3JXUA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1a (hsp70-1) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3jxuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3jxuA04
3MCPA 5AQFA 3W0LA 3O1BA 4BR4A 2AA4A 3VESA 5BN9A 2OANA 2H3GX 3WXIA 3ZETA 2NRHA 4B9QA 4BR9A 5AQGA 4BRFA 1MA9B 2QWNA 2CH6A 3UKUB 2Q36A 3ENHA 1NGBA 5AQHA 3RSEB 1HLUA 2GUPA 4DB3A 1NGDA 4DCHA 2VCPA 3FFKB 2V7ZA 4CZHA 4NO7A 2QWRA 4IJNA 4BROA 4FWPA 3LDPA 4A2BA 3M1FA 1S3XA 4BRIA 4EIAA 3ATVA 2YHXA 3KHYA 4BRNA 3QMLA 1TYQA 1ATNA 2WUSA 3ULEB 2Q2RA 4K42A 2PBDA 1Q18A 2CGJA 3JXUA 1Z05A 3D2FA 4MO4A 3SLCA 3VF4A 3WXLA 3H46O 4MLEA 4H0TB 2D0PA 2FSKA 2GEMA 3R8EA 1J6ZA 4XH1A 4BRKA 3VPZA 2E1ZA 1Y64A 5AQQA 4BR7A 5JLFA 2ZF5O 4PL8A 3VF6A 4H5WA 4ISFA 4QS7A 3CJAA 4FL9A 5BRFA 4BRDA 4BR2A 2D1KA 2P9LA 5BPMA 3H45C 2D0OA 1C0FA 2CH5A 3WQTA 3IFRA 3MK6A 5AR0A 5AFUA 2IVNA 5LY3A 3VEXA 4BRLA 3AAPA 1QQMA 3GE1A 5AQWA 4K43A 3GG4A 3FZMA 1BO5O 3IMXA 5AQKA 2QWLA 2P9PA 4H0YB 2GELA 2FF3B 4CD1A 3A5MC 4RWTA 1XC3A 3H3NO 1BA1A 1C0GA 2E8AA 3LDLA 1X9JA 3FR0A 4FOEA 3VEOA 1Z6RA 3WT0A 5KPTA 2FSNA 1U6ZA 1E4FT 2QW9A 2HF3A 4J8FA 2FXUA 3GL1A 4FWMA 2IVOA 3H1VX 4CZFA 5AQXA 3KZBA 2FF6A 3QFPA 3CQYA 1NGFA 4FWSA 4CJ7A 3F9MA 1NGJA 4CZIA 5FPEA 3U9DA 1EQYA 5EVZA 1KAZA 1TYQB 5BN8A 2A3ZA 5JICA 2Q31A 3CJ9A 1GLCG 5AZIA 2P9IA 2QXLA 1QQNA 5KPZA 5JLHA 3D2FB 3HI0A 5B8HA 5AQLA 4M63C 1T6DA 4IZ9A 1NGEA 3GOIA 4BQZA 1NMDA 3WUHA 4BC5A 1YUWA 1G99A 2FLOA 2V7YA 4PKHA 2P9LB 3U8XA 2QM1A 1S22A 3OHRA 1K8KB 4B1XB 4IJAA 3QFUA 5AQRA 3R9PA 5KQDA 5AFUH 2ZWHA 1X3MA 5EY4A 4H5TA 1NLVA 3D7EO 1P8ZA 3L6QA 4XH4A 3U4LA 1HKBA 3VF2A 3D2EB 2P9PB 3LM2A 4BRQA 4BRPA 3TPQA 1V4SA 2P9KA 3DXMA 1RGIA 1HJOA 3I8BA 3O1WA 1NWKA 1BU6O 4A62A 5EX5A 2KHOA 2Q97A 2HF4A 3VEYA 4FOIA 4CI6A 2V51B 2E88A 4A61A 4ISGA 4CZEA 5E84A 1NGAA 3DXKA 3HBTA 4BC2A 4FWNA 2NLXA 2AP1A 1DGKN 5BRDA 3L0QA 4B1WB 4BRCA 2I7PA 4BRMA 2P9NB 3ZEUA 4BRAA 2UYTA 1T44A 1NBWA 4CBUA 1JCEA 2P9SA 3ZX0A 2GWJA 4CZLA 3VEVA 2ASOA 3LDNA 3EKSA 2GWKA 3WXJA 4WYBA 5BPLA 1JCFA 5AZIB 3SJHA 2P9IB 4CBWA 2A5XA 3QICA 3ENOA 1SQKA 5AQSA 3A5OC 2P9UA 2YJFA 4IWVA 4BQLA 1GLJO 1RDWX 1ZBSA 2A41A 3B8AX 3EL2A 4B1YB 4HWIA 3FZKA 1U2VA 4I6MA 1QZ6A 3MN7A 5AQOA 2A42A 1HUXA 3CHWA 3WQUA 5AQJA 3DJCA 3MN9A 5BREA 5F1XA 1HKCA 3CJ1A 2QWMA 3BUZB 2YHYA 1SZ2A 3P4IA 5FPDA 1DKGD 3BF1A 1KAXA 3EKUA 3VGLA 1BG3A 3ZETB 5FPNA 1HX1A 3FZHA 1T6CA 4H03B 4O8KA 1KAYA 2QWPA 1E4GT 3MN6A 5AZJA 3BF3A 3VENA 1LCUA 4JNEA 3SK3A 3LL3A 3U9ZA 4PKGA 5KQ8A 5AQYA 3ZX2A 5AQTA 3M6GA 2P9KB 3DXMB 4H0OA 3J8AA 1MWMA 3BP8A 3GDQA 3HSCA 3AARA 3CI5A 3W3DA 3EN9A 3EZWA 4B1UB 2ZGZA 1OKJA 4RCHA 3LM9A 4WQ4A 2F9TA 3O6WA 1DEJA 3R6MA 3FE1A 3WEEA 2Q1NA 3MDQA 4KBOA 3CJBA 3CETA 1ZXOA 5AQVA 3DXKB 1TUUA 4B1VA 4K41A 2E2NA 3DAWA 2GTDA 5FPMA 5JMVA 1QZ5A 4AM7A 1GLBG 2E2PA 3A5LC 4EFHA 3H3OB 3ZEUB 3ATUA 4H5NA 1X3NA 4MO5A 5AQIA 2P9SB 1V4TA 4H0XB 2BTFA 2QWOA 4EHUA 1IJJA 2PAVA 4Z94A 3UKRA 1IG8A 2Q0RA 3TU5A 2E1YA 4CZJA 1BWFO 3BEXA 4PL7A 5LJVA 4M7XA 3QDKA 1YAGA 5ADXA 4YDUA 4BVOA 1MDUB 2A6AA 1U2VB 4I6MB 2E20A 4XEIA 2EWSA 4CZKA 5LJWA 2E2QA 3C0BA 4IXCA 4BREA 4E1JA 4EAHD 2VWBA 5EOYA 3S41A 3MMVA 4BG8A 1GLLO 5AZJB 3IUCA 1BOTO 4DQ8A 3H1QA 4BG9A 1QQOA 3VEZA 4CZGA 4JHDA 4BR5A 4AM6A 2D4WA 4QS9A 4BGBA 3CJCA 3M3ZA 4NB4A 4BR0A 3A0IX 1WOQA 1ATRA 1QHAA 3QBWA 4FPAA 4A2AA 5AQZA 1JCGA 2CGLA 5TKYA 1ATSA 2F9WA 4BGAA 3C7NA 3I33A 5EXWA 2ZGYA 3IDHA 3FZFA 4JAXA 4L3QA 5BRHA 3WEEB 5AQUA 4H5VA 1CZAN 4H0VB 3O08A 3SMPA 4WQ4C 4Y0WA 4WQ5C 3VETA 4MLHA 3O80A 4XH5A 1D4XA 4M7YA 4H0PA 3SMSA 1LOTB 1GLDG 4RTFD 3VERA 2DPNA 2W40A 1KXPA 1YXQA 4B1ZA 3FGUA 2ASPA 4HTLA 3UKRB 3HM8A 5AQPA 5BR9A 5CE3A 3QBXA 5KPRA 3VEWA 1GLFO 1NGHA 3VGKA 2VYPA 3G25A 2CGKA 3O5BA 4QS8A 3VOVA 4CBXA 5ADXH 4H5RA 4FSVA 1BA0A 2I7NA 4FWOA 1WUAA 4JD2A 3LDOA 3A5NC 2ITMA 3L4IA 2YHWA 5AQNA 2YI1A 5AQMA 4GNIA 1BDGA 1K8KA 3O8MA 4FPBA 4PKIA 4BRHA 3DWLA 1GLEG 4FWRA 1XUPO 1HKGA 5F2RA 4YDUC 2IVPA 4GY2B 1XQSC 5E26A 1NGGA 5ELZA 2FSJA 4EHTA 1R59O 3H6EA 3KVGA 4FWLA 3UB5A 3UKUA 1H1VA 3CQXA 4K25A 3D2EA 4JN4A 2YCHA 4IO8A 4WQ5A 3HZ6A 4BC3A 2BUPA 2V52B 4FWQA 4JHDB 3RSEA 4C23A 2QWQA 1SAZA 1NGCA 5F0XA 1HPMA 2IIRA 1NGIA 4DHYA 4O5FA 3MN5A 3C7NB 4F9OA 4BVPA 2W41A 3FLCO 1NM1A 3LDQA 4ISEA 2HOEA 3WXKA 2HMPA 3FZLA 1RFQA 3ULEA 4BC4A 2P9NA 4CZMA 3CERA 3GBTA 1ZC6A 2ASMA 2YJEA 4FO0A 4CD3A 1MWKA 1GLAG 5I9EB 3QB0A 2P9UB 3AY9A 3CIPA 1ESVA 1TUYA 1YVNA 3VGMA 3O4WA 3ID8A 2E2OA 3JS6A 5BPNA 3CJ7A 4FWKA 3UE5A 2Q0UA 4LC9B 4BRGA 2J4RA 2NZTA 3HTVA 3EO3A 3ZX3A 2A40A 3A8YA 3AAQA 1BUPA 4JD2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K58A 3MCPA 3W0LA 1B9DA 3O1BA 2AA4A 4JI0K 1HQEA 1VNBA 4FLXA 3BZCA 2HHSA 2O8CA 2OANA 2H3GX 3ZETA 2PFUA 2QWNA 3CCMN 1L3UA 2UUBK 3ZSWA 3KKSA 1IV0A 1NGBA 5AQHA 1HLUA 4FJ9A 1T7BA 2VCPA 3FFKB 2V7ZA 4KH6A 4CJFA 3NH2A 4DV5K 3DYAA 4MDBA 1FW6A 4FYDA 4FWPA 3SV3A 4A2BA 1EXQA 4BRIA 1RBSA 2YHXA 3KHYA 1TYQA 4CVNE 3ULEB 1S9GA 4NCGA 4RW6A 3SAHA 1SL2A 1Z05A 4K0KK 3D2FA 1P00A 4UQGA 4H0TB 1VRUA 1J6ZA 5AQQA 4BR7A 1TKDA 2X6NA 1TAUA 3CQ8A 4GMJB 3V9WA 3CJAA 4BR2A 3SYZA 5BPMA 4E7HA 5FRMA 1F21A 4FLTA 4FLVA 2QK9A 3KLIA 3VMFB 2VY6A 1QQMA 3GG4A 3O4NA 1BO5O 4OJRA 4CJTA 1A5XA 1BIUA 2Q3SA 1VQ6N 4OKEA 1DLOA 3K9JA 4H0YB 1T1TA 3A5MC 4RWTA 1KSPA 1TKTA 2E8AA 3NH0A 5JS2A 3LDLA 1X9JA 1C1AA 1RCHA 4DU1A 3VEOA 1W7AA 1Z6RA 1C0MA 3D45A 5KPTA 1HQUA 3CM6A 1T7EA 2QW9A 2HF3A 4J8FA 4DTMA 1S9EA 2IVOA 4CZFA 3CQYA 4KYPA 3AO2A 2XY6A 2F8SA 4M3ZA 2YX6A 3P39A 1YTUA 2UXDK 3K5LA 5EVZA 4DR7K 5BN8A 5JVHL 3V9ZA 4DR3K 4DTPA 5AZIA 4DS4A 3H08A 2P9IA 2QXLA 3V1OA 1T7PA 1QQNA 5KPZA 3KJVA 5LMUK 3KK1A 4FM2A 1PX9A 3WUHA 4BWJA 3ZT1A 2NRTA 1JLBA 3OYFA 3MWTA 2V7YA 2P9LB 3OJUA 1VSMA 2NUBA 4LF9K 1S22A 1ZFUA 4HHFA 1K8KB 1JLGA 3QFUA 5AQRA 1SV5A 5EU7A 2ZWHA 3KLFA 4KTZA 3PX6A 2IS3A 4H5TA 1NLVA 4A5AA 4DUYK 4DF4A 1RTDA 3U4LA 3VF2A 4CGFA 2P9PB 2KSKA 2Z1JA 3AVFA 4N76A 1V4SA 3NCIA 2E3FA 1N34K 2OTLN 4HUGA 3QI7A 4DTJA 2HBLA 2EX3A 4O5BA 5CHIA 3DLBA 1L5UA 4M3WA 2E88A 2O8DA 4A61A 2JDQD 5E84A 4LF6K 4BY9C 1IBKK 3AO1A 4YY3K 2NLXA 4AILC 1GPSA 2AP1A 2C1GA 4OPKA 1TK5A 1NJYA 4B9VA 4BRMA 5M1QA 4E7LA 3PV8A 2YHBA 4CGHA 2P5GA 2ASOA 1VSJA 4DLGA 3PIOL 1T03A 2OYQA 3EKSA 2GWKA 2KFNA 3WXJA 4WYBA 1JCFA 4O44A 3J7ZO 1RT4A 3SJHA 1N33K 4L8RB 3RMBA 3SUPA 3QICA 5CR4A 3THXA 3PUFA 1SUQA 3A5OC 3O9TA 3OA9A 4ID5A 5SZTA 1NK8A 4JI5K 4BQLA 1TL3A 3NGZA 4B1YB 2HHHK 4HWIA 1QZ6A 2LI7A 3V9SA 3AGKA 5BREA 4CERA 3CJ1A 1S1WA 4R79A 1RTJA 1TK8A 4LF4K 5FPDA 1LAVA 4WF9L 1DKGD 3O9UA 2WBNA 1GOCA 2R7YA 2VQEK 1M90O 5FPNA 2YNGA 5AZJA 5T7BA 2QWPA 1T3VA 2IC3A 1J5EK 2NY9X 1ZBHA 4LFBK 4IEEA 5AQTA 3M6GA 1NKEA 4H0OA 5J1EA 1WT7A 3BP8A 3KD1E 3GDQA 3CI5A 3AARA 3W3DA 2KLAA 1BMRA 1CHZA 3CYMA 3ZSQA 1VAZA 2XRIA 1B7DA 2Q1NA 3MDQA 4CJWA 4I9QA 3QERA 1S1VA 4FK4A 3CETA 1ZXOA 4W5RA 2HHVA 4DV2K 2KZMA 3HL8A 4TSXA 1HMVA 2K35A 1QZ5A 1Q86O 4N47A 4AM7A 4LY7A 2PZSA 3LWLA 2YC1C 1KQSM 1WSGA 4MO5A 5KGWA 5AQIA 2P9SB 1V4TA 4H0XB 2ZE2A 5KRTA 2LY6A 3PX4A 2KBKA 5HRRA 1IG8A 3TU5A 1OH5A 2LSNA 3ZCMA 3PO5A 1BWFO 4JKHA 4Z4EA 5LJVA 3QDKA 4KH4A 4UJ0A 4O8UA 1MDUB 3CMEN 4E0DA 1U2VB 3O9SA 4DSLA 2NRWA 4OX9K 3C6TA 4FJMA 2IAJA 3LWMA 1P90A 4E1JA 1TKZA 1IKWA 2YBRC 1WAJA 3SAGA 2VWBA 3THWB 1NNEA 3QIPA 4LH4A 2ZD1A 1BI4A 5EOYA 3S41A 4PHTX 4V19S 5C24A 1BOTO 1A5WA 1OH7A 2IOCA 4JHDA 4BR5A 4B8CA 4CHNA 1WOQA 1ATRA 3LDSA 4IFVA 2KQ2A 5AQZA 1Q9XA 2CGLA 2F9WA 4KTWA 3CM5A 4KREA 3N4QA 5CYQA 4E1NA 4E72A 3U3YA 5BRHA 1NKCA 1CZAN 4I7FA 4B9LA 1OVYA 1TGOA 3OYKA 1QSSA 1XNQK 3ZSOA 4ILGB 3VETA 1K6YA 2VGMA 4FLWA 3CCUN 1QS4A 3SMSA 3SI6A 2OPQA 1NRBA 3ZT4A 1RNHA 3CFPA 3E1YA 1KXPA 4CGIA 1YXQA 4B1ZA 3Q7BA 3UKRB 2HSTA 5CE3A 3QBXA 4PQUA 5BR8K 3VEWA 2UUAK 1GLFO 3NDKA 1L3SA 3K9KA 1NJIO 3G25A 3AA4A 3VQPA 1I2UA 2Y1IA 3B6OA 4FWOA 2JWLA 2YHWA 3O8MA 5AQMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K58 A;  3MCP A;  3W0L A;  1B9D A;  3O1B A;  2AA4 A;  4JI0 K;  1HQE A;  1VNB A;  4FLX A;  3BZC A;  2HHS A;  2O8C A;  2OAN A;  2H3G X;  3ZET A;  2PFU A;  2QWN A;  3CCM N;  1L3U A;  2UUB K;  3ZSW A;  3KKS A;  1IV0 A;  1NGB A;  5AQH A;  1HLU A;  4FJ9 A;  1T7B A;  2VCP A;  3FFK B;  2V7Z A;  4KH6 A;  4CJF A;  3NH2 A;  4DV5 K;  3DYA A;  4MDB A;  1FW6 A;  4FYD A;  4FWP A;  3SV3 A;  4A2B A;  1EXQ A;  4BRI A;  1RBS A;  2YHX A;  3KHY A;  1TYQ A;  4CVN E;  3ULE B;  1S9G A;  4NCG A;  4RW6 A;  3SAH A;  1SL2 A;  1Z05 A;  4K0K K;  3D2F A;  1P00 A;  4UQG A;  4H0T B;  1VRU A;  1J6Z A;  5AQQ A;  4BR7 A;  1TKD A;  2X6N A;  1TAU A;  3CQ8 A;  4GMJ B;  3V9W A;  3CJA A;  4BR2 A;  3SYZ A;  5BPM A;  4E7H A;  5FRM A;  1F21 A;  4FLT A;  4FLV A;  2QK9 A;  3KLI A;  3VMF B;  2VY6 A;  1QQM A;  3GG4 A;  3O4N A;  1BO5 O;  4OJR A;  4CJT A;  1A5X A;  1BIU A;  2Q3S A;  1VQ6 N;  4OKE A;  1DLO A;  3K9J A;  4H0Y B;  1T1T A;  3A5M C;  4RWT A;  1KSP A;  1TKT A;  2E8A A;  3NH0 A;  5JS2 A;  3LDL A;  1X9J A;  1C1A A;  1RCH A;  4DU1 A; 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