9B 5AQYA 4RWTA 4JHDB 5B8HA 4GY2B 4O8KA 3M1FA 3SK3A 5KQDA 2A5XA 2FF6A 4XH5A 1GLJO 5AQHA 3LDQA 2D1KA 4WYBA 5CE3A 3CJAA 4YDUC 4B9QA 2FF3B 1BU6O 4B1WB 1HKBA 2A41A 3RSEB 5BN9A 1QQNA 3CQYA 4CZKA 3MDQA 2HF3A 3ZEUB 3D2EA 2FXUA 4FWMA 4CZEA 3SMPA 2IVNA 3R8EA 3VEVA 2YHYA 3I33A 2YHWA 3H3NO 4BVOA 5KPTA 4HTLA 2F9TA 3CIPA 3B8AX 3QDKA 3WT0A 4IO8A 1EQYA 4IJAA 5KPZA 1BOTO 4BRHA 2D0PA 1YVNA 1HKGA 4IZ9A 3DJCA 4FWRA 1DGKN 4A2BA 1JCFA 4GNIA 5AQRA 3U9ZA 5AQPA 3CJ7A 3AY9A 1RDWX 3VGMA 3L6QA 4H5WA 3CJCA 1C0FA 2VWBA 4BRAA 2F9WA 1TYQB 5LY3A 2P9IB 3ENHA 3WEEB 3H45C 3CHWA 4WQ5A 3J8AA 2NRHA 4ISGA 2I7PA 2E20A 1WUAA 5AZIA 4BRMA 3H46O 2V51B 1CZAN 3IMXA 1KAXA 3QB0A 4DQ8A 3O80A 1IJJA 5KPRA 1E4FT 4AM6A 4H0PA 5KQ8A 2P9UA 5AQFA 4H5TA 1KAZA 1NGGA 4CD3A 1V4SA 1Z6RA 2W41A 1NBWA 5AQIA 1NGFA 2GELA 2FSNA 2E2PA 4EAHD 2AA4A 4QS8A 4DCHA 3EL2A 1WOQA 2E2QA 1NWKA 2ASPA 2AP1A 2P9NB 3HTVA 4BR5A 3LM2A 4CBUA 2NLXA 3H1QA 2BTFA 3GOIA 2QXLA 3FZLA 2P9LB 5AQQA 4NB4A 1QZ5A 5EX5A 5AQJA 3HM8A 3JS6A 4I6MB 4BR9A 3SLCA 4BGBA 2QWNA 3DXMA 3DXKA 4JN4A 1BUPA 4EIAA 3F9MA 3QBWA 3R9PA 2P9KA 4PKIA 3U9DA 4K43A 5AQGA 3ZX3A 3GBTA 2E88A 1GLAG 2J4RA 4FWKA 3A5NC 2CGJA 3ATVA 3WXIA 2YJEA 3GDQA 3UE5A 3AAPA 5AQOA 1HX1A 4WQ5C 2ITMA 3ULEB 2GEMA 2E1ZA 4CZFA 3G25A 4H0YB 2Q0UA 1RFQA 2P9SB 3WXKA 3C0BA 3VERA 5TKYA 4BG8A 3QBXA 1OKJA 3LDLA 4MO4A 4PKGA 2ZWHA 1RGIA 5BPLA 3LM9A 1X3MA 2W40A 1IG8A 3UKRB 4BR0A 1NGJA 1TYQA 2IVPA 2A3ZA 3CJBA 2ZGZA 3A8YA 3O8MA 1NGHA 1Q18A 4PL8A 1P8ZA 2IVOA 1QQMA 2V7YA 3D2EB 3QFUA 1NMDA 3WEEA 5JMVA 3KZBA 4QS9A 2ZF5O 1Y64A 2YHXA 5E26A 3WXJA 5ELZA 3VGLA 4K25A 4FWOA 1T6DA 3ULEA 3VETA 4BC5A 3WQTA 4BRFA 1DEJA 2ZGYA 1KXPA 4BVPA 4J8FA 1ZXOA 5BRDA 5EXWA 4BR4A 3WXLA 5AR0A 2P9PA 4EHTA 4EHUA 3O6WA 3R6MA 4M7XA 5EVZA 2QWRA 3IFRA 1TUYA 4BR7A 1ATNA 4WQ4A 1SZ2A 2QWOA 4IWVA 1HUXA 1H1VA 3FZFA 4A61A 4IJNA 5BRFA 5I9EB 4BRCA 3LDPA 1YXQA 5ADXA 2PAVA 2QWPA 4FWNA 3MN9A 2WUSA 3P4IA 2KHOA 3FZKA 3VEOA 2A6AA 2P9IA 2UYTA 4ISEA 1X9JA 2ASOA 3OHRA 5AFUA 3FLCO 4MO5A 4PKHA 3ATUA 3CI5A 2P9SA 3DAWA 5LJWA 5AQVA 5BN8A 3EZWA 4XH4A 2GUPA 4AM7A 2YJFA 4BRPA 3O1BA 3A5LC 3VEWA 3W3DA 2E8AA 5BREA 4FPAA 1BO5O 2HOEA 4CI6A 3W0LA 3IUCA 2P9NA 5F1XA 4A62A 4BR2A 3VPZA 5ADXH 1NGIA 3DXMB 1J6ZA 1HJOA 3ZETB 4JD2A 3MCPA 4BC4A 3LDOA 4CZGA 1QHAA 3CJ1A 3VF2A 3AARA 3BUZB 4FWQA 5FPMA 4HWIA 3MN7A 1D4XA 4BRNA 1E4GT 2A42A 2QWMA 2Q97A 2E2NA 3DXKB 3DWLA 4FWSA 3A5MC 3MN6A 1KAYA 5AQUA 3BP8A 4JAXA 3D2FB 3WQUA 4CD1A 4M7YA 4BRLA 3VF4A 2GWKA 2FSJA 2Q36A 4CJ7A 3H3OB 1LOTB 1GLCG 3CERA 4FPBA 4CZJA 1BWFO 1LCUA 1ZC6A 2GWJA 3S41A 3HBTA 1MWMA 4CZLA 4CZHA 3BEXA 4PL7A 3CETA 3ENOA 4WQ4C 2QM1A 2CH6A 1ZBSA 4FWLA 3O4WA 5F0XA 5BPMA 3C7NB 4K42A 1SAZA 1ATSA 3H6EA 1YAGA 1U2VB 2FSKA 3H1VX 4QS7A 5FPEA 4FOEA 2D4WA 4DB3A 3LDNA 4B1ZA 4H0XB 3UKUB 3D2FA 3MN5A 3ZX2A 4C23A 3CQXA 5AQKA 2FLOA 3GL1A 3KVGA 3UKRA 4RCHA 2V7ZA 4BROA 1C0GA 1S3XA 1XQSC 4BGAA 4BC2A 3QFPA 1X3NA 4E1JA 1NGCA 4BREA 3LL3A 5F2RA 2YI1A 1QZ6A 4IXCA 3VGKA 4M63C 4ISFA 3TU5A 3ZX0A 1GLDG 1Z05A 3ZETA 5JLFA 3VEYA 2Q0RA 2D0OA 3U4LA 2H3GX 3FZMA 1T6CA 2GTDA 3O08A 2P9KB 3O1WA 3RSEA 3JXUA 4BRIA 4FOIA 3A5OC 1MWKA 3FZHA 1NGDA 1V4TA 1MA9B 3IDHA 4L3QA 1ATRA 5AQWA 4JHDA 4CZMA 2E2OA 1JCEA 1NLVA 1NGAA 1K8KB 1JCGA 5E84A 3HZ6A 1TUUA 3SJHA 4CBWA 4K41A 5AFUH 2EWSA 2YCHA 3U8XA 2V52B 4FWPA 1MDUB 3M6GA 1HLUA 4BRKA 5AQLA 5AZJA 1K8KA 3EKSA 4BQLA 2QWQA 2PBDA 3FR0A 4B1XB 1XUPO 2CGLA 3L4IA 4BG9A 3CJ9A 4H0VB 3VESA 5AQXA 4XEIA 3HSCA 4O5FA 5AQSA 2Q2RA 1HKCA 4H5RA 2VYPA 4BQZA 1XC3A 3I8BA 3EO3A 1GLBG 1BG3A 4H5VA 1S22A 1GLEG 1G99A 5AZJB 5AZIB 4JD2B 4BRQA 4Y0WA 3UKUA 3TPQA 5AQNA 4JNEA 5LJVA 3ZEUA 2IIRA 4B1YB 2VCPA 3MK6A 3BF1A 2Q1NA 4EFHA 2CH5A 5BPNA 4FO0A 3FGUA 1DKGD 2P9PB 2BUPA 2P9LA 2P9UB 2A40A 4F9OA 1NM1A 1T44A 4MLEA 1GLFO 1NGEA 4H03B 4RTFD 1ESVA 2HMPA 5AQMA 4Z94A 2DPNA 2QWLA 3A0IX 5EOYA 1R59O 3AAQA 4B1VA 3FFKB 4KBOA 2OANA 3VOVA 3M3ZA 5BR9A 3D7EO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LWMA 2NRWA 4LF5K 4NO7A 2Q31A 3RR8A 4QAGA 3VEXA 2WOMA 2IGIA 2E1YA 4OX9K 1U47A 4CBXA 4NCAA 3NDKA 5HROA 4B1UB 5HL7L 4DQPA 1KLNA 1NGBA 5AQZA 1U6ZA 1WSJA 4DS4A 3MMVA 2YKMA 3L4QA 1XNRK 3NBPA 3OYKA 2VQEK 2ASMA 4FL9A 4A2AA 2QW9A 4H0OA 1U49A 3CFRA 1BA0A 4CEDA 3VENA 3O3GA 2BE2A 3TR8A 3B6OA 5GAGP 1NJZA 4B8CA 4JHDB 2B5JA 4O8UA 4GY2B 2WONA 4JYAK 2IDOA 4CIGA 3OJSA 3SK3A 2A5XA 1W9HA 4CVNE 1BCMA 3CJAA 1QHTA 2FF3B 4E89A 2BANA 4FZYA 1A5WA 4B1WB 3VQPA 4F4KA 4ZTJA 1QQNA 1CZ9A 2W6KA 2DFHA 1KTQA 4ICLA 2HF3A 3ZEUB 1QVGM 3TI0A 4PY5A 3MEGA 4FWMA 3SMPA 2P51A 3R8EA 2D5RA 3VEVA 3I33A 2YHWA 3ZT2A 1YHQN 1S72N 1VQ8N 3KLIA 3DRPA 3B8AX 4IDKA 3WT0A 4X64K 3CQ8A 3CM6A 4IO8A 1ILYA 3THXB 2KW4A 5KPZA 2HMIA 2D0PA 4IZ9A 3NF9A 4GNIA 4GKJK 1EO1A 3CJ7A 1A5XA 1RDWX 4CK2A 3DLHA 2F9WA 4CJRA 3WEEB 3H45C 3AV9A 3J8AA 4ISGA 1WUAA 3OBWA 4CHNA 4ELTA 4ZHRA 1CZAN 2KZMA 4JKGB 1YIJN 3O80A 4HUFA 1IJJA 1E4FT 3NVKA 5AQFA 1KAZA 4IFEA 4AQYK 4JKBA 4QOZB 2W41A 1ZYQA 3E66A 4FLXA 4E7LA 1NGFA 2E2PA 1KC8O 4QS8A 3L2WA 5HRNA 4B9UA 4JI1K 4KAZA 3MXJA 2ZJRL 1HRHA 2KTQA 2AP1A 2P9NB 3HTVA 2HBLA 1HNXK 3LM2A 3U6FA 4CJUA 4FK2A 2P9LB 5AQQA 5EX5A 4DV4K 2BDPA 5AQJA 3KLHA 1S1UA 3C6HA 3CCUN 3JS6A 4Z0UA 1GOCA 1G15A 3AA5X 3DXMA 4JN4A 3O9QA 4FLZA 3MAQA 1IG9A 3QBWA 4DTPA 3QO9A 1VQPN 3GBTA 4E1MA 2J4RA 1F21A 2CGJA 2YJEA 4LD0A 3GDQA 1TAQA 3M8QA 4ILGB 4FJLA 2ITMA 4W5RA 4GW6A 1IBMK 2HNZA 4BE2A 1RFQA 5HP1A 3ZYYX 3C0BA 3VERA 5TKYA 4BG8A 3QBXA 4C1NK 1VQ5N 2PY5A 3D0PA 3NGIA 1Z26A 4DV5K 4YOTA 5BPLA 1X3MA 4BR0A 1TYQA 3A8YA 1KSPA 4JS5A 4DR4K 1NKEA 4DSJA 4FW1A 4RG8A 2ZD1A 3PV8A 1RCHA 1DT9A 4W5QA 2JGUA 4QS9A 1VQ7N 3VQEA 5E26A 3WXJA 1JLCA 4B9TA 2KFNA 1NKBA 3VETA 3WQTA 4GV6A 4BRFA 1UOCA 5HOOA 5HLFA 3TSPA 4JI0K 4J8FA 5BRDA 1D9FA 4CGJA 4BR4A 5DK5A 5AR0A 2E6LA 5M1NA 3O6WA 3R6MA 4M7XA 1S9GA 1BQNA 5GINA 4KKOA 4BR7A 5HBMA 2QWOA 4IWVA 1HUXA 3HL8A 4IJNA 5BRFA 4M42A 4BRCA 1N8RO 1YXQA 5ADXA 2PAVA 2QWPA 2D0BA 3VTHA 3FZKA 3VEOA 1RT1A 2P9IA 4CJFA 4ELVA 4AHSA 3ZSQA 3TWHA 2Y1JA 4YOWA 4ID1A 3OHRA 1IH7A 4PKHA 1TK0A 3NH0A 2P9SA 4JKHA 1VQKN 5AQVA 5BN8A 2OPPA 3EZWA 4XH4A 3C6TA 1OH6A 3O1BA 4JI6K 2A1SA 3THWA 4Z4CA 4KTZA 3W3DA 4DV7K 1RTJA 2OZMA 4DU4A 3IUCA 3LZIA 3CCJN 4DV2K 1RT4A 4BR2A 1UAXA 5ADXH 2WFBA 1NGIA 3DXMB 4JRQA 3ZETB 2O4IA 3D7EO 3OYNA 3LDOA 1QS4A 1QHAA 3NFAA 4CZGA 3G0ZA 3VF2A 4FWQA 3THYA 1ASWA 3LANA 3OYLA 2Q97A 5I42A 4CCHA 2YX6A 3CCEN 4FWSA 1KRPA 3A5MC 3S3MA 3MXIA 4RW4A 3NH2A 4MFBA 4B08A 3NHGA 4DWIA 2ZQBA 3O9UA 3VF4A 1VQMN 4CJ7A 5BR8K 1VRUA 4CZJA 4CEBA 2GWJA 1N36K 4J2AA 3HBTA 4CZLA 4M3RA 4CZHA 4RW6A 3SNNA 3ENOA 4FWLA 4FVUA 4E7JA 3DLKA 4F2SA 3SQ1A 4FM2A 4M41A 2FSKA 3H1VX 3M8RA 4M3YA 1IKYA 1KLMA 1YF5L 3RMCA 4E3SA 4DB3A 4AILC 3LDNA 4B1ZA 4H0XB 4JEPA 4DMNA 3V9WA 3MEEA 4LSLA 2E6MA 1J9AA 1VK0A 1EX4A 4LF9K 4CJTA 1XQSC 3ZLJA 2FBYA 4E1JA 4BREA 4E0DA 2YKNA 1FK9A 1OH7A 5DM7L 3C94A 1QQCA 2Q0RA 2E5LK 4CF0A 4B9MA 2AJQA 3U4LA 2H3GX 3FZMA 4IFVA 4CECA 1XNQK 1EWRA 3SUOA 3ZT1A 3JXUA 4BRIA 1JLQA 2EX3A 5AQWA 4B3SK 5CZ2A 4CZMA 3AVBA 3THYB 3TARA 2YHBA 3HZ6A 3QINA 3SJHA 2W42A 2O8EA 4DUZK 4CJVA 2EWSA 1Q81O 2YCHA 1VRTA 3U8XA 1SKRA 2V52B 3KKSA 4FWPA 5J2QA 3HPGA 3SV4A 1LV5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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