3JXUA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1a (hsp70-1) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3jxuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3jxuA04
5AQRA 4BRFA 2J4RA 4K43A 3WQTA 5BPMA 3S41A 3JXUA 2D1KA 1KAXA 3R8EA 3DXKB 3U4LA 1IJJA 1HJOA 4CBWA 2E1YA 1GLJO 4YDUC 5FPNA 3BEXA 5AQTA 3TU5A 3O80A 4FWOA 1Q18A 4H0PA 5TKYA 4FWQA 2FF6A 3H1QA 1HKCA 5CE3A 5BRDA 4QS8A 5AR0A 1BDGA 5BREA 4BRPA 2P9NA 4BVOA 2EWSA 4EIAA 4DHYA 4Y0WA 3C7NB 1SAZA 3WXLA 4FL9A 4BREA 3LDPA 4NO7A 3U9ZA 1BWFO 5JLFA 2CH5A 5ELZA 4JD2A 1HKGA 4JD2B 1RGIA 2GUPA 3CJCA 4XH4A 5JLHA 1ATSA 2Q0UA 2P9IB 1MDUB 3R6MA 2HF3A 3M6GA 3FE1A 2CGLA 4BRDA 4CZJA 3CERA 3IFRA 5AQYA 1X3MA 5BN9A 4DB3A 1C0FA 1K8KB 2QWQA 2ZF5O 4BC5A 2FSKA 1GLLO 4RTFD 3VEZA 4FWSA 3FZMA 5AZJB 2Q31A 4FWKA 4A2AA 3CHWA 1YUWA 2QWLA 3A8YA 4WYBA 1U6ZA 1ATNA 3DXMA 3JS6A 2HF4A 3SMSA 3D7EO 1QQOA 2PAVA 3DXKA 2A6AA 3D2EA 3MDQA 1WUAA 2Q97A 3MN7A 3QICA 1NGHA 3DAWA 3SMPA 3HSCA 3MMVA 2Q36A 3ZX3A 4CI6A 4H5NA 1ATRA 1BU6O 2E20A 4CBXA 3GBTA 5LJWA 4J8FA 2A40A 3HI0A 2NLXA 4EHUA 4H03B 3CJAA 1NBWA 3B8AX 3CJ9A 3EN9A 2CGJA 1BA1A 2QM1A 3SK3A 3QBXA 3QMLA 2YJEA 3IMXA 4M7YA 3A5OC 3LDOA 1V4TA 3WQUA 3A0IX 1E4GT 4IZ9A 4XH1A 4BVPA 3GL1A 1HKBA 1BUPA 1YVNA 4JN4A 4MO5A 2Q1NA 4FWRA 1HUXA 4FWNA 2A3ZA 4RWTA 4FOIA 3GE1A 3A5MC 3CIPA 3EO3A 2ASOA 4PL8A 2V52B 4BRMA 1D4XA 4B1YB 4BR5A 3D2FB 3O8MA 4CZLA 5BPNA 4I6MB 5ADXA 3SJHA 4B9QA 3O1WA 2QWOA 5AQWA 4BRQA 5AQMA 1JCFA 2D0OA 2P9PB 2VWBA 2P9PA 5F0XA 3AARA 1G99A 4WQ5C 2OANA 3DXMB 3ZETB 1H1VA 1YXQA 2Q0RA 3ID8A 1NGIA 1T6DA 3HM8A 3MN5A 4B1XB 4WQ5A 4K41A 3VPZA 3WEEA 1DEJA 3MK6A 2CH6A 3W0LA 2P9KB 2YI1A 3LM2A 2F9WA 3LL3A 2P9KA 1S3XA 1NGBA 4NB4A 4CZGA 3VETA 4AM6A 5FPDA 3UKUA 5AQLA 3EKUA 3QFUA 3UKUB 5FPMA 5KPRA 5AQFA 1GLEG 2QXLA 4JNEA 4BG9A 3KZBA 4BC3A 2HOEA 3AAQA 5BPLA 1LCUA 3FGUA 4LC9B 1HX1A 2E2NA 1S22A 4BQLA 3O1BA 1CZAN 2YCHA 3CJBA 3O08A 2KHOA 3CETA 3VEVA 4CZHA 4PKGA 4KBOA 3LM9A 3ULEB 3L4IA 2A41A 3ULEA 2E88A 3ATVA 1IG8A 2GTDA 4M7XA 1QHAA 3VEXA 3CI5A 4BR7A 1P8ZA 3D2FA 3R9PA 2P9NB 5EX5A 4CZIA 3HTVA 4Z94A 5AQOA 1HLUA 3WXIA 3FZKA 4H5VA 2E2PA 3J8AA 2D0PA 4PKHA 2IVOA 5AQJA 4BRCA 4A62A 3I8BA 5AQNA 2V51B 3FFKB 4XEIA 1C0GA 3WT0A 5EOYA 2W41A 4BR0A 1NGCA 3VEYA 2A42A 4AM7A 3P4IA 4JHDB 2FLOA 4BRAA 4JHDA 2V7ZA 3FR0A 3O5BA 4CD3A 1BOTO 4C23A 5AQGA 2AA4A 3CJ7A 4FWMA 3ATUA 1BA0A 3WUHA 2NZTA 3EKSA 3M1FA 1T6CA 1SZ2A 4EAHD 4FOEA 2HMPA 4IJNA 2WUSA 4H0VB 4H0XB 4BGAA 3BP8A 5AZIB 5F1XA 3U9DA 1Y64A 3EL2A 1QZ6A 4BROA 1OKJA 5BRFA 4PL7A 4E1JA 3WEEB 1KAYA 4BRNA 5LJVA 4MLHA 5AFUH 2QWNA 4IO8A 1U2VA 4IWVA 1QQNA 1U2VB 2W40A 2IVPA 3BUZB 4O5FA 4EFHA 4XH5A 1SQKA 4K25A 3VEOA 3EZWA 1XQSC 3H1VX 1E4FT 2BUPA 3TPQA 5JMVA 2P9LA 3AY9A 2QWPA 2FSJA 1NMDA 2E2QA 4FO0A 4BQZA 3GDQA 2BTFA 4CZEA 3ZEUB 4CZKA 3IUCA 1YAGA 3QBWA 3ZX2A 3C0BA 3H3NO 1DKGD 1NGFA 4QS7A 3IDHA 1NM1A 1ZBSA 1DGKN 1KAZA 3UB5A 2GWJA 4M63C 5AQSA 2GELA 1TUYA 3SLCA 3DWLA 4EHTA 4F9OA 1NWKA 5AQUA 1HPMA 4I6MA 1X3NA 4ISEA 4ISFA 5BN8A 4CBUA 1Z6RA 4L3QA 3UKRB 2PBDA 3DJCA 2QWRA 3MN9A 4K42A 2YHYA 5AQPA 3O6WA 4WQ4C 2AP1A 3VF6A 3WXKA 3ZETA 4DCHA 5I9EB 3OHRA 1RDWX 4BRHA 2P9UA 4H5RA 4HWIA 5AQHA 4JAXA 1NGJA 4GNIA 4WQ4A 2ITMA 1MWMA 2QWMA 4H0OA 1R59O 1TYQB 1ZC6A 5BR9A 1TYQA 5AQIA 3H46O 3W3DA 4BRKA 4CZFA 2H3GX 3MN6A 4FPAA 2V7YA 2Q2RA 4BC4A 3FZHA 3VENA 3RSEA 3QDKA 5E26A 1NLVA 1EQYA 3RSEB 1JCEA 4FWPA 5AQQA 5JICA 1XUPO 3CQYA 4FWLA 2UYTA 1WOQA 3H6EA 2P9LB 3VGKA 3LDQA 3CQXA 3U8XA 2FSNA 2QW9A 4A2BA 4B1VA 3KVGA 3QFPA 4BR4A 4ISGA 5AZIA 5AFUA 1GLFO 1NGGA 4A61A 2E8AA 1GLBG 3G25A 3ZX0A 4HTLA 2ZGYA 4CD1A 4CZMA 2YJFA 3FLCO 3GG4A 5LY3A 5KQ8A 1JCGA 4FPBA 5AQVA 2DPNA 2YHWA 3HZ6A 1ZXOA 3VF2A 4BGBA 1GLCG 3LDLA 5ADXH 4H5WA 1NGAA 4FSVA 5EVZA 4BR2A 2P9SB 2I7NA 2F9TA 2VYPA 2ASPA 2P9SA 5KQDA 3M3ZA 3KHYA 4IJAA 1MA9B 4B1ZA 1X9JA 1Z05A 2D4WA 3L0QA 1J6ZA 3VERA 3ZEUA 1QZ5A 5KPTA 2IVNA 2ZWHA 1QQMA 2GEMA 1BO5O 2P9UB 3O4WA 4MLEA 5BRHA 4B1WB 5AQZA 2P9IA 3ENHA 3WXJA 3UE5A 2YHXA 2E2OA 1TUUA 3A5NC 4GY2B 3VGLA 5F2RA 4PKIA 4BRGA 4B1UB 2E1ZA 4IXCA 5AQKA 3BF1A 2FF3B 3LDNA 3H45C 4BRLA 5EXWA 2CGKA 3UKRA 3FZFA 4H0YB 3C7NA 4BG8A 3I33A 4CJ7A 5E84A 5AZJA 2A5XA 4O8KA 3CJ1A 3QB0A 1ESVA 4YDUA 3ENOA 1GLAG 1RFQA 3L6QA 4MO4A 3MCPA 1T44A 4QS9A 3GOIA 2ZGZA 1GLDG 1NGDA 4RCHA 4DQ8A 1KXPA 5B8HA 5FPEA 3D2EB 3FZLA 4BR9A 3VEWA 1BG3A 3A5LC 1XC3A 2FXUA 3AAPA 3BF3A 2GWKA 5AQXA 2I7PA 3VGMA 4BC2A 5KPZA 5EY4A 3HBTA 3VESA 1K8KA 4H0TB 1NGEA 1LOTB 2VCPA 2NRHA 4H5TA 3F9MA 3H3OB 4BRIA 2ASMA 3VOVA 3VF4A 1V4SA 2IIRA 1MWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJIA 4IDHA 4KRFA 3NGYA 3CCQN 2XY5A 1N8RO 2J4RA 2K35A 2PYJA 2QI2A 3AVBA 1X1PA 4C8OA 2D1KA 1ASWA 1BQMA 5SZTA 1I94K 5HRNA 3V1OA 3DXKB 3O3GA 2E1YA 4BY9C 2YNGA 4YDUC 5J1EA 4O55A 4KKOA 4M3UA 4E7KA 3O80A 2RPIA 1OH7A 1VNAA 2O8DB 3VQDA 1HKCA 5CE3A 5TKWA 4QS8A 3CFRA 2G8UA 1RT4A 2HVHA 4BRPA 5HBMA 4NXNK 3K58A 4EIAA 3IS9A 5HOOA 4CFAA 1K73O 4BREA 3C6HA 4NO7A 2KLAA 1BWFO 1RT7A 1VSKA 4FK0A 4DR6K 3DLRA 4FLUA 3L2VA 1RGIA 4XH4A 3QESA 2XY6A 2E6MA 3FE1A 3HRGA 4CZJA 4OPAA 3CERA 4JRPA 5BN9A 4FLZA 3E1YA 2KSKA 1C0FA 1T7PA 2NUBA 4R79A 2IAJA 4IG0A 1T0ZA 1RNHA 1C1CA 1N36K 5AZJB 4FWKA 4NCAA 1YUWA 4Z4GA 1LAWA 2X78A 4C8LA 4QAGA 4ELVA 1QQOA 4HUFA 2A6AA 2BGGA 3TAEA 3NGIA 2KBKA 3MN7A 4UY8O 4GV3A 3HSCA 2O8BA 1L3SA 4DUZK 1TI5A 1TK8A 4B3TK 3CCUN 3CJAA 1NBWA 2QTDA 3B8AX 1C1BA 1BA1A 2IGIA 2DTUA 3LZIA 1C1AA 1DTQA 3QBXA 4DFMA 3R2VA 1E3MA 1RT1A 3QMLA 4AEIA 1P90A 1ITGA 3IRXA 4AHTA 2RKIA 1E4GT 1L3TA 1W7AA 1HKBA 4B9NA 2D0BA 1CZBA 2Q1NA 4FWRA 1X9SA 4C1NI 1UOCA 1QSLA 4FOIA 5GAHP 2HHSA 1VSFA 1J5OA 2VWKA 1D4XA 3D2FB 3O8MA 4AILC 4DMNA 1IKVA 3O1WA 3K5MA 2YX6A 4BE2A 3KD1E 1S9GA 5AQWA 2QKBA 4ELUA 4C1NK 4LFCK 2VWBA 1VQPN 3PX4A 5F0XA 1G99A 1RILA 2OANA 3ZETB 3CFPA 1H1VA 2OPSA 3O4NA 1WNSA 2YKMA 1NGIA 3ZT2A 1T6DA 5KTQA 5J2NA 4B1XB 3VTHA 3BK3C 1DEJA 4DG1A 1C0TA 3W0LA 3LM2A 2F9WA 2OCEA 2P9KA 1S3XA 4NB4A 1W2BM 1K9MO 4JI8K 5FPDA 4J2AA 1HNXK 4FJ9A 2OTJN 4DTUA 4JNEA 3KZBA 4DV5K 4BE0A 3TSQA 5BPLA 1W97L 1NG9A 1LW0A 4LC9B 2E2NA 3O1BA 1VQ5N 3V1QA 1VNBA 3SAGA 4DFKA 3C95A 4EZ6A 2RHKA 4PKGA 1Q7YO 4KBOA 3HP6A 3BZCA 1IG8A 1SKWA 2O8EB 1WAJA 3AV9A 1QHAA 3VEXA 1FK9A 4AHUA 2QA4N 1IV0A 1NK5A 3MXIA 1K8BA 1HJRA 2LI7A 3R9PA 4CZIA 1JL2A 3CF5L 4CHNA 2ZM6K 1IBLK 3LPUA 3M8RA 3CC2N 4FLYA 1I6GA 4M3YA 1TL3A 3DLKA 1U45A 1WT7A 3J8AA 2E2PA 4W5TA 1UWBA 4DV6K 2HVIA 2HNYA 1TAQA 4AHRA 3TTFA 3ULDA 3SPZA 5HRPA 3FFKB 1JXEA 4N5SA 4Z4FA 1J54A 1HMVA 1B9FA 1RDDA 4JHDB 3OYNA 4F3OA 4BRAA 4JHDA 4YOWA 4DUYK 4B9SA 2VG5A 2Z1HA 3O5BA 3AVMA 1D9DA 3ZSOA 4Z4EA 1KC8O 3ATUA 3WUHA 1LAVA 2UUAK 3EKSA 2QK9A 4DS5A 3TAGA 3C6TA 1WSHA 3M1FA 4DR4K 1SZ2A 4EAHD 1CZ9A 1JZBA 2HMPA 3TTDA 4IJNA 3NMUA 1JKZA 4H0XB 1TGOA 3OYDA 3BP8A 4LF4K 1JLBA 2KFZA 1A5XA 3T1HK 1OKJA 3AVLA 1S1UA 4IKFA 2XRIA 1U2VA 1U2VB 1QHTA 3AVJA 4O5FA 1LQIA 3VEOA 1ZVGA 1XQSC 4CEQA 4CJ4A 4DV1K 3TPQA 3I8DA 2Y1IA 4N41A 1WSJA 2P9LA 4GW6A 3L8BA 3CPEA 1JXCA 3QEXA 2FSJA 2VQEK 3TAFA 4CK3A 4ZTJA 4FO0A 3AVIA 4BQZA 4CEEA 3KK3A 4LF8K 1YJWN 4DTOA 4DV3K 4CHYA 1RDCA 3IUCA 4CZKA 4B9MA 1A5VA 1YAGA 5JS1A 3KC6A 3NF9A 4B8AB 1VQNN 5AQSA 3MAQA 1TUYA 4H8KA 1NWKA 3HSTB 5AQUA 1HPMA 3ITHA 4I6MA 4ISFA 4CFCA 3DJCA 3MN9A 4FJJA 2OZSA 1N33K 3O6WA 1N32K 4LSLA 3T69A 1JXBA 3KIOA 1TKTA 3WXKA 1IH7A 4CW7B 5KRSA 1FKOA 2NRTA 2JGUA 3CCMN 4JAXA 4V19S 1CLQA 2C1GA 1LQHA 2QWMA 1HPZA 3DLGA 5CZ2A 3AVNA 4AHVA 5DM6L 3ZSXA 1TYQA 3W3DA 3G6EN 4CZFA 4FPAA 2V7YA 1GPSA 3VENA 2KPYA 4OVLA 3RSEB 1OVYA 3ZT4A 1PE4A 1KLMA 3HPGA 3LANA 5K14A 2O8CA 4TSXA 3LDQA 2HBKA 1XI1A 1XRSB 3V9SA 1VQ9N 3CC4N 4OLAA 4WCEL 1UA1A 3SQ1A 2E6LA 1NRAA 1GLFO 2YKNA 3C6UA 4A61A 2E8AA 1KRPA 3U3YA 4HTLA 3OYHA 2MZ0A 2KZMA 5KQ8A 4CK1A 4HTUA 3QIPA 3L2UA 4FPBA 5AQVA 4KYPA 2DPNA 2GL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FJI A;  4IDH A;  4KRF A;  3NGY A;  3CCQ N;  2XY5 A;  1N8R O;  2J4R A;  2K35 A;  2PYJ A;  2QI2 A;  3AVB A;  1X1P A;  4C8O A;  2D1K A;  1ASW A;  1BQM A;  5SZT A;  1I94 K;  5HRN A;  3V1O A;  3DXK B;  3O3G A;  2E1Y A;  4BY9 C;  2YNG A;  4YDU C;  5J1E A;  4O55 A;  4KKO A;  4M3U A;  4E7K A;  3O80 A;  2RPI A;  1OH7 A;  1VNA A;  2O8D B;  3VQD A;  1HKC A;  5CE3 A;  5TKW A;  4QS8 A;  3CFR A;  2G8U A;  1RT4 A;  2HVH A;  4BRP A;  5HBM A;  4NXN K;  3K58 A;  4EIA A;  3IS9 A;  5HOO A;  4CFA A;  1K73 O;  4BRE A;  3C6H A;  4NO7 A;  2KLA A;  1BWF O;  1RT7 A;  1VSK A;  4FK0 A;  4DR6 K;  3DLR A;  4FLU A;  3L2V A;  1RGI A;  4XH4 A;  3QES A;  2XY6 A;  2E6M A;  3FE1 A;  3HRG A;  4CZJ A;  4OPA A;  3CER A;  4JRP A;  5BN9 A;  4FLZ A;  3E1Y A;  2KSK A;  1C0F A;  1T7P A;  2NUB A;  4R79 A;  2IAJ A;  4IG0 A;  1T0Z A;  1RNH A;  1C1C A;  1N36 K;  5AZJ B;  4FWK A;  4NCA A;  1YUW A;  4Z4G A;  1LAW A;  2X78 A;  4C8L A;  4QAG A;  4ELV A;  1QQO A;  4HUF A;  2A6A A;  2BGG A;  3TAE A;  3NGI A;  2KBK A;  3MN7 A;  4UY8 O;  4GV3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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